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Tesis sobre el tema "Comparative transcriptomic"

Autor: Grafiati
Publicado: 4 de junio de 2021
Última modificación: 1 de febrero de 2022

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Alasvand, Zarasvand Azita. "Comparative Analysis of Zinc Oxide Nanoparticles Induced Transcriptomic Responses in Arabidopsis." Thesis, North Dakota State University, 2019. https://hdl.handle.net/10365/31694.

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Resumen
The impact that zinc oxide nanoparticles (ZnONP) have on plant physiological responses was evaluated by comparing gene expression changes after Arabidopsis thaliana plants were exposed to ZnONP, in comparison with ionic Zn2+ (ZnSO4) and non-treated controls. After treatment with ZnONP (concentration10 μg L−1), ionic Zn2+ (applied as ZnSO4 at a concentration of 19.7 μg/ L −1), expression analyses via RNA sequencing revealed that 369 genes were down regulated and 249 were upregulated (p < [FDR] 0.05, expression difference < 3). The downregulated genes in ZnONP treated seedlings compared to the Z
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Mutwil, Marek. "Integrative transcriptomic approaches to analyzing plant co-expression networks." Phd thesis, Universität Potsdam, 2011. http://opus.kobv.de/ubp/volltexte/2011/5075/.

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Resumen
It is well documented that transcriptionally coordinated genes tend to be functionally related, and that such relationships may be conserved across different species, and even kingdoms. (Ihmels et al., 2004). Such relationships was initially utilized to reveal functional gene modules in yeast and mammals (Ihmels et al., 2004), and to explore orthologous gene functions between different species and kingdoms (Stuart et al., 2003; Bergmann et al., 2004). Model organisms, such as Arabidopsis, are readily used in basic research due to resource availability and relative speed of data acquisition. A
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Vernon, Caroline. "Transcriptomic Assessment of Gene Responses to Environmental Stress - Genetic and Comparative Approaches." Thesis, University of Liverpool, 2007. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.485870.

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WU, HONGLI. "Characterization of Pleurotus ostreatus mutants defective in lignin degradation using reverse genetic and comparative transcriptomic analyses." Kyoto University, 2020. http://hdl.handle.net/2433/259750.

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Resumen
Kyoto University (京都大学)<br>0048<br>新制・課程博士<br>博士(農学)<br>甲第22854号<br>農博第2437号<br>新制||農||1082(附属図書館)<br>学位論文||R2||N5314(農学部図書室)<br>京都大学大学院農学研究科地域環境科学専攻<br>(主査)教授 本田 与一, 教授 田中 千尋, 准教授 坂本 正弘<br>学位規則第4条第1項該当
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Ullrich, Sophie. "Genomic and transcriptomic characterization of novel iron oxidizing bacteria of the genus “Ferrovum“." Doctoral thesis, Technische Universitaet Bergakademie Freiberg Universitaetsbibliothek "Georgius Agricola", 2016. http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bsz:105-qucosa-205981.

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Resumen
Acidophilic iron oxidizing bacteria of the betaproteobacterial genus “Ferrovum” are ubiquitously distributed in acid mine drainage (AMD) habitats worldwide. Since their isolation and maintenance in the laboratory has proved to be extremely difficult, members of this genus are not accessible to a “classical” microbiological characterization with exception of the designated type strain “Ferrovum myxofaciens” P3G. The present study reports the characterization of “Ferrovum” strains at genome and transcriptome level. “Ferrovum” sp. JA12, “Ferrovum” sp. PN-J185 and “F. myxofaciens” Z-31 represent t
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Leroy, Quentin. "Etude par transcriptomique et génomique comparative de la pathogénicité de Coxiella burnetii : une approche puce à ADN." Thesis, Aix-Marseille 2, 2010. http://www.theses.fr/2010AIX20710/document.

