Дисертації: "Oiseaux de mer – Populations"

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Beaubrun, Pierre-Christian. "Le goéland leucophée (Larus cachinnans michahellis) au Maroc : reproduction, alimentation, répartition et déplacements en relation avec les activités de pêche." Montpellier 2, 1988. http://www.theses.fr/1988MON20058.

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Dasnon, Anaïs. "Estimation des populations d'oiseaux marins à nidification hypogée ou en habitats complexes : optimisation des méthodes dans les Terres Australes Françaises." Electronic Thesis or Diss., La Rochelle, 2023. http://www.theses.fr/2023LAROS027.

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Анотація:

Face à la perte massive de la biodiversité, il devient urgent d'accroître nos connaissances sur les populations afin de pouvoir mettre en place rapidement des mesures de conservation efficaces. Les oiseaux marins figurent parmi les plus menacées et méconnues des espèces d'oiseaux. Nombre de leurs espèces nichent sur des territoires isolés, en terriers ou dans des zones inaccessibles pour l'homme. Les méthodes de prospection traditionnelles sont majoritairement utilisées pour le suivi des populations d'oiseaux marins, mais leur efficacité reste incertaine. Par ailleurs, les nouveaux outils d'acquisition de données et d'analyses proposent de nouvelles perspectives mais restent trop peu éprouvés.Cette thèse propose, dans le contexte de la Réserve naturelle nationale des Terres australes françaises, d'explorer l'efficacité des méthodes traditionnelles pour l'estimation des populations de deux espèces à nidification côtière, de tester la bioacoustique comme nouvelle méthode d'estimation des oiseaux marins à nidification hypogée, et d'utiliser des données de comptage et de suivi démographique d'une population en déclin pour tester l'efficacité de la mise en place de mesures de conservation.Les méthodes de prospection traditionnelles sont les plus robustes et peuvent être utilisées efficacement pour l'estimation et le suivi des populations d'oiseaux marins. Ces méthodes peuvent être complétées par l'utilisation des nouvelles technologies, notamment la bioacoustique pour les prospections des espèces à nidification hypogée. La combinaison des méthodes et la compréhension solide de la biologie et de l'écologie des espèces permettra de les conserver efficacement sur le long-terme
Facing the massive loss of biodiversity, it is crucial to increase our knowledge about populations in order to rapidly implement effective conservation measures. Seabirds are among the most threatened and little-known of all bird species. Many of their species nest in isolated territories, in burrows or in areas inaccessible to man. Traditional survey methods are mainly used to monitor seabird populations, but their effectiveness remains uncertain. In addition, new data acquisition and analysis tools offer new perspectives, but remain too untested.This thesis proposes, in the context of the Réserve naturelle nationale des Terres australes françaises, to explore the effectiveness of traditional methods for estimating the populations of two coastal-nesting species, to test bioacoustics as a new method for estimating burrowing seabirds populations, and to use count and demographic monitoring data from a declining population to test the effectiveness of implementing conservation measures.Traditional survey methods are the most robust and can be used effectively to estimate and monitor seabird populations. These methods can be supplemented by the use of new technologies, in particular bioacoustics for surveys of hypogean nesting species. The combination of these methods and a sound understanding of the biology and ecology of the species will enable them to be conserved effectively over the long term

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Dupraz, Marlène. "Convergence dans l'évolution de la spécialisation d'hôte chez des tiques : modèle tiques-oiseaux de mer à distribution mondiale." Thesis, Montpellier, 2016. http://www.theses.fr/2016MONTT124/document.

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Анотація:

Les interactions intimes et répétées entre hôtes et parasites peuvent engendrer la spécialisation d’un parasite à son hôte, grâce à des adaptations comportementales, morphologiques et/ou génétiques, combinées avec un flux de gènes limité. C’est un processus clef car il participe à l’évolution de la biodiversité parasitaire et peut ainsi permettre de mieux comprendre l’émergence d’organismes pathogènes. Encore peu étudié, une spécialisation d’hôtes a néanmoins été démontré lors de précédentes études chez deux espèces de tiques nidicoles : chez Ixodes uriae une tique dure, parasite des oiseaux marins coloniaux en zone arctique, et dans un complexe de tiques molles Ornithodoros capensis sensu lato, parasitant aussi de nombreuses espèces d’oiseaux marins, mais cette fois-ci en zones tempérées et tropicales. Ces deux espèces sont vectrices d’une grande diversité d’agents pathogènes incluant des virus, des bactéries et des protozoaires. Cependant, les facteurs impliqués dans le phénomène de spécialisation d’hôte restent inconnus. Dans ce cadre, le but de ma thèse était donc de déterminer 1) si l’évolution des divergences en fonction des hôtes est toujours accompagnée par les mêmes changements phénotypiques et 2) si ces changements pourraient permettre d’identifier les facteurs de sélection sous-jacents. Dans ce contexte, des campagnes d’échantillonnage de tiques ont été menées durant la période de reproduction des hôtes oiseaux dans les différentes zones de leur répartition et nous avons réalisé des analyses morphométriques, basées sur l’utilisation de landmarks et de contours sur chaque individu tique et des analyses phylogénétiques et génétiques des populations sur les mêmes individus. L’ensemble de ces résultats suggère la présence de convergences morphologiques au sein de ces systèmes et souligne un rôle de la sélection dans ce processus de divergence. En effet, les caractéristiques écologiques des hôtes mais aussi le micro-habitat exercent des pressions sélectives importantes dans ces deux systèmes pouvant être à l’origine de la divergence observée entre les populations. De plus, les caractéristiques biologiques de chaque espèce de tiques, telle que la capacité de dispersion, entrent également en jeu et peuvent fortement modifier l’épidémiologie des agents infectieux dont elles sont vectrices.Mots clés : Argasidae, écologie de la transmission, évolution convergente, interactions hôte-parasite, Ixodidae, oiseaux marins
Intimate and repeated interactions between hosts and parasites can lead to parasite specialization to a given host via behavioral, morphological and/or genetic adaptations that act in combination with restricted gene flow. Specialization is a key process leading to the generation of parasite biodiversity and can help us understand the emergence of pathogenic organisms. Although little studied, host specialization has already been demonstrated to occur in previous studies of two nidicolous tick species: Ixodes uriae a hard tick parasitizing colonial seabirds in polar regions, and soft ticks of the complex Ornithodoros capensis sensu lato, that also exploit colonial seabirds, but this time in temperate and tropical zones. Both of these species act as vector to a wide variety of pathogenic organisms, including viruses, bacteria and protozoa. However, the factors involved in host specialization remain unknown. In this context, the aim of my thesis was to determine 1) whether the evolution of host specialization is always accompanied by the same phenotypic changes and 2) whether these changes could help to identify the selective factors that influence this phenomenon. In this context, tick collections were conducted during the breeding period of the host birds in different areas of their distribution and morphometric analyses, based on landmark and contour methods, were performed on each individual tick. Phylogenetic and population genetic analyses were also carried out using the same individuals. Overall, the results demonstrate that morphological convergence occurs within these systems, highlighting the role of selection in the divergence process. Indeed, the ecological characteristics of the hosts, but also their micro-habitat, may exert significant selective pressures on ticks and may cause the observed divergence among populations. Likewise, the biological characteristics of each tick species, particularly in relation to dispersal capacity, may also come into play and will greatly modify the epidemiology of associated infectious agents.Keywords: Argasidae, convergent evolution, host-parasite interactions, Ixodidae, transmission ecology, seabirds

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Cornet, Cindy. "Les capacités d'adaptations des oiseaux marins face aux changements environnementaux : le rôle de l'hétérogénéité au sein des populations." Thesis, Strasbourg, 2014. http://www.theses.fr/2014STRAJ047/document.

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La dynamique d’une population résulte de la combinaison de plusieurs traits d’histoire de vie qui sont façonnés par l’histoire évolutive de cette population. L’altération d’un de ces traits par des contraintes environnementales peut donc avoir des effets sur la persistance de la population. Les ajustements individuels de certains traits phénotypiques pourraient permettre à cette population de répondre rapidement à ces contraintes sans la nécessité immédiate d’adaptations génétiques. Durant cette thèse, la variabilité de certains traits a été identifiée chez 3 espèces sentinelles des écosystèmes polaires. Ces résultats permettent de mieux comprendre les associations entre ces traits et les pressions évolutives qui en sont à l’origine, ainsi que l’importance de traits tels que la personnalité dans la part inexpliquée de la variabilité de la valeur sélective des individus. A terme, nous pourrions ainsi mieux évaluer la capacité d’adaptation des populations face aux changements globaux
Population dynamics is driven by several life history traits shaped by the evolutionary history of the population. The alteration of one of these traits by environmental constraints may thus have effects on the population persistence. Individual adjustments of some phenotypic traits could then enable this population to rapidly respond to these constraints without the immediate necessity of genetic adaptations. During this PhD project, we identified variability in some of these traits in 3 sentinel species of polar ecosystems. These results allowed us to better understand the associations between these traits and the evolutionary pressures underlying these associations, as well as the importance of traits such as personality in the amount of variability in individuals’ fitness that remains unexplained. In the long term, we should then be able to better gauge the adaptive capacity of populations to face global changes

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Quillien-Legrand, Marie-Christine. "Ectoparasitisme et arbovirus chez les oiseaux de mer, problèmes écologiques et de santé publique ? : étude de la population de mouettes tridactyles du Cap Sizun." Brest, 1989. http://www.theses.fr/1989BRES2034.

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Beaucoup d’oiseaux de mer se rassemblent en grandes colonies géographiquement stables pour la nidification, ce qui assure un renouvellernt régulier d’hôtes à des tiques adaptées à cet habitat. Cet ectoparasitisme, surtout s’il est lié à une circulation d’arbovirus peut perturber les populations d’oiseaux. Se pose aussi le problème d’une éventuelle dérivation vers d’autres populations animales et vers la population humaine. La réserve ornithologique du Cap Sizun (Finistère) héberge 2 espèces de tiques qui sont infectées par des arbovirus de la famille des Bunyaviridae. A partir d’Ixodes uriae ont été isolés Zaliv Terpeniya, du groupe Uukuvirus, et Avalon, virus du groupe Sakhalin appartenant au genre Nairovirus. Ornithodoros maritimus est associé à un variant du virus Soldado, Neirovirus du groupe Hughes. Plusieurs observations concernant la population de mouettes tridactyles (Rissa tridactyla) de la réserve, tendent è montrer que la présence de tiques, surtout des ornithodores, entraîne des mortalités et désertions. La responsabilité des arbovirus dans la survenue de ces phénomènes n’a pas été prouvée. Ces arbovirus « marins » peuvent aussi infecter les humains, comme en témoigne une enquête sérologique effectuée dans la région. Bien qu’ils ne représentent pas actuellement un problème majeur de santé publique, leur surveillance est souhaitable. Les Bunyaviridae ont un génome fragmenté permettant des recombinaisons génétiques, ce qui peut favoriser l’émergence de variante plus pathogènes et/ou adaptés à d’autres vecteurs.

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Castège, Iker. "Evolution des populations d’oiseaux et de mammifères marins dans le Golfe de Gascogne en relation avec les changements environnementaux." Pau, 2009. http://www.theses.fr/2009PAUU3025.

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Ce travail de thèse porte principalement sur l’analyse des séries chronologiques et de la répartition spatiale des oiseaux et mammifères marins dans le golfe de Gascogne le dernier quart de siècle (1976-2009). Il met en évidence des variations importantes de la dynamique et de l’écologie de ces populations et par conséquent des milieux marins dans lesquels elles vivent, en relation avec deux des forçages environnementaux principaux. Le premier est l’impact direct de l’homme par pollutions et captures accidentelles. Les dernières marées noires (Erika et Prestige) ont eu des effets contrastés et plutôt complexes sur les populations d’oiseaux marins. Pour les cétacés, les variations temporelles dans les échouages semblent davantage reliées à l’abondance en mer des populations plutôt qu’à une évolution des captures accidentelles par engins de pêche. Le deuxième est constitué par les variations océano-climatiques qui sont fortement corrélées avec l’évolution numérique de ces prédateurs supérieurs. Les résultats acquis trouvent des applications en termes de conservation des espèces et des milieux (notamment la désignation des AMPs) ainsi qu’en écologie fondamentale, dans le développement d’approches écosystémiques par exemple
This Thesis report deals mainly with data processing of a long term data set (1976-2009) gathered from a long term survey of seabirds and sea mammals in the Bay of Biscay (France; East Atlantic). In this report we highlight some aspects of the spatio-temporal dynamics of those populations, and thus of the marine ecosystems in which they live. We emphasize the role of two major environmental forces. First of all, we investigated the direct influence of human-borne pollutions and accidental by-catches : recent oilspills (namely from the “Erika” and then the “Prestige” ships) had various and complex effects on seabird populations, but none on cetacean populations, given that stranding patterns were more likely linked by abundance and distribution of living animals at sea than by-catches or accidental oispills. Secondly, we adressed the influence of oceano-climatic variations on abundance of those top-predator populations. Overall results have important implications in species and ecosystem management (e. G. Marine Protected Areas design) as well as fundamental ecology (e. G. Ecosystem oceanography paradigm)

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Barbraud, Christophe. "Forçage environnemental et prédateurs marins endothermes de l'Océan Austral: effets des changements climatiques récents et des pêcheries industrielles sur les populations." Habilitation à diriger des recherches, Université Paul Sabatier - Toulouse III, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00770926.

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L'océan Austral est un endroit où des changements climatiques importants se sont produits au cours du siècle dernier, accompagnés d'un important niveau d'exploitation des ressources naturelles vivantes par l'homme. Ces changements globaux peuvent potentiellement conduire à des perturbations majeures des écosystèmes de l'océan Austral jusqu'aux prédateurs marins supérieurs. La pêche peut aussi directement affecter les oiseaux de mer par la mortalité accidentelle dans les engins de pêche (prises accessoires) et les ressources alimentaires supplémentaires fournies par les rejets. Lors des 20 dernières années un nombre croissant de recherches ont été effectuées sur les effets du changement climatique et des activités de pêche sur les oiseaux marins de l'océan Austral. L'utilisation de données à long terme d'observations en mer et de populations avec des animaux connus individuellement était essentielle pour détecter ces effets. Ici, nous passons en revue ces études afin d'identifier les tendances dans les changements de distribution, de phénologie, de démographie et de dynamique des populations en réponse aux changements climatiques et aux activités de pêche. Des changements dans la répartition et la phénologie de la reproduction ont été documentés en parallèle à l'augmentation des températures de surface de la mer et des changements dans la couverture de glace de mer dans l'océan Indien du Sud. Des températures de surface de la mer anormalement chaudes semblent principalement avoir un effet négatif sur les paramètres démographiques, bien qu'il existe des exceptions. Les variations de l'étendue de la glace de mer affectent également plusieurs paramètres démographiques et la dynamique des populations. Les relations suggèrent des effets non linéaires, avec des conditions optimales de couverture de glace de mer qui semblent être la règle. L'effort de pêche est principalement négativement relié aux taux de survie des populations et pour quelques espèces positivement relié au succès de la reproduction. Quelques études montrent que les facteurs climatiques et les prises accessoires de la pêche peuvent affecter les paramètres démographiques simultanément d'une manière complexe, qui peut être intégrée dans les modèles de dynamique des populations pour prévoir l'impact sur les populations. Bien que chez les oiseaux marins le taux de croissance démographique soit moins sensible aux variations de la survie des juvéniles qu'à des variations de la survie des adultes, la mortalité chronique des immatures en raison de la pêche peut nuire aux populations. Les modèles de population permettent aussi de projeter des trajectoires de populations dans des conditions climatiques futures. Les études à venir devront intégrer d'autres facteurs environnementaux, d'autres niveaux trophiques, le comportement de recherche de nourriture, les interactions entre climat et pêcheries et les mécanismes sous-jacents à la plasticité phénotypique, comme certaines études pionnières réalisées dans l'hémisphère Nord.

