Academic literature on the topic 'Aislamiento de bacterias'

<p>En la mayoría de países en vía de desarrollo, la investigación con microorganismos celulolíticos, se ha orientado escasamente a la transformación de residuos sólidos orgánicos en compost, ignorando su enorme potencial industrial. El principal objetivo de esta investigación fue generar información sobre la capacidad y diversidad de bacterias celulolíticas aisladas de tres hábitats diferentes. El estudio incluyó muestras de suelo de bosques nativos y fincas productoras de cereales y de composteras. De cada muestra, se prepararon diluciones hasta 10-4 y de cada dilución, se inocularon tubos que contenían medio líquido mineral y una tira de papel filtro, como fuente de celulosa. A las tres semanas de incubación se estimó la densidad de población de microorganismos celulolíticos y de las tiras de papel, se realizaron cultivos en medio agar nutritivo y luego en medio sólido mineral, suplementado con celulosa. Los crecimientos bacterianos se sometieron a la prueba del Rojo Congo y los de mayor potencial fueron identificados. En comparación con los suelos, las composteras albergan mayor población de microorganismos celulolíticos. Respecto a las bacterias celulolíticas, en total se obtuvieron 20 aislamientos, 19 de los bosques nativos y 1 aislamiento de una compostera. Los aislamientos 1, 2, 6, 7 y 14 mostraron mayor capacidad celulolítica al producir halos de hidrólisis con una amplitud entre 0.65 y 0.30 cm. El aislamiento 1 fue identificado como Bacillus sp, el aislamiento 7 como Pseudomonas sp y el aislamiento 6 como Erwinia sp. Esta información es útil para explorar con seguridad el potencial de las bacterias celulolíticas en la industria.</p>

A pesar de la importancia para el sostenimiento de la vida de nuestro planeta, en el presente desconocemos a la mayor parte de su diversidad. Muchas bacterias son benéficas para la agricultura, la biomedicina, el medio ambiente y la industria. En la actualidad se tiene especial interés en aislar nuevas especies bacterianas, así como en estudiar la función que desempeñan en sus ambientes. Las metodologías moleculares han permitido elucidar nuevas "Unidades Taxonómicas Organizacionales", no obstante son las metodologías de cultivo las que podrían ayudarnos a explotar el potencial benéfico de las bacterias. En esta revisión se presentan alternativas que se podrían considerar para el aislamiento de diversas bacterias a partir de distintos ambientes y los medios de cultivo que podrían ser utilizados, se destaca la importancia de explorar distintos medios de cultivo para el aislamiento de bacterias a partir de un mismo ambiente.

El objetivo de este trabajo fue caracterizar bacterias oxidadoras de amonio (BOA) aisladas del humedal de flujo subsuperficial de la planta de tratamiento de aguas residuales de la Universidad de Boyacá. Para ello, se realizaron diluciones de muestras de suelo, las cuales fueron enriquecidas con caldo amonio e incubadas durante 28 días a 30ºC. De los tubos con reacción positiva para nitritos, se aislaron bacterias en medio mínimo de sales minerales con amonio como única fuente de nitrógeno. Se obtuvieron 16 aislamientos, los cuales se caracterizaron macroscópica, microscópica, y bioquímicamente. De los 16 aislamientos obtenidos, tan solo 4 tuvieron la capacidad de crecer rápidamente en medio amonio sólido, durante 28 días a 30ºC. Estos aislamientos fueron evaluados por su capacidad de oxidar el amonio a nitrito en medio mínimo de sales minerales. Los resultados indicaron que el aislamiento A7 y A15, presentaron diferencias significativas en la oxidación del amonio con respecto a los demás aislamientos seleccionados, lo cual indica su potencial para ser utilizado en procesos de tratamiento de aguas residuales.

Las bacterias nativas adaptadas a ambientes contaminadas han demostrado su gran capacidad de sobrevivir en condiciones adversas. El objetivo de este estudio fue identificar las bacterias presentes en suelos de minas abandonadas, además de investigar las relaciones filogenéticas de estas bacterias nativas cultivables. Se realizó el aislamiento bacteriano, la extracción de ADN, amplificación por PCR, secuenciación del gen 16S ARNr, reconstrucción filogenética de Máxima Verosimilitud (ML) con RaXML, e identificación de géneros relacionadas con microreact. Las secuencias obtenidas fueron editadas a un tamaño de 1200 – 1400 pb, que posteriormente se compararon con 1137 secuencias procedentes de la base de datos del GenBank. Los nueve aislamientos obtenidos se agruparon filogenéticamente en seis grupos que corresponderían a los géneros Bacillus, Cytobacillus, Paenibacillus, Microbacterium, Peribacillus, Acinetobacter. Por lo tanto, se resalta el potencial inexplorado de estas bacterias para ser utilizadas en procesos de biorremediación. Además, algunas de estas bacterias pueden ser propuestos como indicadores de contaminación, lo que amerita realizar una investigación más detallada debido a que estos microorganismos pueden ser empleados en futuras investigaciones.

Las tendencias actuales de practicar la agricultura apuntan hacia el uso de microorganismos para incidir en la sanidad, producción y calidad de las cosechas; estudios previos en agave han logrado el aislamiento de diferentes microorganismos, pero la identificación de bacterias endófitas es un área que se ha abordado poco a pesar de su importancia económica. En el presente estudio se llevó a cabo un análisis de la endomicrobiota presente en cinco tipos de agave pulquero (Agave salmiana): Manso, Chalqueño, Ayoteco, Púa Larga y Carricillo. Pencas de estas plantas fueron colectadas en el poblado de Nanacamilpa de Mariano Arista, Tlaxcala y procesadas para el aislamiento de microorganismos endófitos en medios selectivos para bacterias diazotróficas, bacilos y Pseudomonas fluorescentes. Los microorganismos aislados fueron identificados molecularmente por la amplificación de fragmentos de la subunidad ribosomal 16S. Se identificaron 35 bacterias endófitas a partir de los cinco tipos de agave pulquero. El número de aislamientos obtenidos correspondió a 7, 11, 3, 5 y 9 a partir de Ayoteco, Carricillo, Chalqueño, Manso y Púa Larga, respectivamente. La endomicrobiota bacteriana de Carricillo fue la más diversificada (nueve especies), mientras que Chalqueño presentó la menor riqueza bacteriana (tres especies); Ayoteco, Manso y Púa Larga presentaron cinco especies bacterianas únicas. En forma global, los géneros de bacterias con mayor representación en los cinco tipos de agave fueron Bacillus con 12 entradas, y Enterobacter y Leclercia con siete entradas cada uno. Bacillus subtilis y Leclercia sp. fueron las especies mayormente representadas en los agaves al encontrarse en tres de los cinco tipos analizados.

