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  1. Dissertationen

Auswahl der wissenschaftlichen Literatur zum Thema „Analyse des voies métaboliques“

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Dissertationen zum Thema "Analyse des voies métaboliques"

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Moulin, Cécile. "Analyse des voies métaboliques au cours du cycle cellulaire : application au métabolisme du cancer." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASG022.

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L’objectif de cette thèse est d’étudier comment la cellule mammifère adapte son métabolisme aux étapes du cycle cellulaire. Le cycle cellulaire est l’ensemble des étapes menant une cellule à se diviser. Le rôle du métabolisme est de fournir à la cellule les éléments et l’énergie dont elle a besoin pour fonctionner. En particulier, à chaque étape du cycle cellulaire, la cellule a besoin de différents éléments pour pouvoir, à terme, se diviser correctement. Il est donc crucial pour la cellule de coordonner le métabolisme et le cycle cellulaire et en particulier de contrôler ce que le métabolisme
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Dupont, Pierre-Yves. "Conception d'outils bioinformatiques pour la modélisation de voies métaboliques et de leur régulation." Thesis, Clermont-Ferrand 1, 2011. http://www.theses.fr/2011CLF1MM27/document.

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La biologie des systèmes actuelle s’appuie sur des techniques d’analyse biologique à haut débit comme la transcriptomique ou la métabolomique. Cependant, ces techniques haut débit ont leurs limites et peuvent générer des erreurs. En croisant les résultats de différentes techniques d’analyse biologique, nous espérons pallier une partie de leurs limites. À cet effet, nous avons commencé à développer une plateforme de modélisation, MPSA (Metabolic Pathways Software Analyzer), permettant d’intégrer les données générées à des réseaux métaboliques. MPSA permet de représenter les graphes de voies mét
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3

Rabatel, Andréane. "Développement embryonnaire du puceron Acyrthosiphon pisum : caractérisation de voies métaboliques et gènes clé dans les interactions trophiques avec Buchnera aphidicola." Phd thesis, INSA de Lyon, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00673174.

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Les pucerons sont parmi les principaux ravageurs des cultures dans les régions tempérées. Leur succès comme parasites de plantes repose sur leur fort potentiel reproductif dû à la parthénogénèse durant le printemps et l'été ainsi qu'à la symbiose avec Buchnera aphidicola. Cette bactérie symbiotique obligatoire fournit aux pucerons les acides aminés essentiels qui sont déficients dans leur alimentation déséquilibrée (la sève élaborée des plantes), et contribue ainsi à leur développement et reproduction. Le premier volet de ce travail de thèse a consisté à déterminer les besoins en acides aminés
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Gabriel, Andréa-Wiktor. "Le pluralisme des voies d’écologisation de la gestion des biomasses résiduaires en agriculture : analyse à partir des réseaux métaboliques et étude de cas dans la vallée de la Drôme." Thesis, université Paris-Saclay, 2021. http://www.theses.fr/2021UPASB017.

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Les biomasses résiduaires (BR) (ex. effluents d’élevage, résidus de cultures, déchets verts et urbains) jouent un rôle clé en agriculture. La modernisation de l’agriculture depuis le XIXe siècle a profondément transformé leur métabolisme, entraînant appauvrissement des sols, pollutions, perte d’autonomie des exploitations agricoles et des territoires en matière de fertilisation.Aujourd’hui, des faits scientifiques solides démontrent la nécessité d’une écologisation de la gestion des BR, mais la nature de cette écologisation fait débat. Des visions radicalement différentes de ce que devraient ê
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Mahout, Maxime. "Logic programming tools for metabolic fluxes analysis and biological applications." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2023. http://www.theses.fr/2023UPASG086.

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En biologie des systèmes, l'analyse des voies métaboliques est une méthode essentielle pour étudier le métabolisme et améliorer la compréhension du fonctionnement des systèmes vivants. Deux concepts clés sont l'analyse des modes élémentaires de flux (EFMs), qui permet de décrire les réseaux métaboliques en termes de voies minimales, et les Minimal Cut Sets (MCSs), représentant les coupures minimales de flux du réseau en termes de réactions. Dans le cadre de cette thèse, nous avons développé une méthode de programmation logique pour le calcul des modes élémentaires de flux: aspefm. L'outil est
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Scalabre, Aurélien. "Étude clinique des modifications du profil métabolique urinaire secondaires à une anomalie congénitale de l’écoulement des urines par Résonance Magnétique Nucléaire et analyse métabolomique." Thesis, Lyon, 2017. http://www.theses.fr/2017LYSE1272/document.

