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Thematische Bibliographien / Diversité Symbiotique / Dissertationen

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Dissertationen zum Thema „Diversité Symbiotique“

Autor: Grafiati

Veröffentlicht am 18. Mai 2024

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1

Pernice, Mathieu. "Diversité bactérienne associée aux organes excréteurs des Nautiloides : caractérisation du système symbiotique, implications évolutives et physiologiques." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066400.

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Les appendices péricardiques des Nautiloides (origine cambrienne ~500 MA) cumulent les trois processus liés à la fonction d’excrétion (filtration, réabsorption, sécrétion). Les bactéries symbiotiques abritées dans ces organes chez deux espèces de Nautiloides : Nautilus macromphalus (Nouvelle-Calédonie) et Nautilus pompilius (Philippines et Vanuatu) ont été caractérisées par différentes approches (séquençage de l’ARNr 16S, CARD-FISH, TEM). L’analyse phylogénétique a permis de proposer l’hypothèse nouvelle d’une «double symbiose» spécifique impliquant deux groupes bactériens (beta protéobactérie

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2

Porro, Barbara. "Diversités génétiques chez l’holobiote Anemonia viridis : des morphotypes de l’hôte à la différenciation symbiotique." Thesis, Université Côte d'Azur (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019AZUR4071.

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Qu’est-ce qu’un individu ? Cette question est un prérequis pour toutes les études en génétique des populations et en biologie évolutive, mais elle est loin d’être naïve dès que l’on prend en compte les relations symbiotiques. Les interactions entre un hôte et ses micro-organismes symbiotiques peuvent conditionner le développement, la reproduction, les capacités adaptatives de l’holobiote qu’ils constituent et donc la trajectoire évolutive de l’espèce. Comprendre ces interactions, c’est appréhender la complexité des interactions symbiotiques et donc caractériser ces différents partenaires et él

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3

Lazrek-Ben, Friha Fatma. "Analyse de la diversité génétique et symbiotique des populations naturelles tunisiennes de Medicago truncatula et recherche de QTL liés au stress salin." Toulouse 3, 2008. http://thesesups.ups-tlse.fr/384/.

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L'objectif de cette thèse est l'étude de la diversité génétique au sein de 136 lignées appartenant à 10 populations naturelles tunisiennes de M. Truncatula. Ces populations proviennent de différentes conditions pédoclimatiques représentatives du territoire tunisien. La première partie consiste à une analyse à l'échelle moléculaire par l'utilisation de 18 microsatellites répartis sur les différents groupes de liaison. Cela a permis de structurer les populations selon un axe nord / sud séparé par la dorsale tunisienne. Le paramètre pluviométrie est le principal facteur influençant cette structur

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4

Moulin, Lionel. "Etude moléculaire de la diversité symbiotique des rhizobia : de l'analyse du gène nodA à l'identification de rhizobia au sein des bé̀ta-protéobactéries." Lyon 1, 2002. http://www.theses.fr/2002LYO10179.

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Les rhizobia sont des bactéries du sol capables d'établir une symbiose fixatrice d'azote avec des légumineuses. Le séquençage et l'analyse phylogénétique du gène de nodulation nodA d'une collection de rhizobia taxonomiquement et symbiotiquement divers a permis d'établir l'existence d'une étroite corrélation entre la séquence protéique NodA et la présence de trois substitutions particulières des FNs. Nous avons développé une méthode de prédiction de la présence de ces substitutions basée sur l'analyse phylogénétique et statistique de la séquence NodA. La caractérisation du gène nodA parmi des s

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5

N'Zoué, Affoué Angèle. "Diversité génétique et fonctionnelle des souches de Bradyrhizobium impliquées dans les cultures mixtes niébé-soja-arachide/céréales (maïs) en Côte d’ivoire : approche méthodologique par analyse multi-locus (MLSA) : étude des effets PGPR sur le maïs." Montpellier 2, 2008. http://www.theses.fr/2008MON20221.

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Les bactéries du genre Bradyrhizobium forment des symbioses fixatrices d'azote avec des légumineuses. En Côte d'Ivoire, des cultures mixtes sont pratiquées en agriculture associant le niébé, le soja, l'arachide et le maïs. Ce travail de thèse décrit la diversité génétique et fonctionnelle des symbiotes des légumineuses trouvées dans ces cultures mixtes, et leurs effets PGPR sur le maïs. Dans un premier temps nous avons développé une analyse phylogénétique Multi-Loci (sur 9 gènes) sur une collection d'isolats d'Aeschynomene de référence afin de détecter les marqueurs les plus informatifs pour l

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Mallien, Cédric. "Étude de la diversité neutre et adaptative chez l'anémone de mer symbiotique Anemonia viridis : apport de techniques de type Next-Generation Sequencing dans les questions de délimitation d’espèces et d’adaptation locale." Thesis, Université Côte d'Azur (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017AZUR4111/document.

