Dissertations / Theses: 'Arthropodes – Teneur en protéines'

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Baringou, Stéphane. "Diversité et fonctionnalité de « nouveaux types » de Heat Shock Protein-70 kDa chez les arthropodes." Thesis, Le Mans, 2016. http://www.theses.fr/2016LEMA1009/document.

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Abstract:

Les Heat Shock Proteins 70 kDa (HSP70) sont considérées comme les membres les plus conservés de la superfamille des HSP. Ces protéines chaperonnes sont indispensables à tous les organismes vivants par leur implication dans de nombreuses voies de signalisation cellulaire et dans la gestion de multiples facteurs de stress environnementaux (température, pollution, salinité, radiation). Largement utilisée en écologie comme biomarqueur de stress, la famille des HSP70 constitue également une cible thérapeutique privilégiée dans les recherches contre les maladies neurodégénératives et les cancers. Dans le cytosol, une large variété de HSP70 a été observée chez quelques espèces modèles (drosophile, levure, humain). Néanmoins, cette diversité reste méconnue au sein du phylum Arthropoda, et plus particulièrement chez les décapodes. La diversité des HSP70 cytosoliques a été étudiée à partir de 735 séquences issues 198 espèces d’arthropodes, dont 142 séquences de décapodes obtenues durant ces travaux. Les analyses de phylogénie moléculaire ont permis la description d’au moins trois groupes distincts de HSP70 cytosoliques chez les arthropodes, comprenant chacun plusieurs subdivisions méconnues jusqu’à présent. Une nouvelle classification et un modèle évolutif des HSP70 cytosoliques sont proposés pour le phylum Arthropoda. Les profils d’expression observés dans ces groupes remettent en cause la catégorisation des HSP70 selon leurs caractère constitutif (HSC70) ou inductible (HSP70). Les spécificités structurales géniques et protéiques observées pour chacune de ces formes reflèteraient différentes capacités d’interaction des HSP70 avec leurs co-chaperons et autres cofacteurs
The 70 kDa Heat Shock Proteins (HSP70) are considered the most conserved members of the HSP family. These molecular chaperones are primordial to living beings, because of their implications in many cellular pathways and the management of multiple environmental stress factors (e. g., temperature, pollutants, salinity, radiations). Widely used in ecology as a biomarker of environmental stress, the HSP70 family is also a privileged therapeutic target for neurodegenerative diseases and cancers. In the cytosol, a wide variety of HSP70 is observed in few model species (Drosophila, human, yeast). Nevertheless, the diversity of cytosolic HSP70 remains unclear amongst the Arthropoda phylum, especially within decapods. The diversity studies of cytosolic HSP70 were based on 735 sequences from 198 arthropod species, including 142 sequences from decapods obtained during this work. Molecular phylogeny analyses revealed at least three distinct groups of HSP70 within arthropods, comprising several unrecognised subdivisions. This study proposes a new classification and an evolutionary model of cytosolic HSP70 amongst the Arthropoda phylum. The expression profiles observed in each group lead to reconsider the HSP70 classification according to their constitutive (HSC70) or inducible (HSP70) features. The observed structural specificities of genes and proteins, relative to each form of HSP70, will probably have to be linked to distinct interactions with cochaperones or other co-factors

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Pichon, S. "Système de sécrétion de type IV et protéines à domaines ankyrines dans les interactions Wolbachia-arthropodes." Phd thesis, Université de Poitiers, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00551985.

