Pour voir les autres types de publications sur ce sujet consultez le lien suivant : Épidémiologie.
Thèses sur le sujet « Épidémiologie »
Créez une référence correcte selon les styles APA, MLA, Chicago, Harvard et plusieurs autres
Consultez les 50 meilleures thèses pour votre recherche sur le sujet « Épidémiologie ».
À côté de chaque source dans la liste de références il y a un bouton « Ajouter à la bibliographie ». Cliquez sur ce bouton, et nous générerons automatiquement la référence bibliographique pour la source choisie selon votre style de citation préféré : APA, MLA, Harvard, Vancouver, Chicago, etc.
Vous pouvez aussi télécharger le texte intégral de la publication scolaire au format pdf et consulter son résumé en ligne lorsque ces informations sont inclues dans les métadonnées.
Parcourez les thèses sur diverses disciplines et organisez correctement votre bibliographie.
1
Rivière, Jeanne. « L'hydatidose : parasitologie, épidémiologie, prophylaxie, traitement ». Nantes, 1988. http://www.theses.fr/1988NANT028P.
Texte intégral
2
Bui, Thi-Mai-Anh. « Séparation des préoccupations en épidémiologie ». Thesis, Paris 6, 2016. http://www.theses.fr/2016PA066457/document.
Texte intégralRésumé :
La modélisation mathématique est largement utilisée pour effectuer des recherches sur la modélisation des maladies infectieuses. Combler le fossé entre les modèles conceptuels et leurs simulations est l'un des problèmes de la modélisation. Les langages métiers sont souvent utilisés pour addresser ces problèmes en séparant deux aspects de la modélisation : la spécification (modèles conceptuels) et la simulation (modèles informatiques). Dans cette perspective, nous développons un langage métier, appelé KENDRICK, dédié à la modélisation épidémiologique, couplé avec une plate-forme de simulation. Un autre problème de la modélisation en épidémiologie est le mélange des aspects de domaine qui doivent être séparés. Afin de faciliter l'écriture et l'évolution des modèles, il est crucial de pouvoir définir une préoccupation avec aussi peu de dépendances avec d'autres que possible et de pouvoir les combiner aussi librement que possible. Nous abordons ces défis en proposant un méta-modèle mathématique commun qui peut représenter les modèles ainsi que les préoccupations. Nous définissons ensuite les opérateurs qui permettent de combiner des préoccupations ainsi que de les appliquer dans un modèle. Le langage KENDRICK simplifie donc la programmation des simulations épidémiologiques en décomposant un modèle monolithique hautement-couplé en préoccupations modulaires. Cela rend alors plus facile la construction des modèles complexes de l'épidémiologie où plusieurs préoccupations sont considérées en même tempsMathematical and computational models have become widely used and demanded tools for examining mechanisms of transmission, exploring characteristics of epidemics, predicting future courses of an outbreak and evaluating strategies to find a best control-program. One of the problems of modelling is bridging the gap between conceptual models (i.e compartmental models of epidemiology) and their computer simulation (through deterministic, stochastic or agent-based implementation). Domain Specific Languages (DSLs) are often used to address such difficulties by separating two concerns of modelling, specification (conceptual model) and implementation (computational model). In this perspective, we develop a DSL called KENDRICK targeted to the epidemiological modelling and coupled with a simulation platform that allows the study of such models. The other important issue needs to be addressed in the context of epidemiological modelling is the heterogeneities introduced by separate concerns. In order to facilitate the specification of models and their evolution, it is crucial to be able to define concerns with as few dependencies with each other as possible and to combine them as freely as possible. We address such challenges by proposing a common mathematical meta-model that supports both concerns and models and enabling their compositions by some operators. We then implement our proposal language KENDRICK based on this meta-model. The language simplifies the construction of complex epidemiological models by decomposing them into modular concerns, by which common concerns can be reused across models and can be easily changed
3
Bui, Thi-Mai-Anh. « Séparation des préoccupations en épidémiologie ». Electronic Thesis or Diss., Paris 6, 2016. http://www.theses.fr/2016PA066457.
Texte intégralRésumé :
La modélisation mathématique est largement utilisée pour effectuer des recherches sur la modélisation des maladies infectieuses. Combler le fossé entre les modèles conceptuels et leurs simulations est l'un des problèmes de la modélisation. Les langages métiers sont souvent utilisés pour addresser ces problèmes en séparant deux aspects de la modélisation : la spécification (modèles conceptuels) et la simulation (modèles informatiques). Dans cette perspective, nous développons un langage métier, appelé KENDRICK, dédié à la modélisation épidémiologique, couplé avec une plate-forme de simulation. Un autre problème de la modélisation en épidémiologie est le mélange des aspects de domaine qui doivent être séparés. Afin de faciliter l'écriture et l'évolution des modèles, il est crucial de pouvoir définir une préoccupation avec aussi peu de dépendances avec d'autres que possible et de pouvoir les combiner aussi librement que possible. Nous abordons ces défis en proposant un méta-modèle mathématique commun qui peut représenter les modèles ainsi que les préoccupations. Nous définissons ensuite les opérateurs qui permettent de combiner des préoccupations ainsi que de les appliquer dans un modèle. Le langage KENDRICK simplifie donc la programmation des simulations épidémiologiques en décomposant un modèle monolithique hautement-couplé en préoccupations modulaires. Cela rend alors plus facile la construction des modèles complexes de l'épidémiologie où plusieurs préoccupations sont considérées en même tempsMathematical and computational models have become widely used and demanded tools for examining mechanisms of transmission, exploring characteristics of epidemics, predicting future courses of an outbreak and evaluating strategies to find a best control-program. One of the problems of modelling is bridging the gap between conceptual models (i.e compartmental models of epidemiology) and their computer simulation (through deterministic, stochastic or agent-based implementation). Domain Specific Languages (DSLs) are often used to address such difficulties by separating two concerns of modelling, specification (conceptual model) and implementation (computational model). In this perspective, we develop a DSL called KENDRICK targeted to the epidemiological modelling and coupled with a simulation platform that allows the study of such models. The other important issue needs to be addressed in the context of epidemiological modelling is the heterogeneities introduced by separate concerns. In order to facilitate the specification of models and their evolution, it is crucial to be able to define concerns with as few dependencies with each other as possible and to combine them as freely as possible. We address such challenges by proposing a common mathematical meta-model that supports both concerns and models and enabling their compositions by some operators. We then implement our proposal language KENDRICK based on this meta-model. The language simplifies the construction of complex epidemiological models by decomposing them into modular concerns, by which common concerns can be reused across models and can be easily changed
4
Dubuque, Josée. « Épidémiologie des hospitalisations pour infections respiratoires ». Thesis, Université Laval, 2007. http://www.theses.ulaval.ca/2007/25005/25005.pdf.
Texte intégral
5
Fortunato, Léa. « Méthodes statistiques d'analyse spatiale en épidémiologie ». Paris 11, 2006. http://www.theses.fr/2006PA11T060.
Texte intégral
6
Chikli, Isabelle. « La listériose : épidémiologie et pouvoir pathogène ». Paris 5, 1991. http://www.theses.fr/1991PA05P210.
Texte intégral
7
Rivalan, Olivier. « Brucellose : diagnostic biologique, épidémiologie et prophylaxie ». Bordeaux 2, 1992. http://www.theses.fr/1992BOR2P027.
Texte intégral
8
Brault, Nicolas. « Le concept de biais en épidémiologie ». Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2017. http://www.theses.fr/2017USPCC229/document.
Texte intégralRésumé :
Cette thèse, qui s'inscrit dans la tradition méthodologique de l'épistémologie historique, porte sur l'histoire et la formation du concept de biais dans l'épidémiologie moderne. Elle montre que la fonction opératoire du concept de biais est essentiellement critique, au sens où ce concept, que les épidémiologistes opposent au cours de l'histoire aux concepts d'objectivité, de preuve et de causalité, joue un rôle décisif dans la constitution de l'épidémiologie comme science, mais aussi dans l'avènement d'une médecine scientifique. Un éclairage historique et critique est apporté à la définition actuelle du biais, conçu comme une erreur ou un écart systématique par rapport à la vérité, ainsi qu'aux différentes taxinomies des biais qui jalonnent l'histoire de ce concept, dont l'origine se situe chez les fondateurs de la statistique mathématique. Le biais apparait ainsi comme une menace aussi bien à la validité du plan d'expérience d'une étude épidémiologique qu'à la validité de l'inférence statistique et du raisonnement médical. En d'autres termes, ce sont les conséquences que la révolution probabiliste a eues sur l'épidémiologie et sur la médecine qui sont ici étudiées, et qui ont conduit les épidémiologistes et les médecins à une forme de scepticisme et même de criticisme envers leurs propres inférences, ce qui donnera naissance au mouvement de la médecine fondée sur des preuvesThis PhD thesis, belonging to the tradition of historical epistemology, deals with the history and the formation of the concept of bias in epidemiology. It shows that the operational function of the concept of bias is essentially critical, in the sense that this concept, used by epidemiologists throughout history as an antonym to both objectivity, causality and evidence, is central to both the construction of epidemiology as a scientific discipline and the advent of scientific medicine. An historical and critical account is given of the actual definition of bias, conceived as a systematic error or deviation from the truth, and to the various taxonomies of bias which marked the history of this concept, whose origin goes back to the founders of mathematical statistics. Bias thus appears as a threat to the validity of the design of an epidemiological study, and to the validity of statistical inference and medical reasoning. In other words, what is studied here is the consequences of the probabilistic revolution on both epidemiology and medicine, which led epidemiologists and physicians to a kind of scepticism or even criticism about their own inferences, which would ultimately give birth to the evidence-based medicine's movement
9
Sadoun, Catherine. « Ostéoporose : épidémiologie, facteurs de risque, traitements ». Paris 5, 1995. http://www.theses.fr/1995PA05P116.
Texte intégral
10
Le, Loc'h Guillaume. « Épidémiologie moléculaire des avipoxvirus chez l’Outarde houbara ». Phd thesis, Toulouse, INPT, 2015. http://oatao.univ-toulouse.fr/14167/1/LeLoch.pdf.
