Thèses : « Maladies bactériennes – Lutte contre »

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Riffaud, Christine. "La bactériose du melon : écologie et stratégies de lutte contre Pseudomonas syringae pv. aptata." Lyon 1, 2002. http://www.theses.fr/2002LYO10017.

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Résumé :

La bactériose du melon, causée par Pseudomonas syringae pv. Aptata, est une maladie importante dans le Sud-Ouest de la France, avec des foyers éphémères dans le Sud-Est, entraînant des pertes économiques significatives lorsque les conditions sont favorables. L'optimisation de la lutte implique l'identification des réservoirs d'inoculum, une meilleure connaissance de la survie des bactéries en phase épiphyte et la recherche de sources de résistance au sein de l'espèce Cucumis melo. Cette étude a consisté à la mise au point d'une technique de détection et de son application pour détecter P. Syringae pv. Aptata dans des sources potentielles de contamination dans lesquelles la bactérie est capable de survivre en l'absence de culture de melon. Les résultats ont montré que P. Syringae pv. Aptata est présent naturellement à de faible fréquence dans les lacs collinaires servant à l'irrigation des cultures de melon pendant la période hivernale. De même, une étude en contamination artificielle a permis de montrer que P. Syringae pv. Aptata est capable de survivre dans le sol en association avec des déchets de culture. L'effet de la phase épiphyte sur les modifications phénotypiques des cellulus de P. Syringae pv. Aptata a été étudié. Les résultats montrent que P. Syringae pv. Aptata est capable de s'adapter lors de la colonisation épiphyte, en réduisant sa taille et en augmentant sa résistance à un oxydant, par rapport à une culture sur milieu synthétique. Nous avons également recherché les sources de résistance chez l'espèce Cucumis melo. Un génotype dont les fruits sont résistants à P. Syringae pv. Aptata a été trouvé parmi la collection de C. Melo. En revanche, les parties végétatives de tous les 282 génotypes testés sont sensibles à cet agent pathogène. L'ensemble des résultats obtenus permettra d'orienter les recherches vers des stratégies de contrôle plus efficaces contre cette nouvelle maladie en focalisant dans un premier temps sur les facteurs conduisant à la modification du phénotype de P. Syringae pv. Aptata en phase épiphyte et dans un second temps sur la détermination de l'importance épidémologique des différentes sources d'inoculum.

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Lavigne, Jean-Philippe. "Lutte contre les infections bactériennes : de l'optimisation de l'administration d'antibiotiques à l'étude d'un modèle de virulence (Brucella suis)." Montpellier 1, 2004. http://www.theses.fr/2004MON1T015.

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Résumé :

POUR LUTTER CONTRE LA PROGRESSION DE LA RESISTANCE BACTERIENNE, DIFFERENTES ACTIONS ONT ETE MENEES AU NIVEAU DE CHAQUE CENTRE HOSPITALIER : DES ETUDES SUR L'ECOLOGIE BACTERIENNE LOCALE OU SUR LA TRANSMISSION DES BACTERIES MULTI-RESISTANTES, DES FORMATIONS RENFORCEES DE PERSONNELS INFIRMIERS. . . PAR AILLEURS, LE MINISTERE ENCOURAGE LES PROGRAMMES DE RECHERCHE BASES SUR LA DECOUVERTE DE NOUVEAUX TRAITEMENTS ANTI-BACTERIENS. CETTE THESE S'INSCRIT DANS CES OBJECTIFS. DANS LE BUT D'UNE MEILLEURE UTILISATION DES ANTIBIOTIQUES, CE TRAVAIL A PERMIS D'OPTIMISER L'ADMINISTRATION DE 2 ANTIBIOTIQUES (CEFTAZIDIME ET SULBACTAM) SUR DES SOUCHES D'ENTEROBACTERIES SECRETRICES DE ß-LACTAMASES A SPECTRE ETENDU. PAR AILLEURS, TROUVER DE NOUVELLES CIBLES NECESSITENT UNE MEILLEURE COMPREHENSION DES STRATEGIES UTILISEES PAR LES BACTERIES POUR PROVOQUER LA MALADIE. L'OBJECTIF N'EST PLUS FORCEMENT DE TUER LA BACTERIE, MAIS PLUTOT DE LA DESARMER. L'ETUDE DES SYSTEMES DE SECRETIONS ET DES PROTEINES EFFECTRICES CONSTITUE UN DES ENJEUX MAJEURS DANS LA COMPREHENSION DE LA VIRULENCE BACTERIENNE. NOUS AVONS UTILISE DANS CE BUT LE MODELE DE VIRULENCE, BRUCELLA SUIS, UN BACILLE A GRAM NEGATIF, QUI SURVIT ET SE MULTIPLIE AU SEIN DES CELLULES INFLAMMATOIRES TELLES QUE LES MACROPHAGES. AU COURS DE NOTRE TRAVAIL, NOUS AVONS MIS AU POINT UNE NOUVELLE STRATEGIE POUR IDENTIFIER LES PROTEINES SECRETEES PAR BRUCELLA DANS LE CYTOPLASME DES CELLULES PHAGOCYTAIRES, BASEE SUR LA SECRETION D'HYBRIDES OBTENUS PAR FUSION DE PROTEINES DE B. SUIS AVEC LA TOXINE YopP DE YERSINIA ENTEROCOLITICA. NOUS AVONS IDENTIFIE UNE NOUVELLE PROTEINE, BvfA (BRUCELLA VIRULENCE FACTOR A), QUI PRESENTE LES PROPRIETES ATTENDUES POUR UN FACTEUR DE VIRULENCE MAJEUR EN RELATION AVEC LE SEUL SYSTEME DE SECRETION CONNU CHEZ BRUCELLA, VirB : I) COMPORTEMENT DE MUTANT KNOCKOUT DE bvfA SIMILAIRE A CELUI DU MUTANT virB DURANT L'INFECTION INTRACELLULAIRE IN VITRO ET IN VIVO, II) CO-REGULATION DE L'EXPRESSION DE bvfA AVEC CELLE DE L'OPERON virB DURANT LA PERIODE D'ACIDIFICATION DU PHAGOSOME. DE PLUS, NOUS AVONS IDENTIFIE UNE NOUVELLE VOIE DE SORTIE DES PROTEINES RECEMMENT DECRITE CHEZ PSEUDOMONAS AERUGINOSA, LE SYSTEME TWIN-ARGININE TRANSLOCATION. DANS L'AVENIR, NOUS POUVONS IMAGINER QUE LE DEVELOPPEMENT DE NOUVELLES MOLECULES ANTIBACTERIENNES AURA POUR BUT DE CIBLER DES SYSTEMES DE SECRETIONS OU DES MOLECULES EFFECTRICES OU D'OPTIMISER L'ADMINISTRATION DES ANTIBIOTIQUES. CES DECOUVERTES AURONT DES RETOMBEES SUR LE TRAITEMENT DE PLUSIEURS BACTERIES PATHOGENES D'IMPORTANCE MAJEURE.

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Bernatchez, Alex. "Étude des propriétés antibactériennes de composés d'huiles essentielles contre des agents pathogènes d'aquaculture." Master's thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/40301.

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Résumé :

L’aquaculture est à la base de l’alimentation de nombreux pays orientaux où la demande croît constamment. Afin de répondre aux besoins alimentaires de la population, les aquaculteurs doivent souvent élever le poisson dans des conditions extrêmes et stressantes pour l’animal. Conséquemment, le système immunitaire des poissons est diminué et les infections bactériennes deviennent fréquentes. Plusieurs traitements antibactériens sont à la disposition des aquaculteurs, mais ceux-ci sont rarement souhaitables comme ils ont souvent une faible efficacité ou peuvent stresser davantage les individus élevés. Ainsi, l’investigation de nouveaux agents antibactériens potentiels est cruciale. La communauté scientifique s’est éveillée dans les dernières années aux propriétés antibactériennes, antifongiques et antivirales des huiles essentielles et de leurs composantes. Dans la présente étude, neuf composantes retrouvées dans différentes huiles essentielles ont été évaluées face à quatre des agents pathogènes les plus répandus en aquaculture, soit Aeromonas salmonicida, Flavobacterium columnare, Streptococcus iniae et Vibrio parahaemolyticus. La concentration minimale inhibitrice des neuf molécules a été déterminée, démontrant la cinnamaldéhyde comme étant le meilleur agent antibactérien parmi celles-ci. Des combinaisons de molécules ayant inhibé la croissance bactérienne n’ont pas démontré d’effet synergique lorsque combinées ensemble. La microscopie électronique à transmission a été utilisée pour observer les altérations visibles de la membrane bactérienne et des structures extracellulaires chez S. iniae après exposition à la cinnamaldéhyde. Aucune différence visible n’était observable entre les bactéries exposées et non exposées à la cinnamaldéhyde. La capacité de la cinnamaldéhyde à inhiber la formation de biofilm a été évaluée par coloration au cristal violet. Les résultats observés suggèrent que cette molécule peut affecter négativement la formation de biofilm de certaines bactéries à l’étude. À la lumière des résultats de cette étude, la cinnamaldéhyde semble être un agent antibactérien d’intérêt dans le traitement ou la prévention d’infections bactériennes en aquaculture.

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Guerinot, Cassandra. "Conception bio-inspirée d'architectures moléculaires amphiphiles pour combattre les infections bactériennes." Electronic Thesis or Diss., Université Clermont Auvergne (2021-...), 2024. http://theses.bu.uca.fr/nondiff/2024UCFA0085_GUERINOT.pdf.

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Résumé :

Les peptides antimicrobiens (PAMs) sont considérés comme des composants clés du système immunitaire inné. Leur intérêt repose sur leur large spectre d'activités et leur faible propension à induire des résistances bactériennes, faisant d'eux une bonne alternative aux antibiotiques actuels. Malheureusement, leur utilisation thérapeutique est souvent entravée par une mauvaise pharmacocinétique et un coût élevé. Toutefois, les PAMs sont une grande source de bio-inspiration pour le développement de peptidomimétiques, conçus pour reproduire le mécanisme d'action des PAMs tout en améliorant le profil thérapeutique. L'objectif de cette thèse est donc de concevoir une variété d'architectures amphiphiles cationiques de type peptoïde (oligomère de glycines N-substituées), inspirées de la structure des PAMs cationiques, puis d'étudier leur potentiel antimicrobien sur un large panel de bactéries à l'état planctonique, sous forme de biofilms ou sanctuarisées à l'intérieur de cellules. Les architectures amphiphiles cationiques ont été conçu en exploitant les chaines latérales de type triazolium, capables d'induire un fort effet cis-directionnel sur les amides du squelette et d'apporter la charge cationique nécessaire. Ce manuscrit détaille les stratégies de synthèse mises au point pour obtenir des peptoïdes linéaires présentant une architecture hélicoïdale de type PolyProline I ainsi que des peptoïdes macrocycliques conçus pour favoriser une architecture amphiphile faciale. L'évaluation de leurs activités antibactériennes et de leur sélectivité est présentée et a permis de mettre en avant les paramètres structuraux importants et l'optimisation des séquences. Une partie de ce travail a également été consacrée à la conception de peptoïdes ciblant des bactéries capables de se sanctuariser à l'intérieur de cellules humaines, grâce à l'insertion de chaines latérales favorisant la pénétration cellulaire Antimicrobial peptides (AMPs) are considered as key components of the innate immune system. Their interest is based on their broad spectrum of activities and their low propensity to induce bacterial resistance, making them a good alternative to current antibiotics. Unfortunately, their direct therapeutic use is often hampered by poor pharmacokinetics and high cost. However, AMPs are a great source of bio-inspiration for the development of peptidomimetics, designed to reproduce the mechanism of action of AMPs while improving the therapeutic profile. The aim of this thesis is therefore to design a variety of amphiphilic cationic peptoid architectures (oligomers of N-substituted glycines), inspired by the structure of cationic AMPs, and to study their antimicrobial potential on a wide panel of bacteria in the planktonic state, in biofilm form or sanctuarized inside cells. Cationic amphiphilic architectures have been designed by exploiting triazolium-type side chains, capable of inducing a strong cis-directional effect on backbone amides and providing the necessary cationic charge. This manuscript details the synthetic strategies developed to obtain linear peptoids exhibiting a PolyProline I-type helical architecture, as well as macrocyclic peptoids designed to promote a facial amphiphilic architecture. Evaluation of their antibacterial activity and selectivity is presented, highlighting important structural parameters and sequence optimization. Part of this work was also focused on the design of peptoids targeting bacteria with the ability to sanctuary themselves inside human cells, thanks to the insertion of side chains promoting cell penetration

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Tremblay, Vanessa. "Évaluation de différents extraits végétaux et sels organiques et inorganiques pour lutter contre la tache bactérienne de la laitue." Master's thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/34485.

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La tache bactérienne (Xanthomonas campestris pv. vitians) cause d’importantes pertes économiques dans la culture de la laitue (Lactuca sativa) lorsque les conditions sont propices à son développement. Un seul produit étant homologué au Canada contre cette maladie, peu d’options s’offrent aux producteurs pour lutter contre cette dernière. Cette étude avait pour objectif d’évaluer différents sels (benzoate de sodium, bicarbonate de sodium, carbonate de sodium, métabisulfite de sodium et sorbate de potassium) et extraits végétaux à base de feuilles de chêne (Quercus rubra), choux frisés (Brassica oleracea var. sabellica) et clous de girofle (Syzygium aromaticum) pour lutter contre la tache bactérienne. Sur la base des concentrations bactéricides minimales (CBMs), les sels se sont avérés plus toxiques envers X. campestris pv. vitians que les extraits végétaux avec des valeurs de CBM inférieures. Parmi les extraits végétaux testés, les extraits à l’éthanol de feuilles de chêne et les extraits de clous de girofle se sont révélés les plus toxiques envers la bactérie. Le bioessai I a montré l’efficacité du carbonate de sodium et du benzoate de sodium à réprimer la maladie en présence d’une pression de maladie faible à modérée. De même, différents extraits de clous de girofle, feuilles de chêne et choux frisés (en combinaison ou non avec un sel) ont permis une réduction marquée de la maladie lors des bioessais II et III. En présence d’une forte pression de maladie (bioessai IV), aucun des traitements ayant causé une réduction intéressante de la tache bactérienne lors des essais I, II et III n’a toutefois mené à une réduction suffisamment importante de la maladie pour permettre la commercialisation des laitues. Plusieurs extraits végétaux et sels ont montré au cours de cette étude un potentiel prophylactique intéressant qui pourrait éventuellement être exploité dans un programme de lutte intégrée contre la tache bactérienne de la laitue.

