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Dissertationen zum Thema „Analyse des voies métaboliques“

Autor: Grafiati
Veröffentlicht am 25. Mai 2024

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Moulin, Cécile. "Analyse des voies métaboliques au cours du cycle cellulaire : application au métabolisme du cancer." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASG022.

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L’objectif de cette thèse est d’étudier comment la cellule mammifère adapte son métabolisme aux étapes du cycle cellulaire. Le cycle cellulaire est l’ensemble des étapes menant une cellule à se diviser. Le rôle du métabolisme est de fournir à la cellule les éléments et l’énergie dont elle a besoin pour fonctionner. En particulier, à chaque étape du cycle cellulaire, la cellule a besoin de différents éléments pour pouvoir, à terme, se diviser correctement. Il est donc crucial pour la cellule de coordonner le métabolisme et le cycle cellulaire et en particulier de contrôler ce que le métabolisme
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Dupont, Pierre-Yves. "Conception d'outils bioinformatiques pour la modélisation de voies métaboliques et de leur régulation." Thesis, Clermont-Ferrand 1, 2011. http://www.theses.fr/2011CLF1MM27/document.

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La biologie des systèmes actuelle s’appuie sur des techniques d’analyse biologique à haut débit comme la transcriptomique ou la métabolomique. Cependant, ces techniques haut débit ont leurs limites et peuvent générer des erreurs. En croisant les résultats de différentes techniques d’analyse biologique, nous espérons pallier une partie de leurs limites. À cet effet, nous avons commencé à développer une plateforme de modélisation, MPSA (Metabolic Pathways Software Analyzer), permettant d’intégrer les données générées à des réseaux métaboliques. MPSA permet de représenter les graphes de voies mét
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Rabatel, Andréane. "Développement embryonnaire du puceron Acyrthosiphon pisum : caractérisation de voies métaboliques et gènes clé dans les interactions trophiques avec Buchnera aphidicola." Phd thesis, INSA de Lyon, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00673174.

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Les pucerons sont parmi les principaux ravageurs des cultures dans les régions tempérées. Leur succès comme parasites de plantes repose sur leur fort potentiel reproductif dû à la parthénogénèse durant le printemps et l'été ainsi qu'à la symbiose avec Buchnera aphidicola. Cette bactérie symbiotique obligatoire fournit aux pucerons les acides aminés essentiels qui sont déficients dans leur alimentation déséquilibrée (la sève élaborée des plantes), et contribue ainsi à leur développement et reproduction. Le premier volet de ce travail de thèse a consisté à déterminer les besoins en acides aminés
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Gabriel, Andréa-Wiktor. "Le pluralisme des voies d’écologisation de la gestion des biomasses résiduaires en agriculture : analyse à partir des réseaux métaboliques et étude de cas dans la vallée de la Drôme." Thesis, université Paris-Saclay, 2021. http://www.theses.fr/2021UPASB017.

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Les biomasses résiduaires (BR) (ex. effluents d’élevage, résidus de cultures, déchets verts et urbains) jouent un rôle clé en agriculture. La modernisation de l’agriculture depuis le XIXe siècle a profondément transformé leur métabolisme, entraînant appauvrissement des sols, pollutions, perte d’autonomie des exploitations agricoles et des territoires en matière de fertilisation.Aujourd’hui, des faits scientifiques solides démontrent la nécessité d’une écologisation de la gestion des BR, mais la nature de cette écologisation fait débat. Des visions radicalement différentes de ce que devraient ê
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Mahout, Maxime. "Logic programming tools for metabolic fluxes analysis and biological applications." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2023. http://www.theses.fr/2023UPASG086.

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En biologie des systèmes, l'analyse des voies métaboliques est une méthode essentielle pour étudier le métabolisme et améliorer la compréhension du fonctionnement des systèmes vivants. Deux concepts clés sont l'analyse des modes élémentaires de flux (EFMs), qui permet de décrire les réseaux métaboliques en termes de voies minimales, et les Minimal Cut Sets (MCSs), représentant les coupures minimales de flux du réseau en termes de réactions. Dans le cadre de cette thèse, nous avons développé une méthode de programmation logique pour le calcul des modes élémentaires de flux: aspefm. L'outil est
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Scalabre, Aurélien. "Étude clinique des modifications du profil métabolique urinaire secondaires à une anomalie congénitale de l’écoulement des urines par Résonance Magnétique Nucléaire et analyse métabolomique." Thesis, Lyon, 2017. http://www.theses.fr/2017LYSE1272/document.

