Dissertations / Theses on the topic 'Peau pathologie'
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Rolland, Marie-Claire. "La peau humaine dans la litterature romaine : physiologie, pathologie, thérapeutique, esthétique, sémiologie." Thesis, Rennes 2, 2018. http://www.theses.fr/2018REN20022.
Full textThe aim of this thesis is to observe and analyse representations of human skin in Latin literature from the 2nd century B.C. to the 2nd century A.D. Starting with a detailed lexical and semantic study of the vocabulary pertaining to the skin, the notion of skin is examined in various fields, allowing us to address implicit allusions to skin along with the associated vocabulary, images and meanings. A physiological approach, based on anatomical knowledge inherited from Greek philosophers, brings us to a definition of normal skin in terms of its nature, functions and changes. Rarely represented in its normal, healthy state, skin is subject to assaults and ill health in various ways. Analysing skin trauma in epic poems and skin pathology, which is referred to in Celsus’ De Medicina, reveals a prevailing representation of damaged and even fatally wounded skin, this being of utmost importance in clinical diagnosis, a means of measuring the health - and particularly illness - of the body as a whole. Therapeutics and cosmetics, in Celsus’ texts, aim to heal whereas in Pliny’s Naturalis Historia, the aim is to care for and mask imperfections. These often cause as much harm to the skin as good. This damaged skin coexists with ideal skin, mainly in elegiac poetry, a skin meant to be seen and touched, from an aesthetical and erotic perspective. Finally, human skin in Roman society acts as an interface, indicating to which social group anindividual may belong as much as one’s identity within that group, according to ethnical, social, biographical, moral and psychological criteria
Billon, Corinne. "Pathologie cutanée du mamelon et de l'aréole." Bordeaux 2, 1997. http://www.theses.fr/1997BOR23073.
Full textLe, Moine Alain. "Rôles de l'IL-4, de l'IL-5 et des éosinophiles dans les rejets de greffes de peau chez la souris." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2000. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/211703.
Full textEl, Jamal Noura. "Homéostasie de l'intestin et de la peau : cibles et modèles pour étudier l'inflammation et la carcinogenèse." Phd thesis, Université du Droit et de la Santé - Lille II, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00790621.
Full textThévenet, Annick. "Modalités de la cicatrisation de plaies expérimentales et spontanées de la peau embryonnaire de poulet." Grenoble 1, 1986. http://www.theses.fr/1986GRE10039.
Full textLuquet-Rouvière, Catherine. "Evaluation clinique des eaux de Fontcaude (Juvignac) en pathologie digestive et dermatologique." Montpellier 1, 1990. http://www.theses.fr/1990MON11299.
Full textMottier, Lorène. "Étude de l’influence des neurones sensoriels dans deux mécanismes de l’inflammation neurogène : l’angiogenèse et la réépithélialisation en condition glyquée." Master's thesis, Université Laval, 2014. http://hdl.handle.net/20.500.11794/25505.
Full textNeurogenic inflammation is an inflammatory process, characterized by the release of neuropeptides, particularly substance P and Calcitonin Gene-Related Peptide (CGRP), in sensory neurons. During this process, angiogenesis and reepithelialization following an injury are essential to reduce inflammation. Within certain diseases, such as diabetes, angiogenesis is diminished, and patients are often suffering of diabetic neuropathies and poor wound healing. To understand that process, two models were reconstructed using tissue engineering with a collagen and chitosan sponge: one model mimics a reconstructed endothelialized and innervated dermis, and the second one follows over time re-epithelialization in a glycated model using glyoxal. Based on our results, substance P seems to be a neuropeptide playing a major role in both mechanisms.
Vassal, Jean-Michel. "Biologie, écologie et pathologie d'Hylesia metabus (Cramer 1775) (Lépidoptères:Saturniidae), agent de la "papillonite" en Guyane française : mise en place d'une structure de lutte intégrée." Montpellier 2, 1989. http://www.theses.fr/1989MON20046.
Full textFarez, Tarik. "Impact de l'interféron gamma sur la production de la kératine 15 dans les kératinocytes isolés de la peau de patients atteints d'épidermolyse bulleuse simplex." Thèse, Université Laval, 2013. http://constellation.uqac.ca/2646/1/030585499.pdf.