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Haidar, Rana. "Caractérisation, criblage et mise en oeuvre de souches bactériennes issues du vignoble bordelais pour la lutte biologique contre les champignons impliqués dans la Pourriture grise et l'Esca de la vigne." Thesis, Bordeaux, 2016. http://www.theses.fr/2016BORD0155/document.

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Contre la pourriture grise et les maladies du bois (MdBs), qui sont des maladies cryptogamiques majeures de la vigne, la lutte biologique a un potentiel de développement considérable dans le contexte actuel de réduction des intrants chimiques en viticulture.L’objectif de cette thèse est de sélectionner et d'étudier des souches bactériennes antagonistes de Botrytis cinerea (Pourriture grise) et de deux champignons pathogènes clefs liés aux MdBs: Phaeomoniella chlamydospora et Neofusicoccum parvum. Les expériences de screening principales sont réalisées in vivo et in planta sur 46 souches bactériennes isolées dans le vignoble bordelais. Le niveau de protection par les souches antagonistes dépend significativement de la souche bactérienne, de l’espèce de champignon pathogène ciblée, du tissu ou organe végétal hôte, mais aussi pour N. parvum, du mode d’application de la souche bactérienne et, pour B. cinerea, du génotype lié aux transposons : transposa ou vacuma.Une réduction significative de 40 à 64% de la taille des nécroses dues à P. chlamydospora et/ou N. parvum est induite par trois souches bactériennes Pantoea agglomerans (S1), Paenibacillus sp. (S19) et Bacillus pumilus (S32) sur des boutures de vigne non greffées. Ces souches ont fait l'objet d'investigations approfondies pour déterminer leurs principaux modes d’action : Antibiose, production de composés volatils qui ont été identifiés et/ou induction de différents gènes de défense de la vigne.Concernant B. cinerea, les souches Enterobacter cowanii (S22), Enterobacter sp. (S23), Bacillus ginsengihumi (S38) et Bacillus sp. (S43, S46) présentent un pouvoir antagoniste important par production de composés volatils et diffusibles anti-Botrytis, ainsi que par compétition pour les nutriments par E. cowanii (S22) Biological control of gray mold and grapevine trunk diseases (GTDs), which are major fungal diseases of grapevine, has a considerable potential development in the current context of reduction of chemical input in viticulture.The aim of this study was to select and study bacterial strains for antagonism against Botrytis cinerea, the causal agent of gray mold, and two key pathogens involved in GTDs: Phaeomoniella chlamydospora and Neofusicoccum parvum. The main screening experiments for antagonistic activity of 46 bacterial strains, isolated from Bordeaux vineyards, have been carried out under different in vivo and in planta conditions. The efficacy of protection by the antagonistic strains significantly depended on the bacterial strain, the targeted pathogen species, the host plant tissue or organ and, for N. parvum, also on the application mode of the bacterial strain and, for B. cinerea, on the transposon genotype: transposa or vacuma.A significant reduction in length of necrosis due to P. chlamydospora and/or N. parvum, ranging between 40 and 64% in non-grafted vine cuttings, resulted from three bacterial strains: Pantoea agglomerans (S1), Paenibacillus sp. (S19) and Bacillus pumilus (S32). These strains were thoroughly further investigated to determine their major modes of action by i) Antibiosis ii) production of antifungal volatile organic compounds, which have been identified, and/or iii) induction of different grapevine defense genes. Concerning B. cinerea, Enterobacter cowanii (S22), Enterobacter sp. (S23) Bacillus ginsengihumi (S38), Bacillus sp. (S43, S46) were of prime importance in the biocontrol by producing anti-Botrytis volatile and diffusible compounds or by competing for nutrients (case of E. cowanii S22)

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Pruvost, Olivier. "La maladie des taches noires de la mangue (Xanthomonas campestris pv. Mangiferaeindicae) : étude bactériologique, biologique, épidémiologique et mise au point des bases d'un système de lutte intégrée dans les confitions de l' Île de la Réunion." Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112020.

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Résumé :

Une étude approfondie de l'agent causal de la maladie des tâches noires de la mangue (Xanthononas campestris pv. Mangiferaeindicae) a permis de mettre en évidence une assez large variabilité des caractères métaboliques, sérologiques, de la sensibilité à une gamme de bactériophages, d'antibiotiques ou de sels de métaux lourds et du contenu plasmidique des 94 isolats étudiés. Une variabilité existe également en ce qui concerne le pouvoir pathogène sur différentes plantes hôte. L'étude des caractéristiques biologiques et épidémiologiques de l'agent pathogène dans les conditions de l'ile de la réunion a permis de mettre en évidence les périodes de sensibilité et réceptivité des tissus de l'hôte et l'influence des paramètres climatologiques sur leur développement. Une survie épiphyte de l'agent pathogène a été démontrer sur feuilles, bourgeons et jeunes fruits. Les modalités de sa dissémination ont été précisées. L'efficacité de différentes formulations chimiques a été étudiée. Des résultats encourageants concernant les possibilités de lutte biologique par utilisation de souches de Bacillus subtilis ou B. Amyloliquefaciens antagonistes ont été obtenus An extensive study was undertaken to characterize 94 isolates of Xanthomonas campestris pv. Mangiferaeindicae responsible for bacterial black spot of mangoes. Studies on carbohydrates assimilation, susceptibility to antibiotics and to heavy metal salts, serotyping and phage-typing, plasmid patterns as well as to pathogenicity to several hosts have revealed a large variability within the isolates. Biological and epidemiological studies of the pathogen under Reunion Island conditions have allowed us to establish susceptibility and receptivity periods of host tissues and their relations to climatic conditions. The pathogen is able to survive as an epiphyte on leaves, buds and immature fruit. Its mode of spread has been studied. Chemical and biological disease control were evaluated and resuls show that disease control may be achieved by using an antagonistic strain of Bacillus subtilis or B. Amyloliquefaciens

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Selmi, Hela. "Effet de l'ajout de biochar sur la symbiose tripartite Ensifer meliloti-Rhizophagus irregularis-luzerne (Medicago sativa L.), sur la production d'inocula bactériens et envers la lutte aux agents pathogènes." Master's thesis, Université Laval, 2016. http://hdl.handle.net/20.500.11794/26598.

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Résumé :

L’agriculture durable repose sur l’utilisation de moins d’intrants chimiques et favorise l’utilisation des produits biologiques comme le biochar. Ce dernier, à certaines doses, peut stimuler la fixation biologique d’azote chez les légumineuses. Notre projet vise à étudier l’effet d’un biochar de copeaux de pin pyrolysés à 700 ºC sur la symbiose tripartite Ensifer meliloti-Rhizophagus irregularis-Medicago sativa L., sur la production d’inocula bactériens et envers la lutte contre les agents pathogènes. Une culture de luzerne inoculée avec deux E. meliloti A2 et S14, en présence du Rhizophagus irregularis et dans un sol amendé avec 0, 15 ou 30 % de biochar (v:v) a été réalisée. Une stimulation significative de la mycorhization a été observée en présence de 15 % de biochar, et des souches A2 et S14. Par contre, l’inoculation de la luzerne avec A2 ou S14 n’a pas eu d’effet significatif sur les rendements, indiquant la présence dans le sol de souches efficaces d’E. meliloti. Une étude portant sur la survie des rhizobiums et du Bacillus subtilis MBI 600 menée pendant 120 jours à 4 et 25 °C. Elle a montré que 15 % de biochar favorise significativement la survie des cellules de rhizobiums. Par contre, pour Bacillus subtilis c’est le Pro-mix à 100 % qui supporte mieux la survie des cellules. Ainsi, l’effet de biochar sur la survie des microorganismes dépend de la nature de ces derniers et de la dose utilisée. L’étude de l’effet des trois doses du biochar sur les agents pathogènes a montré qu’à forte dose il pourrait favoriser le développement des pathogènes. Les résultats apportent des pistes pour les modalités d’application de biochar en agriculture. Par contre, notre étude est réalisée avec un seul type de biochar à trois doses. Il sera donc très important de tester d’autres types ainsi que d’autres doses de biochar. Sustainable agriculture is based on the use of less chemical inputs and promotes the use of biological products such as biochar. Many studies clearly indicate that some biochars can stimulate biological nitrogen fixation in legumes. Our project aims to study the effect of a biochar (Pines, 700ºC) on the tripartite symbiosis Ensifer meliloti-Rhizophagus irregularis-Medicago sativa L., on the production of bacterial inocula and on the fight against pathogens. A culture of alfalfa inoculated with two strains of E. meliloti A2 or S14, in the presence of Rhizophagus irregularis and in a soil amended with 0, 15 or 30% of biochar (vol:vol) was conducted. A significant stimulation of mycorrhization was observed in the presence of 15% biochar and A2 or S14. However, inoculation of alfalfa with A2 or S14 had no significant effect on yields, indicating the presence in soil of effective strains of E. meliloti. A study on survival of rhizobia and Bacillus subtilis MBI 600 at 4°C and 25°C was conducted for 120 days. It showed that biochar (15%, vol:vol) promotes significantly the survival of rhizobial cells but for Bacillus subtilis it is the Pro-mix without biochar which supports better cell survival. Thus, the biochar effect on survival of microorganisms depends on the dose of biochar used. The effect of biochar amendments on P. ultimum and FORL colonization and infection was also evaluated. The study of the effect of three doses of biochar (0, 15, 30%; vol:vol) on pathogens showed that high doses may offer a good environment for pathogens development. Our study was performed using a single type of biochar with three doses. Therefore, it is very important to test other types and doses of biochar to be able to make recommendations.

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Alaphilippe, Aude. "Effets secondaires de l'utilisation d'un agent de lutte biologique : rôle des metabolites primaires de surfaces des feuilles dans l'interaction entre l'agent de lutte biologique et Cydia pomonella L." Paris, AgroParisTech, 2008. http://www.theses.fr/2008AGPT0039.

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Portrait, Véronique. "Contribution à la lutte contre la contamination salmonellique des volailles par l'administration de souches bactériennes à activité anti-Salmonella." La Rochelle, 1999. http://www.theses.fr/1999LAROS171.

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Masih, Emmanuel Isaac. "Lutte biologique contre Botrytis cinerea, agent de la pourriture grise de la vigne." Dijon, 2005. http://www.theses.fr/2005DIJOS049.

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Résumé :

La pourriture grise provoquée par Botrytis cinerea est une des maladies les plus importantes de la vigne. L'utilisation intense de traitements chimiques a conduit à la pollution environnementale et au développement de souches résistantes aux fongicides. Ce travail a permis de montrer le pouvoir antagoniste de bactéries, de levures et/ou d'oomycètes du genre Pythium contre B. Cinerea Après avoir sélectionné et identifié les microorganismes antagonistes, l'étude de leur mode d'action a été entreprise. En particulier, les activités enzymatiques et /ou élicitrices ont été étudiées pour les antagonistes retenus. Une relation entre le pouvoir antagoniste et les activités enzymatiques a été montrée et la synthèse, par les souches de Pythium, d'élicitines a été mise en évidence. Elle est en relation avec le déclenchement des mécanismes de défense de la vigne. L'utilisation des antagonistes comme agents de biocontrôle pourrait donc être envisagée pour améliorer la lutte contre Botrytis cinerea Grey mould disease caused by Botrytis cinerea is one of the most important diseases of the grapevine. The intensive use of the chemical products to irradicate the grey mould disease resulted in environmental pollution, and appearence of the resistant varieties of the pathogen. This study of research showed the antagonism between the B. Cinerea and the bacteria and yeast, and the different isolates of the genus Pythium. The selected antagonistic microbes to Botrytis cinerea, were identified using morphological as well as genetical tools and the study of their mode of action was initiated. The enzymatic activities and the elicitation capability were also studied. These activities have a direct relationship with the trigerring of the natural defence mechanisms of the grapevine. In the following context, the use of the selected micorobes as biocontrol agents can be undertaken for the effective control of Botrytis cinerea

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Capini, Christelle. "Immunisation active anti-cytokine dans la lutte contre les maladies auto-immunes." Paris 6, 2003. http://www.theses.fr/2003PA066395.

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Ngo, Chung Thuy. "Capacité vectorielle des populations d’Anopheles dans la co-transmission de Plasmodium et Wuchereria bancrofti et biodiversité bactérienne de l’estomac des moustiques du centre-sud Vietnam." Thesis, Montpellier 1, 2014. http://www.theses.fr/2014MON13501/document.

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Résumé :