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Abstract:

Wolbachia est une bactérie Gram(-) intracellulaire modifiant la reproduction de nombreux arthropodes. Chez l'isopode Armadillidium vulgare, la souche wVulC entraîne la féminisation des mâles. Nous avons caractérisé deux opérons vir s'exprimant dans tous les tissus hôtes et codant un système de sécrétion de type IV (T4SS) pouvant permettre d'exporter des effecteurs bactériens vers le cytoplasme de l'hôte. La comparaison des séquences et de l'organisation des gènes de 37 souches de Wolbachia a révélé la forte conservation des deux opérons vir suggérant l'importance du T4SS dans la biologie de la bactérie. Nous avons également identifié, dans le génome en cours de séquençage de wVulC, 66 gènes codant des protéines à domaines ankyrines. Ces motifs forment des sites d'interactions protéine-protéine chez les eucaryotes et sont supposés être impliqués chez Wolbachia dans l'interaction avec des protéines de l'hôte. Nous avons montré qu'une des trois copies du gène pk2 de wVulC, n'est exprimée que chez des souches féminisantes mais chez aucune des 3 souches induisant l'incompatibilité cytoplasmique chez les isopodes terrestres. Ce produit du gène pk2 pourrait être impliqué dans la féminisation de l'hôte. Toutefois, nous avons réalisé des tests d'interaction par double-hybride en levures et par la méthode CRAfT (Cre-recombinase Reporter Assay for Translocation) entre les protéines du T4SS et cinq protéines à domaines ankyrines dont Pk2 afin de savoir si ces dernières étaient sécrétées par ce système. Les résultats montrent qu'aucun des cinq produits de gènes ank testés n'est sécrété par la bactérie mais se révèlent encourageants pour identifier les effecteurs de Wolbachia.

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Pichon, Samuel. "Système de sécrétion de type IV et protéines à domaines ankyrines dans les interactions Wolbachia-arthropodes." Poitiers, 2009. http://theses.edel.univ-poitiers.fr/theses/2009/Pichon-Samuel/2009-Pichon-Samuel-These.pdf.

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Abstract:

Wolbachia est une bactérie Gram(-) intracellulaire modifiant la reproduction de nombreux arthropodes. Chez l'isopode Armadillidium vulgare, la souche wVulC entraîne la féminisation des mâles. Nous avons caractérisé deux opérons vir s’exprimant dans tous les tissus hôtes et codant un système de sécrétion de type IV (T4SS) pouvant permettre d'exporter des effecteurs bactériens vers le cytoplasme de l'hôte. La comparaison des séquences et de l'organisation des gènes de 37 souches de Wolbachia a révélé la forte conservation des deux opérons vir suggérant l'importance du T4SS dans la biologie de la bactérie. Nous avons également identifié, dans le génome en cours de séquençage de wVulC, 66 gènes codant des protéines à domaines ankyrines. Ces motifs forment des sites d'interactions protéine-protéine chez les eucaryotes et sont supposés être impliqués chez Wolbachia dans l'interaction avec des protéines de l’hôte. Nous avons montré qu'une des trois copies du gène pk2 de wVulC, n'est exprimée que chez des souches féminisantes mais chez aucune des 3 souches induisant l’incompatibilité cytoplasmique chez les isopodes terrestres. Ce produit du gène pk2 pourrait être impliqué dans la féminisation de l’hôte. Toutefois, nous avons réalisé des tests d'interaction par double-hybride en levures et par la méthode CRAfT (Crerecombinase Reporter Assay for Translocation) entre les protéines du T4SS et cinq protéines à domaines ankyrines dont Pk2 afin de savoir si ces dernières étaient sécrétées par ce système. Les résultats montrent qu'aucun des cinq produits de gènes ank testés n'est sécrété par la bactérie mais se révèlent encourageants pour identifier les effecteurs de Wolbachia
Wolbachia are intracellular Gram(-) bacteria that are reproductive manipulators of many arthropods. In the isopod Armadillidium vulgare, the Wolbachia wVulC strain induces male feminization. Here, we characterized two vir operons which are expressed in all host tissues and which encode a type IV secretion system (T4SS) used to translocate bacterial effectors into host cytoplasm. Gene organization and sequence comparison in 37 Wolbachia strains highlighted the high conservation of both vir operons and their importance for the biology of the bacteria. We also identified in the on-going assembly of the wVulC genome, 66 ankyrin domain-encoding genes. Ankyrin motifs are known to mediate protein-protein interactions in eukaryotic organisms and thus are suggested to mediate in Wolbachia the interaction with host molecules. We showed that one of the three copies of the wVulC pk2 gene is only expressed in feminizing strains but not in the three strains inducing cytoplasmic incompatibility in terrestrial isopods. The associated Pk2 protein could be involved in male feminization. We thus tested the interaction between three T4SS proteins and five ankyrins (including Pk2) via the yeast twohybrid and CRAfT (Cre-recombinase Reporter Assay for Translocation) methods. None of the five ankyrin proteins were revealed to be secreted by the wVulC strain. Nevertheless, this promising approach may enable us to identify Wolbachia effectors

