Thèses : « Synthèse peptique »

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Fruchart-Gaillard, Carole. « Caractérisation pharmacologique et structurale de l'interaction de neurotoxines sur des récepteurs cholinergiques ». Paris 6, 2003. http://www.theses.fr/2003PA066124.

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Troalen, Frédéric. « Utilisation de la synthèse peptidique en immunochimie : application à l'étude de protéines présentant différents niveaux d'organisation structurale ». Paris 5, 1989. http://www.theses.fr/1989PA05P618.

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Petit, Sylvain. « Réduction de pyridines pour la synthèse de Building-Blocks chiraux : peptidomimétiques de type imidazolique : synthèse et application à la synthèse d'analogues d'intérêt ». Phd thesis, INSA de Rouen, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00581586.

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Résumé :

Deux sujets indépendants ont été traités dans ce manuscrit.Dans une première partie a été étudiée la possibilité d'obtenir des synthons chiraux à partir de la pyridine. Pour cela nous avons dans un premier temps développé une méthode originale de quaternisation des sels de pyridium et d'imidazoliums grâce à une réaction de Mitsonubu. Par la suite, des 2-aminopyridines ont été substituées puis engagées dans une réaction de quaternisation-réduction conduisant à des composants saturés. Malheureusement, des composés n'ont pu conduire aux synthons linéaires envisagés.Dans une seconde partie, nous nous sommes intéressés au développement d'un nouveau type de peptidomimétique dans lequel le lien amide est remplacé par un cycle imidazolique, ceci dans la continuité de travaux menés dans notre équipe. Dans un premier temps, nous nous sommes focalisés sur la mise au point de conditions efficaces menant au mime considéré. Cette méthodologie nous a permis la synthèse de plusieurs dipeptides.

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Zerkout, Saïd. « Synthèse d'hydrazino peptides ». Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1994. http://www.theses.fr/1994INPL052N.

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Résumé :

La modification de la liaison amide dans les peptides a plusieurs conséquences potentielles: une biodégradabilité réduite, une possible modulation structurale due aux perturbations du réseau de liaisons hydrogène, et éventuellement, une bio-activité modulée pour l'analogue pseudopeptidique résultant, sans nécessiter de changer les chaines latérales. Nous avons étudie les perturbations structurales induites par la substitution d'une liaison amide par un groupe hydrazide dans diverses séquences mono-, di- et tripeptidiques protégées à leurs deux extrémités par une fonction amide, et contenant l'analogue hydrazine de la proline ou de l'alanine. L'analyse conformationnelle a été conduite à l'état solide par diffraction des rayons X, en solution par spectroscopie infrarouge et résonance magnétique nucléaire du proton, et par modélisation moléculaire. Après des considérations générales sur les structures des peptides et pseudopeptides, l'aspect chimique et technique de ce travail est présenté dans le second chapitre. Le troisième chapitre rassemble les données spectroscopiques et les conclusions sur les structures présentes qui sont ensuite discutées en référence aux séquences peptidiques originelles. La conclusion principale est que le groupe hydrazide induit localement un repliement du à la nucléophilie de l'oxygène du carbonyle et de l'azote alpha qui participent tous les deux a une liaison hydrogène bifide avec le site N-H amide immédiatement situe en aval. La conformation repliée qui en résulte est très stable, et capable de donner naissance à une forme globalement repliée de la molécule, de façon très semblable au repliement beta dans les peptides

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Abbas-Quinternet, Cécile. « Synthèse et études structurales de nouveaux 2 : 1-[[alpha]/aza]-oligomères, vers de nouveaux foldamères ». Thesis, Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2009. http://www.theses.fr/2009INPL055N/document.

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Résumé :

Les foldamères sont considérés comme étant des oligomères capables de s’auto-structurer en solution par le biais de liaisons non covalentes. Ces composés peuvent présenter un grand intérêt biologique dans la mesure où l’on peut en attendre une meilleure résistance aux peptidases, la possibilité de se conjuguer aux ARN et ADN, etc… Au sein des oligomères azapseudopeptidiques, le point d’ancrage de la chaîne latérale est affecté car le CHa de l’acide aminé originel est remplacé par un atome d’azote. Cette substitution engendre la perte du centre chiral CHa et la perturbation des caractéristiques électroniques et structurales des deux liaisons amides adjacentes. Ce travail concerne l’élaboration de nouvelles voies de synthèse de 2:1-[a/aza]-oligomères en solution. Nous avons mis au point un protocole de synthèse généralisable des précurseurs azadipeptidiques Boc-azaAA-AA-OMe orthogonalement protégés. Les 2:1-[a/aza]-trimères, obtenus à partir des précurseurs azadipeptidiques, ont ensuite été engagés dans des réactions d’oligomérisation par couplage peptidique, ce qui nous a permis d’isoler les tous premiers 2:1-[a/aza]-oligomères avec de très bons rendements. La structure des composés préparés a été analysée par spectroscopies RMN, IR, diffraction des RX et par modélisation moléculaire. L’examen des 2:1-[a/aza]-trimères a révélé la formation d’un coude ßII. Les 2:1-[a/aza]-hexamères ont la capacité à s’auto-structurer. D’une manière générale, grâce aux études réalisées par RMN et par IR, nous pouvons fortement envisager que nos 2:1-[a/aza]-oligomères se structurent en solution pour former des foldamères
Foldamers are described as any oligomers with a strong tendency to adopt a specific compact conformation in solution through non covalent interactions. These compounds can make duplexes with RNA and DNA and are more resistant to peptidases. Thus foldamers can have a biological activity. Among azapseudopeptide oligomers, substitution of a nitrogen for the CHa group is a way to preserve the side chains of analogous peptides. This substitution entails the lost of chiral center and the overall conformational and local electronic states might be affected. We have synthesized 2:1-[a/aza]-oligomers on liquid phase. We have developed a new general protocol for obtaining various Boc-azaAA-AA-OMe. Then, 2:1-[a/aza]-trimers, obtained from the precursors, were used in oligomerization reaction by peptidic coupling. By this way, we obtained the first 2:1-[a/aza]-oligomers in very good yields. The structure of the obtained oligomers was analysed by NMR and IR spectroscopies, X-ray diffraction and molecular modelling. The 2:1-[a/aza]-trimers show a ßII-turn and the 2:1-[a/aza]-hexamers structure themselves. On the whole, by NMR and IR spectroscopies, we can strongly consider that our 2:1-[a/aza]-oligomers structure themselves in solution to form foldamers

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Pavlov, Nikola. « Synthèse asymétrique d’analogues de β2-tryptophane et application en synthèse peptidique ». Thesis, Montpellier 2, 2011. http://www.theses.fr/2011MON20186/document.

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Résumé :

Le tryptophane est un acide aminé essentiel qui, en plus de son rôle dans la biosynthèse des protéines, est le précurseur biochimique de nombreux composés. Beaucoup de peptides biologiquement actifs, qui possèdent dans leurs séquences cet acide aminé contenant un substituant indole, ont des propriétés physiologiques importantes. On peut citer par exemple des dérivés comme la sérotonine, le tryptamine, le sumatriptan qui ont des effets neurophysiologiques. Les analogues de tryptophane sont aussi des « building block » important pour la synthèse de peptidomimétiques, d'analogues de produits naturels et de composés biologiquement actifs. Une autre propriété importante du tryptophane et de ses analogues concerne la fluorescence du noyau d`indole qui peut être utilisée par exemple pour l`étude de changements conformationnels d'une protéine et aussi l'étude des interactions protéine-membrane.Dans ce contexte, cette thèse est consacrée à la mise au point d'une nouvelle stratégie de synthèse asymétrique permettant d'accéder efficacement à d`analogues énantiopurs du tryptophane : les beta 2-tryptophanes (2-indolyl-beta-alanines) ainsi qu'à la synthèse et l'étude de nouveaux analogues de peptides à activité opioïdes contenant ces analogues. Nous avons développé une nouvelle stratégie de synthèse asymétrique permettant d'accéder efficacement à des analogues de beta 2-tryptophane (2-indolyl-beta-alanines) énantiopurs. - Nous avons effectué la synthèse d`un auxiliaire chiral le (R)-4-(3-hydroxy-4,4-diméthyl-2-oxopyrrolidin-1-yl) benzoate de benzyle ainsi que celle du dérivé nitroacrylate correspondant : le (R)-4-(3-(3-nitroacryloyloxy)-4,4-diméthyl-2-oxo pyrrolidin-1-yl) benzoate de benzyle ((R)-10). Les composés racémiques ont également été synthétisés pour préparer les témoins racémique des molécules cibles.- Nous avons mis au point des conditions optimisées de la réaction d`alkylation de Friedel-Crafts entre ce nitroacrylate chiral et divers indoles.- Nous avons également étudié pour chaque produit ainsi obtenu les meilleures conditions de transformation conduisant à la synthèse des analogues des N-Fmoc-beta 2-tryptophanes racémiques et optiquement purs.- Nous avons contrôlé l'absence d'épimérisation pouvant se produire pendant les réactions de transformation des produits optiquement purs et déterminé sans ambiguïté la configuration absolue des 2-indolyl-beta-alanines isolées.- Nous avons synthétisé sur support solide par stratégie-(Fmoc) 4 nouveaux peptides potentiellement biologiquement actifs et 2 peptides de référence - analogues raccourcis de la nociceptine
Tryptophan, an essential amino acid, both functions as a building block in protein biosynthesis and as a biochemical precursor. It is abundantly found in most biologically active peptides that exhibit various physiological properties in particular hormonal and antimicrobial activities. Some of its natural derivatives like serotonin, tryptamine, and also unnatural derivatives such as sumatriptan, have neurophysiologic effects. Tryptophan analogues are also important building blocks for the synthesis of peptidomimetics, natural products and biologically active compounds. Another important property of tryptophan and tryptophan analogues is related to the fluorescence of the indole ring that can be used to study conformational changes in protein and in protein-membrane interactions. The asymmetric Friedel-Crafts alkylation of various indoles with a chiral nitroacrylate provides optically active beta-tryptophan analogues after reduction of the nitro group and removal of the chiral auxiliary. This reaction generally occurs in good yield and high diastereoselectivity (up to 90:10). We have established a new route to prepare enantiopure beta-tryptophan analogues ((S)-2-indolyl-beta-alanines). We showed that beta-nitroacrylate (R)-2 is a good chiral auxiliary for asymmetric Friedel-Crafts alkylation of indoles. (R)-2-indolyl--alanines were obtained by the same synthetic route by using the chiral compound (S)-2. beta-tryptophan analogues are delivered in their N-Fmoc-protected form, ready to use for instance in solid phase peptide synthesis, which is one of the most popular method for peptide synthesis. This study provides a new example of asymmetric beta-tryptophan analogues preparation and further studies concerning their applications in medicinal chemistry and in organic synthesis are now in progress

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Attal, Sandra. « Utilisation des enzymes en chimie organique : application à la synthèse d'esters de dipeptides par la papai͏̈ne et de galactosyl-sérines par les α-et β-galactosidases ». Paris 5, 1992. http://www.theses.fr/1992PA05P614.

