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Dissertations / Theses on the topic 'Epigenetic chromatin modifications'

Author: Grafiati

Published: 4 June 2021

Last updated: 1 February 2022

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1

Larson, Jessica. "Hidden Markov Models Predict Epigenetic Chromatin Domains." Thesis, Harvard University, 2012. http://dissertations.umi.com/gsas.harvard:10105.

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Abstract:

Epigenetics is an important layer of transcriptional control necessary for cell-type specific gene regulation. We developed computational methods to analyze the combinatorial effect and large-scale organizations of genome-wide distributions of epigenetic marks. Throughout this dissertation, we show that regions containing multiple genes with similar epigenetic patterns are found throughout the genome, suggesting the presence of several chromatin domains. In Chapter 1, we develop a hidden Markov model (HMM) for detecting the types and locations of epigenetic domains from multiple histone modi

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2

SIDDIQUI, HASAN. "RB-MEDIATED REGULATION OF TRANSCRIPTION AND EPIGENETIC MODIFICATIONS." University of Cincinnati / OhioLINK, 2006. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=ucin1148053497.

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3

Barthes, Pauline. "Modifications de la chromatine associées à l'initiation de la recombinaison méiotique, chez la souris." Thesis, Montpellier 1, 2010. http://www.theses.fr/2010MON1T007.

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Abstract:

La méiose est une étape de la différenciation germinale qui permet la formation des gamètes. Elle est composée de deux divisions successives. La ségrégation des chromosomes homologues à la première division nécessite des connexions entre homologues, mises en place par des événements de crossing-over (CO). Les CO augmentent également la diversité génétique, et leur fréquence et leur distribution sont étroitement régulées. Ils sont générés par un mécanisme de formation et réparation de cassures double brins de l'ADN (CDBs), catalysées par la protéine SPO11 et préférentiellement localisées dans d

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4

Pekowska, Aleksandra. "Epigenetic landscape of normal and malignant lympho-hematopoiesis : interplays between chromatin signature and tissue specific gene expression." Thesis, Aix-Marseille 2, 2011. http://www.theses.fr/2011AIX22011.

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Abstract:

La régulation transcriptionelle fine assurée par les Eléments Cis Régulateurs (ECR, eg. promoteurs et «enhancers») et les facteurs protéiques associés, est à la base de la mise en place et le maintien de l'identité tissulaire. Les modifications de la chromatine corrèlent avec l’activité d’ECRs et constituent l’épigénome de la cellule. Au cours de ma thèse, je me suis intéressée aux transitions des modifications des histones (H3K4me1/me2/me3, H3K36me3, H3K27me3 and H3K9me2) accompagnant le développement précoce de la cellule T. Pour cela, j’ai utilisé un modèle murin reproduisant une étape cruc

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5

Villa, Raffaella. "Role of epigenetic modifications in acute promyelocytic leukemia." Doctoral thesis, Universitat Pompeu Fabra, 2007. http://hdl.handle.net/10803/7144.

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Abstract:

Mi trabajo ha estado enfocado en la implicación de los diferentes mecanismos epigenéticos de PML-RARa en la inducción de la leucemia promielocítica aguda (APL).<br/>En particular yo estudié el rol de MBD1, un miembro de la conservada familia de proteinas capaces de unirse al DNA metilado, demostrando que desempeña un papel importante en la progresión de la leucemia. De hecho, mostré que MBD1 es recruida por PML-RARa a sus promotores diana a través de los mecanismos mediados por HDAC3, participando por tanto en la represión transcripcional. Además, investigué hasta donde la metilación de la H3K

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6

Brazel, Ailbhe Jane. "A genetic and epigenetic editing approach to characterise the nature and function of bivalent histone modifications." Thesis, University of Edinburgh, 2018. http://hdl.handle.net/1842/29603.

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Abstract:

In eukaryotes, DNA is wrapped around a group of proteins termed histones that are required to precisely control gene expression during development. The amino acids of both the globular domains and unstructured tails of these histones can be modified by chemical moieties, such as methylation, acetylation and ubiquitination. The ‘histone code’ hypothesis proposes that specific combinations of these and other histone modifications contain transcriptional information, which guides the cell machinery to activate or repress gene expression in individual cell types. Chromatin immunoprecipitation (ChI

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7

Reis, Kadri 1985. "Epigenetic inheritance and DNA replication in Caenorhabditis elegans." Doctoral thesis, Universitat Pompeu Fabra, 2016. http://hdl.handle.net/10803/456671.

