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Dissertations / Theses on the topic '16S rDNA'

Author: Grafiati

Published: 4 June 2021

Last updated: 25 July 2025

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1

Adams, John D. W. "PCR amplification of Azospirillum 16S rDNA from natural environments." Thesis, University of Newcastle Upon Tyne, 1998. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.297528.

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2

Cheon, Ji Hoon. "Characterization and monitoring of microbial diversity in anaerobic bioreactor based on 16S rDNA." 京都大学 (Kyoto University), 2006. http://hdl.handle.net/2433/143997.

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Abstract:

Kyoto University (京都大学)<br>0048<br>新制・課程博士<br>博士(工学)<br>甲第12307号<br>工博第2636号<br>新制||工||1372(附属図書館)<br>24143<br>UT51-2006-J299<br>京都大学大学院工学研究科都市環境工学専攻<br>(主査)教授津野洋, 教授武田信生, 教授田中宏明<br>学位規則第4条第1項該当

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3

Toledo, Bethânia Figueiredo Barbosa de [UNESP]. "Identificação de estirpes de rizóbios por seqüenciamento parcial dos genes 16S rDNA e nifH." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2008. http://hdl.handle.net/11449/92670.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-10-29Bitstream added on 2014-06-13T18:54:07Z : No. of bitstreams: 1 toledo_bfb_me_jabo.pdf: 494396 bytes, checksum: 73007bbe5afed3d92412924b6ebe8b81 (MD5)<br>Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)<br>A crescente demanda de alimentos causada pelo aumento populacional, aliado a alto custo de fertilizantes industrializados e impacto ambiental causado por eles leva, mundialmente, à utilização em grande escala de inoculantes de bactérias fixadoras de nitrogênio. Os i

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4

Netto, Osmar Vaz de Carvalho. "Identificação de bactérias contaminantes de fermento de cachaça por seqüenciamento do gene 16S rDNA." Universidade de São Paulo, 2007. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-08082007-164157/.

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Abstract:

A cachaça é uma bebida típica brasileira produzida a partir da destilação do caldo de canade- açúcar fermentado principalmente por Saccharomyces cerevisiae. Grande parte da produção nacional é artesanal, e não há uma preocupação por parte dos produtores quanto ao controle microbiológico da fermentação. Este trabalho objetivou caracterizar a comunidade bacteriana contaminante do fermento utilizado na produção de cachaça. Foram coletadas quatro amostras em um alambique artesanal. A primeira (NA) foi coletada um ano anterior às outras três e utilizada como controle. As restantes foram coletadas a

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5

Toledo, Bethânia Figueiredo Barbosa de. "Identificação de estirpes de rizóbios por seqüenciamento parcial dos genes 16S rDNA e nifH /." Jaboticabal : [s.n.], 2008. http://hdl.handle.net/11449/92670.

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Abstract:

Orientadora: Eliana Gertrudes de Macedo Lemos<br>Banca: Maria José Valarini<br>Banca: Jaime Maia dos Santos<br>Resumo: A crescente demanda de alimentos causada pelo aumento populacional, aliado a alto custo de fertilizantes industrializados e impacto ambiental causado por eles leva, mundialmente, à utilização em grande escala de inoculantes de bactérias fixadoras de nitrogênio. Os inoculantes utilizados no Brasil (coleção SEMIA- IPAGRO) ainda não estão suficientemente caracterizados geneticamente. O objetivo deste trabalho foi avaliar e confrontar as seqüências parciais dos genes 16S rDNA e ni

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6

Ziegler, Katie. "Phylogenetic Analysis of a Group of Enteric Bacteria Based on 16S rDNA Gene Sequencing." Miami University Honors Theses / OhioLINK, 2004. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=muhonors1111684418.

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7

Wood, Jacqueline. "Analysis of bacterial populations from the rumen by means of 16S rDNA directed oligonucleotides." Thesis, University of Aberdeen, 1997. http://digitool.abdn.ac.uk/R?func=search-advanced-go&find_code1=WSN&request1=AAIU100186.

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Abstract:

The overall aim of this work was to develop molecular based techniques that would allow the identification and quantification of Prevotella spp. in samples of rumen fluid. This was achieved by developing two methods, both based on PCR amplification of 16S rDNA extracted from rumen and faecal samples. The first method involved the amplification of microbial DNA with universal primers, followed by probing with either a Bacteroides Prevotella specific oligonucleotide (Bac/Pre) or a universal oligonucleotide. Comparison with control DNA extracted from pure cultures allowed the relative abundances

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8

ARAÚJO, Livia Caroline Alexandre de. "Caracterização molecular das linhagens de Zymomonas mobilis da coleção de micro-organismos UFPEDA." Universidade Federal de Pernambuco, 2014. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/17179.

