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Touchette, Lyne, Jean-Michel Beaudoin, Nathalie Isabel, Nancy Gélinas et Ilga Porth. « Comment mettre la génomique forestière et la génomique de la conservation au service des communautés autochtones ? » Forestry Chronicle 97, no 3 (septembre 2021) : 233–49. http://dx.doi.org/10.5558/tfc2021-026.

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Résumé :
Les projets d’aménagement durable et de conservation (ADC) des ressources naturelles en collaboration avec les peuples autochtones ayant recours à une approche en génomique sont en émergence. Les informations et applications issues de la génomique peuvent leur être utiles particulièrement dans un contexte de changements climatiques. Toutefois, le défi de transposer ces applications dans la pratique et de les mettre au service des communautés demeure. Nous présentons ici une revue de littérature exploratoire qui aborde (1) les utilités démontrées de la génomique dans les projets d’ADC impliquant les peuples autochtones, (2) certains enjeux qui peuvent limiter l’adoption des applications de la génomique et (3) le travail collaboratif entre chercheurs et communautés autochtones dans les études analysées. Les utilités démontrées identifiées ont été essentiellement de nature socioécologique. La nature complémentaire des savoirs autochtones et des savoirs scientifiques en génomique a été reconnue comme une opportunité qui devrait être développée davantage pour relever les défis actuels, tels que les changements climatiques. En ce qui concerne l’adoption de cette technologie en ADC dans la pratique, en plus de faire face à des enjeux similaires à d’autres utilisateurs finaux, l’intégration des besoins, des valeurs traditionnelles et des connaissances des communautés autochtones dans les projets de génomique représente également un défi dans un contexte de décolonisation de la recherche en génomique. Finalement, la collaboration communauté-chercheur a été identifiée comme un élément clé pour favoriser la réussite de la transposition de la génomique en ADC.
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2

Glaser, Philippe, Lionel Frangeul et Carmen Buchrieser. « Génomique comparative ». Annales de l'Institut Pasteur / Actualités 11 (janvier 2002) : 33–49. http://dx.doi.org/10.1016/s0924-4204(02)85003-x.

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3

Perbal, Laurence. « La génétique des comportements, du génomique au post-génomique ». Bulletin d’histoire et d’épistémologie des sciences de la vie Volume 15, no 1 (2008) : 15. http://dx.doi.org/10.3917/bhesv.151.0015.

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4

VIGNAL, A., C. DIOT, C. MOLETTE, M. MORISSON, T. FARAUT, M. RAO, F. PITEL, V. FILLON et C. MARIE-ETANCELIN. « Génomique des canards ». INRAE Productions Animales 26, no 5 (19 décembre 2013) : 391–402. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2013.26.5.3168.

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Résumé :
La démocratisation des outils de la génomique et plus particulièrement du séquençage à haut débit a permis le séquençage du génome du canard commun. Des projets complémentaires sont déjà initiés pour prolonger et exploiter au mieux ces premiers acquis. En tout premier lieu, il s’agit de poursuivre la description de la structure du génome et d’en exploiter les connaissances : cartes d’hybrides irradiés pour ordonner la séquence le long des chromosomes ; génomique comparée avec le génome de la poule pour bénéficier des connaissances sur ce génome modèle ; recherche de SNP (Single Nucleotide Polymorphism) pour les études et la gestion de populations ; carte génétique pour la détection des QTL (Quantitative Trait Locus). La première détection de QTL influençant les performances du mulard, réalisée à l’aide de marqueurs microsatellites chez la cane commune, sera complétée par une seconde étude utilisant des marqueurs SNP développés spécifiquement et permettant une bien meilleure couverture du génome. Par ailleurs, il est important de réaliser une annotation fonctionnelle du génome, ce qui peut être abordé par le séquençage de transcrits. A terme, le génome annoté sera utilisé pour analyser son expression dans différents tissus et/ou conditions d’élevage, la connaissance des modèles de transcrits et de protéines facilitant les études en transcriptomique et protéomique. Le canard mulard, produit du croisement de la cane commune avec le canard de Barbarie, devra également être étudié en raison de son intérêt agronomique, lié à ses performances exceptionnelles dans la filière des palmipèdes gras.
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5

Babinet, C. « L'empreinte génomique parentale ». médecine/sciences 8, no 1 (1992) : 65. http://dx.doi.org/10.4267/10608/3046.

