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Dissertations / Theses on the topic 'Analyse phylogénétique'

Author: Grafiati
Published: 4 June 2021
Last updated: 10 February 2022

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1

Blanquart, Samuel. "Reconstruction phylogénétique par analyse bayésienne des séquences moléculaires." Montpellier 2, 2007. http://www.theses.fr/2007MON20201.

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Abstract:
Deux nouveaux modèles pour la reconstruction phylogénétique probabiliste ont été développés, non stationnaires et non paramétriques. Selon ces modèles, un processus stochastique continu introduit des variations des probabilités stationnaires des processus Markoviens de substitution, induisant de manière inédite une dimensionnalité libre. Le second modèle combine cette composante non stationnaire avec un modèle de mélange défini sur les positions de l'alignement de séquences homologues. Cette combinaison modélise conjointement les variations du processus d'évolution, au cours du temps, et le lo
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Guérette, Dominique. "Analyse phylogénétique et fonctionnelle du domaine HR de la transitine." Thesis, Université Laval, 2007. http://www.theses.ulaval.ca/2007/24172/24172.pdf.

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3

Nakouné-Yandoko, Emmanuel. "Orthobunyavirus de la République Centrafricaine : détection, séquençage et analyse phylogénétique." Nancy 1, 2007. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/SCD_T_2007_0160_NAKOUNE-YANDOKO.pdf.

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Abstract:
La famille des Bunyaviridae regroupe plus de 350 virus transmis par des arthropodes, classés en cinq genres. La prévalence de ces virus en République Centrafricaine est mal connue et mérite des études moléculaires afin mettre en place un diagnostic fiable, de mieux caractériser les vecteurs et d'identifier les réservoirs qui sont le plus souvent inconnus. Etant donnée la diversité de ces virus, seuls les virus du genre Orthobunyavirus ont été caractérisés dans cette étude. La caractérisation génomique de Bunyaviridae a été réalisée par le séquençage de segments encadrés par des amorces consens
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4

Thomarat, Fabienne. "Analyse phylogénétique du génome complet de la microsporidie Encephalitozoon cuniculi." Lyon 1, 2002. http://www.theses.fr/2002LYO10072.

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Abstract:
Les microsporidies sont des eucaryotes unicellulaires, parasites intracellulaires obligatoires de nombreux animaux et prostites. Dépourvues de mitochondries, elles ont longtemps été considérées comme des eucaryotes primitifs ayant divergé avant l'endosymbiose à l'origine des mitochondries, en accord avec les premières phylogénies moléculaires. Mais de nouvelles phylogénies moléculaires et la découverte d'un gène d'origine mitochondriale dans leur génome, suggèrent qu'elles sont en réalité des champignons ayant évolué plus rapidement que les autres eucaryotes, peut-être en raison de leur mode d
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5

Pécaud, Sophie. "Systématique phylogénétique et biologie évolutive." Thesis, Paris 1, 2013. http://www.theses.fr/2013PA010663.

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Abstract:
La question des rapports entre systématique phylogénétique et biologie évolutive est abordée sous l'angle de la fondation problématique des concepts, principes et règles de la première sur les hypothèses que formule la seconde concernant les processus évolutifs. La question de la nature et du rôle des hypothèses évolutives utilisées par la cladistique est posée à chaque étape de la méthode : formation de taxons de bases, formulation d'hypothèses d'homologie primaires, mise à l'épreuve de ces hypothèses avec la construction de cladogrammes et dérivation de classifications. L'analyse des choix e
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Orso, Stéphanie. "Analyse phylogénétique moléculaire des genres Nitrobacter (protéobactéries) et Frankia (thallobactéries) et étude de l'instabilité des embranchements dans les arbres phylogénétiques des thallobactéries." Lyon 1, 1997. http://www.theses.fr/1997LYO10032.

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7

Mourlam, Mickaël. "Région auditive des Artiodactyles : signal phylogénétique et écologique." Thesis, Montpellier, 2019. http://www.theses.fr/2019MONTG072.

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Abstract:
La mise en évidence par la biologie moléculaire et par les données paléontologiques de l'appartenance des cétacés au groupe des artiodactyles constitue une des avancées majeures de ces 30 dernières années en mammalogie. Il n'y a cependant pas à l'heure actuelle de consensus quant aux relations phylogénétiques basales des artiodactyles fondées sur des caractères morphologiques et l'histoire évolutive du groupe est de fait, ponctuée de nombreux points d'interrogation. Cette thèse explore une source de caractères phylogénétiques prometteuse : la région auditive (os pétreux, bulle auditive, ossele
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8

Leclère, Lucas. "Evolution de la reproduction sexuée des hydrozoaires : aspects historiques, analyse phylogénétique et développementale." Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066472.