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Abstract:

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-06-29T12:07:11Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação Livia Araujo.pdf: 1983609 bytes, checksum: cbba526737c10f6743b3fd015372721a (MD5)<br>Made available in DSpace on 2016-06-29T12:07:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação Livia Araujo.pdf: 1983609 bytes, checksum: cbba526737c10f6743b3fd015372721a (MD5) Previous issue date: 2014-02-20<br>CAPEs<br>Zymomonas mobilis vem de

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9

Naamala, J., SK Jaiswal, and FD Dakora. "Microsymbiont diversity and phylogeny of native bradyrhizobia associated with soybean (Glycine max L. Merr.) nodulation in South African soils." Systematic and Applied Microbiology, 2016. http://encore.tut.ac.za/iii/cpro/DigitalItemViewPage.external?sp=1001977.

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Abstract:

Abstract The genetic diversity and identification of slow- and fast- growing soybean root nodule bacterial isolates from different agro-climatic regions in Mpumalanga, Limpopo and Gauteng Provinces of South Africa were evaluated. The 16S-rDNA-RFLP analysis of 100 rhizobial isolates and eight reference type strains placed the isolates into six major clusters, and revealed their site-dependent genomic diversity. Sequence analysis of single and concatenated housekeeping genes (atpD, glnII and gyrB), as well as the symbiotic gene nifH captured a considerably higher level of genetic diversity and i

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10

Saraiva, Pedro Miguel Pinheiro. "Bacterial diversity in groundwater samples from Estremenho Karst Massif (Portugal) revealed by 16S rDNA pyrosequency." Master's thesis, Universidade de Aveiro, 2016. http://hdl.handle.net/10773/18544.

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Abstract:

Mestrado em Biologia Molecular e Celular<br>Groundwater provides an important freshwater source, that is many times overexploited and suffer pressures from superficial pollution. Therefore, it is of major interest to go further in the understanding of these environments. The present study examined, for the first time, the composition and diversity of bacterial communities present in groundwater from the Estremenho kart massif (Central-Western Portugal), through culture-independent molecular approaches, DGGE and pyrosequencing based on 16 rDNA sequences). Results showed that this particular en

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11

LIMA, Juliana Falcão de Araújo. "Identificação de cepas de Mycobacterium spp. utilizando abordagem molecular baseada em PCR para alvo 16S-23S do rDNA." Universidade Federal de Pernambuco, 2010. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/1338.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:49:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo122_1.pdf: 1261966 bytes, checksum: a8db3a9221d5dc1a777acd2023ffa373 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010<br>Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior<br>A tuberculose (TB) continua a ser um grave problema de saúde pública. O Brasil, segundo a Organização Mundial da Saúde, ocupa o 18º lugar entre os 22 países responsáveis por 80% do total de casos de tuberculose no mundo. O diagnóstico definitivo da tuberculose é dado

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Lostak, Tracy Karon. "Genetic variation in the 16s mitochondrial rDNA gene from Texas and Oklahoma populations of Amblyomma maculatum." [College Station, Tex. : Texas A&M University, 2008. http://hdl.handle.net/1969.1/ETD-TAMU-2957.

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Täte, Mareike [Verfasser]. "Kulturelle sowie 16S rDNA basierte Untersuchungen der aeroben und anaeroben Keimflora des equinen Uterus / Mareike Täte." Hannover : Bibliothek der Tierärztlichen Hochschule Hannover, 2011. http://d-nb.info/1019427396/34.

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14

Lesack, Kyle. "Nomenclature errors in public 16s rDNA gene databases : strategies to improve the accuracy of sequence annotations." Thesis, University of British Columbia, 2017. http://hdl.handle.net/2429/62456.

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Abstract:

Obtaining an accurate representation of the microorganisms present in microbial ecosystems presents a considerable challenge. Microbial communities are typically highly complex, and may consist of a variety of differentially abundant bacteria, archaea, and microbial eukaryotes. The targeted sequencing of the 16S rDNA gene has become a standard method for profiling membership and biodiversity of microbial communities, as the bacterial and archaeal community members may be profiled directly, without any intermediate culturing steps. These studies rely upon specialized 16S rDNA gene reference dat

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15

Mires, López Roxana Eva. "Identificación de la microflora bacteriana cecal del cuy (Cavia porcellus) mediante análisis del gen 16S rDNA." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2012. https://hdl.handle.net/20.500.12672/15627.

