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Tilliette, Chloé. "Influence du fer et autres éléments traces issus des sources hydrothermales peu profondes sur la biogéochimie marine dans le Pacifique Sud-Ouest." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. http://www.theses.fr/2023SORUS046.

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Resumen
L’océan Pacifique Sud-Ouest a été identifié comme un point chaud de fixation de diazote (N2) par les organismes diazotrophes, arborant des taux de fixation parmi les plus élevés des océans du globe. Le succès de ces espèces repose sur les concentrations non limitantes en fer dissous (DFe) dans la couche photique de la région, dont l’origine demeure méconnue. Dans le cadre de ce travail de thèse, la distribution du DFe a été étudiée le long d’un transect de 6100 km, allant de Nouméa jusqu’aux eaux de la gyre et traversant le Bassin de Lau et l’Arc des Tonga (175 °E à 166 °W, le long de 19–21 °S
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Pillot, Guillaume. "Biodiversités électroactives issues de sources hydrothermales profondes." Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0503/document.

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Resumen
Les sources hydrothermales profondes sont des édifices géologiques formés par l’infiltration d’eau de mer dans la croûte océanique, formant un fluide chaud (>400 °C), riche en métaux qui précipite pour former des cheminées dans lesquelles circulent un courant électrique. Les travaux de recherche présentés ici avaient pour objectif de révéler la présence de microorganismes capable de participer à la production de ce courant électrique ou d’utiliser cette électricité pour vivre au sein de ces cheminées électriquement conductrices. Nous nous sommes focalisés sur les microorganismes capables de
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Pillot, Guillaume. "Biodiversités électroactives issues de sources hydrothermales profondes." Electronic Thesis or Diss., Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0503.

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Resumen
Les sources hydrothermales profondes sont des édifices géologiques formés par l’infiltration d’eau de mer dans la croûte océanique, formant un fluide chaud (>400 °C), riche en métaux qui précipite pour former des cheminées dans lesquelles circulent un courant électrique. Les travaux de recherche présentés ici avaient pour objectif de révéler la présence de microorganismes capable de participer à la production de ce courant électrique ou d’utiliser cette électricité pour vivre au sein de ces cheminées électriquement conductrices. Nous nous sommes focalisés sur les microorganismes capables de
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Mercier, Coraline. "De nouveaux systèmes hôtes-virus associés aux sources hydrothermales océaniques profondes." Thesis, Brest, 2016. http://www.theses.fr/2016BRES0125/document.

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Nos connaissances sur la diversité virale associée aux micro-organismes présents dans les sources hydrothermales océaniques profondes restent encore limitées. Seules quelques études concernant l’abondance virale et l’impact de ceux-ci sur la mortalité microbienne dans ces écosystèmes sont disponibles. En effet, seuls 6 bactériovirus et 2 archéovirus provenant de ces écosystèmes ont été caractérisés à l’heure actuelle. Les deux archéovirus infectent des archées anaérobies hyperthermophiles appartenant à l’ordre des Thermococcales et ont été décrits au laboratoire.Afin d’étendre nos connaissance
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Gorlas, Aurore. "Caractérisation de nouveaux systèmes hôtes-virus associés aux sources hydrothermales océaniques profondes." Brest, 2010. http://www.theses.fr/2010BRES2053.

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Resumen
Les virus représentent un énorme réservoir en termes de biodiversité. Parmi les 5550 virus de procaryotes connus à ce jour, seulement une soixantaine de virus d’Archaea ont été isolés et décrits. Ces derniers sont répartis en 8 nouvelles familles. A ce jour, une seule particule de type viral a été isolée d’une euryarchée hyperthermophile marine, il s’agit de PAVI isolé de Pyrococcus abyssi. Mon travail de thèse a consisté à rechercher et à caractériser de nouveaux virus isolés deuryarchées hyperthermophiles appartenant à l’ordre des Thermococcales. Cet ordre est composé de micro-organismes ana
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Hamraoui, Lahcen. "Collagènes et matrices extracellulaires d'annélides et de vestimentifères des sources hydrothermales profondes." Paris 7, 1995. http://www.theses.fr/1995PA077120.

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Le but de cette thèse est d'étudier deux types de collagène cuticulaire et interstitiel chez des annélides et des vestimentifères des sources hydrothermales et des suintements froids. Après un premier chapitre de rappels sur les collagènes en général et des collagènes des invertébrés et des organismes des sources hydrothermales en particulier et un second chapitre récapitulant les matériels et les méthodes utilisées au cours de ce travail, nos résultats sont exposés en cinq parties. La première partie précise les caractéristiques ultrastructurales de la cuticule d'annelides et de vestimentifèr
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Chamoy, Luc. "Caractérisation de protéines du tube d'un vestimentaire des sources hydrothermales profondes : Riftia pachyptila." Dijon, 2001. http://www.theses.fr/2001DIJOS001.