Mediante la realización de trabajos tendientes a buscar enemigos naturales de mosquitos, se aislaron bacterias entomopatógenas en diferentes zonas del país, entre 1988 y 1991. Se efectuaron aislamientos a partir de mues­tras de tierra y larvas muertas tomadas de los criaderos. Se procedió a utilizar la metodología usada por Brownbridge y Margali (1986) para el aislamiento de bacterias formadores de esporas. Las cepas que presentaron toxici­dad frente a larvas de Culex quinquefas­ciatus (Say) se sometieron a pruebas de identificación bioquímica y sensibilidad frente a diferentes antibióticos. Para completar el esti.lio, las cepas se sometieron a pruebas con larvas de C. quinquefasciatus, Aedes aegypti (L.) y Anopheles stephensi Liston para determinar la Concentración Letal Media ,CL50) y el recuento de esporas del polvo liofilizado. Se aislaron 79 cepas de Bacillus thuringiensis Berliner tóxicas para larvas de mosquitos, tres de las cuales presentan un alto poder larvicida frente a larvas de A. aegypti. Se encontró que los aislamientos CIB 163-131 y CIB 24-726 pertenecen al serotipo H-30, nuevo para el mundo, y el cual fue denominado Bacillus thuringiensis subsp. medellin (B.t.m.). Las proteinas tóxi­cas de estas dos cepas de B.t.m. muestran características inmunológicas diferentes a las de las cepas de referencia de la subsp. israelensis, la cual se halla ampliamente distribuida en las zonas tropicales cálidas de Colombia.

Las bacterias son esenciales en biotecnología debido a su diversidad metabólica y adaptabilidad. Estas bacterias pueden producir metabolitos útiles en diversas áreas, el género Bacillus es notable por sus características explotables en el área biotecnológica, incluyendo la producción de proteínas insecticidas y proteínas antimicrobianas. Este trabajo explora el aislamiento e identificación de bacterias del género Bacillus en muestras recolectadas en El Copal, se procesaron muestras de diferentes fuentes, tras el aislamiento, las bacterias se identificaron utilizando tinción de Gram, prueba de catalasa y amplificación del ADN ribosomal 16S por PCR. Los resultados mostraron que las muestras de musgo, tierra, telaraña y heno tuvieron la mayor diversidad bacteriana. Se aislaron un total de 23 bacterias diferentes morfológicamente, 15 fueron bacilos Gram positivos, de estos se seleccionaron diez que se identificaron molecularmente como: Bacillus sp., Bacillus toyonensis, Bacillus aryabhattai, Peribacillus simplex, Bacillus wiedmannii, Bacillus proteolyticus, Bacillus mobilis y Bacillus amyloliquefaciens. Este estudio resalta la importancia de explorar ambientes diversos para descubrir bacterias con potencial en biotecnología. Las muestras de origen apícola produjeron menos diversidad, pero algunas colonias mostraron potencial antimicrobiano, que se evaluó mediante el método de difusión de pozos.

Este trabajo se propuso aislar bacterias diazotróficas con actividad promotora del crecimiento vegetal, asociadas al cultivo de zanahoria. Se realizaron 3 muestreos, a los 30, 60 y 115 días, en una granja ubicada en una zona rural del municipio de Manizales (Caldas). El aislamiento de las bacterias diazotróficas se efectuó en medios de cultivo semisólidos libres de nitrógeno. A los aislamientos obtenidos se les realizó descripción macro y microscópica, identificación bioquímica y molecular. Se evaluaron características como determinación de compuestos indólicos, actividad nitrogenasa y solubilización de fosfatos. Como cepa patrón se empleó Gluconacetobacter diazotrophicus ATCC 49037. Se recuperaron 20 aislamientos asociados a la rizosfera y 12 al rizoplano. La identificación molecular mostró cinco géneros presentes: Rhizobium, Achromobacter, Bacillus, Enterobacter y Stenotrophomonas. La producción de compuestos indólicos presentó concentraciones entre 9,73 y 112,8 µg/mL. La cepa patrón presentó una actividad mayor, con una producción de compuestos indólicos de 172,5 µg/mL. En la actividad nitrogenasa los aislamientos GIBI411, 394 y 399 tuvieron una actividad mayor o similar a la cepa patrón. Los aislamientos más eficientes en la solubilización de fosfato tricálcico fueron GIBI378 y 385. La solubilización de fosfato de aluminio se valoró por el índice de producción de ácido, siendo los aislamientos GIBI378, 391, 387 y 388 los de mejor comportamiento en esta variable. Los aislamientos encontrados son candidatos potenciales para desarrollar nuevos procesos biotecnológicos para la producción de nuevos biofertilizantes alternativos, considerando las importantes propiedades de promoción del crecimiento vegetal determinadas en este trabajo.

Los hidrocarburos aromáticos monocíclicos: benceno, tolueno, etilbenceno y xileno (BTEX), presentes en crudo y refinados de petróleo, hacen parte de los compuestos con más impacto en el medio ambiente y la salud humana, debido a su naturaleza cancerígena, mutagénica y altamente tóxica. Esta investigación tuvo como objetivo obtener y caracterizar bacterias capaces de degradar tolueno. Se realizaron tres muestreos de suelo contaminado con hidrocarburos del Valle del Cauca en tres condiciones: gasolinería, derrame accidental y taller mecánico. Se aislaron bacterias capaces de crecer en tolueno vapor como única fuente de carbono y se caracterizaron a nivel morfológico, bioquímico y molecular. Para la caracterización molecular se amplificó, secuenció y analizó con herramientas bioinformáticas el gen ribosomal 16S. Se evaluó la utilización de tolueno directo con concentración al 1% como única fuente de carbono. Se logró aislar 29 bacterias con capacidad de metabolizar tolueno. La caracterización bioquímica y molecular identificó a las bacterias aisladas de suelo contaminado como Pseudomonas y Stenotrophomonas. Las bacterias aisladas en el taller mecánico resultaron ser los microorganismos con mejor crecimiento en tolueno como fuente de carbono, poseen un gran potencial para ser utilizadas para fines de biorremediación de suelos y aguas contaminadas con BTEX.

La resistencia bacteriana a los antibióticos es un problema creciente, de alto impacto mundial. Su presencia se relaciona con alta morbilidad y mortalidad. Por ésta razón su vigilancia epidemiológica y todas las medidas sanitarias instauradas para frenar su avance son absolutamente necesarias.Se realizó un estudio prospectivo en los pacientes ingresados a la unidad de terapia intensiva del Hospital Pablo Arturo Suárez de Quito en los meses de febrero a agosto de 2016, para valorar el rendimiento de los hisopados rectales cómo herramienta de detección de enterobacterias multirresistentes, y en base a ello, en una segunda fase, adopción de tres medidas: a. capacitación y vigilancia del cumplimiento estricto de lavado de manos y medidas de aislamiento universal. b. cambios en la política de administración de antibióticos (restricción de prescripción libre de carbapenémicos/ uoroquinolonas) y c. cierre de la unidad para desinfección terminal con hipoclorito de sodio.El seguimiento se hizo por semanas epidemiológicas, los hisopados rectales fueron tomados al ingreso del paciente y todos los días lunes. Hubo positividad para enterobacterias multirresistentes en algunas muestras, siendo el aislamiento más frecuente Klebsiella pneumoniae productora de KPC. De los aislamientos positivos para colonización por bacterias multirresistentes, el 75% evolucionó a infección y de ellos el 22% falleció. Luego de las medidas tomadas, se ha logrado negativizar la presencia de éstas bacterias en los hisopados rectales.