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Fay, Rémi. "De l’envol à la première reproduction : aspects écologiques et évolutifs des traits d’histoire de vie de jeunes oiseaux marins longévifs." Thesis, La Rochelle, 2017. http://www.theses.fr/2017LAROS003/document.

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Jusqu’à aujourd’hui, les traits démographiques du début de vie ont été peu étudiés relativement aux traits adultes chez une grande majorité d’espèces animales. Les jeunes individus sont généralement plus difficiles à étudier en milieu naturel du fait de leur taille plus petite, de leur comportement plus mobile et des forts taux de mortalité qu’ils subissent. Cependant, la bonne compréhension des processus démographiques requiert la prise en compte de l’ensemble des stades de vie. Le manque de connaissance concernant les plus jeunes individus est particulièrement préjudiciable pour les espèces longévives. En effet chez ces espèces, les individus immatures représentent une partie importante de la valeur reproductive totale et ont ainsi une forte influence sur l’ensemble de la dynamique de la population. Ainsi, ces lacunes affectent notre capacité à effectuer des projections démographiques réalistes dans un contexte de changements globaux et plus généralement limitent notre compréhension de l’évolution des traits d’histoire de vie. Afin de pallier à ce manque, cette thèse porte sur l’étude des traits d’histoire de vie en début de vie chez une espèce d’oiseau marin : l’albatros hurleur Diomedea exulans. Chez cette espèce particulièrement longévive, la période d’immaturité peut durer une dizaine d’années. En se basant sur un suivi individuel à long terme et des analyses de type capture-marquage-recapture, nous avons estimé la survie en début de vie ainsi que l’accès à la première reproduction en fonction de l’âge et du sexe. Nous avons également étudié les effets potentiels de facteurs extrinsèques (climat, pêcherie) et intrinsèques (densité dépendance, âge parental) sur ces paramètres. De nombreuses relations entre les taux vitaux de ces jeunes individus et leur environnement ont été décrites. Sur un plan plus théorique, nous avons également pu tester différentes prédictions comme la canalisation des traits d’histoire de vie ou l’existence de différentes stratégies d’histoire de vie au sein d’une même population. Au cours de ce travail, une attention particulière a été portée aux variations des traits démographiques à l’échelle individuelle. Notre étude montre que les taux vitaux d’individus de même âge et de même sexe peuvent être très variables. Nous avons pu associer les traits démographiques en début de vie aux performances futures au stade adulte et révéler certaines causes de ces variations interindividuelles
To date, early life demographic traits have been poorly studied compare to adult traits in the vast majority of animal species. Young individuals are usually more difficult to study due to their small size, their mobile behavior and the high mortality rate that characterizes their life stage. However, the full understanding of the demographic processes requires the integration of all life stages. This lack of knowledge toward early-life stages is particularly detrimental for long lived species. Indeed for these species, the immature component represents a substantial part of the total reproductive value, having a high influence on the whole population dynamics. Hence, such limitations affect the accuracy of population projections in the context of global change and more generally our understanding of life history trait evolution. In order to fill in this gap, this PhD project focuses on early life demographic traits in a seabird species : the wandering albatross Diomedea exulans. In this very long-lived species, the immature period lasts around 10 years. Based on long-term individual monitoring and capture-recapture analyses, we estimated early-life survival and the access to reproduction according to age and sex. We also investigates the respective effects of extrinsic (e.g. climate, fisheries) and intrinsic factors (e.g. density dependence, parental effects) on these parameters. Many relationships between early-life vital rates and environmental variables have been described. From a theoretical perspective, we tested several predictions such as the canalization of life-history traits and the existence of different life-history strategies within a population. In this work, special attention was paid to demographic variations at the individual scale. Our study showed that vital rates of individuals of the same age and sex could be very different. We have linked early-life demographic traits with subsequent adult performances and identified some causes of these individual variations

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Gineste, Benoit. "Étude de la biologie et de la vulnérabilité au développement anthropique des oiseaux marins nocturnes à La Réunion." Thesis, La Réunion, 2016. http://www.theses.fr/2016LARE0015/document.

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La biodiversité est actuellement fortement menacée par les activités humaines. Dépendant des milieux marins et terrestres, les oiseaux marins sont particulièrement exposés aux pressions anthropiques. À La Réunion, les conséquences des impacts des aménagements sur les populations restent méconnues. Dans une optique de conservation et de réalisation d'études environnementales pertinentes, des informations fiables sur la répartition des espèces, sur leur comportement de vol et une évaluation de leur vulnérabilité vis-à-vis des aménagements sont nécessaires. Les objectifs de cette thèse sont de préciser des données biologiques et d'évaluer la vulnérabilité des oiseaux marins nocturnes de La Réunion face aux aménagements. Nous avons étudié l'évolution de la taille et de la répartition des colonies de puffin tropical Puffinus bailloni à l'échelle de l'île sur une période de 19 ans. Les patterns de vol du puffin tropical et du pétrel de Barau Pterodroma baraui ont été caractérisés par imagerie radar à différentes échelles temporelles et spatiales. Nos résultats montrent une stabilité apparente de la population de puffin tropical malgré la forte pollution lumineuse. Le puffin tropical et le pétrel de Barau présentent des patterns de vol spécifiques. Les effectifs estimés de pétrel de Barau suggèrent une population plus importante que celle connue actuellement. Les effectifs estimés de puffin tropical sont cohérents avec les estimations actuelles. Les jeunes pétrels de Barau s'envolent principalement durant les premières heures de la nuit. Des outils d'aide à la décision ont été produits. Nos travaux soulèvent la nécessité de poursuivre des recherches fondamentales et appliquées
The biodiversity is currently threatened by human activities. As they depend both of marine and terrestrial habitats, seabirds are particularly exposed to human pressures. In Reunion Island, the consequences of the urbanization on populations are unknown. For conservation and environmental assessment purposes, accurate information on the species repartition, flight patterns and vulnerability to infrastructure is required. The goals of this thesis are to update biological information on species and to assess the vulnerability of nocturnal seabirds of Reunion Island exposed to infrastructure. We studied the evolution of the size and the repartition of the colonies of tropical shearwater Puffinus bailloni at the scale of the entire island over a 19-years period. The flight patterns of tropical shearwater and Barau's petrel Pterodroma baraui were described with radar technology at different spatial and temporal scales. Our results show an apparent stability of the tropical shearwater population despite an important light pollution. Tropical shearwater and Barau’s petrel present specific flight patterns. The estimated census of Barau's petrel suggests a population size higher than current estimation whereas the estimated census of tropical shearwater is reliable to current estimations. Barau's petrels' juveniles mostly take off during the first hours of the night. Decision making tools have been produced. Our study also highlights the need to conduct further fundamental and applied researches

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Ruffino, Lise. "Ecologie, dynamique de population, comportement et impact d'un rongeur introduit Rattus rattus sur les îles de Méditerranée." Aix-Marseille 3, 2010. http://www.theses.fr/2010AIX30022.

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Les rats invasifs du genre Rattus spp. Sont reconnus à l'heure actuelle comme un facteur majeur de raréfaction d'espèces, notamment d'oiseaux marins. Cependant, le fonctionnement des populations insulaires de rats ainsi que les facteurs favorisant leurs impacts sur les écosystèmes insulaires restent encore mal connus. L'idée générale de ce travail de thèse s'inscrit dans la nécessité d'une meilleure compréhension de l'écologie, de la dynamique de population des rongeurs invasifs, des mécanismes d'impact du rat sur les oiseaux marins, mais aussi de persistance d'espèces. L'analyse d'une base de données concernant ça. 300 îles et îlots du bassin méditerranéen occidental a permis de souligner que la persistance sur le long terme des pétrels et puffins de Méditerranée, malgré une présence ancienne des rats noirs sur ces îles, a pu être facilitée par la diversité de contextes insulaires aux caractéristiques biogéographiques variées. Par ailleurs, l'étude plus fine des mécanismes d'interactions et d'impact a révélé, de manière contre-intuitive, des interactions limitées entre rats et oiseaux aux sites de reproduction des oiseaux ainsi que des capacités de prédation réduites des rats sur les oeufs. Enfin, l'étude de l'écologie trophique d'une population de rats noirs, combinée à un suivi sur deux années de leurs dynamiques de populations et patrons de déplacements sur une petite île de Méditerranée a permis de souligner la faible plasticité écologique et alimentaire des individus, comparativement à celle de la population entière, ainsi que l'importance des effets des apports hydriques et des ressources d'origine allochtone sur le fonctionnement des populations de rats. Des pistes d'investigations nouvelles sont suggérées qui permettraient de mieux appréhender les processus impliqués dans l'impact des rats sur la faune insulaire, dans les extinctions d'espèces mais aussi dans leur coexistence durable parfois observée
Rats Rattus spp. Are considered as a main driver of seabird rarefactions and a leading cause of petrel and shearwater extinction risk. However, the functioning of insular rat populations and the factors likely to affect their impacts on island ecosystems are still poorly understood. Indeed, questionings have been recently raised on the real mechanisms and the magnitude of rat impact on some seabirds with so cryptic nesting behaviours. The general idea of this PhD work lies on the necessity to better understand the ecology, the population dynamics of invasive rodents, the mechanisms of rat impact on seabirds but also of species persistence. As a first research axis, we were interested in the temporal dimension of biological invasions. The analysis of a database of ca. 300 islands and islets from the western Mediterranean basin allowed to underline that the long-term persistence of petrels and shearwaters, despite the longstanding introduction of black rats on these islands, may have been facilitated by various biogeographical contexts. Secondly, the study of the mechanisms of interactions between rats and shearwaters, and more particularly the mechanisms of impact, revealed unexpected limited interactions, along with limited predation capacities on bird eggs. Finally, the study of the trophic ecology of black rats, combined with a long-term survey of the population dynamics and movement paterns on a small Mediterranean island, with a marked spatio-temporal variation in the availability of resources, allowed to underline the low individual diet plasticity of black rats compared to the population level, and the importance of the effects of fresh water inputs and those of allochthonous resources on the functioning of insular rat populations. Future research perspectives should focus on better understanding the processes involved in the impacts of rats on insular biotas, in species extinctions but also in their long-term coexistence

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Ridoux, Vincent. "Ecologie alimentaire des oiseaux de mer des îles Crozet." Brest, 1992. http://www.theses.fr/1992BRES2035.

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Le present travail decrit les regimes alimentaires de 27 especes d'oiseaux de mer des iles crozet et discute les resultats obtenus selon deux perspectives distinctes: l'impact des oiseaux de mer sur les ressources marines et les mecanismes de segregation alimentaire. Les contenus stomacaux ont ete recoltes par des methodes non lethales. L'analyse de ces echantillons a permis de quantifier l'importance de chaque taxon proie reconnu en frequence d'apparition, frequence en nombre et en frequence en masse reconstituee ; de plus, la distribution des classes de taille exploitees est egalement indiquee. La consommation annuelle des oiseaux des iles crozet est estimee a 2,5 millions de tonnes d'organismes marins. Six especes d'oiseaux assurent 98% de ce total: le manchot royal, le gorfou macaroni, le gorfou sauteur, le prion de salvin, le petrel-plongeur commun et le petrel-plongeur de georgie du sud. Les ressources principales sont des euphausiaces, des amphipodes hyperiens et des myctophides a part equivalente. Les especes de poissons et de calmars exploitees commercialement dans l'ocean austral apparaissent de maniere anecdotique dans l'alimentation des oiseaux. Concernant la segregation alimentaire au sein de cette communaute, il a ete observe que parmi les oiseaux de surface, le chevauchement alimentaire est en general moins fort que dans la guilde des plongeurs. Les paires ou les trios d'especes congeneriques montrent generalement de tres forts chevauchements alimentaires, en termes de famille et de tailles de proies exploitees. Il est suggere que la nature et la taille des proies consommees par une espece ne sont generalement pas l'objet d'une selection assimilable a un mecanisme de segregation alimentaire, mais que ces descripteurs du regime alimentaire traduisent des mecanismes de segregation operant sur d'autres axes de la niche alimentaire: principalement les zones prospectees (axe spatial) et les periodes de reproduction (axe temporel)

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Kanyamibwa, Samuel. "Dynamique des populations de cigogne blanche ("Ciconia ciconia L. ") en Europe occidentale : contribution à la conservation des populations naturelles." Montpellier 2, 1991. http://www.theses.fr/1991MON20093.

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Le declin des populations de cigogne blanche ciconia ciconia d'europe occidentale a ete souvent etudie de facon descriptive. Peu d'etudes ont mis en evidence le role joue par les changements des parametres demographiques, notamment du fait de l'absence des methodes appropriees. Grace aux developpements recents des methodes d'estimation des parametres de survie, ce travail montre que le declin des effectifs de cigogne blanche est principalement du a la chute du taux de survie, celui-ci etant lie aux conditions d'hivernage du sahel. Le succes de reproduction est lie surtout aux conditions de reproduction et si ce parametre a egalement baisse significativement, il n'affecte pas sensiblement le taux de multiplication de la population. Cette approche nous a permis de confirmer le plus fort taux de diminution des populations occidentales par rapport aux populations orientales, ces dernieres hivernant le long de l'afrique orientale, et de montrer que les programmes entrepris actuellement pour la reintroduction donnent une stabilite apparente au niveau des effectifs, mais pas au niveau des parametres demographiques. Par ailleurs, nous utilisons les variations de l'ensemble des parametres estimes pour modeliser le fonctionnement demographique de la population de cigogne blanche. Les problemes de conservation des petites populations sont egalement discutes

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Cusset, Fanny. "Importance de la glace de mer pour les oiseaux marins arctiques." Master's thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/36971.

