Dissertations / Theses: 'Análises em tempo real'

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Bognar, Carlos Eduardo. "Aplicação de análises multivariadas em meta-raciocínio bayesiano: uma abordagem para sistemas especialistas de tempo-real." Instituto Tecnológico de Aeronáutica, 2008. http://www.bd.bibl.ita.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=598.

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Abstract:

Redes Bayesianas (RB) oferecem um método prático para o tratamento de incertezas em sistemas especialistas probabilísticos. Considerando que os problemas de atualização de crença e revisão crença em redes multiplamente conectadas são NP-Difíceis, alguns pesquisadores aplicaram processos de meta-raciocínio às inferências, para selecionar algoritmos para as tarefas. Quando possível, os métodos exatos devem ser adotados. Caso contrário, os algoritmos aproximados podem ser selecionados. Como a qualidade das inferências aproximadas varia a cada instância, os dados de entrada contêm características que afetam os desempenhos dos algoritmos. O problema de meta-raciocínio investigado está relacionado com a escolha do algoritmo para uma determinada instância de inferência, considerando restrições temporais. Para realizar meta-raciocínio, essa Tese propõe um método de caracterização da RB e associação conjunta dessas características, aplicando análises multivariadas. Os modelos são utilizados para a predição da probabilidade de que um algoritmo exato possa ser adotado em uma instância específica ou para a escolha do algoritmo aproximado com a melhor qualidade dos resultados. Análises experimentais comparam algumas abordagens alternativas, tais como análise de regressão simples, curvas de utilidade e técnicas de aprendizagem de máquina, mostrando resultados superiores quando análises multivariadas são aplicadas no processo de meta-raciocínio.

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Yoshioka, Marcelo Ehara. "Análise em tempo real de comportamento explosivo em preços no Brasil." reponame:Repositório Institucional do FGV, 2013. http://hdl.handle.net/10438/10587.

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Abstract:

Submitted by marcelo yoshioka (marcelo.ehara@gmail.com) on 2013-03-05T18:48:21Z No. of bitstreams: 1 Dissertação MPFE - Marcelo Ehara.pdf: 697348 bytes, checksum: c264ac718862b8315410772444b9eb00 (MD5)
Approved for entry into archive by Suzinei Teles Garcia Garcia (suzinei.garcia@fgv.br) on 2013-03-05T19:25:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação MPFE - Marcelo Ehara.pdf: 697348 bytes, checksum: c264ac718862b8315410772444b9eb00 (MD5)
Made available in DSpace on 2013-03-06T12:39:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação MPFE - Marcelo Ehara.pdf: 697348 bytes, checksum: c264ac718862b8315410772444b9eb00 (MD5) Previous issue date: 2013-02-04
his study aims to determine the existence of explosive behavior in prices in the Brazilian market and identify when these explosions occurred. The approach consists of using a new methodology based on recursive unit root tests, which identifies the beginning and ending dates of price bubbles. For empirical tests were used market indexes (Bovespa adjusted for dollar and dividend yield) and IGP-DI price series (monthly inflation rate and accumulated 12 months inflation rate), which show evidences of explosive behavior over time. The results show the existence of explosive behavior for the Bovespa index (adjusted for dollar) in 1997, 2006 and 2008 (the period prior to the bankruptcy of Lehman Brothers) and for the IGP-DI inflation rate (accumulated 12 months) in the 80's and 90's, prior to Plano Real.
O objetivo deste trabalho é determinar a existência de comportamento explosivo em preços no mercado brasileiro e identificar quando essas explosões ocorreram. Para tanto, foi utilizada uma nova metodologia recursiva de testes de raiz unitária, que identifica início e fim de explosões de preços em tempo real. Foram escolhidos os índices de mercado (Bovespa ajustado pelo dólar e pelo dividend yield do mercado) e a série de preços IGP-DI (taxa de inflação mensal e acumulada em 12 meses) por apresentarem evidências de comportamento explosivo ao longo do tempo. Os resultados obtidos apontaram a existência de comportamentos explosivos nas séries do Ibovespa ajustado pelo dólar nos anos de 1997, 2006 e 2008 (período anterior à quebra do Banco Lehman Brothers) e na taxa de inflação acumulada em 12 meses nas décadas de 80 e 90, previamente ao Plano Real.

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Ochioni, Alan Clavelland. "Análises de polimorfismos dos genes de mediadores inflamatórios envolvidos na obesidade." reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ, 2016. http://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/16232.

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Abstract:

Submitted by Gilvan Almeida (gilvan.almeida@icict.fiocruz.br) on 2016-10-11T17:33:25Z No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 72052.pdf: 1837714 bytes, checksum: cf69bd1db44cd16b914fb1a4bf1b07fe (MD5)
Approved for entry into archive by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2016-10-13T18:33:35Z (GMT) No. of bitstreams: 2 72052.pdf: 1837714 bytes, checksum: cf69bd1db44cd16b914fb1a4bf1b07fe (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
Made available in DSpace on 2016-10-13T18:33:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 72052.pdf: 1837714 bytes, checksum: cf69bd1db44cd16b914fb1a4bf1b07fe (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Hoje em dia, a obesidade constitui-se num sério problema mundial de saúde e tem sido a maior causa de morbidade e mortalidade associada ao aumento do risco para algumas doenças comuns, como diabetes mellitus tipo 2, doenças cardiovasculares, hipertensão, certas formas de câncer e síndromes metabólica. O aumento de peso surge através de ações conjuntas dos fatores ambientais e genéticos, em particular naqueles que já são geneticamente predispostos. Alguns estudos vêm investigando os fatores genéticos que predispõem a obesidade, porém os resultados ainda não são bem compreendidos. O presente trabalho tem como objetivo analisar alguns dos polimorfismos dos genes que codificam citocinas pró-inflamatórias e anti-inflamatórias, quimiocinas e adipocitocinas. O estudo desses genes pode ajudar a definir um perfil de risco associado ao desenvolvimento de processos inflamatórios na obesidade e trazer expectativas de um desenvolvimento mais efetivo de prevenção e intervenção terapêutica. O estudo está sendo realizado a partir de 190 obesos e 180 eutróficos. As análises dos polimorfismos foram realizadas utilizando técnicas de biologia molecular tais como: PCR convencional, PCR-RFLP e PCR em tempo real O sequenciamento foi realizado para a validação dos resultados encontrados por PCR convencional e RFLP. Resultados preliminares mostraram que no polimorfismo rs7799039, localizado na região promotora do gene LEP, o alelo G (selvagem) é um fator de risco para os obesos (\03C72=19,19, p<0,001; OR=1,974). Outro polimorfismo (rs2167270) do mesmo gene apresentou o alelo mutado A como um fator de risco para a obesidade (\03C72=8,24; p=0,04). Entretanto foram observados resultados significativos para a associação de outros polimorfismos nos genes IL-6 (rs1800795) e IL-10 (rs1800872), com comorbidades em obesos. Contudo, nossas análises revelaram que o polimorfismo rs1800795 do gene IL-6 está influenciando a variável bioquímica LDL nos obesos (p= 0,02) e este pode ser um fator de risco para a SM. A deleção de 14pb no polimorfismo rs3917887 do gene MCP-1 apresenta efeitos significantes em variáveis como o IMC, HDL e LDL (p=0,03, p=0,04 e p=0,05, respectivamente) e da Proteína C Reativa (PCR) nos obesos. Além disso, análises baseadas na concentração da Proteína C-Reativa revelaram que os polimorfismos estudados podem estar associados ao risco de inflamação visto em obesos
Abstract: Nowadays, obesity constitutes a serious global health problem and has been a major cause of morbidity and mortality associated with an increased risk for some common diseases such as type 2 diabetes, cardiovascular disease, hypertension, certain forms of cancer and metabolic syndrome (MS). Weight gain comes through joint actions of environmental and genetic factors, particularly to whom are already genetically predisposed. Some studies have investigated the genetic factors that predispose to obesity, but the results are not yet well understood. This study aims to analyze some of the polymorphisms of genes encoding proinflammatory cytokines, anti-inflammatory cytokines, chemokines and adipocytokines. The study of these genes can help define a risk profile associated with the development of inflammation in obesity and bring expectations of a more effective development of preventive and therapeutic intervention. The study is being conducted from 190 obese and 180 normal weight. The analyzes of the polymorphisms were carried out using molecular biology techniques such as conventional PCR, PCR-RFLP and PCR in real time Preliminary results showed that in the polimorfism rs7799039, located in the promoter region of the LEP gene, the allele G (wild) is a risk factor for obesity (\03C72 = 19.19, p <0.001; OR = 1,974), another polymorphism (rs2167270 ) also into the same gene show the mutated allele as a risk factor for obesity (\03C72 = 8.24; p = 0.04). However we did not show significant results for an association of polymorphisms in other genes such as IL-6 (rs1800797), IL-10 (rs1800872), TNF-\03B1 (rs180629) and MCP-1 (rs3917887) for the development of other co-morbidities in obese. However our analyzes revealed that the rs1800795 polymorphism of the IL-6 gene is influencing LDL in obese patients (p = 0.02) and this can be a risk factor for MS. On the other hand, deletion of 14pb in rs3917887 polymorphism of MCP-1 gene show significant effects on variables such as BMI, HDL and LDL (p = 0.03, p = 0.04 and p = 0.05 respectively) and Protein C-reactive (PCR) in obeses. Furthermore, analysis based on the concentration of the PCR revealed that the studied polymorphisms may be associated with the risk of inflammation in obese subjects

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Neto, Celso de Campos Toledo. "Ciclos do produto brasileiro: decomposição e análise em 'tempo real'." Universidade de São Paulo, 2004. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/12/12138/tde-28072004-110113/.

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Abstract:

Esta tese é composta de três artigos. O primeiro artigo aplica a metodologia proposta por Chari, Kehoe e McGrattan (2003) para decompor as flutuações da indústria brasileira, usualmente medidas por meio da aplicação de filtros mecânicos. Sugere-se que os ciclos encontrados pela utilização do filtro Hodrick Prescott (ou qualquer filtro band pass) englobam oscilações econômicas cuja origem pode ser deslocamentos tanto da demanda quanto da oferta. Em particular, as simulações a partir de dados reais indicam que a maior parte dos ciclos brasileiros têm origem na oferta. Este resultado sugere que a calibração da política monetária a partir da noção usual de hiato do produto é potencialmente falha. De fato, estimativas da curva IS a partir dos componentes cíclicos associados à oferta e à demanda mostra que o impacto negativo de uma elevação de juros é relativamente maior sobre a oferta. De certa forma, portanto, há um viés inflacionário no uso da política monetária. Uma estimativa da Curva de Philips com o componente cíclico associado às mudanças de demanda revela coeficiente positivo maior do que o observado em modelos estimados com a medida usual de hiato do produto. O segundo artigo compara a performance de filtros band pass com a do filtro Hodrick Prescott na determinação dos ciclos do produto brasileiro. Conclui-se, com base em inspeção do desempenho na amostra de dados disponível e em simulações de Monte Carlo, que o filtro Hodrick Prescott é inferior às alternativas consideradas quando o objetivo é extrair os ciclos em tempo real. Essa conclusão é válida para dois modelos estatísticos alternativos de descrição do PIB: (i) supondo que a variável é I(0) em torno de uma tendência linear com quebras e (ii) supondo que a variável é I(1). Há também robustez com relação ao parâmetro de comparação do desempenho dos filtros. O terceiro artigo obtém: (i) uma série do PIB trimestral dessazonalizado perfeitamente compatível com as variações anuais, desde 1980, corrigindo um problema de ajustamento existente na série disponível eletronicamente; (ii) uma série confiável desde 1970, a partir de técnicas de desagregação temporal utilizando indicadores; (iii) uma série trimestral desde 1947 que, provavelmente, preserva uma parcela razoável dos componentes do PIB normalmente associados aos ciclos econômicos e; (iv) uma série alternativa que, provavelmente, incorpora uma parte dos componentes irregulares do período que vai de 1956 a 1969.
The first paper applies the methodology proposed by Chari, Kehoe and McGrattan (2003) to analyze cyclical fluctuations of the Brazilian industry, usually obtained by means of mechanical filters. The results suggest that filter-obtained cycles using the Hodrick Prescott filter or a band pass filter include components originated from supply and demand disturbances. Particularly, the simulations indicate that most Brazilian cycles are due to supply movements. This result leads to the conclusion that calibrating monetary policy based on a filter-obtained output-gap is potentially flawed. Indeed, IS curve estimations using supply-driven and demand-driven cyclical components show that the impact of monetary policy is more significant in the former than the latter. Thus, it would seem that there is an inflation bias in current monetary policy practice. The paper shows also that a Phillips Curve estimated from demand-driven cyclical components reveals a higher coefficient than one obtained by the usual regressions. The second paper compares the performance of band pass filters with the Hodrick Prescott filter in terms of their ability to extract the cycles of Brazilian GDP in real time. Using actual and artificial data, the simulations indicate that the Hodrick Prescott filter is inferior. This conclusion holds for two alternative models to describe the GDP dynamics: (i) supposing the series is I(0) around a deterministic trend with a few structural breaks and (ii) supposing the series is I(1). The results are also robust with respect to more than one benchmark chosen to evaluate the performance of the filters. The third paper obtains: (i) a seasonally adjusted quarterly GDP series for the period 1980 to 2002, that is perfectly compatible with the annual National Accounts real variations, correcting a step problem present in the electronically available series; (ii) a reliable series going back to 1970, using temporal disaggregation methods with indicators; (iii) a series going back to 1947 that, most likely, preserves a reasonable amount of the cyclical components of the GDP and (iv) a series going back to 1956 that is likely to include part of the irregular components.

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Valério, Alberto Januário Gontijo. "Uma análise em tempo real dos dados do PIB brasileiro." reponame:Repositório Institucional do FGV, 2018. http://hdl.handle.net/10438/20515.

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Abstract:

Submitted by Alberto Valeri (albertovalerio19@hotmail.com) on 2018-03-07T21:09:16Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_AlbertoValerio a.pdf: 610344 bytes, checksum: d643747dd044c6996b8870797758554a (MD5)
Rejected by Thais Oliveira (thais.oliveira@fgv.br), reason: Prezado Alberto, boa noite. Para que possamos aprovar seu trabalho, serão necessárias as seguintes alterações: - Na capa, seu nome deve estar 3 cm abaixo do nome da Escola; - O Título de todas as páginas (título principal, agradecimentos, lista de figuras, tabelas e etc) devem ser centralizados, letra maiúscula e negrito; - A contagem das páginas começa na capa, e a numeração aparece a partir da Introdução. Por gentileza, altere e submeta novamente. Qualquer dúvida, entre em contato. Thais Oliveira mestradoprofissional@fgv.br/ 3799-7764 on 2018-03-07T23:48:13Z (GMT)
Submitted by Alberto Valeri (albertovalerio19@hotmail.com) on 2018-03-09T00:21:51Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_AlbertoValerio a.pdf: 613279 bytes, checksum: a9f816a13083c6e0464a115053169d93 (MD5)
Rejected by Thais Oliveira (thais.oliveira@fgv.br), reason: Prezado Alberto, boa tarde. Para que possamos aprovar sua Dissertação, é necessário que remova a data da aprovação. Deve manter o espaço em branco. Por gentileza, alterar e submeter novamente. Atenciosamente. on 2018-03-09T19:32:27Z (GMT)
Submitted by Alberto Valeri (albertovalerio19@hotmail.com) on 2018-03-09T22:03:38Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_AlbertoValerio a.pdf: 613213 bytes, checksum: 84a1f2eec3846c455389e5859bbf7f9d (MD5)
Approved for entry into archive by Thais Oliveira (thais.oliveira@fgv.br) on 2018-03-12T18:21:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação_AlbertoValerio a.pdf: 613213 bytes, checksum: 84a1f2eec3846c455389e5859bbf7f9d (MD5)
Made available in DSpace on 2018-03-13T13:04:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_AlbertoValerio a.pdf: 613213 bytes, checksum: 84a1f2eec3846c455389e5859bbf7f9d (MD5) Previous issue date: 2018-02-05
Neste trabalho há uma comparação entre os dados vintage e dados finais, ou seja, dados disponíveis imediatamente ao mercado e agentes de política monetária e os dados revisados posteriormente ao longo do tempo. A análise é feita do hiato do produto derivado do PIB brasileiro nas duas situações do período de 1996 a 2016. Para a decomposição do PIB, foram utilizados filtro HP, filtro de Beveridge-Nelson e modelo Espaço-Estado, sendo este trabalho uma atualização e inovação ao trabalho de Curcinato et All (2013), 'Output Gap and GDP in Brazil: a real-time data analysis', implementando o filtro de Beveridge-Nelson e modelo Espaço-Estado. Os resultados são similares na conclusão final de ambos os trabalhos, porém nesta obra constatou-se uma maior revisão de 0.9 p.p. da média absoluta entre dados vintage e dados finais, enquanto na obra anterior constatou-se 0.7 p.p.
In this work there is a comparison between the real-time data and revised data, i.e., data available immediately to the market and monetary policy agents and the data revised later on over time. The analysis is made of the output gap of Brazilian GDP in both situations from 1996 to 2016. For the GDP decomposition, we used HP filter, Beveridge-Nelson filter and Space-State model, this work being an update and innovation to the work of Curcinato et All (2013), 'Output Gap and GDP in Brazil: time data analysis,' implementing the Beveridge-Nelson filter and Space-State model. The results are similar in the final conclusion of both works, however in this work a greater revision of 0.9 p.p. of the absolute average between real time data and revised data was verified whereas in the previous work it was verified 0.7 p.p.

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Fonseca, Ana Carolina Proença da. "Análises dos polimorfismos dos genes ADIPOQ, RARRES2, PGC1-\03B1 e FNDC5 e suas possíveis associações ao desenvolvimento da obesidade no Rio de Janeiro." reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ, 2014. https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/12496.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2016-01-07T13:36:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 ana_fonseca_ioc_mest_2014.pdf: 3492833 bytes, checksum: 633b4170768a3cc30468b07649be16d0 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-04-14
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
A obesidade é um sério problema mundial de saúde e tem sido associada ao aumento de risco para doenças comuns como a diabetes mellitus tipo 2, cardiovasculares, hipertensão, certas formas de câncer e síndrome metabólica. Segundo dados da Organização Mundial da Saúde, existem mais de um bilhão de adultos com sobrepeso, e pelo menos 500 milhões de obesos, o que caracteriza a obesidade como um grave problema atual. O aumento de peso surge através de ações conjuntas dos fatores ambientais e genéticos, em particular naqueles indivíduos que já são geneticamente predispostos. Estudos têm investigado os fatores genéticos que predispõem à obesidade, embora tais fatores ainda sejam pouco compreendidos. Os genes candidatos à predisposição da obesidade estão relacionados com a regulação da fome, balanço energético, metabolismo de lipídeos e glicose; e diferenciação de adipócitos. Este trabalho teve como objetivo o estudo de polimorfismos nos genes ADIPOQ (rs17366568 e rs182052), RARRES2 (rs17173608 e rs4721), PGC1-\03B1 (rs8192678 e rs3736265) e FNDC5, no intuito de analisar uma possível associação ao desenvolvimento de obesidade e complicações metabólicas associadas. A genotipagem dos polimorfismos foi realizada em 244 indivíduos, sendo 136 pacientes com obesidade e 108 eutróficos Os polimorfismos estudados foram analisados por PCR em tempo real usando sondas TaqMan e sequenciamento automático. Nossos principais resultados mostraram os obesos exibindo altos níveis de IMC, circunferência abdominal, circunferência do quadril, pressão arterial, glicemia, triglicerídeos, VDL colesterol, proteína C reativa e hemoglobina glicada; e exibiram baixos níveis de HDL colesterol, quando comparados aos eutróficos. Além disso, estes obesos foram mais susceptíveis a diabetes mellitus tipo 2, síndrome metabólica e hipertensão. Em relação às análises moleculares, nós encontramos associações entre o polimorfismo rs3736265 e o haplótipo rs17366568/ rs182052 com a obesidade. Além disso, o polimorfismo rs182052 estava influenciando os traços de obesidade nos pacientes mórbidos, enquanto que o polimorfismo rs17173608 estava influenciando estes traços em ambos os indivíduos obesos e ix eutróficos; e o polimorfismo rs8192678 influenciou o peso nos controles. Com relação aos parâmetros pressóricos e bioquímicos, nós observamos que o polimorfismo rs17173608 estava associado com os altos níveis de glicose nos indivíduos com IMC normal. Já os SNP rs8192678 e rs113173936 tinham efeitos na pressão arterial de obesos. Além disso, os polimorfismos rs3736265 e rs72882318 apresentaram efeitos nos níveis de VDL colesterol e triglicerídeos também em obesos. Finalmente, nossos resultados mostraram que os polimorfismos rs3736265 e rs4721 estavam associados com a síndrome metabólica e a diabetes mellitus tipo 2, respectivamente. Nós concluímos que estes polimorfismos influenciam de diferentes formas a obesidade e as complicações metabólicas
Obesity is a serious health problem worldwide and h as been a major cause of morbidity and mortality associated with an increased risk for some common diseases such as type 2 diabetes mellitus, cardiovascular, hypertension, certain types of cancer and metabolic syndrome. According to the World Health Organi zation, there are more than one billion adults overweight and at least 500 million obese, which characterizes obesity as a serious problem today. Weight gain gives rise due to actions regarding environmental and genetic factors , in particular those who are already genetically predisposed. Studies have investigated the genetic factors that predispose to obesity, although these factors are still poorly understood . The candidate genes associated to obesity predisposition has been associated to the regulation o f hungry, the energy balance, lipid and glucose metabolism; and adipocyte differentiation. This project aims to study the polymorphism of ADIPOQ (rs17366568 and rs182052), RARRES2 (rs17173608 and rs4721), PGC1 - α (rs8192678 and rs3736265) and FNDC5 gene, in order to analyze a possible association with the development of obesity and metabolic complications associated with it. Genotyping of these polymorphisms was performed for 244 subjects, being136 patients with obesity and 108 non - obesity controls. The polymorphisms studied in this project were analyzed by real - time PCR using TaqMan probes and automated sequencing. Our main results showed that obese subjects exhibiting high levels of BMI, abdominal circumfe rence, hip circumference, blood pressure, fasting glucose, triglycerides, VDL - cholesterol, C - reactive protein and glycated haemoglobin, and exhibited lower levels of HDL - cholesterol when compared to controls . Furthermore, these obese subjects were more sus ceptible of type 2 diabetes, metabolic syndrome and hypertension. Regarding the molecular analysis, we found association of rs3736265 polymorphism and rs17366568/rs182052 haplotype with obesity. Moreover, rs182052 polymorphism was influencing traits of obe sity in morbid patients, while rs17173608 polymorphisms were influencing traits in both lean and obese subjects and rs8192678 SNP influenced only weight with control subjects only the weight of controls . Regarding to the blood pressure and biochemical para meters, we observed that rs17173608 polymorphism was associated with high levels of fasting glucose in normal BMI subjects. Already rs8192678 and rs113173936 SNP had effects of blood pressure in obese patients. Furthermore, rs3736265 and rs72882318 polymor phisms had effects of VDL - cholesterol and triglycerides levels in obese subjects. Finally, our results showed that rs3736265 and rs4721 polymorphisms were associated with metabolic syndrome and type 2 diabetes, respectively. We conclude that these polymorp hisms influence the obesity in different ways and metabolic complications as well .

