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Dissertations / Theses on the topic 'ARN ribosomique 18S'

Author: Grafiati
Published: 4 June 2021
Last updated: 1 February 2022

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1

Incardona, Sandra. "Le paludisme au cambodge : épidémiologie, diagnostic moléculaire à haut débit, et variabilité du gène ARNr 18S des quatre espèces infectant l'homme." Paris 7, 2007. http://www.theses.fr/2007PA077226.

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Abstract:
Il est essentiel de bien connaître l’épidémiologie du paludisme pour conduire une lutte efficace. Au Cambodge, la connaissance de la maladie repose sur un dépistage passif des cas. Le diagnostic clinique ou par microscopie ne permet pas de connaître l'incidence précise des infections. Mon travail a consisté à mieux décrire le paludisme au Cambodge et à mettre au point des stratégies adaptées. Une large enquête transversale a mis en évidence une grande hétérogénéité géographique des prévalences et une sous-estimation de la situation dans les zones reculées. Le risque d'infection est augmenté ch
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Scarcella, Karen. "La diversité des communautés microbiennes eucaryotes actives dans les océans canadiens : analyses moléculaires de la diversité du gène d'ARNr 18S et de la nitrate réductase assimilatrice." Thesis, Université Laval, 2009. http://www.theses.ulaval.ca/2009/26382/26382.pdf.

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Druel, Bénédicte. "ARN ribosomal 16S et identification bactérienne." Lyon 1, 1996. http://www.theses.fr/1996LYO1T220.

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4

Delbès, Céline. "Diversité et dynamique structurales et fonctionnelles de la communauté microbienne d'un digesteur anaérobie : approche moléculaire à partir des ADNr 16S et ARNr 16S." Lyon 1, 2000. http://www.theses.fr/2000LYO10247.

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5

Merhej, Vicky. "Evolution des génomes des bactéries intracellulaires." Aix-Marseille 2, 2009. http://www.theses.fr/2009AIX20712.

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6

HELLER, REMY. "Detection et identification des bacteries par amplification et sequencage des genes codant l'arn ribosomique 16s." Strasbourg 1, 1993. http://www.theses.fr/1993STR15059.

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7

Markowicz, Yves. "Structure et organisation du génome plastidial de l'algue brune Pylaiella littoralis (L. ) kjellm : étude des gènes codant pour l'ARN ribosomique 16S." Grenoble 1, 1988. http://www.theses.fr/1988GRE10149.

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8

Doignon-Bourcier, Florence. "Etude taxonomique de Bradyrhizobium symbiotes de petites légumineuses au Sénégal." Lyon 1, 1999. http://www.theses.fr/1999LYO10341.

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Abstract:
Une collection de 73 souches de bradyrhizobia a ete constituee a partir de 28 especes differentes de legumineuses herbacees du senegal appartenant a 13 genres differents, et importantes pour la gestion durable des regions arides et semi-arides au senegal. Ces souches ont ete caracterisees phenotypiquement et genotypiquement, en incluant des souches de reference de bradyrhizobium et une large selection de souches representatives des differents groupes de bradyrhizobium decrits dans la litterature. L'etude de leur spectre d'hote sur 5 plantes differentes a mis en evidence un certain niveau de sp
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Peillon, Rachel. "Épidémiologie moléculaire de bactéries appartenant au complexe Mycobacterium avium dans l'infection sidéenne." Lyon 1, 1997. http://www.theses.fr/1997LYO1T057.

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Courtois, Sophie. "Création de banques d'ADN de micro-organismes telluriques, sans étape préalable de culture in-vitro." Lyon 1, 2000. http://www.theses.fr/2000LYO10059.

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Abstract:
De recentes avancees en ecologie microbienne moleculaire ont demontre que moins de 1% des micro-organismes colonisant des ecosystemes tels que le sol ou les milieux aquatiques pouvaient etre isoles sur milieux de culture. Afin d'exploiter ce potentiel et de mieux apprehender la diversite physiologique des bacteries de l'environnement, l'approche privilegiee dans cette etude a consiste a faire exprimer dans un hote domestique l'information genetique contenue par ces micro-organismes. Nos objectifs etaient triples, visant a demontrer la possibilite de generer de telles banques, a confirmer que l
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Blanc, Chèneby Dominique. "Caractérisation de la microflore dénitrifiante des sols agricoles en lien avec leur aptitude à émettre N2O au cours de la dénitrification." Lyon 1, 2000. http://www.theses.fr/2000LYO10296.

