Littérature scientifique sur le sujet « Analyse et identification moléculaire »
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Articles de revues sur le sujet "Analyse et identification moléculaire":
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Alexandre-Pires, Graça, S. Diaz, J. Meireles, Fernando Boinas et Isabel Pereira da Fonseca. « Passé et futur : études de morphologie et de biologie moléculaire des Culicoides ». Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux 62, no 2-4 (1 février 2009) : 171. http://dx.doi.org/10.19182/remvt.10075.
Résumé :
Culicoides are the biological vectors of bluetongue virus, an arbovirus transmitted by females after the ingestion of blood from viraemic animals. Conventional microscopy is usually used for taxonomic characterization and recently molecular characterization became a very useful tool to differentiate species with similar morphological characteristics, such as those belonging to Culicoides Obsoletus complex and C. dewulfi. On the other hand, scanning electronic microscopy (SEM) allows the visualization of very small details, which can also be used in Culicoides species identification as a complement of other methods. In this work we performed both techniques in order to detect simultaneously subtle features. Female and male specimens of Culicoides obsoletus sensu stricto, C. scoticus and C. dewulfi were washed in ethylic alcohol in gradients until 100%, followed by immersion in acetone. The insects were dried using the point drying method, mounted in stubs and coated with gold palladium. Specimens were observed under electronic microscope. Deoxyribonucleic acid (DNA) was extracted individually from 360 specimens of the C. Obsoletus complex (C. obsoletus s.s., C. scoticus) and 18 specimens of C. dewulfi, then analysed by PCR Multiplex. Several images of heads including details of the eyes (contiguous and bare), sensilla, flagellomeres, absence of teeth in the cibarial arch and pharynx, maxillary palps and mouth parts, thorax, abdomen and legs (in both sexes), genitalia, hind tibial comb, and fifth tarsi with empodium and claws are presented. PCR Multiplex results are shown. In this work, the SEM technique was used to show specific morphological details not obtained by optical microscopy of C. obsoletus. The SEM technique may be helpful to differentiate members of Culicoides species complexes and can be complementary to other classification methods of Culicoides. Samples of Culicoides analysed by PCR Multiplex and examined in parallel with SEM might improve the taxonomic classification of these insects.
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Hureïki, L., et J. P. Croué. « Identification par couplage CG/SM des sous-produits de chloration de deux acides aminés libres, la proline et la méthionine ». Revue des sciences de l'eau 10, no 2 (12 avril 2005) : 249–64. http://dx.doi.org/10.7202/705280ar.
Résumé :
L'objectif de ces travaux a consiste en l'identification des sous-produits de chloration de deux acides aminés libres, la proline et la méthionine, structures reconnues pour leur grande réactivité avec le chlore. Les expériences ont été conduites a pH 8 pour un taux de chlore fixe à 8 moles de chlore par mole d'acide aminé et un temps de contact de 72 heures. Les sous-produits de chloration ont été extraits successivement par le pentane et le diethyl éther (pH acide et pH basique, extraction suivie d'une dérivation au diazométhane) et identifiés par couplage CG/SM. L'essentiel des sous-produits de chloration identifiés a été observé dans l'extrait éthéré obtenu à pH acide, que ce soit pour la proline ou la méthionine. Les acides dichloroacétique et trichloroacétique, composés retrouvés dans les eaux de surface désinfectées au chlore, ont été détectés pour les deux molécules étudiées. Les travaux effectués avec la proline ont permis d'identifier également la N- chlorodichloroacétamide et la N-chlorotrichloroacétamide. On peut noter également la formation de quelques chloroacides présentant un groupement terminal aldehyde ou nitrile caractéristique, ainsi que des composeé à structure pyrrole. En ce qui concerne la méthionine, les analyses par couplage CG/SM ont permis d'identifier quelques composés organiques chlorosoufrés comme le chlorure de méthyle sulfonyle, le chlorure de chlorométhylesulfonyle et le dichloro-1,1 diméthyle sulfonyle, ainsi que du soufre moléculaire S8.
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Ajayi, A. A., G. O. Onipede, B. C. Okafor, K. A. Adepoju et J. C. Nwabuenu. « Phenotypic identification of soil bacterial and fungal communities inhabiting an archaeological monument at Augustine University, Ilara Epe, southwest Nigeria ». African Journal of Clinical and Experimental Microbiology 22, no 4 (27 septembre 2021) : 473–79. http://dx.doi.org/10.4314/ajcem.v22i4.7.
Résumé :
Background: The Sungbo Eredo Monument is an ancient public work with a system of defensive walls and ditches located in Eredo Local Council Development Area of Epe, Lagos State, southwest Nigeria. A huge section of the monument cuts through the Augustine University campus, forming two-sided vertical walls with a deep ridge in-between. The objective of this investigative study is to determine the microbial profile of soil samples from the monument in the University campus.
Methodology: Soil samples were collected from the topsoil at a depth of 7.5cm from four randomly selected points along the edge of the monument. The samples were transported to the microbiology laboratory of the Department of Biological Sciences of Augustine University for analysis. Samples were cultured on Nutrient agar (NA) and incubated aerobically for 24-48 hours for bacteria isolation and on Sabouraud’s Dextrose agar (SDA) for 72 hours for fungi isolation. Bacterial colonies on NA were preliminarily identified to genus level by Gram reaction and conventional biochemical test scheme for Gram-positive (catalase, coagulase, starch hydrolysis) and Gram-negative isolates (oxidase, urease test, indole, methyl red, Voges Proskauer and sugar fermentation tests). Fungi colonies on SDA were identified using conventional macroscopic and microscopic characteristics. Antibiotic susceptibility test of the bacterial isolates to selected antibiotics was done using the Kirby Bauer disc diffusion method.
Results: A total of twenty-three bacterial isolates in four genera; Bacillus, Staphylococcus, Cellobiococcus and Micrococcus and nine fungal isolates in three genera; Saccharomyces, Aspergillus and Botrytis were identified from the cultures. The bacterial isolates were sensitive (>50% sensitivity) to only gentamicin and ofloxacin, with 65.2% and 78.3% sensitivity rates respectively, while they were largely resistant to all other antibiotics such as ceftriaxone, erythromycin, cefuroxime, cloxacillin, ceftazidime and augmentin, with resistance rates of 65.2%, 65.2%, 73.9%, 82.6%, 86.9%, 91.3% respectively.
Conclusion: The results of this investigative study revealed the presence of antibiotic-resistant bacteria (mainly Gram-positive) and fungi on the archaeological monument of Augustine University, adding to the existing data on microbial spectrum of archaeological monuments that could be useful for unraveling human cultural habits and microbe-related human diseases. However, further studies on molecular identification of these microbial spectrum will be required to ascertain their genetic relatedness and ancestral phylogeny, which will be useful for archaeologists in their study of the Sungbo-Eredo ancestral monument.
French title: Identification phénotypique des communautés bactériennes et fongiques du sol habitant un monument archéologique à l'Université Augustine, Ilara Epe, sud-ouest du Nigeria
Contexte: Le monument Sungbo Eredo est un ancien ouvrage public doté d'un système de murs défensifs et de fossés situé dans la zone de développement du conseil local d'Eredo à Epe, dans l'État de Lagos, au sud-ouest du Nigéria. Une énorme section du monument traverse le campus de l'Université Augustine, formant des murs verticaux à deux côtés avec une crête profonde entre les deux. L'objectif de cette étude d'investigation est de déterminer le profil microbien d'échantillons de sol provenant du monument du campus universitaire.
