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Dissertations / Theses on the topic 'Pathologies liées à l’âge'

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Le, Borgne Enora. "Reprogrammation cellulaire pour améliorer la régénération tissulaire altérée dans les pathologies du vieillissement." Thesis, Université de Montpellier (2022-….), 2022. http://www.theses.fr/2022UMONT003.

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Abstract:
Le vieillissement est un processus complexe qui se caractérise par l'altération progressive de la physiologie cellulaire et tissulaire. Modulé par des facteurs génétiques et épigénétiques, il s'accompagne d'une modification du métabolisme cellulaire, d'une diminution de la résistance aux différents stress cellulaires et de la sénescence cellulaire. L’objectif de ce travail est d’utiliser la reprogrammation cellulaire comme stratégie visant à retarder les effets du vieillissement, en induisant un rajeunissement global ou en améliorant les capacités régénératrices de l’organisme.L'expression de quatre facteurs de transcription : OCT4, SOX2, KLF4 et c-MYC (OSKM) permet l’induction de la reprogrammation de cellules somatiques en cellules pluripotentes. Procéder à une reprogrammation dite transitoire, c’est-à-dire initier le processus sans atteindre l’état de pluripotence, a un effet immédiat qui efface en partie les marques caractéristiques du vieillissement des tissus et des cellules. Afin de déterminer comment une courte reprogrammation cellulaire transitoire réalisée précocement affecte les processus de vieillissement chez un animal entier, nous avons induit l'expression d'OSKM chez des souris progériques reprogrammables jeunes et avons révélé une augmentation de la longévité sur les âges tardifs et un effet protecteur sur l’intégrité des structures tissulaires et sur les pathologies liées à l'âge, associé à des modifications des signatures épigénétiques dans les tissus. Ces résultats sur les âges tardifs après une reprogrammation transitoire précoce suggèrent un effet mémoire, se maintenant tout au long de la vie. Afin d’expliquer ces effets à long terme, nous avons exploré l’impact d’une reprogrammation transitoire précoce sur le métabolisme. Nous avons pu mettre en évidence une modification globale de la composition corporelle des animaux, avec un ralentissement de la prise de masse grasse dans les âges jeunes et un maintien de cette même masse grasse dans les âges tardifs, associé à une modification globale de l’ultrastructure et de l’activité métabolique du tissu adipeux blanc. Cette transition métabolique semble aussi impacter le tissu musculaire selon une dynamique qui lui est propre.L’identification des mécanismes sous-jacents nous permettra de définir de nouvelles stratégies pour prévenir le vieillissement et la sénescence, à l’origine de l’apparition des pathologies liées à l’âge
Aging is a complex process characterized by the progressive alteration of cellular and tissue physiology. Modulated by genetic and epigenetic factors, it is accompanied by a modification of the cellular metabolism, a decrease in resistance to various cellular stresses and cellular senescence. The objective of this work is to use cell reprogramming as a strategy to delay the effects of aging by inducing global rejuvenation or by improving the regenerative capacities of the organism.The expression of four transcription factors: OCT4, SOX2, KLF4 and c-MYC (OSKM) allows the induction of somatic cell reprogramming into pluripotent cells. This so-called transient reprogramming, i.e., initiating the process without leading to the pluripotent state, has an immediate effect that partially erases the characteristic marks of tissue and cell aging. In order to determine how an early short transient cellular reprogramming affects aging processes in a whole animal, we induced OSKM expression in young progeric reprogrammable mice and revealed an increase in longevity at late ages and a protective effect on the integrity of tissue structures and on age-related pathologies, associated with modifications of epigenetic signatures in tissues. These results on late ages after an early transient reprogramming suggest a memory effect maintained throughout life. To explain these long-term effects, we explored the impact of an early transient reprogramming on metabolism. We were able to demonstrate a global modification of the body composition of the animals with a decrease of the fat mass gain in the young ages and a maintenance of this same fat mass in the late ages associated with a global modification of the ultrastructure and the metabolic activity of the white adipose tissue. This metabolic transition also seems to impact the muscle tissue with its own dynamics.The identification of the underlying mechanisms will allow us to define new strategies to prevent aging and senescence, which are at the origin of the appearance of age-related pathologies
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Karaman, Svebor. "Indexation de la vidéo portée : application à l’étude épidémiologique des maladies liées à l’âge." Thesis, Bordeaux 1, 2011. http://www.theses.fr/2011BOR14402/document.

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Abstract:
Le travail de recherche de cette thèse de doctorat s'inscrit dans le cadre du suivi médical des patients atteints de démences liées à l'âge à l'aide des caméras videos portées par les patients. L'idée est de fournir aux médecins un nouvel outil pour le diagnostic précoce de démences liées à l'âge telles que la maladie d'Alzheimer. Plus précisément, les Activités Instrumentales du Quotidien (IADL: Instrumental Activities of Daily Living en anglais) doivent être indexées automatiquement dans les vidéos enregistrées par un dispositif d'enregistrement portable.Ces vidéos présentent des caractéristiques spécifiques comme de forts mouvements ou de forts changements de luminosité. De plus, la tâche de reconnaissance visée est d'un très haut niveau sémantique. Dans ce contexte difficile, la première étape d'analyse est la définition d'un équivalent à la notion de « plan » dans les contenus vidéos édités. Nous avons ainsi développé une méthode pour le partitionnement d'une vidéo tournée en continu en termes de « points de vue » à partir du mouvement apparent.Pour la reconnaissance des IADL, nous avons développé une solution selon le formalisme des Modèles de Markov Cachés (MMC). Un MMC hiérarchique à deux niveaux a été introduit, modélisant les activités sémantiques ou des états intermédiaires. Un ensemble complexe de descripteurs (dynamiques, statiques, de bas niveau et de niveau intermédiaire) a été exploité et les espaces de description joints optimaux ont été identifiés expérimentalement.Dans le cadre de descripteurs de niveau intermédiaire pour la reconnaissance d'activités nous nous sommes particulièrement intéressés aux objets sémantiques que la personne manipule dans le champ de la caméra. Nous avons proposé un nouveau concept pour la description d'objets ou d'images faisant usage des descripteurs locaux (SURF) et de la structure topologique sous-jacente de graphes locaux. Une approche imbriquée pour la construction des graphes où la même scène peut être décrite par plusieurs niveaux de graphes avec un nombre de nœuds croissant a été introduite. Nous construisons ces graphes par une triangulation de Delaunay sur des points SURF, préservant ainsi les bonnes propriétés des descripteurs locaux c'est-à-dire leur invariance vis-à-vis de transformations affines dans le plan image telles qu'une rotation, une translation ou un changement d'échelle.Nous utilisons ces graphes descripteurs dans le cadre de l'approche Sacs-de-Mots-Visuels. Le problème de définition d'une distance, ou dissimilarité, entre les graphes pour la classification non supervisée et la reconnaissance est nécessairement soulevé. Nous proposons une mesure de dissimilarité par le Noyau Dépendant du Contexte (Context-Dependent Kernel: CDK) proposé par H. Sahbi et montrons sa relation avec la norme classique L2 lors de la comparaison de graphes triviaux (les points SURF).Pour la reconnaissance d'activités par MMC, les expériences sont conduites sur le premier corpus au monde de vidéos avec caméra portée destiné à l'observation des d'IADL et sur des bases de données publiques comme SIVAL et Caltech-101 pour la reconnaissance d'objets
The research of this PhD thesis is fulfilled in the context of wearable video monitoring of patients with aged dementia. The idea is to provide a new tool to medical practitioners for the early diagnosis of elderly dementia such as the Alzheimer disease. More precisely, Instrumental Activities of Daily Living (IADL) have to be indexed in videos recorded with a wearable recording device.Such videos present specific characteristics i.e. strong motion or strong lighting changes. Furthermore, the tackled recognition task is of a very strong semantics. In this difficult context, the first step of analysis is to define an equivalent to the notion of “shots” in edited videos. We therefore developed a method for partitioning continuous video streams into viewpoints according to the observed motion in the image plane.For the recognition of IADLs we developed a solution based on the formalism of Hidden Markov Models (HMM). A hierarchical HMM with two levels modeling semantic activities or intermediate states has been introduced. A complex set of features (dynamic, static, low-level, mid-level) was proposed and the most effective description spaces were identified experimentally.In the mid-level features for activities recognition we focused on the semantic objects the person manipulates in the camera view. We proposed a new concept for object/image description using local features (SURF) and the underlying semi-local connected graphs. We introduced a nested approach for graphs construction when the same scene can be described by levels of graphs with increasing number of nodes. We build these graphs with Delaunay triangulation on SURF points thus preserving good properties of local features i.e. the invariance with regard to affine transformation of image plane: rotation, translation and zoom.We use the graph features in the Bag-of-Visual-Words framework. The problem of distance or dissimilarity definition between graphs for clustering or recognition is obviously arisen. We propose a dissimilarity measure based on the Context Dependent Kernel of H. Sahbi and show its relation with the classical entry-wise norm when comparing trivial graphs (SURF points).The experiments are conducted on the first corpus in the world of wearable videos of IADL for HMM based activities recognition, and on publicly available academic datasets such as SIVAL and Caltech-101 for object recognition
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De, Vuyst Paul. "Contribution des analyses minéralogiques à l'identification des pathologies respiratoires liées à l'amiante." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1988. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/213387.

