Literatura científica selecionada sobre o tema "Classificação de anuros"

Resumo Apresentamos uma revisão das visões controversas acerca da classificação fisionômica da Floresta de Linhares, aqui definida como a floresta sobre tabuleiros costeiros que ocorre entre os rios Doce e Barra Seca, no norte do Espírito Santo. Compilamos informações sobre o clima estacional dessa região e analisamos a inter-relação das variações interanuais e da dinâmica sazonal da precipitação com atributos ecológicos da floresta. Nossas interpretações revelaram que dados mensais médios de precipitação não exprimem a realidade dos períodos biologicamente secos ano a ano e suas consequências sobre a fisionomia da vegetação. Percebemos que a Floresta de Linhares pode se manifestar como semidecídua ou perenifólia, a depender da severidade da seca em um dado período. Então, propomos que a flexibilidade do regime de renovação foliar da Floresta de Linhares deve ser considerada em sua classificação. Sugerimos classificar a floresta duplamente como estacional semidecidual nos períodos anuais ou supra-anuais caracterizados por deficit hídrico pronunciado, e como floresta estacional perenifólia nos períodos anuais ou supra-anuais sem deficit hídrico significativo.

O estudo teve por objetivo identificar as produções científicas sobre a Classificação Internacional da Prática de Enfermagem - CIPE® e sua contribuição nacional, empregando-se a revisão integrativa como pesquisa para a aproximação do objeto de investigação. Identificaram-se 111 produções científicas no período de 1994 a 2008, sendo 45,5%, estudos brasileiros. A média de produção científica mundial anual foi de 7,3, incluindo o Brasil com a média de 3,3 produções anuais. Verificou-se a predominância de estudos descritivos correlacionais quantitativos voltados ao modelo clínico-individual e pesquisas relatando o uso da CIPE® nos Estados do Rio Grande do Sul, Santa Catarina, Paraná e Paraíba, bem como a importante contribuição da Associação Brasileira de Enfermagem com o projeto Classificação Internacional da Prática de Enfermagem na Saúde Coletiva.

<p class="MsoNormal" style="margin-bottom: .0001pt; text-align: justify; text-justify: inter-ideograph; line-height: 150%;"><span style="font-size: 12.0pt; line-height: 150%; font-family: 'Times New Roman','serif';">Objetivou-se com o presente estudo apresentar os elementos meteorológicos, fatores climáticos, balanço hídrico (BH) desenvolvido por Thornthwaite &amp; Mather, da classificação climática pelos métodos de Thornthwaite &amp; Köppen para o município de Lagoa Seca, Paraíba e a classificação para o cultivo de banana. Utilizou-se os dados de precipitações climatológicas médias mensais e anuais adquiridos do banco de dados coletado pela Agência Executiva de Gestão das Águas do Estado da Paraíba (AESA), para o período de 1985 a 2013, os valores mensais e anuais de temperatura do ar foram estimados pelo método das retas de regressões lineares múltiplas utilizando-se do software Estima-T. O vento pode ser um dos fatores limitantes para a exploração comercial da bananicultura, se as cultivares forem de porte alto e plantado em solos arenosos. Em locais com elevada insolação, o período para que o cacho atinja o ponto de corte oscila entre 80 e 90 dias. Sob pouca insolação, este período de corte variar entre 85 e 112 dias após a sua emissão.</span></p>

O objetivo deste presente trabalho foi esclarecer os debates polemizados acerca do suposto acréscimo de temperatura e redução da pluviosidade em função do desmatamento e urbanização do Cerrado situado no Centro Oeste brasileiro. Para nível de comparação, foram utilizadas as normais climatológicas de 1961-1990 e 1981-2010, obtidas no banco de dados do Instituto Nacional de Meteorologia (INMET), vinculado ao Ministério da Agricultura e Abastecimento (MAPA). A localidade escolhida foi o município de Diamantino-MT, sendo que os resultados obtidos não foram significativos a nível de classificação, permanecendo imutáveis, para ambas as classificações (Köppen e Thornthwaite). Para culturas florestais, pertencentes ao Cerradão, exigentes de CAD média igual ou superior a 120, Segundo Köppen a classificação foi equivalente àquela CAD voltada a exploração extensiva agrícola de culturas anuais, ou seja, AW Megatérmico ou Tropical com seca no Inverno, para ambos os períodos. Já para a classificação de Thornthwaite, levando-se em consideração a CAD para espécies florestais de 120, para as normais climatológicas de 1961-1990 e de 1981-2010, o clima encontrado foi distinto daquele aplicado às culturas anuais, agora dado como B1rA'a' (Clima úmido, sem ou com pequena deficiência hídrica, Megatérmico ou com Evapotranspiração de Verão inferior a 48% da Evapotranspiração Potencial Anual).

O objetivo deste trabalho é dar uma contribuição ao estudo das condições climáticas do Estado do Rio de Janeiro, visando a uma melhor Classificação Climática por meio da identificação de regiões homogêneas em precipitação. Para isto foram utilizadas médias mensais da precipitação de 48 estações meteorológicas, em um período de 30 anos (1971-2000). A análise hierárquica de agrupamento, a orografia e a proximidade do mar, mostraram que o Estado do Rio de Janeiro pode ser dividido, quanto à precipitação, em seis regiões pluviometricamente homogêneas o que possibilitou classificar as estações meteorológicas pelo método de classificação não hierárquica k-means. A região norte do Estado, com precipitações anuais em torno de 870 mm é a mais seca, e a região da encosta sul da Serra do Mar, com 2020 mm, é a mais chuvosa. Mas, em ambas as regiões, os valores da precipitação da estação chuvosa representam em torno de 70% dos totais anuais.

