Teses / dissertações sobre o tema "Murcha de fusarium"

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
O presente trabalho objetivou investigar o potencial de uso do controle biológico no patossistema F. oxysporum f. sp. phaseoli e feijão a partir das seguintes etapas: 1-Selecionar um isolado de F. oxysporum não-patogênico (FO), um isolado de Trichoderma sp. (TR) e outro de Pseudomonas fluorescentes (PF) mais competentes e com alta competitividade rizosférica. 2-Estudar o efeito do tratamento de sementes de feijão com isolados selecionados de Pseudomonas fluorescentes, no desenvolvimento da murcha-vascular. 3-Estudar a relação entre a densidade de inóculo de F. oxysporum f. sp. phaseoli e de F. oxysporum não- patogênicos adicionada no solo para supressão da forma patogênica. 4-Estudar, em solo infestado com F. oxysporum f. sp. phaseoli, o efeito combinado de sementes de feijão tratadas com a bactéria e plantadas em solo infestado com F. oxysporum não-patogênico em casa de vegetação, no desenvolvimento da murcha-vascular. 5-Estudar, em solo infestado com F. oxysporum f. sp. phaseoli, o efeito combinado de sementes de feijão tratadas ou não-tratadas com a bactéria e plantadas em solo infestado com F. oxysporum não-patogênico ou Trichoderma sp. e o efeito de cada potencial antagonista sozinho, no campo, no desenvolvimento da murcha-vascular. Foram testados três isolados de FO, 11 de TR e 150 de PF, obtidos da rizosfera (80), rizoplano (30) e internamente as raízes (40). Nos testes de antibiose “in vitro” foram selecionados 22 isolados de PF e nos testes posteriores de competência e competitividade selecionou-se o isolado PF22 (Pseudomonas putida). Testando-se a competência e competitividade de FO e TR foram selecionados os isolados TR11 de Trichoderma (T harzianum) e FO3 de Fusarium não patogênico. Observou-se que não teve diferença entre as concentrações de FO para um mesmo isolado, no entanto, foi observada diferença entre os isolados e destes com o controle. O isolado FO3 teve uma maior área abaixo da curva de decréscimo da clorofila (AACDCL) para as clorofilas A, B e total (5,38, 1,71 e 7,10, respectivamente), menor severidade da doença (2,37) e maior produção de grãos (6,65g) em relação ao FOPm sozinho, com AACDCL de 2,41, 0,87 e 3,25, respectivamente, severidade 4,25 e produção de grãos de 2,23g. O isolado PF22 sozinho não reduziu a severidade da doença. Quando FO3 e PF22 foram usados em conjunto obteve-se uma maior AACDCL paras as clorofilas A, B e total (4,52, 1,05 e 5,57, respectivamente), maior produção de grãos (12,59g) e redução da severidade da doença (2,50) enquanto que FOPm sozinho teve AACDCL de 0,92, 0,23 e 1,16, respectivamente, severidade de 4,30 e produção de 5,71g de grãos. No campo, os isolados TR11 e FO3 sozinhos ou em conjunto com PF22, não diferiram entre si quanto a AACDCL, mas diferiram do FOPm sozinho. Quanto à produção, observou-se que a associação dos microrganismos FO3 + PF22 e TR11 + PF22 não diferiram entre si, com uma produção de 15 e 14 vagens e 14,7 e 13,1 g de grãos, respectivamente. A produção do tratamento apenas com FOPm foi de 8,3 vagens e 4,5 g de grãos. Esses valores mostram um aumento de aproximadamente 200% na produção de grãos quando utilizados os microrganismos em conjunto no controle da doença no campo. A ação conjunta dos microrganismos usados neste trabalho mostrou-se uma estratégia de controle biológico promissora para a redução no solo da densidade de inóculo de F. oxysporum f. sp. phaseoli e, com isso, propiciar uma redução da ocorrência e dos danos causados por essa doença.
This study aimed to investigate the potential of the biological control upon the pathosystem F. oxysporum f. sp. phaseoli and bean, by the following procedure: 1) Selecting an isolate of non-pathogenic F. oxysporum (FO), an isolate of Trichoderma sp. (TR) and one of fluorescent Pseudomonas (FP), which should be more competent and have a higher degree of rhizosphere competitiveness; 2) Studying the effect of the seed treatment with those selected fluorescent Pseudomonas isolates upon the development of the vascular wilt; 3) Studying the relationship between the inoculum densities of the non-pathogenic F. oxysporum and pathogenic F. oxysporum f. sp. phaseoli added to the soil in order to suppress the pathogenic form. 4) Studying the combined effect of bean seed treatment with F. oxysporum f. sp. phaseoli and sowing in a non-pathogenic F. oxysporum-infested soil upon the development of the vascular wilt, under greenhouse conditions. 5) Comparing the combined effect of bean seed treatment with F. oxysporum f. sp. phaseoli or no treatment followed by sowing in soil infested by either non-pathogenic F. oxysporum or Trichoderma sp., as well as the effect of each antagonistist alone upon the development of the vascular wilt under field conditions. The following isolates were tested: three from FO, 11 from TR and 150 from PF [which were obtained from the rhizosphere (80), rhizoplane (30) and internally from the roots (40)]. In the in vitro antibiosis test, twenty two PF isolates were selected, whereas in the following tests for competence and competitiveness the isolate PF22 (Pseudomonas putida) was selected. When testing FO and TR for competence and competitiveness, the isolates TR11 from Trichodema (T. harzianum) and FO3 from the non-pathogenic Fusarium were selected. No differences were observed among the FO concentrations for the same isolate, but differences between the isolates as well as between these and the control were significant. The FO3 isolate occupied a higher area below the chlorophyll decreasing curve (AACDCL) for A, B and total chlorophylls (5.38, 1.71 and 7.10, respectively), as well as a lower disease severity (2.37) and higher bean yields (6.65g) in relation to FOPm alone, with the respective values of 2.41, 0,87 and 3,25 for AACDCL, 4.25 severity, and 2.23g for bean yield. The isolate PF22 did not reduce by itself the severity of the disease. When using FO3 and PF22 together, a higher AACDCL was obtained for the chlorophylls A, B and total (4.52, 1.05 and 5.57, respectively), as well as higher bean yields (12.59g) and reduced severity of the disease (2.50), whereas FOPm alone showed an AACDCL of 0.92, 0.23 and 1.16, respectively, 4.30 severity, and bean yield of 5.71g. Under field conditions, both the isolates TR11 and FO3 by themselves or combined with PF did not differ from each other for AACDCL, but from the FOPm alone. In relation to the yield, no differences were found for the combination of the microorganisms FO3 + PF22 and TR11 + PF22, since a total of 15 and 14 pods and 14.7 and 13.1 beans were yielded, respectively. In the treatment with FOPm alone, a total of 8.3 pods and 4.5 beans were yielded. These values show an increase of around 200% in bean yield, when the microorganisms were used in combination to control the disease in the field. In this study, the combined action of the microorganisms showed to be a promising biological control strategy for reducing the density of the F. oxysporum f. sp. phaseoli inoculum in the soil providing a reduction in both occurrence and damages caused by this disease.
Tese importada do Alexandria

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
The fusarium wilt, caused by the fungus Fusarium oxysporium f sp phaseoli, is considered one of the most important diseases affecting the common bean crop, especially in areas of intense and successive crops in the winter crop. There is little information about the variability of the pathogen and few common bean cultivars used in Brazil are resistant. The objectives of this study were to identify lines of common bean, previously characterized as resistant to fusarium wilt under controlled conditions, which combine resistance to fusarium wilt in the field and other favorable characters; obtain and select segregating populations of common bean with black beans resistant to fusarium wilt, with high grain yield and commercial grain size; select promising black bean lines with resistance to fusarium wilt, high grain yieldy and mass of 100 grains; estimate correlations and genetic and phenotypic parameters for these three characters. In the evaluation of the elite lines previously obtained as resistant to fusarium wilt, the tests were conducted in a randomized block design with three replications and plots consisting of four rows of four meters. Six lines were used, one carioca and five black beans, along with five cultivars in 28 experiments, between the years 2009 to 2011, in wet, winter and rainy growing seasons, at Paraná, Distrito Federal and Goiás States. In these trials were carried out evaluations for grain yield, plant architecture, lodging tolerance, reaction to fusarium wilt and reaction to anthracnose. Variance and mean grouping test analyzes were performed for the data obtained from five traits and analysis of adaptability and stability was realized for grain yield, using the method Nunes. For obtaining and selecting segregating populations under field conditions, the segregating populations were obtained from crosses in complete diallel scheme. Crosses were realized with eight lines with black granis and with different levels of resistance to fusarium wilt. The trials were composed by 28 populations obtained and two cultivars, one resistant and one susceptible to fusarium wilt. The populations obtained were evaluated in a randomized block design with three replications, in F2, F3 and F4, in winter/2012, winter/2013 and winter/2014, respectively. The three trials were conducted in Santo Antônio de Goiás in field infested by Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli under irrigation by central pivot. The reaction to fusarium wilt, grain yield and weight of 100 grains were evaluated. Analyses were performed for individual and joint variance and for reaction to fusarium wilt was also carried out diallel analysis according Griffing (1956). Means were grouped using the Scott knot test. From the data obtained, two segregating populations were selected. 58 lines from each population were obtained, totalizing 116 lines which were evaluated with five controls. The evaluation of the lines was carried out in the winter/2015 in triple lattice design 11x11 with plots of two lines of 3 meters, also in Santo Antônio de Goiás - GO, in naturally infested area. There is variability in reaction to fusarium wilt, grain yield, plant architecture, lodging tolerance and reaction to anthracnose, among the lines evaluated. The genotype x environment interaction is important for the five characters evaluated. The five lines of black beans (CNFP 15867, CNFP 15870, CNFP 15869, CNFP 15868 and CNFP 15871) were resistant to fusarium wilt. Already CNFC 15872 line, with carioca grain, showed moderately susceptible. The CNFP 15867 and CNFP 15870 lines showed potential for use in breeding. BRS Esplendor cultivars and BRS Notavel are also good choices for planting in areas with fusarium wilt, with good agronomic performance. Regarding the evaluation of segregating populations was detected genetic variability for the three characters. The diallel analysis for reaction to wilt fusarium showed difference between the general combining ability (CGC) of parents and between the specific combination capacity (CEC) of the populations. The resistance to fusarium wilt was explained by additive and non-additive effects. The CNFP 15867 line showed positive estimate of CGC, been indicated for new crosses. Considering together, the mean of population for all traits and diallel analysis for reaction to fusarium wilt, populations BRS Esplendor x BRS Expedito and BRS Expedito x CNFP 15867 were selected. Considering the lines obtained from these two populations, the estimates of heritability, genetic variance and gain expected selection were high for the three traits, indicating good chance of successful selection. Considering the simultaneous selection, it was possible to obtain gains for the three traits, especially for reaction to fusarium wilt (31%). Eight lines have been identified that meet resistance to fusarium wilt, high grain yield and good grain size. There was a significant genetic correlation between fusarium wilt and grain yield, so lines resistant to fusarium wilt present high grain yield.
A murcha-de-fusário, causada pelo fungo Fusarium oxysporium f sp phaseoli, é considerada uma das doenças mais importantes que acometem a cultura do feijoeirocomum, sobretudo em áreas de cultivos intensos e sucessivos na safra de inverno. Existem poucas informações acerca da variabilidade do patógeno e poucas cultivares de feijoeiro-comum utilizadas no Brasil são resistentes. Assim, os objetivos deste trabalho foram: identificar linhagens elite de feijoeiro-comum, previamente caracterizadas como resistentes à murcha-de-fusário em condições controladas, que associem resistência à murcha-de-fusário em campo e outros caracteres favoráveis; obter e selecionar populações segregantes de feijoeiro-comum com grãos pretos resistentes à murcha-de-fusário, com alta produtividade e tamanho comercial de grãos; selecionar linhagens de grãos pretos promissoras com resistência à murchade- fusário, alta produtividade e massa de 100 grãos; estimar correlações e parâmetros genéticos e fenotípicos para esses três caracteres. Na avaliação das linhagens elite previamente obtidas como resistentes à murcha-de-fusário, os ensaios foram conduzidos em delineamento blocos ao acaso, com três repetições e parcelas constituídas de quatro linhas de quatro metros. Foram avaliadas seis linhagens, sendo uma do tipo carioca e cinco de grãos pretos, juntamente com cinco cultivares, em 28 experimentos, entre os anos de 2009 a 2011, nas safras da seca, inverno e das águas, nos Estados de Paraná, Distrito Federal e Goiás. Nesses experimentos foram realizadas avaliações para produtividade de grãos, arquitetura de plantas, tolerância ao acamamento, reação à murcha-de-fusário e reação à antracnose. Foram realizadas análises de variância e testes de agrupamento de médias para os dados obtidos dos cinco caracteres e análise de adaptabilidade e estabilidade para a produtividade de grãos, utilizando o método de Nunes. Para a obtenção e seleção de populações segregantes, em condições de campo, as populações segregantes foram obtidas a partir de cruzamentos em esquema de dialelo completo sem recíprocos. Foram cruzadas oito linhagens/cultivares de feijoeiro-comum com grãos pretos com níveis diferenciados de resistência à murcha-de-fusário. Os ensaios foram compostos pelas 28 populações obtidas nos cruzamentos e duas testemunhas, sendo uma resistente e outra suscetível à murcha-de-fusário. As populações obtidas foram avaliadas em delineamento em blocos casualizados com três repetições, nas gerações F2, F3 e F4, nas safras de inverno/2012, inverno/2013 e inverno/2014, respectivamente. Os três ensaios foram conduzidos em Santo Antônio de Goiás em campo infestado por Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli sob irrigação por pivô central. Foram avaliadas a reação à murcha-de-fusário, produtividade e massa de 100 grãos. Realizaram-se análises de variância individual e conjunta e para reação a murcha-de-fusário também foi realizada análise dialélica segundo Griffing (1956). As médias foram agrupadas utilizando-se o teste de scott knot. A partir dos dados obtidos, foram selecionadas duas populações segregantes, das quais foram obtidas 58 linhagens de cada uma, totalizando 116 linhagens, que foram avaliadas juntamente com cinco testemunhas. A avaliação das linhagens foi realizada na safra de inverno/2015, em delineamento látice triplo 11x11, com parcelas constituídas de duas linhas de 3 metros, também em Santo Antônio de Goiás – GO, em área infestada naturalmente. Existe variabilidade para reação à murcha-de-fusário, produtividade de grãos, arquitetura de plantas, tolerância ao acamamento e reação à antracnose, entre as linhagens avaliadas. A interação genótipos x ambientes é importante para os cinco caracteres avaliados. As cinco linhagens de grãos pretos (CNFP 15867, CNFP 15870, CNFP 15869, CNFP 15868 e CNFP 15871) foram resistentes à murcha-de-fusário. Já a linhagem CNFC 15872, de grão carioca, apresentou-se moderadamente suscetível. As linhagens CNFP 15867 e CNFP 15870 apresentaram potencial para utilização em novos cruzamentos, entretanto, não superaram as melhores testemunhas. As cultivares BRS Esplendor e BRS Notável ainda são boas opções para plantio em áreas com incidência de murcha-de-fusário, apresentando bom desempenho agronômico. Com relação à avaliação das populações segregantes, detectou-se variabilidade genética para os três caracteres. A análise dialélica para reação à murcha-de-fusário mostrou diferença entre as capacidades gerais de combinação (CGC) dos genitores e entre as capacidades específicas de combinação (CEC) das populações. A resistência a murcha-de-fusário foi explicada pelos efeitos aditivos e não-aditivos. A linhagem CNFP 15867 apresentou estimativa positiva de CGC, sendo indicada para realização de novos cruzamentos. Considerando em conjunto, a média das populações para todos os caracteres e a análise dialélica para reação à murcha-de-fusário, foram selecionadas as populações BRS Esplendor x BRS Expedito e BRS Expedito x CNFP 15867. Considerando as linhagens obtidas dessas duas populações, as estimativas de herdabilidade, variância genética e ganho esperado com a seleção foram elevadas para os três caracteres, indicando boa possibilidade de sucesso com a seleção. Considerando a seleção simultânea, foi possível obter ganhos para os três caracteres, com destaque para a reação à murcha-de-fusário (31%). Foram identificadas oito linhagens que reúnem resistência à murcha-de-fusário, alta produtividade e bom tamanho de grão. Foi identificada correlação genética significativa entre murcha-defusário e produtividade de grãos, portanto linhagens resistentes à murcha-de-fusário são mais produtivas.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-12-16Bitstream added on 2014-06-13T19:44:47Z : No. of bitstreams: 1 pinto_zv_dr_botfca.pdf: 894968 bytes, checksum: 522dc825bbc64c7631c86fa63430a259 (MD5)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
A murcha de Fusarium spp. em crisântemo é responsável por sérios prejuízos à cultura no Brasil. Uma alternativa para o seu controle é o uso de substrato supressivo, o qual pode ser obtido pela adição de fontes de matérias orgânicas. Dessa forma, o presente trabalho teve por objetivo desenvolver um substrato supressivo à murcha do Fusarium em crisântemo com a introdução de matéria orgânica em substratos comerciais. Para tanto, lodo de esgoto e lodo de esgoto compostado; torta de mamona; esterco suíno; cama aviária; compostos comerciais Lanzi®; casca de camarão, biofertilizante e hidrolisado de peixe foram incorporados a substratos à base de casca de Pinus e de turfa em diferentes concentrações e combinações. Os experimentos foram realizados em propriedade produtora de crisântemo Bola-belga com problemas de Fusarium. Em todos os experimentos o número mínimo de repetições foi de 20 vasos por tratamento. Transcorridas 8, 12, 15 e 20 semanas do transplantio foi avaliada a severidade da doença por uma escala de notas de 0 para planta sadia a 5 para planta morta. Com os dados foram calculadas as áreas abaixo da curva de progresso da severidade da murcha de Fusarium. Além disso, foram realizadas análises dos atributos químicos e da atividade microbiana dos substratos bem como do desenvolvimento das plantas. O lodo de esgoto, lodo de esgoto compostado, cama aviária, casca de camarão e o composto Lanzi® induziram a supressividade do substrato à base de casca se Pinus e/ou de turfa, controlando a murcha de Fusarium. Por outro lado, esterco suíno, torta de mamona, hidrolisado de peixe, quitosana e Trichoderma asperellum não interferiram na supressividade à doença. Substratos obtidos com lodo de esgoto e cama aviária, em mistura ou não, nas concentrações de 10, 20 e 30% (v/v) foram os mais adequados do ponto de vista de indução de supressividade...
Fusarium spp. wilt causes serious damages to chrysanthemum crops in Brazil. An alternative for its control is the use of suppressive plant growth media, which can be obtained by the addition of organic matter to container media. The objective of the present work was to develop a plant growth media suppressive to the Fusarium spp. in chrysanthemum with the introduction of organic matter to commercial container media. Sewage sludge and sewage sludge compost; castorbean presscake, swine manure; poultry litter; shrimp peel, biofertilizer, chitosan and fish hydrolyzed were incorporated to pine-bark and turf container media in different concentrations and combinations. The experiments were conducted in a Belgianchrysanthemum variety producing property with a Fusarium problem. In all experiments the minimum number of repetitions was 20 containers per treatment. Eight, 12, 15 and 20 weeks following transplanting the severity of the disease was evaluated according to a progressive scale from 0 (healthy plant) to 5 (dead plant). Areas under the disease progress curve for disease severity of Fusarium wilt were calculated. Chemical and microbiological attributes of container media and plant development were analyzed. The sewage sludge, sewage sludge compost, poultry litter, shrimp peel and the Lanzi® compost induced the suppressiveness of pine bark and/or turf container media, controlling the wilt. On the other hand, swine manure, castorbean presscake, fish hydrolyzed, chitosan and Trichoderma asperellum did not affect the suppressiveness to the disease. Plant growth media with sewage sludge and poultry litter, in mixture or alone, in the concentrations of 10, 20 and 30% (v/v) were the most appropriate from the point of view of induction of suppressiveness and product quality, being the plant growth media recommended... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Wagner Bettiol
Banca: Edson Luiz Furtado
Banca: Marcelo Augusto Boechat Morandi
Banca : Nelson Sdney Massola Júnior
Banca: Flávia Rodrigues Alves Patrício
Resumo: A murcha de Fusarium spp. em crisântemo é responsável por sérios prejuízos à cultura no Brasil. Uma alternativa para o seu controle é o uso de substrato supressivo, o qual pode ser obtido pela adição de fontes de matérias orgânicas. Dessa forma, o presente trabalho teve por objetivo desenvolver um substrato supressivo à murcha do Fusarium em crisântemo com a introdução de matéria orgânica em substratos comerciais. Para tanto, lodo de esgoto e lodo de esgoto compostado; torta de mamona; esterco suíno; cama aviária; compostos comerciais Lanzi®; casca de camarão, biofertilizante e hidrolisado de peixe foram incorporados a substratos à base de casca de Pinus e de turfa em diferentes concentrações e combinações. Os experimentos foram realizados em propriedade produtora de crisântemo Bola-belga com problemas de Fusarium. Em todos os experimentos o número mínimo de repetições foi de 20 vasos por tratamento. Transcorridas 8, 12, 15 e 20 semanas do transplantio foi avaliada a severidade da doença por uma escala de notas de 0 para planta sadia a 5 para planta morta. Com os dados foram calculadas as áreas abaixo da curva de progresso da severidade da murcha de Fusarium. Além disso, foram realizadas análises dos atributos químicos e da atividade microbiana dos substratos bem como do desenvolvimento das plantas. O lodo de esgoto, lodo de esgoto compostado, cama aviária, casca de camarão e o composto Lanzi® induziram a supressividade do substrato à base de casca se Pinus e/ou de turfa, controlando a murcha de Fusarium. Por outro lado, esterco suíno, torta de mamona, hidrolisado de peixe, quitosana e Trichoderma asperellum não interferiram na supressividade à doença. Substratos obtidos com lodo de esgoto e cama aviária, em mistura ou não, nas concentrações de 10, 20 e 30% (v/v) foram os mais adequados do ponto de vista de indução de supressividade... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)
Abstract: Fusarium spp. wilt causes serious damages to chrysanthemum crops in Brazil. An alternative for its control is the use of suppressive plant growth media, which can be obtained by the addition of organic matter to container media. The objective of the present work was to develop a plant growth media suppressive to the Fusarium spp. in chrysanthemum with the introduction of organic matter to commercial container media. Sewage sludge and sewage sludge compost; castorbean presscake, swine manure; poultry litter; shrimp peel, biofertilizer, chitosan and fish hydrolyzed were incorporated to pine-bark and turf container media in different concentrations and combinations. The experiments were conducted in a Belgianchrysanthemum variety producing property with a Fusarium problem. In all experiments the minimum number of repetitions was 20 containers per treatment. Eight, 12, 15 and 20 weeks following transplanting the severity of the disease was evaluated according to a progressive scale from 0 (healthy plant) to 5 (dead plant). Areas under the disease progress curve for disease severity of Fusarium wilt were calculated. Chemical and microbiological attributes of container media and plant development were analyzed. The sewage sludge, sewage sludge compost, poultry litter, shrimp peel and the Lanzi® compost induced the suppressiveness of pine bark and/or turf container media, controlling the wilt. On the other hand, swine manure, castorbean presscake, fish hydrolyzed, chitosan and Trichoderma asperellum did not affect the suppressiveness to the disease. Plant growth media with sewage sludge and poultry litter, in mixture or alone, in the concentrations of 10, 20 and 30% (v/v) were the most appropriate from the point of view of induction of suppressiveness and product quality, being the plant growth media recommended... (Complete abstract click electronic access below)
Doutor

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
The fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol), is one of the major problems in tomato cultivation especially in green house crop. The soil infestation with this pathogen can make the green house cultivation unviable, therefore periodic fumigation is recommended to maintain low inoculum level in soil. This study was done to evaluate the fumigant effect of the mustard essential oil (MEO), containing 90% allyl isothiocyanate, to control Fol. In vitro bioassays were done to determine its effect on mycelial growth, sporulation and germination of conidia and clamydospores, with use of a wild Fol and benomyl resistant mutant (Folm). The fungal cultures in Petri plates were fumigated with different concentration of the MEO for 24 or 48 h, and then incubated in MEO free atmosphere. For all fungal propagules, the estimated DE50 was lowest if the fumigation was done for 48 h. The mycelium and conidia of the Fol were more susceptible to MEO than chlamydospores. The MEO did not affect sporulation. Fumigation with MEO was also evaluated for eradication of the chlamydospores of Folm in soil. Initially, the interaction between dose (0, 50, 100 or 150μL/L) and exposure time was determined (2, 4, 6 or 8 days). The soil infested with 2000 ±200 chlamydospores/g was placed in flasks, and after adding the requited amount of MEO the flasks were hermetically sealed. After each exposure period, the inoculum density of the fungus was determined by plating the soil dilutions on benomyl enriched galactosenitrate agar. The regression equation revealed that at dose of 125μL/L an exposure period of 5.4 days was required to eradicate Folm. To determine the fumigant effect of MEO in the green house, 20L of soil infested with 4000 ±250 chlamydospores/g was placed in the plastic bags of 30L, and treated with 0, 50, 100 or 150μL/L of MEO. The bags were then sealed and stored. After 7-days exposure period, the soil was distributed into 4L-plastic pots, and one 20-day old tomato seedling was transplanted into each pot. At 15-day interval, soil from each pot was sampled at 15-day interval to follow the population dynamic of the fungus. The disease progress was accompanied by leaf chlorophyll analysis leaves, and the final severity was evaluated by use of a numerical at the end of 60 days. It was found that the soil fumigation with 150μL/L of MEO reduced the Folm inoculum density by 95% and the disease severity was less than 15%.
A murcha de fusário, causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol), é um problema comum em campos de produção de tomate, especialmente quando o cultivo é realizado em ambiente protegido. Solos infestados por este patógeno podem inviabilizar a produção em estufas, sendo recomendada a fumigação periódica, visando à manutenção de um baixo nível de inóculo no solo. Este trabalho teve como objetivo avaliar o efeito fumigante do óleo essencial de mostarda, que é composto por 90% de isotiocianato de alila (ITCA), na redução de inóculo e no controle da murcha vascular causada por Fol. Foram realizados bioensaios in vitro de crescimento micelial, formação de conídios e germinação de conídios e de clamidósporos. Para os testes, foram utilizados um isolado selvagem (Fols) e um mutante resistente ao benomil (Folm), os quais foram fumigados com ITCA, em diferentes doses, dentro de recipientes plásticos vedados, por períodos de 24 ou 48 horas. Após a fumigação, as placas contendo as culturas foram incubadas na ausência dos vapores do produto até a avaliação. Os menores valores de DE50 foram estimados para o período de 48 horas de exposição, tanto para o bioensaio de crescimento micelial como para os de germinação de conídios e de clamidósporos. Verificou-se que os conídios foram os propágulos de Fol mais sensíveis ao produto e os clamidósporos os mais resistentes. O ITCA não afetou significativamente a formação de conídios pelos isolados. Avaliou-se também a eficiência do produto na erradicação de clamidósporos de Folm no solo. Inicialmente, foi estudada a interação entre doses (0, 50, 100 e 150μL/L) e tempo de exposição (2, 4, 6 e 8 dias) ao ITCA. Solo infestado com 2000 ±200 clamidósporos/g foi transferido para erlenmeyers, que receberam a dose desejada, sendo, em seguida, hermeticamente vedados. Após exposição, a população do fungo foi determinada por meio de plaqueamento de diluições em série em meio seletivo para F. oxysporum acrescido de benomil. A partir da equação de regressão gerada, pôde-se estimar que seria necessária uma fumigação de solo com 125μL/L por períodos superiores a 5,4 dias para erradicação de Folm no solo. Para determinar o efeito de ITCA em casa de vegetação, 20L de solo infestado com 4000 ±250 clamidósporos/g foram colocados em sacos de polietileno de 30L, os quais receberam as doses de 0, 50, 100 ou 150μL/L sendo, posteriormente, vedados, permitindo a fumigação por 7 dias. Decorrido este período, o solo foi transferido para vasos de 4L, os quais receberam uma muda de tomate com 20 dias de idade. As plantas foram cultivadas por 60 dias, sendo retiradas amostras quinzenais de solo para acompanhamento da dinâmica populacional do fungo no solo. Através de análise do conteúdo de clorofila nas folhas, acompanhou-se o desenvolvimento da doença e a severidade final foi avaliada por meio de escala de notas. Foi verificado que a fumigação com 150μL/L de ITCA reduziu em mais de 95% a população de Folm no solo e que a severidade da doença aos 60 dias foi inferior a 15%.