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Resumen
L'environnement hydrothermal profond est hostile à la vie. Seuls les organismes qui ont développé des protections robustes ont pu y prospérer. L'étude de la matrice chitino-protéique du tube de Riftia pachyptila est la première étape de la compréhension des mécanismes d'adaptation de ces animaux. Afin de mieux connaître les processus de synthèse et de maturation de cet exosquelette, une étude de la composition qualitative et quantitative des composants principaux a été menée sur du tube mature et néo-synthétisé en aquariums pressurés. Elle a permis de montrer que les quantités de protéines et
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Jeanthon, Christian. "Bactéries hétérotrophes associées aux Alvinellidae inféodés aux sources hydrothermales profondes (13oN) : comportement vis-à-vis des métaux lourds." Brest, 1991. http://www.theses.fr/1991BRES2002.

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299 bacteries heterotrophes ont ete isolees sur des milieux additionnes de metaux. Ces bacteries, qui colonisent l'epiderme et le tube des alvinellidae preleves sur un site hydrothermal du 13#on (dorsale du pacifique oriental), ont ete identifiees comme membres des genres pseudomonas, alteromonas et vibrio. La determination de leur cmi a montre que 92,3% d'entre elles sont resistantes a au moins un des metaux testes et que 57% sont resistantes a plus d'un metal. La capacite de 40 d'entre elles a accumuler les metaux a ete demontree. Une fraction de ces bacteries (19,1%) contient un a cinq plas
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Moussard, Hélène. "Analyses moléculaires de la diversité et des fonctions de micro-organismes incultivés des sources hydrothermales profondes." Brest, 2006. http://www.theses.fr/2006BRES2029.

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Nos connaissances de la diversité des communautés microbiennes marines ont longtemps été restreintes aux informations précieuses, mais incomplètes, issues de l’utilisation de méthodes de culture. Lors de cette étude, des techniques moléculaires (PCR, clonage, séquençage, hybridation, construction d’une banque métagénomique) et des marqueurs génétiques [ARNr 16S, gènes codants pour des enzymes spécifiques de la voie inverse du cycle tricarboxylique (acIB, oorA)] ont été utilisés pour contourner les limites inhérentes aux méthodes de culture et accéder à la diversité spécifique ainsi qu’aux fonc
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Lossouarn, Julien. "Découverte et caractérisation des premiers virus de Thermotogales (bactéries thermophiles et anaérobies) issus de sources hydrothermales océaniques profondes." Thesis, Brest, 2014. http://www.theses.fr/2014BRES0058/document.

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Notre connaissance de la diversité virale associée aux microorganismes procaryotiques issus des sources hydrothermales océaniques profondes demeure encore limitée. Peu d’études se sont intéressées à l’abondance virale ou à l’impact des virus sur la mortalité microbienne au sein de ces écosystèmes. Le nombre de virus caractérisés, issus de ces environnements, reste faible. Deux virus, PAV1 et TPV1, associés à des archées hyperthermophiles anaérobies appartenant à l’ordre des Thermococcales ont été décrits dans notre laboratoire. Afin de poursuivre nos recherches sur la diversité virale infectan
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Corre, Erwan. "Approches moléculaires de la diversité microbienne de deux environnements extrêmes : les sources hydrothermales profondes et les réservoirs pétroliers." Brest, 2000. http://hal.upmc.fr/tel-01115381.

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L’étude de communautés microbiennes de sources hydrothermales profondes de la dorsale medio-atlantique et de réservoirs pétroliers du bassin parisien a été entreprise par des approches culturales et moléculaires. Ces approches ont consisté d'une part en une analyse directe des ARNr 16S par amplification et hybridation in situ, d'autre part dans l'enrichissement de différents types métaboliques à haute température, et enfin dans la caractérisation de souches isolées d'environnements hydrothermaux. Des séquences d'archaea méthanogènes, halophiles ou hyperthermophiles affiliées aux méthanosarcina
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Jolivet, Edmond. "Etudes physiologiques et moléculaires de la résistance aux rayonnements ionisants d'archaea hyperthermophiles isolées de sources hydrothermales océaniques profondes." Rennes 1, 2002. http://www.theses.fr/2002REN10137.

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Audusse, Emmanuel. "Modelisation hyperbolique et analyse numerique pour les ecoulements en eaux peu profondes." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2004. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00008047.