Full textDjeldjellani, Mohamed. "Étude d'un applicateur destiné à la mesure des propriétés diélectriques de la peau par réflectométrie temporelle." Besançon, 1989. http://www.theses.fr/1989BESA2019.
Full textAmet, Yolande. "Stéroi͏̈des sexuels et glandes à sécrétion externe de la peau : Interactions stéroi͏̈des-récepteurs et répercussions physiologiques." Brest, 1986. http://www.theses.fr/1986BRES2019.
Full textAmouroux, Marine. "Caractérisation de la transformation néoplasique de la peau par spectroscopies optiques sur fantôme de mélanome et carcinome épidermoïde murin photo-induit." Phd thesis, Université Henri Poincaré - Nancy I, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00339385.
Full textBouju, Bénédicte Coiffard Laurence. "Les pathologies dermatologiques à l'officine traitements et conseils /." [S.l.] : [s.n.], 2008. http://castore.univ-nantes.fr/castore/GetOAIRef?idDoc=40341.
Full textSchramm, Frédéric. "Inflammation cutanée et borréliose de Lyme : étude in vitro des interactions entre les cellules résidentes de la peau et Borrelia." Phd thesis, Université de Strasbourg, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00757050.
Full textDauchel, Hélène. "Le système du complément et la cellule endothéliale : biosynthèse in vitro des protéines de la voie alterne et activation pathologique au cours des vascularités leucocytoclasiques." Rouen, 1993. http://www.theses.fr/1993ROUES032.
Full textVITETTA, ANNIE. "Distribution de la tenascine en peau humaine normale et pathologique : etude immunomorphologique." Nice, 1988. http://www.theses.fr/1988NICE6803.
Full textAouidet, Abdallah. "L'installation et le devenir de l'athérome chez le singe Cynomolgus (Macacus fascicularis) soumis à un régime hypercholestérolémique : étude des parois aortiques et coronariennes, des paramètres sériques et cutanés." Toulouse 3, 1987. http://www.theses.fr/1987TOU30237.
Full textVörös, Eva. "Étude quantitative des altérations microanatomiques de la peau au cours du vieillissement : rapport avec les pathologies du vieillissement : influence de certains principes actifs dermopharmacologiques." Paris 12, 1992. http://www.theses.fr/1992PA120027.
Full textThibault, Jacky. "Contribution a l'etude des moyens de prevention de l'escarre de position assise : developpement d'une plateforme de mesure des pressions et deplacements au niveau de l'assise et mise au point d'une aide technique a la prevention, active et personnlisee, geree par microprocesseur." Poitiers, 1987. http://www.theses.fr/1987POIT2288.
Full textZahouani, Hassan. "Qantification de la topographie des surfaces : Application à la peau humaine et à ses pathologies. Extension à toute nature de surfaces." Besançon, 1989. http://www.theses.fr/1989BESA2051.
Full textHanauer, André. "Le chromosome x humain : recherche de sequences exprimees et localisation genique de deux loci correspondanta des maladies." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1989. http://www.theses.fr/1989STR13010.
Full textGendreau, Isabelle. "Études dermopharmacologiques d'une nouvelle molécule destinée au traitement du psoriasis grâce à l'utilisation d'un modèle de substitut cutané pathologique optimisé." Master's thesis, Université Laval, 2015. http://hdl.handle.net/20.500.11794/27545.
Full textPsoriasis is a serious cutaneous disease for which there is currently no cure. In vitro psoriatic skin models could become new tools to assess the potency of new drugs during the development of new therapies. First, this study aimed to optimize the production of psoriatic skin substitutes by the self-assembly method, and then use them to assess the effectiveness of a new potentially antipsoriatic molecule, tBEU. Initially, healthy and psoriatic substitutes have been produced by the self-assembly method partially modified, using 6-well and 12-well plates. These experiments demonstrated that the 6-well plates were more effective for the production of reproducible substitutes and representative of psoriatic skin in vivo than the 12-well plates. Then, these substitutes were treated with tBEU, showing that this molecule decreases significantly keratinocytes proliferation and improves their differentiation. Thus, tBEU may eventually be used as an effective topical treatment for psoriasis.