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Olaya, Nathalia. "Etudes des lésions cellulaires et moléculaires induites au cours des pathologies hépatiques liées au stress oxydant." Paris 11, 2006. http://www.theses.fr/2006PA11T002.

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Raynaud, Martine. "Etude du profil d'inactivation des chromosomes X chez les conductrices de pathologies liées au sexe avec déficience mentale." Tours, 2002. http://www.theses.fr/2002TOUR3306.

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Abstract:
Des déviations du profil d'inactivation des chromosomes X peuvent être corrélées à l'expression des maladies liées au sexe. Nous avons réalisé l'étude du profil d'inactivation dans les leucocytes du sang dans 102 familles de pathologies liées à l'X avec retard mental : 36 familles de déficience mentale liée à l'X (dm/X) d'origine française et 6 familles de syndrome de Nance-Horan, pour lesquelles l'étude clinique et l'étude de localisation ont été réalisées à Tours, 17 familles de syndrome FG étudiées à Tours à partir d'une coopération internationale, 21 familles de dm/X de Belgique, 6 d'Allemagne, 16 de Hollande, pour lesquelles seule l'étude des profils d'inactivation a été réalisée à Tours. Dans 8 familles de dm/X, parmi les 36 familles de dm/X d'origine française, les femmes conductrices ont une inactivation très déviée et les femmes non conductrices ont une inactivation aléatoire. Une fonction pourrait être commune entre les gènes mutés dans ces familles : ils pourraient avoir un rôle dans la prolifération des cellules ou dans leur survie ; ou encore, ils pourraient intervenir dans le processus d'inactivation. Pour 24 parmi les 36 familles de dm/X d'origine française, les profils d'inactivation des conductrices sont aléatoires, qu'elles soient ou non symptomatiques. Dans les familles de syndrome de Nance-Horan, il semble exister une corrélation entre le profil d'inactivation observé dans les leucocytes et la sévérité du phénotye. La localisation génétique du syndrome FG est hétérogène. La mise en évidence d'un profil d'inactivation particulier chez les conductrices dans certaines familles aurait permis de suspecter l'implication d'un même gène. L'analyse révèle en effet différents types de profils d'inactivation, mais sans que l'on puisse établir une correspondance avec le territoire de localisation.
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Rachas, Antoine. "Recours aux soins des jeunes en transition vers l’âge adulte ayant une pathologie chronique." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS004/document.

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Abstract:
L’amélioration du pronostic des pathologies chroniques à début pédiatrique s’est accompagnée d’un nombre grandissant de patients atteignant l’âge adulte. Cependant, l’adolescence et l’entrée dans la vie adulte est une période de multiples changements et de crises, pouvant être à l’origine de rupture avec le système de soins et de complications médicales. Dans cette thèse, j’ai tout d’abord décrit les hospitalisations et la mortalité des jeunes ayant été déclarés en affection de longue durée (ALD) avant 14 ans (N=1752), en comparaison à des jeunes sans pathologie chronique (N=52346). Pour cela, une cohorte rétrospective (2005-2014) a été reconstruite à partir de l’échantillon généraliste des bénéficiaires de l’Assurance maladie. Environ 3% des jeunes de 14 ans avaient déjà été déclarés en ALD. Les profils de mortalité par sexe et les tendances par âge de l’incidence des hospitalisations étaient différents de ceux de la population générale du même âge, en particulier après 18 ans, où l’on observait une chute de l’incidence des hospitalisations. Ensuite, à partir de ces mêmes données, j’ai montré que le pronostic de ces jeunes malades, y compris la mortalité, était associé à la précarité sociale, mesurée par la couverture maladie universelle complémentaire, montrant ainsi que la gratuité des soins à laquelle ces jeunes ont droit dans le système de santé français ne permettait pas de compenser les inégalités sociales dans cette population. Enfin, à un moment ou un autre, ces jeunes sont transférés vers un service d’adultes. Ce passage est un moment crucial dans leur suivi, qui peut être à l’origine d’une discontinuité du suivi médical. Des programmes de transition sont mis en place progressivement pour préparer et accompagner ce transfert. J’ai réalisé une revue systématique de la littérature (23 études) qui a montré qu’il existait deux aspects de la continuité des soins au moment de ce transfert : l’engagement (premier contact) et le maintien dans le suivi en service d’adultes. Cette analyse a également mis en exergue la pauvreté des études existant actuellement pour évaluer les programmes de transition en termes de continuité des soins. Finalement, ces résultats soulèvent de nombreuses questions, notamment les stratégies d’adaptation de ces jeunes vis-à-vis des situations à haut risque et le rôle du transfert en service d’adultes sur le comportement des patients, le pronostic et les pratiques cliniques. Des études incluant largement l’ensemble des jeunes atteints d’une pathologie chronique, intégrant notamment des facteurs liés à l’organisation des soins, liés à la pathologie, individuels et familiaux, devraient être encouragées
The prognosis of childhood-onset chronic conditions has improved, such that more patients now reach adulthood. However, adolescence and entry into adulthood is a critical period that may be associated with poor outcomes, including gaps in care continuity and medical complications. Here, I first described hospitalization and mortality rates in youths registered for a long-term disease (LTD) before the age of 14 (N=1,752), relative to those with no LTD (N=52,346). A retrospective cohort (2005-2014) was built from a sample of the French national health insurance database, called Echantillon généraliste des Bénéficiaires. Approximately 3% of 14-year-old youths had been registered for a LTD. The mortality patterns by gender and the trend in hospitalization rates by age were different from those in the general population of the same age, especially after reaching the age of 18, which was followed by a fall in hospitalization rates. Then, using the same data, I showed that the prognosis of these youths living with a chronic disease, including mortality, was associated with low socio-economic level, as measured by being covered by Couverture Maladie Universelle Complementaire, a public complementary health insurance offering free access to care, delivered on the basis of very low househould incomes. Hence, overcoming financial barriers did not offset social health inequalities in this population. At last, one day, these youths have to be transferred to adult care. Moving to adult care is a critical time in patients’ follow-up that may lead to discontinuity in medical care. Transition programs are being gradually implemented, to prepare and smooth the transfer and support youths during this period. I performed a systematic review of literature (23 studies) that highlighted two aspects of continuity of care during transfer: engagement (first contacts) and retention in adult care once the first contact has been established. This review also emphasized the paucity of knowledge to evaluate transition programs in terms of care continuity. Finally, the results of this PhD raises many issues that need to be addressed, including coping strategies of young patients with high risk situations, and the role of transfer to adult care on patient behavior, prognosis and clinical practices. Studies involving patients with a large spectrum of severe chronic diseases, including factors related to healthcare organization, related to the disease, individual and familial, should be encouraged
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Hervault, Maxime. "Les différences liées au sexe dans la physiopathologie de la sténose valvulaire aortique : impact du phénotype valvulaire, de l’âge, et des hormones sexuelles." Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/67785.