Au Vietnam, malgré les succès du gouvernement dans la lutte contre le paludisme, cette maladie persiste en zones forestières, le long des frontières internationales, en particulier avec le Cambodge, et très peu de données sont disponibles sur la filariose lymphatique de Bancroft (FLB). Aucun vaccin n'étant actuellement disponible, la lutte antivectorielle ciblant les Anopheles, moustiques qui peuvent être vecteurs d'agents du paludisme et de la FLB, reste un des éléments clés pour mieux contrôler ces deux maladies. Toutefois, une meilleure connaissance des vecteurs présents en zones endémiques et l'étude de leur capacité vectorielle s'imposaient compte tenu du manque d'information sur la transmission de ces 2 maladies dans la région centre-sud du Vietnam. La capacité vectorielle étant fortement liée à la flore bactérienne de l'estomac des moustiques, sa biodiversité a été estimée afin de mieux appréhender les familles bactériennes présentes chez les moustiques de terrain, en particulier la présence d'Enterobacteriaceae qui peut avoir une influence sur la résistance des anophèles au développement de Plasmodium, agent du paludisme. Ce champ d'investigation n'avait encore jamais été étudié chez les vecteurs du paludisme au Vietnam.Cette thèse porte sur 2 objectifs principaux : (1) l'évaluation de la capacité vectorielle des espèces d'Anopheles dans la co-transmission de Plasmodium spp. et de Wuchereria bancrofti (agent de la FLB) dans la Province de Dak Nong et de Binh Phuoc du centre-sud Vietnam (à la frontière avec le Cambodge) et (2) l'estimation de la biodiversité de la flore bactérienne de l'estomac de populations d'Anopheles du centre-sud Vietnam et l'évaluation de l'influence de certaines bactéries sur la capacité vectorielle des espèces d'Anopheles. L'identification morphologique et moléculaire des spécimens d'Anopheles collectés dans les sites d'étude nous a permis d'appréhender et de mieux connaître la faune anophélienne du centre-sud Vietnam avec la présence de 24 taxa, dont des vecteurs primaires et secondaires. Les espèces dominantes sont Anopheles dirus (48,2%), An. maculatus (19,1%) et An. minimus (9,8%), trois vecteurs majeurs du paludisme et de la FLB. Pour la première fois au Vietnam, la présence d'An. scanloni, une des 8 espèces du Complexe Dirus et vecteur du paludisme en Thaïlande, a été montrée et confirmée après son identification par techniques moléculaires et séquençage. La relation taxonomique entre An. crawfordi et An. dangi, une espèce nommée de façon informelle au Vietnam en 1987, est clarifiée grâce à une étude phylogénétique qui nous a permis d'établir qu'An. dangi est un variant morphologique d'An. crawfordi.Le taux d'infection parasitaire des anophèles a été analysé grâce à des approches PCR, en temps réel et conventionnelle, afin de déterminer la capacité vectorielle des espèces collectées. Parmi les 765 spécimens d'Anopheles étudiés, 2 spécimens dont 1 An. dirus et 1 An. pampanai, ont été trouvés infectés par P. vivax. Les taux d'infection sont de 0,26% sur l'ensemble de l'échantillon, de 0,41% pour la Province de Binh Phuoc et de 0,28% chez An. dirus et 20% chez An. pampanai. Aucun moustique n'a été trouvé infecté ni par P. falciparum, ni par P. knowlesi et ni par Wuchereria bancrofti. La flore bactérienne de l'estomac des anophèles a été analysée après application de 2 méthodes d'identification basées à la fois sur la culture et la PCR du gène 16S sur 200 abdomens d'anophèles de 11 espèces différentes. Les résultats montrent la présence de 116 genres bactériens, dont 18 genres communs, classés taxonomiquement dans 7 phyla dont Acidobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, Planctomycetes, Proteobacteria et Synergistetes. Le genre dominant de Dak Nong est Acinetobacter et celui de Binh Phuoc est Staphyloccocus. Acinetobacter est aussi dominant dans la communauté bactérienne de tous les spécimens d'Anopheles étudiés In Vietnam, despite the success of the Government in controlling malaria, the disease persists in forest areas along the international borders, especially with Cambodia, and few data are available on the Bancroftian lymphatic filariasis (BLF). No vaccine is currently available to protect from these two diseases, then vector control of Anopheles mosquitoes, that may transmit both malarial and BLF agents, remains one of the key element to control these two diseases. As there is a real lack of information on the transmission of these two diseases in south-central region of Vietnam, it was necessary to apprehend the vectors occurring in endemic areas and to study their vectorial capacity. As bacterial flora in Anopheles midgut may have a strong influence on the vectorial capacity of the mosquito, its biodiversity was estimated in order to better understand bacterial families present in mosquitoes from the field, in particular the presence of Enterobacteriaceae that can have an influence on the development of Plasmodium, agent of malaria. This field of investigation of bacteria has never studied in malaria vectors of Vietnam.This thesis focuses on two main objectives: (1) to evaluate the vectorial capacity of Anopheles species in the co-transmission of Plasmodium spp. and Wuchereria bancrofti (BLF agent) in the Provinces of Dak Nong and Binh Phuoc in south-central Vietnam (near the border with Cambodia), and (2) to estimate the biodiversity of the bacterial flora in the midgut of Anopheles populations of south-central Vietnam and evaluate the influence of certain bacteria on the vectorial capacity of Anopheles species.Morphological and molecular identification of Anopheles specimens collected in the study sites allowed us to apprehend and better understand the Anopheles fauna in south-central Vietnam composed of 24 taxa, including primary and secondary vectors. The dominant species were Anopheles dirus (48.2%), An. maculatus (19.1%) and An. minimus (9.8%), three major vectors of malaria and the BLF. For the first time, An. scanloni, one of the 8 species of Dirus Complex and malaria vector in Thailand, was collected in Vietnam and confirmed by molecular and sequencing techniques. The relationship between An. crawfordi and An. dangi, a species informally named in Vietnam in 1987, was clarified through a phylogenetic study that allows us to establish that An. dangi is a morphological variation of An. crawfordi.The parasites infection rate of Anopheles was investigated using both real-time PCR and conventional PCR to determine the vectorial capacity of the collected species. Of the 765 Anopheles specimens, 2 individuals, such as 1 An. dirus and 1 An. pampanai, were found infected by P. vivax. Then, the infection rates were of 0.26% on the total sample, 0.41% in Binh Phuoc, 0.28% for An. dirus, and 20% for An. pampanai. No mosquito was found infected by either P. falciparum, P. knowlesi or Wuchereria bancrofti.The bacterial flora in Anopheles midguts was analyzed using 2 identification methods based on culture and on 16S PCR-TTGE processed on 200 abdomens of 11 different Anopheles species. The results obtained showed the presence of 116 bacterial genera, including 18 common genera, belonging to 7 phyla such as Acidobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, Planctomycetes, Proteobacteria, and Synergistetes. The dominant genus in Dak Nong was Acinetobacter and Staphyloccocus in Binh Phuoc. Acinetobacter was dominant in the bacterial community of all studied Anopheles. The genus Enterobacter, which can influence the development of the Plasmodium, represented a prevalence of 1.7% of the microbiome of our specimens compared to 39.2% for the predominant genus Acinetobacter. This latter genus was significantly associated to Anopheles infected with Plasmodium vivax

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Pelat, Thibaut. "Obtention et ingénierie d'anticorps recombinants thérapeutiques et/ou prophylactiques dirigés contre les agents du risque biologique provoqué." Montpellier 2, 2009. http://www.theses.fr/2009MON20093.

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Résumé :

Les anticorps recombinants (Ac) de primates non humains (PNH) représentent une approche très prometteuse en vue de la prise en charge médicale d'agents du risque biologique provoqué (« armes biologiques »). Nous avons montré les avantages de cette approche et ses particularités méthodologiques. Un scFv neutralisant la toxine létale de B. Anthracis (2LF : KD= 1,02 nM), et dirigé contre la sous-unité « facteur létal », a été isolé à partir d'une banque immune de scFv de PNH exposée à la surface de phages, et caractérisé. Un autre scFv, 43RCA, neutralisant la ricine, a été isolé par la même technique puis évalué (en particulier : KD= 40 pM). Cette approche peut aussi s'appliquer à des pathogènes n'appartenant pas au risque biologique provoqué, puisqu'un scFv dirigé contre Aspergillus fumigatus a aussi été isolé (MS130i-IIIC3 : KD= 0,96 nM). Les outils d'analyse de séquences disponibles en ligne sur le site IMGT® ont permis de montrer la grande similarité de ces scFv avec leurs homologues humains. Des travaux d'ingénierie de fragments d'Ac ont aussi été réalisés, dont une maturation d'affinité in vitro (KD initial = 3,4 nM ; KD final = 0,18 nM). Une approche particulière de l'humanisation ("germline humanization") utilisant les régions charpentes (FR) d'IgM (rencontrés chez tous les sujets à la différence des FR d'IgG) et la standardisation IMGT® a été implémentée pour assurer une tolérance optimale de l'un de nos scFv. Des essais in vivo d'une IgG primatisée ont démontré ses capacités prophylactique et thérapeutique Recombinant antibodies isolated from non-human primates represent very promising medical countermeasures against bioweapons. The advantages and methodological aspects of this approach have been described. An scFv, neutralizing the lethal toxin of Bacillus anthracis (2LF: KD= 1. 02 nM) and directed against the “lethal factor” subunit was isolated from a phage-displayed immune library, and characterised. Another scFv, 43RCA, neutralizing ricin, was obtained with the same methodology and tested (in particular: KD= 40 pM). This approach may also be used beyond bioweapons, as an scFv directed toward Aspergillus fumigatus was also isolated (MS130i-IIIC3: KD= 0,96 nM). On-line sequence analysis with IMGT tools allowed to show the high degree of similarity between these scFvs and their human counterparts. Antibody fragments were engineered, including an in vitro affinity maturation (KD initial = 3. 4 nM; KD final = 0. 18 nM). Utilizing IMGT standardisation and on-line tools, a “germline humanization” - utilizing FR derived from IgM, encountered by every Human, as opposed to IgG FR - was realized in order to ensure an optimal tolerance for one of our scFvs. A primatized IgG was tested in vivo and showed therapeutic and prophylactic capacities

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Bourgouin, Catherine. "Les Toxines de Bacillus thuringiensis israelensis et de Bacillus sphaericus leur utilisation en lutte biologique contre les vecteurs de maladies tropicales /." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb376121877.

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Sy, Abdoul Aziz. "Lutte biologique contre la pyriculariose du riz (Pyricularia oryzae cav. ) : stratégie et applications." Toulouse, INPT, 1987. http://www.theses.fr/1987INPT025A.

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Résumé :

Quatre vingt douze microorganismes sont testes sous l'angle de leur aptitude a inhiber les formes d'expression predominantes (mycelium, conidies) de pyricularia oryzae cav. Et/ou le developpement de la pyriculariose foliaire au phytotron. In vitro, on observe jusqu'a 100% d'inhibition de la croissance mycelienne et de la germination conidienne du parasite tandis que le taux maximum d'inhibition de la conidiogenese est estime a 74%

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Tachapattaworakul, Thunwadee. "Optimisation de la culture et de la traçabilité de la culture de Trichoderma atroviride destiné à la lutte biologique." Montpellier 2, 2006. http://www.theses.fr/2006MON20076.

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Cacas, Jean-Luc. "Rôle des lipoxygénases et des lipides acyles-hydrolases de type patatine dans l'exécution du processus de mort cellulaire hypersensible chez les plantes." Aix-Marseille 2, 2006. http://www.theses.fr/2006AIX22010.

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Leroy, Valentin. "Décontamination des grains de blé et d'orge par traitements aux ultrasons." Master's thesis, Université Laval, 2017. http://hdl.handle.net/20.500.11794/27917.

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Résumé :

La production céréalière, plus particulièrement le blé et l'orge, subit des pertes importantes de rendement occasionnées par la fonte des semis et les pourritures racinaires. Deux champignons sont majoritairement responsables de ces maladies chez le blé et l'orge : Fusarium graminearum et Bipolaris sorokiniana. L'utilisation des ultrasons comme une alternative « verte » aux fongicides pourrait permettre une culture biologique et minimiser les pertes économiques. L'objectif principal de ce projet consistait à établir les paramètres optimaux (puissance des ultrasons, présence d'éthanol, débit d'oxygène et temps de traitement) afin de réduire la contamination par B. sorokiniana des grains de blé et d'orge sous un seuil de 30 % tout en conservant la germination supérieure au seuil de 85 %. L'ensemble du projet de recherche exploratoire a permis de vérifier l'efficacité de traitements novateurs pour le blé contaminé. Le traitement de ces lots de grains sous forme sèche a révélé un maintien de la germination pour tous les types de traitement (ultrasons 30 W, oxygène en bullage dans l'éthanol et les deux techniques combinées) ainsi qu'une réduction significative du taux de contamination par B. sorokiniana (en moyenne en dessous de 15 %). Pour l'orge, ces traitements semblables ont permis le maintien de la germination ainsi qu'une faible diminution de la contamination par B. sorokiniana. Cette nuance peut être expliquée par la morphologie différente des deux grains. Une réelle avancée dans le domaine du traitement des grains sous forme sèche peut être mise en évidence pour sa rapidité de traitement. Il restera à vérifier l'efficacité du traitement sur d'autres lots et sur des quantités plus importantes pour vérifier la mise à l'échelle du dispositif (supérieure à 100 g). Pour l'avenir, une étude se basant sur le microcalorimétrie sera préconisée pour étudier les prémisses de la germination des grains traités.

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Demeule, Elizabeth. "Effet répressif de Bacillus subtilis et de Bacillus pumilus envers Rhizoctonia solani sur tomate et concombre de serre." Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/66758.

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Résumé :

Les agents phytopathogènes telluriques constituent un problème majeur touchant les productions serricoles de concombre (Cucumis sativus L.) et de tomate (Solanum lycopersicum L.). Les traitements biologiques efficaces sont limités pour lutter contre ces agents pathogènes. Cette étude avait pour objectifs d’évaluer (1) l’effet antagoniste in vitro de Bacillus pumilus Meyer et Gottheil souche PTB180 et Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn souche PTB185 envers Rhizoctonia solani J.G. Kühn, Pythium ultimum Trow, Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary, Phytophthora capsici Leonian, Fusarium oxysporum Schltdl. et F. oxysporum f.sp. radicis-lycopersici Jarvis & Shoemaker, (2) l’effet répresseur d’une application préventive des bactéries sur la pourriture du collet et la fonte des semis causées par R. solani, sur concombre ou tomate en serre et (3) l’effet des bactéries sur la croissance et la productivité des plants de tomate cultivés en serre. Lors des essais in vitro, PTB180 et PTB185, utilisés seuls et en mélange (1:1), ont fortement inhibé la croissance mycélienne des six agents phytopathogènes. Sur plantules de concombre et de tomate, le mélange (1:1) des deux souches a permis une réduction significative (p<0,05) de la sévérité des symptômes de la pourriture du collet. PTB185 et le mélange (1:1) des deux souches ont augmenté significativement la hauteur et la masse sèche des plants infectés par R. solani. Les essais sur graines de tomate montrent que PTB180 a augmenté significativement le taux de levée des graines et que PTB185 a réduit significativement la mortalité post-levée tout en favorisant la croissance des plantules. Les tests réalisés sur plants de tomate sains n’ont pas montré d’effet significatif de PTB180 et PTB185 sur la croissance et la productivité des plants. Les bactéries à l’étude pourraient éventuellement représenter une alternative aux fongicides de synthèse pour lutter contre les agents phytopathogènes.

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Mousques, Adeline. "Mise en évidence d'une nouvelle substance antifongique produite par une souche de Pseudomonas cepacia isolée du sol : action sur Botrytis Cinerea." Bordeaux 2, 1996. http://www.theses.fr/1996BOR20446.

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Résumé :

La pourriture provoquée par le champignon phytopathogène Botrytis cinerea représente un coût économique considérable en viticulture et dans de nombreuses cultures. Les moyens de lutte chimique actuels sont rendus insuffisants par l'émergence de souches résistantes. Des voies alternatives de traitement, telle que la lutte biologique sont donc envisagées. Une souche de Pseudomonas cepacia BA1. 92, isolée du sol manifeste un fort pouvoir antifongique à l'égard du champignon. Son action se traduit par une dégénérescence progressive des extrémités en croissance du mycélium. Cette dégradation semble liée à la fixation du principe actif sur certains constituants, vraisemblablement protéiques à la paroi fongique. La phase initiale de dépôt des microfibrilles de chitine (polymère de structure) observée lors de la néoformation de la paroi des protoplastes, est profondément pertubée par l'action du métabolite bactérien. Cette altération s'accompagne également d'un dérèglement important de l'activité secrétoire qui se manifeste par un relargage massif des protéines dans le milieu extérieur et une multiplication intracellaire de vésicules de type secrétoire. La stabilité à l'égard de la lumière, la polarité élevée, la composante osidique et le pois moléculaire de 662 Da, du composé responsable de l'activité antifongique, attestent de son originalité parmi les métabolites secondaires des bactéries du genre Pseudomonas déjà connus. Par ailleurs, d'autres agents de maladies cryptogramiques notamment les champignons responsables de l'Esca et de l'Eutypiose, sont sensibles in vitro à son action. Néanmoins ce métabolite est sans effet sur les levures œnologiques et les bactéries impliquées dans l'élaboration du vin.