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Fritz, Loïc. « Etude de l'activité peptidyl synthétase de la carboxypeptidase Y : influence de la structure primaire du fragment C-terminal du substrat et application au radiomarquage 3H de 3 hormones neurohypophysaires ». Paris 5, 1989. http://www.theses.fr/1989PA05P617.

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Simon, Julien. « Etude méthodologique du couplage d’acides aminés trifluorométhylés et application à la synthèse d’analogues du GPE, un tripeptide à visée thérapeutique ». Thesis, Cergy-Pontoise, 2012. http://www.theses.fr/2012CERG0596/document.

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Résumé :

Le tripeptide GPE possède une activité neuroprotectrice intéressante in-vitro et in-vivo pour différents types de dommage neuronaux. L'objectif de cette thèse est de mettre au point des méthodes de couplage peptidique pour les acides aminés trifluorométhylés et de réaliser des analogues trifluorométhylés du GPE.Au cours de cette thèse, la synthèse d'acides aminés trifluorométhylés cycliques énantiopurs (proline, pseudoproline) a été réalisée à l'échelle du gramme.Ensuite, une étude méthodologique de l'incorporation de ces acides aminés trifluorométhylés dans des peptides a été effectuée.Des expériences RMN ont été menées pour étudier la conformation cis/trans de la liaison amide de ces peptides trifluorométhylés.Enfin, des analogues du tripeptides GPE ont été synthétisé en remplaçant le motif proline par une proline ou pseudoproline trifluorométhylé. Des tests biologiques sont actuellement en cours pour évaluer leur activité sur divers troubles neuronaux
GPE is a tripeptide with neuroprotecting activity both in-vitro and in-vivo for various neuronal dammage. The goal of this thesis was to work out peptide coupling methods for trifluoromethylated amino acids and the synthesis of trifluoromethylated analogs of GPE.During this thesis, the synthesis of enantiopure cyclic trifluoromethylated amino acids (proline and pseudoprolines) was performed successfully on grams scale.Then, methodological study of their incorporation in peptide was performed.NMR experiments were made to investigate the cis/trans conformation of the amide bound of trifluoromethylated peptide. At last, analogs of the tripeptide GPE were made with trifluoromethylated proline and pseudoprolines instead of the proline. Biological tests are currently under progress to evaluate their activity on various neuronal disorders

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Scornet, Noémie. « Etude de l'allergie aux antibiotiques : synthèse de peptides antigéniques ». Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015SACLS032/document.

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Résumé :

Un certain nombre de principes actifs sont responsables d'hypersensibilité allergique, en particulier les pénicillines et les sulfamides. Selon la théorie de l'haptène, ces principes actifs ne peuvent pas induire de réaction immunitaire par eux-mêmes, mais doivent être liés à une protéine. Ces protéines hapténisées par un antibiotique sont capturées puis digérées par des cellules présentatrices d'antigènes, qui présentent aux lymphocytes T des peptides issus de la protéine digérée. Les peptides hapténisés peuvent activer le système immunitaire des patients allergiques. Ce travail de thèse porte sur la sélection et la synthèse de peptides modifiés par les antibiotiques étudiés, dans le but de trouver ces peptides immunogènes. Pour réaliser cette étude, l'albumine du sérum humain (HSA) a été choisie comme protéine modèle. Son hapténisation a été étudiée pour trois principes actifs de forte prévalence allergique : la pénicilline G, l'amoxicilline et le sulfaméthoxazole. L'analyse par spectrométrie de masse des bioconjugués HSA-antibiotique a permis l'identification des acides aminés hapténisés pour la conception et la sélection par des méthodes in silico de peptides de 15-mers potentiellement immunogènes. La synthèse de ces peptides implique la préparation d'un monomère acide aminé-haptène stable pour une synthèse orientée de peptides d'enchaînements diversifiés. Pour les antibiotiques de la famille des pénicillines, cette synthèse s'est orchestrée autour d'une étape clé : l'ouverture du cycle β-lactame par une lysine. En ce qui concerne le sulfamide sulfaméthoxazole, la synthèse du monomère stable cystéine-sulfaméthoxazole a reposé sur une étape clé de couplage entre le sulfaméthoxazole et un acide cystéique. A partir du monomère lysine-pénicilline G, des peptides ont déjà été synthétisés et testés sur des lymphocytes T. L'effet immunogène et leur valorisation en tant qu'outils pour le diagnostic sont en cours d'évaluation
Many drugs are responsible of allergic reactions, in particular penicillins and sulfonamides. As these antibiotics respond to the hapten theory, they cannot induce the immune system by themselves, but have to bind a protein. These haptenized proteins are detected then digested by antigen presenting cells into peptides which are presented to T cells. These haptenized peptides are responsible of the activation of the immune system in allergic patient. The aim of this study is to select and synthesize immunogenic peptides, modified by selected antibiotics. The human serum albumin (HSA) was chosen as a model protein. It haptenization was studied for three drugs with high allergic prevalence: benzylpenicillin, amoxicillin and sulfamethoxazole. Mass analysis of the resulting bioconjugates HSA-antibiotic allowed identification of haptenized amino-acid which were used to design and select through in silico methods potentially immunogenic 15-mers peptides. The synthesis of these peptides implies the preparation of stable amino-acid-hapten monomers for an oriented synthesis of diversified peptidic sequences. For penicillins, this synthesis was based on a key step: the opening of the penicillins β-lactam ring by a lysine. Regarding the sulfonamide sulfamethoxazole, the synthesis of a stable cysteine-sulfamethoxazole monomer was centered on a coupling key step between the sulfamethoxazole and a cysteic acid. From lysine-benzylpenicillin monomer, peptides have already been synthesized and tested over T cells. Their immunogenic effect and development as tools for diagnosis are being evaluated

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Ieronymaki, Matthaia. « Immunological and Conformational characterization of synthetic peptide probes for autoimmune diseases ». Thesis, Cergy-Pontoise, 2016. http://www.theses.fr/2016CERG0831/document.

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Résumé :

Les maladies auto-immunes sont des maladies chroniques et hétérogènes caractérisées par des réactions du système immunitaire acquis contre les propres tissus sains de l'organisme. Ces maladies affectent presque 5% de la population mondiale et en particulier les jeunes adultes. La complexité de leur spectre est énorme et même si leur étiologie est encore incertaine, il a été démontré que des facteurs génétiques et environnementaux sont impliqués dans le déclenchement du mécanisme pathologique. Cependant, il est nécessaire d'utiliser des outils diagnostiques et / ou pronostiques fiables pour le diagnostic précoce avant que des dommages cellulaires irréversibles ne se produisent et pour surveiller la progression de la maladie.De nombreuses études ont mis en évidence la présence de différents auto-anticorps dans le sérum de patients atteints de maladies auto-immunes. Les auto-anticorps qui sont spécifiques d’une maladie peuvent être utilisés en tant que biomarqueurs (BM) pour son diagnostic alors que les auto-anticorps qui diffèrent en fonction de l'état de la maladie peuvent être utilisés dans le suivi des patients. En fait, dans le cas de l'auto-immunité, un BM facilement détectable et fiable peut être représenté par le titre d'un auto-anticorps spécifique.Dans ce contexte, nous nous intéressons à deux maladies différentes, la sclérose en plaques (SEP) et la gammapathie monoclonale, en utilisant l'approche chimique inverse via le criblage de librairies de peptides par des sérums de patients.En particulier, l'importance des anticorps anti-myéline, et surtout, des anticorps anti-MOG (myéline oligodendrocyte glycoprotéine) est toujours l’objet de débats, soulignant la question très controversée d'un rôle pathogène putatif d'anticorps anti-MOG dans la SEP. Dans cette thèse, nous avons étudié le rôle de MOG comme auto-Ag putatif dans la SEP en utilisant le modèle expérimental d’encéphalomyélite auto-immune (EAE). Ainsi, afin d'évaluer la présence d'un mécanisme d’« epitope spreading » des cellules B, à savoir l'apparition d'une réponse dirigée vers des épitopes distincts de l'agent pathogène induisant la réponse immunitaire, nous avons synthétisé et testé en tant que sondes antigéniques cinq peptides synthétiques qui couvrent la séquence 1-117 de MOG.La seconde étude a porté sur la sélection d'un peptide mimant l'épitope minimal reconnu par l'anticorps monoclonal commercial anti- natural killer cell-1 humain (anti-HNK-1) en utilisant la résonance plasmonique de surface (SPR). L’épitope HNK-1 est considéré comme le déterminant antigénique de la glycoprotéine associée à la myéline (MAG), un composant quantitativement mineur des gaines de myéline. On observe que les patients atteints de troubles neurologiques auto-immuns, tels que la gammapathie monoclonale à IgM et la polyneuropathie démyélinisante, développent souvent des anticorps anti-MAG ciblant spécifiquement l’épitope HNK-1. Par conséquent, l'identification et la caractérisation de ces anticorps est pertinente. Le peptide choisi suite à notre étude pourrait ensuite être utilisé chez des patients atteints de troubles neurologiques pour le développement d'un outil de diagnostic fiable ou de surveillance de l'activité de la maladie par l'identification d'anticorps anti-HNK-1 dans le sérum des patients
Autoimmune diseases (ADs) refer to chronic and heterogeneous diseases with acquired immune system’s reactions against the body’s own healthy tissues. ADs affect more than 5% of the population worldwide and especially young adults. The complexity of their spectrum is enormous and even if their etiology is still unclear, it was demonstrated that both genetic and environmental factors are involved in triggering the pathological mechanism. Hence, a reliable diagnostic and/or prognostic tool for an early diagnosis of ADs before irreversible cellular damage occurs and for monitoring their progression is demanded.Numerous studies have revealed the presence of different autoantibodies (auto-Abs) in sera of patients suffering from ADs. Autoantibodies that are specific for a disease can be used as biomarkers (BMs) for its diagnosis while autoantibodies that differ depending on the disease state can be used in the follow up of the patients. Actually, in the case of autoimmunity, an easily detectable and reliable BM may be represented by the titer of a specific auto-Ab.In this context, we aimed to identify target(s) of the response for two different ADs, multiple sclerosis (MS) and monoclonal gammopathy, using the chemical reverse approach, which involves the screening of focused antigen (Ag) libraries with patients’ serum.In particular, the significance of anti-myelin antibodies, and especially, anti- Myelin Oligodendrocyte Glycoprotein (anti-MOG) antibodies is still matter of debate, underscoring the highly controversial issue of a putative pathogenetic role of anti-MOG antibodies in MS. In this thesis we investigated the role of MOG as putative auto-Ag in MS using the experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE) model. Moreover, in order to assess the presence of a B-cell epitope spreading mechanism, i.e. the occurrence of a response directed toward epitopes distinct from the disease-inducing agent, we synthesized and tested as antigenic probes also five synthetic peptides covering the 1-117 sequence of MOG.The second issue focused on the selection of a peptide mimicking the minimal epitope recognized by the commercial available monoclonal antibody anti-human natural killer cell-1 (anti-HNK-1) using Surface Plasmon Resonance (SPR) technique. HNK-1 epitope, is considered as the antigenic determinant of myelin-associated glycoprotein (MAG), a quantitatively minor component of myelin sheaths. It is observed that patients affected by autoimmune neurological disorders, such as IgM monoclonal gammopathy and demyelinating polyneuropathy, often develop anti-MAG antibodies specifically targeting the HNK-1 epitope. Accordingly, identification and characterisation of these antibodies is relevant. The selected peptide could be subsequently used in earlier stage patients for the development of a novel and reliable diagnostic tool for anti-HNK-1 antibody identification in sera of patients affected by autoimmune neurological disorders monitoring disease activity