O balanço hídrico é uma ferramenta de caraterização temporal da dinâmica de água no solo de determinada região. Objetivou-se estimar o balanço hídrico climático e a classificação do clima do município de Turiaçu-MA. Foram utilizados séries de dados históricos entre os anos de 1961 a 2016, de precipitação pluviométrica e temperatura mensais, sendo excluídos dados omitidos. Para o cálculo do balanço hídrico climatológico, foi adotado o valor de 100 mm para a capacidade de água disponível (CAD). A classificação climática foi obtida por meio dos valores do índice hídrico (Ih), índice de aridez (Ia) e índice de umidade (Iu). A evapotranspiração potencial atingiu valores médios anuais de 1765,3 mm. A deficiência hídrica total anual verificada foi de 535,3mm, distribuído em sua totalidade ao longo do período de estiagem da região (agosto a dezembro). A fórmula climática obtida foi B1sA’a’, isto é, clima úmido, Megatérmico, com deficiência hídrica moderada no verão e 26,6 % da evapotranspiração anual concentrada no trimestre mais quente do ano.

Na presente análise foi utilizado tratamento quantitativo dos dados de precipitação diária em duas séries históricas fornecidas respectivamente pela Agência Nacional de Águas (ANA) 1962 a 2017, e, Instituto Nacional de Meteorologia 1991 a 2017. Os dados coletados foram divididos e analisados por meio de tempos sucessivos representativos mensais, sazonais e anuais; posteriormente, foram elaboradas tabelas e gráficos com os registros pluviométricos do período com o intuito de facilitar a visualização da variabilidade pluviométrica. A primeira etapa constituiu-se na tabulação da série histórica, a seguinte ocupou-se com o tratamento estatístico dos dados de precipitação, utilizando-se os respectivos parâmetros - média, desvio-padrão e coeficiente de variação - admitidos para escalas de análise mensal, sazonal e anual. Também foram caracterizados os anos hidrológicos por meio da metodologia da classificação de “anos padrões” proposta por Monteiro (1976), ou seja, as variações próximas ao ritmo “habitual” classificando-as como habitual (Normal) ou atípico (Seco ou Chuvoso). No estudo ainda ficou evidenciada a existência de duas conjunturas atmosféricas ao longo do ano; uma pautada pela constância do comportamento da precipitação, e, outra pela permanente oscilação. Também ficou explícito que os processos atuantes sobre o verão, primavera e outono são mais regulares que aqueles que atuam sobre o inverno. Com essa compreensão, foi possível identificar o padrão atmosférico na área de estudo e o comportamento da precipitação em Machado/MG.

O artigo examina se eventos de default de companhias abertas no Brasil são previstos por um sistema de classificação de risco de crédito baseado em índices contábeis. O sistema de classificação proposto neste estudo utiliza a análise de conglomerados para classificar as empresas em oito classes de risco, das quais sete são destinadas a empresas solventes e uma para empresas insolventes (em default). A variável utilizada para atribuir as classificações de risco às empresas é a probabilidade de default estimada pelo modelo de risco de crédito desenvolvido por Brito e Assaf Neto (2008). O sistema de classificação de risco atribui ratings anuais para as companhias abertas não financeiras listadas na BM&FBOVESPA no período de 1994 a 2006. Com base nesses ratings, são geradas diversas matrizes de migração de risco para o período analisado. As matrizes de migração evidenciam a elevação do risco das empresas insolventes previamente ao ano de ocorrência do default. A maioria dessas empresas é classificada nas piores classes de risco ou apresenta migrações para ratings inferiores nos anos que precedem o default. Além disso, as taxas de mortalidade das empresas são crescentes nas classes de risco do sistema. Esses resultados evidenciam que insolvências empresariais podem ser previstas por sistemas de classificação de risco baseados, apenas, em índices contábeis.

O número cromossômico diplóide de Schlumbergera truncata e Schlumbergera x buckleyi, de indivíduos com diferentes tipos de coloração de pétalas, foi determinado usando-se pontas de raízes. A utilização de 8-hidroxiquinoleína 0,003 M à 36 °C por 3 horas possibilitou melhor separação cromossômica. Técnica de bandeamento C e de coloração Giemsa permitiram o estudo cariológico dessas espécies. O híbrido Schlumbergera × buckleyi (rósea) apresenta 2n = 22 cromossomos com fórmula cariotípica 16 M + 6 SM. Schlumbergera truncata, apresentando pétalas nas cores vermelha, branca e pink, possui 2n = 22 cromossomos, formulação cariotípica idêntica à de Schlumbergera × buckleyi, enquanto a planta com flores de coloração amarelada mostrou 2n = 34 cromossomos. A classificação cromossômica foi baseada no índice centromérico. Nas plantas que apresentam coloração vermelha, branca, pink e rósea nas pétalas, o melhor período de obtenção de metáfases corresponde ao período de florescimento. Schlumbergera truncata com flores amareladas apresenta dois picos anuais de divisão mitótica. Esses resultados dão suporte à um melhor entendimento da biologia no gênero Schlumbergera e auxiliam na classificação taxonômica nos casos onde apenas as características fenotípicas não são suficientemente confiáveis para a classificação das plantas no mesmo táxon.