Méthodologie: Des échantillons de sol ont été prélevés dans la couche arable à une profondeur de 7,5 cm à partir de quatre points choisis au hasard le long du bord du monument. Les échantillons ont été transportés au laboratoire de microbiologie du Département des sciences biologiques de l'Université Augustine pour analyse. Les échantillons ont été cultivés sur gélose nutritive (NA) et incubés en aérobie pendant 24 à 48 heures pour l'isolement des bactéries et sur gélose au dextrose de Sabouraud's(SDA) pendant 72 heures pour l'isolement des champignons. Les colonies bactériennes sur NA ont été préalablement identifiées au niveau du genre par réaction de Gram et schéma de test biochimique conventionnel pour les isolats Gram-positif (catalase, coagulase, hydrolyse de l'amidon) et Gram-négatif (oxydase, test à l'uréase, indole, rouge de méthyle, Voges Proskauer et sucre essais de fermentation). Les colonies de champignons sur SDA ont été identifiées en utilisant des caractéristiques macroscopiques et microscopiques conventionnelles. Le test de sensibilité aux antibiotiques des isolats bactériens à des antibiotiques sélectionnés a été effectué en utilisant la méthode de diffusion sur disque de Kirby Bauer.
Résultats: Un total de vingt-trois isolats bactériens dans quatre genres; Bacillus, Staphylococcus, Cellobiococcus et Micrococcus et neuf isolats fongiques de trois genres; Saccharomyces, Aspergillus et Botrytis ont été identifiés à partir des cultures. Les isolats bactériens étaient sensibles (sensibilité >50%) uniquement à la gentamicine et à l'ofloxacine, avec des taux de sensibilité de 65,2 % et 78,3 % respectivement, alors qu'ils étaient largement résistants à tous les autres antibiotiques comme la ceftriaxone, l'érythromycine, la céfuroxime, la cloxacilline, la ceftazidime et l'augmentine avec des taux de résistance de 65,2%, 65,2%, 73,9%, 82,6%, 86,9%, 91,3% respectivement.
Conclusion: Les résultats de cette étude d'investigation ont révélé la présence de bactéries résistantes aux antibiotiques (principalement à Gram positif) et de champignons sur le monument archéologique de l'Université Augustine, ajoutant aux données existantes sur le spectre microbien des monuments archéologiques qui pourraient être utiles pour démêler l'homme. les habitudes culturelles et les maladies humaines liées aux microbes. Cependant, d'autres études sur l'identification moléculaire de ces spectres microbiens seront nécessaires pour déterminer leur parenté génétique et leur phylogénie ancestrale, ce qui sera utile aux archéologues dans leur étude du monument ancestral Sungbo-Eredo.
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Baikoro, Manan Djamila, Pawindé Elisabeth Zida, Moustapha Koala, Wendoléan Romain Soalla, Bouma James Neya et Marie Laure Guissou. « Importance et distribution de <i>Macrophomina phaseolina</i> ; associé aux semences de niébé au Burkina Faso- caractérisation préliminaire des isolats du champignon ». International Journal of Biological and Chemical Sciences 17, no 4 (19 septembre 2023) : 1456–71. http://dx.doi.org/10.4314/ijbcs.v17i4.14.
Résumé :
Le niébé, (Vigna unguiculata (L.) Walp.), principale légumineuse cultivée au Burkina Faso, est attaqué par plusieurs agents pathogènes dont les champignons. Parmi ces champignons, Macrophomina phaseolina (Tassi) Goidanich est responsable de la pourriture charbonneuse qui cause d’importantes pertes de production de 80 à 100%. Ces pertes pourraient être considérablement réduites à travers l’utilisation de variétés résistantes à la maladie. L’objectif de l’étude était de contribuer au renforcement des connaissances de l’agent pathogène de la pourriture charbonneuse du niébé pour une meilleure gestion de la maladie au Burkina Faso. A cet effet, une analyse sanitaire des semences, utilisant la méthode du papier buvard a été effectuée sur 27 échantillons de semences collectés dans 14 localités réparties dans les deux principales zones climatiques de production du niébé. La plupart des échantillons de semences collectés (96,30%) étaient infectés par M. phaseolina. Le champignon a été retrouvé dans les semences à des taux moyens d’infection de 35,25% dans la zone Soudanienne et 27,86% dans la zone Soudano-Sahélienne. Une caractérisation moléculaire préliminaire réalisée sur 51 isolats de Macrophomina a permis d’identifier M. phaseolina comme la principale espèce présente dans les semences de niébé dans les deux zones étudiées.
English title: Prevalence of Cowpea Charcoal Rot and Molecular Identification of Three Macrophomina Species in the Sudanian and Sudano-Sahelian Zones of Burkina Faso
Cowpea (Vigna unguiculata (L.) Walp.), the main legume crop cultivated in Burkina Faso, is attacked by several pathogens, including fungi. Among these fungi, Macrophomina phaseolina (Tassi) Goidanich is responsible for charcoal rot and leads to significant production losses ranging from 80 to 100%. These losses could be significantly reduced through the use of disease-resistant varieties. The objective of the study was to contribute to the strengthening of knowledge of the causal agent of cowpea charcoal rot for better management of the disease in Burkina Faso. For this purpose, a seed health analysis, using the blotter paper method. A sanitary analysis was carried out on 27 seed samples collected from 14 localities distributed in the two main climatic zones of cowpea production. Most of the seed samples collected (96.30%) were infected with M. phaseolina. The fungus was found in seeds at average infection rates of 35.25% in the Sudanian zone and 27.86% in the Sudano-Sahelian zone. A preliminary molecular characterization of 51 isolates of Macrophomina lead to identify M. phaseolina as the main species present in cowpea seeds in the two targeted areas.
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Chadha, A., W. Jamal et V. O. Rotimi. « Emergence of nosocomial-acquired extensively drug-resistant and pandrug-resistant Enterobacterales in a teaching hospital in Kuwait ». African Journal of Clinical and Experimental Microbiology 23, no 4 (24 octobre 2022) : 426–36. http://dx.doi.org/10.4314/ajcem.v23i4.11.
Résumé :
Background: The emergence and high ascendancy of infections caused by extensively-drug-resistant (XDR) and pandrug-resistant (PDR) Enterobacterales isolates is a serious clinical and public health challenge. Isolation of PDR Gram-negative bacteria (GNB) in clinical setting is very rare and rarer is the infection caused by XDR GNB. Apart from restricted therapeutic options, these infections are associated with increased mortality and morbidity. Urgent studies to re-evaluate existing therapeutic options and research into new antibiotic molecules are desperately needed. The objectives of this study are to report the emergence of rarely encountered multidrug-resistant (MDR), difficult-to-threat, CRE infections in our hospital and investigate their molecular epidemiology.Methodology: This was a retrospective observational analysis of six patients with severe infections caused by XDR and PDR Enterobacterales isolates at Mubarak AL Kabeer Teaching Hospital, Jabriya, Kuwait, over a period of one and half years. The mechanisms of resistance in these isolates were then prospectively investigated by molecular characterization and genomic studies.Results: The majority of infections were caused by Klebsiella pneumoniae (83.3%, 5/6) and one (16.6%) was caused by Escherichia coli. Three patients had bloodstream infection (BSI), one had both BSI and urinary tract infection (UTI), one had respiratory tract infection, and the last one had UTI. Two patients were infected with OXA-48 producers, one patient was infected with NDM-1 producer, one patient was infected with NDM-5 producer, one patient was infected with both NDM-1 and OXA-48 producer and the last patient was infected with both NDM-5 and OXA-181 producer. For definite treatment, all patients received combination therapy. The mortality rate was high (50.0%).Conclusion: The high mortality rate associated with XDR and PDR Enterobacterales infections and the limited antimicrobial options for treatment highlight the need for improved detection of these infections, identification of effective preventive measures, and development of novel agents with reliable clinical efficacy against them.