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Abstract:

Publicación a texto completo no autorizada por el autor<br>El documento digital no refiere asesor<br>Realiza la identificación molecular de bacterias presentes en el ciego del cuy mediante técnicas moleculares. ADN genómico bacteriano fue obtenido a partir de200 uL de contenido cecal de cuy. Fragmentos de 728 pares de bases del gen 16S rDNA fueron amplificados a partir de un pool de ADN genómico bacteriano mediante PCR. Los productos de PCR fueron clonados al azar en PGEM–T vector plasmid (Promega), transformados en Escherichia coli JM109 y 50 colonias fueron seleccionadas al azar y secue

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16

Koller, Francisco Fernando de Castilho. "Discriminação de ambientes aquáticos poluídos e não poluídos através da amplificação e clivagem do rDNA 16S." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 2002. http://hdl.handle.net/10183/3472.

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Abstract:

O crescimento desordenado da população e a expansão mal planejada das cidades, tem levado a precariedade das condições de saneamento e abastecimento hídrico, tornando a água um importante meio de desenvolvimento e transporte de microrganismos, muitos destes patogênicos. Desta maneira, torna-se necessário além da busca de soluções, o monitoramento eficiente e constante dos níveis e focos de contaminação. O presente trabalho teve como objetivo principal diferenciar ambientes aquáticos poluídos de não poluídos por contaminação de origem fecal, através de padrões moleculares. Para tanto foram esco

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17

Biscola, Vanessa. "Interações entre bactérias láticas produtoras de bacteriocinas e a microbiota autóctone de charque." Universidade de São Paulo, 2011. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9131/tde-06062013-154005/.

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Abstract:

O charque é um produto cárneo tipicamente brasileiro, salgado e seco ao sol, ainda produzido de maneira artesanal. Durante sua produção há uma etapa de fermentação, realizada pela microbiota naturalmente presente na matéria-prima, o que dificulta a padronização do produto, e pode influenciar negativamente em suas características sensoriais e qualidade microbiológica. O controle da etapa de fermentação do charque seria uma alternativa para minimizar este problema e, neste contexto, as bactérias láticas produtoras de bacteriocinas se enquadram de forma interessante. A microbiota autóctone de cha

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18

Oberreuter, Helene. "FT-IR spectroscopic identification and infraspecific diversity of coryneform bacteria in relation to 16S rDNA sequence analysis." [S.l. : s.n.], 2001. http://deposit.ddb.de/cgi-bin/dokserv?idn=962146374.

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19

Rodriguez, Wong Carolina Yolanda. "Identificación de la microflora bacteriana ruminal de la alpaca (vicugna pacos) mediante análisis del gen 16s RDNA." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2012. https://hdl.handle.net/20.500.12672/3966.

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Abstract:

El presente estudio se dirigió a la identificación molecular de bacterias presentes en el compartimiento 1 de alpacas Huacaya mediante secuenciamiento del gen 16S rRNA. ADN genómico bacteriano fue extraído a partir de licor ruminal de 4 alpacas adultas de la raza Huacaya. Fragmentos de 728 bases del gen 16S rDNA fueron amplificados mediante PCR y clonados en un vector de expresión PGEM-T (Promega), transformados en Escherichia coli JM109 y secuenciados en un analizador genético ABI 3130. Cincuenta clonas fueron secuenciadas dando como resultado un total de 24 secuencias únicas del gen 16S ARNr

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Rodriguez, Wong Carolina Yolanda, and Wong Carolina Yolanda Rodriguez. "Identificación de la microflora bacteriana ruminal de la alpaca (vicugna pacos) mediante análisis del gen 16s RDNA." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2012. http://cybertesis.unmsm.edu.pe/handle/cybertesis/3966.

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Abstract:

El presente estudio se dirigió a la identificación molecular de bacterias presentes en el compartimiento 1 de alpacas Huacaya mediante secuenciamiento del gen 16S rRNA. ADN genómico bacteriano fue extraído a partir de licor ruminal de 4 alpacas adultas de la raza Huacaya. Fragmentos de 728 bases del gen 16S rDNA fueron amplificados mediante PCR y clonados en un vector de expresión PGEM-T (Promega), transformados en Escherichia coli JM109 y secuenciados en un analizador genético ABI 3130. Cincuenta clonas fueron secuenciadas dando como resultado un total de 24 secuencias únicas del gen 16S ARNr

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Al, Masalma Mouhamad. "Molecular and cultural analysis of the bacterial flora associated with brain abscesses." Thesis, Aix-Marseille 2, 2011. http://www.theses.fr/2011AIX20663/document.