Este estudio tiene como finalidad de confirmar la capacidad solubilizadora de las cepas aisladas que se puede esperar sean de uso potencial para la formulación de un bioinoculante efectivo para el cultivo de la papa.<br>RESUMEN El fósforo es el segundo nutriente necesario para el desarrollo de las plantas, y de los microorganismos que habitan la rizósfera. En un modelo agrícola convencional, la mayoría de los cultivos requieren cerca de 10 a 30 kg de fósforo por hectárea que se suministran en forma de fertilizantes sintéticos, los cuales debido a sus formas no disponibles tienden a acumularse y modificar las condiciones fisicoquímicas del suelo por la inmovilización química del elemento fierro, aluminio y calcio principalmente, si bien se incrementa el rendimiento de las cosechas, no se consideran los impactos negativos que se producen, como la eutrofización de cuerpos de agua, disminución de las principales reservas de nutrientes, inmovilización de nutrientes en el suelo con los consecuentes desbalances en cultivos, aumento de los costos de producción, entre otros. Atendiendo a esta problemática surge un concepto de agricultura sustentable a través de la generación de biofertilizantes, a partir del estudio, entendimiento y aplicación de microorganismos que actúan como promotores del crecimiento vegetal o que presentan rasgos que favorecen la disponibilidad de micro y macro elementos. El presente trabajo se orientó en el aislamiento de bacterias solubilizadoras de fósforo a partir de suelo cultivado con papa (Solanum tuberosum L.) en el Estado de México. Se llevó a cabo la caracterización fisicoquímica del suelo de las zonas muestreadas, se aislaron y contabilizaron la Bacterias Heterótrofas totales, y se seleccionaron bacterias efectivas para la solubilización de fosfato mediante la siembra en medio Pikovskaya sólido, obteniendo un total de 5 cepas de las que se determinó el diámetro de halo de solubilización, siendo la cepa A3 la que presento un mayor diámetro con 19mm aproximadamente. Al confirmar la capacidad solubilizadora de las cepas aisladas se puede esperar sean de uso potencial para la formulación de un bioinoculante efectivo para el cultivo de la papa.<br>la clave se otorgo por parte de la SIEA de la UAEM, sin financiamiento con clave: 4635/2019SF.

Los microorganismos que sobreviven a las condiciones de mezcla de contaminantes del río Lerma, requieren de un metabolismo especializado para poder sobrevivir, lo cual es una forma natural de adaptación biológica en el mismo río. Bajo éste precepto se tomaron sedimentos del río Lerma como fuente de bacterias resistentes a los contaminantes: Cr (VI) y paratión metílico (PM). Para obtener estas bacterias, se probaron diferentes medios de cultivo selectivo y se establecieron las condiciones de crecimiento de las cepas. Después del aislamiento de bacterias, se procedió a la identificación morfológica, bioquímica y molecular de cada cepa. Finalmente, se determinaron sus concentraciones mínimas inhibitorias y se estableció la cinética de degradación de una bacteria seleccionada por cada contaminante. Siete cepas aisladas de sedimentos del río Lerma fueron capaces de resistir y reducir Cr (VI) a Cr (III). La capacidad de trasformación en orden descendente fue: Pseudomonas entomophila L48> Pseudomonas sp.> Pseudomonas fluorescens A> Klebsiella pneumoniae> Pseudomonas fluorescens B> Comamonas testosteroni A. Las cepas estudiadas presentaron una concentración mínima inhibitoria superior a la encontrada en otros trabajos. La biomasa de Pseudomonas entomophila L48 no se vió afectada por la presencia de Cr (VI). Entre las especies que no han sido reportadas previamente como resistentes a Cr (VI) y que fueron identificadas en este estudio se encontraron: Pseudomonas reactans AMP-13 y Pseudomonas entomophila L48. En un par de estudios locales las especies Klebsiella pneumoniae y Comamonas testosteroni, han sido identificadas como resistentes a Cr (VI). Por otro lado, once cepas con diferentes porcentajes de transformación de PM fueron aisladas, sin embargo, el porcentaje de degradación por cepa fue bajo. La capacidad de trasformación en orden descendente fue: Comamonas testosteroni B>Comamonas testosteroni C>Achromobacter piechaudii B>Rhodococcus erythropolis>Achromobacter piechaudii A>Pseudomonas fluorescens C>Pseudomonas fluorescens D>Cepa 10-1 ISI 2-0.3 mM>Pseudomonas fluorescens E>Leifsonia xyli subsp. xyli>Pseudomonas fluorescens F. Estas cepas representan un potencial biotecnológico para su aplicación en sistemas de tratamiento de reducción de Cr (VI) y degradación de PM.<br>Secretaría de Educación Pública

Los microorganismos marinos han sido siempre objeto de estudios corno productoras de substancias antibacterianas; sin embargo, también son consideradas productoras de substancias antifúngicas, antivirales, antiparasitarias, citotóxicas e inhibitorias de otras formas de crecimiento celular. En el presente trabajo de investigación se describe el aislamiento, el potencial antibacteriano y la caracterización fenotípica de cepas nativas asociadas a Argopeclen purpuratus "concha de abanico" y Crassostrea gigas «ostra" en cultivos. De un total de 345 cepas colectadas, se lograron aislar 83 cepas con capacidad inhibitoria de bacterias patógenas de peces, moluscos y crustáceos, siendo los más sensibles, Aeromonas sobria P-281, A. hydrophila ATCC 7966 y Vibrio parahaemolyticus ATCC 17803. En base a su mayor capacidad inhibitoria fueron seleccionadas 20 cepas, las cuales fueron caracterizadas fenotípicamente para su identificación a nivel de género. Se lograron identificar bacterias marinas pertenecientes a los siguientes géneros: Vibrio (40%), Aeromonas (15%), Flavobacterinm (10%), Pseudomonas (5%), Moraxel/a (5%) y Flexibacter (5%). Cuatro cepas no fueron identificadas (20%). Los resultados de la capacidad inhibitoria obtenidas en este estudio, sugieren que las cepas nativas aisladas seleccionadas podrían ser aprovechadas como agentes probióticos en el control biológico de patógenos de organismos marinos de interés en maricultura (peces, moluscos y crustáceos).

