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Dissertations / Theses on the topic 'ARN G-Quadruplexes'

Author: Grafiati
Published: 30 November 2024
Last updated: 31 July 2025

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Bonnat, Laureen. "Synthèse et étude d'ADN et d'ARN G-quadruplexes à topologies contrôlées. Applications pour la caractérisation et la sélection de ligands." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017GREAV081/document.

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Abstract:
Les acides nucléiques riches en guanines ou en cytosines peuvent se replier sur eux-mêmes et former des systèmes tétramériques tels que les G-quadruplexes (G4) ou les i-motifs. Ces motifs, abondamment représentés dans certaines régions du génome humain semblent contribuer à la régulation cellulaire et suscitent depuis plusieurs années un intérêt grandissant. Ils sont notamment présents dans la région télomérique, mais aussi dans les promoteurs d’oncogènes ou au sein des génomes viraux et sont impliqués dans certaines pathologies humaines. Ils représentent ainsi des cibles thérapeutiques et dia
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Bourdon, Sebastien. "Régulation des ARN G-Quadruplexes par les protéines de liaison à l'ARN et leur interaction avec les N6-Méthyladénosines dans les cellules du cancer." Electronic Thesis or Diss., Université de Toulouse (2023-....), 2024. http://www.theses.fr/2024TLSES129.

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Abstract:
Le développement du cancer et la réponse aux traitements sont associés à des variations de la régulation post-transcriptionnelle qui entraîne une modification du protéome qualitativement et/ou quantitativement. La régulation post-transcriptionnelle implique des protéines de liaison à l’ARN (RBP), interagissant avec des éléments cis comme les séquences, les modifications ou les structures de l’ARN. Parmi ces éléments cis, les structures non-canoniques nommées ARN G-Quadruplexes (RG4), et les modifications N6-Méthyladénosines (m6A), jouent un rôle critique dans le modelage post-transcriptionnel
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Largy, Eric. "Ciblage d’acides nucléiques G-quadruplexes : synthèse et développement de méthodes pour l’analyse et le criblage de ligands sélectifs multimodaux." Thesis, Paris 11, 2011. http://www.theses.fr/2011PA112257.

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Abstract:
L’objectif de ces travaux de thèse était l’étude des interactions de petites molécules avec les multiples structures de l’ADN quadruplex via i) le développement et l’utilisation d’un test haut-débit pour l’analyse des interactions ligand-ADN quadruplex et le criblage de chimiothèques/ciblothèques et ii) la préparation de composés aux modes d’interactions multiples (empilement/sillon, covalent/non-covalent, etc.), sélectifs (quadruplex vs. duplex et intra-quadruplex) et éventuellement fonctionnalisés (biotine, fluorophore, etc.). La première partie des travaux a été centrée sur le développement
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Zheng, Alice Jia-Li. "How the Epstein-Barr virus-encoded EBNA1 mRNA translation is regulated in cis by its mRNA dynamic structure and its nascent polypeptide." Thesis, Université Paris Cité, 2021. https://wo.app.u-paris.fr/cgi-bin/WebObjects/TheseWeb.woa/wa/show?t=3378&f=38122.

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Abstract:
La traduction des ARNm et la production de protéines sont des phénomènes étroitement contrôlés dans la cellule. La séquence de l'ARNm et sa structure, auxquelles sont associées des protéines se liant à l'ARN, ainsi que la qualité de la protéine produite à partir de cet ARNm, évaluée notamment par la voie de contrôle qualité associée aux ribosomes, sont des éléments impliqués dans ce processus majeur pour la cellule. Dans ce domaine, le contrôle de la production de protéine EBNA1 (Epstein-Barr Nuclear Antigen 1) du virus d'Epstein -Barr est un exemple intéressant. La protéine EBNA1 est essentie
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Stefan, Loïc. "Template-Assembled Synthetic G-Quartets (TASQ) hydrosolubles : du ligand de quadruplexes d'ADN et d'ARN à la plateforme catalytique." Thesis, Dijon, 2013. http://www.theses.fr/2013DIJOS084/document.