Jolivot, Romuald. "Développement d'un outil d'imagerie dédié à l'acquisition, à l'analyse et à la caractérisation multispectrale des lésions dermatologiques." Phd thesis, Université de Bourgogne, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00695305.
Full textAli, Akhtar. "Pathology and molecular comparison of a range of pea seed-borne mosaic virus isolates." Title page, contents and summary only, 1999. http://web4.library.adelaide.edu.au/theses/09ACP/09acpa398.pdf.
Full textFörster, Matthias. "Évaluation de la pénétration cutanée des ingrédients de systèmes dispersés : utilisation combinée des cellules de diffusion et de la microscopie confocale Raman." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00865818.
Full textLigat, Julio S. "Pathology and distribution in the host of pea seed-borne mosaic virus." Title page, contents and summary only, 1993. http://web4.library.adelaide.edu.au/theses/09PH/09phl723.pdf.
Full textLim, Maureen Lim. "PEAK RELATIONAL TRAINING – DIRECT TRAINING MODULE: VOCAL IMITATION ACQUISITION BETWEEN DEVELOPMENTAL SOUNDS AND RANDOM." OpenSIUC, 2016. https://opensiuc.lib.siu.edu/theses/1961.
Full textLuciani, Flavie. "Rôle de la E-cadhérine et de béta-caténine dans le développement normal et pathologique du lignage mélanocytaire." Paris 11, 2008. http://www.theses.fr/2008PA112114.
Full textMelanocytes synthesize melanin, that they distribute to surrounding keratinocytes with whom they form the epidermal melanin unit. The two cell types adhere through different types of junctions including adherens junctions, composed of E-cadherin and β-catenin. During my thesis, we demonstrated that the absence of E-cadherin in melanocytes in vivo leads to a defect of proliferation and morphology of cells affecting the organization of the epidermal melanin unit and thus the pigmentation. E-cadherin is also known as tumor suppressor. We have shown in an in vivo model promoting melanocytes transformation, that the absence of E-cadherin may increase the aggressiveness of melanoma. In the melanocyte lineage, β-catenin is also involved in the Wnt signaling pathway and regulates the transcription of target genes. The development of β-catenin gain- and loss-of-function in melanocytes, highlighted a proliferation defect in those cells. The quantity of β-catenin seems to be essential for melanocyte proliferation, mostly done via Mitf-M. Mitf-M acts directly on the proliferation or indirectly by inhibiting the activity of transcription in β-catenin on its targets, including c-myc and cyclin-D1. Finally, β-catenin contributes to the immortalization during melanocytes transformation in vivo. The stabilized form of β-catenin inhibits protein expression of p16Ink4a. The activation of β-catenin can therefore go through the process of senescence at the tumor progression of melanoma
Alawieh, Mohamad. "Etude des mécanismes de régulation après injection de cellules dendritiques allogéniques OX62+ associées à un anticorps anti-CD4 non déplétant dans un modèle de rejet chronique chez le rat." Phd thesis, Université de Bourgogne, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00938811.
Full textDupasquier, Florence. "Hydrogels physiques de chitosane pour la régénération in vivo du tissu cutané après brûlures du troisième degré." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00830801.
Full textWong, Mui-Yun. "Physiological and Molecular Analysis of Nitric Oxide Synthase During Bacterial Infection of Pea (Pisum sativum L.)." NCSU, 2004. http://www.lib.ncsu.edu/theses/available/etd-05202004-173922/.
Full textPoulin, Lionel. "Rôles de l'IL-9 dans les mécanismes de rejet d'allogreffe dirigés par les lymphocytes TCDA+ de type Th2." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2005. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/211038.