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Les dilatations des voies urinaires de diagnostic anténatal (DVU) peuvent être transitoires, ou correspondre à une anomalie significative de l'écoulement des urines pouvant entrainer une dégradation de la fonction rénale. L'identification de biomarqueurs urinaires pourrait contribuer à différencier précocement les uropathies des dilatations transitoires. La métabolomique permet l'identification de toutes les molécules de bas poids moléculaire présentes dans un échantillon biologique et la mise en évidence d'une signature métabolique associée à un événement physiopathologique. L'objectif princi
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Boyer, Frédéric. "Reconstruction ab initio de voies métaboliques." Phd thesis, Université Joseph Fourier (Grenoble), 2004. http://www.theses.fr/2004GRE10076.

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La reconstruction des voies métaboliques d'un organisme est une tâche importante pour les biologistes et plusieurs approches ont déjà été proposées pour assister ce travail mais il y a un besoin pour des approches plus exploratoires. La première partie de cette thèse s'intéresse à la reconstruction ab initio de voies métaboliques. Cela consiste en la recherche d'un réseau réactionnel qui connecte au moins deux composés en se basant uniquement sur une base de réactions autoriées. Nous proposons une nouvelle formulation de ce problème qui considère les réactions comme transferts d'atomes entre c
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Meurice, Guillaume. "Reconstruction in silico de voies métaboliques : application aux voies glycolitiques de Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii." Rennes, Agrocampus Ouest, 2004. http://www.theses.fr/2004NSARI041.

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Depuis la dernière décennie, la recherche en microbiologie fait face à un véritable changement qualitatif et quantitatif avec l’émergence de la génomique (qui concerne les génomes et leur analyse) et le développement de la biologie à haut débit (tous les ʺomiquesʺ). Ce changement permet d’aborder l’étude du fonctionnement cellulaire (voies de signalisations, voies métaboliques) dans sa globalité, et non plus par l’étude individuelle de ses acteurs biologiques. Dans le cadre de cette thèse, nous nous intéressons à la reconstruction des voies métaboliques d’une bactérie d’intérêt agro-alimentair
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Gambert, Ségolène. "Rôle du glycérol dans la régulation des voies métaboliques cardiaques." Paris 11, 2005. http://www.theses.fr/2005PA114817.

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Les acides gras (AG) sont le substrat majoritaire pour la production d'ATP dans le cœur. Le contrôle de la balance AG/glucose serait un moyen d'optimiser la consommation d'O2, problématique dans certaines pathologies. Ce travail a porté sur l'implication du glycérol (gly) sur cette balance. Les modèles utilisés sont les cardiomyocytes en culture primaire de rat nouveau-né et le cœur isolé perfusé travaillant de rat adulte. Nos résultats montrent que l'augmentation de la concentration en gly entraîne une augmentation de son incorporation dans les phospholipides, de son oxydation, une diminution
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Bayle, Kevin. "Développements méthodologiques RMN 13C isotopique pour l'étude de voies métaboliques." Nantes, 2014. https://archive.bu.univ-nantes.fr/pollux/show/show?id=30bc90dd-d09e-4983-ac96-8f8ae6202686.

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Le but de l’étude menée au cours du travail de thèse a été la détermination d’effets isotopiques associés à trois voies métaboliques (Embden-Meyerhof-Parnas, Entner-Doudoroff et phosphocétolase) par le biais de fermentations de micro-organismes et levures effectuant la biotransformation du glucose en éthanol et acide lactique. Dans un premier temps, une réflexion a été menée sur les paramètres analytiques nécessaires à l’analyse d’acides carboxyliques par RMN 13C isotopique. Les questionnements soulevés par l’analyse de l’acide acétique ont amené à élargir l’étude et prendre en compte une gamm
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Barba, Matthieu. "Modules réactionnels : un nouveau concept pour étudier l'évolution des voies métaboliques." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00657359.

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J'ai mis au point une méthodologie pour annoter les superfamilles d'enzymes, en décrire l'histoire et les replacer dans l'évolution de leurs voies métaboliques. J'en ai étudié trois : (1) les amidohydrolases cycliques, dont les DHOases (dihydroorotases, biosynthèse des pyrimidines), pour lesquelles j'ai proposé une nouvelle classification. L'arbre phylogénétique inclut les dihydropyrimidinases (DHPases) et allantoïnases (ALNases) qui ont des réactions similaires dans d'autres voies (dégradation des pyrimidines et des purines respectivement). (2) L'étude de la superfamille des DHODases (qui sui
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Ancelin, Marie-Laure. "Phospholipides de l'érythrocyte impalude : voies métaboliques, régulation, localisation et interférences pharmacologiques." Montpellier 2, 1987. http://www.theses.fr/1987MON20218.

