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Dissertations / Theses on the topic 'PCR5'

Author: Grafiati
Published: 2 June 2025
Last updated: 31 July 2025

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Cravello, Laëtitia. "Etudes structurales des protéines par spectrométrie de masse couplée aux échanges hydrogène/deuterium et à la réticulation chimique." Université Joseph Fourier (Grenoble), 2005. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00009698.

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Abstract:
Les protéines sont impliquées dans de nombreux processus biologiques. Il est nécessaire pour comprendre en détail leur fonction et leur mode d’action afin d’obtenir des informations sur leur structure et sur leurs interactions éventuelles avec leurs partenaires. Le travail réalisé durant cette thèse a consisté à développer deux méthodes innovantes utilisant la spectrométrie de masse pour étudier la structure des protéines et à appliquer ces méthodes à une problématique biologique. Nous avons optimisé une méthode associant les échanges H/D et la spectrométrie de masse sur une protéine modèle, l
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Caye-Eude, Aurélie. "Génétique et architecture clonale des leucémies myélomonocytaires juvéniles sporadiques et syndromiques." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2018. http://www.theses.fr/2018USPCC173/document.

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Abstract:
La LMMJ est un syndrome myéloprolifératif et myélodysplasique rare du jeune enfant, initiée par des mutations classiquement décrites comme mutuellement exclusives de RAS (NRAS, KRAS) ou de régulateurs de la voie RAS (PTPN11, NF1 ou CBL). Ces mutations, somatiques ou constitutionnelles, entraînent l’hyperactivation de cette voie de signalisation et une hypersensibilité spécifique au GM-CSF. La LMMJ est une hémopathie sévère dont le seul traitement est l’allogreffe de moelle osseuse. Cependant sa présentation et son évolution sont particulièrement hétérogènes puisqu’une transformation en leucémi
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Salgado, Vanessa Riesz. "Desenvolvimento de Reações em Cadeia pela Polimerase (PCRs) para o diagnóstico diferencial das principais espécies de Brucella." Universidade de São Paulo, 2011. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-11102012-115215/.

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Abstract:
A brucelose é uma doença altamente contagiosa, responsável por grandes prejuízos econômicos e de saúde pública. É causada por bactérias do gênero Brucella, cujas espécies e seus biovares costumam ser caracterizados pelo isolamento e identificação de características fenotípicas da colônia. Dificuldades como, o perigo na manipulação dos microrganismos, processos laboriosos de tipificação, demora na obtenção de resultados e a instabilidade de características fenotípicas ou isolamento de linhagens atípicas dificultam a tipificação e encorajaram a busca de técnicas mais sensíveis e específicas, com
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Minnella, Walter Settimo Leonardo. "Development of microfluidic tools for biological applications." Thesis, Bordeaux, 2017. http://www.theses.fr/2017BORD0664.

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Abstract:
Cette thèse traite le développement de dispositifs, basés sur la technologie "laboratoire sur puce"(LOC) qui visent à contrôler l'environnement des systèmes biologiques pour des applications macro et microbiologiques. En effet, les caractéristiques de la microfluidique permettent de manipuler l'environnement cellulaire à un niveau supérieur à celui du degré de contrôle atteignable avec les techniques ordinaires. Dans ce travail de thèse sera explorée la possibilité de profiter de ces fonctions afin de développer des outils de diagnostic peu coûteux et pourtant efficaces. En particulier, on rap
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Chisty, L. T. "PcrA function in plasmid replication." Thesis, University College London (University of London), 2014. http://discovery.ucl.ac.uk/1427879/.

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Abstract:
PcrA is a DNA helicase involved in unwinding plasmi ds as a part of a complex in asymmetric rolling - circle replication of certain plasmids carrying antibiotic resistance genes. PcrA translocates on single stranded DNA by coupling ATP hydrolysis to movement on DNA. Initiator protein, RepD is required to nick supercoiled plasmid site - specifically and open an ssDNA stretch that PcrA can bind. The presence of RepD is needed throughout plasmid unwinding to maintain processivity. Using fluorescent - based techniques, PcrA helicase mechanistic functions and interactions with different components
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Rozales, Franciéli Pedrotti. "Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 2013. http://hdl.handle.net/10183/72990.

