Academic literature on the topic 'ARN de transfert de la thréonine'

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Journal articles on the topic "ARN de transfert de la thréonine"

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Kahn, A. "Le code génétique et la spécificité des ARN de transfert." médecine/sciences 5, no. 2 (1989): 119. http://dx.doi.org/10.4267/10608/3928.

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LEROUX, C., and G. TOSSER-KLOPP. "La fonction du gène : les grandes étapes de l’utilisation de l’information génétique." INRAE Productions Animales 13, HS (October 22, 2000): 21–28. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2000.13.hs.3807.

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Abstract:
L’utilisation de l’information portée par l’ADN nécessite une étape de transcription des gènes en ARN et, dans certains cas, une phase de traduction en protéine. La transcription est un phénomène complexe, régulé (un gène eucaryote contient des séquences régulatrices permettant l’initiation et la régulation de la transcription) qui produit trois types d’ARN : les ARN messagers (ARNm), les ARN de transfert (ARNt) et les ARN ribosomiques (ARNr). Les ARNt et les ARNr sont des constituants de la machinerie de traduction des ARNm. En effet, après la transcription, l’ARNm va être maturé (épissage, polyadénylation ...) puis va sortir du noyau pour aller dans le cytoplasme où sa séquence nucléotidique sera traduite en séquence d’acides aminés. Les protéines acquièrent ensuite leur structure définitive après des modifications posttraductionnelles diverses. La régulation de l’expression des gènes peut intervenir à chacune des étapes (transcription, maturation et/ou traduction).
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Sacconi, S., L. Salviati, S. DiMauro, D. DeViVo, M. Davidson, and C. Desnuelle. "M - 15 C5545T : une mutation dominante d’un ARN de transfert (ARNt) mitochondrial humain induisant un « saut du codon stop »." Revue Neurologique 163, no. 4 (April 2007): 117. http://dx.doi.org/10.1016/s0035-3787(07)90711-0.

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Reboud-Ravaux, Michèle. "Dégradation induite des protéines par des molécules PROTAC et stratégies apparentées : développements à visée thérapeutique." Biologie Aujourd’hui 215, no. 1-2 (2021): 25–43. http://dx.doi.org/10.1051/jbio/2021007.

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Abstract:
Alors que, pour la plupart, les médicaments actuels sont de petites molécules inhibant l’action d’une protéine en bloquant un site d’interaction, la dégradation ciblée des protéines, découverte il y a une vingtaine d’années via les petites molécules PROTAC, connaît aujourd’hui un très grand développement, aussi bien au niveau universitaire qu’industriel. Cette dégradation ciblée permet de contrôler la concentration intracellulaire d’une protéine spécifique comme peuvent le faire les techniques basées sur les acides nucléiques (oligonucléotides antisens, ARNsi, CRISPR-Cas9). Les molécules PROTAC sont des chimères hétéro-bifonctionnelles capables de lier simultanément une protéine spécifique devant être dégradée et une E3 ubiquitine ligase. Les PROTAC sont donc capables de provoquer l’ubiquitinylation de la protéine ciblée et sa dégradation par le protéasome 26S. De nature peptidique, puis non peptidique, les PROTAC sont maintenant administrables par voie orale. Ce détournement du système ubiquitine protéasome permet aux molécules PROTAC d’élargir considérablement le champ des applications thérapeutiques puisque l’élimination de protéines dépourvues de poches ou de crevasses bien définies, dites difficiles à cibler, devient possible. Cette technologie versatile a conduit à la dégradation d’une grande variété de protéines comme des facteurs de transcription, des sérine/thréonine/tyrosine kinases, des protéines de structure, des protéines cytosoliques, des lecteurs épigénétiques. Certaines ligases telles que VHL, MDM2, cereblon et IAP sont couramment utilisées pour être recrutées par les PROTAC. Actuellement, le nombre de ligases pouvant être utilisées ainsi que la nature des protéines dégradées sont en constante augmentation. Deux PROTAC sont en étude clinique pour les cancers du sein (ARV471) et de la prostate (ARV110). La dégradation spécifique d’une protéine par le protéasome peut aussi être induite par d’autres types de molécules synthétiques : colles moléculaires, marqueurs hydrophobes, HaloPROTAC, homo-PROTAC. D’autres constituants cellulaires sont aussi éligibles à une dégradation induite : ARN-PROTAC pour les protéines se liant à l’ARN et RIBOTAC pour la dégradation de l’ARN lui-même comme celui du SARS-CoV-2. Des dégradations induites en dehors du protéasome sont aussi connues : LYTAC, pour des chimères détournant la dégradation de protéines extracellulaires vers les lysosomes, et MADTAC, pour des chimères détournant la dégradation par macroautophagie. Plusieurs techniques, en particulier des plates-formes de criblage, la modélisation mathématique et la conception computationnelle sont utilisées pour le développement de nouveaux PROTAC efficaces.
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Dissertations / Theses on the topic "ARN de transfert de la thréonine"