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Abstract:
Cette thèse se propose d'analyser certains aspects historiques, phylogénétiques et développementaux de la reproduction sexuée des cnidaires hydrozoaires, un groupe-clé en raison de sa position phylogénétique, de la diversité qu’il renferme en terme de cycles de vie, ainsi que de son importance historique dans la genèse de la théorie du plasma germinal de Weismann. Les analyses développementales effectuées sur l'hydrozoaire Clytia hemisphaerica ont porté sur la protéine kinase Mos au cours de la maturation ovocytaire ainsi que sur des gènes marqueurs des cellules germinales (Vasa, Nanos, Piwi,
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Lacau, Sébastien. "Morphologie et systématique phylogénétique du genre Typhlomyrmex Mayr, 1862 (Formicidae : Ectatomminae)." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2005. http://www.theses.fr/2005MNHN0034.

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Abstract:
Notre travail aborde différents aspects de la biologie du petit genre de fourmi néotropical : Typhlomyrmex Mayr. L'étude morphologique des stades pré-imaginaux et de l'abdomen des ouvrières confirme la proche parenté des Typhlomyrmecini et des Ectatommini. La présence chez les larves d'un organe tégumentaire abdominal, qui permet à la reine de s'alimenter aux dépens de leur hémolymphe, a été mis en évidence. L'étude cytogénétique a révélé l'existence chez Typhlomyrmex rogenhoferi d'un polymorphisme chromosomique qui semble suivre un cline géographique. Une analyse cladistique basée sur 50 cara
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Ouvrard, David. "Systématique phylogénétique des Hemiptera Psylloidea : morphologie comparée du thorax et structures secondaires de l'ARNr 18S." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2001. http://www.theses.fr/2001MNHN0033.

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Abstract:
Les Psylloidea forment un groupe homogène à la base des Hemiptera, mais les relations phylogénétiques entre les grands groupes qui les constituent sont mal définies. L'approche méthodologique utilisée dans cette étude fait une large part à la reconnaissance et à la sélection des caractères morphologiques et moléculaires pertinents pour la reconstruction phylogénétique du groupe, par la méthode cladistique. Afin d'établir un premier jeu de caractères morphologiques homologues, le thorax des Psylloidea est décrit, et les variations interspécifiques sont relevées, particulièrement dans le pleuron
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Murienne, Jérôme. "Origine de la biodiversité en Nouvelle-Calédonie : analyse phylogénétique de l'endémisme chez les insectes dictyoptères." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066207.

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Abstract:
Dans le but d’analyser l’origine de l’endémisme en Nouvelle-Calédonie, l’histoire évolutive des Insectes Blattidae (Hexapodes, Dictyoptères) a été reconstruite au niveau moléculaire par l’application de différentes méthodes phylogénétiques. Les différents résultats obtenus, aux niveaux régional et local, permettent de modifier fortement les scénarios de l’origine de la biodiversité en Nouvelle-Calédonie. Loin d’être une relique purement Gondwanienne et une région dont la diversification a été progressive et ancienne (« Modèle Muséum »), la Nouvelle-Calédonie montre les caractéristiques nuancée
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Cheikh, Al Bassatneh Marwan. "Diversité taxonomique, phylogénétique et fonctionnelle en région méditerranéenne : congruence ou divergence ?" Thesis, Aix-Marseille, 2019. http://www.theses.fr/2019AIXM0499.

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Abstract:
Les objectifs de la thèse sont d’analyser la biodiversité en région méditerranéenne européenne aux niveaux taxonomique, phylogénétique et fonctionnel et comprendre pourquoi ces différentes estimations de la biodiversité sont convergentes ou pas dans un contexte spatialisé et comment divers facteurs de l'environnement peuvent expliquer cette convergence ou son absence. Dans ce contexte, la thèse s’est d’abord focalisée sur la réalisation de nouveaux arbres phylogénétiques de la flore arborée méditerranéenne intégrant les espèces endémiques de cette région, permettant d’augmenter significativeme
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Belouze, Anne. "Compréhension morphologique et phylogénétique des taxons actuels et fossiles rapportés aux anguilliformes (poissons, téléostéens)." Lyon 1, 2001. http://www.theses.fr/2001LYO10237.

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Abstract:
Les Anguilliformes constituent le groupe le plus diversifié des élopomorphes. Ils colonisent tous les océans mondiaux, parfois même les eaux douces et partagent des caractéristiques anatomiques telles que l'extension des ptérotiques venant au contact des pleurosphénoi͏̈des, la perte de la ceinture pelvienne et le recul des structures branchiales et pectorales. La forte proportion de caractères ultra-spécialisés, notamment réductionnels, conduit vers un constat d'impuissance : à partir des seules formes actuelles, il est impossible de donner une description systématique et phylétique cohérente
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Mejlumian, Lucine. "Analyse phylogénétique et fonctionnelle de la région régulatrice et du gène enveloppe des éléments gypsy chez drosophila." Paris 7, 2001. http://www.theses.fr/2001PA077044.

