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Academic literature on the topic 'Alinhamento de genomas'

Author: Grafiati
Published: 4 June 2021
Last updated: 17 February 2022

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Journal articles on the topic "Alinhamento de genomas"

1

Fonseca Jr., A. A., E. A. Costa, T. S. Oliveira, et al. "PCR Multiplex para detecção dos principais herpesvírus neurológicos de ruminantes." Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia 63, no. 6 (2011): 1405–13. http://dx.doi.org/10.1590/s0102-09352011000600018.

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Abstract:
Desenvolveu-se uma PCR multiplex (mPCR) para diagnóstico diferencial de encefalite bovina causada por herpesvírus suíno 1 (SuHV-1), herpesvírus bovino 1 (BoHV-1), herpesvírus bovino 5 (BoHV-5) e herpesvírus ovino 2 (OvHV-2). Os iniciadores foram projetados após alinhamento de sequências disponíveis no banco de genomas (GenBank) e a reação foi padronizada levando-se em consideração a concentração dos reagentes e os tipos diferentes de DNA polimerase. Após determinação da especificidade e sensibilidade, 65 amostras de encéfalo de bovinos com síndrome neurológica foram submetidas à análise. A sen
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2

Santana, Juliano Oliveira, Gonçalo Santos Silva, and Luciano Angelo De Souza Bernardes. "DUAS PROTEÍNAS (TcTIA6 e TcTIA7) ENVOLVIDAS NA BIOSSÍNTESE DA TIAMINA CODIFICADAS PELO GENOMA do Theobroma cacao L." Infarma - Ciências Farmacêuticas 29, no. 3 (2017): 208–13. http://dx.doi.org/10.14450/2318-9312.v29.e3.a2017.pp208-213.

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Abstract:
A tiamina funciona como um cofator para atividades de várias enzimas que atuam no metabolismo de carboidratos e aminoácidos. Este trabalho objetivou analisar através de técnicas de bioinformática os genes responsáveis pela biossíntese da tiamina codificadas pelo genoma do Theobroma cacao L. Foram encontrados dois genes, um no cromossomo6 e outro no 7, sendo nomeados TcTIA6 e TcTIA7. O alinhamento múltiplo da TcTIA6 e TcTIA7 revelou alta identidade com a proteína da Arabidopis thaliana e seu direcionamento é destinado para a rota secretora do cloroplasto. Foram observados motifs conservados na
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3

Lima, P. P., M. A. Rocha, D. Stancek, A. M. G. Gouveia, and G. D. R. Oliveira. "Vírus da artrite encefalite caprina: isolamento e caracterização de parte do gene gag." Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia 56, no. 2 (2004): 135–42. http://dx.doi.org/10.1590/s0102-09352004000200001.

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Abstract:
Amostras de sangue de 12 animais soropositivos pelo teste de imunodifusão em gel de agarose e que não apresentavam sinais clínicos sugestivos de infecção pelo vírus da artrite-encefalite caprina (CAEV) foram coletadas para isolamento viral. Mácrofagos derivados de monócitos foram co-cultivados com células de membrana sinovial caprina (MSC), resultando em cinco amostras que apresentaram efeito citopático característico do tipo persistente, semelhante ao observado para o CAEV. Uma técnica de reação em cadeia de polimerase (PCR) foi padronizada para amplificar parte do gene gag do genoma pró-vira
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4

Gonçalves, Marcos Cesar, Diogo Manzano Galdeano, Ivan de Godoy Maia, and César Martins Chagas. "Variabilidade genética de Sugarcane mosaic virus, causando mosaico em milho no Brasil." Pesquisa Agropecuária Brasileira 46, no. 4 (2011): 362–69. http://dx.doi.org/10.1590/s0100-204x2011000400004.

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Abstract:
O objetivo deste trabalho foi caracterizar biológica e molecularmente três isolados de Sugarcane mosaic virus (SCMV) de lavouras de milho, analisá-los filogeneticamente e discriminar polimorfismos do genoma. Plantas com sintomas de mosaico e nanismo foram coletadas em lavouras de milho, no Estado de São Paulo e no Município de Rio Verde, GO, e seus extratos foliares foram inoculados em plantas indicadoras e submetidos à análise sorológica com antissoros contra o SCMV, contra o Maize dwarf mosaic virus (MDMV) e contra o Johnsongrass mosaic virus (JGMV). Mudas de sorgo 'Rio' e 'TX 2786' apresent
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5

Silva, Mayara I. V., Cristiane S. Chitarra, João X. de Oliveira Filho, et al. "Identificação de transcritos diferencialmente expressos por Pasteurella multocida em condições de privação de ferro." Pesquisa Veterinária Brasileira 36, no. 10 (2016): 965–70. http://dx.doi.org/10.1590/s0100-736x2016001000008.

