Auswahl der wissenschaftlichen Literatur zum Thema „Habitats artificiels à poissons“

Le développement côtier introduit des habitats artificiels qui impactent la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes. Les solutions d'ingénierie écologique, comme les habitats artificiels à poissons (HAP), peuvent réhabiliter des zones très modifiées, comme les ports, en offrant un abri aux poissons. Les HAP peuvent aussi fournir un substrat aux invertébrés et aux macroalgues, améliorant le fonctionnement de l'écosystème. Leurs effets pourraient aller au-delà des ports et modifier les échanges trophiques avec les habitats adjacents. Cette thèse étudie la biodiversité des invertébrés associés aux HAP et explore les échanges de biomasse entre les ports et les herbiers de Posidonia oceanica adjacents le long de la côte méditerranéenne française.Les objectifs sont : (1) évaluer comment la diversité et la composition des invertébrés benthiques varient avec le temps d'immersion des HAP, (2) comprendre comment les types d'HAP et le contexte environnemental modifient les assemblages benthiques, et (3) explorer les échanges de matière organique entre les ports et les herbiers adjacents. J'ai étudié les HAP Biohut® (ECOCEAN), composés d'une cage métallique remplie de coquilles d'huîtres, attachés aux quais ou sous les pontons dans les ports.Au chapitre 1, j'ai examiné le rôle du temps d'immersion des HAP sur la diversité et la composition des assemblages d'invertébrés dans 3 ports commerciaux. Des variations dans la composition des invertébrés ont été observées entre 6 et 18 mois d'immersion, avec une augmentation de l'abondance, de la richesse et de l'équitabilité au fil du temps. Au chapitre 2, j'ai étudié les variations géographiques et intra-portuaires de la composition et de la diversité des invertébrés. L'étude a révélé des différences dans la composition des taxons entre 2 régions caractérisées par des apports en nutriments différents et des corrélations entre la composition des assemblages et la chlorophylle-a, indicateur de la concentration en nutriments. Les assemblages d'invertébrés variaient aussi selon les zones où les HAP étaient installés, probablement à cause de différences d'accès à la lumière. Au chapitre 3, j'ai étudié la connectivité trophique entre les herbiers de P. oceanica et les ports adjacents sur 4 sites : 2 avec des ports équipés en HAP et 2 non équipés. Dans les sites non équipés, les valeurs δ15N de la matière organique particulaire à l'intérieur du port étaient les plus élevées, suggérant un enrichissement en nutriments d'origine humaine. Ces valeurs diminuaient dans les herbiers selon la distance, indiquant un effet de ces nutriments sur l'herbier proche de l'entrée du port. Les poissons (Diplodus spp.) pouvaient utiliser des ressources venant à la fois de l'herbier et du port de manière similaire sur les 4 sites. Les niches trophiques des poissons capturés dans le port équipé étaient légèrement plus grandes que celles des ports non équipés et se chevauchaient moins avec celles des poissons capturés à l'extérieur. Leurs fèces faisaient également partie de la matière organique sédimentaires des herbiers. Au chapitre 4, j'ai présenté des projets développés avec d'autres scientifiques sur la diversité fonctionnelle des espèces et les relations trophiques dans les HAP, des mesures bioacoustiques sur les AFH et une comparaison de la biodiversité entre les ports et les réserves marines à l'aide d'ADN environnemental.Mon travail a révélé des aspects susceptibles d'améliorer l'utilisation des HAP. La durée d'immersion, les conditions environnementales et les emplacements dans les ports doivent faire l'objet d'une attention particulière. Bien que je n'aie pas trouvé de différences claires dans les échanges entre habitats liés aux HAP, ces derniers semblent jouer un rôle en réduisant l'enrichissement en nutriments. L'importance des poissons dans les échanges entre habitats et le fait que les HAP favorisent leur survie suggèrent que ces HAP pourraient contribuer indirectement à la connectivité trophique<br>Coastal development modifies shorelines by introducing man-made habitats, which significantly impact coastal biodiversity and ecosystem functioning. Ecological engineering solutions, such as artificial fish habitats (AFH), can help rehabilitate extremely modified areas, including ports, by offering shelter for fish. As a side effect, AFH provide a substrate to benthic invertebrates and macroalgae, that could improve ecosystem functioning. The effects of AFH may also extend beyond ports and modify trophic exchange with adjacent habitats via fish feeding hydrodynamics. This thesis investigates