Made available in DSpace on 2018-08-24T12:05:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_11827_Dissertação_Wilker.pdf: 947833 bytes, checksum: 7493679906fbdfd0a73a61ba54d6007e (MD5) Previous issue date: 2018-02-23
O tomate é a hortaliça de maior consumo no mundo, sendo uma cultura de importância econômica e social. Porém, em seu cultivo, é propício a incidência de diversas doenças, dentre elas pode-se destacar a murcha de Fusarium, causada pelo Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici. Sendo assim, objetivou-se com este estudo avaliar a atividade in vitro dos óleos essenciais (OEs) de Thymus vulgaris e Cinnamomun zeylanicum e seus componentes majoritários. A caracterização química dos OEs foi realizada por CG/DIC e CG/EM, tendo identificado o eugenol (77,95%) como componente majoritário do OE canela, o carvacrol (23,93%) e o timol (20,23%) do OE de tomilho. No ensaio foram calculados os valores de CE50 e CE100 do crescimento micelial de cada tratamento, sendo: OE de canela (171,79 e 575,18 ppm); OE de tomilho (106,29 e 341,73 ppm); eugenol (187,46 e 374,93 ppm); timol (88,67 e 193,02 ppm) e carvacrol (52,06 e 170,92 ppm). E, para esporulação, foram calculados os valores de: OE de canela (262,20 e 342,72 ppm); OE de tomilho (67,47 e 255,42 ppm); eugenol (80,94 e 359,55 ppm); timol (97,0 e 194,02 ppm) e carvacrol (44,66 e 113,82 ppm). Com isso, os óleos essenciais e seus componentes majoritários podem ser uma alternativa para o controle do F. oxysporum f.sp. lycopersici.

Submitted by Onia Arantes Albuquerque (onia.ufg@gmail.com) on 2018-10-08T13:49:50Z No. of bitstreams: 2 Tese - Stella Cristina Dias Valdo - 2017.pdf: 4757114 bytes, checksum: 62d9148c9c6315952ac5a86bdb1f9417 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)
Rejected by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com), reason: Olhe o espaço a mais na citação: VALDO, S. C. D. Estudo de resistência à murcha-de-fusarium e identificação de QTLs em feijeiro-comum. 2017. 178 f. Tese (ESPAÇO A MAIS Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2017. on 2018-10-09T10:59:43Z (GMT)
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG
The common bean (Phaseolus vulgaris) crop plays an important role in the culture and economy of Brazil. It is cultivated in all Brazilian regions and is affected by several diseases like fusarium wilt which is caused by Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli (soil-born fungus). This disease brings significant losses in common bean culture and genetic resistance is the primary form of control. One of the core goals of breeding programs is the development of resistant cultivars, therefore the objectives of this work are: i) To select F. oxysporum f. sp. phaseoli resistant F5:7 lines resulted from the crossing between Ouro Branco X CNFP10132, under controlled field and environment conditions ii) To identify SSR markers and QTL-linked SNPs associated with the resistance of common bean to fusarium wilt using 92 recombinat inbred lines(RILs) resulted from the crossing between Ouro Branco x CNFP10132. In the first study, 140 lines, the breeders Ouro Branco and CNFP10132, BRS Esplendor (resistant) and BRS Supremo (susceptible) as controls were evaluated. Field trials were conducted in a center pivot area where natural infestation of the pathogen occurs. The treatments were evaluated in summer and winter crop and the experimental design used was 12x12 triple lattice. The two controlled environment trials were conducted in a completely randomized design. The treatments were inoculated by cutting and immersing the roots in a conidial suspension, which was adjusted to 1x106 conidia/ml for five minutes. The evaluation was performed using a scale of nine grades that represent the severity of the disease: 1 – absence of symptoms and 9 – over 75% of foliage with wilt symptoms. Data were submitted to analysis of variance and Scott-Knott test for both environments. The area under the disease progress curve (AUDPC) and genetic parameters were estimated for controlled environment tests. Significant differences were observed for crops and for controlled environment trials, indicating that environment influences directly the severity of the disease. Highly significant differences were found for lines in all environments evaluated, demonstrating the existence of genetic variability, which allows the selection of resistant lines resistant to fusarium wilt. Treatments were classified in different groups according to the Scott-knott test. When considering the lowest averages in field, controlled environment and AUDPC, the strains Ouro Branco x CNFP 10132.140, Ouro Branco x CNFP 10132.49, Ouro Branco x CNFP 10132.12, Ouro Branco x CNFP 10132.90 and Ouro Branco x CNFP 10132.48 were prominent and are candidates to produce a breeding program. Heritability estimates were high for all environments, mean of 85.48% for field and 95.47% for controlled environment. Therefore, selection for resistance to F. oxysporum f. sp. phaseoli of these lines, will be successful. In the second study it was extracted DNA from 92 lines and from genitors for genotyping with SSRs and SNPs. In order to obtain the localization of these markers, sequences of the primers were aligned to the andean genome of the common bean. The method of single marker (analysis of QTLs based on linear regression) was used to identify QTLs associated with fusarium wilt resistance. These markers were considered significant when brought up p-value <0.05. Ninety-three markers were linked to 104 QTLs associated with fusarium wilt resistance and among these, were considered significant in more than one environment PV 115, PV 251, BARC-PV-0004089, BARC-PV-0004548, BARC-PV-0003450, BARC-PV-0006051, BARC-PV-0003368 , BARC-PV-0005477 and BARC-PV-0004897. However only the BARC-PV-0003450 marker was highly significant in the two environment controled trials (p <0.001) and winter crop (p <0.01) and explained up to 21.5% of the phenotypic variance. Subsequently, the gene annotation was made considering the location of all markers that were significant at p <0.01 comprising 500 kb before and after the localization. 960 coded transcripts were annotated. It was observed in gene annotation that BARC-PV-0003450 marker is located on the chromosome 8, 338.54 kb distant of the gene Phvul.008G014700 which is associated with the putative protein RPP13 related to disease resistance, identified in Arabidopsis thaliana. This protein belongs to the third class of resistance genes that encloses the domain called Leucine-Rich Repeats (LRR). This domain is involved in the recognition of the pathogen by the host during the infection process. Therefore, this marker is suitable for marker- assisted selection aiming the development of cultivars resistant to fusarium wilt.
A cultura do feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris) tem importância cultural e econômica no Brasil. O feijoeiro-comum é cultivado em todas as regiões brasileiras e é acometido por várias doenças, como a murcha-de-fusarium, causada pelo fungo habitante de solo Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli. Esta doença causa significativas perdas na cultura e a principal forma de controle é a resistência genética. Desenvolver cultivares resistentes é um dos alvos dos programas de melhoramento, portanto os objetivos deste trabalho foram: i) selecionar linhagens resistentes obtidas de população F5:7 oriunda do cruzamento entre Ouro Branco e CNFP10132 para F. oxysporum f. sp. phaseoli, em condições de campo e de ambiente controlado e ii) identificar marcadores SSR e SNP's ligados a QTLs associados à resistência do feijoeiro-comum à murcha-de-fusarium utilizando 92 linhagens recombinantes endogâmicas (RILs) derivadas do cruzamento Ouro Branco x CNFP10132. No primeiro estudo 140 linhagens, os genitores Ouro Branco e CNFP10132, duas testemunhas BRS Esplendor (resistente) e BRS Supremo (suscetível) foram avaliados. Os ensaios de campo foram conduzidos em área de pivô central onde ocorre infestação natural do patógeno. Os tratamentos foram avaliados em duas safras (safra das águas e de inverno) em delineamento de látice triplo 12x12. Os dois ensaios em ambiente controlado foram conduzidos em delineamento inteiramente causalizado. As plantas foram inoculadas utilizando o método de corte de raiz e imersão destas na suspensão de conídios, que foi ajustada para 1x106 conídeos/mL durante cinco minutos. A avaliação foi feita utilizando uma escala de notas de nove graus que representam a severidade da doença: sendo 1 - ausência de sintomas e 9 - acima 75% da folhagem com sintomas de murcha. Os dados foram submetidos à análise de variância e teste de Scott-Knott para os ambos ambientes. Para os ensaios em ambiente controlado foram estimados área abaixo da curva do progresso da doença (AACPD) e parâmetros genéticos. Foram observadas diferenças significativas para safras e para ensaios de ambiente controlado, indicativo de que o ambiente influencia diretamente na severidade da doença. Foram encontradas diferenças altamente significativas para linhagens em todos os ambientes avaliados, evidenciando a existência de variabilidade genética, o que possibilita seleção de linhagens resistentes à murcha-de-fusarium. Ao considerar as menores médias em campo, ambiente controlado e ACCPD as linhagens Ouro Branco x CNFP 10132.140, Ouro Branco x CNFP 10132.49, Ouro Branco x CNFP 10132.12, Ouro Branco x CNFP 10132.90 e Ouro Branco x CNFP 10132.48 se destacaram e são candidatas para compor o programa de melhoramento. As estimativas de herdabilidade foram altas para todos os ambientes, média de 85,48% para campo e 95,47% para ambiente controlado. Portanto, a seleção para resistência à F. oxysporum f. sp. phaseoli dentre estas linhagens, será bem sucedida. No segundo estudo foi extraído o DNA de 92 linhagens e dos genitores para genotipagem com marcadores SSRs e SNPs. Para obtenção da localização destes marcadores as sequências dos primers foram alinhadas no genoma andino do feijoeiro-comum. O método de mapeamento por marcas simples (análise de QTLs por meio da regressão linear) foi utilizado para identificar QTLs associados à resistência à murcha-de-fusarium. Foram considerados marcadores significativos os que apresentaram p-valor<0,05. Noventa e três marcadores foram identificados ligados a 104 QTLs associados à resistência à murcha-de-fusarium. Dentre estes marcadores destaca-se os que foram significativos em mais de um ambiente PV 115, PV 251, BARC-PV-0004089, BARC-PV-0004548, BARC-PV-0003450, BARC-PV-0006051, BARC-PV-0003368, BARC-PV-0005477 e BARC-PV-0004897. Dentre os marcadores, somente o marcador BARC-PV-0003450 foi altamente significativo nos dois ensaios, em ambiente controlado (p<0,001) e na safra de inverno (p<0,01), e explicou até 21,5% da variância fenotípica. Foi feita a anotação gênica considerando a localização de todos os marcadores que foram significativos à p<0,01 e abrangeu 500 kb anterior e posterior à localização. Foram anotados 960 transcritos codificados. Ainda observou-se que o marcador BARC-PV-0003450 está localizado no cromossomo 8 distante 338,54 kb do gene Phvul.008G014700 o qual está associado à proteína putativa RPP13 relacionada com resistência à doenças, identificada em Arabidopsis thaliana. Esta proteína pertence à terceira classe de genes de resistência que engloba o domínio denominado de Repetições Ricas em Leucina (LRR; Leucine Rich Repeats). Este domínio está envolvido no reconhecimento do patógeno pelo hospedeiro durante o processo de infecção. Portanto há a possibilidade de selecionar linhagens resistentes à murcha-de-fusarium e identificar QTLs que possivelmente estão ligados aos marcadores utilizados

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T16:35:35Z No. of bitstreams: 1 Litervaldo Pereira Machado.pdf: 672024 bytes, checksum: 9d3735863709f5a0cf0be5231401e55c (MD5)
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Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
The cotton wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum is one of the most important cotton diseases of the world. This disease is potentially destructive and had caused losses to cotton farms in the main cotton growing area in Brazil. The use of resistant cultivars is the main recommended practice to manage fusarium cotton wilt. In this study is described a simple, precise, and fast method to screen cotton germplasm for wilt resistance. By employing this method was identified new resistance sources of cotton genotypes to fusarium cotton wilt, as the genotypes FM 993, Stoneville LA 887, CNPA GO 2002-3778, and HS 26 among 64 accessions inoculated with a Brazilian pathogen population sample.
A murcha-de-fusário, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f.sp. vasinfectum, é uma das principais doenças do algodoeiro em todo o mundo. Apesar da baixa incidencia da doença no cerrado, principal região produtora do Brasil, a murcha-de-fusário tem preocupado os produtores de algodão na região em virtude de ser potencialmente destrutiva. A tática de manejo da doença mais desejável é o uso de cultivares resistentes. Neste trabalho desenvolveu-se um método para seleção de genótipos de algodoeiro, que consistiu no plantio de sementes de algodoeiro em bandejas de plástico para germinação, que foram dispostas em casa-de-vegetação climatizada. As células das bandejas foram preenchidas com vermiculita esterilizada, e em cada célula foi plantada uma semente. Aos 5 e 7 dias após o plantio, depositou-se, em cada célula, uma suspensão de esporos. Foram testados 64 genótipos de algodoeiro com intuito de avaliar a sua resistência à murcha-de-fusário. O uso desse método possibilitou a identificação de novas fontes com alta resistência a murcha-de-fusário, como os genótipos FM 993, Stoneville LA 887,CNPA GO 2002-3778 e HS 26.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2018-08-01T17:33:51Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maythsulene Inácio de Sousa Oliveira - 2015.pdf: 3135445 bytes, checksum: a08e11c7f2df635f3ff7726cfde58f49 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
Common bean (Phaseolus vulgaris L.) is grown in Brazil in three different cropping seasons, and in diverse agroecosystems. In such different environments, the crop is exposed to several constraints responsible for yield losses, such as pathogenic organisms. Among common bean relevant diseases, fusarium wilt (Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli), dry root-rot (Fusarium solani) and Curtobacterium wilt (Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens) have similar symptoms, hindering diagnosis in the field, and whose identification in seed health testing is also limited. In both cases, identification at species level is an important step to manage this root pathogen complex, whose detection can be improved by molecular biology tools. Therefore, this study aimed to: 1) to develop and validate a multiplex PCR (m-PCR) method for simultaneous identification of three common bean pathogens, F. oxysporum f. sp. phaseoli, F. solani and C. flaccumfaciens pv. flaccumfaciens; and 2) develop an isothermal amplification of DNA (LAMP) method to detect of F. oxysporum f. sp. phaseoli on seeds. M-PCR method was developed for identification of isolated colonies, as well as infected seeds. In seeds, total DNA was obtained by alkaline lysis method, which inactivates nucleases during the extraction process. M-PCR allowed the identification of all pathogens, with detection of C. flaccumfaciens pv. flaccumfaciens, F. oxysporum f. sp. phaseoli and F. solani amplicons in agarose gel with respectively 306, 609 and 143 base pairs. Furthermore, m-PCR also reduced costs and time to detect Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli from 10 days to three hours. It was not possible to develop an optimized protocol for detection of F. oxysporum f. sp. phaseoli by the LAMP method, using only the tf1 gene for design of primers, since such primers were functional only for amplifying large amounts of target DNA. Based on the negative results with LAMP, it is suggested that further studies should be performed using other DNA sequences available in GenBank database.
O feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris L.) é cultivado durante todo o ano no território brasileiro, em três épocas distintas e em vários agroecosistemas. Nestes ambientes distintos, a cultura está exposta a diversos fatores que causam perdas de rendimento, como o ataque de patógenos. Dentre as doenças do feijoeiro-comum encontram-se a murcha-de-fusarium (Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli), a podridão-radicular-seca (Fusarium solani) e a murcha-de-curtobacterium (Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens) que apresentam sintomas semelhantes, dificultando seu diagnóstico no campo, e cuja identificação em testes de sanidade de sementes também é limitada. Em ambos os casos, a identificação em nível de espécie é uma importante etapa do manejo deste complexo de patógenos, cuja detecção pode ser aperfeiçoada com a adoção de ferramentas de biologia molecular. Portanto, este estudo teve como objetivos: 1) Desenvolver e validar um método de multiplex PCR (m-PCR) para identificação simultânea de três espécies de patógenos do feijoeiro-comum, F. oxysporum f. sp. phaseoli, F. solani e C. flaccumfaciens pv. flaccumfaciens; e 2) desenvolver a técnica de amplificação isotérmica de DNA (LAMP) para detecção de F. oxysporum f. sp. phaseoli em sementes. O método de m-PCR foi desenvolvido para identificação de colônias isoladas bem como sementes infectadas. Nas sementes, o DNA total foi obtido pela lise alcalina, método que inativa nucleases durante o processo de extração. A m-PCR possibilitou a identificação de todos os patógenos, com detecção de C. flaccumfaciens pv. flaccumfaciens, F. oxysporum f. sp. phaseoli e F. solani em bandas formadas em gel de agarose respectivamente com 306, 609 e 143 pares de base. Além disso, a extração do DNA total das sementes pela lise alcalina em combinação com a m-PCR também possibilitou redução de custos e tempo de realização do diagnóstico de Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli, de 10 dias para três horas. Não foi possível estabelecer um protocolo otimizado para detecção de F. oxysporum f. sp. phaseoli pelo método LAMP, utilizando somente o gene tf1 para desenho dos iniciadores, uma vez que, os iniciadores revelaram-se funcionais apenas para a amplificação com grandes quantidades de DNA alvo. Diante dos resultados obtidos com LAMP, sugere-se que estudos posteriores sejam realizados empregando outras sequências de DNA disponíveis no banco de dados GenBank.

ARAÚJO, Linda Brenna Ribeiro. Potencial genético de variedades tradicionais de feijão-caupi e avaliação para resistência à murcha-de-Fusarium. 2017. 80 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia/Fitotecnia) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017.
Submitted by Deocleciano Xavier (dixavier.ufc@gmail.com) on 2017-08-21T18:35:50Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Linda Brenna R Araújo_FINAL.pdf: 1356498 bytes, checksum: b4e907dfc4ac85e53f13d1e09c6d0d55 (MD5)
Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2017-08-29T20:36:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Linda Brenna R Araújo_FINAL.pdf: 1356498 bytes, checksum: b4e907dfc4ac85e53f13d1e09c6d0d55 (MD5)
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Traditional varieties are an important source of germplasm for several crops, and may present alleles that have long been lost, such as those that confer resistance to biotic and abiotic stresses. In the state of Ceará, the cultivation of the cowpea is highlighted because it is mainly carried out by family farmers who make use of these varieties, and their great adaptation to the region of cultivation and to the management adopted by the farmers can be used in the development of cultivars that better meet their demands. Thus, this work was carried out to evaluate the genetic potential of traditional varieties of cowpea collected from family farmers in the state of Ceará. In order to achieve this objective, laboratory analyzes, field and greenhouse tests were carried out. The laboratory analyzes consisted of the evaluation of the genetic diversity of the varieties through ISSR markers. The field experiments consisted of tests for the evaluation of morphological and agronomic descriptors in two environments: Fortaleza and Madalena, in the state of Ceará. The experiment in greenhouse was conducted to evaluate the existence of sources of resistance to Fusarium wilt by the root-dipping inoculation method. The ISSR markers selected for the study were efficient in identifying the genetic variability of the species, presenting high values of polymorphism and polymorphism information content (PIC). Even so, the genetic distance found between the studied varieties ranged from 0,05 to 0,31, values considered low and that suggest a narrow genetic base of the species. Some traditional varieties evaluated showed higher grain yield than commercial cultivars for the evaluated environments (3286.66 tons/ha), indicating a high agronomic potential and a great environmental adaptation. They presented greater genetic variability for the morphological characters evaluated, when compared to the molecular data. Regarding the severity of the disease, the varieties formed three distinct groups. The group with the lowest severity of the disease (25,00 to 32,50 %) consisted of thirty-seven varieties, the second group with intermediate values of severity (33,75 to 37,50 %) consisted of eight varieties and in the third Group were the five varieties that presented the highest values of severity (41,25 to 51,25 %). The varieties with the best results for agronomic traits, resistance to Fusarium wilt and greater genetic distance are promising for use in breeding programs.
As variedades tradicionais constituem importante fonte de germoplasma para diversas culturas, podendo apresentar alelos há muito perdidos, como os que conferem resistência a estresses bióticos e abióticos. No estado do Ceará, o cultivo do feijão-caupi tem destaque por ser realizado principalmente por agricultores familiares que fazem uso dessas variedades, e a grande adaptação delas à região de cultivo e ao manejo adotado pelos agricultores pode ser utilizada no desenvolvimento de cultivares que atendam melhor às suas demandas. Assim, objetivou-se com esse trabalho avaliar o potencial genético e a resistência à murcha-de-Fusarium de variedades tradicionais de feijão-caupi coletadas junto a agricultores familiares no estado do Ceará. Para se alcançar tal objetivo foram realizadas análises em laboratório, ensaios em campo e em casa de vegetação. As análises em laboratório constaram da avaliação da diversidade genética das variedades através de marcadores ISSR. Os experimentos de campo constaram de ensaios para a avaliação de descritores morfológicos e agronômicos em dois ambientes: Fortaleza e Madalena, no estado do Ceará. O ensaio em casa de vegetação foi realizado para avaliar a existência de fontes de resistência à murcha-de-Fusarium através do método de dipping. Os marcadores ISSR selecionados para o estudo foram eficientes na identificação da variabilidade genética dos genótipos, apresentando altos valores de polimorfismo e conteúdo de informação polimórfica (PIC). Ainda assim, a distância genética encontrada entre as variedades estudadas variou de 0,05 a 0,31, valores considerados baixos e que sugerem uma estreita base genética dos genótipos avaliados. Algumas variedades tradicionais avaliadas apresentaram produtividade de grãos superior às cultivares comerciais para os ambientes avaliados (3286,66 ton/ha), o que indica um alto potencial agronômico e uma grande adaptação ambiental. Elas apresentaram maior variabilidade genética para os caracteres morfológicos avaliados, quando comparados aos dados moleculares. Com relação à severidade da doença, as variedades formaram três grupos distintos. O grupo com a menor severidade da doença (25,00 a 32,50 %) foi constituído por trinta e sete variedades, o segundo grupo com valores intermediários de severidade (33,75 a 37,50 %) foi constituído por oito variedades e no terceiro grupo ficaram as cinco variedades que apresentaram os maiores valores de severidade (41,25 a 51,25 %). As variedades com melhores resultados para os caracteres agronômicos, de resistência à murcha-de-Fusarium e maior distância genética são promissoras para uso em programas de melhoramento genético.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T13:17:49Z No. of bitstreams: 1 Josiene Silva Veloso.pdf: 976122 bytes, checksum: 7669da38d458979fe12860f67c3c1a9c (MD5)
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Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
The cowpea (Vigna unguiculata) is grown predominantly in the North and Northeast of brazil, with low yields due to a variety of factors, including the fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f. sp. tracheiphilum. The present study aimed to characterize isolates of F. oxysporum associated with wilt in cowpea through observations of morphological characters, pathogenicity test and analysis of sequences of the translation elongation factor 1-α (tef1) gene. The colony color of the isolates varied from white to violet with dense aerial mycelium. The microconidia were oval to ellipsoid, slightly curved and unicelular, arranged in false heads formed on short monophyalides. The macroconidiaformed on sporodochia were falcate, slightly curved with three to five septa. Of the 27 isolates of F. oxysporum analyzed 20 were pathogenic to cowpea, causing disease with severity ranging from 1 to 99%. The neighbor-joining analysis based on tef1 grouped the isolates into six haplotypes that were not correlated with pathogenicity.. It is suggested from the results of the present study that f. sp. tracheiphilum represents at least three phylogenetic lineages behaving as polyphyletic and paraphyletic, indicating they have independent evolutionary origins.
O Feijão-caupi é uma leguminosa cultivada predominantemente nas regiões Norte e Nordeste do brazil , apresentando baixo rendimento devido a uma diversidade de fatores, dentre eles a murcha-de-fusário, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. tracheiphilum. O presente estudo teve como objetivo caracterizar isolados de F. oxysporum associados à murcha em feijão-caupi por meio de observações de caracteres morfológicos, teste de patogenicidade e análise de sequencias do gene fator de elongação 1-α (tef1). Os isolados apresentaram coloração variando do branco ao violeta com micélio aéreo bastante denso. Os microconídios apresentaram formato oval a elipsóide, ligeiramente curvado e sem septo, dispostos em falsas cabeças produzidos em monofiálides curtas. Os macroconídios formados em esporodóquios apresentaram formato falcado, ligeiramente curvado com três a cinco septos. Dos 27 isolados de F. oxysporum analisados 20 se mostraram patogênicos ao feijão-caupi, causando doença com severidade variando de 1 a 99%. A análise de neighbor-joining baseada na região tef1 agrupou os isolados em seis haplótipos independentemente de serem ou não patogênicos. Pode-se sugerir a partir dos resultados obtidos no presente estudo que a f. sp. tracheiphilum representa pelo menos três linhagens filogenéticas comportando-se como polifilética e parafilética, indicando assim terem origens evolucionárias independentes.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-20T13:53:01Z No. of bitstreams: 1 Denise de Santana Silva.pdf: 550225 bytes, checksum: ad8bfba40464a81bb730c91685eba898 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-02-20T13:53:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Denise de Santana Silva.pdf: 550225 bytes, checksum: ad8bfba40464a81bb730c91685eba898 (MD5) Previous issue date: 2009-01-23
Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
Heliconias are the most cultivated flowers in tropical floriculture of the Brazil northeast, due to its characteristics like beauty, exotic, exuberant colors and rusticity, but its yield has being affected by Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense. The present study had how objective to determine the genetic diversity existing between the isolates of F. oxysporum f. sp. cubense collected in heliconia and banana through the ITS region of rDNA using ARDRA (Amplified Ribossomal DNA Restriction Analysis), markers like RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). In the ARDRA analysis products amplified by ITS1 and ITS4 primers were digested by restriction enzymes Hae III, Xho I, Hind III and Eco IV by 37ºC. But only enzyme Hae III showed to be efficient a molecular marker, to analysis genetic diversity of F. oxysporum f. sp. cubense to RAPD marker was realized the Polymerase Chain Reaction (PCR) using tenoligonucleotides follow arbitrary up, only seven oligonucleotides generated a total 44 bands polymorphic with fragments varying from 100 pb to 700 pb. The two techniques used in the study genetic diversity showed high genetic variability of fungal, don’t related to with geographical region where were colleted the isolates.
As helicônias são as flores mais cultivadas dentro da floricultura tropical no Nordeste brasileiro, devido a características como beleza, exoticidade, cores exuberantes e rusticidade, porém a produção de várias espécies vem sendo afetada pela murcha de fusário, causada pelo fungo de Fusarium oxysporum f. sp. cubense. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar a diversidade genética existente entre os isolados de F.oxysporum f. sp. cubense, coletados em helicônias e bananeiras através da análise da região ITS do rDNA utilizando ARDRA (Amplified Ribossomal DNA Restriction Analysis) e marcadores do tipo RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Para a amplificação da região do rDNA, foram utilizados os primers ITS1 e ITS4 que foram digeridos pelas enzimas de restrição Hae III, Xho I, Hind III e Eco IV a 37ºC. Porém apenas a enzima Hae III, neste trabalho mostrou ser um marcador molecular eficiente,utilizada na técnica de ARDRA para estudos de diversidade genética dos isolados. Para o marcador RAPD realizou-se a Polymerase Chain Reaction (PCR) utilizando-se dez oligonucleotídeos de seqüência arbitrária, onde apenas sete oligonucleotídeos geraram um total de 44 bandas polimórficas com fragmentos que variaram de 100pb a 700pb. As duas técnicas utilizadas no estudo de diversidade genética evidenciaram alta variabilidade genética do fungo, não relacionada com as regiões geográficas onde foram coletados os isolados.