Texte intégralRésumé :
L’Outarde houbara (Chlamydotis undulata et Chlamydotis macqueenii), dont les populations sont en déclin, fait l’objet d’élevages conservatoires en Afrique du Nord, Asie centrale et Moyen Orient. Des épisodes de variole aviaire y sont régulièrement rapportés malgré une vaccination systématique. En nous appuyant sur une approche épidémiologique et moléculaire, nous avons montré que cette maladie, fréquemment observée dans ces élevages, présente des fluctuations saisonnières et est causée par une grande diversité d’avipoxvirus. L’évaluation de ses impacts sur les performances de reproduction des oiseaux a révélé qu’ils sont minimes. Cependant, l’étude de la phylogénie et de l’évolution de ces virus, en montrant des introductions répétées de virus dans les élevages, a prouvé que les avipoxvirus sont un risque pour les projets de conservation. Enfin, un modèle d’infection expérimentale, développé chez l’Outarde houbara, permet d’envisager de futurs travaux de recherche sur les avipoxvirus.
11
Chabas, Hélène. « Immunité bactérienne et épidémiologie évolutive des phages ». Thesis, Montpellier, 2018. http://www.theses.fr/2018MONTG042.
Texte intégralRésumé :
Les êtres vivants sont confrontés à des parasites qui diminuent leur fitness et se répandent dans la population. En réponse, les hôtes ont développé de nombreuses défenses immunitaires qui sont souvent mises en défaut par l'évolution des parasites. Ces défenses sont de plus souvent extrêmement diversifiées génétiquement. Quel est donc l'apport de la diversité génétique des défenses contre l'évolution des parasites ? Répondre à cette question expérimentalement nécessite un système biologique pour lequel on peut étudier la diversité génétique de l'hôte et l'évolution et la propagation du parasite. Les systèmes bactéries/phages sont de bons candidats pour une telle étude : leur manipulation au laboratoire est aisée, leurs cycles de vie sont rapides et ils ont de forts taux de mutation. La découverte récente de l'immunité CRISPR--Cas a ouvert de nombreuses possibilités : cette dernière a la propriété unique de générer dans le même fond génétique que l'hôte sensible de nombreux allèles de résistance. De plus, son mécanisme de fonctionnement reposant sur une interférence à ARN, la cible d'une résistance est très précisément connue ainsi que les possibilités de la contourner. Ce système permet donc l'étude expérimentale de l'impact de la diversité génétique sur la propagation et l'évolution des parasites, et sur la co-évolution antagoniste. Dans cette thèse, nous cherchons à 1) déterminer l'impact de la composition de la population d'hôtes sur la probabilité qu'une épidémie créée par un virus mutant ait lieu (émergence évolutive), 2) expliciter les causes de l'hétérogénéité de durabilité des résistances et 3) étudier la dynamique co-évolutive entre population génétiquement diversifiée d'hôtes et de parasites. Nous montrons que la composition de la population d'hôtes module fortement la probabilité d'émergence évolutive : une faible diversité génétique associé à un taux intermédiaire d'hôtes sensibles maximisant la probabilité d'émergence évolutive. Dans un second temps, nous montrons que l'immunité CRISPR génère des résistances dont la durabilité est hétérogène et cette hétérogénéité ne peut pas être expliquée par une hétérogénéité des fitness des mutants contournant CRISPR. Enfin, nous montrons que la diversité des résistances est maintenue à court terme par l'hétérogénéité des populations de parasites et que la dynamique co-évolutive est accélérée en présence d'une population génétiquement diverse. Enfin, nous proposons des pistes de recherche qu'il nous parait intéressant d'étudier dans le futurLiving organisms face parasites which decrease their fitness and spread into their population. In response, hosts have evolved countless immune defenses that are often circumvented by parasite evolution. These defenses are usually extremely diverse. What is the impact of such genetic diversity on the protection against the evolution of parasites? Answering this question experimentally requires an experimental system in which host genetic diversity and parasite evolution and spreading can be monitored. Phages and bacteria systems are ideal candidates for such studies as their handling is easy in the lab, their life cycle is short and their mutation rates is high. The recent discovery of CRISPR--Cas immunity has opened many possibilities. Indeed, this immunity has the unique property to generate in the same genetic background as the sensitive host, numerous resistant alleles. In addition, it relies on an interference--RNA-like pathway, which results in the precise understanding of phage bypassing and in the ability to predict the targeted sequence. This system hence allows the experimental study of the impact of host genetic diversity on the epidemiology and the evolution of parasites and on antagonist coevolution. In this PhD, we 1) study how the host population composition impacts the probability of an epidemic created by an escape mutant (evolutionary emergence), 2) try to understand the causes of the heterogeneity in durability of resistances and 3) monitor the coevolution dynamic between genetically diverse populations. We show that the composition of the host population impacts the probability of evolutionary emergence: a low resistances diversity with an intermediate proportion of sensitive hosts maximises the probability of evolutionary emergence. Second, we show that CRISPR--Cas resistances are heterogeneous in their durability and this is not explained by the heterogeneity of escape mutants fitness. Third, we show that resistances diversity is conserved in a short term by parasites genetic diversity and that the coevolutionary dynamic is fastened by parasite intra-specific genetic diversity. Finally, we discuss research questions that we find interesting to develop in the near future
12
Mohsen, Mroueh Fatima. « Diabète et cancer colorectal : épidémiologie et physiopathologie ». Thesis, Strasbourg, 2017. http://www.theses.fr/2017STRAJ117.
Texte intégralRésumé :
Le diabète est une dérégulation systémique chronique caractérisée par des perturbations métaboliques permanentes à l’origine de nombreuses complications, y compris le cancer. Le diabète augmente le risque du cancer colorectal (CRC) de 1,2 à 1,5 fois. Cependant, les voies moléculaires et cellulaires en jeu ne sont pas assez élucidées. Nos résultats témoignent d’une dérégulation de la voie AMPK/mTORC1 dans le diabète et le CRC avec une surexpression de la NADPH oxydase Nox4, augmentant ainsi la production de ROS. Ceci provoque un stress oxydatif qui s’élève en cas de diabète et contribue à la progression du CRC. De plus, nos résultats montrent que ce stress induit une altération de la voie de signalisation AMPK/mTORC1, aboutissant à une agressivité accrue du comportement des cellules cancéreuses du côlon et de la formation de polypes. Notre projet permet, d’une part, d’identifier de nouveaux mécanismes moléculaires impliqués dans la progression du CRC induite par le diabète et d’autre part, de développer des stratégies thérapeutiques efficaces pour inverser la progression du CRC chez les patients diabétiquesDiabetes is a chronic systemic malfunction characterized by persistent metabolic disturbances that culminate in a high rate of complications to which cancer was recently annexed. In fact, diabetes inflates colorectal cancer (CRC) risk by 1.2-1.5 folds. However, the cellular and molecular pathways involved are not well understood. Our results show that AMPK/mTORC1 pathway is deregulated in both diabetes and CRC. This was paralleled by an elevation in the expression of the NADPH oxidase Nox4 leading to an increase in ROS production. Furthermore, our results show that oxidative stress, secondary to alteration in the level and activity of Nox4 is augmented in diabetes and contributes to the progression of CRC. The resulting oxidative stress further led to an alteration in the signaling of the AMPK/mTORC1 pathways culminating in an exacerbated aggressiveness in cancer cell behavior and colon polyp formation. Our project allows the identification of novel molecular mechanisms involved in diabetes-induced CRC progression and development of effective therapeutic strategies to reverse the progression of CRC in diabetic patients
13
Ossart, Caroline. « Le gonocoque : épidémiologie et modalités de traitement ». Paris 5, 1999. http://www.theses.fr/1999PA05P151.
Texte intégral
14
Ghio, Brigitte. « Mort subite du nourrisson : épidémiologie et prévention ». Montpellier 1, 1994. http://www.theses.fr/1994MON11113.
Texte intégral
15
Vialard, Jacquemine. « Paratuberculose des ruminants : épidémiologie, diagnostic et prophylaxie ». Lyon 1, 1994. http://www.theses.fr/1994LYO10283.
Texte intégralRésumé :
La paratuberculose est une affection due au developpement de m. Paratuberculosis dans l'intestin des ruminants. Zoonose potentielle, cette maladie entraine des pertes economiques graves. Les travaux exposes dans cette these portent sur l'epidemiologie, le diagnostic et la prophylaxie de cette affection. Les enquetes effectuees montrent que la maladie peut etre consideree comme preoccupante dans 50% des departements francais et que sa prevalence dans le departement du rhone est de 7%. Sur le plan du diagnostic, les recherches sur la faisabilite des coprocultures de groupe et sur la fiabilite d'un test pcr/sonde nucleique n'ont pas donne les resultats esperes. La reproduction experimentale de la maladie chez le mouton ainsi que l'etude des aspects anatomopathologiques et des differentes techniques de diagnostic chez les caprins ont permis toutefois de preciser les modalites de depistage de l'infection paratuberculeuse chez les petits ruminants. Dans le domaine de la prophylaxie, les travaux realises ont porte sur la sterilisation du colostrum et sur la possibilite, grace a un test e. L. I. S. A. , d'attribuer aux cheptels bovins une qualification sanitaire vis-a-vis de la paratuberculose
16
Laaidi, Karine. « Éco-épidémiologie des pollinoses en Haute-Bourgogne ». Dijon, 1999. http://www.theses.fr/1999DIJOMU14.