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Abstract:
A tuberculose (TB) é um importante problema de saúde pública, portanto, é necessário o desenvolvimento de novas ferramentas para a detecção rápida e confiável do Mycobacterium tuberculosis, prevenindo a transmissão da TB. O objetivo deste estudo foi avaliar dois testes moleculares para detecção de bactérias do Complexo Mycobacterium tuberculosis (MTBC) diretamente de amostras clínicas. Foi realizado um estudo transversal, no qual foram selecionadas 124 amostras respiratórias. As amostras foram avaliadas por dois testes moleculares “in house” para detecção do MTBC: NESTED-PCR (NPCR) e Real Time
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Ziebell, Kim. "Evaluation of PCR and PCR-RFLP protocols to identify the Shiga toxins." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 2000. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk1/tape2/PQDD_0026/MQ51107.pdf.

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Hill, Philip John. "PCR based gene engineering." Thesis, University of Nottingham, 1992. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.317040.

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Costa, Luciana Fachini da [UNESP]. "Avaliação comparativa entre PCR gênero-específica, PCR espécie-específica e nested PCR espécie-específica no diagnóstico da infecção por Brucella ovis." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2010. http://hdl.handle.net/11449/94670.

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Abstract:
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-06-29Bitstream added on 2014-06-13T20:08:22Z : No. of bitstreams: 1 costa_lf_me_botfmvz.pdf: 594547 bytes, checksum: 7d609573704d70bd41e6633e86629767 (MD5)<br>Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)<br>Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)<br>O diagnóstico da infecção por Brucella ovis em ovinos usualmente é realizado por meio de exame clínico, testes sorológicos e bacteriologia. Devido às limitações apresentadas pelas técnicas, o diagnós
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Costa, Luciana Fachini da. "Avaliação comparativa entre PCR gênero-específica, PCR espécie-específica e nested PCR espécie-específica no diagnóstico da infecção por Brucella ovis /." Botucatu : [s.n.], 2010. http://hdl.handle.net/11449/94670.

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Abstract:
Resumo: O diagnóstico da infecção por Brucella ovis em ovinos usualmente é realizado por meio de exame clínico, testes sorológicos e bacteriologia. Devido às limitações apresentadas pelas técnicas, o diagnóstico é geralmente obtido mediante aplicação de duas ou mais técnicas para obtenção de um resultado conclusivo. A Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR) tem sido utilizada como ferramenta diagnóstica aplicável, pois é sensível, pouco dispendiosa, rápida, simples de ser realizada e permite o diagnóstico específico do agente infectante. Neste trabalho foram realizados dois experimentos. No pri
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Jakobsson, Sanna. "Quantitative analysis of BCR-ABL1 fusion gene by Droplet Digital PCR and qRT-PCR." Thesis, Umeå universitet, Biomedicinsk laboratorievetenskap, 2015. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-103957.

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Metivier, Romain. "Ecologie microbienne de produits végétaux : Adaptation de traitements assainissants pour la valorisation de ces produits." Thesis, Bordeaux, 2015. http://www.theses.fr/2015BORD0419/document.

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Abstract:
L’utilisation de coproduits en tant que matière première provenant d’une autre voie industrielle, fait qu’il n’est plus considéré comme « déchet ». Leur valorisation est donc un axe de développement pour les entreprises agronomiques et agroalimentaires. Cependant, leur nouveau statut de « matière première » entraîne des contraintes pour les industriels.Celles-ci sont diverses selon les voies de destination : sanitaires, toxicologiques …Ce travail s’intéresse à deux coproduits issus de filières différentes de transformation végétale :(1) l’épiderme de pomme, comme source d’antioxydants. Leur va
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Saukkoriipi, A. (Annika). "Detection of pneumococcus by PCR." Doctoral thesis, University of Oulu, 2003. http://urn.fi/urn:isbn:9514272110.

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Abstract:
Abstract New rapid methods for sensitive and specific detection of pneumococci are not only needed to improve the diagnosis of pneumococcal disease but are also essential for vaccine and carriage studies. The purpose of this study was to develop sensitive PCR methods for the detection and quantification of S. pneumoniae and to study the applicability of these methods to detecting pneumococci in clinical samples. A previously described PCR method was first developed further by introducing a Europium-labelled hybridisation probe for the detection of amplification products. The hybridisation me
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Beauchamps, Patrick. "Contribution de l'amplification génique (PCR) au diagnostic de la toxoplasmose : intérêts de la PCR quantitative." Lille 1, 1999. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/1999/50376-1999-413.pdf.