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Rebolho, Daniela Cristina. "Um método para identificação de parâmetros modais em tempo real." Universidade de São Paulo, 2006. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/18/18135/tde-26102015-090930/.

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Abstract:

Na Indústria Aeronáutica, é de extrema importância a qualidade e o desempenho de seus produtos, que estão diretamente relacionados ao projeto e ao desenvolvimento de estruturas adequadas, pois além de seu caráter funcional deve-se também garantir a sua integridade nas mais diversas condições de operação. O comportamento dinâmico destas estruturas é um dos seus principais aspectos, principalmente devido à demanda contínua para estruturas mais leves e consequentemente mais flexíveis. Tradicionalmente, as estruturas aeroespaciais devem ser submetidas a alguma forma de verificação antes do voo, de forma a assegurar que a aeronave esteja livre de qualquer fenômeno de instabilidade aeroelástica, que pode ocorrer provocando problemas de fadiga ou falhas estruturais. Um dos fenômenos de instabilidade mais importantes é denominado flutter. As técnicas de ensaio em voo para identificação de flutter são de extrema importância para o conhecimento dos limites de voo seguro. Um dos elementos essenciais para a realização de ensaios de flutter em voo é o processo de identificação dos parâmetros modais estruturais da aeronave sob teste. A identificação precisa e rápida dos parâmetros modais permite determinar com antecedência e segurança as condições de voo em que o fenômeno de flutter irá ocorrer. Atualmente as pesquisas nesta área apontam na direção do desenvolvimento de tecnologia que permita a identificação em tempo real dos parâmetros modais associados ao flutter. Neste trabalho foi realizado o estudo de um método de identificação de parâmetros modais para ser aplicado em tempo real. O método de identificação utilizado para este estudo é o EERA - Extended Eigensystem Realization Algorithm, um método de identificação no domínio do tempo considerado eficiente e poderoso, pois é capaz de identificar o comportamento dinâmico complexo em estruturas. O algoritmo foi validado através de um ensaio experimental num modelo de asa no túnel de vento, onde foram determinados os parâmetros modais envolvidos no flutter. Também foi realizado um ensaio experimental numa placa de alumínio, onde foram identificados os seus parâmetros modais, frequências naturais e fatores de amortecimento. Após sua validação, o método EERA foi adaptado e programado no equipamento de aquisição e processamento de sinais dSPACE®, que é destinado a realizar identificação em tempo real. Por último foi realizado um ensaio experimental em tempo real na placa de alumínio utilizada anteriormente, onde os parâmetros modais identificados on-line foram comparados com os identificados off-line, comprovando assim a eficiência do método na identificação em tempo real.
In the Aeronautical Industry, the quality and the performance of its products, that are directly related to the project and the development of adequate structures, are of extreme importance, since, beyond their functional characteristics, their integrity, in the most diverse operation conditions, must also be guaranteed. The dynamic behavior of these structures is one of its main aspects, mainly due to continuous demand for lighter and consequently more flexible structures. Traditionally, the aerospace structures must be submitted to some form of verification before the flight, to assure that the aircraft is free of any aeroelastic instability phenomenon, which when occurring will provoke structural fatigue problems or failure. One of the more important instability phenomena is called flutter. The techniques of flight test for identification of flutter are of extreme importance for the knowledge of the limits of safe flight. One of the essential elements for the accomplishment of flutter tests in flight is the process of identification of the structural modal parameters of the aircraft under test. The accurate and fast identification of the modal parameters allows determining, with antecedence and security, the flight conditions where the phenomenon of flutter will occur. Currently the research in this area points in the direction of developing the technology that allows the identification in real time of the modal parameters associated to flutter. In this work the study of a method of identification of modal parameters was carried through to be applied in real time. The method of identification used for this study is the EERA - Extended Eigensystem Realization Algorithm, a method of identification in the time domain considered efficient and powerful, since it is capable to identifying complex dynamic behavior in structures. The algorithm was validated with an experimental test in a model of wing in the wind tunnel, where the involved modal parameters in flutter had been determined. Also an experimental test was carried out with an aluminum plate, where its modal parameters, natural frequencies and damping factors, had been identified. After its validation, the method EERA was adapted and programmed in the dSPACE® signals acquisition and processing equipment, which is used for carrying out identification in real time. Finally an experimental test, in real time, with the previously used aluminum plate was carried out, when the modal parameters identified on-line were compared with those identified off-line, thus proving the efficiency of the method for identification in real time.

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Kovach, Stephan. "Detecção de fraudes em transações financeiras via Internet em tempo real." Universidade de São Paulo, 2011. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3141/tde-09082011-155153/.

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Abstract:

Um dos objetivos mais importantes de qualquer sistema de detecção de fraudes, independente de seu domínio de operação, é detectar o maior número de fraudes com menor número de alarmes falsos, também denominados de falsos positivos. A existência de falsos positivos é um fato inerente a qualquer sistema de detecção fraudes. O primeiro passo para alcançar esse objetivo é identificar os atributos que podem ser usados para diferenciar atividades legítimas das fraudulentas. O próximo passo consiste em identificar um método para cada atributo escolhido para efetuar essa distinção. A escolha adequada dos atributos e dos métodos correspondentes determina em grande parte o desempenho de um detector de fraudes tanto em termos da relação entre o número de fraudes detectadas e o número de falsos positivos, quanto em termos de tempo de processamento. O desafio desta escolha é maior ao se tratar de um detector de fraudes em tempo real, isto é, fazer a detecção antes que a fraude seja concretizada. O objetivo deste trabalho é apresentar a proposta de uma arquitetura de um sistema de detecção de fraudes em tempo real em transações bancárias via Internet, baseando-se em observações do comportamento local e global de usuários. O método estatístico baseado em análise diferencial é usado para obter a evidência local de uma fraude. Neste caso, a evidência de fraude é baseada na diferença entre os perfis de comportamento atual e histórico do usuário. A evidência local de fraude é fortalecida ou enfraquecida pelo comportamento global do usuário. Neste caso, a evidência de fraude é baseada no número de acessos efetuados em contas diferentes feitos pelo dispositivo utilizado pelo usuário, e por um valor probabilístico que varia com o tempo. A teoria matemática de evidências de Dempster-Shafer é utilizada para combinar estas evidências e obter um escore final. Este escore é então comparado com um limiar para disparar um alarme indicando a fraude. A principal inovação e contribuição deste trabalho estão na definição e exploração dos métodos de detecção baseados em atributos globais que são de natureza específica do domínio de transações financeiras. Os resultados da avaliação utilizando uma base de dados com registros de transações correspondentes a perfis reais de uso demonstraram que a integração de um detector baseado em atributos globais fez aumentar a capacidade do sistema de detectar fraudes em 20%.
One of the most important goals of any fraud detection system, whichever is the domain where it characterizes the possibility for fraud, is to detect the largest number of frauds with fewer false alarms, also denominated false positives. The existence of false positives is a fact inherent to any fraud detection system. The first step in achieving this goal is to identify the attributes that can be used to differentiate between legitimate and fraudulent activities. The next step is to identify a method for each attribute chosen to make this distinction. The proper choice of the attributes and corresponding methods largely determines the performance of a fraud detector, not only in terms of the rate between the number of detected frauds and the number of false positives, but in terms of processing time. The challenge of this choice is higher when dealing with fraud detection in real time, that is, making the detection before the fraud is carried out. The aim of this work is to present the proposal of an architecture of a real time fraud detection system for Internet banking transactions, based on local and global observations of users behavior. The statistical method based on differential analysis is used to obtain the local evidence of fraud. In this case, the evidence of fraud is based on the difference between the current and historical behavior of the user. The frauds local evidence is strengthened or weakened by the users global behavior. In this case, the evidence of fraud is based on the number of accesses performed on different accounts made by the device used by the user and by a probability value that varies over time. The Dempster-Shafers mathematical theory of evidence is applied in order to combine these evidences for final suspicion score of fraud. This score is then compared with a threshold to trigger an alarm indicating the fraud. The main innovation and contribution of this work are the definition and exploration of detection methods based on global attributes which are domain specific of financial transactions. The evaluation results using a database with records of transactions corresponding to actual usage profiles showed that the integration of a detector based on global attributes improves the system capacity to detect frauds in 20%.

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Lorbieski, Robson. "Um ambiente para análise de Threads distribuídas de tempo real." reponame:Repositório Institucional da UFSC, 2012. http://repositorio.ufsc.br/xmlui/handle/123456789/100972.

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Abstract:

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação, Florianópolis, 2012
Made available in DSpace on 2013-06-26T00:23:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 313320.pdf: 1007920 bytes, checksum: f8e570328bd5e12fe09d459b960a781a (MD5)
Mecanismos de previsão de perda de deadlines são importantes para sistemas de tempo real na medida em que possibilitam otimizar seu desempenho através de ações preventivas ou corretivas. Este trabalho apresenta uma implementação do mecanismo de previsão ASQ (Aperiodic Server Queue) proposto em (PLENTZ, 2008) usando o Java RTS, uma implementação da Real-Time Specification for Java (RTSJ). O objetivo geral é fazer uma análise qualitativa desta implementação com a descrita na referência citada, a qual utiliza a linguagem Java convencional. Para tanto, utiliza-se o mesmo modelo de tarefas proposto em (PLENTZ, 2008) que é composto por tarefas periódicas locais e aperiódicas distribuídas. Este último tipo de tarefa segue o conceito de Threads distribuídas, uma abstração que estende o modelo de threads locais, existentes em sistemas computacionais. Simulações realizadas mostram que o desempenho da implementação desenvolvida neste trabalho não apresenta uma diferença substancial em relação a versão de (PLENTZ, 2008), isto é, o número de previsões corretas e as taxas de erros de ambas as implementações ficam bem próximas com uma pequena tendência de melhora nesta versão aqui apresentada. Além disso, este trabalho apresenta uma implementação bem mais próxima de um sistema de tempo real, distanciando-se de uma simulação, na medida em que utiliza uma linguagem de programação apropriada para o desenvolvimento deste tipo de sistema.

Abstract : Deadline Missing Prediction Mechanisms provide an adequate strategy to improve the system behavior by allowing the anticipation of decisions about necessary measures to improve system performance. This work presents an implementation of ASQ (Aperiodic Server Queue) Prediction Mechanisms proposed by (PLENTZ, 2008) using Java RTS, which is a Real-Time Specification for Java (RTSJ) implementation. The main objective is to analyse qualitatively this implementation in comparison to other described in (PLENTZ, 2008) that was implemented using the conventional Java language. To achieve this objective the same task model described in (PLENTZ, 2008) is used, the task model consists of local periodic tasks and distributed aperiodic taks. The distributed aperiodic model use the Distributed Threads concept which is an abstration that extends the local thread model used in computing systems. Simulations performed in this work shows similar results between this implementations and the one implemented by (PLENTZ, 2008), it means that the number of correct predictions and error rate of both implementations are very close with a small tendency of improvement in this version presented here. Moreover, the work presents an implementation much closer to a realtime system than a simulation is, because utilizes a programming language suitable for the development of real time systems.

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Santos, Vagner Bezerra dos. "Desenvolvimento de um potenciostato/galvanostato portátil e eletrodos impressos para determinações in situ em análises em fluxo com transmissão de dados em tempo real." Universidade Federal de São Carlos, 2013. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/6273.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:34:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5296.pdf: 9754630 bytes, checksum: 1116c7f7ac323deb5c484942710d0111 (MD5) Previous issue date: 2013-07-19
Financiadora de Estudos e Projetos
The main purpose of this work was to develop a potentiostat/galvanostat (PG004) to perform the electroactive metallic ions determination in water samples automatically. A dry thermostated electrochemical cell and a flow system with multicommutation were developed based on the use of the solenoid micropumps and valves with screen-printed electrodes (SPE) for the electrochemical measurements with detection employing stopped flow or continuous flow techniques. Two types of the SPE were developed: i) the SPE based on bismuth film (SPE-BiF) electrochemically deposited for on-line and in situ or ex situ modes, and ii) the boron doped diamond coupled to the SPE (SPE-BDD). These devices, and the electrodes were optimized and their performances were evaluated firstly by employing commercially available potentiostat/galvanostat. Thus, individual or simultaneous determination of Zn2+, Cd2+, and Pb2+ ions were carried out using the stopped flow technique and detection employing square-wave anodic stripping voltammetry (SWASV) to the SPE-BiF, and differential pulse (DPASV) for the SPE-BDD. Limits of detection (LDs) of 1.60 μg L-1, 0.30 μg L-1 and 0.09 μg mL-1, respectively were obtained for the simultaneous determination of Zn2+, Cd2+, and Pb2+ ions by using the SPE BiF ex-situ with SWASV. For the BDD-SPE-DPASV, LDs of 2.50 μg L-1, 0.38 μg L-1 and 0.10 μg L-1 were obtained, respectively, for the determination mentioned previously. Determination of analytes individually or simultaneously were also carried out with SPE-BDD employing multiple pulse amperometry (MPA), and LDs of 150 μg L-1, 87.0 μg L-1 and 13.0 μg mL-1 were obtained respectively for simultaneous determination of Zn2+, Cd2+, and Pb2+ ions with a sampling rate of 54 determinations per hour. In parallel with the electroanalyticals determinations, the PG004 was developed according to the following sequence. i) development of the electronic circuits; ii) calibrations of the PG004; iii) assembly of the PG004 with the flow module coupled to it; iv) coupling of the peripheral devices to the CPU of the PG004 for the wireless transmission of the data with Bluetooth®, Wi-Fi® and 3G protocol, and a GPS receiver), and v) connections of the power unit (12 V batteries) and solar board. Then, the PG004 was employed to determine Cd2+ and Pb2+ ions with SPE-BDD and SWASV in laboratory to simulate in situ conditions. Then, the PG004 was placed to the field for in situ determinations of Cd2+ and Pb2+ ions with good results: i) individual and simultaneous determinations of the Cd2+ and Pb2+ ions with recoveries ranged from 93.3 to 109%; ii) voltammograms with no noises and with good resolutions; iii) reception of the geographical coordinates using the GPS receiver and sending experimental data via mobile technology (GPRS); iv) great autonomy of energy due to the solar board; v) automated capture, filtration and thermostatic temperature control for in situ analysis; vi) SPE-BDD and SPE-BiF reusable at the end of the analysis and vii) low waste generation per determination (700 μL).
O objetivo central deste trabalho foi desenvolver um potenciostato/galvanostato (PG004) para aplicação na determinação de íons metálicos eletroativos em amostras de águas naturais de modo automatizado. Foram também desenvolvidos uma célula eletroquímica termostatizada a seco e sistemas em fluxo com multicomutação baseado no emprego de microbombas, válvulas solenoide e eletrodos impressos para determinações eletroquímicas com detecção com parada de fluxo ou com detecção com fluxo contínuo. Os eletrodos foram de dois tipos: i) eletrodos impressos de filme de bismuto (SPE-BiF) depositados eletroquimicamente em modo online e in situ ou ex situ; ii) diamante dopado com boro acoplado a eletrodo impresso (SPE-BDD). Estes aparatos e eletrodos foram otimizados e seus desempenhos foram avaliados primeiramente empregando-se potenciostatos/ galvanostatos comerciais. Para isso, determinações em modo individual ou simultâneo dos íons Zn2+, Cd2+ e Pb2+ foram realizadas empregando-se a técnica de parada de fluxo e detecção por voltametria de redissolução anódica por onda quadrada (SWASV) empregando SPE-BiF e por pulso diferencial (DPASV) empregando SPE-BDD. Limites de detecção (LDs) de 1,60 μg L-1, 0,30 μg L-1 e 0,09 μg L-1 foram obtidos para a determinação simultânea dos íons de Zn2+, Cd2+ e Pb2+, respectivamente, empregando-se SPE-BiF ex situ com SWASV. No caso de SPEBDD- DPASV, foram obtidos LDs de 2,50 μg L-1, 0,38 μg L-1 e 0,10 μg mL-1, respectivamente para a determinação supramencionada. Determinações dos analitos, separados ou simultaneamente, também foram realizadas com SPE-BDD empregando amperometria de múltiplos pulsos (MPA); os LDs obtidos foram 150 μg L-1, 87,0 μg L-1 e 13,0 μg L-1 respectivamente, com uma frequência de amostragem de 54 determinações por hora. Em paralelo às determinações eletroanalíticas supracitadas, desenvolveu-se o PG004 na seguinte sequência: i) desenvolvimento do circuito eletrônico; ii) calibrações PG004; iii) montagem do PG004 com o módulo em fluxo acoplado; iv) acoplamento dos periféricos de transmissão de dados sem fio (wireless) para comunicação Bluetooth®, Wi-Fi® e 3G, e receptor GPS à CPU do PG004; v) montagem da unidade de alimentação a base de baterias de 12 V e X placas de captação de energia solar. Em seguida, o PG004 foi empregado na determinação dos íons Cd2+ e Pb2+ com SPE-BDD e SWASV em laboratório com simulação das condições em campo. Posteriormente, o PG004 foi conduzido a campo para as determinações in situ dos íons Cd2+ e Pb2+. Resultados satisfatórios foram obtidos, tais como: i) determinações individuais e simultâneas dos íons Cd2+ e Pb2+ com percentual de recuperação entre 93,3 a 109 %; ii) voltamogramas não ruidosos com boa resolução; iii) recepção das coordenadas geográficas com o GPS e envio de dados experimentais via tecnologia de telefonia móvel (GPRS); iv) autonomia maior de energia com uso das placas de captação de energia solar; v) sistema automatizado de captação, filtração e controle termostático da temperatura para análises in situ; vi) SPE-BiF ou SPE-BDD reaproveitados e/ou reutilizados ao fim das análises e vii) baixa geração de resíduo por determinação (700 μL).

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Smaniotto, Giselle Cristina. "A expressão variável do imperativo nas histórias em quadrinhos : uma análise em tempo real." Universidade Estadual de Londrina. Centro de Letras e Ciências Humanas. Programa de Pós-Graduação em Estudos da Linguagem, 2005. http://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls000107020.

