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Academic literature on the topic 'Détection des rangées de cultures'
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Journal articles on the topic "Détection des rangées de cultures"
1
DesRochers, Pierre, Vicky Huppé, Jean-Marc Leclerc, and Pierre Chevalier. "La mérule pleureuse, Serpula lacrymans : revue de la situation historique et des interventions possibles." Article de synthèse 97, no. 1 (July 13, 2017): 44–53. http://dx.doi.org/10.7202/1046726ar.
Full textAbstract:
À la suite de la médiatisation de cas récents de contamination domiciliaire par la mérule pleureuse, Serpula lacrymans, nous examinons la prévalence historique de celle-ci au Canada à partir de données provenant des herbiers mycologiques et des collections de cultures de Ressources naturelles Canada en comparaison avec celle rapportée en Europe et aux États-Unis. À partir des connaissances développées en Europe sur la mérule, nous décrivons sa biologie, sa détection, la prévention de sa contamination et la restauration des bâtiments affectés dans le contexte réglementaire québécois et canadien.
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Sitterlé, E., C. Rodriguez, J. M. Costa, N. Fauchet, E. Dannaoui, and F. Botterel. "Détection et quantification de la variabilité génétique de cyp51a chez Aspergillus fumigatus dans des cultures primaires de prélèvements respiratoires." Journal de Mycologie Médicale 25, no. 2 (June 2015): e101. http://dx.doi.org/10.1016/j.mycmed.2015.02.016.
Full text
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Yattara, Almouner A. A., Amadou K. Coulibaly, and Frédéric Francis. "Diversité et abondance des pucerons [Homoptera : Aphididae] et leur impact sur la dissémination des virus infectant la pomme de terre au Mali." Phytoprotection 94, no. 1 (May 2, 2014): 1–7. http://dx.doi.org/10.7202/1024719ar.
Full textAbstract:
Des études sur l’abondance et la diversité des pucerons ont été menées pendant trois campagnes agricoles au Mali. Sur la base de relevés de bacs jaunes installés dans des cultures de pomme de terre à Kati et à Sikasso, 2 525 pucerons ont été capturés et identifiés. Dix-neuf espèces de pucerons ont été recensées, dont deux qui ont été observéesin situsur la culture :Aphis gossypii(Glover) etMyzus persicae(Sulzer). La plupart de ces espèces sont des ravageurs de cultures et elles contribuent également à la transmission virale. Des échantillons foliaires prélevés dans des parcelles de pomme de terre dans les deux régions ont été testés par la technique ELISA pour la détection des deux principaux virus dommageables, soit lePotato VirusY (PVY) et lePotato Leaf Roll Virus(PLRV). Le taux de plantes virosées dans les deux localités pendant les trois années variait de 19,3 % à 21,8 % pour le PVY, alors qu’il était de 8,5 % à 9,3 % pour le PLRV. L’occurrence de ces maladies virales s’est révélée être très homogène d’une année à l’autre, avec des taux relativement importants. Cette étude est une première quantification dans cette région du Mali de l’importance des relations pucerons vecteurs–virus en culture de pomme de terre.
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Codjo Jacques, HOUNDETE, ASSONGBA Yédjanlognon Faustin, YOKA Joseph, and DJEGO Julien Gaudence. "Importance de l’association de cultures face aux variabilités climatiques dans les collines au Benin." Journal of Applied Biosciences 150 (June 30, 2020): 15403–18. http://dx.doi.org/10.35759/jabs.150.3.