Full textL'interleukine 9 (IL-9) est une cytokine produite par les lymphocytes T qui joue un rôle important dans les voies effectrices Th2. Dans la littérature, l’IL-9 est fortement associée au développement de l’éosinophilie tissulaire. Dans notre première étude, nous avons analysé le rôle joué par l'IL-9 dans le rejet d'allogreffe bm12 par des souris B6 (pour C57BL/6), un modèle dans le lequel une simple disparité au niveau de la molécule du CMH de classe II favorise une réaction inflammatoire de type Th2. Dans ce modèle, de faible alloantigénicité, les greffes cardiaques bm12 survivent presque indéfiniment dans les receveurs B6 (>60 jours). Nos expériences ont été conçues afin de savoir si l’expression de l’IL-9 au niveau de la greffe pouvait modifier la survie de greffes cardiaques exprimant les alloantigènes bm12. Nous avons ainsi montré que la production locale d’IL-9 induit le rejet des allogreffes cardiaques exprimant l’alloantigène I-Abm12 (survie <30jours). Aucun des organes transgéniques pour l’IL-9 n’a survécu plus de 30 jours alors que des greffes non transgéniques ne furent pas rejetées (>50 jours). L’analyse histologique des allogreffes cardiaques transgéniques pour l’IL-9 montre une infiltration cellulaire dense du myocarde. La composante principale de cet infiltrat est la présence de nombreux éosinophiles.
Pour étudier la contribution des cytokines de type Th2, comme l’IL-4 et l’IL-5, dans le rejet des cœurs transgéniques pour l’IL-9, nous avons sélectivement bloqué ces cytokines lors du processus de rejet. Le traitement avec des anticorps neutralisant l’IL-4 bloque complètement le rejet induit par l’IL-9 et permet la survie à long terme des allogreffes cardiaques. Au point de vue de l’histologie ces greffes ne montrent ni infiltration leucocytaire ni artériopathie. Afin de déterminer si l’infiltration éosinophilique induite par l’IL-9 provient de l’activité directe de l’IL-9 ou est le résultat de la sécrétion d’IL-5, un traitement avec un anticorps anti-IL-5 a été appliqué aux receveurs d'allogreffe cardiaque. Ce traitement augmente la survie de la majorité des allogreffes et modifie de manière marquée la composition de l’infiltrat cellulaire en prévenant le recrutement des éosinophiles. De manière intéressante, les cœurs transgéniques pour l’IL-9 qui survivent indéfiniment après le traitement anti-IL-5 arborent une importante fibrose.
A la différence du cœur bm12, la peau bm12 greffée sur un receveur B6 subit un rejet rapide et l'histologie des greffes rejetées révèle la présence d'infiltrats denses à éosinophiles. Notre laboratoire a montré que ce processus de rejet est dirigé par les lymphocytes T CD4+ alloréactifs et que les souris B6 déficientes pour l'IL-5 et la voie de cytotoxicité Fas/Fas-L sont incapables de rejeter des peaux bm12. Nos premiers résultats laissaient supposer un rôle pour l'IL-9 dans notre modèle de rejet de greffes en disparité des molécules du CMH de classe II: premièrement, nous avions observé la production d'IL-9 par les lymphocytes T de type Th2 alloréactifs et deuxièmement, l'ARNm d'IL-9 était fortement exprimé au niveau des allogreffes de peaux rejetées. C’est pourquoi, la survie de peaux bm12, déficientes pour la molécule Fas, greffées sur des receveurs B6 déficients pour l'IL-9 (B6.IL-9-/-) a été comparée avec celle de peaux transplantées sur des receveurs B6. Nous avons montré que, comme les souris B6 normales, les animaux B6.IL-9-/- rejettent leur greffe dans les 15 jours. Donc, contrairement à l'IL-5, l'IL-9 n'est pas essentielle pour le rejet de peau dirigé par les cellules T CD4+ de type Th2 dans notre modèle de disparité des molécules du CMH de classe II.
Néanmoins, les allogreffes de peaux, dans notre modèle de disparité des molécules du CMH de classe II, contiennent moins d’éosinophiles lorsqu’elles sont rejetées par des receveurs déficients pour la synthèse d’IL-9 (IL-9-/-). En plus du modèle bm12, nous avons également observé un rôle de l’IL-9 dans un autre modèle de rejet Th2. Il a été montré par notre laboratoire que le rejet d’allogreffes cardiaques Balb/c complètement incompatibles par des souris receveuses B6.CD8-/- est caractérisé par le recrutement d’éosinophiles dans l’organe rejeté (106). Dans celui-ci, l’ARNm de l’IL-9 est présent pendant le rejet, de même que l’IL-4 et l’IL-5 et les greffes rejetées par des receveurs IL-9-/- contiennent moins d’éosinophiles par rapport à des receveurs contrôles. Les mécanismes par lesquels l’IL-9 induit le recrutement des éosinophiles ne sont pas complètement connus.