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Dimitrova, Tatiana. "Emulsions stabilisées par les protéines : forces colloi͏̈dales, rhéologie et crémage." Bordeaux 1, 2000. http://www.theses.fr/2000BOR12223.

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Abstract:

Cette thèse est vouée à établir les corrélations entre les propriétés spécifiques des films protéiques et les propriétés macroscopiques des émulsions stabilisées par les protéines. Nous avons simulé le comportement des films isolés et parallèlement nous avons effectué des mesures de propriétés macroscopiques telles que le module élastique de cisaillement et la cinétique de crémage des émulsions. Les forces colloi͏̈dales répulsives qui s'exercent entre des gouttes d'émulsion ont été explorées à l'aide de deux techniques complémentaires (magnétique chaining technique et une variante de la cellule de Mysels). L'élasticité des émulsions a été mesurée et nous mettons en évidence que le module élastique de cisaillement est anormalement élevé pour certains types de protéines, (en particulier l'albumine de sérum bovin). Cette étude ouvre de nouvelles perspectives quant à l'étude des propriétés rhéologiques des émulsions à base de protéines. Il apparaît que les forces répulsives mesurées dans des conditions d'approche quasi statique des surfaces ne sont pas toujours pertinentes pour comprendre le comportement d'une émulsion. Elle met en particulier en évidence une corrélation forte entre le module élastique de cisaillement et le module élastique de dilatation des surfaces recouvertes par des protéines. Finalement, nous étudions la relation entre la floculation des gouttes d'émulsion et le phénomène de crémage et nous établissons un modèle théorique permettant de quantifier le degrés de floculation et la cinétique de crémage en l'absence de diffusion brownienne.

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Suc, Sylvie. "Amélioration génétique de la teneur en protéines du soja (Glycine max L. Merr. )." Toulouse, INPT, 1993. http://www.theses.fr/1993INPT027A.

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Abstract:

La teneur en proteines de la graine de soja (glycine max. L. Merr. ) constitue un element essentiel de la qualite des produits issus du soja et destines a l'alimentation humaine ou animale. Son amelioration se heurte a la tres forte liaison negative entre sa valeur et le rendement. L'objectif de ce travail consiste a analyser les voies physiologiques et genetiques permettant d'envisager une amelioration parallele de la teneur en proteines et du rendement. Cinq geniteurs, representatifs d'une certaine variabilite pour ces deux parametres, ont ete croises selon un plan diallele complet. L'etude physiologique a mis en evidence des differences genotypiques au niveau du metabolisme azote (fixation symbiotique, remobilisation tardive des molecules azotees), et du metabolisme carbone (photosynthese nette maximale et fonctionnement photochimique), avec des comportements particuliers montrant la possibilite pour la plante d'accumuler par des voies multiples, des teneurs elevees en proteines dans sa graine. Il n'existe pas d'effet heterosis pour la teneur en proteines chez les hybrides f1. L'etude diallele a montre la preponderance des effets additifs pour la teneur en proteines et le rendement dans le cadre de ce materiel vegetal, les parametres de fonctionnement de la plante presentant des determinismes genetiques plus complexes. Des combinaisons genetiques differentes peuvent permettre d'atteindre des teneurs en proteines elevees, les geniteurs x514-95 et provar presentant des proportions differentes de genes dominants et recessifs impliques dans l'expression de la teneur en proteines. Ces resultats confirment l'existence de plusieurs voies physiologiques permettant d'aboutir a de fortes teneurs en proteines. Le controle genetique different de ces voies de synthese permet d'envisager des recombinaisons favorables pouvant etre a la base d'une amelioration de la richesse en proteines de la graine avec une prise en compte parallele de la productivite