Submitted by Chaylane Marques (chaylane.marques@ufpe.br) on 2015-03-13T18:48:26Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Carolina Barbosa Malafaia.pdf: 821341 bytes, checksum: 4b8e456f19c8ffafa204bbf76f242dea (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5)
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CAPES
O tomate (Solanum lycopersicum) é uma hortaliça de grande importância econômica no Brasil que apresenta diversos problemas fitossanitários que reduzem a sua produtividade, destacando-se, dentre eles, a murcha de fusário causada pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol). As quitinases são descritas em muitas plantas como participantes na defesa contra patógenos e o seu acúmulo em tecidos vegetais inoculados poderá servir como marcador bioquímico para seleção de progênie resistente no programa de melhoramento do tomateiro. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a resistência de genótipos de tomate em relação ao isolado da raça fisiológica 2 de Fol, bem como acompanhar a influência durante a interação planta-patógeno sobre a atividade de proteínas relacionadas à patogênese (RP) das classes das quitinases. Mudas com 30 dias de idade dos genótipos Ourovivo, Viradouro, Redenção, Belmonte, BHRS e IPA-06 foram inoculadas pelo método dipping que consiste no corte de raízes e imersão na suspensão de conídios do patógeno. A avaliação foi realizada 21 dias após inoculação (dai) e os genótipos agrupados em resistentes ou sensíveis. Apenas o genótipo BHRS se comportou como resistente ao isolado da raça 2 de Fol. Para o acompanhamento da secreção de quitinases durante o processo de interação tomateiro x Fol dois genótipos, BHRS (resistente) e IPA-6 (sensível), foram avaliados quanto a secreção desta enzima extraídas dos tecido foliar e radicular com 1, 2, 4, 6, 9 e 11 dai. Observou-se maior atividade da enzima em plantas desafiadas do genótipo BHRS, principalmente no tecido radicular aos 6 dai. O genótipo BHRS poderá servir como fonte de genes de resistência à raça 2 de Fol.

The cowpea is very important for the poor populations of the North and Northeast of the Brazil. Several factors corroborate to production low of the culture, among them we can quote the disease, focusing on cowpea Fusarium wilt , caused by the fungus Fusarium oxysporum f.sp. tracheiphilum. This study aimed to evaluate the influence of incorporation of crop succession on the severity of cowpea Fusarium wilt. In all experiments we used soil without previous history of cultivation with this culture. There were no observed F. oxysporum populations indigenous in the soil. The experiments were conducted in microplots of concrete pipes containing soil artificially infested with the pathogen structures, the density of 5x103 cfu g-1 of soil. The experiment consisted of three cultivation cycles being: (i) cowpea, (ii) succession cultural and (iii) cowpea. The culture succession were: corn - MI, sorghum - SO, cotton - AL, castor - MN and sunflower - GI; legumes: Crotalaria juncea - CJ, Crotalaria spectabilis - CS, bean-pig - FP, pigeon pea Dwarf - GA, lab-lab - LA and black velvet - velvet MP and dwarf - MA. There were still some treatments: plots with cowpea without inoculum of F. o. f. sp. tracheiphilum - TEST, plots of cowpea inoculated with F. o. f. sp. tracheiphilum (cowpea) - CA, and plots infested with the pathogen in fallow system - PO. The incorporation of succession before of the cowpea planting provided a range in the disease severity of 56.67% to 26.33%. Among the legumes studied the FP and MP were the most suitable for reducing the severity of the disease and offer better grain yield. For succession crops to the OS and GI showed a greater reduction in severity of Fusarium wilt of cowpea.
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
O feijão-caupi é muito importante para as populações carentes do Norte e Nordestes brasileiro. Diversos fatores corroboram para as baixas produções da cultura, dentre eles podemos destacar as doenças, com foco à murcha-de-fusário do feijão-caupi, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f.sp. tracheiphilum. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a influência da incorporação de sucessões de cultivo na severidade da murcha-de-fusário do feijão-caupi. Em todos os experimentos utilizouse solo sem histórico anterior de cultivo com a cultura. Não foram detectadas populações autóctones de F. oxysporum no solo. Os experimentos foram conduzidos em microparcelas constituídas de manilhas de concreto contendo solo infestado artificialmente com estruturas do patógeno, na densidade de 5x103 ufc g-1 de solo. O experimento foi constituído de três ciclos de cultivos: (i) feijão-caupi, (ii) sucessões culturais e (iii) feijão-caupi. As sucessões culturais foram compostas por cultivos agrícolas: milho - MI, sorgo - SO, algodão - AL, mamona - MN e girassol - GI; leguminosas: crotalária juncea - CJ, crotalária spectabilis - CS, feijão-de-porco - FP, guandu anão - GA, lab-lab - LA e mucuna-preta - MP e mucuna-anã - MA. Constaram ainda como tratamentos: parcelas com feijão-caupi sem inóculo de F. o. f. sp. tracheiphilum - TEST, parcelas de feijão-caupi inoculadas com F. o. f. sp. tracheiphilum (caupi) CA, e parcelas Infestadas com o fitopatógeno em sistema de pousio - PO. A incorporação das sucessões antecedendo o plantio do feijão-caupi proporcionou uma amplitude na severidade da doença de 56,67% a 26,33%. Dentre as leguminosas estudadas o FP e a MP foram os mais indicados, por reduzirem a severidade da doença e apresentarem melhor produção de grãos. Para os cultivos agrícolas as sucessões com o SO e GI, apresentaram a maior redução da severidade da murcha- de-fusário do caupi.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003-04Bitstream added on 2014-06-13T20:58:39Z : No. of bitstreams: 1 silva_jc_me_botfca.pdf: 186787 bytes, checksum: 6b00fb1158e56a1f4a6f91be11738372 (MD5)
A cultura do tomateiro é severamente atacada por diversas doenças, entre elas pode-se destacar a Murcha-de-Fusário. O objetivo do presente trabalho foi o de avaliar a eficiência de isolados de Fusarium oxysporum não patogênicos (Fnp) 233, 233/1, 245, 245/1, 141/3, 251, 251/2, 251/5, 257, originários da Universidade de Torino, Itália, no controle da Murcha-de-Fusário, causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici raças 1 e 2 (Fol). Os isolados patogênicos CA4A (Fol - 1), C-21A (Fol - 2), TO11 (Fol - 2) e TO245 (Fol - 2), bem como os isolados não patogênicos, foram cultivados em meio de cultura BD (batata-dextrose) durante 10 dias à 25ºC, com agitação constante de 150rpm. Para se obter estruturas de resistência do fungo 500 ml de inóculo líquido de cada isolado de Fnp foram adicionados em 1000 g de talco e incubados durante 30 dias. Com o intuito de verificar a patogenicidade dos isolados CA4A, C-21A, TO11 e TO245, plântulas de tomateiro cv. Viradoro foram transplantadas para substrato infestado com inóculo líquido nas concentrações de Fol de 103, 104, 105 e 106 conídios mL-1. Após 35 dias do transplante, as mudas foram avaliadas quanto a severidade da doença (Notas variando entre 1 a 6, onde: 1 planta sadia e 6 planta morta), a altura e as massas secas do sistema radicular e da parte aérea das plantas. As concentrações de 106 e 105 conídios mL-1 dos isolados de Fol promoveram a maior severidade da doença, quando comparadas com a testemunha não inoculada. Após determinar a concentração do patógeno, verificou-se a atividade não patogênica dos isolados de Fnp em plantas de tomateiro onde, raízes foram imersas em uma suspensão de conídios dos... .
The tomato is severely is affected by several diseases, among them may be detached the Fusarium wilt. The objective this present research was to evaluate the efficacy of the nonpathogenic Fusarium oxysporum strains (Fnp) 233, 233/1, 245, 245/1, 141/3, 251, 251/2, 251/5, 257, from the University of Torino, Italy, on the control of Fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol) races 1 and 2. The pathogenic strains CA4A race 1, C-21A race 2, TO11 race 2 and TO245 race 2, as well the nonpathogenic strains were growing in liquid media PD (potato-dextrose) during 10 days at 25ºC, with constant agitation at 150 rpm. To obtain resistant structure of the fungi 500 mL of the liquid inoculum with each the Fnp strain were mixed in 1000 g of talc and incubated for 30 days. To evaluate the pathogenic activity of the strains: CA4A (Fol - 1), C-21A (Fol - 2), TO11 (Fol - 2) e TO245 (Fol - 2), tomato seedlings cv. Viradoro susceptible to race 2 of the pathogen were transplanted into the infested substrate with inoculum suspension in the concentrations of Fol 103, 104, 105 e 106 conidia mL-1. After 35 days of the seedlings transplantation were evaluated the disease severity (Notes between 1 and 6, where: 1 health plant e 6 died plant), the height plants and the weight dry material of the root system and aerial part of the plants. The concentrations 106 e 105 conidia mL-1 of the strains de Fol increased the higher severity, when compared with non inoculated plants. After determination the concentration of the pathogen, observed the nonpathogenic activity of the Fnp strains in tomato plants where, roots were dipped in a conidial suspension in the concentration of the 106 conidia mL-1. The plants were growing into pots for the 500 mL capacity of the substrate and after 35 days of the growing in greenhouse were realized the evaluations. The plant... (Complete abstract, click electronic address below).

Orientador: Wagner Bettiol
Resumo: A cultura do tomateiro é severamente atacada por diversas doenças, entre elas pode-se destacar a Murcha-de-Fusário. O objetivo do presente trabalho foi o de avaliar a eficiência de isolados de Fusarium oxysporum não patogênicos (Fnp) 233, 233/1, 245, 245/1, 141/3, 251, 251/2, 251/5, 257, originários da Universidade de Torino, Itália, no controle da Murcha-de-Fusário, causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici raças 1 e 2 (Fol). Os isolados patogênicos CA4A (Fol - 1), C-21A (Fol - 2), TO11 (Fol - 2) e TO245 (Fol - 2), bem como os isolados não patogênicos, foram cultivados em meio de cultura BD (batata-dextrose) durante 10 dias à 25ºC, com agitação constante de 150rpm. Para se obter estruturas de resistência do fungo 500 ml de inóculo líquido de cada isolado de Fnp foram adicionados em 1000 g de talco e incubados durante 30 dias. Com o intuito de verificar a patogenicidade dos isolados CA4A, C-21A, TO11 e TO245, plântulas de tomateiro cv. Viradoro foram transplantadas para substrato infestado com inóculo líquido nas concentrações de Fol de 103, 104, 105 e 106 conídios mL-1. Após 35 dias do transplante, as mudas foram avaliadas quanto a severidade da doença (Notas variando entre 1 a 6, onde: 1 planta sadia e 6 planta morta), a altura e as massas secas do sistema radicular e da parte aérea das plantas. As concentrações de 106 e 105 conídios mL-1 dos isolados de Fol promoveram a maior severidade da doença, quando comparadas com a testemunha não inoculada. Após determinar a concentração do patógeno, verificou-se a atividade não patogênica dos isolados de Fnp em plantas de tomateiro onde, raízes foram imersas em uma suspensão de conídios dos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo).
Abstract: The tomato is severely is affected by several diseases, among them may be detached the Fusarium wilt. The objective this present research was to evaluate the efficacy of the nonpathogenic Fusarium oxysporum strains (Fnp) 233, 233/1, 245, 245/1, 141/3, 251, 251/2, 251/5, 257, from the University of Torino, Italy, on the control of Fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol) races 1 and 2. The pathogenic strains CA4A race 1, C-21A race 2, TO11 race 2 and TO245 race 2, as well the nonpathogenic strains were growing in liquid media PD (potato-dextrose) during 10 days at 25ºC, with constant agitation at 150 rpm. To obtain resistant structure of the fungi 500 mL of the liquid inoculum with each the Fnp strain were mixed in 1000 g of talc and incubated for 30 days. To evaluate the pathogenic activity of the strains: CA4A (Fol - 1), C-21A (Fol - 2), TO11 (Fol - 2) e TO245 (Fol - 2), tomato seedlings cv. Viradoro susceptible to race 2 of the pathogen were transplanted into the infested substrate with inoculum suspension in the concentrations of Fol 103, 104, 105 e 106 conidia mL-1. After 35 days of the seedlings transplantation were evaluated the disease severity (Notes between 1 and 6, where: 1 health plant e 6 died plant), the height plants and the weight dry material of the root system and aerial part of the plants. The concentrations 106 e 105 conidia mL-1 of the strains de Fol increased the higher severity, when compared with non inoculated plants. After determination the concentration of the pathogen, observed the nonpathogenic activity of the Fnp strains in tomato plants where, roots were dipped in a conidial suspension in the concentration of the 106 conidia mL-1. The plants were growing into pots for the 500 mL capacity of the substrate and after 35 days of the growing in greenhouse were realized the evaluations. The plant... (Complete abstract, click electronic address below).
Mestre

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-10T15:46:17Z No. of bitstreams: 1 Frederick Mendes Aguiar.pdf: 412210 bytes, checksum: 4f5f91c02dea9d844bac53a51c2cafa0 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-03-10T15:46:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Frederick Mendes Aguiar.pdf: 412210 bytes, checksum: 4f5f91c02dea9d844bac53a51c2cafa0 (MD5) Previous issue date: 2011-02-24
Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
Okra is a vegetable crop with high nutritional value, being a rich source of vitamins and mineral salts. Fusarium wilt (caused by Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum – FOV) is one of the major field diseases of okra in tropical areas. In the present work, 53 okra accessions and the commercial cultivar Santa Cruz 47 were evaluated aiming to identify sources of resistance to Brazilian FOV isolates and to study the resistance stability of the selected accessions to different pathogen isolates. An initial screening was carried out with only one FOV isolate (Fus-194). In the second assay, thirty-three accessions identified in the first screening were re-evaluated in two assays (in two different seasons) using two FOV isolates (Fus-194 and Fus-201). The resistance evaluation was carried out with 21 day-old plantlets, using the root-dipping inoculation procedure, utilizing a spore suspension of 1x106 conidia/mL. The evaluation was done using a disease severity grade system with grades ranging from 0 to 4. These grades were used to generate a disease index that was employed for clustering the accessions according to their reaction to FOV. In the evaluation carried out in August (average temperature of 19,8°C) only 12 out the 32 accessions (i.e. 37%) were rated as having high to intermediate resistant response to Fus-194 isolate. Only 28% of the accessions were classified within the high to intermediate resistance cluster when using the Fus-201 isolate. In the assay carried out in October (higher temperatures) 72% of the accessions were classified as resistant and intermediate resistant to Fus-194 isolate, whereas 32% were resistant to isolate Fus-201. Our results indicated that the Fus-201 isolate was more aggressive than Fus-194. Comparative analysis of the assays indicated that the overall aggressiveness of the isolates was higher in August than in October assay. The accessions BR-2399 and BR-1449 as well as the commercial cultivar Santa Cruz 47 were the most promising accessions displaying higher levels of stable resistance against the two Brazilian FOV isolates.Okra is a vegetable crop with high nutritional value, being a rich source of vitamins and mineral salts. Fusarium wilt (caused by Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum – FOV) is one of the major field diseases of okra in tropical areas. In the present work, 53 okra accessions and the commercial cultivar Santa Cruz 47 were evaluated aiming to identify sources of resistance to Brazilian FOV isolates and to study the resistance stability of the selected accessions to different pathogen isolates. An initial screening was carried out with only one FOV isolate (Fus-194). In the second assay, thirty-three accessions identified in the first screening were re-evaluated in two assays (in two different seasons) using two FOV isolates (Fus-194 and Fus-201). The resistance evaluation was carried out with 21 day-old plantlets, using the root-dipping inoculation procedure, utilizing a spore suspension of 1x106 conidia/mL. The evaluation was done using a disease severity grade system with grades ranging from 0 to 4. These grades were used to generate a disease index that was employed for clustering the accessions according to their reaction to FOV. In the evaluation carried out in August (average temperature of 19,8°C) only 12 out the 32 accessions (i.e. 37%) were rated as having high to intermediate resistant response to Fus-194 isolate. Only 28% of the accessions were classified within the high to intermediate resistance cluster when using the Fus-201 isolate. In the assay carried out in October (higher temperatures) 72% of the accessions were classified as resistant and intermediate resistant to Fus-194 isolate, whereas 32% were resistant to isolate Fus-201. Our results indicated that the Fus-201 isolate was more aggressive than Fus-194. Comparative analysis of the assays indicated that the overall aggressiveness of the isolates was higher in August than in October assay. The accessions BR-2399 and BR-1449 as well as the commercial cultivar Santa Cruz 47 were the most promising accessions displaying higher levels of stable resistance against the two Brazilian FOV isolates.
O quiabo é uma hortaliça de alto valor alimentício e uma importante fonte de vitaminas e sais minerais. Dentre os problemas fitossanitários que ocorrem no quiabeiro, a murcha-de-fusário, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum (FOV) é uma das mais importantes por proporcionar grandes perdas na produção. Este trabalho objetivou avaliar, em condições de casa de vegetação, a cultivar comercial Santa Cruz 47 e uma coleção de 53 acessos de quiabeiro, visando identificar fontes de resistência a FOV e analisar a estabilidade da resistência de acessos promissores a diferentes isolados do patógeno. Inicialmente foi conduzida uma triagem utilizando um único isolado de FOV (Fus-194). Em uma segunda etapa, trinta e dois acessos obtidos na primeira etapa, foram reavaliados para resistência ao FOV utilizando dois isolados (Fus-194 e Fus-201), em duas épocas do ano. A inoculação foi realizada em mudas com 21 dias após semeadura, pela imersão das raízes em suspensão de conídios (1x106 conídios/mL) do patógeno. A avaliação da severidade da doença foi realizada usando uma escala de notas, variando de 0 a 4. As notas foram transformadas em índice de doença (ID) e agrupadas em classes de acordo com a reação da doença. Na segunda etapa do trabalho realizado no mês de agosto de 2010 (temperatura média de 19,8°C), dos 32 acessos avaliados, 12 (37%) foram considerados altamente resistentes a medianamente resistentes ao Fus-194. Para o isolado Fus-201 apenas 28% foram classificados dentro dessas duas classes. No ensaio realizado no mês de outubro (temperatura média de 25°C) referente à segunda etapa desse trabalho, 72% dos acessos foram considerados medianamente a altamente resistentes ao Fus-194. Neste ensaio, 32% dos acessos foram resistentes ao isolado Fus-201. Os resultados demonstraram uma maior agressividade do isolado Fus-201 em relação ao isolado Fus-194. Os níveis de agressividade dos isolados testados foram maiores no ensaio realizado no mês de agosto do que em outubro. Os acessos BR-2399, BR-1449 e a cultivar Santa Cruz 47 apresentaram resistência estável aos dois isolados do patógeno tanto na etapa preliminar, quanto nas duas épocas de avaliação da segunda etapa do trabalho.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2017.
Made available in DSpace on 2017-10-03T04:21:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 349731.pdf: 958802 bytes, checksum: af7a648dfcfc9da10a4ea89c52799b05 (MD5) Previous issue date: 2017
A Murcha de Fusarium (MF), causada por Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli (Fop), é uma das principais doenças do feijoeiro. Embora a resistência genética seja a sua principal forma de controle, o desenvolvimento e lançamento de novas cultivares tem sido dificultado pela variabilidade do patógeno. Neste cenário, novas alternativas de controle precisam ser consideradas. O presente trabalho teve por objetivo avaliar o potencial de compostos bioativos e fermentados de algas marinhas no controle da MF do feijoeiro, bem como seu efeito na emergência de plântulas. Inicialmente, quinze compostos foram testados em casa-de-vegetação usando tratamentos de semente, solo e folha. As sementes foram embebidas por 4 h antes da semeadura, enquanto que a irrigação do solo e a pulverização foliar foram realizadas em plantas com as primeiras folhas totalmente expandidas, aos 12 dias após a semeadura. Dentre os compostos testados, somente a ulvana reduziu a intensidade da doença quando pulverizada sobre as folhas e aumentou a emergência de plântulas quando embebida via semente. Em um segundo experimento, foi comparado o efeito da frequência de pulverizações de ulvana no progresso da doença e na colonização do fungo. Adicionalmente, foi testado o efeito do tratamento de semente com ulvana na emergência de plântulas em solo infestado com Fop, esterilizado/não-infestado e não-esterilizado/não-infestado. Uma, duas ou três aplicações de ulvana similarmente protegeram as plantas de feijão contra Fop até o terceiro trifólio expandido. A partir deste estádio, Fop eficientemente colonizou epicótilos de feijão independente do tratamento. A pulverização foliar de ulvana reduziu o progresso da doença comparado as plantas controle, mas não afetou a intensidade final no estádio de enchimento de vagens. Ulvana aumentou a emergência de plântulas em todas as condições testadas, mostrando ser um eficiente tratamento promotor de crescimento no feijão.