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Walbott, Hélène. "Etude biochimique et structurale de deux pyrimidine-c5 méthyltransférases des arn de transfert." Paris 11, 2007. http://www.theses.fr/2007PA112159.

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Abstract:
Dans la cellule, l’ARNt est une molécule-clé de la traduction génétique. Pour être fonctionnel, il doit subir différentes étapes de maturation post-transcriptionnelle, au cours desquelles certains de ses nucléotides sont modifiés chimiquement grâce à des enzymes dites de modification. Mon sujet de thèse a porté sur l’étude biochimique et structurale de deux pyrimidine-C5 méthyltransférases (MTases) des ARNt. Une première partie de mon travail a consisté en la caractérisation biochimique de la cytosine-C5 MTase de S. Cerevisiae, Trm4. L’analyse de son mécanisme catalytique et de son organisation modulaire a ainsi été réalisée. Une seconde partie de mon travail a contribué à l’identification de la m5U54 MTase d’ARNt de P. Abyssi, PabTrmU54, et a conduit à la résolution de sa structure tridimensionnelle en complexe avec la S-adénosyl-L-homocystéine, par cristallographie aux rayons X. L’ensemble de ces résultats a permis d’améliorer nos connaissances sur le mode de reconnaissance spécifique du substrat ARN par les enzymes de modification
In the cell, tRNA is a key molecule of genetic translation. To become functional, it undergoes different steps of post-transcriptional maturation. During this process, some of its nucleosides are chemically modified by modification enzymes. My thesis project focused on the biochemical and structural study of two tRNA C5-pyrimidine methyltransferases (MTases). The first part of my work consisted in the biochemical characterization of the S. Cerevisiae C5-cytosine MTase, Trm4. The analysis of its catalytic mechanism and of its modular organization was then realized. The second part of my work contributed to the identification of the P. Abyssi tRNA m5U54 MTase, PabTrmU54, and led to the resolution of its crystal structure in complex with S-adenosyl-L-homocysteine, by X-ray crystallography. Finally, all these results participated in the improvement of our knowledge about the specific mode of RNA recognition by modification enzymes
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Guillon, Jordan. "Caractérisation moléculaire de mécanismes d’échappement à la sénescence : définition d'une hétérogénéité de la sénescence Regulation of senescence escape by TSP1 and CD47 following chemotherapy treatment Regulation of senescence escape by the cdk4–EZH2–AP2M1 pathway in response to chemotherapy tRNA biogenesis and specific aminoacyl-tRNA synthetases regulate senescence stability under the control of mTOR. Proteomics approaches to define senescence heterogeneity and chemotherapy response Chemotherapy-induced senescence, an adaptive mechanism driving resistance and tumor heterogeneity." Thesis, Angers, 2020. http://www.theses.fr/2020ANGE0005.