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Piva, Guillaume. "Maîtrise de la qualité biochimique de la graine pour deux légumineuses : soja, haricot : impact des conditions de culture et des choix de génotypiques." Toulouse, INPT, 2001. http://www.theses.fr/2001INPT005A.

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Abstract:

La qualité des produits végétaux constitue une attente majeure de la société. Dans le cas des légumineuses étudiées, soja et haricot, les producteurs et l'ensemble de la filière jusqu'à la commercialisation portent un intérêt marqué à l'amélioration de la composition des graines pour leur utilisation dans l'industrie alimentaire ou non alimentaire. Notre démarche s'inscrit dans ce contexte et vise à caractériser les moyens d'élaboration de la qualité recherchée et de production satisfaisante par le choix du génotype et de l'adaptation des conduites de culture. La première partie de ce travail met en évidence les variations de composition de la graine sous l'effet des conditions agro-climatiques (date de semis, irrigation, choix génotypique et année culturale). Pour les deux légumineuses, la disponibilité hydrique pendant les phases de formation et de grossissement des graines joue un rôle déterminant sur la concentration en protéines et en Oligosaccharide de la famille du Raffinose (RFO). L'effet de décalage de semis et l'effet de l'année culturale sont significativement plus marqués pour le soja que pour le haricot. La seconde partie décrit l'évolution des équilibres entre les constituants de la graine dans les différentes conditions. Elle met en évidence la compétition entre les accumulations de protéines et d'huile (soja) entre protéines et RFO (soja, haricot), entre les différents acides gras (soja). La troisième partie souligne les relations entre la composition et les indicateurs de la production (rendement / Poids Moyen d'une Graine ou PMG). Pour les génotypes améliorés étudiés, les relations rendement / teneur en protéines et rendement / teneur en RFO sont généralement peu significatives; ceci suggère une relative indépendance entre les processus de formation des organes fructifères et ceux des synthèses des composés. En conclusion, ce travail dégage des éléments de connaissance sur l'élaboration de la composition des graines de soja et de haricot récoltées dans des conditions de culture diversifiées. Il propose quelques voies pour maîtriser l'orientation des synthèses des constituants recherchés par les utilisateurs et les consommateurs sans préjudice appréciable pour la production.

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Lacaze, Xavier. "Interprétation des interactions génotype x environnement et étude des Déterminants génétiques de l'adaptation : exemple de la teneur en protéines du grain de blé dur (Triticum turgidum)." École nationale supérieure agronomique (Montpellier), 2005. http://www.theses.fr/2005ENSA0019.

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Abstract:

Un objectif majeur en amélioration des plantes est de développer des variétés dont les performances agronomiques seront optimales dans les différentes conditions environnementales de l'aire de culture. Pour cela, le développement d'une gamme de génotypes différenciés mais adaptés spécifiquement à l'une ou l'autre des contraintes environnementales, est une voie possible. Une telle stratégie nécessite l'exploration et l'interprétation du terme statistique d'interaction génotype x environnement (GxE). L'objectif de cette thèse est d'interpréter en termes d'adaptation les variations de performances génotypiques atypiques entre environnements et de préciser le déterminisme génétique du comportement génotypique différentiel à ces contraintes. Le caractère étudié, est la teneur en protéines du grain de blé dur. 288 lignées recombinantes correspondant à 6 populations issues d'un demi-diallèle entre 4 variétés ont été expérimentées dans 11 environnements différents et génotypées. La typologie environnementale a été réalisée à l'aide de différentes caractéristiques liées au pédoclimat, à l'itinéraire technique, ainsi qu'à la croissance et au développement des génotypes parentaux. Parmi ces covariables environnementales, celles correspondant à la réserve en eau du sol, à la demande climatique en eau de la plante au cours de la phase " dernière feuille- floraison " ainsi que les stress thermique de fin de cycle se sont avérées les plus pertinentes pour expliquer l'effet principal environnement (> 40 %) alors que l'état azoté de la plante, les indices de stress thermiques et l'évapotranspiration de la phase reproductrice du cycle expliquait 16 à 20 % du terme d'interaction GxE. Cette caractérisation environnementale nous a permis d'interpréter les fortes interactions entre Aptitude Générale à la Combinaison individuelle (principale composante de la valeur en croisement) et milieu en termes de réponse adaptative. A partir d'une carte génétique non saturée, 3 QTL 'Protéines' (2 sur le chromosome 2A et 1 sur le 3B) ont été identifiés. Ils expliquaient entre 7. 7 et 12. 4 % de la variation phénotypique globale. Par régression factorielle, des interactions QTLxE significatives ont été également mises en évidence pour 5 régions chromosomiques : 3 d'entre elles correspondent aux QTL précédents (2A et 3B) corroborant l'hypothèse " sensibilité allélique " pour expliquer l'origine de la plasticité alors que les 2 autres étant situés sur les chromosomes 6B et 7B. Les fortes températures au cours de la période post-floraison, ainsi que la demande d'évapotranspiration au cours de la phase préfloraison expliquant une part conséquente de ces interactions, les allèles favorables pour une gamme de conditions donnée ont été identifiés. Ces données suggèrent qu'à terme une sélection assistée par marqueurs pourrait être mise en œuvre pour la réalisation de génotypes adaptés à des conditions stressantes spécifiques.

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Hernandez-Sanchez, Fabiola. "Contribution à l'étude du séchage de la spiruline et de son impact sur la qualité biochimique du produit sec." Lyon 1, 2006. http://www.theses.fr/2006LYO10313.

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Abstract:

La spiruline est un aliment à haute valeur nutritive qui contient 55 à 65% de protéines. La qualité du produit sec dépend des procédés de séchage utilisés. Ainsi, dans cette thèse, une méthode de transformation est caractérisée, le séchage convectif, et l’influence de plusieurs procédés de séchage sur sa qualité biochimique. Un photobioréacteur de type air-lift d’un volume utile de 40 L a été construit afin d’obtenir une production importante de biomasse fraîche pour les expériences de séchage. Il a été possible de caractériser le bioréacteur par sa productivité et par le taux de croissance des cultures. La contraction de la biomasse lors du séchage convectif a été caractérisée pour des formes initiales en cylindre et en plaques minces. La vitesse de séchage a été corrigée en prenant en compte la contraction. Cette méthode a permis d’observer une première phase à vitesse de séchage constante pour des cylindres de différents diamètres initiaux. La Courbe Caractéristique de Séchage (CCS) et les valeurs du coefficient de diffusion moyen de l’eau ont été déterminés pour les cylindres. La teneur en protéines et des sucres totaux de la biomasse fraîche de spiruline a été analysée pour différents types de séchage : convectif, infrarouge, par atomisation et par lyophilisation. Le meilleur procédé pour la récupération des protéines et des sucres totaux a été la lyophilisation
Spirulina is a high nutritive foodstuff which contains 55% to 65% of proteins. The quality of the dry product depends on drying methods. Thus, in this work, the convective drying method was investigated as concern process parameters influence and the influence of several drying methods on the biochemical quality of dried product. An air-lift photobioreactor of 40 L volume was built in order to obtain an important production of fresh biomass for the drying experiments. It was possible characterize its productivity and the spirulina cultures growth rate. The shrinkage behaviour of the biomass with convective drying was characterized for the initial samples shaped as cylinders and thin layers. The drying rate was corrected by taking of account the shrinkage. This revealed the existence of a constant drying rate periods for cylinders of various initial diameters. The Characteristic Drying Curve (CDC) and the values of the water mean diffusion coefficient were estimated for the cylinders. The proteins and total sugars contents on dried samples were analyzed after different drying methods by convective, infra-red, atomization, and freeze-drying. The best drying method for the recovery of proteins and total sugars contents was freeze-drying