Magíster en Bioquímica área de especialización Bioquímica Ambiental y Memoria para optar al Título de Bioquímico<br>Autor no autoriza el acceso a texto completo de su documento hasta enero de 2019<br>La Antártica es el continente más austral de la tierra, contiene cerca del 80% de las reservas de agua dulce del planeta y presenta una serie de condiciones extremas, como bajas temperaturas y alta radiación ultravioleta. A pesar de esto, el hombre ha sido capaz de sobrevivir en la región y realizar actividades científicas y de explotación durante más de 80 años. Como consecuencia, las distintas zonas habitadas han sufrido contaminación, principalmente asociada a diesel. Este compuesto es nocivo, ya que presenta una gran cantidad de moléculas orgánicas como hidrocarburos aromáticos policíclicos (HAPs) y compuestos inorgánicos como metales pesados (Cd, Cr y Pb). La descontaminación de HAPs se puede llevar a cabo mediante procesos físicos, químicos y biológicos. Los procesos biológicos representan una opción ecológica, económica y segura, que involucra una menor alteración de los suelos y en consecuencia constituye una excelente alternativa para la descontaminación del territorio Antártico. A la fecha, se ha reportado un gran número de bacterias capaces de degradar HAPs. Sin embargo, debido al Tratado Antártico no está permitido ingresar microorganismos o ADN foráneo al continente, por lo que se hace vital encontrar bacterias nativas que puedan ser usadas en la biorremediación de diesel en Antártica. Debido a su mayor solubilidad en agua, menor toxicidad para el humano y similitud estructural con otros HAPs, el compuesto que se utiliza como modelo para aislar y estudiar microorganismos degradadores de HAPs es el fenantreno. En base a lo expuesto, se planteó la hipótesis: “La presencia de hidrocarburos aromáticos policíclicos y metales pesados en suelos antárticos ha favorecido el desarrollo de bacterias degradadoras de fenantreno resistentes a metales”. El objetivo general de este trabajo fue aislar y caracterizar bacterias antárticas resistentes a metales pesados (Cd, Cr y Pb) y evaluar su capacidad de metabolizar fenantreno. Para esto se utilizó muestras de suelo antártico obtenido de distintas zonas expuestas y no expuestas a diesel, las cuales fueron caracterizadas química y biológicamente. Además, se aisló y caracterizó bacterias degradadoras de fenantreno resistentes a metales y se estudiaron los procesos asociados a la degradación de fenantreno. Durante este trabajo de tesis se utilizó muestras de suelo obtenidas de la 49° Expedición Científica Antártico (ECA 49°): 4 muestras de suelos no expuestos a diesel (A0, B4, C3 y C8) y 4 muestras de suelos expuestos a diesel (D3, D4, E2 y E4). El análisis del suelo determinó la presencia de HAPs en los suelos expuestos a diesel, en promedio 1000 veces más concentrado que en los suelos sin exposición. Además, en los suelos D3 y D4 (suelos expuestos a diesel) se observó una mayor concentración de cadmio y plomo total en comparación a todas las muestras, sobre los 30 y 600 mg Kg-1, respectivamente. Respecto a la caracterización biológica, el suelo expuesto a diesel D4 presentó mayor actividad biológica y número de heterótrofos, relacionado directamente al contenido de HAP (el suelo D4 presentó la mayor concentración del hidrocarburo, ̴ 30 mg Kg-1). De los 8 suelos se aisló 350 microorganismos, de los cuales 53 fueron capaces de degradar fenantreno. Mediante un screening desarrollado durante esta tesis basado en espectroscopía de fluorescencia total asociada a calibración multivariada, se seleccionó 3 aislados por su alto nivel de degradación. Estos microorganismos se caracterizaron, en particular la cepa D43FB (identificada como Pseudomonas flavescens) resiste 25 mg L-1 de Cd+2 y 5 mg L-1 de Cr+6. Además, tras 7 de incubación es capaz de degradar hasta un 80% de fenantreno en medio M9 con el hidrocarburo como única fuente de carbono. Al agregar 0.025, 0.05 y 0.5 mg L-1 de Cd+2 el porcentaje de degradación es 60, 26 y 25 mg L-1, respectivamente. Además, en un proceso de bioaumetación de suelos degrada aproximadamente un 75% de los hidrocarburos presentes en el terrario. Por otro lado, a este aislado se asoció su capacidad de degradar fenantreno a la facultad de formar biopelículas y adherirse a cristales de este compuesto, junto con descartar la liberación de biosurfactante o la quimiotaxis. Siendo una excelente alternativa para más ensayos de biorremediación de suelos. El trabajo planteado tiene profundas implicaciones para estudios en biorremediación y potencialmente podría representar una alternativa de descontaminación de ecosistemas antárticos aprovechando los bio recursos propios de la Antártica. La proyección de este trabajo está asociada a dilucidar completamente los procesos asociados a la degradación de Pseudomonas flavescens D43FB y continuar ensayos de biorremediación en terrarios, y así eventualmente terminar la investigación en un proceso in situ en Antártica<br>Antarctica is the southernmost continent on earth, contains ~80% of the planet's fresh water and presents a series of extreme conditions such as low temperatures and high ultraviolet radiation. Despite this, the man has been able to survive in the region doing scientific and operational activities for over 80 years. Consequently, various inhabited areas have been contaminated mainly with diesel. This compound is harmful, because it is composed by organic molecules such as polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) and heavy metals (Cd, Cr and Pb). Decontamination of PAHs can be accomplished by physical, chemical and biological processes. Biological processes represent an ecological, economical and safe option that involves a minor alteration of the soil and thus is an excellent alternative for the decontamination of the Antarctic territory. To date, a large number of bacteria capable of degrading PAHs has been reported, however due to the Antarctic treaty is prohibited to enter foreign DNA and microorganisms to the mainland, so it is vital to find native bacteria that can be used in diesel bioremediation. Due to its higher solubility in water, lower toxicity to humans and structural similarities to other PAHs, the compound used as a model to isolate and study PAH degraders is phenanthrene. Based on the above, in this thesis the following hypothesis was proposed: "The presence of polycyclic aromatic hydrocarbons and heavy metals in Antarctic soils has favored the development of phenanthrene degrading bacteria resistant to heavy metals". The overall objective of this work was to isolate and characterize Antarctic bacteria resistant to heavy metals (Cd, Cr and Pb) and assess their ability to metabolize phenanthrene. To accomplish this, Antarctic soils obtained from different areas exposed to diesel were characterized chemically and biologically. Also, phenanthrene degrading bacteria resistant to heavy metals were isolated and characterized, and the degradation mechanisms involved were studied. Soil samples were obtained during the 49th expedition to the Antarctic continent (ECA 49), 4 soils none exposed to diesel (A0, B4, C3 and C8) and 4 soils exposed to diesel (D3, D4, E2 and E4). Soil analysis determined the presence of tri-aromatic polycyclic hydrocarbons in soil exposed to diesel, on average 1000 times more concentrated than in soils with no exposure. Moreover, D3 and D4 soils (exposed to diesel) display a greater cadmium concentration and total lead when compared to all samples, ~30 and 600 mg Kg-1, respectively. Regarding the biological characterization, soil exposed to diesel D4, display greater biological activity and heterotrophes, a result that was directly related to PAH content (D4 soil display the highest concentration of hydrocarbons, ~30 mg Kg-1). This relationship was confirmed by a soil enrichment test with phenanthrene, where it was observed that phenanthrene acts as a supplement in soils exposed to diesel. 350 environmental microorganisms were isolated from the 8 Antarctic soils, 53 of them were able to degrade phenanthrene. Three of them were selected for their high capacity to degrade the hydrocarbon. These isolates were selected through a screening developed during this thesis, based on total fluorescence spectroscopy associated to second order multivariate calibration. Selected isolates were characterized and the resistance to heavy metals was determined. In particular, strain D43FB (corresponding to Pseudomonas flavescens) resists 25 mg L-1 of Cd+2 and 5 mg L-1 of Cr+6. After 7 days, this bacterium was able to degrade ~80% of phenanthrene in M9 medium with the hydrocarbon as a sole carbon source. By adding 0.025, 0.05 and 0.5 mg L-1 of Cd+2 this value decreases to 60, 26 and 25 mg L-1, respectively. Moreover, in a bioaugmentation assay of soil the isolate is capable of degrading ̴75 % of PAH present in the terrarium. In the other hand, the capacity of this microorganism to degrade phenanthrene was associated with their ability to form biofilm and adhere to phenanthrene crystals. The proposed work has profound implications for bioremediation studies and potentially could represent an alternative for the decontamination of Antarctic ecosystems. The projection of this work is linked to fully elucidate the mechanism of degradation of Pseudomonas flavescens D43FB and continue testing bioremediation in terrariums, and so eventually complete the investigation with an in situ process in Antarctica<br>Fondecyt, INACH T_19-11 e INACH MT-05_13