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Abstract:
Formés à partir de brins d’ADN ou d’ARN riches en guanines, les quadruplexes résultent de l’empilement de tétrades de guanines constituées chacune par l’auto-assemblage dans un même plan de quatre guanines, stabilisées entre elles par un réseau de liaisons hydrogènes. En s’inspirant de cet édifice naturel, il est présenté au long de ce manuscrit de thèse la synthèse et l’étude de molécules de type TASQ (pour template-assembled synthetic G-quartet) hydrosolubles capables de former de manière intramoléculaire une tétrade de guanines synthétique : les DOTASQ, le PorphySQ et le PNADOTASQ. La premi
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Ferret, Lucille. "Involvement of lysosomes in cancer resistance to transcription inhibitors." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASL044.

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Abstract:
Les lysosomes jouent un rôle clé dans divers mécanismes de résistance aux traitements anticancéreux, notamment en piégeant les médicaments à l’intérieur de leur structure et en activant des voies de stress adaptatives. Si cibler la transcription s’est révélée être une stratégie prometteuse contre les cellules cancéreuses, les mécanismes sous-jacents de résistance aux inhibiteurs de la transcription demeurent largement méconnus. Mon projet de thèse vise à explorer le rôle des lysosomes dans les mécanismes de résistance induits en réponse à deux inhibiteurs puissants de l’ARN POL I (composés A e
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Decorsière, Adrien. "Régulation de la maturation en 3' des pré-ARNm de gènes de susceptibilité aux cancers p53 et msh6." Toulouse 3, 2011. http://thesesups.ups-tlse.fr/1313/.

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Abstract:
La maturation en 3' des pré-ARNm constitue une étape de régulation posttranscriptionnelle indispensable à l'expression d'un gène. Elle est composée de deux réactions : le clivage de l'extrémité 3' qui permet de libérer l'ARNm du site de transcription et l'ajout de la queue poly(A) qui contrôle à la fois l'export nucléaire, la stabilité et la traduction du transcrit mature. Plusieurs études montrent, d'une part, que la maturation en 3' est inhibée de manière globale lors de dommages à l'ADN et d'autre part, que des dérégulations de cette maturation peuvent contribuer au développement tumoral. N
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Paul, Alexis. "G-quadruplexes and acridines : from molecular recognition to drug design." Strasbourg, 2009. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2009/PAUL_Alexis_2009.pdf.

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Bedrat, Amina. "G4-Hunter : un nouvel algorithme pour la prédiction des G-quadruplexes." Thesis, Bordeaux, 2015. http://www.theses.fr/2015BORD0197/document.

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Abstract:
Des séquences compatibles avec la formation de G4 sont présentes au niveau de certaines régions clés du génome telles que les extrémités des chromosomes, mais également les régions de commutation de classe des immunoglobulines, les promoteurs de certains gènes dont des oncogènes et des séquences transcrites. Plus de 370 000 cibles potentielles ont été prédites lors des analyses bioinformatiques du génome humain. Cependant, ces prédictions ne sont pas exhaustives étant limitées par la formulation des algorithmes de prédiction utilisés. En effet, les séquences recherchées suivent la formule cons
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Hodeib, Samar. "Real-time unfolding of DNA G-quadruplexes by helicases and polymerases." Thesis, Paris Sciences et Lettres (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017PSLEE027/document.

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Abstract:
Les structures G-quadruplexes (G4) sont considérées comme des obstacles qui s’opposent à la progression du réplisome. Les séquences capables de former des G4 dans le génome humain se trouvent dans les régions d’ADN double brin au niveau des oncogènes et des proto-oncongènes et sur l’extrémité simple brin des télomères. La plupart des études biochimiques et biophysiques ont caractérisé les propriétés thermodynamiques des G4 en utilisant par exemple la température de fusion Tm pour déduire la thermodynamique de la formation/résolution du G4. Cependant, les expériences en solution donnent seuleme
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Sidibe, Assitan. "Effet de ligands de G-quadruplexes sur la séquence terminale des télomères." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2012. http://www.theses.fr/2012MNHN0017.