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Анотація:

En Arctique, la productivité marine comprend deux floraisons successives de producteurs primaires, les algues deglace et le phytoplancton, qui sont étroitement liée à la phénologie de la glace de mer. Ceux-ci constituent la base du réseau trophique et fournissent l’énergie transférée vers les niveaux trophiques supérieurs. Ainsi, tout changement affectant la banquise arctique aura de fortes implications sur la phénologie des producteurs primaires, et affectera par conséquent tous les autres niveaux trophiques. Des études antérieures ont démontré le potentiel des Isoprénoides Hautement Ramifiés (HBIs) pour quantifier les contributions relatives des deux pools de producteurs primaires vers les niveaux trophiques supérieurs. Ici, nous combinons les HBIs avec les isotopes stables afin (i) d’évaluer si et à quel point les oiseaux marins arctiques dépendent de la glace de mer, et (ii) de déterminer si les variations de glace affectent leur écologie alimentaire et leur performance reproductive. L’étude cible deux espèces abondantes en Arctique présentant des écologies distinctes: le guillemot de Brünnich (Uria lomvia) et le fulmar boréal (Fulmarus glacialis). Pour chaque espèce, 60 œufs ont été récoltés sur l’île du Prince Leopold (Arctique canadien) pendant des années aux conditions de glace fortement contrastées (2010-2013). Les distributions en HBIs et les compositions isotopiques (carbone et azote) et énergétiques ont été analysées pour chaque œuf. Les résultats montrent que la présence de glace est bénéfique pour la performance reproductive des guillemots, avec des œufs plus gros et plus énergétiques pondus durant les années plus englacées. Les guillemots sont étroitement liés à la banquise et dépendent fortement de proies associées à la glace. Au contraire, les fulmars ne présentent aucune association claire aux communautés sympagiques, et les variations du couvert de glace n’affectent ni leur écologie alimentaire ni leur performance reproductive. De fait, les guillemots semblent plus vulnérables face aux changements climatiques à venir, alors que des espèces plus résilientes comme les fulmars pourraient en tirer avantage. Dans l’ensemble, notre étude souligne l’importance des approches multi-biomarqueurs afin de mieux appréhender l’importance des ressources sympagiques pour les prédateurs supérieurs au sein d’écosystèmes marins arctiques en pleine mutation.
In the Arctic, sea ice sets the clock for marine productivity. This includes two consecutive pulses of primary producers, sea-ice algae and phytoplankton, that constitute the basis of marine food webs and provide the energy transferred to higher trophic levels. As such, any change affecting Arctic sea-ice will have strong implications on the phenology of primary producers, and cascading effects on all other trophic levels. Previous studies demonstrated the potential of Highly Branched Isoprenoid biomarkers (HBIs) to quantify the relative contributions of the two pools of primary producers to higher trophic levels. Here, we combined HBIs with stable isotopesto (i) evaluate if and how much arctic seabird rely on sea ice, and (ii) determine if changes in sea ice affect their feeding ecology and reproductive performance. We focused on two Arctic species exhibiting contrasting ecologies: the thick-billed murre (Uria lomvia) and the northern fulmar (Fulmarus glacialis). For each species, 60 eggs were collected on Prince Leopold Island (Canadian Arctic) during years of highly contrasting ice conditions (2010-2013). Eggs were analysed for HBI distributions, isotopic (carbon and nitrogen) and energetic compositions. Results showed that murres were closely linked to sea ice and heavily relied on ice-associated prey. Sea ice presence was beneficial for murres’ reproductive performance, with larger and more energetic eggs laid during icier years. In contrast, fulmars did not exhibit a clear association with sympagic communities. Even large changes in sea ice did not seem to affect their feeding ecology or their reproductive performance. Murres therefore appear more vulnerable to changes and may become the losers of future climate shifts in the Arctic, while more resilient species such as fulmars might make the most of the situation. Overall, our study emphasises the importance of combining different biomarkers to better understand the importance of sympagic resources for top predators within changing Arctic marine ecosystems

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Le, Bohec Céline Gauthier-Clerc Michel Grémillet David. "Stratégies d'histoire de vie d'un oiseau longévif le manchot royal (Aptenodytes patagonicus) /." Strasbourg : Université Louis Pasteur, 2008. http://eprints-scd-ulp.u-strasbg.fr:8080/00000991.

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Анотація:

Thèse de doctorat : Physiologie et biologie des organismes, populations, interactions : Strasbourg 1 : 2007.
Thèse soutenue sur un ensemble de travaux. Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. p. 202-233.

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Connan, Maëlle. "Biomarqueurs lipidiques, réseau trophique pélagique et écologie alimentaire des oiseaux de mer Procellariiformes." Paris 6, 2005. http://www.theses.fr/2005PA066622.

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Lecomte, Vincent. "La Sénescence en milieu naturel : une étude pluridisciplinaire chez deux oiseaux marins longétifs, le grand Albatros et le Pétrel des neiges." Poitiers, 2010. http://theses.edel.univ-poitiers.fr/theses/2010/Lecomte-Vincent/2010-Lecomte-Vincent-These.pdf.

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Peu de données sont actuellement disponibles sur les effets de l'âge sur les performances physiologiques et comportementales des animaux sauvages. Compte tenu de sa nature multifactorielle, il est délicat d'explorer les corrélats physiologiques et comportementaux de la sénescence en conditions naturelles sans mener une approche multidisciplinaire. Cette thèse de terrain constitue le premier travail multidisciplinaire abordant la question cruciale du vieillissement en conditions naturelles. Notre but est d'analyser simultanément les effets de l’âge sur la physiologie, les comportements de recherche alimentaire et le succès reproducteur chez deux ‘modèles d’étude’ du vieillissement : le Grand Albatros Diomedea exulans (2-48 ans ; île subantarctique de Crozet) et le Pétrel des Neiges Pagodroma nivea (7-46 ans ; Terre Adélie, Antarctique). Nous avons conduit des études transversales pour décrire les patrons de variation avec l'âge du comportement de recherche alimentaire, de la performance de reproduction et de nombreux marqueurs phénotypiques (associés au vieillissement chez l'Homme ou les animaux de laboratoire), tels que l'immunité, le stress oxydant, les défenses antioxydantes, les taux basaux de d'hormones, la réponse hormonale au stress et la réponse cardiaque au stress. Chez le Grand Albatros, nous avons détecté un effet de l’âge sur le comportement de recherche alimentaire, la réponse au stress et le succès reproducteur, mais pas sur les marqueurs basaux de l'immunité, du stress oxydant ou des taux hormonaux. Les vieux Albatros mâles ont des aires de pêche différentes de celles des mâles plus jeunes, sont moins actifs à la surface de l’eau, parcourent de plus grandes distances, et reviennent de mer avec des taux relatifs d'hormone de stress plus élevés que les jeunes. En revanche, aucun effet de l'âge été détecté sur la physiologie ou le comportement des femelles, suggérant que les patrons de variations avec l'âge sont propres à chaque sexe, comme chez l'Homme ou les animaux de laboratoire. En outre, l'examen des albatros non reproducteurs suggère que c'est en situation de contrainte que les patrons de variation avec l'âge des traits physiologiques s'expriment. Chez le Pétrel des neiges, aucun effet de l'âge n'a été détecté sur la réponse immunitaire humorale, sur l'augmentation des taux d'hormone de stress pendant la réponse immunitaire, sur la croissance ou la réponse au stress des poussins, suggérant qu'il est difficile de mettre en évidence des corrélats physiologiques de la sénescence chez cette espèce longévive. Dans l’ensemble, nos résultats suggèrent que (i) les niveaux de maintenance somatique restent élevés jusque dans la fin de vie chez les oiseaux longévifs, contrairement aux espèces peu longévives ; (ii) les traits phénotypiques associés aux comportements alimentaires pourraient être des facteurs proximaux du vieillissement en conditions naturelles ; (iii) le sexe est un paramètre majeur de la détermination des patrons de variation avec l'âge en conditions naturelles
Very little is known on the deterioration of physiological and behavioural performances with age in wild animals. Given the multifaceted nature of senescence, identifying the effects of age on physiology and behaviour remains a challenging. We investigated the effects of age on a broad array of phenotypic traits in two long-lived seabirds, the Wandering Albatross Diomedea exulans (age 2–48+ years; Ile de la Possession, Southern Indian Ocean) and the Snow Petrel Pagodroma nivea (age 7–46 years; Terre Adélie, Antarctica). We studied foraging behaviour using satellite tracking and miniaturized activity loggers, and monitored reproductive performance. An array of phenotypic traits (immune function, levels of oxidative stress, antioxidant defenses, baseline hormonal levels, endocrine and cardiac stress responses) known to reflect senescence in vertebrates was also examined. In Wandering albatrosses, there was age related patterns in foraging behaviour, stress response and reproductive performance, but not in baseline physiology. There was an unexpected pattern of spatial segregation by age in the foraging areas of male albatrosses. Old males, but not females, travelled a greater distance but were less active at the sea surface, and exhibited low foraging efficiency, suggesting that foraging ability (i. E. The ability of individuals to extract energy from their environment) might play a central role in shaping ageing patterns in natural conditions. Moreover, the stress response of non-breeding males, but not breeding males, was affected by age, suggesting that age-related patterns are enhanced when individuals face ‘challenging’ conditions. In contrast, there was no detectable effect of age in females, suggesting that senescence rates are sex-specific in wild seabirds, as in humans an in laboratory model animals. In Snow Petrels, there was no detectable effect of age on PHA-induced immune response, PHA-induced hormone levels, chick growth or chick physiology, suggesting that physiological senescence is difficult to detect in this very long-lived seabird. Overall, our results highlight that age, gender, reproductive status and foraging ability interact in shaping ageing patterns in natural conditions, and suggest that long-lived seabirds maintain a high level of physiological fitness in old age, which supports the disposable soma theory

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Scherrer, Bruno. "Application et optimisation de l'échantillonnage probabiliste en écologie continentale." Montpellier 2, 1987. http://www.theses.fr/1987MON20115.

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Martin, Jean-Louis. "Variation géographique, adaptation et spéciation : l'exemple de Parus caeruleus (Aves)." Montpellier 2, 1988. http://www.theses.fr/1988MON20233.

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Eveillard-Buchoux, Marie. "Côtes rocheuses de Bretagne et oiseaux pélagiques : vers une valorisation intégrée du patrimoine naturel." Thesis, Nantes, 2018. http://www.theses.fr/2018NANT2003/document.

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Les côtes de l’Europe Atlantique hébergent un grand nombre d’oiseaux pélagiques nicheurs de l’hémisphère nord. Dans cette configuration, la Bretagne (France) constitue la principale limite méridionale de leur aire de répartition. Ces oiseaux vivent en haute mer et reviennent à terre pour se reproduire, nichant dans un environne-ment spécifique : les côtes rocheuses. Cet habitat particulier est défini par des caractéristiques géomorpho-logiques répondant aux exigences comportementales des espèces. L’oiseau, en occupant ces sites, révèle, sous un angle, la richesse de leurs formes et leurs situations géographiques originales. Les oiseaux pélagiques et les côtes rocheuses constituent des objets de recherche en géographie depuis de nombreuses années. Cependant, l’analyse de leur association est une démarche nouvelle dans cette discipline et l’élargissement au champ patrimonial complète l’approche scientifique. Il montre par exemple que la mise en protection des sites les plus emblématiques concerne avant tout le paysage, l’habitat ou l’oiseau, plus rarement la falaise. Les oiseaux marins sont souvent les espèces « phares » des sites littoraux où ils constituent le patrimoine naturel majeur, s’observant aussi sur le plan de la valori-sation touristique. L’oiseau est omniprésent, la falaise est quasiment absente, que ce soit dans les publications ou dans le discours des guides, en dehors du point de vue qu’elle propose sur un paysage. Dans tous les cas, il est rare de voir associer ces deux patrimoines. La recherche menée sur cette thématique illustre tout l’intérêt et l’enjeu du développement, pour le tourisme de nature, de cette approche croisée oiseau / relief
The North-West coasts of Europe provide rocky cliff nesting sites for a large number of Northern Hemis-phere pelagic seabirds. Although pelagic seabirds and their habitats have been studied from the geogra-phic standpoint for many years, the relation between seabird species and nest-site geomorphological characteristics represents a new field of study. Focu-sing on several Brittany populations, the present study demonstrates that the geomorphological characteristics of these micro-habitats appear to correspond to preferences for different seabird species, highlighting the importance of nest-site micro-geomorphological criteria to the successful reproduction of cliff-nesting seabirds. Extending these data to the spheres of conservation and eco-tourism, they underscore the importance, and even the primacy, of the protection of nesting popula-tions based on geomorphological criteria, rather than on large-scale, area-wide considerations. Conse-quently, much more emphasis should be placed on the importance of the geomorphological characteris-tics of nesting sites, as opposed to the present ‘bird only’ emphasis in most publications and tourist information

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Joachim, Jean. "Dialectes et populations du pinson des arbres (Fringilla coelebs) dans le Sud-ouest de la France." Toulouse 3, 1995. http://www.theses.fr/1995TOU30006.

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Les nombreuses particularites locales dans le chant du pinson des arbres sont decrites comme des dialectes pouvant etre percus comme le reflet de l'isolement plus ou moins grand des populations. La cartographie des zones dialectales souligne le fractionnement en sous-unites de population de l'ensemble des pinsons vivant sur un secteur geographique donne. Dans le grand sud-ouest de la france, le pinson presente une repartition en taches, tres correlee avec le couvert forestier. Un modele d'incidence du pinson, base sur ce couvert forestier et des points d'ecoute, a dirige l'echantillonnage. Chaque secteur ou la probabilite d'occurence du pinson etait superieure a 0,5 a ete sonde. Chaque chant numerise a ete traite afin de calculer un spectre de frequences. Les tableaux des analyses discriminantes quadratiques soulignent les differences des chants appartenant aux divers secteurs geograph iques. 14 dialectes differents ont ainsi ete mis en evidence. Parmi eux, trois grandes familles se distinguent: 1) la famille pyreneenne, 2) la famille du massif central, et 3) la famille des landes. De nombreux cantons-tests ont ete suivis sur plusieurs annees dans des secteurs a forte, moyenne et faible densite de pinson. Aucun renouvellement dialectal n'est sensible dans les zones a forte densite. La ou les densites sont moyennes, ce renouvellement est lent autour des noyaux dialectaux et moyen ailleurs. Dans les zones a faible densite, ce renouvellement est tres rapide. Le calcul de trois niveaux de renouvellement: specifique, dialectal et individuel, aboutit a la cartographie des zones demographiquement dominantes, de leur zone d'influence, et permet une certaine visualisation des flux inter-populations

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Masski, Hicham. "Identification des frayères et étude des structures de population du turbot Psetta maxima L. Et du bar Dicentrachus labrax L. En Manche ouest et dans les zones avoisinantes." Brest, 1998. http://www.theses.fr/1998BRES2089.

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Le turbot et le bar sont deux especes de poisson a forte valeur commerciale. Leur exploitation en manche ouest s'effectue de maniere ciblee par les professionnels de la peche. L'effet de ciblage est plus prononce quand la ressource se regroupe. Ainsi, les debarquements de ces deux especes augmentent fortement pendant leurs periodes de frai respectives. L'utilisation des donnees commerciales a permis d'identifier les zones de frai du turbot et du bar en manche ouest et dans les zones avoisinantes. Les deux especes etudiees se regroupent au large. Le turbot, qui est un poisson benthique, forme des groupes multiples et distincts de taille inferieure au rectangle statistique (decoupage ciem). Les groupes se retrouvent le long du plateau continental des cotes bretonnes a des profondeurs comprises entre 80 et 110 m. Le bar effectue des regroupements de grande ampleur s'etendant sur plus d'un rectangle statistique. La zone la mieux identifiee se retrouve en manche ouest, et deux autres zones ont ete identifiees en gascogne nord et dans le canal de bristol. Les individus qui se regroupent sont a un stade avance de maturite sexuelle. Les plus jeunes ont trois ans dans le cas du turbot, et six ans dans le cas du bar. Pendant la phase de regroupement, les individus les plus ages ont un comportement different des individus les plus jeunes, revelant une dynamique dans la composition de la structure des populations sur les zones de frai.

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Claessens, Olivier. "Effets de la fragmentation de l'habitat sur les peuplements d'oiseaux forestiers tropicaux : le cas de la mise en eau du barrage de Petit Saut (Guyane franc̨aise)." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2000. http://www.theses.fr/2000MNHN0020.