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Bourget, Nathalie. "Polymorphisme génétique et phylogénie de bactéries du genre bifidobacterium : études du gène ribosomique 16s et de la séquence intergénique 16s-23s." Nancy 1, 1994. http://www.theses.fr/1994NAN10299.

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Abstract:
Le polymorphisme génétique de bactéries du genre bifidobacterium a été mis en évidence par l'analyse des profils de restriction de l'ADN total des souches par des endonucléases à haute et basse fréquence de coupure. De plus, les expériences de PFGE ont permis d'estimer à 2,1 mb la taille du génome des souches de l'espèce b. Breve. Le ribotypage met en évidence un polymorphisme interspécifique aussi bien qu'intra-spécifique. Les séquences de l'ARN 16s (1450 pb) de cinq souches ont été comparées à celles disponibles dans les banques de données. L'arbre phylogénétique construit, montre que les bi
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Baudin, Florence. "Etude de la conformation de deux arn ribosomiques : l'arn 16s d'escherichia coli et l'arn 5s de xenopus laevis : relations structure-fonction." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1989. http://www.theses.fr/1989STR13172.

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Abstract:
Ce memoire porte sur l'etude de la conformation de deux arn ribosomiques, l'arn 16s d'escherichia coli et l'arn 5s d'oocyte de xenopus laevis. Une etude systematique a ete realisee sur toute la molecule d'arn 16s isolee, dans la sous-unite 30s et dans le ribosome 70s a l'aide de sondes de structure enzymatiques et chimiques. Ces etudes permettent de definir les regions en contact avec les proteines, celles situees a l'interface des deux sous-unites et celles subissant des ajustements conformationnels. L'etude d'une region possedant un role dans le decodage de l'arnm, en presence de l'arnt fixe
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Orso, Stéphanie. "Analyse phylogénétique moléculaire des genres Nitrobacter (protéobactéries) et Frankia (thallobactéries) et étude de l'instabilité des embranchements dans les arbres phylogénétiques des thallobactéries." Lyon 1, 1997. http://www.theses.fr/1997LYO10032.

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Jagoueix, Sandrine. "Liberobacter africanum et liberobacter asiaticum, les bactéries associées à la maladie du greening des agrumes : caractérisation, phylogénie et détection par l'étude de l'ADN ribosomique 16S." Bordeaux 2, 1995. http://www.theses.fr/1995BOR28363.

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Goregues, Christelle. "Analyses physiologiques, biochimiques et génétiques pour appréhender la diveristé fonctionnelle des bactéries dénitrifiantes en milieu marin côtier." Aix-Marseille 2, 2004. http://www.theses.fr/2004AIX22106.

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Abstract:
La dénitrification est un processus respiratoire réalisé par des bactéries hétérotrophes anaérobies facultatives dites dénitrifiantes. En absence d'oxygène, des oxydes d'azotes (nitrate ou nitrite) sont alors utilisés comme accepteurs terminaux d'électrons alternatifs et sont réduits en composés gazeux (oxyde nitrique, oxyde nitreux et azote moléculaire). La dénitrification est un processus clef du cycle de l'azote dans les sédiments marins puisqu'elle diminue la quantité d'azote disponible pour la production primaire par diffusion dans l'atmosphère. Cependant, dans zones cotières qui reçoiven
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Moulin, Lionel. "Etude moléculaire de la diversité symbiotique des rhizobia : de l'analyse du gène nodA à l'identification de rhizobia au sein des bé̀ta-protéobactéries." Lyon 1, 2002. http://www.theses.fr/2002LYO10179.