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Abstract:
Les télomères sont des complexes nucléoprotéiques situés à lʼextrémité des chromosomes. Le rôle des télomères dans la protection du génome, et leur implication dans la sénescence et le cancer en font une cible privilégiée dans la lutte contre le cancer. Une stratégie originale consiste à bloquer lʼaccès de lʼextrémité télomérique aux protéines nécessaires à sa réplication et à sa stabilité comme par exemple la télomérase qui est activée dans 85% des cancers ou les protéines POT1 et TRF2 qui protègent lʼextrémité télomérique. A cause de la répétition en guanines du brin G, lʼextrémité des télom
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Elizondo-Riojas, Miguel-Angel. "Simulations de dynamique moléculaire et études spectroscopiques des interactions entre le complexe antitumoral cisplatine et l'ADN." Paris 7, 2002. http://www.theses.fr/2002PA077075.

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Gurung, Pratima. "Deciphering the role of G-quadruplexes and their interacting proteins in Plasmodium falciparum." Thesis, Montpellier, 2020. http://www.theses.fr/2020MONTT010.

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Abstract:
Le paludisme continue d'être l'une des principales causes de morbidité et de mortalité dans les pays en développement. Le développement de la résistance aux médicaments antipaludiques disponibles et la rareté des vaccins efficaces ont rendu nécessaire la recherche urgente de nouvelles cibles antipaludiques. La forme grave du paludisme est causée par Plasmodium falciparum, qui présente un cycle de vie complexe impliquant diverses formes morphologiquement et fonctionnellement distinctes chez deux hôtes différents - l'humain et le moustique anophèle. Afin de se développer dans l'environnement de
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Laurent, Marc. "Rôle des G-quadruplexes dans la spécification des origines de la réplication chez les vertébrés." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2016. http://www.theses.fr/2016USPCC162/document.

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Abstract:
Les origines de réplication sont les sites à travers le génome où est initiée la synthèse de l’ADN. Les multiples cartographies des origines de réplication dans des cellules de vertébrés ont identifié une association entre origines de réplication et motifs G4. Les motifs G4 sont des séquences ayant le potentiel de se replier en G-quadruplexe. Des travaux menés précédemment au laboratoire ont montré que la capacité d’un motif G4 à se replier en G-quadruplexe est essentielle pour l’activité de deux origines de réplication modèles dans la lignée cellulaire de poulet DT40. Cependant, le motif G4 n
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Buffet, Charles-Henri. "Photoactivatable G-quadruplex ligands : synthesis, activation, reactivity, and biological application." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASF009.

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Abstract:
Les G-quadruplexes sont des structures non canoniques des acides nucléiques formés au niveau de région riche en guanine et en présence d'ions potassium. Ces structures sont connues pour se former dans le génome humain (> 10 000) et semblent participer à la régulation de phénomènes biologiques.Le but du projet est de développer et étudier des ligands trifonctionnels pour les utiliser comme outils dans un protocole d'immunoprecipitation pour mieux comprendre l'accessibilité et la dynamique des G4s via une association covalente entre le ligand et la structure G4. Les ligands sont composés de i
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Morel, Elodie. "Conception d’outils chimiques pour la détection des structures d’ADN G-quadruplex." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015SACLS237.

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Abstract:
Des structures secondaires d’acides nucléiques atypiques, les structures G-quadruplex, peuvent se former autour d’un cation (K+ ou Na+) dans les régions riches en guanines, grâce à une association de type Hoogsteen. La formation de ces structures est impliquée dans de nombreux mécanismes biologiques, comme la réplication, la transcription ou l’épissage. Elles peuvent affecter l’architecture de l’ADN jusqu’au niveau de la chromatine et provoquer une instabilité importante, tant génétique qu’épigénétique. De nombreuses méthodes ont été développées afin de détecter ces structures in vivo et de co
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Bertrand, Hélène. "Hétérocycles aromatiques étendus : variations structurales pour l'auto-assemblage bi-dimensionnel et la reconnaissance d'ADN G-quadruplexe." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00343363.