La sangre obtenida en el matadero es un producto altamente contaminado que requiere un procesamiento inmediato si se pretende utilizarla como insumo alimentario en la fabricación de productos destinados al consumo humano. Si bien es cierto que los sistemas de higienización podrían ser muy eficientes desde el punto de vista de calidad microbiológica, su instalación en la línea de sacrificio comportaría muchas dificultades desde el punto de vista técnico y en algún caso sería muy costoso. La bioconservación podría ser una alternativa para mejorar la calidad microbiológica de la sangre, alargar su vida útil y reducir las posibilidades de procesamiento inmediato. <br/>El presente estudio nos permitiría formular la posibilidad de aplicar la bioconservación en sangre de cerdo procedente de matadero industrial, utilizando bacterias ácido lácticas (BAL) como cultivo bioprotector, para lo cual se aislaron cepas de BAL autóctonas y se confeccionaron dos colecciones una de BAL mesófilas y otra de psicrótrofas.<br/>Se evaluó el potencial antagonista de la colección de BAL mesófilas y psicrótrofas a 30ºC y a 15ºC respectivamente frente a bacterias contaminantes habituales de este subproducto. Las BAL que demostraron antagonismo en placa (7,1% a 30ºC y 11% a 15ºC) fueron seleccionadas para evaluar el potencial antagonista en sangre, donde el efecto inhibitorio se vio favorecido por la adición de un 2% glucosa. S.aureus y P. fluorescens fueron los indicadores más inhibidos por las cepas mesófilas, en algunos casos con reducciones superiores a 7 unidades logarítmicas. En condiciones psicrótrofas la bacteria más sensible a la presencia de BAL fue Bacillus sp., donde 8 de las 11 BAL ensayadas permitieron reducciones superiores a 4 logs y 1cepa incluso superiores a 7 logs; se obtuvieron reducciones máximas de 3 logs de E.coli y Pseudomonas fue inhibida por todas las BAL ensayadas, en algún caso con reducciones superiores a 5 logs.<br/>Las 5 que cepas que presentaron el espectro de inhibición más amplio en condiciones mesófilas y 7 en condiciones psicrótrofas frente a los microorganismos indicadores contaminantes de sangre de matadero se identificaron mediante técnicas moleculares por comparación de la secuencias correspondientes al gen que codifica la síntesis de 16S ARNr (16S ADNr) con las secuencias publicadas en las bases de datos. <br/>De las 7 cepas antagonistas en condiciones psicrótrofas 5 se identificaron como Lactococcus garvieae y 2 como Enterococcus malodoratus/gilvius raffinosus. Todas las BAL con potencial antagonista en condiciones mesófilas pertenecían al género Lactobacillus, 3 de elllas se identificaron como Lactobacillus murinus/animalis y una se identificó como Lactobacillus reuteri. TA20 que tuvo un gran espectro de inhibición a ambas temperaturas se identificó como Lactococcus garvieae.<br/>En este estudio se evaluaron tres métodos de conservación a largo plazo de las cepas que mostraron potencial antagonista. Se comparó la liofilización, la atomización frente a la congelación a -80ºC que era método que se había utilizado hasta el momento para conservar ambas colecciones de BAL. En general, los métodos de deshidratación (atomización y liofilización) y mantenimiento en refrigeración a 5ºC de los cultivos deshidratados se han mostrado más eficaces que la congelación.<br>Blood from slaughtered animals is a product with a high contamination level that requires an immediately processing after collection if the object is to use it as a food ingredient destined to human consumption. Nevertheless, even if hygienic collection systems used in abattoirs were be efficient enough to control the microbiological quality, their installation in the slaughtered line would be technically complicate and in some case would be so expensive.<br/>Bioconservation is an alternative to improve microbiological quality, to extend its shelf life and reducing the possibility of immediate processing after collection.<br/>The present study would permit us to formulate the possibility to applicate bioconservation in porcine blood from industrial abattoirs, using lactic acid bacteria (LAB) strains as biopreservative cultures. So a mesophylic and a psicrotrophyc LAB strains collections were confectioned.<br/>The antagonistic capacity toward usual contaminant bacteria in blood of the mesophylic and psicrotrophyc collections at 30ºC and 15ºC respectively were investigated. The LAB that demonstrated the widest inhibitory spectrum in agar plate evaluation (7,1% at 30ºC and 11% at 15ºC) were screened in order to evaluate their inhibitory activity in blood, where was observed that the addition of glucose at 2% had a positive effect in the inhibitory levels. <br/>The most sensible indicators to the mesophylic LAB were S. aureus and P. fluorescens. In some cases it was obtained reductions of 7 logarithmic units. In psicotrophic conditions the most sensible bacteria to LAB presence was Bacillus spp. where 8 of the 11 strains assayed inhibited in more than 4 logarithmic units and 1 of them inhibited this indicator in 7 logarithmic units..<br/>It was obtained maxim reductions of 3 logs versus E. coli. P. fluorescens was inhibited by all the assayed strains and in some case it was obtained reductions superior to 5 logs.<br/>The 5 mesophylic and 7 psictrophyc strains that demonstrated the widest inhibitory spectrum toward the indicators microorganisms from abattoir blood were identified using molecular techniques though comparison of the gene sequences that codify the synthesis of 16S RNAr (16S DNAr) with the sequences in the data base.<br/>5 from the 7 strains with antagonistic capacity in psicotrophyc conditions were identified like Lactococcus garvieae and the other two strains were identified like Enterococcus malodoratus/gilvius/raffinosus. All the antagonistic LAB in mesophylic conditions belonged to genus Lactobacillus, 3 of them were identified like Lactobacillus murinus/animalis and one of them as Lactobacillus reuteri. TA20 that had a widest spectrum at both assay temperatures was identified as Lactococcus garvieae.<br/>In this study there were evaluated three methods of conservation of cultures belonged to those LAB that demonstrated antagonistic capacity. It was compared freeze-drying, spray drying against freezing at -80ºC, that is the method used to conserve both LAB collections. Generally, the dehydration methods (freeze-drying and spray drying) and maintaining in refrigeration at 5ºC of dehydrated cultures showed to be better than freezing at -80ºC.