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Abstract:
La toxoplasmose est une parasitose ubiquitaire occupant une large place en médecine humaine et vétérinaire. Cette affection parasitaire très fréquente en France est le plus souvent bénigne voire asymptomatique. Pourtant, elle reste redoutable en situation de transmission congénitale. De même, sa survenue chez les malades immunodéprimés a radicalement changé la conception de cette maladie. Pour compenser les insuffisances du sérodiagnostic et du diagnostic parasitologique, nous avons mis au point un diagnostic permettant un dépistage très précoce face à la suspicion d'une toxoplasmose congénita
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Chandramoulee, Swaran Yuvaneswari. "Evaluation of direct PCR for forensic DNA profiling and the development of a direct PCR multiplex." Thesis, University of Strathclyde, 2012. http://oleg.lib.strath.ac.uk:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=18935.

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Abstract:
The use of direct PCR with different types of sample was explored in this study. Genomic DNA preparations at various concentrations and buccal cell counts were deposited on commonly encountered substrates, recovered and amplified using direct PCR before subjecting them to capillary electrophoresis. The electropherograms obtained were compared to those obtained using the standard DNA profiling protocol which involves extraction and amplification prior to capillary electrophoresis. Direct PCR was found to be better than the standard DNA profiling protocol in both studies and was further tested w
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Cloux, Boccoz Stéphanie. "Développement de PCRs multiplexes pour le diagnostic : microarrays analytiques." Thesis, Lyon 1, 2015. http://www.theses.fr/2015LYO10282/document.

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Abstract:
Les travaux présentés dans cette thèse font suite à celle de Melle LE GOFF. Ils se concentrent sur la technologie HIFI brevetée et développée pendant ses travaux. Une première partie du travail présenté dans ce manuscrit concerne le test HIFI Blood 96™ et plus particulièrement les améliorations et les évolutions apportées au test afin d'en faire un véritable outil de génotypage, multiparamétrique et haut-débit pouvant être installé dans les banques de sang dans le but de constituer des inventaires de sang génotypé de façon étendue, participant ainsi à améliorer la sécurité transfusionnelle. Il
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Bischoff, Erik. "Schnellnachweis von bierschädlichen Bakterien mit PCR." [S.l.] : [s.n.], 2002. http://deposit.ddb.de/cgi-bin/dokserv?idn=964420333.

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Lien, Tonje Gulbrandsen. "Statistical Analysis of Quantitative PCR Data." Thesis, Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet, Institutt for matematiske fag, 2011. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:no:ntnu:diva-13094.

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Abstract:
This thesis seeks to develop a better understanding of the analysis of gene expression to find the amount of transcript in a sample. The mainstream method used is called Polymerase Chain Reaction (PCR) and it exploits the DNA's ability to replicate. The comparative CT method estimate the starting fluorescence level f0 by assuming constant amplification in each PCR cycle, and it uses the fluorescence level which has risen above a certain threshold. We present a generalization of this method, where different threshold values can be used. The main aim of this thesis is to evaluate a new method ca
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Karlsson, Magdalena, and Emilia Semberg. "Tracing probiotics in salami using PCR." Thesis, Uppsala universitet, Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi, 2011. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-157177.

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Abstract:
Starter cultures of different bacteria strains like lactic acid producing bacteria, Staphylococcus and Kocuria are used when making salami. Starter cultures give the sausage specific flavours and improve the quality and ripening of the final product. Probiotic strains can also be added during the production of salami. Studies have shown that probiotics are good for health and are therefore added to food, such as fermented sausages. In order to work as a probiotic strain, the bacteria have to survive during the production process, storage and through the whole human gastrointestinal tract. The
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Halpern, Micah. "Immuno-PCR detection of Lyme borreliosis." Doctoral diss., University of Central Florida, 2013. http://digital.library.ucf.edu/cdm/ref/collection/ETD/id/6286.

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Abstract:
Lyme borreliosis, more commonly referred to as Lyme disease, is the fastest growing zoonotic disease in North America with approximately 30,000 confirmed cases and 300,000 estimated infections per year. In nature, the causative agent of Lyme disease, the bacterium Borrelia burgdorferi, cycles between Ixodes sp. ticks and small mammals. Humans become infected with Lyme disease after being bitten by an infected tick. The primary indicator of a Borrelia burgdorferi infection is a bull's eye rash typically followed by flu-like symptoms with treatment consisting of a 2-4 week course of antibiotics.
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Pelikánová, Veronika. "Automatická genotypizace bakterií metodou rep-PCR." Master's thesis, Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, 2018. http://www.nusl.cz/ntk/nusl-378029.