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Resumen
L’objectif de cette thèse a été d’enrichir nos connaissances sur les bactériesintracellulaires strictes et spécialement Coxiella burnetii, agent responsable de la fièvre Q.Pour ce faire, nous avons d’une part amélioré les techniques de préparation de l’ARN pourles études transcriptionnelles et d’autre part utilisé la technologie des puces à ADN pouranalyser le transcriptome ainsi que la diversité génomique de C. burnetii.L’utilisation d’échantillons cliniques dans les études transcriptionnelles est limitéepar la quantité de matériel disponible qui ne permet pas d’analyser simultanément les pro
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Al-Twaim, Sarah. "Comparative transcriptomic and proteomic investigation of host cell responses during Toxoplasma gondii and Neospora caninum invasion of human astrocytes." Thesis, University of Liverpool, 2014. http://livrepository.liverpool.ac.uk/2008149/.

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Resumen
Toxoplasma gondii and Neospora caninum are intracellular protozoan parasites from the phylum Apicomplexa. Both parasites share many morphological and genetic features, but have diverse host preferences. While T. gondii can infect any warm-blooded animal including humans, N. caninum does not. The basis of host preference in these two parasites is unknown, but could be due to differences in tropism to specific host cells. The discovery of differences between host cell responses could lead to a better understanding to why T. gondii can lead to disease in humans and N. caninum cannot, specifically
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Noguero, Mélanie. "Contribution de l'albumen au développement de la graine chez Medicago truncatula : caractérisation d'un facteur de transcription de type DOF exprimé dans l'albumen chalazal." Thesis, Dijon, 2014. http://www.theses.fr/2014DIJOS022/document.

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Resumen
Dans un contexte actuel qui tend vers une réduction d’intrants dans les systèmes de culture et une relance de la production de protéines végétales pour réduire la dépendance alimentaire de la France, la culture des légumineuses constitue une alternative. Les légumineuses à graines offrent une source riche en protéines pour l’alimentation animale et humaine. Au sein de l'UMR1347 Agroécologie, le pôle "déterminismes Génétiques et Environnementaux de l’Adaptation des Plantes à des Systèmes de culture Innovants" (GEAPSI) étudie via une approche multidisciplinaire (génétique, écophysiologie, physio
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Kamel, Laurent. "Caractérisation de protéines sécrétées du champignon Rhizophagus irregularis : criblage de leur effet sur l’établissement de la symbiose endomycorhizienne." Thesis, Toulouse 3, 2017. http://www.theses.fr/2017TOU30052.

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Resumen
La symbiose mycorhizienne à arbuscule (MA) est une association mutualiste s’établissant entre les racines des plantes et des champignons du sol appartenant à l’embranchement des Gloméromycètes. Dans cette association, le champignon agit comme un fertilisant naturel, fournissant à la plante divers minéraux (phosphore, mais aussi azote et soufre …) en échange de sources de carbone indispensables à son développement. Une caractéristique originale de ces champignons est leur très large spectre d’hôte : de l’ordre de 80% des espèces végétales ont l’aptitude à former cette symbiose, et certains espè
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Vaughn, Roy. "Comparative Developmental Transcriptomics of Echinoderms." Scholar Commons, 2012. http://scholarcommons.usf.edu/etd/4245.

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Resumen
The gastrula stage represents the point in development at which the three primary germ layers diverge. At this point the gene regulatory networks that specify the germ layers are established and the genes that define the differentiated states of the tissues have begun to be activated. These networks have been well characterized in sea urchins, but not in other echinoderms. Embryos of the brittle star Ophiocoma wendtii share a number of developmental features with sea urchin embryos, including the ingression of mesenchyme cells that give rise to an embryonic skeleton. Notable differences are th
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Hovhannisyan, Hrant 1992. "Comparative transcriptomics of host-pathogen interactions and hybridization in Candida pathogens." Doctoral thesis, Universitat Pompeu Fabra, 2020. http://hdl.handle.net/10803/670316.

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Resumen
Candida pathogenic yeasts represent a global healthcare problem. They comprise phylogenetically diverse species, including newly emerged pathogens. How human-Candida interactions vary across species, and what processes underlie the emergence of novel pathogens are poorly understood. Current thesis addresses these issues using comparative transcriptomics and bioinformatics. We established the global patterns of host-pathogen interactions between human host and the main Candida species, providing novel mechanistic insights into their interplay. We also explored lncRNAs of these pathogens, assess
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Fumey, Julien. "Tempo et mode de l'évolution des populations cavernicoles de l'espèce Astyanax mexicanus." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLS528/document.