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Abstract:
La sténose valvulaire aortique (SVA) est une pathologie dégénérative de la valve aortique qui touche 2 à 4% de la population âgée de plus de 65 ans, et 4,6% des personnes âgées de plus de 75 ans. Cette pathologie se traduit par un épaississement et une rigidification des feuillets de la valve aortique, induisant un défaut d’ouverture et de fermeture de la valve. Parmi les nombreux facteurs de risque de développer une SVA, nous retrouvons la bicuspidie (anomalie congénitale touchant 1 à 2% de la population générale), l’âge, la dyslipidémie et le sexe mâle. Les mécanismes impliqués dans la physiopathologie de la SVA sont bien connus, nous retrouvons des mécanismes impliqués dans l’inflammation, la fibrose, la calcification, la survie et la prolifération cellulaire. Toutefois, malgré une littérature abondante sur la physiopathologique de la SVA, peu de recherches ont été effectuées sur l’impact du sexe et des hormones sexuelles sur la progression de la SVA. Il a été récemment observé que pour une même sévérité hémodynamique de la SVA, les hommes présentent un degré de calcification plus important et une proportion de fibrose valvulaire moins élevée comparativement aux femmes. Ainsi, l’objectif de cette maîtrise est d’étudier l’impact du sexe, du phénotype valvulaire et de l’âge sur le degré de calcification et le remodelage de la valve aortique chez des patients humains. Pour mener à bien ce projet, nous avions accès aux caractéristiques cliniques, aux données de tomodensitométrie, et aux valves explantées des patients. Les résultats obtenus montrent que les femmes, indépendamment du phénotype valvulaire ou de l’âge, vont présenter un degré de calcification plus faible et un remodelage fibrotique plus important des valves aortiques comparativement aux hommes. De plus, chez les patients bicuspides, les femmes jeunes présentent une valve aortique moins calcifiée que les femmes plus âgées.
Aortic valve stenosis (AS) is a degenerative pathology of the aortic valve that affects 2 to 4% of the population over 65 years of age, and 4,6% of people over 75 years of age. This pathology results in a thickening and stiffening of the aortic valve leaflets, leading to an impaired opening, and closing of the valve. The risk factors for developing AS are bicuspid valve (a congenital anomaly affecting 1 to 2% of the general population), age, dyslipidemia, and male sex. The mechanisms involved in the pathophysiology of AS are relatively well known. Mechanisms involved in inflammation, fibrosis, calcification, survival, and cell proliferation are found. However, despite an important bibliography on the pathophysiology of AS, very little research has been done on the impact of sex and sex hormones on the progression of AS. It has recently been shown that for the same hemodynamic severity of AS, men have a higher degree of calcification and a lower proportion of fibrosis of their valve than women. Thus, the objective of this master is to study the impact of sex, valve phenotype and age on the degree of calcification and valve remodelling in human patients for whom we had their clinical characteristics as well as CTscan data and explanted valves. Results obtained shown that women, regardless of valve phenotype or age, will have a lower degree of valve calcification and a greater fibrotic remodelling of their valves than men. In addition, in bicuspid patients, young women have a less calcified aortic valve compared to older women.
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Gonzalez, Serrano Ligia Elena. "Caractérisation de l'ArgRS mitochondriale humaine et contribution à la compréhension des pathologies liées aux mutations des aminoacyl-ARNt synthétases mitochondriales." Thesis, Strasbourg, 2018. http://www.theses.fr/2018STRAJ074/document.

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Abstract:
Les aminoacyl-ARNt synthétases mitochondriales humaines (aaRS mt) sont des enzymes clés de la traduction mitochondriale. Elles catalysent l'aminoacylation des ARNt par les acides aminés correspondent. Des mutations dans leurs gènes sont corrélées à des pathologies avec un large spectre de phénotypes cliniques, mais aux mécanismes moléculaires sous-jacents encore incompris. L'objectif de ce travail de thèse s'intègre dans les axes scientifiques du laboratoire, mais élargit l'intérêt et les connaissance à un système encore peu exploré: l'arginyl-ARNt synthétase mitochondriale (ArgRS mt). Des mutations dans la ArgRS sont liées à une hypoplasie Pontocérébelleuse (PCH6), une pathologie neurodéveloppementale sévère. Le travail de cette thèse s’articule autour de 3 axes : (I) L’analyse des phénotypes cliniques des pathologies liées aux mutations dans les aaRS mt, (II) La caractérisation des propriétéscellulaires de l’ArgRS mt, et (III) L'étude de l’impact de mutations « pathologiques » sur diverses propriétés de l’ArgRS mt. Combinés avec les travaux précédents, les résultats obtenus sont une contribution importante à l'élargissement des connaissances fondamentales des mt aaRSs, et apportent un nouvel éclairage sur le lien entre les mt-aaRSs-mutations et la maladie
Human mitochondrial aminoacyl-tRNA synthetases (mt-aaRSs) are housekeeping enzymes involved in the mitochondrial translation. They catalyze the aminoacylation of tRNAs with their cognate amino acids. Mutations in their nuclear genes are correlated with pathologies with a broad spectrum of clinical phenotypes, but with so far no clear explanations about the underlying molecular mechanism(s). The aim of this PhD work follows the long-standing efforts of the host laboratory but expand the interest and knowledge to an unexplored system: the human mitochondrial arginyl-tRNA synthetase (mt-ArgRS). Mutations in the mt-ArgRS lead to Pontocebellar hypoplasia type 6, a severe neuro-developmental pathology. I thus contributed to i) comprehensively analyze the clinical data reported in pathologies related to mutations on mt-aaRSs, resulting in a categorization according to the affected anatomical system; ii) decipher some cellular properties of the mt-ArgRS; and iii) investigate to impact of disease-associated mutations on mt-aaRSs properties. Combined with previous works, the present results expand the knowledge of the mt-aaRSs, shedding new light on the link between mt-aaRSs-mutations and disease
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Goven, Delphine. "Régulation de l’hème oxygénase-1 dans les macrophages au cours des pathologies pulmonaires liées à l’exposition de la fumée de cigarette." Thesis, Paris Est, 2009. http://www.theses.fr/2009PEST0051.