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Abstract:

Una gran proporción del genoma de la mayoría de eucariotas superiores está formado por secuencias repetitivas de DNA que contienen señales de represión de la transcripción. Para entender mejor cómo funciona la herencia de una generación a otra de esta cromatina reprimida, llevamos a cabo un screening genómico de RNA de interferencia usando Caernorhabditis elegans con el objetivo de identificar los genes responsables de la represión cuantitativa de una secuencia integrada en el genoma de células somáticas formada por múltiples copias de un transgén. Así encontramos que la inhibición de muchos

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8

Rodriguez, Granados Natalia. "Towards the understanding of the epigenetic and transcriptional regulation of sex expression in Cucumis melo." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASS082.

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Abstract:

Chez les plantes, le terme « déterminisme sexuel » désigne le processus développemental par lequel les fleurs mâles et femelles se trouvent séparées sur la même plante (monoécie) ou sur des individus différents (dioécie). La famille des Cucurbitaceae compte une grande diversité de systèmes de reproduction. Dans ce processus, fortement sous le contrôle de phytohormones, l’éthylène joue un rôle majeur. Il est probable que des modes de reproduction tels que la monoéciereposent sur l’établissement de programmes d’expression génique différents, grâce à une régulation épigénétique des gènes de déter

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9

Perriaud, Laury. "Étude systémique des cibles génomiques de la methyl-CpG binding domain protein 2 (MBD2), un répresseur transcriptionnel dépendant de la méthylation de l'ADN : évolution de la distribution de MBD2 dans un modèle syngénique de progression tumorale mammaire." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00833153.

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Abstract:

Les protéines à " Methyl-CpG-binding domain " (MBD) jouent un rôle important dans l'interprétationde la méthylation de l'ADN conduisant à la répression transcriptionnelle via le recrutement decomplexes remodelant la chromatine. Dans les cancers, MBD2 jouerait un rôle essentiel dans la perted'expression des gènes hyperméthylés. Ainsi, MBD2 serait une cible potentielle pour rétablir, enpartie au moins, leur expression. Caractériser, à l'échelle du génome, la distribution de MBD2 et sesconséquences sur la répression transcriptionnelle au cours de la cancérogenèse est donc une étapeincontournable.

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10

Chatterjee, Nilanjana. "SWI/SNF COMPLEXES COORDINATE WITH HISTONE MODIFICATIONS TO REGULATE CHROMATIN REMODELING." OpenSIUC, 2011. https://opensiuc.lib.siu.edu/dissertations/433.

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Abstract:

SWI/SNF, the founding member of ATP dependent chromatin remodelers and its paralog RSC in yeast perform similar yet distinct functions inside the cell. In vitro these complexes use ATP dependent DNA translocation to either mobilize or disassemble nucleosomes. However, how these complexes interact with nucleosomes and the mechanism by which chromatin remodeling is achieved is not fully understood. Further, it is not understood how they perform disparate roles in vivo despite their similar biochemical activities. To understand the fundamental differences between these complexes the substrate sp

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11

Arnold, Christian. "The Eukaryotic Chromatin Computer." Doctoral thesis, Universitätsbibliothek Leipzig, 2016. http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bsz:15-qucosa-137584.

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Abstract:

Eukaryotic genomes are typically organized as chromatin, the complex of DNA and proteins that forms chromosomes within the cell\\\'s nucleus. Chromatin has pivotal roles for a multitude of functions, most of which are carried out by a complex system of covalent chemical modifications of histone proteins. The propagation of patterns of these histone post-translational modifications across cell divisions is particularly important for maintenance of the cell state in general and the transcriptional program in particular. The discovery of epigenetic inheritance phenomena - mitotically and/or meiot

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12

Taty, Taty Gemael Cedrick. "Rôle des modifications de la chromatine dans la réparation des cassures double-brin de l'ADN et la stabilité génétique." Thesis, Toulouse 3, 2016. http://www.theses.fr/2016TOU30190/document.