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Abstract:
La sénescence est induite suite à l’érosion télomérique, l’activation d’oncogènes ou en réponse à la chimiothérapie. Ce mécanisme de suppression tumorale empêche la prolifération de cellules anormales et la transformation. Cependant, certains travaux ont montré qu’en réponse à la chimiothérapie la sénescence constitue davantage un mécanisme d’adaptation permettant aux cellules tumorales d'échapper. Ainsi, nous avons caractérisé de nouveaux mécanismes d’échappement permettant de définir une hétérogénéité de sénescence. Lors de nos études, nous avons observé que la stabilité de ce mécanisme suppressif est régulée épigénétiquement par EZH2. Cette méthylase module l’expression d’AP2M1, une protéine d’endocytose nécessaire à l’échappement. La pérennité de la sénescence est également modulée par les facteurs sécrétés du SASP tels que la TSP1. Cette glycoprotéine limite, par interaction avec son récepteur CD47, l’émergence de cellules persistantes. La réduction de l’expression de ce récepteur favorise alors l'échappement à la sénescence. Enfin, la biosynthèse des ARNt module également la stabilité de ce mécanisme suppressif. Lors de l’émergence de cellules persistantes, mTOR favorise l’expression d’ARNt spécifiques et la résolution du stress protéique. L’expression des ARNt-ligases correspondantes est alors nécessaire à l’échappement. Ainsi, la sénescence est plus hétérogène que ce qui était initialement décrit. Sa stabilité est perturbée par l’expression de régulateurs épigénétiques, de protéines de l’endocytose, de récepteurs spécifiques et par la dérégulation de la biosynthèse d’ARNt
Senescence is induced as a result of telomeric shortening, activation of oncogenes or in response to chemotherapy. This tumour suppression mechanism prevents the proliferation of abnormal cells and transformation. However, some studies have shown that in response to chemotherapy, senescence is more of an adaptation mechanism allowing tumour cells to escape. Thus, we have characterized new escape mechanisms allowing to define senescence heterogeneity. During our studies, we observed that the stability of this suppressive mechanism is epigenetically regulated by EZH2. This methylase modulates the expression of AP2M1, an endocytosis protein required for escape. The stability of senescence is also modulated by secreted SASP factors such as TSP1. By interaction with its receptor CD47, this glycoprotein limits the emergence of persistent cells. The reduction in the expression of this receptor then favours the escape of senescence. Finally, tRNA biosynthesis also modulates the stability of this suppressive mechanism. During the emergence of persistent cells, mTOR promotes the expression of specific tRNAs and the resolution of protein stress. The expression of the corresponding tRNA ligases is then required for escape. Thus, senescence is more heterogeneous than initially described. Its stability is disturbed by the expression of epigenetic regulators, endocytosis proteins, specific receptors and by the deregulation of tRNA biosynthesis
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Gaudin, Cyril. "Nouvelles caractérisations structurales de l'ARN transfert-messager." Rennes 1, 2004. http://www.theses.fr/2004REN10023.

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Abstract:
La "trans-traduction" est un mécanisme bactérien qui permet la libération de ribosomes bloqués en cours de synthèse protéique. Ce mécanisme fait intervenir l'ARN transfert-messager (ARNtm), comportant un domaine ARNt et un cadre ouvert de lecture, et la protéine SmpB. Chez certaines espèces, le gène codant pour l'ARNtm a subi une permutation circulaire dont la transcription aboutit à un ARN précurseur maturé sous la forme de deux ARN distincts. Nous avons caractérisé par cartographie chimique et enzymatique la structure secondaire de cet ARNtm en deux parties. D'autre part, nous avons déterminé, par résonance magnétique nucléaire, le degré de similarité structurale entre le domaine assurant la fonction ARNt de la molécule (TLD) et les ARNt standards. Nous avons montré que ce domaine interagit avec SmpB. Afin d'obtenir des informations supplémentaires sur l'initiation de la trans-traduction, nous avons entrepris de résoudre la structure du complexe TLD/SmpB par RMN.
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Morelle, Geoffrey. "Les ARN de transfert, une nouvelle source de petits ARN non-codants chez Arabidopsis thaliana." Thesis, Strasbourg, 2015. http://www.theses.fr/2015STRAJ015/document.