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Malembic, Sylvie. "Evaluation de la stratégie planticorps comme méthode de lutte contre les mollicutes phytopathogènes : Action in vitro d'anticorps recombinants sur Spiroplasma citri : Résistance de tabacs exprimant des anticorps recombinants à l'infection par le phytoplasme du stolbur." Bordeaux 2, 2001. http://www.theses.fr/2001BOR28900.

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Résumé :

Les phytoplasmes, bactéries phytopathogènes sans paroi de la classe des mollicutes, sont localisés exclusivement dans le phloème et ont résisté à la mise en culture. Responsables de nombreuses maladies de plantes, aucun moyen de lutte curative n'existe à ce jour. Une strátégie de lutte par transgénèse a été entreprise au laboratoire. Elle consiste à exprimer une immunoglobuline Ig) recombinante de type scFv spécifique du phytoplasme du stolbur, dans le tabac, hôte du phytoplasme. Afin d'évaluer l'efficacité de cette stratégie, nous avons étudié l'action des Ig sur le mollicute phytopathogène cultivé Spiroplasma citri. Nous avons montré que, tant les Ig natives que les scFv, dirigés contre la protéine majeure de sa surface, inhibent la multiplication de ce microorganisme. Nous avons ensuite réalisé l'ingénierie de scFv anti-stolbur pour leur expression dans le tabac suivant les voies d'adressage apoplastique (tabacs 35-pel-scFv et RSS-scFv-KD), afin d'évaluer la production des anticorps dans la sève élaborée où sont localisés les phytoplasmes. Nous avons mis en évidence que les tabacs 35-pel-scFv produisent les scFv en quantité importante mais ne montrent qu'une résistance transitoire à la maladie, les anticorps n'étant probablement pas ou peu adressés vers la sève élaborée. En effet, il a été récemment montré que les protéines de la sève sont produites dans le cytoplasme des cellules compagnes pour transiter via les plasmodesmes vers le tube criblé. Les tabacs pour lesquels l'expression du scFv est ciblée vers le cytoplasme de façon constitutive (35-scFv) ou spécifiquement dans les tissus du phloème (RSS-scFv-KD), malgré un bon niveau de transcription des ARNm du scFv, ne produisent pas d'anticorps détectables et résistent peu à la maladie. Les anticorps sont donc efficaces in vitro pour inhiber la croissance des mollicutes phytopathogènes, mais leur ciblage vers la sève élaborée s'avère difficile. Différentes stratégies envisagées pour optimiser ce ciblage sont discutées Phytoplasmas are phloem-restricted wall-less bacteria of the class mollicutes which have resisted in vitro cultivation so far. They are responsible for numerous plant diseases and there is no curative method for disease control. An antibody-based resistance method is evaluated in our laboratory for the stolbur phytoplasma. It consists in expressing scFv recombinant immunoglobulins (Ig) specific for this phytoplasma in tobacco plants, natural hosts for this pathogen. First we demonstrated that both native Ig and recombinant scFv, specific for the major surface protein of the culturable phytopathogenic mollicute Spiroplasma citri, inhibit its growth in vitro. Secondly, we engineered various anti-stolbur scFv constructions for their expression in tobacco plants via the apoplastic (35-pel-scFv plants) or symplasmic (35-scFv and RSS-scFv-KD) pathway, to evaluate their production into the phloem sap were phytoplasmas are located. Our results indicate that scFv, although produced in large amounts in 35-pel-scFv tobaccos, were probably not, or only slightly, present in the phloem sap. Only a transient disease resistance was observed in these plants. Indeed, it has been recently demonstrated that many phloem sap proteins are produced in the cytoplasm of companion cells and that they move towards sieve tubes via plasmodesmatas. Transgenic tobaccos plants in which scFv expression was targeted to the cytoplasm either constitutively (35-scFv) or specifically to phloem tissues (RSS-scFv-KD), in spite of a good transcription of scFv mRNAs, did not produce detectable amounts of scFv. These tobaccos, as previously, showed little resistance to the disease. As scFv inhibit in vitro growth of phytopathogenic mollicutes, the plantibody strategy appears to be well adapted to control phytoplasma diseases. However, targeting scFv in the phloem sap has to be optimized and various alternatives for sap targeting are discussed

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Jousse, Cyril. "Contribution à la lutte contre les maladies du bois de la vigne, en particulier l'esca." Phd thesis, Université de Poitiers, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00185265.

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Résumé :

L'esca est un syndrome cryptogamique vasculaire de la vigne (Vitis vinifera). Une phase pionnière, sous la dépendance de Phaeoacremonium aleophilum (PA), Phaeomoniella chlamydospora (PC) et éventuellement de Eutypa lata (EL) permet la mise en place d'autres espèces. Depuis l'interdiction de l'arsénite de sodium, cette maladie n'est plus contrôlée. Nous avons étudié les propriétés de PA, PC et EL, en particulier l'impact sur leur croissance de fongicides commerciaux et de fongicides systémiques synthétisés au laboratoire, ainsi que de molécules naturelles. Ces pathogènes ne présentent pas la même sensibilité à ces molécules et l'un d'eux (PA) est peu affecté par divers traitements. En parallèle, nous avons étudié les propriétés d'ambimobilité de l'acide salicylique (AS) et de quelques-uns de ses dérivés halogénés. Nous avons montré que F 30, un dérivé acide du fenpiclonil, est mobile dans les boutures de vigne après application foliaire. Il est en partie retenu dans le bois et libère la molécule parent dans les racines. L'acide 5-chlorosalicylique (5-ClAS), connu pour être plus actif que AS pour stimuler les défenses naturelles, présente une mobilité voisine de celle de AS. Sur ces bases, F 30 et 5-ClAS ont été retenus pour des tests préliminaires de traitement par voie foliaire de boutures de vigne infectées. Cette recherche exploratoire souligne la complexité de la problématique, une lutte chimique (fongicide), génératrice de contraintes, devant s'intégrer dans une stratégie globale de contrôle.

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Mille, Bruno. "La rhynchosporiose de l'orge à Rhynchosporium secalis (Oud. ) DAVIS : élaboration de nouvelles stratégies de lutte, importance relative des différentes sources d'inoculum." Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112110.

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Résumé :

De nouvelles stratégies de lutte contre la rhynchosporiose de l'orge sont proposées et certaines caractéristiques épidémiologiques de l'agent pathogène Rhynchosporium secalis (Oud. ) Davis, notamment le rôle des semences, précisées en révélant directement la présence du champignon sur ces dernières, ou indirectement lors d'essais au champ. Une première méthode d'analyse, "classique", comprend une désinfection préalable des grains d'orge (éthanol, hypochlorite de sodium et solution antibactérienne et antifongique), avant leur dépôt sur un milieu électif ("orge") et sélectif (terramycine + iprodione + procymidone + 2,4 D). Son taux de réussite est toutefois relativement faible. La deuxième, par immunofluorescence, permet l'analyse de routine des lots de grains. Une plus grande spécificité des immunsérums est obtenue lors de protocoles d'immunisation complexes faisant intervenir des formes antigéniques différentes (spores, mycélium). Les essais de traitements chimiques des semences et de pulvérisations de produits antifongiques sur le sol permettent d'estimer l'importance relative des types d'inoculum "semence" et "sol". Ils démontrent également l'intérêt de telles interventions en tant que techniques culturales. Les mélanges de variétés enfin peuvent aussi constituer une stratégie limitant l'extension de la maladie New cultural practices against barley scald disease were proposed and some epidemiological characteristics of the fungal pathogen Rhynchosporium secalis (Oud. ) Davis, especially importance of seeds, assessed both directly showing its presence and indirectly by field trials. The first analysis method, a "classical" one, associated barley seeds disinfection with ethanol, sodium hypochlorite and bactericidal and fungicidal solution, before placing them on the elective ("barley") and selective medium (terramycine + iprodione + procymidone + 2,4 D). But the experiments were not adequatly successful. The second method, immunofluorescence, allowed routine analysis of seeds samples. Moreover, a higher specificity of immunsera was obtained by complex immunization procedures including different antigenic forms. The chemical treatments of seeds and sprayings of fungicides on the soil that were tested allowed estimation of the comparative importance of "seeds" and "soil" inoculum. They also demonstrated that such applications can be useful as cultural techniques. Lastly, varietal mixtures can be used as a strategy to limit disease spreading in the crop

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Martoub, Maria. "Impact global de l’huile minérale blanche sur le pathosystème plante-puceron-virus : vers de nouvelles perspectives de lutte contre les virus non persistants." Amiens, 2010. http://www.theses.fr/2010AMIE0121.

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Résumé :

Au champ, le contrôle de la transmission non persistante du virus Y de la pomme de terre repose sur l’utilisation d’huiles minérales blanches en épandage hebdomadaire. Si ces traitements sont efficaces, leurs modes d’action ne sont pas complètement élucidés. Au cours de ces travaux de thèse, nous avons été amenés à évaluer l’impact du traitement sur chacun des 3 partenaires du pathosystème : la plante, le virus et son vecteur, le puceron. Nous avons montré que le traitement des plants de pomme de terre avant leur infestation par des pucerons virulifères, réduit significativement la transmission du virus YNTN. De plus, celui-ci affecte le comportement et la physiologie du puceron colonisateur M. Euphorbiae. Nous avons caractérisé des effets négatifs sur l’orientation du puceron adulte et la survie des stades larvaires. Des effets probiotiques se traduisent par l’amélioration de la survie et de la reproduction des pucerons adultes, ainsi que de certains paramètres de la prise alimentaire. Etonnement, nous montrons que l’exposition directe du puceron au traitement suffit à déclencher des effets similaires : aphicides et probiotiques. Enfin, nous montrons que le traitement de la plante entraine des événements cellulaires précoces et tardifs similaires aux processus de perception et de signalisation en réponse à un bioagresseur. Les résultats obtenus placent l’huile minérale parmi les méthodes de lutte alternatives des plus prometteuses, pour son efficacité et qui répond aux préoccupations environnementales actuelles Mineral oil weekly spray has been shown to efficiently reduce non persistent PVY transmission in the field. To date, its mode of action is poorly understood. In this project we assessed mineral oil effect on each partner of the plant – aphid – virus system. We showed that potato plant treatment prior to viruliferous aphid infestation, led to significantly reduced virus YNTN transmission. Besides, it affects M. Euphorbiae behaviour and physiology. Indeed, we characterized negative effects on adult orientation and nymphal survival. Other probiotic effects characterized were: enhanced longevity and reproduction of surviving adults, and some parameters related to feeding behaviour as well. Surprisingly, we demonstrated that direct aphid exposure to mineral oil is sufficient to trigger similar aphicid and probiotic effects. Eventually, we show that plant treatment triggers cellular events similar to pathogen perception and signalling response. Our results highlight the high-potential use of mineral oil as alternative method in virus transmission control, for its efficacy and environment friendly use as well

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Gbedjissi, Louis Ghélus. "Relations mollusques - diptères sciomyzidae, implications dans la lutte contre les distomatoses au Bénin." Avignon, 2003. http://www.theses.fr/2003AVIG0312.

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Résumé :

Sept Sepedon et 1 Sepedonella sont trouvées au Bénin. Les populations fluctuent selon le caractère aquatique permanent ou non des milieux, la pluviométrie et les fréquentations humaines. Les cycles de 6 espèces sont inédits. L'alimentation larvaire est testée avec les mollusque Biomphalaria pfeifferi, Lymnaea natalensis, Bulinus forskalii impliqués dans les parasitoses animales et humaines. Sepedon knutsoni et Sepedonella nana n'attaquent que l'oligochète Aulophorus furcatus. L'annélidophagie serait un comportement secondaire distinct de la malacophagie stricte des Sciomyzidae. Sepedon ruficeps est malacophage et annélidophage. S. Umbrosa, parasitoi͏̈de terrestre,force la bouche de Subulina octona. S. Trichrooscelis, parasitoi͏̈de de Succinea campestris consomme aussi Lymnaea natalensis. S. Ruficeps apparaît comme un agent potentiel au contrôle des mollusques nuisibles au Bénin. La prédation des L3 est la plus élevée et dépend aussi de la taille et de l'éthologie du mollusque-proie Seven Sepedon and 1 Sepedonella are found in Benin. Population levels fluctuate following permanent or temporary states of aquatic habitats, rainfall and human activities. Complete life cycles are gave for 6 species. Larval predation is tested with various snails, Biomphalaria pfeifferi, Lymnaea natalensis, Bulinus forskalii, known to their implication as intermediate-host of animal or human distosomiasis. Sepedon knutsoni and Sepedonella nana attack and consume only on aquatic oligochaeta Aulophorus furcatus. This annelidophagous behavior is probably derived from the habitual malacophagous known for all Sciomyzidae larvae. Sepedon ruficeps larvae are both malacophagous and annelidophagous. S. Umbrosa larvae are parasitoid of the terrestrial gastropoda Subulina octona which is attacking by forcing its mouth. S. Trichrooscelis larval are parasitoi͏̈d of Succinea campestris, occasionnaly eat Lymnaea natalensis. With a higth predation by their instar larvae, S. Ruficeps is a very good species in a tentative to reduce the snails levels implicated in the distosomiasis. But, the larval predation to depend on size and snail behavior

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Martini, Jessica. "Acteurs et dynamiques d’action publique autour de la lutte contre les maladies chroniques dans un pays sous régime d’aide: Le cas de la lutte contre le diabète au Mali." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2020. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/308303.