Abstract : The Fusarium wilt (Fw), caused by Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli (Fop), is one of the most diseases of common bean worldwide. Although the genetic resistance have been the main recommended measure, the development and release of new bean cultivars has been difficult because of the high pathogen variability. In this scenario, new strategies of disease control need to be encouraged. The present study was aimed at evaluating the potential of bioactive compounds and fermented seaweeds in controlling the bean Fw as well as their effect in seedling emergence. Initially, fifteen compounds were screened under greenhouse conditions by using seed, soil and leaf treatments. Seed soaking was carried out for 4 hours previous to sowing, whereas soil irrigation or foliar spraying were performed at the first leaf growth stage (12 days after sowing). Among the tested compounds, only ulvan reduced disease intensity when sprayed onto leaves and increased seedling emergence when soaked in seeds. The effect of ulvan spray frequency was analyzed in follow-up assays on Fw progress and fungal colonization. In addition, seedling emergence was tested in Fop-infested soil, sterilized/non-infested and non-sterilized/non-infested. One, two or three applications of ulvan similarly protected bean plants until the third trifoliate leaf stage. From this stage, Fop efficiently colonized epicotyls of bean plants independently of treatment. Foliar spraying of ulvan reduced disease progress compared to control but did not affect the final intensity at pod filling growth stage. Ulvan showed to be an effective growth-promoting treatment by increased seedling emergence in all tested conditions.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-09-03T13:56:52Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 334287 bytes, checksum: df1e61532c2f6aab384cf8621f7e550c (MD5)
Made available in DSpace on 2018-09-03T13:56:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 334287 bytes, checksum: df1e61532c2f6aab384cf8621f7e550c (MD5) Previous issue date: 2017-12-18
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
O feijoeiro-comum é suscetível à várias doenças, dentre elas a murcha-de-Fusarium. A murcha-de-Fusarium é uma doença muito presente nas áreas de plantio de feijão e pode levar a perdas de até 100%. Além da resistência a doenças, o objetivo do melhoramento do feijoeiro é a obtenção de linhagens que sejam produtivas, com arquitetura de plantas ereta e grãos comercialmente aceitáveis. Assim, o objetivo deste trabalho foi a seleção de famílias endogâmicas de feijoeiro, visando a extração de linhagens superiores quanto à resistência a murcha-de-Fusarium, arquitetura de plantas, aspecto comercial de grãos e produtividade. As famílias avaliadas foram provenientes de duas populações selecionadas a partir de um conjunto de híbridos oriundos de um cruzamento dialélico. As populações oriundas dos cruzamentos CVIII 8511 x VC 25 (população 1) e Pérola x VC 25 (população 2) foram as que se mostraram promissoras quanto a produtividade de grãos e resistência à murcha-de-Fusarium. Noventa famílias oriundas da população 1 e 34 famílias oriundas da população 2 juntamente com 7 testemunhas (genitores e variedades comerciais) foram avaliadas por três gerações/safras (F 2:3 , F 2:4 e F 2:5 ) em experimentos de campo. As características avaliadas foram dias da emergência ao florescimento (DEF), arquitetura de plantas (ARQ), produtividade de grãos (PROD), aspecto comercial de grãos (GRÃO), severidade de murcha-de-Fusarium (FUS), crestamento bacteriano (CREST) e mofo-branco (MOFO). Os dados obtidos foram analisados utilizando-se metodologia de modelos mistos. Observou-se significância para o efeito de famílias sobre a maioria dos caracteres, com exceção de DEF, ARQ (F 2:5 ) e PROD (F 2:5 ), o que indica variabilidade genética entre as famílias avaliadas. Por meio do índice de seleção FAI-BLUP ranqueou-se as 124 famílias com o intuito de selecionar as 20 melhores que sofrerão extração de linhagens. A partir das 20 famílias selecionadas foram estimados, para todos os caracteres significativos, ganhos de seleção direta (- 5.73% a -27.36%) e simultânea pelo FAI-BLUP (-0.15% a -9.34%). As 124 famílias foram agrupadas pelo método de Tocher em 3 grupos de diversidade e um destes grupos foi dividido em 30 subgrupos pelo mesmo método. As 20 famílias selecionadas pelo índice foram alocadas em 11 subgrupos de dissimilaridade genética, o que mostra que o índice considera, em parte, a diversidade genética na seleção. As 20 melhores e as 20 piores famílias também apresentaram diversidade genética pelo gráfico biplot. Assim, conclui-se que as populações oriundas dos cruzamentos CVIII 8511 x VC 25 e Pérola x VC 25 apresentam potencial para a extração de linhagens superiores considerando as características resistência a murcha-de-Fusarium, arquitetura de plantas, produtividade de grãos e aspecto comercial de grãos.
Common bean is susceptible to several diseases, among them Fusarium wilt. Fusarium wilt is a very common disease in the areas of bean planting and can lead to losses of up to 100%. In addition to resistance, bean breeding seeks for lineages that are productive, with erect plant architecture and commercially acceptable grains. Thus, the objective of this work was the identification of inbred families of common bean, aiming the extraction of superior inbred lines considering resistance to Fusarium wilt, plant architecture, grain commercial aspect and grain yield. The families evaluated were obtained from two populations selected from a set of hybrids originated from a diallel cross. The populations obtained from the crosses CVIII 8511 x VC 25 (population 1) and Pérola x VC 25 (population 2) were the ones that showed potential regarding grain yield and resistance to Fusarium wilt. Ninety population 1 inbred families and 34 population 2 inbred families along with 7 controls (breeders and commercial varieties) were evaluated in three field harvests / generations (F 2:3 , F 2:4 and F2 :5 ). The evaluated characteristics were days of emergence to flowering (DEF), plant architecture (ARQ), grain yield (PROD), commercial aspect of grain (GRÃO), and severity of Fusarium wilt (FUS), bacterial blight (CREST) and white-mold (MOFO). The data obtained were analyzed using a mixed model methodology. Significance was observed for the effect of families on most of the characters except for DEF, ARQ (F 2:5 ) and PROD (F 2:5 ). This indicates genetic variability among the evaluated families. Using the FAI-BLUP selection index, the 124 families were ranked in order to select the 20 best that will undergo inbred line extraction. From the 20 families selected, considering all the significant characters, direct selection gains (-5.73% to -27.36%) and simultaneous FAI- BLUP gains (-0.15% to -9.34%) were estimated. The 124 families were grouped by the Tocher method into 3 diversity groups and one of these groups was divided into 30 subgroups by the same method. The 20 families selected by the index were allocated in 11 subgroups of genetic dissimilarity, which shows that the index considers the genetic diversity in the selection. The 20 best and the 20 worst families also presented genetic diversity by the biplot graph. Therefore, it is concluded that the populations obtained from the crossings CVIII 8511 x VC 25 and Pérola x VC 25 shows potential for the extraction of superior inbred lines considering resistance to Fusarium wilt, plant architecture, grain commercial aspect and grain yield.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-04-22T10:42:12Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2175949 bytes, checksum: cbe19c7e16e1d8e5f10097aa9663d4f9 (MD5)
Made available in DSpace on 2016-04-22T10:42:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2175949 bytes, checksum: cbe19c7e16e1d8e5f10097aa9663d4f9 (MD5) Previous issue date: 2015-11-16
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
O melhoramento do feijoeiro para a obtenção de cultivares resistentes é a estratégia mais efetiva e econômica contra fitopatógenos, sobretudo habitantes de solo, onde o controle químico é inexistente e práticas culturais ineficientes. Os objetivos com este trabalho foram: i) estimar a capacidade geral e específica de combinação de genitores visando melhoramento do feijoeiro para resistência à murcha-de-fusarium (Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli - Fop) com base na severidade da doença e redução do crescimento da planta, ii) estudar a herança da resistência do feijoeiro-comum à murcha-de-fusarium a partir de sete cruzamentos contrastantes e iii) transformação genética de Fop e uso desses transformantes para analisar o processo de colonização em tecidos do feijoeiro. Oito genótipos de feijoeiro grupo carioca foram combinados em esquema de dialelo parcial (3 x 5). Os genitores e 15 híbridos F1’s foram avaliados quanto a severidade da murcha-de- fusarium isolado FOP UFV 01, porcentagem de redução da altura e da massa fresca de parte aérea da planta e produtividade de grãos. A resistência do feijoeiro a Fop é controlada por poucos genes dominantes, enquanto a redução do crescimento da planta é governada por um conjunto diferente de genes, incluindo genes dominantes e recessivos. A redução do crescimento da planta, como resposta de suscetibilidade a Fop, aumentou a eficácia na seleção de genitores visando o melhoramento do feijoeiro para resistência à murcha-de-fusarium. A população segregante oriunda do cruzamento VC 25 / CVIII 8511 // VC 25 / Pérola, é promissora visando o melhoramento do feijoeiro para os caracteres produtividade de grãos, resistência à murcha-de-fusarium e redução do crescimento. Para o estudo de herança da resistência a Fop isolado FOP UFV 01, 210 plantas de cada população F2 resultante dos sete cruzamentos contrastantes do dialelo parcial foram avaliadas individualmente quanto à severidade da murcha-de-fusarium. Duas classes marcantes (resistente e suscetível) foram observadas nos parentais e gerações F1 e F2 dos cruzamentos, indicando herança oligogênica da resistência. A partir da segregação da geração F2, houve contraste entre as metodologias, porém pelos estimadores de máxima verossimilhança, metodologia mais adequada, conclui-se que a resistência é governada por um gene dominante de efeito maior com a presença de poligenes. Altas estimativas de herdabilidade indicam maiores chances de sucesso com a seleção. Por retrocruzamentos é possível à transferência do gene dominante de efeito maior das fontes de resistência deste trabalho. As fontes de resistência citadas neste trabalho direcionarão o melhoramento visando à desenvolvimento de cultivares de feijoeiro com resistência durável a Fop através da piramidação do gene dominante de efeito maior e dos poligenes. Para a análise do processo de colonização de Fop em tecidos da raiz e caule do feijoeiro, Fop raça 2 brasileira foi transformado para a expressão do gene da proteína verde fluorescente (egfp). O uso combinado de Driselase e Lyzing Enzyme foi eficiente para a protoplastização de micélio de Fop. O protocolo de transformação com base em PEG- CaCl2 foi eficiente para a obtenção de transformantes estáveis com colônias expressando o gene egfp. Aos 6 dias após a inoculação (DAI), o fungo penetrou na planta via pelos radiculares e aos 11 DAI cresceu em células parenquimáticas de maneira intercelular. Aos 19 DAI, atingiu o xilema bloqueando a passagem de água e sais minerais resultando em murcha e morte da planta aos 25 dias.
Common bean improvement for development of resistant cultivars is the most effective and economic strategy against plant pathogens, especially soil inhabitants where there is not chemical control and cultural practices is an incomplete control measure. The objectives of this study were: i) to estimate the general and specific combining ability of parents for common bean breeding for resistance to Fusarium wilt (Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli - Fop), based on disease severity and reduced plant growth, ii) to study the inheritance of resistance to Fusarium wilt in common bean in seven contrasting crosses and iii) Fop genetic transformation and colonization in bean tissue. Eight bean genotypes of carioca group were combined in a partial diallel scheme (3 x 5). The parents and their 15 F1’s hybrids were evaluated for severity of Fusarium wilt, strain FOP UFV 01, percentage of height reduction and fresh weight of plant shoots and grain yield. Resistance to Fop in common bean is controlled by a few dominant genes, while the reduction in plant growth by a different set of genes, including dominant and recessive genes. Measuring the reduction in plant growth, a response of Fop susceptibility, increased the efficiency in parents selecting for common bean breeding for Fusarium wilt resistance. The segregating population, from the cross VC 25 / CVIII 8511 // VC 25 / Pérola, is promising for common bean breeding for the traits grain yield, resistance to Fusarium wilt and stunted growth. To study the inheritance of resistance to Fop strain FOP UFV 01, 210 plants of each F2 population of the seven contrasting partial diallel crosses were individually evaluated for severity of Fusarium wilt. Two prevalent classes (resistant and susceptible) were observed in parental, F1 and F2 generations of the crosses, indicating oligogenic inheritance of resistance. From the segregation of the F2 generation, there was contrast results between the methodologies, but by maximum likelihood estimators, most appropriate methodology, it is concluded that resistance is governed by a single dominant major gene with the presence of polygenes. High heritability estimates indicate higher chances of success with selection. By backcrossing is possible to transfer the major dominant gene of resistance sources of this work. Resistance sources cited in this paper will direct improvement in order to development of bean cultivars with durable resistance to Fop by pyramiding of the major gene and the polygenes. For following the Fop colonization process in bean root and stem tissues, Fop 2 Brazilian race was transformed for the green fluorescent protein gene (egfp) expression. The combined use of Driselase and Lyzing Enzyme was efficient for Fop mycelium protoplastization. The PEG-CaCl2 transformation protocol was efficient to obtain stable transformants with colonies expression the egfp gene. At 6 days post-inoculation (DPI), the fungus penetrated the plant via root hair and grew 11 DPI in parenchyma cells in a intercellular way. At 19 DAI, reached the xylem, blocked the passage of water and minerals resulting in wilting and plant death at 25 days.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-22T12:20:46Z No. of bitstreams: 1 Maria Geane Fontes.pdf: 821903 bytes, checksum: 4445cab0572746ea891f8154c542c186 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-03-22T12:20:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria Geane Fontes.pdf: 821903 bytes, checksum: 4445cab0572746ea891f8154c542c186 (MD5) Previous issue date: 2013-02-21
Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
The fusarium wilt is a major disease in tomato and cause reduction in productivity and product quality. This study aimed to evaluate the efficiency of Trichoderma species and yeasts as agents biocontrollers of fusarium wilt in tomato caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici race 3. For this, tomato seedlings at 21 days were transplanted to pots containing soil infested with 50 g of substrate colonized with F. oxysporum f. sp. lycopersici and with Trichoderma (8g/vaso). In the experiment aiming at the selection of yeast inoculation was performed by the method of root pruning where tomato seedlings at 21 days were immersed in cell suspension (1.5 x107 cells/mL) of yeast and transplanted to pots, previously infested structures with the pathogen. We also assessed the effect of different dosages of inoculum of Trichoderma (2, 4, 6, 8 and 10g) and different concentrations of yeast (104, 105, 106, 107, 108 cells/mL). The antagonistic activity of Trichoderma in vitro was assessed by base pairing in culture. Antagonism of yeast was performed by means of continuous groove, the center of the Petri dish and two discs culture medium pathogen positioned 0.2 cm from opposite ends of the plate. Of the 48 isolates of Trichoderma tested four (T25, LCB72, LCB80 and LCB 48Te) were the most effective in reducing disease severity, and the isolate T25 promoted the highest level of disease control (71.2%). The values of the effective dose for 50% reduction in disease severity (ED50), the lowest values were presented by isolated LCB 48Te (6.8 g) and LCB80 (7.2 g), indicating that they are more effective in controlling of the disease. Of the 45 tested yeasts, four (Hanseniaspora opuntia, Pichia kluyveri, P. caribbica and P. fermentans) decreased by 100% severity of fusarium wilt. The values of the effective concentration for 50% reduction in disease severity (EC50), the lowest values were presented by isolated 28FR (2.1x106 cells/mL) and 32FR (2.3x106 cells/mL), indicating they are the most effective in controlling the disease. With regard to the production of the four yeast killer phenotype presented as positive. In in vitro tests, Trichoderma T25, LCB72, LCB80 and LCB 48Te completely inhibited the pathogen, and the isolated yeast 39F2B was the most effective in inhibiting the mycelial growth of the pathogen.
A murcha-de-fusário é uma das principais doenças na cultura do tomateiro e causa redução na produtividade e qualidade do produto. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a eficiência de espécies de Trichoderma e de leveduras como agentes biocontroladores da murcha-de-fusário em tomateiro causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, raça 3. Para isto, plântulas de tomateiro aos 21 dias foram transplantadas para vasos contendo solo, infestado com 50 g de substrato colonizado com F. oxysporum f. sp. lycopersici e com os isolados de Trichoderma (8g/vaso). No experimento visando à seleção de leveduras, a inoculação foi efetuada pelo método do corte de raízes, onde plântulas de tomateiro, aos 21 dias foram imersas na suspensão de células (1,5x107 células/mL) de leveduras e transplantadas para vasos, previamente infestado com as estruturas do patógeno. Também foi avaliado o efeito de diferentes dosagens de inóculo de Trichoderma (2, 4, 6, 8 e 10g) e diferentes concentrações de leveduras (104, 105, 106, 107, 108 células/mL). A atividade antagônica de Trichoderma in vitro foi avaliada através do pareamento de cultura. O antagonismo de leveduras foi realizado, por meio de estria contínua, no centro da placa de Petri e dois discos de meio de cultura do patógeno posicionados a 0,2 cm das extremidades opostas da placa. Dos 48 isolados de Trichoderma testados quatro (T25, LCB72, LCB80 e LCB 48Te) foram os mais eficientes na redução da severidade da doença, sendo o isolado T25 o que proporcionou maior nível de controle da doença (71,2%). Quanto aos valores da dose efetiva para reduzir em 50% a severidade da doença (DE50), os menores valores foram apresentados pelos isolados LCB 48Te (6,8 g) e LCB 80 (7,2 g), indicando serem mais efetivos no controle da doença. Das 45 leveduras testadas, quatro (Hanseniaspora opuntia, Pichia kluyveri, P. caribbica e P. fermentans) reduziu em 100% a severidade da murcha-de-fusário. Quanto aos valores da concentração efetiva para reduzir em 50% a severidade da doença (CE50), os menores valores foram apresentados pelos isolados 28FR (2,1x106 células/mL) e 32FR (2,3x106 células/mL), indicando serem os mais efetivas no controle da doença. Com relação à produção do fenótipo killer as quatro leveduras se apresentaram como positivas. Nos testes in vitro os isolados de Trichoderma T25, LCB72, LCB80 e LCB 48 Te inibiram completamente o fitopatógeno, e o isolado de levedura 39F2B foi o mais eficiente na inibição do crescimento micelial do fitopatógeno

O Amarelo ou Murcha de Fusarium, causado por Fusarium oxysporum f. sp. zingiberi vem assumindo grande importância na cultura do gengibre devido à ausência de métodos eficientes de controle. Com os objetivos de testar a termoterapia associada ao tratamento químico e biológico para a obtenção de rizomas-semente sadios e avaliar a indução de supressividade do solo a Fusarium oxysporum f. sp. zingiberi com a incorporação de casca de camarão, seis ensaios foram conduzidos. Para o tratamento térmico, foram utilizados rizomas infectados, com aproximadamente 5cm de comprimento. As relações tempo-temperatura utilizadas foram: 45°C por zero, 60, 120 e 180 minutos e 50°C por zero, dez e 20 minutos (ensaio 1 e campo); 50°C por zero, 30 e 60 minutos e 55°C por zero, 10 e 20 minutos (ensaio 2); 50, 55 e 60ºC por zero, 10 e 20 min (ensaio 3). As caldas para tratamento térmico foram constituídas por água, solução de tiofanato metílico e caldo fermentado por Bacillus subtilis. No experimento em laboratório, os rizomas foram inoculados artificialmente. Após uma semana, receberam o tratamento térmico a 45º C por 60, 120 e 180 minutos e a 50ºC e 55ºC por 10e 20 minutos. Após a termoterapia, segmentos de rizoma foram plaqueados, sendo avaliados pela contagem dos segmentos que apresentavam o crescimento do patógeno. Na coleta, foram avaliadas altura, peso da matéria fresca da parte aérea e produção, e realizado o plaqueamento da parte aérea, raiz e rizoma. Para verificar a possibilidade do uso de casca de camarão, o solo foi infestado com o isolado patogênico. Após uma semana, houve a incorporação da casca de camarão ao solo nas concentrações de 0; 2,5; 5; 7,5; 10; 15 e 20% (v/v). A população de Fusarium do solo e a comunidade de actinomicetos foram avaliadas semanalmente por diluição em série e plaqueamento. Após oito semanas da incorporação, foi realizado o plantio de um rizoma-semente de gengibre por vaso. Na coleta, a avaliação foi realizada da mesma maneira que para termoterapia. Através de todos os resultados obtidos nos cinco ensaios de termoterapia, verificouse a possibilidade de utilização da técnica com sucesso no auxílio ao controle da doença. As melhores combinações tempo/temperatura foram a 45ºC pelo tempo de 120 minutos ou a 55ºC por 20 minutos em todas as caldas. No teste com o uso da casca de camarão, houve uma diminuição da população de Fusarium e aumento da comunidade de actinomicetos nos solos que receberam a incorporação de casca. A adição de casca de camarão ao solo permite o plantio do gengibre em locais onde o patógeno esteja presente.
Yellow or Fusarium Wilt, caused for Fusarium oxysporum f. sp. zingiberi comes assuming great importance in the culture of the ginger due to absence of efficient methods of control. With the objectives to test the thermotherapy associated with the chemical and biological treatment for the healthy attainment of ginger-seed and to evaluate the induction of soil suppressiveness to Fusarium oxysporum f. sp. zingiberi with the incorporation of shrimp peel, six experiments had been lead. For the thermal treatment, infested rhizome had been used, with approximately 5cm of length. The used relations time-temperature had been: 45°C for zero, 60, 120 and 180 minutes and 50°C for zero, ten and 20 minutes (experiment 1 and field); 50°C for zero, 30 and 60 minutes and 55°C for zero, 10 and 20 minutes (experiment 2); 50, 55 and 60ºC for zero, 10 and 20 min (experiment 3). Solutions for thermal treatment had been constituted by water, solution of thiophanate methylic and broth leavend for Bacillus subtilis. In the experiment in laboratory, rhizomes had been inoculated artificially. After one week, they had received the thermal treatment 45º C for 60, 120 and 180 minutes and 50ºC and 55ºC for 10 and 20 minutes. After the thermal treatment, segments of rhizomes had been placed in plates, being evaluated for the counting of the segments that presented the growth of the pathogen. In the collection, height, weight of the aerial part and production had been evaluated, and carried through plating of the aerial part, root and rhizome. To verify the possibility of the use of shrimp peel, the soil was infested with isolated the pathogenic one. After one week, had the incorporation of the peel of shrimp to the soil in the concentrations of 0; 2,5; 5; 7,5; 10; 15 and 20% (v/v). The population of Fusarium of the soil and the community of actinomycetes had been evaluated weekly by dilution in series and placed in plates. After eight weeks of the incorporation, the plantation of one rizome-seed of ginger for vase was carried through. In the collection, the evaluation was carried through in the same way that for thermotherapy. Through all the results gotten in the five experiments of thermotherapy, it was verified successfully possibility of use of the technique in the aid to the control of the illness. The best combinations time/temperature had been 45ºC for the time of 120 minutes or 55ºC per 20 minutes in all solutions. In the test with the use of the shrimp peel, it had a reduction of the population of Fusarium and increase of the community of actinomycetes in the soil that had received the incorporation from peel. The addition of peel of shrimp to the soil allows the plantation of the ginger in places where the pathogen is present.