the patterns of distribution of invertebrate biodiversity associated with AFH and explores the exchange of biomass between marinas and adjacent Posidonia oceanica meadows along the French Mediterranean coast where these habitats are often adjacent.The objectives are: (1) evaluating how taxonomic diversity and composition of benthic invertebrates vary with AFH immersion time, (2) understanding how AFH types and environmental context modify benthic assemblages, and (3) exploring the exchanges of organic matter between marinas and adjacent meadows. I focused on Biohut® AFH (ECOCEAN), made of a metal cage filled with oyster shells, attached to docks or under pontoons in harbours and marinas.In chapter 1, I examined the role of immersion time in determining the diversity and composition of invertebrate assemblages colonising AFH in 3 commercial harbours. The findings indicated significant variations in invertebrate composition from 6 to 18 months, with increased abundance, taxonomic richness, and evenness over time. In chapter 2, I focused on the geographical and within-port variability in taxonomic composition and diversity of invertebrates dwelling in AFH. The study revealed differences in taxa composition between 2 large regions, characterised by different nutrient loads and correlations between assemblage composition and chlorophyll-a, a proxy for nutrient concentration. The number of taxa was the highest in the nutrient-enriched region. Additionally, invertebrate assemblages varied according to port habitats where the AFH were placed, possibly due to differences in light availability. In chapter 3, I investigated trophic connectivity between P. oceanica meadows and adjacent marinas at 4 sites where both habitats are present. Two marinas were equipped with AFH and the remaining 2 were not. At the unequipped sites, the δ15N values of the particulate organic matter within the marina were the highest indicating human-derived nutrient enrichment. The values decreased within the meadow, gradually according to the distance. This suggests a spill of nutrients over the portion of the meadow adjacent to the inlet. Fish relied on resources from both the seagrass meadow and the marina, similarly among the 4 sites, however, the trophic niches of fishes (Diplodus spp.) captured within the equipped marina were slightly larger than those within unequipped ones and overlapped less with the trophic niches of the fish captured outside. Fish faeces were also part of the organic matter sedimenting within meadows. In chapter 4, I reported initiatives developed with other scientists. They include species functional diversity and trophic relations within AFH, acoustic signatures of organisms dwelling in AFH and biodiversity comparison between ports and marine reserves using environmental DNA.My work has highlighted several aspects that could improve the effectiveness of AFH as ecological engineering solutions. Immersion time, local environmental conditions, and specific locations within ports need particular attention. Although I did not find clear differences in cross-habitat exchange related to AFH, they seemed to play a role in reducing nutrient enrichment. Moreover, since fish play an important role in cross-habitat exchanges and find refuge within AFH, this ecological engineering solution could indirectly contribute to change trophic connectivity

The aim of this PhD was to better understand the characteristics and consequences of the transformations of Mediterranean infralittoral fish (Teleostei) nursery habitats, in order to gather useful knowledge for management of coastal areas in Mediterranean regions. Among the seascape mosaic, Cystoseira forests, a threatened macrophytes-formed habitat, displayed higher densities of fish juveniles (notably Labridae and Serranidae) than alternate states of rocky bottoms photophilic biocenosis, namely Dictyotales and Sphacelariales bushland and barren grounds. The relatively higher nursery value of Cystoseira forests (for Symphodus spp. ) and of the shallow heterogeneous blocks and pebbles gentle slopes (for Diplodus spp. ) where consistent through space at both local (1 km) and regional (20 km) scales, although juvenile densities varied significantly in space between sites for a given nursery habitat. The spatial variability of juvenile densities, both across various habitats and among Cystoseira forests was notably related to habitat tri-dimensional structure (heterogeneity and complexity); this structure provided refuges for juveniles and influenced namely predation success of their predators. This experimental and observational study demonstrated that habitat human-induced