Full textAbstract:
Objectif : Cette étude vise à estimer les performances agronomiques de la production du mais par association à une espèce de la famille des cucurbitacaea «goussi» en vue de l’exploitation des processus écologiques. Méthodologie et résultats : les essais ont été installés en champs paysans sur un sol ferrugineux tropical dans deux (2) villages de la commune de Glazoué. Le dispositif expérimental est en blocs aléatoires complets (BAC) avec deux répétitions ou blocs. Chaque bloc est subdivisé en deux parcelles élémentaires abritant chacune un traitement. Les traitements sont du maïs en culture pure (Témoin absolu T0) et maïs en association avec goussi (Test T1). Les données climatiques, agronomiques et de rentabilité financière ont été collectées sur cette expérimentation. En matière de résultat, il ressort que l’humidité au niveau des parcelles du système de l’association de maïs et goussi est supérieure à celle des parcelles du système de culture pure de maïs et ceci durant tous les temps de collectes. Le poids des épis était le plus élevé pour l’association maïs et goussi de même que pour tous les autres paramètres (le nombre de rangées par épis, le nombre de grains par épis et le poids de 100 graines). Conclusion et application des résultats : la pratique agricole qui constitue à associer deux espèces végétales domestiquées Zea mays L. de la famille des Poaceaes et Citrullus lanatus (Thunb.) de la famille des Cucurbitaceae est une des meilleures stratégies mises en place par les producteurs pour les impacts des changements climatiques. Mots clés : Mélange de culture ; variabilité climatique ; maïs-goussi ; rentabilité et Citrullus lanatus Importance of the association of crops facing climate variability in the hills in Benin ABSTRACT Objective: This study aims to estimate the agronomic performance of corn production by association with a species of the cucurbitacaea family "goussi" for the exploitation of ecological processes. Methodology and results: the trials were set up in peasant fields on tropical ferruginous soil in two (2) villages in the commune of Glazoué. The experimental setup is in complete random blocks (BAC) with two repetitions or blocks. Each block is subdivided into two elementary plots, each housing a treatment. The treatments are corn in pure culture (absolute control T0) and corn in association with goussi (Test T1). Climatic, agronomic and financial profitability data were collected on this experiment. In terms of results, it appears that the humidity in the plots of the system of the association of maize and goussi is higher than that of the plots of the system of pure cultivation of corn and this during all the times of collections. The weight of the cobs was highest for the corn and goussi combination as well as for all the other parameters (the number of rows per cob, the number of grains per cob and the weight of 100 seeds). Conclusion and application of the results: the agricultural practice, which consists in associating two domesticated plant species Zea mays L. of the family Poaceae and Citrullus lanatus (Thunb.) of the family Cucurbitaceae is one of the best strategies implemented by producers to the impacts of climate change. Keywords: Mixed cropping; climate variability; Maize-goussi; profitability and Citrullus lanatus
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Vaudour, Emmanuelle, Paul-Emile Noirot-Cosson, and Olivier Membrive. "Apport des images satellitaires de très haute résolution spatiale Pléiades à la caractérisation des cultures et des opérations culturales en début de saison." Revue Française de Photogrammétrie et de Télédétection, no. 208 (September 5, 2014): 97–103. http://dx.doi.org/10.52638/rfpt.2014.106.
Full textAbstract:
Cette étude s'inscrit dans des programmes de recherche visant à surveiller spatialement l'effet des apports de produits résiduaires organiques sur les stocks de carbone des sols, et nécessitant pour cela le recueil de données spatialisées sur les systèmes de culture. L'objectif de cette étude est celui d'évaluer, au niveau d'organisation spatiale des parcelles culturales, l'apport des images satellitaires de Très Haute Résolution Spatiale (THRS) Pléiades à l'identification des cultures à des stades de développement précoce d'une part, à la détection des changements d'état de surface des sols nus liés aux opérations culturales, d'autre part. La région d'étude, vaste d'environ 4000 ha, dont 2100 ha de surface agricole utile, est située à l'ouest du territoire périurbain francilien de la Plaine de Versailles et du Plateau des Alluets (PVPA) (Yvelines). Environ 100 parcelles culturales ont fait l'objet d'observations de terrain synchrones des prises de vue des deux images Pléiades acquises les 3 et 24 avril 2013 et d'une image SPOT4 acquise le 2 avril 2013. La structuration géomatique de ces données acquises sur le terrain a servi à délimiter des zones susceptibles de servir à l'entraînement ou la validation des résultats de classification assistée par machine à support de vecteurs à noyau polynomial (pSVM). La classification pSVM a été mise en œuvre sur les 4 bandes spectrales assorties du NDVI pour les images monodates, et pour les 8 bandes spectrales assorties de 2 bandes NDVI pour l'image bi-temporelle Pléiades. Pour les classifications monodates des cultures, la précision totale atteint 87% pour l'image SPOT4 du 2 avril (6 classes), 79% pour l'image Pléiades du 3 avril (6 classes) et 85% pour celle du 24 avril (7 classes). Pour la classification bitemporelle (7 classes), la précision totale est de près de 80%, avec des cultures d'hiver très bien discriminées tandis que les confusions opèrent entre l'orge de printemps aux stades 2-3 feuilles et les sols nus préparés pour les autres cultures de printemps. A la date la plus précoce (2-3 avril), l'image Pléiades discrimine bien les opérations culturales (précisions utilisateur et producteur >77%), les jachères et les prairies et renseigne sur l'hétérogénéité spatiale des stades de développement des cultures, tandis que les céréales d'hiver et le colza sont mieux détectés sur l'image SPOT4 (précisions utilisateur et producteur >70%). Les images Pléiades apportent donc des informations complémentaires à celles des images multispectrales de haute résolution spatiale.