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GUENET, Jean-Louis. « EMPREINTE GÉNOMIQUE PARENTALE ». Bulletin de l'Académie vétérinaire de France, no 1 (2009) : 297. http://dx.doi.org/10.4267/2042/48008.

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7

Vachy, R. « Pharmacie et génomique. » médecine/sciences 14, no 2 (1998) : 252. http://dx.doi.org/10.4267/10608/1024.

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8

J.H. « Génomique et légumes ». Biofutur 2000, no 198 (mars 2000) : 51. http://dx.doi.org/10.1016/s0294-3506(00)88804-3.

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Planchon, Philippe. « L'hybridation génomique comparative ». Biofutur 1997, no 165 (mars 1997) : 10A. http://dx.doi.org/10.1016/s0294-3506(97)87615-6.

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Boissinot, Maurice, et Michel G. Bergeron. « Génomique et bioterrorisme ». médecine/sciences 19, no 10 (octobre 2003) : 967–71. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/20031910967.

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Piguet, Vincent, et Shahnaz Abraham. « Mélanome et génomique ». Revue Médicale Suisse -2, no 2381 (2002) : 438–42. http://dx.doi.org/10.53738/revmed.2002.-2.2381.0438.

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Horn, Ruth. « La France et la Grande-Bretagne à l’ère de la médecine génomique ». médecine/sciences 35, no 2 (février 2019) : 163–68. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2019004.

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Résumé :
L’annonce du plan « France Médecine Génomique 2015 » témoigne de la volonté des pouvoirs publics français de faire de la médecine génomique l’un des éléments phares de la santé publique et de la recherche scientifique nationales. C’est dans ce contexte que la France a annoncé sa coopération avec la Grande-Bretagne, l’un des plus grands leaders mondiaux de la médecine génomique. Une telle collaboration au niveau international impose une réflexion à un cadre normatif commun qui réponde aux nouveaux défis éthiques posés par la médecine génomique. Afin qu’un tel cadre soit adapté aux différents contextes nationaux, il est nécessaire d’identifier et d’analyser les questions éthiques au niveau général et dans leurs contextes particuliers. Dans cette revue, nous discuterons de l’enjeu international de la médecine génomique et, plus précisément, de l’entrée de la France dans la compétition internationale. Nous explorerons ensuite les enjeux éthiques de la médecine génomique en prenant comme étude de cas le contexte prénatal. Nous finirons par une réflexion sur l’impact que peut avoir le contexte national sur la façon dont les questions éthiques émergent en France par rapport à la Grande-Bretagne.
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Jeanteur, Philippe. « De la génomique à la post-génomique : un retour aux origines ? » Bulletin de l'Académie Nationale de Médecine 186, no 5 (mai 2002) : 895–906. http://dx.doi.org/10.1016/s0001-4079(19)34278-5.

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Neou, M., B. De La Villéon, A. Jouinot, S. Garinet, J. Pipoli, F. Letourneur, J. Bertherat et G. Assié. « Génomique des corticosurrénalomes : de la génomique intégrée au séquençage haut débit ». Annales d'Endocrinologie 77, no 4 (septembre 2016) : 278. http://dx.doi.org/10.1016/j.ando.2016.07.121.

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Dreyfus, J. C., et E. Bursaux. « Empreinte génomique et méthylation ». médecine/sciences 10, no 2 (1994) : 216. http://dx.doi.org/10.4267/10608/2592.

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Bihain, BE, N. Shork, L. Bougueleret, M. Blumenfed, I. Chumakov, F. Yen et D. Cohen. « Génomique, promesses et réalités. » médecine/sciences 16, no 1 (2000) : 17. http://dx.doi.org/10.4267/10608/1496.

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17

Delourme, Régine. « Marqueurs moléculaires et génomique ». Oléagineux, Corps gras, Lipides 7, no 1 (janvier 2000) : 19. http://dx.doi.org/10.1051/ocl.2000.0019.

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Quintana-Murci, Lluis. « Génomique humaine et évolution ». L’annuaire du Collège de France 121 (2024) : 227–34. http://dx.doi.org/10.4000/12ku0.

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Triadou, Patrick Charles Gabriel. « Génomique 2000, aspects culturels ». Comptes Rendus de l'Académie des Sciences - Series III - Sciences de la Vie 324, no 12 (décembre 2001) : 1077–83. http://dx.doi.org/10.1016/s0764-4469(01)01402-0.