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Abstract:
L'élément gypsy est un rétrovirus endogène de la drosophile dont les propriétés infectieuses ont été démontrées chez drosophila melanogaster. L'expression de ses propriétés infectieuses et sa transposition sont contrôlées par un gène de l'hôte appelé flamenco. Ce travail présente l'analyse de la région ltr qui contient les séquences régulatrices, et du gène d'enveloppe responsable des propriétés infectieuses chez des éléments gypsy présents chez différentes espèces de drosophile. Les relations phylogénétiques entre les éléments gypsy ne sont pas en accord avec les relations évolutives entre le
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Dandjinou, Alain T. "Détermination de la structure secondaire de TLC1, l'ARN de la télomérase chez Saccharomyces spp. par analyse phylogénétique." Thèse, Université de Sherbrooke, 2004. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/4205.

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Abstract:
Chez la plupart des eucaryotes, les télomères sont constitués de séquences répétitives d'acide déoxyribonucléique (ADN) formant des complexes avec une multitude de protéines. La capacité des séquences télomériques et sous-télomériques à s'associer de façon transitoire et constitutive à diverses protéines confère aux extrémités chromosomiques une structure particulière appelée télosome. Certains complexes présents au télosome sont capables de contrebalancer l'érosion de l'ADN télomérique inhérente aux limitations des ADN polymérases conventionnelles. La télomérase, un des complexes retrouvés au
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Nguembock, Billy. "Etude phylogénétique et biogéographique de l'avifaune forestière des montagnes de l'Ouest du Cameroun." Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066492.

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Abstract:
Plusieurs hypothèses de l’origine des taxons camerounais ainsi que de leur distribution ont été formulées sur la base de la systématique traditionnelle. Ces données font état principalement de quatre grandes situations biogéographiques des passereaux des montagnes de l’Ouest du Cameroun. Toutefois, les relations phylogénétiques de ces passereaux ainsi que leur répartition dans divers lieux n’ont pas encore fait l’objet d’analyses phylogénétique et biogéographique indispensables à toute tentative d’interprétation historique de leur origine ainsi que de leur distribution. Afin d’examiner ces que
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Rouget, Isabelle. "Reconstruction phylogénétique chez les ammonites : confrontation des approches cladistique et stratigraphique, le cas des Dayiceras (Ammonitina , Eodeoceratoidea)." Dijon, 2002. http://www.theses.fr/2002DIJOS051.

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Wittmann, Tatiana. "Analyse phylogénétique des souches du virus de la fièvre hémorragique Ebola et mise en évidence de souches atypiques." Thesis, Nancy 1, 2007. http://www.theses.fr/2007NAN10129/document.

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Abstract:
La fièvre hémorragique à virus Ebola (FHVE) est due à un virus à ARN non segmenté de polarité négative de l’ordre des Mononégavirales. Il compose avec le virus de Marburg la famille des Filoviridae. Il existe 4 espèces Ebolavirus réparties géographiquement : Zaïre en Afrique centrale, Soudan en Afrique de l’Est, Côte d’Ivoire en Afrique de l’Ouest et Reston en Asie. Ebolavirus zaïre, apparu en 1976 en République Démocratique du Congo, est l’espèce la plus létale pour l’homme (jusqu’à 88% de mortalité) et a été à l’origine de plusieurs vagues d’épidémies depuis sa ré-émergence en 1995. Les flam
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Sagne, Claire. "La diversification des siréniens à l'Eocène (Sirenia, Mammalia) : étude morphologique et analyse phylogénétique du sirénien de Taulanne, Halitherium taulannense." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2001. http://www.theses.fr/2001MNHN0036.

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Abstract:
A la fin de l'Eocène, la mer nummulitique de la Téthys centrale inonde la région des Alpes de Haute-Provence (France). Le gisement priabonien de Taulanne, associé à cette transgression, constitue un milieu de vie calme et peu profond, à proximité du littoral. Il a livré des restes abondants et variés d'un nouveau dugongidé (Mammalia, Sirenia, Dugongidae, Halitherium taulannense), accumulés dans plusieurs niveaux. L'étude exhaustive de sa morphologie, avec notamment des séries de croissance allant du nouveau-né à l'adulte âgé, peut être dès lors confrontée aux variabilités individuelle et ontog
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Orliac, Maëva. "Le rôle des Listriodontinae dans la différenciation des Suidae (Mammalia) : paléoanatomie, systématique, phylogénie." Paris 6, 2007. http://www.theses.fr/2007PA066115.