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La structure et la composition des peuplements d'oiseaux ont été étudiées sur la retenue du barrage de petit saut pendant et après la mise en eau, de 1993 à 1996. Une zone témoin de 35 ha sur terre ferme, une ile de 28 ha et 14 ilots de 0,3 à 12 ha ont été étudies. Des relevés standardisés par captures et par points d'écoute et un inventaire complet de l'avifaune ont été réalisés. 342 espèces reparties en 22 guildes ont été recensées. Le peuplement de terre ferme est caractérise par une grande richesse et diversité, des densités globale et spécifiques faibles, une répartition irrégulière des espèces liée a l'hétérogénéité du milieu ou à une compétition interspécifique. Les ilots sont caractérises par une densité globale forte, une composition spécifique et en guildes différente, une diminution de la richesse, de la diversité et de l'abondance, des densités spécifiques fortes et fluctuantes, un taux de renouvellement et une proportion d'espèces non-résidentes élevés. Des extinctions ont eu lieu sur la grande ile dès son isolement. Les facteurs de régulation et de divergence des peuplements insulaires sont étudies. Une restriction des tailles de territoires, un relâchement de la territorialité, une désorganisation des rondes plurispécifiques ont été observes. La richesse, l'abondance, la densité du peuplement, le taux d'extinction et la proportion d'espèces résidentes sont lies a la surface plus qu'à la distance d'isolement. La qualité du milieu, un effet fondation, les relations mutualistes et la prédation expliquent la composition des peuplements insulaires. Le régime alimentaire, l'habitat, la strate exploitée, la taille corporelle et la socialité des espèces influent sur leur sensibilité à la fragmentation du milieu. 5 guildes sont peu sensibles, au moins 7 sont défavorisées. Les résultats sont discutés dans le cadre de la biogéographie insulaire et sur le plan de la conservation. L'intérêt et les limites des points d'écoute en forêt tropicale sont soulignes.

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Larour, Marie-Lucile. "Les déplacements et leurs implications démographiques pour les populations d'oiseaux migrateurs soumis aux prélèvements cynégétiques : l'exemple du Fuligule milouin et du Fuligule morillon." Nantes, Ecole nationale vétérinaire, 2013. http://www.theses.fr/2013ONIR028F.

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A travers l’exemple du Fuligule milouin (Aythya ferina) et du Fuligule morillon (Aythya fuligula), l’objectif de cette thèse est de contribuer à une meilleure compréhension de la dynamique et du fonctionnement démographique des populations d’oiseaux migrateurs, soumis à des prélèvements cynégétiques. Pour ce faire, nous avons étudié les déplacements de ces deux espèces de canards plongeurs à différentes périodes de leur cycle annuel, et leurs implications démographiques grâce à une approche de Capture-Marquage-Recapture. Les déplacements hivernaux des deux espèces de fuligules se traduisent ainsi par un renouvellement important des individus à une échelle locale voire à plus grande échelle. D’autre part, les patrons/stratégies de migration des fuligules de la limite sud-ouest de leur aire de nidification ne répondent pas aux règles habituelles qui s’appliquent aux individus du nord de l’Europe. En effet, les fuligules se reproduisant dans les zones tempérées du sud-ouest de l’Europe migrent principalement vers le nord et les mâles semblent plus contraints à migrer, les femelles ayant tendance à être sédentaires. Enfin, si la migration des fuligules est à l’origine d’un mélange d’individus, notamment sur les sites d’hivernage, l’importante fidélité aux sites de reproduction des femelles permettrait l’existence d’une structure démographique de leurs populations à l’échelle de la France. Sur la base de ces résultats spécifiques, un certain nombre de perspectives en termes de gestion et conservation des canards plongeurs sont proposées.

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Enstipp, Manfred. "Diving energetics and fine scale foraging behaviour of avian divers and their capacity to buffer environmental change." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2005. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2005/ENSTIPP_Manfred_2005.pdf.

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Les oiseaux marins sont présents sur toutes les mers du globe et dans des zones climatiques extrêmement différentes, allant des tropiques jusqu’aux régions polaires. Un grand nombre d’espèces vivent en haute mer et capturent leurs proies sous l’eau. L’élément liquide possède un énorme pouvoir de refroidissement et génère de fortes contraintes thermiques sur ces homéothermes. Ces contraintes ont certainement influencé les modes de colonisation des écosystèmes aquatiques par les oiseaux marins. Dans ces milieux hostiles, les oiseaux assurent leur survie par le biais de deux stratégies (non exclusives). (1) Augmentation de l’isolation périphérique afin de minimiser les pertes de chaleur au contact de l’eau; (2) exploitation de zones riches en nourriture afin de maximiser leurs gains d’énergie au cours de la recherche alimentaire. La combinaison de ces deux stratégies permet l’optimisation de l’efficacité énergétique au cours de la recherche alimentaire. Afin de comprendre comment les oiseaux marins se sont adaptés au milieu aquatique au cours de leur trajectoire évolutive et de définir leur rôle au sein des écosystèmes actuels, il est donc de toute première importance d’étudier les mécanismes qui régissent leurs dépenses énergétiques ainsi que leurs gains en énergie au cours de la recherche alimentaire. Au cours des deux dernières décennies, les avancées technologiques ont permis la réalisation d’un grand nombre d’études concernant le comportement alimentaire des oiseaux marins ainsi que leurs besoins énergétiques. Ces deux volets ont pourtant rarement été considérés conjointement et certains aspects fondamentaux restent négligés. Par exemple, l’effet de la pression sur l’isolation thermique et sur la flottabilité des oiseaux plongeurs, ainsi que ses conséquences sur les coûts énergétiques de la plongée n’ont pas encore été mesurés directement. En outre, le comportement prédateur des oiseaux plongeurs a principalement été déduit de mesures effectuées par des capteurs embarqués. Des observations directes et détaillées des techniques de pêche ainsi que des études de l’impact de divers facteurs biotiques et abiotiques sur ces stratégies restent extrêmement rares. Le comportement des oiseaux marins est d’autre part principalement étudié à l’échelle de l’individu. Il est cependant nécessaire et urgent de prédire les réactions des communautés d’oiseaux marins aux changements environnementaux, qu’ils soient d’origine naturelle ou anthropique. Ces stress environnementaux provoquent en effet à l’heure actuelle des changements de régime et de structure variés au sein des écosystèmes marins. Des informations détaillées concernant les processus d’acquisition et de dépense d’énergie chez différentes espèces d’oiseaux marins constituent donc la base de modèles bio-énergétiques qui permettront une approche fonctionnelle prédictive du rôle des oiseaux marins au faîte des réseaux trophiques aquatiques. La collecte de données écophysiologiques ainsi que leur synthèse dans le cadre d’exercices de modélisation, nous permettra donc de juger de la capacité d’adaptation des prédateurs marins aux changements environnementaux (tels qu’une baisse de la disponibilité des proies). Mes travaux de thèse, qui traitent de l’écophysiologie de la recherche alimentaire chez les oiseaux plongeurs ont principalement concerné les cormorans. Des études récentes ont suggéré que les coûts de la recherche alimentaire sont particulièrement élevés chez ces oiseaux, mais que ceux-ci adaptent leur comportement prédateur afin de minimiser la durée totale de la recherche alimentaire (par le biais d’une augmentation de l’efficacité prédatrice). Cette stratégie nécessite l’exploitation de ressources alimentaires particulièrement profitables (forte densité des proies et/ou grande valeur calorifique). On peut donc prédire que les cormorans seront particulièrement sensibles aux contraintes environnementales affectant les conditions de la recherche alimentaire et/ou la disponibilité des proies. Ce sont donc d’excellents modèles d’étude de l’impact de ce type de changements sur les prédateurs marins. Mes travaux de thèse s’articulent en sept chapitres. A l’issue d’une introduction générale (chapitre 1), je présente deux études de la dépense énergétique associée à la recherche alimentaire chez les oiseaux plongeurs (chapitres 2 et 3). Plus spécifiquement, j’ai étudié l’influence de la température de l’eau, de la profondeur des plongées ainsi que du statut nutritif des oiseaux sur les coûts énergétiques de la plongée chez les cormorans huppés (Phalacrocorax aristotelis) et les cormorans à aigrettes (Phalacrocorax auritus). Je détaille par la suite les comportements associés à la recherche alimentaire chez les oiseaux plongeurs (chapitres 4 et 5). Il s’agit d’une analyse détaillée des techniques de capture des poissons chez les cormorans à aigrettes et les grands cormorans (Phalacrocorax carbo) en fonction de divers paramètres biotiques et abiotiques. Enfin, je combine certains de ces résultats avec des données tirées de la littérature afin de développer un modèle bio-énergétique (chapitre 6). Ce modèle, élargi à quatre espèces d’oiseaux marins de la Mer du Nord, m’a permis de calculer leurs besoins alimentaires théoriques pendant la phase d’élevage des poussins. Il m’a également permis de tester la capacité d’adaptation de ces différentes espèces à une baisse de la disponibilité de leurs proies principales. Ces diverses études débouchent sur des conclusions et perspectives qui sont présentées dans le chapitre 7
Avian divers are confronted with a number of physiological challenges when foraging in cold water, especially at depth. Diving is believed to be particularly costly in cormorants (Phalacrocoracidae) because of their poor insulation and less efficient foot-propulsion. I used open-circuit respirometry to study the energetic requirements of two Phalacrocorax species, the European shag (P. Aristotelis) and the double-crested cormorant (P. Auritus) when diving in a shallow (1 m) and deep (10 m) dive tank. I also investigated the modifying effects of water temperature and feeding status on dive costs. My results indicate that the energetic costs during shallow diving in European shags and double-crested cormorants are comparable to other foot-propelled divers. Metabolic rate was significantly increased when diving to greater depth and at lower water temperatures, while feeding before diving increased metabolic rate, albeit not significantly. The strong effects of depth and water temperature on cormorant diving metabolic rate are most likely a consequence of their partially wettable plumage and their reduced plumage air volume, which makes them prone to heat loss and, hence, increases thermoregulatory costs. The energetic requirements of animals have to be satisfied by intake of resources from the environment. Hence, the quest for food is a central aspect of animal behavior. Although the study of seabird foraging behaviour has greatly profited from recent technological developments, we still know little about predator-prey interactions on a fine scale. I used an underwater video array to investigate the prey-capture behaviour of double-crested cormorants foraging on live rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). I tested the effects of a variety of factors on the underwater foraging behaviour of cormorants and established a functional link between prey density and cormorant prey capture rate. Prey density and behaviour both significantly affected predator performance. At prey densities below 2-3 g fish m-3 birds increased their search time during a trial drastically, while prey-encounter rate was greatly decreased. When cormorants attacked shoaling rather than solitary trout, their capture success was significantly reduced, while pursuit duration was significantly increased. Seabird energetics and behaviour are typically studied on the individual or species level. However, if we want to understand how seabirds react to environmental changes, we have to consider entire communities. In the western North Sea, a large seabird assemblage critically depends on a single fish species, the lesser sandeel (Ammodytes marinus), which is also exploited by an industrial fishery. I developed an algorithm to test for the capacity of four seabird species during chick-rearing in Scotland to buffer a potential decline in sandeel abundance by increasing their foraging effort in various ways. My results show that under the conditions currently operating in this region shags and guillemots (Uria aalge) may have sufficient time and energy to allow them to increase their foraging effort considerably, while Kittiwakes (Rissa tridactyla) and gannets (Morus bassanus) appear more constrained by time and energy respectively. My study suggests that during chick-rearing gannets are working at the highest metabolic level of all species considered and hence, have the least physiological capacity to increase foraging effort. This indicates that gannets could potentially be very sensitive to a reduction in sandeel abundance. My thesis emphasises the importance of taking into account seabird energetics as well as fine scale behavioural requirements, when trying to develop management schemes for fisheries that will allow the coexistence of both seabirds and human fishery in a sustainable way

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Sauser, Christophe. "Les oiseaux marins polaires, sentinelles de la glace de mer : Réponses démographiques et traits d’histoire de vie." Thesis, La Rochelle, 2020. http://www.theses.fr/2020LAROS027.

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L’impact du changement climatique sur la glace de mer et les écosystèmes polaires qui en dépendent est reconnu depuis plusieurs décennies. Cependant, ces milieux sont généralement difficiles à étudier en raison de leur climat extrême, de leur isolement et des difficultés logistiques associées. Le manque de connaissances concernant les mécanismes reliant les traits d’histoire de vie des organismes polaires et la variation de la glace de mer est particulièrement préjudiciable à notre compréhension des conséquences du changement climatique sur les espèces longévives comme les oiseaux marins polaires. Ces derniers, généralement situés au sommet des réseaux trophiques, pourraient cependant constituer des espèces sentinelles des écosystèmes liés à la glace de mer. L’objectif de cette thèse est d’améliorer les connaissances sur les processus impliqués dans les réponses des populations de prédateurs marins polaires aux variations environnementales, et principalement les mécanismes liés à la glace de mer. Pour répondre à cet objectif nous nous sommes basés sur le suivi individuel à long terme de deux espèces d’oiseaux marins polaires, le pétrel des neiges (Pagodroma nivea) et le damier du Cap (Daption capense). Les deux espèces se reproduisent en milieu polaire. L’une est particulièrement dépendante de la glace de mer pour s’alimenter (le pétrel des neiges) tandis que l’autre préfère un habitat libre de glace (le damier du Cap). Au cours de ce travail, nous avons estimé l’influence de facteurs extrinsèques (forçages ascendants, descendants, météorologie locale) et intrinsèques (âge, expérience de reproduction, sexe, colonie) sur les réponses démographiques des espèces à l’aide de modèles multi-états de capture-marquage-recapture. Nous avons également testé l’influence des facteurs environnementaux sur les traits phénotypiques (condition corporelle et phénologie de reproduction) du pétrel des neiges. Chez les damiers du Cap nous montrons une diminution du succès reproducteur ainsi que l’influence de plusieurs paramètres extrinsèques (température de surface de l’eau de mer, prédation, météorologie locale) sur celui-ci. En parallèle nous montrons une augmentation de la survie des adultes et une corrélation de celle-ci avec l’oscillation Antarctique. Chez le pétrel des neiges, nous avons mis en évidence l’influence de la glace de mer et d’autres facteurs extrinsèques (prédation, oscillation Antarctique, météorologie locale) et intrinsèques (sexe, colonie, expérience de reproduction) sur de multiples traits démographiques. Nous avons également montré un décalage (retard) dans la phénologie de reproduction des pétrels des neiges en réponse à des changements environnementaux (concentration de glace de mer, vents) et nous avons constaté que la reproduction retardée avait un impact négatif sur la probabilité d'envol des poussins. Enfin nous avons aussi montré que la concentration de glace de mer et l’oscillation Antarctique ont une influence négative sur la survie et la condition corporelle des juvéniles de pétrel des neiges. Cette thèse permet d’apporter de nouvelles connaissances sur les liens entre glace de mer et les traits d’histoire de vie d’une espèce pagophilique, le pétrel des neiges et d’une espèce moins associée à la glace, le damier du Cap. Ces connaissances permettent de mieux appréhender les conséquences du changement climatique sur les oiseaux marins polaires et les écosystèmes polaires en général, et apporte une contribution à la compréhension de la dynamique des populations concernant les variations démographiques intra spécifiques à fine échelle spatiale
The impact of climate change on sea ice and polar ecosystems has been well recognized. However, these environments are generally difficult to study because of their extreme climate, isolation and the associated logistical difficulties. The lack of knowledge regarding the mechanisms linking the life history traits of polar organisms and sea ice variation limit our understanding of the consequences of climate change on long-lived species such as polar seabirds and sea ice ecosystems. Seabirds, generally located at the top of food webs, could however constitute sentinel species of ecosystems linked to sea ice. The objective of this thesis is to improve knowledge on the processes involved in the responses of polar marine predators to environmental variations, and mainly the mechanisms linked to sea ice. For this purpose we have based our analyses on the long-term monitoring of two polar seabirds, the snow petrel (Pagodroma nivea) and the Cape petrel (Daption capense). Both species breed in polar environments of the Southern Ocean. One is particularly dependent on sea ice for foraging (snow petrel) while the other prefers ice-free habitats (Cape petrel). During this PhD, we estimated the influence of extrinsic factors (top-down, bottom-up, local weather) and intrinsic factors (age, breeding experience, sex and colony) on the demographic responses of these two species using multi-states capture-recapture models. We also tested the influence of environmental factors on phenotypic traits (body condition and breeding phenology) of snow petrels. For the Cape petrel, we show a decrease in breeding success as well as an influence of several extrinsic parameters (sea surface temperature, predation, local weather) on this demographic parameter. We also show an increase in adult survival linked to variations of a large scale climate index, the southern annular mode. Modelling of the population dynamics using a matrix population model indicated a positive population growth rate and suggest that this species probably beneficiates from current climate changes. In snow petrels, we demonstrate the influence of sea ice and other extrinsic factors (predation, southern annular mode, local weather) as well as intrinsic factors (sex, colony, breeding experience) on multiple demographic traits (probabilities of survival, breeding, hatching, and fledging). We also show a shift (delay) in the breeding phenology of snow petrels in response to environmental changes (sea ice concentration, winds), and found that delayed reproduction negatively impacted the probability of fledging. Finally, we show that the sea ice concentration and the southern annular mode have a negative influence on the survival and body condition of juvenile snow petrels. This thesis provides new knowledge on the links between sea ice and the life history traits of two Antarctic polar seabirds characterized by specific dependence to sea ice. This knowledge helps to better understand the consequences of climate change on polar seabirds and polar ecosystems in general, and contributes to the understanding of population dynamics concerning intra-specific demographic variations at a fine spatial scale

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Bauthian, Isabelle. "Dynamiques spatiales des espèces d'intérêt cynégénétique : l' apport des modèles de dynamique des populations." Paris 6, 2005. http://www.theses.fr/2005PA066378.