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Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
Heliconias are flowers most cultivated inside world floriculture tropical in Brazil northeast, but its yield has being affected by Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f.sp. cubense. The present study had as objective to verify disease occurrence, to evaluate inoculation methods, characterize isolates considering morphology, aggressivety and genetical diversity, identify resistance sources, to verify efficiency of fungical filtrate in distinction of resistance and susceptibility and, at the end, involvement of structural mechanisms in pathogen-host interaction. The disease occurrence was evaluated in 28 farms at Pernambuco, Alagoas and Sergipe, Brazil. After isolates obtaintion, were tested inoculation methods by injection on bottom of pseudo stem, “meia lua” method, depositing inoculants around plant and “dipping”, where roots are wounded, immersed in suspension and replanted after. The plants were evaluated by external and internal symptoms, considering disease index with variation of 1 to 6. For morphological characters, isolates were incubated for five days in microculture, after observed with optical microscopy. Micro and macroconidia were measured by micrometric lents, with increase of 40X. The aggressivity of isolates was determined colony disks in stems of H. psittacorum cv. Alan carle detached and perfured. Stems were incubated in humid chamber during five days. The evaluation was according with vascular darking in stem diameter and was based in index disease with notes variation of 1 a 4. Genetical diversity was verified bymolecular analysis and vegetative compatibility agroupment technique. For molecular analysis, it was realized Polymerase Chain Reaction (PCR) using 37 oligonucleotides of Inter-simple Sequence Repeat (ISSR) and eletrophoretical run in agarosis gel (2%). Binary data were analyzed by GENES 2.0 program. VCG was determined by nit mutants obtaintion, by complete medium (CM), potato-dextrose-clorate (PDC) and minimum medium (MM) sequence. For groupment formation Mutants were pared for complementary test by observation of heterocarion. For identification of resistance sources, 12 species of heliconia were inoculated by injection with isolate considering higher aggressivity and, after 40 days were done evaluations based on disease index. Fungical extract was obtained after fungus incubation during 24 days in Czapek medium, being used concentrations of 25, 50, 75 and 100%. Aliquots of 1mL were deposited on detached leaves of resistant plants of Heliconia psittacorum cv. Golden Torch, and of susceptible H.psittacorum cv. Alan Carle. Leaves inoculated were in humid chamber condition for 24, 48 and 72 hours. Structural mechanisms involved in interaction were observed by histological cuts on roots of used species at resistance sources studies and treatments wereinoculated and no inoculated with F.oxysporum f.sp. cubense. It was observed Fusarium wiltoccurrence in 88% of farms of tropical flowers production, where were obtained 31 isolates of F. oxysporum f.sp. cubense. Injection method showed be more efficient, with characteristics disease symptoms in lower time interval, at 36 days. Macroconidia showed variation of 25,56 μm x 3,7 μm to 33,92 μm x 3,39 μm and microconidia variation of 6,23 μm x 2,01 μm to 10,3 μm x 3,35 μm, dimension obtained for conidia were with variation for specie. It was observed distinction of three groups for aggressivity, where 15 isolates were considered intermediary aggressivity, eight lower aggressivity isolates. Methods used for genetical diversity showed genetical variability. At molecular analysis was formed five groups considering a genetical distance of 70% and genetical similarity varying of 0,51 to 0,94. At VCG study was observed formation of three groups, but 71% of isolates did not belong none group. Both of techniques determined high genetical diversity and not geographical correlation among isolates of the same area. Species H. bihai, H. psittacorum cv. Golden Torch, H. psittacorum cv. Golden Torch Adrian, H. rostrata, H. stricta Capri, H. psittacorum cv. Sassy and H. caribea were considered resistant to Fusarium wilt. Species moderally resistant were H. latispatha and H. wagneriana. Heliconia. psittacorum cv.Alan Carle and H. chartacea cv. Sexy Pink were susceptible while H. stricta Fire Bird was highly susceptible. Fungical filtrate concentrate in 50 % was the mostefficient of resistance distinction and susceptibility on cultivars. In structural mechanisms it was observed that there is not relation between diameter and lignification of celular wall with pathogen resistance, because in some resistant species did not show increase of diameter or lignin accumulation.
As helicônias são as flores mais cultivadas dentro da floricultura tropical no Nordeste brasileiro, porém sua produção vem sendo afetada pela murcha de fusário, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f.sp. cubense. O presente estudo objetivou verificar a ocorrência da doença, avaliar métodos de inoculação, caracterizar os isolados quanto a morfologia, agressividade e diversidade genética, identificar fontes de resistência, verificar a eficiência do filtrado fúngico na distinção de resistência e suscetibilidade e, por fim, o envolvimento de mecanismos estruturais na interação patógeno-hospedeiro. A ocorrência da doença foi avaliada em vinte e oito propriedades nos estados de Pernambuco, Alagoas e Sergipe. Após a obtenção dos isolados, foram testados os métodos de inoculação de injeção na base do pseudocaule, método de “meia lua”, depositando-se o inóculo em torno da planta e “dipping”, onde as raízes das plantas são feridas, imersas na suspensão e depois replantadas. As plantas foram avaliadas pelos sintomas internos e externos, com base em escala de notas que variavam de 1 a 6. Para os caracteres morfológicos, os isolados foram incubados por cinco dias em microcultura e, em seguida, observados com auxílio de microscópio ótico. Os macroconídios e os microconídios foram medidos através da lente micrométrica com aumento de 40X. A agressividade dos isolados foi determinada por inoculação de discos de colônia em colmos de Heliconia psittacorum cv. Alan carle destacados e perfurados. Os colmos foram incubados sob condição de câmara úmida por cinco dias. A avaliação foi de acordo com o escurecimento vascular no diâmetro do colmo e baseou-se na escala denota variando de 1 a 4. A diversidade genética foi verificada através da análise molecular e da técnica de grupamento de compatibilidade vegetativa (VCG). Para análise molecular, realizou-se a Polymerase Chain Reaction (PCR) utilizando-se trinta e sete oligonucleotídeos de Inter-simple Sequence Repeat (ISSR) e a corrida eletroforética em gel de agarose (2%). Os dados binários foram analisados pelo programa Genes 2.0. O VCG foi determinado através da obtenção de mutantes nit, pelas seqüências nos meios completo (MC), batata-dextrose-clorato (BDC) e meio mínimo (MM). Para a formação de grupamentos, os mutantes foram pareados para o teste de complementariedade através da observação da formação do heterocárion. Na identificação de fontes de resistência, doze espécies de helicônia foram inoculadas por injeção com o isolado considerado de maior agressividade e após quarenta dias foram feitas as avaliações baseada na escala de notas. O filtrado fúngico foi obtido após o cultivo do fungo por vinte e quatro dias em meio Czapeksendo utilizadas as concentrações de 25, 50, 75 e 100%. Alíquotas de 1 mL foram depositadas sobre a superfície de folhas destacadas das plantas resistentes de Heliconia psittacorum cv.Golden torch, e das suscetíveis H. psittacorum cv. Alan carle. As folhas inoculadas ficaram em condição de câmara úmida por 24, 48 e 72 horas. Os mecanismos estruturais envolvidos na interação foram observados por cortes histológicos nas raízes das espécies utilizadas no estudo de fontes de resistência e os tratamentos foram inoculados e não inoculados com F. oxysporum f.sp. cubense. Foi constatada a ocorrência da murcha de fusário em 88% das propriedades visitadas, de onde foram obtidos trinta e um isolados do fungo. O método de injeção mostrou ser o mais eficiente, apresentando os sintomas característicos da doença em menor intervalo de tempo, aos trinta e seis dias. Os macroconídios apresentaram variação de 25,56 μm x 3,7 μm a 33,92 μm x 3,39 μm e os microconídios a variação de 6,23 μm x 2,01 μm a 10,3 μm x 3,35 μm. Observou-se a distinção de três grupos quanto à agressividade, onde quinze isolados foram enquadrados com de agressividade intermediária, oito foram de maior agressividade e oito foram de menor agressividade. As técnicas utilizadas no estudo de diversidade genética apresentaram alta variabilidade genética. Na análise molecular formaram-se cinco grupos considerando uma distância genética de 70% e uma dissimilaridade genética variando de 0,51 a 0,94. No estudo de VCG observou-se a formação de três grupos, porém 71% dos isolados não fizeram parte de nenhum grupo. Ambas as técnicas determinaram uma alta diversidade genéticae a não correlação geográfica entre os isolados pertencentes a uma mesma região. As espécies Heliconia bihai, H. psittacorum cv. Golden Torch, H. psittacorum cv. Golden Torch Adrian, H. rostrata, H. stricta cv. Capri, H. psittacorum cv. Sassy e H. caribea foram consideradas resistentes à murcha de fusário. As espécies moderadamente resistentes foram H. latispatha e H. wagneriana. Heliconia psittacorum cv. Alan Carle e H. chartacea cv. Sexy Pink foram as suscetíveis enquanto que a H. stricta cv. Fire Bird foi altamente suscetível. O filtrado fúngico concentrado em 50% foi o mais eficiente na distinção de resistência e suscetibilidade nas cultivares. Na avaliação dos mecanismos estruturais observou-se que não há relação entre a espessura e lignificação da parede celular com a resistência ao patógeno, pois em algumas espécies resistentes não constatou-se o aumento de espessura ou acúmulo de lignina.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T16:51:26Z No. of bitstreams: 1 Leonardo Tavares de Souza (1).pdf: 547012 bytes, checksum: 3ce24d8a338d375481b7eaa6393560c4 (MD5)
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Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
The Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, is an important disease of tomato (Solanum lycopersicon L.) in Northeastern Brazil. Order to select genotypes with potential for use in the disease management, 60 strains were evaluated (F7 generation) from the crossing of access BHRS-2, 3 and Viradoro cultivar in relation to isolates from the physiologic races 2 and 3 of F. oxysporum f. sp. lycopersici. Seedlings 21 days old were inoculated using the method of cutting the roots and soak in the suspension of conidia of the pathogen. The evaluation was performed after 21 days, with the scale of grades ranging from 1 to 5. The genotypes were grouped into five classes of reaction. Most genotypes (73.3%) behaved as highly resistant to the race 2 isolate, while 45.0% were classified as susceptible and 28.3% as highly susceptible to the race 3 isolate. Only the L-1 strain showed high resistance reaction to both isolates. The stability of this line of resistance was evaluated on five isolates ofeach race (2 and 3). The line L-1 showed high levels of resistance to all race 2 isolates, therefore indicating high stability of resistance. However, for race 3 isolates, this strain showed three distinct classes of reaction, ranging from highly resistant to susceptible, indicating instability of resistance to this race.
A murcha-de-fusário, causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, é uma importante doença do tomateiro (Solanum lycopersicon L.) no Nordeste brasileiro. Visando selecionar genótipos com potencial de utilização no manejo da doença, foram avaliadas 60 linhagens (geração F7) oriundas do cruzamento entre o acesso BHRS-2,3 e a cultivar Viradoro, em relação a isolados das raças fisiológicas 2 e 3 de F. oxysporum f. sp. lycopersici. Mudas com 21 dias de idade foram inoculadas pelo método do corte de raízes e imersão na suspensão de conídios do patógeno. A avaliação foi realizada após 21 dias, com o auxílio de escala de notas de 1 a 5, para agrupamento dos genótipos em cinco classes de reação. A maioria dos genótipos (73,3%) se comportou como altamente resistente ao isolado da raça 2, enquanto 45,0% foram classificados como suscetíveis e 28,3% como altamente suscetíveis ao isolado da raça 3. Somente a linhagem L-1 apresentou reação de alta resistência aos dois isolados de ambas as raças. A estabilidade da resistência dessa linhagem foi avaliada em relação a cinco isolados de cada raça (2 e 3) do patógeno. A linhagem L-1 apresentou reação de alta resistência a todos os isolados da raça 2, evidenciado estabilidade da resistência. No entanto, em relação aosisolados da raça 3, essa linhagem apresentou três classes de reação distintas, variando de altamente resistente a suscetível, indicando instabilidade da resistência à essa raça.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-17T12:44:24Z No. of bitstreams: 1 Andre Luiz Menezes Machado.pdf: 1193901 bytes, checksum: 3958c2853de30c17420bd30e2a594162 (MD5)
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Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
Tomato (Lycopersicon esculentum) crop yield has been limited by Fusarium wilt occurrence in the State of Pernambuco, Brazil. This disease, caused by Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici, drastically reduces the harvest period due to the early fruit fall. This work aimed to analyze the intensity of Fusarium wilt in tomato planted in 47 soil samples from the Agreste region of Pernambuco and to determine factors which could be related to either soil suppressivenes or conduciveness to this disease/pathogen. Bioassays were carried out using tomato (Santa Clara cv.) planted in artificially infested and non-infested soils, aiming to verify the existence of suppressive and conducive soils to the disease. In order to characterize factors which could be related to these phenomena, the samples were submitted to analysis for determination of field capacity, permanent wilting point, clay, silt and sand percentages (physical characteristics), macronutrients, microbialcarbon, carbon from organic matter and total nitrogen levels (chemical characteristics) and population levels of Fusarium oxysporum, Trichoderma spp., Bacillus spp. and Pseudomonas spp. of fluorescent group in the soils (microbiological characteristics). Then the influence of these factors upon each other as well as on the incidence of the disease was verified. Fusarium wilt was positively correlated (r = 0,32) to soil C/N ratio in the first bioassay, however the disease was negatively correlated (r = -0,35) to Ca level in the soil, for the second one, both artificially infested with the pathogen. CAF-1 and CAF-16 samples were considered suppresive, while CAF-2 and SAI-2 were conducive. Infested and non-infested bioassays were related to each other pointing out the occurrence of suppressiveness in the soils No significant correlations (P=0,05) between disease levelsand physical, chemical or microbiological soil characteristics were observed. Furtherstudies must be carried out to characterize soils suppressiveness and conduciveness to Fusarium wilt of tomato in the Agreste region, in order to effectivelly contribute for the development of an integrated disease management
No Estado de Pernambuco, a produtividade da cultura do tomateiro (Lycopersicon esculentum) tem sido limitada devido à ocorrência da murcha-de-fusário, causada por Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici, que reduz drasticamente o período de colheita pela queda prematura dos frutos. O presente trabalho teve como objetivos analisar a intensidade da murcha-de-fusário em plantas de tomateiro cultivadas em 47 amostras de solos da região Agreste de Pernambuco e determinar os possíveis fatores associados à supressividade ou conducividade desses solos à doença. Foram realizados bioensaios com plantas de tomateiro (cv. Santa Clara) cultivadas nos solos com e sem infestação artificial com o patógeno, sendo constatada a existência de solos supressivos e conducivos à doença. Visando caracterizar os possíveis fatores envolvidos nesses fenômenos, os solos foram submetidos a análises para determinação das características físicas (capacidade de campo,ponto de murcha permanente e teores de areia, silte e argila), químicas (quantificação de macronutrientes, carbono microbiano, carbono orgânico total e nitrogêncio total) e microbiológicas (levantamento populacional de Fusarium oxysporum, Trichoderma spp., Bacillus spp. e Pseudomonas spp. do grupo fluorescentes). Foi analisada a interrelação entre os fatores e a influência sobre a supressividade e/ou conducividade desses solos à murcha-de-fusário. A incidência da doença se correlacionou positivamente (r = 0,32) com a relação C/N, no primeiro plantio, e negativamente (r = -0,35) com os teores de Ca no solo, no segundo plantio, ambos com infestção artificial. Os solos CAF-1 e CAF-16 foram considerados supressivos, enquano CAF-2 e SAI-2 foram conducivos. Os plantios com esem infestação correlacionaram-se, indicando a supressividade nos solos analisados. Não foram constatadas correlações significativas (P=0,05) dos níveis de doença com as demaiscaracterísticas químicas, físicas e microbiológicas dos solos. Novos estudos devem ser realizados para a caracterização dos mecanismos de supressividade ou conducividade dos solos da região Agreste à murcha-de-fusário do tomateiro, visando contribuir efetivamente para o manejo integrado da doença

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-21T13:35:42Z No. of bitstreams: 1 Christtianno de Lima Rollemberg.pdf: 2445206 bytes, checksum: 4da0aaed00880d13a23b17cdb6cae239 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-02-21T13:35:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Christtianno de Lima Rollemberg.pdf: 2445206 bytes, checksum: 4da0aaed00880d13a23b17cdb6cae239 (MD5) Previous issue date: 2013-04-30
This study evaluated the use of silicon (Si) in micropropagation of banana 'Silk' and 'Pacovan Ken' aiming to reduce the severity of fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense and moko disease caused by Ralstonia solanacearum race 2. The banana plantlets were produced in vitro by adding calcium silicate and potassium silicate (0, 0.25, 0.5, 0.75 and 1 g L-1) to MS medium in the phases of multiplication and rooting. After in vitro culture, the plants were transferred to plastic tubes containing substrate plus the same sources of Si, and maintained in a greenhouse for 45 days, when they were inoculated with the pathogens. With respect to fusarium wilt in cultivars Silk and Pacovan Ken, the elevation of Si increased the incubation period (IP) and reduced the disease index (DI) and area under the disease progress curve (AUDPC). In cultivar Silk but not in Pacovan Ken calcium silicate was significantly more effective than potassium silicate. In shoots and roots of both cultivars in both sources, before and after acclimatization Si concentration was greater at a dose of 1.0 g L-1 compared to the control without Si. Before acclimatization, calcium silicate provided higher Si concentration in the shoots than potassium silicate. The opposite happened with the Si concentration in the roots. After acclimatization, there was no difference between the calcium silicate and potassium silicate, for both cultivars. In general, for both cultivars and sources of Si there were positive correlations with the concentration of Si and IP, and negative correlations with DI and AUDPC. Before and after acclimatization, the anatomical variable of roots: thickness of the root epidermis, cortex, endodermis and central cylinder of banana 'Silk' and 'Ken Pacovan' were influenced by Si sources. Calcium silicate was more efficient in increasing the thickness of the root epidermis, cortex and central cylinder, while potassium silicate was more efficient in thickening of the endodermis. In general, there were positive correlations among anatomical variable of roots with PI and negative correlations with DI and AUDPC, except for potassium silicate in cultivar Silk. The research conducted with moko disease showed that increase of Si in Silk and Pacovan Ken cultivars caused increase in IP and decreases the DI and AUDPC. At the dosage of 1.0 g L-1 AUCPD was reduced by 27.3%. In cultivar Silk, calcium silicate was more effective than potassium silicate (P≤0.05), while in „Pacovan Ken‟ there was no difference. In both cultivars, plants treated with Si showed, in general, concentrations of chlorophylls a, b and total higher than plants Si- up to six days after inoculation, which may have influenced the disease IP. In general, both the enzymes related to oxidative stress (CAT, SOD and APX), as the plant defense (POX, PPO, CHI and GLU), had increased its activities in plants treated with Si, especially those with calcium silicate, indicating a possible role in reducing the severity of the disease. The supply of Si in micropropagation of banana 'Silk' and 'Pacovan Ken' promoted reduction of Fusarium wilt and moko disease, and therefore can be used as a new technology in the management of these diseases.
Este estudo avaliou o uso do silício (Si) na micropropagação de bananeira „Maçã‟ e „Pacovan Ken‟ visando a redução da severidade da murcha-de-fusário, causada pelo Fusarium oxysporum f. sp. cubense e do moko da bananeira causado por Ralstonia solanacearum raça 2. As mudas de bananeira foram produzidas in vitro com adição de silicato de cálcio e silicato de potássio (0; 0,25; 0,5; 0,75 e 1 g L-1) ao meio de cultivo MS nas fases de multiplicação e enraizamento. Após o cultivo in vitro, as plantas foram transferidas para tubetes contendo substrato acrescido das mesmas fontes de Si, e mantidas em casa de vegetação por 45 dias, quando foram inoculadas com os patógenos. Com relação à murcha-de-fusário, nas cultivares Maçã e Pacovan Ken, a elevação das doses de Si aumentou o período de incubação (PI) e reduziu o índice de doença (IDO) e a área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD). Em „Maçã‟ o silicato de cálcio foi significativamente mais eficiente que o silicato de potássio, o que não ocorreu na „Pacovan Ken‟. A concentração de Si na parte aérea e raízes das cultivares, em ambas as fontes, antes e após a aclimatização foi maior na dose de 1,0 g L-1 em relação à testemunha sem Si. Antes da aclimatização, o silicato de cálcio proporcionou maior concentração de Si na parte aérea que o silicato de potássio. O contrário aconteceu com a concentração de Si nas raízes. Após aclimatização, não houve diferença entre o silicato de cálcio e o silicato de potássio, para as duas cultivares. Em geral, para ambas as cultivares e fontes de Si foram observadas correlações positivas da concentração de Si com PI e correlações negativas com IDO e AACPD. Antes e após a aclimatização das plantas, as espessuras da epiderme radicular, córtex, endoderme e cilindro central das bananeiras „Maçã‟ e „Pacovan Ken‟ foram influenciadas pelas fontes de Si. O silicato de cálcio foi mais eficiente no aumento da espessura da epiderme radicular, córtex e cilindro central, enquanto o silicato de potássio foi mais eficiente no aumento da espessura da endoderme. Em geral, foram observadas correlações positivas das variáveis anatômicas das raízes com PI e correlações negativas com IDO e AACPD, exceto para silicato de potássio em bananeira „Maçã‟. Na pesquisa desenvolvida com o moko da bananeira, a elevação das doses de Si nas cultivares Maçã e Pacovan Ken causou aumento no PI e reduções do IDO e AACPD. Na dosagem de 1,0 g L-1, a AACPD foi reduzida em até 27,3%. Em bananeira „Maçã‟ o silicato de cálcio foi mais eficiente que o silicato de potássio (P≤0,05), enquanto na „Pacovan Ken‟ não houve diferença. Nas duas cultivares, plantas tratadas com Si apresentaram, de maneira geral, concentrações de clorofilas a, b e total maiores que as plantas Si- até os seis dias após inoculação, o que pode ter influenciado o PI da doença. Em geral, tanto as enzimas relacionadas ao estresse oxidativo (CAT, SOD e APX), quanto as de defesa da planta (POX, PFO, GLU e QUI), tiveram suas atividades aumentadas nos tratamentos com silício, especialmente naqueles com silicato de cálcio, indicando uma possível participação na redução da severidade da doença. O fornecimento de Si na micropropagação de bananeiras „Maçã‟ e „Pacovan Ken‟ promoveu redução da murcha-de-fusário e moko da bananeira, podendo ser utilizado como uma nova tecnologia no manejo dessas doenças.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2016.
Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-08-02T18:17:54Z No. of bitstreams: 1 2016_SandroCoelhoLinharesMontalvão_PARCIAL.pdf: 1518701 bytes, checksum: d86ee1aac30dfe2a9bb7f01f5ab7f320 (MD5)
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O algodoeiro é uma das espécies mais cultivadas no mundo. A cotonicultura brasileira tem destaque, ocupando o 5o lugar entre os produtores mundiais e 3o como exportador. Apresenta a maior média de produção por área cultivada (~5t/ha) em sequeiro no mundo. As pragas e doenças podem comprometer a produtividade. Assim, duas doenças merecem destaque, a meloidoginose (Meloidogyne incognita raças 3 e 4) e a murcha de fusário (Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum), pois podem ser destrutívas às plantas, tanto isoladamente como em associação. A dificuldade de se fazer um controle eficiente, é devido à capacidade dos patógenos de parasitarem uma ampla gama de hospedeiros e terem grande persistência no solo, dificultando o controle através de tratos culturais como a rotação de cultura e até mesmo a utilização de tratamentos químicos. A busca por alternativas como o uso de Bacillus sp. no controle de doenças de plantas é justificada. Assim, o objetivo geral desse trabalho foi selecionar e caracterizar estirpes de Bacillus antagonistas a M. incognita e F. oxysporum f. sp. vasinfectum (Fov). Para tanto, foi realizado um ensaio in vitro com 11 estirpes de Bacillus thuringiensis para verificar a atividade tóxica a Caenorhabditis elegans, e posteriormente contra J2 de M. incognita, em laboratório e em casa de vegetação. Também foram testados quatro produtos biológicos (Onix, Rizos, NemaControl e Nemix) e carbofuran – (Furadan 350 SC) para o controle de M. incognita em casa vegetação. Para isso, foi instalado um ensaio em delineamento inteiramente casualizado com seis repetições por tratamento e uma planta por vaso. Foram inoculados os ovos e eventuais J2 do nematoide, 20 dias após a emergência das plantas e as seguintes variáveis foram avaliadas: altura (cm), peso fresco da parte aérea (g), peso seco da parte aérea (g), peso fresco de raiz (g), peso seco de raiz (g) e fator de reprodução (FR). Para a histopatologia, foi selecionado o produto Onix (Bacillus methylotrophicus) inoculado em sementes de algodão. Vinte dias após a emergência das plântulas foi inoculada uma suspensão de J2 de M. incognita. As avaliações foram realizadas entre 2 e 45 dias após a inoculação, com o cálculo de fator de reprodução, acompanhamento da penetração de J2 durante os 12 primeiros dias após a inoculação dos nematoides e cortes histopatológicos da raiz para acompanhar o desenvolvimento do parasita. Para a realização dos ensaios de seleção de Bacillus contra Fov, foi realizada uma seleção prévia do meio de cultura, onde diferentes concentrações de meio EMBRAPA e meio BDA foram avaliadas. Nos testes de antagonismo, foi proposta uma escala de notas para facilitar as avaliações, onde com os testes e o auxilio da escala foram avaliados 178 isolados de Bacillus e selecionadas 13 estirpes para os ensaios de metabólitos solúveis em água e metabólitos voláteis. Por fim, foi realizado um teste em casa de vegetação para avaliar a eficiência dos isolados selecionados in vitro, onde as sementes de algodão foram sanitizadas, microbiolizadas com micélio e esporo de Fov colocadas em bandejas com substrato, inoculadas com os tratamentos e conduzidas em casa de vegetação por 25 d. Quatro estirpes de B. thuringiensis tóxicas a C. elegans também apresentaram atividade de controle in vivo sobre M. incognita; o produto Onix reduziu aproximadamente 50% o FR de M. incognita; para os testes de antagonismo contra Fov, as estirpes de Bacillus, GF267, S1301, S1823, S1967, S2535 e S2536 foram selecionadas.
Cotton crop is one of the most cultivated arround the world. The brazilian cotton production has grown, occupying 5th place among the world's producers and 3rd as exporter. Brazil presents the highest average production per cultivated area (~5t/ha) in non-irrigated land in the world. Pests and diseases can compromise the productivity. Thus, two diseases highlight: root-knot nematode (Meloidogyne incognita races 3 e 4) and Fusarium-wilt (Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum). These pathogens can be destructive to the plant, both singly as in association. The difficulty of making an efficient control, is due to the ability of the pathogens to infect a wide range of hosts and to have great persistence in soil, making difficult to control through cultural practices as the crop rotation and even the use of chemical treatments. The search for alternatives such as the use of Bacillus sp. in the control of plant diseases is justified. Thus, the overall objective of this work was to select and characterize strains of Bacillus antagonists to M. incognita and F. oxysporum f. sp. vasinfectum (Fov). For that, initialy an in vitro trial was conducted with 11 strains of Bacillus thuringiensis to evaluate their toxic activity to Caenorhabditis elegans, and later against J2 juvenilles of M. incognita, in laboratory conditions and under greenhouse. Were also tested four commercial products (Onix, Rizos, NemaControl and Nemix) and carbofuran – (Furadan 350 SC) for the control of M. incognita under greenhouse. This test was conducted in a completly randomized design with six replications per treatment and one plant per pot. Nematode eggs were inoculated, 20 d after emergence of plants and the following plant variables were evaluated: height (cm), shoot fresh weight (g), shoot dry weight (g), fresh root weight (g), root dry weight (g), the reproduction factor (RF). For the histopathological study was selected the product Onix (Bacillus methylotrophicus) inoculated in cotton seeds. Twenty days after cotton seed germination a suspension juvenilles of M. incognita was inoculated. The evaluations was carried out from 2 to 45 d after inoculation. The reproduction fator and penetration of J2 were evaluated and observed by histopathology tissue cuts. For the tests of selection of Bacillus against Fov, a prior selection of culture media was done, where different concentrations of culture medium EMBRAPA and BDA were evaluated. In tests of antagonism 178 isolates of Bacillus have been tested and 13 strains were selected for water-soluble metabolites and volatile metabolites. Finally, a greenhouse test was conducted to evaluate the efficiency of in vitro selected isolates, where the cotton seeds were inoculated with Fov and antagonists, and, cultivated under greenhouse for 25 d. Four strains of B. thuringiensis toxic to C. elegans also in vivo controled M. incognita; the product ‘Onix’ reduced around 50% of RF for M. incognita; in tests of antagonism against Fov, the strains of Bacillus, GF267, S1301, S1823, S1967, S2535 e S2536 were selected.

Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2015-12-04T13:26:54Z No. of bitstreams: 2 Tese - Renato Carrer Filho - 2014.pdf: 2054236 bytes, checksum: 3f27769d51475d87f621d5e241854928 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
The tomato is a solanaceous plant who became quite prominent in the last century, not only by the pleasant taste, but also for being a rich source of amino acids, organic acids, vitamins, as well as the high concentration of beneficial substances, including lycopene. To meet the growing demand for tomatoes, various breeding programs were executed, aiming an increment in production, productivity and fruit quality, such as the reduction of secondary metabolites. By proceeding crossings to improve agronomic traits of the culture, genes conferring hardiness and hence resistance to disease were probably lost, favoring the increased attack of pests and diseases. Among the most troubling diseases stands the vascular wilt caused by Fusarium oxysporum f. spp. lycopersici. The difficulty of controlling this disease comes from the intrinsic characteristics of the pathogen, such as high adaptability to the underground environment while associated with the host and the production of resistance structures that remain viable in the soil for a long time. Genetic resistance stands out as the main tool in the control of this pathogen, which requires a continuous accession characterization program and the identification of sources of resistance, ensuring the introgression of 'I' genes that express resistance to physiologic races of the pathogen. Coupled with genetic resistance, the use of microorganisms as antagonists and their introduction in the pathogen´s microhabitat has become a promising alternative in the context of the management of root diseases of tomato, highlighting the colonizing bacteria from the rhizosphere of plants, termed rhizobacteria, as the main biocontrol agents. This study aimed to identify resistant tomato accessions to three physiological races of Fusarium oxysporum f. spp. lycopersici, by morphological and molecular methods, as well as detect multiple sources of resistance from the germplasm bank of EMBRAPA CNPH. The assay consisted of an evaluation of 28 varieties, 3 hybrids, 32 strains and 19 wild accessions, totaling 82 accessions. The susceptibility or resistance was confirmed by visualization of DNA bands on an agarose gel generated by specific molecular markers capable of amplifying regions of the target genes I-1, I-2 and I-3, expressing resistance to classes 1, 2 and 3 of F. oxysporum f. spp. lycopersici, respectively. To enhance the durability of this resistance, 10 rhizobacteria of the Bacillus genus were tested as biocontrol agents of wilt in greenhouse assays. In parallel, in vitro root colonization, antibiosis and detection of potential biocontrol genes involved in the tests were conducted. All Bacillus isolates showed variable levels of control of the pathogen in vitro, while the UFG-07 (Bacillus subtilis) and UFG-10 (Bacillus circulans) isolates have excelled in disease suppression in the greenhouse, which reinforces the hypothesis of substances acting as an antimicrobial control.
O tomateiro é uma solanácea que se tornou bastante proeminente no século passado, não só pelo agradável paladar, mas também por ser uma rica fonte de aminoácidos, ácidos orgânicos, vitaminas, como também pela grande concentração de substâncias benéficas, entre elas o licopeno. Para atender à crescente demanda pelo tomate, vários programas de melhoramento visando o aumento da produção, produtividade, qualidade dos frutos, como a diminuição de metabólitos secundários, foram empreendidas. Ao se procederem os cruzamentos visando melhorar as características agronômicas da cultura, genes que conferiam rusticidade e, consequentemente, resistência às doenças, foram provavelmente perdidos, favorecendo o aumento do ataque de pragas e doenças na cultura do tomateiro. Dentre as doenças mais preocupantes destaca-se a murcha vascular causada pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici. A dificuldade de controle desta doença advém de características intrínsecas do patógeno, como alta adaptabilidade ao ambiente subterrâneo em associação com o hospedeiro e pela produção de estruturas de resistência que ficam viáveis no solo por um longo tempo. A resistência genética destaca-se como a principal ferramenta no controle deste fitopatógeno, o que requer um programa contínuo de caracterização de acessos e de identificação de fontes de resistência, garantindo a introgressão de genes ‘I’ que expressam resistência as raças fisiológicas do patógeno. Aliado a resistência genética, o uso de microrganismos como agentes antagonistas e sua introdução no microhabitat do patógeno, tem-se tornado como alternativa promissora no contexto do manejo de doenças radiculares do tomateiro, com destaque para as bactérias colonizadoras da rizosfera de plantas, denominadas rizobacterias, como os principais agentes de biocontrole. O objetivo deste trabalho visou identificar acessos de tomateiro resistentes às 3 raças fisiológicas de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, pelos métodos morfológico e molecular, assim como detectar fontes de resistência múltipla no banco de germoplasma da EMBRAPA CNPH. O ensaio consistiu na avaliação de 28 variedades, 3 híbridos, 32 linhagens e 19 acessos selvagens, totalizando 82 acessos. A resistência ou suscetibilidade foi corroborada pela visualização de bandas de DNA em gel de agarose, ao utilizar-se de marcadores moleculares específicos para amplificar das regiões alvo, gene I-1, I-2 e I-3 que expressam resistência à raça 1, 2 e 3 de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, respectivamente. Visando maior durabilidade da resistência, 10 rizobacterias do gênero Bacillus foram testadas como agentes de biocontrole da murcha do tomateiro, em casa de vegetação. Paralelamente foram conduzidos, in vitro, antibiose e detecção de possíveis genes envolvidos no biocontrole. Isolados de Bacillus apresentaram controle variável do patógeno in vitro, enquanto que os isolados UFG-07 (Bacillus subtilis) e UFG-10 (Bacillus circulans) se destacaram na supressão da doença em casa de vegetação.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-06-28T15:02:41Z No. of bitstreams: 1 TESE_Patricia Migliorini.pdf: 2682211 bytes, checksum: 8bdf76d1693cb07dba37b177863fdbef (MD5)
Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-07-03T18:36:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE_Patricia Migliorini.pdf: 2682211 bytes, checksum: 8bdf76d1693cb07dba37b177863fdbef (MD5)
Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-07-03T18:38:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE_Patricia Migliorini.pdf: 2682211 bytes, checksum: 8bdf76d1693cb07dba37b177863fdbef (MD5)
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Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
O presente trabalho teve por objetivo: a) avaliar o efeito de diferentes doses e fontes de Si por meio do recobrimento de sementes sobre a qualidade física, fisiológica e sanitária de sementes assim como, determinar a concentração de silício e cálcio absorvidos em plântulas de feijão; b) avaliar o desempenho de plântulas inoculadas com Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli e recobertas com diferentes fontes de Si, durante a emergência e na expressão dos mecanismos bioquímicos, envolvidos nas respostas pós infecção em diferentes momentos e; c) avaliar o efeito do recobrimento de sementes com Si em resposta à infecção em uma cultivar suscetível e resistente ao Colletotrichum lindemuthianum, sobre o potencial fisiológico e sanitário de sementes e plântulas, durante o desenvolvimento inicial da cultura do feijão. Testou-se diferentes doses (0; 45; 90; 135 e 180g Si 100 kg-1 de sementes) e fontes de Si [Agrosilício®, silicato de cálcio e casca de arroz carbonizada (CAC)] via recobrimento de sementes, inoculados ou não pelo método de restrição hídrica. O recobrimento das sementes composto por Agrosilício®, CAC e silicato de cálcio não altera a qualidade física das sementes e proporciona plântulas vigorosas, sem comprometer a emergência final. Sementes recobertas com doses de silicato de cálcio e CAC elevam a concentração de Si nas raízes, mas reduzem a concentração de cálcio (Ca), enquanto que o Agrosilício® aumenta a concentração de Si em folhas e do Ca nas raízes. Diferentes fontes e doses de Si não controlam patógenos associados às sementes de feijão. A associação do F. oxysporum f. sp. phaseoli nas sementes prejudica a emergência e crescimento das plântulas. O Si tem pouco efeito nas respostas em plântulas não inoculadas, mas eleva a concentração de lignina. Na presença do F. oxysporum f. sp. phaseoli, o Si desencadeia melhor desempenho inicial das plântulas, favorece e potencializa os mecanismos de defesa. A fonte de Si fornecido pelo Agrosilício® proporciona uma antecipação rápida inicial da peroxidase o que pode ter amenizado e atrasado os danos do patógeno nas plântulas. A CAC como fonte de Si, embora tenha contribuído para a potencialização das enzimas de defesa nos períodos mais avançados da infecção, não se mostrou eficiente no controle da incidência da doença. O recobrimento das sementes com Si diminui a incidência e a severidade de C. lindemuthianum e proporciona maior crescimento das plântulas de feijão. O efeito de respostas potencializadas pelo Si tem maior expressividade na cultivar de maior suscetibilidade.
The a im of this study was: a) to evaluate the effect of different doses and sources of Si through the coating of seeds on the physical quality, physiological and sanitary conditions of seeds as, to determine the concentration of silicon and calcium absorbed in bean seedlings; b) to evaluate the performance of seedlings inoculated with Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli and covered with different sources of Si, during emergence and in the expression of biochemical mechanisms, involved in post-infection responses at different times and; c) to evaluate the effect of seed coating with Si in response to infection in a susceptible and resistant Colletotrichum lindemuthianum, on the physiological and sanitary potential of seeds and seedlings, during the initial development of the bean culture. Different doses were tested (0; 45; 90; 135 and 180g Si 100 kg-1 of seeds) and sources of Si [Agrosilício®, calcium silicate and rice husk ash (AHC)] by seed coating, whether or not inoculated by the water restriction method. The covering of seeds composed of Agrosilício®, AHC and calcium silicate, does not change the physical quality of the seed, provides vigorous seedlings, without compromising the end emergency. Seeds coated with doses of calcium silicate and AHC, increase the concentration of Si in roots, but reduce the concentration of calcium (Ca), while the Agrosilício® increases the concentration of Si in leaves and Ca in the roots. Different sources and doses of Si do not control pathogens associated with bean seeds. The association of F. oxysporum f. sp. phaseoli in seeds impairs seedling emergence and growth. Si has little effect on responses in uninoculated seedlings, but raises lignin concentration. In the presence of F. oxysporum f. sp. phaseoli, Si triggered better initial seedling performance, favored and enhanced the defense mechanisms. The Si source supplied by Agrosilício® provides early rapid anticipation of peroxidase, which may have ameliorated and delayed the damage of the pathogen in the seedlings. The AHC as a source of Si, although it has contributed to the potentiation of defense enzymes in the later stages of infection was not efficient in controlling the incidence of the disease. The seed coating with Si decreases the incidence and severity of C. lindemuthianum and provides greater growth of the bean seedlings. The effect of responses potentiated by Si has greater expressiveness in the cultivar of greater susceptibility.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2016.
Submitted by Camila Duarte (camiladias@bce.unb.br) on 2017-01-30T13:32:48Z No. of bitstreams: 1 2016_CléiaSantosCabral.pdf: 2724884 bytes, checksum: 13ed53ddad55c8137a1e96b9bd0b4b3e (MD5)
Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-02-10T17:58:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_CléiaSantosCabral.pdf: 2724884 bytes, checksum: 13ed53ddad55c8137a1e96b9bd0b4b3e (MD5)
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A alface (Lactuca sativa L.) é uma das hortaliças mais importantes no Brasil e no mundo. A murcha de fusário (causada por distintas raças do fungo Fusarium oxysporum f. sp. lactucae – FOLAC) é uma das principais doenças de da alface em regiões tropicais e subtropicais. Devido à dificuldade de implementação de estratégias eficazes de controle químico e cultural, o uso de cultivares com resistência genética é o método mais prático de manejo da doença. Fontes estáveis de resistência à raça FOLAC 1 foram encontradas, mas a base genética dessa característica ainda se encontra mal caracterizada. A integração da seleção assistida por marcadores (SAM) em programas de melhoramento convencional irá acelerar o desenvolvimento e lançamento de cultivares de alface com resistência genética a esse patógeno. O presente estudo teve como objetivos: elucidar os fatores genéticos associados à resistência a murcha de fusário (Capítulo 2) e idenficar marcadores moleculares potencialmente ligados aos fatores de resistência a isolados de FOLAC raça 1 identificados na cultivar ‘Vanda’ (Capítulo 3). O estudo da herança genética da resistência a FOLAC raça 1 foi conduzido com populações segregantes (F2 e F3) obtidas do cruzamento entre um parental suscetível ‘Gizele’ e ‘Vanda’. Populações foram inoculadas com uma suspensão de esporos do patógeno (3 x 106 microconídios/mL) por meio de corte e imersão de raízes e avaliadas quanto à resistência por meio de escala de notas. O DNA genômico das plantas resistentes e suscetíveis foi extraído e usado como molde em diferentes sistemas de marcadores (RAPD, SCAR, DR analogs, SRR e CAPS), visando identificar polimorfismos ligados a essa característica. Com relação à resistência a FOLAC raça 1, os estudos indicaram um controle genético relativamente simples na cultivar ‘Vanda’, com os resultados de segregação indicando um locus monogênico com uma provável combinação de efeitos de dosagem e penetrância incompleta. No entanto, os diferentes sistemas de marcadores moleculares utilizados nessa primeira etapa do trabalho não permitiram encontrar polimorfismos com estreita ligação com o(s) fator(es) de resistência. Desta forma, uma nova etapa do trabalho foi conduzida visando identificar por meio do método genotyping-by-sequencing (GBS) marcadores moleculares ligados a resistência (Capítulo 4). O GBS foi explorado na identificação de SNPs (single nucleotide polymorphisms) empregando DNA extraído dos dois parentais e de um conjunto de 82 indivíduos da população F2 derivados do cruzamento entre ‘Vanda’ x ‘Gizele’. Cada indivíduo foi genotipado utilizando o Illumina Hiseq 3000, que produziu 4,5 milhões de reads por amostra. Um total de 10.017 SNPs foi identificado entre os parentais. Estes SNPs foram avaliados para ligação com o fenótipo de resistência nos 82 indivíduos F2. Os dados genotípicos foram condensados em 1.484 scaffolds ou supercontigs. Um subconjunto de 417 scaffolds contendo polimorfismos foi selecionado para a construção de um mapa de ligação após filtragem baseada em missing data (< 20%), teste de qui-quadrado (3:1 p>0,05) e número de SNPs por scaffold. O mapa foi composto por 17 grupos de ligação, com um comprimento total de 1.132,984 cM. A análise de QTL (quantitative trait loci) para resistência a FOLAC raça 1 foi realizada no mapa de ligação com os conjuntos de dados de severidade da doença obtido nas populações F2 e F3. Dois QTLs de efeito maior foram identificados no cromossomo 9, explicando 30 a 40% da variação fenotípica observada na população F3 e F2, respectivamente. Um QTL de efeito menor foi detectado no cromossomo 4, explicando 0,06% da variação fenotípica na população F3. Desta forma, o presente estudo estabelece a porção mediana do cromossomo 9 como sendo a localização física do principal locus de resistência para FOLAC raça 1 presente na cultivar ‘Vanda’. Portanto, os marcadores moleculares localizados na proximidade desta região genômica são candidatos para o desenvolvimento de ferramentas de SAM em programas de melhoramento genético visando incorporar essa característica em linhagens elite de alface.
Lettuce (Lactuca sativa L.) is one of the most important leafy vegetable crops in Brazil and worldwide. Fusarium wilt (caused by distinct races of the fungus Fusarium oxysporum f. sp. lactucae – FOLAC) is one of the main soil-borne diseases of lettuce in tropical and subtropical regions. Due to the complexity of implementing effective cultural and chemical control, the most practical disease management strategy has been the use of cultivars with genetic resistance. Stable sources of resistance to FOLAC race 1 have been found, but the genetic basis of this trait is yet poorly characterized. The integration of marker assisted selection (MAS) in conventional breeding programs would be an important contribution to accelerate the development and release of lettuce cultivars with genetic resistance to this pathogen. In this context, the present study aimed to elucidate the inheritance of resistance to FOLAC race 1 detected in the cultivar Vanda (Chapter II) and to search for molecular markers linked to FOLAC race 1 resistance factor(s) (Chapter III). Inheritance studies were carried out using segregating populations (F2 and F3 families) derived from the cross between a susceptible cultivar (Gizele) and a FOLAC race 1 resistant cultivar (Vanda). The parental lines and the segregating populations were inoculated via root dipping technique with a conidial suspension adjusted to 3 x 106 microconidia/mL. Reaction to one FOLAC race 1 isolate was evaluated using a disease rating scale ranging from 1 (= no symptoms) to 5 (= dead plant). The studies indicated a simple genetic control of FOLAC race resistance in cultivar Vanda, with segregation results indicating a single gene locus with a likely combination of dosage effects and incomplete penetrance. Genomic DNA of resistant and susceptible plants was extracted and used as a template in PCR assays with different marker systems (RAPD, SCAR, DR Analogs, SSRs and CAPS) aiming to identify polymorphisms linked to the resistant reaction. However, none of the evaluated molecular techniques were able to identify markers in close linkage with the resistance factor(s). Therefore, a new phase of the present study was conducted with the objective of searching for markers linked to resistance through the employment of the genotyping-by-sequencing (GBS) strategy (Chapter IV). The GBS strategy was employed using DNA extracted from the parental lines and 82 phenotyped F2 individuals derived from the same cross between Gizele x Vanda. Each individual was genotyped using the Illumina Hiseq 3000. A total of 4.5 million reads was obtained per sample with 10,017 SNPs being identified among the parental lines as well as among the 82 F2 individuals. Genotypic data were condensed into 1484 scaffolds. Four hundred seventeen (417) scaffolds containing polymorphisms were selected for the construction of the linkage map after filtering based on missing data (< 20%), chi-square test (3: 1 p> 0.05) and number of SNPs per scaffold. The final map consisted of 17 linking groups with a total length of 1,132.984 cM. The QTL analysis for resistance to FOLAC race 1 was performed on the linkage map based upon the disease severity datasets of F2 population and F3 families. Two major effect QTLs were identified on chromosome 9, explaining 30 to 40% of the phenotypic variation observed in the population F3 and F2, respectively. One QTL of minor effect was also identified on chromosome 4, explaining 0.06% of the phenotypic variation in the F3 population. This study establishes the central region of chromosome 9 as the physical location of a major resistance locus to FOLAC race 1 found in Vanda. Molecular markers in close proximity to this genomic region are candidates for the development of MAS tools for breeding programs aiming to incorporate this trait into elite lettuce lines.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2001-08Bitstream added on 2014-06-13T18:45:56Z : No. of bitstreams: 1 soares_rm_dr_botfca.pdf: 319005 bytes, checksum: 543157cd638502df6a98d42b83b09746 (MD5)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff) causa a murcha-de-Curtobacterium do feijoeiro, doença recentemente constatada no Brasil, na safra das águas de 1995, no Estado de São Paulo. Trata-se de um patógeno de colonização vascular e de difícil controle, sendo recomendados à utilização de cultivares resistentes, além de rotação de culturas e o uso de sementes sadias. O presente trabalho teve como objetivos avaliar a ação inibitória de Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli e Fusarium spp., in vitro, sobre Cff e na indução de resistência à murcha-de-Curtobacterium, em plantas de feijoeiro cultivadas em vaso contendo substrato infestado com isolados de Fusarium spp. Teve também os objetivos de avaliar os efeitos do tratamento de sementes e da pulverização com acibenzolar-S-methyl, sobre plantas de feijoeiro e na indução de resistência à doença, sob condições de casa-de-vegetação, e as atividades de peroxidases, polifenoloxidases e nível de proteínas totais solúveis nas folhas e no caule. Os resultados observados mostraram que isolados de F. oxysporum f. sp. phaseoli e Fusarium spp., cultivados sobre discos de papel-de-filtro em meio de cultura agarizado, inibiram o crescimento de Cff in vitro e os isolados de Fusarium spp. não foram eficazes no controle da murcha-de-Curtobacterium em plantas de feijoeiro. O tratamento de sementes com acibenzolar-S-methyl, nas dosagens de 25, 50 e 75 g i.a./100 Kg de sementes, foi prejudicial à germinação e ao vigor e não induziu resistência à doença; a pulverização de feijoeiro com acibenzolar-S-methyl na dosagem de 250 μg i.a./mL foi fitotóxico e a dosagem de 100 μg i.a./mL não causou fitoxidez e foi ineficaz para induzir de resistência à murcha-de- Curtobacterium na cultivar suscetível (IAC Carioca), quando pulverizadas antes ou após a inoculação, ou... .
Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff) cause the bacterial wilt of common bean, disease recently observed in State of São Paulo, Brazil. It is a vascular colonization pathogen, difficult to be controlled, and the resistant cultivars utilization is the best control method, followed by crop rotation and health seeds use. This work evaluated the in vitro inhibitory action of Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli and Fusarium spp. over Cff and its effects in the resistance induction to the bacterial wilt in common bean plants, cultivated in vases with substrate infested with Fusarium spp. It was also evaluated the effects of seed treatment and spraying through the use of acibenzolar-S-methyl, on common bean plants, in the resistance induction to disease under greenhouse conditions. Peroxidases and polyphenoloxidases activities, and total soluble protein level were observed in the leaf and stem. The results showed that Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli and Fusarium spp., cultivated on paper-filter discs on agar medium, inhibited the in vitro Cff growth, and the Fusarium spp. isolates were not efficient to induce resistance to bacterial wilt in common bean plants. The acibenzolar-S-methyl seed treatment (25, 50 and 75 g a.i./100 Kg of seeds) was prejudicial to germination and vigour, and it did not induce resistance to disease; spraying bean plants with 250 mg a.i./mL was phytotoxic, while with 100 mg a.i./mL it did not cause phytotoxicity, being either inefficient to induce resistance to bacterial wilt in the susceptible cultivar (IAC Carioca), spraying before or after inoculation, or to increase the resistance in cultivars with different levels of resistance (IAC Carioca Akytã and IAC Carioca Pyatã); the acibenzolar-S-methyl spraying (100 mg a.i./mL) increased the peroxidases activity in leaf and stem, as well as the polyphenoloxidases and total soluble protein level in the stem.

Orientador: Antonio Carlos Maringoni
Resumo: Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff) causa a murcha-de-Curtobacterium do feijoeiro, doença recentemente constatada no Brasil, na safra das águas de 1995, no Estado de São Paulo. Trata-se de um patógeno de colonização vascular e de difícil controle, sendo recomendados à utilização de cultivares resistentes, além de rotação de culturas e o uso de sementes sadias. O presente trabalho teve como objetivos avaliar a ação inibitória de Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli e Fusarium spp., in vitro, sobre Cff e na indução de resistência à murcha-de-Curtobacterium, em plantas de feijoeiro cultivadas em vaso contendo substrato infestado com isolados de Fusarium spp. Teve também os objetivos de avaliar os efeitos do tratamento de sementes e da pulverização com acibenzolar-S-methyl, sobre plantas de feijoeiro e na indução de resistência à doença, sob condições de casa-de-vegetação, e as atividades de peroxidases, polifenoloxidases e nível de proteínas totais solúveis nas folhas e no caule. Os resultados observados mostraram que isolados de F. oxysporum f. sp. phaseoli e Fusarium spp., cultivados sobre discos de papel-de-filtro em meio de cultura agarizado, inibiram o crescimento de Cff in vitro e os isolados de Fusarium spp. não foram eficazes no controle da murcha-de-Curtobacterium em plantas de feijoeiro. O tratamento de sementes com acibenzolar-S-methyl, nas dosagens de 25, 50 e 75 g i.a./100 Kg de sementes, foi prejudicial à germinação e ao vigor e não induziu resistência à doença; a pulverização de feijoeiro com acibenzolar-S-methyl na dosagem de 250 μg i.a./mL foi fitotóxico e a dosagem de 100 μg i.a./mL não causou fitoxidez e foi ineficaz para induzir de resistência à murcha-de- Curtobacterium na cultivar suscetível (IAC Carioca), quando pulverizadas antes ou após a inoculação, ou... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo).
Abstract: Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff) cause the bacterial wilt of common bean, disease recently observed in State of São Paulo, Brazil. It is a vascular colonization pathogen, difficult to be controlled, and the resistant cultivars utilization is the best control method, followed by crop rotation and health seeds use. This work evaluated the in vitro inhibitory action of Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli and Fusarium spp. over Cff and its effects in the resistance induction to the bacterial wilt in common bean plants, cultivated in vases with substrate infested with Fusarium spp. It was also evaluated the effects of seed treatment and spraying through the use of acibenzolar-S-methyl, on common bean plants, in the resistance induction to disease under greenhouse conditions. Peroxidases and polyphenoloxidases activities, and total soluble protein level were observed in the leaf and stem. The results showed that Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli and Fusarium spp., cultivated on paper-filter discs on agar medium, inhibited the in vitro Cff growth, and the Fusarium spp. isolates were not efficient to induce resistance to bacterial wilt in common bean plants. The acibenzolar-S-methyl seed treatment (25, 50 and 75 g a.i./100 Kg of seeds) was prejudicial to germination and vigour, and it did not induce resistance to disease; spraying bean plants with 250 mg a.i./mL was phytotoxic, while with 100 mg a.i./mL it did not cause phytotoxicity, being either inefficient to induce resistance to bacterial wilt in the susceptible cultivar (IAC Carioca), spraying before or after inoculation, or to increase the resistance in cultivars with different levels of resistance (IAC Carioca Akytã and IAC Carioca Pyatã); the acibenzolar-S-methyl spraying (100 mg a.i./mL) increased the peroxidases activity in leaf and stem, as well as the polyphenoloxidases and total soluble protein level in the stem.
Doutor