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Abstract:

Les abcès cérébraux sont des infections potentiellement mortelles, entraînant souvent des séquelles graves. La prise en charge médicale en reste empirique en raison d’un manque de connaissance approfondie des microorganismes responsables de cette condition. Dans la plupart des laboratoires microbiologiques, le diagnostic d’abcès cérébral est basé sur la culture du pus recueilli chirurgicalement. Malheureusement, cette procédure a de nombreuses limites et ne permet l’identification que d’une petite partie de la population microbienne en cause. L’amplification par PCR et le séquençage du gène co

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Ritchie, Lauren Elizabeth. "Molecular characterization of intestinal bacteria in healthy cats and a comparison of the fecal bacterial flora between healthy cats and cats with inflammatory bowel disease (IBD)." [College Station, Tex. : Texas A&M University, 2008. http://hdl.handle.net/1969.1/ETD-TAMU-3081.

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Ferreira, Campos Felipe. "Diversidade de bactérias associadas ao muco do zoantídeo Palythoa Caribaeorum (Cnidaria, Anthozoa) do litoral sul de Pernambuco." Universidade Federal de Pernambuco, 2011. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/9117.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:13:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3053_1.pdf: 2529352 bytes, checksum: ea122352da45d79a2b72d5634d4999af (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011<br>Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco<br>O zoantídeo Palythoa caribaeorum é um cnidário colonial cujo os pólipos são conectados por um espesso tecido que possui partículas minerais incorporadas e habita extensas áreas dos recifes costeiros no Brasil. Este zoantídeo é popularmente conhecido por "baba-de-

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Hansen, Mario Jens. "Genotyp-Identifizierung und Wechselwirkungen an zwei Populus-Chimären." Doctoral thesis, Humboldt-Universität zu Berlin, Landwirtschaftlich-Gärtnerische Fakultät, 2005. http://dx.doi.org/10.18452/15385.

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Abstract:

Zwei Populus-Pfropfchimären (MA und AI), die aus P. x canadensis ‘Marilandica’ (M), P. maximowizcii x P. trichocarpa ‘Androscoggin’ (A) and P. nigra L. ’Italica’ (I) aufgebaut sind, wurden für Untersuchungen zur Laub- und Blütenblattentwicklung genutzt. In MA bildet M die äußere Lage (L1) und ihr Derivat, die Epidermis, während die inneren Lagen (L2, L3 etc.) von A gebildet werden. Bei AI stammt die L1 von A und L2, L3 etc. werden von I gebildet. Die genotypisch andersartige Epidermis bedingt bei Periklinal-Chimären morphologische Effekte wie zum Beispiel einen Fruchtknoten in einigen MA-Blüt

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Colares, GeÃrgia Barguil. "Diversidade e estrutura de comunidades microbianas associadas Ã rizosfera de Rhyzophora mangle do manguezal do Rio Pacoti, zona leste da costa cearense." Universidade Federal do CearÃ, 2010. http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=6987.

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Abstract:

CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior<br>Os manguezais sÃo ecossistemas costeiros que ocorrem em regiÃes de clima tropical e subtropical, sujeitos a aÃÃo das marÃs. SÃo regiÃes de extrema importÃncia para a reproduÃÃo de espÃcies, atuam como aparadores da linha da costa e possuem espÃcies vegetais endÃmicas, conhecidas como mangue. Os manguezais geralmente sÃo Ãreas bastante populosas, estando sujeitos a diversos impactos antrÃpicos, como a descarga de esgotos nÃo-tratados, o desmatamento das espÃcies vegetais e assoreamento dos rios. Esses impactos afetam as populaÃÃes d

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Perim, Júlia Elídia de Lima. "Diversidade microbiana envolvida na ciclagem do nitrogênio em solos de cultivo de cana-de-açúcar no estado de São Paulo." Universidade de São Paulo, 2016. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-28112016-175102/.