Contexte: L'émergence et la montée en puissance des infections causées par des isolats d'entérobactéries ultrarésistantes (XDR) et pandrug-résistantes (PDR) constituent un sérieux défi clinique et de santé publique. L'isolement de bactéries Gram-négatives PDR (GNB) en milieu clinique est très rare et plus rare est l'infection causée par XDR GNB. En dehors des options thérapeutiques restreintes, ces infections sont associées à une augmentation de la mortalité et de la morbidité. Des études urgentes pour réévaluer les options thérapeutiques existantes et la recherche de nouvelles molécules antibiotiques sont désespérément nécessaires. Les objectifs de cette étude étaient de signaler l'émergence d'infections à CRE multirésistantes (MDR), difficiles à menacer, rarement rencontrées dans notre hôpital et d'enquêter sur leur épidémiologie moléculaire.Méthodologie: Il s'agissait d'une analyse observationnelle rétrospective de six patients atteints d'infections graves causées par des isolats d'entérobactéries XDR et PDR à l'hôpital universitaire Mubarak AL Kabeer, Jabriya, Koweït, sur une période d'un an et demi. Les mécanismes de résistance de ces isolats ont ensuite été étudiés de manière prospective par caractérisation moléculaire et études génomiques.Résultats: La majorité des infections ont été causées par Klebsiella pneumoniae (83,3%, 5/6) et une (16,6%) a été causée par Escherichia coli. Trois patients avaient une infection du sang (BSI), un avait à la fois une BSI et une infection des voies urinaires (UTI), un avait une infection des voies respiratoires et le dernier avait une UTI. Deux patients ont été infectés par des producteurs d'OXA-48, un patient a été infecté par un producteur de NDM-1, un patient a été infecté par un producteur de NDM-5, un patient a été infecté par un producteur de NDM-1 et d'OXA-48 et le dernier patient a été infecté avec le producteur NDM-5 et OXA-181. Pour un traitement définitif, tous les patients ont reçu une thérapie combinée. Le taux de mortalité était élevé (50.0%).Conclusion: Le taux de mortalité élevé associé aux infections XDR et PDR Enterobacterales et les options antimicrobiennes limitées pour le traitement soulignent la nécessité d'améliorer la détection de ces infections, l'identification de mesures préventives efficaces et le développement de nouveaux agents avec une efficacité clinique fiable contre elles.
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Lechapt Zalcman, E., C. Bazille, A. Rousseau, F. Burel-Vandenbos et J. Y. Pierga. « Analyse histologique et moléculaire des métastases cérébrales ». Cancer/Radiothérapie 19, no 1 (février 2015) : 10–15. http://dx.doi.org/10.1016/j.canrad.2014.11.004.
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Stellzig-Eisenhauer, Angelika, Eva Decker, Philipp Meyer-Marcotty, Christiane Rau, Britta S. Fiebig, Wolfram Kress, Kathrin Saar et al. « Défaut primaire d’éruption (DPE). Analyse génétique clinique et moléculaire ». L'Orthodontie Française 84, no 3 (septembre 2013) : 241–50. http://dx.doi.org/10.1051/orthodfr/2013055.
Résumé :
Définition : Le « défaut primaire d’éruption » (DPE), parfois aussi appelé « échec primaire d’éruption », désigne l’absence d’éruption partielle ou totale d’un germe non-ankylosé. Elle est due à une perturbation du mécanisme d’éruption. Le processus moléculaire conduisant à ce dysfonctionnement n’est pas connu à ce jour. Échantillon et méthodes : Quatre familles ont été étudiées. Dans chacune, au moins deux individus étaient affectés d’un défaut primaire d’éruption (DPE) non syndromique. Un diagnostic radiologique (panoramique) a été conduit sur tous les patients et les membres de leur famille qui n’étaient pas affectés (groupe contrôle). L’analyse génétique comprenait une analyse de liens pangénomique suivie d’un séquençage direct de l’ADN avec une cartographie des gènes candidats positionnels. Résultats : En partant des patients affectés, nous sommes parvenus à reconstituer des pédigrées sur deux ou trois générations dans les familles avec une transmission du défaut primaire d’éruption non syndromique selon un mode autosomique dominant. Quinze patients atteints de DPE ont été diagnostiqués. La distribution selon le genre s’est révélée pratiquement égale (7 femmes et 8 hommes). L’analyse génétique moléculaire du gène PTHR1 révèle trois mutations hétérozygotes (c.1050-3C>G ; c.543 + 1G>A ; c.463G>T). Aucune mutation n’a été trouvée chez les personnes non affectées. Conclusion : La connaissance des causes génétiques du DPE non syndromique peut maintenant être utilisée pour effectuer un diagnostic différentiel en cas de défaut d’éruption. Elle permet d’identifier très tôt les membres d’une famille qui sont touchés et pourrait, à long terme, déboucher sur de nouvelles possibilités de traitement. Le diagnostic génétiquement validé de défaut primaire d’éruption peut soustraire les patients et leurs orthodontistes à des années de tentatives de tractions vouées à l’échec, car le traitement orthodontique seul n’est pas une solution valable. Au contraire, il produit des effets iatrogènes sur les dents d’ancrage non affectées et sur les maxillaires.
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Armignacco, R., T. Lartigue, A. Jouinot, A. Septier, M. Neou, C. Gaspar, K. Perlemoine et al. « Identification d’une signature moléculaire d’hypercortisolisme par analyse du methylome du sang total ». Annales d'Endocrinologie 81, no 4 (septembre 2020) : 180. http://dx.doi.org/10.1016/j.ando.2020.07.117.
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Rodriguez-Nava, Veronica, Frédéric Laurent, Andrée Couble et Patrick Boiron. « Identification phénotypique et moléculaire des bactéries appartenant au genre Nocardia ». Revue Francophone des Laboratoires 2007, no 391 (avril 2007) : 49–56. http://dx.doi.org/10.1016/s1773-035x(07)80129-8.
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Teyssier, C., E. Jumas-Bilak, H. Marchandin, H. Jean-Pierre, J. L. Jeannot, G. Dusart, V. Foulongne et M. Siméon de Buochberg. « Identification d’espèce et épidémiologie moléculaire des bactéries du genre Ochrobactrum ». Pathologie Biologie 51, no 1 (février 2003) : 5–12. http://dx.doi.org/10.1016/s0369-8114(02)00361-9.
Thèses sur le sujet "Analyse et identification moléculaire":
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Balloul, Jean-Marc. « Identification, analyse biochimique, et clonage moléculaire d'un antigène protecteur de Schistosoma mansoni ». Lille 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LIL10130.
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Verdier, Yann. « Sélection, identification et caractérisation partielle d'antigènes du spermatozoïde du renard (Vulpes vulpes) en vue de leur utilisation dans un vaccin contraceptif ». Nancy 1, 2002. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/SCD_T_2002_0307_VERDIER.pdf.
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Gautier, Nicolas. « Caractérisation et analyse d'un épitope T CD4 de la protéine IE1 du cytomégalovirus, et des fonctions effectrices de clones T CD4 anti-IE1 ». Toulouse 3, 1996. http://www.theses.fr/1996TOU30216.