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Nous etudions dans cette these differentes lois de conservation hyperboliques associees a la modelisation des ecoulements en eaux peu profondes.<br />Nous nous consacrons d'abord a l'analyse numerique du systeme de Saint-Venant avec termes sources. Nous presentons un schema volumes finis bidimensionnel d'ordre 2, conservatif et consistant, qui s'appuie sur une interpretation cinetique du systeme et une methode de reconstruction hydrostatique des variables aux interfaces. Ce schema preserve la positivite de la hauteur d'eau et l'etat stationnaire associe au lac au repos.<br />Nous etendons ensu
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Gaillard, Mélusine. "Etude moléculaire de PAV1, le premier virus hyperthermophile marin : Recherche et caractérisation préliminaire de particules de type virale chez les archées de l'ordre de Thermococcales inféodées aux sources hydrothermales marines profondes." Brest, 2006. http://www.theses.fr/2006BRES2007.

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Resumen
Le premier virus hyperthermophile issu d'une source hydrothermale marine profonde, PAV1, a été isolé dans notre laboratoire. Il infecte l'archée Pyrococcus abyssi et possède une morphologie de citron. Son génome est un ADN double brin circulaire de 18,1 kpb. Dans le cadre de cette thèse, nous avons d'abord étudié son génome. Il est présent à fort nombre de copies dans la cellule et ne comporte pas de méthylations de type dam ou dcm. Sa topologie consiste en un léger surenroulement négatif dans son hôte. Les 25 gènes prédits sont transcrits en six ARNm majoritairement polycistroniques et l'un d
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Nercessian, Olivier. "Etude de la diversité spécifique et fonctionnelle des communautes microbiennes associées à des sources hydrothermales marines profondes par des approches moléculaires." Brest, 2003. http://www.theses.fr/2003BRES2005.

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Resumen
Nos connaissances de la diversité des communautés microbiennes marines ont longtemps été restreintes aux informations précieuses, mais incomplètes, issues de l'utilisation de méthodes de culture. Lors de cette étude, des techniques moléculaires (PCR, RT-PCR, clonage, séquençage, hybridation) et des marqueurs génétiques [ARNr 16S, gènes codant pour des enzymes spécifiques de différentes voies métaboliques (mcr A, pmo A, dsrAB)] ont été utilisés pour contourner les limites inhérentes aux méthodes de culture et accéder à une vision plus réaliste de la diversité spécifique et fonctionnelle de comm
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Jollivet, Didier. "Distribution et évolution de la faune associée aux sources hydrothermales profondes à 13°N sur la dorsale du Pacifique oriental : le cas particulier des polychètes alvinellidae." Brest, 1993. http://www.theses.fr/1993BRES2023.

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Resumen
Une étude sur la distribution et l'évolution des communautés des sources hydrothermales profondes de la dorsale du pacifique oriental à 13°Non a été entreprise à partir des prélèvements et des données iconographiques obtenus au cours de 3 campagnes. Le peuplement se subdivise en 6 unités et se repartit en 3 grands groupes spatio-temporels d'espèces. Un modèle de succession spatio-temporelle de la mégafaune est propose à partir de ces observations. Les espèces ont un cycle court et un recrutement discontinu compatible avec l'évolution rapide du milieu. Leurs populations sont soumises à des exti
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Ladrat, Christine. "Mise en évidence et étude de deux enzymes thermostables de micro-organismes thermophiles isolés d'écosystèmes hydrothermaux sous-marins." Compiègne, 1993. http://www.theses.fr/1993COMPD586.

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Resumen
La présence de deux activités enzymatiques thermostables : la beta-glucosidase et l'alcool déshydrogénase (ADH) a été recherchée sur 190 isolats thermophiles obtenus à partir d'échantillons prélevés sur sept sites hydrothermaux (deux dans le bassin de Lau, deux dans le bassin Nord-Fidjien et trois sur la ride du Pacifique oriental). 83 isolats possèdent l'activité beta-glucosidase et seulement 10 l'ADH. L'étude de la thermostabilité de ces enzymes a orienté le travail de caractérisation enzymatique vers deux isolats archaebactériens ultra-thermophiles : l'isolat ST549 pour la beta-glucosidase
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Birien, Tiphaine. "Génétique et génomique des microorganismes piézophiles des sources hydrothermales océaniques profondes : adaptation aux hautes pressions hydrostatiques chez l'archée piézo-hyperthermophile : Thermococcus barophilus, apport de la génétique et impact des hydrogénases." Thesis, Brest, 2018. http://www.theses.fr/2018BRES0018.