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Abstract:
Les rhizobia sont des bactéries du sol capables d'établir une symbiose fixatrice d'azote avec des légumineuses. Le séquençage et l'analyse phylogénétique du gène de nodulation nodA d'une collection de rhizobia taxonomiquement et symbiotiquement divers a permis d'établir l'existence d'une étroite corrélation entre la séquence protéique NodA et la présence de trois substitutions particulières des FNs. Nous avons développé une méthode de prédiction de la présence de ces substitutions basée sur l'analyse phylogénétique et statistique de la séquence NodA. La caractérisation du gène nodA parmi des s
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Markowicz, Yves. "Structure et organisation du génome plastidial de l'algue brune Pylaiella littoralis (L.) Kjellm étude de gènes codant pour l'ARN ribosomique 16S /." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37615724q.

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Pericard, Pierre. "Algorithmes pour la reconstruction de séquences de marqueurs conservés dans des données de métagénomique." Thesis, Lille 1, 2017. http://www.theses.fr/2017LIL10084/document.

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Abstract:
Les progrès récents en termes de séquençage d’ADN permettent maintenant d’accéder au matériel génétique de communautés microbiennes extraites directement d’échantillons environnementaux naturels. Ce nouveau domaine de recherche, appelé métagénomique, a de nombreuses applications en santé, en agro-alimentaire, en écologie, par exemple. Analyser de tels échantillons demande toutefois de développer de nouvelles méthodes bio-informatiques pour déterminer la composition taxonomique de la communauté étudiée. L’identification précise des organismes présents est en effet une étape essentielle à la com
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Kabir, Md Mahbubul. "Les populations d'azospirillum dans les sols tropicaux : dénombrement, identification et diversitéPplication aux sols de rizières du Bangladesh." Lyon 1, 1996. http://www.theses.fr/1996LYO10029.

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Abstract:
L'utilisation efficace d'une population bacterienne comme inoculum depend de l'adaptation de la souche introduite a une nouvelle niche ecologique occupee par les bacteries indigenes. La niche ecologique de populations indigenes d'azospirillum a ete abordee dans plusieurs modeles differant par la nature et l'organisation de la matrice solide (argileuse, sableuse, argilo-sableuse). On a montre une concentration importante (x300) d'azospirillum dans les macrostructures stabilisees par le systeme racinaire actif de digitaria. La mise au point de marqueurs genetiques comme outil d'appreciation de l
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La, riviere Marie. "Les communautés bactériennes d'un holobionte méditerranéen, la gorgone rouge Paramuricea clavata : diversité, stabilité et spécificité." Thesis, Aix-Marseille, 2013. http://www.theses.fr/2013AIXM4057.

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Abstract:
Les communautés du coralligène dominées par des gorgonaires ont été sévèrement affectées par des évènements de mortalités massives liés au réchauffement de la Méditerranée. Pour évaluer la contribution des bactéries associées à l’holobionte Paramuricea clavata à son fonctionnement et sa santé, il est apparu primordial de caractériser le compartiment microbien naturel de ce gorgonaire tempéré.Dans ce contexte, l’objectif général de cette thèse était de décrire les interactions existant entre la gorgone rouge P. clavata et ses bactéries associées en Méditerranée nord-occidentale. Les analyses en
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Togo, Amadou Hamidou. "Evaluation du microbiote du lait maternel." Thesis, Aix-Marseille, 2019. http://theses.univ-amu.fr.lama.univ-amu.fr/190704_TOGO_875gep269amks488i891qf_TH.pdf.

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Abstract:
Malgré les progrès technologiques dans l'exploration du microbiote humain et les nombreuses études menées sur le microbiote du tube digestif, le microbiote du colostrum et du lait maternel demeure un microbiote négligé. Cependant, les résultats de quelques études ont montré une grande diversité de bactéries commensales qui constituent le microbiote du lait maternel qui pourrait coloniser l'intestin du nourrisson. Selon les auteurs de ces études, le colostrum et le lait maternel pourraient être impliqués dans la transmission verticale des phénotypes associés au microbiote intestinal maternel. D
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Mougel, Marylène. "Mecanisme de reconnaissance arn-proteine dans le risobome d'escherichia coli : etude des sites de fixation des proteines s8 et s15 sur l'arn 16s." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1987. http://www.theses.fr/1987STR13198.