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Gervelmeyer, A., H. Abu Ajarnijeh, E. Bani Younis, O. Anasweh, N. Bzour, R. Akasheh, Peter-Henning Clausen, C. Staak, and G. Monreal. "Production d'anticorps de jaune d'oeuf antiviraux spécifiques pour le diagnostic de la maladie de Newcastle, de la bronchite infectieuse et de la maladie de Gumboro par le test d'immunofluorescence directe." Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux 51, no. 1 (January 1, 1998): 5–9. http://dx.doi.org/10.19182/remvt.9652.
Full textAbstract:
Les possibilités d'utilisation d'anticorps de jaune d'oeuf (IgY) pour la détection des virus de la maladie de Newcastle (NDV), de la bronchite infectieuse (IBDV) et de la maladie de Gumboro (IBDV) par le test d'immunofluorescence directe ont été examinées. Des poules pondeuses ont été immunisées avec différents vaccins commerciaux à NDV, IBV et IBDV inactivés. L'immunisation a donné des titres élevés d'anticorps spécifiques dans le jaune d'oeuf à partir de 4 à 8 semaines après l'immunisation initiale, et ce durant une période d'environ 20 semaines. Les IgY ont été extraites du jaune d'oeuf par précipitation au sulfate d'ammonium, puis purifiées par la méthode de chromatographie d'affinité, donnant 1,46 mg d'IgY spécifique par jaune d'oeuf en moyenne. Après marquage avec l'isothiocyanate de fluorescéine (FITC) la sensibilité et la spécificité des conjugués ont été évaluées sur des cultures cellulaires sur des lamelles couvre-objets. Dans le test d'immunofluorescence directe, les conjugués dilués au 1 : 8 ou au 1 : 4 avec du PBS réagissaient spécifiquement avec l'antigène homologue dans des calques d'organes de poussins infectés expérimentalement et dans des cultures cellulaires sur des lamelles couvre-objets. Aucune réaction n'a été observée avec des antigènes hétérologues. La fluorescence non spécifique était facilement éliminée par une absorption avec de la poudre de foie. En conclusion, ces résultats montrent que les IgY marquées avec FITC peuvent être produites en grandes quantités de manière facile et économique. Pour le diagnostic de NDV, IBV et IBDV, les anticorps de jaune d'oeuf constituent donc une excellente alternative à la production d'anticorps fluorescents à partir du sang de lapins ou de poules, notamment pour les laboratoires ayant des moyens financiers limités.
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Gagnon, Christine, Jérôme Lemaître, Gilles Lupien, and Junior A. Tremblay. "Mise en place d’un inventaire spécifique du hibou des marais pour le Québec." Hiboux et nyctales 139, no. 1 (December 3, 2014): 12–16. http://dx.doi.org/10.7202/1027665ar.
Full textAbstract:
Les populations nord-américaines du hibou des marais (Asio flammeus) sont en déclin depuis les années 1970 et le statut de l’espèce préoccupe plusieurs administrations. Les inventaires traditionnels représentent mal les patrons d’abondance de cette espèce, à cause de son comportement nomade. L’objectif de l’étude était de développer et de mettre en place un programme d’inventaire spécifique à l’espèce afin de documenter sa présence sur le territoire. Au Québec, le Saguenay–Lac-Saint-Jean semble être une région propice à la nidification de l’espèce. Nous avons sélectionné les sites d’observation en combinant les observations historiques avec les données sur les cultures fourragères. Nous avons réalisé 2 phases d’inventaire par site, de 3 visites chacune. En 2012, 7 des 8 sites étaient occupés durant la phase de migration et de formation des couples, contre 3 sur 9 l’année suivante. Durant la phase de nidification, 3 sites sur 8 étaient occupés en 2012 et 1 des 9 sites l’était en 2013. Nos résultats indiquent que la méthodologie permet de maximiser la détection de l’espèce. Deux visites par phase semblent toutefois suffisantes pour détecter la présence de l’espèce dans 1 site. Enfin, par l’intermédiaire de ce projet, les ornithologues amateurs et les agriculteurs contribuent à la préservation de l’espèce.
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Shaw, A. E., H. Marqardt, A. Lukas, and P. P. C. Mertens. "Commercialisation d'un test RT-PCR en temps réel pour une détection globale de la fièvre catarrhale ovine." Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux 62, no. 2-4 (February 1, 2009): 121. http://dx.doi.org/10.19182/remvt.10032.