OBJETIVO: O artigo descreve as estratégias do Estudo Longitudinal de Saúde do Adulto (ELSA-Brasil) para a manutenção da adesão dos participantes ao longo do tempo e seu seguimento adequado. Isto é fundamental para garantir a validade interna de estudos longitudinais e identificar, investigar e classificar os desfechos incidentes de interesse.MÉTODOS: A metodologia de seguimento da coorte combina contatos telefônicos anuais com re-exames e entrevistas a cada três ou quatro anos. O objetivo é identificar desfechos incidentes de natureza transitória, reversíveis ou não; desfechos finais, de natureza irreversível; bem como complicações relacionadas à evolução das doenças cardiovasculares e diabetes, principais doenças estudadas.RESULTADOS: As entrevistas telefônicas visam monitorar a saúde dos participantes e identificar possíveis eventos ocorridos, como internações hospitalares, exames ou procedimentos especializados definidos previamente. O participante também é incentivado a comunicar a ocorrência de algum evento de saúde ao Centro de Pesquisa. A partir da identificação de um potencial evento, é iniciado um processo de investigação, que inclui acesso a prontuários médicos para verificação de datas e informações detalhadas sobre aquele evento. Os documentos obtidos são analisados sem identificação do paciente, profissional ou serviço de saúde e classificados por um comitê de especialistas médicos. A classificação de desfechos incidentes adotada baseia-se em critérios internacionais consagrados, garantindo comparabilidade e reduzindo o erro de classificação deles. Além dessas estratégias, a ocorrência de desfechos poderá ser investigada por meio do relacionamento de dados com bases secundárias do Ministério da Saúde, como as de mortalidade e internações.CONCLUSÕES: A correta identificação de desfechos permitirá estimar sua incidência na coorte e investigar o efeito das exposições estudadas no ELSA-Brasil em sua linha de base e nas ondas posteriores.

Made available in DSpace on 2015-04-11T14:03:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JUAN_G_Colonna.pdf: 4938138 bytes, checksum: 3d27bcde3035f46e94b9cbed83b4935d (MD5) Previous issue date: 2012-03-06
CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Wildlife monitoring is often used by biologist to acquire information about animals and their habitat. In this context, animal sounds and vocalizations usually provide a specie fingerprint that is used for classifying the target species in a given site. For that matter, Wireless Sensor Networks (WSNs) represent an interesting option for automa- tically classifying animal species based on their vocalizations. In this work, we provide a solution that applies machine learning and signal processing techniques for classifying wildlife based on their vocalization. As a proof-of-concept, we choose anurans as the target animals. The reason is that anurans are already used by biologists as an early indicator of ecological stress, since they provide relevant information about terrestrian and aquatic ecosystems. Any solution must consider WSN limitations, trying to reduce the communication load to extend the network lifetime. Therefore, our solution repre- sents the acoustic signals by a set of features. This representation allows us to identifiy specific signal patterns for each specie, reducing the amount of information necessary to classify it. Identifying such features, and/or combinations among them, is a key point to improve the solution benefit-cost ratio. As a consequence, we implemented and compared sets of existing features based on Fourier and Wavelet transforms. In our analysis, we first compare the sets of spectral and temporal characteristic, by using the entropy as a criterion for generating the combinations. Second, we reduce the set of features by using genetic algorithm. The proposed framework contains three steps: (i) the pre-processing to prepare the signals and perform the extraction of syllables, (ii) the extraction of features, and (iii) the species classification, using k-NN or SVM. Our experiments comprise four case studies, evaluating the effect of sampling frequency of the hardware and the number of bits used to represent each sample. This enable us to conclude that, in enviromental monitoring using WSNs, the set of Mel coefficients is the most appropriate for classifying anuran calls.
O monitoramento de animais selvagens é frequentemente usado por biólogos para cole- tar informações a cerca dos animais e seus habitats. Neste contexto, os sons produzidos pelos animais oferecem uma impressão biométrica que pode ser usada para classificar os animais em uma dada região. Assim, Redes de Sensores Sem Fio (RSSFs) representam uma importante alternativa para a classificação automática de animais, baseando-se nos sons por eles produzidos. Neste trabalho, apresentamos uma solução, que usa aprendizagem de máquina e processamento de sinais, para classificar animais selva- gens com base em suas vocalizações. Como prova-de-conceito, aplicamos a solução para classificar anuros. O motivo é que anuros já são utilizados por biólogos como indicador precoce de estresse ecológico, oferecendo informação a cerca de ecossistemas terrestre e aquático. Além disso, a solução deve considerar as limitações de RSSFs, buscando reduzir a carga de comunicação para prolongar o tempo de vida da rede. Portanto, representamos os sinais acústicos por conjuntos de características. Esta re- presentação nos permite identificar padrões específicos que descrevem cada uma das espécies monitoradas, reduzindo, assim, o volume de informação a ser trafegado na rede. A identificação destas características, ou combinações delas, é um ponto chave para aprimorar a relação custo-benefício da solução. Em nossa análise, primeiramente comparamos os conjuntos de características temporais e espectrais, usando a entropia como critério para geração das combinações. A seguir, reduzimos o conjunto de ca- racterísticas, usando algoritmos genéticos. O framework proposto contém três passos: (i) pré-processamento, para preparar os sinais e extrair unidades chamadas sílabas; (ii) extração de características; e (iii) classificação, usando k-NN ou SVM. Os experimentos consistem de quatro estudos de casos, avaliando o efeito da quantização e o número de bits usados para representar o sinal quantizado. Isto nos permite concluir que, para os cenários avaliados, o conjunto de coeficientes Mel é o mais adequado para classificar vocalizações de anuros.