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Abstract:

O Brasil é o maior produtor mundial de cana-de-açúcar, sendo o Estado de São Paulo responsável por mais de 50% do total desta produção. Esta cultura tem um enorme impacto sobre a agricultura brasileira e devido a isto, uma melhor compreensão da composição da comunidade microbiana relacionada a ciclagem do nitrogênio (N) nestes solos é de grande importância para o aprimoramento no cultivo da cana-de-açúcar. No entanto, pouco se sabe sobre a relação entre grupos microbianos e essa cultura. Este trabalho visou determinar variações nas comunidades microbianas que participam das transformações do N

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Fishman, Ross H. "The Molecular Analysis of the Biofilm of Proximal Incipient Caries in Young Permanent Teeth." The Ohio State University, 2009. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1244847351.

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Martinati, Juliana Camargo [UNESP]. "Análise filogenética de linhagens de Xylella fastidiosa de diferentes hospedeiros baseada na sequencia da região intergênica 16S-23S rDNA." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2003. http://hdl.handle.net/11449/87733.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003-05-22Bitstream added on 2014-06-13T19:28:40Z : No. of bitstreams: 1 martinati_ja_me_rcla.pdf: 362018 bytes, checksum: 52f2a691f2a1ec67ccf4b3cf6fda2d9e (MD5)<br>Linhagens de Xylella fastidiosa de diferentes hospedeiros, incluindo citros, café, pêssego, videira entre outros, foram utilizadas para construir uma relação filogenética a partir da análise de seqüências completas de nucleotídeos do espaço intergênico 16S-23S rDNA. Dadas as dificuldades encontradas frente ao uso dos primers utilizad

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Carvalho, Elen Bethleen de Souza, and 92-99187-9362. "Estudo da microbiota da rizosfera do guaranazeiro (Paullinia cupana Kunth var.sorbilis (Mart.) Ducke) pelo sequenciamento do gene 16S rDNA." Universidade Federal do Amazonas, 2015. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5832.

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Abstract:

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-24T13:58:37Z No. of bitstreams: 2 Tese - Elen B. S. Carvalho.pdf: 1542638 bytes, checksum: 747fad508eb1974ab20e86fd0cfa2904 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)<br>Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-24T13:58:51Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Elen B. S. Carvalho.pdf: 1542638 bytes, checksum: 747fad508eb1974ab20e86fd0cfa2904 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8

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Martinati, Juliana Camargo. "Análise filogenética de linhagens de Xylella fastidiosa de diferentes hospedeiros baseada na sequencia da região intergênica 16S-23S rDNA /." Rio Claro : [s.n.], 2003. http://hdl.handle.net/11449/87733.

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Abstract:

Orientador: Siu Mui Tsai<br>Banca: Marco Aurelio Takita<br>Banca: Mauricio Bacci Junior<br>Resumo: Linhagens de Xylella fastidiosa de diferentes hospedeiros, incluindo citros, café, pêssego, videira entre outros, foram utilizadas para construir uma relação filogenética a partir da análise de seqüências completas de nucleotídeos do espaço intergênico 16S-23S rDNA. Dadas as dificuldades encontradas frente ao uso dos primers utilizados para o sequenciamento da região genômica em questão, fez-se necessária a construção de novos primers baseada em dados após alinhamento e comparação com as seqüênci

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ANTONIO, Cec?lia de Souza. "Ocorr?ncia de bact?rias endof?ticas associadas a variedades de cana-de-a??car cultivadas nos estados: Alagoas e Pernambuco." Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, 2010. https://tede.ufrrj.br/jspui/handle/jspui/1535.

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Abstract:

Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2017-04-18T20:10:31Z No. of bitstreams: 1 2010 - Cec?lia de Souza Ant?nio.pdf: 1613209 bytes, checksum: e560fdd88ef8707b79c6d4b0120730ec (MD5)<br>Made available in DSpace on 2017-04-18T20:10:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010 - Cec?lia de Souza Ant?nio.pdf: 1613209 bytes, checksum: e560fdd88ef8707b79c6d4b0120730ec (MD5) Previous issue date: 2010-04-20<br>CAPES<br>The sugar cane is one of the major agricultural products in Brazil. The crop is able to associate with diazotrophic bacteria (fix nitrogen from the air), that may be located

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Walsh, Kerry A. "Characterising the microbial community associated with a constructed wetland treating landfill leachate at Pitsea landfill site using 16S rDNA analysis." Thesis, University of East London, 2002. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.274628.

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CARVALHO, José Roberto Santo de. "Ecologia microbiana de reatores UASB submetidos a diferentes condições de operação para tratar efluente têxtil." Universidade Federal de Pernambuco, 2016. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/20169.