Texte intégralRésumé :
Un intérêt croissant est porté actuellement à la pollution de l’atmosphère et à ses effets sur la santé humaine, mais les études réalisées se focalisent généralement sur la pollution chimique, et l’on néglige bien souvent la pollution biologique. Cette dernière est pourtant responsable d’allergies parfois sévères, associant des symptômes bénins tels que la rhinite, la conjonctivite ou la toux à un autre plus grave et plus invalidant, il s’agit de l’asthme. Ces manifestations saisonnières méritent d’être étudiées afin de comprendre les différents aspects de l’allergie pollinique et d’essayer de mettre en œuvre des méthodes de prévision et de prévention, ce qui peut permettre à la fois une amélioration de la santé des allergiques et, par suite, une réduction des coûts liés à cette affection. Cette étude, qui a pour cadre géographique la Haute-Bourgogne, s’articule en trois volets. Le premier volet constitue une mise en place du cadre physiopathologique et géographique de la recherche, et une description des données et des méthodes utilisées. Le deuxième volet représente une étude d’épidémiologie analytique, et nous a permis de décrire la pollinose sous plusieurs aspects complémentaires : les allergènes, les symptômes ressentis par les malades, les ventes de médicaments antiallergiques et l’évolution de l’éosinophilie. Enfin le troisième et dernier volet rassemble trois éléments majeurs de l’étiologie des pollinoses : le pollen lui-même, par sa nature et son évolution saisonnière ; les conditions météorologiques, qui agissent aussi bien sur la dissémination des pollens que directement sur les manifestations allergiques ; et la pollution chimique dont le polluant le plus souvent incriminé s’est avéré être l’ozoneAn inceasing interest is now given to atmospheric pollution of the atmosphere and to its effects on human health, but the studies usually concern chemical pollution, and the biologic pollution is often neglected. Nevertheless, the latter is responsible for allergies sometimes severe, associating benign symptoms such as rhinitis, conjunctivitis or cough to another one more serious and more disabling, which is asthma. These seasonal manifestations are worth being studied in order to understand the different aspects of pollinic allergy and to try to elaborate forecast and prevention methods, which could improve the health of allergic people and, consequently, reduce the costs due to this disease. This study, taking place in High-Burgundy (France), comprises three parts. The first one describes the physiopathologic and geographic setting of the study, the data and the methods used. The second part represents a study of analytic epidemiology, and allowed us to describe several ans complementary aspects of pollinosis : allergens, syntoms felt by sick persons, the sales of anti allergic drugs ans eosinophily evolution. Then the third and last part emphasizes three major elements which can explain the etiology of pollinosis : the pollen itself, by its nature and its seasonal evolution ; meteorological conditions, which influences pollen dispersal as well as, more directly, allergic manifestations ; and chemical pollution, whose more offending pollutant was proved to be ozon
17
Deslandes, Emmanuelle. « Modelisation des données longitudinales complexes en épidémiologie ». Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066161.
Texte intégralRésumé :
L'étude de l'évolution et de la valeur pronostique des marqueurs longitudinaux est très fréquente en médecine. Ce travail s'est centré sur la modélisation de données longitudinales en présence de données manquantes ou censure informative à droite. Notre objectif premier a été d'évaluer si un marqueur mesuré de façon répétée au cours du temps pouvait être utilisé comme critère de substitution lors de l'évaluation de l'efficacité d'un nouveau traitement dans le cadre d'un essai thérapeutique. Le premier développement a été de comparer deux stratégies de modélisation pour ces données longitudinales et de survie : un modèle multi-état décrivant les trajectoires des malades entre différents compartiments définis par la valeur du marqueur et la censure informative, et un modèle conjoint du processus longitudinal et du délai de censure informative. Puis, nous avons modélisé l'évolution d'un marqueur en présence de censure informative. Nous proposons une modélisation conjointe des données longitudinales et des données de survie multivariée, lorsque le sous-modèle de survie est un modèle paramétrique pour les fonctions de risque de sous-répartition des événements en compétition. Nous nous sommes alors placés dans un contexte d'inférence bayesienne. Chaque développement a fait l'objet d'une application en épidémiologie clinique, que ce soit dans l'étude de la lymphocytose comme critère de substitution de l'efficacité d'un traitement dans la leucémie, ou dans l'évaluation du bénéfice du remplissage vasculaire chez des malades de réanimation sur un score de gravité mesuré pendant leur séjour
18
Fadloun, Samiha. « Visualisations pour la veille en épidémiologie animale ». Thesis, Montpellier, 2018. http://www.theses.fr/2018MONTS025/document.
Texte intégralRésumé :
De nombreux documents concernant l'émergence, la propagation ou le suivi de maladies humaines et animales sont quotidiennement publiés sur le Web. Afin de prévenir l'expansion des maladies, les épidémiologistes doivent constamment rechercher ces documents et les étudier afin de détecter les foyers de propagation le plus tôt possible. Dans cette thèse, nous nous intéressons aux deux activités liées à ce travail de veille afin de proposer des outils visuels permettant de faciliter/accélérer l'accès aux informations pertinentes. Nous nous focalisons sur les maladies animales, qui ont été moins étudiées et qui pourtant peuvent avoir de lourdes conséquences sur les activités humaines (maladies transmises d'animaux à humains, épidémies dans les élevages, ...).La première activité du veilleur consiste à collecter les documents issus du Web. Pour cela, nous proposons EpidVis, un outil visuel permettant aux épidémiologistes de regrouper et structurer les mots-clés nécessaires à leurs recherches, construire visuellement des requêtes complexes, les lancer sur différents moteurs de recherche et visualiser les résultats retournés. La seconde activité du veilleur consiste à explorer un grand nombre de documents concernant les maladies. Ces documents contiennent non seulement des informations telles que les noms des maladies, les symptômes associés, les espèces infectées, mais aussi des informations de type spatio-temporelles. Nous proposons EpidNews, un outil de visualisation analytique permettant d'explorer ces données en vue d'en extraire des informations. Les deux outils ont été réalisés dans le cadre d'une étroite collaboration avec des experts en épidémiologie. Ces derniers ont réalisé des études de cas pour montrer que les fonctionnalités des propositions étaient complètement adaptées et permettaient de pouvoir facilement extraire de la connaissanceMany documents concerning emergence, spread or follow-up of human and animal diseases are published daily on the Web. In order to prevent the spread of disease, epidemiologists must frequently search for these documents and analyze them to detect outbreaks as early as possible. In this thesis, we are interested in the two activities related to this monitoring work in order to produce visual tools facilitating the access to relevant information. We focus on animal diseases, which have been less studied but can have serious consequences for human activities (diseases transmitted from animals to humans, epidemics in livestock ...).The first activity is to collect documents from the Web. For this, we propose EpidVis, a visual tool that allows epidemiologists to group and organize the keywords used for their research, visually build complex queries, launch them on different search engines and view the results returned. The second activity is to explore a large number of documents concerning diseases. These documents contain not only information such as disease names, associated symptoms, infected species, but also spatio-temporal information. We propose EpidNews, a visual analytics tool to explore this data for information extraction. Both tools were developed in close collaboration with experts in epidemiology. The latter carried out case studies to show that the functionalities of the proposals were completely adapted and made it possible to easily extract knowledge
19
Biard, Lucie. « Test des effets centre en épidémiologie clinique ». Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2016. http://www.theses.fr/2016USPCC302.
Texte intégralRésumé :
La modélisation des effets centre dans le cadre des données de survie repose souvent sur l'utilisation de modèles de Cox à effets mixtes. Tester un effet centre revient alors à tester à zéro la variance de l'effet aléatoire correspondant. La distribution sous l'hypothèse nulle des statistiques des tests paramétriques usuels n'est alors pas toujours connue. Les procédures de permutation ont été proposées comme alternative, pour les modèles linéaires généralisés mixtes.L'objectif est de développer, pour l'analyse des effets centre dans un modèle de survie de Cox à effets mixtes, une procédure de test de permutation pour les effets aléatoires.La première partie du travail présente la procédure de permutation développée pour le test d'un unique effet centre sur le risque de base, avec une application à la recherche d'un effet centre dans un essai clinique chez des patients atteints de leucémie myéloïde aiguë. La seconde partie porte sur l'extension de la procédure au test d'effets aléatoires multiples afin d’étudier à la fois des effets centre sur le risque de base et sur l'effet de variables, avec des illustrations sur deux cohortes de patients atteints de leucémie aiguë. Dans une troisième partie, les méthodes proposées sont appliquées à une cohorte multicentrique de patients en réanimation atteints d'hémopathies malignes, pour étudier les facteurs déterminant les effets centre sur la mortalité hospitalière. Les procédures de permutation proposées constituent une approche robuste et d'implémentation relativement aisée pour le test, en routine, d'effets aléatoires, donc un outil adapté pour l'analyse d'effets centre en épidémiologie clinique, afin de comprendre leur origineCentre effects modelling within the framework of survival data often relies on the estimation of Cox mixed effects models. Testing for a centre effect consists in testing to zero the variance component of the corresponding random effect. In this framework, the identification of the null distribution of usual tests statistics is not always straightforward. Permutation procedures have been proposed as an alternative, for generalised linear mixed models.The objective was to develop a permutation test procedure for random effects in a Cox mixed effects model, for the test of centre effects.We first developed and evaluated permutation procedures for the test of a single centre effect on the baseline risk. The test was used to investigate a centre effect in a clinical trial of induction chemotherapy for patients with acute myeloid leukaemia.The second part consisted in extending the procedure for the test of multiple random effects, in survival models. The aim was to be able to examine both center effects on the baseline risk and centre effects on the effect of covariates. The procedure was illustrated on two cohorts of acute leukaemia patients. In a third part, the permutation approach was applied to a cohort of critically ill patients with hematologic malignancies, to investigate centre effects on the hospital mortality.The proposed permutation procedures appear to be robust approaches, easily implemented for the test of random centre effect in routine practice. They are an appropriate tool for the analysis of centre effects in clinical epidemiology, with the purpose of understanding their sources
20
Nivoix, Yasmine. « Infections fongiques invasives : épidémiologie et optimisation thérapeutique ». Strasbourg, 2009. http://www.theses.fr/2009STRA2006.
Texte intégral
21
Fleury, Catherine. « Étude épidémiologique clinique et anatomo-pathologique du mélanome du cheval camarguais ». Lyon 1, 2001. http://www.theses.fr/2001LYO1T270.
Texte intégral
22
Mintsa, mi ondo Julie. « Les aspects spatiaux dans la modélisation en épidémiologie ». Phd thesis, Université de Grenoble, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00870752.