transformations, such as forest fragmentation and cover density decrease critically reduced their nursery value for coastal fishes. Our results suggest that the fish productivity virtually lost in areas where forests have already disappeared may be considerable. Finally, these essential habitats were scarce and not homogenously distributed along the coast: in the case of Diplodus spp. , less than 10% of the studied rocky shores displayed nursery habitats. Furthermore, the present work highlighted that the current design of management measures did not take into account the spatial distribution of these nursery habitats and the connectivity between all essential habitats at each life stages. A conceptual scheme aiming at adopting such “seascape approach” is proposed, in order to better target conservation efforts and guarantee coastal fish assemblages’ replenishment<br>Cette thèse avait pour objet les habitats de l’Infralittoral rocheux Méditerranéen qui ont un rôle de nourricerie pour les juvéniles de poissons (Téléostéens). Cette étude visait à mieux comprendre leurs caractéristiques et les conséquences de leurs transformations, notamment d’origine anthropique, dans le but de rassembler des données utiles à la gestion des zones côtières. Au sein de la mosaïque paysagère sous-marine, parmi les faciès de la biocénose des macrophytes photophiles de la roche infralittorale, les forêts de Cystoseires forment un habitat à macrophytes arborescentes qui est menacé. Cette thèse a démontré que ces forêts abritaient des densités plus élevées de juvéniles de poissons (notamment Labridae et Serranidae) que celles observées au sein de faciès alternatifs, en particulier les brousses à Dictyotales et Sphacelariales et les faciès de surpâturage. La haute valeur relative de nourricerie, que ce soit des forêts de Cystoseires (pour trois espèces du genre Symphodus), ou des petits fonds à blocs et galets (pour les espèces du genre Diplodus), a été observée de manière récurrente dans les différents sites littoraux étudiés aussi bien à l’échelle locale (1 km) que régionale (20 à 100 km). Cependant, pour un habitat donné, les densités de juvéniles ont montré une forte variabilité spatiale entre sites. La variabilité spatiale des densités de juvéniles, aussi bien entres sites des forêts à Cystoseires que d’un habitat à l’autre, était notamment associée aux différences de structure tridimensionnelle de l’habitat (hétérogénéité et complexité). Cette structuration fournissait un refuge pour les juvéniles et a en particulier influencé l’efficacité de leurs prédateurs. Ces travaux, sur la base de manipulations expérimentales et d’observations in situ, ont démontré que les transformations des habitats, telles que la fragmentation des forêts ou la diminution de la densité de leur couverture, réduisaient drastiquement leurs valeurs de nourricerie pour les poissons côtiers. Ces résultats suggèrent que la productivité en poissons virtuellement perdue, dans les zones où les forêts ont déjà totalement disparu, est considérable. Par ailleurs, ces habitats essentiels se sont avérés rares et in-équitablement distribués le long des côtes : dans le cas des Diplodus spp. , moins de 10% des côtes rocheuses étudiées présentaient des habitats nourriceries. Enfin, ce travail a mis en évidence que la planification actuelle des mesures de gestion des zones côtières méditerranéennes ne prenait généralement pas en compte la distribution spatiale des habitats nourriceries, ni leur connectivité avec les autres habitats essentiels à chaque étape clef du cycle de vie des poissons. Un schéma conceptuel, visant à adopter une telle « approche paysage » de la gestion, est proposé : il vise à promouvoir une focalisation optimale des efforts de conservation et à garantir ainsi le renouvellement des peuplements de poissons côtiers

Les écosystèmes d'eau douce figurent parmi les plus menacés, confrontés à de nombreuses perturbations telles que les invasions biologiques et la pollution. En réponse à ces pressions, leur biodiversité et leurs fonctions peuvent subir de forts changements au fil du temps. Ces perturbations ont entraîné des déclins marqués de la biodiversité, notamment chez les poissons, essentiels au fonctionnement des écosystèmes. Cette thèse vise à explorer les moteurs des dynamiques écologiques – des communautés de poissons au fonctionnement des écosystèmes – dans les lacs d'eau douce. Pour étudier ces dynamiques, nous avons utilisé un suivi sur dix ans dans des lacs artificiels, qui peuvent connaître des processus écologiques similaires à ceux des écosystèmes naturels, mais à un rythme plus rapide en raison de leur artificialité et de l'impact