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Abstract:
Au cours de ces 10 dernières années une nouvelle classe de petits ARN non-codants nommés "tRNA-derived fragments" (tRFs) a été caractérisée. Tandis que le rôle canonique des tRNA est bien connu, les raisons pour lesquels des fragments de tRNA s'accumulent dans la cellule restent inconnues. Actuellement, peu d'informations sont disponibles sur leurs biogenèses et leurs rôles biologiques, mais les preuves montrant leur importance dans la régulation de l'expression des gènes augmente régulièrement. Cependant, peu de données sont disponibles chez les plantes. A l'aide d’expérience de "deep-sequencing" et de northern blot nous avons confirmé l'existence d'une grande population en tRFs d'origine variée. A la suite de ces observations, trois questions sont établies. Tout d'abord, quelles sont les enzymes responsables de la biogenèse des tRFs. Ensuite, où les tRFs sont générés. Enfin, est-ce que les tRFs sont des sous-produits de la dégradation des tRNA ou ont-ils une fonction biologique?
During the last decade, a new class of small non-coding RNAs called tRNA-derived fragments (tRFs) has emerged. Whilst the canonic role of tRNA is well-known, the reason(s) why stable tRFs remains in the cell is unknown. Indeed, the number of tRFs has rapidly increased in various evolutionary divergent organisms. To date, only few data on their biogenesis and on their biological roles is known but their importance in the regulation of gene expression and in cell life is expanding. In plants, the existence of tRFs has also been reported but only few data are available. Using deep-sequencing on various small RNA libraries from Arabidopsis thaliana and Northern blots experiments, we confirmed the existence of a large but specific population of tRFs. Following these observations, three questions are addressed. First, what are the enzymes responsible for tRFs biogenesis, second where are tRFs generated and third, are tRFs merely degredation by-products or do they have biological functions?
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Barraud, Pierre. "Etudes structurales de différents processus biologiques impliquant les ARN de transfert." Phd thesis, Université René Descartes - Paris V, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00364789.

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Abstract:
Le travail retranscrit dans cette thèse regroupe l'étude de différents processus biologiques impliquant les ARN de transfert. Premièrement, dans le cadre de l'étude du rôle de la protéine de nucléocapside (NC) dans la formation du complexe d'initiation de la transcription inverse du VIH-1, un site de fixation fort et spécifique de la NC a été identifié sur le bras D de l'ARNtLys3 — l'ARNt servant d'amorce à la transcriptase inverse lors de la synthèse du brin d'ADNc(-). Cette fixation permet d'une part la fusion des interactions tertiaires entre les bras T et D de l'ARNtLys3 et pourrait d'autre part être l'un des facteurs déplaçant l'équilibre vers la formation de l'hybride ARNtLys3/ARN viral. L'étude structurale par RMN du complexe NC/bras D s'est heurtée à des problèmes d'échange chimique dans la gamme intermédiaire–rapide de l'échelle de temps spectrale. L'utilisation de séquences de type CPMG–HSQC a permis d'améliorer le rapport signal/bruit des expériences RMN, et particulièrement celui des signaux des résidus de l'interface. Ceci nous a permis d'identifier les résidus de la NC impliqués dans la reconnaissance du bras D. Deuxièmement, la structure de la m1A58 méthyltransférase de T. thermophilus (TrmI) — une enzyme de modification des ARNt — a été résolue par cristallographie et affinée à 1.7 Å. Ceci a permis d'identifier trois résidus potentiellement impliqués dans la catalyse et/ou la reconnaissance du substrat ARNt (D170, Y78 et Y194). La production de variants de TrmI au niveau de ces résidus ainsi que des études d'amarrage moléculaire d'une adénine au site actif ont permis de confirmer cette hypothèse et de proposer un rôle catalytique pour chacun d'eux. Parallèlement, des études par gel natif et par spectrométrie de masse en conditions non dénaturantes ont montré une stoechiométrie 1/2 pour le complexe entre l'enzyme TrmI tétramérique et le substrat ARNt. Troisièmement, la résolution de la structure cristallographique de l'ARNtfMet initiateur d'E. coli a révélé une conformation unique de la région de l'anticodon. Cette conformation unique est associée au paires GC de la tige anticodon, caractéristiques des ARNt initiateurs. Cette conformation particulière — dans laquelle la base A37 ne vient pas s'empiler entre les bases 36 et 38, comme dans tous les ARNt élongateurs — permet de mettre en lumière de nombreux résultats biochimiques de la littérature et suggère un mécanisme par lequel la machinerie de l'initiation de la traduction pourrait discriminer l'ARNt initiateur de tous les ARNt cellulaires.
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Laforest, Marie-Josée. "Phylogénie de l'édition des ARN de transfert mitochondriaux chez les chytridiomycètes." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 2001. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk3/ftp04/NQ65315.pdf.

