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Dissertationen zum Thema „Reaction-diffusion processes“

Autor: Grafiati
Veröffentlicht am 28. Juni 2021
Zuletzt aktualisiert am 29. Juli 2025

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Hellander, Stefan. "Stochastic Simulation of Reaction-Diffusion Processes." Doctoral thesis, Uppsala universitet, Avdelningen för beräkningsvetenskap, 2013. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-198522.

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Numerical simulation methods have become an important tool in the study of chemical reaction networks in living cells. Many systems can, with high accuracy, be modeled by deterministic ordinary differential equations, but other systems require a more detailed level of modeling. Stochastic models at either the mesoscopic level or the microscopic level can be used for cases when molecules are present in low copy numbers. In this thesis we develop efficient and flexible algorithms for simulating systems at the microscopic level. We propose an improvement to the Green's function reaction dynamics
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Claus, Isabelle. "Microscopic chaos, fractals, and reaction-diffusion processes." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2002. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/211441.

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3

Santos, Jaime Eduardo Moutinho. "Non-equilibrium dynamics of reaction-diffusion processes." Thesis, University of Oxford, 1997. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.361994.

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4

Agliari, Elena, Raffaella Burioni, Davide Cassi, and Franco M. Neri. "Autocatalytic reaction-diffusion processes in restricted geometries." Universitätsbibliothek Leipzig, 2016. http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bsz:15-qucosa-192966.

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Agliari, Elena, Raffaella Burioni, Davide Cassi, and Franco M. Neri. "Autocatalytic reaction-diffusion processes in restricted geometries." Diffusion fundamentals 7 (2007) 1, S. 1-8, 2007. https://ul.qucosa.de/id/qucosa%3A14157.

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Abdulbake, Janan. "A renormalisation approach to reaction-diffusion processes on fractals." Thesis, Glasgow Caledonian University, 2003. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.289517.

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7

Chaudhry, Qasim Ali. "Computational Modeling of Reaction and Diffusion Processes in Mammalian Cell." Doctoral thesis, KTH, Numerisk analys, NA, 2012. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-93466.

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PAHs are the reactive toxic chemical compounds which are present as environmental pollutants. These reactive compounds not only diffuse through the membranes of the cell but also partition into the membranes. They react with the DNA of the cell giving rise to toxicity and may cause cancer. To understand the cellular behavior of these foreign compounds, a mathematical model including the reaction-diffusion system and partitioning phenomenon has been developed. In order to reduce the complex structure of the cytoplasm due to the presence of many thin membranes, and to make the model less computa
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Gérard, Thomas. "Theoretical study of spatiotemporal dynamics resulting from reaction-diffusion-convection processes." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2011. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/209861.

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Dans les réacteurs industriels ou dans la nature, l'écoulement de fluides peut être couplé à des réactions chimiques. Dans de nombreux cas, il en résulte l'apparition de structures complexes dont les propriétés dépendent entre autres de la géométrie du système.<p><p>Dans ce contexte, le but de notre thèse a été d'étudier de manière théorique et sur des modèles réaction-diffusion-convection simples les propriétés de dynamiques spatio-temporelles résultant du couplage chimie-hydrodynamique. <p>Nous nous sommes focalisés sur les instabilités hydrodynamiques de digitation visqueuse et de densité q
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Larsson, Stig. "On reaction-diffusion equation and their approximation by finite element methods /." Göteborg : Chalmers tekniska högskola, Dept. of Mathematics, 1985. http://bibpurl.oclc.org/web/32831.

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Wang, Siyang. "Simulation of stochastic reaction-diffusion processes on lower dimensional manifolds with application in molecular biology." Thesis, Uppsala universitet, Institutionen för informationsteknologi, 2012. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-181613.

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In this thesis, we simulate stochastically the reaction-diffusion processes in a living cell. The simulation is done in three dimension (3D) by MATLAB. The one dimensional (1D) polymers are embedded in the 3D space. The reaction and diffusion events occur both in the space and on the polymers. There is also a possibility for the molecule to jump between the 3D space and 1D polymers. Two simulation levels are used: mesoscopic and microscopic. An accurate and efficient algorithm is developed for the mesoscopic simulation. The corresponding microscopic Smoluchowski equation is solved numerically
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Eigel, Martin. "An adaptive meshfree method for reaction-diffusion processes on complex domains applications in cell biology." Thesis, University of Warwick, 2008. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.502535.