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Les dilatations des voies urinaires de diagnostic anténatal (DVU) peuvent être transitoires, ou correspondre à une anomalie significative de l'écoulement des urines pouvant entrainer une dégradation de la fonction rénale. L'identification de biomarqueurs urinaires pourrait contribuer à différencier précocement les uropathies des dilatations transitoires. La métabolomique permet l'identification de toutes les molécules de bas poids moléculaire présentes dans un échantillon biologique et la mise en évidence d'une signature métabolique associée à un événement physiopathologique. L'objectif princi
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Boyer, Frédéric. "Reconstruction ab initio de voies métaboliques." Phd thesis, Université Joseph Fourier (Grenoble), 2004. http://www.theses.fr/2004GRE10076.

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La reconstruction des voies métaboliques d'un organisme est une tâche importante pour les biologistes et plusieurs approches ont déjà été proposées pour assister ce travail mais il y a un besoin pour des approches plus exploratoires. La première partie de cette thèse s'intéresse à la reconstruction ab initio de voies métaboliques. Cela consiste en la recherche d'un réseau réactionnel qui connecte au moins deux composés en se basant uniquement sur une base de réactions autoriées. Nous proposons une nouvelle formulation de ce problème qui considère les réactions comme transferts d'atomes entre c
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Meurice, Guillaume. "Reconstruction in silico de voies métaboliques : application aux voies glycolitiques de Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii." Rennes, Agrocampus Ouest, 2004. http://www.theses.fr/2004NSARI041.

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Depuis la dernière décennie, la recherche en microbiologie fait face à un véritable changement qualitatif et quantitatif avec l’émergence de la génomique (qui concerne les génomes et leur analyse) et le développement de la biologie à haut débit (tous les ʺomiquesʺ). Ce changement permet d’aborder l’étude du fonctionnement cellulaire (voies de signalisations, voies métaboliques) dans sa globalité, et non plus par l’étude individuelle de ses acteurs biologiques. Dans le cadre de cette thèse, nous nous intéressons à la reconstruction des voies métaboliques d’une bactérie d’intérêt agro-alimentair
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Gambert, Ségolène. "Rôle du glycérol dans la régulation des voies métaboliques cardiaques." Paris 11, 2005. http://www.theses.fr/2005PA114817.

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Les acides gras (AG) sont le substrat majoritaire pour la production d'ATP dans le cœur. Le contrôle de la balance AG/glucose serait un moyen d'optimiser la consommation d'O2, problématique dans certaines pathologies. Ce travail a porté sur l'implication du glycérol (gly) sur cette balance. Les modèles utilisés sont les cardiomyocytes en culture primaire de rat nouveau-né et le cœur isolé perfusé travaillant de rat adulte. Nos résultats montrent que l'augmentation de la concentration en gly entraîne une augmentation de son incorporation dans les phospholipides, de son oxydation, une diminution
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Bayle, Kevin. "Développements méthodologiques RMN 13C isotopique pour l'étude de voies métaboliques." Nantes, 2014. https://archive.bu.univ-nantes.fr/pollux/show/show?id=30bc90dd-d09e-4983-ac96-8f8ae6202686.

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Le but de l’étude menée au cours du travail de thèse a été la détermination d’effets isotopiques associés à trois voies métaboliques (Embden-Meyerhof-Parnas, Entner-Doudoroff et phosphocétolase) par le biais de fermentations de micro-organismes et levures effectuant la biotransformation du glucose en éthanol et acide lactique. Dans un premier temps, une réflexion a été menée sur les paramètres analytiques nécessaires à l’analyse d’acides carboxyliques par RMN 13C isotopique. Les questionnements soulevés par l’analyse de l’acide acétique ont amené à élargir l’étude et prendre en compte une gamm
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