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Sromek, Ludmila Katarzyna. "Phylogéographie et génomique des populations de la coque de lagune Cerastoderma glaucum." Thesis, Université Côte d'Azur (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017AZUR4105.

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Une forte structure génétique a été décrite dans la littérature parmi les populations européennes de la coque de lagune Cerastoderma glaucum. Cependant, les limites géographiques entre les grandes divisions génétiques varient d'un marqueur à l'autre et leur faible nombre ne permettait pas de tester réellement les échanges génétiques entre ces groupes. Le but principal de cette thèse était donc d'estimer la structure des populations de C. glaucum à l'aide de marqueurs, en considérant les rôles respectifs de la divergence passée et de la fragmentation de l'habitat. Pour atteindre ses objectifs, des populations des côtes atlantiques et méditerranéennes ont été étudiées en utilisant : i) des marqueurs génétiques classiques (un EPIC et des marqueurs microsatellites déjà publiés); ii) des séquences associées à des sites de restriction (“restriction associated DNA sequences”) ou RADseq. Alors que les marqueurs génétiques classiques ont révélé le caractère divergent des populations de Méditerranée orientale, l'approche RADseq a permis de reconstruire les relations phylogénétiques entre groupes au sein de l'espèce avec une résolution jamais encore ateinte. Trois lignées profondément divergentes ont ainsi été identifiée au sein de C. glaucum: une en Mer Egée – Mer Noire, une en Mer Ionienne et la dernière largement distribuée de la Méditerranée à la Baltique. Cette dernière lignée c'est par ailleurs sous divisée en entités isolées en Méditerranée Occidentale, en Atlantique, en Mer du Nord et an Baltique. Comparée à l'espèce soeur C. edule, qui profite d'un habitat moins fragmenté, C. glaucum présente une beaucoup plus forte différenciation génétique entre populations. Il semble donc que des incompatibilités génétiques, conséquences de l'isolement géographique et de l'adaptation locale, aient pu être à l'origine d'un complexe d'espèces. Ces résultats soulignent par ailleurs le rôle évolutif particulier de l'habitat lagunaire, accélérateur de la diversification génétique
Previous studies found a high level of genetic structuring among the European populations of the lagoon cockle Cerastoderma glaucum. However, the geographic locations of the major genetic divisions differed among markers and the small number of genetic markers used lacked the power to test for gene flow between divergent clusters. Therefore, the main aim of this thesis was to assess the population structure of C. glaucum using new genetic markers in the light of the respective role of past divergence and habitat fragmentation. To reach these objectives, populations from the Atlantic and Mediterranean coasts have been investigated using: i) classical genetic markers (EPIC together with previously published microsatellites); ii) restriction-site associated DNA sequencing (RADseq). When the classical genetic markers revealed the divergent character of Eastern Mediterranean populations, the RADseq approach allowed inferring phylogenetic relationships with an unprecedented resolution. Three deeply divergent lineages were described within C. glaucum: one in the Aegean-Black Sea region, one in the Ionian Sea, and the last one widely distributed from the Western Mediterranean to the Baltic Sea. This last lineage underwent further diversification with isolated entities detected in Western Mediterranean, Atlantic, North Sea and Baltic Sea. Compared to the sister species C. edule, which thrives in a less fragmented habitat, C. glaucum displayed a much stronger genetic differentiation among populations. Consequently, it seems that genetic incompatibilities, which emerged as a by-product of geographic isolation together with local adaptation, led to the origin of a species complex. These results highlight the evolutionary role of lagoon habitats, where genetic diversification can proceed very quickly

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Perennou, Christian. "Peuplements d'oiseaux aquatiques en milieu anthropisé : un exemple, les plaines de la côte de Coromandel (Inde du sud-est)." Lyon 1, 1990. http://www.theses.fr/1990LYO10194.

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La cote de coromande est caracterisee par une tres forte anthropisation: quasidisparition des milieux naturels, densite de population tres elevee. . . Les activites agricoles ont cree un paysage domine par des zones humides artificielles temporaires qui permettent le maintien d'un peuplement d'oiseaux aquatiques hivernal diversifie. Sa composition quantitative a ete etablie: pour deux groupes temoins (anatides et ardeides), des comparaisons d'effectifs et de compositions specifiques a l'echelle mondiale demontrent l'interet d'une approche biogeographique des peuplements hivernaux d'oiseaux d'eau. L'utilisation relative des differents habitats a ete etablie; et l'evolution sur trois cycles hivernaux de la composition d'un peuplement d'un reservoir d'irrigation montre que la gestion de l'eau par l'homme est un facteur important de variabilite, qui se surimpose aux facteurs naturels. Une comparaison avec l'une des dernieres zones humides naturelles regionales est effectuee. Les rythmes journaliers d'activite des principales especes d'anatides et de ciconiiformes ont ete etablis et compares et l'importance des derangements, d'origine humaine ou non, a ete etablie. Un modele d'utilisation des biotopes aquatiques du coromandel est propose. La question de la conservation des populations regionales d'oiseaux d'eau et de leurs habitats conclut ce travail

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Nabholz, Benoît. "Dynamique évolutive de l'ADN mitochondrial des oiseaux et des mammifères : Mutation, Sélection et Taille des populations." Montpellier 2, 2008. http://www.theses.fr/2008MON20115.

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L'origine et l'évolution du génome mitochondrial sont fascinantes par de nombreux aspects. Aujourd'hui, ce génome représente moins de 1% de l'ensemble de l'ADN de la majorité des animaux mais il héberge quelques uns des gènes les plus essentiels aux fonctions métaboliques. L'hypermutabilité mitochondriale est, chez les animaux, l'une de ses caractéristiques les plus singulières. L'étude du déterminisme du taux de mutation mitochondrial est le premier objectif de cette thèse. Par une approche phylogénétique précise, nous avons obtenu le taux de mutation de plus d'un millier d'esp`eces d'oiseaux et de mammifères. Nous avons révélé une gamme de variation très importante entre espèces, cette variation allant jusqu'à couvrir deux ordres de grandeur chez les mammifères. Grâce à une étude intra-classe et par la comparaison entre les oiseaux et les mammifères, nous avons montré que cette variation pouvait ˆetre en lien avec la longévité des organismes à travers une sélection pour une réduction du taux de mutation mitochondrial chez les espèces longévives. La deuxième partie de cette thèse concerne l'action de la sélection naturelle et de la dérive génétique sur l'évolution de l'ADN mitochondrial (ADNmt). Prenant comme point de départ les récentes preuves de sélection positive dans l'évolution de l'ADNmt (notamment chez les invertébrés), nous détectons, a contrario, essentiellement les traces de la sélection purificatrice chez les oiseaux et les mammifères. De manière plus surprenante, nous avons montré que la taille des populations n'est apparemment pas liée au niveau de polymorphisme mitochondrial des espèces, mais influencé, en revanche, l'efficacité de la sélection, mesurée au travers de la quantité de mutations faiblement délétères qui se fixent au cours de la divergence. Nous proposons qu'une forte stochasticité temporelle de la taille des populations pourrait expliquer ce résultat. L'ensemble de ces résultats participent à la compréhension de l'évolution d'un génome singulier, et a également des implications sur les utilisateurs, particulièrement nombreux, de l'ADN mitochondrial en temps que marqueur moléculaire
The origin and evolution of mitochondrial genome is fascinating. Currently, it makes up less than 1% of the whole organism genome, but contains some of the most important genes. A particularly intriguing feature of the animal mitochondrial genome is its hypermutability. The first goal of this work is to progress in our understanding of the determinism of mitochondrial DNA (mtDNA) substitution rate variations by distinguishing between two classical hypotheses of evolutionary biology –the generation time hypothesis and the metabolic rate hypothesis– and an other hypothesis that comes from biomedecine, namely the longevity hypothesis. Using a phylogenetic approach, we obtained lineage-specific mitochondrial mutation rates across more than one thousand bird and mammalian species. This analysis reveals an unexpectedly high level of mitochondrial mutation rate variation between lineages. The bird/mammal comparison and a within-class analysis suggest that this variation could be linked to species longevity through a (direct or indirect) selective pressure reducing the mitochondrial mutation rate in long-lived species. In the second part of this work, we address the impact of natural selection and genetic drift on mtDNA. Recent evidence of positive selection acting on mtDNA (mostly in invertebrates) was used as a starting point. We showed that, contrary to invertebrates species, bird and mammal mtDNA evolution is mainly under purifying selection. Surprisingly, even in the absence of positive selection, population size variations have no effect on mtDNA genetic diversity, but influence the rate of non-synonymous substitutions. This result could be explained by strong stochasticity of population sizes. All these results contribute to increase our understanding of an unusually evolving genome, and also have implications for the numerous users of mtDNA as a tool to reconstruct population and species history

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Rolland, Virginie. "Influence des changements climatiques et des pêcheries industrielles sur la dynamique des populations d'albatros de l'océan austral." Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066707.

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Cette thèse s’inscrit dans le contexte des changements globaux et du rythme accéléré d’extinction des espèces. Le but est de quantifier l’impact relatif des fluctuations climatiques et des activités humaines sur la démographie des populations. En particulier, les pêcheries industrielles font accidentellement, chaque année, des centaines de milliers de victimes parmi les oiseaux marins, notamment les albatros. Les réponses démographiques de quatre espèces d’albatros menacés de l’océan Austral (albatros à sourcils noirs, à bec jaune, fuligineux à dos sombre et grand albatros) sont comparées dans cette étude. Le succès reproducteur des quatre espèces a répondu de manière très contrastée aux anomalies climatiques selon la zone d’alimentation (subtropical, sub-Antarctique) et la saison (reproduction, hors-reproduction). La survie de toutes ces espèces a été canalisée contre les variations climatiques mais fortement affectée par les pêcheries palangrières au thon rouge du Sud sauf pour l’albatros à bec jaune dont le déclin serait majoritairement dû à la présence du choléra aviaire, cause d’une forte mortalité des jeunes poussins. Les pêcheries semblent avoir un impact plus important que les changements climatiques mais les interactions des effets climatiques et des pêcheries sont complexes. En outre, le réchauffement prédit pour la fin du 21ème siècle annonce la croissance de la population d’albatros à sourcils noirs de Kerguelen, à la condition que l’effort de pêche n’augmente pas tandis que celle des albatros fuligineux à dos sombre continuerait son déclin même dans le cas d’un arrêt de la pêche. Il paraît donc nécessaire de prédire les conséquences futures du réchauffement et des activités humaines sur des espèces menacées comme les albatros.

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De, Buron-Brun Isaure. "Biologie des populations d'Acanthocéphales : étude du complexe Acanthocephaloides propinquus, parasite de Poissons marins et lagunaires." Montpellier 2, 1986. http://www.theses.fr/1986MON20205.

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L'etude morphoanatomique et du polymorphisme enzymatique montre qu'il s'agit d'un complexe d'especes. Une approche de la dynamique des populations montre l'importance relative de differents poissons hotes au cours du cycle biologique de l'acanthocepale. La localisation dans l'intestin de l'hote et la mode d'attachement sont observes ainsi que les modes d'infestation. Une nouvelle espece de microsporidie parasite des acanthocephales est signalee

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Poupart, Timothée. "Foraging ecology of winter-breeding seabirds in New Zealand." Thesis, La Rochelle, 2019. http://www.theses.fr/2019LAROS016.