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Abstract:

Le génome humain est constamment la cible d'agents qui endommagent l'ADN. Ces dommages sont multiples et variés tels que les cassures simple et double brin (DSB). Les DSBs sont des lésions très toxiques dont l'origine peut être multiple. Les cellules de mammifères réparent les DSBs en utilisant deux mécanismes principaux, la recombinaison homologue (RH) qui est dépendante du cycle cellulaire et utilise la chromatide sœur comme matrice de réparation et la jonction des extrémités non homologues (NHEJ) qui est indépendante du cycle cellulaire et consiste en la ligation des extrémités d'ADN endomm

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Baker, Katie. "The chromatin landscape of barley : gene expression, evolution and epigenetics." Thesis, University of Dundee, 2015. https://discovery.dundee.ac.uk/en/studentTheses/13a096cd-f45b-4e34-babd-ccb3ff3607ca.

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Abstract:

Barley (Hordeum vulgare) is an economically important crop species with a large diploid genome. Around a half of the barley genome and a fifth of the genes are constrained within a low-recombining pericentromeric (LR-PC) region. I explored the LR-PC gene component with a genomic investigation of gene expression, diversity and evolution. Chromatin environments were also explored in the LR and high recombining (HR) regions by surveying the genic and genomic distributions of nine histone modifications. Firstly, regions of HR and LR were identified and compared for gene evolution, expression and d

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Shiota, Hitoshi. "Régulation de la programmationpost-méiotique du génomemâle par NUT." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016GREAV079/document.

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Abstract:

Pendant les derniers stades de la spermatogenèse, les cellules germinales mâles post-méiotiques subissent une réorganisation dramatique de l'architecture de leur chromatine, impliquant notamment le remplacement presque total des histones par les protamines, créant des noyaux fortement condensés que l'on trouve dans le sperme mature. Au cours de ce processus, un événement précoce clé est la vague d'hyperacetylation des histones, qui précède leur remplacement. Notre équipe a précédemment identifié le facteur d'expression testiculaire de la famille BET, Brdt (BRomoDomain Testis), qui se lie aux h

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15

Moffat, Michael. "Aberrant DNA modification profiles in embryonic stem cells lacking polycomb repressive complexes." Thesis, University of Edinburgh, 2016. http://hdl.handle.net/1842/25711.

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Abstract:

Transcriptional repression is maintained by many molecular processes, including DNA methylation and polycomb repression. These two systems are both associated with chromatin modification at the promoters of silent genes, and are both essential for mammalian development. Previous work has shown that DNMT proteins are required for correct targeting of polycomb repressive complexes (PRCs). In this thesis, I investigate whether targeting of DNA modification has a reciprocal dependence on the polycomb machinery by mapping DNA modification in wild-type and PRC-mutant ES cells (Ring1B null, EED null,

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Cong, Rong. "Functional analysis of nucleolin-chromatin interaction in vivo." Thesis, Lyon, École normale supérieure, 2011. http://www.theses.fr/2011ENSL0636.

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Abstract:

La nucléoline, une des protéines non-ribosomique les plus abondantes du nucléole, semble être impliquée dans de nombreux aspects du métabolisme de l'ADN en plus de son rôle dans la régulation de la transcription par l'ARN polymérase I, la maturation du pré-ARNr et l’assemblage des ribosomes. L'objectif de cette thèse est d'étudier l'interaction de la nucléoline avec la chromatine, et de déchiffrer la fonction de la nucléoline dans la régulation de l’expression génique. Il a été rapporté que la nucléoline est nécessaire pour la transcription des gènes codant pour l'ADN ribosomal in vivo, mais l

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Goudarzi, Afsaneh. "Male genome programming guided by histone acylations." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016GREAV059/document.

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Abstract:

Le principal intérêt de nos études présentées dans ce manuscrit, correspond à la compréhension des évènements, reliés aux acylations d’histones au niveau des lysines (Ks) dans les cellules germinales post méiotiques, qui régulent spécifiquement l’expression des gènes à l’échelle du génome entier.Dans la première partie de mon travail, nous avons élaboré une stratégie afin d’analyser le rôle des « histones acetyl transférases » (HATs), Cbp et p300, dans les cellules germinales post méiotiques. Pour ce faire, nous avons généré une lignée de souris conditionnellement et partiellement invalidée po

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Gibson, Matthew D. "Reading the Epigenetic State of Chromatin Alters its Accessibility." The Ohio State University, 2016. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1480534756664384.

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19

Zhao, Wei. "Caractérisation moléculaire et fonctionnelle des gènes impliqués dans la mise en place et la lecture de la méthylation d'histones chez l'Arabidopsis thaliana." Thesis, Strasbourg, 2017. http://www.theses.fr/2017STRAJ033/document.