Made available in DSpace on 2015-04-11T14:02:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Afonso.pdf: 820074 bytes, checksum: 796ca447ff3c69734519173f92044438 (MD5) Previous issue date: 2013-03-27
Wireless Sensor Networks (WSNs) can be used in environmental conservation applications and studies due to its wireless communication, sensing, and monitoring capabilities. In the Ecology context, amphibians are used as bioindicators of ecosystemic changes of a region and can early indicate environmental problems. Thus, biologists monitor the anuran (frogs and toads) population in order to establish environmental conservational strategies. Anuran were chosen because the sounds they emit allow classification by using microphones and signal processing. In this work we propose and evaluate some distributed algorithms for anuran classification based on their calls (vocalizations) in the habit using WSNs. This method is interesting because it is not intrusive and it allows remote monitoring. Our solution builds cluster of nodes whose acoustic collected measurements are correlated. The nodes of the same group are combined to generate local classification decisions. Then, these decisions are combined to generate a global decision. We use k-means algorithm for clustering nodes with correlated measurements, which groups instances by similarity. Experiments show that, in comparison with other literature algorithms, the error rate of our solution were 26 pp (percentage points) lower.
As Redes de Sensores Sem Fios (RSSFs) podem ser utilizadas em aplicações de conservação e estudo ambiental devido à sua capacidade de sensoriamento, monitoramento e comunicação sem fio. Dentro do contexto da Ecologia, os anfíbios são utilizados como bioindicadores de mudanças no ecossistema de uma região e podem precocemente indicar problemas ambientais. Desta forma, os biólogos monitoram a população de anuros (sapos e rãs) a fim de estabelecer estratégias de conservação do meio ambiente. Os anuros são escolhidos por causa sons que emitem (coaxar), que permitem a identificação dessas espécies por meio de microfones e processamento do sinal. Portanto, neste trabalho propomos e avaliamos alguns algoritmos distribuídos para classificação de anuros baseados em suas vocalizações em seu habitat usando RSSF. Este método é interessante pois não é intrusivo e permite o monitoramento remoto. Nossa solução cria grupos de nós sensores cujas medidas acústicas coletadas estão correlacionadas. Os dados dos nós de um mesmo grupo são combinados para gerar decisões de classificação locais. Essas decisões são então combinadas para formar uma decisão global. Para agrupar os nós com medidas correlacionadas, utilizamos o algoritmo k-means, que agrupa instâncias similares. Os experimentos mostram que, em comparação com outros algoritmos da literatura, a taxa de erro da nossa solução chegou ser até 26 pp (pontos percentuais) menor.