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Nebbak, Amira. "Développement expérimental et application sur terrain d'outils innovants pour l'identification des arthropodes." Thesis, Aix-Marseille, 2017. http://www.theses.fr/2017AIXM0605.

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Abstract:

Les arthropodes hématophages tels que les moustiques, les tiques et les puces ont une importance significative en santé publique en raison de leur capacité à transmettre des maladies majeures aux humains et aux animaux. La lutte anti-vectorielle et la surveillance épidémiologique des vecteurs sont essentielles dans la stratégie de lutte contre ces maladies. Cette dernière n'est réussie que grâce à une identification correcte et précise des vecteurs. Ainsi dans ce travail nous avons mis au point les protocoles pour la préparation des échantillons pour l'identification des moustiques adultes et leur stades aquatiques ainsi que des tiques et des puces par MALDI-TOF MS. Cet outil s'est déjà distingué comme étant fiable pour l'identification des arthropodes. La deuxième partie de notre travail a consisté en l'application de ces protocoles sur des larves de moustiques collectées sur terrain durant une enquête entomologique menée dans la ville de Marseille. Lors de cette étude, la pertinence et la fiabilité du MALDI-TOF MS pour l'identification des larves de moustiques collectées sur terrain a été vérifiée. Enfin, nous avons réalisé l'inventaire des communautés virales de trois espèces de moustiques collectées à Marseille par métagénomique, qui a révélé la présence de nombreux nouveaux virus. L'ensemble des résultats présentés dans cette thèse souligne que l'utilisation d'outils innovants tels que le MALDI-TOF MS et la métagénomique pour étudier les vecteurs et les agents qu'ils portent est une stratégie prometteuse qui contribuera dans la connaissance des cycles de transmission zoonotique et des risques potentiels d'émergence des maladies vectorielles en population humaine
Hematophagous arthropods such as mosquitoes, ticks, and fleas are of significant importance in public health because of their ability to transmit major diseases to humans and animals. Vector control and epidemiological vector surveillance are essential in the strategy of combating vector-borne diseases. The latter is successful only by a correct and precise identification of the vectors. Thus in this work, we have developed and improved the protocols of samples preparation for the identification of adult mosquitoes and their aquatic stages, ticks, and fleas by MALDI-TOF MS. This tool has been already distinguished as being reliable for the arthropods identification. The second part of our work consisted in the application of these protocols on mosquito larvae collected in the field during an entomological investigation carried out in the city of Marseille. In this study, the relevance and reliability of MALDI-TOF MS for the identification of mosquito larvae collected in the field were verified. Finally, we carried out the inventory of the viral communities of three mosquito species collected in Marseille by metagenomics, which revealed the presence of numerous new viruses. All the results presented in this thesis emphasize that the use of innovative tools such as MALDI-TOF MS and metagenomics to study vectors and the agents they carry is a promising strategy that will contribute to the knowledge of zoonotic transmission cycles and the potential risks of the emergence of vector-borne diseases in human populations

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Kossinova, Olga. "Insights into the selenocysteine incorporation mechanism in mammals." Strasbourg, 2011. http://www.theses.fr/2011STRA6221.