Full textAbstract:
The arrival of bluetongue virus serotype 8 (BTV-8) in Northern Europe (2006), followed by BTV-1, 6 and 11 (2008-09), has resulted in an unprecedented epidemiological situation, which (like the earlier situation in Southern Europe and the Mediterranean region) requires rapid and accurate diagnosis to monitor and help control virus transmission and spread. Reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) assays and molecular sequencing have increasingly become accepted as front line tools for the analysis and investigation of BTV outbreaks. The increasing number of BTV sequences that are now available provides a basis for molecular epidemiology studies to characterize new incursions into Europe and neighbouring regions, for real-time tracing of virus movement and development of additional diagnostic tools. The resolution and therefore the impact of molecular epidemiology will inevitably increase still further as more sequence data become available. However, although most individual BTV isolates from a single outbreak will not be fully sequenced, it is still important to identify infected animals as rapidly as possible in order to help control disease spread. Real-time RT-PCR is a very rapid, high throughput and effective method for detection of viral ribonucleic acid (RNA) (and thus infection) in blood / tissue samples, cell cultures and vector insects. Real-time RT-PCR is not affected by the immune status of the animal, or by vaccination with inactivated BTV vaccines. It has therefore become very important for investigation of suspected clinical cases, as well as screening animals for importation. In order to be fully effective, these diagnostic capabilities must also be concordant across different laboratories. An assay developed at the Institute for Animal Health (IAH), has recently been commercialized in collaboration with Qiagen. Pre-production test kits were initially assessed without denaturation of RNA samples and their sensitivity was below that of the original IAH assay. The assay in this format also failed to detect several weak positive blood samples received by the Community Reference Laboratory at Pirbright, despite an internal positive control signal confirming the absence of inhibition. Heat denaturation of these weak positive samples, before adding the mastermix, increased detection sensitivity of these samples. A denaturation step was therefore included in all further experiments. These data indicate that BTV RNA present in non-clinical, convalescent cases is double stranded and is therefore derived primarily from viral particles, not from actively replicating viral mRNA. The sensitivity and specificity of the optimized assay were subsequently evaluated. Probit analysis using in vitro transcribed RNA copies indicated that the limit of detection was 0.85 copy per microlitre of sample, equal to 8.5 copies per reaction. Further testing showed that assay specificity equalled that of the original IAH assay. It efficiently detected all 24 established BTV types with no detection of non-BTV RNAs, including genetically and clinically related viruses (epizootic haemorrhagic disease, African horse sickness, foot-and-mouth disease, and vesicular stomatitis viruses), or the ruminant hosts. A 100% concordance was observed with the IAH assay when a batch of samples from Libya were tested using the optimized Qiagen assay. This represents a commercially available assay that is fully compatible with different high throughput systems. This assay potentially allows greater concordance between different laboratories that will integrate well with molecular epidemiology investigations of virus origin and movement.
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Kamga, Eléonore, André Kamga, Fritz Tabi Oben, Eléazar Tchemtchoua, and Georges Etame Kossi. "Culture du café robusta (Coffea canephora): risques liés à la variabilité et au changement climatique dans le bassin de production du Moungo, Littoral-Cameroun." International Journal of Biological and Chemical Sciences 16, no. 1 (June 8, 2022): 353–66. http://dx.doi.org/10.4314/ijbcs.v16i1.30.
Full textAbstract:
Le climat est l’un des facteurs les plus importants de la production des cultures. Il influence tant positivement que négativement l’ensemble des activités agricoles et a une action marquée sur le rendement des cultures. Les changements présents dans les éléments constituant le climat permettent de comprendre le niveau de productivité actuel, de concevoir et/ou modifier les pratiques des producteurs. L’objectif de cette étude était de déterminer l’effectivité d’un changement du climat et d’identifier les risques possibles de ces changements climatiques sur la culture du Café Robusta. La série de données de 44 ans (1974 -2017) pour les précipitations et le nombre de jours de pluie, celle de 38 ans (1980 - 2017) pour les températures moyennes et celle de 37 ans (1981 -2017) pour l’humidité relative moyenne, ont été obtenues à la station météorologique de Nkongsamba. Ces séries ont été ensuite découpées en deux périodes de 30 ans chacune. La détection des changements dans les séries s’est faite par le logiciel changepoint.np de R et la méthode PELT, tandis que la comparaison des deux périodes de 30 ans chacune s’est faite à l’aide du test de Student et celui de Wilcoxon. Les résultats ont montré que les changements climatiques sont réels dans le bassin de production du Moungo. Ils sont caractérisés par l’augmentation des températures moyennes de 0,9°C, couplée à une réduction de 20 jours de pluie et la baisse de 1,3% de l’humidité relative. Par ailleurs une réduction de 10 jours de pluies entre les deux périodes de 30 ans a été observée. Elle est couplée à une augmentation des températures moyennes de 0,8°C. Les risques causés par ces changements sur la culture du café robusta sont légers. Toutefois ces changements concourent aux conditions favorables de développement du principal ravageur du caféier Hypothenemus hampei. L’association du café avec des espèces agroforestières, ainsi qu’une protection phytosanitaire adéquate, peut réduire la pression du ravageur et augmenter les rendements du café.
