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Rozprawy doktorskie na temat „Multi-omique”

Autor: Grafiati
Data publikacji: 11 stycznia 2025
Data aktualizacji: 31 lipca 2025

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Mareschal, Sylvain. "Caractérisation multi-omique des Lymphomes B Diffus à Grandes Cellules." Rouen, 2015. http://www.theses.fr/2015ROUES046.

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Les lymphomes B diffus à grandes cellules (LDGCB) sont des proliférations cancéreuses agressives prenant leur origine dans le système lymphatique, et qui représentent 4000 nouveaux cas par an en France. Si des progrès significatifs ont été réalisés ces dernières années concernant leur prise en charge, un peu plus d’un tiers des patients ne répondent pas aux immuno-chimiothérapies actuelles. Les travaux présentés dans ce mémoire visaient à caractériser ces tumeurs par plusieurs techniques à haut débit, afin de mettre en évidence des altérations somatiques susceptibles d’expliquer ou de faire su
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Crespo, Marion. "Analyse multi-omique des acylations de lysines d'histones pendant la gamétogénèse." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019GREAV066.

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Streszczenie:
L’aspect novateur de ce projet réside dans l’étude des acylations au niveau de la lysine K27 de l’histone H3, classiquement étudiée sous forme méthylée ou acétylée. Nous avons réalisé ce travail sur des cellules germinales méiotiques et post-méiotiques de souris. La spermiogénèse, qui implique un programme d’expression spécifique ainsi qu’une régulation fine de la transcription, est un processus particulièrement adapté à la compréhension du rôle des nouvelles modifications d’histones. Ces travaux regroupent l’utilisation de quatre approches omiques différentes, à savoir la protéomique, la méta
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Puig, Lombardi Emilia Maria. "Conséquences de la stabilisation des G-quadruplex (G4) dans le génome humain ; une approche multi-omique." Electronic Thesis or Diss., Paris Sciences et Lettres (ComUE), 2019. https://theses.hal.science/tel-03055043.

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Les G-quadruplex (G4), structures secondaires pouvant être adoptées par les acides nucléiques, jouent des rôles biologiques dans de nombreux processus cellulaires : maintenance des télomères, réplication cellulaire et virale, réarrangements génomiques, réponse au dommages de l’ADN, régulation transcriptionnelle. Dans le génome humain, il existe une forte présence de séquences potentiellement capables de former des G4 et, en fonction des algorithmes de recherche utilisés pour les identifier in silico, le nombre de motifs est variable et peut atteindre plusieurs centaines de milliers. Récemment,
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Ngo, Carine. "Caractérisation de l’hétérogénéité moléculaire des sarcomes épithélioïdes par analyse multi-omique et transcriptomique sur cellule unique." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASL085.

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Les sarcomes épithélioïdes (SE) sont un sous-type très rare de sarcome agressif, affectant tous les groupes d’âge et classiquement divisé en deux entités clinico-pathologiques – les sous-types distal et proximal – suggérant la présence d’une hétérogénéité inter-tumorale. Comme les tumeurs rhabdoïdes affectant les jeunes enfants, les SE sont caractérisés par la perte de SMARCB1, une sous- unité centrale du complexe de remodelage de la chromatine SWI/SNF. En utilisant des données de bulk multi-omique et transcriptomique sur cellule unique, nous avons mis en évidence l’existence de deux sous-type
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Beaumont, Chloé. "Intégration multi-omique pour prédire la croissance et le turnover des protéines des fruits en développement." Electronic Thesis or Diss., Bordeaux, 2024. http://www.theses.fr/2024BORD0443.

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Pour lever les verrous liés à l’amélioration des productions végétales, une meilleure compréhension des mécanismes de développement des fruits est essentielle, avec le métabolisme des protéines au coeur des processus. Les récents travaux sur le turnover des protéines de tomate ont mis en évidence l’importance de la synthèse protéique dans les traits métaboliques et physiologiques.Des résultats récents du laboratoire montrent également que les protéines jouent un rôle clé dans la croissance des fruits, permettant de bien prédire la vitesse relative de croissance (RGR) sur un panel de neuf espèc
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Ali, Baber. "Prédiction et compréhension des interactions génotypes x environnements par des approches d'intégration multi-omique chez le maïs." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASB060.