humain constant. Plus précisément, nous avons : (i) identifié le vecteur probable de colonisation initiale des poissons via une approche multidisciplinaire, (ii) analysé les changements dans la composition des communautés et leurs moteurs en quantifiant les variations de contributions des lacs et espèces à la bêta-diversité, (iii) utilisé un cadre de trajectoire écologique pour examiner la dynamique des structures trophiques, et (iv) utilisé la télédétection pour étudier la dynamique temporelle de la production primaire des lacs et son lien avec la structure des réseaux trophiques – reconstruite via un cadre de modélisation bayésien. Nos résultats soutiennent la zoochorie aviaire comme vecteur initial de colonisation. L'eutrophisation et les invasions biologiques se sont révélées être des moteurs clés des changements dans les communautés, devenant de plus en plus dominées par des espèces non indigènes à mesure que les lacs maturent. Ces changements ont été liés à des modifications de la structure trophique, avec des chaînes trophiques plus longues et une plus grande redondance trophique. Enfin, nous avons constaté que la structure des réseaux trophiques – influencée par la morphologie et la maturité des lacs – semblait liée à la dynamique de la production primaire, les lacs avec des réseaux trophiques plus complexes présentant une production primaire plus stable. Les résultats de cette thèse suggèrent des dynamiques écologiques interconnectées. Bien que la dynamique des communautés soit initialement façonnée par la colonisation naturelle, l'eutrophisation et les invasions biologiques d'origine humaine entraînent un remplacement d’espèces, remodelant ainsi les structures trophiques des communautés. Ensuite, la structure des réseaux trophiques influence les fluctuations des fonctions écosystémiques. Cette thèse constitue une base essentielle pour comprendre ces dynamiques et ouvre de nouvelles perspectives pour explorer leurs interconnexions, notamment concernant les fonctions écosystémiques, cruciales pour le maintien de la biodiversité et des services écosystémiques<br>Freshwater ecosystems rank among the most threatened, facing a wide range of disturbances such as biological invasion and pollution. As these ecosystems respond to such pressures, both their biodiversity and functions can undergo substantial changes over time. These threats have driven significant biodiversity declines, especially in fish, which are essential for ecosystem functioning. This thesis aims to explore the drivers of ecological dynamics – from fish communities to ecosystem functioning – in freshwater lakes. To investigate such dynamics we used a decade-long survey of artificial lakes, which can experience ecological processes similar to those in natural ecosystems but at a faster rate due to their artificial nature and ongoing human impact. Specifically, we: (i) identified the most likely vector for initial fish colonization using a multidisciplinary approach, (ii) analyzed changes in fish community composition and their drivers by quantifying changes in lake and species contributions to beta-diversity, (iii) applied an ecological trajectory tool to examine fish trophic structure dynamics, and (iv) used remote sensing to study the temporal dynamics of lake primary production and its link to food web structure – reconstructed via a Bayesian modeling framework. Our results strongly support avian-zoochory as an initial colonization pathway. Eutrophication and biological invasions emerged as key drivers of fish community changes, with fish communities becoming increasingly dominated by non-native species as lakes mature. These compositional changes were linked to shifts in trophic structure, mainly towards longer food chains and greater trophic redundancy. Finally, we found that food web structure – driven by lake morphology and maturity – seemed related to primary production dynamics, with lakes that have more complex food webs exhibiting more stable primary production. The findings throughout the thesis suggest interconnected ecological dynamics. While community dynamics are initially shaped by natural colonization, human-induced eutrophication and biological invasions drive species turnover, reshaping community trophic structures. Then, food web structures influence fluctuations in ecosystem function. This research lays a key foundation for understanding ecological dynamics and opens new avenues for exploring their interconnections; particularly regarding ecosystem functions, which are critical to maintaining biodiversity and ecosystem services