L’IL-5 est considérée comme la cytokine clé pour le développement de l’éosinophilie. De plus, le rejet aigu des cœurs transgéniques pour l’IL-9 est caractérisé par une infiltration massive d'éosinophiles et est inhibé lors de la neutralisation de l'IL-5. Nous avons entrepris la seconde étude pour investiguer le lien fonctionnel entre l’IL-9 et l’IL-5 dans le rejet d’allogreffe, ce qui permettra de mieux comprendre le recrutement des éosinophiles par l’IL-9.
Bien que le rejet ne soit pas inhibé par le manque d’IL-9, les allogreffes rejetées par les souris déficientes en IL-9 contiennent moins d’éosinophiles par rapport à des souris contrôles et présentent une production plus faible d’IL-5 par les cellules T alloréactives. De manière intéressante, la production optimale d’IL-5 après une stimulation allogénique requiert un récepteur à l’IL-9 (IL-9R) fonctionnel sur les cellules répondeuses. De plus, l’infiltration d’éosinophiles induite par l’IL-9 est absente dans des peaux transplantées sur des receveurs déficients pour le récepteur de l’IL-9. Finalement, la production d’IL-5 par des cellules T CD4+ stimulées par l’anti-CD3 est abolie par la neutralisation de l’IL-9.
En conclusion, nous pouvons dire que l'IL-9 est capable d'induire un rejet de type Th2, caractérisé par une forte infiltration d’éosinophiles et une dépendance à l'IL-5 et à l'IL-4. Notre étude montre également que l’IL-9 peut agir directement sur les cellules T CD4+ pour induire leur capacité à sécréter de l’IL-5. Cependant, l’IL-9 n’est pas indispensable au processus de rejet Th2 et il est probable que lorsque l’IL-9 est bloquée d'autres cytokines soient capables de compenser son absence. Notre étude permet une meilleure compréhension des voies complexes du recrutement des éosinophiles.
Doctorat en sciences biomédicales
info:eu-repo/semantics/nonPublished
Liu, Xiaoguang. "Characterization of the pea pathogenicity (PEP) gene cluster in the fungal pathogen Nectria haematococca." Diss., The University of Arizona, 2002. http://hdl.handle.net/10150/279972.
Full textGeraldeli, Gizele M. R. "Microtensile bond strength after environmental challenge of peak SE with proteolytic inhibitor." Thesis, University of Iowa, 2012. https://ir.uiowa.edu/etd/2874.
Full textHamoudi, Mounira cherifa. "Evaluation d'une forme galénique à base d'alpha cyclodextrine et d'huile végétale pour l'administration par voie orale de molécules actives peu solubles dans l'eau." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00769948.
Full textJacob, Laurent. "Role immunogene d'une proteine de surface cellulaire au cours du lupus erythemateux dissemine." Paris 6, 1986. http://www.theses.fr/1986PA066541.
Full textFunnell, Deanna Lillian. "The inheritance of pathogenicity genes in Nectria haematococca mating population VI and the association of virulence of pea with dispensable chromosomes." Diss., The University of Arizona, 1996. http://hdl.handle.net/10150/288699.
Full textChaillol, Isabelle. "Mesure de l'exposition au rayonnement ultraviolet solaire pour les études épidémiologiques." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00831718.
Full textZhu, Yanmin. "The expression of a pectinmethylesterase (PME) gene in root tips of pea and its impact on border cell separation and plant-microbe interactions in the rhizosphere." Diss., The University of Arizona, 1999. http://hdl.handle.net/10150/288949.
Full textCeloy, Rhodesia Mateo. "(+)-Pisatin Biosynthesis: From (-) Enantiomeric Intermediates via an Achiral Isoflavene." Diss., The University of Arizona, 2013. http://hdl.handle.net/10150/293423.
Full textDahan, (ép Gaubert) Marie-Line. "L'effet du vieillissement sur la microcirculation cutanée." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00370422.