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Resumen
Le poisson Astyanax mexicanus est un modèle particulièrement intéressant pour l'étude de l'évolution. En effet, dans cette espèce de poissons d'eau douce, il existe des populations vivant de façon pérenne dans des grottes. Dans cet environnement, l'obscurité est totale et permanente et les ressources en nourriture souvent faibles. Les poissons cavernicoles se sont adaptés à la vie souterraine et ils présentent de nombreuses modifications phénotypiques comme la dépigmentation, la perte des yeux, l’augmentation du nombre et de la taille d’organes sensoriels non-visuels et plusieurs changements d
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Fuzita, Felipe Jun. "Molecular physiology of digestion in arachnida: functional and comparative-evolutionary approaches." Universidade de São Paulo, 2014. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-08122014-100929/.

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Resumen
Spiders and scorpions are efficient predators arachnid (PA) consuming preys larger than themselves. Few studies reported, molecularly, the digestion in PA. This work describes a biochemical, transcriptomic and proteomic analysis of the midgut and midgut glands (MMG) and digestive juice (DJ) from Nephilengys cruentata and Tityus serrulatus MMG. Cathepsin L, B, D and F, legumain, trypsin, astacin, carbohydrases and lipases were identified by these approaches. Peptide isomerase and ctenitoxins, which are venom proteins were identified, showing a correlation among digestive and venom enzymes. Summ
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Ylla, Bou Guillem 1990. "Comparative transcriptomics of hemimetabolan and holometabolan metamorphosis." Doctoral thesis, Universitat Pompeu Fabra, 2018. http://hdl.handle.net/10803/565925.

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Resumen
The evolutionary success of insects was particularly shaped by the innovation of the metamorphosis, especially by the transition from hemimetaboly to holometaboly. The mechanisms underlying this evolutionary transition represent an unsolved question, although different approaches have been used to study them. In the present thesis we followed a transcriptomic approach, comparing data on mRNA and miRNA expression in key developmental moments, comprising embryonic and postembryonic stages, in species representing the hemimetabolan and holometabolan modes. Most of the work has been carried out in
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Moreno-Villena, Jose J. "Molecular evolution of C4 photosynthesis in grasses using comparative transcriptomics." Thesis, University of Sheffield, 2017. http://etheses.whiterose.ac.uk/19606/.

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Resumen
The evolution of adaptations, some of impressive complexity, help organisms to survive in a variety of environments. However, evolutionary innovations are often restricted to certain taxonomic groups with evolutionary precursors. Evolutionary novelties usually arise through the co-option of pre-existing genes into new functions and by comparing organisms with and without the trait of interest, the ancestral state of the co-opted elements can be inferred. This allows us to identify the properties that facilitated their co-option, and therefore increase the evolvability of the complex trait itse
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Nelson, Andrew D. L., Upendra K. Devisetty, Kyle Palos, Asher K. Haug-Baltzell, Eric Lyons, and Mark A. Beilstein. "Evolinc: A Tool for the Identification and Evolutionary Comparison of Long Intergenic Non-coding RNAs." FRONTIERS MEDIA SA, 2017. http://hdl.handle.net/10150/624658.

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Resumen
Long intergenic non-coding RNAs (lincRNAs) are an abundant and functionally diverse class of eukaryotic transcripts. Reported lincRNA repertoires in mammals vary, but are commonly in the thousands to tens of thousands of transcripts, covering similar to 90% of the genome. In addition to elucidating function, there is particular interest in understanding the origin and evolution of lincRNAs. Aside from mammals, lincRNA populations have been sparsely sampled, precluding evolutionary analyses focused on their emergence and persistence. Here we present Evolinc, a two-module pipeline designed to fa
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Krishnan, Vandhana. "Computational approaches for comparative genomics and transcriptomics using 454 sequencing technology." Pullman, Wash. : Washington State University, 2009. http://www.dissertations.wsu.edu/Thesis/Summer2009/v_krishnan_072409.pdf.