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Abstract:

Este trabalho tem por objetivo investigar na linguagem escrita das histórias em quadrinhos a variação que permeia o modo imperativo. Variação que é percebida na fala espontânea formal e informal, namídia e, principalmente, nos textos dialogados. Assume-se neste estudo que esta variação corresponde à associação com os modos subjuntivo ou indicativo e não com a pessoa pronominal (tu/vós). Com o intento de verificar uma possível mudança em curso, são analisadas histórias em quadrinhos que correspondem ao período de pouco mais de meio século (de 1950 a 2003). O modelo teórico-metodológico adotado é o da Sociolingüística Laboviana e os dados recebem tratamento estatístico através do programa de regras variáveis VARBRUL. Os fatores lingüísticos considerados relevantes no condicionamento da forma variante indicativa são: o número da pessoa verbal, a polaridade da estrutura, a conjugação verbal, a presença/ausência de pronome complemento (tipo, posição e pessoa). O fator extralingüístico que considera as histórias traduzidas e as histórias nacionais também mostrou-se decisivo na freqüência de uso da forma indicativa. Nos dados totais observa-se uma percentagem de apenas 15% de uso da forma variante. Entretanto, analisando-se o aparecimento da forma indicativa década a década, comprova-se o crescimento desta, efetivamente, a partir da década de 80. Dessa forma, podemos concluir que a manifestação do modo imperativo está inserido num processo de mudança lingüística, na qual as formas indicativa e subjuntiva, no contexto estudado, lutam igualitariamente para expressar a modalidade imperativa. Vale ressaltar que esse fenômeno de variação não sofre qualquer estigma social, sendo as formas variantes aceitas sem preconceito lingüístico. Desse modo, seja na fala ou na escrita, o processo de mudança pode ser acelerado. Acredita-se que este estudo possa, juntamente com outros já realizados e a realizar-se, caracterizar o processo de variação do fenômeno em análise, confirmando-se daqui a algum tempo um avanço ou não em direção à mudança lingüística, sendo mais um passo rumo à descrição da linguagem em uso no Português Brasileiro atual.
This work is aimed at investigating the variation which permeates the imperative form in the written language in comic books. It is assumed in this study that this variation corresponds to the association with the subjunctive or indicative and not with the pronominal person (tu/vós). With the objective of verifying a possible change in this way, comic books which correspond to a period of more than half a century (from 1950 to 2003) are analysed. The theoretical ? methodological model adopted is the Labovian Sociolinguistic and the data has received statistical treatment through the VARBRUL variable rules program. The linguistic factors considered relevant in the conditioning of the variant forms are: the number of the grammatical person, the structure of the polarity, the verbal conjugation, the presence/absence of the complement pronoun (type, position and person). The extralinguistic factor which considered the translated and national stories was also considered decisive in the frequency of the use of the indicative form. It is observed in the total data a percentage of only 15% of use of the variant form. However, if we analyse the appearance of the indicative form decade by decade, we can show its growth from the 80?s on. This way, we can conclude that the manifestation of the imperative form is embedded in a linguistic changing process, in which the indicative and subjunctive forms, in the studied context, fight in an egalitarian way to express the imperative model. It is also remarkable that this variation phenomenon doesn?t undergo any social stigma and the variant forms are accepted with no linguistic prejudice. This way, in the spoken or written language, the changing process may be accelerated. It is believed that this study may, with the others which were carried out and will be carried out, characterize the process of the phenomenon of variation in analysis, being one more step to the language description in use of the present Brazilian Portuguese.

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García, Lina Marcela Palacio. "Metodologias de análise de dados para um sistema de otimização em tempo real." Universidade de São Paulo, 2013. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-01082013-161137/.

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Abstract:

A otimização em tempo real (RTO: Real Time Optimization) permite fazer correções, com o menor atraso possível, nas condições de operação de um processo, buscando manter um desempenho ótimo. A RTO, na abordagem clássica, requer um ciclo constante de análise e correção do estado do processo que inclui múltiplas etapas: i) identificação do estado estacionário, ii) identificação e correção dos erros grosseiros, iii) reconciliação dos dados, iv) ajuste dos parâmetros do modelo, v) estimação das condições operacionais ótimas e, vi) implementação das condições no sistema de controle. Um sistema de análise de dados é necessário na aquisição das variáveis medidas da planta que classifique o estado da operação como válido para atualizar um modelo em estado estacionário. O sistema deve fornecer um modelo atualizado que seja representativo do comportamento real da operação para que seja otimizado em um passo posterior. Este trabalho é focado na análise de metodologias de detecção de estado estacionário, reconciliação de dados e estimação de parâmetros com as características necessárias que um sistema de RTO requer. Como caso de estudo considera-se uma coluna depropenizadora da PETROBRAS, em que foi feita uma análise da variabilidade associada à instrumentação para melhorar o conhecimento da operação. Além disso, a análise e validação do modelo do processo, permitiu estabelecer faixas de convergência nas especificações do processo e parâmetros. Finalmente, sugere-se que a composição da corrente de alimentação e a queda de pressão na coluna sejam classificadas como parâmetros importantes no ajuste de modelo.
Real-time optimization (RTO) allows making corrections in process operation conditions, with the smallest possible delay, in order to provide an optimal performance. RTO, in the classical approach, requires a constant cycle of analysis and correction of process conditions, that includes multiple steps: i) steady state identification, ii) gross errors detection and correction, iii) data reconciliation, iv) parameter estimation, v) economical optimization and vi) implementation of the optimal conditions in the control system. A data analysis system is required in the plant to classify the operating conditions as valid in order to update a steady state model. The system shall provide an updated model that can represent the real behavior of the operation that wi ll be optimized in a next step. This work is focused on the analysis of methodologies for steady-state detection, data reconciliation and parameter estimation with the required characteristics that an RTO system requires. As a case-study, a depropenizer column, owned by Petrobras is considered. An analysis of the variability of the instrumentation was performed to allow a better understanding of the process. Moreover, the analysis and validation of the process model enabled drawing convergence boundaries on process specifications and parameters. Finally, it is suggested that the feed composition and the column pressure drop should be considered as important parameters in model fitting.

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Tanaka, Simone Missae. "Análise de homoplasmia de plantas transplastômicas de fumo via PCR em tempo real." Universidade de São Paulo, 2012. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11144/tde-07022012-161104/.

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Abstract:

A transformação plastidial oferece uma série de vantagens em relação à transformação nuclear, como: altos níveis de expressão de proteínas, capacidade de expressar múltiplos transgenes em operons e contenção gênica pela ausência de transmissão pelo pólen. Devido ao alto número de cópias do genoma plastidial por cloroplasto e ao alto número de cloroplastos por células vegetais, são necessários ciclos de regeneração sob condições seletivas para obter transformantes homoplásmicos. A análise de homoplasmia é realizada pela metodologia de Southern blot ou pelo teste de herança do transgene pela germinação de sementes em meio seletivo. O Southern blot é trabalhoso, demorado e para maior sensibilidade envolve o uso de radioisótopos, enquanto o teste de germinação é realizado somente após a produção de sementes necessitando de um ciclo de reprodução da planta. Assim, o objetivo deste trabalho foi desenvolver um método rápido, sensível e eficaz para determinar o grau de homoplasmia de plantas transplastômicas, baseado na técnica de PCR em tempo real. Folhas de fumo foram transformadas com vetores compostos pelos genes 9 dessaturase (pMR1), 15 dessaturase (pMR3), -3 elongase (pMR5) e 12/3 dessaturase (pMR10), todos contendo o gene de seleção aadA. No total, 44 plantas foram obtidas, sendo 21 plantas positivas para a inserção do transgene. O grau de homoplasmia foi determinado pela proporção entre o número de cópias do transgene e o número de cópias do gene endógeno. Inicialmente, misturas de DNA de plantas transplastômicas homoplásmicas (pMR1 e pMR3) com DNA de planta tipo selvagem foram preparadas para simular diferentes graus de homoplasmia. DNA da planta transplastômica ou do plasmídeo foi diluído em série para construção das curvaspadrão, com a quantidade dos genes sendo estimada por meio da plotagem nessas curvas. Os índices de homoplasmia detectados na PCR em tempo real foram compatíveis com os resultados do teste de germinação com valores abaixo de 1 para plantas heteroplásmicas, 1 para a planta homoplásmica e 0 para as plantas sem a inserção do transgene. Os resultados das análises de amostras coletadas após o primeiro ciclo de regeneração mostraram que 13 das 21 plantas já se apresentavam em estado homoplásmico não sendo necessários mais ciclos de regeneração. A PCR em tempo real mostrou ser um método eficiente para análise do grau de homoplasmia de plantas transplastômicas.
Plastid transformation offers several advantages in relation to nuclear transformation, such as high-level of protein expression, the feasibility of expressing multiple transgenes in operons and gene containment through the lack of pollen transmission. Due to the high copy number of plastidial genome in chloroplasts and the high number of chloroplasts per plant cells, regeneration cycles under selective conditions are necessary to obtain homoplasmic transformants. Homoplasmy analysis is performed by Southern blot methodology or transgene inheritance test through seed germination in selective medium. Southern blot is laborious, time consuming and for more sensitivity it would require the use of radioisotopes, while germination test can be performed only after seed production which require a plant reproduction cycle. The objective of this study was to develop a fast, sensitive and effective method to determine the homoplasmy degree of transplastomic plants, based on real-time PCR. Tobacco leaves were transformed with vectors containing the 9 desaturase (pMR1), 15 desaturase (pMR3), -3 elongase (pMR5) and 12/3 desaturase (pMR10) each one with the aadA selection gene. In total, 44 plants were obtained, of which 21 were positive for the insertion of the transgene. The homoplasmy degree was determined by the proportion between the number of transgene copies and the number of endogenous gene copies. Initially, mixtures of homoplastomic plants DNA (pMR1 and pMR3) with wild-type plant DNA were prepared to simulate different degrees of homoplasmy. Transplastomic plant DNA or plasmid DNA was diluted to construct the standard curves and the gene amount was detected by plotting in this curves. The homoplasmy rate detected in real-time PCR were consistent with the results of germination test with values below 1 for heteroplasmic plants, 1 for homoplasmic plants and 0 for plants without the transgene insertion. The results obtained from the samples collected after the first regeneration cycle showed that 13 of the 21 plants were already in a homoplasmic state and did not require more cycles of regeneration. The real-time PCR proved to be an effective method for analyzing the homoplasmy degree of transplastomic plants.

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Baroni, Leandro. "Análise de algoritmos de navegação para um sistema GPS diferencial em tempo real." Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais (INPE), 2004. http://urlib.net/sid.inpe.br/jeferson/2004/09.21.09.01.

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Abstract:

O Sistema de Posicionamento Global (GPS) é um sistema de navegação baseado em satélites que permite ao usuário determinar sua posição e tempo com alta precisão. A determinação de posição do GPS é baseada no conceito de tempo de chegada do sinal, o qual está sujeito a diversas fontes de erros em sua medida. O efeito combinado destes erros na propagação do sinal causa uma degradação na precisão do posicionamento. Entretanto, existem métodos de melhorar a precisão do posicionamento, como o GPS diferencial (DGPS) e o posicionamento por dupla diferença, que tentam compensar, atenuar ou eliminar várias fontes de erros. Neste trabalho são analisados algoritmos que permitam navegação precisa em tempo real, através de técnicas de GPS diferencial. Algoritmos de GPS diferencial foram desenvolvidos, implementados e testados através da realização de posicionamento em tempo real para um usuário com a utilização de três métodos: DGPS na posição, DGPS nas medidas de pseudodistância e posicionamento por dupla diferença. Estes algoritmos foram testados em dois casos: estático, no qual ambos os receptores são mantidos fixos; e dinâmico, no qual o receptor usuário está se movendo. Os dados em ambos os casos foram coletados por dois receptores Ashtech Z12. O desempenho dos algoritmos no teste estático foi comparado com a linha de base conhecida, enquanto que o desempenho dos algoritmos no teste dinâmico foi comparado com uma trajetória de referencia pós-processada e analisado em termos das precisoes obtidas.
The Global Positioning System (GPS) is a satellite-based navigation system that allows user to determine position and time with high precision. The position determination with GPS is based on the concept of signal time of arrival, which is aected by several errors sources in measurements. The combined eects of these errors at signal propagation cause degradation in the positioning accuracy. However, there are methods to improve the positioning accuracy, like dierential GPS (DGPS) and double dierence positioning, which try to compensate, attenuate or eliminate several error sources. In this work algorithms that allow precise real time navigation, through dierential GPS techniques are analyzed. Dierential GPS algorithms were developed, implemented and tested by the real time positioning for an user through three methods: DGPS on position, DGPS on pseudorange measurements and double dierence measurements. These algorithms were tested in two cases: static, in which both receivers are fixed; and dynamic, in which the user receiver is moving. The data in both cases were collected by two Ashtech Z12 receivers. The algorithms performance in the static test was compared with a known baseline, while the algorithm performance in the dynamic test were compared with a post-processed reference trajectory and analyzed in terms of accuracies attained.

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Almeida, Neto Euclides. "Otimização dinâmica em tempo real : arquitetura de software, diagnóstico e análise de inviabilidades." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 2011. http://hdl.handle.net/10183/36008.

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Abstract:

As constantes pressões por redução de margem de lucro, melhoria de qualidade de produtos e segurança operacional que a indústria de processamento vem sofrendo, tem levado as mesmas a utilizarem ferramentas especializadas de otimização de processos. Nas décadas de 1980 e 1990, esta indústria investiu fortemente na utilização de ferramentas de otimização estacionária em tempo real (RTO) nas formas online e offline. Esta tecnologia já atingiu o seu grau de maturidade. Porém está limitada pelas suas características estacionárias, não tendo capacidade de otimizar processos diante das perturbações freqüentes, tais como alterações de qualidade e quantidade de carga, transições decorrentes de alterações de programação de produção ou de receita de uma produção em batelada ou semi-batelada, dentre outros. Para cobrir este espaço, a otimização dinâmica em tempo real (DRTO) é a tecnologia adequada para reduzir a quantidade de produtos fora de especificação e otimizar o lucro operacional diante destas perturbações. Porém, esta tecnologia ainda não atingiu o seu grau de maturidade, tendo ferramentas comerciais apenas na sua versão offline. Com o objetivo de contribuir com a consolidação desta tecnologia, propõe-se estudar e desenvolver uma arquitetura de sistema de DRTO para operar nas plantas de processo, promover melhorias conceituais nesta tecnologia, e desenvolver uma ferramenta de diagnóstico e sintonia de DRTO. Esta estrutura é bem completa e fornece a flexibilidade necessária para uso industrial. A ferramenta de diagnóstico permite resolver os problemas que ocorrerem ao longo do uso do DRTO. Além disso, é apresentada uma nova metodologia de análise e solução de inviabilidades, baseada em otimização multiobjetivos aplicada à otimização dinâmica. Esta técnica pode ser utilizada tanto online quanto offline, para diagnóstico, e na solução de problemas de otimização dinâmica, conferindo mais robustez ao DRTO, evitando insucessos do otimizador.
Considering the constant pressures for profit margins reduction, improvement of products quality and operational safety, that the processing industry has been submitted, has led them to the use of specialized tools of processes optimization. In the 1980 and 1990 decades, this industry has invested strongly in the use of stationary real-time optimization tools (RTO), in the online and offline forms. This technology already reached its degree of maturity, but limited to its stationary characteristics, having no ability to optimize processes due to frequent disturbances, such as quality and feed flows transitions, consequence of frequent changes in the production scheduling or recipes in batch or semibatch operations, and others. To cover this space, the dynamic real-time optimization (DRTO) is the appropriate technology to reduce the off-spec production and optimize the operational profit when the process is submitted to these disturbances. However, this technology has not reached its maturity, having only commercial tools available only in yuor offline version. In order to contribute to the consolidation of this technology, it is proposed to study and develop a DRTO system architecture to operate in process plants, to promote a conceptual improvements in this technology, and to develop a DRTO diagnostic and tuning tool. This structure is quite complete and provides the flexibility required for industrial application. The diagnostic tool allows us to solve problems that occur during the use of the DRTO system. In addition, a new methodology for infeasibility analysis and solution in DAOP is proposed here, and it is based on the solution of the multiobjective dynamic optimization. This technique can be used in online and offline modes, for diagnostics and troubleshooting dynamic optimization problems, giving more robustness to the DRTO systems, avoiding some optimizer failures.

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Pintor, Paulo Sérgio Oliveira. "Processamento analítico de fluxos de dados de tráfego em tempo quase real." Master's thesis, Universidade de Aveiro, 2017. http://hdl.handle.net/10773/23468.

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Abstract:

Mestrado em Sistemas de Informação
Nos dias de hoje, as tecnologias com as quais temos contacto geram dados sobre a sua utilização e sobre o utilizador, com uma velocidade e variedade sem precedentes. Cria-se assim a necessidade de gerir os fluxos de dados e de transformar estes dados em informação armazenada de forma estruturada, inferindo sobre a mesma e retirando conclusões. As áreas de aplicação são diversas e uma das vertentes que tem recebido maior atenção é o processamento de dados referentes ao tráfego automóvel obtidos usando dispositivos GPS, que se devidamente tratados permitem dar informação adicional aos utilizadores sobre o estado do trânsito, encontrar os caminhos mais rápidos ou até fazer previsões sobre o tráfego no futuro. O objetivo desta dissertação consiste em implementar um protótipo que consiga fazer o processamento de um fluxo de dados obtidos em tempo real e estruturá-los de forma a dar respostas sobre o estado do tráfego no momento e no futuro próximo. Para conseguir dar estas respostas, serão considerados não só os dados recebidos em tempo real como também informação adquirida anteriormente, de forma a ser possível fazer comparações e tirar conclusões. O protótipo está dividido em três módulos principais: o pré-processamento e a análise de dados históricos; o processamento de dados de tráfego em tempo quase real; e a apresentação de resultados. O protótipo foi sujeito a testes e os seus resultados sujeitos a avaliação de forma a verificar a validade das respostas devolvidas ao utilizador.
Nowadays, the technologies we handle generate data about their usage and the user, with an unprecedented rate and variety. This raises the need to manage all the data streams and to transform these data in information. This information is stored in a structured way allowing to infer about it and withdraw conclusions. There is a wide range of application areas, with the car traffic data processing receiving the most attention. These data are obtained from GPS devices and if properly processed, allow the user to have additional information about the traffic status, the faster way to a destination and even predictions on the future traffic status. This dissertation aims to implement a prototype able to process and structure the data streams in real-time, to ultimately present answers about the traffic status at the moment or even in a near future. These answers are obtained not only by the real-time information but also by previously acquired information. Having two sources of information allows to compare and withdraw statistical conclusions. The prototype is divided in three main modules: the pre-processing and analysis of historical data; the processing of traffic data in near real-time; and the results presentation. The prototype was subject to tests and their results subject to evaluation to verify the answers’ assertiveness.

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Martinhago, Ciro Dresch [UNESP]. "Identificação do sexo de embriões humanos através da análise de blastômero pelas técnicas da reação em cadeia da polimerase em tempo real (PCR em tempo real) e hibridização in situ fluorescente (FISH)." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2007. http://hdl.handle.net/11449/104166.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-02Bitstream added on 2014-06-13T20:48:03Z : No. of bitstreams: 1 martinhago_cd_dr_botfm_prot.pdf: 1810275 bytes, checksum: 5592d92db2f6fd8dea862970f2f6df15 (MD5)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Cpdp - Centro Paulista de Pesquisa e Diagnostico
O diagnóstico genético pré-implantacional (PGD) é um procedimento o qual permite que embriões sejam testados perante uma doença genética antes de sua transferência para o útero materno, ou seja, antes...
Preimplantation genetic diagnosis (PGD) is a procedure that permits embryos to be tested for a possible genetic diseade before being transferred to the maternal uterus, i.e., before the beginning of pregnancy... (Complete abstract click electronic access below)

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Martinhago, Ciro Dresch. "Identificação do sexo de embriões humanos através da análise de blastômero pelas técnicas da reação em cadeia da polimerase em tempo real (PCR em tempo real) e hibridização in situ fluorescente (FISH) /." Botucatu : [s.n.], 2007. http://hdl.handle.net/11449/104166.

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Abstract:

Orientador: José Gonçalves Franco Junior
Banca: Walter Pinto Junior
Banca: Sang Choon Cha
Banca: Marilza Vieira Cunha Rudge
Banca: José Carlos Peraçoli
Resumo: O diagnóstico genético pré-implantacional (PGD) é um procedimento o qual permite que embriões sejam testados perante uma doença genética antes de sua transferência para o útero materno, ou seja, antes... (Resumo completo clicar acesso eletrônico abaixo)
Abstract: Preimplantation genetic diagnosis (PGD) is a procedure that permits embryos to be tested for a possible genetic diseade before being transferred to the maternal uterus, i.e., before the beginning of pregnancy... (Complete abstract click electronic access below)
Doutor

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Costa, Araújo Natália. "Análise do polimorfismo genético da lectina de ligação da manose (MBL) e a doença periodontal em diabéticos." Universidade Federal de Pernambuco, 2009. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/8177.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2014-06-12T22:57:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4047_1.pdf: 527643 bytes, checksum: 5a0f9b33994af35eb4597e4aa3372c69 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
A lectina de ligação da manose (MBL) é uma proteína plasmática sintetizada no fígado e é um importante constituinte do sistema imune inato. É capaz de se ligar a determinados carboidratos presentes na superfície de vários patógenos e interagir com proteínas séricas (MASPs) para realizar a ativação do complemento. Seus níveis séricos são afetados por polimorfismos genéticos do gene MBL2 e têm sido associados à suscetibilidade a doenças infecciosas e autoimunes. Este estudo investigou a associação entre o polimorfismo no exon-1 do gene MBL2 com a doença periodontal em pacientes diabéticos tipo 2. A amostra foi composta por 100 pacientes que se submeteram ao exame clínico periodontal que avaliou, em seis sítios de cada dente, profundidade de sondagem, sangramento à sondagem, nível de inserção clínica, placa dental e número de dentes presentes. A doença periodontal foi definida como a presença de 4 + sítios com perda de inserção de ≥5 mm com um ou mais destes sítios com profundidade de sondagem de 4 + mm. Foi realizada a coleta das células de descamação da mucosa oral e a detecção do polimorfismo foi feita através da técnica de PCR em tempo real e análise da temperatura da curva de melting. Os dados evidenciaram não haver diferença estatisticamente significante entre as freqüências genotípicas (p=1,00) e alélicas (p=1,00) observadas entre os indivíduos controles e aqueles com periodontite. Este estudo indica que polimorfismo no exon-1 do gene MBL2 não esteve associado com a presença de doença periodontal na amostra estudada

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Freitas, Ramon Morais de. "Técnicas de análise de séries temporais aplicadas à detecção de desflorestamento em tempo real." Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais, 2007. http://urlib.net/sid.inpe.br/mtc-m17@80/2007/05.07.18.51.