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Strauss, Jörg. « Optisch aktive chromophorfunktionalisierte Cyclo- und Hairpinpeptide Synthese, Elektrochemie, Spektroskopie / ». [S.l.] : [s.n.], 2002. http://deposit.ddb.de/cgi-bin/dokserv?idn=964806177.

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Nguyen, Van Nhien Albert. « Synthèse stéréosélective de glyco-a-aminonitriles et applications en synthèse peptidique et hérérocyclique ». Amiens, 2001. http://www.theses.fr/2001AMIE0004.

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Halie, Delphine. « Synthèse diastéréosélective de mimes du peptide RGD ». Paris 5, 2006. http://www.theses.fr/2006PA05P639.

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Clavé, Guillaume. « Synthèse de nouveaux réactifs hétérotrifonctionnels : application au SPIT-FRI ; synthèse d'analogues des microcystines ». Rouen, 2009. http://www.theses.fr/2009ROUES046.

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Résumé :

Le SPIT-FRI est une nouvelle méthode de détection imunoanalytique par compétition impliquant la ligation, sur une seule et même structure, d’un fluorophore, d’un analogue de l’analyte à détecter et d’un support solide. Ainsi l’utilisation de cette méthode nécessite la mise en œuvre de compétances en optique, immunologie et chimie. Les travaux concernant la partie chimique font l’objet de ce manuscrit de thèse, plus particulièrement ils portent d’une part sur la synthèse d’analogues d’une famille d’analytes prioritaire à détecter : les microcystines. Il s’agit de toxines naturelles, principales responsables de la toxicité de l’eau douce, produites par diverses familles de cyanobactéries. D’autre part, un nouveau type de réactifs hétérotrifonctionnels (i. E. , tripode) ont été synthétisés en vue d’effectuer leur dérivatisation séquentielle, dans un premier temps avec un analogue d’analyte d’intérêt, un fluorophore, et enfin utiliser la troisième fonction réactive afin d’immobiliser sur support solide l’entière structure. Concernant la synthèse d’analogues des microcystines, de très bons résultats ont été obtenus avec l’obtention de cinq analogues dont les structures ont été affinées grâce aux résultats obtenus avec les analogues précédents pour finalement aboutir à la synthèse d’un analogue validé pour une mise en œuvre du SPIT-FRI. Au cours de ces travaux, différents tripodes ont été synthétisés et utilisés avec différents analogues de composés d’intérêt, notamment des toxines naturelles, afin de mettre en œuvre le SPIT-FRI. Des premiers résultats très encouragants ont été obtenus du point de vue synthétique même si d’autres problèmes concernant la mise en œuvre du SPIT-FRI sont apparus.

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Franceschini, Nicolas. « Synthèse énantiosélective de motifs rigidificateurs du squelette peptidique ». Amiens, 2004. http://www.theses.fr/2004AMIED003.

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Résumé :

Ce travail a pour objet la synthèse énantiosélective de motifs 2-oxopipérazines 3-substitués en vue de les incorporer dans des analogues peptidiques à visée anti-tumorale. La stratégie choisie permet de contrôler la configuration absolue de deux carbones asymétriques. Celle du premier carbone asymétrique repose sur l'alkylation diastéréosélective en C-3 d'une 1-(2'-hydroxyéthyl)-2-oxopipérazine. Un jeu d'oxydation sélective permet de contrôler la configuration absolue du second carbone asymétrique en C-1' autorisant l'accès à tous les stéréoisomères possibles. Ces travaux ont également permis d'établir une nouvelle méthode d'obtention du noyau thiomorpholin-3-one. Une série d'inhibiteurs potentiels de l'aromatase humaine de structure imidazothiomorpholine a ainsi vu le jour. De plus, l'alkylation diastéréosélective appliquée aux 4-(2'-hydroxyéthyl)-thiomorpholin-3-ones permet de préparer facilement et énantiosélectivement une large gamme de noyaux thiomorpholin-3-ones 2-substitués
In this manuscript, the enantioselective synthesis of constrained dipeptide analogues to be incorporated in a segetalin is described. We have chosen, as a constraint, a 3-substituted-2-oxopiperazine unit. Insertion of this residue could reinforce the segetalin's anti-angiogenic character. The synthesis of the constrained dipeptide, involved a diastereoselective alkylation of a key-intermediate, prepared from L-serine in 7 steps in 44% yield. In parallel, we worked out a new strategy to access to the thiomorpholin-3-one skeleton. Thus, we prepared some analogues containing this cycle and presenting the necessary functionalities to be aromatase inhibitors. Finally, an efficient asymmetric synthesis of 2-substitued-thiomorpholin-3-ones by stereocontrolled alkylation at the 2-position has been proposed

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Beuzelin, Isabelle. « Synthèse peptidique prébiotique à partir de N-carbamoylaminoacides ». Montpellier 2, 1998. http://www.theses.fr/1998MON20206.

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Résumé :

Le travail presente dans cette these s'inscrit dans le cadre de la chimie de l'evolution et concerne plus particulierement la chimie de l'evolution. Dans la premiere partie de ces travaux, les possibilites competitives de synthese d'-aminoacide et de n-carbamoylaminoacide ont ete analysee. Dans les conditions prebiotiques presumees, l'equilibre resultant du systeme rcho/nh3/hcn entre l'-hydroxynitrile (>99,9%) et l'-aminonitrile (<0,1%) a pu etre cinetiquement deplace vers le precurseur de l'-aminoacide (l'-aminonitrile) dans des conditions diluees extremement douces, selon deux processus catalytiques utilisant le formaldehyde et l'anhydride carbonique. Une etude cinetique du comportement des composes intermediaires de ces deux processus catalytiques a permis de montrer la preeminence des n-carbamoylaminoacides. Dans la deuxieme partie de cette these, le comportement cinetique des -aminoacides en presence de solutions aqueuses de cyanate a ete etudie en prenant en compte les differents processus catalytiques d'hydrolyse des cyanates. La glycine, aminoacide modele dans cette etude, meme a faible concentration (10-3 mol. L-1) est convertie au ph de l'ocean primitif en n-carbamoylglycine. La derniere partie de ces travaux est relative a l'activation chimique des n-carbamoylaminoacides par le systeme gazeux nitrosant no/o2 en phase solide aussi bien qu'en solvant organique. La nitrosation des n-carbamoylaminoacides constitue une voie d'acces simple aux n-carboxyanhydrides avec une tres bonne selectivite et sans rejets autres que n2 et h2o. Cette synthese correspond a une nouvelle voie efficace de preparation des n-carboxyanhydrides, veritables precurseurs peptidiques.

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Collet, Magalie. « Peptidonucléoside polyoxine J, inhibiteur de la chitine synthase : approches vers la synthèse du nucléoside C2' - désoxy -C2' fluoré, et synthèse de l'acide 5-O-carbamoyle polyoxamique ». Toulouse 3, 2004. http://www.theses.fr/2004TOU30198.

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Résumé :

Les polyoxines, peptidonucléosides d'origine naturelle connus pour leurs propriétés antifongiques en tant qu'inhibiteurs de la biosynthèse de la chitine, sont des composés très actifs in vitro, mais présentant une faible biodisponibilité in vivo. Le but de cette thèse a donc été de trouver des méthodes de synthèse d'analogues C2'-désoxy-C2'-fluorés de la thymine polyoxine C, constituant nucléosidique de la polyoxine J (la plus active), ainsi que d'obtenir, d'une manière originale, la partie peptidique non naturelle de la polyoxine J, à savoir l'acide 5-O-carbamoyle polyoxamique. Après une présentation de la cible biologique et de l'intérêt de l'introduction d'un atome de fluor, ce travail s'est divisé en deux grandes parties. Tout d'abord, deux approches de la synthèse de la partie nucléosidique fluorée par passage par des 2-désoxy-2-fluorobutyrolactones, puis une optimisation de la synthèse de la partie peptidique via la formation d'un intermédiaire oxazolidinone
Polyoxins, which form an important class of peptidyl nucleosidic antibiotics that selectively and competitively inhibit chitin synthase, are very active components in vitro, but weakly bioavailable in vivo. The subject of this thesis has been to found new synthetic methods to access to C2'-fluoro-C2'-deoxy analogues of thymine polyoxine C, nucleosidic part of polyoxine J (the more active one), and to obtain, by an original way, the non natural peptidic moiety of polyoxine J, which is the 5-O-carbamoyl polyoxamic acid. After a presentation of the biological target and the interest of the introduction of a fluorine atom, this work is divided into two parts. Fisrt, two approaches of the fluorinated nucleosodic part using 2-deoxy-2-fluorobutyrolactones as intermediates, and then, an optimization of the synthesis of the peptidic part using the formation of an oxazolidonone intermediate

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Liu, Yong-Peng. « Total Synthesis of Microsclerodermin D ». Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASF024.