Made available in DSpace on 2018-08-24T12:05:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_11833_DISSERTAÇÃO DÉBORA_CRISTINA_GONÇALVES_AGROQQUIMICA_2018.pdf: 1153022 bytes, checksum: 81a5e783c37833c235d8cee08e0683fe (MD5) Previous issue date: 2018-02-23
O tomateiro pode ser cultivado em várias regiões devido à aceitabilidade da cultura a diferentes tipos de clima. Todavia, a cultura é suscetível a uma série de doenças que acarreta na redução da produção e produtividade, dentre as quais se destaca a murcha de Fusarium causada pelo agente etiológico Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici. O plantio de cultivares resistentes tem se mostrado eficiente contra as raças 1 e 2 desse patógeno, entretanto o surgimento da raça 3 tem comprometido a eficiência do controle genético. Assim, o objetivo do presente estudo foi avaliar o potencial uso do óleo essencial de Origanum vulgare L. e do carvacrol no tratamento de sementes visando inibir a incidência da murcha de Fusarium em mudas de tomateiro. O O. vulgare L. e o carvacrol foram caracterizados por CG-DIC e CG-EM. Nos testes in vitro, o OE de O. vulgare L. (50, 85, 140, 240 e 400 µg mL-1) e o carvacrol (50, 85, 140, 240 e 400 µg mL-1) foram avaliados para determinar as concentrações efetivas mínimas para inibir 50 e 100% (CE50 e CE100) do crescimento micelial do patógeno. Os testes de fitotoxicidade com o OE O. vulgare L. e com o carvacrol foram realizados em sementes de tomateiro. Ensaios in vivo foram realizados em casa de vegetação com sementes tratadas com o OE de O. vulgare L. e do carvacrol nas concentrações de 100, 200, 400, 600, 1.200 µg mL-1, onde foram avaliadas as variáveis índice de velocidade de emergência (IVE), altura das mudas de tomateiro e área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD). Os componentes majoritários do OE de O. vulgare L. foram carvacrol (67,67%), o-cimeno (11,60%) e timol (3,91%). Nos testes in vitro o OE de O. vulgare L. e o carvacrol inibiram 100% de PIC nas concentrações de 400 e 200 µg mL-1, respectivamente. O OE de O. vulgare L. apresentou ação fungicida contra F. oxysporum f.sp. lycopersici na concentração de 400 µg mL-1, enquanto o carvacrol apresentou efeito fungistático em todas as concentrações testadas (200-1.000). As CE50 e CE100 para o OE de orégano foram 134,5 e 323 µg mL-1 e para o carvacrol 62,6 e 166 µg mL-1, respectivamente. Não houve fitotoxidez nas sementes nem em plântulas de tomateiro. Para os testes in vivo, o OE de O. vulgare L. e o carvacrol não apresentaram diferença significativa entre osdois; porém houve diferença entre as concentrações, à medida em que as concentrações foram aumentando, a incidência da doença diminuía. A AACPD foi reduzida em 68% na concentração de 1.200 µg mL-1. Portanto, o OE de O. vulgare L. e o carvacrol podem ser uma alternativa para o tratamento de sementes de tomateiro, e fazer parte de um programa de manejo integrado da murcha de Fusarium em mudas de tomateiro.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-16T12:53:24Z No. of bitstreams: 1 Eddy Enrique Barraza Andrion (1).pdf: 947495 bytes, checksum: aa5e0f6002d19bd71d54a71eae9dc237 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-03-16T12:53:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Eddy Enrique Barraza Andrion (1).pdf: 947495 bytes, checksum: aa5e0f6002d19bd71d54a71eae9dc237 (MD5) Previous issue date: 2009-07-31
The cowpea (Vigna unguiculata L.) is one of the main crops in the Northeast of Brazil especially for the small farmers. The Fusarium wilt and Rhizoctonia canker caused by Fusarium oxysporum f.sp. tracheiphilum and Rhizoctonia solani, respectively are the cowpea diseases showing more frequency and intensity in the Northeast of Brazil. This work aimed to evaluate the natural suppressiveness of 66 soils of this region to the Fusarium wilt and Rhizoctonia canker, and to analyze the physical, chemical and biological characteristics of this soils associated with disease suppressiveness or conducivity. The evaluated soils were grouped from highly suppressive to highly conducive in relation to Fusarium wilt and Rhizoctonia canker severities. The main variables involved in Fusarium wilt suppressiveness were high levels of phosphorus and potassium, basal respiration (CO2 evolution) and indexes of microbial diversity and equitability. For Rhizoctonia canker important correlations were determined with levels of phosphorus, potassium and sodium, basal respiration and enzymatic activity of fluorescein diacetate. There was no correlation between physical factors and suppressiveness to Fusarium wilt, but it was possible to correlate the levels of sand, clay and silt with suppressiveness and/or conducivity of Rhizoctonia canker. Three soils previously classified as highly supressive to Rhizoctonia canker were evaluated in relation to eight strains and three inoculum densities of R. solani. There was significant difference among soils and strains in relation to levels of disease severity. In the three soils the severity levels induced by the strain CMM-1053 were similar to those observed in former studies. Most of the strains showed different behavior in relation to soils, except for CMM-1064 and CMM-1066. There was significant difference among disease severity levels and different inoculum densities. The three soils presented good stability in relation to the different R. solani strains, but the inoculum density may be a limiting factor in the implementation of the natural soil suppressiveness or the supressivity induction in conducive soils.
O caupi (Vigna unguiculata L.) é uma das culturas mais importantes da região Nordeste do Brasil, principalmente na economia de pequenos produtores rurais. A murcha-de-fusário e a rizoctoniose, causadas pelos fungos Fusarium oxysporum f.sp. tracheiphilum e Rhizoctonia solani, respectivamente, são as doenças mais freqüentes e de maior intensidade em caupi no Nordeste brasileiro. Esta tese teve como objetivos avaliar a supressividade natural de 66 solos do Nordeste brasileiro à murcha-de-fusário e rizotoniose do caupi, analisar as características físicas, químicas e biológicas dos solos associadas com a supressividade ou conducividade às doenças, bem como avaliar a estabilidade da supressividade de três solos à rizoctonose do caupi, considerando diferentes isolados e densidades de inóculo de R. solani. Em relação à severidade da murcha-de-fusário e da rizoctoniose do caupi, os solos avaliados foram agrupados desde fortemente supressivos a altamente conducivos. As principais variáveis envolvidas na supressividade da murcha-de-fusário foram elevados teores de fósforo e potássio, respiração basal (CO2 evoluído) e os índices de diversidade e eqüitabilidade microbiana. Para a rizoctoniose, foram determinadas correlações importantes com os níveis de fósforo, potássio e sódio, respiração basal e atividade enzimática de diacetato de fluoresceína. Não foram correlacionados fatores físicos com a supressividade à murcha-de-fusário, porém foi possível correlacionar os teores de areia, argila e silte com asupressividade e/ou conducividade da rizoctoniose. Três solos classificados como fortemente supressivos à rizoctoniose foram avaliados em relação a oito isolados e três densidades de inoculo de R. solani. Houve diferença significativa entre os solos e os isolados quanto aos níveis de severidade da doença. Nos três solos os níveis de severidade induzidos pelo isolado CMM-1053 foram similares aos verificados nos estudos prévios. A maioria dos isolados apresentou comportamentos diferente em função dos solos, com exceção dos isolados CMM-1064 e CMM-1066. Foi verificada diferença significativa entre os níveis de severidade da doença e as diferentes densidades de inoculo. Os três solos evidenciaram estabilidade em relação aos diferentes isolados de R. solani, porém a densidade de inóculo pode ser um fator limitante na implementação da supressividade natural dos solos ou da indução da supressividade em solos conducivos.

O Brasil se encontra entre os maiores produtores e consumidores mundiais de feijão, o qual representa a principal fonte de proteína vegetal na dieta alimentar de significativa parcela da população. Apesar de apresentar destaque na produção mundial de feijão, a produtividade média brasileira é muito baixa. Na safra das águas de 2002, o Brasil obteve uma produtividade de 926kg.ha-1, valor muito aquém do potencial genético da cultura, que pode chegar a 4.000kg.ha-1. As doenças estão entre os principais fatores que contribuem para a baixa produtividade e o alto risco dessa cultura. As doenças causadas por fungos de solo são um dos fatores de maior contribuição, com destaque para a murcha ou amarelecimento de Fusarium. Alguns estudiosos apontam, como uma das principais causas para a ocorrência e predisposição das plantas a patógenos e insetos-praga, o desequilíbrio nutricional (carência ou excesso) aliado ao estádio fenológico do hospedeiro, além do componente genético. Nas condições do Brasil, ainda são escassos os trabalhos visando ao controle cultural da murcha de fusarium em feijão. Assim, o presente trabalho teve por objetivos: (i) a avaliação do efeito da variação do pH do meio de cultura sobre o desenvolvimento micelial de Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli; (ii) a verificação do efeito da variação do pH do meio de cultura, na patogenicidade de Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli; e (iii) a verificação e a quantificação dos efeitos das fontes e distribuição da adubação nitrogenada e do tratamento químico das sementes, na incidência e severidade da murcha de fusarium e na produtividade de feijão. Foram avaliadas quatro raças de F. oxysporum f. sp. phaseoli, em função de seis valores de pH in vitro. Em casa-de-vegetação, foram testadas as mesmas quatro raças provenientes do experimento in vitro. E em campo, foram avaliadas duas fontes e cinco combinações de doses de adubação nitrogenada, em relação à incidência da murcha de fusarium e à produtividade de feijão. De acordo com os resultados obtidos neste trabalho, pode-se concluir que: (i) as quatro raças de F. oxysporum f. sp. phaseoli apresentaram reações distintas, em função da variação do pH do meio de cultura; (ii) as raças III e IV apresentaram desenvolvimento mais rápido; (iii) as diferenças proporcionadas pela variação do pH do meio de cultura foram menores que as causadas pelas raças; (iv) a variação do pH do meio de cultura não proporcionou diferenças na patogenicidade das mesmas; (v) apesar de não terem sido observadas diferenças estatísticas entre as raças de F. oxysporum f. sp. phaseoli, a raça I, foi mais patogênica; (vi) o tratamento químico de sementes de feijão, assim como a adubação nitrogenada de feijão, não proporcionou diferenças na população, incidência da murcha de fusarium e produtividade de grãos de feijão; (vii) não houve influência da adubação nitrogenada na população, incidência da murcha de fusarium e produtividade de grãos de feijão; (viii) as fontes e combinações de doses de N, assim como o tratamento químico das sementes, não proporcionaram diferenças nos teores dos macronutrientes e micronutrientes, exceto para o ferro, nas folhas de feijão; e (ix) a adubação nitrogenada com 0+80kg.ha-1 e 10+70kg.ha-1 (semeadura+cobertura) proporcionaram maiores teores de ferro em folhas de feijão.
Brazil is one of the biggest world growers and consumers of common bean, that is one of the main protein sources in the feeding habits of the significantly population plot. Even if present prominence in the world common bean production, the Brazilian yield is very low. In the spring-summer 2002 the yield was about 926 kg.ha-1, a value much lower than the crop genetic potential, that can reach 4,000 kg.ha-1. Between the mainly factors that contribute for the low yield and the unstability of this crop, diseases have an important place. The diseases caused by soil fungi are one of the most important factors, with prominence to the fusarium wilt. Some researchers point the nutritional imbalance (lack or excess) as one of the mainly causes for the occurrence and predisposition of the plants to the pathogens and insects-pests attack, in addition with the plant growing phase and the climate conditions, beyond of the genetics interference. In the Brazilian conditions, there are a few studies that aimed the cultural control of the bean yellows. This study aimed: (i) the evaluation of the culture media pH variation effect at the mycelia development of Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli; (ii) the verification of the culture media pH variation effects at the pathogenicity of F. oxysporum f. sp. phaseoli; and (iii) the verification and quantification of the N sources and doses combinations effects at the incidence of fusarium wilt and common bean yield. Four strains of F. oxysporum f. sp. phaseoli were evaluated in relation of six culture media pH values. The same four strains proceeding from the in vitro experiment were tested in a green house experiment. Two sources and five doses combination of nitrogen fertilizaton were evaluated in relation of bean yellows incidence and common beans yield. The results obtained in this study showed that: (i) the four strains of F. oxysporum f. sp. phaseoli showed distinct reactions according the culture media pH variation; (ii) the strains III and IV showed faster development; (iii) the differences caused by the culture media pH variation were smaller than those caused by the strains; (iv) the culture media pH variation did not cause pathogenicity variation; (v) although statistical differences were not observed between the strains of F. oxysporum f. sp. phaseoli, the strain I was the most pathogenic; (vi) the chemical common bean seeds treatment, as well the nitrogen fertilization did not cause differences in the population, fusarium wilt incidence and common bean yield; (vii) the sources and combinations of nitrogen doses, as well the chemical common bean seeds treatment, did not cause differences in the macronutrients and micronutrients content, except for iron in the common bean leaves; and (viii) the nitrogen fertilization with 0+80kg.ha-1 and 10+70kg.ha-1 (planting and cover) caused greater iron content in common bean leaves.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-20T14:08:02Z No. of bitstreams: 1 Domingos Eduardo Guimaraes Tavares de Andrade.pdf: 2752116 bytes, checksum: f1548d1f41182d089565eefd683ee4ff (MD5)
Made available in DSpace on 2017-02-20T14:08:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Domingos Eduardo Guimaraes Tavares de Andrade.pdf: 2752116 bytes, checksum: f1548d1f41182d089565eefd683ee4ff (MD5) Previous issue date: 1999-02-24
Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
Fresh tomato is very important in the Agreste Region of Pernambuco State, Brazil. However its production is impaired by the occurrence of Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f.sp. lycopersyci. This study aimed to survey the disease intensity in planting areas of Camocim de São Félix county, Agreste of Pernambuco and to determine the ideal sample size for disease assessment, to analyze the disease spatial pattern in field, to characterize the variability of Fusarium oxysporum f.sp. lycopersyci populations and to select the resistance of tomato cultivars to races 1 and 2 of the pathogen. The disease survey in 50 planting areas showed high disease prevalence (72%) and average incidence of 17,15%. Using the incidence data from 36 areas as pilot-samples, the sample size for disease assessment was determined accordimg to the mean variability coefficient. The number of rows to be sampled was inversely related to disease incidence and acceptable error. To quantify the disease in future surveys, considering 10% error, each area should have 130rows and 12 plants/row sampled. The disease spatial pattern was studied in 11 planting areas in plots with 480 plants, using mapping, ordinary runs, fitting of β-binomial distribution and spatial autocorrelation analyses. Seven areas showed agregation of diseased plants and four areas presented the randomized pattern suggesting that there is not a single spatial pattern of the diasease in field.Thirty-six pathogen isolates were characterized in relation to epidemiological components, races and isoenzymatic patterns. The disease incidence separated isolates into two similarity groups but based upon the area under the disease progress curve (AUPDC) and progress rate there was three groups. Only one isolate belonged to race 1 while all the others were race 2 suggesting a small population variability regarding to races. The relative mobility of bands indicated six similarity groups for esterases and eight groups for fosfatase. There were no significant correlations among the relative mobility values for isozymes and the values for epidemiological components. In the resistance assay the disease temporal progress was analysed in 25 tomato cultivars inoculated with isolates of races 1 and 2. Race 2 isolates induced disease symptoms in all cultivars but race 1 isolates only induced symptoms in cultivars Santa clara I-5300, Jumbo AG-592, Barão Vermelho AG-591, Débora Plus AF-799, Débora and Viradouro. The cultivars Seculus and Rio Grande showedlonger incubation periods and smaller incidence values, progress rate and AUPDC, suggesting their use in programs of Fusarium wilt integrated management in Agreste of Pernambuco.
A cultura do tomateiro estaqueado apresenta expressiva importância na região Agreste do Estado de Pernambuco tendo, contudo, sua produção é limitada devido à ocorrência de murcha-de-fusário, causada por Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici. Este estudo objetivou realizar o levantamento da intensidade da murcha-de-fusário em áreas de plantio no município de Camocim de São Félix, Agreste do Estado de Pernambuco, determinar o tamanho ideal da amostra para quantificação da doença, analisar o arranjo espacial da doença no campo, caracterizar a variabilidade de populações de F. oxysporum f.sp. lycopersici e selecionar cultivares de tomateiro resistentes às raças 1 e 2 do patógeno. No levantamento da intensidade da murcha-de-fusário em 50 áreas de plantio, foi constatada uma alta prevalência da doença (72%), com incidência média de 17,15%. Utilizando os dados de incidência de 36 áreas como amostragens-piloto o tamanho de amostras para quantificação da doença foi determinado com base no coeficiente de variação da média. O número de linhas por área, a ser amostrado, reduziu com a elevação da incidência da doença e do erro aceitável. Considerando o nível de erro de 10%, a amostragem em cada área de 130 linhas com 12 plantas/linha é apropriada para quantificar a incidência da doença em levantamentos futuros. O arranjo espacial da doença foi investigado em 11 áreas de plantio, numa parcela de 480 plantas/área, utilizando-se as análises de mapeamento, “ordinary runs”,ajuste à distribuição beta-binomial e autocorrrelação espacial. Em sete áreas ficou evidenciada a agregação de plantas doentes, enquanto que em quatro, ficou evidente o arranjo aleatório, indicando não haver um padrão único de arranjo espacial da doença no campo. Na caracterização da variabilidade de F. oxysporum f.sp. lycopersici, 36 isolados foram avaliados em relação a componentes epidemiológicos, a raças e a padrões isoenzimáticos. Com base na incidência da doença foi possível a separação dos isolados em dois grupos de similaridade, elevando-se para três quando consideradas a área abaixo da curva de progresso da doença e a taxa de progresso. Apenas um isolado foi caracterizado como pertencente à raça 1, enquanto os demais foram pertencentes à raça 2, indicando uma pequena variabilidade na população quanto à raça. O padrão isoenzimático possibilitou a separação dos isolados em seis grupos de similaridade para esterase e oito grupos para fosfatase. Não foram constatadas correlações significativas entre os valores da mobilidade relativa para as isoenzimas e os obtidos nos componentes epidemiológicos. Na avaliação da resistência ao patógeno, foi analisado o progresso temporal da murcha-de-fusário em 25 cultivares de tomateiro inoculadas com isolados das raças 1 e 2. Todas as cultivares apresentaram plantas com sintomas da doença, quando inoculadas com os isolados da raça 2, enquanto apenas as cultivares Santa Clara I-5300, Jumbo AG-592, Barão Vermelho AG-591, Híbrido Débora Plus AF-799, H. Débora e Viradoro evidenciaram suscetibilidade ao isolado da raça 1. As cultivares H. Seculus e Rio Grande destacaram-se das demais ao propiciarem os maiores períodos de incubação e os menores valores de incidência, de taxa de progresso e de área abaixo da curva de progresso da doença, indicando o potencial para utilização em programas de manejo integrado da murcha-de-fusário no Agreste de Pernambuco.