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Abstract:
RESUMO: Ferro (Fe) é um elemento essencial e a capacidade de adquiri-lo in vivo têm sido descrita em diversos agentes patogênicos através de fatores de virulência. Análises de transcritos durante a privação de Fe tem sido descritos através da técnica de "microarray", entretanto a técnica de RNA-seq recentemente tem demonstrado resultados superiores. Neste trabalho, o isolado de Pasteurella multocida (Pm 16759) altamente patogênico em suínos foi cultivado em duas condições com diferentes concentrações de Fe (controle e privação) com o objetivo de analisar transcritos diferencialmente expressos.
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6

Queiroz, Jackson Alves da Silva, Luciane Soares Alves, Deusilene Souza Vieira Dall’acqua, and Luan Felipo Botelho Souza. "Desenho e Validação de Primers In Silico para Detecção do Vírus Sincicial Respiratório Humano." REVISTA FIMCA 4, no. 1 (2017): 17–30. http://dx.doi.org/10.37157/fimca.v4i1.6.

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Abstract:
Introdução: O desenvolvimento de primers é extremamente importante para pesquisas moleculares. Objetivos: O presente estudo objetivou desenhar e validar primers in silico para detecção do vírus sincicial respiratório humano (RSVH). Materiais e Métodos: Foi construído um banco de 100 sequências de genoma completo do Vírus Sincicial Respiratório Humano (RSVH) depositadas no Genbank (NCBI). Realizado um alinhamento múltiplo global utilizando o algoritimo Clustal W, mapeadas as regiões conservadas e selecionado os primers. Posteriormente submetidos a análise dos parâmetros especificidade, pela fer
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Bruna Luiza Correia, Felipe José Estevão, Marcela Leite, Jamille Silva dos Santos, and Giselle Camargo Mendes. "AVALIAÇÃO DE CARACTERÍSTICAS MORFOLÓGICAS E AGRONÔMICAS DE SELEÇÃO DE MUTANTES DE ARROZ (oryza sativa)." Anais da Mostra Nacional de Iniciação Científica e Tecnológica Interdisciplinar (MICTI) - e-ISSN 2316-7165 1, no. 13 (2020). http://dx.doi.org/10.21166/micti.v1i1.1547.

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Abstract:
O trabalho é inserido dentro do projeto “macro” que visa a identificação de acessos desementes mutantes de arroz (Oryza sativa), obtidas em um banco de germoplasma, que mostratolerância e produtividade com o objetivo futuro de utilização da técnica de sequenciamentodo genoma (NGS - Next Genome Sequence) para identificar do local da mutação. Para isso, éimportante que tenhamos um conhecimento das técnicas de bioinformática, banco de dados ealinhamentos de sequência, e também técnicas de programação, a fim de conseguirmosmontar o genoma. Nesse contexto, o objetivo deste trabalho foi utilização d
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Dissertations / Theses on the topic "Alinhamento de genomas"

1

Epamino, George Willian Condomitti. "Alinhamento múltiplo de genomas de eucariotos com montagens altamente fragmentadas." Universidade de São Paulo, 2017. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-31102017-102826/.

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Abstract:
O advento do sequenciamento de nova geração (NGS - Next Generation Sequencing) nos últimos anos proporcionou um aumento expressivo no número de projetos genômicos. De maneira simplificada, as máquinas sequenciadoras geram como resultado fragmentos de DNA que são utilizados por programas montadores de genoma. Esses programas tentam juntar os fragmentos de DNA de modo a obter a representação completa da sequência genômica (por exemplo um cromossomo) da espécie sendo sequenciada. Em alguns casos o processo de montagem pode ser executado com maior facilidade para organismos com genomas de tamanhos
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Pizauro, Lucas José Luduverio. "Caracterizaçao de estirpes de Staphylococcus spp isoladas em ambiente de ordenha e no leite bubalino /." Jaboticabal, 2017. http://hdl.handle.net/11449/148914.

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Abstract:
Orientador: Luiz Francisco Zafalon<br>Coorientador: Fernando Antônio de Ávila<br>Coorientador: Oswaldo Durival Rossi Junior<br>Banca: Maurício de Alvarenga Mudadu<br>Banca: Luciano Menezes Ferreira<br>Banca: Hélio José Montassier<br>Banca: Marita Vedovelli Cardozo<br>Resumo: Tendo em vista a importância e o crescente interesse na produção de leite de búfala e seus derivados e da ocorrência de Staphylococcus coagulase negativa (SCN) como patógenos da mastite tanto em bovinos como em bubalinos. O presente estudo objetivou avaliar genes de virulência, a resistência a antimicrobianos, bem como met
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