Résumé :
Les lymphocytes t cd4#+ specifiques de la proteine ie1 du cmv sont susceptibles de jouer un role important dans le controle d'une infection latente a cmv. L'analyse des interactions cmh/antigene/tcr et des fonctions effectrices exercees par les lymphocytes t cd4 est une etape dans la comprehension du role de la reponse t cd4 anti-cmv. Dans ce but, notre etude englobe la caracterisation et l'analyse d'epitopes t cd4 de la proteine ie1 du cmv, l'analyse des fonctions effectrices de ces clones t et le role des cytokines secretees. Une digestion enzymatique de la proteine recombinante gst-ie1(86-491) suivi d'une analyse par hplc-ms combinee a des tests de lymphoproliferation a permis l'identification d'un epitope presente par hla-dr8 correspondant au 14-mere 162-dkremwmacikelh-175. Un autre epitope ie1(86-105) presente par hla-dr3 a necessite la synthese de peptides chevauchants. La synthese d'analogues tronques, etendus et disubstitues par des residus alanine ont permis de definir la sequence optimale de l'epitope correspondant au 14-mere ie1(162-175) avec un core central de l'epitope situe sur la sequence ie1(164-171). Dans cette sequence, le domaine m166-w167 constitue le site principal d'interaction avec la molecule de cmh, et les domaines r164-e165 et m168-a169 les sites principaux d'interaction avec le tcr. D'autre part, la disubstitution des domaines c170-i171 et i158-v159 augmentent l'immunogenicite de l'epitope suggerant l'effet negatif de la chaine laterale de certains residus sur la reconnaissance t. Le profil de secretion de cytokines montre que les clones t cd4#+ diriges contre la proteine ie1 sont de type th1-th0. De plus, ils possedent une activite cytotoxique restreinte par hla-dr. Au laboratoire, nous avons montre que les cytokines secretees ifn-gamma et tnf-alpha agissent en synergie dans le controle du cmv in vitro. Enfin, l'analyse de la reponse du clone t cd4 specifique du peptide ie1(158-175) en presence des analogues disubstitues montre une correlation des differentes fonctions effectrices: proliferation, secretion de cytokines et cytotoxicite
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Glasser, Anne-Lise. « Contribution à l'étude des relations structures-fonctions des acides ribonucléiques de transfert de cellules eucaryotes : analyse, identification et rôle de nouveaux nucléosides hypermodifiés ». Dijon, 1993. http://www.theses.fr/1993DIJOS019.
Résumé :
Les ARNt se caractérisent par la présence d'une grande variété de nucléosides modifiés. Selon leur positionnement et leur structure chimique, les nucléosides modifiés confèrent, en partie du moins, son identité a l'ARNt qui les contient. La caractérisation chimique de certains nucléosides hypermodifiés a été entreprise pour tenter d'élucider les relations entre la structure de ces nucléosides et leur fonction biologique. La stratégie analytique mise au point et utilisée dans cet objectif réside essentiellement en un ensemble de méthodes combinées chromatographiques et spectrométriques permettant, à partir d'ARNt, l'isolement, la purification et l'identification de mono nucléosides de structures inconnues. A l'aide de ces méthodes et après avoir établi une bibliothèque des paramètres chromatographiques et spectraux de plus de 50 nucléosides de référence, nous avons déterminé la structure chimique de nouveaux nucléosides modifiés. L'étude conduite sur les ARNT méthionine initiateurs (ARNt#Met #i) de plusieurs espèces de levures et de végétaux, nous a ainsi permis de découvrir et d'identifier deux purines hypermodifiées localisées en position 64 et de structures chimiques inédites: adénosine et guanosine phosphoribosylées. Nous avons pu montrer qu'une telle modification purique peut etre considérée comme un marqueur de ces ARNt#M#e#ti. Son role biologique serait d'empêcher l'ARNt#M#e#ti d'être entrainé vers les étapes de l'élongation protéique. Nous avons également mis en évidence et établi la structure d'un autre nucléoside hypermodifié, la 2-o-methyl-5-carbomoylmethyluridine (ncm#5um), localisé en position 34 (wobble) d'un nouvel isoaccepteur l'ARNt#l#e#u (ncm#5umaa) isolé de la levure saccharomyces cerevisiae. Nous avons alors montre qu'une telle structure chimique entraine une reconnaissance unique et spécifique du seul codon leucine UUA
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Trape, Sébastien. « Les Mugilidae des côtes ouest-africaines : identification moléculaire, phylogénie et bio-écologie du recrutement des juvéniles dans un estuaire hypersalé ». Montpellier 2, 2009. http://www.theses.fr/2009MON20163.
Résumé :
La persistance de la sécheresse depuis les années 1970 en Afrique de l'Ouest a particulièrement affecté le fonctionnement des écosystèmes côtiers. Dans certains estuaires cette perturbation a engendré une inversion du gradient de salinité et l'apparition de zones hypersalées (salinité > 60). Afin d'appréhender l'impact de ces changements environnementaux sur le recrutement et la croissance des juvéniles dans les milieux estuariens, les patrons spatio-temporels de recrutement (structures de taille et distributions d'abondance) de toutes les espèces de mulets ont été étudiés dans l'estuaire inverse du Sine Saloum (Sénégal). La croissance des juvéniles a été mesurée grâce aux microstructures journalières des otolithes. La taxonomie des Mugilidae en Afrique de l'Ouest étant confuse et les critères morphométriques nécessaires à l'identification des juvéniles encore inconnus, nous avons dans un premier temps (1) élaboré une phylogénie moléculaire des espèces, (2) développé une méthode génétique pour l'identification des juvéniles et enfin (3) mis au point une clef d'identification morphométrique. Les analyses moléculaires ont révélé l'existence d'une nouvelle espèce sur les côtes ouest africaines (Chelon bandialensis) et montré que Mugil ashanteensis et Mugil metzeleaari précédemment confondues avec Mugil cephalus et Mugil curema constituent deux espèces valides. Les patrons spatio-temporels du recrutement des juvéniles ont révélé que Liza dumerili dominait très largement le peuplement en représentant 89 % des captures totales. Les décalages entre les périodes de recrutement des espèces expliquent la colonisation d'un même environnement par des espèces proches. La croissance des juvéniles de L. Dumerili, plus élevée avec les faibles salinités (moyenne 36), met en exergue les contraintes apportées par l'hypersalinisationThe persistence of the drought since the 1970s in West Africa has particularly affected the functioning of coastal ecosystems. This perturbation has conducted to reverse salinity gradients in some estuaries and the appearance of hypersaline areas (salinity > 60). To get some insights about the consequences of these environmental changes on the recruitment and the growth of juveniles in estuarine ecosystems, spatio-temporal patterns of recruitment (size structures and abundance distributions) of all Mugilidae species have been studied in the inverse Sine Saloum estuary (Senegal). The growth has been measured using otolith daily microincrements. The taxonomy of West African Mugilidae being confused and the morphological criteria necessary for identifying juveniles yet unknown, in a first step we have (1) carried out a molecular phylogeny of the mullet species, (2) developed a genetic method for identifying juveniles and finally (3) developed a morphometric identification key for juveniles. Molecular analyses have revealed the existence of a new mugilid species along the West African coasts (Chelon bandialensis) and shown that Mugil ashanteensis and Mugil metzeleaari previously confounded with Mugil cephalus and Mugil curema are valid species. The spatio-temporal patterns of recruitment of juveniles have revealed that Liza dumerili largely dominated the assemblage, representing 89% of the total catches. The gaps between recruitment periods of the species explain the colonisation of a same environment by close related species. The juvenile growth of L. Dumerili, higher in low salinities (mean 36), highlights constraints associated with hypersalinity
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Gervais, Julie. « Identification et analyse fonctionnelle des effecteurs tardifs impliqués dans la colonisation systémique du colza par Leptosphaeria maculans ». Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS346/document.