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Abstract:
L’intoxication tabagique, source d’oxydants, est un facteur de risque important de développement de l’emphysème pulmonaire et du pneumothorax spontané primitif. Les macrophages alvéolaires contribuent pour une large part à l’inflammation pulmonaire au cours de ces pathologies en produisant des métalloprotéases et des espèces réactives de l’oxygène à l’origine du déséquilibre des balances protéase/anti-protéase et oxydant/antioxydant. L'hème oxygénase-1 (HO-1), exprimée principalement par les macrophages, est une enzyme clé des défenses anti-oxydantes pulmonaires. Nous avons initialement étudié l’expression et la localisation cellulaire de l’HO-1 et de ses régulateurs potentiels (Nrf2, Keap1, Bach1 et HIF-1a) dans les macrophages alvéolaires au cours de l’emphysème pulmonaire post-tabagique et du pneumothorax spontané primitif. Les voies de régulation de l’expression de ces protéines ont été analysées in vitro sur des macrophages dérivés de la lignée THP-1 exposés ou non au condensat de fumée de cigarette et à l’hypoxieréoxygénation visant à mimer une partie des effets de l’atélectasie-réexpansion observée lors de la prise en charge thérapeutique des pneumothorax récidivants. Les travaux présentés dans cette thèse nous ont permis de mettre en évidence une altération de l’expression de la voie Nrf2/Keap1-Bach1 associée à une diminution de l’expression des enzymes anti-oxydantes, dont l’HO-1, dans les macrophages alvéolaires au cours de l’emphysème pulmonaire sévère post-tabagique, malgré un stress oxydant important. In vitro, ces altérations pourraient être liées à une activation spécifique des MAPKinases ERK1/2 et JNK par le condensat de fumée de cigarette. Nous avons également montré que la stimulation du système de l’HO-1 était probablement orchestrée par la voie du facteur HIF-1a, et non par celle de Nrf2, dans les macrophages alvéolaires au cours du pneumothorax spontané primitif récidivant du sujet fumeur. Ces résultats pourraient contribuer à une meilleure connaissance de la physiopathologie de l’emphysème pulmonaire et permettre d’envisager de nouvelles approches thérapeutiques basées sur la préservation et/ou la restauration de l’équilibre Nrf2/Keap1-Bach1. Nos travaux suggèrent également que la physiopathologie du pneumothorax spontané primitif est différente chez les patients fumeurs et non fumeurs. Le pneumothorax du sujet fumeur est associé à un stress oxydant pulmonaire et à une induction de l’HO-1 probablement orchestrée par HIF-1a. Ces résultats, confirmés in vitro, mettent en évidence une interaction potentielle entre le stress oxydant et l’hypoxie-réoxygénation
Chronic cigarette smoking, a source of oxidants, is an important risk factor for lung emphysema and primary spontaneous pneumothorax development. Alveolar macrophages are mainly involved in lung inflammation observed in these pathologies through the production of metalloproteases and reactive oxygen species resulting to protease/anti-protease and oxidant/anti-oxidant imbalances. Heme oxygenase-1 (HO-1), mainly expressed in macrophages, is a key enzyme in pulmonary anti-oxidant defences. Therefore, the first aim of our studies was to investigate the expression and cellular localisation of HO-1 and its potential regulators (Nrf2, Keap1, Bach1 and HIF-1a) in alveolar macrophages from smoking related lung emphysema and primary spontaneous pneumothorax. Regulation pathways involved in expression of these proteins were assessed in vitro in macrophage cell line THP-1 exposed or not to cigarette smoke condensate and with or without hypoxia-reoxygenation mimicking parts of events induced by atelectasia-reexpansion during recurrent pneumothorax constitution and treatment. In these studies, we showed an altered expression of Nrf2/Keap1- Bach1 pathway associated with a reduced expression of anti-oxidants enzymes, like HO-1, in alveolar macrophages from smoking related lung emphysema patients, despite an important oxidative stress. These alterations might be related to cigarette smoke condensate activated ERK1/2 and JNK MAPKinases as observed in THP-1 cells. Furthermore, we showed that HO- 1 system induction was mediated by HIF-1a instead of Nrf2 pathway in alveolar macrophages from smoking related recurrent primary spontaneous pneumothorax. These findings may contribute to a better knowledge of the pathophysiology of lung emphysema and could provide new therapeutic approaches based on preservation and/or restoration of Nrf2/Keap1-Bach1 equilibrium. Our results also suggest that the pathophysiology of primary spontaneous pneumothorax could be different in smokers and non smokers. Spontaneous pneumothorax in smokers is associated with lung oxidative stress and the orchestrated induction of HO-1 probably via HIF-1a. These results provide a new link between oxidative stress and hypoxia/reoxygenation
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Ruel, Coralie. "Apport de l'électrophorèse capillaire pour l'étude des anomalies de glycosylation de protéines liées à des pathologies : vers l'identification de nouveaux biomarqueurs." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018SACLS519.

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Abstract:
La glycosylation est l’une des principales modifications post-traductionnelles des protéines. La glycosylation des protéines est fortement modifiée lors de diverses pathologies comme le cancer, la polyarthrite rhumatoïde ou les troubles congénitaux de la glycosylation («Congenital disorders of glycosylation», CDGs). Ainsi, la nature et les proportions relatives des oligosaccharides liés aux protéines peuvent être utilisées pour dépister, pronostiquer voire suivre l’évolution de pathologies. Les travaux de cette thèse se sont focalisés sur l’étude de la glycosylation pour permettre le dépistage de certaines pathologies : les CDGs, la maladie d’Alzheimer (MA) et la dégénérescence rétinienne. Plusieurs stratégies fondées sur l’électrophorèse capillaire (EC) ont été envisagées pour répondre à cet objectif. Tout d’abord, le développement d’une méthode par EC de zone (ECZ) l’apolipoprotéine C-III (ApoC-III) intacte, une O-glycoprotéine impliquée dans le dépistage des troubles de la O-glycosylation, a permis de séparer les différentes glycoformes selon leur degré de sialylation. L’analyse d’échantillons d’ApoC-III standard provenant de différents fournisseurs par spectrométrie de masse (MS) MALDI -TOF a mis en évidence une hétérogénéité liée à la présence (inattendue) de formes carbamylées. Un traitement du plasma basé sur une immunocapture de l’ApoC-III suivie d’une dérivation sur billes magnétiques de la protéine par un fluorophore a permis de séparer ses différentes glycoformes en ECZ. Ensuite, une analyse N-glycomique de fluides biologiques employant une nouvelle technique de préparation d’échantillon que nous avons adaptée au plasma et au liquide céphalorachidien, a été réalisée par EC en gel couplée à une détection par fluorescence induite par laser (ECG-LIF) sur des patients sains et atteints de la MA. Cette étude a permis de mettre en évidence quelques modifications des N-glycanes chez ces patients. Enfin la combinaison des deux stratégies d’analyse de la glycosylation (glycoprotéine intacte et glycanes libérés), a permis de détecter la transferrine intacte présente dans le liquide vitré à des concentrations faibles ainsi que ses N-glycanes libérés, dans le cadre du dépistage d’une maladie oculaire. L’EC-QTOF-MS a également été explorée pour l’analyse de N-glycanes dérivés avec un nouveau fluorophore permettant d’améliorer la sensibilité en MS
Glycosylation is one of the most main types of post-translational modifications of proteins. Disease-associated modifications in protein glycosylation have been observed for various pathologies such as cancer, rheumatoid arthritis, or «Congenital disorders of glycosylation» (CDGs). They are often exploited for diagnosis, prognosis and monitoring of these diseases. This thesis work focused on the glycosylation study with the aim to allow the screening of different pathologies: CDGs, Alzheimer’s disease and retinal degeneration diseases. Different strategies based on capillary electrophoresis (CE) were considered to fulfil this goal. First, the developement of a CZE analysis of intact apolipoprotein C-III (ApoC-III), an O-glycoprotein implied in the screening of O-glycosylation disorders, allowed the separation of its glycoforms according to their sialylation degree. The MALDI-TOF mass spectrometry (MS) analysis of standard ApoC-III batches from different standard ApoC-III batches from different suppliers highlighted an additonnal heterogeneity due to (unexpected) carbamylated species. A plasma pretreatment based on an immunocapture of apoC-III followed by protein derivatization on magnetic beads using a fluorophore allowed to separate its glycoforms by CZE. Second, a glycomic analysis of biologicial fluids using a new sample treatment method that we adjusted to plasma and cerebrospinal fluid samples was performed by CGE-LIF on controls and Alzheimer’s patients. It allowed to highlight some modifications of N-glycans for this disease. Finally, the combination of both strategies of glycosylation analysis (intact glycoprotein and released N-glycans) allowed the detection of intact transferrin present in vitrous humor but also of its released N-glycans for the screening of retinal degeneration disease. CE-QTOF-MS was also investigated for the analysis of released N-glycans derivatized by a new fluorophore which increases MS sensitivity
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Castets, Perrine. "Etude des pathologies liées à SEPN1 : rôles de la sélénoprotéine N au cours du développement et de la regénération du tissu musculaire." Paris 6, 2009. http://www.theses.fr/2009PA066376.