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Dubreuil, Vincent, Damien Arvor, and Nathan Debortoli. "Monitoring the pioneer frontier and agricultural intensification in Mato Grosso using SPOT vegetation images." Revue Française de Photogrammétrie et de Télédétection, no. 200 (April 19, 2014): 2–11. http://dx.doi.org/10.52638/rfpt.2012.56.
Full textAbstract:
La production de soja a augmenté de manière considérable les dix dernières années au Mato Grosso, atteignant 17,9millions de tonnes en 2009 (contre 7,2 en 1998). Une telle expansion a eu de graves conséquences environnementales et socio-économiques, telles que la déforestation et l'urbanisation. L'objectif de cet article est de mettre en avant l'efficacité des techniques de télédétection et des indices qui en découlent, tels que le NDVI, pour analyser l'avancée des champs de soja au Mato Grosso ainsi que la transformation de l'agriculture dans cetÉtat. L'indice NDVI a été calculé à partir de séries mensuelles du capteur SPOT-Vegetation. Il a permis de trouver les zones cultivées et de surveiller la croissance des cultures. Il a aussi permis la détection des pratiques de gestion de double culture, qui se sont drastiquement accrues depuis quelques années. Les résultats ont montré une corrélation de 0,98 entre notre estimation des zones cultivées et les statistiques agricoles officielles de l'IBGE pour l'intégralité du Mato Grosso. Les séries temporelles de NDVI ont également confirmé l'augmentation des systèmes de double culture, représentant 30% des zones cultivées en 1999, 57% en 2006 et 67% en 2009. Cette évolution est un indicateur de la diversification de l'agriculture et de l'intensification des traitements dans cette région. En outre, la surveillance des grandes clairières récentes au niveau local (comté de Vera) a montré une réduction de l'écart entre trois états consécutifs conduisant à l'intensification des pratiques agricoles. En se fondant sur notre méthodologie, nous avons finalement proposé une classification des municipalités selon leurs modes d'usages du sol dominants.
Dissertations / Theses on the topic "Détection des rangées de cultures"
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Bah, Mamadou Dian. "Détection des adventices par imagerie aérienne." Thesis, Orléans, 2020. http://www.theses.fr/2020ORLE3190.
Full textAbstract:
Dans le contexte agricole actuel, il est nécessaire de réduire l’utilisation des produits phytosanitaires contre les mauvaises herbes. Le désherbage localisé présente une alternative prometteuse pour limiter les coûts et l’impact environnemental. Cependant, la localisation automatique des adventices n’est pas une tâche facile car elle présente plusieurs défis scientifiques et technologiques. L’objectif de cette thèse est de proposer des méthodes de traitement d’images et d’intelligence artificielle pour la localisation des adventices en grandes cultures. Dans ce cadre, nous avons abordé deux problématiques, la détection des rangées de culture et la détection des adventices. Deux méthodes ont été proposées pour la détection des rangées de culture. La première méthode combine la transformée de Hough et l’algorithme de regroupement linéaire itératif SLIC. La deuxième, quant à elle, utilise une approche totalement nouvelle basée sur l’apprentissage profond. Ces deux méthodes ont été utilisées pour détecter les adventices inter-rang et celles qui sont en contact avec les rangées de culture. Pour tendre vers une meilleur efficacité, deux nouvelles méthodes de détection d’adventices par apprentissage machine, entièrement automatiques ont été développées. L’originalité de ces méthodes est que l’apprentissage est effectué sur des données annotées automatiquement. La première méthode est basée sur l’apprentissage profond tandis que la seconde génère des modèles à partir de descripteurs profonds et un classifieur à classe unique. Les résultats obtenus sur des données réelles montrent l’intérêt des approches proposéesIn the current agricultural context, there is a need to reduce the use of pesticides for weed control. Localized weed control presents a promising option to limit costs and environmental impact. However, automatic weed detection is not an easy task and presents several scientific and technological challenges. The objective of this thesis is to propose image processing and artificial intelligence methods for weed detection in field crops. Within this framework, we addressed two issues, crop row detection and weed detection. Two methods were proposed for crop row detection. The first method combines the Hough transform and the simple linear iterative clustering SLIC. The second one uses a completely new approach using deep learning. Both methods were used to detect inter-row weeds and weeds in contact with crop rows. To achieve greater efficiency, two new fully automatic machine learning weed detection methods have been developed. The originality of these methods is that learning is carried out on automatically annotated data. The first method is based on deep learning while the second method generates models from deep features and one-lass classifier. The results obtained on real data show the interest of the proposed approaches
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Lebeuf, Maria. "Gestion des risques de contamination et leur détection en animalerie axénique." Master's thesis, Université Laval, 2021. http://hdl.handle.net/20.500.11794/69051.