Texte intégralRésumé :
Dans cette thèse on s'intéresse a l'aspect spatial dans la modélisation en épidémiologie, ainsi que des conditions menant a la stabilité des systèmes que nous présentons, en épidémiologie, a partir des modèles classiques de Ross et Mckendrick. Dans un premier temps, nous examinons les effets de l'indice de la différence normalisée de végétation (NDVI) dans un modèle de contamination du paludisme a Bankoumana, une région du Mali. A partir du système obtenu, nous trouvons le taux de reproduction de base. Deux points d'équilibre sont déduits dont, un point d'équilibre sans maladie et un point d'équilibre endémique. Ce dernier point d'équilibre ainsi que le taux de reproduction de base sont fonction de l'indice de végétation normalisée. Par la suite, nous construisons un modèle ayant des équations a retard, dans lequel est également incorporée le NDVI. Le taux de reproduction de base ainsi que les deux points d'équilibre qui découlent de notre système sont fonction des retards introduits. Nous montrons que la stabilité de nos points d'équilibre est, non seulement fonction du taux de reproduction de base, mais elle est aussi étroitement liée aux retards introduits. Dans une autre optique, nous fractionnons la région d'étude en zones dans lesquelles nous émettons l'hypothèse que le taux de contagion induite par les individus d'une zone sur les individus de la même zone, ainsi que celui des individus d'une zone sur ceux d'une autre zone, peut être différents. Nous obtenons un système qui nous permet de déterminer les points d'équilibre ainsi que les conditions qui nous permettent d'obtenir la stabilité au sens de Lyapunov. Puis, nous perturbons le système précédent au niveau de son unique point d'équilibre endémique, en introduisant un bruit additif. Par suite, les conditions permettant la stabilité au sens de Lyapunov, sur le nouveau système obtenu, sont également déduites . Dans un cadre similaire, nous élaborons un modèle multi-groupes, dans lequel nous introduisons des coordonnées spatiales. Les groupes sont formés selon une proximité dépendant du rayon d'un cercle, de manière aléatoire. Ici, le taux de contagion est supposé uniforme dans les groupes. Après avoir déterminé les points d'équilibre ainsi que le taux de reproduction de base,nous trouvons les conditions qui favorisent la stabilité au sens de Lyapunov dans le cadre général. A l'ordre 1, c'est-a-dire, lorsqu'on suppose que nous n'avons qu'un groupe, les conditions de stabilité sont obtenus par le critère de Routh-Hurwitz.
23
Lévesque, Simon. « Épidémiologie moléculaire des entérites à Campylobacter en Estrie ». Thèse, Université de Sherbrooke, 2013. http://hdl.handle.net/11143/6837.
Texte intégralRésumé :
Résumé : Le Campylobacter est la première cause de gastro-entérites bactériennes dans les pays
industrialisés. La grande majorité des cas sont des infections sporadiques dont la source
est rarement identifiée. Le Campylobacter fait partie de la flore intestinale normale
d’une large diversité d’animaux et peut également se retrouver dans l’eau. Le but de
mon projet de recherche était d’étudier l’épidémiologie clinique et moléculaire des
infections à Campylobacter en Estrie afin de déterminer les principales sources
d’infections sporadiques et de comparer les génotypes des isolats de Campylobacter
selon les différentes niches écologiques. Nous avons déterminé le profil de sensibilité
aux antibiotiques d’isolats de différentes sources. Nous avons observé un haut taux de
résistance à l’érythromycine et à la tétracycline et un faible taux de résistance à la
ciprofloxacine chez les isolats de poulet, pouvant refléter l’utilisation de ces
antibiotiques dans cet élevage. Le fait que le taux de résistance à l’érythromycine parmi
les isolats humains soit significativement moins élevé que chez les isolats de poulet
suggérait l’importance d’autres sources de Campylobacter chez l’humain. Afin de
déterminer quelle méthode de typage moléculaire serait la mieux adaptée pour notre
devis de recherche, nous avons comparé quatre méthodes (AFLP, MLST, typage du
gène fla et EGCP). Seul le MLST a pu attribuer des isolats humains à des niches
écologiques particulières comme le poulet, le lait cru et l’eau. Afin d’optimiser la
technique de MLST, nous avons développé un système complémentaire basé sur le
HRM, qui est beaucoup plus rapide et moins coûteux que le MLST. Nous avons
démontré que le HRM a le potentiel de complémenter les méthodes d’analyses basées
sur du séquençage pour l’étude des mutations ponctuelles et de faciliter une vaste
gamme d’études basées sur des méthodes génotypiques, telle la détection de mutations
ponctuelles qui confèrent de la résistance aux antibiotiques. Nous avons entrepris par la
suite une étude cas-cas et un vaste projet d’isolement et de caractérisation moléculaire
de souches de Campylobacter en Estrie, afin de véritablement cerner les mécanismes de
transmission de la bactérie et de comparer les sources d’infections sporadiques chez les
cas acquis en régions rurales vs urbaines. Nous avons confirmé que le poulet était
responsable de la majorité des cas de campylobactérioses. Cependant, nos résultats
suggèrent que la saisonnalité ainsi que le gradient urbain-rural de la campylobactériose
sont dus à l’exposition aux souches bovines, particulièrement chez le groupe d’âge des
15-34 ans via l’exposition professionnelle. Par la détermination des sources
d’infections, nous avons établi des pistes d’interventions utilisables par les autorités de
santé publique, afin de diminuer l’incidence de la campylobactériose au Québec.Abstract : Campylobacteriosis is the leading notifiable enteric disease in industrialised countries. It colonizes a wide range of animal which in turn spread the disease. The majority of campylobacteriosis cases are sporadic infections for which the source is rarely apparent. The main goal of my research project is to determine contamination sources of Campylobacter in the Eastern Townships, to identify the sources and routes of transmission and to establish the main sources of sporadic infections. We determined antimicrobial susceptibility profiles of Campylobacter isolates in order to predict which bacterial population will be resistant, caused by antimicrobial selective pressure administered to the host. High levels of resistance of chicken isolates to erythromycin and tetracycline, and low levels of resistance to ciprofloxacin reflect the use of the former antibiotics in animal husbandry. The fact that the erythromycin and tetracycline resistance levels were significantly lower among human isolates suggests that other transmission sources are important for human infection. In order to determine which molecular typing method will be the most relevant for our research design, we compared four typing methods (AFLP, MLST,/7a typing and PFGE). Only MLST has the potential to link isolates to a particular ecological niche, such as chicken, raw milk and water. In order to optimize MLST, we developed a complementary system based on HRM. We demonstrated that HRM has the potential to complement the analysis methods based on sequencing for SNP and facilitate a wide range of studies based on genotypic methods. We have subsequently undertaken a major project of isolation and molecular characterization of Campylobacter in the Eastern Townships, in order to truly understand the mechanisms of transmission of the bacteria and determine the source of sporadic cases. We confirmed that chicken was responsible for the majority of cases of campylobacteriosis. However, we have shown that the urban-rural gradient of campylobacteriosis in the Eastern Townships could be explained by exposure to bovine, especially for the 15-34 year old age group through occupational exposure. By the identification of infection sources, we proposed courses of action that could be used by public health authorities to reduce the incidence of campylobacteriosis in Quebec.
24
Mintsa, Mi Ondo Julie. « Les aspects spatiaux dans la modélisation en épidémiologie ». Thesis, Grenoble, 2012. http://www.theses.fr/2012GRENS042/document.
Texte intégralRésumé :
Dans cette thèse on s'intéresse a l'aspect spatial dans la modélisation en épidémiologie, ainsi que des conditions menant a la stabilité des systèmes que nous présentons, en épidémiologie, a partir des modèles classiques de Ross et Mckendrick. Dans un premier temps, nous examinons les effets de l'indice de la différence normalisée de végétation (NDVI) dans un modèle de contamination du paludisme a Bankoumana, une région du Mali. A partir du système obtenu, nous trouvons le taux de reproduction de base. Deux points d'équilibre sont déduits dont, un point d'équilibre sans maladie et un point d'équilibre endémique. Ce dernier point d'équilibre ainsi que le taux de reproduction de base sont fonction de l'indice de végétation normalisée. Par la suite, nous construisons un modèle ayant des équations a retard, dans lequel est également incorporée le NDVI. Le taux de reproduction de base ainsi que les deux points d'équilibre qui découlent de notre système sont fonction des retards introduits. Nous montrons que la stabilité de nos points d'équilibre est, non seulement fonction du taux de reproduction de base, mais elle est aussi étroitement liée aux retards introduits. Dans une autre optique, nous fractionnons la région d'étude en zones dans lesquelles nous émettons l'hypothèse que le taux de contagion induite par les individus d'une zone sur les individus de la même zone, ainsi que celui des individus d'une zone sur ceux d'une autre zone, peut être différents. Nous obtenons un système qui nous permet de déterminer les points d'équilibre ainsi que les conditions qui nous permettent d'obtenir la stabilité au sens de Lyapunov. Puis, nous perturbons le système précédent au niveau de son unique point d'équilibre endémique, en introduisant un bruit additif. Par suite, les conditions permettant la stabilité au sens de Lyapunov, sur le nouveau système obtenu, sont également déduites . Dans un cadre similaire, nous élaborons un modèle multi-groupes, dans lequel nous introduisons des coordonnées spatiales. Les groupes sont formés selon une proximité dépendant du rayon d'un cercle, de manière aléatoire. Ici, le taux de contagion est supposé uniforme dans les groupes. Après avoir déterminé les points d'équilibre ainsi que le taux de reproduction de base,nous trouvons les conditions qui favorisent la stabilité au sens de Lyapunov dans le cadre général. A l'ordre 1, c'est-a-dire, lorsqu'on suppose que nous n'avons qu'un groupe, les conditions de stabilité sont obtenus par le critère de Routh-HurwitzIn this thesis, our interest is on the aspect in space of the establishment of a spatial model in epidemiology and the conditions leading to the stability of the systems that we present, in epidemiology, from the classical models by Ross and Mckendrick. Firstly, we intend to examine the eects of the Normalized DiFerence Vegetation Index(NDVI) in a model of contamination of malaria in Bankoumana, a region in Mali. From the system obtained, we willnd the basic reproduction rate. Then we deduce two point of equilibrium, among which one point of equilibrium without the disease and another one with an endemic point. The latter with the basic reproduction rate vary according to the indices of normalized vegetation. Then, we will build a model having equations delay, containing the NDVI. The rate of basic reproduction and the two points of equilibrium that come from our system depend upon the delay introduced. We will show that the stability of our points of equilibrium is not only dependent upon the basic reproduction rate, but also closely related to the delays introduced. In another way, we will divide the region of study in areas where we will set hypotheses that the rate of contamination brought about by individuals in an area of study on the others, can be dierent. It will permit us to obtain a system in which we will determine the points of equilibrium and the conditions that will lead us to obtain the stability according to Lyapunov. Then, we will disturb the previous system at the level of its unique endemic point of equilibrium, with the introduction of an additional noise. The conditions leading to stability according to Lyapunov, on the new system obtained, are generally deduced here. In a similar framework, we will elaborate a multigroups model, in which we will introduce spatial coordinates. The groups are formed according to a closeness depending to a radius of a circle at random. Here, the rate of contamination is supposed to be uniform in the groups. After having determined the point of equilibrium and the rate of basic reproduction, we will nd the conditions facilitating stability in as by Lyapunov in a global framework. In the order1, it means that supposing that we have only one group, the conditions of stability are obtained according to the Routh-Hurvitz criteria
25
Houga-Lauron, Claire. « Étude des méthodes statistiques utilisées en épidémiologie dentaire ». Nantes, 1985. http://www.theses.fr/1985NANT1467.