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Paludisme, maladie parasitaire majeure, pres d'un homme sur deux vivant en zone d'endemie, lors de la croissance erythrocytaire asexuee, une quantite considerable de phospholipides (pl) est utilisee par le parasite pour la biogenese de ses membranes. Biosynthese de novo (voie de kennedy) des 2 pl majoritaires, la phosphotidylcholine (pc) et la phosphatidylethenalamine (pe) au sein de l'erythrocyte impalude. Le transport de la choline par diffusion facilitee et l'activite choline phosphate cytidyltransferase sont des etapes limitantes pour la biosynthese de novo de la pc. Existence d'une voie d
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Ambrosetti, Damien. "Carcinomes rénaux : caractérisation moléculaire et des voies métaboliques dépendant des mécanismes hypoxiques." Thesis, Nice, 2015. http://www.theses.fr/2015NICE4143/document.

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Les carcinomes rénaux (RCC) sont subdivisés en plusieurs sous-types, définis selon des critères histologiques, phénotypiques et génétiques. Le diagnostic différentiel de ces tumeurs est primordial avec des conséquences pronostiques et thérapeutiques. Génétique et diagnostic : Nous avons étudié les données cliniques, histologiques, immunohistochimiques et génétiques d'une série de RCC papillaires (PRCC) de type 1 et 2. Une caractérisation génomique exhaustive complétée par NGS nous a permis de classer les PRCC de type 2 dans plusieurs groupes d'évolution variable. Nos résultats fournissent des
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Issa, Razanne. "Analyse symbolique et inférence de modèles métaboliques." Thesis, Bordeaux, 2015. http://www.theses.fr/2015BORD0100/document.

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L’objectif de cette thèse est de proposer une nouvelle méthode de construction de modèles métaboliques dans le contexte de la génomique comparée. Nous avons développé un outil, ab-pantograph, permettant l’inférence de modèles métabolique se basant sur la logique abductive. Pour ce faire, nous avons introduit une représentation logique de modèles métaboliques minimaux enzymatiques, puis à partir d’un modèle métabolique dit de référence, nous avons dérivé un modèle minimal enzymatique explicite accompagné d’association de gènes. Enfin, en couplant ce modèle métabolique au génome d’un organisme c
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Even, Sergine. "Régulation des voies centrales chez Lactococcus lactis : Intégration des profils métaboliques et transcriptionnels." Toulouse, INSA, 2001. http://www.theses.fr/2001ISAT0009.

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L'étude du métabolisme central chez Lactococcus lactis a été appréhendée de façon globale en y intégrant à la fois une dimension métabolique et moléculaire, grâce à la mise au point d'une méthode globale et quantitative de dosage des transcrits glycolytiques, de type filtre ADN. Cette approche a permis de caractériser l'influence du substrat carboné (glucose ou galactose) et de la richesse du milieu sur le métabolisme carboné de L. Lactis IL 1403, récemment séquencée par l'INRA. Le comportement métabolique de cette souche est original par rapport à la souche modèle L. Lactis NCDO 2118 : la lim
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Brunelliere, Jérôme. "Caractérisation des voies métaboliques d'une souche de Streptomyces impliquée dans la production de vanilline." Clermont-Ferrand 2, 2009. http://www.theses.fr/2009CLF21947.

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La souche de Streptomyces setonii ATCC 39116 est utilisée par la société Rhodia dans la production de vanilline naturelle, qui est la molécule majoritaire de l'arôme de vanille, par bioconversion de l'acide férulique. Afin d'améliorer les rendements de production, une connaissance des voies métaboliques et des mécanismes de régulation mis en jeu lors de cette bioconversion est nécessaire. Pour cela, le séquençage de son génome a été réalisé. Les voies métaboliques d'intérêt ont alors pu être reconstituées in silico. Le suivi cinétique de l'expression des gènes intervenant aux étapes cruciales
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Combes, Adrien. "Influence des perturbations métaboliques sur des voies de signalisation impliquées dans la biogenèse mitochondriale." Thesis, Lille 2, 2015. http://www.theses.fr/2015LIL2S045/document.

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L’évolution des populations occidentales s’accompagne d’une augmentation de la sédentarité et des maladies métaboliques qui accroissent les problèmes de santé. Ces évolutions ont des répercussions sur le muscle squelettique qui voit sa capacité à produire de l’énergie aérobie diminuer. Néanmoins, le muscle squelettique est très plastique et les capacités oxydatives musculaires s’améliorent rapidement par l'activité physique. Les mitochondries sont des éléments majeurs des capacités oxydatives musculaires et la compréhension des mécanismes moléculaires qui régissent la biogenèse et la fonction
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Claudel-Renard, Clotilde. "Inférence fonctionnelle et prédiction de voies métaboliques : application à la bactérie fixatrice d'azote Sinorhizobium meliloti." Toulouse 3, 2003. http://www.theses.fr/2003TOU30170.