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Resumen
Thesis (M.S. in computer science)--Washington State University, August 2009.<br>Title from PDF title page (viewed on Aug. 12, 2009). "School of Electrical Engineering and Computer Science." Includes bibliographical references (p. 80-87).
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Cuomo, Claudia. "Gut patterning in development and evolution : a comparative differential transcriptomics approach." Thesis, Open University, 2017. http://oro.open.ac.uk/50273/.

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Resumen
All bilaterians share a common kit of transcription factors and cis-regulatory elements that compose the Gene Regulatory Network (GRN) essential for the development of the body plan. Modifications within the elements of the GRN determine the evolution of animal forms. In this study, the GRN for embryonic gut specification in two echinoderm species, the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus and the sea star Patiria miniata, has been studied with the purpose of acquiring further knowledge on the process of gut patterning in the sea urchin larva and to compare it with the sea star embryo, focu
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Lelandais, Gaëlle. "Analyse comparative, intra et inter espèces, de transcriptomes de levures." Paris 7, 2005. http://www.theses.fr/2005PA077206.

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Resumen
Les groupes de gènes co-régulés constituent, par leur association combinatoire et leur programme cinétique d'expression, l'essentiel de la réponse biologique face à l'extrême variété des situations que la cellule doit savoir affronter. L'identification de ces groupes de gènes est un des objectifs majeurs des approches post-génomiques. En particulier, l'étude de la dynamique du transcriptome grâce aux puces à ADN, permet d'identifier les gènes dont l'expression est corrélée et ainsi d'appréhender la structure et le fonctionnement des réseaux de régulation. Le travail présenté dans cette thèse a
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Atolagbe, Oluwatomisin Toluwanimi. "Comparative Analysis of the Transcriptomes of M1 and M2 Macrophages." University of Toledo Health Science Campus / OhioLINK, 2017. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=mco150166566713963.

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Petit, Coraline. "Évolution et Développement d'un organe sériel - la molaire : Transcriptomique comparée des bourgeons de molaire chez les rongeurs." Thesis, Lyon, 2017. http://www.theses.fr/2017LYSEN009/document.

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Resumen
Les programmes de développement font appel à l'expression coordonnée de milliers de gènes, à laquelle le RNA-seq nous donne maintenant accès.Quelles différences d'expression sous-tendent les différences de programmes de développement, (i)entre organes similaires d'une même espèce ? (ii) entre organes homologues dans des espèces différentes ? Alors que d'autres études s'intéressent à des gènes maîtres régulateurs, je me suis intéressée au transcriptome pris dans son ensemble, dans ce qu'il peut nous apporter pour comprendre les différences de programme de développement en relation avec la morph
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Sun, Mai. "Global analysis of mRNA metabolism by comparative dynamic transcriptome analysis." Diss., Ludwig-Maximilians-Universität München, 2013. http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bvb:19-173316.

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Arista, Gautier. "Génomique comparative et fonctionnelle de familles de gènes liés au métabolisme secondaire de la vigne (Vitis vinifera) et de ses proches parents." Thesis, Strasbourg, 2017. http://www.theses.fr/2017STRAJ010/document.

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Resumen
La vigne (Vitis vinifera) possède un métabolisme secondaire particulièrement riche donnant naissance à une large palette de molécules dont certaines sont impliquées dans les défenses contre les pathogènes et d'autres dans la grande diversité d’arômes qui fait la renommée des vins. L’analyse de la séquence de référence du génome de la vigne a permis de mettre en évidence une remarquable expansion de certaines familles de gènes liés au métabolisme secondaire par rapport aux autres plantes. Dans ce travail, j'ai étudié les familles gènes codant pour les cytochromes P450, dont certains sont impliq
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Nelson, A. D. L., E. S. Forsythe, U. K. Devisetty, et al. "A Genomic Analysis of Factors Driving lincRNA Diversification: Lessons from Plants." GENETICS SOCIETY AMERICA, 2016. http://hdl.handle.net/10150/621708.