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Abstract:
L’étude du Listriodontinae (Suidae, Mammalia) de Béon 1 (Gers, France), Eurolistriodon tenarezensis, et de restes inédits de listriodonte du Kenya et du Pakistan dresse un bilan des caractères morphologiques de la sous-famille et met en évidence une diversité inattendue de la région auditive, ainsi qu’une morphologie singulière du rhinarium. Les éléments postcrâniens se révèlent d’un grand intérêt systématique. Une analyse phylogénétique incluant 50 taxons et fondée sur 200 caractères dentaires, crâniens et postcrâniens, est menée à l’échelle des Suidae. Les résultats soutiennent la présence d
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Bellec, Laure. "Les virus de mamiellales (Prasinophyceae) : abondance, diversité et interactions coévolutives." Paris 6, 2009. http://www.theses.fr/2009PA066341.

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Abstract:
Les virus jouent un rôle important dans la régulation des populations phytoplanctoniques mais relativement peu de données existent sur leur distribution, leur diversité génétique, la structure de leurs populations et leurs relations évolutives. Nous proposons d’approfondir ces questions en étudiant un système hôte-virus formé par les microalgues Prasinophyceae et leurs virus Phycodnaviridae. Les prasinophytes sont ubiquistes et dans ce groupe les genres Bathycoccus, Ostreococcus et Micromonas (ordre des Mamiellales) sont les plus abondants en milieu marin. Deux cent vingt-cinq nouvelles souche
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Arbez, Thomas. "Etudes anatomiques et phylogénétiques des structures endocrâniennes des stégocéphales (tétrapodes anciens)." Thesis, Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2018. http://www.theses.fr/2018MNHN0014/document.

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Abstract:
L’anatomie interne des crânes des stégocéphales Stanocephalosaurus (Temnospondyli), Laosuchus (Chroniosuchia) et Diplocaulus (Lepospondyli) a pu être révélée par l’utilisation de la tomographie à rayons X et a permis de mieux comprendre leur paléobiologie : 1) l’oreille moyenne de Stanocephalosaurus serait adaptée à la perception de sons dans le milieu subaquatique ; 2) des canaux sensoriels intra-osseux ont été identifiés chez Laosuchus. La morphologie endocrânienne a ensuite été utilisée dans une analyse phylogénétique portant sur les relations de parentés controversées entre stégocéphales e
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Li, Tianlun. "Groupes microbiens fonctionnels impliqués dans la méthanisation de la cellulose et du méthanol : diversité, fonction et influence de la température." Paris 11, 2008. http://www.theses.fr/2008PA112020.

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Abstract:
Afin de mieux comprendre le fonctionnement des communautés microbiennes intervenant lors de la méthanisation de la cellulose et du méthanol, des échantillons issus de la digestion anaérobie de déchets ont été incubés en présence de cellulose, de glucose, d'acétate et de méthanol enrichis en carbone 13, en conditions mésophiles et thermophiles. Après extraction et séparation de l'ADN lourd et léger par ultracentrifugation sur des gradients de densité (technique SIP), la diversité fonctionnelle a été caractérisée par inventaire moléculaire et analyse phylogénétique. Au total, 20 banques de clone
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Taupin, Claire. "La séryl-ARNt synthétase d'Haloarcula marismortui : purification, stabilité, séquençage du gène, expression, modèle structural et étude phylogénétique." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1996. http://www.theses.fr/1996GRE10215.

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Abstract:
La seryl-arnt synthetase d'une archaebacterie hyperhalophile, haloarcula marismortui (hmserrs), a ete purifiee. Elle est halophile et halostable, contrairement a l'enzyme homologue d'e. Coli. Les conditions optimales pour l'activite et la stabilite de la hmserrs sont pratiquement identiques dans le nacl et le kcl et caracteristiques des proteines hyperhalophiles ; en revanche, la hmserrs est denaturee a hautes concentrations en mgcl#2. Des spectres d'emission de fluorescence de la hmserrs ont mis en evidence un etat intermediaire de denaturation a basse salinite. Apres microsequencage peptidiq
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Moulinier, Thierry. "Etude moléculaire du génome mitochondrial chez le Basidiomycète Agrocybe Aegerita : organisation du gène Cox I, analyse phylogénétique des séquences exoniques et introniques, caractérisation de réarrangements intramoléculaires." Bordeaux 2, 1995. http://www.theses.fr/1995BOR28392.

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Tarrieu, Frédérique. "Analyse de la diversité phylogénétique de "Trypanosoma cruzi cruzi", agent de la maladie de Chagas, par séquençage des gènes 18S et Tc52. Applications au diagnostic moléculaire." Montpellier 2, 2000. http://www.theses.fr/2000MON20220.