Submitted by Celso Magalhaes (celsomagalhaes@ufrrj.br) on 2018-08-14T12:35:45Z No. of bitstreams: 1 2017 - Cristiana Maia de Oliveira.pdf: 3631492 bytes, checksum: d4d9d115590b3750ed24bebb16823dea (MD5)
Made available in DSpace on 2018-08-14T12:35:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017 - Cristiana Maia de Oliveira.pdf: 3631492 bytes, checksum: d4d9d115590b3750ed24bebb16823dea (MD5) Previous issue date: 2017-08-25
Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES
Among the main diseases which affects tomato plants there is Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (FOL). Control of this disease is difficult due to the farmer?s specialization in the crop, pathogen ability to survive in the soil for long periods and physiological specialization of the pathogen in races. Three races of the pathogen have been described in Brazil, 1, 2 and 3, being the 3 of more restricted occurrence. The main strategy to control this disease is the use of resistant cultivars to the races present in the region. Nova Friburgo, RJ, an important tomato producing region during the summer, shows serious problems with plant diseases caused by common soil pathogens and soil management. For this reason, the present work was developed based on the collection of soil and plants samples in 41 farm family units, aiming to study different aspects related to Fusarium wilt in the region. The presentation of the work and the results obtained was divided into four chapters. In Chapter 1, a survey on the occurrence of the disease in the farm unities and identification of the predominant races was presented. In Chapter 2, studies on the incidence and distribution of the disease, as well as, evaluation of the most planted cultivars for resistance to the three races of FOL was presented. In the Chapter 3, we have showed studies on the management practices adopted by the farmers and their relations with soil fertility, plant nutrition and disease severity. Finally, in Chapter 4, 100 tomato accessions were evaluated regarding cultivar resistance to the three races of the pathogen. The accessions were obtained in the germplasm collection of the Department of Crop Science of the UFRRJ. Among the main results, we could identify the generalized occurrence of race 3 of FOL in the region, as well as, that most of the planted cultivars are susceptible to this race. The management practices adopted by the farmers contribute to the dissemination and survival of the pathogen the selection of race 3 due to the use of resistant cultivars to races 1 and 2 only. Finally, from the tomato accessions evaluated, five were resistant to races 1 and 2 of FOL and no resistant access to race 3 was identified
Dentre as principais doen?as do tomateiro est? a murcha-de-fus?rio causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (FOL). O seu controle ? dificultado pelo cultivo sucessivo do tomateiro (Solanum lycopersicum L.) por produtores especializados na cultura, pela capacidade de sobreviv?ncia do pat?geno no solo por longos per?odos e pela presen?a de ra?as do pat?geno. At? ent?o j? foram descritas tr?s ra?as do pat?geno no Brasil (1, 2 e 3) sendo a ra?a 3 de ocorr?ncia mais restrita. A principal estrat?gia para controle da doen?a ? o uso de cultivares resistentes ?(s) ra?a(s) presentes na regi?o. O munic?pio de Nova Friburgo, RJ, importante regi?o produtora de tomate no ver?o, apresenta s?rios problemas com doen?as causadas por pat?genos habitantes do solo, que se intensificam devido a pr?ticas inadequadas de manejo de solo. Diante disto, desenvolveu-se o presente trabalho tendo como base a coleta de amostras de solo e de plantas em 41 unidades familiares visando estudar diferentes aspectos relacionados ? murcha-de-fus?rio na regi?o. A apresenta??o do trabalho e dos resultados obtidos foi dividida em quatro cap?tulos. No Cap?tulo 1, s?o apresentados estudos com o levantamento sobre a ocorr?ncia da doen?a nas propriedades e de identifica??o das ra?as predominantes. No Cap?tulo 2, s?o apresentados estudos sobre a incid?ncia e distribui??o da doen?a e avalia??o das cultivares mais plantadas quanto a resist?ncia ?s tr?s ra?as de FOL. No Cap?tulo 3, s?o apresentados os estudos sobre as pr?ticas de manejo adotadas pelos produtores e as suas rela??es com a fertilidade do solo, nutri??o das plantas e severidade da doen?a. E finalmente, no Cap?tulo 4 ? descrita a avalia??o de cerca de 100 acessos de tomateiro da cole??o de germoplasma do Departamento de Fitotecnia da UFRRJ quanto ? resist?ncia ?s tr?s ra?as do pat?geno. Entre os principais resultados obtidos pode-se destacar a constata??o de ocorr?ncia generalizada da ra?a 3 de FOL na regi?o e a confirma??o de que a maioria das cultivares plantadas s?o suscet?veis a esta ra?a. Constatou-se, ainda, que as pr?ticas de manejo adotadas pelos produtores contribuem para a dissemina??o e sobreviv?ncia do pat?geno e para sele??o da ra?a 3 devido ao uso de cultivares resistentes ?s ra?as 1 e 2. Por fim, na avalia??o dos acessos de tomateiro da UFRRJ, identificaram-se cinco acessos resistentes ?s ra?as 1 e 2 de FOL e nenhum acesso resistente ? ra?a 3.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-17T15:25:38Z No. of bitstreams: 1 Cleia Santos Cabral.pdf: 1106804 bytes, checksum: 14447df94770ff469bfc234136893b59 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-02-17T15:25:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cleia Santos Cabral.pdf: 1106804 bytes, checksum: 14447df94770ff469bfc234136893b59 (MD5) Previous issue date: 2012-02-17
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
Fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f. sp. lactucae (FOLac), is an important disease of lettuce in the world. This disease was reported in Brazil, recently. From 2008 to 2011 the laboratories of Plant Pathology of Embrapa Hortaliças (Embrapa Vegetable Crops), Sakata Seeds Sudamerica and Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural (INCAPER) collected some FOLac isolates in states from the Southern and the Southeastern regions of Brazil. The isolates were identified as F. oxysporum by the morphological characteristics of conidia and conidiophores. Isolates were inoculated on lettuce plants, cultivars Elisa, Vera, and Red Salad Bowl, conditions in a greenhouse. Isolates were also inoculated on plants of others Asteraceae species (Cichorium endivia, Cichorium intybus, Sonchus oleraceus, Emilia sonchifolia, Bidens pilosa e Tagetes erecta) and others botanical families as (Solanum lycopersicum, Capsicum annuum, Nicotiana tabacum, Gossypium hirsutum, Phaseolus vulgaris e Ocimum basilicum). Lettuce cultivars Elisa and Vera were suscetible to all isolates while the cultivar Red Salad Bowl was resistant. All isolates were reisolated from diseased plants fulfilling the Koch‟s postulates. Others plant species were not susceptible to any isolate, proving that isolates belong to the species F. oxysporum f. sp. lactucae. The isolates were also inoculated in a differential set of cultivars comprising: „Patriot‟ (Susceptible to all races), „Costa Rica No. 4‟ (resistant to race 1) and „Banchu Red Fire‟ (resistant to race 2). Cultivars „Patriot‟ and „Banchu Red Fire‟ were susceptible while „Costa Rica No. 4‟ was resistant, confirming that all the isolates were race 1. Molecular analysis using a primer specific to race 1 isolates was performed using F. oxysporum f. sp. lycopersici (FOL) raça 3 and a non-pathogenic isolate as negative controls. DNAs of FOLac isolates were amplified by PCR and those of the negative controls were not, confirming the specificity of the primers and the presence of only the race 1 of FOLac in Brazil. In addition, it was used the Translation elongation factor 1-α region (tef-1α) for phylogenetic analysis between FOLac isolates races 1 and 2 and isolates of F. oxysporum. Comparison of the sequences obtained with the tef-1α confirmed the polyphyletic origin of the forma specialis lactucae and also showed a greater genetic variability among Brazilian isolates of FOLac race 1compared with isolates of the same race available in GenBank. After the isolates characterization, it was made a screening of 102 accessions for resistance to the isolate Fus-173 and it was selected 47 as highly resistant. After this, the selected genotypes were evaluated for the stability of resistance in three additional assays, using different FOLac race 1 isolates. In all three assays it was used a highly susceptible cultivar (Regina) as susceptible control. In the first assay, carried out in October 2011, it were used the isolates Fus-202 and Fus-205. In the second assay, carried out in November 2011, it were used the isolates Fus-219 and Fus-222. In the third assay, carried out in December 2011, it were used the isolates (Fus-207, Fus-209 e Fus-220). Inoculation was performed on 25 days old seedlings on greenhouse conditions. Seedlings were inoculated by cutting their roots and emerging them in spore suspension of pathogen. Evaluation was carries out 30 days after inoculation, using a grade scale varying from 0 (heath plants) to 4 (dead plants). Data were transformed in Disease Index (DI) submitted to a variance analysis and the media were compared by the Tukey‟s test (5%). Thirty two accessions were identified as having broad spectrum of resistance to different pathogen isolates in the four inoculation seasons.
A murcha de fusário, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. lactucae (FOLac) é uma das doenças mais importantes da alface. Esta doença foi relatada recentemente no Brasil. Nos anos de 2008 a 2011 foram coletados isolados de FOLac nos Laboratórios de Fitopatologia da Embrapa Hortaliças, Sakata Seed Sudamerica Ltda e do Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural (Incaper). Estes eram provenientes de todos os estados das Regiões Sul e Sudeste do Brasil. A identificação foi feita observando-se as características morfológicas de conídios e conidióforos. Os isolados foram inoculados em plantas das cultivares Elisa, Vera e Red Salad Bowl, em condições de casa de vegetação. Os mesmos também foram inoculados em plantas de outras espécies de Asteraceae (Cichorium endivia, Cichorium intybus, Sonchus oleraceus, Emilia sonchifolia, Bidens pilosa e Tagetes erecta) e de outras famílias (Solanum lycopersicum, Capsicum annuum, Nicotiana tabacum, Gossypium hirsutum, Phaseolus vulgaris e Ocimum basilicum). Os isolados foram identificados como Fusarium oxysporum. As cultivares Elisa e Vera foram suscetíveis a todos os isolados e a Red Salad Bowl foi resistente. Efetuou-se o re-isolamento do patógeno, completando-se assim os Postulados de Koch. Nenhuma outra espécie de planta foi suscetível ao patógeno, confirmando a identificação como F. oxysporum f. sp. lactucae. Em seguida, os isolados foram avaliados quanto a sua virulência numa série de cultivares diferenciadoras de raças: Patriot (suscetível), Costa Rica No. 4 (resistente à raça 1) e Banchu Red Fire (resistente à raça 2). As cultivares Patriot e Banchu Red Fire comportaram-se como suscetíveis a todos os isolados, enquanto a cultivar Costa Rica No. 4 comportou-se como resistente. Concluiu-se que os isolados avaliados são da raça 1 de FOLac. Adicionalmente, foi feito um teste com primers específicos para a raça 1 de FOLac, utilizando como controles um isolado de F. oxysporum f. sp. lycopersici (FOL) raça 3 e um isolado não patogênico de F. oxysporum. O fragmento de DNA foi amplificado por PCR para os isolados de FOLac e não foi amplificado para o isolado de FOL e nem para o isolado não patogênico de F. oxysporum. Este resultado confirma a especificidade desse par de primers e a presença apenas da raça 1 de FOLac no Brasil. Além disso, foi utilizada a região do fator de elongação da tradução (tef-1α) para análise filogenética entre os isolados FOLac raças 1 e 2 e isolados de F. oxysporum. Comparação das seqüências obtidas com o tef-1α confirmou a origem polifilética da forma specialis lactucae e também observou-se uma maior variabilidade genética entre os isolados brasileiros de FOLac raça 1 comparados com isolados da mesma raça disponíveis no GenbanK. Posteriormente, 102 acessos (cultivares comerciais ou linhagens) foram avaliados, visando identificar fontes de resistência a FOLac e analisar a estabilidade da resistência de acessos promissores a diferentes isolados do patógeno. Inicialmente foi feita uma seleção preliminar, utilizando um isolado do patógeno (Fus-173). Em seguida, quarenta e sete acessos altamente resistentes mais uma testemunha suscetível (Regina), identificados na seleção preliminar, foram reavaliados para estabilidade da resistência ao FOLac raça 1, utilizando os isolados (Fus-202 e Fus-205) no mês de Outubro de 2011; isolados (Fus-219 e Fus-222) no mês de Novembro de 2011 e isolados (Fus-207, Fus-209 e Fus-220) no mês de Dezembro de 2011. A inoculação foi realizada em condições de casa de vegetação, pelo método de corte das raízes e imersão na suspensão de conídios do patógeno. A avaliação foi realizada após 30 dias, com auxílio de escala de notas variando de 0 (planta sadia) a 4 (planta morta). Os dados obtidos foram transformados em índice de doença (ID) e submetidos a uma análise de variância e comparação de médias pelo teste de Tukey (5%). Foram identificados trinta e dois acessos apresentando amplo espectro de resistência aos diferentes isolados do patógeno nas quatro épocas de inoculação.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-16T15:49:19Z No. of bitstreams: 1 Erick Farias Couto.pdf: 519238 bytes, checksum: 39bbbff610acf377a744dada09f340cf (MD5)
Made available in DSpace on 2017-03-16T15:49:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Erick Farias Couto.pdf: 519238 bytes, checksum: 39bbbff610acf377a744dada09f340cf (MD5) Previous issue date: 2008-03-03
The cotton has been in the human history for ages; it is used to the confection of clothes and its subproducts are an important source of protein to the domestic animals. Because of its wide distribution in the Brazil, the ocurrence of disease has become more frequently. Among the diseases, great importance is given to the fusarium wilt of cotton (Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum) because of its potential to cause severe losses and its hard control. The present work aimed to develop alternatives to be offered to the cotton producers. The first experiment refers to the evaluation of the planting methods of cotton and the reaction of 106 cultivars in relation to the vascular wilt of fusarium. Among the methods of planting, the plastic cups was chosen because in this method the roots of the seedlings can grow more vigorously. In the water restricion method there was no ocurrence of typical simptoms of the vascular wilt. The paper towel method resulted in anormal seedlings or the seedlings were contaminated with parasites. It was possible to determinated a group with a high level of resistance among the cultivars tested. In this group, its important to say that the cultivar SP 2473-A also exhibit resistance to the ramulosis. The second experiment is reffered to the resistance induction with the abiotic inducers (acibenzolar-S-metil, metil jasmonato e fosfato de potássio) in seedlings of the cotton cultivar ‘BRS Cedro’ and the evaluation of the enzymatic activity elicited (in samples of leaves and stem) in seedlings induced (once and twice) and seedlings without the induction, inoculatedand not inoculated with Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum. The infection index was also evaluated in this treatments. The treatment with methyl jasmonate (two inoculations) in the stem showed the minor infection index (45,00). It was possible to correlate this treatment with the minor infection index and the high level of the enzyme superoxide dismutase in the stem.
O algodão tem acompanhado a história do homem desde tempos remotos, serve como matéria prima para a confecção de vestuário e ainda apresenta como subprodutos uma rica fonte de proteína para o consumo de animais domésticos. Devido a sua ampla distribuição em todo o Brasil, a ocorrência de doenças tem se tornado cada vez mais freqüente. Dentre as doenças, um grande destaque é dado a murcha de fusário (Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum), devido ao seu potencial em causar sérios prejuízos e seu difícil controle. Diante do exposto, o presente trabalho refere-se as atividades realizadas visando desenvolver uma alternativa para a cadeia produtiva do algodoeiro. O primeiro experimento refere-se a avaliação de métodos de plantio de algodoeiro e avaliação de 106 cultivares de algodoeiro em relação a murcha de fusário. Dentre os métodos de plantio avaliados, o plantio em copo plástico foi o escolhido por ter proporcionado um melhor desenvolvimento do sistema radicular das plântulas de algodoeiro. No método da restrição hídrica não ocorreu o aparecimento de sintomas característicos da murcha de fusário. O método do papel toalha resultou em plântulas anormais ou as sementes foram parasitadas com contaminantes. Entre as cultivares testadas quanto a reação a murcha de fusário foi possível estabelecer um grupo com um alto nível de resistência com destaque para a cultivar SP 2473-A, que também possui resistência contra a ramulose. O segundo experimento refere-se a indução de resistência com os indutores abióticos (acibenzolar-S-metil, metiljasmonato e fosfato de potássio) em plântulas da cultivar BRS Cedro de algodoeiro e avaliação da atividade enzimática elicitada (amostras de folhas e caule) em plantas induzidas (com uma e duas induções) e não induzidas, inoculadas e não inoculadas com Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum, sendo ainda realizada a avaliação do índice de infecção. O menor índice de infecção (45,00) foi obtido pelo tratamento com metil jasmonato (duas inoculações) no caule. Neste tratamento foi possível estabelecer a provável conexão entre o menor índice de infecção e um alto nível da enzima peroxidase nas folhas e da enzima superóxido dismutase no caule.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-20T18:26:23Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 899599 bytes, checksum: 6cb5d0eb2fc69c24761a203f60e8006c (MD5)
Made available in DSpace on 2017-06-20T18:26:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 899599 bytes, checksum: 6cb5d0eb2fc69c24761a203f60e8006c (MD5) Previous issue date: 2012-07-27
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Foram isoladas bactérias da rizosfera de plantas-escape ou apresentando baixa seve- ridade de doenças em cultivo de tomateiro convencional e orgânico, de floresta de eucalipto e de floresta nativa. Utilizando metodologias para o isolamento de actino- micetos e de rizobactérias totais e endosporogênicas foram obtidos um total de 635 isolados bacterianos, sendo 590 obtidos no presente trabalho e 45 selecionados em outros trabalhos. Sementes de tomate foram microbiolizadas com suspensão bacte- riana de cada um dos isolados. Vinte e nove isolados (4,56%) foram capazes de reduzir as doenças do tomateiro causadas por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol) e Xanthomonas gardneri (Xg) em 50% ou mais e em 60% ou mais, respectiva- mente em substrato esterilizado. No ensaio realizado em substrato não esterilizado, as plantas tratadas com os antagonistas foram novamente desafiadas contra Xg e Fol e também foi testado se os isolados seriam eficientes no biocontrole do fungo Alternaria solani (As). No ensaio realizado em solo não esterilizado, os antagonista foram dispensados no tomateiro por microbiolização de sementes e encharcamento de solo cinco dias antes da inoculação com o patógeno desafiante. Alguns isolados não foram eficientes em promover o biocontrole da mancha-bacteriana e da murcha- de-fusário em solo não esterilizado. Quinze dos isolados selecionados contra Xg e Fol também foram eficientes no biocontrole da pinta-preta. Todos os 29 isolados foram capazes de colonizarar o sistema radicular das plântulas de tomateiro. Os três isolados que mais reduziram as severidades de Fol, Xg e As, em percentagem média, foram os isolados UFV252 (não identificado), UFV618 (Streptomyces setonii) e UFV592 (Bacillus cereus) em 47,91, 46,32 e 42,02%, respectivamente. Esses três isolados e o ácido jasmônico (AJ) foram testados contra Xg, Fol e As e na atividade de enzimas de defesa: β-1,3-glucanases (GLU), quitinases (QUI), peroxidases (POX), polifenoloxidases (PFO), lipoxigenases (LOX) e fenilalanina amônia-liases (FAL), além da concentração de aldeído malônico (MDA). Os isolados foram aplicados nas plantas por microbiolização de sementes e também por encharcamento de solo cinco dias antes da inoculação dos patógenos desafiantes e o AJ foi pulverizado nas plantas 48 horas antes da inoculação. Mesmo nas plantas não inoculadas, os tratamentos tiveram maior atividade de algumas enzimas em relação ao tratamento-controle não inoculado. Esses resultados sugerem que as rizobactérias podem estar induzindo resistência sistêmica no tomateiro, uma vez que mesmo na ausência do patógeno ocorreu aumento na atividade enzimática. No patossistema tomateiro-Xg as maiores atividades das enzimas de defesa nas plantas inoculadas com Xg em comparação ao controle que resultaram em menor severidade da mancha-bacteriana foram: QUI e LOX, para o tratamento UFV618; PPO, QUI e LOX, para os tratamentos UFV592 e UFV252; e GLU, QUI, POX, PPO e FAL, para o tratamento AJ. Para o patossistema tomateiro-Fol, as maiores atividades das enzimas de defesa nas plantas inoculadas com Fol em comparação ao controle, que resultaram em menor severidade da murcha-de-fusário foram as enzimas QUI e LOX, para os tratamentos UFV618; e UFV592, para o tratamento AJ. Além dessas enzimas houve aumento na atividade da POX e PAL. No tratamento UFV252 houve aumento na atividade das enzimas PFO, FAL e QUI. Já no patossistema tomateiro-As foi observado que não houve aumento da atividade de nenhuma enzima para o tratamento UFV618, entre as plantas inocu- ladas com As e o tratamento-controle; também não ocorreu redução da severidade da pinta-preta. Entretanto, no tratamento UFV592 houve aumento na atividade das enzi- mas QUI e FAL e no tratamento UFV252 ocorreu aumento na atividade da PFO e FAL. Além da PFO, QUI e FAL houve aumento na atividade LOX no tratamento AJ. A maior atividade dessas enzimas parece ter contribuído para a redução da severi- dade da pinta-preta pelos tratamentos UFV592, UFV252 e AJ. Em todos os patossis- temas em pelo menos uma época de coleta a concentração de MDA foi maior no tratamento-controle, inoculado em comparação com os tratamentos UFV618, UFV592, UFV252 e AJ, indicando maior dano nas membranas no tratamento- controle, o que corrobora com os maiores valores de severidade observados nesse tratamento.
Bacteria were isolated from the rhizosphere of plants escape or showing low disease severity in tomato cultivation of conventional and organic eucalyptus forest and native forest. Using methodologies for isolating actinomycetes, rhizobacterias, and endosporogenic bacterias. This gave a total of 635 bacterial isolates, 590 isolates were obtained in this study and 45 isolates were selected for further work. Tomato seeds were microbiolized with bacterial suspension of each isolate. Twenty-nine isolates (4.56%), were able to reduce the tomato diseases caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol) and Xanthomonas gardneri (Xg) in 50% or more and 60% or more, respectively, in sterile substrates. In the assay accomplished in substrate unsterile, plants treated with the antagonists were again challenged against Xg and Fol and also tested whether these isolates would be effective in the biocontrol fungus Alternaria solani (As). In the test carried out in non-sterile soil, the antagonist were dispensed by microbiolization in tomato seeds and soil drenching, five days before inoculation with the pathogen challenging. Some isolates were effective in promoting the biocontrol of bacterial spot and fusarium wilt in unsterilized soil. Fifteen of selected isolates against Xg and Fol were also effective in biocontrol of early blight. All 29 isolates were able to colonizarar the root system of tomato seedlings. The three isolates that most reduced the severities of Fol, Xg, and As, average percentage, the isolates were UFV252 (unidentified), UFV618 (Streptomyces setonii) e UFV592 (Bacillus cereus) at 47.91, 46.32, and 42.02%, respectively. These three isolates and jasmonic acid (JA) were tested agains Xg, Fol, and As and activity of defense enzymes: β-1,3-glucanases (GLU), chitinases (CHI), peroxidases (POX), polyphenoloxidases (PPO), lipoxygenases (LOX), and phenylalanine ammonia lyase (PAL), in addition the concentration of malondialdehyde (MDA). The strains were applied in plants by seed microbiolization and also by soil drenching, five days before inoculation of challenging pathogens and the JA was sprayed on plants 48 h before inoculation. Even in non-inoculated plants treatments had higher activity of some enzymes in relation to the control uninoculated. These results suggest that rhizobacteria may be inducing systemic resistance in tomato, since even in the absence of the pathogen caused an increase in enzyme activity. In pathosystem tomato-Xg the highest activities of defense enzymes in plants inoculated with Xg compared to the control that resulted in lower bacterial spot severity were: CHI and LOX for the treatment UFV618; PPO, CHI, and LOX for the treatments UFV592 and UFV252, and GLU, CHI, POX, PPO e PAL for the treatment JA. In pathosystem tomato - Fol the highest activities of defense enzymes in plants inoculated with Fol compared to the control, that resulted in lower fusarium wilt severity were the enzymes CHI and LOX for the treatments UFV618 and UFV592, for the treatment JA beyond these enzymes increased in activity of POX and PAL. In UFV252 treatment increased the activity of enzymes PPO, PAL e CHI. Already in the pathosystem tomato- As was noted that there was no increase in the activity of the enzyme for the UFV618 treatment, between inoculated plants with As and control treatment, there was also no reduction in severity of early blight. However, the UFV592 treatment was no increase in enzyme activity CHI and FAL, and UFV252 treatment occurred increase in PPO activity and FAL. Besides the PPO, CHI, and PAL there was an increase in LOX activity in JA treatment. The increased activity of these enzymes appears to have contributed to reducing the severity of early blight by UFV592, AJ, and UFV252 treatments. In all pathosystems at least one collection time the concentration of MDA in control treatment was higher in comparison to UFV618, UFV592, AJ, and UFV252 inoculated treatments. Indicating greater damage membranes in control treatment which corroborates with the highest severity observed in these treatments.
Tese liberada do sigilo pelo Orientador em 06 de junho de 2017. Documento anexado ao Termo de Autorização.

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CAPES
The fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici is a disease of economic importance to tomato crop (Lycopersicon esculentum Mill.) because of the losses caused in the production. This study aimed to select bacteria belonging to the genus Bacillus which have antagonistic activity to fungi present in tomato producing areas. It was obtained 193 bacterial isolates from tomato roots and stems. We performed the complete sequencing 16S rRNA subunit of 32 bacteria from the work collection using the 27F and Amp2 primers. These bacteria were randomly selected, and 20 bacteria were obtained from healthy tomato plants. The results showed a high similarity to species of the genus Bacillus: B. thuringiensis, B. megaterium, B. cereus, B. toyonensis, B. stratosphericus and Paenibacillus barcinonensis. Evaluation of the functional characteristics of the bacterial strains showed that 72% possess proteolytic activity, 78% have cellulolytic activity, 48% are able to solubilize inorganic phosphate, 42% solubilize zinc oxide and 40.8% are able to produce indols. Antagonism tests carried out in vitro showed that some bacterial strains reduced the mycelial growth of the three races of the fungus when subjected to direct method (parallel streaks). An experiment was conducted using the genotypes Debora Plus, Santa Clara Miss Brazil, Perinha and Carolina in order to select a sensitive tomato genotype to the three fungal races. The Perinha variety was the most susceptible for races 1, 2 and 3 and presented the highest percentage of fungal colonization. Thus, this variety was used in a greenhouse experiments to evaluate the antagonistic role of the Bacillus strains against three fungal races. The antagonistic activity of bacteria was assessed 15 days after transplanting of the tomato seedlings to contaminated substrate. The results showed that the B. stratosphericus strain contributed to control at least 93.25% of the damage caused by race 1, strains from species B. megaterium and B. thuringiensis controlled 100% the damage caused by race 2 and at least 67.35% of the disease caused by the race 3 of the fungus. The results suggest that some strains have the potential to control race 1, 2 and 3 of the F. oxysporum f. sp. lycopersici and have functional activities that may contribute to improving the growth of tomato plants. However, field studies are needed to confirm the role of these Bacillus species during the interaction with tomato plants grown in soil contaminated with the race 1, 2 and 3 of the fusarium wilt.
A murcha-de-fus?rio causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici ? uma doen?a de grande import?ncia econ?mica para a cultura do tomateiro (Lycopersicon esculentum Mill.) devido as perdas que ocasiona na produ??o. O presente estudo teve como objetivo selecionar bact?rias pertencentes ao g?nero Bacillus que apresentam atividade antag?nica para aplica??o em ?reas produtoras de tomate infestadas pelo fungo. Foram obtidos 193 isolados de bact?rias de ra?zes e hastes de tomateiro. Foi realizado o sequenciamento completo da subunidade 16S RNAr de 32 isolados da cole??o de trabalho, utilizando os iniciadores 27F e Amp2. Essas bact?rias foram selecionadas aleatoriamente, sendo que 20 bact?rias foram obtidas de tomateiro sadio. Os resultados mostraram uma alta similaridade das estirpes com as esp?cies do g?nero Bacillus: B. thuringiensis, B. megaterium, B. cereus, B. toyonensis, B. stratosphericus, al?m da esp?cie Paenibacillus barcinonensis. Testes para avaliar as caracter?sticas funcionais das estirpes bacterianas in vitro mostraram que 72% das estirpes possuem atividade proteol?tica, 78% possuem atividade celulol?tica, 48% solubilizam fosfato inorg?nico, 42% solubilizam zinco e 40,8% s?o capazes de produzir indol. Testes de antagonismo realizados in vitro mostraram que algumas estirpes bacterianas retardaram ou reduziram o crescimento micelial das tr?s ra?as do fungo quando submetidos ao m?todo de a??o direta (estrias paralelas). Com o objetivo de selecionar um gen?tipo de tomateiro sens?vel as tr?s ra?as do fungo, foi instalado um experimento utilizando os gen?tipos D?bora Plus, Santa Clara Miss Brasil, Perinha e Carolina. A variedade Perinha foi a mais suscet?vel as ra?as 1, 2 e 3 j? que apresentou um maior percentual de coloniza??o do fungo. A atividade antag?nica das bact?rias foi avaliada 15 dias ap?s o transplantio das mudas de tomate da variedade Perinha para o substrato contaminado. Os resultados mostraram que a estirpe da esp?cie B. stratosphericus controlou cerca de 93,25% das plantas crescidas na presen?a da ra?a 1 do fungo. J? as esp?cies B. megaterium e B. thuringiensis controlaram 100% da doen?a das plantas de tomateiro cultivadas em substrato com a ra?a 2 e de 67,35% das plantas cultivadas em substrato com a ra?a 3 do fungo. Os resultados obtidos sugerem que algumas estirpes possuem potencial para controle de F. oxysporum f. sp. lycopersici ra?a 1, 2 e 3 e possuem atividades funcionais que podem contribuir para a melhoria do crescimento das plantas de tomateiro cultivadas em ?reas infestadas com o fungo. Entretanto, estudos em campo s?o necess?rios para confirmar o papel dessas esp?cies de Bacillus na intera??o com plantas de tomateiro cultivadas na presen?a das ra?as 1, 2 e 3 da murcha de fus?rio.

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
A busca por alternativas no controle de doenças em substituição ao uso intensivo de agrotóxicos tem sido objeto da pesquisa agrícola. Rizobactérias são conhecidas pelo biocontrole de doenças e promoção de crescimento em diversos cultivos. Os objetivos deste trabalho foram avaliar a eficácia de seis rizobactérias, pré- selecionadas, no controle de Ralstonia solanacearum e Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (FOL), em casa de vegetação e relacionar este comportamento a produção de compostos “in vitro”, bem como avaliar a proteção de plantas de tomate contra doenças da parte aérea que ocorreram naturalmente em condições de campo. Foi avaliada a capacidade destas rizobactérias em produzir quitinases, amilases, lipases, compostos antibióticos e de solubilizar fosfato. A microbiolização das sementes com a rizobactéria DFs1420 (Bacillus sp.) reduziu a severidade da murcha bacteriana em 66% aos 14 dias após a inoculação, no primeiro ensaio e valores de AACPD em 70%, no segundo ensaio. Este controle pode ser associado à produção de compostos responsáveis pela antibiose observada “in vitro”. Streptomyces (DFs1296 e DFs1315) e Bacillus sp. (DFs1414) reduziram significativamente a murcha de fusário. O controle observado pode ser atribuído à atividade quitinolítica e/ou antibiótica por compostos voláteis. Foram instalados três ensaios de campo. A severidade das doenças foliares foi monitorada ao longo do tempo. As rizobactérias foram capazes de proteger as plantas contra Septoria lycopersici. DFs1414 e DFs1421 (Pseudomonas sp.) foram as mais estáveis, proporcionando proteção em dois ensaios consecutivos. As rizobactérias DFs1296 e DFs1420 foram capaz de controlar a requeima (Phytophthora infestans) em dois ensaios. A bactéria DFs1296 também apresentou capacidade de proteção contra estas e outras doenças quando pulverizada semanalmente na parte aérea. De modo geral, o controle alcançado por estas bactérias, microbiolizadas às sementes ou em aplicação foliar, não diferiu dos tratamentos utilizando produtos químicos recomendados para a cultura em aplicações semanais.
The search on alternative control of diseases to replace the use of pesticides has been the subject of agricultural research. Rhizobacteria are known by controlling diseases and promoting growth in several crops. The objectives of this work were to evaluate the efficacy of six rhizobacteria pre-selected for the control of Ralstonia solanacearum and Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (FOL) in greenhouse, and to relate this behavior with the production of compounds "in vitro", as well as evaluate the protection of tomato plants against foliar diseases under field conditions. It was evaluated the ability of these rhizobacteria to produce chitinases, amylases, lipases, antibiotic compounds and to solubilize phosphate. The seed microbiolization with rhizobacterium DFs1420 (Bacillus sp.) reduced the severity of the bacterial wilt 66% at 14 days after inoculation and AUDPC 70%, respectively, the first and second assays. This control may be associated with the production of compounds responsible for the antibiosis observed "in vitro". Streptomyces (DFs1296 and DFs1315) and Bacillus sp. (DFs1414) significantly reduced fusarium wilt. The control observed can be attributed to the chitinolytic activity and/or antibiosis in the presence of volatile compounds. Three field trials were carried out in field. The foliar diseases severity was monitored over time. The rhizobacteria were capable of protecting plants against Septoria lycopersici. DFs1414 and DFs1421 (Pseudomonas sp.) were the most stable, providing protection in two consecutive trials. The rhizobacteria DFs1296 and DFs1420 were able to control late blight (Phytophthora infestans) in two trials. DFs1296 also had the ability to protect against these and other diseases when sprayed weekly in the plant canopy.In general, the control achieved by these rhizobacteria, by seed microbiolization or by foliar application, did not differ from treatments using recommended chemical in weekly applications.