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Résumé :

La microsclerodermine D est un peptide macrocyclique d’origine marine qui comporte six amino acides, dont deux sont disponibles commercialement : la glycine (Gly) et la sarcosine (Sar). Les quatre autres amino acides : l’acide (R)-γ-amino-β-hydroxybutyrique (GABOB), le D-6-chlorotryptophane (6-Cl-Trp), un β-amino acide polyhydroxylé (APTO) et l’acide 3-amino-4-hydroxypyrrolidinoacetique (PyrrAA) seront préparés via de nouvelles voies de synthèse. Notre objectif est de développer une voie de synthèse de la microsclerodermine D modulable et qui permettrait la synthèse d’autres membres de la famille des microsclerodermines et d’analogues. Nos nous intéresserons également à de potentielles études permettant d’évaluer leurs propriétés biologiques et leur potentiel en tant qu’agent anticancéreux
Microsclerodermin D is a macrocyclic peptide of marine origin which contains six amino acids, of which two are commercially available: glycine (Gly) and sarcosine (Sar). The four other amino acids: (R)-γ-amino-β-hydroxybutyric acid (GABOB), D-6-chlorotryptophan (6-Cl-Trp), a polyhydroxylated β-amino acid (APTO) and 3-amino-4-hydroxypyrrolidinoacetic acid (PyrrAA) will be accessible by new synthetic routes. Our goal is to develop a modular synthetic route to microsclerodermin D that could be applicable for the preparation of other microsclerodermin family members and analogues thereof. We are also looking forward to make some investigations on their biological activities or potential as anticancer drug

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Wilking, Sven David. « Synthese und Charakterisierung DNA-bindender Peptide ». [S.l.] : [s.n.], 2006. http://deposit.ddb.de/cgi-bin/dokserv?idn=981403824.

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Biagini, Anne. « Synthèse peptidique catalysée par les protéases en milieu faiblement hydraté ». Aix-Marseille 3, 1990. http://www.theses.fr/1990AIX30074.

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Résumé :

Le greffage de polyethylene glycol (peg) sur les groupements amines des enzymes permet de les solubiliser dans les solvants organiques tout en conservant leur activite catalytique. Ainsi modifiees, la subtilisine, la thermolysine et la papaine peuvent catalyser la synthese de dipeptides par condensation ou aminolyse d'un acide amine n-protege. La specificite des proteases pour le residu donneur du groupement carboxylique est modifiee dans le benzene. De plus, la peg-papaine catalyse la synthese d'oligopeptides et la digestion des proteines. Lorsque la reaction de proteolyse est realisee en presence d'un agent nucleophile potentiel, des reactions de transpeptidation apparaissent et permettent l'incorporation d'acides amines dans les proteines. Il y a la une potentialite d'application de cette technique a la valorisation des proteines sur le plan nutritionnel par exemple

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Blondelle, Sylvie. « Synthèse peptidique sur polymères carbonylés via les imidazolidinones-4 ». Montpellier 2, 1988. http://www.theses.fr/1988MON20136.

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Suppo, Jean-Simon. « Développement d’une nouvelle stratégie pour la synthèse peptidique inversée ». Thesis, Montpellier, Ecole nationale supérieure de chimie, 2015. http://www.theses.fr/2015ENCM0023.

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Résumé :

Ce manuscrit traite du développement d’une nouvelle méthodologie de synthèse peptidique inversée. En premier lieu, une procédure simple et dans des conditions douces de formation de liaison peptidique est abordée. Contrairement à la stratégie classique où un acide carboxylique est activé, la réaction à lieu en présence d’amines activées. La stratégie a été appliquée à la synthèse de dipeptides et s’est révélée particulièrement efficace dans le cas très sensible de la cystéine où aucune trace d’épimérisation a été détectée. Cette stratégie a également prouvé son efficacité dans les cas du test d’Anderson. La synthèse d’un tétrapeptide modèle dans la direction naturelle (N->C) a permis d’illustrer le champ d’application de la méthodologie. Parallèlement à ce travail, le développement de nouveaux groupements protecteurs silylés de la fonction acide carboxylique est abordé, potentiellement applicables dans le cadre d’une synthèse peptidique dans le sens naturel (N->C)
This manuscript deals with the development of a new inverse peptide synthesis. First, a mild, practical, and simple procedure for peptide-bond formation is reported. Instead of activation of the carboxylic acid functionality, the reaction involves an unprecedented use of activated α-aminoesters. The method provides a straightforward entry to dipeptides and was effective when a sensitive cysteine residue was used, as no epimerization was detected in this case. In a same time, the methodology has proved his efficiency concerning the Anderson’s test. The applicability of this method to iterative peptide synthesis was illustrated by the synthesis of a model tetrapeptide in the challenging reverse NC direction. Finally, the development of a new strategy of protection of carboxylic acid function into silyl esters was described en route to an application in reverse NC direction

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Simon, Julien. « Etude méthodologique du couplage d'acides aminés trifluorométhylés et application à la synthèse d'analogues du GPE, un tripeptide à visée thérapeutique ». Phd thesis, Université de Cergy Pontoise, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00816535.

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Résumé :

Le tripeptide GPE possède une activité neuroprotectrice intéressante in-vitro et in-vivo pour différents types de dommage neuronaux. L'objectif de cette thèse est de mettre au point des méthodes de couplage peptidique pour les acides aminés trifluorométhylés et de réaliser des analogues trifluorométhylés du GPE.Au cours de cette thèse, la synthèse d'acides aminés trifluorométhylés cycliques énantiopurs (proline, pseudoproline) a été réalisée à l'échelle du gramme.Ensuite, une étude méthodologique de l'incorporation de ces acides aminés trifluorométhylés dans des peptides a été effectuée.Des expériences RMN ont été menées pour étudier la conformation cis/trans de la liaison amide de ces peptides trifluorométhylés.Enfin, des analogues du tripeptides GPE ont été synthétisé en remplaçant le motif proline par une proline ou pseudoproline trifluorométhylé. Des tests biologiques sont actuellement en cours pour évaluer leur activité sur divers troubles neuronaux.

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Pradel, Valérie. « Synthèse d'inhibiteurs de la dipeptidylpeptidase IV ». Paris 5, 1994. http://www.theses.fr/1994PA05P162.

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Drouot, Cyrille. « Synthèse combinatoire de pseudopeptides inhibiteurs de l'activité "Bêta" sécrétase impliquée dans la maladie d'Alzheimer. Synthèse en phase solide du peptide amyloi͏̈de 1-42 et d'analogues du peptide intestinal vasoactif ». Montpellier 2, 1998. http://www.theses.fr/1998MON20142.

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Résumé :

Ce travail se situe a l'interface de la chimie et de la biologie. La chimie peptidique et pseudopeptidique a comme principal objectif la synthese d'outils pharmacologiques indispensables a la comprehension des phenomenes cellulaires complexes. Au cours de ce travail nous avons aborde, la synthese d'inhibiteurs necessaires pour la caracterisation d'une activite enzymatique, et la synthese d'analogues peptidiques afin de decrire les relations structure fonction d'un peptide et de son recepteur. Le depot amyloide de peptide a est sans doute l'evenement central qui rend compte de l'etiologie de la maladie d'alzheimer. La synthese d'inhibiteurs d'une des activites enzymatiques impliquee dans la liberation de ce peptide a ete l'objectif de ce travail. Cette activite appelee secretase pourrait appartenir a la famille des protease acide ou des metalloproteases. L'utilisation de la chimie combinatoire a conduit a la synthese d'une librairie pseudopeptidiques incorporant un motif chimique specifique des proteases acides. Les resultats biologiques obtenus nous ont conduit ensuite a la synthese de pseudopeptides inhibiteurs d'enzymes de type metalloprotease. D'autre part la synthese de ce peptide a long de 42 amino acides a ete effectuee en phase solide. Cette strategie est rapide et efficace et permet d'obtenir le produit final avec une purete satisfaisante. La derniere partie de ce travail concerne la synthese d'analogues du peptide intestinal vasoactif. L'incorporation d'une alanine sur chacune des 28 positions des acides amines constitutifs du vip, nous a permis d'obtenir des informations sur la relation structure fonction de ce peptide vis a vis de ses deux sous-types de recepteurs.

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Niddam, Valérie. « Conception, synthèse et évaluation anti-rétrovirale de dérivés du type peptidique, pseudo-peptidique et hétérocyclique ». Aix-Marseille 2, 1997. http://www.theses.fr/1997AIX22026.

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Résumé :

Ce travail avait pour objectif de concevoir et de mettre au point la synthese de composes inhibiteurs de la protease du virus de l'immunodeficience humaine. Par le remplacement bioisosterique d'un groupement methylene situe en position d'une fonction amide par un heteroatome, la synthese de 3 types de composes modeles : peptidique, pseudo-peptide acyclique et un heterocycle a 7 membres, a ete developpee. Dans le cas de derives peptidiques, la synthese du dipeptide leus-phe-oallyl etait requise. La deprotection de l'intermediaire de synthese a necessite une deprotection par du pd(pph#3)#4 compatible avec la presence du groupement thiophenoxy. Le synthon resultat leus-phe-oh etait utilisable pour la synthese peptidique en phase solide. Dans le cas de derives pseudo-peptidiques acycliques une fonctionnalisation en position d'une fonction cetone par un agent de sulfenylation approprie suivie d'une reduction, a permis de synthetiser les pseudo-peptides thiophenoxy -hydroxyles desires. La synthese du modele heterocyclique a 7 membres de type uree a fait l'objet d'une etude preliminaire de reactivite chimique. La formation de l'heterocycle a 7 chainons, le 1,3-dibenzyl-1,3-diazepane-dimethyl-5,6-o-isopropylidene-2,4,7-trione, convenablement fonctionnalise, a necessite l'exploration de plusieurs schemas de synthese faisant intervenir la condensation d'un diester sur un agent de carbonylation, la reduction specifique et partielle d'une fonction amide-uree, la condensation de type acyloine ou encore l'oxydation d'un motif diol en dicetone. L'evaluation virologique des composes bioisosteres synthetises semble indiquer que le concept developpe peut etre appliquer a la mise au point d'anti-proteases du virus vih. Certains de ces modeles necessitent une optimisation par une etude structure activite antivirale.

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Dutheuil, Guillaume. « Peptidomimétiques : vers une double liaison fluoréecomme analogue de la liaison peptidique ». Rouen, INSA, 2006. http://www.theses.fr/2006ISAM0007.