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Renaudineau, Yves. « Génomique, épigénétique et pathologies ». Option/Bio 25, no 518 (décembre 2014) : 13–15. http://dx.doi.org/10.1016/s0992-5945(14)72020-3.

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Kahn, A. « Génomique et Santé publique ». Cahiers de Nutrition et de Diététique 39, no 3 (juin 2004) : 165. http://dx.doi.org/10.1016/s0007-9960(04)94450-1.

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Michielin, Olivier, et George Coukos. « Médecine génomique et oncologie ». Praxis 103, no 10 (1 mai 2014) : 591–96. http://dx.doi.org/10.1024/1661-8157/a001659.

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Résumé :
Die Fortschritte der Genomik, insbesondere die Hochgeschwindigkeitssequenzierung der neuen Generation, revolutionieren die Onkologie. Der Einfluss dieser Technik manifestiert sich einerseits durch die Identifizierung germinaler Mutationen, die verschiedene Tumorarten verursachen können und eine individuelle Betreuung der Patienten oder der gesunden Träger erlauben, und andererseits durch die Kennzeichnung aller von der Tumorzelle erworbenen, somatischen Mutationen, die die Tür zur personalisierten Behandlung mit Ziel der Progression der implizierten Onkogene öffnet. In beiden Fällen erlauben Sequenzierungstechniken der neuen Generation, ein globales Vorgehen mit Analyse der gesamten Mutation des Genoms und Korrelation der klinischen Daten. Der Nutzen für die Qualität der Behandlung unserer Patienten ist äusserst beeindruckend.
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Couturier, J., et L. Lumbroso-Le Rouic. « Génomique du mélanome uvéal ». EMC - Ophtalmologie 8, no 3 (janvier 2011) : 1–3. http://dx.doi.org/10.1016/s0246-0343(11)55728-4.

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Kottler, M. L. « Empreinte génomique et pseudohypoparathyroïdie ». Annales d'Endocrinologie 65, no 6 (décembre 2004) : 493–94. http://dx.doi.org/10.1016/s0003-4266(04)95961-6.

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M., J. M. « Plan Génomique pour tous ». Revue Francophone des Laboratoires 2017, no 495 (septembre 2017) : 77. http://dx.doi.org/10.1016/s1773-035x(17)30334-9.

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Lacombe, Didier. « Génétique, génomique et médecine ». La Presse Médicale 41, no 1 (janvier 2012) : 1–2. http://dx.doi.org/10.1016/j.lpm.2011.09.003.

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Desjardins, Michel, et Michel Bergeron. « L’endocytose à l’ère génomique ». médecine/sciences 18, no 11 (novembre 2002) : 1045–46. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/200218111045.

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Milano, Gérard. « Cancers ORL et génomique ». médecine/sciences 22 (janvier 2006) : 50–53. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2006221s50.

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Quintana-Murci, Lluis. « Génomique humaine et évolution ». L’annuaire du Collège de France, no 120 (13 février 2023) : 159–67. http://dx.doi.org/10.4000/annuaire-cdf.18277.

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Casselyn, Marina. « Redondance génomique et transcription ». Revue Médicale Suisse 5, no 196 (2009) : 701. http://dx.doi.org/10.53738/revmed.2009.5.196.0701.

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Burt, David W., et Paul M. Hocking. « Mapping quantitative trait loci and identification of genes that control fatness in poultry ». Proceedings of the Nutrition Society 61, no 4 (novembre 2002) : 441–46. http://dx.doi.org/10.1079/pns2002185.

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Résumé :
RésuméLa génomique de la volaille a bénéficié des avancements technologiques rapides acquis en génomique humaine et sur les organismes modèles. Certains outils et certains approches sont maintenant bien établis chez le poulet, y compris les cartes et marqueurs (génétiques comme physiques), mapping loci pour caractéres quantitatifs, mapping comparative, ressources expressed sequence tag et bacterial artificial chromosome, et mapping physique. De plus, la phase suivante de la découverte génétique, la génomique fonctionnelle, est en cours. Les progre`s dans le mapping de loci pour caracte`res quantitatifs de croissance et d'adiposité seront discutés pour illustrer ces nouvelles technologies et ces nouvelles approches dans l'étude de la génétique et de la physiologie avicole.
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Batista Da Costa, J., J. Wright, M. Dall’era, T. Bivalacqua, R. Seiler, E. Gibb, Q. Wang et al. « Classifieur génomique permettant d’identifier de tumeurs à profil génomique neuro-endocrine (« ne-like ») ». Progrès en Urologie 28, no 13 (novembre 2018) : 670. http://dx.doi.org/10.1016/j.purol.2018.07.115.