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Renvoisé, Aurélie. "Applicabilité de la PCR "universelle" 16S comme outil d'identification et de détection bactérienne en laboratoire hospitalier de bactériologie." Thesis, Aix-Marseille, 2012. http://www.theses.fr/2012AIXM5016/document.

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Abstract:
La PCR universelle ciblant le gène codant pour l'ARNr 16S à l'aide d'amorces universelles, a d'abord été développée pour des études phylogénétiques. En effet ce gène est universellement retrouvé chez les bactéries et sa fonction est conservée. Ainsi, il peut servir d'« horloge moléculaire » pour mesurer les distances phylogénétiques entre les différentes espèces bactériennes. La PCR universelle a ensuite été appliquée en microbiologie clinique dans deux domaines distincts : la détection et l'identification bactériennes. Dans ce travail, nous avons évalué l'applicabilité de la PCR « universelle
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Auer, Lucas. "Vers la maîtrise des communautés microbiennes lignocellulolytiques : impact de la source d'inoculum et du prétraitement du substrat sur le fonctionnement des communautés." Thesis, Toulouse, INSA, 2016. http://www.theses.fr/2016ISAT0050/document.

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Abstract:
La lignocellulose est le composant principal des parois végétales et donc le biopolymère végétal le plus abondant sur Terre. Sa transformation en molécules d’intérêt industriel est donc une voie prometteuse pour diminuer la consommation de ressources fossiles. Au sein de la plateforme des carboxylates, la transformation de la lignocellulose repose sur l’utilisation de communautés bactériennes. Mais s’ils sont augmentés par des approches de prétraitement du substrat, les rendements sont encore faibles. Afin de les améliorer, nous avons ici testé les capacités de dégradations de communautés micr
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Al, Masalma Mouhamad. "Molecular and cultural analysis of the bacterial flora associated with brain abscesses." Thesis, Aix-Marseille 2, 2011. http://www.theses.fr/2011AIX20663/document.

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Abstract:
Les abcès cérébraux sont des infections potentiellement mortelles, entraînant souvent des séquelles graves. La prise en charge médicale en reste empirique en raison d’un manque de connaissance approfondie des microorganismes responsables de cette condition. Dans la plupart des laboratoires microbiologiques, le diagnostic d’abcès cérébral est basé sur la culture du pus recueilli chirurgicalement. Malheureusement, cette procédure a de nombreuses limites et ne permet l’identification que d’une petite partie de la population microbienne en cause. L’amplification par PCR et le séquençage du gène co
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Wang, Yang. "La diversité bactérienne dans les sols de surface de San Rafael Swell (Utah, USA) et le Desert de Maine (USA)." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015SACLS120/document.

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Abstract:
Les zones arides couvrent environ un tiers de la surface terrestre de la planète. Des études visant à comprendre la dispersion microbienne dans les déserts ont été réalisées. En effet, les communautés microbiennes du sable des déserts peuvent jouer un rôle important dans la stabilité des sols. Le pyroséquençage pour les ARNr 16S à partir de l’ADN total extrait des sols des échantillons de sable peut donner des renseignements clés sur la structure des communautés bactériennes qui les composent. Dans cette étude, la diversité et la structure des communautés bactériennes de la surface du sol des
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Murillo, Nathalia. "Le microbiote du DEMODEX associé à la rosacée." Thesis, Aix-Marseille, 2013. http://www.theses.fr/2013AIXM5092/document.

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Abstract:
Demodex est un genre d’acariens dont deux espèces sont connues pour coloniser la peau de l’homme : Demodex folliculorum et Demodex brevis. Leur implication dans le développement de la rosacée reste controversée. Cette maladie est caractérisée par une inflammation chronique de la peau et est définie en quatre sous-type majeurs : la rosacée érythémato-télangiectasique (ETR), la rosacée papulopustuleuse (PPR), la rosacée phymateuse et la rosacée oculaire. Certains pensent que le rôle des acariens est principalement d’exacerber une inflammation déjà enclenchée. Toutefois, l’isolation par culture d
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Gebelin, Virginie. "Etude des différents niveaux de régulation du stress oxydatif chez Hevea brasiliensis : implication des miRNAs." Thesis, Montpellier 2, 2012. http://www.theses.fr/2012MON20024/document.