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Resumen
Transcriptomic analyses from across eukaryotes indicate that most of the genome is transcribed at some point in the developmental trajectory of an organism. One class of these transcripts is termed long intergenic noncoding RNAs (lincRNAs). Recently, attention has focused on understanding the evolutionary dynamics of lincRNAs, particularly their conservation within genomes. Here, we take a comparative genomic and phylogenetic approach to uncover factors influencing lincRNA emergence and persistence in the plant family Brassicaceae, to which Arabidopsis thaliana belongs. We searched 10 genomes
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Kilaru, Aruna, and J. B. Ohlrogge. "Comparative Transcriptomics Identifies Key Steps in Storage Oil Biosynthesis in Plant Tissues." Digital Commons @ East Tennessee State University, 2015. https://dc.etsu.edu/etsu-works/4801.

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Robson, Lisa Marie. "Comparative and Functional Analysis of Gene Expression in Ophiostoma Species." The University of Waikato, 2008. http://hdl.handle.net/10289/2652.

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Ophiostoma floccosum and Ophiostoma piliferum are polymorphic ascomycete fungi found throughout the world. Both species are important economically as they are known to colonise timber and cause discoloration of wood thus reducing its aesthetic value and subsequently price. Albino variants of the two species, in particular O. piliferum, are used as biological control agents to prevent sapstaining and have been used commercially for the past 15 years to reduce pitch/wood extractives in paper manufacturing. Other members of the genus include the plant pathogens O. novo-ulmi and O. clavigerum, kno
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Lebreton, Annie. "Caractéristiques génomiques du genre fongique Mucor et évolution adaptative liée à différents modes et conditions de vie au sein du genre." Thesis, Brest, 2018. http://www.theses.fr/2018BRES0098/document.

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Resumen
Le genre Mucor appartient au phylum des Mucoromycota, un groupe issu de l’une des lignées ayant divergé très tôt dans l'évolution des espèces fongiques (early diverging lineages). Ces groupes restent encore très peu connus par rapport aux Ascomycètes et Basidiomycètes. Le genre Mucor est un genre d'espèces saprophytes, avec cependant une certaine diversité au niveau du mode de vie. Il existe en effet au sein du genre, des endophytes de plantes (comme M. endophyticus) ou encore des pathogènes opportunistes d'animaux (comme les espèces thermophiles M. circinelloides ou M. indicus). Le genre est
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Jiang, Xiaofang. "Genomics and Transcriptomics Analysis of the Asian Malaria Mosquito Anopheles stephensi." Diss., Virginia Tech, 2016. http://hdl.handle.net/10919/79959.

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Resumen
Anopheles stephensi is a potent vector of malaria throughout the Indian subcontinent and Middle East. An. stephensi is emerging as a model for molecular and genetic studies of mosquito-parasite interactions. Here we conducted a series of genomic and transcriptomic studies to improve the understanding of the biology of Anopheles stephensi and mosquito in general. First we reported the genome sequence and annotation of the Indian strain of the type form of An. stephensi. The 221 Mb genome assembly was produced using a combination of 454, Illumina, and PacBio sequencing. This hybrid assembly met
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Kilaru, Aruna, and J. B. Ohlrogge. "Comparative Transcriptome Analysis For Metabolic Engineering Of Oil In Biomass Crops." Digital Commons @ East Tennessee State University, 2015. https://dc.etsu.edu/etsu-works/4799.

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Le, Béguec Céline. "Analyse intégrative des ARN longs non-codants chez le chien et leurs implications dans le mélanome oral canin, modèle des mélanomes humains." Thesis, Rennes 1, 2018. http://www.theses.fr/2018REN1B030/document.

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Les ARN longs non-codants (lncRNAs) constituent une famille d'ARN hétérogènes qui jouent un rôle majeur dans de nombreux cancers et notamment dans les mélanomes. Le chien est un modèle naturel et spontané pour l’analyse génétique comparée des cancers et, l'annotation du génome canin a récemment été enrichie avec l'identification de plus 10 000 lncRNAs. Afin de réaliser des prédictions fonctionnelles bioinformatiques des lncRNAs, nous avons caractérisé les profils d'expression des lncRNAs canins à partir de 26 tissus distincts. Nous avons défini la spécificité tissulaire d
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Chapuis, Sophie. "Contribution à l’étude du mouvement systémique de deux phytovirus : analyse comparative du transcriptome de cellules compagnes infectées et saines." Thesis, Strasbourg, 2014. http://www.theses.fr/2014STRAJ041/document.