Texte intégral
26
Bouard, Bertrand. « Épidémiologie de la dracunculose et méthodes de lutte ». Bordeaux 2, 1990. http://www.theses.fr/1990BOR25135.
Texte intégral
27
Lecuix, Isabelle. « La toxocarose humaine : épidémiologie, clinique, thérapeutique et prophylaxie ». Bordeaux 2, 2000. http://www.theses.fr/2000BOR2P086.
Texte intégral
28
L'Hostis, Monique. « Babesia divergens en France : épidémiologie descriptive et analytique ». Montpellier 1, 1994. http://www.theses.fr/1994MON13515.
Texte intégral
29
Poisson, Philippe. « Protection intra-buccale : épidémiologie-évaluation biomécanique et physiologique ». Bordeaux 2, 2005. http://www.theses.fr/2005BOR21247.
Texte intégral
30
Rotureau, Brice. « Eco-épidémiologie des leishmanioses cutanées en Guyane française ». Antilles-Guyane, 2005. http://www.theses.fr/2005AGUY0143.
Texte intégralRésumé :
Cette thèse répond globalement aux besoins de réactualiser et d'améliorer les connaissances écologiques et épidémiologiques au sujet des leishmanioses cutanées de Guyane par l'apport de techniques de biologie moléculaire spécialement adaptées, en s'inscrivant dans une approche éco-épidémiologique moléculaire intégrée. La mise au point d'une technique moléculaire de détection et d'identification des Leishmania du Nouveau Monde par PCR-RFLP, adaptée pour le diagnostic et les études épidémiologiques à grande échelle, a tout d'abord été réalisée. En parallèle, une amélioration du diagnostic de routine par culture en milieu synthétique et un développement de la surveillance des cas de leishmaniose cutanée guyanais ont également été menés. Puis, cette nouvelle méthode moléculaire a été mise en application sur des échantillons prélevés chez des patients guyanais, conduisant à une étude éco-épidémiologique du polymorphisme des Leishmania, et mettant en évidence une corrélation entre le génotype des parasites, leur origine géographique et la présentation clinique. Une actualisation du taux d'incidence des différentes espèces de Leishmania endémiques en Guyane a été réalisée par la même occasion. Des missions de captures de phlébotomes et de mammifères ont également été menées. Trois résultats significatifs ont été obtenus. Le premier est une confirmation de l'adaptation des phlébotomes du sous-genre Nyssomyia aux milieux secondarisés par anthropisation. Le second est l'absence d'implication des Chiroptères dans les cycles parasitaires des Leishmania en Guyane. Le troisième est la mise en évidence d'un risque d'importation des formes viscérales exemplifié pour la première fois en Guyane par plusieurs cas de leishmanioses viscérales canines à L. Infantum importée d'Europe. Dans un dernier temps, une intégration des données moléculaires, écologiques, épidémiologiques, cliniques, géographiques, démographiques et sociales est proposéeOverall, this thesis aims at reactualizing and improving ecological and epidemiological knowledge about cutaneous leishmaniases in French Guiana by using new and adapted molecular tools. Thus, it took up the challenge of an integrated molecular eco-epidemiological approach. A molecular technique (PCR-RFLP) for the detection and the identification of New World Leishmania species was first designed for diagnosis and large-scale epidemiological studies. Parallely, cultures in synthetic medium were carried out for the improvement of routine diagnosis. A strict monitoring of the cutaneous leishmaniasis cases of French Guiana was also developped. Then, the new molecular method was applied to samples from Guianan patients within a large-scale eco-epidemiological study of the Leishmania parasites polymorphism. The actualization of the specific incidence was done and we observed the correlation between the different parasite genotypes and some clinical and epidemiological parameters. Some sand fly and mammal capture sessions confirmed the adaptability of the Nyssomyia sand flies to anthropized ecotopes, proved the absence of implication of Chiroptera in the Guianan pathogenic complexes, and led to the first observations in French Guiana of canine visceral leishmaniases due to L. Infantum imported from Europe. Finally, an integration of molecular, ecological, epidemiological, clinical, geographical, demographic and social data was given
31
Riffard, Serge. « Détection, identification, épidémiologie des Legionella par amplification génique ». Lyon 1, 1997. http://www.theses.fr/1997LYO1T285.
Texte intégral
32
Annesi-Maesano, Isabella. « Marqueurs en épidémiologie respiratoire : applications et problèmes méthodologiques ». Paris 11, 1995. http://www.theses.fr/1995PA11T039.
Texte intégral
33
Messas, Emmanuel. « Insuffisance mitrale ischémique : épidémiologie, physiopathologie, pronostic et traitements ». Paris 5, 2006. http://www.theses.fr/2006PA05N23S.
Texte intégralRésumé :
La transplantation de cellules musculaires autologues améliore la fonction cardiaque du cœur infarci. La préparation de ces cellules reste complexe. Cette étude compare les résultats fonctionnelles obtenus après injection de bupivacaine (48 heures avant le prélèvement musculaire périphérique) et après injection d’un éminçât musculaire sans culture préalable. Après 7 jours de culture, le nombre de myoblastes disponible est plus important dans le groupe bupivacaine que dans le groupe culture seule (1 683 147 versus 85 300, P=0. 0013). On compare ensuite l’éminçât et la culture cellulaire sur 66 rats avec infarctus produit par ligature coronaire. Une semaine après l’infarctus, les rats sont réopérés et on injecte en intra. . .
34
Bafeta, Aïda. « Épidémiologie et méthodologie des méta-analyses en réseau ». Sorbonne Paris Cité, 2015. http://www.theses.fr/2015USPCC106.
Texte intégralRésumé :
La méta-analyse en réseau permet d'évaluer toutes les comparaisons deux à deux possibles entre interventions même en absence de certains essais. Depuis les années 2000, l'utilisation des méta-analyses en réseau a considérablement augmenté. La méta-analyse en réseau est une méta-analyse, elle est probablement soumise aux mêmes types de biais et doit se réaliser dans le cadre rigoureux d'une revue systématique. Cependant, aucune étude ne s'était intéressée aux éléments essentiels de la réalisation d'une revue systématique dans les méta-analyses en réseau comme la recherche de la littérature, l'évaluation du risque de biais ou la présentation des résultats. Nous avons évalué si les méta-analyses en réseau suivent les recommandations essentielles à la conduite et la présentation des revues systématiques. Nous avons montré que certains éléments essentiels à la conduite et la présentation des revues systématiques ne sont pas rapportés. Notamment, les étapes concernant la recherche bibliographique, l'évaluation de la qualité méthodologique des essais inclus, le biais de publication sont mal rapportées. Nous avons évalué comment sont présentés les résultats dans les méta-analyses en réseau. Nous avons mis en évidence que la présentation des résultats dans les méta-analyses en réseau est très hétérogène. Les auteurs des méta-analyses en réseau ne présentent pas ou rapportent de manière inadéquate les éléments essentiels permettant d'évaluer l'ensemble des preuves disponibles (les interventions incluses, les comparaisons directes incluses, le nombre d'essais et de patients inclus dans chaque comparaison), les estimations deux à deux provenant des comparaisons directes, indirectes ou mixtes. Nos résultats montrent la nécessité de développer et de promouvoir des recommandations pour la conduite et la présentation de ce type d'étude, dans le but d'améliorer la transparence et la reproductibilitéNetwork meta-analyses allow for estimating all possible pair-wise comparisons between interventions, even some trials are lacking In the past few years, network meta-analyses have been increasingly used for comparing healthcare interventions. Network meta-analyses are primarily meta-analyses; they are probably subject to the same types of bias and should therefore be performed according to the explicit and rigorous methods used in systematic reviews. However, did not evaluate the presence of essential methodological components of the systematic review process such as conducting a literature search and assessing the risk of bias of individual studies, or the presentation of findings in reports of network meta-analyses. We assessed whether network meta-analyses follow the key methodological recommendations for reporting and conduct of systematic reviews. We show that the essential methodological components of the systematic review process—conducting a literature search and assessing risk of bias of individual studies—are frequently lacking in reports of network meta-analyses. We assessed how the results of network meta-analyses are reported. We show that the results of network meta-analyses are heterogeneously reported. The author inadequately reported essential component to judge the amount of evidence (that is, the interventions included in the network, direct comparisons between interventions, number of randomised trials and patients for each comparison) and the relative effect sizes between interventions from direct evidence, indirect evidence, and the network meta-analysis. Development of reporting guidelines to assist authors in writing and readers in critically appraising reports of network meta-analyses is timely
35
Salameh, Pascale. « Troubles respiratoires chroniques non cancéreux et expositions aux pesticides : résultats d'études épidémiologiques au Liban ». Bordeaux 2, 2002. http://www.theses.fr/2002BOR20929.