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Abstract:
Dans ce travail de thèse, nous nous sommes intéressés à la synthèse et l'utilisation d'outils chimiques pour l'étude des interactions intermoléculaires dans le domaine des nanostructures et dans celui de la biologie.<br />Dans ce but, nous avons développé une famille de molécules, les triazatrinaphthylènes (TrisK), se caractérisant par un large coeur aromatique ainsi que par la diversité des chaînes latérales qui peuvent y être introduites, leur nature gouvernant le type d'application désirée.<br />L'introduction de chaînes lipophiles confère aux TrisKs des propriétés d'auto-assemblage sur des
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Tkach, Olha. "Caractérisation photophysique d'un analogue fluorescent isomorphe de la guanosine et son application pour le marquage des G-quadruplexes." Electronic Thesis or Diss., Strasbourg, 2025. http://www.theses.fr/2025STRAJ015.

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Abstract:
La dynamique des interactions acides nucléiques/protéines peut être étudiée par des techniques de fluorescence en marquant l'ARN/ADN par des analogues fluorescents de nucléosides. Dans ce travail, nous avons caractérisé la photophysique de l'isothiozaloguanosine (tzG), un analogue de la guanosine, à différentes polarité, proticité, pH et température du milieu. Nos résultats montrent que la tzG possède une photophysique complexe et sa réponse spectroscopique apparait plus sensible que celle de la thiénoguanosine (thG). Elle devrait donc se montrer supérieure pour suivre les changements de confo
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Merle, Patrick. "Etude de ligands de l'ADN G-quadruplexe télomérique dans le traitement du glioblastome et cancer bronchique : approches combinatoires." Thesis, Clermont-Ferrand 1, 2011. http://www.theses.fr/2011CLF1MM14.

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Pipier, Angélique. "Etudes des G-quadruplexes : impact de la stabilisation par des ligands en tant qu'agents anti-cancéreux et identification des protéines associées régulant leur métabolisme." Thesis, Toulouse 3, 2020. http://www.theses.fr/2020TOU30118.

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Abstract:
Les G-quadruplexes (ou G4) sont des structures non canoniques des acides nucléiques formées à partir de séquences riches en guanines. Les G4 sont des structures stables, présentes sur l'ensemble du génome et qui peuvent adopter différentes conformations. La formation des G4 peut réguler, de façon positive ou négative, différents processus cellulaires tels que la transcription, la réplication, les transactions des ARN et les mécanismes mitochondriaux. L'ensemble de ces processus nécessite le recrutement de protéines capables de moduler la formation de ces structures. Certaines protéines, telles
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Beauvarlet, Jennifer. "Caractérisation du rôle de la voie de réponse aux dommages à l'ADN et des lysosomes dans la mort cellulaire et la sénescence induites par un ligand G-quadruplexe." Thesis, Bordeaux, 2018. http://www.theses.fr/2018BORD0318.

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Abstract:
Les G-quadruplexes (G4) sont des structures non canoniques des acides nucléiques qui peuvent être formés dans des régions d’ADN ou d’ARN riches en guanines. Les ligands G4 (LG4), sont des molécules capables d’interagir et de stabiliser les structures G4, qui présentent de nombreuses propriétés anti-cancéreuses. Nous avons travaillé avec le LG4 20A, appartenant à la famille des triarylpyridines, qui stabilise efficacement les structures G4 in vitro. Les objectifs de ce travail ont été de déterminer les mécanismes moléculaires et cellulaires responsables des effets anti-prolifératifs du 20A dans
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Reznichenko, Oksana. "Combinatorial chemistry approaches for the development of G-quadruplex DNA and RNA ligands." Thesis, université Paris-Saclay, 2021. http://www.theses.fr/2021UPASF014.