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Bien que le coût énergétique de la reproduction contraigne les animaux à élever leur(s) jeune(s) pendant le pic d’abondance de ressource alimentaire au printemps et/ou en été, certaines espèces font exception en se reproduisant en hiver. Comment leurs besoins énergétiques élevés peuvent-ils être satisfaits pendant une période traditionnellement décrite par des conditions environnementales difficiles réduisant les ressources alimentaires ? Cette question a été peu étudiée jusqu’à présent. Cette stratégie originale de reproduction hivernale est adoptée par davantage d’espèces d’oiseaux marins en Nouvelle-Zélande qu’ailleurs dans le monde, avec une concentration sur la côte ouest de l’île du Sud. Dans ce contexte, cette thèse a eu trois objectifs. Tout d’abord, décrire le comportement de recherche alimentaire à fine échelle d’espèces d’oiseaux marins nicheuses en hiver clés du réseau trophique, sur la côte ouest de l’ile du Sud de la Nouvelle-Zélande. Ensuite, examiner les facteurs intrinsèques et extrinsèques déterminant leur comportement. Enfin, quantifier le recouvrement de leurs niches écologiques sur leur zone d’alimentation durant la période d’élevage du(des) jeune(s). Nous avons étudié la stratégie de recherche alimentaire sur une communauté d’espèces constituée de deux guildes : les oiseaux plongeurs (manchot du Fiordland Eudyptes pachyrhynchus) et de surface (pétrel de Westland Procellaria westlandica, albatros de Buller Thalassarche bulleri bulleri). L’approche s’est basée sur le déploiement de bio-loggers sur ces oiseaux (GPS, accéléromètre, enregistreur de plongée) et l’analyse isotopique (carbone, azote) de sang prélevé après leur voyage en mer. Les individus équipés se sont moins éloignés de leur colonie que leurs espèces congénères nichant en été, en utilisant majoritairement les eaux du talus continental et néritiques. Mâles et femelles ont eu des comportements de recherche alimentaire semblables, avec des différences spatiales concernant l’albatros de Buller. Des taux de rencontre de proies élevés ont été enregistrés chez les trois espèces, permettant un élevage du(des) jeune(s) avec un taux de succès élevé, et sans effort supérieur par rapport aux espèces nichant en été. Ces résultats suggèrent que les oiseaux marins nichant en hiver sur l’île du Sud de la Nouvelle-Zélande ont une phénologie de reproduction concordant avec des ressources alimentaires hivernales locales suffisantes. Des données supplémentaires issues de la littérature ont permis d’inclure le manchot bleu Eudyptula minor et le Cormoran tacheté Stictocarbo punctatus (espèces nichant aussi en hiver sur la même côte) dans l’étude de ségrégation de niche écologique. Cette communauté a montré un recoupement partiel de leur niche écologique, mais aussi un faisceau de divergences sur le plan des déplacements horizontaux, verticaux, de la distribution temporelle de l’activité de recherche alimentaire, du régime alimentaire et de la niche isotopique. Cette ségrégation écologique explique la coexistence de cette communauté avienne dans un même habitat. Par conséquent, la stratégie de reproduction hivernale peut être favorable aux oiseaux marins prédateurs supérieurs, lorsque des processus océanographiques locaux sont favorables. Sur le plan océanographique, un mélange vertical des eaux attire et garantit la persistance de proies au cours de l’hiver. En outre, la phénologie hivernale de la reproduction contribue aussi à l’émancipation du poussin au printemps. Ainsi, elle concorde avec le pic local de productivité primaire, en accord avec les prédictions. Ces espèces présentes en populations modestes, peuvent ainsi terminer leur cycle de reproduction hivernal avant que d’autres espèces beaucoup plus abondantes (comme les millions de Puffin fuligineux Puffinus griseus) rentrent de migration et s’engagent à leur tour dans leur reproduction estivale
Although the cost of reproduction constrains animals to breed during spring/summer when food availability peaks, exception exist in seabirds with few species engaged in breeding during winter months. How their elevated energy needs can be sustained during a period traditionally reported for food shortage and challenging at-sea conditions is poorly understood. In addition, this unusual breeding phenology is adopted by more species in New Zealand than elsewhere in the world, with a concentration on the South island west coast where several winter breeding species are reported to forage with overlap. Therefore, the objectives of this thesis were to: 1) describe the fine-scale foraging behaviour of winter-breeding species from the west coast of New Zealand’s South Island, 2) investigate the intrinsic and extrinsic factors driving their foraging, and 3) quantify their niche overlap as they exploit similar areas during elevated energetically demand. Using bio-logging data (GPS, accelerometer, dive recorder) combined with stable isotopes (carbon and nitrogen from whole blood), the winter foraging strategies of breeding males and females were investigated in a deep diver (Fiordland penguin Eudyptes pachyrhynchus) and two surface-feeders / shallow divers (Westland petrel Procellaria westlandica and southern Buller’s albatross Thalassarche b. bulleri). The tracked individuals foraged close to their colony compared to their summer breeding congenerics, using primarily the nearby shelf-slope and neritic waters. Males and females displayed similar foraging behaviour in penguins and petrels, while spatial sexual differences occurred for albatross. All three species encountered prey at a high rate, allowing raising offspring with good success and without higher foraging effort than their summer-breeding congeners.These findings suggest that winter-breeding species have a phenology matching a winter prey resource on the shelf of the west coast of New Zealand’s South Island. With additional data from literature for little penguin Eudyptula minor and spotted shag Stictocarbo punctatus, this winter-breeding community showed partial overlap of their foraging niche, but an accumulation of small divergences in home ranges, diving behaviour, temporal pattern of foraging, diet and trophic level is likely to explain their coexistence. Hence, winter-breeding can be a favourable phenology for high-level predators, which exploit shelf-slope and inshore waters undergoing winter mixing that insure fish and squids persistence through winter. In addition, winter-breeding also allow the matching of chick-fledging period with the spring (local primary production peak), and before the elevated needs of millions of summer-breeding species back from migration

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Savina, Marie. "Modélisation écologique des populations de palourdes roses (Paphia rhomboi͏̈des) et d'amandes de mer (Glycymeris glycymeris) en Manche." Aix-Marseille 2, 2004. http://www.theses.fr/2004AIX22064.

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Ponce, Françoise. "Impact de l'alimentation sur la dynamique des populations de tétras lyre (Tetrao tetrix) dans les Alpes françaises : méthodologie, description, sélection, nutrition." Montpellier 2, 1991. http://www.theses.fr/1991MON20019.

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L'alimentation de deux populations de tetras lyre tetrao tetrix a ete etudiee, l'une localisee a cervieres dans les hautes-alpes et l'autre aux fretes en haute-savoie au moyen de l'analyse fecale. Des tests realises sur la methode utilisee montrent que, bien qu'elle consomme beaucoup de temps, elle fournit des resultats en poids sec fiables et representatifs de la matiere ingeree. Ensuite, les etudes portant sur le regime du tetras lyre a travers son aire de repartition font l'objet d'une synthese bibliographique. On distingue cinq periodes dans l'alimentation des adultes. En hiver, il consomme essentiellement du pin a crochet et du meleze. En mai puis juin, la nourriture se diversifie avec la presence de nouvelles pousses de meleze mais aussi de fleurs et de feuilles. L'alimentation estivale consiste en fruits secs et fleurs avec les premieres baies alors qu'en automne, les baies representent l'essentiel. La proportion d'aiguilles et fleurs de meleze dans la nourriture des poules en mai est liee a la proportion de femelles avec une nichee en aout suivant. Les poussins consomment d'autant plus d'arthropodes qu'ils sont plus jeunes. Les fruits secs puis les baies constituent le complement de leur regime. La selection des habitats semble prevaloir sur celle de la nourriture. Les analyses biochimiques montrent que le regime hivernal du tetras lyre n'est pas limitant, ni du point de vue nutritif, ni d'un point de vue energetique

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Seytre, Catherine. "In situ monitoring of the fish assemblages in the recent Cap Roux marine protected aera (french Mediterranean) : reserve effect, trophic interactions and fish exportation." Nice, 2009. http://www.theses.fr/2009NICE4068.

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Le cantonnement de pêche du Cap Roux (Saint-Raphaël) est une Aire Marine Protégée (AMP) créée en 2003 à la demande des pêcheurs professionnels de la Prud'homie de pêche de Saint-Raphaël. Cette AMP qui s'étend sur une surface de 450 ha, a été créée dans un but de gestion de la pêche côtière locale. Toutes ces caractéristiques : mise en place récente, habitats disponibles et volonté de gestion des pêches, en font un remarquable site d'étude sur la mise en place de l'effet réserve. Pour cette étude, des méthodes d'observation complémentaires : comptages visuels en plongée sous-marine réalisés sur l'herbier à Posidonia oceanica et avec la méthode FAST ainsi que des pêches expérimentales, ont permis d'échantillonner différentes parties du peuplement de poissons. En parallèle, une étude a été réalisée sur une réserve établie depuis 1975 (Scandola, Corse). Les résultats acquis dans la réserve de Scandola sont : une mise en évidence de l'effet réserve sur une longue période avec une stabilisation du peuplement de poissons dans la zone protégée, une relation positive entre la diversité spécifique et la productivité du peuplement de poissons, et une exportation de juvénile de poissons depuis la zone protégée en suivant les courants marins. Le cantonnement de pêche du Cap Roux a montré une augmentation encore faible de l'abondance et de la taille pour les espèces de poissons ciblées par la pêche mais sans modification des interactions trophiques à l'intérieur de la zone protégée. Après 5 ans de protection la restauration des stocks de poissons a commencé mais ne semble pas encore suffisante pour atteindre les objectifs de gestion de la pêche côtière locale
The Cap Roux MPA (Saint-Raphaël) is a Marine Protected Area (MPA) initiated by the commercial fishermen of the Prud'homie de pêche de Saint-Raphaël and created in 2003. This 450-ha MPA was created as a management tool for local fisheries. This MPA is an outstanding site to study the reserve effect due to the following characteristics: recent implementation, availability of habitats and will for fisheries management. For this study, complementary observation methods: underwater visual censuses on Posidonia oceanica beds or with the new FAST method, and experimental fishing, allowed to sample different parts of the fish assemblage. The study of the Cap Roux MPA was combined with a study of the Scandola Marine Reserve (Corsica), created in 1975. The results obtained for the Scandola MPA were: a long-term reserve effect combined with a stabilisation of the fish assemblage structure within the no-take zone, a positive relationship between the fish assemblage diversity and secondary production, and a juvenile fish exportation from the MPA towards fished areas following the marine currents. In the recent Cap Roux MPA, the increase in abundance and size of target fish was still weak and no modification of the trophic structure inside the protected zone was observed. Five years after the MPA implementation, the restoration of fish stocks began but is not strong enough to fulfil the objectives of local fisheries sustaining

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Vaugoyeau, Marie. "Les effets maternels en tant que médiateurs des changements globaux : mécanismes et conséquences sur les populations d'oiseaux : comparaison de populations à différents niveaux d'urbanisation." Thesis, Paris 6, 2015. http://www.theses.fr/2015PA066172/document.

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Dans le contexte des changements globaux, la transformation du milieu rural ou naturel en milieu urbain est particulièrement bien étudiée. A la fois cause et conséquences des changements, l’urbanisation exerce de fortes pressions de sélection sur les populations et les écosystèmes. En effet, les facteurs tels que la perte d’habitat naturel, la hausse de la température, de la luminosité ou de la perméabilité des sols érodent la biodiversité en ville. Les contraintes environnementales influencent les phénotypes et la survie des organismes. Les parents peuvent moduler l’influence de l’environnement sur le phénotype du jeune et du futur adulte en s’investissant dans la reproduction. L’objectif de cette thèse était de comprendre le rôle des effets maternels sur les phénotypes des oiseaux urbains à travers la description et la mise en relation des variations environnementales, phénologiques et phénotypiques entre et au sein de populations aviaires à différents niveaux d’urbanisation. Pour mener à bien ce projet, deux espèces ont été sélectionnées : les mésanges bleues (Cyanistes caeruleus) et les mésanges charbonnières (Parus major) présentes le long du gradient urbain-rural. Le suivi de trois saisons de reproduction a été réalisé sur sept sites en zone urbanisée (parcs et jardins de Paris), une saison sur trois sites en zone semi-urbanisée et cinq saison sur deux sites en zone rurale (forêt de Fontainebleau et bois privés du CEREEP). La phénologie, le succès de reproduction ainsi que le phénotype (condition corporelle, condition physiologique et signaux colorés) des adultes et des jeunes ont été mesurés. Les résultats montrent que l’urbanisation n’influence pas la phénologie mais le succès de reproduction des deux espèces est plus faible sur Paris par rapport à la zone rurale. De plus, la coloration des adultes et la condition corporelle des jeunes varient avec l’habitat. Afin de mieux comprendre ce qui influence la coloration des mésanges charbonnières, une expérience de supplémentation a été mise en place après la mue des adultes. Enfin pour mieux cibler l’effet de la température sur le succès de reproduction des mésanges charbonnières, une expérience de chauffage des nids a été réalisée. Tous les résultats récoltés montrent que les mésanges bleues et charbonnières ont de grandes capacités d’adaptation aux facteurs environnementaux même si leur succès de reproduction est diminué en zone urbaine ce qui explique en partie la pérennité de leurs présences dans les centres urbains à travers l’Europe
In global changes context, the transformation of rural or natural area into urban area is well studied. At once cause and consequence of global changes, urbanization induces high selections pressures on populations and ecosystems. Factors such as habitat destruction, temperature, luminosity and soil permeability increase diminish biodiversity in town. Environmental characteristics influence phenotypes and survival of organisms. Parents can modulate environmental influence on young or future adult phenotype by investing in reproduction. The aim of this thesis was to understand the role of maternal effects on urban bird phenotypes through description and relation between environmental variation, differences in phenology and in phenotypes within and among populations at different levels of urbanization. For this purpose, two species were selected; the blue tit (Cyanistes caeruleus) and the great tit (Parus major), present along an urbanisation gradient. Monitoring of three reproductive seasons were realised in seven sites in urban area, (parks of Paris), on in three sites in suburban areas and five reproductive seasons in two sites in rural area (Fontainebleau forest and private forest of CEREEP). The phenology, reproductive success and phenotype (coloured signals, body and physiological condition) of adults and nestlings were measured. Thesis results showed that for the two species, phenology did not differ between habitats but reproductive success was lower in Paris than in rural areas. Moreover, great tit coloration and nestling body condition varied with habitat. In order to understand how and which factors influenced great tit colouration, a supplementation experiment was realised after moult. Finally to study temperature influence on great tit reproductive success, a heating nest experiment was realised. Thesis results showed that blue and great tits are highly able to adapt to urban environments even if their reproductive success was decreased in urban area which explained presence in all Europeans cities

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Frodello, Jean-Pierre. "Influence de la pollution par les métaux, en Méditerranée, sur les populations de cétacés et altérations histologiques concomitantes : extension à certains poissons." Corte, 1999. http://www.theses.fr/1999CORT3044.

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Mandon-Dalger, Isabelle. "Sélection de l'habitat et dynamique d'invasion d'un oiseau introduit, le cas du bulbul orphée à la Réunion." Rennes 1, 2002. http://www.theses.fr/2002REN10043.

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Анотація:

Le Bulbul orphée (Pycnonotus jocosus) est un passereau qui a été introduit sur l'île de la Réunion il y a 30 ans et qui pose des problèmes à la production fruitière. La complexité du relief, la différence de pluviosité entre les deux versants, et la mosai͏̈que de paysages sur une faible surface, font de la Réunion un modèle pour l'étude des processus de colonisation. En s'appuyant sur une méthodologie multi-échelle, l'étude de l'invasion du Bulbul orphée permet de révéler l'importance des facteurs abiotiques dans la propagation. L'étude du régime alimentaire montre une forte consommation de pestes végétales qui pourraient favoriser l'installation du bulbul. A l'échelle du paysage, l'étude de la dynamique spatiale et temporelle fournit des arguments en faveur d'une micropropagation, le long d'habitats linéaires de type interface zone refuge / zone d'alimentation. Les paysages les plus fragmentés sont les plus propices à ces oiseaux et semblent limiter les déplacements des oiseaux. Ces résultats permettent de fournir des indicateurs pour l'estimation du coefficient de diffusion dans la modélisation de la propagation et une orientation originale de la gestion des impacts du bulbul.

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Bino, Taulant. "L'avifaune aquatique du système lagunaire méditerranéen de Karavasta (Albanie) et sa conservation." Montpellier 2, 1998. http://www.theses.fr/1998MON20059.

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Анотація:

La structuration et la repartition des communautes d'oiseaux d'eau hivernants et nicheurs ont ete analysees pour l'ensemble des zones humides d'albanie afin de determiner, de facon quantitative, l'importance de ces zones pour ces especes. La faiblesse des effectifs d'oiseaux reproducteurs contraste avec l'abondance des oiseaux hivernants pour lesquels l'albanie presente un interet international. L'impact du derangement, d'origine humaine, est sans doute la cause majeure du peu de reproducteurs observes mais d'autres facteurs, d'ordre regional ou local, doivent egalement etre consideres. Pour certaines especes coloniales, notamment les larides, les sites de nidification sont en cause. Ce probleme est considere dans le cas de la zone humide la plus importante d'albanie, le complexe lagunaire de karavasta, ou la dynamique saisonniere des colonies de larides et leur succes de reproduction ont ete mesures en 1995 et 1996. Deux habitats sont utilises en debut de saison de reproduction : (i) le cordon dunaire separant le complexe lagunaire de la mer et (ii) les ilots de la lagune interieure. Seules les colonies situees sur les ilots se maintiennent et ont un bon succes de reproduction alors que les colonies situees sur les bancs de sables sont generalement abandonnees. Aucun des facteurs consideres, fluctuations des niveaux d'eau ou predation sur les ufs, n'apparait comme la cause de la situation actuelle. L'echec de la nidification hors de la lagune interieure provient d'un changement du statut de conservation de la zone, qui a entraine une forte augmentation du derangement humain. Pour faire face aux problemes rencontres aujourd'hui et afin de sauvegarder l'avifaune aquatique de ce complexe, des mesures de gestions sont proposees et testees.