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Abstract:
La sélénoprotéine N (SelN) est impliquée dans plusieurs pathologies neuromusculaires regroupées sous le terme SEPN1-Related Myopathies. L’expression prédominante de la protéine dans les tissus humains fœtaux et le phénotype musculaire précoce développé par les poissons zèbre invalidés, suggèrent que SelN pourrait être impliquée dans la myogenèse. Nous avons montré que le gène est exprimé précocement dans les précurseurs musculaires chez la souris et que l'expression protéique chute brutalement au cours de la période périnatale. Le modèle murin déficient en SelN ne présente pas de phénotype évident. En revanche, ces souris développent des défauts marqués lorsqu'elles sont soumises à un test de nage forcée. En parallèle, des défauts modérés de régénération musculaire ont été observés chez ces souris après injection de cardiotoxine. Une réduction drastique de la population de cellules satellites a en outre été mise en évidence et confirmée par le fait qu’une seconde régénération efficace n’est pas possible chez ces souris. Ces résultats ouvrent des perspectives nouvelles quant à la compréhension des pathologies associées à SelN.
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Decorde, Kelly. "Les antioxydants d'un extrait de jus de melon, l'Extramel : potentialités dans la prévention de pathologies liées au stress oxydant sur le modèle hamster doré syrien : athérosclérose et obésité." Montpellier 2, 2008. http://www.theses.fr/2008MON20164.

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Abstract:
On étudie les potentialités d'action d'un concentré de jus de melon riche en antioxydants, Extramel®, sur modèles pathologiques de stress oxydant, d'athérosclérose et d'obésité, d'origine nutritionnelle. La première partie étudie la faisabilité de l'étude en testant la capacité d'Extramel® à prévenir le stress oxydant in vitro sur modèle cellulaire THP-1. Nous y avons mis en évidence l'action inhibitrice d'Extramel® sur la production de l'anion superoxyde en diminuant l'expression de la sous-unité p22phox de la NADPH oxydase. Ceci nous a conduit à aborder l'étude in vivo, sur modèle animal d'athérosclérose. Après 12 semaines d'expérimentation, Extramel® prévient le stress oxydant, diminue la dyslipidémie ainsi que les dépôts lipidiques aortiques. Dans une troisième partie, Extramel® a été apporté à des hamsters recevant un régime induisant l'obésité. Nous montrons une prévention de l'obésité et de la stéatose hépatique associée, en rétablissant la balance leptine/adiponectine, en réduisant l'insulinémie et l'insulino-résistance. Plusieurs hypothèses sur le(s) mécanisme(s) d'action de l'extrait sont proposées; la plus plausible serait l'action antioxydante intra-luminale de ses enzymes, protégeant ainsi l'organisme de l'absorption de lipides radicalaires et/ou d'antioxydants non enzymatiques inactivés. L'éventualité qu'un peptide bioactif issu de l'hydrolyse intestinale de la SOD reste une hypothèse à ne pas rejeter. En résumé, ce travail met en avant les potentialités d'Extramel® en tant que complément alimentaire
The purpose of this study is to explore the action potential of a concentrated melon juice particularly rich in antioxidants, Extramel®, on pathological models of oxidative stress, early atherosclerosis and obesity from nutritional origin. In the first part of this work, we explored the feasibility of this study, testing the ability of the extract to prevent oxidative stress in vitro on cell model THP-1. This enabled us to demonstrate the inhibitory action of Extramel® on the production of superoxide anion by reducing the expression of p22phox subunit of the NADPH oxidase. These results led us to address in vivo studies on animal model of atherosclerosis. After a 12-week experimental period, Extramel® prevents oxidative stress, reduces dyslipidemia and aortic lipid deposition. In a third part, Extramel® was given to hamsters fed a diet inducing obesity. We show the prevention of obesity and of fatty liver associated, including restoring the balance leptin / adiponectin, reducing insulin and insulin resistance induced by this diet. Several assumptions about the mechanism(s) of action of the antioxidants from the extract are proposed. The most plausible concerns the intra-luminal action of antioxidant these enzymes, thus protecting the body against the absorption of fat radicals and / or non-enzymatic antioxidants inactivated. The possibility that a bioactive peptide issuing from the intestinal hydrolysis of SOD remains a hypothesis that cannot be ruled out. In summary, this work highlights the potential of Extramel® as a dietary supplement
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Jourda, de Vaux de Foletier Albane. "Etude de la cellulolyse bactérienne dans le caecum des équidés : variations de la population bactérienne liées à l’âge et à l'alimentation : caractérisation de l'espèce bactérienne cellulolytique dominante : interactions avec une espèce non cellulolytique caécale." Dijon, 1997. http://www.theses.fr/1997DIJOS060.

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Abstract:
Le tube digestif du poulain est colonisé dès les premières heures de vie à un niveau semblable à celui de l'adulte. Les bactéries cellulolytiques s'installent également à ce moment, comme pour les ruminants, tandis que, pour d'autres herbivores monogastriques, elles ne s'implantent qu'au sevrage. Les bactéries cellulolytiques sont cent fois moins nombreuses dans le caecum d'âne ou de poney que dans le rumen de bovin ou d'ovin, pour un même régime et pour des adultes. Les variations du régime alimentaire modifient leur nombre. Les régimes riches en cellulose et en azote inorganique favorisent leur développement. Les dix souches de bactéries cellulolytiques isolées du caecum présentent des propriétés métaboliques qui les différencient des souches ruminales de ruminococcus flavefaciens. Les profils générés par PCR-RFLP de l'Adnr 16S d'un premier groupe de souches montrent des similarités avec ceux de souches de référence de R. Flavefaciens, elles pourraient constituer une nouvelle espèce de ruminocoques. L'analyse des profils du second groupe de souches n'a pas permis de préciser leur relation phylogénétique avec les autres souches caecales ni avec les souches de référence de R. Flavefaciens. Des bactéries du genre enterococcus ont également été isolées. Elles présentent une nouvelle combinaison de caractères. La séquence de leur Adnr 16S démontre qu'elles appartiennent à une nouvelle espèce nommée E. Asini. La co-culture sur substrat soluble d'une souche de R. Sp. Du premier groupe et d'E. Asini présente des propriétés intéressantes si on se réfère à la physiologie du caecum. En effet, dans les trois premiers jours, Enterococcus Asini libère principalement du lactate dans le milieu. Entre le troisième et le quatrième jour, la co-culture réutilise une partie de ce lactate. Ces observations restent à confirmer in vivo. L'association de ces bactéries au niveau du caecum permettrait de diminuer les acidoses lactiques dans le caecum des équidés.
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Alves, Pires Claire. "Maladie d’Alzheimer et Syndrome d’Apnées du Sommeil : deux pathologies liées ? Etude des conséquences d’un stress hypoxique sur la cognition et la pathologie Tau dans le modèle murin transgénique THY-Tau22." Thesis, Lille 2, 2015. http://www.theses.fr/2015LIL2S035/document.