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Abstract:

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-07-31T14:41:08Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Dissertação_Mestrado_Roberto_Carvalho_2016.pdf: 4128480 bytes, checksum: d7d2a90680981c944fb1c8f51356fdf0 (MD5)<br>Made available in DSpace on 2017-07-31T14:41:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Dissertação_Mestrado_Roberto_Carvalho_2016.pdf: 4128480 bytes, checksum: d7d2a90680981c944fb1c8f51356fdf0 (MD5) Previous issue date: 2016-06-28<br

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Venter, P., T. Venter, N. Luwes, Smidt O. De, and J. F. R. Lues. "Towards the discrimination of milk (origin) applied in cheddar cheese manufacturing through the application of an artificial neural network approach on Lactococcus lactis profiles." Journal for New Generation Sciences, Vol 11, Issue 1: Central University of Technology, Free State, Bloemfontein, 2013. http://hdl.handle.net/11462/632.

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Abstract:

Published Article<br>An artificial neural network (ANN) that is able to distinguish between Cheddar cheese produced with milk from mixed and single breed sources was designed. Samples of each batch (4 pure Ayrshire/4 mixed with no Ayrshire milk) were ripened for 92 days and analysed every 14 days. A novel ANN was designed and applied which, based only on Lactococcus lactis counts, provided an acceptable classification of the cheeses. The ANN consisted of a multi-layered network with supervised training arranged in an ordered hierarchy of layers, in which connections were allowed only between n

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Simões, Tiago Henrique Nogueira. "Triagem de enzimas associadas à biotransformação de hidrocarbonetos a partir de metagenoma de sedimentos contaminados com petroléo e metais pesados." Universidade de São Paulo, 2009. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-29042010-101614/.

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Abstract:

A metagenômica trouxe novas perspectivas ao estudo de comunidades microbianas no ambiente, permitindo explorar tanto a diversidade taxonômica de microrganismos ainda não-cultivados, como o acesso direto a genes e vias metabólicas. Neste trabalho, foram construídas bibliotecas metagenômicas a partir de amostras de sedimentos de mangue da Baía de Guanabara (RJ), impactadas com hidrocarbonetos de petróleo e metais pesados. Proteobacteria (33,3%), bactérias afiliadas a redutoras-de-sulfato (29,7%) e Firmicutes (20%) representaram os grupos principais nas amostras ambientais, baseado em análises fi

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Santos, Thiago Monteiro Araújo dos. "Diversidade genética de bactérias endofíticas associadas a frutos de café (Coffea arabica L.)." Universidade Federal de Viçosa, 2008. http://locus.ufv.br/handle/123456789/5358.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:51:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1207373 bytes, checksum: f279fd080120df1d02002fe650c0e5bf (MD5) Previous issue date: 2008-08-22<br>Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico<br>The complexity and limited knowledge of the epiphytic and endophytic microbiota in coffee cherries, especially the unculturable ones, make it a challenging task the characterization of this microbiodiversity and its possible role as producers of precursors to compounds inherent to higher quality coffees. The present study was conducted

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Santos, Viviane Piccin dos [UNESP]. "Filogenia molecular de cianobactérias baseada em sequências do 16S-23S-ITS rDNA e PC-IGS: investigação de transferência lateral do PC." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2011. http://hdl.handle.net/11449/87867.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-17Bitstream added on 2014-06-13T19:28:52Z : No. of bitstreams: 1 santos_vp_me_rcla.pdf: 692384 bytes, checksum: 87577700198a680d7662c5fe0990efe7 (MD5)<br>Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)<br>As cianobactérias apresentam uma ampla variabilidade fenotípica e ecológica. Porém, esta variabilidade, muitas vezes, não corresponde à sua diversidade genética. Assim, o uso de marcadores moleculares é fundamental para os estudos de filogenia neste grupo. Entretanto, a fi

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Streubel, Anna [Verfasser]. "Entwicklung einer gattungsspezifischen PCR für Mykobakterien mit speziesspezifischer Detektion durch Restriktions-Endonukleasen Anhand des 16S-23S rDNA Gen Spacers / Anna Streubel." Berlin : Medizinische Fakultät Charité - Universitätsmedizin Berlin, 2008. http://d-nb.info/1023261502/34.

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Santos, Viviane Piccin dos. "Filogenia molecular de cianobactérias baseada em sequências do 16S-23S-ITS rDNA e PC-IGS : investigação de transferência lateral do PC /." Rio Claro : [s.n.], 2011. http://hdl.handle.net/11449/87867.