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Abstract:

A deteção de desflorestamento em tempo real ou próximo do real é de fundamental importancia para ações conjuntas de caráter preventivo e punitivo dos órgaos governamentais no que tange a politica de controle e prevenção do desflorestamento na Amazonia. Neste contexto, este trabalho tem o objetivo de propor uma metodologia para detecção de desflorestamento em tempo real a partir de imagens MODIS. A metodologia consiste em caracterizar e detectar áreas desflorestadas através de séries espaço temporais de imagens MODIS. A área de estudo proposta para realização da pesquisa compreende tres micro-regioes do estado de Mato Grosso que tem sido caracterizada pela alta taxa de desflorestamento nos últimos anos. A detecção do desflorestamento em tempo real utilizou-se das imagens MOD02 di´arias adquiridas no período de 2005 a 2006. Seguindo a metodologia PRODES e DETER a detecção das áreas desflorestadas basearam-se nas frações vegetação e solo derivadas do modelo linear de mistura espectral. Para constru¸cao das séries espaço-temporais foram utilizados os produtos de refletancia e temperatura de superfície. A caracterização das séries temporais foi baseada em 4 técnicas: wavelets, análise de padrões de gradientes, divergencia de KullBack-Leibler e expoente de Hurst. Os dados de campanhas de campo, Projeto DETER, PRODES, imagens CBERS e TM, foram utilizados como verdade terrestre para validação da metodologia. A utilização de imagens multitemporal do produto MOD02 apresentou uma exatidao global de detecção dos focos de desflorestamento (92,72 %) quando comparados com os dados de verdade terrestre. Com a utilização das transformadas de wavelets foi possível filtrar e caracterizar a data e o uso do solo após o desflorestamento, i.e., mudança dinamica da cobertura do solo. Com a análise de padroes de gradiente é proposta uma metodologia para redu¸cao da dimensionalidade de dados que permite identifi- car áreas desflorestadas. Através da Divergencia de Kullback-Leibler e Expoente de Hurst foi possível analisar a complexidade estatística e textura das imagens fra¸cao vegetação para áreas desflorestadas e áreas de floresta.
The detection of deforestation in a near real time is of fundamental importance for Government policy and surveillance of forest areas. A near real-time detection would allow control of the increase of new clearings and monitoring of the deforestation pattern and dynamics in Amazonia. In this context, this work has the objective to propose a methodology to detect deforestation in near real time using MODIS images. The methodology consists on to characterize and detect deforested areas using temporal spatial time series of MODIS images. The study area is located in the Mato Grosso State, Brazilian Amazonia, encompassing three micro regions that has been characterized by high deforestation rates in the last years. The detection of deforestation in a near real time used daily MODIS images (MOD02) acquired in 2005 to 2006 time period. Following the PRODES and DETER methodology the detection of deforested areas was based on multitemporal soil and vegetation fraction images derived from linear spectral mixing model. The time-series analysis was based on the surface reflectance and surface temperature products aquired from 2000 to 2006. For the characterization of spatiotemporal time series was used 4 technics: wavelets transforms, gradiente patterns analysis, Hurst exponent and Kullback-Leibler divergency. The field campaign data, PRODES and DETER information, and Landsat TM and CBERS CCD images were utilized as ground truth for validation of the methodology. The use of multitemporal images of MOD02 product presented a global accuracy of 92.72 % to detect the deforestation when compared with ground truth. With the use of wavelets transform it was possible to characterize the deforestation date and pos-deforestation land use type. (croplands, pasture or regrowth), i.e., the landcover change dynamics. The Gradient Pattern Analysis showed a new aproach to reduce the dimensionality of data volume for in deforestation detection. The Kullback-Leibler divergency and Hurst exponent were used to analyze the statistical complexity and texture of vegetation fraction images for forest and deforested areas.

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Cusinato, Rafael Tiecher. "Ensaios sobre previsão de inflação e análise de dados em tempo real no Brasil." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 2009. http://hdl.handle.net/10183/22654.

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Abstract:

Esta tese apresenta três ensaios sobre previsão de inflação e análise de dados em tempo real no Brasil. Utilizando uma curva de Phillips, o primeiro ensaio propõe um “modelo evolucionário” para prever inflação no Brasil. O modelo evolucionário consiste em uma combinação de um modelo não-linear (que é formado pela combinação de três redes neurais artificiais – RNAs) e de um modelo linear (que também é a referência para propósitos de comparação). Alguns parâmetros do modelo evolucionário, incluindo os pesos das combinações, evoluem ao longo do tempo segundo ajustes definidos por três algoritmos que avaliam os erros fora-da-amostra. As RNAs foram estimadas através de uma abordagem híbrida baseada em um algoritmo genético (AG) e em um algoritmo simplex de Nelder-Mead. Em um experimento de previsão fora-da-amostra para 3, 6, 9 e 12 passos à frente, o desempenho do modelo evolucionário foi comparado ao do modelo linear de referência, segundo os critérios de raiz do erro quadrático médio (REQM) e de erro absoluto médio (EAM). O desempenho do modelo evolucionário foi superior ao desempenho do modelo linear para todos os passos de previsão analisados, segundo ambos os critérios. O segundo ensaio é motivado pela recente literatura sobre análise de dados em tempo real, que tem mostrado que diversas medidas de atividade econômica passam por importantes revisões de dados ao longo do tempo, implicando importantes limitações para o uso dessas medidas. Elaboramos um conjunto de dados de PIB em tempo real para o Brasil e avaliamos a extensão na qual as séries de crescimento do PIB e de hiato do produto são revisadas ao longo do tempo. Mostramos que as revisões de crescimento do PIB (trimestre/trimestre anterior) são economicamente relevantes, embora as revisões de crescimento do PIB percam parte da importância à medida que o período de agregação aumenta (por exemplo, crescimento em quatro trimestres). Para analisar as revisões do hiato do produto, utilizamos quatro métodos de extração de tendência: o filtro de Hodrick-Prescott, a tendência linear, a tendência quadrática, e o modelo de Harvey-Clark de componentes não-observáveis. Todos os métodos apresentaram revisões de magnitudes economicamente relevantes. Em geral, tanto a revisão de dados do PIB como a baixa precisão das estimativas de final-de-amostra da tendência do produto mostraram-se fontes relevantes das revisões de hiato do produto. O terceiro ensaio é também um estudo de dados em tempo real, mas que analisa os dados de produção industrial (PI) e as estimativas de hiato da produção industrial. Mostramos que as revisões de crescimento da PI (mês/mês anterior) e da média móvel trimestral são economicamente relevantes, embora as revisões de crescimento da PI tornem-se menos importantes à medida que o período de agregação aumenta (por exemplo, crescimento em doze meses). Para analisar as revisões do hiato da PI, utilizamos três métodos de extração de tendência: o filtro de Hodrick-Prescott, a tendência linear e a tendência quadrática. Todos os métodos apresentaram revisões de magnitudes economicamente relevantes. Em geral, tanto a revisão de dados da PI como a baixa precisão das estimativas de final-de-amostra da tendência da PI mostraram-se fontes relevantes das revisões de hiato da PI, embora os resultados sugiram certa predominância das revisões provenientes da baixa precisão de final-de-amostra.
This thesis presents three essays on inflation forecasting and real-time data analysis in Brazil. By using a Phillips curve, the first essay presents an “evolutionary model” to forecast Brazilian inflation. The evolutionary model consists in a combination of a non-linear model (that is formed by a combination of three artificial neural networks - ANNs) and a linear model (that is also a benchmark for comparison purposes). Some parameters of the evolutionary model, including the combination weight, evolve throughout time according to adjustments defined by three algorithms that evaluate the out-of-sample errors. The ANNs were estimated by using a hybrid approach based on a genetic algorithm (GA) and on a Nelder-Mead simplex algorithm. In a 3, 6, 9 and 12 steps ahead out-of-sample forecasting experiment, the performance of the evolutionary model was compared to the performance of the benchmark linear model, according to root mean squared errors (RMSE) and to mean absolute error (MAE) criteria. The evolutionary model performed better than the linear model for all forecasting steps that were analyzed, according to both criteria. The second essay is motivated by recent literature on real-time data analysis, which has shown that several measures of economic activities go through important data revisions throughout time, implying important limitations to the use of these measures. We developed a GDP real-time data set to Brazilian economy and we analyzed the extent to which GDP growth and output gap series are revised over time. We showed that revisions to GDP growth (quarter-onquarter) are economic relevant, although the GDP growth revisions lose part of their importance as aggregation period increases (for example, four-quarter growth). To analyze the output gap revisions, we applied four detrending methods: the Hodrick-Prescott filter, the linear trend, the quadratic trend, and the Harvey-Clark model of unobservable components. It was shown that all methods had economically relevant magnitude of revisions. In a general way, both GDP data revisions and the low accuracy of end-of-sample output trend estimates were relevant sources of output gap revisions. The third essay is also a study about real-time data, but focused on industrial production (IP) data and on industrial production gap estimates. We showed that revisions to IP growth (month-on-month) and to IP quarterly moving average growth are economic relevant, although the IP growth revisions become less important as aggregation period increases (for example, twelve-month growth). To analyze the output gap revisions, we applied three detrending methods: the Hodrick-Prescott filter, the linear trend, and the quadratic trend. It was shown that all methods had economically relevant magnitude of revisions. In general, both IP data revisions and low accuracy of end-of-sample IP trend estimates were relevant sources of IP gap revisions, although the results suggest some prevalence of revisions originated from low accuracy of end-of-sample estimates.

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Moreira, Eunice Maria Sampaio. "Análise de tendência do índice Bovespa em tempo real utilizando técnicas de inteligência artificial." reponame:Repositório Institucional do FGV, 1992. http://hdl.handle.net/10438/5129.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2010-04-20T20:15:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 1992-03-25T00:00:00Z
Estudamos e propusemos uma solução para o caso específico do índice Bovespa (fechamento) à vista. Utilizamos técnicas de inteligência artificial, estudando modelos pouco estruturados para a análise de tendências de alta ou queda deste índice. Modelo matemático aliado às técnicas de IA é comparado e integrado, procurando adequar às necessidades de análise na área de negócios.

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Silva, Karila Palma. "Análise de valor para determinação do tempo de execução no pior caso (WCET) de tarefas em sistemas de tempo real." reponame:Repositório Institucional da UFSC, 2015. https://repositorio.ufsc.br/xmlui/handle/123456789/133239.

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Abstract:

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Automação e Sistemas, 2015
Made available in DSpace on 2015-06-02T04:10:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 333801.pdf: 3059940 bytes, checksum: 6dc6cd5583e623b2d79424bb7f769b16 (MD5) Previous issue date: 2015
A utilização de sistemas computacionais na sociedade tem se expandido e as aplicações com requisitos de tempo real são mais comuns, variando em relação à complexidade e às necessidades de garantia no atendimento de restrições temporais (deadlines). Uma propriedade importante na definição do comportamento temporal de uma tarefa é o tempo de computação, que é o tempo necessário para a execução completada tarefa. Um dos grandes problemas de obtê-lo está ligado à análise da microarquitetura do processador. Considerando um processador que possui memória de dados com latência variada, é necessário a análise de valor para identificar a região de memória que a instrução acessa (memória principal ou ScrathPad Memory), para que o pior tempo de execução dos programas não seja consideravelmente superestimado. O objetivo deste trabalho é usar a análise de valor para determinar o tempo correto de acesso à memória, através da identificação da região de memória que cada instrução acessa, com a finalidade de obter um limite superior do WCET menos pessimista.

Abstract: The use of computer systems in our society has expanded and applications with real-time requirements are getting more usual, varying in relation to the complexity and the necessity of guaranting deadlines. An important restriction in defining the temporal behavior of a task is the computation time, i.e., the time necessary to complete the task. Amajor problem in obtaining WCET is the processor microarchitecture analysis. Considering a processor with a data memory that has varying latency, value analysis is necessary to identify the memory region tha teach instruction accesses (main memory or ScrathPad Memory), so the worst execution time of programs are not considerably overestimated.The objective of this work is to use value analysis to obtain the correct memory access time by identifying the region of memory each instruction accesses, obtaining WCET upper bounds that are less pessimistic.

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Zagari, Eduardo Nicola Ferraz. "Escalonamento em tempo real das funções avançadas de analise de rede eletrica de um moderno centro de controle." [s.n.], 1996. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/261128.

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Abstract:

Orientadores: Ariovaldo Verandio Garcia e Alcir Jose Monticelli
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica
Made available in DSpace on 2018-07-21T08:26:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Zagari_EduardoNicolaFerraz_M.pdf: 6499242 bytes, checksum: afbf9227df546b9a164aab340310382d (MD5) Previous issue date: 1996
Resumo: Este trabalho apresenta dois modelos de implementação de escalonadores para as funções de análise de rede em tempo real em um Centro de Controle. Os escalonadores propostos gerenciam funções como o configurador de rede, o estimador de estado e o fluxo de potência on-line, tanto de forma periódica como por solicitação do operador. O primeiro modelo é um escalonador estático, baseado no algoritmo Taxa Monotônica com Servidor Esporádico, e o segundo, baseado no algoritmo Próximo Prazo, é um escalonador com atribuição dinâmica de prioridades. As características das funções avançadas de análise de rede foram analisadas quanto aos seus aspectos de restrições temporais e independência entre instâncias de varreduras do sistema de aquisição de dados distintas. As implementações foram feitas para arquiteturas computacionais monoprocessadas, sob o sistema operacional UNIX. Foram realizados testes em um sistema elétrico da região de Campinas através de três ambientes distintos
Resumo: Este trabalho apresenta dois modelos de implementação de escalonadores para as funções de análise de rede em tempo real em um Centro de Controle. Os escalonadores propostos gerenciam funções como o configurador de rede, o estimador de estado e o fluxo de potência on-line, tanto de forma periódica como por solicitação do operador. O primeiro modelo é um escalonador estático, baseado no algoritmo Taxa Monotônica com Servidor Esporádico, e o segundo, baseado no algoritmo Próximo Prazo, é um escalonador com atribuição dinâmica de prioridades. As características das funções avançadas de análise de rede foram analisadas quanto aos seus aspectos de restrições temporais e independência entre instâncias de varreduras do sistema de aquisição de dados distintas. As implementações foram feitas para arquiteturas computacionais monoprocessadas, sob o sistema operacional UNIX. Foram realizados testes em um sistema elétrico da região de Campinas através de três ambientes distintos
Abstract: This work presents two real-time schedulers for network analysis functions in energy management systems. The proposed schedulers handle functions such as network configuration, state estimation and on-line power flow, both in periodic mode as well as in asynchronous mode (interruption handling). The first mo dei is a fixed priority scheduler, designed using the rate monotonic scheduling algorithm with a sporadic server, and the second one, based on the earliest deadline scheduling algorithm, is a dynamic scheduler. Time constraints and independence of the network functions were studied and then considered in the definition of the scheduler characteristics. The schedulers implementations described in this work refer specifically to the network analysis functions running on a single processor in Unix workstations. Tests have been performed with part of the CPFL network (Campinas region) and the results are reported in the dissertation
Mestrado
Mestre em Engenharia Elétrica

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Peronaglio, Fernanda Fernandes. "Modelagem de relações entre tarefas usando interfaces gráficas aplicada em sistemas de tempo-real /." São José do Rio Preto, 2019. http://hdl.handle.net/11449/183357.

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Abstract:

Orientador: Aleardo Manacero
Banca: Henrique Dezani
Banca: Rodrigo Capobianco Guido
Resumo: A análise de sistemas computacionais por meio de simulação depende fortemente de como as tarefas a serem executadas serão modeladas. Isso é ainda mais importante quando se fala de sistemas de tempo-real, em que tarefas devem ser atendidas dentro dos intervalos corretos e a análise por simulação evita perigos possivelmente presentes se executadas no ambiente real. Entretanto, simuladores de tarefas tipicamente as modelam como blocos independentes de carga de trabalho. Embora isso seja correto ou aceitável em muitas situações, isso não é sempre verdade em sistemas de tempo-real, pois normalmente aplicações desse tipo apresentam relações de dependência entre si. Em alguns simuladores isso é resolvido com a escrita do modelo de tarefa em alguma linguagem de modelagem especíﬁca, o que evidentemente diﬁculta o trabalho de simulação se comparado com abordagens gráﬁcas. Desse modo, aqui se propõe uma abordagem que permita a modelagem de interações entre tarefas, em especial de tempo-real, por meio de interfaces visuais, sem comprometer a corretude do motor de simulação. A modelagem visual permite que o usuário se concentre no problema a ser avaliado e não na programação de seus detalhes, melhorando a eﬁciência desse processo. Na abordagem proposta se parte do conceito de árvores hierárquicas para estabelecer associações entre tarefas, elementos de processamento e recursos do sistema. As relações previstas entre tarefas incluem precedência, sincronismo, paralelismo e exclusão mútua...
Abstract: Analysis of computing systems through simulation is strongly dependent of how tasks to be executed are modeled. This is even more important in real-time systems, where tasks must be executed before their deadlines, and their simulation avoid possible risks present in the real environment. However, simulators of such tasks usually model them as independent load blocks. Although this is correct for many systems, it is not always true for real-time systems, where applications usually have dependence relationships between tasks. In some simulators this is solved by enforcing the user to write the model in some modeling or simulation language, clearly making the simulation harder when compared to graphical approaches. Therefore, a graphical approach for task modeling is proposed. This approach is specially aimed to real-time tasks and does not compromise simulation accuracy. Graphical, that is visual, modeling allows for the user to focus on the problem to be evaluated and not in programming details of the system, improving the eﬃciency of this process. This proposal is based on the hierarchical tree concept to establish associations between tasks, processing elements and system resources. Chosen relationships include precedence, synchronism, parallelism and mutual exclusion. This proposal is validated through its application in a simulator of real-time scheduling algorithms named RTsim, which already oﬀers interesting modeling/simulation characteristics such as interfaces to ...
Mestre

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Silva, Tiago Sanches da. "Plataforma de estudo para determinação de conectividade cerebral embarcada e em tempo real." Universidade de São Paulo, 2016. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3142/tde-30062016-075729/.

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Abstract:

A presente dissertação examina um método de determinação da conectividade cerebral cujo uso vem se tornando popular nos últimos anos, o partial direct coherence (PDC), que se destaca dentre outros métodos por possibilitar a verificação das relações imediatas de sinais multivariados. Este método representa a conectividade cerebral no domínio da frequência e tem íntima relação com a noção de \"causalidade\" de Granger (GRANGER, 1969), que possibilita quantificar a influência mútua entre séries temporais observadas. De um ponto de vista computacional, o referido método faz uso de modelos de séries temporais que hoje têm implementação bastante eficiente em termos de algoritmos off-line, mas cujo sucesso depende da presunção de estacionariedade dos dados, fato que é somente verdadeiro em trechos relativamente curtos de sinais de origem cerebral, como no caso do EEG (Eletroencefalograma). O objetivo deste trabalho é criar um sistema que calcule o PDC, continuamente, em tempo real e que possua a mesma precisão do método off-line, além de ser uma plataforma de estudos para implementações e testes de métodos de determinação da conectividade neural em tempo real. A plataforma desenvolvida é modular, incentivando futuros trabalhos na mesma, e mostrouse eficaz quanto a precisão numérica dos resultados do cálculo do PDC. As características de tempo real foram atingidas com algumas restrições, que dependem da configuração do usuário e do número de canais que um sinal possui.
This thesis examines a method of determination of brain connectivity whose use becomes popular in recent years, the partial direct coherence (PDC) that stands out in comparison with other methods for making possible the verification of immediate relations of multivariate signal. This method represents the brain connectivity in the frequency domain and has a close relationship with the notion of Granger causality (GRANGER, 1969) that makes it possible to quantify the mutual influence between observed time series. From a computational perspective, the above method makes use of time series models, which today has very efficient implementation in terms of off-line algorithm, but whose success depends on presume that the data is stationary, a fact that is only true in relatively short stretches of cerebral signals, especially in the case of EEG. The objective of this thesis is to create a system that calculates the PDC continuously and in real time maintaining the same precision of the off-line method. Furthermore being a research platform for implementations and tests of new methods for determining neural connectivity in real time. The developed platform is modular encouraging future work on it, and was effective in the numerical accuracy of the PDC calculation results. The real time characteristics were achieved with some restrictions that depend of the user configuration and the number of channels that the signal has.