Texte intégralRésumé :
Introduction :Les pesticides sont des composés toxiques et fréquemment utilisés. Les utilisateurs professionnels et la population générale y sont exposés. L'objectif de ce travail est de vérifier si les expositions entraînent des effets respiratoires chroniques dans la population libanaise. Matériel et méthodes : Plusieurs études ont été conduites. 1-Une étude préliminaire transversale pour l'évaluation de l'étendue du problème sur le terrain libanais, concernant l'éducation et les moyens de protection des travailleurs de pesticides, et l'apparition chez eux de symptomes d'intoxication en comparaison à la population générale. 2-Une étude de type avant-après, comparant les effets sur les fonctions respiratoires de l'exposition professionnelle industrielle aux pesticides. 3-Une étude cas-témoins d'asthme et bronchite chronique chez les adultes et leur association aux pesticides. 4-Une étude transversale chez les enfants associant les symptomes respiratoires chroniques et l'asthme à l'exposition aux pesticides. Résultats : La connaissance des pesticides est insuffisante dans la population générale et chez les agriculteurs ; ces derniers ne prennent pas assez de mesures de prévention. Ils sont plus à risque de développer des symptomes respiratoires ou autres. Dans une industrie de conditionnement des pesticides, les travailleurs ont une fonction respiratoire inférieure à celle d'autres travailleurs. L'étude en population générale a aussi montré une association entre les expositions domestiques ou environnementales et l'apparition de problèmes respiratoires chroniques tels que l'asthme et la bronchite chronique. Les enfants, de leur côté, sont aussi à risque de développer des problèmes respiratoires chroniques, l'asthme en particulier, en cas d'exposition aux pesticides. Conclusion : Les études épidémiologiques menées au Liban ont montré des associations significatives entre tout type d'exposition aux pesticides et les troubles respiratoires.
36
Jusot, Jean-François. « Évaluation de la prise en charge et des mesures d'hygiène dans la prévention des gastroentérites nosocomiales en pédiatrie ». Lyon 1, 2004. http://www.theses.fr/2004LYO10117.
Texte intégralRésumé :
Ce travail traite de l'évaluation de la prise en charge et de la prévention des gastroentérites nosocomiales en pédiatrie. Après une revue de la littérature qui met l'accent sur les infections à rotavirus, nous rapportons les résultats d'une surveillance épidémiologique réalisée en collaboration avec plus de trente services de pédiatrie du sud-est de la France. Une étude prospective a permis de mieux connaître les aspects cliniques et épidémiologiques des cas de gastroentérite nosocomiale. La surveillance épidémiologique a trouvé un taux moyen d'incidence de gastroentérite nosocomiale de 3,6%, comparable à ceux de la littérature. Parmi les mesures d'hygiène déclarées, deux étaient liées et prédictives des taux d'incidence : la limitation des déplacements du patient et le fait de maintenir la porte de la chambre fermée. La concordance entre les mesures d'hygiène déclarées lors de la surveillance épidémiologique et celles observées lors d'un audit pour la prise en charge d'une diarrhée a été analysée. L'audit confirmait la bonne observance déclarée du lavage des mains, alors que l'utilisation des solutions hydro-alcooliques et le port de gants étaient insuffisants. A titre prospectif, nous avons élaboré un modèle mathématique de la transmission de l'infection à rotavirus en milieu hospitalier dont les principaux paramètres sont liés au contact entre l'enfant et les soignants d'une part et à la proportion d'enfants infectés présentant une diarrhée dans le service d'autre part. Ce travail trace de nouvelles perspectives de lutte contre la transmission de l'infection à travers l'incitation à développer des surveillances épidémiologiques et des audits
37
Zewail, Reem. « Épidémiologie des maladies parasitaires chez les immigrants au Québec ». Mémoire, Université de Sherbrooke, 2014. http://hdl.handle.net/11143/5482.
Texte intégralRésumé :
Introduction
Le Québec accueille 50 000 immigrants annuellement dont 30 % viennent d’Afrique et 27 % d’Asie. Dans les dix dernières années, 200 à 600 enfants ont été adoptés annuellement, majoritairement de l’Asie. Plusieurs régions d’origine des immigrants sont endémiques pour des parasites. C’est pourquoi l’immigration influence fortement l’épidémiologie de ces maladies. La giardiase, la filariose, la schistosomiase, la strongyloïdose et la malaria sont les plus prévalentes. Il existe peu de données sur les maladies parasitaires chez les immigrants au Québec. Cette étude vise à décrire l’épidémiologie de cette problématique dans la province.
Méthode
Une étude descriptive transversale a été privilégiée. Les immigrants ayant consulté au centre des maladies tropicales de l’Université McGill et les enfants de la clinique d’adoption de l’hôpital Maisonneuve-Rosemont ont été ciblés. Une grille standardisée a été utilisée pour la collecte des données dans la base de données de GeoSentinel et les dossiers médicaux. Des analyses descriptives et inférentielles fournissent un profil des immigrants atteints et des facteurs associés.
Résultats
Au moins un parasite se trouve chez 32 % (202/638) des immigrants à l’étude. Les parasitoses les plus prévalentes chez ces cas sont la strongyloïdose (28%), la filariose (21%), la schistosomiase (17%), et la malaria (12%). Le tiers des cas sont des demandeurs d’asile et 43 % (86/202) viennent de l’Afrique subsaharienne. Une proportion élevée d’infection, 50 % (27/56), se trouve chez les Haïtiens. Chez 15 % (73/499) des enfants adoptés, on trouve au moins un parasite; la giardiase et la strongyloïdose sont les plus prévalentes. La majorité (292/499) des enfants à l’étude viennent de la Chine et 69 % (22/32) des enfants Haïtiens sont infectés par des parasites.
Discussion et conclusion
La littérature appuie nos résultats. La population immigrante est en croissance au Québec ce qui est une des richesses de la province. Par contre, c’est une population qui est vulnérable au niveau de la santé. Environ 1/3 des immigrants et 1/6 des enfants adoptés sont atteints par des parasitoses. Plus de la moitié (57 %) des immigrants atteints sont infectés par des parasites qui ont des conséquences importantes. Des interventions ciblant cette population sont recommandées afin de diminuer ce fardeau.
38
Picot, Marie-Christine. « Épidémiologie de la dépression : projet d'étude en milieu professionnel ». Montpellier 1, 1990. http://www.theses.fr/1990MON11172.
Texte intégral
39
Callies, Philippe. « La cysticercose à Madagascar : diagnostic, épidémiologie et suivi thérapeutique ». Paris 5, 1993. http://www.theses.fr/1993PA05P155.
Texte intégral
40
Casin, Isabelle. « Taxonomie et épidémiologie moléculaires des "Haemophilus" responsables d'infections humaines ». Paris 11, 1990. http://www.theses.fr/1990PA11A001.
Texte intégral
41
Ouabi, Mastafa. « La bilharziose urogénitale à Errachidia (Maroc) : dépistage et épidémiologie ». Lille 2, 1992. http://www.theses.fr/1992LIL2P015.
Texte intégral
42
Acquaviva, Eric. « Pharmaco-épidémiologie des psychotropes chez les enfants et adolescents ». Paris 6, 2011. http://www.theses.fr/2011PA066433.
Texte intégralRésumé :
L’objet de ce travail est l’étude pharmaco-épidémiologique des psychotropes chez les enfants et adolescents. L’estimation de la fréquence annuelle de prescription de psychotropes chez les enfants et adolescents de 18 ans et moins est de 2. 2%. En 2005, l’enquête ESCAPAD montre que 14. 9% des sujets âgés de 17 ans ont pris un traitement pour dormir ou pour les nerfs durant les douze derniers mois. Seuls 49. 7% de ces prises médicamenteuses sont prescrites par un médecin. Deux tiers des prescriptions sont réalisés hors AMM. Près d’un tiers d’entre elles sont des prescriptions simultanées de plusieurs psychotropes. Les antidépresseurs sont les psychotropes les plus concernés. Le suivi des prescriptions d’antidépresseurs montre que des mesures de Santé Publique telles que les mises en garde émises en 2004 on été suivies d’une diminution significative des prescriptions d’antidépresseurs et de modifications des pratiques de prescription
43
Ruppé, Etienne. « Épidémiologie, quantification et conséquences du portage intestinal d'entérobactéries multirésistantes ». Paris 7, 2013. http://www.theses.fr/2013PA077067.
Texte intégralRésumé :
La diffusion récente et mondiale des entérobactéries multirésistantes et notamment celles qui produisent des béta-lactamases à spectre élargi (BLSE) a compromis l'efficacité des antibiotiques utilisés dans les infections qu'elles causent. Le microbiote intestinal joue un rôle central dans ce phénomène en étant le réservoir des entérobactéries chez l'Homme. Pourtant, la caractérisation de ce portage reste parcellaire sur de nombreux points, ce qui empêche d'en prendre en compte ses caractéristiques pour le soin des patients. C'est pourquoi nous avons tenté dans ce travail d'enrichir les connaissances autour des différentes phases du portage digestif d'entérobactéries multirésistantes (pré-colonisation, colonisation et post-colonisation). Nous nous sommes tout d'abord intéressés à la phase qui précède la colonisation en cherchant à caractériser les déterminants menant au portage d'entérobactéries productrices de BLSE. Nous avons pu observer que ces bactéries diffusaient dans des zones géographiques isolées, et que la prédiction de leur portage digestif à l'entrée à l'hôpital en France était difficile à partir des données disponibles à ce moment. En ce qui concerne la colonisation elle-même, nous avons développé un nouveau marqueur quantitatif du portage d'çntérobactéries résistantes : l'abondance relative (soit le ratio entre la densité intestinale des entérobactéries résistantes sur celle des entérobactéries totales). Nous avons étudié l'évolution de ce marqueur lors d'un traitement par lévofloxacine, un antibiotique largement utilisé dans les infections urinaires. Toujours pour mieux caractériser la colonisation elle-même, nous avons développé une méthode microbiologique de détection des entérobactéries productrices de la carbapénémase OXA-48 après sa découverte incidentelle chez une patiente ne présentant pas de facteurs de risque habituels pour le portage de telles bactéries. Enfin, nous avons étudié la phase post-colonisation (i) en établissant pour la première fois le lien entre abondance relative dans les selles des Escherichia coli producteurs de BLSE et le risque d'infection urinaire à ces bactéries, et (ii) en objectivant le transfert In vivo d'une carbapénémase KPC d'une Klebsiella pneumoniae acquise en Grèce vers une K. Pneumoniae commensale. En conclusion, nos travaux autour du portage digestif d'entérobactéries multirésistantes ont montré le rôle central du microbiote intestinal et ont ouvert des perspectives innovantes et concrètes dans le contrôle de ces bactériesThe recent widespread of multidrug-resistant enterobacteria, especially those producing extended-spectrum beta-lactamases (ESBL), has jeopardized the efficacy of currently advised treatments of the infections they cause. The intestinal microbiota might play a key role in this phenomenon as being the main reservoir for enterobacteria. Still, data about intestinal carriage of multidrug-resistant enterobacteria remain scarce for some aspects that could benefit to the patients. In the present work, we aimed to add knowledge to the different phases of the intestinal carriage of multidrug-resistant enterobacteria (pre-colonization, colonization and post-colonization). We first focused on the pre-colonization phase and studied the determinants that lead to the intestinal carriage of multidrug-resistant enterobacteria. We found that such bacteria had spread even in extremely remote places, and that at hospital admission, the prediction of their digestive carriage was poorly effective based on the clinical data available at that time. About colonization itself, we worked on the quantitative dimension of the carriage of ESBL-producing enterobacteria and introduced a new marker: the relative abundance i. E. The ratio between the intestinal densities of ESBL-producing enterobacteria and that of total enterobacteria. We observed the evolution of this marker after a short exposure to levofloxacin, a widely-prescribed fluoroquinolone. Furthermore about thé colonization phase, we developed a microbiological method to recover enterobacteria producing the OXA-48 carbapénémase, subsequently to its incidental detection in a patient with no obvious risk factors for carriage of such bacteria. Eventually, we studied the post-colonization phase (i) in establishing for the first time the link between the relative abundance of ESBL-producing enterobacteria and their occurrence in urinary-tract infections in women, and (ii) in observing the in vivo transfer of the KPC carbapenemase from a Greece-acquired strain of Klebsiella pneumoniae to a commensal K. Pneumoniae. In conclusion, our results highlighted the central role played by the intestinal microbiota and opened new, concrete perspectives of the management of multidrug-resistant enterobacteria
44
Benhamiche, Anne-Marie. « Épidémiologie descriptive des cancers digestifs : incidence, prévalence, tendances chronologiques ». Dijon, 2000. http://www.theses.fr/2000DIJOMU05.