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Abstract:
Hevea brasiliensis est cultivé pour le caoutchouc naturel contenu dans le latex. Une exploitation intensive combinée aux stress environnementaux affectent la production de latex. L'encoche sèche ou Tapping Panel Dryness (TPD) est déclenché par un désordre physiologique complexe au sein des laticifères. Il est responsable d'une perte annuelle de production de 10 à 40% en fonction de l'âge de la plantation et des clones d'hévéa utilisés Le stress oxydatif, point de départ de la maladie, affecte l'écoulement, par la coagulation in situ des particules du caoutchouc. Chez les plantes, la réponse ad
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Mbogning, Fonkou Maxime Descartes. "Exploration du microbiote respiratoire humain." Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0693/document.

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Abstract:
L'établissement d'un répertoire exhaustif ainsi que son élargissement constituent les deux objectifs principaux de ce travail. Nous avons d'abord établi la toute première liste de bactéries identifiées par culture des voies respiratoires au travers de la littérature scientifique. Nous répertorions ici 756 espèces, ce qui représente 27,23% de l'ensemble des bactéries isolées chez l'homme lorsque comparé au répertoire établi récemment par Bilen et al. Parmi ces bactéries, 514 avaient déjà été isolées au moins une fois dans les poumons. Plus de la moitié (i.e., 65,5%) des bactéries isolées pour l
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Michaud, Caroline. "Dynamique des symbioses mutualistes hôtes-microbiotes : mode et efficacité de transmission des symbiotes dans les populations du termite xylophage Reticulitermes grassei." Thesis, Tours, 2019. http://www.theses.fr/2019TOUR4027.

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Abstract:
Les symbioses mutualistes sont ubiquistes et jouent un rôle majeur dans le fonctionnement des écosystèmes. Chez les insectes, il est souvent décrit que la spécificité et la stabilité évolutive de ces symbioses mutualistes est due à une transmission verticale stricte des symbiotes des parents à la descendance. Pour tester le rôle de la transmission verticale dans le maintien évolutif des symbioses mutualiste, son exclusivité et son efficacité doivent être étudiées à une échelle évolutive (d’une lignée hôte à une autre) ainsi qu’à une échelle écologique (d’une génération à la suivante). Ce proje
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Benamar, Samia. "Utilisation d'outils bio-informatiques pour l'étude de pathogènes émergents." Thesis, Aix-Marseille, 2017. http://www.theses.fr/2017AIXM0197.

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Abstract:
La recherche en bactériologie et virologie est à la fois de nature cognitive et appliquée. Elle consiste à fédérer et mettre en place une capacité de recherche multidisciplinaire et pouvoir l'intégrer sur un champ très vaste de microorganismes et de maladies. Les nouvelles avancées conceptuelles et technologiques dans le domaine de la génomique, notamment les avancées dans les techniques à haut débit (séquençage, PCR...) permettent actuellement d’avoir rapidement des génomes bactériens et viraux entiers, ou seulement sur quelques gènes d’une grande population. Les progrès dans ce domaine perme
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Khelaifia, Saber. "Détection et culture des archaea associées aux muqueuses intestinale et orale humaines." Thesis, Aix-Marseille, 2013. http://www.theses.fr/2013AIXM5029.

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Abstract:
Les archaea constituent l'un des quatre domaines connus du vivant. Contrairement à ce que leur nom laisse supposer, elles ont colonisé tous les écosystèmes et les microbiotes de certains hôtes dont l'Homme. Chez l'homme, certaines espèces d'archaea méthanogènes ont été associées aux muqueuses orale, intestinale et vaginale. Ces archaea méthanogènes sont des procaryotes anaérobies stricts et leurs conditions de culture restent fastidieuses et très mal connues. Quatre archaea methanogènes seulement ont été isolées à partir de prélèvements humains y compris dans le microbiote digestif Methanobrev
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Bélanger, François. "Étude des interactions fonctionnelles de la tétraboucle 900 de l'ARN ribosomique 16S dans le ribosome bactérien." Thèse, 2005. http://hdl.handle.net/1866/15202.

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