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Carvalho, Carlos Alberto de Paiva. "Estudo do algoritmo dos múltiplos tiros para controle ótimo em tempo real de veículos aeroespaciais." Instituto Tecnológico de Aeronáutica, 1989. http://www.bd.bibl.ita.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1474.

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Abstract:

Neste trabalho é apresentado um estudo do algoritmo dos Múltiplos Tiros para solução do problema de valor de contorno em dois pontos que surge da aplicação do Princípio de Mínimo de Pontryagin para guiagem ótima de veículos aeroespaciais. É feita uma descrição do método e é proposta uma modoficação no sentido de aumentar a sua velocidade e robustez, tornando-o mais adequado para uso em tempo real. É feita, através de simulação digital, uma avaliação do método modificado para a guiagem em malha fechada e em tempo real de um míssil solo-ar.

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Froder, Hans. "Desenvolvimento de métodos para a quantificação direta de Salmonella sp. por PCR-tempo real e por transcriptase reversa-PCR-tempo real." Universidade de São Paulo, 2008. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9131/tde-25012011-175156/.

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Abstract:

Para obter resultados rápidos e confiáveis que permitam o monitoramento da segurança microbiológica de alimentos, seja pela indústria ou pelos órgãos de fiscalização, diversos métodos alternativos têm sido desenvolvidos para a detecção e quantificação de Salmonella. Os propósitos do estudo foram avaliar a viabilidade de emprego do QIAamp® DNA Stool Mini Kit para extração e purificação de DNA de Salmonella; validar ensaios baseados em PCR-tempo real (PCR-RT) para quantificar o DNA de Salmonella empregando ttr ou tuf e desenvolver um ensaio para quantificar Salmonella baseado na transcriptase reversa-PCR-tempo real (RT-PCR-RT). Para avaliação do QIAamp® DNA Stool Mini Kit empregaram-se fezes coletadas diretamente do reto de animais infectados ou não, sendo estas últimas artificialmente contaminadas e submetidas à extração segundo protocolo do fabricante. As amostras de DNA isoladas foram quantificadas empregando um ensaio Salmonella-específico PCR-RT utilizando como alvo o lócus ttr. O mesmo ensaio foi utilizado para células de Salmonella provenientes de meio de cultura. O ensaio PCR-RT baseado no alvo tuf foi validado empregando-se primeiramente cepas de diferentes sorotipos de Salmonella e de outras Enterobacteriaceae. A seguir sua eficiência foi avaliada para alimentos-modelo (ave e suíno) artificialmente contaminadas com elevada (≈ 6 log UFC/mL) e baixa (≈ 2 log UFC/mL) população de Salmonella Typhimurium DT 104. A validação do método quantitativo de Salmonella por RT-PCR-RT foi realizada primeiramente com células em meio de cultura e posteriormente nos mesmos alimentos-modelo utilizados para PCR-RT. Em ambos os métodos, alíquotas dos alimentos-modelo foram mantidas a 20 ºC e a 8 ºC, sendo examinadas em diferentes tempos pós-inoculação. Como controle empregou-se a enumeração de microrganismos mesófilos totais e de Salmonella por técnicas convencionais. A taxa de recuperação de Salmonella em fezes suínas artificialmente inoculadas, após tratamento com QIAamp® DNA Stool Kit, variou entre 25% a 50%, dependendo da quantidade inicial de células. Empregando o DNA extraído e submetendo-o à PCR-RT para o ttr obteve-se limite de detecção de 2,8 log UFC eq/g de fezes; método que foi menos sensível que o convencional. A quantificação de Salmonella por PCR-RT empregando tuf apresentou limite de detecção menor que 1 log UFC eq. Os resultados obtidos com este método, empregando-se células em meio de cultura ou alimentos-modelo, foram, de maneira geral, ligeiramente inferiores aos do método convencional. A eficiência de amplificação para PCR-RT e tuf foi de 94%. O método RT-PCR-RT apresentou limite de detecção semelhante ao obtido com o ttr (2 log UFC eq) e sua eficiência de amplificação foi de 100%. Observou-se que tuf é expresso na fase logarítmica de multiplicação bacteriana, o que o torna um bom indicador da viabilidade de Salmonella.
In order to get fast and trustworthy results that allow monitoring the microbiological food safety either by industries or governmental agencies, diverse alternative methods have been developed for Salmonella detection and quantification. The purposes of this study were to evaluate the viability of the use of QIAamp® DNA Stool Mini Kit for Salmonella DNA extraction and purification; to validate assays based on real time-PCR (PCR-RT) to quantify Salmonella DNA by using ttr or tuf, and to develop an assay to quantify Salmonella based on reverse transcriptase- PCR-real time (RT-PCR-RT). For QIAamp® DNA Stool Mini Kit evaluation feces taken directly from the rectum of infected or health animals were used, with the former being artificially contaminated. Samples were submitted to DNA extraction, according to manufacturers protocol. The isolated DNA were quantified using a Salmonella-specific PCR-RT targeting the ttr locus. The same assay was used for Salmonella cells originated from culture medium. The PCR-RT assay with tuf as target was first validated employing different Salmonella serovars and other Enterobacteriaceae strains. After, its efficiency was evaluated on food-models (chicken and swine) spiked with high (≈ 6 log CFU/mL) and low (≈ 2 log CFU/mL) Salmonella Typhimurium DT 104 populations. The validation of the quantitative RT-PCR-RT method was first conducted with cells grown in culture medium, and then in the same food-model used for PCR-RT. For both methods aliquots of foodmodels were maintained at 20 ºC and 8 ºC being evaluated at different incubation times. Enumeration of total mesophilic microorganisms and Salmonella based on conventional methods were used as controls. The DNA recovery rate in swine feces artificially inoculated, after QIAamp® DNA Stool Mini Kit treatment, was between 25% to 50% depending the initial amount of cells. Using the extracted DNA and submitting it to PCR-RT for ttr a detection level of 2,8 CFU eq/g of feces was obtained. This method showed lower sensitivity than the conventional. Salmonella quantification by PCR-RT employing tuf showed a detection level lower than 1 log CFU eq. The results obtained with this method and cells suspended in culture medium or in food-model systems were, in general slightly lower that those obtained with the conventional method. The efficiency of amplification for PCR-RT tuf was 94%. Detection limit of RT-PCR-RT was similar to that of ttr (2 log CFU eq) and efficiency of amplification was 100%. tuf was expressed in logarithmic phase of bacteria growth curve showing that it is a good viability indicator for Salmonella.

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Morais, Rayana Carla Silva de. "Aplicabilidade da técnica de PCR em tempo real para caracterização de espécies de Leishmania." reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ, 2015. https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/12756.

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Abstract:

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Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães
A Leishmaniose Tegumentar Americana (LTA) é causada por protozoários, do gênero Leishmania, envolvidos em um complexo ciclo biológico. No Brasil, sete espécies estão envolvidas com a etiologia da doença, distribuídas em todas as regiões geográficas e responsáveis por diferentes manifestações clínicas. Diante disso, o diagnóstico em conjunto com a identificação da espécie é de grande importância clínico-terapêutica. Este trabalho tem por objetivo avaliar a aplicabilidade da técnica de PCR quantitativa em tempo real (qPCR) para identificação de espécies de Leishmania envolvidas com a etiologia da LTA. Foram realizados ensaios de qPCR para padronização da Temperatura de melting (Tm) utilizando cepas de referência de diferentes espécies de Leishmania. Após o diagnóstico em amostras de sangue de animais domésticos utilizando a qPCR, as amostras positivas foram analisadas através de suas Tm, e os produtos de qPCR foram purificados e sequenciados. Dez amostras previamente caracterizadas por isoenzimas, também foram analisadas através da Tm. Ainda como teste de referência, foi padronizada uma Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) utilizando as cepas de referência e testada nas amostras. Através da padronização da Tm das espécies, foram criados dois intervalos de análise: 1 (Tm = 78-79,99°C), que compreende: Leishmania (V.) braziliensis, Leishmania (V.) panamensis, Leishmania (V.) lainsoni, Leishmania (V.) guyanensis e Leishmania (V.) shawi; e 2 (Tm = 80-82,2°C), que compreende: Leishmania (V.) naiffi, Leishmania (L.) amazonensis e Leishmania (L.) mexicana. Um total de 223 amostras positivas foi analisado, destas, 58 incluídas no intervalo 1 e 165 no intervalo 2. O sequencimento de 94 destas amostras foi correspondente à L. (V.) braziliensis, L. (V.) panamensis e L. (V.) guyanensis. A RFLP em 173 amostras identificou 167 L. (V.) braziliensis, 05 L. (L.) mexicana e 01 L. (V.) panamensis. A análise da Tm das dez amostras caracterizadas por isoenzimas demonstrou 80 por cento de concordância (p = 0,6499) entre o padrão-ouro (isoenzimas) e os intervalos desenvolvidos neste estudo. Os resultados do sequenciamento foram concordantes com a qPCR em 43,62 por cento (n= 41) das amostras. A RFLP e qPCR tiveram 27,74 por cento (n= 48) de concordância. Análise estatística mostrou que a qPCR e sequenciamento são testes sem diferenças estatísticas significantes (p = 0,2566). Sendo assim, é possível concluir que a Tm da qPCR pode ser utilizada como um método para direcionamento da espécie de Leishmania presente na amostra em análise, sendo necessário a realização de métodos clássicos de caracterização, quando a precisão na identificação do parasito for crucial para implementação do tratamento, como em casos de resistência e/ou recidiva da doença. A utilização desta tecnologia pode ser ainda mais precisa quando for utilizada a metodologia com sondas desenhadas para cada espécie de Leishmania, sendo necessários estudos futuros para comprovar esta perspectiva (AU)
The American Cutaneous Leishmaniasis (ACL) is caused by protozoa of the genus Leishmania, involved in a complex biological cycle. In Brazil, seven species are involved in the etiology of the disease, distributed in all geographic regions and responsible for different clinical manifestations. Therefore, the diagnosis together with the identification of the species is of great clinical and therapeutic importance. This work aims to evaluate the applicability of the technique of real-time quantitative PCR (qPCR) for the identification of Leishmania species involved in the etiology of ACL. qPCR assays for standardizing the melting temperature (Tm) using reference strains of different species of Leishmania were performed. After the diagnosis on blood samples of domestic animals using the qPCR positive samples were analyzed by their Tm and qPCR products were purified and sequenced. Ten samples previously characterized by isoenzymes were also analyzed by Tm. Also as a reference test was standardized as Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) using the reference strains and tested on samples. Through standardization of Tm species two ranges of analysis were created: 1 (Tm = 78-79,99°C), comprising: Leishmania (V.) braziliensis, Leishmania (V.) panamensis, Leishmania (V.) lainsoni, Leishmania (V.) guyanensis e Leishmania (V.) shawi; and, 2 (Tm = 80-82,2°C), comprising: Leishmania (V.) naiffi, Leishmania (L.) amazonensis e Leishmania (L.) mexicana. A total of 223 positive samples were analyzed, of these, 58 included in the range 1 and 165 in the range 2 to 94 and the sequence of these samples corresponded to L. (V.) braziliensis, L. (V.) panamensis and L. (V.) guyanensis. By RFLP in 173 samples were identified 167 L. (V.) braziliensis, 05 L. (L.) mexicana and 01 L. (V.) panamensis The analysis of Tm of the ten samples characterized by isoenzymes showed 80 per cent agreement (p = 0.6499) between the gold standard (isoenzymes) and intervals developed in this study. The sequencing results were concordant with qPCR in 43.62 per cent (n= 41) of the samples. The RFLP and qPCR had 27.74 per cent (n= 48) agreement. Statistical analysis showed that qPCR and sequencing tests are no statistically significant differences (p = 0.2566). Thus, we conclude that the Tm of qPCR can be used as a method for direction of Leishmania species present in the sample under analysis, performing classic methods of characterization is necessary when the accuracy in identifying the parasite is crucial for implementation treatment, such as in cases of resistance and / or recurrence of the disease. The use of this technology can be even more precise when the methodology with probes designed for every Leishmania species is used; future studies are needed to confirm this view (AU)

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Tolentino, Carlos Henrique Corrêa. "Modelagem e análise de restrições de tempo real no escalonamento em síntese de alto nível." Florianópolis, SC, 2004. http://repositorio.ufsc.br/xmlui/handle/123456789/86612.

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Abstract:

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-graduação em Ciência da Computação.
Made available in DSpace on 2012-10-21T08:46:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 202752.pdf: 768214 bytes, checksum: c8a8db65a7bdaaa5e098882707a683d9 (MD5)
Este trabalho apresenta a resolução de um problema clássico da Síntese de Alto Nível: o escalonamento sob restrições de recursos e de tempo. Para tanto utiliza uma abordagem orientada à exploração automática de soluções alternativas. O problema consiste em escalonar as operações de um algoritmo buscando uma melhor utilização dos recursos físicos e satisfazendo uma série de restrições de recursos, de precedência e de tempo. Os resultados experimentais mostram o sucesso das técnicas propostas em eliminar soluções de baixa qualidade do espaço de busca e melhorar a qualidade média do espaço de soluções. Em adição, na maioria dos testes realizados houve uma redução do tempo de busca por soluções de boa qualidade.

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Arruda, Eduardo Henrique Zanella de. "Análise de eventos em sistemas elétricos de potência em tempo real utilizando sincrofasores e a transformada wavelet discreta." reponame:Repositório Institucional da UFSC, 2017. https://repositorio.ufsc.br/xmlui/handle/123456789/183230.

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Abstract:

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica, Florianópolis, 2017.
Made available in DSpace on 2018-02-06T03:17:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 349769.pdf: 7351711 bytes, checksum: c4c9058ce4e9650224b4d6d367c6376e (MD5) Previous issue date: 2017
Este trabalho tem como objetivo o estudo e o desenvolvimento de metodologias para a análise automática de eventos, em tempo real, em Sistemas de Energia Elétrica (SEE), com a utilização de dados de medição sincronizada de fasores (SMSF) e da Transformada Wavelet Discreta (TWD). As metodologias aplicadas empregam conceitos dos sistemas de monitoramento de grandes áreas (WAMS). Tais sistemas visam melhorar e facilitar a operação em tempo real de grandes SEEs, os quais reduzem o tempo para a tomada de decisões a fim de evitar a propagação de eventos por meio do efeito cascata, diminuindo, assim, a ocorrência de blecautes. A análise automática de eventos engloba a detecção em tempo real, a classificação quanto ao tipo de evento, sua localização e a magnitude em MW, quando há cortes de carga ou geração. Todas as etapas do processo de análise de eventos fazem o uso da TWD, por meio de uma análise multiresolução (AMR). Essa técnica de análise de sinais se destaca pela capacidade de decompor o sinal em funções no domínio do tempo e da frequência, simultaneamente, os quais permitem identificar as frequências existentes no sinal em seu respectivo instante temporal. As características dos sinais são observadas em tempo real e, na ocorrência de um evento, as características do evento, por sua vez, são extraídas em diferentes resoluções e interpretadas pelo algoritmo desenvolvido. O algoritmo foi implementado em linguagem C# e validado com dados do Sistema Nacional de Medição Sincronizada de Fasores em Baixa Tensão (110 ou 220 V) - SMSF MedFasee BT/UFSC. Este sistema dispõe de 25 pontos de medição instalados em universidades, abrangendo 20 estados das cinco regiões geográficas do país. Os resultados obtidos demonstram que a TWD apresenta resultados efetivos em todas as etapas do processo de análise automática de eventos em SEE em tempo real.
Abstract : This work has as objective the study and the development of methodologies for the automatic analysis of events in real-time, in Electric Power Systems (EPS), with the use of synchronized phasor measurement data and the Discrete Wavelet Transform (DWT). The methodologies use the concept of wide area measurement systems (WAMS). Such systems aim to improve and facilitate the real-time operation of large EPS, reducing the time for actions to be taken, in order to prevent the propagation of an event through the cascading effect, thereby decreasing blackout occurrences. Automatic event analysis encompasses real-time detection, classification of type of event, its location and its magnitude, in MW, when there are load or generation shedding. All stages of the process of event analysis make use of TWD through a Multiresolution Analysis (AMR). This signal analysis technique is highlighted by the capacity to decompose the signal into functions in time and frequency domains simultaneously, which allows identifying the existing frequencies of the signal at their respective time instant. The signal characteristics are observed in real-time and, with the occurrence of an event, the event characteristics are extracted at different resolutions and interpreted by the developed algorithm. The algorithm was developed in C# language and validated with data from the National Synchronized Measurement System at Low Voltage (110 or 220 V) - SMSF MedFasee BT. This system has 25 measuring points installed at universities, covering 20 states of the five geographic regions of Brazil. The acquired results show that DWT presents effective results in all stages of the processes of automatic event analysis in real-time, in EPS.

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Silva, Alexandra Rosa da. "Análise da cinética de replicação do parvovírus canino em cultivo de células CRFK através da PCR em tempo real." Universidade de São Paulo, 2011. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-07082012-163057/.

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No presente estudo, foi inicialmente padronizada uma PCR para detecção do DNA viral da semente de Parvovírus Canino utilizado na vacina brasileira Imunovet® (VR-953TM), tendo como alvo o gene VP2. O produto de PCR foi submetido ao seqüenciamento a fim de caracterizar geneticamente a semente vacinal. A seguir, foi padronizada uma reação de PCR em tempo real (RT-PCR) para detecção de um fragmento de 119 pb do gene VP2, a qual foi empregada para avaliar a cinética de replicação da amostra vacinal do CPV em diferentes métodos e tempos de cultivo celular. A correlação entre os resultados do título infeccioso das amostras virais e o número de cópias obtido na RT-PCR foi avaliado pelo Coeficiente de Correlação de Pearson. A PCR padronizada apresentou uma sensibilidade analítica de 457 DICC50/mL. O seqüenciamento do produto de PCR revelou que a amostra vacinal é do tipo CPV-2. A RT-PCR padronizada apresentou uma sensibilidade analítica de 1030 cópias de DNA/mL e uma boa especificidade analítica, pois não detectou o DNA de Adenovírus canino tipos 1 e 2 e Herpesvírus Equino tipo 1. A RT-PCR exibiu Coeficientes de Variação de triplicatas intra-ensaio de 0,43% e inter-ensaio de 0,29%. O Coeficiente de Correlação de Pearson entre o título infeccioso das amostras virais e o número de cópias obtido na RT-PCR foi de 0,55, considerado moderadamente positivo. Considerando que a região alvo da RT-PCR padronizada apresentou 100% de identidade com 93,52% (159/170) das amostras pesquisadas no GenBank pelo BLAST, a RT-PCR padronizada sugere ter um potencial uso no diagnóstico.
In this study, was originally a standard PCR for detection of viral DNA from the canine parvovirus vaccine seed used in Brazilian Imunovet® (VR-953TM), targeting the VP2 gene. The PCR product was subjected to sequencing to genetically characterized the vaccine seed. Then, a reaction was standardized real-time PCR (RT-PCR) to detect a fragment of 119 bp VP2 gene, which was used to evaluate the growth kinetics of the CPV vaccine sample in different methods and cell culture times. The correlation between results of the infectious titre and the number of copies obtained in RT-PCR was evaluated by Pearsons correlation coefficient. The standardized PCR showed an analytical sensitivity of 457 TCID50/mL. The sequencing of the PCR product showed that the vaccine sample is CPV type 2. The standardized RT-PCR showed an analytical sensitivity of 1030 DNA copies/mL and a good analytical specificity, it does not detect the DNA of canine adenovirus type 1 and 2 and equine herpesvirus type 1. The RT-PCR showed coefficients of variation intra-assay triplicates of 0,43% and inter-assay of 0,29%. The Pearsons correlation coefficient between the titre of infectious viral samples and the number of copies obtained in RT-PCR was 0,55, considered moderately positive. Whereas the target region of the standardized RT-PCR showed 100% identity with 93,52% (159/170) of samples surveyed in Genbank by BLAST, the standard RT-PCR suggests a potential diagnostic use.

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Pavanelli, Paula Edilene. "Controle e monitoramento em tempo real do regime de jorro estavel atraves da analise espectral." [s.n.], 2006. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/267495.