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Des génomes entiers de bactéries sont séquencés en nombre croissant. Parallèlement sont mis en place des programmes d'analyse systématique de l'expression des gènes et des protéines dans différentes conditions. La compréhension du fonctionnement d'un organisme nécessite une annotation des fonctions des gènes et l'intégration de ces données dans des schémas fonctionnels. Les voies métaboliques constituent une classe de fonctions permettant d'aborder ce problème d'intégration, elles sont bien répertoriées chez de nombreux organismes et sont accessibles à l'expérimentation. Dans un premier temps,
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Perquin, Magali. "Etude épidémiologique et moléculaire des voies métaboliques associées au glutathion dans le cancer du sein." Nancy 1, 2000. http://www.theses.fr/2000NAN11322.

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Thèse de doctorat en génie biologique et médicale. Les glutathion 5-transférases (GST) et peroxydases (GPX) associées à la glutathion réductase (GSSR) catalysent des réactions essentielles dans la prbtection des cellules contre les molécules toxiques comme les agents anticancéreux et les espèces réactives du stress oxydant. Centrées Sur le glutathion (GSH), les voies métaboliques ainsi composées sont activées dans la plupart des tumeurs et associées au phénotype résistant. Deux approches sont développées dans ce travail. 1)Une étude épidémiologique sur 41 patientes a permis de constater l'élév
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Sancho, Alain. "Mesure par résonance magnétique nucléaire du fractionnement isotopique de l'hydrogène : application à l'étude des voies métaboliques." Toulouse, INPT, 1989. http://www.theses.fr/1989INPT033G.

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La methode de resonance magnetique nucleaire du fractionnement isotopique naturel specifique qui permet de determiner la repartition des atomes de deuterium sur une molecule de produit organique a ete employee sur du mannitol extrait de pheophycee. En milieu naturel, les algues synthetisent un mannitol globalement appauvri en deuterium par rapport a l'eau du milieu. Cet appauvrissement a lieu selectivement sur les carbones 1, 3, 4 et 6 alors que les carbones 2 et 5 sont associes preferentiellement avec le deuterium. En milieu de culture controle, sur l'algue sargassum muticum, une relation a p
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Arnould, Jean-Marie. "De la carcirine des crabes à la carnosine des vertébrés : De nouvelles voies métaboliques de l'histamine." Nancy 1, 1987. http://www.theses.fr/1987NAN10126.

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Fouchard, Swanny. "Étude des voies métaboliques de production d'hydrogène chez la microalgue Chlamydomonas reinhardtii et transposition en photobioréacteur." Nantes, 2006. http://www.theses.fr/2006NANT2016.

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A partir du constat que la consommation énergétique et les risques environnementaux associés se sont considérablement accrus ces dernières années, des pistes nouvelles sont aujourd'hui étudiées pour développer l'utilisation d'énergies alternatives propres et renouvelables, et l'hydrogène semble dans ce contexte être une solution sérieuse. Sa production par voie photobiologique a fait l'objet de ce travail, dont l'objectif est d'exploiter les capacités photosynthétiques des microalgues afin d'élaborer à terme un procédé de production d'hydrogène à partir d'énergie solaire et d'eau sans dégageme
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Gouirand, Victoire. "Etude de la reprogrammation des voies métaboliques des acides aminés au cours de la carcinogenèse pancréatique." Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0673.

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La progression maligne de l’adénocarcinome canalaire pancréatique (ADKP) s'accompagne d'une profonde réaction desmoplasique, limitant la vascularisation de la tumeur et de fait privant les cellules tumorales en nutriments, forçant les cellules tumorales à adapter leur métabolisme. L’objectif de thèse était de définir les changements métaboliques relatifs à l’ADKP. Par une analyse transcriptomique des tumeurs pancréatiques développées de manière spontanée chez les souris, nous avons établi le profil métabolique des ADKPs lié aux acides aminés au cours de leur progression. Ainsi, nous avons mont
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Bacca, Hélène. "Étude des voies métaboliques des sucres chez l'huître creuse Crassostrea gigas : implication dans les mortalités estivales." Rennes 1, 2007. http://www.theses.fr/2007REN1S079.

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L'objectif de ce travail de thèse était d'étudier les voies de synthèse et de dégradation du glycogène en relation avec la reproduction et les mortalités estivales de l'huître Crassostrea gigas. Les séquences complètes des ARNm de la glycogène phosphorylase (Cg-GPH) et de la glycogène synthase (Cg-GYS) ont été caractérisées. Les périodes de forte abondance de ces transcrits manquent chacune une phase opposée du cycle énergétique du glycogène (utilisation ou accumulation respectivement). Il n'existe cependant aucune opposition saisonnière des activités enzymatiques correspondantes. Bien que l'a
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Dominguez, Hélène. "Croissance et flux métaboliques de Corynebacterium glutamicum sur divers sucres : interactions entre transporteurs PTS et voies métaboliques : [thèse en partie soutenue sur un ensemble de travaux]." Toulouse, INSA, 1994. http://www.theses.fr/1994ISAT0051.