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Dreyfus, J. C. « Diversité génomique des populations européennes ». médecine/sciences 9, no 2 (1993) : 217. http://dx.doi.org/10.4267/10608/2897.

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Muller, Y., et J. Clos. « L'hormone thyroïdienne : un commutateur génomique ? » médecine/sciences 13, no 1 (1997) : 116. http://dx.doi.org/10.4267/10608/320.

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Jordan, B. « Séquençage génomique : le second souffle ». médecine/sciences 8, no 8 (1992) : 854. http://dx.doi.org/10.4267/10608/3242.

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Robert, T., J. Torrents, N. Jourde-Chiche, S. Greillier, B. Dussol, P. Brunet, L. Raymond et S. Burtey. « Approche génomique des néphropathies indéterminées ». Néphrologie & ; Thérapeutique 18, no 5 (septembre 2022) : 309–10. http://dx.doi.org/10.1016/j.nephro.2022.07.241.

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Icart, Jean-Claude. « Les temps de la génomique ». Oléagineux, Corps gras, Lipides 9, no 2 (mars 2002) : 71. http://dx.doi.org/10.1051/ocl.2003.0071.

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Fellay, Jacques. « Médecine génomique et Maladies infectieuses ». Praxis 103, no 10 (1 mai 2014) : 587–90. http://dx.doi.org/10.1024/1661-8157/a001658.

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Résumé :
Die aktuellen Fortschritte im Wissen um genetische Variationen des Menschen und deren Konsequenzen erlauben einen besseres Verständnis für die jahrtausendealte Schlacht, die sich Mensch und Mikrobe liefern. Zahlreiche Polymorphismen, die unsere Antwort auf Infektionen oder deren Therapien modulieren, wurden schon identifiziert. Einige davon haben klinischen Nutzen gebracht. Damit die personalisierte Medizin aber auch in der Infektiologie Realität werden kann, braucht es nicht nur fortwährende Anstrengungen in der Forschung, sondern auch in der Ausbildung.
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Léger, Clotilde. « Génomique : l'Irlande entre en scène ». Biofutur 2000, no 200 (mai 2000) : 62. http://dx.doi.org/10.1016/s0294-3506(00)89148-6.

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Lathrop, G. Mark, Cécile Julier, Fumihiko Matsuda, Ivo Gut et Michèle Durand. « La génomique et les maladies ». Biofutur 2000, no 206 (décembre 2000) : 76–81. http://dx.doi.org/10.1016/s0294-3506(00)90089-9.

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Coronini, Par Roger, Pierre-Benoit Joly et Marie-Angèle de Looze. « Génomique : une course à handicap ». Biofutur 1997, no 173 (décembre 1997) : 14–17. http://dx.doi.org/10.1016/s0294-3506(97)82179-5.

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Coste, J., et C. Defer. « Session 18 Dépistage génomique viral ». Transfusion Clinique et Biologique 7, no 3 (janvier 2000) : 323–26. http://dx.doi.org/10.1016/s1246-7820(00)80061-0.

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Stoll, C. « Empreinte génomique : introduction et définitions ». Archives de Pédiatrie 2, no 6 (juin 1995) : 608. http://dx.doi.org/10.1016/0929-693x(95)90290-j.

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Vialard, F., M. Benahmed, R. Lombroso et J. Selva. « Instabilité génomique et infertilité masculine ». Gynécologie Obstétrique & ; Fertilité 32, no 12 (décembre 2004) : 1013–22. http://dx.doi.org/10.1016/j.gyobfe.2004.10.016.

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Pierce, Raymond J., Benjamin Bertin et André Capron. « Vers la génomique du schistosome ». médecine/sciences 20, no 3 (mars 2004) : 271–72. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2004203271.

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Le Guyader, Hervé. « La valse génomique du requin ». Pour la Science N° 541 – novembre, no 11 (19 octobre 2022) : 92–94. http://dx.doi.org/10.3917/pls.541.0092.