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Abstract:
This thesis deals with automatic bacteria genotyping by rep-PCR method. Its theoretical part presents various methods of DNA typing, basic information on electrophoresis and modern electrophoretic approaches, including their problems, misleading data distortion. In order to automate typing, there has been introduced a program for phylogenetic sample classification from rep-PCR, also applicable for data from chip capillary electrophoresis. The program consists of three main parts: digitization, bandmatching and clustering apparatus to bacterial type classification. The result of the algorithm i
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Šuranská, Hana. "Identifikace vinných kvasinek metodou PCR-RFLP." Master's thesis, Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická, 2009. http://www.nusl.cz/ntk/nusl-216494.

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Abstract:
This thesis deals with identification of the wine yeasts by applying the PCR-RFLP method. The identification and characteristic of the yeasts has gone through substantial changes in recent years. There have been introduced new methods of taxonomic classifying based on the molecular methods, which are oriented to easy and fast identification. One of these methods is the PCR-RFLP method. The amplification of the 5•8S-ITS rDNA sequence by the polymerase chain reaction with use of the primers ITS1 and ITS4 leads to the amplification of the specific sequence of DNA. Such multiplied DNA is after rep
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Feugeas, Olivier. "Pcr (polymerase chain reaction) et vih." Lille 2, 1990. http://www.theses.fr/1990LIL2M264.

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Reis, Levi Eduardo Soares. "Detecção de Leishmania por PCR e suas variações (seminested PCR e PCR em tempo real), em fragmentos de pele e de baço de cães com leishmaniose visceral." Programa de Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas. CIPHARMA, Escola de Farmácia, Universidade Federal de Ouro Preto, 2013. http://www.repositorio.ufop.br/handle/123456789/3364.

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Abstract:
Submitted by Oliveira Flávia (flavia@sisbin.ufop.br) on 2013-10-10T16:05:16Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23599 bytes, checksum: 9e2b7f6edbd693264102b96ece20428a (MD5) DISSERTAÇÃO_DetecçãoLeishmaniaPCR.pdf: 1009268 bytes, checksum: f3643332a0889fcb5d973bed29de784f (MD5)<br>Approved for entry into archive by Gracilene Carvalho (gracilene@sisbin.ufop.br) on 2013-10-21T14:45:17Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23599 bytes, checksum: 9e2b7f6edbd693264102b96ece20428a (MD5) DISSERTAÇÃO_DetecçãoLeishmaniaPCR.pdf: 1009268 bytes, checksum: f3643332a0889fcb5d973bed29de784f (MD5)<br>Made av
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Noll, Lance. "Escherichia coli O157: detection and quantification in cattle feces by quantitative PCR, conventional PCR, and culture methods." Thesis, Kansas State University, 2015. http://hdl.handle.net/2097/18923.

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Abstract:
Master of Science<br>Department of Diagnostic Medicine/Pathobiology<br>T. G. Nagaraja<br>Shiga toxin-producing E. coli O157 is a major foodborne pathogen. The organism colonizes the hindgut of cattle and is shed in the feces, which serves as a source of contamination of food. Generally, cattle shed E. coli O157 at low concentrations (≤ 10[superscript]2 CFU/g), but a subset of cattle, known as “super-shedders”, shed high concentrations (>10[superscript]3 CFU/g) and are responsible for increased transmission between animals and subsequent hide and carcass contamination. Therefore, concentrati
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Lima, Ana Carolina Stocco de. "Diagnóstico molecular de Leishmaniose Tegumentar Americana: identificação de espécies de Leishmania por SSUrDNA PCR e G6PD PCR." Universidade de São Paulo, 2010. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5160/tde-20092010-162811/.

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Abstract:
A Leishmaniose Tegumentar Americana (LTA) representa um sério problema de saúde pública. No Brasil muitas espécies são reconhecidas como patogênicas para o homem, portanto o diagnóstico diferencial é necessário para compreender o perfil epimemiológico da LTA em áreas endêmicas. Com o objetivo de identificar espécies de Leishmania utilizando ferramentas moleculares, cinquenta e três biópsias de pele de pacientes com LTA, fixadas em formalina e incluídas em parafina dos Estados do Pará (N=33) e Maranhão (20) foram submetidos a diferentes protocolos da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) para a
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SPACOV, Isabel Cristina Guerra. "Utilização de marcadores de rDNA-PCR e tDNA-PCR para tipagem de isolados clínicos de Pseudomonas aeruginosa." Universidade Federal de Pernambuco, 2005. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/6640.