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Orientadores: Osvaldir Pereira Taranto, Flavio Vasconcelos da Silva
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica
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Resumo: Este trabalho apresenta o controle e monitoramento em tempo real do regime de jorro estável através do método de identificação dos regimes de contato gás-sólido por medidas de pressão no leito de jorro. O trabalho foi realizado em duas etapas: 1) identificação em tempo real dos regimes fluidodinâmicos no processo em leito de jorro baseada na análise espectral das flutuações de queda de pressão do leito e 2) controle do processo em regime estável por malha PI. O sistema constitui-se de um leito construído em acrílico com dimensões de 0,70m de altura de coluna e 0,143m de diâmetro interno, operando com três diferentes partículas, esferas de vidro (dp = 2,59mm e Pp = 2,487 g/cm3), poliestireno (dp = 2,19mm e Pp = 1,196 g/cm3) e ABS (dp = 3,08mm e Pp = 1,029 g/cm3). Determinou-se a faixa da freqüência dominante 7,2-7,9 Hz, característico do regime de jorro estável, através do algoritmo da Transformada Rápida de Fourier (FFT) para cada partícula. Todas as medidas de pressão do leito durante o processo foram coletadas pelo sistema de aquisição através da placa PCI 6024E (National Instruments) utilizando o software LabView 7.1TM. Com o intuito de controlar o regime de jorro estável no processo em leito de jorro foram definidas como variáveis controlada e manipulada a freqüência dominante do espectro de potência (Hz) e o sinal de comando para o inversor de freqüência (V), respectivamente. A freqüência dominante foi determinada pela análise espectral das flutuações de queda de pressão no leito. O sinal de comando para inversor de freqüência atuava na variável de processo vazão de ar. Aplicaram-se perturbações degrau em malha aberta na variável manipulada para determinar os parâmetros do controlador e implementou-se a malha de controle no processo. Nos experimentos em malha fechada foram aplicadas perturbações na carga como adição de partículas e alteração na posição de abertura da válvula de ar de entrada no leito afim de testar o desempenho do controlador. Os resultados obtidos mostraram que o controlador PI manteve o sistema operando em regime estável mesmo quando aplicadas perturbações na carga, atingindo assim o objetivo do trabalho proposto
Abstract: This work describes the control and on line monitoring of the spouted bed steady regime using the gas-solid contact regimes identification method by pressure measurements. The work presents two main features: 1) the on line identification of fluid dynamic regimes in the spouted bed process based in the spectral analysis of the pressure fluctuations and 2) the process control using PI controllers. Experiments were performed in an acrylic cylindrical column 0.70m high and with 0.143m of internal diameter. The bed was made of three different particles: glass spheres (dp = 2.59mm and Pp = 2.4873 g/cm3), polystyrene (dp = 2.19mm and Pp = 1.1962 g/cm3) and ABS (dp = 3.08mm and p = 1.0286 g/cm3). The dominant frequency band was determined: 7.2-7.9 Hz for steady regime, through the algorithm of the Fast Fourier Transform (FFT), for each particle. All the measurements of pressure during the process were collected by a data acquisition system and using software LabView 7.0TM. The procedure to control the steady regime in the spouted bed process was: define the dominant frequency as the controlled variable and the signal of command for frequency inverter as the manipulated variable. The dominant frequency was determined by the spectral analysis of pressure fluctuations in the spouted bed. The command signal for frequency inverter affected the air flow variable. Step disturbances were applied in open loop in the manipulated variable to determine the parameters of the controller and control system was implemented in the process. Step disturbances like addition of particles in the spouted bed and change the position of opening of the air valve were applied in closed-loop to test the performance of the controller. The results show that PI controller was able to maintain the system operating in steady regime when disturbances were applied in the feed stream, which was the goal of this research
Mestrado
Engenharia de Processos
Mestre em Engenharia Química

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Ihlaseh, Shadia Muhammad [UNESP]. "Análise da expressão dos genes STEAP1 e STEAP2 em adenocarcinomas de próstata por RT-PCR quantitativa em tempo real." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2008. http://hdl.handle.net/11449/95903.

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Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-02-27Bitstream added on 2014-06-13T19:57:00Z : No. of bitstreams: 1 ihlaseh_sm_me_botfm.pdf: 228425 bytes, checksum: d8ddb66a9f9af259ca5de94c447588a1 (MD5)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
O câncer de próstata (CaP) é um problema de saúde pública devido suas altas taxas de incidência e de mortalidade. Atualmente, os marcadores disponíveis para o diagnóstico e prognóstico não são capazes de diferenciar os CaPs indolentes dos que progridem mais agressivamente. Estudos moleculares usando análises em larga escala, como hibridação genômica comparativa baseada em arrays (aCGH), permitem a identificação de vários genes candidatos a marcadores. Estudos prévios de nosso grupo usando hibridação aCGH em CaP demonstraram amplificação em 7q21.13, onde estão mapeados os genes STEAP1 e STEAP2 (sixtransmembrane epithelial antigen of prostate 1 e 2). Esses genes apresentam expressão aumentada em diversas linhagens de células neoplásicas, incluindo as de próstata. No entanto, seu papel no desenvolvimento e progressão do CaP permanece desconhecido. Há evidências de que eles codificam antígenos tumorais com potencial para serem utilizados como marcadores prognósticos. O presente trabalho visou determinar o perfil de expressão dos genes STEAP1 e STEAP2 por RT-PCR quantitativa em tempo real (qRT-PCR) em adenocarcinomas primários de próstata, em amostras de tecido não-neoplásico adjacente aos tumores e em hiperplasias nodulares da próstata (HNP). Amostras de próstatas avaliadas histologicamente como normais foram obtidas de necropsias e usadas como controles. Os pacientes foram agrupados em três classes segundo o risco de recorrência do tumor (baixo, moderado e alto) de acordo com o PSA (antígeno prostático sérico), a graduação histológica e o estadiamento dos tumores. Foi observado aumento de expressão dos genes STEAP1 e STEAP2 em 28% e 38% das amostras, respectivamente; em três pacientes com alto risco de recorrência houve aumento simultâneo da expressão dos dois genes. A expressão...
Available prognostic markers as serum PSA levels, Gleason differentiation scores and tumor staging have not been able to discriminate indolent from aggressive tumors. Increased expressions of STEAP1 and STEAP2 genes (six-transmembrane epithelial antigen of prostate 1 e 2) have been shown in neoplastic cell lineages from prostate, urinary bladder, ovary and other tumors. Previously, using comparative genomic hybridization based in arrays in prostate adenocarcinomas and their metastasis, we described genomic gains at the 7q21.13. In this region are mapped the STEAP1 and STEAP2 genes. The involvement of these genes in PCa development and progression remains to be clarified. These genes possibly express tumoral antigens and are putative molecular markers.The objective of the present study was to determine the gene expression profiles of the STEAP1 e STEAP2 genes by real time quantitative PCR in primary prostate adenocarcinomas, surrounding non-neoplastic tissues, and in nodular hyperplasia of the prostate. The results were associate with tumor pathologic characteristics and patients clinical features. Samples from histologically confirmed normal prostates obtained from necropsies were used as normal controls. According to potential risk for tumor recurrence (low, moderate and high risk) patients were classified in three groups depending on the serum PSA levels, Gleason scores, and tumor stages. Increased expression of STEAP1 e STEAP2 genes were registered in 28% and 38% of samples, respectively; both genes presented simultaneously increased expression level in three high-risk cases. Similar pattern of expression were detected in the majority of CaP (Spearman r=0,63; p<0,0001) and non-neoplastic surrounding tissue (Spearman r=0,78; p=0,0002) samples. Compared to the non-neoplastic surrounding tissues there was significant increase of STEAP1 gene expression in PCa samples... (Complete abstract click electronic access below)

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Ihlaseh, Shadia Muhammad. "Análise da expressão dos genes STEAP1 e STEAP2 em adenocarcinomas de próstata por RT-PCR quantitativa em tempo real /." Botucatu : [s.n.], 2008. http://hdl.handle.net/11449/95903.

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Abstract:

Resumo: O câncer de próstata (CaP) é um problema de saúde pública devido suas altas taxas de incidência e de mortalidade. Atualmente, os marcadores disponíveis para o diagnóstico e prognóstico não são capazes de diferenciar os CaPs indolentes dos que progridem mais agressivamente. Estudos moleculares usando análises em larga escala, como hibridação genômica comparativa baseada em arrays (aCGH), permitem a identificação de vários genes candidatos a marcadores. Estudos prévios de nosso grupo usando hibridação aCGH em CaP demonstraram amplificação em 7q21.13, onde estão mapeados os genes STEAP1 e STEAP2 (sixtransmembrane epithelial antigen of prostate 1 e 2). Esses genes apresentam expressão aumentada em diversas linhagens de células neoplásicas, incluindo as de próstata. No entanto, seu papel no desenvolvimento e progressão do CaP permanece desconhecido. Há evidências de que eles codificam antígenos tumorais com potencial para serem utilizados como marcadores prognósticos. O presente trabalho visou determinar o perfil de expressão dos genes STEAP1 e STEAP2 por RT-PCR quantitativa em tempo real (qRT-PCR) em adenocarcinomas primários de próstata, em amostras de tecido não-neoplásico adjacente aos tumores e em hiperplasias nodulares da próstata (HNP). Amostras de próstatas avaliadas histologicamente como normais foram obtidas de necropsias e usadas como controles. Os pacientes foram agrupados em três classes segundo o risco de recorrência do tumor (baixo, moderado e alto) de acordo com o PSA (antígeno prostático sérico), a graduação histológica e o estadiamento dos tumores. Foi observado aumento de expressão dos genes STEAP1 e STEAP2 em 28% e 38% das amostras, respectivamente; em três pacientes com alto risco de recorrência houve aumento simultâneo da expressão dos dois genes. A expressão... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)
Abstract: Available prognostic markers as serum PSA levels, Gleason differentiation scores and tumor staging have not been able to discriminate indolent from aggressive tumors. Increased expressions of STEAP1 and STEAP2 genes (six-transmembrane epithelial antigen of prostate 1 e 2) have been shown in neoplastic cell lineages from prostate, urinary bladder, ovary and other tumors. Previously, using comparative genomic hybridization based in arrays in prostate adenocarcinomas and their metastasis, we described genomic gains at the 7q21.13. In this region are mapped the STEAP1 and STEAP2 genes. The involvement of these genes in PCa development and progression remains to be clarified. These genes possibly express tumoral antigens and are putative molecular markers.The objective of the present study was to determine the gene expression profiles of the STEAP1 e STEAP2 genes by real time quantitative PCR in primary prostate adenocarcinomas, surrounding non-neoplastic tissues, and in nodular hyperplasia of the prostate. The results were associate with tumor pathologic characteristics and patients clinical features. Samples from histologically confirmed normal prostates obtained from necropsies were used as normal controls. According to potential risk for tumor recurrence (low, moderate and high risk) patients were classified in three groups depending on the serum PSA levels, Gleason scores, and tumor stages. Increased expression of STEAP1 e STEAP2 genes were registered in 28% and 38% of samples, respectively; both genes presented simultaneously increased expression level in three high-risk cases. Similar pattern of expression were detected in the majority of CaP (Spearman r=0,63; p<0,0001) and non-neoplastic surrounding tissue (Spearman r=0,78; p=0,0002) samples. Compared to the non-neoplastic surrounding tissues there was significant increase of STEAP1 gene expression in PCa samples... (Complete abstract click electronic access below)
Orientador: João Lauro Viana de Camargo
Coorientador: Silvia Regina Rogatto
Banca: Maria Inês Pardini
Banca: Luciano João Nesrallah
Mestre

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Eiras, Fabio Cocchi da Silva. "Benefícios do padrão IEEE 802.11e para tráfego de tempo real em redes WLAN não estruturadas." Universidade de São Paulo, 2009. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3142/tde-01062009-175020/.

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Abstract:

A utilização das redes sem fio nos mais diversos segmentos vem crescendo vertiginosamente nos últimos anos. Aliado ao crescimento da utilização das redes, está a diversificação de aplicações utilizadas por todos os usuários, sejam eles corporativos ou domésticos. Isto tem contribuído significativamente para o desenvolvimento de tecnologias que ofereçam mecanismos de qualidade de serviço, de forma a permitir o uso satisfatório de aplicações como voz e vídeo em tempo real. Este trabalho estuda os efeitos que a existência de tráfego de voz e dados em redes sem fio padrão IEEE 802.11 causa no desempenho da rede e por consequência no desempenho das aplicações. Para realizar este estudo foram executadas simulações baseadas em uma rede sem fio com topologia ad hoc, com variações no número de estações e quantidade de tráfego gerado. Foram simulados os padrões 802.11g e 802.11e com o objetivo de analisar o desempenho dos mecanismos de qualidade de serviço e os benefícios que estes mecanismos geram para a transmissão de tráfego em tempo real em redes sem fio padrão IEEE 802.11. Verificou-se que o padrão IEEE 802.11e apresenta um ganho de desempenho para aplicações de tempo real, porém ele apresenta limitações que devem ser consideradas nos projetos de redes sem fio.
The use of wirelles networks in most various sectors has been growing drastically in past years Allied to the wireless networks use, the diversification of applications and services provided can be directly verified whether by home or corporate users. This alliance contributes significantly to the needs of technology development which offer the quality of service mechanisms, allowing satisfactory use of real-time applications like voice and video This paper studies the effects that coexistent voice and data traffic on a IEEE 802.11 standard wireless network cause in the network performance and, consequently, in the applications performance. To make this study a reality, it was necessary to run simulations of a wireless ad hoc topology network, with variations in the number of workstations and the quantity of generated traffic. The 802.11g and 802.11e standards were used in the simulations with the purpose of analyzing the performance of quality of service mechanisms and the benefits they create for the real-time transmissions in IEEE 802.11 standard wireless networks. It was verified that the IEEE 802.11e standard presents a perfomance gain for the real-time applications, but it has limitations that should be considered in wireless networks design.

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Midena, Raquel Zanin. "Suscetibilidade antimicrobiana e protocolo de purificação de RNA para análise de expressão gênica de isolados clínicos de Fusobacterium nucleatum." Universidade de São Paulo, 2015. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/25/25147/tde-26022016-143429/.

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Abstract:

Fusobacterium nucleatum é uma espécie bacteriana Gram-negativa, anaeróbia estrita e uma das espécies frequentemente encontradas nas infecções primárias do sistema de canais radiculares. Esta espécie tem grande importância na formação de biofilmes por ser uma ponte de união entre espécies que não são capazes de interagir. Os micro-organismos constituintes de biofilmes trocam material genético, aumentando a tolerancia dos mesmos e é quase impossível um isolado clínico ter os genes totalmente iguais à cepa padrão de coleções de cultura como da ATCC (American Type Culture Colection). O presente estudo investigou a espécie bacteriana anaeróbia Fusobacterium nucleatum isolada de canais radiculares, comparando-a com sua cepa de referência. Foi feito a comparação da suscetibilidade microbiana in vitro por meio de cultura microbiológica pelo método do E-test, com as cepas em crescimento planctônico e em biofilme. Também foi definido um protocolo de Purificação de RNA para esta espécie em ambas as condições de crescimento. As cepas clínicas de F. nucelatum foram isoladas por meio da cultura microbiológica de 23 pacientes que apresentavam dentes com infecção primária e periodontite apical visível em radiografia. Foi feito isolamento e identificação da espécie por série bioquímica com testes comerciais (Sistema Api, Bio-Meriéux, França) e PCR convencional, sendo no total 4 isolados clínicos investigados. Foi verificada a suscetibilidade antimicrobiana dos seguintes antibióticos: Amoxicilina, Amoxicilina + ácido clavulânico, Ampicilina, Azitromicina, Clindamicina, Eritromicina e Metronidazol. O protocolo para purificação de RNA foi feito com microesferas de zircônia, dispositivo bead beater, kit comercial RNeasy (Qiagen) e transcrição para DNA complementar (cDNA). A qualidade da purificação foi testada quanto a sua capacidade de amplificação pela reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) utilizando primer para o gene 16s RNA específico para F. nucelatum. Todas as cepas testadas foram 100% suscetíveis a Amoxicilina + ácido clavulânico, Ampicilina, Azitromicina, Clindamicina e Metronidazol. Ambos os tipos de crescimento bacteriano demonstraram resistência somente à eritromicina. O protocolo proposto para a purificação do RNA de F. nucelatum dos isolados em crescimento planctônico e em biofilme foi eficaz. A média do rendimento do RNA das amostras para as bactérias em crescimento planctônico foi de 514,2 ng/μL (DP ± 397,7) e para as amostras em biofilme foi de 377,1 ng/μL (DP± 144,1). Os valores encontrados sugerem uma boa qualidade de RNA, livre de contaminação por proteínas. Todas as cepas de Fusobacterium nucleatum isoladas de canais radiculares, assim como a cepa ATCC foram suscetíveis aos antibióticos testados, com exceção do antibiótico eritromicina em ambos os tipos de crescimento bacteriano. As bactérias em biofilme apresentaram aumento na tolerância frente aos agentes antimicrobianos, com diferença estatística. O protocolo estabelecido para a purificação do RNA de cepas de Fusobacterium nucleatum cultivadas em fase planctônica e em biofilmes teve êxito com amplificação por qPCR.
Fusobacterium nucleatum is a Gram-negative bacterial species, strict anaerobic and one of the species often found in primary infection of the root canal system. This species has great importance in biofilm formation to be a union bridge between species which are not able to act alone. The constituent microorganisms of the biofilm exchange each tother genetic material, increasing the strength of them. It is almost impossible for a clinical isolate have genes totally equal to a standard strain, such as strains of culture collections like ATCC (American Type Culture Collection). The present study investigated anaerobic bacterial species Fusobacterium nucleatum isolated from root canals, comparing them to the ATCC strain. The microbial in vitro susceptibility of biofilm and planktonic growth of the strains was compared by means of microbiological culture and the E-test method, with the antibiotics Amoxicillin, Amoxicillin + clavulanic acid, Ampicillin, Azithromycin, Clindamycin, Eritromycin and Metronidazole.. Also, a RNA Purification protocol for the strains under the same growth conditions was defined. Clinical isolates were obtained by microbiological samples of patients with teeth with pulp necrosis and apical periodontitis visible on radiographs. The species isolation and identification were performed using commercial biochemical tests (Sistema Api, Bio-Meriéux, France) and conventional PCR, obtaining four clinical isolates. The protocol for RNA purification was done with zirconia beads, bead beater device and commercial kit RNeasy (Qiagen) and transcribed into complementary DNA (cDNA). The quality of purification was tested for its ability of amplification by real time polymerase chain reaction (qPCR) using primer for the gene 16s RNA specific for F. nucleatum. All tested trains were 100% susceptible to amoxicillin + clavulanic acid, ampicillin, azithromycin, clindamycin and metronidazole. Both types of bacterial growth showed resistance to Erythromycin. Bacteria in biofilm showed a decrease in susceptibility to all antibiotics, but without statistical difference. The protocol proposed for the purification of RNA of F. nucleatum was effective, in the planktonic and the biofilm growth. The average yield of RNA samples for bacteria in planktonic growth was 514.2 ng /μL (SD ± 397.7) and the samples in biofilm was 377.1 ng / μL (SD ± 144.1). These found values suggest a good quality of RNA, free of protein contamination. The established protocol for the purification of the RNA of the Fusobacterium nucleatum strains, grown in biofilm and planktonic phase, had successfully amplified by qPCR.

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Leão, Fábio Bertequini [UNESP]. "Metodologia para análise e interpretação de alarmes em tempo real de sistemas de distribuição de energia elétrica." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2011. http://hdl.handle.net/11449/100333.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
Neste trabalho é proposta uma metodologia para a análise e interpretação de alarmes em tempo real em sistemas de distribuição de energia elétrica, considerando o diagnóstico em nível de subestações e redes. A metodologia busca superar as dificuldades e desvantagens dos métodos já propostos na literatura especializada para resolver o diagnóstico de faltas em sistemas de potência. O método proposto emprega um modelo matemático original bem como um novo algoritmo genético para efetuar o diagnóstico dos alarmes de maneira eficiente e rápida. O modelo matemático é dividido em duas partes fundamentais: (1) modelo de operação do sistema de proteção; e (2) modelo de Programação Binária Irrestrita (PBI). A parte (1) é composta por um conjunto de equações de estados esperados das funções de proteção dos relés do sistema, modeladas com base na lógica de operação de funções de proteção tais como sobrecorrente, diferencial e distância, bem como na filosofia de proteção de sistemas de potência. A parte (2) é estabelecida através de uma função objetivo formulada com base na teoria de cobertura parcimoniosa (parcimonious set covering theory), e busca a associação ou “match” entre os relatórios de alarmes informados pelo sistema SCADA (Supervisory Control and Data Acquisition) e os estados esperados das funções de proteção formuladas na parte (1) do modelo. O novo algoritmo genético proposto é empregado para minimizar o modelo de PBI e possui como característica a utilização de dois parâmetros de controle. O algoritmo possui taxas de recombinação e mutação automática e dinamicamente calibradas, baseadas na saturação da população corrente, possuindo uma imediata resposta à possível convergência prematura para ótimos locais. A metodologia desenvolvida para o diagnóstico...
This work proposes a methodology for the analysis and interpretation of real-time alarms in electric power distribution systems in the substation level and network level. The methodology seeks to overcome the difficulties and disadvantages of the methods already proposed in the literature to solve the fault diagnosis in power systems. The proposed method employs a novel mathematical model and a genetic algorithm to carry out the diagnosis of alarms efficiently and quickly. The model is divided into two main parts: (1) a protection system operation model; and (2) Unconstrained Binary Programming (UBP) model. Part (1) provides a set of expected state equations of the protective relay functions established based on the protection operation logic such as overcurrent, differential and distance as well as the protection philosophy. Part (2) is established through an objective function formulated based on parsimonious set covering theory for associating the alarms reported by SCADA (Supervisory Control and Data Acquisition) system with the expected states of the protective relay functions. The novel genetic algorithm use only two control parameters and is employed to minimize the UBP model. In addition the algorithm has recombination and mutation rates automatically and dynamically calibrated based on the saturation of the current population and it presents an immediate response to possible premature convergence to local optima. The methodology developed for the diagnosis of substations is extended to distribution networks considering that the network has sufficient level of automation for remote monitoring of the primary feeders. In this way a new paradigm for protection of distribution networks developed based on Smart Grid concept is proposed. Extensive tests are performed with the methodology applied to distribution... (Complete abstract click electronic access below)

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Leão, Fábio Bertequini. "Metodologia para análise e interpretação de alarmes em tempo real de sistemas de distribuição de energia elétrica /." Ilha Solteira : [s.n.], 2011. http://hdl.handle.net/11449/100333.