Texte intégralRésumé :
Par leur fréquence et leur gravité, les cancers digestifs posent un réel problème de santé publique. Le Registre Bourguignon des Cancers Digestifs a été crée avec l'idée que la recherche épidémiologique et la recherche en santé publique permettent de concevoir de nouvelles modalités de lutte contre ces cancers. Dans ce contexte, l'objectif de ce travail est de souligner l'intérêt de l'épidémiologie descriptive. Les données collectées localement et dans le cadre du réseau FRANCIM ont modifié nos connaissances sur la fréquence des cancers digestifs qui reposaient auparavant sur les statistiques de mortalité. En France, le cancer colorectal se situe au premier rang des cancers, avec le cancer du sein. Le nombre estimé de nouveaux cas était de 33400 en 1995. L'estimation de l'incidence des cancers digestifs, à la fois sur le plan national et sur le plan régional fournit des données utiles aux décideurs sur la fréquence de ces cancers en France. L'estimation du risque cumulé de cancer colorectal dans les groupes à risque élevé (antécédants familiaux de tumeur colorectale) suggère des recommandations pratiques pour une stratégie de dépistage dans ces groupes. L'étude des tendances évolutives, fondées sur des techniques de modélisation tenant compte de l'âge, de la période de diagnostic et de la cohorte de naissance, permet une meilleure connaissance des variations temporelles et suggère des hypothèses sur le rôle des facteurs environnementaux ou alimentaires dans l'évolution de l'incidence. Au 31 décembre 1995, le nombre estimé de personnes ayant eu un cancer colorectal était de 186000. Ces données sont précieuses pour déterminer les besoins de prise en charge médicale ou de surveillance de ces cancers, concevoir et analyser des enquêtes à visée étiologique, définir ou évaluer une politique de prévention ou de dépistage.
45
Theophile, Hélène. « Etude de la causalité en pharmacovigilance et pharmaco-épidémiologie ». Thesis, Bordeaux 2, 2011. http://www.theses.fr/2011BOR21898/document.
Texte intégralRésumé :
L’analyse de la causalité, qui consiste à déterminer si la prise d’un médicament est la cause de la survenue d’un événement, est la problématique centrale de la pharmacovigilance et de la pharmaco-épidémiologie.La première partie de ce travail aborde l’étude de la causalité au plan individuel, au travers des méthodes d’imputabilité. Nous avons d’abord comparé une méthode d’imputabilité récemment développée, la méthode logistique, et la méthode d’imputabilité officiellement utilisée en France à un jugement consensuel d’experts pris comme référence. Les résultats montrent que la méthode française d’imputabilité tend à sous-coter la responsabilité du médicament (faible sensibilité) alors que la méthode logistique tend à la surestimer (faible spécificité). Par la suite, une nouvelle version de la méthode française d’imputabilité visant à améliorer sa sensibilité et son pouvoir discriminant a été proposée. Le travail de validation portant sur cette méthode réactualisée montre une amélioration de sa sensibilité et des résultats se rapprochant plus du jugement consensuel d’experts. Pour la méthode logistique, les critères d’imputabilité et leurs poids ont été réévalués sur un échantillon plus important d’observations que celui ayant servi à la pondération initiale. La validité de cette nouvelle version et celle de l’un des algorithmes les plus couramment utilisés en pharmacovigilance, la méthode Naranjo, ont été comparées à un jugement consensuel d’experts. Les résultats concernant la validité interne et les qualités prédictives de la méthode Naranjo ne sont pas satisfaisants alors que la méthode logistique présente une spécificité améliorée ainsi qu’une bonne sensibilité et valeurs prédictives. Cette dernière méthode présente donc des caractéristiques qui devraient améliorer l’évaluation de la responsabilité des médicaments dans la survenue des événements indésirables. La mise en place de méthode d’imputabilité spécifique à une classe thérapeutique et/ou à un type d’événement indésirable pourrait aussi améliorer l’évaluation des événements indésirables. Nous proposons une grille d’imputabilité adaptée aux accidents hémorragiques sous antithrombotique. Dans la deuxième partie de cette thèse, l’analyse épidémiologique de la causalité est abordée en proposant deux méthodes : l’analyse populationnelle des cas individuels, en particulier leur délai de survenue après exposition médicamenteuse, et l’approche cas-population. Bien que beaucoup moins robustes que les méthodes classiques, elles sont testées sur des problématiques réelles de pharmacovigilance et les résultats montrent qu’elles peuvent être utiles pour une première exploration d’une association causale potentielle. En conclusion, ce travail méthodologique pourrait aider à mieux évaluer la responsabilité des médicaments dans la survenue d’événements indésirables après leurs autorisations de mise sur le marchéThe analysis of causality, which consists of determining if drug intake is the cause of the event occurrence, is the central issue of pharmacovigilance and pharmacoepidemiology. The first part of this work deals with the study of causality assessment methods at the level of individual cases. We first compared the recently developed logistic causality assessment method and the method officially used in France, to consensusual expert judgement taking as a reference. The results showed that the French causality assessment method tended to underestimate the responsibility of the drug (low sensitivity) whereas the logistic method tended to overestimate it (low specificity). Subsequently a new version of the French causality assessment method aiming to improve its sensitivity and discriminating power was proposed. The validation phase of this updated method showed improved sensitivity and a performance closer to consensual expert judgement. For the logistic method, the criteria of causality assessment and their weights were re-evaluated on a larger sample of drug-event pairs that had been used in the initial weighting. The validity of this method and that of one of the most commonly used algorithms in pharmacovigilance, the Naranjo method, were compared to consensual expert judgement. Results concerning the internal validity and the predictive qualities of the Naranjo method were not satisfactory while the logistic method presented an improved specificity and good sensitivity and predictive values. The logistic method now presents characteristics that should improve the assessment of drug responsibility in the occurrence of adverse events. The implementation of causality assessment method specific to a therapeutic class and / or to a type of adverse event could also improve the assessment of adverse events. We proposed a scale adapted to hemorrhages with antithrombotics and derived from the French causality assessment method. In the second part of this thesis, the epidemiological analysis of causality was tackled by proposing two methods: the populational analysis of individual cases, in particular their time to onset after drug exposure, and the case-population approach. Although less robust than the conventional methods, these were tested on real problems of pharmacovigilance and the results indicate that they may be useful for an initial exploration of a potential causal association. In conclusion, this methodological work could help to better assess drug causality in the occurrence of adverse event in post maketing surveillance
46
Dong, Siwei. « Réactions d'hypersensibilité immédiate en anesthésie : épidémiologie et risques environnementaux ». Thesis, Université de Lorraine, 2012. http://www.theses.fr/2012LORR0171/document.
Texte intégralRésumé :
Les réactions d'hypersensibilité immédiate survenant au cours de l'anesthésie demeurent un sujet de préoccupation majeure pour les anesthésistes. Le médicament le plus fréquemment responsable d'une anaphylaxie sont les curares. Le but de ce travail est de préciser l'épidémiologie actuelle et d'identifier certains facteurs environnementaux susceptibles d'expliquer la fréquence élevée des réactions allergiques aux curares qui peuvent survenir en l'absence de toute exposition préalable. Dans la première partie de la thèse, une enquête nationale décrivant l'épidémiologie des réactions anaphylactiques peranesthésiques entre 2005 et 2007 en France. Elle a confirmé l'intérêt du dosage d'IgE spécifique anti-curare. La survenue de réactions d'hypersensibilité immédiate allergique à l'induction anesthésique lors d'une première exposition aux curares a conduit à évoquer l'existence d'une sensibilisation croisée avec des substances présentes dans l'environnement et possédant un ammonium quaternaire. Différentes hypothèses ont été proposées, notamment une exposition aux produits cosmétiques et/ou désinfectants, une exposition à des antigènes de type phosphorylcholine rencontrés dans les levures, ou certains parasites. Dans la deuxième partie de la thèse, deux populations professionnelles, des apprentis coiffeurs exposés à des agents chimiques contenant des ions ammoniums, et des boulanger-pâtissiers exposés à des allergènes de levures et de parasites, ont été comparées avec la population générale à la recherche de différences concernant la prévalence des anticorps IgE spécifique anti-curare. Au terme de ce travail, l'exposition à des produits cosmétiques chez les coiffeurs apparaît comme un facteur de risque de développer des anticorps IgE spécifique anti-curare, démontrant pour la première fois l'hypothèse du lien entre l'exposition répétée aux produits cosmétiques contenant l'ammonium quaternaire et la sensibilisation croisée aux curaresImmediate hypersensitivity reactions occurring during anesthesia remains a major concern for anesthesiologists. The drugs most frequently responsible for anaphylaxis are neuromuscular blocking agents (NMBAs). The purpose of this study is to determine the current epidemiology and to identify environmental factors that may explain the high frequency of allergic reactions to neuromuscular blocking agents that can occur without any prior exposure. In the first part of the thesis, a national survey describing the epidemiology of anaphylaxis during anesthesia between 2005 and 2007 in France was carried out. The value of testing specific IgE against NMBA was confirmed.The occurrence of immediate allergic hypersensitivity reaction when first exposure to an NMBA during induction led to evoke the existence of cross-sensitization with substances present in environment and having a quaternary ammonium compound. Different hypotheses have been proposed including exposure to cosmetics and / or disinfectants, exposure to antigens encountered in phosphorylcholine yeasts, or parasites, or exposure to a derivative opiate, pholcodine. In the second part of the thesis, two occupational populations, hairdressers apprentice exposed to chemical agents containing ammonium ions, baker and pastry maker exposed to allergens yeast and parasites were compared with the general population to search for differences regarding the prevalence of specific IgE antibody against NMBA. At the end of this work, hairdressers exposed to cosmetics agents appears to be a risk factor for developing specific IgE antibodies against NMBA and we demonstrated for the first time the hypothesis of the ross-sensitization between repeated exposures to cosmetics products containing quaternary ammonium and NMBAs
47
Imbert, Sébastien. « Épidémiologie et sensibilité aux antifongiques des espèces cryptiques d’Aspergillus ». Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2020. http://www.theses.fr/2020SORUS237.