Full textAbstract:
L'usage d'animaux axéniques comme modèles a augmenté exponentiellement dans les dernières années en recherche expérimentale. Afin de conserver leur statut axénique, les animaux doivent être contenus dans des isolateurs traditionnels ou des isolateurs au niveau de la cage, incluant la cage scellée à pression positive de Tecniplast : l'Isocage. Cependant, le moyen le plus efficace de confirmer leur statut axénique des animaux reste incertain, particulier pour les isolateurs au niveau de la cage, comportant un plus grand risque de contamination que l'isolateur traditionnel en raison de leur contact plus fréquent avec l'environnement extérieur. Ce projet de maîtrise a pour buts de gérer le risque de contamination associé à l'Isocage en optimisant la désinfection par immersion et en déterminant l'efficacité des mesures de précautions axéniques, puis finalement de déterminer l'efficacité des mesures de détection à démontrer la présence de contaminants en cages axéniques Les travaux d'optimisation de la désinfection par immersion a permis de déterminer la charge microbienne résiduelle retrouvée à la surface des Isocages entre deux changements de cage, d'évaluer l'efficacité sporicide de deux désinfectants, et finalement de déterminer le temps optimal de désinfection pour l'immersion des cages axéniques lors d'un changement de cage selon la concentration du désinfectant utilisé. L'efficacité de mesures de précaution axéniques a été confirmée en comparant les flores microbiennes retrouvées à la surface de cages contenues dans des locaux axéniques et non axéniques. L'efficacité des mesures de détection à démontrer la présence de contaminants en Isocage a été déterminée en développant, validant et optimisant trois différentes méthodes, puis en testant in situ leur efficacité à détecter des contaminants artificiellement introduits dans des cages axéniques. Cet ouvrage constitue un apport important au domaine puisqu'il est l'un des premiers à aborder la gestion des risques et l'efficacité des méthodes de détection lors d'utilisation de l'Isocage et du bassin d'immersion annexé à la station de biosécurité avec des animaux axéniques.The use of axenic animals as models have increased exponentially in recent years in experimental research. In order to maintain their axenic status, animals must be contained in traditional isolators or isolators at the cage level, which includes Tecniplast's sealed positive pressure Isocage. However, the most effective way to confirm animal axenic status remains uncertain, especially for cage-level isolators, which carry a greater risk of contamination than the traditional isolator due to their most frenquent contact with outer environment. This Master's project aims were to manage the risk of contamination associated with Isocage by optimizing disinfection by immersion and determining the effectiveness of axenic precautionary measures; then finally to determine the effectiveness of the detection measures to demonstrate the presence of microbial contaminants in axenic Isocages. The optimization of disinfection by immersion made it possible to determine the residual microbial load found on the surface of Isocages between two cage changes, to evaluate the sporicidal efficiency of two disinfectants, and finally to determine the optimal disinfection time for the immersion of the axenic cages during a change of cage depending on the concentration of disinfectants used. The effectiveness of axenic precautionary measures has been confirmed by comparing the microbial flora found on the surface of cages contained in axenic and non-axenic rooms. The effectiveness of detection measures to demonstrate the presence of contaminants in Isocage has been determined by developing, validating and optimizing three different methods, then by testing in situ their effectiveness to detect contaminants artificially introduced into axenic cages. This work constitutes an important contribution to the field since it is one of the first to discuss risk management and the effectiveness of detection methods when using Isocage and the immersion basin attached to the biosecurity station with axenic animals.
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Galopin, Élisabeth. "Adressage par microfluidique digitale : application à la détection de marqueurs biologiques par plasmon de surface et détection intégrée." Lille 1, 2007. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/2007/50376-2007-223.pdf.