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Abstract:
La diversite genetique de trypanosoma cruzi cruzi, un protozoaire parasite responsable de la maladie de chagas en amerique latine, est considerable. Les populations naturelles de ce parasite presentent une structure clonale caracterisee par la propagation de lignees uniparentales stables sur de grandes aires geographiques et dans le temps. Les analyses menees sur la bases de marqueurs multilocus (isoenzymes et rapd) ont mis en evidence l'existence de deux lignees majeures, les dtus (discrete typing units) 1 et 2. La dtu 2 est subdivisee en cinq dtus 2a a 2e. Dans notre etude, nous avons analys
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Carvajal, Campos Amaranta. "Characterization of Aspergillus section Flavi : molecular markers as tools to unmask cryptic species." Thesis, Toulouse 3, 2018. http://www.theses.fr/2018TOU30036/document.

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Abstract:
Certains champignons, notamment des Ascomycètes, peuvent synthétiser des métabolites secondaires toxiques pour les hommes et les vertébrés, appelés mycotoxines. Étant donné que la présence de ces champignons dans les aliments de base constitue un risque potentiel pour la santé humaine et animale, les aliments de base sont éliminés lorsqu'ils sont contaminés. La section Flavi est un des groupes de champignons les plus importants du point de vue économique et sanitaire car il comprend des espèces productrices de mycotoxines. Parmi les mycotoxines produites par ce groupe se trouvent les aflatoxin
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Rineau, Valentin. "Un nouveau regard cladistique sur l'anatomie comparée, la phylogénie, la systématique et la paléoécologie des rudistes (Bivalvia, Hippuritida)." Thesis, Paris 6, 2017. http://www.theses.fr/2017PA066503/document.

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Abstract:
Les rudistes bivalves forment un groupe monophylétique qui s’étend dans le registre fossile de 160 à 66 millions d’années. L’objectif de cette thèse est de porter un nouveau regard sur l’histoire évolutionnaire de ce groupe dans le cadre de la théorie cladistique. Dans une première partie sont posées les bases théoriques, méthodologiques et techniques de l’analyse à trois éléments. Le concept de triplet permet de proposer des arguments sur la pertinence des arbres consensus. La méthode d’analyse à trois éléments est ensuite comparée à la méthode de parcimonie grâce à des arguments théoriques e
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Rouhan, Germinal. "Systématique phylogénétique du genre Elaphoglossum Schott ex J. Sm (Elaphoglossaceae, Monilophytes) : approches morphologique, moléculaire, et implications biogéographiques pour la région de l'Océan Indien." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2005. http://www.theses.fr/2005MNHN0029.

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Abstract:
Elaphoglossum Schott ex J. Sm. (Elaphoglossaceae) est l’un des genres de Monilophytes les plus diversifiés. Cette diversité spécifique est paradoxalement associée à une morphologie générale simple et uniforme. L’objectif de cette Thèse est de proposer une hypothèse phylogénétique qui permette de clarifier la taxinomie du genre. Des caractères morphologiques et moléculaires ont été analysés. Les résultats confirment la monophylie du genre et suggèrent la reconnaissance de 5 clades majeurs. Les résultats phylogénétiques sont également utilisés pour expliquer la distribution actuelle du genre et
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Palmeira, Leonor. "Analyse et modélisation des dépendances entre sites voisins dans l'évolution des séquences d'ADN." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00178453.

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Abstract:
Cette thèse a porté, d'une part, sur l'analyse des sur- et sous-représentations en dinucléotides au sein de différents génomes complets, en recherchant les liens éventuels avec des mécanismes connus de dommages causés à l'ADN qui soient liés à des sites avoisinants — particulièrement les voisins directs en 5' et 3'. L'étude de l'effet des UVs sur les génomes de micro-organismes, et sur l'effet de la méthylation sur les génomes de métazoaires en a été un des grands axes. D'autre part, les résultats récents de Bérard et al. sur des modèles d'évolution incorporant des dépendances entre bases adja
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Martin, Florence. "Exploration de la biodiversité bactérienne dans un sol pollué par les hydrocarbures : analyse par marquage isotopique du potentiel métabolique et de la dynamique des communautés impliquées dans la dégradation." Phd thesis, Université de Grenoble, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00637464.

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Abstract:
Les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP) sont des composés ubiquitaires issus de la combustion incomplète de matières organiques. Ils sont à l'origine de pollutions de l'environnement, surtout liées à l'exploitation des produits pétroliers, car ce sont des composés toxiques pour les êtres vivants et pour l'homme en particulier. De nombreuses bactéries capables de dégrader les HAP ont été isolées et étudiées, mais celles qui les dégradent in situ sont mal connues, car moins de 5% des bactéries du sol sont cultivables en laboratoire. Le premier objectif de cette étude était d'identifier
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Ladevèze, Sandrine. "La région auditive des Métathériens (Mammalia, Metatheria) du tertiaire inférieur d'Amérique du sud : Incidence sur l'origine phylogénétique et la systématique des Notometatheria (Métathériens d'Australie et d'Amérique du sud." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2005. http://www.theses.fr/2005MNHN0049.