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Rival, Sandrine. « Synthèse peptidique enzymatique à l'aide de l'élastase de Pseudomonas aeruginosa ». Lyon 1, 1996. http://www.theses.fr/1996LYO10241.

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Résumé :

L'elastase de pseudomonas aeruginosa (pse) n'ayant jamais ete utilisee en synthese peptidique de maniere systematique, notre travail a tout d'abord consiste a faire l'inventaire des acides amines pouvant former une liaison peptidique, par leur extremite n- ou c-terminale. L'appartenance de pse au groupe des metalloproteases a impose des syntheses par controle thermodynamique et parmi les strategies utilisables, nous avons choisi de deplacer l'equilibre de synthese en precipitant le peptide au fur et a mesure de sa formation. Nous avons ainsi pu obtenir et caracteriser 25 dipeptides amides de type z-x-x-nh#2. Neanmoins pour atteindre l'utilisation optimale d'une protease en synthese peptidique, de nombreuses caracteristiques du fonctionnement de l'enzyme en mode reserve doivent etre connues, notamment sa specificite. En ce qui concerne celle de pse, des acides amines encombrants et hydrophobes sont necessaires en position p'#1 du dipeptide amide. Le sous-site s#1 est peu specifique et de nombreux acides amines peuvent etre incorpores, a condition qu'ils soient alpha-amines, depourvus de substituants apolaires sur le carbone beta et porteurs d'un hydrogene sur le carbone alpha ainsi que sur l'azote. En ce qui concerne le mecanisme de fixation des substrats a pse, nous avons montre qu'il est de type bi-uni sequentiel au hasard, c'est-a-dire que les substrats se lient a l'enzyme dans un ordre indifferent. Dans cette etude cinetique, nous avons mis au point une methode conductimetrique permettant la mesure en continu des vitesses de syntheses. Cette methode est parfaitement correlee a la clhp en phase inverse, que nous avons choisie comme technique de reference

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Haltout, Abdelaziz. « La calcitonine de saumon-1 : modèle de différents modes de synthèse peptidique en phase solide ». Paris 12, 1993. http://www.theses.fr/1993PA120042.

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Résumé :

Les peptides sont indispensables au developpement des differents domaines des sciences de la vie. Leur synthese en phase solide a l'inverse des techniques de biotechnologie, permet d'obtenir relativement d'une facon rapide tout peptide desire. Mais cette methodologie est onereuse a cause du prix des produits de depart, des reactifs, des techniques de purification et d'analyse. Il nous a donc semble interessant d'acceder aux peptides de synthese en les preparant par des moyens peu couteux et avec des equipements plus simples. Pour cela, nous avons choisi la calcitonine du saumon-1 comme modele. Pour sa synthese en strategie t-boc, nous avons compare l'efficacite de trois agents du couplage: le bop, le tbtu et le pybop que nous avons employes en melange equimolaire avec du hobt. L'emploi du bop pour la synthese de la sct1 en strategie t-boc nous a permis d'incorporer le t-boc-arg#2#4 sans proteger sa fonction guanidyle. Pour la synthese de la sct1, la strategie fmoc comparee a celle t-boc s'est revelee plus longue, generant davantage de reactions secondaires tout en mettant en uvre des reactifs plus chers et en outre sans aboutir a une synthese totale. Pour eviter l'emploi de la chromatographie hplc, technique tres onereuse, nous avons developpe une technique de purification des peptides sur des unites cm memsep. La sct1 purifiee sur cette technique possede une activite hypocalcemiante specifique statistiquement identique a celle de la sct1 de reference. Pour avoir une forme de liberation progressive des peptides, nous avons synthetise la sct1 sur la metanitrobenzhydrylamine resine. Le complexe peptidyl-resine injecte au rat est actif apres 48 heures. Cet effet n'a pas ete du a un clivage, mais plutot a la liberation de la sct1 adsorbee sur celle liee sur le polymere. Comme ce systeme pouvant etre immunogene, nous avons verifie que ce complexe ne suscitait pas la formation d'anticorps anti-sct-1 aussi bien apres administration orale que parenterale. Ceci prouve que la sct1 n'est pas tres immunogene et donc peut etre utilisee sans trop de risques en therapeutique humaine. Enfin, pour eviter l'emploi de l'acide fluorhydrique, de manipulation delicate pouvant entrainer des reactions secondaires, nous avons essaye de synthetiser un support solide permettant d'obtenir des peptides amides en employant des conditions douces de clivage

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Merhi, Ghada. « Synthèse et évaluation de nouveaux muramyl peptides ». Paris 11, 1996. http://www.theses.fr/1996PA114809.

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Grand, Vincent. « Synthèse et structure des peptides réduits : influence structurale de l'état aminé ou ammonium du lien amidé réduit ». Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1995. http://www.theses.fr/1995INPL038N.

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Résumé :

Dans le présent travail, nous avons comparé diverses méthodes de synthèse pour la préparation d'analogues réduits de mono-, di-, et tripeptides connus pour adopter des structures définies telles que le repliement bêta, gamma et Asx. Sauf lorsque le lien amide réduit est C-terminal, et ou une substitution nucléophile est à recommander, la réduction de l'imine obtenue à partir d'un aldéhyde peptidique est la plus efficace. La structure de ces analogues réduits a été analysée à l'état solide par diffraction des rayons X, et en solution organique par spectroscopie IR et RMN. Du fait de la probable protonation du lien amide réduit au pH physiologique, ces analogues ont été analysés dans les deux états neutre (amine) et protoné (ammonium). Les peptides réduits dans leur forme amine sont plus flexibles que les peptides apparentes, et le lien amide réduit dans cet état électronique ne semble pas en état de nucléer une structure locale bien définie. Dans leur forme ammonium en revanche, les peptides réduits sont bien mieux structurellement définis du fait du fort caractère donneur de proton de la fonction ammonium. Il en résulte que le groupe ammonium interagit par liaison hydrogène avec les carbonyles peptidiques pour former des structures locales apparentées aux repliements bêta et gamma. Ces structures locales sont suffisamment stables pour que les molécules s'organisent autour de ces contraintes. Il est donc important de connaitre l'état électronique du peptide réduit dans le système biologique concerné lorsqu'on désire étudier sa conformation bioactive

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Baron, Alice. « Synthèse et Etude d'Analogues Peptidiques en tant qu'Inhibiteurs de Fusion du VIH ». Thesis, Montpellier 2, 2010. http://www.theses.fr/2010MON20209/document.

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Résumé :

Depuis la découverte du Virus de l'Immunodéficience Humaine (VIH) au début des années 80, la recherche de nouvelles molécules anti-VIH demeure un challenge important pour la communauté scientifique. Les effets secondaires liés à l'usage d'inhibiteurs de la réplication virale, la découverte des récepteurs et la compréhension du mécanisme d'entrée du virus dans la cellule hôte ont encouragé la recherche sur de nouveaux inhibiteurs ciblant l'entrée virale. A ce jour, l'Enfuvirtide est le seul inhibiteur d'entrée approuvé en tant qu'inhibiteur de fusion. Bien que ce composé soit un antiviral puissant, il présente néanmoins de sérieuses limitations, son mode d'administration (injection sous cutanée deux fois par jour) et l'émergence de résistances, le classent en agent rétroviral de seconde classe. Une approche alternative est la génération de D-peptides inhibiteurs de fusion, résistants aux protéases et prometteurs pour le développement et l'identification d'une nouvelle classe de médicaments anti-VIH. Basée sur cette dernière approche, cette thèse est consacrée à la synthèse et à l'étude d'analogues peptidiques en tant qu'inhibiteurs de fusion du VIH. Tout d'abord, des études de modélisation associées à la synthèse d'analogues peptidiques ont permis de mettre en évidence et de comprendre les caractéristiques essentielles responsables de l'activité des D-peptides. Ensuite, des études de relations structure-activité, à partir de séquences modifiées, ont conduit à l'obtention de nouveaux analogues peptidiques inhibiteurs de fusion actifs. Enfin, dans le but de réduire la nature peptidique et par conséquent d'améliorer les propriétés pharmaceutiques, des macrocycles peptidiques ont été conçus, et une nouvelle stratégie de synthèse de peptides cycliques a été développée
Since the discovery of the Human Immunodeficiency Virus (HIV) at the beginning of the 1980's, the search for new anti-HIV molecules remains an important challenge for the scientific community. Secondary effects associated with viral replication inhibitors, the discovery of receptors and the understanding of the mechanism of the viral entry makes HIV viral entry one of the most promising target for HIV drug development. To date, Enfurvitide is the only approved entry inhibitor as HIV fusion inhibitor. Although highly effective, Enfurvirtide has several serious limitations including high dosing requirements, the administration by injection, and the emergence of resistant strains. An alternative approach that has shown considerable potential is the generation of new D-peptides HIV fusion inhibitors expected to be resistant to proteolytic degradation and useful for the development and the identification of a new class of anti-HIV drugs with improv ed bioavailability.Based on this approach, the present work is dedicated to the synthesis and the study of peptide analogs as HIV fusion inhibitors. First, modeling studies and the synthesis of peptide analogs were devoted to point out and to understand the key elements responsible for the activity of the reference D-peptides. Then, structure activity relationship studies based on different modifications sequences led to the discovery of active peptide analogues as HIV fusion inhibitors. In another approach, in order to decrease peptide nature and consequently to improve the pharmaceutical properties, reduced cyclic peptides were designed. Finally, a novel strategy for cyclic peptide synthesis was developed

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Khalil, Ahmad. « Modification de la liaison peptidique : synthèse d'analogues phosphonés du TRH et de la Leu-enképhaline ». Montpellier 2, 1988. http://www.theses.fr/1988MON20046.

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Shpak-Kraievskyi, Pavlo. « Nouvelles méthodologies pour la synthèse asymétrique de peptides aldéhydiques β3-C-terminaux et de dérivés d’acides aminés disubstitués via hétérocycloaddition ». Thesis, Le Mans, 2013. http://www.theses.fr/2013LEMA1002/document.