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L’anémone de mer symbiotique Anemonia viridis possède cinq morphes définis à l’aide de critères morphologiques. Premièrement, le statut taxonomique de trois des morphes d’A. viridis (var. rufescens, rustica et smaragdina) a été précisé à l’aide de marqueurs moléculaires basés sur des gènes de stress et des marqueurs RAD. Nous avons pu déterminer que ces trois morphes ne formaient qu’une seule espèce et mis en évidence quatre lignées génétiques indépendantes sur base de la géographie (trois en mer Méditerranée, une dans la Manche). Par l’utilisation des variations des séquences ITS2, nous n’avo

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Zouache, Karima. "Interactions multipartites entre communautés symbiotiques, pathogènes et vecteurs : le système vectoriel bactéries, endosymbiotiques, virus chikungunya, moustiques aedes." Thesis, Lyon 1, 2010. http://www.theses.fr/2010LYO10183.

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Aedes albopictus et Aedes aegypti sont des moustiques vecteurs d’arbovirus tels que le virus de la dengue et le virus du chikungunya. En plus des virus transmis, les moustiques hébergent également des bactéries dont certaines affectent la biologie des hôtes. Par exemple, la bactérie Wolbachia infecte naturellement Aedes albopictus. Comme chez la plupart des insectes, cette bactérie est un parasite qui manipule la reproduction du moustique et peut également interagir avec certains pathogènes, modifiant ainsi la transmission du pathogène par le moustique hôte. Hors Wolbachia, peu d’études ont ét

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8

Mohamad, Roba. "Adaptation des bactéries symbiotiques de légumineuses métallicoles : effets des métaux lourds et de la plante hôte sur la composition des populations de rhizobia symbiotiques d’Anthyllis vulneraria et de Lotus corniculatus." Thesis, Montpellier, 2016. http://www.theses.fr/2016MONTT153/document.

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Deux légumineuses (Anthyllis vulneraria et Lotus corniculatus) adaptées aux métaux lourds constituent un matériel d’intérêt pour la phytostabilisation de sites miniers. Leur fonction de fixatrices biologiques d’azote grâce à leur symbiose avec des bactéries symbiotiques permet l’établissement efficace d’une couverture végétale durable limitant la dispersion des métaux dans l’environnement. Nos objectifs ont été d’étudier les effets des métaux lourds et de la plante hôte sur les populations symbiotiques naturellement associées à ces légumineuses en analysant (i) les populations symbiotiques ass

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9

Perrineau, Marie-Mathilde. "Variations géographiques et temporelles de la diversité des bactéries symbiotiques associées à Acacia mangium : zone d’origine, zones d’introduction et inoculation contrôlée." Thesis, Montpellier 2, 2011. http://www.theses.fr/2011MON20046/document.

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Acacia mangium Willd. est une légumineuse ligneuse introduite dans de nombreux pays tropicaux à partir de son aire d'origine (Australie), avec ou sans inoculations volontaires par des rhizobiums sélectionnés. Des campagnes d'échantillonnage des bactéries symbiotiques fixatrices d'azote ont été réalisées dans sa zone d'origine à différentes époques (1986, 2007 et 2009) et dans trois zones d'introduction (Brésil, Sénégal et Malaisie). Après isolement et test de nodulation homologue, la diversité de plus de 500 souches a été analysée sur un gène de ménage (recA) et un gène symbiotique (nodA). Nou

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Damon, Coralie. "Impact de la nature du couvert végétal sur la diversité taxonomique et fonctionnelle des champignons symbiotiques et des microorganismes eucaryotes associés." Thesis, Lyon 1, 2010. http://www.theses.fr/2010LYO10061.

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Au sein des sols forestiers, la richesse taxonomique et le rôle des microorganismes eucaryotes (en grande partie des champignons) restent encore largement méconnus. L’espèce d’arbre est un des facteurs qui structurent les communautés de ces microorganismes. Nous avons étudié l’impact de l’essence forestière (hêtre et épicéa) sur la diversité taxonomique et fonctionnelle de ces communautés par une approche métatranscriptomique et une approche biochimique (focalisée sur les champignons ectomycorhiziens). Nous avons montré un effet de la séquence étudiée (ADNr 18S, ADNc) sur la distribution taxon

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Darius, Hélène Taiana. "Diversité des dinoflagellés symbiotiques de sept espèces de coraux du lagon de Tahiti." Pacifique, 1998. http://www.theses.fr/1998PACI0024.

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Rangin, Cécile. "Phylogéographie, compétition et sélection chez les bactéries symbiotiques Sinorhizobium meliloti et Sinorhizobium medicae." Montpellier 2, 2008. http://www.theses.fr/2008MON20220.