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Abstract:
Les gisements paléocènes de Tiupampa (Bolivie) et Itaboraí (Brésil) sont d'une importance majeure dans la compréhension de l'histoire évolutive des Notometatheria car ils représentent les plus anciens assemblages de métathériens sud-américains. Ils ont délivré de nombreux restes dentaires ainsi que des crânes et des périotiques isolés qui sont ici décrits. Des études morphométriques montrent une corrélation des proportions des molaires et du périotique, cependant l'attribution d'un périotique à un taxon défini par des dents demeure difficile. Des analyses de parcimonie menées sur des caractère
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Bosdeveix, Robin. "Entre classifications fonctionnelle et phylogénétique : le groupe des végétaux : une reconstruction didactique fondée sur l'histoire des sciences dans le cadre de la formation des enseignants de sciences de la vie et de la Terre." Sorbonne Paris Cité, 2016. http://www.theses.fr/2016USPCC051.

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Abstract:
Cette recherche établit une dialectique entre didactique et histoire des sciences concernant les classifications biologiques, en ciblant le groupe des végétaux qui présente une multiplicité d'acceptions et une importante rectification historique. Cette étude s'inscrit dans le cadre de la formation des professeurs de sciences de la vie et de la Terre et se structure en trois enquêtes complémentaires. La première, de nature didactique, permet d'identifier à l'échelle nationale sept conceptions des végétaux dans une situation classificatoire ouverte et d'étudier les raisonnements classificatoires
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Lapierre, Dominique. "Diversité culturelle et religieuse dans le Devisement du monde de Marco Polo." Thesis, Normandie, 2018. http://www.theses.fr/2018NORMR117.

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Abstract:
L’objectif de cette thèse est de proposer une nouvelle lecture du Devisement du Monde – connu également sous le titre du Livre des Merveilles, La Description du Monde ou Il Milione – axée sur le regard que porte Marco Polo sur ses contemporains de l’autre bout du monde et la réception qui lui est réservée. Parti dans le contexte des croisades qui réduit l’opposition Orient/Occident à la dualité sarrasin/chrétien, le jeune Marco Polo se retrouve, au travers de ses voyages et à la cour de Kubilai Khan, dans une problématique beaucoup plus vaste, où pratiques et croyances multiples s’inscrivent d
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Ranwez, Vincent. "Méthodes efficaces pour reconstruire de grandes phylogénies suivant le principe du maximum de vraisemblance." Phd thesis, Université Montpellier II - Sciences et Techniques du Languedoc, 2002. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00843175.

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Abstract:
La reconstruction de phylogénies moléculaires consiste à retrouver l'arbre évolutif (ou phylogénie) d'un ensemble de séquences homologues. La méthode de reconstruction la plus fiable actuellement, semble être la méthode du maximum de vraisemblance. Les méthodes classiques pour rechercher la phylogénie de vraisemblance maximale deviennent, rapidement, très coûteuses en temps de calcul lorsque le nombre de séquences augmente. Elles ne peuvent donc pas traiter de grandes phylogénies. Actuellement, les deux types de méthodes qui permettent de reconstruire de grandes phylogénies suivant le principe
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Santolini, Marc. "Analyse computationnelle des éléments cis-régulateurs dans les génomes des drosophiles et des mammifères." Phd thesis, Université Paris-Diderot - Paris VII, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00865159.

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Abstract:
La différenciation cellulaire et la spécification des tissus biologiques dépendent en partie de l'établissement de programmes d'expression génétique caractéristiques. Ces programmes sont le résultat de l'interprétation de l'information génomique par des Facteurs de Transcription (TFs) se fixant à des séquences d'ADN spécifiques. Décoder cette information dans les génomes séquencés est donc un enjeu majeur. Dans une première partie, nous étudions l'interaction entre les TFs et leurs sites de fixation sur l'ADN. L'utilisation d'un modèle de Potts inspiré de la physique des verres de spin et de d
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Gagnier, Pierre-Yves. "Analyses anatomiques et phylogénétiques de quelques vertébrés paléozoïques américains." Paris 7, 1989. http://www.theses.fr/1989PA077191.

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Abstract:
Les premiers restes incontestables de vertébrés proviennent de l'Ordovicien d'Australie, d'Amérique du Nord et de Bolivie. Ils sont tous de formations géologiques caractéristiques d'un environnement littoral marin, intertidal à subtidal. Sacabambaspis jJanvieri de l'Ordovicien de Bolivie est décrit. La comparaison des vertébrés ordoviciens montrent que les formes australiennes et boliviennes ont entre elles des relations phylogénétiques plus étroites qu'avec les genres nord-américains. Ces derniers sont plus proches des Hétérostracés. Les genres australiens et boliviens forment un ensemble, le
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Afrache, Hassnae. "Prédiction de la fonction des butyrophilines par l'étude de leur évolution et de leur variabilité génétique." Thesis, Aix-Marseille, 2014. http://www.theses.fr/2014AIXM5032.