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Résumé :

Les peptides aldéhydes sont connus comme inhibiteurs de protéases et précurseurs de différentes classes de composés biologiquement actifs. Les méthodes pour leur synthèse impliquent classiquement la transformation d'un précurseur (amide de Weinreb, ester, alcool, acétal) en aldéhyde en étape finale pour éviter l'épimérisation du stéréocentre en position α de l'aldéhyde. En revanche, les β-peptides aldéhydes, plus stables à l’épimérisation, ont été relativement peu explorés. Ils sont généralement obtenus par homologation de l'acide aminé correspondant malgré les faibles rendements, les problèmes d’épimérisation et de nombreuses étapes. Par conséquent, un nouvel accès synthétique aux β-peptides aldéhydes reste toujours un challenge difficile. Sur la base des travaux antérieurs dans notre équipe en hétérocycloaddition diastéréosélective [4+2] et [3+2], nous avons développé au cours de ce doctorat de nouvelles stratégies pour l'accès asymétrique à ces dérivés de β-aminoacides par deux voies complémentaires :1) Une voie utilisant les hétérocycles à six chaînons de type 6-ATO (6-alcoxytétrahydrooxazinone) qui ont été préparés par une réaction d’hétérocycloaddition hautement stéréosélective avec de bons rendements et ed. Ces cycloadduits ont été transformés par transacétalisation vers les aminoacétals intermédiaires «mixtes» ou «symétriques». Ces nouveaux acétals sont des intermédiaires parfaits pour la N-élongation par couplage peptidique, conduisant finalement aux aldéhydes peptidiques β3-C-terminaux monosubstitués. 2) Sur une autre approche, les hétérocycles à cinq chaînons 5-AISO (3,3'-disubstitué 5-alcoxy-isoxazolidines) ont été obtenus par cycloaddition dipolaire-1,3 entre des cétonitrones esters et des éthers vinyliques. Ces composés ont été utilisés avec succès en tant que précurseurs d'aminoaldéhydes β3-disubstitués après l’étape de transprotection de l'atome d'azote, suivie par la copure de la liaison N-O. L’extension asymétrique de l'étape de cycloaddition a été étudiée par des voies énantiosélective et diastéréosélective, ouvrant ainsi l'entrée vers les peptides aldéhydiques β3-disubstitués-C-terminaux énantioenrichis
Peptide aldehydes are known as protease inhibitors and precursors for many biologically active compounds. Methods for their synthesis involve classically the transformation of a precursor (Weinreb amide, ester, alcohol, acetal) into an aldehyde as one of the final steps to prevent epimerization of the carbon α to the aldehyde. By contrast, β-peptide aldehydes, more stable to epimerization, have been relatively unexplored. They are usually obtained by homologation of the corresponding amino acid despite low yielding steps, an epimerization problem and low number of accessible amino acids. Therefore, new synthetic access to β-peptide aldehydes is still a challenging problem. On the basis of previous work in our team concerning [4+2] and [3+2] diastereoselective cycloadditions, we have developed during this PhD thesis new strategies for the asymmetric access of β-amino acid derivatives by two complementary ways :1) Original six-membered heterocycles 6-ATO (6-alkoxy-tetrahydrooxazinone ) were prepared by a highly stereoselective heterocycloaddition reaction with good yields and de. These cycloadducts were transformed via transacetalisation into both «mixed» and «symmetrical» aminoacetals. Moreover, these new acetals are ideal intermediates for further peptide coupling, leading ultimately to monosubstituted β3-C-terminal peptide aldehydes. 2) By another approach five-membered heterocycles 5-AISO (3,3’-disubstituted 5-alkoxy-isoxazolidines) were obtained via 1,3-dipolar cycloaddition between α-keto ester nitrones and vinyl ether. These compounds were successfully used as precursors of disubstituted β-amino aldehydes after transprotection of the nitrogen atom and N-O cleavage of the isoxazolidine ring. Asymmetric extension of the cycloaddition step was studied by enantioselective and diastereoselective pathways, thus opening unprecedented entry to enantioenriched disubstituted β3,β3-C-terminal peptide aldehydes

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Henry, Jennifer A. « Peptide synthesis in relation to isopenicillin N synthase ». Thesis, University of Edinburgh, 1991. http://hdl.handle.net/1842/12076.

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Résumé :

The preparation of two compounds designed to mimic the active site of Isopenicillin N Synthase (IPNS) is presented. Both compounds consist of two fragments from the enzyme linked by a lipophilic unit. The first contains a short linker unit namely 11-aminoundecanoic acid and the second contains a longer linker consisting of three of these units. The compounds were prepared by solid phase peptide synthesis and purified using a combination of gel permeation chromatography and Phenyl Sepharose hydrophobic interaction chromatography. These compounds have been examined in a two phase system of n-octane and aqueous buffer, containing the IPNS cofactors and tripeptide substrate. The postulated mimic would involve the lipophilic linker unit residing in the organic phase, thus holding the two peptides in close proximity in the aqueous phase. It was hoped that the addition of the Fe²+ cofactor might promote the adoption of a structure resembling that of the enzyme active site. Cyclisation of the penicillin precursors ACV and PCV has not been observed under the conditions investigated, however the compound containing the short linker has been observed to bind iron. Work on immunological studies on IPNS fragments has resulted in the preparation of anti-sera to the N-terminal peptide (IPNS(1-21). These anti-sera have been shown to bind to the peptides IPNS(1-21) and Cys-IPNS(1-21) in an ELISA test and have also been used to detect the native enzyme IPNS by the Western blot method.

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McMath, Andrew. « Synthèse d'analogues cyclopropaniques de peptides ». Paris 5, 1997. http://www.theses.fr/1997PA05P608.

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Ali, Daham Hassan. « Studies on the antigenicity of citrate synthase ». Thesis, University of Bath, 1989. https://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.233608.

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Morisset, Eleonore. « Le silicium pour la production catalytique d'hydrogène et la synthèse d'amides ». Thesis, Normandie, 2019. http://www.theses.fr/2019NORMC233.

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Résumé :

Ces travaux de thèse reposent sur l’utilisation du silicium et de ses dérivés comme espèces pouvant répondre à certains enjeux techniques actuels. La silylation des alcools par le phénylsilane représente une méthode attractive pour la production douce d’hydrogène. Ce projet a permis de mettreen évidence une catalyse efficace par des bases azotées simples et disponibles. L’étude du mécanisme suggère que l’étape déterminante de cette réaction est la déprotonation de l’alcool. Le phénylsilane a ensuite montré son utilité dans le cadre de la synthèse des amides, mais également pour la synthèse peptidique en absence d’épimérisation. Par la suite, cette méthodologie a été étendue à la synthèse de quelques amides de Weinreb. Dans le but de mieux comprendre le mécanisme réactionnel, la synthèse de quelques phénylsilanes substitués de groupes électroattracteurs et de groupes électrodonneurs a été entreprise. Enfin la réaction d’acétylation des amines à partir d’acétate de silicium a été examinée. Un large panel d’amines primaires, secondaires et ainsi que des anilines ont été acétylées révélant l’intérêt synthétique de l’acétate de silicium en chimie organique
This thesis is based on the use of silicon and its derivatives as species that can meet some current technical challenges. The silylation of alcohols by phenylsilane is an attractive method for the gentle production of hydrogen. This project has demonstrated efficient catalysis with simple and available nitrogen bases. The study of the reaction mechanism suggests that alcohol deprotonation is decisive for this reaction. Phenylsilane has proved its utility in the context of amide synthesis, but also for peptide synthesis in the absence of epimerization. Subsequently, this methodology was extended to synthesis of several Weinreb amides. In order to better understand the reaction mechanism, the synthesis of some substituted phenylsilanes with electron-withdrawing groups and electron-donor groups was undertaken. Finally, the acetylation of amines using silicon acetate was examined. A large panel of primary, secondary amines and anilines were easily acetylated, revealing the synthetic interest of silicon acetate in organic chemistry

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Beretta, Margaux. « Synthèse d'analogues de la gougérotine à visée antifongique ». Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS484/document.

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Résumé :

Face à l’explosion démographique mondiale actuelle, les rendements agricoles se doivent d’être les plus élevés possible. Afin de relever ce défi, l’utilisation de pesticides efficaces et éco-compatibles est devenue indispensable. Dans le cadre de la recherche de nouveaux composés répondants à ces objectifs, les produits naturels continuent de retenir l’attention des chercheurs. Parmi eux, nous nous sommes intéressés à la gougérotine, un peptidonucléoside découvert au sein d’une bactérie dans les années 60 et possédant un large spectre d’activités biologiques. Dans le but d’optimiser l’activité antifongique et de diminuer la toxicité de la molécule, plusieurs analogues ont été synthétisés en jouant notamment sur la nature de la base nucléique. Une des réactions clé au cœur de la synthèse de nucléoside est la N-glycosylation permettant la liaison glycosidique entre la base nucléique et un donneur de glycosyle. Au cours de la voie de synthèse des analogues peptidonucléosidiques, une étude méthodologique de la N-glycosylation a été réalisée mettant en jeu différents donneurs de glycosyle et bases nucléiques. Des tests préventifs ont ensuite été réalisés sur les composés obtenus afin d’évaluer leur potentiel antifongique. Grâce aux analogues de la gougérotine et aux intermédiaires synthétisés, une étude de relation structure-activité a été menée
In the current context of the world demographic explosion, agricultural yields need to be as high as possible. The use of efficient and environment friendly pesticides has therefore become essential. In the framework of the discovery of new compounds, natural products remain an important source of inspiration. Among them, we focused on gougerotin, a peptidylnucleoside isolated from a bacteria in the 60’s which possess a broad spectrum of biologic activities. In order to improve antifungal potential and decrease the phytotoxicity of gougerotin, several analogues have been synthesized replacing the natural nucleobase. N-glycosylation is one of the key-reaction in peptidylnucleoside synthesis. During the synthesis of the analogues, a study of the N-glycosylation was carried out with three different donors and several bases. Protectives tests were realized with many pathogens to evaluate antifungal activity of our compounds and a structure-activity relationship was established

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Rolland, Valérie. « Synthèse peptidique en milieu organique par une endoprotéase modifiée et supportée ». Montpellier 2, 1990. http://www.theses.fr/1990MON20113.

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Résumé :

Ce travail a pour but d'elaborer une methodologie originale permettant d'acceder au couplage de fragments peptidiques en eliminant tout risque de racemisation et la protection des chaines laterales des acides amines. Dans une premiere partie l'alpha-chymotrypsine endoprotease specifique vis-a-vis des acides amines aromatiques, est modifiee par des fonctions acryliques et copolymerisee avec des agents de reticulation et de maille a base de polyethylene glycols eux aussi fonctionnalises. Dans une deuxieme partie nous avons etudie les capacites de ce biocatalyseur supporte dans des couplages peptidiques en milieu organiques ou les phenomenes d'hydrolyse secondaire, constates dans la synthese enzymatique en milieu aqueux, sont quasiment elimines. Le biocatalyseur supporte permet l'obtention de produits optiquement purs avec des rendements tres satisfaisants. L'interet economique et industriel d'un tel catalyseur est son recyclage: il peut catalyser plusieurs cycles de reactions sans perdre son activite

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Nun, Pierrick. « Micro-ondes et activation mécanique : applications en synthèse organique et peptidique ». Montpellier 2, 2009. http://www.theses.fr/2009MON20107.