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Streszczenie:
Les programmes de sélection du maïs s'appuient sur des réseaux d'essais pour évaluer la performance phénotypique (P) des hybrides dans diverses conditions de culture. Dans ces essais, les interactions entre le génotype et l'environnement (IGE) ont un effet substantiel sur la variabilité phénotypique qui peut parfois dépasser l'effet génétique principal (G). Il est donc important de mieux modéliser ces IGE pour garantir l'amélioration génétique du maïs.Les modèles classiques de prédiction génomique, même ceux modélisant les IGE, ne tiennent pas compte de la complexité du génome et de la manière
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Galati, Gianni. "Étude de la synthèse des furocoumarines chez le panais par des approches d'ingénierie métabolique et de multi-omique." Thesis, Université de Lorraine, 2019. http://www.theses.fr/2019LORR0065/document.

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Les plantes sont soumises durant leur vie à de nombreux stress environnementaux. Face à ces contraintes, les végétaux ont développé au cours de l'évolution différentes stratégies. La plus emblématique est la mise en place du métabolisme spécialisé, représenté par une grande diversité chimique et fonctionnelle. Bien que ce métabolisme soit de plus en plus étudié ces dernières années, de nombreuses lacunes persistes à son propos, liées notamment (i) à la complexité des modifications métabolomiques engendrées par la perception de stress, (ii) aux coûts et avantages que ces métabolites imputent à
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Galati, Gianni. "Étude de la synthèse des furocoumarines chez le panais par des approches d'ingénierie métabolique et de multi-omique." Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2019. http://www.theses.fr/2019LORR0065.

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Les plantes sont soumises durant leur vie à de nombreux stress environnementaux. Face à ces contraintes, les végétaux ont développé au cours de l'évolution différentes stratégies. La plus emblématique est la mise en place du métabolisme spécialisé, représenté par une grande diversité chimique et fonctionnelle. Bien que ce métabolisme soit de plus en plus étudié ces dernières années, de nombreuses lacunes persistes à son propos, liées notamment (i) à la complexité des modifications métabolomiques engendrées par la perception de stress, (ii) aux coûts et avantages que ces métabolites imputent à
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Le, Corre Anne-Claire. "Approche multi-échelles (élevage, cellule, -omique) des mécanismes de transmission inter-espèces d’Anaplasma phagocytophilum et de sa circulation chez les bovins." Thesis, Paris Est, 2017. http://www.theses.fr/2017PESC1073.

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Anaplasma phagocytophilum est une alpha-protéobactérie à multiplication intracellulaire stricte transmise par les tiques du genre Ixodes sp. Responsable notamment des anaplasmoses granulocytaires bovine et humaine, elle peut également infecter de nombreux mammifères, tels les ruminants sauvages ou les rongeurs. En Europe, plusieurs cycles, encore mal connus, semblent coexister et impliquer des hôtes (réservoirs et victimes) différents. Cela semble être en particulier le cas pour les souches bovines et humaines, conduisant à supposer que les souches bovines ne seraient pas zoonotiques. Du fait
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Le, boulch Pauline. "Déterminants moléculaires de la résistance au puceron vert (Myzus persicae) chez le pêcher (Prunus persica) : étude multi-omique des réponses à l'infestation." Electronic Thesis or Diss., Avignon, 2022. http://www.theses.fr/2022AVIG0371.