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Resumen
Les phytovirus empruntent les vaisseaux du phloème pour envahir leur plante hôte de manière systémique. Ce mouvement étant très mal connu, l’objectif de cette étude était d’identifier par une approche transcriptomique, des gènes spécifiquement dérégulés dans les cellules compagnes (CC) suite à l’infection virale par un Polerovirus, le Turnip yellows virus (TuYV) ou par un Potyvirus, le Lettuce mosaic virus (LMV). Pour ce faire, des protoplastes de CC ont été préparés et triés par la technologie de FACS. Les ARN extraits ont ensuite été traités par RNAseq et hybridation sur puces CATMA. Malgré
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Ravindran, Suda Parimala [Verfasser], and Mathilde [Akademischer Betreuer] Cordellier. "Comparative and population transcriptomics of Daphnia galeata / Suda Parimala Ravindran ; Betreuer: Mathilde Cordellier." Hamburg : Staats- und Universitätsbibliothek Hamburg, 2018. http://d-nb.info/1173899278/34.

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Kilaru, Aruna, and J. Ohlrogge. "Insights into Storage Oil Biosynthesis: Comparative Transcriptomics of Seed and Non-Seed Tissues." Digital Commons @ East Tennessee State University, 2011. https://dc.etsu.edu/etsu-works/4867.

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Wamalwa, Mark. "Development of a comprehensive annotation and curation framework for analysis of Glossina Morsitans Morsitans expresses sequence tags." Thesis, University of the Western Cape, 2011. http://etd.uwc.ac.za/index.php?module=etd&action=viewtitle&id=gen8Srv25Nme4_5497_1325767222.

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Resumen
This study has successfully identified transcripts differentially expressed in the salivary gland and midgut and provides candidate genes that are critical to response to parasite invasion. Furthermore, an open-source Glossina resource (G-ESTMAP) was developed that provides interactive features and browsing of functional genomics data for researchers working in the field of Trypanosomiasis on the African continent.
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Kimbung, Stanley Mbandi. "A computational framework for transcriptome assembly and annotation in non-model organisms: the case of venturia inaequalis." Thesis, University of the Western Cape, 2014. http://hdl.handle.net/11394/4022.

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Resumen
Philosophiae Doctor - PhD<br>In this dissertation three computational approaches are presented that enable optimization of reference-free transcriptome reconstruction. The first addresses the selection of bona fide reconstructed transcribed fragments (transfrags) from de novo transcriptome assemblies and annotation with a multiple domain co-occurrence framework. We showed that selected transfrags are functionally relevant and represented over 94% of the information derived from annotation by transference. The second approach relates to quality score based RNA-seq sub-sampling and the descripti
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Farhat, Sarah. "Analyses comparatives des génomes et transcriptomes de deux espèces d’Amoebophrya distinctes en termes d'impact sur l'hôte." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018SACLE008/document.

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Resumen
Les algues marines jouent un rôle essentiel dans les cycles biogéochimiques, étant entre autre responsables de la production de la moitié de l’oxygène atmosphérique. La dynamique environnementale de ces organismes reste très peu étudiée. Les Syndiniales (Alveolata), groupe de protistes parasites ubiquistes, restent mal connus à l'égard des autres membres du plancton marin. Parmi eux, la plupart des représentants infectant les dinoflagellés photosynthétiques appartiennent au groupe Amoebophrya, étant capables d’infecter certaines micro-algues toxiques responsables d’efflorescences (marées rouge
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Anlauf, Holger. "A comparative analysis of the calcification transcriptome and proteome of Emiliania huxleyi." Thesis, University of Southampton, 2015. https://eprints.soton.ac.uk/403349/.