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Résumé :

La chimie verte ou chimie pour le développement durable est un domaine en pleine expansion depuis quelques années. La nécessité de limiter l'impact des activités humaines sur l'environnement et la santé, de trouver de nouvelles ressources pour les réactifs et les solvants nous oblige à envisager une nouvelle manière de faire de la chimie. Parmi tous les domaines de la chimie verte, nous avons choisi de travailler sur le développement de nouvelles méthodes permettant d'effectuer des réactions en conditions sans solvant. Parmi ces méthodes, nos travaux se sont particulièrement portés sur les micro-ondes et l'activation mécanique. Nous avons ainsi développé une méthode sans solvant pour la réaction de Pétasis, permettant de préparer une large variété de tricycles en une seule étape et avec un lavage basique pour seule purification. Nous avons aussi montré qu'il était possible de réaliser un couplage de Suzuki en 10 min à 110°C sans utiliser de support solide tel que l'alumine et avec un nouveau catalyseur, le PEPPSI. Utilisant l'activation mécanique, nous avons montré tout l'intérêt de cette méthode pour la préparation de nitrones et d'hydrazones, composés obtenus après condensation d'une amine sur un carbonyle. Les hydrazones ont aussi pu être N-alkylées en conditions basiques. Nous avons aussi montré l'applicabilité de l'activation mécanique dans la synthèse de di et tripeptides en utilisant des aminoacides activés sous forme d'Uréthane N-carboxyanhydrides (UNCA). Les peptides sont obtenus par simple broyage en conditions basiques d'un UNCA avec un chlorhydrate d'aminoester. Enfin nous avons réalisé l'un des premiers exemples d'application en synthèse asymétrique de broyage sans solvant pour l'alkylation de bases de Schiff en présence de sels de cinchonidine, permettant d'obtenir des aminoacides
Green or Sustainable chemistry has become a growing area in the last few years. The necessity to limit the impact of human activities on environment and health, to find new resources for reactants and solvents drives us to develop a new way to perform chemistry. For this purpose, we have chosen to work on the development of new methods allowing us to perform solvent-free reactions. Among all these methods, mechanical and microwaves activations were specifically studied. Using microwaves, we first developed solvent-free Petasis reactions, giving a large variety of tricycles in one step and with a basic aqueous wash as the only purification step. We also showed that the Suzuki coupling could be performed in 10 min at 110°C without any solid support such as alumina and using a new NHC-Pd catalyst, the PEPPSI. Using mechanical activation, the interest of this method for the synthesis of nitrones and hydrazones was proven, the compounds were obtained after condensation of an amine on a carbonyle. Hydrazones could also be N-alkylated in a second step in basic conditions. The applicability of mechanical activation to prepare di- and tri-peptides using activated aminoacids, Urethane N-carboxyanhydrides (UNCA), was also shown. Peptides were obtained after ball-milling a UNCA with an aminoester chlorhydrate in basic conditions. Finally, one of the first applications of a ball-mill in asymmetric synthesis was realized, in order to prepare aminoacids after alkylation of Schiff bases in presence of cinchonidinium salts

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Drouin, Myriam. « Monofluoroalcène comme isostère de la liaison peptidique : synthèse, caractérisation et application ». Doctoral thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/35619.

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Résumé :

Les propriétés uniques apportées par l’introduction d’un atome de fluor dans un composé bioactif ont favorisé son utilisation en chimie médicinale. Le nombre et la diversité des groupements fluorés maintenant présents en témoignent. Parmi ceux-ci, le monofluoroalcène présente des caractéristiques intéressantes, dont celle d’être un isostère non hydrolysable de la liaison peptidique. Cette thèse portera sur le motif monofluoroalcène et sera divisée en trois axes principaux, soit sa synthèse, sa caractérisation et son utilisation potentielle comme sonde fluorée. Tout d’abord, l’alkylation allylique catalysée au palladium de 3,3-difluoropropènes a été développée, en utilisant le diméthylmalonate et ses dérivés comme nucléophiles. Une large gamme de monofluoroalcènes a été obtenue dans de bons rendements. Une variante asymétrique de la réaction a également été examinée. Cependant, elle présente des limites importantes, et uniquement les substrats cycliques réagissent de manière énantiosélective. Les produits obtenus peuvent ensuite subir différentes transformations, comme une monodécarboxylation en deux étapes donnant le mime de la liaison peptidique lié à un acide β-aminé. Afin d’obtenir des dérivés d’acides α-aminés, la synthèse du motif par une réaction de substitution nucléophile bimoléculaire avec réarrangement allylique à partir d’acides aminés a aussi été brièvement explorée. L’influence sur l’hydrophobie de l’incorporation du monofluoroalcène dans de courts peptides a ensuite été évaluée. L’indice d’hydrophobie, un paramètre déterminé en utilisant la chromatographie liquide haute performance en phase inverse, a été calculé pour différents peptides fluorés et naturels. Il a été possible de conclure que la présence du motif dans le squelette d’un peptide augmentait sa lipophilie et de quantifier cette valeur. Finalement, l’incorporation du monofluoroalcène comme isostère de la liaison peptidique dans de larges peptides a été effectuée, afin d’obtenir une étiquette-19F située dans le squelette pour l’étude d’événements biologiques par résonance magnétique nucléaire. Le motif a été incorporé dans deux peptides, la PGLa et (KIGAKI)3, qui ont été analysés par des techniques biophysiques.
The unique properties associated with the incorporation of fluorine into bioactive compounds have led to its important use in medicinal chemistry. Nowadays, various fluorinated functional groups are employed. Among them, the monofluoroalkene shows interesting properties. This thesis will present the study of the monofluoroalkene as a peptide bond isostere and will focus on its synthesis, characterization and use as a fluorinated probe. The palladium catalyzed allylic alkylation of 3,3-difluoropropenes using dimethylmalonate and its derivatives was developed. Various monofluoroalkenes were obtained in good yields. An asymmetric variant of the transformation was then investigated, but the transformation was limited to six-membered cycles. Some derivatization of the monofluoroalkenes obtained could be performed, such as a two steps monodecarboxylation procedure to access a peptide bond mimic followed by a β-amino acid. To access α-amino acid derivatives, a bimolecular nucleophilic substitution with allylic rearrangement starting from natural amino acids was briefly investigated. The influence on the hydrophobicity of the incorporation of a monofluoroalkene into the backbone of short peptides was then evaluated. The hydrophobicity index, a parameter that can be determined by using reverse-phase high performance liquid chromatography, was used to quantify the lipophilicity of fluorinated and natural peptides. In every case, the presence of the monofluoroalkene enhanced the hydrophobicity of the compounds. Finally, the monofluoroalkene was incorporated into the backbone of larger peptides to access a new 19F-label for the study of biological events by nuclear magnetic resonance. The motif was integrated into the sequence of two peptides, PGLa and (KIGAKI)3, and the fluorinated mutants were studied using biophysical techniques.

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André, Frédéric. « Préparation et structure d'aza-peptides dérivés de l'asparagine et de l'alanine : introduction dans des peptides d'intérêt biologique ». Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1996. http://www.theses.fr/1996INPL096N.

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Au sein des pseudopeptides, il est une famille où une modification affecte le point d'ancrage de la chaîne latérale en remplaçant, par un atome d'azote, le CHalpha de l'acide aminé protéinogène originel. Un avantage primordial lié, de ce fait, à l'introduction d'un aza-aminoacide (noté AzXxx) dans un peptide bioactif réside dans la conservation (ou non, au choix) de l'intégrité chimique de la chaîne latérale qui joue un rôle capital au cours d'une étape de reconnaissance moléculaire. Deux conséquences inhérentes à cette substitution sont la perte du centre chiral CHalpha et la probable perturbation des caractéristiques électroniques et structurales des deux liaisons amides adjacentes. Pour incorporer l'analogue aza-peptidique de l'asparagine ou de l'alanine dans un peptide synthétisé en phase liquide homogène ou sur support polymère insoluble, nous avons mis au point une méthode de synthèse, très douce, qui fait appel au triphosgène bis-(trichlorométhyl)-carbonate comme agent de carbonylation-activation du synthon hydrazine substituée à dessein. La structure des aza-peptides préparés a été analysée d'une part, à l'état cristallin, par diffraction des rayons X et d'autre part, en solution organique, par spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier et par résonance magnétique nucléaire à une et deux dimensions. Ainsi, la substitution Asn/AzAsn ou Ala/AzAla engendre de fortes modulations conformationnelles: l'atome d'azote Nalpha, appartenant à l'aza-residu placé juste en amont d'une L-proline, acquiert une chiralité de type D ; de plus, ce dernier en position i+1 est inclus dans un repliement de type béta avec une disposition trans de la liaison amide tertiaire médiane et où la proline occupe la position i+2 alors que, dans les peptides, celle-ci n'y est pas favorable. Enfin, d'une manière générale, la présence au sein d'un peptide d'une aza-asparagine, est susceptible d'accroitre localement la rigidité de la séquence et sa compacité

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Passaquin, Anne-Catherine. « Interferon et syntheses hormono-inductibles : etude de l'effet de l'interferon sur la synthese de la lactate deshydrogenase inductible par les catecholamines ». Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1986. http://www.theses.fr/1986STR13109.

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Kollappillil, Somakumar Krishnakumar. « Synthesis and analysis of puromycin analogues and amphiphilic peptidyl-RNA conjugates ». Thesis, Lyon 1, 2010. http://www.theses.fr/2010LYO10086.