Résumé :
Leptosphaeria maculans est un champignon pathogène, responsable de l’une des principales maladies du colza (Brassica napus), la nécrose du collet. Le cycle de vie infectieux de L. maculans est particulièrement complexe. Après l’infection primaire des feuilles et des cotylédons, le champignon développe une longue phase de vie endophytique dans la tige. Cette phase de vie, qui est entièrement asymptomatique, dure plusieurs mois, avant que la nécrose ne se développe à la base de la tige, préjudiciable à l'élaboration du rendement. Durant cette phase, le colza peut présenter une « résistance adulte » limitant l'apparition et la gravité des symptômes. Alors que les gènes fongiques exprimés au cours de l’infection primaire du colza sont largement étudiés, très peu de connaissances étaient disponibles concernant la phase de colonisation systémique. Pour expliquer la capacité du champignon à coloniser la tige sans induire de symptômes, nous avons donc émis l’hypothèse que L. maculans exprimait à ce stade des effecteurs, c'est-à-dire des petites protéines sécrétées, interférant avec le système de défense de la plante. L’objectif de ma thèse était d'identifier de tels effecteurs et de les caractériser afin de mieux comprendre la colonisation systémique du colza par le champignon. Un des enjeux sous-jacents de cette thèse était aussi d'identifier de nouvelles résistances permettant la reconnaissance spécifique de ces effecteurs, qui pourraient expliquer, au moins en partie, la résistance adulte observée dans certaines variétés.Par une approche transcriptomique, j'ai pu identifier 307 effecteurs candidats "tardifs", spécifiquement exprimés lors de la colonisation de la tige et 107 effecteurs "précoces", spécifiquement exprimés lors de la colonisation des cotylédons. J’ai confirmé que les gènes codant des effecteurs précoces de L. maculans sont spécifiquement localisés dans les régions pauvres en gènes et riches en éléments répétés du génome fongique. A l'inverse les gènes codant des effecteurs candidats tardifs sont absents de ces régions et sont localisés dans les régions riches en gènes du génome. Les effecteurs de L. maculans ont donc une localisation génomique distincte en fonction de leur profil d'expression.Une analyse approfondie de cinq de ces effecteurs tardifs a permis de montrer leur conservation dans les populations naturelles de L. maculans et leur implication dans la suppression de la mort cellulaire végétale. Ces résultats associés à l'analyse de leur profil d'expression dans des échantillons de tige issus du champ au cours d'une saison culturale ont permis de proposer le modèle suivant: L. maculans coloniserait la tige de colza en sécrétant des effecteurs supprimant la mort cellulaire et donc interférant avec les défenses de la plante. A la fin de la saison culturale, la diminution de l'expression de ces effecteurs permettrait au champignon de passer d'un stade de vie biotrophe à un stade de vie nécrotrophe et d’induire la nécrose au collet. Cette transition entre les deux modes de vie serait donc basée sur un équilibre entre effecteurs supprimant la mort cellulaire et effecteurs induisant la mort cellulaire.Dans le but d'identifier de nouvelles sources de résistance spécifiques et/ou faciliter l’identification de résistances quantitatives dans le matériel végétal, j'ai créé des souches fongiques sur-exprimant précocement des effecteurs tardifs. Avec ces souches transformées j'ai évalué par test cotylédonnaire une grande collection de génotypes de colza pour identifier de potentielles relations de type gène-pour-gène. Une variété présentant une réponse hypersensible à un effecteur tardif a ainsi pu être identifiée, le contrôle monogénique de cette réponse a été validé et sa cartographie génétique effectuée dans deux descendances. Cette approche permet donc effectivement d'identifier de nouvelles sources de résistances pour lutter efficacement contre la nécrose du colletLeptosphaeria maculans is a pathogenic fungus, responsible for one of the main diseases of oilseed rape (Brassica napus), the stem canker disease. The infectious life cycle of L. maculans is especially complex. After the primary infection of leaves and cotyledons, the fungus develops a long endophytic stage in the stem. This infection stage, which is entirely asymptomatic, lasts several months before necrosis develops at the stem base, responsible of yield loss. At this stage, the oilseed rape may exhibit "adult resistance" limiting the onset and severity of symptoms. While the fungal genes expressed during the primary infection are extensively studied, very little knowledge was available concerning the systemic colonization. To explain the ability of the fungus to colonize the stem without inducing symptom, we have therefore hypothesized that L. maculans expressed effectors, i.e. small secreted proteins, interfering with the plant defense system.The objective of my thesis was to identify such effectors and to characterize them to better understand the systemic colonization of oilseed rape by L. maculans. One of the underlying challenges of this thesis was also to identify new resistances allowing the specific recognition of these effectors expressed during stem colonization, and which may explain, at least in part, the adult resistance observed in some varieties.Using a transcriptomic approach, I was able to identify 307 "late" effector candidates specifically expressed during stem colonization and 107 "early" effector candidates specifically expressed during cotyledon colonization. I confirmed that the genes encoding early effectors of L. maculans are specifically localized in gene-poor regions and rich in repeated elements of the fungal genome. Conversely, late candidate effectors are absent from these regions and are located in regions rich in genes of the genome. L. maculans effectors have thus a distinct genomic localization based on their expression profile.A detailed analysis of five of these late effectors showed their conservation in the natural populations of L. maculans and their involvement in the suppression of plant cell death. These results, associated with the analysis of their expression profile in stem samples from the fields during a growing season, allowed us to propose the following model: L. maculans would colonize systemically the oilseed rape stem by secreting effectors suppressing cell death and thus interfering with plant defenses. At the end of the growing season, the decreased expression of these effectors would allow the fungus to switch from a biotrophic to a necrotrophic lifestyle and to induce stem canker. This transition between the two ways of life would therefore be based on a balance between effectors suppressing and effectors inducing cell death.In order to identify new specific sources of resistance and / or to facilitate the identification of quantitative resistances in plant material, I created fungal strains over-expressing late effectors during cotyledon colonization. With these transformed strains I evaluated by cotyledonary test a large collection of oilseed rape genotypes to identify potential gene-for-gene. A variety with a hypersensitive response to a late effector was thus identified, the monogenic control of this response was validated and its genetic mapping carried out in two progenies. This approach therefore effectively enables the identification of new sources of resistance for effective control of L. maculans
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Taupin, Vanessa. « La différenciation sporale chez les microsporidies : imagerie 3D et isolement des stades de développement, analyse de l'expression différentielle de protéines structurales et première identification des glycanes ». Phd thesis, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00702783.
Résumé :
La microsporidie, Encephalitozoon cuniculi, parasite intracellulaire, est un pathogène opportuniste. Des reconstructions tridimensionnelles à partir de coupes sériées ont permis de visualiser les différents stades cellulaires au cours de la sporogenèse. L'immunolocalisation de protéines pariétales couplée à l'hybridation in situ des ARNm correspondants ont révélé leur expression différentielle durant le développement intracellulaire. L'étude sur la glycosylation des protéines a permis de démontrer l'absence de N-glycosylation et l'existence d'une voie de O-mannosylation. Semblables à celles des champignons, les chaînes sont linéaires d'une longueur maximale de 8 mannoses liés en alpha1,2 et les mannoprotéines sont localisées dans le capuchon polaire. Des protéines fucosylées sont présentes dans la paroi sporale. La mise au point d'un protocole de séparation des stades sporogoniques en gradient de densité, offre des perspectives d'analyses biochimiques comparatives
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Rouhan, Germinal. « Systématique phylogénétique du genre Elaphoglossum Schott ex J. Sm (Elaphoglossaceae, Monilophytes) : approches morphologique, moléculaire, et implications biogéographiques pour la région de l'Océan Indien ». Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2005. http://www.theses.fr/2005MNHN0029.