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Abstract:
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:06:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6313_1.pdf: 1481990 bytes, checksum: 994600fb8e4272b6f803e8477c45a54d (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005<br>Pseudomonas aeruginosa é uma bacteria Gram-negativa ubíqua e oportunista. Na rotina hospitalar, os marcadores fenotípicos nem sempre revelam a diversidade das bactérias distribuídas nos diversos setores, assim, aplicamos três métodos moleculares baseados na amplificação por PCR do locus de rDNA e tDNA para caracterizar a divers
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Ferreira, Karin Correa Scheffer. "Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR." Universidade de São Paulo, 2011. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-19102012-132944/.

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Abstract:
Este estudo teve como objetivo detectar a presença do vírus da raiva em diferentes órgãos de morcegos do gênero Artibeus empregando as técnicas moleculares como RT-PCR, hnRT-PCR e Real Time RT-PCR. De aproximadamente 4000 espécimes de morcegos recebidas no Instituto Pasteur para o diagnóstico da raiva, foram selecionados 30 morcegos do gênero Artibeus, com resultados positivos para raiva pelas técnicas tradicionais de IFD e inoculação em células N2A utilizando suspensões feitas a partir do SNC. Para as técnicas moleculares, foram retirados glândulas salivares, bexigas urinárias, rins, pulmões
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Faganello, Fernanda de Sillos. "Validação de protocolo para detecção de Guignardia citricarpa em citros por PCR convencional e PCR em tempo real." Universidade Federal de Goiás, 2013. http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/4005.

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Abstract:
Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2015-01-29T19:55:46Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Fernanda Bueno Sampaio - 2013.pdf: 855102 bytes, checksum: 072ad37c90c900b69a5b7d188b872f7c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)<br>Approved for entry into archive by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2015-01-29T19:56:16Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Fernanda Bueno Sampaio - 2013.pdf: 855102 bytes, checksum: 072ad37c90c900b69a5b7d188b872f7c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD
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Souza, Stefania Marcia de Oliveira. "Padronização de um protocolo de PCR e Nested PCR para detecção de Listeria monocytogenes em queijos minas frescal." reponame:Repositório Institucional da UnB, 2011. http://repositorio.unb.br/handle/10482/8674.

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Abstract:
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária. 2011.<br>Submitted by alcianira lima persch (alcyrpl@yahoo.com.br) on 2011-06-23T00:59:46Z No. of bitstreams: 1 2011_StefaniaMarciadeOliveiraSouza.pdf: 2564047 bytes, checksum: 97b9b2a9bf641f22916bd222874a0c57 (MD5)<br>Approved for entry into archive by Guilherme Lourenço Machado(gui.admin@gmail.com) on 2011-06-27T16:48:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_StefaniaMarciadeOliveiraSouza.pdf: 2564047 bytes, checksum: 97b9b2a9bf641f22916bd222874a0c57 (MD5)<br>Made available in DSpace on 2011-06-27T16:4
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Benedetto, Elena. "Protocolli e applicazioni della reazione a catena della polimerasi (PCR)." Bachelor's thesis, Alma Mater Studiorum - Università di Bologna, 2015. http://amslaurea.unibo.it/9634/.

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Abstract:
Con il seguente lavoro di tesi si propone un excursus dell’evoluzione della tecnica che ha permesso l’amplificazione del DNA in laboratorio, spiegandone i principi elementari di base. La scoperta che il DNA è il depositario dell’informazione genica ha aperto la strada a una nuova disciplina: la biologia molecolare, dove molte delle tecniche utilizzate limitano le funzioni naturali degli acidi nucleici. Dalla sua introduzione, la tecnologia PCR ha modificato il modo nel quale l’analisi del DNA viene condotta nei laboratori di ricerca e di diagnostica. Con lo scopo di rilevare direttamente se
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Johansson, Olle. "Detektion av Fusobacterium necrophorum med realtids-PCR." Thesis, Linnéuniversitetet, Institutionen för naturvetenskap, NV, 2010. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:lnu:diva-9216.