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Résumé :

Une étude récente sur le transfert peptidique pH dépendant effectuée avec divers ARNt aminoacyles a révélé la dépendance au pH du transfert peptidique. L’instabilité hydrolytique rend impossible l’obtention de la valeur expérimentale du pKa de l’eau donné pour le groupement α-amino des esters 3'-aminoacyladenosine. Comme les analogues de la puromycine sont les analogues les plus proches du 3’-terminal des ARNt aminoacyles et qu’ils contiennent une liaison amide stable en position 3’, il est intéressant de déterminer la valeur du pKa du groupement α-amino de différents analogues de la puromycine mais aussi de corréler ces valeurs de pKa aux valeurs de pKa des groupements ARNt aminoacyles correspondants obtenues par le transfert peptidique pH dépendant. Le premier chapitre de la thèse se concentre sur la synthèse de différents analogues de la puromycine et sur la détermination de leur basicité par une analyse RMN pH dépendante. Ce chapitre discutera aussi la conformation intrinsèque des analogues de la puromycine mesurée par la pH dépendance de leur constante de couplage J1’-2’. Les synthèses d’analogues dinucléotidiques, d’un analogue xylo-puromycine et d’un analogue de désoxyxylopuromycine seront aussi décrites. Les conjugués peptidyl-ARN miment des fragments importants d’intermédiaires de la transduction. Ces analogues peuvent être utilisés comme outils expérimentaux pour comprendre l’évolution de la synthèse codée des peptides. L’innovation dans le concept de ‘négoce moleculaire’ entre les peptides, les oligonucléotides et les bicouches lipidiques, qui pourrait être à la base de l’évolution de la synthèse peptidique contrôlée par l’ARN, nous a poussé à synthétiser des conjugués peptidyl-ARN amphiphiliques et à étudier leurs interactions avec les bicouches lipidiques. Dans le deuxième chapitre les stratégies de synthèse sur support solide utilisant des analogues de puromycine comme élément constitutif seront discutées
A recent pH dependent peptidyl transfer assay in the ribosome with various aminoacyl tRNAs revealed the pH dependence of the peptidyl transfer. Hydrolytic instability makes impossible to obtain the experimental bulk water pKa data for the α-amino groups of 3'-aminoacyladenosine esters. Since puromycin analogues are the most similar analogues of the 3’-end of the aminoacyl tRNAs and they contain a stable amide bond in 3’-position, the determination of the pKa value of the α-amino groups of different puromycin analogues and correlation of these pKa values with those of α-amino groups of the corresponding aminoacyl tRNAs obtained by pH dependent peptidyl transfer deserves attention. Chapter 1 of the thesis focuses on the synthesis of different puromycin analogues and on the determination of their basicities by a pH dependent NMR analysis. This chapter also analyses the intrinsic conformations accessed by the puromycin analogues, as measured by the pH dependence of their J1’-2’ coupling constants. The synthesis of dinucleotide analogues, a xylo-puromycin analogue and a deoxyxylopuromycin analogue will also be described. Peptidyl-RNA conjugates mimic important fragments of natural intermediates of translation. These analogues can be used as an experimental tool to understand the evolution of the coded synthesis of peptides. The novelty in the concept of a ‘molecular deal’ between peptides, oligonucleotides and lipidic bilayers, which may be the basis for the evolution of RNA controlled peptide synthesis, prompted us to synthesize amphiphilic peptidyl-RNA conjugates and to study their interactions with lipidic bilayers. In chapter 2 the solid support synthetic strategies using puromycin analogues as the building blocks will be discussed

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Bossu, Isabelle. « Conception et synthèse de nouveaux glycoclusters biologiquement actifs ». Phd thesis, Université de Grenoble, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00680067.

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Les interactions multivalentes sucre/protéine sont impliquées dans de nombreux processus biologiques tels que l'adhésion hôte-pathogène, la communication cellulaire ou les réponses immunitaires. La conception de glycoconjugués capables de présenter des motifs osidiques en cluster est essentielle, non seulement pour étudier ces phénomènes de reconnaissance complexes mais aussi pour développer des agents biologiquement actifs. Dans ce contexte, l'objectif de ma thèse a été de synthétiser de nouveaux glycoclusters et d'évaluer leurs propriétés biologiques. Ces glycoclusters ont été obtenus en conjuguant des sucres sur des cyclopeptides par des méthodes chimiosélectives (cycloaddition de Huisgen et ligation oxime). Des composés tetravalents, hexavalents et hexadécavalents d'architectures et de compositions variables ont été synthétisés, entièrement caractérisés puis évalués au laboratoire ou dans le cadre de collaborations avec différentes cibles. Un glycocluster hexadécavalent fucosylé a ainsi pu être identifié comme puissant inhibiteur de l'interaction de la lectine PA-IIL de la bactérie Pseudomonas aeruginosa à une concentration subnanomolaire. Une autre famille de composés associant des sucres et des peptides a montré des propriétés immunologiques uniques, notamment pour activer les cellules NK contre des cellules cancéreuses sans déclencher de phénomène d'autoapoptose. Mots clés : chimie des sucres, chimie des peptides, glycoclusters, ligations chimiosélectives, interactions sucre-protéine, lectine, cellule NK.

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Andreini, Manuel. « Synthèse et étude de C-glycosyl-b-amino acides et de leurs assemblages ». Thesis, Nancy 1, 2008. http://www.theses.fr/2008NAN10023/document.

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Résumé :

Ce travail concerne la synthèse de courts glycopeptides pouvant adopter une structuration secondaire définie. Les chaînes b-peptidiques peuvent se structurer sur de courtes séquences oligomèriques. C’est pourquoi les b-peptides ont été choisis pour réaliser ce travail, de plus ils sont résistants aux peptidases et aux protéases. Nous nous sommes intéressés à la préparation de ce type d’oligomères artificiels modifiés en les liants à des unités sucres. Nous souhaitons étudier l’influence de la glycosylation de chaînes b-peptidiques, et déterminer si la structuration est conservée lorsque la chaîne est « décorée » par des résidus sucres. Dans ce contexte, nous avons présentés l’homo-oligomérisation de glyco-amino acide artificiel formant une nouvelle classe de carbopeptoïdes. Une analyse conformationnelle par modélisation moléculaire et par des techniques spectroscopiques (RMN, DC, IR) a été menée sur cette première classe d’oligomères. Un second aspect de notre travail à consisté à synthétiser des C-glycosyl-b3-amino acides et des O-glycosyl-b3-amino acides. Ces monomères sont, en effet, des unités centrales dans la formation de glycosyl-b-peptides. Finalement ; nous nous sommes intéressés à la synthèse d’une nouvelle classe d’analogues de glyco-b-amino acide appelée les Na-(C-glycosyl)-hydrazino acides
The objective of this work was the design and synthesis of short glycopeptides that can fold into well defined and typical secondary structures. b-Peptides frameworks are capable of forming structurally well-defined and predictable structures on short sequences and were therefore chosen for our purpose. In addition, b-peptide backbones are resistant to peptidases and proteases. We were interested in preparing such artificial oligomers modified, like a vaste majority of proteins, by linkage to carbohydrates. The study of carbohydrate-functionalized b-peptides is expected to bring important information concerning the structural stability of such glycoconjugates. In this context, we have presented the homo-oligomerisation of the unnatural glyco-amino acid into a new class of carbopeptoïds. The conformational preference of this first class of oligomers has been assessed by spectroscopic techniques (NMR, IR, CD) and calculations. Another part of this work concerned the synthesis of C-glycosyl-b3-amino acids and O-glycosyl-b3-amino acids as building blocks in the construction of glyco-b-peptides. Finally, we were interested in the synthesis of a new class of glyco-b-amino acids analogues, which are called Na-(C-glycosyl)-hydrazino acids

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Awada, Hawraà. « Synthèse sélective de γ-amino acides cyclobutaniques : préparation de nouveaux organogélateurs peptidiques ». Thesis, Paris 11, 2014. http://www.theses.fr/2014PA112365/document.

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Résumé :

L’acide γ-aminobutyrique ou GABA est le principal neurotransmetteur inhibiteur présent dans le système nerveux central (CNS). Afin d’obtenir un nouveau dérivé cyclobutanique du GABA, le cis-3,4CB-GABA, sous forme énantiomériquement pure, deux stratégies de synthèses efficaces et reproductibles ont été mises au point. Ces deux voies de synthèse impliquent toutes les deux une étape-clé de photocycloaddition [2+2] qui permet de créer le cycle à 4 chaînons. La première consiste en une homologation de l’acide cis-2-aminocyclobutanique (cis-ACBC), et la deuxième est une synthèse multi-étape qui utilise le caprolactame comme composé de départ.D’autre part, grâce à une synthèse stéréosélective du (1R,2S)-cis-2,3CB-GABA, quelques oligomères C- et N-protégés – di, tri, et tétra-peptides – de cet aminoacide ont été préparés. Ceux-ci ont été caractérisés par les techniques de RMN 1D et 2D, IR, RX. Les analyses ont montré qu’il n’existe pas d’interactions non-covalentes (liaisons hydrogène) inter-résidu au sein de ces structures moléculaires. En revanche, la propriété de gélification de ces oligomères dans différents solvants organiques a été mise en évidence. Des solutions et des gels formés à partir de ces peptides ont été analysés par microscope électronique à balayage et des clichés ont été obtenus montrant une organisation du dipeptide et du tetrapeptide en fibrilles. Le tripeptide lui n’a présenté aucun assemblage intermoléculaire régulier
The γ-aminobutyric acid (GABA) is the major inhibitory neurotransmitter in the central nervous system (CNS). In order to obtain new enantiomerically pure cyclobutanic derivative of GABA, the cis-3,4CB-GABA, two efficient synthetic strategies have been established. Both synthetic routes employed a photocycloaddition [2 +2] protocol, which provided the cyclobutanic ring. The first route involved the homolgation of the cis-2-aminocyclobutanecarboxylic acid (cis-ACBC), whereas the second route is a multi-step synthesis using caprolactam as starting material.On the other hand, the (1R,2S)-cis-GABA-2,3CB was synthetized, and a series of N- and C-protected oligomers of di, tri, and tetrapeptides of this amino acid were prepared. These oligomers were characterized by NMR (1D and 2D) techniques, IR, and X-ray. The analyses have shown that there are no non-covalent interactions (hydrogen bonds) between the residues of each oligomers. However, the gelation property of these oligomers in various organic solvents was demonstrated. Solutions and gels formed from these peptides were analyzed by scanning electron microscopy, and the obtained images showed a fibrous organization of the di- and tetrapeptide, while the tripeptide showed no regular intermolecular assembly

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Frank, Robert. « Untersuchungen zur Synthese, den physikalisch-chemischen Eigenschaften und der biologischen Aktivität von Thioxopeptiden ». [S.l. : s.n.], 2000. http://deposit.ddb.de/cgi-bin/dokserv?idn=961200510.

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Thèses sur le sujet « Synthèse peptique »

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