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A mesh-free numerical method for solving partial differential equations (PDE) on geometrically complex domains is presented. The approach is based on the general Partition of Unity Method (PUM), a framework developed by Babuska and Melenk in [8, 122]. In order to underline the universality of our method, we summarise the current state-of-the-art of the PUM in a comprehensive, self-contained way. Additionally, as an interesting research direction, fundamental and recent a posteriori error estimation techniques are discussed and transferred to the PUM. These are employed to steer an adaptive ref
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Ayodele, Segun Gideon [Verfasser]. "Lattice Boltzmann Modeling of Advection-Diffusion-Reaction Equations in Non-equilibrium Transport Processes / Segun Gideon Ayodele." Aachen : Shaker, 2013. http://d-nb.info/1050344170/34.

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Hellander, Andreas. "Multiscale Stochastic Simulation of Reaction-Transport Processes : Applications in Molecular Systems Biology." Doctoral thesis, Uppsala universitet, Avdelningen för teknisk databehandling, 2011. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-152098.

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Quantitative descriptions of reaction kinetics formulated at the stochastic mesoscopic level are frequently used to study various aspects of regulation and control in models of cellular control systems. For this type of systems, numerical simulation offers a variety of challenges caused by the high dimensionality of the problem and the multiscale properties often displayed by the biochemical model. In this thesis I have studied several aspects of stochastic simulation of both well-stirred and spatially heterogenous systems. In the well-stirred case, a hybrid method is proposed that reduces the
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Driver, David Philip. "An optimisation-based approach to FKPP-type equations." Thesis, University of Cambridge, 2018. https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/277769.

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In this thesis, we study a class of reaction-diffusion equations of the form $\frac{\partial u}{\partial t} = \mathcal{L}u + \phi u - \tfrac{1}{k} u^{k+1}$ where $\mathcal{L}$ is the stochastic generator of a Markov process, $\phi$ is a function of the space variables and $k\in \mathbb{R}\backslash\{0\}$. An important example, in the case when $k > 0$, is equations of the FKPP-type. We also give an example from the theory of utility maximisation problems when such equations arise and in this case $k < 0$. We introduce a new representation, for the solution of the equation, as the optimal value
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Yangari, Sosa Miguel Ángel. "Fractional reaction-diffusion problems." Tesis, Universidad de Chile, 2014. http://www.repositorio.uchile.cl/handle/2250/115538.

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Doctor en Ciencias de la Ingeniería, Mención Modelación Matemática<br>This thesis deals with two different problems: in the first one, we study the large-time behavior of solutions of one-dimensional fractional Fisher-KPP reaction diffusion equations, when the initial condition is asymptotically front-like and it decays at infinity more slowly than a power x^b, where b < 2\alpha and \alpha\in (0,1) is the order of the fractional Laplacian (Chapter 2); in the second problem, we study the time asymptotic propagation of solutions to the fractional reaction diffusion cooperative systems (Chapter 3
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Bock, Josué. "Contribution à l'élaboration d'un modèle d'évolution physico-chimique de la neige." Thesis, Grenoble, 2012. http://www.theses.fr/2012GRENU037/document.

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Il est aujourd'hui avéré que la composition chimique de l'atmosphère des régions enneigées – et notamment des régions polaires – est sensiblement affectée par les échanges d'espèces chimiques réactives entre l'air et la neige. En effet, le manteau neigeux constitue un véritable réacteur photochimique multiphasique, mais les mécanismes physico-chimiques à l'œuvre en son sein sont encore mal connus. Une compréhension détaillée des processus s'y déroulant est indispensable pour modéliser correctement la composition et la réactivité de l'atmosphère au-dessus des régions enneigées. De plus, la reco
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Moreira, Juliana. "Eletrogeração de peróxido de hidrogênio (H2O2) em eletrodos de difusão gasosa (EDG) modificados com quinonas (metil-p-benzoquinona, antraquinona-2-ácido carboxílico e ácido antraflávico) e azocomposto (Sudan Red 7B)." Universidade de São Paulo, 2018. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75135/tde-14032019-100953/.