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Abstract:
Fusobacterium necrophorum är en gramnegativ anaerob bakterie som grupperas i ss. necrophorum och ss. funduliforme. Fusobacterium necrophorum ss. funduliforme har på senare tid misstänkts kunna spela en roll vid vanligare svalginfektioner såsom halsfluss. Syftet med detta arbete var att sätta upp och bepröva en metod för realtids-PCR (Polymerase Chain Reaction) enligt Taqman för att detektera ss funduliforme. Vi undersökte även hur förvaringstiden i transportmedium (Amies kol, Copan) och odlingsmedium (Fastidious Agar Broth) påverkar överlevnaden för F. necrophorum ss. funduliforme och resultat
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Crane, Bryan Lee 1976. "Real time PCR measurement by fluorescence anisotropy." Thesis, Massachusetts Institute of Technology, 2004. http://hdl.handle.net/1721.1/30347.

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Abstract:
Thesis (Ph. D.)--Massachusetts Institute of Technology, Dept. of Mechanical Engineering, February 2005.<br>Page 230 blank.<br>Includes bibliographical references (p. 181-190).<br>Real-time polymerase chain reaction (PCR) is the gold-standard for quantitation in both mutation and gene expression analyses. Already this technique has found valuable clinical application in disease diagnosis and progression evaluation. As the number of known gene-disease correlations continues to rise, there will be increased demand for higher throughput and decreased cost for these analyses. Present real-time PCR
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Pinheiro, Maria de Fátima Terra. "Contribuição da PCR na investigação médico-legal." Doctoral thesis, Universidade do Porto. Reitoria, 1997. http://hdl.handle.net/10216/10096.

Full text
Abstract:
Dissertação de Doutoramento em Ciências Biomédicas apresentada ao Instituto de Ciências Biomédicas de Abel Salazar da Universidade do Porto<br>O principal objectivo deste estudo consistiu no desenvolvimento de metodologias de análise do DNA, em amostras biológicas, com aplicação na determinação da relação de parentesco entre indivíduos (casos de filiação) e casos de identificação genética humana.A descoberta da PCR para o estudo dos loci altamente polimórficos, designadamente loci VNTR e STR, constituiu uma inovação muito promissora em várias áreas da ciência e, em particular, na Medicina Lega
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Oliveira, Tânia Maria dos Santos. "PCR em tempo real: métodos e aplicações." Master's thesis, Universidade de Aveiro, 2010. http://hdl.handle.net/10773/7230.

Full text
Abstract:
Mestrado em Toxicologia e Ecotoxicologia<br>A reacção em cadeia da polimerase (PCR) é uma técnica fundamental nos laboratórios actuais, que revolucionou a detecção de RNA e DNA. Recentemente, uma nova técnica designada PCR em tempo real, evoluiu da técnica de PCR convencional, com o objectivo de minimizar as suas numerosas limitações. Esta técnica, também conhecida como PCR Quantitativa ou PCR em tempo real Quantitativa é um método de quantificação e amplificação simultânea do DNA. A PCR em tempo real é baseada na detecção e quantificação de um composto fluorescente (durante as primeiras fases
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Van, Winkle Carolyn. "Forensic DNA Extraction Strategies for PCR Analysis." Thesis, University of North Texas, 1998. https://digital.library.unt.edu/ark:/67531/metadc278269/.

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Abstract:
There is a transition nationwide on the analysis of forensic evidentiary stains containing biological material from traditional serology to Polymerase Chain Reaction (PCR) methodologies. The increased sensitivity of PCR, the limited number of alleles at each locus, and the necessity of producing unambiguous data for entry into the FBI's Combined DNA Index System make this study of extraction procedures of utmost importance. A "single tube" extraction procedure for blood stains collected onto FTA™ paper and a modified differential nonorganic extraction method from spermatozoa containing mixed
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Mann, Tobias. "A thermodynamic approach to PCR primer design." Saarbrücken VDM Verlag Dr. Müller, 2007. http://d-nb.info/988796201/04.

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Williams, Neil Ray. "PCR-based polymorphisms in bermudagrass (Cynodon spp.)." [Gainesville, Fla.] : University of Florida, 2003. http://purl.fcla.edu/fcla/etd/UFE0001484.

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Pinheiro, Maria de Fátima Terra. "Contribuição da PCR na investigação médico-legal." Tese, Universidade do Porto. Reitoria, 1997. http://hdl.handle.net/10216/10096.