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Fuchs-Gallezot, Magali, et Maryline Coquidé. « Génétique, génomique et post-génomique dans les programmes de SVT, une discipline scientifique scolaire ». RDST, no 2 (31 décembre 2010) : 17–52. http://dx.doi.org/10.4000/rdst.272.

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ROBERT-GRANIÉ, C., A. LEGARRA et V. DUCROCQ. « Principes de base de la sélection génomique ». INRAE Productions Animales 24, no 4 (8 septembre 2011) : 331–40. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2011.24.4.3265.

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Résumé :
Avec l’arrivée de données de génotypage à haut débit, il est maintenant possible d’estimer la valeur génétique d’animaux candidatsà la sélection dès leur naissance, sans attendre la collecte de phénotypes. La sélection génomique bouleverse complètement les perspectivesen amélioration génétique. Elle nécessite la constitution d’une population de référence formée d’animaux génotypés (jusqu’àrécemment, il s’agissait principalement de mâles) et ayant des performances précises, par exemple la performance moyenne de leursfilles. Les évaluations génomiques consistent à prédire les phénotypes dans cette population de référence comme la somme des effetsdes marqueurs moléculaires. Le problème méthodologique principal est que le nombre d’effets à estimer est typiquement beaucoupplus élevé que le nombre de phénotypes disponibles. Nous décrivons les idées générales de diverses familles de méthodes proposées :BLUP génomique basé sur une parenté entre individus calculée à partir des marqueurs, méthodes Bayésiennes plus flexibles maisaussi plus coûteuses, méthodes de sélection de variables, méthode en une seule étape qui combine évaluation génétique nationale etévaluation génomique. La précision des évaluations génomiques est faite par validation croisée chez les animaux les plus jeunes de lapopulation de référence. La taille de la population de référence, la manière de prendre en compte les QTL à effet fort et le degré d’apparentemententre candidats à la sélection et animaux de la population de référence ont un impact non négligeable sur l’efficacité desméthodes de sélection génomique.
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Droin-Mollard, M., L. Hervouet, K. Lahlou-Laforêt et S. de Montgolfier. « Les propositions génomiques en oncopédiatrie : bouleversements des temporalités et des repères éthiques — points de vue des patients, des parents et des professionnels ». Psycho-Oncologie 15, no 4 (décembre 2021) : 152–57. http://dx.doi.org/10.3166/pson-2022-0176.

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Résumé :
Objectif : Expliciter les enjeux complexes associés à l’expansion de la génomique en oncopédiatrie. Méthodologie : Différents matériaux d’enquêtes qualitatives pour analyser les avis des enfants, de leurs parents et des professionnels. Résultats : Ce travail permet de décrire l’intrication entre cancer et génomique dans le soin qui entraîne une compression des temporalités, l’implication d’un plus grand nombre d’acteurs et bouleverse les repères éthiques de la génétique. Conclusion : Les acteurs proposent des points d’amélioration pour repenser la temporalité et le consentement.
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TRIBOUT, T. « Perspectives d’application de la sélection génomique dans les schémas d’amélioration génétique porcins ». INRAE Productions Animales 24, no 4 (8 septembre 2011) : 369–76. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2011.24.4.3270.

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Résumé :
L’évaluation génomique est une nouvelle méthode d’estimation de la valeur génétique des animaux d’élevage qui est en train de révolutionnerl’organisation des schémas d’amélioration génétique bovins laitiers. La récente disponibilité d’une puce porcine de 60 000marqueurs SNP permet d’envisager la mise en place de cette méthodologie chez le porc. Dans cette espèce, les perspectives les plusintéressantes de l’évaluation génomique semblent être la possibilité d’améliorer les populations pour des caractères non mesurablesen routine, d’augmenter la précision des valeurs génétiques estimées, et de sélectionner les individus de l’étage de sélection pour leurvaleur en croisement et en milieu de production. Les coûts de mise en oeuvre d’une sélection génomique chez le porc seraient élevés,en raison principalement de la taille des populations de référence nécessaires à une évaluation précise, du nombre élevé de candidatsà génotyper, et de la variété des populations et lignées sélectionnées. Le partage de ressources entre Organisations de Sélection et lerecours aux techniques d’imputation génotypiques permettraient de maîtriser ces coûts.
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