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Os processos oxidativos avançados (POA) são uma alternativa para complementar os processos clássicos de tratamento de efluentes que podem não ser eficientes para remoção de alguns tipos de poluentes como, por exemplo, os poluentes emergentes. Os POA se baseiam na geração de espécies altamente reativas (radicais hidroxila), a partir de peróxido de hidrogênio (H2O2), que oxidam os poluentes. O H2O2 pode ser eletrogerado in situ pela reação de redução de oxigênio (RRO) no meio reacional. O uso de eletrodos de difusão gasosa (EDG) altamente porosos proporciona o suprimento de oxigênio na interface
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Shabala, Alexander. "Mathematical modelling of oncolytic virotherapy." Thesis, University of Oxford, 2013. http://ora.ox.ac.uk/objects/uuid:cca2c9bc-cbd4-4651-9b59-8a4dea7245d1.

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This thesis is concerned with mathematical modelling of oncolytic virotherapy: the use of genetically modified viruses to selectively spread, replicate and destroy cancerous cells in solid tumours. Traditional spatially-dependent modelling approaches have previously assumed that virus spread is due to viral diffusion in solid tumours, and also neglect the time delay introduced by the lytic cycle for viral replication within host cells. A deterministic, age-structured reaction-diffusion model is developed for the spatially-dependent interactions of uninfected cells, infected cells and virus par
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Mélykúti, Bence. "Theoretical advances in the modelling and interrogation of biochemical reaction systems : alternative formulations of the chemical Langevin equation and optimal experiment design for model discrimination." Thesis, University of Oxford, 2010. http://ora.ox.ac.uk/objects/uuid:d368c04c-b611-41b2-8866-cde16b283b0d.

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This thesis is concerned with methodologies for the accurate quantitative modelling of molecular biological systems. The first part is devoted to the chemical Langevin equation (CLE), a stochastic differential equation driven by a multidimensional Wiener process. The CLE is an approximation to the standard discrete Markov jump process model of chemical reaction kinetics. It is valid in the regime where molecular populations are abundant enough to assume their concentrations change continuously, but stochastic fluctuations still play a major role. We observe that the CLE is not a single equatio
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DELOUBRIERE, OLIVIER. "Problemes stochastiques associes a l'equation de langevin : persistance et processus de reaction-diffusion." Paris 6, 2001. http://www.theses.fr/2001PA066070.

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Cette these comprend deux parties independantes. Dans la premiere nous etudions la probabilite de persistance de differents processus aleatoires - probabilite qu'ils restent au-dessus d'un seuil fixe pendant un certain intervalle de temps - qui definit un nouvel exposant de la dynamique hors d'equilibre. Une theorie de perturbation au premier ordre a recemment ete elaboree pour calculer les exposants de persistance des processus gaussiens non markoviens. Nous elaborons ici la theorie au second ordre et l'appliquons au calcul de l'exposant de persistance de l'equation de la diffusion. Nous etud
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Velleret, Aurélien. "Mesures quasi-stationnaires et applications à la modélisation de l'évolution biologique." Thesis, Aix-Marseille, 2020. http://www.theses.fr/2020AIXM0226.

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Je décris le comportement en temps long de plusieurs processus qui illustrent les mécanismes de sélection naturelle. Il arrive que ces effets de sélection s’interprètent comme un conditionnement qui biaise la dynamique d’un processus aléatoire "neutre". Ce processus évolue sur un espace potentiellement très général, notamment continu et non borné. On peut ainsi caractériser aussi bien la dynamique du profil complet de la population que celle du profil d’un individu choisi uniformément dans la population. On voit naturellement apparaître dans ces modèles des transitions brutales de ces lois qui
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Galanti, Marta. "Processus de diffusion et réaction dans des milieux complexes et encombrés." Thesis, Orléans, 2016. http://www.theses.fr/2016ORLE2004/document.