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Les comportements cinetiques de corynebacterium glutamicum ont ete clairement determines sur glucose, sur fructose, sur saccharose et sur melange de glucose et de fructose. Sur fructose, les contraintes metaboliques, a savoir un flux gluconeogenique fournissant les hexoses phosphates necessaires a la biosynthese cellulaire et un flux limite dans la voie des pentoses, sont correlees a un rendement en biomasse peu eleve mais aussi a un debordement de metabolisme conduisant a la production de dihydroxyacetone et de lactate. Ce phenomene a ete attribue a une regulation negative de la glyceraldehyd
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Bennani, Dosse Mohammed. "Analyses métriques à trois voies." Rennes 2, 1993. http://www.theses.fr/1993REN20010.

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De nombreux domaines scientifiques utilisent la notion de distance dans des contextes très différents. D'une manière générale, une distance désigne une mesure de différence ou de ressemblance entre deux objets. En analyse des données, on souhaite souvent mesurer la dissemblance entre trois et non plus deux objets. Pour analyser de telles données, les techniques usuelles cherchent à les réduire pour ne considérer que les relations par paires. En procédant ainsi, ces techniques provoquent une perte d'informations. L'objet de cette étude est d'introduire les concepts de dissimilarité et de distan
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Isabelle, Sébastien. "Exploiter la diversité génétique des cultivars de tomates pour mieux comprendre les voies métaboliques des composés volatils." Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/68540.

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La tomate (Solanum lycopersicum) est largement appréciée par les consommateurs. La flaveur distinctive des tomates provient des interactions entre les acides, les sucres et un mélange complexe de composés volatils. Ces substances volatiles sont principalement dérivées de nutriments tels que les caroténoïdes, les acides gras et les acides aminés. Bien que la tomate soit considérée comme un modèle pour le développement des fruits, la plupart des voies métaboliques menant à la synthèse de volatils ne sont pas encore bien comprises. Afin de mieux interpréter les sentiers métaboliques, nous avons q
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Madoui, Mohammed-Amine. "Identification d'effecteurs du pouvoir pathogène et de voies métaboliques chez l'oomycète Aphanomyces euteiches par une approche génomique." Toulouse 3, 2009. http://thesesups.ups-tlse.fr/632/.

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Les oomycètes sont des microorganismes eucaryotes responsables de maladies dévastatrices chez les plantes cultivées. La pourriture racinaire causée par l'oomycète Aphanomyces euteiches est à l'origine de dommages importants sur les cultures de légumineuses. Afin d'identifier les effecteurs du pouvoir pathogène et de mieux connaitre le métabolisme d'A. Euteiches, une analyse globale du transcriptome a été réalisée. L'analyse bioinformatique de 20 000 ADNc issus de la souche ATCC201684 a conduit à la mise en place d'une base de données accessible en ligne, AphanoDB, sur laquelle les ESTs assembl
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Alaoui, Hicham El. "Le métabolisme lipidique des microsporidies : caractérisation des voies métaboliques potentiellement liées à la thérapie chez encéphalitozoon cuniculi." Clermont-Ferrand 2, 2000. http://www.theses.fr/2000CLF22233.

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Les microsporidies, parasites intracellulaires obligatoires, responsables de différentes pathologies chez l'homme et l'animal, possèdent un appareil invasif riche en membranes. Ceci justifie l'étude du métabolisme des lipides, en particulier le métabolisme des phospholipides, ceci dans une optique thérapeutique. Nos analyses ont été effectuées sur des spores de trois espèces : glugeaatherinae et spraguea lophii (parasites de poissons) et encephalitozoon cuniculi (parasite de mammifères). Une certaine similarité entre les profils d'acide gras des parasites et hôtes respectifs a été observée. Pl
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Corriveau, Stéphanie. "Étude de l'équilibre entre les voies métaboliques de l'acide arachidonique dans le myomètre de femmes enceintes à terme." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2011. http://hdl.handle.net/11143/5553.

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Les voies métaboliques de l'acide arachidonique (AA) produisent divers dérivés qui sont impliqués dans le contrôle de la contraction et de la relaxation des muscles lisses.Les métabolites de l'AA sont produits soit par la voie des cyclooxygénases, des lipoxygénases ou celles des cytochromes P450 époxygénase et [oméga]-hydroxylase. À ce jour, aucune étude n'a analysé les effets des eicosanoïdes produits des cytochromes P450 sur le muscle lisse utérin en fin de grossesse. Le but de cette étude est de comparer les effets des différents sous-produits de l'acide arachidonique sur le myomètre gravid
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Debourg, Alain. "La régulation des flux métaboliques au travers des voies de biosynthèse des acides aminés branchés chez Saccharomyces cerevisiae." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1993. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/212827.