Submitted by Márcia Silva (marcialbuquerq@yahoo.com.br) on 2017-11-16T18:57:52Z No. of bitstreams: 1 Tese_completa_JuanGColonna.pdf: 14919946 bytes, checksum: e525d20972ecf19b31a0f8f85772dbe0 (MD5)
Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-11-16T20:14:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese_completa_JuanGColonna.pdf: 14919946 bytes, checksum: e525d20972ecf19b31a0f8f85772dbe0 (MD5)
Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-11-16T20:17:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese_completa_JuanGColonna.pdf: 14919946 bytes, checksum: e525d20972ecf19b31a0f8f85772dbe0 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-11-16T20:17:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_completa_JuanGColonna.pdf: 14919946 bytes, checksum: e525d20972ecf19b31a0f8f85772dbe0 (MD5) Previous issue date: 2017-09-15
CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Wildlife monitoring is often used by biologists and ecologists to acquire information about animals and their natural habitats. In survey programs, specialists collect environmental information to infer about animal population status and their variations over time. The main goal of such programs is to identify environmental problems in early stages. However, acquiring the necessary data for this purpose is a manual work and must be carried out by groups of experts in areas of di cult access during long periods of time. In this context, Wireless Sensor Networks (WSNs) are useful alternatives to alleviate the manual work. Such networks are made up of small sensors with transmission, storage, and local processing capabilities. These networks enable bioacoustic methods for automatic species recognition to be embedded in the sensor nodes in order to automate and simplify the monitoring task. Since animal sounds usually provide a species ngerprint, it can be used to recognize the presence or absence of a target species in a site. Accordingly, in this thesis, we present an approach that combines machine learning methods, WSNs and bioacoustic signal processing techniques for wildlife monitoring based on animal calls. As a proof-of-concept, we choose anurans as the target animals. The reason is that anurans are already used by biologists as an early indicator of ecological stress, since they provide relevant information about terrestrian and aquatic ecosystems. Our solution integrates four fundamental steps: noise ltering and bioacoustic signal enhancement, automatic signal segmentation, acoustic features extraction, and classi cation. We also consider the WSNs limitations, trying to reduce the communication and processing load to extend the sensors' lifetime. To accomplish with the restriction imposed by the hardware, we represent the acoustic signals by a set of low-level acoustic descriptors (LLDs or features). This representation allows us to identify speci c signal patterns of each species, reducing the amount of information necessary to classify it. The adverse environmental conditions of the rainforest pose additional challenges, such as noise ltering. We developed a ltering method based on Singular Spectrum Analysis (SSA). This choice was based on several comparisons with other ltering methods. The SSA method has additional advantages: it is non-parametric, it adapts to the di erent input signals, and it has an equivalent
O monitoramento de animais silvestres em seu habitat natural é objeto de estudo de biólogos e ecólogos que coletam informações ambientais para inferir o estado das popula ções animais e suas variações ao longo do tempo. Um objetivo especí co desses estudos é identi car problemas ecológicos em estágios iniciais. No entanto, a coleta das informações é um trabalho manual que deve ser realizado por um grupo de especialistas em áreas de difícil acesso durante períodos de tempo prolongados. Neste contexto, as Redes de Sensores Sem Fio (RSSF) são uma alternativa viável ao monitoramento manual. Estas redes são constituídas por pequenos sensores com capacidade de transmissão, armazenamento e processamento local. Isto possibilita que métodos bioacústicos para reconhecimento automático de espécies sejam embarcados nos nós sensores para automatizar e simpli car a tarefa de monitoramento. Como os sons produzidos pelos animais oferecem uma impressão digital bioacústica, esta pode ser usada para identi car a presença ou ausência de uma espécie particular em uma região. Neste trabalho, apresentamos uma abordagem que utiliza aprendizagem de máquina, RSSF e processamento digital de sinais bioacústicos para reconhecer espécies animais com base em suas vocalizações. Como prova-de-conceito, aplicamos nossa solução para identi- car de forma automática diferentes espécies de anuros. Escolhemos anuros uma vez que são utilizados como indicadores precoces de estresse ecológico, pelo fato de serem sensíveis às mudanças do habitat e oferecerem informações sobre os ecossistemas terrestre e aquático. Nossa abordagem integra quatro operações fundamentais: filtragem de ruídos e aprimoramento dos sinais acústicos, segmentação automática desses sinais, extração de descritores acústicos e classificação. Além disso, nossa solução considera as limitações de RSSF, buscando reduzir a carga de processamento e comunicação para prolongar o tempo de vida dos sensores. Portanto, representamos os sinais por um conjunto de descritores acústicos de baixo nível (Low-Level Acoustic Descriptors - LLDs) conhecidos como Mel Frequency Cepstral Coe cients (MFCCs). A técnica escolhida para filtrar os ruídos ambientais foi o Singular Spectrum Analysis (SSA), esta escolha foi baseada nas diversas comparações que zemos com outros métodos de filtragem. Além disso, o SSA é não paramétrico, se adapta ao coaxar de cada espécie e possui um esquema equivalente na teoria de ltros FIR, o que possibilita ter uma implementação com complexidade computacional constante. Ainda no método de ltragem, desenvolvemos uma versão robusta do SSA. Esta nova versão é mais tolerante aos diferentes ruídos ambientais, sejam estes Gaussianos ou não. A robustez também permitiu identi car os componentes acústicos causados pelos ruídos ambientais associados com as baixas frequências. No que diz respeito à segmentação, primeiro realizamos uma comparação entre diferentes LLDs baseados na teoria da informação. Nesta etapa, desenvolvemos um método não supervisionado capaz de se adaptar às diferentes condições de ruídos ambientais, sejam estes branco ou coloridos. Na segunda etapa, adaptamos dois dos LLDs comparados para funcionamento incremental. Assim, foi possível de nir uma metodologia para segmentar os sinais acústicos em tempo real com custo de memória constante, ideal para ser embarcado em um nó sensor de baixo custo e obter as porções dos áudios que possuem as informações relevantes para o reconhecimento das espécies. Finalmente, avaliamos diferentes estratégias de classi cação e propusemos uma nova forma de validação cruzada para avaliar a capacidade de generaliza ção do método. Portanto, a validação cruzada tradicional de sílaba-por-sílaba foi substituída por uma validação cruzada que separa diferentes indivíduos nos conjuntos de teste e treinamento. Isto viabilizou uma avaliação mais justa e permitiu estimar o comportamento nal que o método de classi cação embarcado no nó sensor teria em uma situação real. Dentre os métodos de classi cação planos comparados descobrimos que SVM e kNN são os mais promissores. Todavia, propomos e desenvolvemos uma estratégia de classi cação hierárquica multirótulo para decompor e simpli car o espaço de decisões do classi cador e simultaneamente reconhecer a família, o gênero e a espécie de cada amostra. Isto nos permite concluir que nossa abordagem é exível o su ciente para se adaptar aos diferentes cenários monitorados, sem deixar de otimizar a relação custo-benefício da solução de monitoramento proposta.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-06Bitstream added on 2014-06-13T19:25:17Z : No. of bitstreams: 1 berneck_bm_dr_rcla_parcial.pdf: 206641 bytes, checksum: 22c62228324e8fe9decc6bf29dfd355e (MD5) Bitstreams deleted on 2015-07-02T12:35:57Z: berneck_bm_dr_rcla_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-07-02T12:37:25Z : No. of bitstreams: 1 000726221_20300206.pdf: 188726 bytes, checksum: eedea7388fc1cbd09142a4a27ca8114c (MD5)
O gênero Aplastodiscus é composto por 15 espécies, principalmente florestais, que se distribuem na Mata Atlântica desde o estado de Alagoas ao Rio Grande do Sul, incluindo Goiás (DF), NE da Argentina e leste do Paraguai. Doze destas quinze espécies foram descritas há mais de 20 anos, as outras três foram descritas no início do século XXI. Nos últimos vinte anos muito material novo foi coletado e houve um incremento quantitativo e qualitativo nas coleções de Anfíbios do Brasil. Este novo material, agora disponível, permitiu observar a variação intra-específica de determinadas espécies e cunhar o projeto que culminou na presente tese de doutorado. Além disso, o conhecimento das relações filogenéticas de Aplastodiscus até o momento é parcial, pois não existem análises que integrem simultaneamente evidências moleculares e fenotípicas para todas as espécies. Foi realizada uma análise molecular para todo o material de tecido biológico obtido, onde investigamos principalmente os limites interespecíficos em Aplastodiscus e sua distribuição geográfica além de uma análise filogenética com base em dados moleculares e fenotípicos das espécies atualmente reconhecidas e das espécies propostas como novas pelo presente estudo. Para tanto, a partir de dados moleculares e fenotípicos fizemos uma busca heurística no programa TNT (Tree analysis using New Techology) atingindo 15 vezes a longitude mínima. Dentre todas espécies atualmente reconhecidas apenas Aplastodiscus musicus não pode ser incluída. O critério para determinação de novas espécies foi a monofilia e a presença de evidências fenotípicas que sustentassem a hipótese de uma nova espécie. As árvores mais parcimoniosas permitiram recuperar sete espécies ainda não descritas, além de sugerir a sinonímia entre A. callipygius e A. albosignatus...
Aplastodiscus includes 15 species from Atlantic Forest from State of Alagoas to Rio Grande do Sul, in Goiás (DF), NE of Argentina and East of Paraguai. Twelve of these species were described in the 80’s, only three of them were described recently. Over the past twenty years, lots of fresh material were incorporated in zoological collections allowing a better understanding of the morphological variation of Aplastodiscus species. Furthermore, the knowledge of the phylogenetic relationships is partial, there is no available data that integrate molecular and phenotypic evidence for all species. In this thesis will be presented an analysis for all tissue material where we investigate the species limits in Aplastodiscus and the geographical distribuition of these species, and a phylogenetic analysis on basis in molecular and phenotypic data... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Julián Faivovich
Coorientador: Célio Fernando Baptista Haddad
Banca: Mariana Lucio Lyra
Banca: Paulo Christiano de Anchietta Garcia
Banca: Helio Ricardo da Silva
Banca: Luciana Barreto Nascimento
Resumo: O gênero Aplastodiscus é composto por 15 espécies, principalmente florestais, que se distribuem na Mata Atlântica desde o estado de Alagoas ao Rio Grande do Sul, incluindo Goiás (DF), NE da Argentina e leste do Paraguai. Doze destas quinze espécies foram descritas há mais de 20 anos, as outras três foram descritas no início do século XXI. Nos últimos vinte anos muito material novo foi coletado e houve um incremento quantitativo e qualitativo nas coleções de Anfíbios do Brasil. Este novo material, agora disponível, permitiu observar a variação intra-específica de determinadas espécies e cunhar o projeto que culminou na presente tese de doutorado. Além disso, o conhecimento das relações filogenéticas de Aplastodiscus até o momento é parcial, pois não existem análises que integrem simultaneamente evidências moleculares e fenotípicas para todas as espécies. Foi realizada uma análise molecular para todo o material de tecido biológico obtido, onde investigamos principalmente os limites interespecíficos em Aplastodiscus e sua distribuição geográfica além de uma análise filogenética com base em dados moleculares e fenotípicos das espécies atualmente reconhecidas e das espécies propostas como novas pelo presente estudo. Para tanto, a partir de dados moleculares e fenotípicos fizemos uma busca heurística no programa TNT (Tree analysis using New Techology) atingindo 15 vezes a longitude mínima. Dentre todas espécies atualmente reconhecidas apenas Aplastodiscus musicus não pode ser incluída. O critério para determinação de novas espécies foi a monofilia e a presença de evidências fenotípicas que sustentassem a hipótese de uma nova espécie. As árvores mais parcimoniosas permitiram recuperar sete espécies ainda não descritas, além de sugerir a sinonímia entre A. callipygius e A. albosignatus... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)
Abstract: Aplastodiscus includes 15 species from Atlantic Forest from State of Alagoas to Rio Grande do Sul, in Goiás (DF), NE of Argentina and East of Paraguai. Twelve of these species were described in the 80's, only three of them were described recently. Over the past twenty years, lots of fresh material were incorporated in zoological collections allowing a better understanding of the morphological variation of Aplastodiscus species. Furthermore, the knowledge of the phylogenetic relationships is partial, there is no available data that integrate molecular and phenotypic evidence for all species. In this thesis will be presented an analysis for all tissue material where we investigate the species limits in Aplastodiscus and the geographical distribuition of these species, and a phylogenetic analysis on basis in molecular and phenotypic data... (Complete abstract click electronic access below)
Doutor

Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad
Banca: Maria Laura Ponssa
Banca: Hélio Ricardo da Silva
Banca: Boris Leonardo Blotto Acuna
Banca: Paulo Christiano de Anchietta Garcia
Resumo: O gênero Adenomera é composto por 16 espécies, das quais seis possuem distribuição restrita à Mata Atlântica. O grupo apresenta uma taxonomia complicada por apresentar espécies crípticas, com alto grau de polimorfismo intraespecífico e interespecífico. Recentemente, uma análise filogenética extensa, abrangendo grande parte da distribuição das espécies do gênero, 35 espécies candidatas foram propostas; 16 na Mata Atlântica. No presente trabalho, propomos testar se as espécies candidatas distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético. Usando uma abordagem interativa com dados diretos de morfologia externa e bioacústica, pudemos delimitar espécies dentro dos clados Thomei e Marmorata. A maior amostragem dados fenotípicos e de um fragmento do gene 16S de indivíduos da Mata Atlântica na análise, permitiu inferir com maior confiança que as espécies distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético (clados Thomei + Marmorata), irmão do clado Hylaedactyla + Martinezi. O material adicional nos permitiu delimitar e redescrever duas espécies previamente consideradas como um complexo de espécies (Adenomera marmorata e A. bokermanni). Das 16 espécies candidatas do clado Mata Atlântica previamente sugeridas, pudemos delimitar apenas 10 espécies sendo sete já conhecidas e três novas para a Ciência.
Abstract: The genus Adenomera has 16 species, six of which are Atlantic Forest dwellers. The genus has a difficult taxonomy, mostly due to the high levels of intra and interspecific polymorphism. Recently, a phylogenetic analysis using samples collected through the whole geographic distribution of the genus (roughly tropical and temperate cis-Andean South America) suggested the existence of 35 candidate species; 16 of which being Atlantic Forest dwellers.The present contribution intends to test whatever the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit. An integrative approach with directly observed data on morphology and bioacoustics allowed species delimitation within the Thomei and Marmorata Clades. Based on a denser sampling of phenotipic and 16S rRNA fragments, we recovered the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit, with two major clades (Thomei + Marmorata) and sister to the Hylaedactyla + Martinezi clade. The additional material allowed the delimitation and redescritpion of two species previously understood as species complexes (Adenomera marmorata and A. bokermanni). Of the 16 Atlantic Forest dwellers candidate species, we could delimit only 10; seven of those assignable to previously described species
Doutor