Full textChez la souris âgée, sans neuropathie périphérique, la PIV était altérée en raison d'une diminution de la vasodilatation endothélium-dépendante ; et la contribution des facteurs endothéliaux de la vasodilatation était modifiée : l'Endothelium-Derived Hyperpolarizing Factor jouait un rôle primordial en raison d'une diminution du monoxyde d'azote et de la prostacycline. Chez les sujets âgés (60-75 ans), la PIV était altérée en comparaison avec les sujets jeunes (20-35 ans) en raison d'une diminution de la vasodilatation endothélium-dépendante mais aussi d'une altération des fibres capsaïno-sensibles et/ou des neurotransmetteurs. En présence d'une neuropathie périphérique, la PIV était abolie. Ces modifications de la microcirculation cutanée au cours du vieillissement expliqueraient la plus grande vulnérabilité de la peau à l'ischémie et l'augmentation du risque d'ulcère de pression liée à l'âge. La compréhension des modifications de la PIV avec l'âge permet d'entrevoir de nouvelles perceptives de prévention et de traitement de l'ulcère de pression chez le sujet âgé.
Wessels, Andries Bernardus. "Genetic characterization and fungicide resistance profiles of Botrytis cinerea in rooibos nurseries and pear orchards in the Western Cape of South Africa." Thesis, Stellenbosch : Stellenbosch University, 2012. http://hdl.handle.net/10019.1/20070.
Full textENGLISH ABSTRACT: Botrytis cinerea Pers. Fr. [teleomorph Botryotinia fuckeliana (de Bary) Whetzel] causes serious losses of over 200 crops worldwide, including rooibos seedlings and pears. This pathogen is characterized by morphological, physiological and genetic diversity. The genetic diversity and population structure have not been investigated for B. cinerea populations in South Africa. Botrytis cinerea collected from rooibos seedlings and in pear orchards in the Western Cape of South Africa were investigated in the present study. The study was done with the aid of microsatellite markers, the amplification of mating type alleles MAT1-1 and MAT1-2 and determination of resistance towards various fungicides. Population dynamics was inferred and a similar picture emerged in both production systems. Botrytis cinerea annually causes severe losses of rooibos seedlings (Aspalathus linearis) in nurseries situated in the Clanwilliam region. Sampling was done in five nurseries and the cryptic species status of the isolates obtained was determined through restriction enzyme digestion of the Bc-hch gene. All but one (206 out of 207) of the isolates belonged to Group II or B. cinerea ‘sensu stricto’. Analysis of the B. cinerea Group II population, using seven microsatellite loci, was performed to assess the genetic population structure. Total gene diversity (H) was high, with a mean of 0.67. Two of the nurseries populations’ sample sizes were severely limited after clone correction, yet 100 genotypes were discerned among the 206 isolates genotyped. The percentage of maximal genotypic diversity (G) ranged between 16 and 68 for the five populations, with a total value of 17 for the 100 genotypes. One genotype, represented by 27 clones, was isolated from four nurseries. Relatively low but significant population differentiation was observed in total between nurseries (mean FST = 0.030, P = 0.001). The distribution of mating types MAT1-1 and MAT1-2 differed significantly from the ratio of 1:1 for the total population plus two of the nurseries’ populations. Three nursery populations had an equal mating type distribution. The index of association (IA) analyses suggests that the populations are asexually reproducing. Analysis of molecular variance (AMOVA) indicated that 97% of the total genetic variation is distributed within subpopulations. Fungicide resistance frequency against iprodione for 198 of the genotyped isolates displayed highly varying levels of resistance amongst the five nurseries. The mean total incidence of resistance towards iprodione was 43%, ranging from 0% to 81% for the five nurseries. Baseline sensitivity towards pyrimethanil yielded an average EC50 value of 0.096 mg/L. Botrytis cinerea isolates were collected from pear blossoms (Pyrus communis) in four orchards. Two orchards in the Ceres area and two in the Grabouw area