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Dissertations / Theses

Academic literature on the topic 'Analyse de synténies'

Author: Grafiati

Published: 2 February 2024

Last updated: 31 July 2025

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Dissertations / Theses on the topic "Analyse de synténies"

1

Lariviere, Delphine. "Méthodes bioinformatiques d'analyse de l'histoire évolutive des familles de gènes ˸ intégration de données, indices évolutifs, et analyses fonctionnelles appliquées aux familles de gènes impliquées dans la réponse des plantes aux stress environnementaux." Electronic Thesis or Diss., Montpellier, SupAgro, 2016. http://www.theses.fr/2016NSAM0041.

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Abstract:

L'étude des familles de gènes et de leur histoire évolutive apporte des indices précieux pour l'annotation fonctionnelle. En effet, le transfert d’annotations fonctionnelles entre gènes dépend de leur histoire évolutive, que cela soit l’histoire des duplications ou la simple divergence de séquence. Afin d'aider la compréhension des familles de gènes, la reconstruction de l'histoire évolutive doit être associée à des annotations et indices fonctionnels liés aux gènes de la famille. Cette reconstruction de l'histoire évolutive des familles passe par l'intégration de plusieurs données hétérogènes

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2

Barchi, Lorenzo. "Construction d'une carte haute résolution intra-spécifique du piment (Capsicum annuum L. ) et analyse QTL des caractères agronomiques." Montpellier 2, 2007. http://www.theses.fr/2007MON20029.

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Abstract:

L’objective de la thèse était de développer une carte intra-specifique à haute résolution du piment (C. Annuum. L) pour intégrer l’information génétique de caractères horticulturaux et pour générer des outils pour la sélection multi-caractères chez le piment. La carte à haute résolution a été construite en utilisant une descendance recombinante de 297 lignées F5. Les parents utilisés étaient la variété commerciale Yolo Wonder et la variété épicé Criollo de Morellos 334. Un totale de 597 marqueurs moléculaires ont été utilisés. La carte trame couvrait 1857 cM avec une distance moyenne entre mar

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3

Lemoine, Frédéric. "Intégration, interrogation et analyse de données de génomique comparative." Paris 11, 2008. http://www.theses.fr/2008PA112180.

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Abstract:

Nos travaux s’inscrivent dans le projet ANR « Microbiogenomics ». Ce projet a pour but la construction d'un entrepôt de données de génomes bactériens. Cet entrepôt doit rassembler de nombreuses données actuellement dispersées, dans le but d'améliorer l'annotation des génomes bactériens. Au sein de ce projet, nos travaux comportent plusieurs volets. La première problématique porte principalement sur l'extraction et le traitement de données biologiques. Nous nous sommes intéressés plus particulièrement à la conservation de l’ordre des gènes des génomes procaryotes au cours de l’évolution. Pour c

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4

Colombo, Tristan. "Algorithmes pour la recherche de classes de gènes en relations fonctionnelles par analyse de proximités et de similarités de séquences." Phd thesis, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille II, 2004. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00008447.

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Abstract:

Notre étude porte sur les transporteurs ABC dans les génomes bactériens complets. L'analyse bioinformatique du répertoire de ces systèmes comprend l'identification des partenaires, l'assemblage, la reconstruction des systèmes incomplets, la classification en sous-familles, et l'identification du substrat transporté. Cette thèse propose des outils permettant l'étude de ces problèmes par l'utilisation de méthodes informatiques. Les hypothèses biologiques employées sont que : (i) des gènes voisins sur le chromosome peuvent être impliqués dans un même processus métabolique s'ils ont été conservés

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5

Deniélou, Yves-Pol. "Alignement multiple de données génomiques et post-génomiques : approches algorithmiques." Grenoble, 2010. http://www.theses.fr/2010GRENM076.

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Abstract:

L'alignement multiple de réseaux biologiques a pour objectif d'extraire des informations fonctionnelles des données haut-débit représentées sous forme de graphes. Ceci concerne, par exemple, les données d'interaction protéines-protéines, les données métaboliques ou même les données génomiques. Dans un premier temps nous proposons un formalisme précis, qui s'appuie sur les notions de graphe de données stratifié et de multigraphe d'alignement (MGA), et qui définit les alignements multiples locaux en autorisant notamment un réglage de la conservation de la topologie entre les réseaux. Nous présen

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6

Lemaitre, Claire. "Réarrangements chromosomiques dans les génomes de mammifères : caractérisation des points de cassure." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00364265.

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Abstract:

Les réarrangements chromosomiques sont des mutations qui modifient la structure et l'organisation des génomes. Ils sont ici étudiés dans le cadre de l'évolution des génomes de mammifères. L'objectif de ces travaux est de caractériser les régions du génome qui ont subi de tels évènements; elles sont appelées des points de cassure. Dans un premier temps, nous avons développé une méthode permettant d'identifier précisément ces régions sur un génome par comparaison avec un génome d'espèce différente. Nous montrons qu'elle améliore nettement la résolution par rapport aux méthodes existantes. Cela p

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7

Poirion, Olivier. "Discrimination analytique des génomes bactériens." Thesis, Ecully, Ecole centrale de Lyon, 2014. http://www.theses.fr/2014ECDL0033/document.

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Abstract:

Le génome bactérien est classiquement pensé comme constitué de “chromosomes”, éléments génomiques essentiels pour l’organisme, stables et à évolution lente, et de “plasmides”, éléments génomiques accessoires, mobiles et à évolution rapide. La distinction entre plasmides et chromosomes a récemment été mise en défaut avec la découverte dans certaines lignées bactériennes d’éléments génomiques intermédiaires, possédant à la fois des caractéristiques de chromosomes et de plasmides. Désignés par le terme de “chromosomes secondaires”, “mégaplasmides” ou “chromid”, ces éléments sont dispersés parmi l

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