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L'objectif général de cette thèse est d'analyser les processus de diffusion et les processus de réaction-diffusion dans plusieurs types de conditions non-idéales, et d'identifier dans quelle mesure ces conditions non idéales influencent la mobilité des particules et les réactions entre les molécules. Dans la première partie de la thèse, nous nous concentrons sur les effets de l'encombrement macromoléculaire sur la mobilité, ainsi élaborant une description des processus de diffusion dans des milieux densément peuplés. Tous les processus sont analysés à partir de la description microscopique du
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Janák, Marcel. "Diagnostika polovodičů a monitorování chemických reakcí metodou SIMS." Master's thesis, Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství, 2021. http://www.nusl.cz/ntk/nusl-443241.

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Hmotnostná spektrometria sekundárnych iónov s analýzou doby letu (TOF-SIMS) patrí vďaka vysokej citlivosti na prvkové zloženie medzi významné metódy analýzy pevných povrchov. Táto práca demonštruje možnosti TOF-SIMS v troch odlišných oblastiach výskumu. Prvá časť práce sa zaoberá lokalizáciou defektov vysokonapäťových polovodičových súčiastok, ktorá je nevyhnutná k ich ďalšiemu skúmaniu metódou TOF-SIMS. Bola navrhnutá experimentálna zostava s riadiacim softvérom umožňujúca automatizované meranie záverného prúdu v rôznych miestach polovodičový súčiastok. Druhá časť práce sa zaoberá kvantifikác
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Bellot, Benoit. "Améliorer les connaissances sur les processus écologiques régissant les dynamiques de populations d'auxiliaires de culture : modélisation couplant paysages et populations pour l'aide à l'échantillonnage biologique dans l'espace et le temps." Thesis, Rennes 1, 2018. http://www.theses.fr/2018REN1B008/document.

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Une alternative prometteuse à la lutte chimique pour la régulation des ravageurs de culture consiste à favoriser les populations de leurs prédateurs en jouant sur la structure du paysage agricole. L'identification de structures spatio-temporelles favorables aux ennemis naturels peut se faire par l'exploration de scénarios paysagers via une modélisation couplée de paysages et de dynamiques de population. Dans cette approche, les dynamiques de populations sont simulées sur des paysages virtuels aux propriétés structurales contrôlées, et l'observation des motifs de populations associés permet l'i
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ORCIL, KERVAJAN LOUISIANE. "Etude de l'influence des cinetiques d'echange sur les processus de transport dans les electrolytes." Paris 6, 1987. http://www.theses.fr/1987PA066561.

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Jiménez, Oviedo Byron. "Processus d’exclusion avec des sauts longs en contact avec des réservoirs." Thesis, Université Côte d'Azur (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018AZUR4000/document.

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Mourragui, Mustapha. "Comportement hydrodynamique des processus de sauts, de naissances et de morts." Rouen, 1993. http://www.theses.fr/1993ROUES002.

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Dans cette thèse, nous étudions la limite hydrodynamique des processus de sauts, de naissances et de morts qui décrivent l'évolution de particules indistingables sur le tore. Dans ces systèmes, les particules sautent indépendamment les unes des autres, elles sont créées et détruites selon des taux non linéaires. En utilisant différentes méthodes : la méthode de l'estimation surexponentielle de C. Kipnis, S. Olla et S. R. S. Varadhan, la méthode de production d'entropie de M. Z. Guo, G. C. Papanicolaou et S. R. S. Varadhan et la méthode d'entropie relative de H. T. Yau, nous démontrons que sous
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PAPASEIT, CYRIL. "Formation de motifs microtubulaires in vitro et dans l'embryon de drosophile par des processus dissipatifs de type réaction-diffusion." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1998. http://www.theses.fr/1998GRE10190.

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Les processus physico-chimiques de reaction-diffusion ont ete proposes par turing comme une explication possible de l'auto-organisation et de la morphogenese biologique. La theorie prevoit que des systemes chimiques ou biochimiques loin de l'equilibre thermodynamique peuvent former des structures complexes a partir d'un etat initialement homogene. Les processus impliques sont non-lineaires, irreversibles, et consomment continuellement de l'energie. Dans certaines conditions, des solutions de microtubules in vitro se comportent ainsi. La prediction principale de cette theorie consiste en ce que
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Kuchi, Venkateswarlu. "Development of an innovative ISOL system for the production of short-lived neutron-deficient ions." Thesis, Normandie, 2018. http://www.theses.fr/2018NORMC233/document.