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Parmi les nombreux ravageurs auxquels les plantes sont confrontées, les pucerons sont certainement ceux qui causent le plus de dommages aux cultures en raison de leur multiplication rapide, des dégâts directs qu’ils occasionnent et des virus phytopathogènes qu’ils transmettent. Le puceron vert du pêcher (Myzus persicae, Sulzer) est un ravageur généraliste qui s’attaque à un large panel de plantes incluant le pêcher, son hôte primaire, mais également de nombreux hôtes secondaires de familles botaniques diverses dont différentes espèces cultivées. Des travaux antérieurs ont mis en évidence des a
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Laguillaumie, Marie-Océane. "Exploration multi-omique de la maladie résiduelle minimale dans deux modèles syngéniques murins de dormance tumorale de leucémie myéloïde et de mélanome." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2024. http://www.theses.fr/2024ULILS031.

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Streszczenie:
État de l’art : La dormance tumorale est une stratégie de résistance utilisée par les cellules cancéreuses. Elle constitue un obstacle majeur dans la thérapie du cancer, puisqu’elle mène à la maladie résiduelle minimale (MRD) et augmente le risque de rechute. Bien que cliniquement significatifs, les mécanismes derrière la dormance tumorale et la MRD ne sont pas bien compris. Nous avons utilisé deux modèles murins syngéniques de leucémie myéloïde et de mélanome élaborés par le laboratoire pour explorer les profils génétiques, épigénétiques, transcriptomiques et protéomiques liés à la dormance t
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Benkirane, Hakim. "Deep learning methods for the integration of multi-omics and histopathology data for precision medicine in oncology." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASR022.

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La médecine de précision est une approche émergente pour le traitement et la prévention des maladies qui prend en compte la variabilité individuelle dans les gènes, l'environnement et le mode de vie. L'objectif est de prédire plus précisément quelles stratégies de traitement et de prévention pour une maladie particulière fonctionneront dans quels groupes de personnes. En oncologie, la médecine de précision s'accompagne d'une augmentation drastique des données collectées pour chaque individu, caractérisée par une grande diversité de sources de données. Par exemple, les patients recevant un trai
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Pobel, Cédric. "Characterization of de novo metastatic prostate cancer : an ancillary study of the PEACE-1 phase 3 clinical trial." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASL118.

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Le cancer de la prostate de novo métastatique sensible à la castration représente 5 à 10% des cancers de la prostate au diagnostic mais est responsable de 50% des décès lié aux cancers de la prostate tous stades confondus. Dans cette étude ancillaire de l'essai PEACE-1, notre hypothèse était que les variants agressifs ou neuroendocrine peuvent être détectés dès le diagnostic. Nous avons rapatrié de façon centralisée les prélèvements en paraffine des biopsies au diagnostic des patients inclus dans PEACE1 (NCT01957436) pour réaliser des analyses d'immunohistochimie (IHC), de séquençage de nouvel
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Briscik, Mitja. "Développement d'approches à noyaux pour l'intégration de données biologiques provenant de sources hétérogènes." Electronic Thesis or Diss., Université de Toulouse (2023-....), 2025. http://www.theses.fr/2025TLSES003.

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Les progrès récents des biotechnologies à haut débit facilitent l'accès à de vastes ensembles de données, ce qui représente à la fois des opportunités et des défis pour la biostatistique. Dans ce contexte, les méthodes à noyau, qui offrent une version non linéaire de tout algorithme linéaire uniquement basé sur le produit scalaire, sont particulièrement adaptées à l'analyse et à l'intégration de données de grande dimension. Cette thèse s'inscrit dans le cadre du projet européen E-MUSE, " Complex microbial ecosystems multiscale modelling : mechanistic and data driven approaches integration ". C
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Bernard, Maria. "Étude du rôle fonctionnel du microbiote intestinal dans l'adaptation à un régime sous optimal et dans l'efficience alimentaire de la poule pondeuse en utilisant une approche multi-omique." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASB075.

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La poule est l'espèce animale d'élevage la plus exploitée dans le monde, et les oeufs, en plus d'avoir des qualités nutritives indéniables, représentent, pour l'homme, la ressource d'origine animale la moins coûteuse. Les industries avicoles s'efforcent d'optimiser leur production, notamment en améliorant l'efficience alimentaire, un caractère important pour assurer la rentabilité des élevages tout en réduisant leur impact environnemental. Ce caractère complexe est sous l'influence de la génétique et de l'environnement, mais de plus en plus d'études confirment également le rôle du microbiote i
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Dupuis, Louise. "Causal network analysis of single cell multi-omics data applied to a cellular therapy against multiple sclerosis." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2024. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2024SORUS628.pdf.