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Résumé :

Introduction. La présente thèse explore les processus de construction de l’action publique et la manière dont ils influencent la participation des associations de patients, à partir du cas d’une maladie chronique, le diabète, et dans le contexte d’un pays à faible revenu, le Mali. Si la question de la participation a été étudiée de longue date dans la littérature, en revanche elle a été peu étudiée en lien avec le diabète et en contexte africain en particulier. Cadre théorique. Une approche interdisciplinaire originale a fondé ce travail, intégrant des réflexions et cadres théoriques issus de la santé publique, des sciences politiques et de la sociologie. Dans une perspective d’action publique, l’accent a été mis sur les acteurs et leurs interactions, en prenant en compte différentes échelles d’action (locale, nationale et internationale). Méthodes. Les données ont été récoltées à Bamako sur une période longue, de 2008 à 2014, et à partir de plusieurs projets. La triangulation des sources (autorités nationales, partenaires internationaux, associations) et des techniques qualitatives d’enquête (entretiens, observations, revue documentaires) a été privilégiée.Résultats. La gouvernance du secteur de la santé et les dynamiques de la société civile malienne montrent l’engagement des autorités nationales et des partenaires internationaux en faveur de la participation de la société civile. Or, l’histoire de la lutte contre le diabète revèle les angles morts des stratégies et mécanismes promus en faveur de cette participation. La mise à l’agenda tardive du diabète par les autorités maliennes, au début des années 2000, suit la tendance internationale autour des maladies non transmissibles, mais elle contraste avec la mobilisation précoce des patients et des professionnels de santé engagés autour du diabète dès 1991. Différents facteurs peuvent expliquer cette dissonance entre stratégies nationales et internationales d’une part, et engagements locaux d’autre part. Les processus de mise à l’agenda, ainsi que la capacité des associations de patients à s’imposer sur la scène publique et politique, sont influencés par les représentations, les ressources, et les formes d’engagement des acteurs engagés aux différentes échelles et périodes.Discussion. Ce travail montre comment la mise à l’agenda d’une maladie et la place accordée aux patients dans l’action publique dépendent d’une co-responsabilité des multiples acteurs engagés. Il met également en évidence le caractère intermittent du partenariat entre associations de patients diabétiques et décideurs politiques, révélant ainsi le cloisonnement et la fragilité des acquis obtenus dans le cadre d’autres maladies, telles que notamment le VIH/sida.Conclusion. Ce travail invite à continuer l’analyse des politiques de santé dans une perspective d’action publique, en contexte africains mais également dans une perspective comparative avec les contextes des pays du Nord. Doctorat en Santé Publique info:eu-repo/semantics/nonPublished

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Marchive, Chloé. "Identification et caractérisation fonctionnelle d'un gène codant un facteur de transcription de type WRKY chez la Vigne, VvVRKY1 : implication dans les mécanismes de défense." Bordeaux 1, 2006. http://www.theses.fr/2006BOR13144.

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Résumé :

Afin de comprendre le rôle des facteurs de transcription WRKY dans les réactions de féfense de la Vigne (Vitis vinifera) contre des agents pathogènes, nous avons identifié un ADNc, VvWRKY1, codant une protéine présentant de fortes homologies avec les membres de cette famille multigénique. Après avoir vérifié la fonctionnalité de la protéine, traduite par sa capacité à se lier à l'ADN spécifiquement au niveau des boîtes W, l'étude de l'expression de ce géne chez la Vigne a été réalisée. VvWRKY1 est ainsi fortement régulé au cours du développement des feuilles et des baies de raisin. Des molécules de stress comme l'acide salicylique, l'éthylène, le peroxyde d'hydrogène induisent son expression dans les feuilles de Vigne alors que l'acide jasmonique la réprime. L'analyse fonctionnelle de VvWRKY1 a été entreprise par sur-expression chez le Tabac, Arabidopsis thaliana et la Vigne. Les résultats suggèrent une réelle implication de cette proteine dans la défense contre des champignons pathogènes. Effectivement, une sensibilité différente est observée dans les plantes transgéniques par rapport aux plantes sauvages vis-à-vis de différents champignons. Toutefois, les mécanismes sous-jacents n'ont pas encore été identifiés mais des expériences d'hybridation sur puces à ADN comparant les Vignes transgéniques et les Vignes sauvages ont permis d'identifier des gènes potentiellement régulés par VvWRKY1 dont deux gènes codant des lipoxygénases

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Affia, Hicham. "Évaluation de différents sels et mélanges de sels pour lutter contre "Pseudomonas cichorii" dans la laitue." Master's thesis, Université Laval, 2016. http://hdl.handle.net/20.500.11794/26797.

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Résumé :

Ce projet avait pour objectif d’évaluer l’efficacité de certains sels utilisés comme agents de conservation dans l’industrie agroalimentaire et pharmaceutique pour lutter contre la maladie des taches et des nervures noires de la laitue (Lactuca sativa), causée par la bactérie Pseudomonas cichorii. L’étude a permis 1) de déterminer les concentrations minimales inhibitrices (MICs) des sels et de mélanges de ces sels envers des souches virulentes de P. cichorii et 2) d’évaluer l’effet de ces sels et mélanges de sels, appliqués à des concentrations avoisinant les MICs, sur le développement de la maladie. Les résultats obtenus montrent une réduction significative, bien que partielle et variable, de la gravité des symptômes de maladie suite à l’application de NaHCO3 (160 mM), de AlCl3 (4 mM) et des mélanges Na2S2O5 + CaCl2 (12 mM), Na2S2O5 + AlCl3 (4 mM) et Na2S2O5 + NaHCO3 (125 mM). À la lumière des résultats obtenus, il est clair que les sels testés dans le cadre de cette étude ne permettent pas une réduction suffisamment marquée de la maladie pour envisager la commercialisation des plants. On ne peut toutefois exclure la possibilité que ces sels puissent permettre une réduction suffisante de la maladie des taches et des nervures noires lorsqu’utilisés avec des méthodes complémentaires de lutte dans un programme de lutte intégrée.

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Ben, M'henni Yosra. "Gestion de la maladie de dépérissement du pommier : criblage in vitro et in planta des activités protectrices d’une collection de microorganismes contre les Pythiacées et caractérisation chimique du principal actif produit par l’isolat A. westerdijkiae A7 Biocontrol and growth promotion potential of combined application of Trichoderma simmonsii and Aspergillus westerdijkiae in Apple root stock dieback." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASS127.

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Résumé :

Le dépérissement du pommier est une maladie tellurique causée par plusieurs espèces Pythiacée. Il est responsable de graves dommages et de pertes d'arbres dans de nombreux vergers en Tunisie. Comme la lutte chimique contre cette maladie pose des problèmes éco toxicologiques et les moyens prophylactiques ont des efficacités limitées, d’autres moyens de lutte sont activement recherchés. L’objectif de cette thèse était d’identifier un nouvel agent de lutte biologique contre les oomycètes responsables de cette maladie à partir d’une collection d’isolats fongiques et bactériens Tunisiens comme alternative au contrôle chimique. Les isolats fongiques étudiés appartenaient aux genres Trichoderma, Aspergillus et Penicillium spp., les isolats bactériens appartenaient au genre Bacillus spp. clade subtilis. Les isolats fongiques ont fortement inhibé la croissance in vitro des Pythiacées (> 40%) par rapport aux isolats bactériens ; en particulier, les filtrats de culture des isolats A. westerdijkiae A7 et T. simmonsii A2. L'évaluation de l’activité préventive et curative contre les Pythiacées sur des porte-greffes du pommier de ces deux isolats fongiques et de la souche Bacillus B2 a montré que T. simmonsii A2 était le plus efficace lorsqu'il était appliqué à titre préventif. De même, la combinaison de la souche Bacillus B2 et de l’isolat A. westerdijkiae A7 a induit une bonne protection contre les Pythiacées en préventif. La combinaison des isolats T. simmonsii A2 et A. westerdijkiae A7 a entraîné une meilleure protection en traitement curatif, alors que la combinaison des trois isolats ensemble réduisait fortement l’activité protectrice. Notre étude révèle le potentiel des isolats Tunisiens, seuls ou en combinaison, en tant qu'agents de lutte biologique contre le dépérissement du pommier ainsi qu'un effet bénéfique supplémentaire sur la croissance végétale observé au niveau des racines et de la longueur des tiges. Ainsi, nous avons sélectionnés les meilleurs candidats agissant par antibiose pour l'identification des principaux agents actifs responsables de l'activité anti-oomycète. L'isolat A. westerdijkiae A7 a été retenu avec 100% d'inhibition de la croissance mycélienne des isolats de Pythiacées testés. Plusieurs étapes de purification successives du filtrat de culture ont permis d’identifier l'acide pénicillique (acide 3-méhoxy-5-méthyl-4-oxo-2,5-hexadiénoïque) en tant que principale molécule responsable de l’inhibition la croissance mycélienne des Pythiacées testées. Étant donné que l’acide pénicillique possède des propriétés toxiques pour la santé humaine et animale, l’isolat A. westerdijkiae A7 ne pourra pas être utilisé en tant que BCA puisqu’il produit cette mycotoxine malgré nos résultats prometteurs in planta. L’ensemble de ces travaux montre le potentiel anti-oomycète des micro-organismes in vitro qui peut différer de l’activité protectrice contre les Pythiacées in planta. Ils révèlent également la nécessité de caractériser l’ingrédient actif pour les études de toxicité nécessaire au développement d’un produit de bio-contrôle Apple dieback is a telluric disease caused by several Pythiaceae species. It is responsible for serious damage and loss of trees in many orchards in Tunisia. As the chemical control of this disease poses eco-toxicological problems and the prophylactic means have limited effectiveness, other means of fight are actively sought. The objective of this thesis was to identify a new biological control agent against oomycetes responsible for this disease from a collection of Tunisian fungal and bacterial isolates as an alternative to chemical control. The fungal isolates studied belonged to the genera Trichoderma, Aspergillus and Penicillium spp., The bacterial isolates to the genus Bacillus spp. clade subtilis. Fungal isolates strongly inhibited the growth of Pythiaceae in vitro (> 40%) compared to bacterial isolates; in particular, the culture filtrates of isolates A. westerdijkiae A7 and T. simmonsii A2. The evaluation of the preventive and curative activity against Pythiaceae on apple rootstocks of these two fungal isolates and of the Bacillus B2 strain showed that T. simmonsii A2 was the most effective when applied preventively. Likewise, the combination of the Bacillus B2 strain and the A. westerdijkiae A7 isolate induced good protection against Pythiaceae as a preventive measure. The combination of the T. simmonsii A2 and A. westerdijkiae A7 isolates resulted in better protection in curative therapy, while the combination of the three isolates together greatly reduced the protective activity. Our study reveals the potential of Tunisian isolates, alone or in combination, as biological control agents against apple dieback as well as an additional beneficial effect on plant growth observed at the level of the roots and the length of the stems. Thus, we have selected the best candidates acting by antibiosis for the identification of the main active agents responsible for anti-oomycete activity. The A. westerdijkiae A7 isolate was retained with 100% inhibition of mycelial growth of the Pythiaceae isolates tested. Several successive purification steps of the culture filtrate made it possible to identify penicillic acid (3-mehoxy-5-methyl-4-oxo-2,5-hexadienoic acid) as the main molecule responsible for inhibiting growth mycelia of the Pythiaceae tested. Since penicillic acid has toxic properties for human and animal health, isolate A. westerdijkiae A7 cannot be used as BCA since it produces this mycotoxin despite our promising results in planta. All of this work shows the anti-oomycete potential of microorganisms in vitro, which may differ from the protective activity against Pythiaceae in planta. They also reveal the need to characterize the active molecule for the toxicity studies necessary for the development of a biocontrol product

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Audette, Carolane. "Interaction entre le nématode à kyste (Heterodera glycines) et Phytophthora sojae chez le soya." Master's thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/33829.

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Résumé :

Le nématode à kyste du soya (NKS), Heterodera glycines, est la principale cause de pertes économiques chez le soya aux États-Unis. Au Canada, on le retrouve en Ontario depuis 1988 et il continue à gagner du terrain chaque année. Il a été répertorié pour la première fois au Québec en 2013, et les producteurs de soya québécois ont déjà commencé à déployer des outils pour sa répression. La méthode de lutte la plus utilisée contre cet organisme est l’utilisation de gènes de résistance quantitative combiné à la rotation des cultures. Par contre, l’organisme causant le plus de dommages chez le soya à l’heure actuelle au Québec est la pourriture phytophthoréenne, causée par l’oomycète, Phytophthora sojae. Cette maladie racinaire peut, elle aussi, être réprimée grâce à des cultivars génétiquement résistants (résistance qualitative à gènes Rps). Sachant que le NKS se retrouve déjà dans certaines régions du Québec où sévit également P. sojae, il devient urgent de déterminer si les cultivars de soya présentement utilisés exprimeront une résistance satisfaisante contre ces agents pathogènes majeurs. Dans ce contexte, l’objectif principal de ce projet était d’évaluer l’interaction entre ces deux agents pathogènes du soya en fonction de la résistance (qualitative à gènes Rps / résistance quantitative au NKS) des cultivars utilisés. L’étude, réalisée en système hydroponique, a permis de démontrer qu’en présence d’un cultivar sensible aux deux organismes, P. sojae a un impact négatif sur la capacité du NKS à produire des kystes. Cela suggère que P. sojae pourrait influencer le développement du NKS. La présence du nématode, quant à elle, n’a pas influencé l’efficacité de la résistance qualitative à gènes Rps contre P. sojae. En conséquence, les cultivars résistants aux deux agents pathogènes représentent une bonne option pour prévenir et lutter contre ces affections. The soybean cyst nematode (SCN), Heterodera glycines, is the leading cause of economic losses in soybean in the United States. In Canada, it has been found in Ontario in 1988 and continues to spread every year. It was identified for the first time in Quebec in 2013 and soybean growers have already begun to deploy management tools. The most commonly used control method against SCN is the use of quantitative resistance genes and crop rotation. However, the most damaging organism in soybean in Quebec currently is Phytophthora root rot, caused by Phytophthora sojae. This root disease can also be controlled by genetically resistant cultivars (qualitative resistance with Rps genes). Because SCN is now present in regions struggling with P. sojae, it is important to determine if the cultivars will express sufficient resistance against these two major pathogens. In this context, the main objective of this project was to evaluate the interaction between these two organisms on soybean, according to the resistance (qualitative Rps genes/ or quantitative resistance to SCN) of the cultivars used. This study, in a hydroponic system, demonstrated that P. sojae has a negative impact on SCN capacity to produce cysts produced. This suggests that P. sojae might influence SCN development. On the other hand, resistant cultivars were not affected by the presence of both pathogens and the presence of the nematode did not influence the efficacy of qualitative Rps resistance gene against P. sojae. As a result, cultivars resistant to both pathogens are a good option for preventing and controlling these diseases.

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Bouchard-Rochette, Mathieu, and Mathieu Bouchard-Rochette. "Bacillus pumilus et Bacillus subtilis pour lutter contre la pourriture grise chez la tomate et le concombre de serre." Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/38128.