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Orientador: Jose Roberto Sanches Mantovani
Banca: Rubén Augusto Romero Lázaro
Banca: Carlos Roberto Minussi
Banca: Oriane Magela Neto
Banca: Julio Cesar Stacchini de Souza
Resumo: Neste trabalho é proposta uma metodologia para a análise e interpretação de alarmes em tempo real em sistemas de distribuição de energia elétrica, considerando o diagnóstico em nível de subestações e redes. A metodologia busca superar as dificuldades e desvantagens dos métodos já propostos na literatura especializada para resolver o diagnóstico de faltas em sistemas de potência. O método proposto emprega um modelo matemático original bem como um novo algoritmo genético para efetuar o diagnóstico dos alarmes de maneira eficiente e rápida. O modelo matemático é dividido em duas partes fundamentais: (1) modelo de operação do sistema de proteção; e (2) modelo de Programação Binária Irrestrita (PBI). A parte (1) é composta por um conjunto de equações de estados esperados das funções de proteção dos relés do sistema, modeladas com base na lógica de operação de funções de proteção tais como sobrecorrente, diferencial e distância, bem como na filosofia de proteção de sistemas de potência. A parte (2) é estabelecida através de uma função objetivo formulada com base na teoria de cobertura parcimoniosa (parcimonious set covering theory), e busca a associação ou "match" entre os relatórios de alarmes informados pelo sistema SCADA (Supervisory Control and Data Acquisition) e os estados esperados das funções de proteção formuladas na parte (1) do modelo. O novo algoritmo genético proposto é empregado para minimizar o modelo de PBI e possui como característica a utilização de dois parâmetros de controle. O algoritmo possui taxas de recombinação e mutação automática e dinamicamente calibradas, baseadas na saturação da população corrente, possuindo uma imediata resposta à possível convergência prematura para ótimos locais. A metodologia desenvolvida para o diagnóstico... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)
Abstract: This work proposes a methodology for the analysis and interpretation of real-time alarms in electric power distribution systems in the substation level and network level. The methodology seeks to overcome the difficulties and disadvantages of the methods already proposed in the literature to solve the fault diagnosis in power systems. The proposed method employs a novel mathematical model and a genetic algorithm to carry out the diagnosis of alarms efficiently and quickly. The model is divided into two main parts: (1) a protection system operation model; and (2) Unconstrained Binary Programming (UBP) model. Part (1) provides a set of expected state equations of the protective relay functions established based on the protection operation logic such as overcurrent, differential and distance as well as the protection philosophy. Part (2) is established through an objective function formulated based on parsimonious set covering theory for associating the alarms reported by SCADA (Supervisory Control and Data Acquisition) system with the expected states of the protective relay functions. The novel genetic algorithm use only two control parameters and is employed to minimize the UBP model. In addition the algorithm has recombination and mutation rates automatically and dynamically calibrated based on the saturation of the current population and it presents an immediate response to possible premature convergence to local optima. The methodology developed for the diagnosis of substations is extended to distribution networks considering that the network has sufficient level of automation for remote monitoring of the primary feeders. In this way a new paradigm for protection of distribution networks developed based on Smart Grid concept is proposed. Extensive tests are performed with the methodology applied to distribution... (Complete abstract click electronic access below)
Doutor

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Biazuzo, Milena Moura de Araujo. "Análise da expressão diferencial de genes relacionados à tolerância ao déficit hídrico em feijoeiro comum." Universidade de São Paulo, 2013. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-03092013-141700/.

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Abstract:

O Brasil é o maior produtor mundial de feijão com produção média anual de 3,5 milhões de toneladas, entretanto, um dos maiores problemas enfrentados por essa cultura é o déficit hídrico, que leva a uma redução considerável em seu rendimento. Dessa forma, a identificação de genes que controlam os mecanismos de defesa e adaptação do feijoeiro à falta de água durante o seu desenvolvimento é de grande utilidade. E, como a tolerância à seca é um caráter multigênico, genótipos com diferentes graus de tolerância apresentam expressão gênica diferencial, com ativação e/ou repressão de determinados genes. Diante disso, esse trabalho teve como objetivos: (i) identificar genes diferencialmente expressos em dois genótipos de feijoeiro comum, sendo um tolerante (BAT 477) e o outro suscetível (IACCarioca 80SH) à seca; (ii) verificar a expressão gênica espacial (em raízes, caules e folhas) e temporal (cinco níveis crescentes de déficit hídrico - 24 h, 48 h, 72 h, 96 h e 120 h de exposição ao estresse) por meio de RT-qPCR; (iii) predizer a função dos genes identificados, com base nos genes ortólogos de Arabidopsis thaliana, usando dados públicos de microarranjo disponíveis na plataforma Genevestigator. Para atingir esses objetivos, foi conduzido um experimento em casa-de-vegetação, sendo induzido o déficit hídrico, por meio da suspensão da irrigação, quando as plantas atingiram o estádio fenológico R5, mantendo sob suprimento hídrico adequado as plantas-controle. Foi então utilizada a técnica de cDNA-AFLP para isolar os transcritos diferencialmente expressos entre os dois genótipos, sob seca, a qual aliada ao sequenciamento possibilitou a identificação e anotação de 45 transcritos, sendo 21 exclusivamente expressos no genótipo tolerante e 24 no genótipo suscetível. Dentre os transcritos identificados no genótipo tolerante, podem ser listados pelo menos 11, com potencial de serem usados para transformação genética (chlorophyll A-B binding protein, HSP40, HSP70, glycosyl hydrolase, serine/threonine protein kinase, trehalose-6-phosphate synthase, E3 ubiquitin ligase, fructose biphosphate aldolase, mediator complex subunit 13, aquaporin nodulin MTN-3-related e TCP transcription factor), e no genótipo suscetível, podem ser listados nove (coatomer protein complex, monoamine-oxidase A repressor R1, synaptobrevin, haloacid dehalogenase-like hydrolase, ADP-ribosylation factor, mTERF, serine protease S1C HtrA-related, legume lectin e SWI/SNF-related chromatin binding). Na análise de expressão gênica espacial e temporal, os transcritos mais promissores para uso em trabalhos futuros de transformação genética foram: aquaporin nodulin MTN3, E3 ubiquitin ligase, serine/threonine protein kinase, glycosyl hydrolase e HSP 70 protein, uma vez que tiveram uma expressão bastante pronunciada no genótipo tolerante. Através das análises in silico, baseadas nos genes ortólogos de A. thaliana, foram descobertos processos e vias metabólicas que podem estar envolvidos na resposta do feijoeiro comum ao déficit hídrico. Além disso, foram identificados genes associados com a tolerância à seca, corroborando os dados experimentais. Sendo assim, os resultados obtidos nesse trabalho fornecem o entendimento necessário ao desenvolvimento de ferramentas moleculares (marcadores para genes diferencialmente regulados) para serem utilizados em programas de melhoramento, bem como para informação genética básica na anotação funcional do genoma do feijoeiro e também para utilização desses genes candidatos em trabalhos de transformação genética para obtenção de plantas mais tolerantes à seca.
Brazil is the largest producer of common beans, with average annual production of 3.5 million tonnes; however, one of the biggest problems faced by this crop is drought, which leads to a considerable reduction in their yield. Thus, the identification of genes that control the defense mechanisms and adaptation of common bean to drought during its development is very useful. Drought tolerance is a multigenic character, so genotypes with different degrees of water deficit tolerance exhibit differential gene expression, with activation and/or repression of certain genes. Therefore, this study aimed to: (i) identify differentially expressed genes in two common bean genotypes, one tolerant (BAT 477) and other susceptible (IAC-Carioca 80SH) to drought, (ii) verify the spatial (root, stem and leaves) and temporal (five increasing levels of water deficit - 24 h, 48 h, 72 h, 96 h and 120 h of stress exposition) gene expression by RTqPCR (iii) predict the genes function, based on Arabidopsis thaliana orthologous genes, using available data in the public microarray platform Genevestigator. To achieve these objectives, an experiment was conducted in a green house, being induced water deficit, by withholding water when the plants reached growth stage R5, maintaining adequate water supply under the control plants. To isolate transcripts differentially expressed between the two genotypes under drought was used the cDNA-AFLP technique, which coupled with sequencing enabled the identification and annotation of 45 transcripts, 21 exclusively expressed in the tolerant genotype and 24 in the susceptible one. Among the transcripts identified in the tolerant genotype, may be listed at least 11, with potential to be used in genetic transformation (chlorophyll A-B binding protein, HSP40, HSP70, glycosyl hydrolase, serine/threonine protein kinase, trehalose-6-phosphate synthase, E3 ubiquitin ligase, fructose biphosphate aldolase, mediator complex subunit 13, aquaporin nodulin MTN-3-related and TCP transcription factor), and in the susceptible genotype, can be listed nine (coatomer protein complex, monoamine-oxidase A repressor R1, synaptobrevin, haloacid dehalogenase-like hydrolase, ADP-ribosylation factor, mTERF, serine protease S1C HtrA-related, legume lectin and SWI/SNF-related chromatin binding). In the spatial and temporal gene expression analysis, the transcripts that stood out for use in genetic transformation future studies were: aquaporin nodulin MTN3, E3 ubiquitin ligase, serine/threonine protein kinase, glycosyl hydrolase and HSP 70 protein, since it had an expression quite pronounced in the tolerant genotype. Through the in silico analysis, based on orthologous genes of A. thaliana, was discovered processes and metabolic pathways that may be involved in the common bean response to drought. In addition, we identified genes associated with drought tolerance, corroborating the experimental data. Thus, the present results provide the necessary understanding to develop molecular tools (markers for differentially regulated genes) to be used in breeding programs, as well as basic genetic information in the common bean functional genome annotation and also to use these candidate genes for genetic transformation to obtain drought-tolerant plants.

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Mozol, Ivan Miletovic. "Análise temporal da expressão gênica e atividade enzimática, relacionadas ao estresse oxidativo e proteômica de Eucalyptus grandis inoculados com Puccinia psidii." Universidade de São Paulo, 2013. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13112013-151232/.

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Abstract:

A floresta plantada de eucalipto representa a maior porcentagem entre as florestas plantadas no Brasil, principalmente para a producao de papel e celulose. Porem, durante todo o seu desenvolvimento, o eucalipto sofre o ataque de diferentes patogenos, e entre eles esta o fungo Puccinia psidii causador da ferrugem, principal doenca do eucalipto em regioes tropicais. Assim, com o intuito de estudar alguns mecanismos de defesa da planta contra a infeccao do fungo, este trabalho visou analisar a expressao genica de enzimas relacionadas ao estresse oxidativo e a atividade das mesmas; e o proteoma de clones de eucalipto resistentes e suscetiveis, ao longo do processo de infeccao, colonizacao e multiplicacao do fungo nas plantas. Foi possivel observar diferencas na expressao dos genes em todos os horarios estudados, principalmente as 24 horas apos inoculacao com o fungo. Alem disso, com a analise do proteoma pode-se observar algumas proteinas de grande relevancia para este trabalho, como algumas relacionadas a estresse oxidativo e a resposta de defesa da planta.
The eucalyptus planted forest represents the major percentage among all planted forests in Brazil, mainly for the production of paper and cellulose. However, during its development, the eucalyptus can be attacked by a large number of different pathogens, like the fungus Puccinia psidii, the causer of the eucalyptus rust, main disease that affects the eucalyptus in tropical regions. Thus, in order to study some plant defense mechanisms against the infection of the fungus, this study aimed to analyse the gene expression of some enzymes related to oxidative stress and their activities, and the proteome of resistant and susceptible eucalyptus clones, during the process of infection, colonization and multiplication of the fungus in the plant. We could observe differences in the gene expression at all times studied, mostly at 24 hours after inoculation with the fungus. Besides, with the proteome analysis we could find the very relevant proteins for this study, for instance some proteins related to the oxidative stress and to the plant defense response.

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Winkelstroter, Lizziane Kretli. "Quantificação e análise de viabilidade de Listeria monocytogenes em biofilmes por semeadura em placa, microscopia de fluorescência e ensaios preliminares de PCR em tempo real." Universidade de São Paulo, 2009. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/60/60135/tde-19022009-131003/.

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Abstract:

A formação de biofilmes é um fator preocupante para indústria de alimentos, pois pode comprometer a sanitização de superfícies de contato e aumentar o risco de contaminação por patógeno em alimentos processados. L. monocytogenes é uma bactéria de ampla distribuição no ambiente e com capacidade de formar biofilmes e sobreviver por longos períodos em condições adversas. Esta bactéria pode causar doenças em pessoas imunocomprometidas e mulheres grávidas manifestando-se por infecções do sistema nervoso central, abortos e nascimentos prematuros. Vários estudos têm demonstrado que algumas bactérias podem sofrer transição para o estado viável mas não cultivável em resposta ao estresse. Considerando-se a importância da garantia da segurança e qualidade dos alimentos, há necessidade de desenvolvimento e de padronização de técnicas rápidas para a quantificação de células viáveis de L. monocytogenes em alimentos e biofilmes. Neste estudo foi avaliada a formação de biofilmes e viabilidade celular de Listeria monocytogenes em condições de estresse. Foram utilizadas técnicas de semeadura em placa e quantificação direta por microscopia de fluorescência com os corantes cloreto de 5-ciano-2,3-di-(p-tolil) tetrazólio (CTC) e 4,6-diamino-2- fenilindol (DAPI). Foram também realizados ensaios preliminares para padronização da Reação da Polimerase em Cadeia em tempo real (PCR em tempo real) com amostras previamente tratadas com brometo de etídio monoazídico (EMA). Os resultados obtidos demonstraram que o método de semeadura em placa foi adequado somente para a enumeração de células viáveis de L. monocytogenes em biofilmes enquanto que o método de enumeração por microscopia de fluorescência com CTC-DAPI permitiu quantificar bactérias no estado viável e viável mas não cultivável. Também foi observado que a presença de bacteriocinas de L. sakei 1 e L. mensenteroides 11 causou a diminuição na viabilidade e formação de biofilmes por L. monocytogenes. Os resultados preliminares utilizando culturas puras de L. monocytogenes demonstraram que o tratamento com brometo de etídio monoazídico (EMA) antes da análise por PCR em tempo real reduziu a amplificação do DNA de células mortas em 1 log de UFC por mL. No entanto dependendo da concentração utilizada, pode ocorrer também a inibição da amplificação de células viáveis de L. monocytogenes. Os resultados do presente trabalho indicaram que a microscopia de fluorescência é comparável à placa para análise de células de L. monocytogenes não estressadas. Entretanto, para a quantificação de L. monocytogenes submetida a estresse, é desejável a utilização de corantes de viabilidade celular. O método de PCR em tempo real com pré-tratamento com EMA é promissor mas, ainda necessita de maior padronização para avaliação de sua aplicabilidade na determinação seletiva de células viáveis de L. monocytogenes.
Biofilm formation is of great concern for food industry because it may compromise sanitization of surfaces and increase contamination risk of processed foods by bacterial pathogens. L. monocytogenes is an ubiquitous bacterium which is able to form biofilms and to survive for long periods under adverse conditions. L. monocytogenes may cause disease in immunocomprommised people and pregnant women, manifesting as central nervous system infections, abortion and premature birth. Some bacteria can undergo transition to viable but non-cultivable state in response to stress and it is important to study techniques for rapid quantification of viable cells of L. monocytogenes in foods. In this study biofilm formation and cell viability of Listeria monocytogenes were studied in stress conditions by plate counting, direct quantification by fluorescence microscopy with double staining dyes 5-cyano-2,3-ditolyl tetrazolium chloride (CTC)/4\'-6 diamino-2 phenylindole (DAPI). Preliminary experiments with real time polymerase chain reaction and treatment with ethidium bromide monoazide (EMA) were also performed. The results showed that plate count method was suitable for enumeration only of viable cells of L. monocytogenes in biofilms since, fluorescence microscopy with CTC-DAPI yielded higher counts, probably due to the presence of viable but nonculturable cells. It was also observed that the presence of bacteriocins of L. sakei 1 and L. mensenteroides 11 decreased viability and formation of biofilm by L. monocytogenes. Results obtained with pure cultures of L. monocytogenes showed that the treatment with ethidium bromide monoazide (EMA) before real time PCR detection, reduced DNA amplification of dead cells in 1 log CFU per mL, but depending on the concentration used, EMA also inhibited amplification of viable cells of L. monocytogenes. The results indicated that plate counting and fluorescence microscopy are equivalent for enumeration of non-stressed L. monocytogenes cells. However, the use of double staining with fluorescence microscopy is a more suitable method if stressed cells are present. The EMA-real time PCR is a promissing tool for rapid evaluation of viable L. monocytogenes, but it needs further standartization.

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Nakatani, Sueli Massumi. "Genotipagem do vírus da hepatite C por PCR em tempo real com base na análise da região NS5B." Universidade de São Paulo, 2008. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5147/tde-30012009-162159/.

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Abstract:

A genotipagem do vírus da hepatite C (VHC) é a principal ferramenta para prognóstico e tempo de tratamento. Dependendo do genótipo infectado existem diferentes esquemas e tempo de tratamento. O objetivo deste trabalho foi desenvolver padronizar e validar um método de genotipagem por PCR em tempo real com base na análise da região NS5B. Esta região apresenta um grau de polimorfismo que permite identificar de modo mais acurado tanto os tipos como os subtipos do VHC. Para isto foram desenhados dois conjuntos de primers e sondas. Neste trabalho desenvolvemos um método one-step modificado em uma reação triplex em que ocorre a identificação dos genótipos (1a, 1b, 3a) e em outro set a identificação dos genótipos (2a, 2b, 2c). Os resultados obtidos pelo método de genotipagem em tempo real concordaram em 100% com os resultados de seqüênciamento da região NS5B quando excluímos amostras que foram identificados como mistura de genótipos no método desenvolvido e classificados somente como um único genótipo no seqüênciamento. Houve uma boa concordância entre o método desenvolvido e o seqüênciamento da região NS5B pelo coeficiente de Kappa (k= 0,6222; p=0,0020). O método de desenvolvido conseguiu detectar 97,93% (190/194) do genótipo 1, 86,11% (31/36) do genótipo 2 e 100% (80/80) do genótipo 3. A média da sensibilidade foi de 97%. Quando comparamos a genotipagem por PCR em tempo real e LiPA nas 310 amostras analisadas não houve resultados discordantes em relação ao genótipo. Entretanto, 26,24% (79/301) das amostras analisadas apresentaram resultados discordantes em relação ao subtipo quando comparados os dois métodos. Foi determinada a sensibilidade analítica do método através de um ponto do painel da OptiQuant que foi diluído de modo seriado e a sensibilidade relativa foi realizada através de amostras de plasma de pacientes com carga viral determinada pelo Cobas Amplicor. O limite mínimo de detecção determinado foi de 125UI/ml para o genótipo 3a, 250 UI/ml para o genótipo 1b e 2b e 500 UI/ml para o genótipo 1a. Somados a isso, o método desenvolvido tem um custo de R$ 58,00, um valor nove vezes menor que o método comercial utilizado em nosso laboratório. Além disso, no método desenvolvido, o tempo trabalhado cai para menos de 2 horas sem a necessidade de manipulação constante em comparação com LiPA que necessita em torno de 16 horas, devido ao vários passos de hibridizações e lavagens. No presente trabalho o método de genotipagem por PCR em tempo real para o VHC mostrou-se eficiente e capaz de identificar de um modo acurado os diferentes genótipos e seus subtipos e contribuir para um entendimento melhor do verdadeiro papel dos genótipos e seus subtipos e da variabilidade genética na história natural da infecção do VHC.
Hepatitis C virus (HCV) genotyping is the most significant predictor of response to antiviral therapy. Depending on the infecting HCV genotyping different antiviral regimens have been proposed as well as the length of different treatment. The aim of this study was to develop and evaluate a new real time PCR of HCV genotyping based in NS5B region. This region has sequencing heterogeneity and can accurately identify both type and subtype of HCV. Furthermore, we compared the real time PCR with LiPA and sequencing of NS5B region. We developed a new one-step modified method in triplex reaction where we identified in two sets genotypes (1a, 1b, 3a) and (2a, 2b, 2c). Results obtained by real time PCR agreed 100% with those obtained by NS5B sequencing when excluded samples with mixed of HCV genotypes identified by real time PCR genotyping and in NS5B sequencing all samples were classified only as only one genotype. We found a good concordance for the analysis of genotype concordance between genotyping by real time and sequencing of NS5B region through the coefficient kappa (k= 0,6222; p=0,0020). The method developed detected 97,93% (190/194) of genotype 1, 86,11% (31/36) of genotype 2 and 100% (80/80) of genotype 3, with the overall sensitivity of this new method being 97%. Among 310 samples only two samples had discordant results at type level when comparing real time PCR and LiPA. However, 26,24% (79/301) had discordant results at subtype level when comparing LiPA and real time PCR genotyping of HCV. In order to measure the analytical sensitivity of the real time assay, one member of the panel OptiQuant HCV RNA was diluted. The relative sensitivity was determined by analysis the clinical specimens based upon the initial HCV RNA concentration determined by Cobas Amplicor. The lower limit of detection was estimated to be 125 IU/ml for genotype 3a, 250 IU/ml for genotype 1b and 2b, and 500 IU/ml for genotype 1a. Finally, the cost of each reaction are about R$ 58,00 nine fold lower than the commercial method available in Brazil. Manipulation time of real time PCR genotyping is about 2 hours, in comparison to LiPA that requires about 16 hours due to various hybridization steps and washing. This study was demonstrated an efficient method of identification in a accurate way. HCV genotyping which is important to understand the role of genotypes and subtypes, as well as of genomic variability in the natural history of HCV infection.