were sampled from. A total of 181 isolates were collected from the four orchards. Incidence of blossom infection in the orchards ranged from 3% to 17%. Overall, there was a high incidence of isolates that had only the Boty transposable element (74%) compared to those harbouring both (Boty and Flipper), simultaneously (transposa, 24%). One isolate examined had the Flipper element only. Cryptic species status according to restriction enzyme digestion of the Bc-hch gene indicated that all the isolates belonged to Group II or B. cinerea ‘sensu stricto’. Analysis of the Group II population, through the use of seven microsatellite loci, was performed to assess the genetic population structure. Total gene diversity (H) was high, with a mean of 0.69 across all populations. Although two of the subpopulations displayed a high clonal proportion, overall 91 genotypes were discerned among the 181 isolates. The percentage of maximal genotypic diversity (G) ranged between 18 and 33 for the four populations, with a total value of 14 for the 91 genotypes. One genotype, represented by 27 clones, was isolated from all orchards. Moderate, but significant population differentiation was present in total among orchards (mean FST = 0.118, P = 0.001). The distribution of the mating types, MAT1-1 and MAT1-2, did not differ significantly from a 1:1 ratio for the total population as well as the subpopulations. Index of association (IA) analyses, on the other hand, suggests that the populations reproduce asexually. Analysis of molecular variance (AMOVA) indicated that 88% of the total genetic variation is distributed within subpopulations, 9% between subpopulations and only 3% between production areas. Fungicide resistance frequency against fenhexamid, iprodione and benomyl varied, with the highest levels of resistance present against benomyl and low levels of resistance seen towards iprodione and fenhexamid. In conclusion, this study has shown that there exist within the studied populations of B. cinerea, obtained from rooibos nurseries and pear orchards, an adaptive capacity to overcome current means of control. The use of population genetics to further our understanding of how plant pathogens interact and spread throughout a given environment is of cardinal importance in aiding the development of sustainable and integrated management strategies. Knowledge of the dispersal of B. cinerea in the two studied cropping systems has shed light on the inherent risk that it poses, and this together with knowledge of the levels of resistance that occurs should serve as an early warning to help divert possible loss of control in future.
AFRIKAANSE OPSOMMING: Botrytis cinerea Pers. Fr. [teleomorf Botryotinia fuckeliana (de Bary) Whetzel] veroorsaak ernstige verliese van meer as 200 gewasse wêreldwyd, insluitende rooibossaailinge en pere. Hierdie patogeen word deur morfologiese, fisiologiese, asook genetiese diversiteit gekenmerk. Die genetiese diversiteit en populasie-struktuur van B. cinerea populasies wat in Suid-Afrika voorkom, is nog nie ondersoek nie. Botrytis cinerea verkryg vanaf rooibossaailinge en in peerboorde in die Wes-Kaap van Suid-Afrika is ondersoek. Hierdie studie is met behulp van mikrosatellietmerkers, amplifikasie van die twee paringstipe gene (MAT1-1 en MAT1-2), asook die bepaling van weerstandsvlakke teenoor verskeie swamdoders, uitgevoer. Populasie-dinamika is afgelei en ‘n soortgelyke tendens is in beide produksie-sisteme waargeneem. Botrytis cinerea veroorsaak jaarliks ernstige verliese van rooibossaailinge (Aspalathus linearis) in kwekerye in die Clanwilliam-area. Monsters is in vyf kwekerye versamel en die kriptiese spesiestatus van die verkrygde isolate is deur restriksie-ensiemvertering van die Bc-hch geen bepaal. Almal behalwe een (206 uit 207) isolaat het aan Groep II of B. cinerea ‘sensu stricto’ behoort. Analise van die B. cinerea Groep II populasie, deur middel van sewe mikrosatellietmerkers, is uitgevoer om die genetiese populasiestruktuur te bepaal. Totale geendiversiteit (H) was hoog, met ‘n gemiddelde van 0.67. Alhoewel twee van die kwekerye se monstergrootte erg ingeperk is ná kloonverwydering, is daar nogtans 100 genotipes onder die 206 isolate wat geïsoleer