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Abstract:
Dissertação de Doutoramento em Ciências Biomédicas apresentada ao Instituto de Ciências Biomédicas de Abel Salazar da Universidade do Porto<br>O principal objectivo deste estudo consistiu no desenvolvimento de metodologias de análise do DNA, em amostras biológicas, com aplicação na determinação da relação de parentesco entre indivíduos (casos de filiação) e casos de identificação genética humana.A descoberta da PCR para o estudo dos loci altamente polimórficos, designadamente loci VNTR e STR, constituiu uma inovação muito promissora em várias áreas da ciência e, em particular, na Medicina Lega
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Gregušová, Barbora. "Identifikace vybraných bakterií v sýrech pomocí PCR." Master's thesis, Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická, 2009. http://www.nusl.cz/ntk/nusl-216493.

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Abstract:
This work is focused on identification and species specification of a collection of 44 clostridial strains using molecular-genetic methods. DNA of bacteria isolated from late-blowing defected cheeses was used. The purified DNA was diluted to 10 ng/µl and its ability to be amplified was verified by PCR with universal primers. By genus-specific PCR was proved that DNA of all samples belongs to Clostridium genus. Based on species-specific PCR reactions, it was determined that 7 strains belong to C. butyricum and 12 strains belong to C. tyrobutyricum. 15 strains were positively detected in both sp
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Jurečková, Nela. "PCR identifikace nepatogenních bakterií izolovaných ze sýrů." Master's thesis, Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická, 2010. http://www.nusl.cz/ntk/nusl-216587.

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Abstract:
Different species of genus Bifidobacterium are part of human and animal intestinal flora. These bacteria have benefit effects and therefore they are used in foods and pharmaceutical products as probiotics. Cheese is now suitable as a probiotic matrix except yoghurts and fermentated milks. This diploma thesis was focused on optimalization of DNA isolation from bacteria of genus Bifidobacterium. Magnetic microparticles (P(HEMA-co¬-GMA)) were used for DNA isolation in presence of 8% polyethyleneglycol PEG 6000 and 5 M sodium chloride. Phenol extraction weas also used as an isolation method. Isola
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Uygun, Sahra. "Development Of Analysis Methods For Cry1ac And Sam-k Gene Lines In Tomato Using Pcr And Real-time Pcr." Master's thesis, METU, 2010. http://etd.lib.metu.edu.tr/upload/3/12611991/index.pdf.

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Abstract:
Genetically modified organisms are entering the human diet in all over the world. In order to have transparency in the foods that are being consumed, there is a need to trace the genetically modified organisms (GMOs) in the market and consequently this need brings the necessity of analytical methods that are capable of detecting, identifying and quantifying the transgenic events. These analytical methods also form the basis of the labeling regulations that are tried to be formed regarding GMOs. The main aim of this study is to develop and apply the detection methods for the two of the tomato e
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Odlander, Paulina. "Optimisation and Validation of PCR Method for HLA Gene Expression to Enable PCR System Transfer and Master Mix Change." Thesis, Linköpings universitet, Institutionen för fysik, kemi och biologi, 2020. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-171826.

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Abstract:
Health Tech company Dynamic Code AB provides a PCR test for determination of HLA DQ-genes connected to development of celiac disease. The PCR method is probe based and in real time and is at this time carried through on the, somewhat outdated, PCR instrument from Thermo Fisher/Applied Biosystems called 7300 Real-Time PCR System. The run time for this analysis on the instrument is 1 hour and 50 minutes. The Master Mix in use is TaqMan™ Gene Expression Master Mix, from the same manufacturer. Moving on to a more modern PCR instrument is a natural step for the company and is favourable in several
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Naranjo, Luis Fabian Nuñez. "Isolamento e propagação de Astrovírus, Adenovírus, Coronavírus, Parvovírus, Rotavírus e Reovírus de aves comerciais com problemas entéricos em ovos embrionados." Universidade de São Paulo, 2012. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10133/tde-08102012-161644/.

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Abstract:
Os ovos embrionados são estruturas complexas compostas pelo embrião e as membranas de suporte (corioalantóide, amniótica, gema). O desenvolvimento embrionário e suas membranas geram diversos tipos de células que são necessárias para a replicação bem sucedida de uma grande variedade de vírus. Dentre os vírus entéricos, os ovos embrionados foram usados como o principal hospedeiro para o isolamento, cultivo e propagação da grande maioria destes. O presente trabalho descreve o isolamento, cultivo e propagação em ovos embrionados livres de patógenos específicos (SPF), assim como a caracterização ma
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Silva, Sheila Oliveira de Souza. "Padronização de uma reação em cadeia pela polimerase em nested (nested-PCR) para detecção e diferenciação das espécies de Cryptosporidium spp e caracterização molecular de Cryptosporidium isolados de roedores sinantrópicos." Universidade de São Paulo, 2011. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-24042012-151514/.