Texte intégralRésumé :
Le concept d’espèces cryptiques a révolutionné la taxonomie du genre Aspergillus ces dernières années. Plusieurs dizaines d’espèces peuvent désormais être retrouvées dans des prélèvements d’origine humaine, avec une incidence croissante. Cependant, leur identification précise restant difficile, les connaissances concernant leur pouvoir pathogène et leur sensibilité aux antifongiques demeures incomplètes pour le moment. Le développement récent de l’application en ligne MSI, dédiée à l’identification des microorganismes à partir de leur spectre de masse, a permis de démocratiser l’identification de ces « nouvelles » espèces. La collaboration avec le réseau d’utilisateurs de l’application nous a permis de constituer et d’étudier une importante collection d’isolats cryptiques (390 isolats issus de 69 espèces et 13 sections différentes), combinant une identification moléculaire précise, l’étude des profils de sensibilité aux antifongiques par une méthode de référence et l’implication clinique des isolats. Au cours de ce travail, nous avons mis en évidence des profils de résistance naturelle aux antifongiques, propres à certaines espèces. D’un autre côté, nous avons montré toute la diversité des espèces impliquées en pathologie humaine, dont certaines pour la première fois, ainsi que le tropisme pathogène particulier de quelques espèces. Ce travail nous a donc permis d’améliorer et d’apporter de nouvelles connaissances sur les espèces cryptiques d’Aspergillus et souligne toute l’importance de leur identification précise en pratique clinique. La version 2 de l’application MSI améliorée au cours de cette étude, représente donc un outil simple et puissant pour celaIn recent years, the cryptic species concept has revolutionized the Aspergillus genus taxonomy. Henceforth, dozens of species could be found in human samples, with an increasing incidence. However, as their identification remains a challenge, few is known regarding their pathogenicity or their antifungal susceptibility. The recent development of the MSI web application dedicated to the microorganism’s identification from their mass spectra, has improved these “new” species identification in numerous centers. The collaboration with this network of users allowed us to collect and study a large collection of cryptic isolates (390 isolates from 69 species and 13 sections), combining an accurate DNA sequence-based identification, the antifungal susceptibility testing by reference method and the clinical involvement. We brought evidence for species-dependent antifungal resistance patterns. We also highlighted the extent of species diversity involved in human disease, including some species never described, and the species-dependent pathogenicity patterns for some species. Thus, this work improved the knowledge on Aspergillus cryptic species and underline the importance of their accurate identification in clinical practice. The new version 2 of the MSI application, upgraded during this study, stand for an easy and powerful tool for this
48
Lemesle, Martin Martine. « Epidémiologie des accidents vasculaires cérébraux et des accidents ischémiques transitoires dans la ville de Dijon, France ». Dijon, 2000. http://www.theses.fr/2000DIJOMU10.
Texte intégralRésumé :
Par leur fréquence et leur gravité, les Accidents Vasculaires Cérébraux (AVC) représentent un problème majeur de santé publique. Depuis 1985, le registre dijonnais des AVC permet de recenser tous les AVC et les accidents ischémiques Transitoires (AIT) survenant dans la population de Dijon intra-muros de 150 000 habitants. Dans ce contexte, l’objectif de ce travail est de souligner l’intérêt de l’épidémiologie descriptive et d’approcher quelques données d’épidémiologie analytique. Les données recueillies dans ce registre de population permettent de calculer une incidence des AVC à Dijon de 170/100 000 hommes et de 126/100 000 femmes. Ces taux d’incidence sont parmi les plus faibles au monde. Les patients victimes d’AVC, les plus sévères, ou porteurs de nombreux facteurs de risque, sont fréquemment hospitalisés, alors que les accidents mineurs peuvent être traités en ambulatoire d’où l’intérêt de travailler sur un registre de population. Nous confirmons une moindre mortalité de ces accidents au sein de la population urbaine de Dijon (Bourgogne, France) par rapport à la population rurale d’Avallon (Bourgogne, France). L’étude des tendances évolutive des incidences permet une meilleure connaissance des variations temporelles des AVC et identifie des évolutions différentes en fonction du sous-type ischémique (infarctus, lacunes ou AIT) suggérant un meilleur contrôle de certains facteurs de risque (hypertension artérielle) ou l’augmentation de certains patients à risques différents (cardiopathie emboligène). L’étude de la mortalité initiale à 3 mois des AVC, dans 12 centres européens retrouve un des taux le plus faible à Dijon (20%). La survie à 5 ans après un AVC, s’améliore dans la population Dijonnaise de 1986 à 1991. Ces données sont précieuses pour déterminer les besoins de prise en charge médicale et pour organiser les efforts de prévention des facteurs de risque incriminés dans la survenue de ces AVC ou des AIT.
49
Sonfack, Tsafack Elodie Pamela. « La coqueluche au Québec depuis l'introduction du vaccin acellulaire : Bilan épidémiologique ». Thesis, Université Laval, 2012. http://www.theses.ulaval.ca/2012/27845/27845.pdf.
Texte intégralRésumé :
En 1998, le Québec a changé de vaccin et introduit dans le calendrier vaccinal des enfants le vaccin acellulaire contre la coqueluche. Par la suite, en 2004 la formulation adolescent/adulte du vaccin acellulaire combinée avec celui contre la diphtérie et le tétanos (dcaT) a commencé à être administrée dans le cadre de la vaccination scolaire aux adolescents de 14-16 ans. Près de 12 ans après l’introduction du vaccin acellulaire, nous avons fait un bilan épidémiologique portant sur le taux d’incidence de la maladie tel que déclaré au fichier des maladies à déclaration obligatoire (MADO) ainsi que sur les taux d’incidence des hospitalisations provenant du fichier administratif des hospitalisations au Québec (MED-ECHO) pour pouvoir décrire l’évolution de la coqueluche au Québec. L’analyse a montré trois périodes en fonction du vaccin utilisé. La période 1990-1998 où tous les enfants étaient vaccinés au vaccin entier, la période 1999-2002 où la majorité des enfants de moins de cinq ans avaient reçu un mélange de vaccin entier et acellulaire et la période 2003-2009 où les enfants étaient tous vaccinés au vaccin acellulaire.
Du 1er janvier 1990 au 31 décembre 2009 le total des cas de coqueluche déclarés s’élève à 32 692 dont 5 216 cas hospitalisés. L’incidence moyenne a été de 38 et 6,2 pour 100 000 habitants de 1990 à 1998, de 16 et 2,1 pour 100 000 habitants entre 1999 et 2002 et de 7 et 1,1 pour 100 000 habitants de 2003 à 2009. Parmi les enfants de 6 à 12 ans ayant reçu uniquement du vaccin acellulaire on n’observe pas d’augmentation significative du risque avec l’intervalle depuis la dose de rappel à 4-6 ans. Les taux d’incidence chez les adultes sont restés bas de 2000 à 2009 et ne suggèrent pas un besoin de faire des changements dans la vaccination de ces derniers. La stratégie de cocooning qui consiste à vacciner les parents des nouveau-nés pour prévenir une hospitalisation chez les nourrissons de moins de six mois requerrait de vacciner entre 7 545 et 11 857 parents par hospitalisation prévenue. Cette stratégie semble donc peu efficiente pour le contrôle de la morbidité lie à la coqueluche du nourrisson.
50
Sixou, Michel. « Etude épidémiologique de la transmission d'Actinobacillus actinomycetemcomitans dans la parodontite aigue͏̈ juvénile ». Toulouse 3, 1991. http://www.theses.fr/1991TOU30227.
Texte intégralRésumé :
De nombreuses etudes ont incremine actinobacillus actinomycetemcomitans (a. A. ) dans les maladies parodontales et plus specifiquement dans la parodontite aigue juvenile (paj). L'objectif de cette etude etait de determiner, dans un premier temps, la prevalence et la distribution de a. A. Dans la cavite buccale de sujets normaux et de sujets presentant une paj (4000 prelevements). Dans un second temps, la transmission de ce microorganisme a ete etudiee par la determination des biotypes, des serotypes et des genotypes des souches isolees sur les differents membres d'une meme famille. Quarante sept familles et 136 sujets ont participe a cette etude. Ces travaux ont permis d'optimiser la procedure de prelevement, d'isolement et identification de a. A. , la mise au point d'une sonde d'adn qui s'est revelee un excellent moyen d'identification de a. A. Dans des prelevements polybacteriens. Les etudes de biotypes, de serotype et de genotypes ont clairement montre la transmission de ce microorganisme entre conjoint et parfois entre enfants. Cette constatation pourrait expliquer les frequentes recidives apres traitement, observees chez les sujets presentant une paj. Le conjoint normal est un porteur sain qui pourrait jouer le role de reservoir et recontaminer le patient atteint de paj