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Abstract:

La méthylation des histones constitue un niveau important de contrôle épigénétique chez les eucaryotes. Mes études portent sur la caractérisation des facteurs potentiellement intervenant dans la mise en place et la lecture de la méthylation pour mieux apprécier son rôle et des mécanismes sous-jacents dans la régulation de la transcription et du développement des plantes chez l’Arabidopsis thaliana. Ainsi, la première partie de mes travaux de thèse a contribué à l’étude d’une protéine à domaine SET (SET DOMAIN GROUP7, SDG7) et à montrer que SDG7 est nécessaire au bon déroulement de l'induction

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Stempor, Przemyslaw. "Relationships between chromatin features and genome regulation." Thesis, University of Cambridge, 2018. https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/288630.

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Abstract:

Regulation of gene expression is an essential process for all living organisms. Transcriptional regulation, associated with chromatin, is governed by: (1) DNA sequence, which creates regulatory sites (promoters, enhancers and silencers), where sequence motifs and features (e. g. CpG) can attract transcription factors (TFs) and influence chromatin structure or RNA polymerase II (Pol II) binding, initiation and elongation; (2) non-sequence, epigenetic factors - histone modifications, TF binding, chromatin remodelling (histone placement, eviction and reconstitution), and non-coding RNA regulation

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Spadiliero, Barbara. "Epigenetic traits in the parasite Trypanosoma cruzi : DNA and histones modifications linked to its life cycle." Paris 6, 2009. http://www.theses.fr/2009PA066759.

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Parameswaran, Kalaivani Nithyha. "Understanding the mechanisms of histone modifications in vivo." Thesis, Strasbourg, 2016. http://www.theses.fr/2016STRAJ097/document.

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Abstract:

Les modifications post-traductionnelles (MPTs) d’histones sont apparues comme un acteur majeur de la régulation de l’expression des gènes. Cependant peu de choses sont connues sur le réel impact des MPTs sur la chromatine. Il a été suggéré que les MPTs d’histones (H2A, H2B, H3 et H4) ont le potentiel de moduler la fonction chromatinienne selon un « codehistone » en recrutant des protéines spécifiques de liaison. L’objectif de mon projet est d’approfondir la fonction de l’acétylation du domaine globulaire de l’histone H3 et de comparer cette modification avec celles des queues N-terminale in vi

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Gerson, Rosalind J. "The Interaction Between Sir3 and Sir4 is Dispensable for Silent Chromatin Spreading in Budding Yeast." Thesis, Université d'Ottawa / University of Ottawa, 2015. http://hdl.handle.net/10393/32232.

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Abstract:

In Saccharomyces cerevisiae, telomeric and HM silencing requires the histone deacetylase Sir2 and the chromatin binding proteins Sir3 and Sir4, which interact to form the SIR complex. Silent chromatin formation begins with a nucleation step, followed by spreading of Sir proteins along chromatin. Overexpression of Sir3 extends silent chromatin domains, however the role of Sir protein interactions within silent chromatin extensions remains unknown. Here, we generated the Sir3 mutant, Sir3-4A, which cannot interact with Sir4 but is capable of forming silent chromatin extensions when overexpressed

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Oliete, Calvo Paula. "Study of the SAGA deubiquitination module: identification of new modulators and its implication on Spinocerebellar Ataxia Type 7." Doctoral thesis, Universitat Politècnica de València, 2017. http://hdl.handle.net/10251/86155.

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Abstract:

Regulation of chromatin by epigenetic modifications is a fundamental step during the control of gene expression in eukaryotic cells. The participation of different factors including histone chaperones, chromatin remodeling complexes and histone-modifying complexes regulate chromatin dynamics and ensure the correct metabolism of transcripts that need to be exported to the cytoplasm. In these lines, post-translational modifications including monoubiquitination of histone H2B (H2Bub1) and methylation of histone H3 represent a well-studied histone cross-talk which is required for chromatin integri

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Rajput, Abdul Mateen. "Histone modifications after DNA damage affect survival in Schizosaccharomyces pombe." Thesis, Södertörns högskola, Institutionen för livsvetenskaper, 2010. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:sh:diva-6886.