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Résumé :

Cette étude s’inscrit dans le cadre d’un programme de recherche destiné à évaluer le potentiel d’utilisation en horticulture des bactéries Bacillus pumilus souche PTB180 et Bacillus subtilis souche PTB185. Elle avait pour objectifs (1) d’évaluer in vitro l’activité antagoniste contre Botrytis cinerea des souches PTB180 et PTB185, (2) d’estimer leur capacité à survivre sur la phyllosphère de la tomate et du concombre et 3) d’évaluer leur effet sur le développement de la pourriture grise (B. cinerea) sur des plants de tomate et de concombre cultivés en serre. L'activité antagoniste de PTB180 et PTB185 a été évaluée en boîtes de Pétri sur géloses, sur tissus foliaires de tomate et de concombre et sur fruits de tomate. Les deux souches ont inhibé très fortement la croissance mycélienne et la germination des spores de B. cinerea sur géloses. Sur feuilles de tomate et sur disques foliaires de concombre, PTB185 et le mélange (1:1) des deux souches ont réduit significativement (p ≤ 0,01) la croissance mycélienne de B. cinerea comparativement aux témoins. PTB180 a réprimé significativement la croissance mycélienne de B. cinerea sur les fruits de tomate. Afin d'estimer la survie de PTB180 et PTB185 sur la phyllosphère, des plants de tomate et de concombre ont été pulvérisés jusqu'à ruissellement avec une suspension (1×107 unités formatrices de colonies [UFC]/mL) de PTB180, PTB185 ou d'un mélange (1:1) des deux souches. Les populations de chaque souche ont ensuite été suivies au cours du temps sur les feuilles. Les résultats obtenus montrent que les souches survivent au moins 21 jours sur les plants de tomate et de concombre avec un taux de survie variant de 43% à 100%. De plus, pratiquement aucune variation dans les proportions de chaque souche n'a été observée au fil du temps lorsque PTB180 et PTB185 étaient appliquées en mélange. Enfin, l’application foliaire de PTB180, PTB185 et du mélange (1:1) des deux souches a permis une réduction significative de l’incidence et de la sévérité de la pourriture grise chez des plants de tomate et de concombre inoculés avec B. cinerea et cultivés en serre. Les souches PTB180 et PTB185 ont montré au cours de cette étude une forte activité antagoniste envers B. cinerea, la capacité de survivre sur la phyllosphère de plants de tomate et de concombre et de réprimer le développement de la pourriture grise chez ces derniers. Ces souches pourraient éventuellement être utilisées comme agents de lutte biologique contre la pourriture grise du concombre et de la tomate de serre. Cette étude s’inscrit dans le cadre d’un programme de recherche destiné à évaluer le potentiel d’utilisation en horticulture des bactéries Bacillus pumilus souche PTB180 et Bacillus subtilis souche PTB185. Elle avait pour objectifs (1) d’évaluer in vitro l’activité antagoniste contre Botrytis cinerea des souches PTB180 et PTB185, (2) d’estimer leur capacité à survivre sur la phyllosphère de la tomate et du concombre et 3) d’évaluer leur effet sur le développement de la pourriture grise (B. cinerea) sur des plants de tomate et de concombre cultivés en serre. L'activité antagoniste de PTB180 et PTB185 a été évaluée en boîtes de Pétri sur géloses, sur tissus foliaires de tomate et de concombre et sur fruits de tomate. Les deux souches ont inhibé très fortement la croissance mycélienne et la germination des spores de B. cinerea sur géloses. Sur feuilles de tomate et sur disques foliaires de concombre, PTB185 et le mélange (1:1) des deux souches ont réduit significativement (p ≤ 0,01) la croissance mycélienne de B. cinerea comparativement aux témoins. PTB180 a réprimé significativement la croissance mycélienne de B. cinerea sur les fruits de tomate. Afin d'estimer la survie de PTB180 et PTB185 sur la phyllosphère, des plants de tomate et de concombre ont été pulvérisés jusqu'à ruissellement avec une suspension (1×107 unités formatrices de colonies [UFC]/mL) de PTB180, PTB185 ou d'un mélange (1:1) des deux souches. Les populations de chaque souche ont ensuite été suivies au cours du temps sur les feuilles. Les résultats obtenus montrent que les souches survivent au moins 21 jours sur les plants de tomate et de concombre avec un taux de survie variant de 43% à 100%. De plus, pratiquement aucune variation dans les proportions de chaque souche n'a été observée au fil du temps lorsque PTB180 et PTB185 étaient appliquées en mélange. Enfin, l’application foliaire de PTB180, PTB185 et du mélange (1:1) des deux souches a permis une réduction significative de l’incidence et de la sévérité de la pourriture grise chez des plants de tomate et de concombre inoculés avec B. cinerea et cultivés en serre. Les souches PTB180 et PTB185 ont montré au cours de cette étude une forte activité antagoniste envers B. cinerea, la capacité de survivre sur la phyllosphère de plants de tomate et de concombre et de réprimer le développement de la pourriture grise chez ces derniers. Ces souches pourraient éventuellement être utilisées comme agents de lutte biologique contre la pourriture grise du concombre et de la tomate de serre.

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St-Laurent, Marianne. "Amélioration de la lutte biologique contre le tétranyque à deux points en framboisières sous grands tunnels : essais d'un supplément nutritif, de plantes-réservoirs et de brumisation." Master's thesis, Université Laval, 2017. http://hdl.handle.net/20.500.11794/29866.

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Résumé :

Les grands tunnels procurent de nombreux avantages pour la culture de framboises, dont l’amélioration des rendements et la qualité des fruits. Cependant, ils fournissent également un environnement idéal pour la prolifération du tétranyque à deux points, Tetranychus urticae, un important ravageur. Bien que plusieurs acaricides soient disponibles, les délais avant-récolte et le développement de résistance chez le tétranyque peuvent être problématiques. Les acariens prédateurs phytoséiides, tel Neoseiulus fallacis, sont reconnus pour leur efficacité à contrôler les tétranyques. Toutefois, de nombreuses introductions doivent souvent être faites au cours d’une saison, entraînant des coûts importants. Le principal objectif de cette étude était d’améliorer l’efficacité de la lutte intégrée contre les tétranyques tout en diminuant le nombre d’introductions de prédateurs dans la culture du framboisier sous grands tunnels. Les objectifs spécifiques étaient de déterminer l'efficacité de quatre stratégies de lutte intégrée en framboisière sous grands tunnels et d’estimer le coût ($/ha) de ces stratégies en les comparant à la lutte conventionnelle. Les méthodes de lutte testées combinent les différentes stratégies suivantes : l’introduction des prédateurs Neoseiulus fallacis, l’ajout de la plante-réservoir Sorbaria sorbifolia, l’utilisation du supplément nutritif à base de pollen pour prédateurs « Nutrimite » de Biobest ainsi que la brumisation des tunnels. Les essais se sont déroulés chez deux producteurs de framboises de la grande région de Québec. Les données recueillies par dépistage des tétranyques et des prédateurs ont démontrées que le supplément de pollen a un effet positif sur la capacité de prédation de N. fallacis et que la brumisation tend à diminuer les densités de population de T. urticae. High tunnels show many benefits for raspberry production, including increased yield and improved fruit quality. However, this crop management approach also provides an environment that fosters outbreaks of the two-spotted spider mite, Tetranychus urticae. Although some miticides are available, pre-harvest application intervals and pesticide resistance development can be problematic. Phytoseiid predatory mites, such as Neoseiulus fallacis, are recognized for their efficacy in controlling spider mites. However, repeated introductions often must be made during a season, resulting in significant cost. To reduce these costs and thereby make biological control more attractive to growers, we tested a food supplement for predators, a banker plant and misting. The main objective of this study was to improve the effectiveness of integrated control against spider mites while decreasing the number of predator introductions in raspberry production under high tunnels. The specific objectives were to determine the effectiveness of four integrated pest management (IPM) strategies in raspberry under high tunnels and estimate their cost ($ / ha) in comparison to conventional control (mitices only) methods. The tested approaches combined different strategies: introduction of Neoseiulus fallacis predators; addition of Sorbaria sorbifolia as a banker plant; use of a pollen-based food supplement for predators, “Nutrimite", from Biobest; and misting. Tests were conducted at two raspberry farms in the greater Quebec City (Quebec, Canada) area. Data collected by monitoring populations of both spider mites and predators show that the pollen supplement has a positive effect on the predatory ability of N. fallacis and that misting tends to reduce T. urticae densities.

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Ali-Haimoud, Djamel-Eddine. "Contribution à l'étude de la lutte biologique contre Drechslera teres (Sacc. ) Shoem. , parasite de l'orge." Toulouse, INPT, 1994. http://www.theses.fr/1994INPT007A.

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Résumé :

Les principaux resultats de cette etude preliminaire montrent qu'a partir du phylloplan et des residus de recoltes de l'orge, des antagonistes tres actifs in vitro contre les principales sequences biologiques du pathogene peuvent etre isoles. Ce sont principalement differentes especes de trichoderma qui inhibent totalement la morphogenese des organes sclerotioides sur pailles, leur myceliogenese et egalement l'agressivite du mycelium qui en est issu. Ces antagonistes de meme qu'une espece de cephalosporium et une espece d'acremonium sont egalement tres actifs sur la sporulation du resting mycelium sur paille. Parmi les differentes especes de trichoderma utilisees, t. Koningii et t. Pseudokoningii sont capables egalement de reduire en conditions controlees l'expression de la maladie a partir de l'inoculum seminicole. La germination conidienne de d. Teres semble etre une sequence biologique hautement sensible aux antagonistes, a l'exception de fusarium graminearum, cephalosporium sp et ascochyta sp. Cette etude montre egalement que si certains de ces microorganismes conservent in vivo leur pouvoir de s'opposer au bon deroulement de certaines sequences biologiques et epidemiologiques de d. Teres (tels les trichoderma spp), d'autres au contraire se revelent etre de pietres candidats pour la lutte contre le developpement de la maladie in vivo et en conditions controlees. Ainsi, il semble donc qu'il n'existe pas de methode de screening preponderante par rapport a telle ou telle autre methode et que la multiplication de ces derniers soit une condition sine qua non a un choix exhaustif reel de tous les antagonistes potentiels existant dans un environnement donne. L'etude comparee des deux formes du pathogene montre que ces dernieres reagissent differemment aux traitements a l'aide des antagonistes. Ce comportement a deja ete observe par differents auteurs, notamment concernant l'environnement chimique et pourraient expliquer la soudaine explosion de cette maladie en france, particulierement celle due a la forme maculata, liee a l'inadequation de la lutte chimique actuellement pratiquee. Nos resultats montrent par ailleurs que certains antagonistes agissent en fait par effet synergique car ils inhibent in vitro certaines sequences biologiques du pathogene et induisent l'elicitation de proteines de defenses chez l'hote. Ainsi, l'actinomycete micromonospora 6 induit la production d'une chitinase chez l'orge qui est egalement produite lors de l'attaque par d. Teres. Les pr proteines pourraient constituer un outil efficace de l'amelioration genetique de l'orge si l'on etablit une relation (qualitative ou quantitative) entre leur production et la resistance a l'helminthosporiose

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Cedeno, Virna. "Prévention des maladies et amélioration génétique de la crevette : Litopenaeus vannamai en Equateur." Montpellier 2, 2000. http://www.theses.fr/2000MON20243.

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Allaire, Mathieu, and Mathieu Allaire. "Diversité fonctionnelle des Pseudomonas producteurs d'antibiotiques dans les rhizosphères de conifères en pépinières et en milieu naturel." Master's thesis, Université Laval, 2005. http://hdl.handle.net/20.500.11794/18046.

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Résumé :

La production de millions de semis voués à la reforestation est affectée par les problèmes de pourritures racinaires. Afin de développer des agents de biocontrôle adaptés aux pépinières, nous criblons les populations de Pseudomonas spp. des rhizosphères d’épinettes provenant de pépinières et de milieu naturel, pour détecter des gènes de production d’antibiotiques. Nous avons isolé plusieurs souches portant des gènes de production de phloroglucinol, de pyrrolnitrine, de cyanure d’hydrogène et de phénazines. L’analyse de ces gènes montre que pour les producteurs de phloroglucinol, un génotype est dominant dans les pépinières, alors qu’un génotype différent est dominant chez les souches provenant de milieu naturel. Ces dernières possèdent également les gènes de synthèse de la pyrrolnitrine et leur capacité d’inhiber Cylindrocladium floridanum in vitro est supérieur. De plus, en se basant sur la séquence du gène phzC, nous avons isolé trois groupes de producteurs de phénazines, dont deux provenant de milieu naturel et un de pépinière. L’analyse du gène de la portion 16s de l’ARN ribosomal confirme que ces trois groupes appartiennent à différente espèces. La production de millions de semis voués à la reforestation est affectée par les problèmes de pourritures racinaires. Afin de développer des agents de biocontrôle adaptés aux pépinières, nous criblons les populations de Pseudomonas spp. des rhizosphères d’épinettes provenant de pépinières et de milieu naturel, pour détecter des gènes de production d’antibiotiques. Nous avons isolé plusieurs souches portant des gènes de production de phloroglucinol, de pyrrolnitrine, de cyanure d’hydrogène et de phénazines. L’analyse de ces gènes montre que pour les producteurs de phloroglucinol, un génotype est dominant dans les pépinières, alors qu’un génotype différent est dominant chez les souches provenant de milieu naturel. Ces dernières possèdent également les gènes de synthèse de la pyrrolnitrine et leur capacité d’inhiber Cylindrocladium floridanum in vitro est supérieur. De plus, en se basant sur la séquence du gène phzC, nous avons isolé trois groupes de producteurs de phénazines, dont deux provenant de milieu naturel et un de pépinière. L’analyse du gène de la portion 16s de l’ARN ribosomal confirme que ces trois groupes appartiennent à différente espèces. Fluorescent Pseudomonas spp. that produce antibiotics such as 2,4-diacetylphloroglucinol and phenazines show biocontrol activity against many important soil borne fungal pathogens. We isolated several strains of Pseudomonas carrying genes for DAPG and PCA synthesis from the rhizosphere of black spruce (Picea mariana) and white spruce (Picea glauca) in two different conifer nurseries and in one natural stand. Sequence analysis of a portion of the phlD gene revealed that one dominant genotype was present in both nurseries and that a different genotype was dominant in the natural forest. Strains from the natural forestwere also found to have the genes for pyrrolnitrin synthesis but lack pyoluteorin biosynthesis genes. Furthermore, in vitro anitfungal assays against Cylindrocladium floridanum showed a much stronger inhibition by strains isolated from natural forest than from nursery. Analysis of phenazine genes revealed 3 groups of phenazines-producers; one from a nursery and two from natural stand. Fluorescent Pseudomonas spp. that produce antibiotics such as 2,4-diacetylphloroglucinol and phenazines show biocontrol activity against many important soil borne fungal pathogens. We isolated several strains of Pseudomonas carrying genes for DAPG and PCA synthesis from the rhizosphere of black spruce (Picea mariana) and white spruce (Picea glauca) in two different conifer nurseries and in one natural stand. Sequence analysis of a portion of the phlD gene revealed that one dominant genotype was present in both nurseries and that a different genotype was dominant in the natural forest. Strains from the natural forestwere also found to have the genes for pyrrolnitrin synthesis but lack pyoluteorin biosynthesis genes. Furthermore, in vitro anitfungal assays against Cylindrocladium floridanum showed a much stronger inhibition by strains isolated from natural forest than from nursery. Analysis of phenazine genes revealed 3 groups of phenazines-producers; one from a nursery and two from natural stand.