Résumé :
Elaphoglossum Schott ex J. Sm. (Elaphoglossaceae) est l’un des genres de Monilophytes les plus diversifiés. Cette diversité spécifique est paradoxalement associée à une morphologie générale simple et uniforme. L’objectif de cette Thèse est de proposer une hypothèse phylogénétique qui permette de clarifier la taxinomie du genre. Des caractères morphologiques et moléculaires ont été analysés. Les résultats confirment la monophylie du genre et suggèrent la reconnaissance de 5 clades majeurs. Les résultats phylogénétiques sont également utilisés pour expliquer la distribution actuelle du genre et plus particulièrement l’origine des taxons de l’Océan Indien. Compte tenu de l’âge de la radiation estimé ici au Cénozoïque, l’hypothèse avancée soutient qu’il s’est produit de multiples dispersions à longue distance depuis le centre de diversité actuel Néotropical vers la région de l’Afrique et de l’Océan Indien. Enfin, les taxons de cette dernière région font l’objet d’une révision taxinomiqueElaphoglossum Shott ex J. Sm. (Elaphoglossaceae) is one of the most diversified Monilophyte genera. This great diversity is paradoxically associated to a simple and uniform general morphology. The aim of this thesis is to propose for the first time a supported phylogenetic hypothesis to clarify the taxonomy of the genus. To do that, morphological and molecular characters were analysed from a sample of 123 species. The results confirm the monophyly of the genus and suggest that it contains five well supported main clades. The phylogenetic tree resulting from this analysis was also used to examine biogeography of the genus, especially the origin of species in the Indian Ocean area. Because the genus radiated during the Cenozoic, long-distance dispersal probably best explains sister-group relationships between the diversity center of the Neotropics with the Paleotropical region of the Indian Ocean. Finally, the taxa from the latter region are revised
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Saumonneau, Amélie. « Etude d'un complexe de régulation transcriptionnelle du gène d'un transporteur de glucose chez la Vigne : identification de gènes "ASR", analyse fonctionnelle de leurs regions promotrices et caractérisation moléculaire de ces protéines régulatrices ». Poitiers, 2007. http://www.theses.fr/2007POIT2279.
Résumé :
Les protéines ASR sont impliquées dans les réponses aux stress abiotiques et beaucoup de processus de développement, comme la maturation. Cependant, leurs fonctions biologiques restent inconnues. L’ADNc d’une protéine ASR de Vigne, VvMSA, est isolée par l’approche du simple hybride. Elle agit comme un facteur de transcription à l’égard du promoteur du gène VvHT1. Le clonage du gène entier VvMSA révèle l’existence d’une famille multigénique d’ASR, chez la Vigne. Une étude fonctionnelle de leurs promoteurs est réalisée par délétions des promoteurs et fusions en amont du gène rapporteur Luciférase par expression transitoire dans des protoplastes de Vigne. L’expression conférée par les promoteurs VvMSA, est régulée par les sucres et induite par l’ABA et le stress au froid. La caractérisation biochimique de VvMSA a montré la présence de 2 isoformes protéiques se différenciant par une délétion de 5 acides aminés provoquant une différence de mobilité électrophorétique. Des analyses in vitro et in vivo ont prouvé la phosphorylation des 2 isoformes de VvMSA. L’hypothèse impliquant VvMSA dans un complexe de régulation transcriptionnelle est étudiée. Par une approche de double hybride, un partenaire protéique nommé VvDREB est isolé. La technique de BiFC a confirmé l’interaction de VvMSA et de VvDREB et la formation exclusive de ce complexe dans le noyau. Les résultats obtenus montrent l’implication des glucides, de l’ABA et des stress abiotiques dans la régulation transcriptionnelle des gènes VvMSA. La caractérisation biochimique de VvMSA et son interaction avec VvDREB suggèrent leur intervention dans un complexe régulateur de l’expression génique en réponse aux stress abiotiquesThe ASR proteins are involved in plant response to abiotic stresses as well as in developmental processes such as ripening. However, biological functions of these proteins remain unknown. The one-hybrid approach allowed isolating, a grape ASR, VvMSA, witch is a putative transcription factor of VvHT1. In grapevine, cloning of VvMSA genes revealed one polymorphism in this multigenic family. The functional analysis of promoter regions is performed by progressive deletions and their fusion upstream to luciferase reporter gene. The constructions expression in grape protoplasts demonstrated a sugar regulation and ABA/cold stress induction of VvMSA expression. VvMSA Biochemical characterization showed two isoforms of the protein differing by a lack of five amino acids in one of them. In vitro and in vivo experimentation also revealed the phosphorylation of isoforms. VvMSA presents the functional characteristics of a regulatory protein, but does not display any domain specific for transcription factor. This suggests its involvement in a complex for transcriptional regulation. By the means of two-hybrid screening using VvMSA as bait, a partner of this protein is isolated. It is belonging to the DREB proteins family, involved in plant response to water, salt and osmotic stresses. By BiFC approach, we confirmed the interaction between VvMSA and VvDREB and provided the exclusive nuclear localization of their complex. The obtained results allow us to consider grape ASR as non-histone chromosomal proteins, that might act as downstream components of a common signal transduction pathway involved in the responses of plant cells to environmental factors mediated by sugar and ABA signaling
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Seesao, Yuwalee. « Caractérisation des Anisakidae dans les poissons marins : développement d’une méthode d’identification par séquençage à haut-débit et étude de prévalence ». Thesis, Lille 2, 2015. http://www.theses.fr/2015LIL2S043/document.
Résumé :
Les genres Anisakis, Pseudoterranova, Hysterothylacium et Contracaecum, membres de la famille des Anisakidae, sont des nématodes dont les larves sont présentes chez de nombreuses espèces de poissons et céphalopodes. Ces larves peuvent induire des pathologies digestives et/ou allergiques chez l’Homme. En France, la consommation des produits de la pêche, surtout crus ou peu cuits est en augmentation. Ce travail de thèse s’intègre dans le programme ANR Fish-Parasites, financé par l’ANR (ANR-10-ALIA-004). Il a pour but d’évaluer les risques liés à la consommation des produits de la pêche et pour objectif principal d’étudier la répartition des Anisakidae dans les produits de la pêche. _x000D_Le plan d’échantillonnage a été établi suite à une analyse de type risk-ranking utilisant les données de consommation, l’origine géographique, des données de prévalence déjà existantes sur les Anisakidae. Au total, 1768 poissons appartenant à 18 espèces ont été collectés. L’ensemble des organes a été disséqué pour isoler les parasites. Ceux-ci ont été identifiés selon 2 méthodes : i) analyse individuelle par séquençage Sanger pour les organes ayant moins de 11 nématodes ii) analyse en pool par séquençage à haut débit (HTS) pour le reste. Le développement de plusieurs outils (création d’une base de séquences de référence, conception des amorces, mise au point de la préparation de matrice de séquençage et développement d’un pipeline d’analyse automatisé) a été nécessaire pour la mise en place de la méthode HTS. A partir des résultats obtenus, une acquisition et une structuration des données de prévalence des parasites potentiellement pathogènes pour l’Homme et présents dans les produits de la pêche couramment consommés a pu être réalisée.Sur 1 768 poissons échantillonnés, deux espèces n’étaient pas du tout parasitées : plies (Pleuronectes platessa) et saumon Atlantique (Salmo salar) d’élevage. 