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Les travaux de cette thèse se situent à l'intersection de la découverte causale, de l'analyse de données single-cell multi-omiques et de l'immunologie, en particulier de la sclérose en plaques. Son objectif principal est d'adapter et d'étendre les algorithmes de découverte causale tels que MIIC (Multivariate Information-base Inductive Causation) qui reconstruisent les réseaux causaux à partir de données d'observation pour les adapter aux données single-cell multi-omiques, et de les appliquer à l'étude des mécanismes sous-jacents à une thérapie potentielle contre la sclérose en plaques. Cette r
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Raad, Sabine. "Développement de nouveaux tests fonctionnels d'aide à l'interpretation des variants de signification biologique inconnue dans le cadre de prédispositions génétiques au cancer." Thesis, Normandie, 2018. http://www.theses.fr/2018NORMR079.

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L’identification des mutations constitutionnelles à l’origine d’une prédisposition génétique au cancer est essentielle à la prise en charge médicale des patients et de leurs familles. Depuis l’implémentation des technologies de séquençage à haut-débit dans les laboratoires diagnostiques, le principal défi n’est plus la détection des variations génétiques mais leur interprétation et leur classification. La question de l’interprétation de la variation est particulièrement cruciale lorsqu’elle conditionne la stratégie thérapeutique. Ainsi, il est essentiel de disposer de tests simples adaptables
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Caro, Ilana. "Caractérisation de la signature moléculaire de la maladie des petites artères cérébrales occultes par l'étude de biomarqueurs multi-omiques." Electronic Thesis or Diss., Bordeaux, 2024. http://www.theses.fr/2024BORD0453.

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La maladie des petits vaisseaux cérébraux (MPVC) regroupe des processus pathologiques affectant les petits vaisseaux cérébraux (artérioles, capillaires, etc.), détectables en imagerie cérébrale par résonance magnétique (IRM) et dont la prévalence augmente avec l’âge. La MPVC constitue un contributeur vasculaire majeur au déclin cognitif et au risque de démence, et augmente significativement le risque d'accident vasculaire cérébral (AVC). Elle résulte de facteurs génétiques et environnementaux complexes. Bien que plus de 70 loci génétiques aient été associés à la MPVC, les mécanismes moléculair
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Barreda, Léa. "Characterization of the seed specialized metabolome landscape and plasticity in Brassicaceae species." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASB048.

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Les métabolites spécialisés (MS) jouent un rôle crucial dans l'interaction des plantes et des graines avec leur environnement. De plus, les modifications des MS contribuent largement à leur(s) diversité et activités. Malgré leur importance pour la qualité des graines, l'étude des effets de l'environnement sur la production et l'accumulation de ces MS a été négligée. Les graines accumulent à la fois des MS bénéfiques et toxiques, qui jouent divers rôles biologiques et écologiques, et sont importants dans la nutrition animale et humaine et pour d'autres usages industriels. Ainsi, l'étude de la c
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Maurin, Lucas. "A multi-omics approach to identify key genes in the endocrine and exocrine pancreas and their role in T2D." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2024. http://www.theses.fr/2024ULILS068.

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Le diabète de type 2 (DT2) est une maladie multifactorielle caractérisée par une hyperglycémie chronique, et causée par des facteurs génétiques et environnementaux, tels que le vieillissement. Alors que les études d'association pangénomique (GWAS) ont commencé à identifier les causes génétiques du DT2, les études d'association épigénomique (EWAS) ont rencontré un succès limité dans la caractérisation de l'impact de l’environnement en raison de la taille très réduite des échantillons étudiés et du manque d'études fonctionnelles. De plus, l'ampleur de l'interaction entre la variation génétique e
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