is, waargeneem. Die persentasie van maksimale genotipiese diversiteit (G) het tussen 16 en 68, vir die vyf populasies, gewissel, met ‘n totaal van 17 vir die 100 genotipes. Een genotipe, verteenwoordig deur 27 klone, is uit vier kwekerye geïsoleer. Relatief lae dog noemenswaardige populasie-differensiasie is in totaal tussen kwekerye waargeneem (gem. FST = 0.030, P = 0.001). Die verspreiding van die twee paringstipes (MAT1-1 en MAT1-2) het beduidend verskil van ‘n 1:1 verhouding vir die totale populasie, asook twee van die kwekerye se populasies. Die drie oorblywende kwekerye se populasies het egter ‘n gelyke verdeling van die twee paringstipes getoon. Die indeks van assosiasie (IA) analises toon dat die populasies ongeslagtelik voortplant. Analise van molekulêre variasie (AMOVA) het aangedui dat 97% van die totale genetiese variasie binne die subpopulasies versprei is. Hoogs variërende vlakke van weerstand tussen die vyf kwekerye teenoor die swamdoder iprodioon, is vir die 198 isolate wat getoets is, gevind. Die totale gemiddelde frekwensie van weerstand teenoor iprodioon was 43%, wat tussen 0% en 81% vir die vyf kwekerye gevarieer het. Fondasie-vlak-sensitiwiteit vir pyrimethanil het ‘n gemiddelde EC50 waarde van 0.096 mg/L opgelewer. Botrytis cinerea isolate is ook vanuit peerbloeisels (Pyrus communis L.) vanuit vier boorde versamel, twee uit elk van die Ceres- en Grabouw-areas. In totaal is 181 isolate vanuit die vier boorde versamel. Die frekwensie van bloeiselinfeksie het tussen 3% en 17% gewissel. Oor die algemeen was daar ‘n hoë frekwensie van isolate wat slegs die Boty transponeerbare element teenwoordig gehad het (74%) in vergelyking met dié wat tegelykertyd beide (Boty en Flipper) teenwoordig gehad het. Een isolaat het slegs die Flipper element gehad. Bepaling van die kriptiese spesiestatus met behulp van restriksie-ensiemvertering van die Bc-hch geen het aangedui dat alle versamelde isolate tot Groep II of B. cinerea ‘sensu stricto’ behoort het. Analise van die Groep II populasie, deur middel van sewe mikrosatellietmerkers, is uitgevoer om genetiese populasie-struktuur te bepaal. Totale geendiversiteit (H) was hoog, met ‘n gemiddelde van 0.69 oor alle populasies. Alhoewel twee subpopulasies ‘n hoë klonale fraksie getoon het, is 91 genotipes tussen die 181 isolate wat verkry is, onderskei. Die persentasie van maksimale genotipiese diversiteit (G) het tussen 18 en 33 vir die vier populasies gewissel, met ‘n totale waarde van 14 vir die 91 genotipes. Een genotipe, verteenwoordig deur 27 klone, was in al vier boorde teenwoordig. Gematigde dog beduidende populasie differensiasie was in totaal tussen boorde teenwoordig (gem. FST = 0.118, P = 0.001). Die verspreiding van die paringstipes (MAT1-1 en MAT1-2) het nie betekenisvol van ‘n 1:1 verhouding vir die totale populasie, insluitende die subpopulasies, verskil nie. Indeks van assosiasie (IA) analises het egter aangedui dat die populasies ongeslagtelik voortplant. Analise van molekulêre variasie (AMOVA) het aangedui dat 88% van die totale genetiese variasie in subpopulasies te vinde was, 9% tussen subpopulasies en slegs 3% tussen produksie-areas. Frekwensie van swamdoder weerstandbiedendheid vir fenhexamid, iprodioon en benomyl het gewissel, met die hoogste vlakke teenoor benomyl waargeneem, maar baie lae vlakke teenoor fenhexamid en iprodioon. Samevattend het hierdie studie getoon dat die populasies van B. cinerea wat in hierdie twee produksie-sisteme, op rooibossaailinge en in peer boorde, ondersoek is, ‘n aanpasbaarheid toon om huidige metodes van beheer te oorkom. Die gebruik van populasiegenetika as ‘n hulpmiddel om ons kennis van patogeen-interaksies en -verspreiding te verbreed, is van kardinale belang in die ontwikkeling van geïntegreerde en volhoubare beheermaatreëls. Kennis van die verspreiding van B. cinerea in die bestudeerde gewasproduksiestelsels, werp lig op die inherente risiko wat dié patogeen inhou. Dít, tesame met kennis van die weerstandsvlakke wat voorkom, kan as ‘n vroegtydige waarskuwing dien ten einde moontlike verlies van beheer in die toekoms te help teenwerk.
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Doctorat en sciences biomédicales
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