43,30 % des poissons n’étaient pas infectés par des Anisakidae. Sur la totalité des poissons, 28,62 % étaient infectés au niveau des viscères ; 22,96% dans les viscères et les filets et 5,49 % n’étaient infectés par des Anisakidae que dans les filets.Les cinq espèces de poisson dont la prévalence dans les filets était la plus élevée étaient : la lingue bleue (100 %), la cardine franche (70 %), le lieu noir (63 %), la baudroie (61 %) et le merlu (60 %).Les Anisakidae les plus identifiés étaient : Anisakis simplex, Anisakis pegreffii, Hysterothylacium aduncum, Pseudoterranova krabbeii.Anisakis a été retrouvé dans toutes les localisations et généralement de façon plus importante, Contracaecum a été retrouvé principalement dans le foie, Hysterothylacium dans la cavité corporelle et Pseudoterranova dans les filets et la cavité corporelle.Anisakis simplex était présent dans toutes les zones de pêches sauf dans le golfe du Lion. La zone des eaux féringiennes était la zone dans laquelle la diversité des Anisakidae était la plus importante sur une seule espèce de poisson échantillonnée (lingue bleue).L’étude statistique logistique multivariée a montré que la variable espèce et la variable taille du poisson influencent la prévalence d’Anisakis et Pseudoterranova dans les filets.Le HTS sur le PGM™ Ion Torrent s’est révélé être un outil puissant et innovant permettant l’analyse d’un grand nombre d‘échantillons d’Anisakidés à moindre coût, en peu de temps et avec un résultat équivalent à la méthode individuelle par séquençage SangerAnisakis, Pseudoterranova, Hysterothylacium and Contracaecum genera, members of the Anisakids family, are nematodes which larvae are recovered from numerous fish and cephalopods species. These larvae may induce digestive and/or allergic pathologies in human being. In France, the consumption of fishery products, mostly raw or undercooked is increasing. This PhD work is part of the research program Fish-Parasites funded by the ANR (ANR-10-ALIA-004). It aimed to assess risks related to fishery products consumption and its main goal was to study the distribution of Anisakids in fishery products.The sampling plan was based on a risk-ranking analysis using data on fishery products consumption, fishing areas and prevalence data from previous work on Anisakids. A total of 1 768 fish from 18 species were collected. All the organs were dissected for parasites isolation. Parasites were identified using two approaches : i) single analysis by Sanger sequencing for organs containing less than 11 nematodes ii) pooled analysis by high throughput sequencing (HTS) for the remaining. The development of numerous tools (database creation with reference sequences, primers design, set up of the sequencing template preparation and development of an automatic analytical pipeline) was necessary for the HTS method set up. From the sequencing results, acquisition and structuring of the prevalence data has been carried out on parasites potentially pathogenic for human being and recovered from commonly consumed fishery products.On 1 768 sampled fish, two species were not parasitized at all: plaice (Pleuronectes platessa) and aquacultured Atlantic salmon (Salmo salar). 43.30 % of the fish were not infected by Anisakids. Concerning infected fish, 28.62% were contaminated in the visceral organs; 22.96% in both visceral organs and fillets and, finally, 5.49% of the fish were infected by Anisakids only in fillets.The five fish species with an elevated prevalence in their fillets were by decreasing values: blue ling (100 %), megrim (70 %), saithe (63 %), monkfish (61 %) and hake (60 %). The most identified Anisakids were: Anisakis simplex, Anisakis pegreffii, Hysterothylacium aduncum, Pseudoterranova krabbeii.Anisakis has been recovered in all the localisations and generally in higher quantities, Contracaecum has mainly been recovered from the liver, Hysterothylacium from the corporal cavity and Pseudoterranova from both fillets and corporal cavity. Anisakis simplex was isolated from all the fishing areas except for the Lion Gulf and it was the genus with the most important number of individuals. The zone of Feroan waters was the region with the most important diversity of Anisakids into a single sampled fish species (blue ling).The multivariate logistic statistical study showed that the fish species and size affect the prevalence of Anisakis and Pseudoterranova in fish fillets.HTS with the PGM™ Ion Torrent proved to be a powerful and innovative tool for the analysis of large numbers of Anisakids samples with low cost, in a shorter time and with a result equivalent to the individual method of Sanger sequencing
Livres sur le sujet "Analyse et identification moléculaire":
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Peace, Diane McClymont. Détection, identification et évaluation des matières étrangères dans les aliments. Ottawa, Ont : Santé et bien-être social Canada, 1990.
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Organisation de coopération et de développement économiques (Paris). Identification et quantification des profits de la corruption : Une analyse OCDE-StAR. Paris : OCDE, 2011.
3
Alain, Branchaud, dir. Identification des larves et des oeufs des suceurs, Moxostama, par analyse de l'ADN mitochondrial. Québec : Gouvernement du Québec, Ministère de l'environnement et de la faune, Direction de la faune et des habitats, 1996.
4
Sall, Hamath. Analyse du secteur financier et identification d'un projet d'appui à l'investissement industriel au Sénégal : Rapport provisoire. Dakar] : Groupe de réflexion pour la compétitivité et la croissance, 1998.
5
Ouedraogo, Jean-Baptiste. Analyse des effets de la sécheresse et des inondations au Burkina Faso : Identification des conséquences sur les populations et le développement socio-économique du pays. [Ouagadougou, Burkina Faso] : J.-B. Ouedraogo, 1986.
6
Chartier, François. Papilles et molécules : La science aromatique des aliments et des vins. Montréal : Éditions La Presse, 2009.
7
Burrion, Jean-Benoît. Analyse de la situation du système sanitaire et identification des axes d'orientation des appuis comunautaires dans le secteur santé RCA : Rapport definitif. Bruxelles : AEDES, 1999.
8
Membranology and subcellular organelles. Greenwich, Conn : JAI Press, 1992.
Chapitres de livres sur le sujet "Analyse et identification moléculaire":
1
Huglo, Michel. « Le traité de musique d’Abbon de Fleury : identification et analyse ». Dans Abbon, un abbé de l’an Mil, 225–39. Turnhout : Brepols Publishers, 2008. http://dx.doi.org/10.1484/m.bhcma-eb.3.191.
2
Somma, Maria. « Towards Regenerative Wasted Landscapes : Index of Attractiveness to Evaluate the Wasted Landscapes of Road Infrastructure ». Dans Regenerative Territories, 297–310. Cham : Springer International Publishing, 2022. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-78536-9_19.
Résumé :
AbstractIn recent years, the modernisation process has led to a radical transformation of the territory, producing waste in various forms (José Zapata Campos and Michael Hall in Organising waste in the city, Bristol University Press, 2013). Waste, not only in the sense of domestic or industrial waste but also in a broader concept linked to the territory and landscape’s spatial context. The concept relates to the degraded and subsequently abandoned area. Places understood as waste, areas expelled from the city and extraneous as they have no use and are now at the end of their life cycle.These areas, recognised as wastescapes (Amenta and Attademo in CRIOS 12:79–88, 2016) or a waste of land (Berger in Drosscape: Wasting land in urban America, Princeton Architectural Press, 2007), draw the and landscape’s mosaic increasingly fragmented. Also, current mobility requirements lead to a discussion on the design of road infrastructure. While in some cases the tendency is to upgrade existing ones, in others the choice is to design and build new routes. These new routes are causing many problems for the landscape, which is becoming even more devastated. A territory made up of linear elements, and ecosystem networks that physically connect urban space to environmental space create multiple landscapes within which transport networks act as a glue between the different urban poles and as a generator of abandoned areas (Russo in Techne 15:39–44, 2018).With this in mind, the study aims to analyse and assess, through spatial indicators, the potential that abandoned sites close to major road infrastructures can offer to society not only in economic but also in environmental terms.Starting from the Focus Area’s municipalities identified in the Horizon 2020 REPAiR project (Geldermans et al., in REPAiR project: REsource Management in Peri-urban AReas: Going beyond urban metabolism, 2017) for the Neapolitan context, only four of the eleven municipalities identified by the project are considered to make the analyses exhaustive and replicable in other contexts.The methodology defined the relationships between the built environment and abandoned infrastructure spaces, which cross and fragment the city and are devoid of functionality.The study had structured in three main phases: Identification of the abandoned interstitial areas of the road and neighbouring infrastructures in the municipalities of Afragola, Cardito, Casalnuovo di Napoli and Casoria (municipal territories of the metropolitan city of Naples); Analysis of the indexes of proximity to the urbanised areas and connectivity between the abandoned interstitial areas and the urbanised fabric; Evaluate these indices for the suburban areas to identify the attractiveness for future urban regeneration processes. In this sense, the attractiveness potential of abandoned interstitial spaces of road infrastructures had assessed.If included in a decision support system, these analyses and evaluations would support the definition of urban regeneration actions. In this sense, it evaluated the potential for the attractiveness of abandoned interstitial areas of road infrastructure. In this context, particular attention is paid to the environment in which we live and its protection and preservation.
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« 9. Les oligosaccharides : Configuration et analyse ». Dans Chimie moléculaire et supramoléculaire des sucres, 141–56. EDP Sciences, 1995. http://dx.doi.org/10.1051/978-2-7598-0267-8.c010.