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Abstract:

S. cerevisiae Ada2 and Bre1 has a role in histone post-translational modifications. Deletion of these genes causes deficiency in acetylation (Ada2) or ubiquitination (Bre1) of histones. Further, mutants lacking these genes or homologous genes showed different phenotypes in human and S. cerevisiae while treated with DNA damaging agents 4-NQO and MMS. Bre1 deficient cells showed 4-NQO sensitivity in S. cerevisiae and resistance in human cells. Since it has been shown that S. pombe is more close to mammals in chromatin regulation we wanted to examine S. pombe response against MMS and 4-NQO. By ho

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Zhu, Yan. "Microfluidic Technology for Low-Input Epigenomic Analysis." Diss., Virginia Tech, 2018. http://hdl.handle.net/10919/83402.

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Abstract:

Epigenetic modifications, such as DNA methylation and histone modifications, play important roles in gene expression and regulation, and are highly involved in cellular processes such as stem cell pluripotency/differentiation and tumorigenesis. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) is the technique of choice for examining in vivo DNA-protein interactions and has been a great tool for studying epigenetic mechanisms. However, conventional ChIP assays require millions of cells for tests and are not practical for examination of samples from lab animals and patients. Automated microfluidic chips off

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Bilgraer, Raphaël. "Déchiffrer le code histone : épigénétique et toxicologie placentaire." Thesis, Paris 5, 2014. http://www.theses.fr/2014PA05P627/document.

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Abstract:

En influençant le degré de compaction de la chromatine ainsi que ses interactions avec différents partenaires protéiques, les modifications post-traductionnelles des histones sont impliquées dans la régulation de l’expression des gènes. Avec les différents variants d’histones incorporés dans la chromatine, ces modifications dynamiques et sensibles à l’environnement sont constitutives du code histone. Ce travail présente une approche globale de criblage baptisée approche histonomique, visant à révéler une perturbation épigénétique à l’échelle des histones. Cette approche originale offre une com

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Filleton, Fabien. "Cartographie et analyse de variations épigénomiques naturelles chez la levure Saccharomyces cerevisiae." Thesis, Lyon, École normale supérieure, 2015. http://www.theses.fr/2015ENSL1044.

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Abstract:

L'épigénome est défini par l’ensemble de l’information chromatinienne autre que celle fournie par la séquence ADN. Au sein d'une même espèce et pour un type cellulaire donné, chaque individu présente des caractéristiques particulières de l'épigénome. Les épi-polymorphismes, définis comme étant les différences inter-individus de marques chromatiniennes, sont encore partiellement caractérisés et peuvent être liés aux phénotypes de chacun. La première partie de mon travail a été d'identifier et d'interpréter chez S.cerevisiae l'impact des épi-polymorphismes de modification des queues d'histones.

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Jené, i. Sanz Alba 1984. "Integrative study of the regulatory and epigenomic programs involved in cancer development." Doctoral thesis, Universitat Pompeu Fabra, 2013. http://hdl.handle.net/10803/113380.

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Abstract:

El càncer ha estat tradicionalment considerat una malaltia fonamentalment genètica, però recentment s'està fent palès que la desregulació de mecanismes epigenètics contribueix en gran manera al desenvolupament tumoral. Al bell mig de la intersecció entre la genètica i l'epigenètica s'hi troben els factors reguladors de la cromatina (CRFs, en anglès), que són un focus important de recerca a causa de la seva potencial utilitat en teràpies contra el càncer. En aquesta tesi, determino l'estat transcriptòmic de cèl·lules normals i tumorals basant-me en informació epigenètica i regulatòria, i d

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Vogler, Christine [Verfasser]. "Analysis of epigenetic chromatin modifications : the function of the H2A C-terminal tail in chromatin / vorgelegt von Christine Vogler." 2009. http://d-nb.info/993163173/34.

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31

Pacis, Alain. "Dynamic epigenetic changes in immune responses to infection in human dendritic cells." Thèse, 2014. http://hdl.handle.net/1866/11740.

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Abstract:

La méthylation de l'ADN est une marque épigénétique importante chez les mammifères. Malgré le fait que la méthylation de la cytosine en 5' (5mC) soit reconnue comme une modification épigénétique stable, il devient de plus en plus reconnu qu'elle soit un processus plus dynamique impliquant des voies de méthylation et de déméthylation actives. La dynamique de la méthylation de l'ADN est désormais bien caractérisée dans le développement et dans le fonctionnement cellulaire des mammifères. Très peu est cependant connu concernant les implications régulatrices dans les réponses immunitaires. Pour se

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Mashtalir, Nazar. "Regulation of BAP1 tumor suppressor complex by post-translational modifications." Thèse, 2014. http://hdl.handle.net/1866/12772.