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Morales, Aguida Maria Rodrigues [UNESP]. "Análise da expressão de genes relacionados à resistência a Meloidogyne javanica em soja, através da técnica de PCR em tempo real." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2007. http://hdl.handle.net/11449/92680.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-13Bitstream added on 2014-06-13T20:14:44Z : No. of bitstreams: 1 morales_amr_me_jabo.pdf: 2247542 bytes, checksum: 86246681e04ea55e109f11ef3ef48d68 (MD5)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Este trabalho teve como objetivo analisar a expressão de genes de soja envolvidos na resistência ao nematóide de galhas, Meloidogyne javanica, utilizando a técnica de PCR em tempo real (RT-PCR). Foram avaliadas raízes de soja inoculadas e não inoculadas com o nematóide. Linhagens de soja resistentes (genótipo PI595099) e suscetíveis (cultivar BRS133) e indivíduos resultantes deste cruzamento foram inoculados com juvenis do nematóide. Raízes foram coletadas após um, três e seis dias de inoculação. O RNA total foi extraído e em seguida foi feita a síntese de cDNA, para ser utilizado nas reações de PCR em tempo real. As reações para quantificação do nível de expressão relativa foram preparadas em triplicatas, e um controle endógeno, o gene RNAr 18S também foi incluído. Os resultados mostraram que comparando os indivíduos resistentes com os suscetíveis, os resistentes apresentaram maior expressão dos genes, Chs, Xet, Hs1pro-1, Sth-2.
This work objective was to analyze the expression of soybean genes involved in the resistance to the root nematode, Meloidogyne javanica, using the Real Time PCR (RT-PCR) technique. Soybean roots inoculated and not inoculated with the nematode were evaluated. Resistant soybean lineages (genotype PI595099) and susceptible lineages (cultivate BRS133) and resulting individuals of this crossing were inoculated with juvenile of the nematode. Roots were collected after one, three and six days after inoculation. The Total RNA was extracted and, afterwards cDNA synthesis was made, to be used in the reactions of Real Time PCR. The reactions for quantification relative expression level were prepared in triplicate, and an endogenous control, gene rRNA 18S, was also included. The results showed that comparing the resistant individuals with the susceptible ones, resistants showed higher expression level of the genes, Chs, Xet, Hs1pro-1, Sth-2.

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Morales, Aguida Maria Rodrigues. "Análise da expressão de genes relacionados à resistência a Meloidogyne javanica em soja, através da técnica de PCR em tempo real /." Jaboticabal : [s.n.], 2007. http://hdl.handle.net/11449/92680.

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Abstract:

Orientadora: Eliana Gertrudes Macedo Lemos
Coorientador: Alexandre Lima Nepomuceno
Banca: Jaime Maia dos Santos
Banca: Ricardo Vilela Abdelnoor
Resumo: Este trabalho teve como objetivo analisar a expressão de genes de soja envolvidos na resistência ao nematóide de galhas, Meloidogyne javanica, utilizando a técnica de PCR em tempo real (RT-PCR). Foram avaliadas raízes de soja inoculadas e não inoculadas com o nematóide. Linhagens de soja resistentes (genótipo PI595099) e suscetíveis (cultivar BRS133) e indivíduos resultantes deste cruzamento foram inoculados com juvenis do nematóide. Raízes foram coletadas após um, três e seis dias de inoculação. O RNA total foi extraído e em seguida foi feita a síntese de cDNA, para ser utilizado nas reações de PCR em tempo real. As reações para quantificação do nível de expressão relativa foram preparadas em triplicatas, e um controle endógeno, o gene RNAr 18S também foi incluído. Os resultados mostraram que comparando os indivíduos resistentes com os suscetíveis, os resistentes apresentaram maior expressão dos genes, Chs, Xet, Hs1pro-1, Sth-2.
Abstract: This work objective was to analyze the expression of soybean genes involved in the resistance to the root nematode, Meloidogyne javanica, using the Real Time PCR (RT-PCR) technique. Soybean roots inoculated and not inoculated with the nematode were evaluated. Resistant soybean lineages (genotype PI595099) and susceptible lineages (cultivate BRS133) and resulting individuals of this crossing were inoculated with juvenile of the nematode. Roots were collected after one, three and six days after inoculation. The Total RNA was extracted and, afterwards cDNA synthesis was made, to be used in the reactions of Real Time PCR. The reactions for quantification relative expression level were prepared in triplicate, and an endogenous control, gene rRNA 18S, was also included. The results showed that comparing the resistant individuals with the susceptible ones, resistants showed higher expression level of the genes, Chs, Xet, Hs1pro-1, Sth-2.
Mestre

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Meola, Juliana. "Análise da Expressão Gênica Diferencial em Endometriose." Universidade de São Paulo, 2008. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-11062008-103704/.

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Abstract:

A endometriose é uma doença ginecológica benigna, de etiologia complexa e multifatorial, caracterizada pela presença de estroma e tecido glandular tipo endométrio fora da cavidade uterina. Afeta de 10 a 15% da população feminina, que apresentam sintomatologia variada, incluindo dor pélvica e infertilidade. Para elucidar mecanismos potenciais que estejam envolvidos com a fisiopatologia complexa desta doença, analisamos o perfil de expressão gênico diferencial pela metodologia de hibridação subtrativa em tecido eutópico e ectópico (lesões peritoniais e endometrioma ovariano) de 17 mulheres com endometriose, no início da fase proliferativa do ciclo menstrual. Foram identificados 291 genes desregulados nas lesões endometrióticas, considerados como genes candidatos. Para a validação dos dados, utilizamos a metodologia de PCR em tempo real para os genes CTGF e SPARC, indicados como superexpressos; e MYC, MMP3, IGFBP1 e PAEP como menos expressos nas lesões. Diferenças significativas de expressão nas lesões peritoniais foram obtidas para os genes SPARC, MYC, IGFBP1, PAEP e nos endometriomas ovarianos para os genes MMP3 e PAEP. Sugerimos que a desregulação dos genes SPARC, MYC, MMP3, IGFBPI e PAEP seja responsável pela perda da homeostase celular nas lesões endometrióticas, contribuindo para a implantação e sobrevivência do tecido ectópico no ambiente extra-uterino. Este trabalho disponibilizou ao banco de dados da literatura, 291 genes com expressão gênica diferencial em lesões endometriótricas peritoniais e ovarianas como candidatos a investigações futuras.
Endometriosis is a benign gynecological disease, which presents a multifactorial and complex etiology, characterized by the presence of stromal and glandular endometrium tissue outside the uterine cavity. Ten to 15% of the female population is affected by the disease with a wideranging symptomatology including pelvic pain and infertility. To clarify the potential mechanisms involved in the complex physiopathology of this disease, we analyzed the differential gene expression profile by subtractive hybridization in eutopic and ectopic tissue (peritoneal lesions and ovarian endometriomas) from 17 women with endometriosis, in the early proliferative phase of the menstrual cycle. We identified 291 genes deregulated in the endometriotic lesions, considered as candidate genes. For data validation, Real Time PCR was applied for genes CTGF and SPARC, indicated as overexpressed; and for genes MYC, MMP3, IGFBP1 and PAEP, indicated as downregulated in the lesions. Significant differences in the peritoneal lesions expression were obtained for genes SPARC, MYC, IGFBP1, PAEP and in the ovarian endometriomas for genes MMP3 and PAEP. We suggest that the deregulation of genes SPARC, MYC, MMP3, IGFBPI and PAEP is responsible for loss of cellular homeostasis in the endometriotic lesions, contributing for the implantation and maintenance of the ectopic tissue in the extra-uterine environment. This study provided 291 genes with differential gene expression, in peritoneal and ovarian lesions, to the literature database as candidates for future investigations.

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Nicodemos, Fernando Garcia. "Análise de características temporais de sistemas operacionais de tempo real para aplicações espaciais utilizando métodos minimamente intrusivos." Instituto Tecnológico de Aeronáutica, 2013. http://www.bd.bibl.ita.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2870.

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Abstract:

A utilização de processadores modernos no segmento espacial possibilitou o aumento de desempenho dos sistemas embarcados críticos, tornando a operação através de um Sistema Operacional de Tempo Real - SOTR inevitável. Entretanto, os efeitos que as características do núcleo do SOTR tem na aplicação devem ser considerados. Assim, o principal requisito de uma aplicação espacial baseada em um SOTR, segundo a norma "ECSS-E-ST-40C: Software", é a verificação se o comportamento de tempo real é previsível. Atualmente, estão disponíveis abordagens baseadas em software para a verificação temporal, tais como a utilização de modelos analíticos e simulação, conjuntos dedicados ao teste de temporização, benchmarks e análise estática de código. Uma vez que não há padronização acerca das metodologias, essas abordagens podem resultar na superestimação temporal e de recursos. Nesse contexto, a utilização de ferramentas de hardware externas para medir o desempenho das características do núcleo de um SOTR são de suma importância nas aplicações espaciais. O presente trabalho propõe o Ambiente de análise de Desempenho de Tempo Real - ADTR para a medição de overheads e verificação temporal das características do núcleo de um SOTR. A abordagem é baseada em uma ferramenta de hardware minimamente intrusiva projetada utilizando uma Field Programmable Gate Array - FPGA. Os experimentos foram conduzidos com a nova ferramenta em um estudo de caso de aplicação em computadores de bordo para satélites, baseado no processador ERC32 e o SOTR Real-Time Executive for Multiprocessor Systems - RTEMS. São apresentados dois modelos de teste, considerados aqui como duas características do núcleo do RTEMS: chaveamento de contexto com preempção e latência de interrupção externa com preempção. Os resultados mostram a eficiência da nova ferramenta para medição das duas características. É possível utilizar o novo ambiente para complementar outros métodos de verificação temporal para o atendimento da norma.

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Silva, Karla Kristine Dames da. "Análise em tempo real da impedância do sistema respiratório e da mobilidade toracoabdominal em portadores de DPOC com obstrução brônquica acentuada." Universidade do Estado do Rio de Janeiro, 2009. http://www.bdtd.uerj.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=10036.

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Abstract:

Introdução: A DPOC caracteriza-se pela limitação ao fluxo aéreo associada à resposta inflamatória anormal dos pulmões a partículas ou gases nocivos. As alterações mecânicas decorrentes da DPOC estão relacionadas com a disfunção mecânica das fibras do diafragma, já observadas nas fases iniciais da doença. Alguns estudos têm demonstrado o elevado potencial da Técnica de Oscilações Forçadas (FOT) na detecção das alterações mecânicas da DPOC. Contudo, tais aplicações da FOT não permitiam a análise em tempo real das alterações do sistema respiratório, bem como da mobilidade toracoabdominal destes indivíduos. Desta forma, os objetivos desta pesquisa foram analisar, em tempo real, as alterações de impedância do sistema respiratório nas distintas fases do ciclo em portadores de DPOC, assim como avaliar a movimentação toracoabdominal destes indivíduos. Metodologia: Trata-se de um estudo observacional controlado, prospectivo onde foram analisados 48 indivíduos, 23 indivíduos controles e 25 portadores de DPOC com grau de obstrução acentuado. Os indivíduos realizaram exames de FOT para análise da impedância do sistema respiratório e mobilidade toracoabdominal, simultaneamente. Posteriormente aos exames da FOT os indivíduos foram submetidos à Espirometria. Resultados: Os resultados demonstraram aumento da impedância do sistema respiratório nos indivíduos com DPOC em comparação ao grupo controle, em nos parâmetros estudados (Zt, Zi, Ze, Zii, Zie, Zrs e Zpp) (p<0,0001). Em relação às distintas fases do ciclo, os indivíduos deste estudo apresentaram impedâncias maiores na fase inspiratória quando comparadas à fase expiratória (p<0,004). Somente 10% dos portadores de DPOC apresentaram assincronia toracoabdominal (φ ≥ 45), sendo que os valores médios não apresentaram diferença estatística quando comparados ao grupo controle. Discussão: A impedância total do sistema respiratório (Zt) aumentada nos portadores de DPOC confirma o aumento da carga mecânica do sistema respiratório destes indivíduos. Essas alterações são coerentes com o processo fisiopatológico, evidenciado pela obstrução ao fluxo aéreo e destruição do parênquima pulmonar. O aumento da impedância na fase inspiratória quando comparada à fase expiratória, sugere um aumento no trabalho resistivo e elástico. Não foram evidenciados sinais de assincronia na mobilidade toracoabdominal na maior parte dos indivíduos, sugerindo que alguns mecanismos adaptativos atuam na tentativa de evitar a fadiga do músculo respiratório. Conclusões: A DPOC resulta no aumento da carga mecânica do sistema respiratório, alterações identificadas pelo aumento da impedância do sistema respiratório, medida pela FOT em tempo real. Este aumento foi mais evidente durante a fase inspiratória. A mobilidade toracoabdominal não se mostrou alterada na maior parte dos indivíduos com DPOC. Estes resultados são consistentes com publicações prévias e fundamentos fisiopatológicos, confirmando o potencial da FOT monofreqüência na avaliação das modificações relacionadas à DPOC.
Introduction: COPD is carachterized by airflow limitation associated abnormal inflammatory response of the lung to noxious particles or gases. The mechanical alterations associated with COPD have been related with dysfunction of the diaphragm, observed since the initial phases of the disease. Several studies have confirmed the high potential of FOT in the assessment of the mechanics modifications related to COPD. However, such studies did not allow a real-time analysis of the changes in the respiratory system, and the thoracoabdominal mobility of these individuals. Thus, the goals of the present study were to analyze, in real-time, the impedance alterations of the respiratory system in different phases of the respiratory cycle of COPD patients. Methodology: This research consists of a controlled observational study where 48 individuals were analyzed, 23 controls and 25 individuals with COPD and severe airway obstruction. Firstly, they performed simultaneous analysis of impedance of the respiratory system and thoracoabdominal motion. In subsequent examinations, these subjects were submitted to spirometry. Results: The results demonstrated an increase of the respiratory system impedance in individuals with COPD compared with the control group in all of the studied parameters (Zt, Zi, Ze, Zii, Zie, ΔZrs e Zpp) (p<0.0001). Considering the different phases of the respiratory cycle, higher impedances were observed in the inspiratory phase (p<0.004). Only 10% of individuals with COPD showed thoracoabdominal asynchrony (φ≥ 45), and the mean values showed no statistical difference when compared to the control group. Discussions: The total impedance of the respiratory system increased in individuals with COPD, which describes the increase of the mechanic load of the respiratory system in these individuals. These alterations are coherent with the physiopathology of COPD, associated with airflow obstruction and lung parenchyma destruction. The increase of the impedance in the inspiratory phase suggests an increase of the resistive and elastic work. There were not signals of thoracoabdominal asynchrony in the major part of the studied individuals, suggesting that some adaptation mechanisms act to compensate respiratory muscle fatigue. Conclusion: The COPD results in the increase of the mechanic load of the respiratory system. These alterations were identified by the increase of the respiratory system impedance, which was more evidence in the inspiratory phase. The thoracoabdominal asynchrony was not usual in individuals with COPD. Those results are consistent with previously published data and physiopathological fundamentals, confirming the potential of monofrequency FOT in the assessment of the modifications related to COPD.

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Fischer, Benedito René. "Análise de processadores para aplicação em tempo real do método do gradiente conjugado no controle ótimo de processos." Universidade de São Paulo, 1995. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-13042015-172158/.

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Abstract:

O método do gradiente conjugado, uma das técnicas de otimização irrestrita da Programação Matemática, normalmente e empregado na solução de problemas de controle ótimo, apresentando a vantagem, sobre outros métodos, de convergência razoavelmente rápida e economia de memória. A limitação do método e que o mesmo e calculado para problemas com tempo final fixo. Neste trabalho e feita uma generalização do método do gradiente conjugado para que ele possa ser empregado na solução de problemas de controle ótimo em tempo real. Através de simulações, foi determinada uma correlação entre a constante de tempo dominante do sistema e o melhor intervalo de operação para o método. Foi proposto um algoritmo original para controle ótimo com tempo final livre, e também estabelecidas as condições sobre a velocidade do processador, para que esse algoritmo possa ser aplicado em tempo real. Devido ao interesse do controle em tempo real, a velocidade de processamento, o baixo custo do equipamento e as pequenas dimensões físicas são fundamentais. Desta forma, e feita uma analise de desempenho de vários tipos de processadores, com ênfase nas arquiteturas 80x86. De forma a obter maior velocidade de processamento, foram analisadas implementações de arquiteturas paralelas usando transportadores, redes de computadores e uma arquitetura onde cada processador compartilha um segmento de sua memória com os demais
The conjugate gradient method, one of the techniques of unconstrained optimization of Mathematical Programming, normally is employed in the solutions of optimal control problems. The conjugate gradient method has as main advantages over other methods a relatively fast convergence and minimal use of memory. The method has one limitation. It can only be computed for problems with fixed final time. In this work, a generalization of the conjugate gradient method is proposed, allowing extending the applications of the method to the solutions of problems of optimal real time control. Using simulations, a correlation was determined between the dominant time constant of the system and the best operation time interval for the method. An original algorithm was proposed for optimal control with final free time and also the conditions for the processor\'s speed were established, so that the algorithm can be employed in real time. Processing speed, low cost of equipment and small physical dimensions are fundamental for real time control. In this manner, a performance analysis is made of the several processors, with emphasis on architectures of the 80x86. In order to get faster processing, three implementations of parallel architectures were analyzed, using transporters, computer networks and an architecture where each processor shares a segment of memory with the other

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MEDEIROS, Arthur Henrique Perini de. "Análise de desempenho da proteção de motores de Indução de Média Tensão utilizando simulação digital em tempo real." reponame:Repositório Institucional da UNIFEI, 2015. http://repositorio.unifei.edu.br:8080/xmlui/handle/123456789/171.

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Submitted by repositorio repositorio (repositorio@unifei.edu.br) on 2015-11-19T12:11:28Z No. of bitstreams: 1 dissertacao_medeiros_2015.pdf: 5239326 bytes, checksum: ff5b961721985ea1fb0c797f09c6a7b2 (MD5)
Made available in DSpace on 2015-11-19T12:11:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_medeiros_2015.pdf: 5239326 bytes, checksum: ff5b961721985ea1fb0c797f09c6a7b2 (MD5) Previous issue date: 2015-03
Este trabalho de dissertação teve como objetivos: (i) avaliar e validar os ajustes propostos pelo estudo de proteção existente de um motor de indução de disfibrador de cana com potência de 3.500 c.v, através da realização de testes Hardware-in-the-Loop, utilizando o Simulador Digital em Tempo Real (RTDS), (ii) investigar possíveis melhorias nos ajustes da proteção do motor do desfibrador, (iii) trazer para o âmbito dos sistemas industriais a utilização do RTDS. O caso teste utilizado consiste de um sistema industrial de produção de açúcar e álcool, com carga instalada de 12 MW e cogeração de energia com o reaproveitamento do bagaço da cana. A produção de energia elétrica é realizada através de dois turbogeradores, um movido à vapor de contrapressão de15 MW e outro de condensação com extração de 25 MW. Foram simuladas faltas internas e externas à zona de proteção do motor, considerando dois conjuntos de ajustes no relé SEL 710: o primeiro corresponde aos ajustes atuais implantados em campo e o segundo, corresponde aos ajustes propostos neste trabalho. Os resultados obtidos mostram que os ajustes propostos representam um ganho significativo nos tempos de atuação da proteção, sobretudo das funções subtensão (27), desequilíbrio de corrente (51Q e 46) e rotor travado (50 LJ).

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Dissertations / Theses on the topic 'Análises em tempo real'

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