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Dans le cadre de l'installation GANIL / SPIRAL-1, un système innovant de source d'ions cible (TISS) a été conçu pour produire des nouveaux faisceaux d'ions radioactifs compétitifs et déterminer dans quelle mesure il est possible d'améliorer les performances de production par l’optimisation de l’ensemble cible-source (ECS) d’ions dédié à la production d'un faisceau d'ions radioactifs spécifique.L'isotope d'alcalin de courte durée de 74Rb ( demi-vie = 64.8 ms) a été choisi comme cas d’école.En étudiant et en améliorant les processus impliqués dans le fonctionnement de l’ECS, i.e. production dans
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Rodrigues, Daiana Aparecida. "Modelagem e solução numérica de equações reação-difusão em processos biológicos." Universidade Federal de Juiz de Fora, 2013. https://repositorio.ufjf.br/jspui/handle/ufjf/1153.

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Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-04-11T19:27:27Z No. of bitstreams: 1 daianaaparecidarodrigues.pdf: 8225936 bytes, checksum: 96ec323f343f92c319f4e261145f9c6a (MD5)<br>Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-04-24T03:34:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 daianaaparecidarodrigues.pdf: 8225936 bytes, checksum: 96ec323f343f92c319f4e261145f9c6a (MD5)<br>Made available in DSpace on 2016-04-24T03:34:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 daianaaparecidarodrigues.pdf: 8225936 bytes, checksum: 96ec323f343f92c319f4e261145f9c6a (MD5)
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Wadi, Hicham. "Géométrie globale du transport dans l'espace des phases (Systèmes à deux degrés de liberté) : application à l'étude de la réactivité chimique." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1997. http://www.theses.fr/1997GRE10239.

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Le cadre de cette these est strictement celui des systemes hamiltoniens a deux degres de liberte, invariants par renversement du temps. Notre resultat principal est d'etre parvenus a construire des sections de poincare globalement transverses au flot. A partir de ces sections il devient possible d'analyser d'une maniere globale l'organisation geometrique des trajectoires dans l'espace des phases. Notre construction repose essentiellement sur le concept de pods (periodic orbit dividing surface) ; il s'agit de trajectoires periodiques dont la trace sur l'espace des configurations ne dessine pas
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Orellana, Esbel Tomás Valero. "Um modelo de duas escalas da resposta elétrica de tecido muscular induzida por ativação de mastócitos." Laboratório Nacional de Computação Científica, 2010. http://www.lncc.br/tdmc/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=205.

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O estudo dos mecanismos que desencadeiam as reações alérgicas é um tema de grande interesse científico na atualidade. A anafilaxia, reação alérgica sistêmica severa, tem ocupado um lugar de destaque nas pesquisas. Diferentes experimentos em laboratório, tanto in vivo quanto in vitro, assim como diferentes modelos matemáticos baseados nos resultados experimentais, têm procurado investigar a participação ou não dos mastócitos nesse mecanismo. No entanto, os resultados obtidos não são conclusivos, dividindo a comunidade científica em dois grupos: os que consideram determinante o papel dos mastóci
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Baptestini, Elizabeth Machado. "Um sistema presa-predador com evasão mediada por feromônio de alarme." Universidade Federal de Viçosa, 2006. http://locus.ufv.br/handle/123456789/4276.

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Made available in DSpace on 2015-03-26T13:35:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1414332 bytes, checksum: 6e2f42018f3e3dcdf9e8cbccab567e7a (MD5) Previous issue date: 2006-03-20<br>Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior<br>Pattern, structure and emergent collective properties are ubiquitous in systems with many units (alive or inanimated) coupled through nonlinear interactions. Within this context, the study of cooperative phenomena in population dynamics of ecological interest has attracted the attention of the mathematicians and physicists since Lotka an
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Nguepedja, Nankep Mac jugal. "Modélisation stochastique de systèmes biologiques multi-échelles et inhomogènes en espace." Thesis, Rennes, École normale supérieure, 2018. http://www.theses.fr/2018ENSR0012/document.