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Abstract:

L'acide aminé sélénocystéine est codé par UGA qui agit généralement comme un codon stop. Une machinerie spécialisée est utilisée pour incorporer cet acide aminé dans les sélénoprotéines qui implique une structure en tige-boucle, appelée SECIS, et des protéines. L'une d’elles est SBP2, SECIS Binding Protein 2. Pour mieux comprendre ce mécanisme et identifier de nouveaux partenaires de l'élément SECIS, deux stratégies ont été développées. 1/ identification des contacts de l’élément SECIS avec le ribosome par des pontages covalents. Dans ce but, j’ai construit des ARN messagers modèles, l’élément SECIS contenant des agents pontants. Après action des UV, il s’avère que SBP2 est liée au SECIS dans les complexes 48S et 80S de pré-translocation. Lorsque la formation de la liaison peptidique est bloquée par l’anisomycine, l’élément SECIS n’est plus lié à SBP2 mais à des protéines ribosomiques, SBP2 étant présente dans le complexe. L'interprétation est la suivante. Pendant la transpeptidation, SBP2 est associée au ribosome mais ensuite SBP2 le quitte et se lie au SECIS à l'étape de pré-translocation. 2/ Le site de liaison de SBP2 sur la sous-unité 60S n’avait pas encore été localisé. Les complexes SBP2-40S, 60S-SBP2 et 80S-SBP2 ont été soumis aux diépoxybutane ou 2-iminothiolane. Nous avons montré que SBP2 se lie à la sous-unité 60S uniquement et que l'ARNr 28S contribue davantage au site de liaison que les protéines ribosomiques. Pour identifier cette région de l’ARNr 28S, les radicaux hydroxyles ont été employés et nous avons montré que SBP2 réside sur le côté solvant de la sous-unité 60S, à proximité du site A
The amino acid selenocysteine is encoded by a UGA triplet which acts generally as a stop codon. A specialized machinery is used to incorporate this amino acid into selenoproteins, involving a specific stem-loop, termed SelenoCysteine Insertion Sequence (SECIS), and some protein factors. One of those is the SECIS Binding Protein 2 (SBP2), which is necessary for ribosome recognition of the UGA as the Sec codon. Using synthetic selenocysteine mRNAs and translational inhibitors, several steps of mRNA translation were analyzed. The data obtained allowed us to propose the following mechanism for selenocysteine insertion : during the transpeptidation step of elongation, SBP2 is bound to the ribosome; however, after transpeptidation, SBP2 leaves the ribosome and binds the SECIS in the pre-translocation step. We showed earlier that SBP2 binds specifically to the purified human 60S but not to the 40S ribosome subunits but the actual location was unknown. The SBP2•40S, SBP2•60S and SBP2•80S complexes were thus studied using crosslinking reagents. SBP2 did not crosslink to the 40S subunit in either the 40S•SBP2 or 80S•SBP2 complexes, correlating with the binding data. However, SBP2 crosslinks to the 60S subunit in either the free state or in the 80S ribosome. I next showed that the 28S rRNA contributes more to the crosslink than ribosomal proteins. This led us to use hydroxyl radical footprinting to study the molecular environment of SBP2 on the ribosome. According to the probing data, the binding of SBP2 to the human 60S subunit protects 2 helices in expansion segment 7 of the 28S rRNA. I proposed that the SBP2 binding site is located in the vicinity of the L7/L12 stalk

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Khaldi, Marwa. "Étude du lien entre la physico-chimie de dérivés laitiers et leur aptitude à l’encrassement lors du traitement thermomécanique en échangeur de chaleur." Thesis, Lille 1, 2016. http://www.theses.fr/2016LIL10032/document.