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Abstract:

Orientador: Maria do Carmo Bittencourt de Oliveira<br>Banca: Luiz Henrique Zanini Branco<br>Banca: Mariana Cabral de Oliveira<br>Resumo: As cianobactérias apresentam uma ampla variabilidade fenotípica e ecológica. Porém, esta variabilidade, muitas vezes, não corresponde à sua diversidade genética. Assim, o uso de marcadores moleculares é fundamental para os estudos de filogenia neste grupo. Entretanto, a filogenia molecular enfrenta um desafio na seleção dos marcadores devido à ocorrência relativamente frequente da transferência de genes de forma lateral entre os procariotos. Em cianobactérias

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Nyarku, Rejoice E. "Development and analytical validation of a genus-specific Brucella real-time PCR assay targeting the 16S-23S rDNA internal transcribed spacer." Diss., University of Pretoria, 2020. http://hdl.handle.net/2263/77428.

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Abstract:

Brucellosis is an economically important bacterial disease of both animals and humans. In sub-Saharan Africa, the diagnosis of the disease remains a challenge. Brucellosis is underreported in South Africa, due to inconsistency in reports of bacteriological and serological tests, which lack adequate sensitivity and specificity in the diagnosis of the disease. They also are ineffective in confirming brucellosis during early stages of the disease. The aim of this study was to develop a 16S-23S ribosomal deoxyribonucleic acid (rDNA) internal transcribed spacer (ITS) quantitative polymerase chain r

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Saengkerdsub, Suwat. "Establishment, identification, quantification of methanogenic archaea in chicken ceca and methanogenesis inhibition in in vitro chicken ceca by using nitrocompounds." Thesis, Texas A&M University, 2003. http://hdl.handle.net/1969.1/3999.

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Abstract:

In the first phase of this study, the diversity of methanogenic bacteria in avian ceca was found to be minimal. Based on 16S rDNA clone libraries, a common phylotype, designated CH101, ranged between 92.86 to 100 % of the total clones whereas less than 1% of the other phylotypes were found. On the basis of the sequence identity, all of the sequences, except sequence CH1270, are related from 98.97 to 99.45% to 16S rDNA Methanobrevibacter woesei GS. Sequence CH1270 is 97.62% homologous to the sequence identified to uncultured archaeon clone ConP1-11F. Clearly, the predominant methanogen found to

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SANTANA, Raphael Carlos Ferrer de. "Potencial biotecnológico de actinobactérias da coleção UFPEDA contra Candida spp." Universidade Federal de Pernambuco, 2015. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/17208.

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Abstract:

Submitted by Irene Nascimento (irene.kessia@ufpe.br) on 2016-06-30T16:59:18Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação- Raphael Santana.pdf: 1198352 bytes, checksum: 2ddd13ab9df70bdaf76d80dd5d481f49 (MD5)<br>Made available in DSpace on 2016-06-30T16:59:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação- Raphael Santana.pdf: 1198352 bytes, checksum: 2ddd13ab9df70bdaf76d80dd5d481f49 (MD5) Previous issue date: 2015-02-24<br>FACEPE<br>Actinobactérias são bacté

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Neves, Juliana Teixeira de Magalhães. "Características moleculares e identificação de Lactobacillus delbrueckii UFV H2b20." Universidade Federal de Viçosa, 2003. http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/10679.

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Abstract:

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-13T18:17:32Z No. of bitstreams: 1 resumo.pdf: 17263 bytes, checksum: 8e51a65fe7d8eecb448411acb64cf05b (MD5)<br>Made available in DSpace on 2017-06-13T18:17:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 resumo.pdf: 17263 bytes, checksum: 8e51a65fe7d8eecb448411acb64cf05b (MD5) Previous issue date: 2003-02-20<br>Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais<br>A estirpe probiótica Lactobacillus UFV H2b20, previamente classificada como Lactobacillus acidophilus por suas características de fermentação de açúcares, apre

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Andrees, Sebastian [Verfasser]. "Untersuchung des 16S-23S rDNA Spacers der Gattung Nocardia und seine Bedeutung für die Speziesidentifizierung mittels gattungsspezifischer PCR und Restriktionsfragmentlängen-Polymorphismus / Sebastian Andrees." Berlin : Medizinische Fakultät Charité - Universitätsmedizin Berlin, 2011. http://d-nb.info/1025510771/34.

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Mills, John. "Bacterial Community Analysis of Meat Industry Conveyor Belts." The University of Waikato, 2007. http://hdl.handle.net/10289/2236.