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Resumen
Calcium carbonate precipitation by marine organisms is an acknowledged contributor to the global carbon cycle. Coccolithophores are unicellular marine phytoplankton, that by excreting calcium scales and performing photosynthesis, contribute largely to the flux of atmospheric carbon to the surface and deeper oceans. The impact of elevated future ocean temperature and ocean acidity on the mechanism and rates, by which coccolithophores secret their calcium carbonate scales internally and contribute to the global carbon cycle, has been widely studied. However, biomineralisation in coccolithophores
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Dugar, Gaurav [Verfasser], and Cynthia [Gutachter] Sharma. "Comparative transcriptomics and post-transcriptional regulation in Campylobacter jejuni / Gaurav Dugar ; Gutachter: Cynthia Sharma." Würzburg : Universität Würzburg, 2017. http://d-nb.info/1129107515/34.

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Jaleta, Tegegn [Verfasser], and Adrian [Akademischer Betreuer] Streit. "Comparative Transcriptomics and Genetic Analyses in Animal Parasitic Nematodes / Tegegn Jaleta ; Betreuer: Adrian Streit." Tübingen : Universitätsbibliothek Tübingen, 2016. http://d-nb.info/119961601X/34.

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Camprubí, Font Carla. "Genetics and transcriptomics of adherent-invasive Escherichia coli (AIEC): new approaches to uncover molecular markers for its rapid identification." Doctoral thesis, Universitat de Girona, 2019. http://hdl.handle.net/10803/672302.

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Resumen
The adherent-invasive Escherichia coli (AIEC) pathotype could play a role in the course of Crohn’s disease. This is characterized by its capacity to adhere to and to invade intestinal epithelial cells as well as to replicate and survive within macrophages. At present, identification of the AIEC pathotype relies on time-consuming techniques based on the phenotypic screening of cultured bacteria, which are not standardized. In this thesis, we focused on the study of AIEC genetics in order to look for key characteristics that could assist the development of a molecular tool for the identification
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Ockendon, Nina Frances. "Comparative transcriptome profiling in wild species : uncovering gene expression signatures of mating systems." Thesis, University of Bath, 2015. https://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.646142.

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Resumen
Understanding the molecular processes underlying adaptation of complex phenotypes presents major challenges in evolutionary biology. An important question currently is how to accurately use the plethora of ‘omics data to better understand ecological variation. Using RNA-seq transcriptome data from many lineages, I demonstrate the power of this data type when studying the molecular basis of complex phenotypes. My work has produced three major results. Firstly, I have integrated bacterial RNA-seq data with high throughput phenotype microarrays, providing the first indication of functional pathwa
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Cruz, Pulido Diana Patricia. "Comparative transcriptome profiling of human and pig intestinal epithelial cells after Deltacoronavirus infection." The Ohio State University, 2020. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1587711071257247.

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Soto-Suarez, Mauricio. "Etude comparative de souches de Xanthomonas oryzae par des approches d’hybridations soustractives et de transcriptome." Perpignan, 2009. http://www.theses.fr/2009PERP1282.

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Resumen
Xanthomonas oryzae pv. Oryzae (Xoo) agent causal de la bactériose vasculaire du riz (BB) est une maladie entraînant d’importantes pertes de récolte en Afrique de l’Ouest. Sur la base d’analyses génétiques et du pouvoir pathogène de nouvelles souches de Xanthomonas oryzae ont été récemment identifiées en Afrique. Des différences entre les génomes de souches asiatique et africaine de X. O. Pv. Oryzae ont été mises en évidence (Gonzalez et al. 2007). Plusieurs gènes bactériens sont probablement activés lors des différentes étapes de l’interaction avec la plante. Les objectif de notre étude sont (
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Ferreira, de Carvalho Julie. "Évolution du génome des spartines polyploïdes envahissant les marais salés : apport des nouvelles techniques de séquençage haut-débit." Phd thesis, Université Rennes 1, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00795861.