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Les besoins grandissants de prévisions robustes pour des systèmes complexes conduisent à introduire des modèles mathématiques considérant un nombre croissant de paramètres. Au temps s'ajoutent l'espace, l'aléa, les échelles de dynamiques, donnant lieu à des modèles stochastiques multi-échelles avec dépendance spatiale (modèles spatiaux). Cependant, l'explosion du temps de simulation de tels modèles complique leur utilisation. Leur analyse difficile a néanmoins permis, pour les modèles à une échelle, de développer des outils puissants: loi des grands nombres (LGN), théorème central limite (TCL)
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El, kettani Perla. "Équations d'évolution stochastiques locales et non locales dans des problèmes de transition de phase." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018SACLS494/document.

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Le but de cette thèse est de développer des méthodes de démonstration d’existence et d’unicité de solutions d’équations d’évolution stochastiques locales ou non locales dans les problèmes de transition de phase. Au chapitre 1, nous étudions un problème à valeur initiale pour une ´équation de réaction-diffusion stochastique non locale avec des conditions aux limites de Neumann homogènes dans un ouvert borné de ℝn de frontière suffisamment régulière. On considère le cas d’un opérateur elliptique non linéaire assez général et on suppose que le bruit est additif et induit par un processus Q-Wiener
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Jutard, Jérôme. "Instabilités interfaciales morphologiques : étude de l'évolution morphologique d'une électrode de cuivre soumise à une réaction électrochimique." Phd thesis, Grenoble INPG, 1993. https://theses.hal.science/tel-00844069.

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L'étude de l'évolution morphologique d'une surface de cuivre plongée dans un électrolyte liquide et soumise à une dissolution anodique a été abordée selon les trois angles suivants. La modélisation du problème et sa résolution analytique simplifiée ont permis d'introduire un outil de caractérisation et prédiction des instabilités morphologiques globales en fonction des constantes cinétiques associées a l'évolution du système. Un modèle numérique a permis de préciser les rôles respectifs de la réaction d'interface, de la diffusion en phase liquide et de certains paramètres comme le rayon de cou
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Dudziuk, Grzegorz. "Optimization of closed-loop controls by thermostats for a class of nonlinear reaction-diffusion processes." Doctoral thesis, 2014.

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W niniejszej rozprawie przeprowadzone s¡ zarówno jako± iowa, jak i numery zna analiza prob- lemu optymaliza ji sterowania ze sprz »eniem zwrotnym zastosowanego do pewnej klasy nielin- iowy h pro esów reak ji-dyfuzji. Sko« zona li zba urz¡dze« steruj¡ y h i pomiarowy h skupia swoje dziaªania wewn¡trz obszaru pro esu. Urz¡dzenia pomiarowe zbieraj¡ dane o ewolu ji pro- esu, nast pnie urz¡dzenia steruj¡ e otrzymuj¡ zebrane dane i uru hamiaj¡ odpowiedni¡ reak j . Celem sterowania jest utrzyma¢ ewolu j pro esu blisko zde niowanego przez u»ytkownika stanu referen yjnego. Powy»ej wspomniany problem op
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"Computational models of signaling processes in cells with applications: Influence of stochastic and spatial effects." Thesis, 2012. http://hdl.handle.net/1911/70209.

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The usual approach to the study of signaling pathways in biological systems is to assume that high numbers of cells and of perfectly mixed molecules within cells are involved. To study the temporal evolution of the system averaged over the cell population, ordinary differential equations are usually used. However, this approach has been shown to be inadequate if few copies of molecules and/or cells are present. In such situation, a stochastic or a hybrid stochastic/deterministic approach needs to be used. Moreover, considering a perfectly mixed system in cases where spatial effects are present
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Chacón-Acosta, Guillermo, Mayra Núnez-López, and José A. Santiago. "Curvature effects on a simplified reaction-diffusion model of biodegradation." 2017. https://ul.qucosa.de/id/qucosa%3A31634.

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The biodegradation process of some types of polymers occurs due to many different factors including their morphology, structure and chemical composition. Although this is a complicated process, most of its important stages like the diffusion of monomers and the hydrolysis reactions have been modeled phenomenologically through reaction-diffusion equations, where the properties of the polymers were encompassed. Using a simplified reaction-diffusion model for the biodegradation of polymers, in this contribution we study the possible effects of the curvature of the system’s geometry in the degrada
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