Aisla un bacteriófago lítico denominado Vf1, procedente del mar peruano, capaz de infectar a Vibrio fluvialis, bacteria que afecta humanos y organismos acuáticos. El bacteriófago Vf1 fue caracterizado con respecto a su morfología, estabilidad térmica, diferentes rangos de pH, sensibilidad frente al cloroformo, exposición a la luz UV, rango de hospederos y la curva de crecimiento de un paso. La microscopía electrónica de transmisión, evidenció cabeza de forma icosaedrica con un diámetro de 82.773 nm y un talo largo no contráctil de 142.318 nm de longitud, características propias a la familia Siphoviridae. El fago Vf1, fue resistente al calor a 20°C por 30 minutos, perdiendo su viabilidad a partir de 50 y 60°C; y en valores de pH entre 7 y 8 mantuvo títulos elevados, disminuyendo el título entre 5 y 6, siendo nulo a valores de pH ácido. La viabilidad frente a la exposición al cloroformo, evidenció una reducción en el título del 50% y frente a la luz UV, la reducción fue del 100% a 90 segundos de exposición. En la curva de crecimiento de un paso evidenció un período de latencia de 20 minutos y el tamaño de la explosión o burst size fue 602 partículas por centro infectivo. Los parámetros biológicos evaluados en este estudio evidenciaron el potencial del bacteriófago Vf1 para poder ser utilizado en fagoterapia, además, la metodología evaluada podría ser utilizado para el aislamiento de otros bacteriófagos de ambientes marinos.<br>Tesis

Introducción: Acinetobacter baummannii es el principal patógeno en la lista de la Organización Mundial de la Salud de resistencia antibiótica. Este ha surgido como patógeno a nivel mundial debido a la expansión de clonas epidémicas internacionales (CI) productoras de carbapenemasas de clase D (tipo OXA). Durante la última década, sin embargo, los reportes de la CI-I en Latinoamérica son escasos e inexistentes para las CI-II y CI-III. Objetivo: Este estudio evalúa la resistencia fenotípica, la presencia de mecanismos moleculares de resistencia a carbapenemos y la relación clonal de 80 muestras clínicas de A. baumannii recolectados desde Febrero de 2014 y Abril de 2016 en dos hospitales de tercer nivel en Lima. Materiales y métodos: La identificación de especies se realizó por espectrometría de masas (MALDI-TOF MS), la susceptibilidad antimicrobiana por difusión de discos y E-test, excepto para colistina, que fue determinado por microdilución en caldo de cultivo e interpretado según las guías del CLSI. Para tigeciclina se utilizó las guías EUCAST para Enterobacterias. Los genes de resistencia a carbapenémicos se detectaron por PCR y secuenciación. La relación clonal se estudió por electroforesis de campo pulsado (PFGE) y MLST con el esquema Pasteur. Resultados: La mayoría de las cepas eran resistentes a carbapenémicos (97.5%) y la susceptibilidad se encontraba elevada únicamente para colistina (95%). La electroforesis de campo pulsado identificó dos clonas principales en ambos hospitales: la clona D comprendiendo 51 aislamientos (61.3%) asociada con la secuencia-tipo 2 (ST2) portadora de OXA-72 y la clona F de 13 aislamientos (16.3%), asociada con ST79 y portadora de OXA-72. Estas eran endémicas en al menos un hospital. Se identificaron cepas ST1 y ST3 productoras de OXA-23, representando aislamientos esporádicos. Resulta resaltante la presencia de la nueva variante OXA-253 de la OXA-143 con una nueva secuencia de inserción (ISAba47). Conclusión: Mientras las líneas clonales predominantes de A. baummannii en Latinoamérica se relacionan con ST79, ST25, ST15 y ST1 productoras de OXA-23, en el estudio se reporta el surgimiento de ST2 altamente resistentes (CI-II) productoras de OXA-72 y la primera identificación de ST3 (CI-III) en Latinoamérica, ambas representando un serio riesgo para la salud pública a nivel mundial.<br>Background: Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii is the top-ranked pathogen in the World Health Organisation priority list of antibiotic-resistant bacteria. It emerged as a global pathogen due to the successful expansion of a few epidemic lineages, or international clones (IC), producing acquired class-D carbapenemases (OXA-type). During the last decade, however, reports regarding IC-I isolates in Latin America are scarce and non-existent for IC-II and IC-III isolates. Objective: This study evaluates the phenotypic resistance patterns, the presence of carbapenem-resistance mechanisms and the clonal relatedness of 80 non-duplicate clinical samples of A. baumannii collected from February 2014 through April 2016 at two tertiary care hospitals in Lima. Methods and materials: Species identification was performed by MALDI-TOF MS, antimicrobial susceptibility testing was analysed by disk diffusion and E-test for all antibiotics but colistin, which was determined by broth microdilution, and interpreted according to CLSI guidelines for Acinetobacter spp. Tigecycline results were interpreted following EUCAST guidelines for Enterobacteriaceae. Carbapenemase genes were detected by PCR and Sanger DNA sequencing. The clonal relatedness was examined by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and MLST with the Pasteur scheme. Results: Almost all isolates were carbapenem-resistant (97.5%), and susceptibility only remained high for colistin (95%). PFGE showed two main clusters spread between both hospitals: cluster D containing 51 isolates (63.8%) associated with sequence type 2 (ST2) and carrying OXA-72, and cluster F containing 13 isolates (16.3%) associated with ST79 and also carrying OXA-72. ST2 and ST79 were endemic in at least one of the hospitals. International clone I (IC-I) ST1 and IC-III (ST3) OXA-23-producing isolates were also identified. They accounted for sporadic hospital isolates. Interestingly, two isolates carried the novel OXA-253 variant of OXA-143 together with an upstream novel insertion sequence (ISAba47). Conclusion: While the predominant A. baumannii lineages in Latin America are linked to ST79, ST25, ST15, and ST1 producing OXA-23 enzymes, we report the emergence of highly-resistant ST2 (IC-II) isolates in Peru producing OXA-72 and the first identification of ST3 isolates (IC-III) in Latin America, both considered a serious threat to public health worldwide.<br>Tesis