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Resumen
Les Spartines jouent un rôle écologique majeur sur les marais salés. Elles représentent un excellent modèle pour appréhender les conséquences écologiques de la spéciation par hybridation et polyploïdie dans le contexte d'invasion biologique. On s'intéresse plus particulièrement, à l'hybridation récente entre une espèce hexaploïde d'origine américaine Spartina alterniflora et une espèce hexaploïde européenne S. maritima ayant donnés deux hybrides F1 (S. x townsendii et S. x neyrautii) et la nouvelle espèce envahissante allododécaploïde (S. anglica). Les nouvelles technologies de séquençage haut
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Pöschl, Yvonne [Verfasser], Ivo [Akademischer Betreuer] Große, and Dirk [Akademischer Betreuer] Walther. "Comparative transcriptomics and network reconstruction with applications to auxin signaling / Yvonne Pöschl ; Ivo Große, Dirk Walther." Halle, 2016. http://d-nb.info/1116952424/34.

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Pöschl, Yvonne Verfasser], Ivo [Akademischer Betreuer] [Große, and Dirk [Akademischer Betreuer] Walther. "Comparative transcriptomics and network reconstruction with applications to auxin signaling / Yvonne Pöschl ; Ivo Große, Dirk Walther." Halle, 2016. http://d-nb.info/1116952424/34.

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Michely, Stéphanie. "Dynamique des génomes et évolution du métabolisme lipidique chez les levures du clade Yarrowia." Thesis, Paris, AgroParisTech, 2014. http://www.theses.fr/2014AGPT0021/document.

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Resumen
Yarrowia lipolytica appartient à un groupe de levures qui a divergé très tôt dans l'arbre des hémiascomycètes. Cette levure est capable d'utiliser, comme seule source de carbone, des substrats hydrophobes très variés et est capable de synthétiser de nouveaux acides gras libres à partir de composés non hydrophobes. Ces caractéristiques font de Y. lipolytica un modèle de levure hémiascomycète pour l'étude du métabolisme des lipides. Sa capacité oléagineuse est facilitée par l'expansion de familles de protéines ayant eu lieu au cours de l'évolution après la divergence du clade Yarrowia. En effet,
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Sanya, Daniel Ruben Akiola. "Biologie intégrative du métabolisme lipidique chez les levures du genre Blastobotrys." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLA002/document.

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Resumen
Les levures oléagineuses ascomycètes font partie des productrices de lipides les plus connus de notre époque. Elles peuvent produire des lipides, des molécules chimiques dérivées et des acides organiques à partir de sucres simples ou complexes. Nous avons choisi les levures du genre Blastobotrys afin de définir un nouvel organisme modèle pour la production d'acides gras et de lipides, car ces levures sont capables de synthétiser et de stocker naturellement 15 à 25% de lipides dans leur biomasse sèche à partir de glucose et xylose, soit plus que Yarrowia. lipolytica dans les mêmes conditions. L
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Wetterbom, Anna. "Genome and Transcriptome Comparisons between Human and Chimpanzee." Doctoral thesis, Uppsala universitet, Genomik, 2010. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-112893.

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Resumen
The chimpanzee is humankind’s closest living relative and the two species diverged ~6 million years ago. Comparative studies of the human and chimpanzee genomes and transcriptomes are of great interest to understand the molecular mechanisms of speciation and the development of species-specific traits. The aim of this thesis is to characterize differences between the two species with regard to their genome sequences and the resulting transcript profiles. The first two papers focus on indel divergence and in particular, indels causing premature termination codons (PTCs) in 8% of the chimpanzee g
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Siqueira, Franciele Maboni. "Análise genômica e transcricional comparativa de Mycoplasma hyopneumoniae, Mycoplasma flocculare e Mycoplasma hyorhinis." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 2013. http://hdl.handle.net/10183/143434.

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Resumen
Mycoplasma hyopneumoniae, Mycoplasma flocculare e Mycoplasma hyorhinis são capazes de aderir e colonizar o trato respiratório de suínos. Enquanto a presença de M. flocculare é considerada assintomática, M. hyopneumoniae e M. hyorhynis são relacionados ao desenvolvimento de patologias. M. hyopneumoniae é o agente etiológico da pneumonia enzoótica suína e M. hyorhynis além dos pulmões pode atingir outros sítios e hospedeiros, estando relacionado a artrites, poliserosites e desenvolvimento de vários tipos de câncer em humanos. Apesar dos avanços tecnológicos na área de genômica, raros são os dado
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