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Bried, Joël. "Déterminisme de la fidélité au site et au conjoint chez les oiseaux dépendant des ressources marines." Lyon 1, 2000. http://www.theses.fr/2000LYO10182.

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Jeudi, de Grissac Sophie. "Où va la jeunesse ? Mouvements et quête alimentaire des juvéniles de procellariiformes durant leur première année en mer." Thesis, La Rochelle, 2016. http://www.theses.fr/2016LAROS016/document.

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Анотація:

Le stade juvénile chez les animaux demeure souvent une période mystérieuse aux yeux des scientifiques. La survie juvénile est pourtant un facteur déterminant du futur des populations. Les animaux juvéniles sont connus pour leur mortalité importante durant les premiers mois après l’indépendance et leur taux de survie augmente avec l’âge. La théorie suppose d’une part que les juvéniles ont des capacités de survie moindres que celles des adultes. Ils seraient peu efficaces dans leur recherche de nourriture et auraient besoin d’une période d’apprentissage pour être capables de supporter les couts associés à la reproduction. De plus, des facteurs proximaux telles que les fluctuations environnementales et la compétition affectent également la survie des juvéniles. Des études sur les oiseaux terrestres, ont permis d’obtenir de nombreuses informations grâce à la possibilité de faire des observations directes et récemment des études télémétriques. Cependant collecter des données en milieu marin s’avère compliqué, en particulier lorsque l’on s’intéresse aux juvéniles. Les oiseaux marins longévifs ont en commun la longue durée de leur période d’immaturité (jusqu’à plus de 10 ans). Les jeunes, à l’indépendance, se dispersent seuls en mer durant plusieurs années, ne revenant à terre que pour se reproduire une fois adulte. Ainsi, les suivre durant leurs premiers mois afin de comprendre leurs comportements et leur écologie alimentaire constitue un véritable défi. Dans ce contexte, cette thèse a pour objectif d’élucider au moins en partie le mystère de la vie juvénile des oiseaux marins. Grâce à des technologies bio-télémétriques nous avons pu suivre par satellite un large panel de juvéniles de neuf espèces proches d’albatros et pétrels (procellariiformes) se reproduisant dans les Terres Australes et Antarctiques Françaises de l’Océan Austral : les îles Crozet, Kerguelen et Amsterdam. Les trajectoires ont été analysées grâce à différentes méthodes statistiques permettant de décrire les mouvements, le comportement alimentaire et les répartitions spatiales des jeunes après leur envol, le tout en lien avec les conditions environnementales. Les résultats obtenus sont discutés à la lumière de la comparaison avec les adultes des mêmes espèces. Grâce à ce jeu de données j’ai étudié les stratégies de dispersion des jeunes inexpérimentés qui quittent le nid. J’ai montré que ces stratégies ainsi que la proportion d’inné les contrôlant sont très variables selon les espèces et suivent ou non celles des parents selon les espèces. Le taux de variabilité dans les stratégies juvéniles peut refléter leur potentielle plasticité et leur capacité à répondre à des changements de l’environnement et in fine affecter la dynamique des populations. Par ailleurs, l’analyse de trajectoires de juvéniles de grand albatros a révélé qu’en plus de leurs capacités innées ils apprennent très rapidement les compétences de base requises pour survivre en mer puis optimiser leur recherche alimentaire. Cependant des différences perdurent par rapport aux adultes, suggérant que d’autres comportements non-observables (via nos données) nécessitent une période d’apprentissage plus longue. Enfin, quelle que soit la stratégie adoptée, elle semble en partie contrainte par la compétition intraspécifique avec les individus plus âgés puisque les juvéniles limitent celle-ci via une ségrégation spatiale. Ce dernier point souligne le besoin de prendre en compte la répartition spatio-temporelle âge-dépendante des espèces lorsque l’on veut mettre en œuvre des mesures de protection pour ces espèces. Ces travaux apportent de nouvelles connaissances sur plusieurs des aspects majeurs de l’écologie en mer d’individus inexpérimentés cherchant leur nourriture seuls dans un environnement hautement imprévisible. Nous apprenons ici comment de l’instinct et de l’expérience découlent des stratégies de vie juvéniles qui permettent aux oiseaux de survivre dans un environnement inconnu
The juvenile stage of animals is often much of a mystery to scientists. Moreover, juvenile survival is known to be a strong determinant for the future of a population. Indeed, juvenile animals are known to face high mortality during the first months after independence, with survival rates improving with age. One ultimate hypothesis implies that juveniles have a lower survival rate than adults because of their lack of experience. Thus they are initially poor foragers and require a learning period (immaturity) to improve their efficiency before being able to bear breeding and its associated energetic costs. Proximal factors also influence juvenile survival, such as environmental fluctuations and competition. Studies on terrestrial animals have provided useful information thanks to the possibility of direct observation and, recently, bio-logging technologies. However, collecting data in the marine environment is more difficult, particularly when juveniles are concerned. Long-lived marine species such as seabirds have an extensive immature period extending from a few years up to more than ten years. The offspring of these species will usually leave their natal site and disperse at sea for several years before returning to breed on land, most of the time at their place of birth. This makes it difficult to obtain direct observations, and so documenting their first journey at sea to learn more about their behavioural and foraging ecology is a challenge. In this context, this PhD aims to unravel at least part of the mystery of juvenile seabirds’ early life by investigating the first months at sea of newly fledged individuals from several long-lived species of procellariiformes. Using state of the art advancements in biotelemetry, I was able to follow, at sea, by satellite a large set of juveniles from nine closely related species of albatross and petrel breeding in the French Southern Territories of the Southern Ocean : Crozet, Kerguelen and Amsterdam Islands. Some of these species had never been tracked before. Trajectories were analysed using various new statistical methods that allowed movement strategies, alongside foraging behaviour and spatial distributions, to be described, all in tight link with environmental conditions. The findings were discussed in the light of a comparison with adults of the same species. Using this huge dataset I first examined the dispersal strategies of young birds that had left their nest and were totally independent from their parents. I showed that the strategies, as well as the amount of innate information controlling them are highly variable depending on species. Their movements take them in various habitats following or not the parental strategies. The amount of variability in juvenile strategies is linked to potential plasticity when facing environmental changes. These parameters are related to the history life trait of species, and might affect demography and population dynamics. In addition, by analysing juvenile wandering albatross tracks I showed that although they quickly learn the basics of flight and foraging optimization required to survive at sea, behavioural differences with adults persist in time, suggesting that non-observable behaviours need a longer period of learning and memorisation. Finally, whatever the strategy adopted, it seems to be driven in part by intraspecific competition since juveniles mitigate competition with older birds by segregating spatially. This last point highlights the crucial need of acknowledging age-related distribution when making management decisions to protect seabird populations. This work provides new insights about several major aspects of the at-sea ecology of naïve individuals foraging alone in a highly unpredictable environment. We learn here how instinct followed by experience shape specific early life strategies that allow young birds to deal with environmental conditions and interspecific competition so as to be able to survive

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Caudron, Arnaud. "Etude pluridisciplinaire des populations de truite commune (Salmo trutta L. ) des torrents haut-savoyards soumises à repeuplement : diversité intra-spécifique, évaluation de pratiques de gestion et ingénierie de la conservation de populations natives." Chambéry, 2008. http://www.theses.fr/2008CHAMS056.

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Le premier volet du présent travail décrit (microsatellites de l' ADN) la diversité génétique des populations de truite (Salmo trutta) sur l'ensemble du réseau hydrographique de la Haute-Savoie et des principaux stocks de pisciculture utilisés pour le repeuplement. L'analyse de 163 secteurs a permis de localiser onze zones abritant encore des populations natives d'origine méditerranéenne. L'étude de la structuration génétique de ces populations natives a conduit à déterminer six unités de gestion génétiquement différenciées devant être gérées comme des entités indépendantes. Le deuxième volet s'attache à décrire les pratiques de repeuplement et à évaluer en vraie grandeur et à large échelle spatiale la contribution du repeuplement et du recrutement naturel. Pour ce faire, le fluoromarquage des otolithes à l'alizarine redS a été développé pour marquer près de 3 millions d'alevins par an pendant trois ans. L'étude met en évidence une contribution dominante du recrutement naturel dans les populations en place comme dans les captures par pêche à la ligne. Les résultats montrent, sans pouvoir identifier les causes, une forte variation spatiale et temporelle de la contribution des repeuplements et ce y compris lorsque les pratiques ne changent pas. La troisième partie présente des suivis temporels visant à évaluer les effets génétiques de différentes stratégies de conservation et de réhabilitation de populations natives. Les résultats de ces suivis permettent d'apporter des éléments d'aides à la décision aux gestionnaires des populations confrontés à diverses situations
In the first part, the genetic diversity of wild brown trout (Salmo trutta) populations is described (by analysis of microsatelittes of the ADN) on the whole hydrographic network of the Haute-Savoie. The main hatchery strains used to stock the rivers were studied too. The analysis of 163 river sectors allowed the location of eleven zones still harbouring native populations of the mediterranean lineage. The genetic structuration of these native populations allowed to determine six different management units. The second part presents a description of the stocking practices and an assesment, at large scale, of the respective contribution of stocking and natural recruitment. For that, the otolith fluoromarking method with Alizarin RedS was used to mark about 3 millions of fry by year during three years. The study has shown a higher contribution of the natural recruitment than stocking in standing population and in catches by anglers. The result showed, without knowing the reasons, high spatial and temporal variabilities of stocking contribution and that despite using the same restocking procedures. To finish, temporal studies were developped to evaluate the genetic effects of several strategies aimed to conserve and/or to rehabilite native populations. The results allow to help fishery managers to better conserve and restore native populations of brown trout

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Desmarchelier, Manuela. "Contribution à l'étude de la biologie des populations de Tacauds Trisopterus luscus (L. 1758) en Manche orientale et dans le sud de la Mer du Nord." Lille 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LIL10125.

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Actuellement débarqué en prise accessoire et de plus en plus valorisé sous forme de filets frais ou de succédané de mollusques ou de crustacés, l'intérêt économique du tacaud nécessite une meilleure connaissance de la population. Des données sont présentées sur l'habitat, la répartition géographique et par âge, la reproduction, la croissance, la dynamique de la population, la pêche et le circuit commercial du tacaud débarqué à Boulogne

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Pichegru, Lorien. "Stratégies de recherche alimentaire d’oiseaux marins vulnérables dans le Benguela." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2008. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2008/PICHEGRU_Lorien_2008.pdf.

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Dans un contexte de changements globaux rapides, il est crucial de comprendre les mécanismes de recherche alimentaire des prédateurs marins supérieurs afin de déterminer leur capacité d’adaptation face à la variabilité environnementale, dans le but de prédire les conséquences de ces changements sur la dynamique de leurs populations et de définir des mesures de conservation appropriées pour ces espèces menacées et les réseaux trophiques auxquels elles participent. Dans l’upwelling du Benguela, en Afrique du Sud, les fous du Cap (Morus capensis) et les manchots du Cap (Spheniscus demersus) sont vulnérables d’extinction et font face depuis une dizaine d’années au déplacement vers le sud-est de leurs proies principales, les sardines (Sardinops Sagax) et les anchois (Engraulis encrasicolus), sous l’influence probable des changements climatiques. Nous avons effectué une étude détaillée des stratégies de recherche alimentaire des fous du Cap au moyen d’enregistreurs électroniques miniaturisés portés par ces oiseaux tout au long de leurs voyages en mer, ainsi que des suivis de leur régime alimentaire et de l’abondance et de la distribution de leurs proies dans le Benguela. Nous avons montré que les fous du Cap sont capables d’augmenter substantiellement leur effort de prospection alimentaire face à une faible disponibilité des proies naturelles sur la côte ouest de l’Afrique du Sud. Ils restent pourtant limités dans l’étendue de leur aire de recherche alimentaire par la nécessité de retourner régulièrement à la colonie pour nourrir leur progéniture. Ils se tournent alors vers des proies de substitution, des déchets de pêche au merlu (Merluccius spp. ) de faible valeur nutritive. Ces proies représentent de la « Junk-food » pour les poussins de fous et ont un impact négatif sur leur survie. Même s’ils permettent aux adultes de réduire significativement leur effort de prospection en hiver, les déchets de pêche ne compensent donc pas la faible disponibilité des sardines et des anchois au cours de la saison de reproduction. Nous avons déterminé que pour une densité des proies naturelles inférieure à 25 g m-2 dans l’aire de nourrissage des fous du Cap, les adultes reproducteurs ne parviennent plus à équilibrer leur balance énergétique et échouent massivement au cours de la reproduction. Poussés par la fidélité à leur site de reproduction, les fous du Cap étudiés reviennent cependant tenter de se reproduire dans des conditions environnementales sub-optimales et se retrouvent victimes d’un piège écologique. La structure sociale d’une espèce peut donc ralentir son adaptation aux changements environnementaux. Les petits poissons pélagiques, sardines et anchois, sont désormais rares au large de la côte ouest de l’Afrique du Sud et la compétition des oiseaux marins du Benguela avec les pêcheries industrielles à la senne atteint son paroxysme. La biotélémétrie, particulièrement le suivi GPS des fous et des manchots du Cap en mer, nous a permis de définir leurs zones d’alimentation de manière très précise. En nous basant sur ces données et sur des suivis des activités de pêche à la senne, nous proposons des mesures de conservation qui prennent en compte les zones d’alimentation des prédateurs supérieurs concernés tout en considérant les besoins économiques locaux. Ces zones permettront le maintien des populations d’oiseaux marins menacées et nos données alimenteront également les plans de gestion écosystémique des pêcheries dans le but d’une exploitation durable des ressources naturelles
In the context of rapid global changes, understanding the foraging mechanisms of marine top predators is crucial to determine their ability to adapt to environmental variability, in order to predict the consequences of changes on population dynamics and to define appropriate conservation measures for threatened species and the trophic webs to which they belong. In the Benguela upwelling system, in South Africa, Cape gannets (Morus capensis) and African penguins (Spheniscus demersus) are vulnerable to extinction and are facing for 10 years onward a progressive south-eastward shift of their main prey, sardines (Sardinops Sagax) and anchovies (Engraulis encrasicolus), probably due to climate change. We performed a detailed study on Cape gannet foraging strategies, using birdborne recorders, and analysing their diet and the distribution and abundance of their prey in the Benguela. We showed that Cape gannets are able to increase substantially their foraging effort facing poor natural prey availability on the west coast of South Africa. However they are limited in the extent of their foraging area by the need to regularly come back to the colony to feed their young. Thus they turn to feeding behind trawlers on hake fishery discards (Merluccius spp. ) of poor nutritional content. These prey represent « Junk-food » for the gannet chicks and have a negative impact on their survival. Even if they allow adults to significantly decrease their foraging effort during winter, fishery discards can not compensate for a poor availability in sardines and anchovies during the breeding season. We have determined that below a density of 25 g m-2 of natural prey in their foraging area, breeding Cape gannets can not equilibrate their energy balance and fail massively in their breeding attempt. Faithful to their breeding site, Cape gannets come back to attempt breeding under sub-optimal conditions, and so are lead to an ecological trap, instead of emigrating. The social structure of a species can therefore lag its adaptation to environmental changes. Small pelagic fish, sardines and anchovies, are currently scarce off the west coast of South Africa, enhancing the competition between seabirds and purse-seine fisheries. Biotelemetry, and particularly GPS tracking on Cape gannets and African penguins at sea, allowed us to precisely define theses birds’ foraging zones. Basing our decision on these data and on purse-seine fisheries activities, we suggest conservation measures that take into account foraging areas of these top predators, while considering local economic needs. These zones are crucial for the maintenance of threatened endemic populations and our data would help in an ecosystemic approach to fisheries management, for a sustainable exploitation of the environment

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Albert, Céline. "Exposure of Arctic seabirds to pollutants and the role played by individual migratory movements and non-breeding distribution." Thesis, La Rochelle, 2020. http://www.theses.fr/2020LAROS020.