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Abstract:
Les G-quadruplexes (G4s) sont des structures non-canoniques d’acides nucléiques (ADN et ARN) constituées d’au moins deux quartets de guanines. L’une des propriétés importantes des G4s est leur capacité à former des complexes avec de petites molécules exogènes (ligands) et d’influencer ainsi les processus biologiques dans lesquels ils sont impliqués. Ainsi, l’interaction de petites molécules avec certaines structures G4s permettrait de diminuer l’expression de certains oncogènes, d’inhiber la télomérase ou encore d’induire des dommages à l’ADN. Ce travail vise à développer des méthodologies rap
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Audry, Julien. "Réplication et maintenance des télomères chez Schizosaccharomyces pombe : Rôle du complexe RPA dans la prévention ou la résolution de structures secondaires de type G-quadruplexes." Thesis, Aix-Marseille, 2015. http://www.theses.fr/2015AIXM4013.

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Abstract:
Les télomères sont des structures nucléoprotéiques protégeant l’extrémité des chromosomes de la dégradation et assurant la réplication de l’ADN terminal. En effet, de nombreuses protéines de réplication sont impliquées dans le maintien de ces structures, comme le complexe RPA (Replication Protein A). Ce complexe très conservé chez les eucaryotes se fixe à l’ADN simple brin et est impliqué dans la réplication, les mécanismes de recombinaison et la réparation de l’ADN. Chez S.pombe, la mutation ponctuelle de la sous-unité RPA1 (Rpa1-D223Y) provoque le raccourcissement des télomères. Dans cette é
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Romero, Salas Tonatiuh. "Etude in vitro des interactions entre la protéine de réplication A humaine (hRPA) et l' ADN." Paris 6, 2005. http://www.theses.fr/2005PA066542.

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Saadallah, Dounia. "Synthèse de complexes originaux de Ruthénium(II) à base de ligands étendus dérivés de phénanthroline, caractérisation photophysique et propriétés d’interaction avec les G-quadruplexes." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2016. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/242038.

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Abstract:
Depuis plusieurs années, on observe un intérêt grandissant envers des structures particulières de l’ADN, les quadruplexes de guanine ou G4. Ces structures, largement étudiées in vitro, sont encore peu connues in cellulo mais semblent jouer un rôle important dans la régulation de l’expression génétique. Elles ont rapidement été considérées comme des cibles thérapeutiques potentielles pour certaines maladies telles que le cancer. Le premier indice de leur existence dans les cellules n’a été obtenu qu’en 2013 par immunodétection sur des cellules fixées. Les recherches sont actuellement tournées v
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Lefebvre, Joël. "Outils moléculaires pour l'étude des G-quadruplex au sein du génome." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS536/document.

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Abstract:
L’acide désoxyribonucléique se structure chez les êtres vivants de différentes façons. La plus connue est sa forme double hélice mais de nombreuses autres structures secondaires existent et notamment les G-quadruplex. Il s’agit d’une structure basée sur le repliement d’un brin d’ADN possédant des répétitions de guanines. L’association de quatre guanines entre elles par liaisons hydrogène forme un plan appelé G-quartet. Ce réseau de liaisons hydrogène est appelé appariement de Hoogsteen. L’empilement d’au moins deux quartets autour d’un cation monovalent comme le potassium ou le sodium constitu
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Sfaxi, Rym. "Régulation de la maturation en 3' des pré-ARNm en réponse aux dommages de l'ADN." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS358.

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Abstract:
La maturation 3’ des pré-ARNm constitue une étape majeure dans la régulation post-transcriptionnelle de l’expression des gènes, indispensable à la stabilité, l’export vers le cytoplasme et la traduction des ARNm. Elle est composée de deux réactions : un clivage à l’extrémité 3’ suivie de l’addition d’une queue poly(A). Des études ont montré que la maturation en 3’ est inhibée en réponse aux dommages de l’ADN. Cependant, la cellule a mis en place des mécanismes compensatoires qui permettent à certains pré-ARNm d’être correctement maturés assurant ainsi le maintien de son intégrité. Les travaux
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Mougeot, Romain. "Synthèse de sondes fluorescentes hybrides epicocconone-triphénylamine pour le piégeage de protéines liées aux zones à risques de l'ADN." Thesis, Normandie, 2018. http://www.theses.fr/2018NORMR126.