4
Finita Shey, Jirndi. « Chapitre 3 : External factors impeding effective implementation of teaching/learning contents prescribed for national languages at the observation sub-cycle ». Dans Méthodes et pratiques d’enseignement des langues africaines : Identification, analyses et perspective, 75–93. Observatoire européen du plurilinguisme, 2019. http://dx.doi.org/10.3917/oep.ndibn.2019.01.0075.
Résumé :
Cette étude a pour objectif d’examiner les facteurs externes qui contribuent à rendre inefficace l’implémentation des contenus d’enseignement / apprentissage prescrits pour les classes du sous-cycle d’observation. Pour ce faire, nous avons utilisé la technique d’échantillonnage aléatoire simple. Cinquante enseignants de langues nationales ont été interrogés à l’aide d’un questionnaire. Les données obtenues ont été analysées en utilisant les procédures d’analyse quantitative et qualitative. Cette analyse a permis d’identifier divers facteurs, parmi lesquels : les lacunes dans la connaissance du contenu pédagogique des enseignants, le manque de manuels adéquats, l’insuffisance des programmes de recyclage et de formation continue.
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Cleland, Joshua. « Recherche, identification et analyse des articles consacrés à l'utilité diagnostique des tests et mesures cliniques ». Dans Examen clinique de l'appareil locomoteur, 25–37. Elsevier, 2007. http://dx.doi.org/10.1016/b978-2-294-06818-8.50002-4.
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Bichet, Vincent, Arthur Barbier, Valentin Chevassu, Daniel Daval, Émilie Gauthier, Murielle Montandon, Hervé Richard et Matthieu Thivet. « Traverser les montagnes du Jura : identification de voies antiques de franchissement de la haute chaîne jurassienne par analyse LiDAR ». Dans Des routes et des hommes : la construction des échanges par les itinéraires et les transports. Éditions du Comité des travaux historiques et scientifiques, 2019. http://dx.doi.org/10.4000/books.cths.4356.
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Musso, A., et P. Provenzano. « Identification of a sliding block model to analyse the stability of motion of detrital reservoir banks ». Dans Landslides : Evaluation and Stabilization/Glissement de Terrain : Evaluation et Stabilisation, Set of 2 Volumes, 1411–17. CRC Press, 2004. http://dx.doi.org/10.1201/b16816-201.
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Mortera, Julia. « Analysis of DNA mixtures using Bayesian networks ». Dans Highly Structured Stochastic Systems, 39–44. Oxford University PressOxford, 2003. http://dx.doi.org/10.1093/oso/9780198510550.003.0004.
Résumé :
Abstract Here we present an extension, rather than a discussion, of the article by S. Lauritzen, where we describe another modern application of Bayesian networks, concerning forensic identification using DNA profiles. In Dawid et al. (2002), Bayesian networks (Cowell et al. 1999) were used to analyse complex cases of forensic inference, involving missing data on one or more of the relevant individuals in paternity testing, genetic mutation, and identification on a large pedigree.
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Ecalle, Jean, Annie Magnan et Catherine Biot-Chevrier. « Analyse de l’évolution des connaissances alphabétiques précoces et de leur poids en identification de mots écrits : une étude longitudinale de la GS au CP ». Dans L’apprentissage de la langue écrite, 23–32. Presses universitaires de Rennes, 2009. http://dx.doi.org/10.4000/books.pur.60422.
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Wilson, Emma. « ‘Mon histoire de Loi V. Stein’ : Duras, Reading, and Amnesia ». Dans Sexuality and the Reading Encounter, 163–91. Oxford University PressOxford, 1996. http://dx.doi.org/10.1093/oso/9780198158851.003.0006.
Résumé :
Abstract In her essay ‘La Maladie de la douleur: Duras’, Julia Kristeva writes: ‘il ne faut pas donner les livres de Duras aux lecteurs et lectrices fragiles’.1 How, we might wonder, may the fragile reader become a victim of Duras’s texts? Is it possible, indeed, that Duras’s texts work to undermine the reader’s certainty and sanity, forming, rather than reflecting, the trauma of noncathartic identification Kristeva has sought to analyse? And might this be understood in positive rather than negative terms? Kristeva’s argument works to suggest that Duras’s texts confront her readers with madness and horror, in unspeakable intimacy.
Actes de conférences sur le sujet "Analyse et identification moléculaire":
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PERHERIN, Céline, Celine TRMAL, Frederic PONS et Celine BOURA. « Identification et analyse des systèmes de défense contre les submersions marines ». Dans Journées Nationales Génie Côtier - Génie Civil. Editions Paralia, 2016. http://dx.doi.org/10.5150/jngcgc.2016.068.
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Hicks, Tim, Tamara Baldwin, Richard Cummings et Trevor Sumerling. « An Assessment of the Radiological Impact of Human Intrusion at the UK Low Level Waste Repository (LLWR) ». Dans ASME 2011 14th International Conference on Environmental Remediation and Radioactive Waste Management. ASMEDC, 2011. http://dx.doi.org/10.1115/icem2011-59356.
Résumé :
The UK Low Level Waste Repository Ltd submitted an Environmental Safety Case for the disposal of low-level waste (LLW) to the Environment Agency on the 1st of May 2011. The Environmental Safety Case (ESC) presents a complete case for the environmental safety of the Low Level Waste Repository (LLWR) both during operations and in the long term (Cummings et al, in these proceedings). This includes an assessment of the long-term radiological safety of the facility, including an assessment of the potential consequences of human intrusion at the site. The human intrusion assessment is based on a cautiously realistic approach in defining intrusion cases and parameter values. A range of possible human intrusion events was considered based on present-day technologies and credible future uses of the site. This process resulted in the identification of geotechnical investigations, a housing development and a smallholding as requiring quantitative assessment. A particular feature of the site is that, because of its proximity to the coast and in view of expected global sea-level rise, it is vulnerable to coastal erosion. During such erosion, wastes and engineered barrier materials will be exposed, and could become targets for investigation or recovery. Therefore, human intrusion events have been included that are associated with such activities. A radiological assessment model has been developed to analyse the impacts of potential human intrusion at the site. A key feature of the model is the representation of the spatial layout of the disposal site, including the engineered cap design and the large-scale spatial heterogeneity of radionuclide concentrations within the repository. The model has been used to calculate the radiation dose to intruders and to others following intrusion at different times and at different locations across the site, for the each of the selected intrusion events, considering all relevant exposure modes. Potential doses due to radon and its daughters in buildings constructed on excavated spoil from the repository are a particular concern. Options for managing the emplacement of the radium-bearing waste packages with regard to human intrusion have been assessed. These calculations show that a managed waste emplacement strategy can ensure that calculated doses are consistent with regulatory guidance levels.
Rapports d'organisations sur le sujet "Analyse et identification moléculaire":
1
Gestion des terres et des ressources par les communautés autochtones : Évaluation des besoins en données géospatiales, identification et analyse des données, volume 2, Identification et analyse des données. Natural Resources Canada/ESS/Scientific and Technical Publishing Services, 2008. http://dx.doi.org/10.4095/306199.
2
Gestion des terres et des ressources par les communautés autochtones : Évaluation des besoins en données géospatiales, identification et analyse des données, résumé. Natural Resources Canada/ESS/Scientific and Technical Publishing Services, 2008. http://dx.doi.org/10.4095/306185.
3
Gestion des terres et des ressources par les communautés autochtones : Évaluation des besoins en données géospatiales, identification et analyse des données, volume 1, Besoins des Premières nations en information et en cartographie, expérience de dix processus d'aménagement du territoire au Canada. Natural Resources Canada/ESS/Scientific and Technical Publishing Services, 2008. http://dx.doi.org/10.4095/306197.