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Resumen
Dans cette étude, les adaptations physiologiques aux hautes pressions hydrostatiques ont été étudiées après délétion de groupes de gènes codant pour les hydrogénases chez Thermococcus barophilus. Cette archée piézo-hyperthermophile isolée au niveau du site hydrothermal "Snakepit" à 3 550 mètres de profondeur a pour pression optimale 40 MPa ; des études trancriptomiques antérieures ont mis en évidence la sur-expression de certains gènes codants pour les hydrogénases sous des conditions de pressions sub et supra optimales (0,1 et 70 MPa). Ici, nous essayons de déterminer le rôle précis de chaque
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Lattuati-Derieux, Agnès. "Caracterisation par des methodes chimiques et spectroscopiques des lipides de micro-organismes marins : _ thermococcus hydrothermalis et pyrococcus abyssi, archaea hyperthermophiles de sources hydrothermales marines profondes _ marinobacter hydrocarbonoclasticus, bacterie marine halotolerante extreme." Paris 6, 1998. http://www.theses.fr/1998PA066201.

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Resumen
L'objectif de ce travail consistait a apporter une contribution a l'etude des lipides des communautes microbiennes marines. Cette etude basee sur l'utilisation de methodes chimiques et de techniques d'analyses spectroscopiques concerne plus precisement les micro-organismes marins thermococcus hydrothermalis et pyrococcus abyssi, archaea hyperthermophiles sulfo-oxydantes isolees de sites hydrothermaux marins, et marinobacter hydrocarbonoclasticus, bacterie marine ubiquiste halotolerante extreme. Cette recherche presente une description qualitative et quantitative des lipides de t. Hydrothermali
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Llanos, Villarreal Jenny A. "Comportement vis-à-vis des métaux lourds de micro-organismes thermophiles isoles d'un site hydrothermal profond." Brest, 2000. http://www.theses.fr/2000BRES2021.

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Resumen
La sensibilité aux métaux de 30 souches thermophiles isolées du site hydrothermal du bassin de Lau a été mesurée. Les 14 bactéries aérobies hétérotrophes sporulantes appartenant a genre bacillus, les 6 bactéries anaérobies fermentatives appartenant a l'ordre des thermotogales et les 10 archæbactéries anaérobies fermentatives réductrices de soufre appartenant a l'ordre des thermococcales ont pu être différenciées par leur sensibilité aux métaux. Les thermococcales étaient les plus résistantes au cadmium et au zinc alors que les thermotogales s'avéraient les plus sensibles. En revanche, les ther
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Hernández, Ávila Iván. "Dispersion larvaire et cycle de vie dans les environnements hydrothermaux profonds : le cas de Rimicaris exoculata et d'espèces proches." Thesis, Brest, 2016. http://www.theses.fr/2016BRES0086/document.

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Resumen
Les écosystèmes hydrothermaux profonds hébergent des communautés présentant de fortes biomasses, issues de l’activité chimiotrophique des microorganismes, avec de nombreux exemples d’associations symbiotiques entre ces derniers et les organismes de la mégafaune dominante. La connaissance du cycle de vie de ces espèces, y compris de leurs symbiontes, et de la façon dont elles sont capables de disperser et de coloniser de nouveaux sites est incontournable pour la compréhension du fonctionnement des communautés hydrothermales.Dans cette étude, sont présentées de nombreuses avancées portant sur la
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Simeoni, Chiara. "Méthodes numériques pour des équations hyperboliques de type Saint-Venant." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2002. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00922706.

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Resumen
L'objet de la thèse est de contribuer à l'étude numérique des lois de conservation hyperboliques avec termes sources, ce qui est motivé par les applications aux équations de Saint-Venant pour les eaux peu profondes. La première partie traite des questions habituelles de l'analyse des approximations numériques des lois de conservation scalaires. On se concentre sur des schémas aux volumes finis semi-discrets, dans le cas général d'un maillage non-uniforme. Pour définir des discrétisations appropriées du terme source, on introduit le formalisme spécifique de la méthode "Upwind Interface Source"
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Elmiloud, Chaabelasri. "Contribution à la modélisation des écoulements en eaux peu profondes, avec transport de polluant. (Application à la baie de Tanger)." Phd thesis, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00575138.

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Resumen
Cette thèse est une contribution à la résolution numérique d'une loi de conservation hyperbolique résultante d'un couplage entre les équations de Saint-Venant, associée à la modélisation des écoulements en eaux peu profondes, et l'équation de transport-diffusion d'un polluant non actif. Le modèle mathématique utilisé est bi-dimensionnel, intégrant des termes de friction, de diffusion, des tensions de surface et un terme tenant compte la variation de la bathymétrie. Nous présentons un modèle numérique basé sur un schéma volumes finis bidimensionnel d'ordres deux, conservatif et consistant, sur
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