Cette thèse a pour thème central l'étude de deux problèmes soulevés dans les pêcheries modernes, la dégradation des habitats et le manque d'informations, qui comptent parmi les causes les importantes de la surexploitation des ressources halieutiques. Les deux premiers chapitres sont consacrés à l'examen du problème de la dégradation des habitats marins liée notamment aux activités de pêche destructrices. Le modèle de Gordon-Schaefer est prolongé afin de tenir compte de l'impact négatif de la pêche sur les habitats. Les conséquences pour la gestion sont analysées et l'importance de la prise en compte des habitats dans le développement des programmes de gestion des ressources halieutiques est mise en évidence. Le modèle élaboré est ensuite utilisé pour évaluer les bénéfices économiques des récifs artificiels, un outil de gestion auquel font de plus en plus appel les gestionnaires des pêcheries artisanales pour répondre à la dégradation des habitats. Enfin, dans le troisième chapitre, le rôle de l'information pour une pêche durable est examiné lorsque la ressource est en accès libre. Si, dans les deux premiers chapitres, il est supposé que les informations complètes sont disponibles pour l'élaboration des recommandations de gestion, dans la dernière étude, la décision concernant l'exploitation des ressources halieutiques est prise dans un contexte où aucune information sur la ressource n'est accessible. Cette décision est prise individuellement par chaque pêcheur qui opère dans la pêcherie. En développant un modèle multi-agents, nous montrons l'impact de l'apprentissage des pêcheurs sur la dynamique globale du système halieutique<br>This thesis focuses on two main problems posed in contemporary fisheries: habitat degradation and lack of information. They count among the most important causes of the overexploitation of marine resources. The first two chapters aim at examining the habitat degradation that is linked to destructive fishing activities. The Gordon-Schaefer model is extended to take account of the negative impact of fishing on the habitats. The consequences for fisheries management are analyzed and the importance of taking into account habitats in the development of fisheries management programs is highlighted. Then the extended model is used to evaluate the economic benefits of artificial reefs, a management tool to which frequently resort the managers of small-scale fisheries to mitigate the effects of habitat degradation. Finally, in the third chapter the role of information for sustainable fisheries is examined under open access. If in the first two chapters it is assumed that there is complete information, in the last study this assumption is relaxed - no information on the resource is known. The decision concerning the exploitation of marine resources is made individually by each fisherman that operates in the fishery. By developing an agent-based model, we show the impact of individual learning on the global dynamics of the system

Cette thèse en contrat CIFRE vise à proposer une méthodologie d'aménagement des fonds marins côtiers en habitats artificiels (HA) de production à vocation halieutique, en tant que nouveaux supports pour l'écosystème. L'objectif est d'apporter aux gestionnaires du milieu marin côtier une réponse complémentaire aux outils de gestion de la pêche, et plus largement des écosystèmes. La démarche méthodologique est géo-systémique, elle vise à intégrer ces aménagements à l'écosystème et au socio-système de la pêche côtière artisanale (stratégie du type GIZC). Les travaux menés au Japon, tant bibliographiques que de terrain, au sujet des récifs artificiels, nous ont permis d'appréhender l'aménagement intégré des fonds marins à travers la relation entre les espèces et leur habitat. Cette approche nous a conduits à proposer de faire évoluer le concept de "récif artificiel" vers celui d'"habitat artificiel" adapté à l'environnement côtier. La comparaison des méthodes utilisées par le Japon, le Portugal et la France, trois nations dont cet outil d'aménagement est avant tout à vocation halieutique, nous a permis d'identifier le manque d'une méthodologie d'aménagement globale en France. Ce sont les bases de cet outil que nous proposons de définir. Il est construit suivant les relations de la société avec la nature au niveau biophysique et socio-économique, en s'appuyant sur une typologie des habitats artificiels. Son application sur un cas d'étude nous a permis d'appréhender ses limites et la nécessité de définir un cadre de gestion des usages. L'HA est un instrument participatif transactionnel utile à la concertation pour la gestion des conflits. L'ménagement des fonds marins permet une délimitation et une appropriation d'un territoire côtier jusqu'ici "libre", processus responsabilisant préalables à une attitude de gestionnaire de la ressource. La préservation des écosystèmes côtiers favorisée par ces outils pourrait participer au développement équilibré des collectivités territoriales<br>This thesis under CIFRE contract aims to offer a methodology to change shore underwater marine systems into artificial habitat for ecosystem and fisheries exploitation. The objective is to give additional tools and answers to professionals specialised in fisheries and ecosystems management. The methodology is geo-systemic, it aims to integrate these changes into the ecosystem and socio-economic systems of artisanal fisheries (strategy type ICAM). The studies conducted on site in Japan taught us how to handle the integration of the underwater world through the relationship between species and their living space. This approach leads us to change the concept of "artificial reef" to the concept of "artificial habitat" as living spaces adapted for species living in a shore environment. The comparison of techniques from Japan, Portugal and France (the priority for these countries is to improve their marine parks with artificial habitat in order to help fishery related professions) helped us to identify a lack methodology in France. It is this global methodology that we want to define. The essence of this methodology is based on the relationship between society and nature at two levels : biophysical and socio-economical. It's organised by typology of artificial living space. Its application on one case study allows us to understand its limits and the necessity to define a common way of using such spaces. AH are participative transactional tools during concerted phases. We demonstrate that the wish to improve underwater living spaces enables the limitation and familiarization of shore territories which was until now unknown. The preservation of the shore ecosystems made possible by this methodology could assist in a balanced development of territorial collectivities

Les nourriceries et frayères sont des zones fonctionnelles halieutiques d’importance (ZFHI) qui abritent des phases clés du cycle de vie des poissons marins. Ces ZFHI subissent de multiples pressions anthropiques dont l’impact sur la dynamique des populations est rarement quantifié. Cette thèse vise à combler ces lacunes par une approche de modélisation de dynamique de population structurée en âge et en stades, où les phases critiques du cycle de vie sur les ZFHI sont explicitement représentées. Dans une première partie, le cas d’étude précis de la sole commune en Manche Est est examiné par une approche statistique hiérarchique bayésienne. Dans une deuxième phase, un modèle de population générique est développé pour représenter des populations de poissons aux histoires de viecontrastées. Le modèle intègre une relation stockrecrutement paramétrée en fonction de la qualité et de la quantité des habitats juvéniles. Cette approche est d’abord utilisée pour mettre en évidence l’impact de scénarios de dégradation/restauration de surface et de qualité des nourriceries sur la dynamique des populations, et la sensibilité des réponses aux variations interspécifiques des paramètres démographiques. Puis, il est appliqué pour évaluer le bénéfice de la restauration des nourriceries estuariennes pour quatre espèces commerciales de Manche Est. Finalement le modèle est étendu pour intégrer l’impact de pressions anthropiques au niveau des frayères. Les hypothèses et limites des approches sont discutées, tout comme les perspectives d’utilisation du cadre générique et son intérêt en appui à la gestion<br>Spawning and juvenile habitats are Critical Essential Fish Habitats (CEFH) that support key phases of the life cycle, when fish aggregate on restricted areas. These CEFH face numerous anthropogenic pressures that impact fish locally. Yet, these impacts are poorly quantified at population scale. This PhD aims to fill this knowledge gap using ageand stage-structured modelling approaches, with explicit representation of the critical life stages on CEFH. A first approach aims to assess the impact of Seine estuary restoration for the common sole in the Eastern English Channel. It uses a hierarchical Bayesian modelling framework integrating a great amount of data and expertise to perform simulations of juvenile habitat restoration. The second one develops a generic mechanistic model to represent marine fish population with contrastedfish population with contrasted life histories. It integrates a comprehensive steepness-based parameterization of the stock-recruitment relationship that directly depends upon juvenile habitat quality and surface area. This model is used to explore population response to juvenile habitat degradation/restoration and its sensitivity to interspecific variability in demographic rates. Then the approach is applied to assess the potential impact of restoring estuarine nursery grounds for four species of main fisheries interest in the Eastern English Channel. Finally, the model is extended to integrate anthropogenic pressures affecting spawning grounds. The main hypothesis and limits of the approaches are discussed; this outlined the large venues of the generic model, for both further scientific investigation and help for management