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Abstract:

Le régulateur transcriptionnel BAP1 est une déubiquitinase nucléaire (DUB) dont le substrat est l’histone H2A modifiée par monoubiquitination au niveau des residus lysines 118 et 119 (K118/K119). Depuis les dernières années, BAP1 emerge comme un gene suppresseur de tumeur majeur. En effet, BAP1 est inactivé dans un plethore de maladies humaines héréditaires et sporadiques. Cependant, malgré l’accumulation significative des connaissances concernant l’occurrence, la pénétrance et l’impact des défauts de BAP1 sur le développement de cancers, ses mécanismes d’action et de régulation restent très p

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Nawaz, Zahid. "Epigenetic Modulators of Glioma : From miRNAs to Chromatin Modifiers." Thesis, 2016. http://hdl.handle.net/2005/3146.

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Abstract:

The glial cells of the brain and the peripheral nervous system retain the capacity to divide and proliferate throughout the lifespan of an individual and thereby have the propensity to give rise to the most adult neurological tumours. Among them, the tumours which arise from different kinds of glial cells are referred to as gliomas. Of the various types of gliomas, astrocytomas are the most common central nervous system neoplasms which make upto 60% of all the primary brain tumours. Being the most prevalent type, the WHO classifies them into grades ranging from I to IV based on their intensity

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Rampersaud, Andy. "Chromatin accessibility and epigenetic changes induced by xenobiotic and hormone exposure in young adult mouse liver." Thesis, 2019. https://hdl.handle.net/2144/39470.

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Abstract:

Transcription factors activated by exogenous or endogenous stimuli alter gene expression with major effects on chromatin accessibility and the epigenome. This thesis investigates that impact of environmental chemical and hormonal exposure on liver chromatin accessibility in a mouse liver model. Exposure to the constitutive androstane receptor (CAR)-specific agonist ligand 1,4-bis-[2-(3,5-dichloropyridyloxy)]benzene (TCPOBOP) induces localized changes in chromatin accessibility at several thousand DNase hypersensitive sites (DHS). Activating histone marks, associated with enhancers and promoter

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Gerighausen, Daniel. "TiBi-3D - a Guide through the World of Epigenetics." 2014. https://ul.qucosa.de/id/qucosa%3A17227.

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Abstract:

In the last two decades the study of changes in the genome function that are not induced by changes in DNA has consolidated a strong research field called ”epigenetics”. Chromatin state changes play an essential role in the regulation of transcription of many genes, thus controlling cell differentiation. A large part of these changes is due to histone modifications that alter the accessibility of the DNA. Current state of the art visualization methods for the analysis of epigenetic data sets are not suited to represent the relationship between the combinatorial pattern of histone modifications

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Arnold, Christian. "The Eukaryotic Chromatin Computer: Components, Mode of Action, Properties, Tasks, Computational Power, and Disease Relevance." Doctoral thesis, 2013. https://ul.qucosa.de/id/qucosa%3A12334.

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Abstract:

Eukaryotic genomes are typically organized as chromatin, the complex of DNA and proteins that forms chromosomes within the cell\\\''s nucleus. Chromatin has pivotal roles for a multitude of functions, most of which are carried out by a complex system of covalent chemical modifications of histone proteins. The propagation of patterns of these histone post-translational modifications across cell divisions is particularly important for maintenance of the cell state in general and the transcriptional program in particular. The discovery of epigenetic inheritance phenomena - mitotically and/or me

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Gerighausen, Daniel. "Kombination von K-means++ Clustering und PCA zur Analyse von Chromatin-Daten." 2013. https://ul.qucosa.de/id/qucosa%3A17148.

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Abstract:

In der Epigenetik werden die Veränderungen der Erbinformationen neben der DNS erforscht. Dabei werden den Histonen, um die sich die DNS im Zellkern wickelt, eine große Bedeutung zugeordnet. In dieser Arbeit werden die Ergebnisse eines neuen Segmentierungsverfahrens ausgewertet und visualisiert. Dabei werden die vorliegenden Daten mittels des k-means++ Algorithmus geclustert.Zuerst werden die Clusterergebnisse statistisch ausgewertet, um sie dann mit den durch vorgehenden Arbeiten erworbenen Kenntnissen zu vergleichen. Mittels dieses Vergleichs werden dann die idealen Parameter für das Clusteri

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