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Abstract:
Dans le cadre de cette thèse nous nous sommes intéressés à l'étude de l'évolution et de la variabilité génétique de la famille des butyrophilines (BTN), des récepteurs de la superfamille des immunoglobulines impliqués dans la régulation de la réponse immunitaire. Par une étude phylogénétique approfondie nous avons caractérisé chez les mammifères 14 groupes phylogénétiques résultant d'une série de duplications à partir de huit gènes ancestraux à la base des thériens. Par la suite, nous avons étudié l'évolution des BTN de la région CMH chez les primates et leur variabilité génétique dans les pop
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Maliet, Odile. "Exploring heterogeneity in diversification patterns across the tree of life using probabilistic models." Thesis, Sorbonne université, 2018. http://www.theses.fr/2018SORUS081.

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Abstract:
Dans cette thèse, je présente différentes approches pour quantifier et expliquer les variations dans le processus de diversification au sein de l’arbre du vivant. Toutes les approches présentées s’appuient sur des modèles probabilistes. Le premier chapitre s’intéresse à la forme générale des phylogénies, et propose une nouvelle mesure de la relation entre la richesse spécifique et la profondeur des clades au sein d’une phylogénie. Nous montrons que, dans les phylogénies empiriques, cette mesure s’écarte de la valeur attendue pour un processus de diversification homogène entre l
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Zheng, Yue. "Identification d'une plante médicinale africaine par le DNA barcoding et étude de composés à activité anti-HIV de cette plante." Thesis, Strasbourg, 2015. http://www.theses.fr/2015STRAJ095/document.

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Abstract:
Mon travail de thèse porte sur l'identification d'un arbre médicinal africain par le DNA barcoding et l'étude de composés à activité anti-VIH de cet arbre. Une première analyse de la séquence du marqueur ITS2 déterminée à partir d'ADN extrait de copeaux de bois a suggéré que la plante pourrait appartenir au genre Cassia ou au genre apparenté Senna. En analysant la séquence de ce marqueur ITS2 et aussi celle du trnHpsbA spacer d'une cinquantaine d'espèces des genres Cassia et Senna j'ai pu identifier la plante comme étant Cassia abbreviata. L'alignement de ces séquences m'a permis d'identifier,
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Gagnon, Jules. "Création d'outils pour l'automatisation d'analyses phylogénétiques de génomes d'organites." Thesis, Université Laval, 2004. http://www.theses.ulaval.ca/2004/21635/21635.pdf.

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Abstract:
Le traitement des données de séquençage pour les rendre utilisables dans une analyse phylogénétique est long et répétitif. De plus, certaines analyses plus complexes peuvent difficilement être entreprises sans l'automatisation de certaines tâches. La création d'outils bioinformatiques permettrait de diminuer le temps consacré à la préparation des données. Le but de cette recherche est de développer des outils informatiques permettant d'automatiser le traitement de données provenant du séquençage d'organites. Pour ce faire, il a été nécessaire de créer: item des bases de données de gènes d'
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Souday, Caroline. "Analyse morphométrique des molaires déciduales et définitives dans le genre Homo : perspectives phylogénétiques et biogéographiques." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2008. http://www.theses.fr/2008MNHN0006.

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Abstract:
Les travaux concernant la phylogénie des hominidés se heurtent au problème de la représentativité de registre fossile. Les restes dentaires présentent alors un grand intérêt car ce sont les éléments anatomiques les mieux préservés. La morphologie des couronnes des molaires définitives et déciduale dans le genre Homo a ainsi été analysée par une méthode de morphométrie géométrique : les transformées de Fourier radiales. L'originalité de la morphologie des molaires chez les Néandertaliens est démontrée par cette approche, ainsi que leur proximité morphologique avec des fossiles européens plus an
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Rolland, Morgane. "Etude des relations phylogénétiques entre les lentivirus des petits ruminants." Bordeaux 2, 2003. http://www.theses.fr/2003BOR21029.

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Abstract:
Les lentivirus des petits ruminants ou SRLV ("small ruminant lentivirus") correspondent au virus mae͏̈di visna ou MVV, qui infecte les moutons, et au virus de l'arthrite-encéphalite caprine ou CAEV ("caprine arthritis-encephalitis Virus"), qui infecte les chèvres. Pour faciliter l'étude des SRLV, nous avons immortalisé des cellules GSM ("goat synovial membrane") par l'expression ectopique de la télomérase. La lignée cellulaire GSM T a proliféré à un rythme constant avec plus de 160 passages en culture, tout en conservaNt la morphologie des cellules GSM primaires. De plus, les cellules GSM T pe
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Baidaliuk, Artem. "Interactions between the insect-specific flavivirus CFAV, its mosquito host aedes aegypti, and co-infecting arboviruses." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2019. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2019SORUS494.pdf.