Orientador: Julián Faivovich
Coorientador: Banca: Célio Fernando Baptista Haddad
Banca: Hélio Ricardo da Silva
Banca: Luciana Bolsoni Lourenço
Banca: Délio Baêta
Banca: Marco Rada
Resumo: A tribo Cophomantini inclui espécies de pererecas que dentre outras características, possuem um pré-polex ósseo e avantajado. Atualmente inclui cinco gêneros. Seu maior gênero em riqueza de espécies, e também um dos mais diversos da família Hylidae, o gênero Boana contem atualmente 92 táxons formalmente descritos. No entanto, até o presente aproximadamente 60% de sua diversidade taxonômica foi analisada em filogenias mais inclusivas. O gênero Boana é dividido em sete grupos de espécies. Muitas de suas espécies são associadas a estes grupos através de caracteres fenotípicos. Alguns destes grupos, todavia encontram-se pouco suportados molecularmente, e apesar de várias espécies agruparem-se por fenótipos, os agrupamentos filogenéticos carecem de sinapomorfias fenotípicas. Na presente tese, foram amostradas seqüências de 83 espécies de Boana, bem como de espécimes pertencentes ao gênero, porém de taxonomia indefinida, totalizando 256 terminais para o gênero. Inserimos seqüências de DNA representando fragmentos de até dez genes por terminal do nosso banco de dados. Recuperamos Boana liliae inserida em Myersiohyla, outro gênero de Cophomantini. A análise filogenética das 83 espécies de Boana resultou em uma melhoria para o suporte de muitos dos seus relacionamentos internos, mas curiosamente, apesar da densa amostragem taxonômica, muitos agrupamentos permanecem pouco suportados. Finalmente, fizemos um estudo comparativo do pré-polex na tribo Cophomantini. Investigamos o elemento e... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)
Abstract: The tribe Cophomantini includes treefrog species which, among other traits, have an osseous and enlarged prepollex. Currently it includes five genera. The genus Boana is the most diverse of the tribe, and also one of the richest genera of Hylidae, including 92 formally described taxa. However, approximately 60% of its taxonomic diversity was analyzed in more inclusive phylogenies. The genus Boana is divided into seven groups of species. Many of its species are assigned to their respective groups through phenotypical characters. Some of those groups are still poorly supported molecularly. Even being many species assigned to their respective groups through phenotypes, many groupings remain without phenotypical synapomorphies. On the present thesis, we sampled sequences of 83 species of Boana, as well specimens of undetermined taxonomy, totalizing 256 terminals for the genus. Each terminal have sequences of up to ten gene fragments. We recovered Boana liliae nested within the genus Myersiohyla, also from the tribe Cophomantini. The phylogenetic analysis of the 83 species of Boana resulted in better supports for many of its internal relationships. Curiously, besides the dense taxonomic sampling, many groupings remain poorly supported. Finally, we made a comparative study of the prepollex within the tribe Cophomantini. We surveyed this element and osteological and myological structures associated, established homology hypothesis, and optimize the resulted characters on the most parsimonious tree previously recovered. The prepollex of species of this tribe have a considerable evolutionary plasticity, and its two basic morphologies evolved many times on the tribe Cophomantini
Doutor

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:29:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-30. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:33:56Z : No. of bitstreams: 1 000856906_20200330.pdf: 252372 bytes, checksum: 02c2741a36d6004e8b4bc263260ac6f2 (MD5)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
O gênero Adenomera é composto por 16 espécies, das quais seis possuem distribuição restrita à Mata Atlântica. O grupo apresenta uma taxonomia complicada por apresentar espécies crípticas, com alto grau de polimorfismo intraespecífico e interespecífico. Recentemente, uma análise filogenética extensa, abrangendo grande parte da distribuição das espécies do gênero, 35 espécies candidatas foram propostas; 16 na Mata Atlântica. No presente trabalho, propomos testar se as espécies candidatas distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético. Usando uma abordagem interativa com dados diretos de morfologia externa e bioacústica, pudemos delimitar espécies dentro dos clados Thomei e Marmorata. A maior amostragem dados fenotípicos e de um fragmento do gene 16S de indivíduos da Mata Atlântica na análise, permitiu inferir com maior confiança que as espécies distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético (clados Thomei + Marmorata), irmão do clado Hylaedactyla + Martinezi. O material adicional nos permitiu delimitar e redescrever duas espécies previamente consideradas como um complexo de espécies (Adenomera marmorata e A. bokermanni). Das 16 espécies candidatas do clado Mata Atlântica previamente sugeridas, pudemos delimitar apenas 10 espécies sendo sete já conhecidas e três novas para a Ciência.
The genus Adenomera has 16 species, six of which are Atlantic Forest dwellers. The genus has a difficult taxonomy, mostly due to the high levels of intra and interspecific polymorphism. Recently, a phylogenetic analysis using samples collected through the whole geographic distribution of the genus (roughly tropical and temperate cis-Andean South America) suggested the existence of 35 candidate species; 16 of which being Atlantic Forest dwellers.The present contribution intends to test whatever the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit. An integrative approach with directly observed data on morphology and bioacoustics allowed species delimitation within the Thomei and Marmorata Clades. Based on a denser sampling of phenotipic and 16S rRNA fragments, we recovered the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit, with two major clades (Thomei + Marmorata) and sister to the Hylaedactyla + Martinezi clade. The additional material allowed the delimitation and redescritpion of two species previously understood as species complexes (Adenomera marmorata and A. bokermanni). Of the 16 Atlantic Forest dwellers candidate species, we could delimit only 10; seven of those assignable to previously described species
FAPESP: 10/515606-8

Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad
Coorientador: Thais Helena Condez
Banca: Paulo Christiano de Anchieta Garcia
Banca: Taran Grant
Resumo: Os sapos miniaturizados do gênero Brachycephalus, popularmente chamados de sapos-pulga e sapinhos-pingo-de-ouro, são endêmicos da Mata Atlântica do Brasil, ocorrendo nas regiões nordeste, sudeste e sul. A alta diversidade deste grupo, conforme verificado nos últimos anos, vem demonstrando uma interessante história evolutiva ainda não bem compreendida. As informações atuais nos direcionam, sobretudo, a dois cenários com relação a sua distribuição e taxonomia: o primeiro, representado pelos sapos-pulga que possuem ampla distribuição geográfica e altitudinal, representados por quatro espécies; e o segundo, representado pelos sapinhos-pingo-de-ouro que são restritos às encostas e aos topos de montanhas, majoritariamente microendêmicos, contendo a maior riqueza do gênero com 27 espécies. Recentemente, foi descoberto um significativo número de espécies de Brachycephalus para a região sul do Brasil, aumentando a atenção para esse gênero. Através de expedições a campo no nordeste de Santa Catarina, como resultado do Plano de Ação Nacional para a Conservação da Herpetofauna Ameaçada de Extinção da Região Sul do Brasil, uma iniciativa do Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade - Ministério do Meio Ambiente, foram obtidos registros para Brachycephalus em locais não amostrados anteriormente. Dessa forma, esse estudo amostrou nove localidades no nordeste de Santa Catarina, especialmente, em duas regiões de serra localizadas entre os municípios de Garuva, Itapoá e São ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)
Abstract: The miniaturized toadlets of the genus Brachycephalus, popularly known as flea-toads and pumpkin toadlets, are endemic species of the Atlantic Forest, occurring in northeast, southeast, and south of Brazil. The high diversity of this group of species, as verified in recent years, highlights one attractive evolutionary history that is not completely understood. The current information suggests two distinct scenarios related to this species distribution and taxonomy: first, represented by the flea-toads, which have wide geographical and altitudinal distribution and comprises four species; and second, represented by the pumpkin toadlets, which are mostly microendemic (with geographic distribution restricted to the slopes and mountain tops) and comprises the greatest species richness of the genus, with 27 species. Recently, a significant number of Brachycephalus species were discovered from southern Brazil, increasing the general interest in this genus. During field expeditions to the northeastern of Santa Catarina state, organized by the Plano de Ação Nacional para a Conservação da Herpetofauna Ameaçada de Extinção da Região Sul do Brasil, one initiative of the Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade - Ministério do Meio Ambiente, records of Brachycephalus were obtained for new localities, never explored before. Thus, in this study we surveyed nine localities from northeastern Santa Catarina state, in two mountainous regions near the Babitonga Bay at the municipalities of Garuva, Itapoá and São Francisco do Sul: the Serra do Saí and the Serra da Palha. As a result from the expeditions we discovered a new species of pumpkin toadlet, which represents the first record for this group of species in lowland areas. In addition, we found morphological variability and molecular similarities within populations, suggesting that this ... (Complete abstract click electronic access below)
Mestre

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:23:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-20. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:29:53Z : No. of bitstreams: 1 000849656.pdf: 1157483 bytes, checksum: 29cdbaf0597abec1e03cbfbba3d987ea (MD5)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
Os parasitas representam importante papel na manutenção da diversidade local de hospedeiros e das funções ecossistêmicas, porém são os primeiros organismos a desaparecer por causa das ações antrópicas sobre o ambiente natural. Variações sazonais relacionadas ao ambiente são fatores importantes e que influenciam direta ou indiretamente na relação parasita-hospedeiro e na estrutura da comunidade de helmintos. O objetivo deste estudo é descrever e comparar a composição e estrutura da comunidade de helmintos associados ao anfíbio anuro Dendropsophus nanus, da RPPN Foz do Rio Aguapeí, município de Castilho, estado de São Paulo, nos hidroperíodos de seca e cheia. Foram coletados 298 anuros em quatro campanhas, duas na estação seca e duas na estação cheia, totalizando 40 dias de coleta. Parâmetros parasitários como prevalência, intensidade média de infecção, abundância média e agregação dos parasitas nas populações de hospedeiros, assim como a estrutura da comunidade de helmintos foram avaliados. Foi encontrado uma riqueza de onze taxa, sendo a metacercária de Lophosicyadiplostomum sp. o taxa mais abundante, seguido por Cylindrotaenia cf. americana. A comunidade de helmintos alcançou um padrão de agregação elevado. Espécimes da família Cosmocercidae foram classificados como co-dominantes nos dois hidroperíodos. C. cf. americana foi dominante na seca e co-dominante na cheia, enquanto Cosmocerca podicipinus e o oligochaeta Dero (Allodero) lutzi foram co-dominantes na seca. Os outros taxa foram considerados colonizadores sem sucesso. Os resultados indicaram que não houve diferença dos parâmetros prevalência, intensidade média de infecção e abundância média entre os hidroperídos, porém a diversidade parasitária variou entre as estações, sendo a diversidade na seca maior que na cheia
Parasites play an important role in maintaining the local diversity of hosts and the ecosystem functions, however they are the first organisms that disappear because of human activities upon the nature. Seasonal variations related to the environment are important factors that directly or indirectly influence the host-parasite relationship and helminth community structure. This study aims to describe and compare the composition and helminth community structure associated with the amphibian anuran Dendropsophus nanus, from the RPPN Foz do Rio Aguapeí, municipality of Castilho, São Paulo State, in the dry and rainy hydro-periods. A total of 298 frogs were collected in four sampling efforts, two in the dry season and two in the rainy season, totaling 40 days of sampling. Parasitic parameters such as prevalence, mean intensity of infection, mean abundance and aggregation of parasites in host populations, as well as the structure of helminth community, were evaluated. A richness of eleven taxa was found, with the metacercariae of Lophosicyadiplostomum sp. the most abundant taxa, followed by Cylindrotaenia cf. americana. The helminth community reached a high pattern of aggregation. Cosmocercidae family specimens were classified as co-dominant in both hydro-periods. Cylindrotaenia cf. americana was dominant in the dry season and co-dominant in the rainy season, while Cosmocerca podicipinus and the oligochaeta Dero (Allodero) lutzi were co-dominant in the dry season. The other taxa were considered settlers without success. Even though the parasite diversity varied between periods and the diversity was higher in the dry season than in the rainy season, the results showed no difference in the prevalence parameters, mean infection intensity and mean abundance between the hydro-periods

Neste trabalho apresentamos um modelo de previsão da distribuição geográfica de anuros baseado em uma Rede Neural Autocodificadora. O problema de previsão é tratado como uma tarefa de classificação One-Class, em que a localização conhecida dos indivı́duos é representada através de suas coordenadas espaciais, temporais e variáveis meteorológicas correlacionadas. O modelo mostrou alto grau de acuidade quando utilizado para prever a ocorrência de sapos da espécie Bufo Americanus no sul do Canadá. O método proposto é computacionalmente leve e pode ser acoplado a redes de sensores para monitoramento ambiental.