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Les deux espèces bactériennes, Sinorhizobium meliloti et S. Medicae forment une symbiose efficace avec Medicago truncatula, tout en présentant un polymorphisme de fixation d'azote. Nous n'avons pas pu confirmer dans ce modèle l'existence de mécanismes de sanction des symbiotes non-fixateurs décrits théoriquement et expérimentalement chez d'autres couples symbiotiques. Les deux espèces bactériennes pourraient alors être maintenues en sympatrie avec la même plante-hôte du fait d'avantages sélectifs différents : S. Meliloti serait plus compétitrice pour la nodulation de la plante, alors que S. Me

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Soussou, Souhir. "Adaptation de la symbiose Fabacées-rhizobium aux sites miniers : absorption du zinc par Anthyllis vulneraria et analyse de la diversité des bactéries symbiotiques d'Hedysarum coronarium." Thesis, Montpellier, SupAgro, 2013. http://www.theses.fr/2013NSAM0007/document.

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Les fortes teneurs en éléments traces métalliques (ETMs) présents dans les déblais miniers entraînent généralement une forte réduction de la diversité végétale et microbienne. Selon les caractéristiques physico-chimiques des sols, la nature des métaux, leur concentration et leur spéciation, seules certaines espèces végétales et microbiennes ont développé des mécanismes particuliers et se sont adaptées à la présence d'ETMs. C'est le cas d'Anthyllis vulneraria et d'Hedysarum coronarium, deux Fabacées qui sont présentes sur d'anciennes mines de Zn/ Pb respectivement au sud de la France et au nord

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Halary, Sébastien. "Etude des symbioses de mytilidés des écosystèmes marins profonds à base chimiosynthétique par des techniques de FISH, de microscopie et de traitement d'images." Paris 6, 2009. http://www.theses.fr/2009PA066057.

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Les symbioses impliquant des bactéries méthanotrophes et sulfoxydantes se rencontrent chez de nombreux mytilidés des écosystèmes marins profonds à base chimiosynthétiques pour lesquels elles jouent un rôle majeur dans la nutrition et l’adaptation à leur environnement. Ce travail de thèse a consisté à adapter et développer différentes approches basées sur le FISH (Fluorescent in situ hybrization), la microscopie et l’analyse d’images. Ces techniques ont permis l’identification de 6 types de bactéries symbiotiques sur une même coupe de filaments branchiaux de l’éspèce Idas sp. Et l’étude ultrast

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Vachat, Francis. "Plasmides de rhizobia nodulant le haricot (Phaseolus vulgaris L. ) : transfert de plasmides symbiotiques, diversité de séquences repC de réplication." Dijon, 2000. http://www.theses.fr/2000DIJO5067.

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L'objectif de cette étude était d'estimer l'effet potentiel des transferts horizontaux de plasmides sur la structure des populations naturelles de rhizobium symbiotes du haricot, et d'identifier des marqueurs permettant de caractériser et de suivre les plasmides dans ces populations. Douze plasmides symbiotiques (psyms) transférables ont été identifies au sein d'un échantillon d'isolats symbiotes du haricot. Cinq de ces psyms appartenant à cinq espèces ont été marques avec le transposon tn5 et croises avec une trentaine de souches réceptrices de notre échantillon. Des transferts ont été observ

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Pichon, Delphine. "Associations symbiotiques chez les céphalopodes : étude comparative de la diversité bactérienne dans les glandes nidamentaires accessoires du système reproducteur." Paris 6, 2005. http://www.theses.fr/2005PA066236.

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LORTET, GILLES. "La diversite symbiotique des rhizobia : une approche moleculaire appliquee a differents groupes taxonomiques isoles des genres acacia et sesbania au senegal." Paris 11, 1996. http://www.theses.fr/1996PA112296.

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La specificite de la symbiose fixatrice d'azote entre les rhizobia et les legumineuses est surtout determinee par la structure des facteurs nod, molecules lipo-oligosaccharidiques dont la production par la bacterie est induite par la plante-hote. Les rhizobia isoles des genres acacia et sesbania appartiennent a plusieurs groupes taxonomiques, dont les especes sinorhizobium saheli et sinorhizobium teranga, et le groupe genomique u. Nous avons tout d'abord montre sur une collection de souches appartenant a ces differents groupes taxonomiques qu'independamment de leur position taxonomique, toutes

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Terraz, Gabriel. "Diversité génétique et admixture au sein du complexe d’espèces Bemisia tabaci : contributions des compartiments nucléaires et cytoplasmiques." Thesis, Lyon, 2016. http://www.theses.fr/2016LYSE1112/document.

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Les invasions biologiques ont des conséquences écologiques telles que l'émergence de pathogènes et de ravageurs. Les populations invasives font face à de nouvelles conditions biotiques et abiotiques qu'elles doivent surmonter. Ces invasions biologiques sont des systèmes modèles pour étudier l'évolution sur de courtes échelles de temps car elles nécessitent une adaptation rapide qui fait intervenir différents processus (sélection naturelle, dérive, plasticité phénotypique). Du fait des introductions multiples et de l'hybridation, une augmentation de la variabilité génétique nucléaire peut-être

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