La biodiversité aquatique du bassin versant de l'Amazone, le plus grand système fluvial au monde et le plus diversifié en espèces, reste encore relativement mal répertoriée malgré toute l'attention que le bassin suscite au niveau de la communauté scientifique internationale. La répartition spatiale des espèces dans le bassin, et notamment celle des poissons d'eau douce, reste encore assez peu documentée, très parcellaire et dispersée entre les pays et institutions, associée à une taxonomie parfois confuse. Il en va de même pour la distribution des habitats aquatiques et des formes fluviales associées à l'échelle de l'ensemble du bassin, la dimension de celui-ci limitant l'acquisition de données de terrain. Améliorer la connaissance sur la répartition de la biodiversité et des habitats aquatiques dans le bassin versant de l'Amazone est pourtant une étape cruciale afin de pouvoir appréhender les facteurs et processus à l'origine de la diversification des espèces, identifier les zones à protéger prioritairement (hotspots de biodiversité) et mieux évaluer la vulnérabilité des espèces face aux changements globaux. Ce travail de thèse découle de l'ensemble de ces constats et vise à réduire les lacunes importantes de connaissances soulevées<br>The aquatic biodiversity of the Amazon basin, the largest and most species rich river basin on Earth, is still relatively poorly documented despite all the attention received from the international scientific community. Knowledge about the spatial distribution of species, and in particular of freshwater fishes, is very fragmented and dispersed between countries and institutions. The distribution of river forms has been also poorly explored at the scale of the entire basin, its continental dimension limiting the acquisition of field data. Improving the knowledge on the distribution of biodiversity and aquatic habitats in the basin is however a crucial step to better understand the factors and processes behind species diversification, identify priority areas for conservation (biodiversity hotspots) and assess the species vulnerability to global changes. This thesis work aims to reduce these significant knowledge gaps

Au cours de cette étude sur l'alimentation artificielle de la perche perca fluviatilis élevée en milieu contrôlé, nous avons précisé l'intérêt de ses potentialités zootechniques et mis en évidence que: les larves acceptent une alimentation composée pendant les 15 premiers jours de leur vie avec un taux de survie maximal de 26%. Pendant les 10 jours qui suivent l'éclosion, une distribution des particules alimentaires d'une taille inferieure à 125 m, améliore les taux de croissance et de survie des larves. Ces aliments semblent mieux détectés dans des bassins à parois internes claires et sous un éclairage de 800 lux. Pour les juvéniles préalablement élevés en étang, l'adaptation à leur nouveau milieu est intimement liée à la nature de l'alimentation. Une phase transitoire à base de foie de buf haché double le taux de survie de ces perches par rapport à un passage direct à l'aliment artificiel. Une ration journalière de 2% du poids vif convient pour une bonne croissance des perches (20-22g) élevées à 18-20c en circuit fermé ; elle engendre cependant une élévation du coefficient de variation pondéral, lui-même lie au dimorphisme sexuel. Des taux de rationnement de 4 et 6% n'améliorent ni la croissance, ni la composition corporelle des perches. En cage flottante, une ration de 3% semble plus appropriée. Quoiqu'il en soit, les gains de poids des perches élevées en circuit fermé ou en cages flottantes ne sont pas significativement différents. Chez les perches élevées en cages, l'induction gonadosomatique est essentiellement attribuée à la variation de température. Le déclenchement de la maturité sexuelle provoque une involution des indices hepatosomatiques et modifie la composition corporelle. Les perches élevées en circuit ferme sont plus riches en triglycérides et plus pauvres en phospholipides et en protéines que celles issues des cages.