El desarrollo de la agricultura en el mundo involucra distintos modelos de producción. El esquema predominante responde a la aplicación de un paquete tecnológico. Este modelo agrícola convencional, si bien ha permitido incrementar los rendimientos de cosecha, no ha sabido considerar los impactos negativos que produce sobre el medio. En este punto se destaca el empleo desmedido de fertilizantes químicos, asociado a la eutrofización de cuerpos de agua, disminución de las principales reservas de nutrientes, inmovilización de nutrientes en el suelo con los consecuentes desbalances en cultivos, aumento de los costos de producción, entre otros. En un contexto de desarrollo sustentable surge el concepto de biofertilización, a partir del estudio, conocimiento y utilización de diversos microorganismos que actúan como Promotores del Crecimiento Vegetal. En la provincia de Mendoza, uno de los elementos que más limita el desarrollo de los cultivos es el fósforo, siendo por ello aplicado al suelo a partir de fuentes externas. El presente trabajo se focalizó sobre el estudio de las Bacterias Solubilizadoras de Fósforo, en particular aquellas capaces de solubilizar las formas inorgánicas del elemento. Se trabajó para ello, de forma comparativa, con un suelo implantado con tomate para industria (Solanum lycopersicum L.) y un suelo sin cultivar, localizados en Chacras de Coria, departamento Luján de Cuyo, Mendoza. En tres momentos fenológicos del ciclo del tomate se tomaron muestras de suelo de ambos sitios. Se determinó la presencia de Bacterias Solubilizadoras de Fósforo, el número de unidades formadoras de colonia y se aislaron las formas predominantes para realizar pruebas de eficiencia. Se midieron los índices de solubilización en placa de cada cepa aislada, aquellas que presentaron los valores más altos fueron seleccionadas para realizar pruebas de solubilización en medio líquido. Durante la maduración de frutos se encontró mayor cantidad de bacterias solubilizadoras que en el momento de floración, lo que es coincidente con la mayor demanda del cultivo. En ninguna etapa se hallaron diferencias significativas entre los sitios cultivado y no cultivado respecto a dicha variable. El porcentaje de Bacterias Solubilizadoras de Fósforo respecto a las bacterias aerobias mesófilas totales se incrementó de floración a maduración. La etapa de trasplante debió analizarse como un caso particular, donde el riego y los aportes de materia orgánica resultaron determinantes en la dinámica poblacional microbiana. En floración, se aislaron 33 cepas solubilizadoras, mientras que en maduración se obtuvieron 50. En ambos momentos fenológicos 9 cepas presentaron índices de solubilización mayores a 2, de las cuales 8 correspondieron a muestras de suelo cultivado y sólo una a suelo no cultivado. En trasplante, se aislaron 50 cepas, de las que sólo una presentó un índice de solubilización elevado. De las 19 cepas seleccionadas, hubo tres con una capacidad sobresaliente para solubilizar fósforo en medio líquido. Todas las cepas aisladas fueron conservadas en un cepario en freezer, en medio de cultivo adicionado con glicerol. Se sugiere realizar la identificación de las cepas y efectuar ensayos de bioinoculación con aquellas que reportaron mayor eficiencia.<br>Fil: Scattareggia, Juan Pablo. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias.

Uno de los explosivos nitroaromáticos más utilizados en el mundo es el 2,4,6- trinitrotolueno (TNT), el cual puede permanecer en la naturaleza durante largos periodos de tiempo sin degradarse, debido a la disposición simétrica de los grupos nitro en su estructura. Incluso a bajas concentraciones, el TNT tiene un efecto mutagénico en organismos vivos, desde microorganismos hasta humanos; es cancerígeno y causa diversas enfermedades; por dicho motivo, la presente investigación tuvo como objetivo el aislamiento e identificación molecular de cepas bacterianas, procedentes de un lote de explosivo con contaminación biológica, con la capacidad de degradar el TNT. Se aislaron 5 cepas bacterianas pertenecientes a los géneros Microbacterium, Acidovorax y Diaphorobacter. La cepa S3B perteneciente al género Diaphorobacter, obtuvo un crecimiento superior a las otras cuatro cepas bacterianas empleando únicamente TNT a diferentes concentraciones (20 ppm, 60 ppm y 100 ppm) como fuente de nitrógeno. Finalmente, en el ensayo de degradación del TNT, se obtuvo un porcentaje de degradación del 77.7% de; asimismo, se detectó la liberación de nitritos. La presente investigación muestra el potencial de la cepa S3B para la biorremediación de suelos y aguas contaminadas con TNT.<br>Perú. Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Vicerrectorado de Investigación y Posgrado. Programa de Promoción de Trabajo de Investigación. B20100150a

Los suelos están constituidos con una diversidad de fauna (mega, macro y microorganismos), poco explorada y estudiada. Las lombrices de tierra (invertebrados y macroorganismos del suelo, cuyo ancho es &gt; 2000 μm) y las bacterias (microorganismos que miden entre 0 5 y 5 m) que habitan en el suelo, establecen una relación mutualista (entre organismos de diferente morfología y tamaño), cuando estas últimas colonizan el tracto digestivo de las lombrices (Lavelle et al., 1995). Parece que la gran mayoría de los invertebrados del suelo no poseen enzimas para digerir directamente la celulosa, lignina, taninos y complejos húmicos, en cambio estas enzimas, en su mayoría están presentes en las bacterias.

Helicobacter pylori es un bacilo, microaerófilo y agente etiológico asociado con la enfermedad ácido-péptica en humanos. Actualmente se le conoce responsable del 85-95 % de las úlceras duodenales, 70- 80 % de las úlceras gástricas y tiene protagonismo relevante en el 60- 70 % de los casos de cáncer gástrico, neoplasias más frecuentes a nivel mundial (1,2). En zonas costeras de Colombia (Barranquilla, Cartagena y Santa Marta), un estudio realizado a partir de biopsias gástricas reportó una frecuencia de infección por H. pylori de 77,9% (3). El riesgo de desarrollo, distribución y la severidad de las patologías relacionadas con infección por H. pylori depende de una variedad de factores: la patogenicidad y virulencia de la bacteria, la susceptibilidad del huésped y el nivel socio-económico, entre otros (4–8). Hoy se emplean diversidad de técnicas para el diagnóstico del H. pylori: cultivos microbiológicos, estudios histopatológicos, test del aliento, test rápido de la ureasa, test serológicos, test de antígeno en heces y más recientemente pruebas moleculares de ADN y ARN. Sin embargo, las técnicas convencionales se caracterizan por su complejidad, escaso valor predictivo y costos elevados (9–11). La PCR es la prueba molecular más extensamente usada por su sensibilidad, especificidad y aplicabilidad para detectar microorganismos de difícil aislamiento, como es el caso de H. pylori (12).