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Abstract:
La compréhension des mécanismes biologiques et l’implication des protéines dans ces mécanismes ont toujours été un enjeu important pour les biologistes. Les zones à risques de l’ADN impliquées dans les cancers, comme les G-quadruplex, les zones riches en Adénine-Thymine et leurs environnements proches sont particulièrement étudiés depuis de nombreuses années. L’essor des techniques d’analyses par fluorescence a permis aux scientifiques de mettre au point des sondes marquant ces domaines avec toujours plus de précision et de sensibilité. Cependant, de nombreuses interrogations existent sur la n
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Tanushi, Xhaferr. "Impairing the repair of the oxidative DNA damage 8-oxoG in nuclear and mitochondrial genomes, which consequences for the cell?" Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASL070.

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Abstract:
OGG1 est une ADN glycosylase de la voie de réparation par excision de base (BER) qui excise spécifiquement la guanine oxydée 8oxoG. La voie BER est bien connue pour son rôle dans la maintenance du génome nucléaire mais elle est également la principale voie de réparation de l'ADN mitochondrial. La déficience de l'activité d'OGG1 entraîne une mutagenèse importante lors de la réplication de l'ADN nucléaire, ce qui n'a pas été détecté au niveau de l'ADNmt. Malgré cela, la déficience d'OGG1 induit une augmentation des ROS mitochondriaux, une perte du potentiel de la membrane mitochondriale et une a
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Miclot, Tom. "Modeling the influence of DNA lesion on the regulation of gene expression." Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2022. http://www.theses.fr/2022LORR0256.

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Abstract:
Les acides nucléiques sont des macromolécules organiques qui résultent de la polymérisation de nucléotides. Ces molécules sont généralement considérées comme le support de l'information génétique. Deux familles d'acides nucléiques sont actuellement connues : l'ADN et l'ARN. D'un point de vue structurel, la forme la plus populaire est la double hélice d'ADN. Cependant, d'autres formes existent et parmi elles, le G-quadruplex. Il s'agit d'un repliement de l'ADN, ou de l'ARN, dans une zone riche en guanines. Celles-ci forment des quadruplex de guanines, qui sont empilées les unes sur les autres e
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Lecarme, Lauréline. "Synthèse de complexes métallo-salen et dérivés pour la biocatalyse et l'assemblage supramoléculaire." Thesis, Grenoble, 2014. http://www.theses.fr/2014GRENV038/document.

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Abstract:
Des complexes salen et dipyrrophénolate de fer comportant des unités phénolatesenrichies en électron (substituants tert-butyl ou methoxy) ont été préparés. Leur chimieoxydative conduit à des espèces radicalaires dont une a été caractérisée par diffraction desRX. Les complexes dipyrrophénolate de manganèse et cuivre ont été également étésynthétisés et oxydés, engendrant des espèces radicalaires. Le premier s’est avéré efficace entermes d’oxygénation d’oléfines, le second pour l’oxydation d’alcools.La fonctionnalisation des phénols par des chaînes alkylimidazolium rend les complexeshydrosolubles
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Ferreira, Cátia Vanessa Pereira. "Ácidos nucleicos como alvo terapêutico: presente e futuro." Master's thesis, 2016. http://hdl.handle.net/10451/35800.

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Abstract:
Trabalho Final de Mestrado Integrado, Ciências Farmacêuticas, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia, 2016<br>Os ácidos nucleicos são as moléculas base dos seres vivos. Desde a mais simples bactéria até aos mamíferos mais desenvolvidos, todos os têm nas suas células, e é a partir deles que todas as proteínas são originadas. Mutações que provoquem erros na sua replicação, transcrição e tradução, se incapazes de serem corrigidos, podem dar origem à desregulação das células e consequentemente a doenças, ou até à morte dessas células. Mas há casos em que pode ser desejada a morte celular, c
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