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L’Arctique, bien que région éloignée de toutes activités anthropiques intensives, est contaminé par les polluants émis à de plus basses latitudes. En effet, les caractéristiques physico-chimiques de certains polluants leur permettent d’être transportés sur de longues distances, via les courants atmosphériques ou océaniques. Parmi eux se trouve notamment le mercure (Hg), élément trace non-essentiel naturellement émis dans l’environnement mais dont les émissions d’origine anthropiques ont fortement augmenté depuis le 19ème siècle. Ce neurotoxique engendre chez les espèces animales des troubles comportementaux, mais aussi des problèmes de reproduction et dans les cas extrêmes, la mort. Le milieu marin est particulièrement sensible à la contamination au Hg. En effet, une fois dans l’environnement marin, le Hg intègre la chaine alimentaire (sous sa forme toxique méthylée - MeHg), dans laquelle sa concentration augmente d’un niveau trophique à l’autre (processus de bioamplification) et/ou accumule au sein des organismes (processus de bioaccumulation). Ainsi, les prédateurs supérieurs longévifs tels que les oiseaux marins, en fin de chaine alimentaire, présentent les concentrations de Hg parmi les plus élevées. Ils sont largement et efficacement utilisés comme bio-indicateurs de la contamination au Hg de leur environnement. La majeure partie des connaissances actuelle sur la contamination au Hg des oiseaux marins Arctique concerne la saison de reproduction, durant laquelle les concentrations varient spatialement, avec notamment les concentrations les plus élevées trouvées en Arctique Canadien. Durant cette période, qui ne représente qu’une partie de l’année, les oiseaux se reproduisent à terre et sont donc plus facilement accessibles. Mais une fois la saison de reproduction terminée, la majorité des oiseaux marins migrent en haute mer, en dehors de l’Arctique. Une étude précédente a montré qu’une population de mergules nains (Alle alle) se reproduisant à l’Est du Groenland a des concentrations de Hg plus élevées en période de non-reproduction qu’en période de reproduction, avec des effets délétères sur la reproduction suivante. Au cours de ce travail de thèse, et grâce à une approche multi espèces et multi colonies, nous nous sommes intéressés au rôle de la migration des oiseaux marins sur leur contamination au Hg et ce à l’échelle de l’Arctique. Nos résultats montrent une saisonnalité dans la contamination au Hg, nous permettant d’étendre les résultats mis en avant pour les mergules nains à de nombreuses autres espèces d’oiseaux marins. Nous avons également trouvé que cette saisonnalité varie spatialement avec des variations saisonnières plus importantes pour les populations se reproduisant en Atlantique Ouest (Ouest du Groenland et Est du Canada). Ces résultats nous ont amenés à faire l’hypothèse que cette variation était une conséquence de la migration des oiseaux marins et de la distribution de leur zone d’hivernage. Pour tester cette hypothèse, nous avons utilisé les oiseaux comme bio-indicateurs de leur environnement. Pour cela, nous avons combiné des analyses de Hg avec du biologging afin de retracer l’origine spatiale de la contamination hivernale au Hg. Nos résultats montrent une augmentation des concentrations de Hg suivant un gradient est-ouest nous permettant ainsi d’étendre les résultats des précédentes études concernant la période de reproduction à l’hiver et à l’ensemble des régions marines à l’échelle de l’Atlantique Nord - Arctique. Ainsi, les résultats du présent travail de thèse nous permettent de conclure qu’au-delà de leur migration, ce sont les zones de reproduction et d’hivernages des oiseaux marins arctiques qui conditionnent leur contamination au Hg
The Arctic, even far from intensive human activities, is contaminated by pollutants emitted at Northern mid-latitudes. Because of their physico-chemical characteristics, pollutants are transported over large distances through atmospheric or oceanic currents. Among them is mercury (Hg), a naturally occurring and non-essential trace element whose emissions increased since the 19th century because of human activities. This neurotoxic negatively impacts animals’ health and induces behavioral changes, reproduction issues and in the most extreme case, death. The marine environment is particularly sensitive to Hg, which incorporates the food chain (under is toxic and methylated form – MeHg) in which its concentration increases from one trophic level to the other (e.g. biomagnification process) and accumulates within organisms (e.g. bioaccumulation process). Hence, long-lived top predators like seabirds, found at the end of the food chain usually show some of the highest contamination to Hg. They are commonly and efficiently used as bio-indicators of the health of their environment. Most of the current knowledge about Hg contamination in Arctic seabirds focused on the breeding period during which Hg was found to spatially vary, with usually higher Hg concentrations in the Canadian Arctic. During this period, which represents a part of the year only, seabirds aggregate in colonies for reproduction where they are more easily accessible. However, at the end of this period, seabirds migrate to overwinter mostly in open seas, outside of the Arctic. A previous study on a little auk (Alle alle) population breeding in East Greenland found that Hg concentrations were higher during the non-breeding period than during the breeding period, with carryover effects on the following reproduction. In the present doctoral work, based on a multi-species and multi-colony approach, we studied winter Hg exposure and the role of seabird migration in their contamination to Hg at large spatial scale. We found a seasonality in Hg concentrations allowing us to extend the results found in little auks to several species and at a larger spatial scale. We also found that this seasonality was spatially different with some of the highest variations for seabirds breeding in the West Atlantic (West Greenland and Canadian Arctic). We therefore proposed that such variations were due to seabird’s migration and the areas they overwintered at. To test such hypotheses, we used seabirds as bio-indicators of winter Hg contamination through the North-Atlantic Arctic. More specifically, we combined Hg measurements with geolocators devices to track the spatial origin of winter Hg contamination. We found an east-west increase in Hg concentrations allowing us to extend the results found during the breeding period to the winter period, through the entire North-Atlantic Arctic marine region. Results of the present doctoral work allow us to conclude that beyond migration, seabird distribution during the breeding and non-breeding periods drive their contamination to Hg

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Riffaut, Léa. "Impact des pollutions pétrolières sur les oiseaux marins : origine géographique des individus victimes et conséquences démographiques sur les populations." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066079.

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Corbeau, Alexandre. "Relations entre oiseaux marins et pêcheries : Albatros sentinelles de l’océan Austral." Thesis, La Rochelle, 2020. http://www.theses.fr/2020LAROS021.

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La 6ème crise majeure d’extinction des espèces qui sévit actuellement n’épargne pas les oiseaux marins, notamment les albatros. Leurs populations ont chuté de 70% au cours des 60 dernières années essentiellement par mortalité dans les palangriers. Les grands albatros couvrent d’énormes distances pendant leurs trajets de recherche alimentaire et leur curiosité et leur opportunisme favorisent les rencontres régulières avec des bateaux. Ils constituent ainsi des modèles privilégiés pour étudier les relations entre les oiseaux marins et les pêcheries. Au cours de cette thèse, grâce au développement de nouveaux prototypes de balises déployés sur les albatros hurleurs et d’Amsterdam de l’océan Indien et à de nouvelles méthodes d’estimation du risque de captures accidentelles, nous avons pu démontrer que les comportements de recherche alimentaire naturels diffèrent de ceux associés à un bateau. De même, les caractéristiques intrinsèques des oiseaux (espèce, population, sexe, âge et personnalité) entrainent des différences d’exposition au risque de captures accidentelles notamment par l’utilisation d’habitats différents. Enfin nous avons mis en évidence que les caractéristiques des bateaux avaient également une forte influence sur ce risque de captures accidentelles, notamment par le type de bateaux rencontrés, leur légalité, les pratiques utilisées et la présence de rejets de pêche. Nous concluons par la présentation de nouvelles méthodes pour mieux estimer le risque de captures accidentelles et la nécessité de connaissances fondamentales des espèces et populations pour mieux protéger les milieux marins toujours plus en danger
The current 6th major species extinction crisis is also affecting seabirds, especially albatrosses. Their populations have decreased by 70% over the last 60 years, mainly due to mortality in longline fisheries. Large albatrosses cover enormous distances during their foraging trips and their curiosity and opportunism favour regular encounters with boats. Thus, they constitute privileged models for studying the relationships between seabirds and fisheries. During the course of this thesis, thanks to the development of new prototype loggers deployed on Wandering and Amsterdam albatrosses in the Indian Ocean and new methods for estimating by-catch risks, we were able to observe that natural foraging behaviours differ from those associated with a boat. Similarly, the intrinsic characteristics of birds (species, population, sex, age and personality) lead to differences in exposure to by-catch risk, particularly through the use of different habitats. Finally, we have shown that the characteristics of boats also have a strong influence on the risk of by-catch, in particular through the type of boats encountered, their legality, the fishing practices used and the presence of discards. We conclude by presenting new methods to better estimate the risks of by-catch and the need for fundamental knowledge of species and populations in order to better protect marine environments that are increasingly endangered

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Moulins, Aurélie. "To the integrated approach and to the management of pelagic biodiversity inside a marine protected area : case of the cetacean populations in the Pelagos sanctuary (north-western Mediterranean sea)." Lyon 1, 2008. http://www.theses.fr/2008LYO10027.

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Péron, Clara. "IMPACT DES CHANGEMENTS CLIMATIQUES ET DISTRIBUTION SPATIALE DES OISEAUX MARINS DE L'OCÉAN AUSTRAL." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00660322.

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D'après le dernier rapport du Groupe Intergouvernemental d'Experts sur l'Evolution du Climat (GIEC), la réalité d'un réchauffement majeur du climat est sans équivoque. Ce travail de thèse a consisté à dresser un bilan des changements climatiques passés et récents dans l'océan Austral et à évaluer si l'impact de ces changements sur la distribution spatiale des oiseaux marins était déjà détectable et/ou prévisible. Grâce aux données historiques d'observation en mer par bateau sur 12 espèces d'oiseaux marins, nous avons mis en évidence une diminution d'abondance chez trois espèces et des changements de distribution contrastés entre les années 1980 et 2000. Ces espèces ont la particularité d'exploiter les eaux subtropicales où le réchauffement a été plus intense pendant cette période. Les suivis télémétriques apportent des informations précieuses sur la variabilité spatio-temporelle de la distribution des zones d'alimentation. Les modèles d'habitat nous ont permis de (1) caractériser les habitats exploités d'un point de vue océanographique, (2) comprendre la réponse des oiseaux aux variations saisonnières et interannuelles du climat, et enfin (3) prédire la distribution future des habitats favorables en utilisant les projections climatiques du GIEC. Les deux espèces étudiées ciblent des zones productives où les ressources sont prédictibles dans le temps et l'espace. Les variations saisonnières de la distribution du pétrel à menton blanc (Procellaria aequinoctialis) de Kerguelen sont principalement gouvernées par la dynamique de la glace de mer alors que les manchots royaux (Aptenodytes Patagonicus) de Crozet sont étroitement liés au front polaire. Ces structures océanographiques, forcées par la température, gouvernent la distribution et l'abondance des ressources disponibles pour les prédateurs. Le réchauffement de 1 à 3°C prédit par les modèles climatiques pourrait donc avoir des conséquences importantes sur la disponibilité des proies. Ainsi, nos modèles d'habitat prédictifs ont révélé un déplacement de 300 km vers le sud des zones d'alimentation du manchot royal d'ici la fin du 21ème siècle. Un tel changement serait bien au-delà des capacités de recherche alimentaire actuelles des manchots. Malgré les incertitudes liées aux modèles et aux réponses des niveaux trophiques inférieurs, nos résultats suggèrent une forte pression de sélection sur les stratégies d'approvisionnement des oiseaux marins dans les années à venir.

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Sirami, Clélia. "Abandon des terres et avifaune : dynamiques spatiales et temporelles d’un paysage méditerranéen." Montpellier, ENSA, 2006. http://www.theses.fr/2006ENSA0018.

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Анотація:

L’abandon des terres, moins étudié que l’intensification agricole, affecte de nombreuses régions. Les dynamiques végétales qui en résultent sont progressives ce qui en rend la perception plus diffuse et le diagnostic des effets sur la flore et la faune plus délicat. C'est aussi une expérience grandeur nature pour étudier la capacité des espèces animales à répondre aux changements. Cette thèse étudie les conséquences de l’abandon des terres sur la dynamique temporelle et spatiale des oiseaux dans un paysage méditerranéen et en explore les mécanismes. Nous avons utilisé des données d'avifaune recueillies entre 1978 et 2003 sur une zone d’étude au nord de Montpellier. Nous les avons croisées avec une analyse fine, par photographies aériennes, des changements paysagers après abandon des pratiques agricoles en place au début du XXe siècle. Nos résultats confirment une augmentation de l'occurrence des espèces d'oiseaux forestiers, une diminution de celle des espèces de milieux ouverts et une fermeture progressive des milieux par colonisation des ligneux. Chez les espèces numériquement stables on observe des modifications de la distribution spatiale cohérentes avec la réorganisation du paysage végétal. Elles suggèrent de futures régressions d’effectifs. Pour les espèces de milieux ouverts les processus d'extinction et de colonisation locale opèrent à des échelles spatiales différentes: la station pour l'extinction, le paysage pour la colonisation. Les réponses des espèces aux modifications de la végétation sont déterminées par l'effet cumulé d'un petit nombre de caractéristiques biologiques: l'habitat sélectionné (type et structure), l'amplitude d'habitat, le comportement migratoire, et la répartition biogéographique. Une espèce de milieu ouvert, à faible amplitude d’habitat, migratrice et à répartition méridionale sera plus exposée à un effet négatif de l'abandon. Une espèce forestière, à large amplitude d'habitat, sédentaire et à répartition géographique septentrionale bénéficiera probablement des changements en cours. Ces résultats permettent une meilleure prédiction de la sensibilité des espèces à l'abandon des terres et suggèrent des échelles pertinentes en vue de mesures compensatoires
Land abandonment, less studied than agricultural intensification, affects an increasing number of regions. The slow rate of the vegetation dynamics it triggers makes its perception diffuseand the diagnosis of its effects on plants and animal communities uneasy. It is also a natural experiment for studying the ability of animals to respond to change. We analysed the consequences of land abandonment on the temporal and spatial dynamics of bird species in a Mediterranean landscape and the mechanisms involved. We used data on the avifauna collected between 1978 and 2003 in an area north of Montpellier (France). We confronted it with a detailed study of aerial photographs assessing temporal vegetation changes after cessation of the land use practices in place in the early XXth century. We confirmed an increase in occurrence of forest species, a decline in open habitat species and a progressive habitat closure through colonisation by ligneous plants. Some numerically stable species showed distribution shifts over time consistent with shifts in vegetation distribution and a potential for future population decline. For open habitat species, local extinction or colonisation depended on different spatial scales: plot scale for extinction and landscape scale for colonisation. Species responses to vegetation changes were linked to cumulative effects of a small number of biological characteristics: habitat selected (type and structure), habitat breadth, migratory behaviour, and type of geographical distribution. An open habitat species, with a narrow habitat breadth, migratory, and with a southern distribution range was more likely to be negatively affected by abandonment. A forest species with a broad habitat breadth, sedentary, and with a more northerly range was likely to benefit from it. Our results allow a better prediction of species sensitivity to land use changes and suggest appropriate scales for mitigation measures

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