Full textAbstract:
Ce travail porte sur la conception d'éléments d'un laboratoire sur puce pour la détection sensible de protéines. Pour travailler sur de petits volumes d'échantillons et à concentrations faibles, la microfluidique discrète et en particulier, les ondes acoustiques de surface (SAW) ont été choisies. Nous mettons en évidence les effets bénéfiques d'un mélange SAW sur les interactions biologiques: diminution des constantes d'interactions avec des surfaces actives, et l'amélioration d'un facteur 300 des temps de mélange en goutte. Les caractérisations et les simulations réalisées justifient l'utilisation des SAW comme méthode d'adressage fluidique pour améliorer l'interaction entre le liquide à analyser et les surfaces actives de détection. Des simulations par éléments finis (FEM) permettent d'évaluer les facteurs d'amélioration du mélange SAW pour une gamme d'interactions. Nous avons également mis en place un concept original de plasmon de surface en goutte couplé à la plateforme microfluidique digitale. Ceci permet d'allier une détection temps réel et sans marquage à l'adressage fluidique par SAW. La volonté d'intégrer un système de détection au sein de la plateforme microfluidique a aussi mené à la réalisation de dispositifs SAW fonctionnant jusqu'à 5GHz. Leur utilisation comme nanobiodétecteur est validée pour des sensibilités picomolaires. Un système complet comprenant une culture de cellules en goutte, l'actionnement microfluidique, ainsi qu'une zone de détection intégrée est enfin proposé.
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Fould, Sabine. "Détection dans le sol de Pasteuria penetrans, parasite obligatoire des nématodes phytoparasites du genre Meloidogyne et influence des facteurs telluriques abiotiques sur la distribution du complexe parasitaire." Lyon 1, 1999. http://www.theses.fr/1999LYO10333.
Full textAbstract:
Pasteuria penetrans est une bacterie non cultivable in vitro, parasite obligatoire des nematodes phytoparasites du genre meloidogyne. Elle controle ces ravageurs de cultures en limitant leur reproduction. L'objectif de l'etude ecologique in situ du complexe parasitaire meloidogyne javanica-p. Penetrans est d'optimiser l'efficacite, souvent heterogene, de ce parasitoide indigene. Le suivi de cette bacterie dans le sol a necessite sa caracterisation prealable. L'analyse moleculaire demontre l'appartenance du genre pasteuria a la famille des bacillacees et rapproche p. Penetrans des bacteries de type bacillus thuringiensis, parasites d'insectes. Elle a egalement permis le developpement d'une methode de detection immunologique de p. Penetrans au seuil de 5000 sp/g de sol. L'evolution spatio-temporelle des populations de m. Javanica parasitees ou non et des spores de p. Penetrans fut suivie dans une parcelle naturellement infestee. Cette etude revela une diminution des populations totales de m. Javanica, correlee a celle des populations parasitees, phenomene caracteristique d'une regulation des populations de type densite-dependance retardee. La distribution spatiale de la population de nematodes parasites ne se recouvrant pas avec celle de la bacterie, des facteurs responsables furent recherches dans le sol. Une analyse multivariee relie le parasitisme aux ions de la solution de sol et a la structure et la texture du sol. La fraction ionique du sol agit directement sur le parasitisme en participant au mecanisme d'attachement des spores de p. Penetrans sur la cuticule des nematodes, la teneur en cations divalents reduisant la charge negative de surface des spores. En revanche, la structure et la texture agiraient indirectement sur l'attachement en controlant la rencontre des deux organismes. Ainsi, peut etre envisagee une meilleure maitrise des agents de lutte biologique comme p. Penetrans a travers la gestion des facteurs telluriques abiotiques.
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Renouard, Catherine. "Comparaison de deux méthodes de diagnostic direct du cytomégalovirus : isolement du virus en culture cellulaire, détection d'antigènes très précocés du CMV dans les cultures cellulaires." Paris 5, 1990. http://www.theses.fr/1990PA05P184.
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Guénette, Caroline. "Évaluation du potentiel de l’infrarouge spectral pour la détection hâtive du stress nutritif chez les végétaux de grandes cultures. Application à la culture de la pomme de terre." Thesis, Université Laval, 2003. http://www.theses.ulaval.ca/2003/21037/21037.pdf.
Full textAbstract:
À l’heure actuelle, la gestion des fertilisants dans les productions agricoles est un sujet auquel les producteurs et les gestionnaires accordent beaucoup d’attention. La sur-utilisation des fertilisants engendre des coûts environnementaux et financiers importants qui ont récemment mené à une législation, aussi fédérale que provinciale, dans ce domaine.
Pour en arriver à l’utilisation optimale des fertilisants azotés, ce sont les carences des végétaux qui doivent être évaluées correctement. Ce projet de recherche vise à évaluer le potentiel de détection des carences nutritives en azote chez la pomme de terre par la télédétection spectrale infrarouge.
Pour atteindre notre objectif, nous avons effectué une campagne de mesure en serre où le plan expérimental était sous forme de mesures répétées. Quatre niveaux de carences nutritives en azote ont été induits chez des plants de pomme de terre. Le stress causé par la carence nutritive chez les plants a été mesuré selon des techniques agronomiques et des techniques de télédétection, incluant la spectroscopie infrarouge.