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Abstract:
La maladie d’Alzheimer (MA) est une pathologie neurodégénérative multifactorielle constituant la première cause de démence. Au niveau cérébral, deux types de lésions histopathologiques sont retrouvées chez les patients : les dépôts amyloïdes, constitués de peptides bêta ;-amyloïdes (A bêta;) agrégés dans le milieu extracellulaire ; et la dégénérescence neurofibrillaire (DNF), accumulation intra-neuronale de fibrilles formées de filaments appariés en hélices, majoritairement constitués de protéines Tau agrégées et pour lesquelles l’état de de phosphorylation est altéré. Si le principal facteur de risque de MA est l’âge, de nombreux facteurs de risques environnementaux et génétiques ont également été identifiés. Depuis plusieurs années, les études cliniques réalisées chez des patients atteints de la MA semblent indiquer que les troubles du sommeil, et en particulier le syndrome d’apnées du sommeil (SAS), pourraient être à l’origine de la conversion des patients présentant une déficience cognitive légère vers une MA, ainsi que d’une aggravation du tableau cognitif chez ces patients Alzheimer. Dans ce contexte, plusieurs études expérimentales se sont intéressées aux effets d’un stress hypoxique intermittent sur la composante amyloïde de la MA. En particulier, il a été démontré qu’un stress hypoxique intermittent pouvait potentialiser la synthèse de peptides Aβ in vitro mais également in vivo. En revanche, à l’heure actuelle, l’effet d’un stress hypoxique intermittent sur la pathologie Tau demeure très peu connu. Or, chez l’homme, la progression de la DNF est corrélée avec celle des atteintes cognitives. De fait, et suite aux études cliniques semblant indiquer une majoration des troubles cognitifs chez les patients Alzheimer présentant un SAS, il nous a semblé pertinent de nous intéresser à la pathologie Tau en situation d’hypoxie. Les objectifs de ces travaux de thèse étaient d’évaluer l’effet d’un stress hypoxique sur la mémoire et la protéine Tau chez l’animal. Pour cela, nous avons utilisé le modèle murin transgénique THY-Tau22, qui surexprime une protéine Tau humaine mutée et développe une pathologie Tau progressive corrélée avec une atteinte mnésique observable lors de tests comportementaux. Nous avons utilisé des animaux à différents stades de la pathologie Tau : les premiers présentaient une pathologie Tau modérée, les seconds présentaient une pathologie Tau à un stade plus avancé. Les animaux ont été soumis à deux protocoles d’hypoxie différents : un protocole d’hypoxies aiguës (Fraction inspirée en oxygène (FiO2) égale à 8% pendant une heure) mais répétées de façon bihebdomadaire pendant plusieurs mois, et un protocole d’hypoxies intermittentes (FiO2 variant de 5% à 21% par cycles de 60 secondes, 8 heures par jour, pendant deux semaines). Nos résultats ont mis en évidence des effets inattendus du stress hypoxique sur la mémoire des animaux, associés à des modifications de l’état de phosphorylation et de l’agrégation de la protéine Tau. En particulier, les animaux transgéniques les plus âgés (donc présentant une pathologie Tau a un stade avancé) soumis au protocole d’hypoxies intermittentes (modèle de SAS) ont présenté une amélioration de leurs capacités mnésiques, ce qui va à l’encontre des observations réalisées en clinique humaine (aggravation des troubles cognitifs des sujets atteints de la MA et présentant un SAS). Ces résultats sont associés à une réduction des quantités de protéines Tau agrégées dans l’hippocampe, signe d’une réduction de la pathologie Tau dans le modèle. Nous discutons ici ces résultats et leur apport en clinique humaine
Alzheimer’s disease (AD) is a multifactorial neurodegenerative pathology constituting the first cause of dementia. At a cerebral level, two kinds of histopathological lesions are found in patients: amyloid deposits (extracellular aggregates of β-amyloid peptides: Aβ) and neurofibrillary degeneration (NFD). NFD consists in intraneuronal accumulation of paired helical filaments, mainly composed of aggregated and hyperphosphorylated Tau proteins. Aging is the main risk factor for AD. However, numerous environmental and genetic risk factors have also been identified. Since several years, some clinical studies have shown that sleep disorders breathing, and especially the sleep apnea syndrome (SAS) could be responsible of the conversion of mild cognitive impairment to AD. SAS could also be an aggravating factor for AD, with an increase of the cognitive decline seen in patients. In this context, many experimental studies have been interested in the consequences of an intermittent hypoxic stress on the amyloid pathology. More specifically, it has been shown that an intermittent hypoxic stress could potentiate Aβ synthesis both in vitro and in vivo. Nevertheless, the impact of an intermittent hypoxic stress on Tau pathology remains poorly investigated. As clinical studies in AD patients with a SAS have shown an increase of the cognitive decline, and that it is well known that NFD is correlated with the cognitive impairment in AD patients, we were interested to study the Tau pathology under hypoxia.Our objectives in this thesis were to evaluate the consequences of a hypoxic stress on memory and Tau protein in animals. We used the THY-Tau22 transgenic mouse model, overexpressing a human mutated Tau protein and presenting a progressive Tau pathology correlated with a memory impairment observable in behavioural tasks. The animals were submitted to hypoxia at different stages of the Tau pathology: the younger animals showed a moderate Tau pathology whereas the olders presented a major Tau pathology. Two different protocols were used in this work. The first one consisted in repeated acute hypoxias (inspired fraction of oxygen (FiO2): 8% for 1 hour, twice a week, for several months). The second one was a protocol of intermittent hypoxias (FiO2 comprised between 5% and 21%, 60 seconds cycles, 8 hours per day, for 2 weeks). We observed some unexpected results of hypoxic stress on memory and Tau pathology in our transgenic mice. More specifically, the THY-Tau22 mice exhibiting the stronger Tau pathology (the older animals) have shown an improvement of their memory after two weeks of intermittent hypoxia. This result goes against the clinical observations (aggravation of the cognitive decline of AD patients with a SAS), but is correlated in our model to a significant decrease of aggregated Tau protein in the hippocampi of our mice. We discuss here these results and their contribution to human pathology
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Fourgeux, Cynthia. "Cholestérol-24S-hydroxylase (CYP46A1) et homéostasie du cholestérol dans la rétine en conditions physiologiques et pathologiques." Phd thesis, Université de Bourgogne, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00905888.

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Abstract:
Le cholestérol est le principal stérol présent dans la rétine. Dans sa forme libre, le cholestérol est distribué dans toutes les couches cellulaires de la rétine, alors que le cholestérol estérifié s'accumule essentiellement à la base de l'épithélium pigmentaire rétinien. La capacité intrinsèque de la rétine à synthétiser le cholestérol paraît limitée, ce qui implique nécessairement que des voies extra-rétiniennes participent activement à suppléer la rétine en cholestérol. Les cellules gliales de Müller contribueraient à l'apport de cholestérol aux neurones de la rétine, en particulier pour la formation des synapses. Les conséquences délétères d'une accumulation ou à l'inverse d'un déficit en cholestérol dans les neurones sur leur survie souligne l'importance de maintenir l'équilibre entre l'apport et la néosynthèse du cholestérol d'une part et son élimination d'autre part. Pour cela, la rétine neurale a en particulier la capacité de convertir, pour l'éliminer, le cholestérol en 24S-hydroxycholestérol. En effet, le transport du 24S-hydroxycholestérol au travers des membranes est facilité par la présence d'un groupe hydroxyle supplémentaire, lui conférant une polarité plus importante par rapport au cholestérol. L'enzyme qui catalyse cette réaction est la cholestérol-24S-hydroxylase (CYP46A1). Des liens ont été établis entre CYP46A1, 24S-hydroxycholestérol et processus neurodégénératifs dans le cerveau, suggérant un rôle potentiel dans certaines pathologies comme la maladie d'Alzheimer. CYP46A1 est exprimée dans la rétine neurale, et plus particulièrement dans les cellules ganglionnaires de la rétine. Le rôle de CYP46A1 dans la rétine reste pour l'instant inconnu. Cependant, par analogie avec le cerveau, nous pouvons supposer une fonction dans le contrôle de l'homéostasie du cholestérol dans les neurones et envisager une association avec des pathologies dégénératives de la rétine comme la Dégénérescence Maculaire Liée à l'Âge (DMLA) ou le glaucome. Dans ce contexte, l'objectif de nos travaux a consisté à évaluer le rôle de la cholestérol-24S-hydroxylase dans la rétine en conditions physiologiques et pathologiques. Par une approche clinique, nous avons trouvé qu'un polymorphisme génétique dans CYP46A1 était un facteur de risque de glaucome (Risque relatif=1,26, intervalle de confiance à 95%=1,006-1,574, p<0,05) (Fourgeux et al. 2009, Invest Ophthalmol Vis Sci 50:5712-7). Par contre, ce polymorphisme génétique n'a pas été retrouvé, en tant que tel, comme facteur de risque chez des patients DMLA, mais pourrait l'être chez les patients non porteurs d'allèles à risque dans les gènes CFH et LOC388715 (Fourgeux et al. 2012, Invest Ophthalmol Vis Sci 53:7026-33). Deux approches expérimentales nous ont permis de suggérer qu'il existe un lien entre le stress des cellules de la rétine et le 24S-hydroxycholestérol. En effet, dans une étude in vivo faite chez le rat, après avoir reproduit une caractéristique principale du glaucome par l'augmentation de la pression intraoculaire, nous avons suggéré le rôle crucial de la glie dans le maintien de l'expression de CYP46A1 au cours de la neurodégénérescence de la rétine (Fourgeux et al. 2012, Acta Ophthalmol, Sep 23 ; doi: 10.1111/j.1755-3768.2012.02490.x.). Enfin, l'inhibition pharmacologique de l'activité CYP46A1 dans la rétine par le voriconazole injecté in vivo chez le rat nous a permis de mettre en évidence que la diminution du contenu en 24S-hydroxycholestérol de la rétine était associée à une dysfonction des cellules ganglionnaires, évaluée par électrorétinographie. En parallèle, nous avons observé une activation gliale, dont l'amplitude était amplifiée par l'inhibition de l'activation microgliale induite par la minocycline [...]
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Mercier, Claudine. "La prévention en pédiatrie : analyse et étude statistique des hospitalisations de nourrissons dans un service de pédiatrie en 1983 à Nantes : estimation des taux d'admissions et de pathologies liées à des carences de mesures préventives." Nantes, 1985. http://www.theses.fr/1985NANT3350.