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Abstract:
Les virus de la dengue (DENV) et du Zika (ZIKV) sont des virus transmis par les moustiques qui causent de graves problèmes de santé publique à travers le monde. Ces virus transmis par des arthropodes (arbovirus) sont des virus à ARN du genre Flavivirus principalement transmis à l'homme par le moustique Aedes aegypti. De plus, les moustiques Ae. aegypti sont naturellement infectés par le cell-fusing agent virus (CFAV), le premier flavivirus spécifique d'insecte (FSI) ayant été décrit. L'évolution du CFAV, ses interactions avec les arbovirus chez les moustiques co-infectés et les réponses immuni
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Chapus, Charles. "Analyse de données phylogénétiques à l'aide de la signature génomique : aspects méthodologiques et application aux procaryotes." Paris 7, 2005. http://www.theses.fr/2005PA077012.

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Bikandou, Blaise. "Epidémiologie moléculaire, variabilité génétique et analyses phylogénétiques des virus de l'immunodéficience humaine au Congo-Brazzaville." Paris 5, 2001. http://www.theses.fr/1999PA05S023.

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Abstract:
Le syndrome d'immunodéficience acquise humaine est cause par des virus qui appartiennent à la famille des retroviridae et au genre lentivinae, caractérisés par une plus grande variabilité de leur matériel génétique. La caractérisation génétique du plus grand nombre d'isolats de VIH circulant dans le monde est importante pour, la surveillance de la dynamique de l'épidémie et la définition des différents antigènes candidats pour une préparation vaccinale. La majorité des patients infectés par les VIH réside en Afrique sub-saharienne et c'est dans la région équatoriale de ce continent qu'est obse
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Ninkam, Nghemning Diane. "Souches africaines du virus de la rougeole : étude de l'interaction virus-cellule et analyses phylogénétiques." Université Joseph Fourier (Grenoble), 2002. http://www.theses.fr/2002GRE10087.

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Filleul, Arnaud. "Les relations phylogénétiques des téléostéens (Actinopterygii, Osteichthyes) basaux actuels et fossiles : analyse du problème de la monophylie des Elopomorphes." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2001. http://www.theses.fr/2001MNHN0030.

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Abstract:
Les Elopomorphes sont un groupe de poissons à la morphologie extrêmement hétérogène. Ils sont cependant considérés comme monophylétiques, essentiellement en raison de leur larve particulière, la leptocéphale. Pourtant, l'étude d'une nouvelle espèce fossile de Téléostéen, Baugeichthys caeruleus, a montré que le groupe était mal soutenu (Filleul, 2000a, 2000b). Une première analyse phylogénétique a été menée en utilisant la matrice d'Arratia (1997) et conduit à suggérer la paraphylie du groupe, les Albuliformes étant plus étroitement apparentés aux Clupéocéphales qu'aux Elopiformes. Pour tester
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Renois, Fanny. "Etude des Caractéristiques Virologiques, Cliniques et de la Réponse Inflammatoire au Cours de l’Infection de l’Arbre Respiratoire par les Entérovirus Humains." Thesis, Reims, 2012. http://www.theses.fr/2012REIMS038/document.

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Abstract:
Le genre Entérovirus (EV) (famille des picornaviridae) est composé de petits virus à ARN non enveloppées classés en 12 espèces dont 7 sont pathogènes pour l'homme : 4 espèces (A-D) d'enterovirus humains (HEV) et trois espèces (A-C) de rhinovirus humains (HRV). Dans le genre enterovirus, les HRV et HEV sont reconnus comme des pathogènes respiratoires fréquemment responsables d'infections des voies aériennes supérieures et inférieures chez l'enfant et l'adulte. Entre 2009 et 2012, de nouveaux génotypes d'HEV à tropisme respiratoire (HEV-68, 104, 109, et le CVA-21) ont été décrits dans des cas is
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Donati, Beatrice. "Graph models and algorithms in (co-)evolutionary contexts." Thesis, Lyon 1, 2014. http://www.theses.fr/2014LYO10235/document.

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Abstract:
Cette thèse s'inscrit dans le cadre de la bioinformatique. Les outils mathématiques les plus utilisés dans ce travail relèvent de la théorie des graphes, des statistiques, de la théorie des ensembles et des mathématiques discrètes. Ces mathématiques ont permis de développer des modèles de systèmes biologiques ainsi que des algorithmes efficaces dans l'étude concrète de ces modèles. La nécessité d'analyses de jeux de données de très grande taille a rendu critique dans notre démarche cette notion d'efficacité des algorithmes. Il faut enfin remarquer que le champ biologique qui a servi de support
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