La vigilancia pasiva por laboratorio de Streptococcus pneumoniae se realiza en los países de la Región de las Américas desde 1993 bajo la denominación de Sistema Regional de Vacunas (SIREVA), con el apoyo de la Organización Panamericana de la Salud. En 1997, los países de la Región propusieron introducir las pruebas de laboratorio para Haemophilus influenzae, y en el 2000, para Neisseria meningitidis. Así se amplió la vigilancia por laboratorio de las enfermedades bacterianas invasivas con los tres patógenos anteriores, esta vez bajo la denominación de SIREVA II. La red está compuesta por 19 laboratorios nacionales de referencia situados en varios países. Durante los últimos años se han ido incorporando nuevos ensayos, entre ellos pruebas de biología molecular, que facilitan la detección de estos patógenos en muestras biológicas. Los datos de la vigilancia por laboratorio de los países de la Región se recopilan y se presentan desde el 2005 en el Informe regional de SIREVA II. El objetivo principal de esta publicación es compartir información sobre la identificación de estos patógenos en la vigilancia pasiva por laboratorio que realizan los países durante un año calendario, dar seguimiento a la distribución de sus serotipos o serogrupos y correlacionarlos con los presentes en las vacunas disponibles. Esta publicación proporciona información actualizada sobre los aislamientos invasivos de Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae y Neisseria meningitidis de muestras biológicas recogidas durante el 2017 y realizadas en laboratorios de países de las Américas. Los datos de la vigilancia por laboratorio de este informe conservan el esquema de presentación que la red definió hace varios años, pues son necesarios para mantener informados a los programas de salud pública, al personal de laboratorio y a la comunidad científica, así como para facilitar información útil a las decisiones basadas en la evidencia. Estos datos pueden servir para promover estudios adicionales que generen nuevo conocimiento y faciliten la comprensión de estos eventos.

Introducción: La listeriosis es una enfermedad de transmisión alimentaria causada por bacterias del género Listeria. La adquieren los seres humanos, principalmente a través del consumo de alimentos contaminados, como leche, queso y otros productos lácteos. Para tratar esta enfermedad se han utilizado antibióticos como la penicilina, la eritromicina y el meropenem, entre otros. Sin embargo, debido a su uso indiscriminado, entre otros factores, las bacterias han generado una alta resistencia a los antibióticos. Por ello, es necesario implementar nuevas alternativas para controlar las poblaciones bacterianas. Una opción es el uso de la terapia fágica, que se basa en la aplicación de bacteriófagos específicos para infectar y destruir bacterias de forma selectiva. Metodología: En este estudio, aislamos bacteriófagos específicos de Listeria y los caracterizamos molecular y morfológicamente. Para ello, se evaluaron parámetros como su espectro lítico y su cinética lítica, lo que demostró que los bacteriófagos eran capaces de inhibir el crecimiento de Listeria spp. y otras bacterias enteropatógenas. Resultados: los cebadores específicos de los bacteriófagos P40, P35 y P100 determinaron que los fagos eran específicos de Listeria. La microscopía electrónica de transmisión mostró que este fago tenía características de la familia Siphoviridae. Conclusión: Los fagos aislados presentaban características para su uso en fagoterapia.

La resistencia inducida tiene como base la activación de los mecanismos de defensa natural de las plantas antes de la llegada del patógeno. Esta inducción de resistencia se lleva a cabo con agentes bióticos y abióticos, con microorganismos y con agentes químicos sintéticos. En café se han desarrollado varios trabajos utilizando diversos microorganismos no patógenos o patógenos atenuados para tratar de inducir resistencia contra la roya /Hemileia vastatrix/. Dentro de los tratamientos que se han ensayado con este propósito están las formulaciones comerciales con /Bacillus thuringiensis/, aislamientos de la bacteria /Pseudomonas/ spp., urenidiosporas de /H. vastatrix/ inactivadas térmicamente y extractos crudos de células de la bacteria /Xanthomonas campestris/.

La columna de Winogradsky (CdW) es un dispositivo cilíndrico que permite el cultivo de microorganismos en su propio ambiente y bajo condiciones que, debido a los gradientes de nutrientes, oxígeno y a la misma altura de la columna, logran una diferenciación estratificada de la diversidad microbiana que puede generarse en ella. Dentro de la columna se depositan variedad de sustancias como lodos, diferentes sustratos específicos, material orgánico diverso, los cuales se analizan después de un periodo de tiempo de cultivo; permitiendo el aislamiento de grupos bacterianos de interés o accediendo a inóculos que pudieran llevarse a investigaciones en laboratorios, con microorganismos difíciles de cultivar. Al tratarse de un entorno cerrado, las CdW tienen la dificultad para el muestreo y monitoreo de variables de interés, perdiendo información importante de la evolución temporal de dichas variables y su correlación con los resultados finales del cultivo. Desde la bioingeniería es posible el diseño de CdW que permitan ampliar el estudio de microorganismos presentes en los sustratos, y emplearla como base para el aislamiento y selección de microorganismos de interés.

Meta: Evaluar la capacidad de las pruebas HB&amp;L-ESBL/AmpC® and HB&amp;L-Carbapenemase® kits (ALIFAX) para detectar Enterobacterales productores de carbapenemasas y beta lactamasas de espectro extendido (BLEE) y/o AmpC desreprimida en caldo de hemocultivos positivos. Método: Se incluyeron 111 cepas conocidas de Enterobacterales, 41 productoras de BLEE y/o AmpC, 33 de carbapenemasas (EPC) y resto sin estos mecanismos de resistencia. Se inoculó 10 ul de una suspensión 0,5 Mc Farland de la cepas conocidas en frascos de hemocultivos descargados anteriormente como negativos. Cuando el hemocultivo dio aviso positivo se siguieron las recomendaciones del fabricante para el procesamiento con ambas pruebas: HB&amp;L-ESBL/AmpC® y HB&amp;L-Carbapenemase® kits. HB&amp;L Carbapenemase kit fue capaz de detectar los 33 hemocultivos inoculados con aislamientos de EPC mostrando curvas de crecimiento bacteriano ascendente. De las cepas negativas para EPC (n = 78) detectó una como positiva. Por tanto, mostró una sensibilidad de 100% (IC 95% 89,6-100) y una especificidad de 98,7% (IC95% 93,1-99,8). ESBL/AmpC kit detectó como positivos los 33 hemocultivos inoculados con EPC y 39/41 de los inoculados con BLEE y/o AmpC desrreprimida y uma cepa sin mecanismos de resistencia. Por tanto, mostró una sensibilidad de 97,3% (IC 95% 90,7-99,3) y una especificidad de 97,3% (IC95% 86,2-99,5). Conclusión: Ambas pruebas mostraron una performance excelente en relación a la sensibilidad y especificidad permitiendo la detección precoz de bacteriemias causadas por BLEE y carbapenemasas en comparación con los métodos convencionales. Estas pruebas tienen un costo menor que las pruebas moleculares y las inmunocromatográficas con un gran potencial para ser utilizadas en instituciones sanitarias de baja y mediana complejidad, donde estos mecanismos de resistencia sean frecuentes y en las cuales actualmente sólo se utilicen métodos tradicionales.