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Philippe, Christophe. "Cartographie physique du chromosome X humain : 1) contribution à la cartographie physique de la région q13-q22 du chromosome X humain : 2) analyse de deux cas de pathologies récessives liées à l'X chez des femmes porteuses de translocation (X ; Autosome) équilibrées." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1994. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/INPL_T_1994_PHILIPPE_C.pdf.

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Abstract:
Ce travail contribue à l'établissement de la carte physique de la région q13-q22 du chromosome X humain. Nous avons rassemblé huit translocations X ; Autosomes (t(X;A)) équilibrées chez des femmes présentant des troubles de la fonction ovarienne. Dans une première partie, nous définissons huit nouveaux points de cassure dans la région Xq13-q22. Ces balises sont tout d'abord isolées par hybridation somatique interspécifique à partir des t(X;A) ; elles sont ensuite localisées par rapport aux marqueurs de la région proximale des bras longs du chromosome X humain. En regroupant nos t(X;A) avec des délétions de la région Xq21 publiées précédemment, nous proposons un panel de réarrangements qui subdivise la région Xq21 en 21 segments, soit plus d'une borne par mégabase d'adn. Cette collection constitue donc un bon canevas pour la construction d'une carte physique, génétique et fonctionnelle détaillée de la région q21 du chromosome X humain. La deuxième partie de ce travail consiste en la caractérisation moléculaire fine des points de cassure sur l'X pour les deux t(X;A) présentées dans cette étude qui sont associées avec des pathologies récessives liées à l'X. D'une part, chez la patiente TDo, atteinte de choroïdérémie et porteuse d'une t(X;7)(q21;p12), nous confirmons la localisation du point de cassure sur l'X dans le gène CHM, entre le troisième et le quatrième exon. D'autre part, le point de cassure sur le chromosome X chez la patiente PMI, porteuse d'une t(X;13)(q13;q31) en association avec un retard mental, a permis le clonage positionnel d'un gène qui pourrait être un bon candidat pour l'un des nombreux retards mentaux non spécifiques liés à l'X que compte la région proximale des bras longs du chromosome X humain
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Garnier, Mickaël. "Modèles descriptifs de relations spatiales pour l'aide au diagnostic d'images biomédicales." Thesis, Paris 5, 2014. http://www.theses.fr/2014PA05S015/document.

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Abstract:
La pathologie numérique s’est développée ces dernières années grâce à l’avancée récente des algorithmes d’analyse d’images et de la puissance de calcul. Notamment, elle se base de plus en plus sur les images histologiques. Ce format de données a la particularité de révéler les objets biologiques recherchés par les experts en utilisant des marqueurs spécifiques tout en conservant la plus intacte possible l’architecture du tissu. De nombreuses méthodes d’aide au diagnostic à partir de ces images se sont récemment développées afin de guider les pathologistes avec des mesures quantitatives dans l’établissement d’un diagnostic. Les travaux présentés dans cette thèse visent à adresser les défis liés à l’analyse d’images histologiques, et à développer un modèle d’aide au diagnostic se basant principalement sur les relations spatiales, une information que les méthodes existantes n’exploitent que rarement. Une technique d’analyse de la texture à plusieurs échelles est tout d’abord proposée afin de détecter la présence de tissu malades dans les images. Un descripteur d’objets, baptisé Force Histogram Decomposition (FHD), est ensuite introduit dans le but d’extraire les formes et l’organisation spatiale des régions définissant un objet. Finalement, les images histologiques sont décrites par les FHD mesurées à partir de leurs différents types de tissus et des objets biologiques marqués qu’ils contiennent. Les expérimentations intermédiaires ont montré que les FHD parviennent à correctement reconnaitre des objets sur fonds uniformes y compris dans les cas où les relations spatiales ne contiennent à priori pas d’informations pertinentes. De même, la méthode d’analyse de la texture s’avère satisfaisante dans deux types d’applications médicales différents, les images histologiques et celles de fond d’œil, et ses performances sont mises en évidence au travers d’une comparaison avec les méthodes similaires classiquement utilisées pour l’aide au diagnostic. Enfin, la méthode dans son ensemble a été appliquée à l’aide au diagnostic pour établir la sévérité d’un cancer via deux ensembles d’images histologiques, un de foies métastasés de souris dans le contexte du projet ANR SPIRIT, et l’autre de seins humains dans le cadre du challenge CPR 2014 : Nuclear Atypia. L’analyse des relations spatiales et des formes à deux échelles parvient à correctement reconnaitre les grades du cancer métastasé dans 87, 0 % des cas et fourni des indications quant au degré d’atypie nucléaire. Ce qui prouve de fait l’efficacité de la méthode et l’intérêt d’encoder l’organisation spatiale dans ce type d’images particulier
During the last decade, digital pathology has been improved thanks to the advance of image analysis algorithms and calculus power. Particularly, it is more and more based on histology images. This modality of images presents the advantage of showing only the biological objects targeted by the pathologists using specific stains while preserving as unharmed as possible the tissue structure. Numerous computer-aided diagnosis methods using these images have been developed this past few years in order to assist the medical experts with quantitative measurements. The studies presented in this thesis aim at adressing the challenges related to histology image analysis, as well as at developing an assisted diagnosis model mainly based on spatial relations, an information that currently used methods rarely use. A multiscale texture analysis is first proposed and applied to detect the presence of diseased tissue. A descriptor named Force Histogram Decomposition (FHD) is then introduced in order to extract the shapes and spatial organisation of regions within an object. Finally, histology images are described by the FHD measured on their different types of tissue and also on the stained biological objects inside every types of tissue. Preliminary studies showed that the FHD are able to accurately recognise objects on uniform backgrounds, including when spatial relations are supposed to hold no relevant information. Besides, the texture analysis method proved to be satisfactory in two different medical applications, namely histology images and fundus photographies. The performance of these methods are highlighted by a comparison with the usual approaches in their respectives fields. Finally, the complete method has been applied to assess the severity of cancers on two sets of histology images. The first one is given as part of the ANR project SPIRIT and presents metastatic mice livers. The other one comes from the challenge ICPR 2014 : Nuclear Atypia and contains human breast tissues. The analysis of spatial relations and shapes at two different scales achieves a correct recognition of metastatic cancer grades of 87.0 % and gives insight about the nuclear atypia grade. This proves the efficiency of the method as well as the relevance of measuring the spatial organisation in this particular type of images
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Meddeb, Wiem. "Extraction, caractérisation physicochimique, profil lipidique et activité cytoprotectrice d'huiles de Chardon-Marie de Tunisie." Thesis, Bourgogne Franche-Comté, 2018. http://www.theses.fr/2018UBFCK063.