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Barraud, Pierre. "Etudes structurales de différents processus biologiques impliquant les ARN de transfert." Paris 5, 2008. http://www.theses.fr/2008PA05P616.

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Abstract:
Le travail de cette thèse regroupe l’étude de différents processus biologiques impliquant les ARNt. Premièrement, dans l’étude du rôle de la NC dans la formation du complexe d’initiation de la transcription inverse du VIH-1, un site de fixation fort et spécifique de la NC a été identifié sur le bras D de l’ARNtLys3. Cette fixation permet la fusion des interactions entre les bras T et D. Deuxièmement, la structure de la m1A58 MTase de T. Thermophilus a été résolue par cristallographie. Ceci a permis d’identifier trois résidus impliqués dans la catalyse. Parallèlement, des études ont montré une stoechiométrie 1/2 pour le complexe entre l’enzyme TrmI et l’ARNt. Troisièmement, la résolution de la structure de l’ARNtfMet initiateur d’E. Coli a révélé une conformation unique de la région de l’anticodon. Cette conformation permet d’expliquer des résultats biochimiques de la littérature et suggère comment la machinerie de l’initiation de la traduction pourrait discriminer cet ARNt
During this thesis, we have studied several biological processes involving tRNA. First, the study of the role of the NC protein in the formation of the HIV-1 reverse transcription initiation complex enabled us to identify a strong and specific binding site for the NC onto the D-arm of tRNALys3. This allows the melting of tertiary interactions between the T and D-arms. Secondly, the structure the m1A58 MTase of T. Thermophilus was solved by crystallography. Three residues involved into catalysis and tRNA substrat recognition were identified. In addition, experiments revealed the 1/2 stoichiometry of the TrmI tRNA complex. Thirdly, the resolution of the E. Coli initiator tRNAfMet structure uncovered a unique conformation of the anticodon region. This peculiar structure put in light biochemical results of the literature and suggests a mechanism by which the translation initiation machinery could discriminate the initiator tRNA
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Gasparutto, Didier. "Synthèse chimique totale d'un ARN de transfert avec ses bases modifiées." Grenoble 1, 1992. http://www.theses.fr/1992GRE10148.