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Fer, Maude. "Voies métaboliques d'époxydations et d'hydroxylation des acides gras poly-insaturés à longue chaîne par les cytochromes P450 humains." Brest, 2007. http://www.theses.fr/2007BRES2002.

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Depuis la découverte de la troisième voie catalytique d'oxydation de l'acide arachidonique par les cytochromes P450 (CYP), s'ajoutant à celles des lipoxygénases et des cyclooxygénases, il est apparu que les oxylipides formés (lipides contenant 3 atomes d'oxygène) ont des rôles biochimiques importants. Notre étude a pour but de réexaminer les voies d'époxydation et d'hydroxylation de plusieurs acides gras polyinsaturés à longue chaîne (AGPI-LC) par 17 CYPs humains recombinants. Le métabolisme des acides gras étudiés, 8,11,14-ETA (C20:3 n- 6), 5,8,1 1-ETA (C20:3 n-9), AA (C20:4 n-6), EPA (C20:5
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Pérès, Sabine. "Analyse de la structure des réseaux métaboliques : application au métabolisme énergétique mitochondrial." Bordeaux 2, 2005. http://www.theses.fr/2005BOR21282.

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L'analyse des voies métaboliques est une étape essentielle pour étudier les comportements d'un réseau métabolique. Une approche théorique telle les modes élémentaires permet d'analyser les propriétés structurales du réseau. Leur recherche dans un réseau métabolique est souvent caractérisée par une explosion combinatoire de leur nombre. Nous avons appliqué ce formalisme à trois réseaux métaboliques : le réseau mitochondrial énergétique du muscle, du foie et de la levure. Nous avons ensuite construit une méthode de classification des modes élémentaires afin d'analyser les résultats obtenus. Cett
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Al, Shaer Ali. "Analyse des déformations permanentes des voies ferrées : approche dynamique." Marne-la-vallée, ENPC, 2005. https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00001592.

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Fetita, Catalin Iulian. "Analyse morphofonctionnelle des voies aériennes en TDM spiralée volumique." Paris 5, 2000. http://www.theses.fr/2000PA055021.

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Enjeu majeur de l'imagerie pulmonaire numérique, l'analyse quantitative des voies aériennes en tomodensitométrie (TDM) spiralée volumique nécessite de disposer d'outils de segmentation, modélisation, description, représentation et visualisation 3D de l'arbre bronchique. Dans ce contexte d'aide au diagnostic fondée sur la vision par ordinateur, cette thèse développe deux méthodes originales et automatiques, l'une par approche hybride 2D/3D, l'autre par modélisation purement tridimensionnelle, aboutissant à la bronchographie TDM virtuelle, nouvelle fonctionnalité clinique de navigation 3D intell
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Carquet, Marie. "Approches combinatoires pour la reconstruction d'une voie de biosynthèse chez la levure : variation des niveaux d'expression et analyse fonctionnelle d'une étape clé de la voie." Thesis, Toulouse, INSA, 2015. http://www.theses.fr/2015ISAT0024/document.

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Afin d’optimiser la production d’un composé d’intérêt tout en évitant les conséquences néfastes sur la viabilité cellulaire, un défi majeur de l’ingénierie métabolique est d’obtenir un équilibre entre les flux métaboliques endogènes de la cellule et le flux consommé par une nouvelle voie de biosynthèse. Dans ce contexte d’optimisation, les stratégies combinatoires génèrent une diversité de voies métaboliques et de modes de régulation rassemblant de précieuses informations quant aux choix d’orientations stratégiques à faire. Notre étude s’inscrit dans un projet visant à produire les molécules r
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Soltani, Mohamed. "Distribution lipidique et voies métaboliques chez quatre bactéries Gram-négatives hydrocarbonoclastes : variation en fonction de la source de carbone." Phd thesis, Paris 6, 2004. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00009276.

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Les principaux objectifs de ce travail de recherche étaient (i) l'étude de la composition lipidique de quatre bactéries Gram-négatives hydrocarbonoclastes Marinobacter hydrocarbonoclasticus, Marinobacter aquaeolei, Acinetobacter calcoaceticus et Pseudomonas oleovorans en fonction de la source de carbone, (ii) la détermination des différents voies métaboliques de dégradation des hydrocarbures comportant une chaîne alkyle et (iii) mieux connaître la composition en Β-hydroxy acides lipopolysaccharidiques de leurs membranes extérieures. La première partie de ce travail présente une description qua
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Stentelaire, Christelle. "Contrôle des voies métaboliques fongiques impliquées dans la biotransformation de la fraction féruloylée de coproduits agricoles en vanilline naturelle." Aix-Marseille 1, 1999. http://www.theses.fr/1999AIX11082.