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Abstract:

At the commencement of this study, some sensitive overseas markets were rejecting chilled vacuum-packed New Zealand lamb due to higher than expected total viable counts, and counts of Enterobacteriaceae, a family of bacteria used to indicate sanitary condition. Of the many factors that influence the bacterial composition of chilled lamb in the overseas marketplace, the meat producer can only exert significant control over: Hygiene, ensuring the bacterial viable count on the meat prior to packaging is as low as possible, and comprised of as few species as possible that are capable of anaerobic

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MUNDELL, J. NICOLE. "PHYLOGENETIC ANALYSIS OF KENTUCKY STRAINS OF XYLELLA FASTIDIOSA." UKnowledge, 2005. http://uknowledge.uky.edu/gradschool_theses/406.

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Abstract:

Phytopathogenic bacterium, Xylella fastidiosa, causes a number of economically important diseases, including Pierces disease (PD) of grape and bacterial leaf scorch (BLS) of a number of landscape trees. In Kentucky (KY), BLS affects a number of shade trees including many oak and maple species. In 2001, PD was diagnosed in grapevines in western KY. Xylella fastidiosa is also detected in many asymptomatic landscape plants and grasses. It was the goal of this research to identify hosts of X. fastidiosa around KY and use phylogenetic analysis to compare sequences of the 16S rDNA and gyrase B (gyrB

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Marais, Laurette Marlize. "Characterization of bacteria isolated from a platinum mine tailings dam / Laurette Marais." Thesis, North-West University, 2012. http://hdl.handle.net/10394/8721.

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Abstract:

Contamination from various sources has a huge impact on soil health and microbial community composition. Metal contamination of soil in mining scenarios is of concern and is not adequately addressed, particularly with respect to the microbial community. The mining industry is one of the largest contributors to heavy metal contamination of soil in South Africa, especially since the country is one of the major mining countries in the world. Platinum mining is of special importance, since the largest percentage of the world’s reserves of platinum group metals are found and mined in South Africa.

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Zimmermann, Bianca Laís. "Aspectos da relação simbiótica entre as bactérias Wolbachia (Alphaproteobacteria, Rickettsiales) e os isópodos terrestres (Crustacea, Oniscidea)." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 2010. http://hdl.handle.net/10183/28424.

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Abstract:

Wolbachia é uma alfaproteobactéria que apresenta simbiose com uma variedade de artrópodos e nematoides, estando entre os mais abundantes gêneros de bactérias intracelulares já descobertos. Na região Neotropical, os estudos sobre tais bactérias e seus hospedeiros, em especial isópodos terrestres, ainda são incipientes. O presente trabalho teve como objetivos: investigar as espécies de isópodos terrestres neotropicais infectados por Wolbachia; analisar a prevalência de infecção, variação genética e relações filogenéticas das linhagens presentes nessas espécies; investigar a simbiose de Wolbachia

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Scuderi, Maria Cristina. "Identificazione molecolare di lattobacilli umani ed epidemiologia delle resistenze." Thesis, Universita' degli Studi di Catania, 2011. http://hdl.handle.net/10761/306.

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Abstract:

Quarantacinque ceppi di lattobacilli umani sono stati identificati mediante tecniche molecolari (16S rDNA PCR-RFLP; multiplex PCR 16S-ITS-23S rDNA e regione fiancheggiante la 23S rDNA, multiplex PCR sul gene tuf). Le attivita' in vitro verso differenti classi antibiotiche (beta-lattamici, macrolidi, lincosammidi, fluorochinoloni, glicopeptidi e aminoglicosidi) sono state determinate mediante test di microdiluizione in terreno liquido e diffusione in terreno solido. E' stato effettuato lo studio genotipico della resistenza ai chinoloni mediante amplificazione e sequenziamento delle QRDR (Quinol

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Oliveira, Marcelo Nagem Valério de. "Archaea como componentes da microbiota endofítica de frutos do cafeeiro." Universidade Federal de Viçosa, 2009. http://locus.ufv.br/handle/123456789/5316.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:51:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1109551 bytes, checksum: 5f0d13927b00626f1a0d15b78536b7bc (MD5) Previous issue date: 2009-07-13<br>Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico<br>This is the first study of genetic diversity of the Archaea community associated to coffee fruits (Coffea arabica L.). It was performed in cherry coffee fruits of cultivars Bourbon Amarelo, Bourbon Vermelho, Catuaí Amarelo, Catuaí Vermelho and Catucaí Vermelho in different altitudes. The archaeal diversity during natural drying of depu

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