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Abstract:
Cryptosporidium spp são protozoários cosmopolita que acometem peixes, répteis, anfíbios, aves e mamíferos. Mais de 20 espécies são reconhecidas dentro deste gênero. Os roedores, grupos de organismos abundantes e ubíquos, têm sido considerados reservatórios de Cryptosporidium para humanos e animais de produção. As seqüências codificadoras da menor unidade ribossômica (18S rRNA) de Cryptosporidium spp caracterizam-se por intercalações entre regiões conservadas e polimórficas ao longo dos seus 1700 pares de bases. O objetivo deste estudo foi desenhar primers específicos para o gene 18S rRNA, pot
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Abujamra, Tereza. "Detecção de agentes bacterianos envolvidos nos quadros de aerossaculite em perus através da reação em cadeia pela polimerase (PCR)." Universidade de São Paulo, 2010. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-15122011-113034/.

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Abstract:
Considerando a crescente importância econômica da exportação de carne de peru e os desafios sanitários que surgem com o aumento da produção desta espécie, o presente projeto propõe a detecção dos agentes bacterianos em perus apresentando quadro de aerossaculite, através da reação em cadeia pela polimerase (PCR). Um total de 201 suabes de sacos aéreos foram coletados a partir das carcaças de perus em um abatedouro comercial localizado no Centro Oeste do Brasil. Os suabes foram submetidos a PCR para detecção de Bordetela avium, Pasteurela multocida, Ornithobacterium rhinotracheale, Mycolplasma.
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Arraes, Ana Carolina Palmeira. "Detecção da diversidade molecular de Candida spp. isoladas de UTI neonatal." reponame:Repositório Institucional da UFBA, 2013. http://www.repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/11817.

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Abstract:
Submitted by Hiolanda Rêgo (hiolandar@gmail.com) on 2013-06-10T20:55:35Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_ICS_ Ana Carolina Arraes.pdf: 1876812 bytes, checksum: c4740a70b3675be50d2ebafeb0ba8fe3 (MD5)<br>Made available in DSpace on 2013-06-10T20:55:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_ICS_ Ana Carolina Arraes.pdf: 1876812 bytes, checksum: c4740a70b3675be50d2ebafeb0ba8fe3 (MD5)<br>CAPES<br>A incidência de candidemia tem aumentado nos últimos anos e o espectro das espécies de Candida tem mudado com a emergência das espécies não-albicans e com o aumento da resistência antifúngica. A técn
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Blackstone, Vivienne Eve. "Investigations of the PCI5-Initiated Polymerisation of the Phosphoranimine C13P=NSiME3." Thesis, University of Bristol, 2007. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.499917.

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Hipólito, Janayna Roriz. "Diagnóstico molecular para malária por nestedpcr e pcr em tempo real." Universidade Federal do Amazonas, 2006. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/2242.

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Abstract:
Made available in DSpace on 2015-04-11T13:38:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Janaina Roriz Hipolito.pdf: 4312682 bytes, checksum: ecb7ef268b16e006660e9770d5f663b4 (MD5) Previous issue date: 2006-07-28<br>Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas<br>A malária é um problema de saúde pública na região Amazônica, mais de 200 mil casos dessa doença ocorrem anualmente no Amazonas, sendo 80% deles causados pelo P. vivax, que vem apresentando índices crescentes de morbidade, principalmente associados à diminuição da sensibilidade aos antimaláricos. Dentre as estratégias para
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Melo, Cláudia Moura de. "Analise da variação intra-especifica em linhagens brasileiras de Schistosoma mansoni (Sambon, 1907) atraves de RAPD-PCR e RAP-PCR." [s.n.], 2001. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/316090.

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Orientadores : Vanderlei Rodrigues, Luiz Candido de Souza Dias<br>Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia<br>Made available in DSpace on 2018-07-28T23:40:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Melo_ClaudiaMourade_D.pdf: 21271243 bytes, checksum: e521441608321ceb6dde5db11e7107b2 (MD5) Previous issue date: 2001<br>Resumo<br>Resumo: Variações fenotípicas intra e inter-populacionais de Schistosoma mansoni ocorrem em várias áreas geográficas. A heterogeneidade genética do parasita contribui para a observada variação fenotípica na interação parasita-hospedeiro, desempe
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