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Gravel, Valérie. "Lutte contre Pythium ultimum chez la tomate de serre : une approche microbienne." Thesis, Université Laval, 2007. http://www.theses.ulaval.ca/2007/24523/24523.pdf.

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Bouchard-Rochette, Mathieu. "Bacillus pumilus et Bacillus subtilis pour lutter contre la pourriture grise chez la tomate et le concombre de serre." Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/38128.

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Résumé :

Cette étude s’inscrit dans le cadre d’un programme de recherche destiné à évaluer le potentiel d’utilisation en horticulture des bactéries Bacillus pumilus souche PTB180 et Bacillus subtilis souche PTB185. Elle avait pour objectifs (1) d’évaluer in vitro l’activité antagoniste contre Botrytis cinerea des souches PTB180 et PTB185, (2) d’estimer leur capacité à survivre sur la phyllosphère de la tomate et du concombre et 3) d’évaluer leur effet sur le développement de la pourriture grise (B. cinerea) sur des plants de tomate et de concombre cultivés en serre. L'activité antagoniste de PTB180 et PTB185 a été évaluée en boîtes de Pétri sur géloses, sur tissus foliaires de tomate et de concombre et sur fruits de tomate. Les deux souches ont inhibé très fortement la croissance mycélienne et la germination des spores de B. cinerea sur géloses. Sur feuilles de tomate et sur disques foliaires de concombre, PTB185 et le mélange (1:1) des deux souches ont réduit significativement (p ≤ 0,01) la croissance mycélienne de B. cinerea comparativement aux témoins. PTB180 a réprimé significativement la croissance mycélienne de B. cinerea sur les fruits de tomate. Afin d'estimer la survie de PTB180 et PTB185 sur la phyllosphère, des plants de tomate et de concombre ont été pulvérisés jusqu'à ruissellement avec une suspension (1×107 unités formatrices de colonies [UFC]/mL) de PTB180, PTB185 ou d'un mélange (1:1) des deux souches. Les populations de chaque souche ont ensuite été suivies au cours du temps sur les feuilles. Les résultats obtenus montrent que les souches survivent au moins 21 jours sur les plants de tomate et de concombre avec un taux de survie variant de 43% à 100%. De plus, pratiquement aucune variation dans les proportions de chaque souche n'a été observée au fil du temps lorsque PTB180 et PTB185 étaient appliquées en mélange. Enfin, l’application foliaire de PTB180, PTB185 et du mélange (1:1) des deux souches a permis une réduction significative de l’incidence et de la sévérité de la pourriture grise chez des plants de tomate et de concombre inoculés avec B. cinerea et cultivés en serre. Les souches PTB180 et PTB185 ont montré au cours de cette étude une forte activité antagoniste envers B. cinerea, la capacité de survivre sur la phyllosphère de plants de tomate et de concombre et de réprimer le développement de la pourriture grise chez ces derniers. Ces souches pourraient éventuellement être utilisées comme agents de lutte biologique contre la pourriture grise du concombre et de la tomate de serre.

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Barrera, Gaytan Juan Francisco. "Dynamique des populations du scolyte des fruits du caféier, hypothenemus hampei (Coléoptera : Scolytidae), et lutte biologique avec le parasitoi͏̈de Cephalonomia stephanoderis (Hymenoptera : Bethylidae), au Chiapas, Mexique." Toulouse 3, 1994. http://www.theses.fr/1994TOU30085.

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Résumé :

Ce travail porte sur l'etude de la dynamique des populations d'un insecte ravageur du fruit du cafeier hypothenemus hampei (ferrari) (coleoptera: scolytidae), et sa lutte biologique avec le parasitoide cephalonomia stephanoderis betrem (hymenoptera bethylidae) au chiapas (mexique). Ce ravageur, d'origine africaine, a ete observe pour la premiere fois au mexique en 1978. Le memoire comprend trois sections. Sont tout d'abord presentees des generalites sur la region etudiee (le soconusco) la plante-hote (le cafeier) et l'insecte ravageur (le scolyte). Puis, sont abordees des recherches complementaires sur la dynamique des populations d'h. Hampei ; en particulier, le type de reproduction a ete etudie en detail ainsi que le cycle biologique de ce scolyte dans la nature, les relations liant l'infestation et la phenologie du cafeier (coffea arabica l. ), l'effet de l'ombrage sur l'intensite des attaques et la distribution spatio-temporelle de l'infestation durant quatre annees. Une methode d'echantillonnage binomial sequentiel de ce scolyte est proposee pour evaluer ses niveaux de population. La troisieme partie debute par des generalites sur la lutte biologique utilisee contre h. Hampei, insistant particulierement sur c. Stephanoderis, parasitoide introduit au mexique en 1988. Puis, sont presentees des recherches complementaires sur la biologie de ce parasitoide, son acclimatation dans les cafeieres mexicaines, son elevage de masse et son impact sur les populations d'h. Hampei au champ. Enfin, sur la base des resultats obtenus, est suggeree une methode de lutte biologique contre le ravageur pour la region cafeiere du chiapas

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Bala, Kanak. "Biological control of Botrytis cinerea, a destructive plant-pathogen." Dijon, 2007. http://www.theses.fr/2007DIJOS047.

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Résumé :

Il est connu que les ‘pesticides’ (produits phytopharmaceutiques) utilisés depuis plus de 100 ans en agriculture sont néfastes, autant pour les vivants que pour l’environnement. Il est urgent de développer un remplacement de ces produits toxiques à l’homme et à son entourage. Le but de ce travail est double : d’abord, trouver les micro-organismes non pathogènes dans les vignobles et, ensuite, les mettre en concurrence avec les parasites de la vigne. Nous envisageons de tirer bénéfice sur deux fronts : 1. Lutte biologique contre les maladies cryptogamiques de la vigne, 2. Déclenchement de la résistance chez la vigne contre les maladies. Les micro-organismes utilisés deviennent ainsi, des ‘bio-fongicides’ qui remplacent les produits chimiques. La vigne est attaquée par plusieurs parasites; les plus importants en Bourgogne sont : le mildiou par Plasmopara viticola, l’oïdium par Uncinula necator, et la pourriture grise par Botrytis cinerea. Pour cette thèse nous avons choisi de nous concentrer sur la « pourriture grise » de la vigne et d’autres végétaux, maladie provoquée par le redoutable champignon, Botrytis cinerea. Nous avons isolé quelques espèces de Pythium non pathogènes à partir du sol de vignobles ainsi que d’autres sols agricoles et forestiers. . The pesticides used in agriculture for controlling phyto-pathogens have hazardous health effects on plants, animals and humans. Massive application of toxic pesticides is a serious problem today in almost all developing countries. Developing safer, environment-friendly biological products may help in overcoming the risks posed by pesticides and may also help in protecting public health, thereby promoting safer means of pest control. This thesis aims at the Biological control of plant diseases by non-phytopathogenic microorganisms, isolated from soil of vineyards and rhizosphere of crop fields. Introduction of these microorganisms leads to a twofold benefit 1. Biological control of the disease by the antagonist effect of the micro-organisms; 2. Enhanced disease resistance in plants to phytopathogens. Hence, these microorganisms could serve as an alternative to chemical control of plant diseases. Grapevine is challenged every year by fungal and viral and bacterial parasites. Among the fungal, the major ones are downy mildew by Plasmopara viticola, powdery mildew by Uncinula necator, black rot by Guignardia bidwellii, phomopsis leaf, cane spot and fruit rot disease by Phomopsis viticola, Eutypa Dieback by Eutypa armeniaceae and grey mould by Botrytis cinerea. Crown gall by bacterial parasite Agrobacterium tumefaciens, and viral diseases includes Peach Rosette mosaic virus disease, tomato ringspot and tobacco ringspot by nematode Xiphinema americanum. .

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Pichard, Brigitte. "Bacillus polymyxa, inhibiteur de parasites microbiens du chou-fleur." Brest, 1992. http://www.theses.fr/1992BRES2018.

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Des problemes d'ordre phytosanitaire dus a des parasites microbiens se posent constamment en agriculture. Les moyens de lutte actuels sont insuffisants contre la plupart des bacteries phytopathogenes. C'est le cas de xanthomonas campestris pv. Campestris, responsable de la nervation noire du chou-fleur. Une souche de bacillus polymyxa (bp1), isolee de semences de chou-fleur, inhibe in vitro plusieurs micro-organismes phytopathogenes. Elle synthetise des substances antifongiques et antibacteriennes, en quantites variables selon les conditions de culture. La production des premieres est favorisee par un milieu a base de lactose et de soytone, celle des secondes par du lactose et un melange d'acides amines. Les deux antibiotiques antibacteriens produits sont des nouveaux peptides denommes gavaserine et saltavaline, en fonction de leur composition en acides amines. La gavaserine contient egalement un acide gras. Les substances antifongiques sont purifiees par les methodes classiques de precipitation et chromatographies. Leurs identifications sont en cours. La souche bp1, ou du moins les antibiotiques qu'elle produit, peut etre utilisee pour traiter les semences de chou-fleur. Elle protege la plante de la nervation noire due a xanthomonas campestris pv. Campestris et peut en meme temps diminuer les fontes de semis causees par alternaria brassicicola. Elle preserve le pouvoir germinatif et le rendement en matiere fraiche des plantules

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Leyronas, Christel. "Avancées dans la compréhension des Neotyphodium et Epichloe, clavicipitacées endophytes des graminées fourragères et à gazon : méthodes de lutte." Paris, Institut national d'agronomie de Paris Grignon, 2005. http://www.theses.fr/2005INAP0001.

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Delannoy, Etienne. "Caractérisation de péroxydases associées à la défense du cotonnier ("Gossypium hirsutum") contre "Xanthomonas campestris" pathovar "Malvacearum"." Montpellier 2, 2003. http://www.theses.fr/2003MON20175.

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Corre, Marie-Hélène. "Identification et caractérisation de composés produits par des bactéries environnementales pour la lutte biologique contre Legionella pneumophila." Thesis, Poitiers, 2018. http://www.theses.fr/2018POIT2309/document.

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Résumé :

Les circuits et réseaux d’eau subissent épisodiquement des problèmes de contamination par des microorganismes tels que Legionella pneumophila, conduisant à la dégradation de la qualité microbiologique de l’eau circulante. De nouveaux moyens de traitements doivent être mis en place de façon notamment à limiter l’usage de biocides chimiques. Ce travail de thèse s’inscrit dans cette problématique et a pour objectif d’identifier de nouveaux composés actifs contre L. pneumophila en tenant compte de son comportement et de ses interactions au sein de son microenvironnement. De manière à obtenir des composés produits par des souches bactériennes appartenant à la même niche écologique que L. pneumophila, une campagne de prélèvement d’eau a été réalisée. Un total de 273 isolats environnementaux ont été isolés et testés contre L. pneumophila. Les résultats obtenus indiquent que 178 de ces isolats (65%) présentent une activité anti-Legionella. Quatre souches ont ensuite été sélectionnées (Aeromonas bestiarum SW257, Rahnella aquatilis SW265, Flavobacterium spp. PW52 et Pseudomonas spp PW329) et les composés actifs produits ont été caractérisés. A. bestiarum SW257 produit un peptide anti-Legionella. Flavobacterium sp. PW52 produit un mélange de composés anti-Legionella ayant des propriétés tensioactives, les flavolipides. Pseudomonas sp. PW329 produit des composés organiques volatiles, identifiés par SPME-GC-MS, actifs contre L. pneumophila. Enfin, R. aquatilis SW265 produit un sidérophore à activité anti-Legionella Water is essential to sustain life and water sources used for human consumption must be biologically safe, to avoid any risk for health. Indeed, the most common and widespread health risk associated with drinking water are infectious diseases caused by pathogenic microorganisms such as Legionella pneumophila. However, more efforts are needed to control disinfection by-products and minimize people exposure to potentially hazardous chemicals while maintaining adequate disinfection to ensure good water quality. Thus, this work aimed to find natural antibacterial compounds to control L. pneumophila growth using bacteria from freshwater environments. Environmental aquatic bacteria were sampled from five freshwater sources to get a large culturable bacterial collection. A total of 273 bacterial isolates were recovered and screened for their ability to produce anti-Legionella compounds. Among those, 178 (65%) were shown to be active against L. pneumophila. Four strains (Aeromonas bestiarum SW257, Rahnella aquatilis SW265, Flavobacterium spp. PW52, and Pseudomonas spp PW329) were next selected for the characterization of their active compounds. A. bestiarum SW257 produces an anti-Legionella peptide, and Flavobacterium spp PW52 produces a mixture of anti-Legionella compounds with surface active properties, named flavolipids. Finally Pseudomonas sp. PW329 delivers many volatile organic compounds, and R. aquatilis SW26 produces a anti-Legionella siderophore

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Poilleux, Francine. "La fédération girondine de lutte contre les maladies respiratoires : adaptation d'une structure à l'évolution de la pathologie respiratoire." Bordeaux 2, 1994. http://www.theses.fr/1994BOR2M222.

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Rezgui, Awatef. "Étude de la microflore colonisant les tissus ligneux de Vitis vinifera : Intérêt pour le développement d’agents de biocontrôle contre une maladie du bois de la vigne, l’esca." Thesis, Bordeaux, 2016. http://www.theses.fr/2016BORD0449/document.