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Abstract:
La famille des Astéracées est économiquement très importante, car beaucoup de ses plantessont cultivées principalement pour leurs valeurs alimentaires dont la laitue (Lactuca), lachicorée (Cichorium) et le tournesol (Heliantus annuus) cultivé pour son huile. Une despropriétés typiques de cette famille, dont fait partie le Silybum marianum, est la richesse deses huiles en divers composés naturels bénéfiques pour la santé. Actuellement et pour lesdécennies à venir, les maladies liées à l’âge constituent un problème majeur de santépublique. Prévenir leur apparition ou s'opposer à leur évolution est un objectif majeur. Dansce contexte, les activités cytoprotectrices de l'huile de graines de Silybum marianumoriginaires de différentes régions de la Tunisie ont été étudiées sur le modèled’oligodendrocytes murins 158N en utilisant le 7-cétocholestérol (7KC) comme agentcytotoxique. Le 7KC a été utilisé car il est augmenté dans le plasma, le liquide céphalorachidienet/ou certains tissus (paroi vasculaire et intestinale, rétine, cristallin, cerveau) depatients atteints de maladies liées à l’âge (maladies cardiovasculaires, maladie d'Alzheimer,dégénérescence maculaire liée à l’âge, cataracte) ou de maladies inflammatoires évolutives del’intestin. Le 24S-hydroxycholestérol (24S-OHC) a aussi été utilisé car il est augmenté dans lecerveau aux stades précoces de la maladie d’Alzheimer. Afin de déterminer la composition del'huile de Silybum marianum (acides gras, tocophérols, polyphénols, phytostérols) diversestechniques physicochimiques et de chromatographie liquide et gazeuse ont été utilisées. Lespropriétés anti-oxydantes de l'huile de Silybum marianum ont été définies par les tests KRL,FRAP et DPPH et les propriétés cytoprotectrices par des techniques complémentaires demicroscopie, de cytométrie en flux et de biochimie. Les études sur la compositionphysicochimique des huiles des graines de Silybum marianum de différentes régions de laTunisie (Bizerte, Sousse, Zaghouan) ont montré que ces dernières sont riches en Vitamine E(α-tocophérol) et sont fortement anti-oxydantes. Les acides gras majeurs sont l'acidelinoléique (C18:2) (valeurs comprises entre 57,0% et 60,3%) et l'acide oléique (C18:1) (lesvaleurs se situent entre 15,5% et 22,4%). Trois acides phénoliques ont également étéidentifiés (vanillique, p-coumarique et silybine), avec une prédominance de l'acide vanillique.Sur les cellules 158N, ces huiles atténuent la cytotoxicité du 7KC et du 24S-OHC: perted'adhérence cellulaire, altération de la membrane plasmique, dysfonctionnementmitochondrial, surproduction d’espèces réactives de l’oxygène, induction de l'apoptose(condensation et / ou fragmentation nucléaire, activation de la caspase-3 et clivage PARP) etautophagie (activation de LC3-I en LC3-II). L'atténuation des effets cytotoxiques du 7KC etdu 24S-OHC observée avec les huiles de Silybum marianum est de l'ordre de celle observéeavec l’α-tocophérol utilisé comme témoin positif. La composition chimique et les résultatsobtenus cellules 158N sont en faveur d’effets bénéfiques de l’huile de Chardon-Marie sur lasanté humaine et la prévention de certaines maladies liées à l’âge
The family Asteraceae is economically very important because many of its plants are grownmainly for their food values including lettuce (Lactuca), chicory (Cichorium) and sunflower(Heliantus annuus) grown for its oil. One of the typical properties of this family, whichincludes Silybum marianum, is the richness of its oils in various natural compounds beneficialto health. Currently and for decades to come, age-related diseases are a major public healthproblem. Preventing their appearance or opposing their evolution is a major objective. In thiscontext, the cytoprotective activities of Silybum marianum seed oil originating from differentarea of Tunisia were studied on the 158N murine oligodendrocyte model using 7-ketocholesterol (7KC) and 24S-hydroxycholesterol (24S-OHC) as a cytotoxic agent. The 7KChas been used because it is increased in plasma, cerebrospinal fluid and / or tissues (vascularand intestinal wall, retina, lens, brain) of patients with age-related diseases (cardiovasculardiseases, Alzheimer's disease, age-related macular degeneration, cataract) or inflammatorybowel disease. The 24S-OHC was used because it is increased in the brain at the early stagesof Alzheimer’s disease. In order to determine the composition of Silybum marianum oil (fattyacids, tocopherols, polyphenols, phytosterols) various liquid and gas chromatographytechniques were used. The anti-oxidant properties of Silybum marianum oil were defined byKRL, FRAP and DPPH tests and cytoprotective properties by complementary microscopy,flow cytometry and biochemistry techniques. Studies on the physicochemical composition ofSilybum marianum seeds oils from different regions of Tunisia (Bizerte, Sousse, Zaghouan)have shown that the latter are rich in vitamin E (α-tocopherol) and are strongly antioxidant.The major fatty acids are linoleic acid (C18:2) (values between 57.0% and 60.3%) and oleicacid (C18:1) (values between 15.5% and 22.4%).. Three phenolic acids have also beenidentified (vanillic, p-coumaric and silybin), with a predominance of vanillic acid. On 158Ncells, these oils attenuate the cytotoxicity of 7KC and 24S-OHC: loss of cell adhesion,alteration of the plasma membrane, mitochondrial dysfunction, overproduction of reactiveoxygen species, induction of apoptosis (nuclear condensation and / or fragmentation). ,activation of caspase-3 and PARP cleavage) and autophagy (activation of LC3-I in LC3-II).The attenuation of cytotoxic effects of 7KC and 24S-OHC observed with Silybum marianumoils is of the order of that observed with α-tocopherol used as a positive control. The chemicalcomposition and results obtained on 158N cells are in favor of the beneficial effects of milkthistle oil on human health and on its ability to prevent some age-related diseases
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Hoertel, Nicolas. "Effets des pathologies psychiatriques sur le risque de tentative de suicide : similitudes et différences selon l’âge au sein d’une cohorte en population générale Mental disorders and risk of suicide attempt: a national prospective study A dimensional liability model of age differences in mental disorder prevalence: evidence from a national sample Effects of psychiatric disorders on suicide attempt: similarities and differences between older and younger adults in a national cohort study A comprehensive model of predictors of suicide attempt in depressed individuals and effect of treatment-seeking behavior: results from a national 3-year prospective study." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2018. http://www.theses.fr/2018USPCB007.

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Abstract:
Les troubles mentaux sont associés à un risque accru de tentative de suicide. Or, la comorbidité entre les troubles psychiatriques est fréquente et peut être expliquée par des modèles où ces troubles sont appréhendés comme des manifestations de dimensions latentes de psychopathologie. Nous avons cherché à évaluer si le risque de tentative de suicide est dû à certains troubles psychiatriques ou à certaines dimensions de psychopathologie (internalisée ou externalisée) ou à un facteur de psychopathologie générale. Au sein d’une cohorte en population générale suivie sur une période de trois ans, nous avons utilisé des modèles d’équation structurelle afin de distinguer les effets spécifiques des effets partagés des différents troubles mentaux sur le risque de tentative de suicide. La structure dimensionnelle globale des troubles psychiatriques était invariante selon l'âge et leurs effets sur le risque de tentative de suicide étaient médiés principalement par une dimension de psychopathologie générale représentant un effet commun partagé, quel que soit le groupe d'âge. Cet effet était significativement plus faible chez les adultes d’au moins 50 ans comparativement aux sujets les plus jeunes. Les résultats étaient similaires en utilisant différentes approches de modélisation de la comorbidité psychiatrique, ainsi que dans un modèle incluant la plupart des facteurs de risque cliniques de tentative de suicide dans le sous-groupe de sujets présentant un épisode dépressif caractérisé. Nos résultats suggèrent que le facteur de psychopathologie générale a un rôle majeur et devrait être considéré comme une cible thérapeutique privilégiée afin de permettre une meilleure prévention du suicide
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