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Abstract:
Des progres dans la synthese chimique des oligoribonucleotides sont decrits et ont conduit a la premiere synthese chimique totale d'un acide ribonucleique de transfert. L'introduction de synthons phosphoramidites originaux en serie arn, avec l'utilisation du groupement n-ethyl-n-methylamino pour la protection transitoire du phosphate, constitue la premiere amelioration majeure. Ces monomeres permettent d'obtenir des rendements de couplage sur support de l'ordre de 98% en 4 minutes, compares aux 95-96% atteints apres 15 min. Avec les derives diisopropylamino classiques. Ces composes, utilises avec succes pour la preparation de fragments d'arn de 16 a 36 bases de longueur, permettent d'envisager la synthese d'oligoribonucleotides de longueur superieure a 50 residus. Cependant, des problemes d'elimination du groupement tbdms protegeant la fonction alcool en position 2 du ribose existent pour les longs fragments synthetiques et, une etude de la protection de l'hydroxyle en 2 a alors ete entreprise. L'utilisation, pour l'etape de desilylation finale, du trishydrofluorure de triethylamine (tea. 3hf) en remplacement du fluorure de tetrabutylammonium (tbaf) constitue un progres important. L'excellente reactivite de ce reactif ainsi que sa totale compatibilite avec les fragments nucleiques ont ete mises en evidence sur des modeles mixtes adn-arn, ainsi que sur des oligoribonucleotides de synthese. L'ensemble de ces ameliorations a alors permis la preparation de l'arn de transfert specifique de l'alanine chez e. Coli, compose de 76 nucleotides dont trois bases modifiees: la pseudouracile, la thymine et la dihydrouracile. Cette molecule synthetique, qui a ete isolee puis totalement caracterisee, a montre une activite biologique convenable vis-a-vis de l'alanine
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Ouenzar, Bouchra. "Un exemple de spécialisation de la population des ARN de transfert en relation avec la différenciation cellulaire chez le poulet." Paris 11, 1987. http://www.theses.fr/1987PA112145.

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Abstract:
Une corrélation significative a été observée entre la distribution des gènes de tARN analysée par hybridation tARN-ADN et par cartographie électrophorétique et celle des tARN matures de différents tissus de poulet. La relation entre cette dernière distribution et les codons dans l'ARNm a été étudiée par analyse comparée du tARN total et du tARN polysémique de 2 tissus de poulet: le magnum d'oviducte et les tendons d'embryons. Dans l'ARNm du magnum, la distribution moyenne des codons est proche de celle des vertébrés, par contre, l'ARMm des tendons dont 60 % de la synthèse protéique est constituée par le collagène, présente une composition particulière en codons (19 % de codons glycine et 12 % de codons proline). L'étude de la séquence primaire des tARN a permis d'identifier leurs anticodons. L'augmentation relative du tARNPro et du tARNGly dans les tendons respectivement de 100 et 40 % par rapport au magnum, indiquent une spécialisation de ces tARN pour la synthèse du collagène. Cependant ces valeurs n'atteignent pas celles des codons correspondants dans l'ARNm des tendons. La relation entre l'abondance de tARN spécifiques et le niveau de synthèse du collagène a été étudiée dans les cellules en culture primaire de tendons d'embryons de poulet. Dans ces cellules la synthèse du collagène peut être : -soit induite par addition d'ascorbate : et dans ce cas, quelle que soit la synthèse du collagène les proportions relatives des iso-tARN glycine et proline restent constantes. -soit inhibée par transformation vire-induite : une chute d'environ 50 % est alors observée dans les proportions relatives de ces tARN parallèlement à l'apparition des caractéristiques de la transformation. Il semble donc que la spécialisation de la population de tARN pour la synthèse du collagène est déterminée par le phénotype différencié de la cellule.
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Bonnefond, Luc Giegé Richard Rudinger-Thirion Joëlle. "La tyrosyl-ARNt synthétase mitochondriale humaine originalités fonctionnelles, structurales et place dans l'évolution /." Strasbourg : Université Louis Pasteur, 2007. http://eprints-scd-ulp.u-strasbg.fr:8080/809/01/Bonnefond_Luc_2007.pdf.

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Books on the topic "ARN de transfert de la thréonine"

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Hatfield, Dolph L. Transfer RNA in Protein Synthesis. Taylor & Francis Group, 2017.

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L, Hatfield Dolph, Lee Byeong J, and Pirtle Robert M, eds. Transfer RNA in protein synthesis. Boca Raton: CRC Press, 1992.

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Lestienne, Patrick, ed. Mitochondrial Diseases: Models and Methods. SPRINGER-VERLAG, 1999.

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4

Lestienne, Patrick. Mitochondrial Diseases: Models and Methods. Springer, 2011.

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5

Mitochondrial Diseases: Models and Methods. Springer, 2011.

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