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La vanilline est la molécule aromatisante la plus utilisée dans le monde. En raison du prix élevé de l'arôme naturel de vanille, l'essentiel du marché est couvert par de la vanilline de synthèse. L'utilisation de procédés biotechnologiques apparaît comme une alternative séduisante pour la production de vanilline naturelle. C'est dans ce contexte que l'INRA a développé un procédé associant deux champignons aux propriétés de bioconversion complémentaires : un Ascomycète, "Aspergillus niger" transformant l'acide férulique en acide vanillique et un Basidiomycète, "Pycnoporus cinnabarinus" ou "Phan
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Vila, Nova Meryl. "Détection et identification des mutations et des voies métaboliques associées à l'adaptation à l'hôte dans le pangénome de Salmonella." Thesis, Paris Est, 2019. http://www.theses.fr/2019PESC0057.

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L’évolution du genre Salmonella a conduit à l’apparition d’espèces et de sous-lignées adaptées à différents hôtes jouant un rôle majeur dans la compréhension des mécanismes biologiques de l’adaptation bactérienne. En raison du lourd fardeau sanitaire et socio-économique que représente les salmonelloses, le genre Salmonella est donc contrôlé par des laboratoires hospitaliers et de sécurité alimentaire. Nous avons donc développé deux approches analytiques permettant de détecter et identifier les mutations associées à l’adaptation aux hôtes de Salmonella sans a priori sur les éléments génomiques
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Tavernier, Patricia. "Etude de la biosynthèse de polymères chez Sinorhizobium Meliloti. Caractérisation par RMN du carbone 13 des voies métaboliques impliquées." Amiens, 1997. http://www.theses.fr/1997AMIE0116.

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Ce travail porte sur l'etude de la biosynthese de polymeres (exopolysaccharides, poly--hydroxybutyrate, -glucanes, glycogene) par un micro-organisme multiproductif : sinorhizobium meliloti. Tout d'abord, la production d'eps et de phb a ete caracterisee dans des milieux avec des apports azotes differents (extrait de levure, nitrate d'ammonium) ou carence en azote et a partir de deux sources carbonees : glucose ou fructose. La nature de la source carbonee et azotee affecte a la fois la croissance et la production des polymeres par les deux souches de s. Meliloti etudiees (m5n1 et su47). La crois
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Burguière, Pierre. "Régulation du transport de la cystine et des voies métaboliques de la biosynthèse de la cystéine chez Bacillus subtilis." Paris 7, 2006. http://www.theses.fr/2006PA077081.

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Bacillus subtilis est une bactérie du sol aérobie capable de sporuler. Elle sert de modèle pour l'étude des bactéries à Gram positif. Au cours de ce travail, nous avons identifié et caractérisé tous les systèmes de transport de la cystine de Bacillus subtilis : TcyP (symporteur cystine::cation), TcyJKLMN et TcyABC (ABC transporteurs). Les systèmes TcyP et TcyJKLMN sont des transporteurs à haute affinité de la cystine alors que TcyABC est un transporteur mineur. L'expression des gènes tcyABC est faible et constitutive alors que celle des gènes tcyP et tcyJKLMN est réprimée en présence de cystéi
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Al, shaer Ali. "Analyse des déformations permanentes des voies ferrées ballastées - Approche dynamique." Phd thesis, Ecole des Ponts ParisTech, 2005. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00001592.

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L'étude du comportement des voies ferrées ballastées sous les passages de trains à grandes vitesses est une des recherches les plus importantes dans le domaine des transports. À cause du passage répété de trains à grandes vitesses, des tassements verticaux différentiels sont observés tout au long de la voie ferrée. Ces tassements dépendent de la qualité de la plate-forme, de la vitesse de roulement ainsi que du comportement dynamique de la voie. Ils peuvent menacer le confort et la sécurité des passagers et nécessiter des coûts élevés de maintenance pour rendre la voie à sa géométrie initiale.
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Coat, Rémy. "Caractérisation des voies métaboliques et des marqueurs précoces de l'altération microbiologique des ovoproduits au cours de leurs procédés de fabrication." Thesis, Nantes, 2018. http://www.theses.fr/2018NANT4038/document.

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L’ovoproduit est une matrice biologique complexe, constituée de protéines, lipoprotéines, lipides et de nombreux micronutriments (vitamines, minéraux, etc.). Cependant, une fois cassé et homogénéisé l'ovoproduit entier liquide perd une bonne part de ses propriétés de conservation, devenant ainsi pour certaines bactéries un excellent milieu de croissance. Ce développement bactérien non maîtrisé provoque en plus des risques sanitaires, des altérations biochimiques modifiant fortement les qualités organoleptiques de l’ovoproduit. On se propose dans cette thèse d’étudier les mécanismes biochimique
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Le, Boulch Malo. "Taxonomie et inférence fonctionnelle des procaryotes : développement de MACADAM, une base de données de voies métaboliques associées à une taxonomie." Thesis, Toulouse, INPT, 2019. http://www.theses.fr/2019INPT0131.