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Résumé :

Les maladies du bois de la vigne (MDBs) et plus particulièrement l’esca, sont devenues en l’espace de deux décennies l’objet de préoccupations majeures puisqu’elles mettent en danger la pérennité de nombreux vignobles partout dans le monde. En Tunisie, ces maladies sont peu connues mais elles semblent être en pleine expansion et, en France, environ 13% du vignoble est improductif à cause des dépérissements qu’elles provoquent. Pour lutter contre les MDBs, les filières viticoles françaises et tunisiennes sont actuellement dans une impasse technique car elles ne disposent d’aucune méthode de lutte chimique « curative ». Dans ce contexte, l’objectif de cette thèse est de (i) déterminer quels agents pathogènes sont responsables des dégradations du bois de la vigne en Tunisie ? Les symptômes correspondent-ils à ceux de l’esca ? Existe-t-il une spécificité des agents pathogènes chez les ceps tunisiens ? Aussi (ii) afin de lutter contre ces maladies du bois (MDBs), de potentiels agents de biocontrôle bactériens ont été recherchés dans les parties ligneuses de ceps sélectionnés dans des vignobles tunisiens. Ils ont été caractérisés et des essais de protection in planta ont été réalisés. [...] Ces champignons ont été identifiés au niveau morphologique et moléculaire. Leur pathogénicité a été confirmée après inoculation sur jeunes plants de vigne. Des travaux originaux basés sur la co-inoculation de plants de vigne par ces 3 pathogènes ont montré qu’ils pouvaient rentrer en compétition entre eux au sein du végétal. Par ailleurs, sur le même thème, 2 autres pathogènes des MDBs, i.e. Phomopsis viticola et Diploidia seriata, ont été isolés dans une autre étude à partir de ceps prélevés dans la même région en Tunisie. Dans une deuxième étape, la microflore bactérienne colonisant les tissus ligneux de vignes prélevées dans le nord de la Tunisie a été étudiée afin de rechercher des agents de lutte biologique potentiels. La technique d’empreinte moléculaire Single-Strand Conformation Polymorphism (SSCP) a d’abord montré que les communautés bactériennes étaient différentes en fonction des tissus qu’elles colonisaient, i.e. le bois nécrosé ou sain. Soixante-neuf souches bactériennes ont été isolées par méthode pasteurienne, et les 19 souches les plus abondantes ont fait la suite de l’étude. L’identification moléculaire de ces souches par séquençage de l’ARNr 16S et du gène rpoB a montré l’existence de 4 genres colonisant les ceps de vignes : Bacillus, Curtobacterium, Pantoea et Pseudomonas. Ces bactéries ont été également caractérisées au niveau biochimique, métabolique et génétique. Des tests de sélection in vitro contre les trois pathogènes fongiques ont été effectués, suite auxquels, une souche B6 de B. subtilis a été sélectionnée pour des essais de protection in planta en serre. Par la suite, une étude combinant deux bactéries antagonistes isolées de bois de vigne tunisien, i.e. B. subtilis B6, et français, i.e. Pantoea agglomerans S5, a été réalisée pour lutter contre 2 agents pathogènes, Phaeomoniella chlamydospora (isolé des vignobles français) et N. parvum (isolé des vignobles tunisiens), impliqués dans les MDBs. Deux cépages, un fréquent en Tunisie, le Muscat d’Italie, et l’autre en France, le Cabernet Sauvignon, ont été utilisés. En effet, suivant l’agent pathogène et le cépage utilisés, les résultats de protection obtenus étaient différents. Les meilleurs résultats de protection ont été obtenus en combinant les bactéries et en les appliquant sur Muscat d’Italie contre les 2 champignons pathogènes. La spécificité et l’efficacité de la protection biologique a ici été démontrée Grapevine trunk diseases (GTDs) such as esca are of major concern for viticulture worldwide. In Tunisia, knowledge about the symptoms of this disease and the microflora associated with, is still incomplete despite their ability to cause considerable damage to vineyards. In France, around 13% of whole vineyard is unproductive because of GTDs, and no effective treatment currently exists. In that context, the objectives of the present PhD study were: (i) to characterize the fungal microflora inhabiting the wood tissues of Tunisian esca-foliar symptomatic vines in order to identify the pathogens responsible for wood decay. (ii) To investigate the bacterial microflora colonizing the wood tissues of Tunisian grapevines cv. Muscat d’Italie in order to find a suitable Biological Control Agent (BCA) that can be applied to vineyards. First, in order to better characterize the microflora colonizing the wood tissues of vine, samples were collected from 10 vineyards in the north of Tunisia. Fungal isolates were obtained from trunk of grapevines showing decline, small and distorted leaves and chloroses. To identify the isolated fungal species, sequencing of the Internal Transcribed Spacer region of the rDNA was performed (ITS1 and ITS4 primers). Three pathogens, i.e. Lasidiodiplodia pseudotheobromae, Neofusicoccum parvum and Schizophyllum commune, described in the literature as involved in GTDs were isolated for the first time in Tunisia. Their pathogenicity was confirmed in planta. Moreover, the coinoculation of these 3 fungi in planta, showed that they displayed a competitive inhibition effect on each other. In another study, two others pathogens involved in GTDs, i.e. Phomopsis viticola and Diploidia seriata were also isolated from the same region. This PhD also aimed at identifying the bacterial microflora inhabiting the wood tissues of escafoliar symptomatic vines, i.e. necrotic and non-necrotic wood, using microbiological and molecular approaches. Complex bacterial communities, as shown by Single-Strand Conformation Polymorphism (SSCP) analyses, colonize both types of wood tissues. After isolation, the 19 most abundant cultivable strains were sequenced (16S rRNA and rpoB genes) and identified as belonging to four genera: Bacillus, Pantoea, Pseudomonas and Curtobacterium. They were then screened for their in vitro antagonistic traits against the three pathogenic fungi L. pseudotheobromae, N. parvum and S. commune. Based on the results obtained, two bacterial strains were selected: B. subtilis (strain B6) and Pantoea agglomerans (strain S5), respectively isolated from Tunisian and French grapevines. They were then tested in planta on young vines of cv Muscat d’Italie and Cabernet Sauvignon against two fungal pathogens involved in GTDs, i.e. N. parvum (isolated from Tunisian wood) and Phaeomoniella chlamydospora (isolated from French vines). Young vines of both cultivars were inoculated by B. subtilis B6, P. agglomerans S5 or the combination of B6+S5, singly or in combination with N. parvum and P. chlamydospora. In terms of plant protection, the most efficient condition to reduce in planta necrosis caused by the fungal pathogens in the two cultivars was the combination of the two bacteria. However, bacterial treatments were significantly more efficient to reduce necrosis caused by N. parvum or P. chlamydospora in Muscat d’Italie than in Cabernet Sauvignon

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Marcillaud, Laurence. "Etude des propriétés antimicrobiennes d'un extrait végétal : applications dans les domaines viticole et œnologique." Bordeaux 2, 1998. http://www.theses.fr/1998BOR20632.

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Résumé :

En viticulture, les maladies cryptogramiques restent un problème prépondérant surtout lié à l'apparition de souches résistantes rendant les moyens de lutte actuels insufffisants. L'étude de nouveaux principes actifs d'origine végétale semble une voie de recherche intéressante. Un extrait de pépins et de pulpe de Citrus paradisii manifeste un pouvoir fongicide à l'égard de plusieurs champignons pathogènes de la vigne. Son activité se traduit par une variation de la perméabilité membranaire. Cette action semble liée à l'insertion du principe actif de l'édifice phospholopidique, la cellule perdant alors toute résistance aux phénomènes de plasmolyse. De plus cette activité a pour effet secondaire une modification des processus respiratoires cellulaires. Les premiers essais au vignoble laissent apparaître une activité comparable à celle de la bouillie bordelaise vis-à-vis du mildiou et une faible activité dans le traitement de la pourriture grise sur cépage blanc. Les propriétés antioxydante et anti-microbienne du produit peuvent être également appliquées aux processus de vinification. Ainsi, nous avons pu réaliser des vinifications en l'absence de dioxyde de soufre remplacé par l'extrait végétal. Pour ce qui concerne le mutage et la conservation des vins blancs liquoreux, il a été possible de réduire les doses de dioxyde de soufre.

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Pellan, Lucile. "Décryptage des mécanismes impliqués dans le biocontrôle des champignons mycotoxinogènes des céréales." Thesis, Montpellier, 2020. http://www.theses.fr/2020MONTG036.

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Résumé :

Décryptage des mécanismes impliqués dans le biocontrôle des champignons mycotoxinogènes des céréales.Les céréales sont le premier facteur d'exposition des consommateurs aux mycotoxines, des métabolites secondaires toxiques synthétisés par certaines moisissures et présentant un risque pour la santé humaine et animale. Les espèces Fusarium graminearum et Fusarium verticillioides sont ainsi responsables de la production de mycotoxines de type trichothécènes et fumonisines, respectivement, d’un impact élevé surtout en pré-récolte. Avec la diminution de l'utilisation des pesticides en raison de leur toxicité, une stratégie alternative pour lutter contre ces maladies fongiques au champ, peut-être l'utilisation de micro-organismes antagonistes. Non-pathogènes, ces agents de biocontrôle (BCAs) sont capables de limiter la progression des Fusaria et leur synthèse de mycotoxines à l’aide de différents mécanismes biologiques cependant encore mal connus. Dans ce contexte, les objectifs de cette étude sont d’évaluer par quels mécanismes trois BCAs commerciaux sélectionnés (Streptomyces griseoviridis, Trichoderma asperellum, Pythium oligandrum) peuvent moduler la croissance et la production de mycotoxines des pathogènes du genre Fusarium, in vitro et in situ. Des activités antagonistes et des niveaux variables d'inhibition de la croissance (jusqu’à 80%) et de la mycotoxinogenèse (jusqu’ à 90%) ont été observés in vitro selon les BCAs, les pathogènes ou les conditions de culture. Les hypothèses sont ensuite vérifiées et complétées grâce à la mise au point d’une toolbox de tests spécifiques de certains modes d’action. Leur chronologie est évaluée tout au long de l’interaction, de la germination des spores pathogènes jusqu’à la formation de périthèces de conservation, en testant une grande diversité de mécanismes des BCAs : synthèse de composés anti-germinatifs, mycophagie, synthèse d’enzymes chitinolytiques, émission de composés volatils antifongiques, inhibition des voies de biosynthèse des mycotoxines, bio-transformation de mycotoxines, compétition spatiale et nutritionnelle ou impact sur la conservation du pathogène. S. griseoviridis présente des capacités de compétition nutritionnelle, mais sa stratégie principale est basée sur l'antibiose, à travers la synthèse de nombreux composés antifongiques qui compense un déficit important en capacité de colonisation spatiale. Cependant, il peut être à l’origine de stimulation de production de mycotoxines. T. asperellum est capable d'activer un très large éventail de défenses et d'attaques combinant la synthèse de divers composés antifongiques (métabolite, enzymes, COVs), avec différentes cibles (spores, mycélium, mycotoxines), et une action directe par mycoparasitisme. L’efficacité de P. oligandrum est principalement due à sa forte capacité à coloniser l'environnement, avec une action directe via la prédation microbienne et la réduction de la formation de périthèces. Ces comportements in vitro ont pu également être analysés chez F. graminearum in situ tout au long de son cycle de vie (de la colonisation des épis à la survie dans les résidus de culture), et mis en perspectives avec les différents modes d’action identifiés chez chacun des BCAs. L’ensemble du projet a permis d’importantes avancées dans le décryptage des mécanismes d’actions des BCAs, et propose des voies d’amélioration pour optimiser l'utilisation et l'efficacité de ces antagonistes et donc limiter l'utilisation des produits phytopharmaceutiques, tout en maintenant une production saine avec de faibles niveaux de mycotoxines Deciphering the mechanisms involved in the biocontrol of mycotoxinogenic fungi of cereals.Cereals are the first factor of consumer exposure to mycotoxins, toxic secondary metabolites synthesized by particular moulds and which present a risk for human and animal health. The species Fusarium graminearum and Fusarium verticillioides are thus responsible for the production of trichothecenes and fumonisin-like mycotoxins, respectively, with a high impact especially in pre-harvest. With the decrease of pesticide use due to their toxicity, an alternative strategy to control these fungal diseases in the field may be the use of antagonistic microorganisms. Non-pathogenic, these biocontrol agents (BCAs) are able to limit the progression of Fusaria and their synthesis of mycotoxins through various biological mechanisms, however still poorly understood. In this context, the objectives of this study are to evaluate by which mechanisms three selected BCAs (Streptomyces griseoviridis, Trichoderma asperellum, Pythium oligandrum) can modulate the growth and mycotoxin production of Fusarium pathogens, in vitro and in situ. Antagonistic activities and varying levels of inhibition of growth (up to 80%) and mycotoxinogenesis (up to 90%) have been observed in vitro depending on BCAs, pathogens or culture conditions. The hypotheses are then verified and completed thanks to the development of a toolbox of tests specific to certain modes of action. Their chronology is evaluated throughout the interaction, from pathogenic spore germination to the formation of perithecia, by testing a wide variety of BCA mechanisms: synthesis of anti-germinative compounds, mycophagy, chitinolytic enzyme synthesis, emission of volatile antifungal compounds, inhibition of mycotoxin biosynthesis pathways, mycotoxin bio-transformation, spatial and nutritional competition or impact on pathogen conservation. S. griseoviridis presents nutritional competition capacities, but its main strategy is based on antibiosis, through the synthesis of numerous antifungal compounds that offsets a significant deficit in spatial colonization capacity. However, it can stimulate the mycotoxin production. T. asperellum is capable of activating a very wide range of defenses and attacks combining the synthesis of various antifungal compounds (metabolite, enzymes, VOCs), with different targets (spores, mycelium, mycotoxins), and a direct action by mycoparasitism. The efficacy of P. oligandrum is mainly due to its strong capacity to colonize the environment, with a direct action via microbial predation and reduction of perithecia formation. These in vitro performances could also be analyzed in F. graminearum in situ throughout its life cycle (from colonization of ears to survival in culture residues), and put into perspective with the different modes of action identified in each of the BCAs. The whole project has led to important advances in deciphering the mechanisms of action of BCAs and proposes ways of improvement to optimize the use and efficacy of these antagonists. Thus limit the use of chemical plant protection products, while maintaining a healthy production with low levels of mycotoxins

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Adamolle, Cécile. "Le virus de la sharka : obtention et caractérisation partielle d'anticorps polyclonaux spécifiques de protéines non structurales : approche de la bio-écologie de deux sérotypes épidémiques en verger." Bordeaux 2, 1993. http://www.theses.fr/1993BOR28233.

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Anastasi, Carole. "Innovation moléculaire à visée thérapeutique : Conception, synthèse et évaluation des propriétés antivirales de nouveaux dérivés de la 2',3'-didésoxy-3'-thiacytidine : Mécanisme d'action : drogue et prodrogue?" Aix-Marseille 2, 2003. http://www.theses.fr/2003AIX22068.

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Thèses sur le sujet « Maladies bactériennes – Lutte contre »

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