Une fois le potentiel de détection des carences évalué pour chaque technique, c’est la comparaison entres elles qui permet de déterminer lesquelles mèneront à la discrimination la plus hâtive dans la saison de croissance.
Une combinaison optimale d’indice est identifiée et sa capacité de discrimination est quantifiée par une analyse discriminante. La recherche conclut à une amélioration notable du potentiel de discrimination du stress causé par une carence nutritive en azote en combinant 3 indices de télédétection spectrale.At the present time, the management of fertilizers in the agricultural productions is a subject on which producers and administrators grant much attention. The overuse of fertilizers generates important environmental and financial costs which recently lead to both federal and provincial legislations in this field. To gain optimal use of nitrogenized fertilizers, one must evaluate correctly the plant‘s deficiencies. This research project aims at evaluating the potential of detection of the nutritive nitrogen deficiency on potato plants by the use of infra-red spectral remote sensing. To achieve our goal, we performed repeated measurements in a greenhouse experimental setup. Four levels of nitrogen deficiencies were induced on potato plants. The stress caused by the nutritive deficiency was measured according to agronomic techniques and remote sensing techniques, including the infra-red spectroscopy. Once the potential of detection evaluated for each technique, the comparison among them made it possible to determine which technique(s) allowed the hastiest discrimination during the growing season. An optimal combination of index has been identified. Its capacity of discrimination between levels of nitrogen deficiency has been quantified by a discriminant analysis. Research concludes with a notable improvement of discrimination potential by combining three remote sensing index.
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Guénette, Caroline. "Évaluation du potentiel de l'infrarouge spectral pour la détection hâtive du stress nutritif chez les végétaux de grandes cultures. Application à la culture de la pomme de terre." Master's thesis, Université Laval, 2003. http://hdl.handle.net/20.500.11794/17814.
Full textAbstract:
À l’heure actuelle, la gestion des fertilisants dans les productions agricoles est un sujet auquel les producteurs et les gestionnaires accordent beaucoup d’attention. La sur-utilisation des fertilisants engendre des coûts environnementaux et financiers importants qui ont récemment mené à une législation, aussi fédérale que provinciale, dans ce domaine. Pour en arriver à l’utilisation optimale des fertilisants azotés, ce sont les carences des végétaux qui doivent être évaluées correctement. Ce projet de recherche vise à évaluer le potentiel de détection des carences nutritives en azote chez la pomme de terre par la télédétection spectrale infrarouge. Pour atteindre notre objectif, nous avons effectué une campagne de mesure en serre où le plan expérimental était sous forme de mesures répétées. Quatre niveaux de carences nutritives en azote ont été induits chez des plants de pomme de terre. Le stress causé par la carence nutritive chez les plants a été mesuré selon des techniques agronomiques et des techniques de télédétection, incluant la spectroscopie infrarouge. Une fois le potentiel de détection des carences évalué pour chaque technique, c’est la comparaison entres elles qui permet de déterminer lesquelles mèneront à la discrimination la plus hâtive dans la saison de croissance. Une combinaison optimale d’indice est identifiée et sa capacité de discrimination est quantifiée par une analyse discriminante. La recherche conclut à une amélioration notable du potentiel de discrimination du stress causé par une carence nutritive en azote en combinant 3 indices de télédétection spectrale.At the present time, the management of fertilizers in the agricultural productions is a subject on which producers and administrators grant much attention. The overuse of fertilizers generates important environmental and financial costs which recently lead to both federal and provincial legislations in this field. To gain optimal use of nitrogenized fertilizers, one must evaluate correctly the plant‘s deficiencies. This research project aims at evaluating the potential of detection of the nutritive nitrogen deficiency on potato plants by the use of infra-red spectral remote sensing. To achieve our goal, we performed repeated measurements in a greenhouse experimental setup. Four levels of nitrogen deficiencies were induced on potato plants. The stress caused by the nutritive deficiency was measured according to agronomic techniques and remote sensing techniques, including the infra-red spectroscopy. Once the potential of detection evaluated for each technique, the comparison among them made it possible to determine which technique(s) allowed the hastiest discrimination during the growing season. An optimal combination of index has been identified. Its capacity of discrimination between levels of nitrogen deficiency has been quantified by a discriminant analysis. Research concludes with a notable improvement of discrimination potential by combining three remote sensing index.
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Sirois, Charles. "Détection des mauvaises herbes dans les cultures du bleuets nains." Thèse, 2020. http://depot-e.uqtr.ca/id/eprint/9739/1/eprint9739.pdf.
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