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Les procaryotes sont des organismes ubiquitaires vivant en communauté et possédant une extrême diversité métabolique en lien avec leur omniprésence. Pour contribuer à la compréhension du rôle fonctionnel des procaryotes, nous avons développé MACADAM : une base de données de voies métaboliques associées à une taxonomie centrée sur les procaryotes.L'objectif était de mettre à disposition de la communauté scientifique des données d'informations fonctionnelles sélectionnées sur leur qualité (qualité des génomes, qualité des annotations), enaccès libre et interopérables. MACADAM regroupe les PGDBs
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Peltzer, Juliette. "Établissement de nouvelles lignées murines myogéniques, en vur de l'étude in vitro des régulations coordonnées des voies métaboliques et contractiles." Paris 12, 2007. http://www.theses.fr/2007PA120030.

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Notre objectif est d'élucider les facteurs impliqués dans les régulations coordonnées métaboliques et contractiles des fibres musculaires. Nous avons établi des clones myogéniques dérivés de cellules satellites de souris immortomouse. 1- Nous avons analysé l'expression d'enzymes métaboliques et de protéines contractiles (MHC) de clones issus de muscles de souris adultes, lents-oxydatifs et rapides-glycolytiques et de muscles néonataux. Nos données suggèrent que, seules les cellules issues de muscles lents seraient prédéterminés. Le clone WTT, dérivé de muscles néonataux se différencie avec un
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Salou, Patrick. "Fermentation malolactique chez Leuconostoc oenos : aspects cinétiques, métaboliques et énergétiques." Toulouse, INSA, 1992. http://www.theses.fr/1992ISAT0018.

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Dans le cadre de la mise en uvre potentielle de bacteries lactiques pour realiser la fermentation malolactique dans les produits derives du raisin, le comportement cinetique et metabolique d'une souche de leuconostoc oenos a ete etudie en culture discontinue, sur milieu complexe, avec un objectif d'optimisation des productivites et de comprehension de la physiologie. L'influence de divers facteurs d'environnement sur la croissance et la degradation de l'acide malique a ete caracterisee et quantifiee. Les cinetiques observees resultent de limitations des flux cataboliques des substrats energeti
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Grosse, Yann. "Détermination des voies métaboliques impliquées dans la génotoxicité de la mycotoxine ochratoxine A, par la mise en évidence d'adduits à l'ADN." Toulouse, INPT, 1996. http://www.theses.fr/1996INPT013A.

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L'ocratoxine A, mycotoxine contaminant les céréales, mise en cause dans la néphropathie endémique des Balkans, serait responsable de l'incidence élévée de tumeurs du tractus urinaire associées à cette maladie. C'est un cancérogène hépatique et rénal chez le rongeur, et son activité génétoxique a été mise en évidence par l'induction de cassures simples brins et d'adduits à l'acide désoxyribonucléique au niveau du rein et du foie de souris. [. . . ]
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Abdallahi, Ould Mohamed Salem. "Implication du stress oxydant, du monoxyde d'azote et des voies métaboliques associées, dans la pathogénie de la bilharziose à Schistosoma mansoni." Aix-Marseille 2, 2001. http://www.theses.fr/2001AIX22074.

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Nicoloff, Hervé. "Biodiversité et expression des voies métaboliques chez les bactéries lactiques : biosynthèse du carbamylphosphate chez Lactobacillus plantarum - Régulation de deux protéines homologues." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2001. http://www.theses.fr/2001STR13204.

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Les bactéries lactiques sont caractérisées par de grandes exigences nutritionnelles. Nous recherchons les mécanismes moléculaires conduisant aux doubles auxotrophies pour l'arginine et les pyrimidines. L'étude des voies de biosynthèse de ces composés a été réalisée chez une souche prototrophe Lactobacillus plantarum CCM 1904. Le carbamylphosphate (CP), un intermédiaire réactionnel commun de ces deux voies, est synthétisé chez L. Plantarum par deux carbamylphosphate synthétases régulées par les pyrimidines (CPS-P) ou par l'arginine (CPS-A). L'étude du rôle de chacune de ces enzymes dans la bios
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Truquet, Rémy. "Variations cycliques et dégagements de chaleur : analyse et voies de controle." Toulouse, INPT, 1997. http://www.theses.fr/1997INPT065H.

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Notre recherche est motivee par le besoin d'apporter une contribution a l'etude d'un phenomene physique complexe qui intervient dans le controle du fonctionnement d'un systeme industriel. Notre application vise le phenomene du degagement de chaleur qui se produit dans les moteurs a allumage commande. La comprehension du phenomene constitue une premiere etape a la suite de laquelle il est envisageable de proposer des solutions pour l'exploiter dans le cadre du controle des moteurs a combustion interne. L'amelioration du controle est necessaire en raison des normes de pollution qui deviennent tr
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