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Abstract:

Ce travail de thèse est une contribution à la compréhension de l’encrassement des échangeurs de chaleur à plaques (ECP) lors du traitement thermique de solutions de protéines du lactosérum. Ce travail vise principalement à établir les liens existants entre la composition des différentes solutions de lactosérum (teneurs en β-lactoglobuline (β-lg) et en calcium), leurs comportements en dénaturation et leurs aptitudes à encrasser les surfaces chaudes de l’ECP. Cette étude a montré l’influence de la teneur en calcium et du ratio molaire calcium/protéine sur les mécanismes de dénaturation thermique de la β-lg, les distributions des masses de dépôt protéique, la dynamique de formation de dépôt et la structure des premières couches de dépôt en surface. Par ailleurs, la détermination des constantes cinétiques de dénaturation chaude de la β-lg et la connaissance de l’histoire thermique du produit ont permis de simuler les profils de concentrations des différentes espèces de β-lg (native, dépliée et agrégée) le long de l’ECP et d’étudier la corrélation entre la masse de dépôt sec et les quantités de β-lg dénaturées dans l’ECP. Ainsi, cette simulation a pu mettre en évidence le faible rôle des agrégats dans les mécanismes d’encrassement et à la fois l’influence de l’espèce dépliée et de la teneur en calcium dans la distribution du dépôt protéique. Enfin, une corrélation originale entre la distribution de la masse de dépôt sec dans chaque canal de l’ECP et les paramètres cinétiques de dénaturation a été établie pour chaque solution protéique modèle étudiée, montrant ainsi l’impérieuse nécessité des approches de génie de la réaction chimique pour prédire l’encrassement protéique
This Ph.D. work is a contribution for understanding the fouling in plate heat exchangers (PHE) during the heat treatment of whey protein solutions. This work aims at establishing the relationship between the composition of the different whey protein solutions (β-lactoglobulin content (β-lg) and calcium), their denaturation behaviour and their ability to foul the hot surfaces of the PHE.This study showed the strong impact of the calcium content and the calcium/protein molar ratio on the β-lg thermal denaturation mechanisms, the distributions of the deposit fouling, deposit formation dynamics and the structure of the first deposit layers.The determination of the β-lg denaturation kinetic constants and the knowledge of the thermal profile allowed to simulate the concentration profiles of the different β-lg species (native, unfolded and aggregated) along the PHE and to study the correlation between the dry deposit mass of and the amount of denatured β-lg in the PHE. This simulation highlighted the negligible role of the aggregates in the fouling mechanisms and both the influence of the unfolded species and the calcium content on the distribution of protein deposition. Finally, a new correlation between the distribution of dry deposit masses in each channel of the PHE and the denaturation kinetic parameters was determined for each studied protein solution, showing thus that chemical reaction engineering approaches are requested for predicting proteinaceous fouling

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Moras, Benjamin. "Fractionnement de protéines végétales pour le développement d'ingrédients alimentaires infantiles hypoallergéniques et à teneur réduite en phytoestrogènes." Thesis, Toulouse, INPT, 2015. http://www.theses.fr/2015INPT0070.

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Abstract:

Les travaux de recherche présentés dans ce manuscrit ont pour but de développer des procédés industriels pour la production de quatre ingrédients alimentaires infantiles ayant des propriétés hypoallergéniques et des teneurs réduites en phytoestrogènes. Les propriétés nutritionnelles des protéines de riz et de soja en font des sources intéressantes. Néanmoins, plusieurs problématiques liées aux caractéristiques des produits apparaissent aujourd’hui : la présence de phytoestrogènes (isoflavones) dans les isolats protéiques de soja ; la difficulté à solubiliser et isoler les protéines de riz et la forte allergénicité des protéines dans le cas du soja. Ces travaux présentent l’étude du fractionnement des protéines de soja et de riz pour le développement : d’isolat protéique à teneur réduite en isoflavones ; isolat protéique de riz ayant une teneur supérieure à 90% de protéines ; hydrolysats protéiques de soja et de riz dont le profil de poids moléculaire est maitrisé et potentiellement hypoallergénique. Afin d’y parvenir, la réduction de la taille des protéines par des processus enzymatiques puis le contrôle de leur poids moléculaire ont dû être étudiés. Concernant l’élimination des phytoestrogènes (isoflavones), deux méthodes ont permis d’atteindre de hauts rendements d’extractions. En premier lieu, l’étude de l’extraction par éthanol via une optimisation à petite échelle, suivie d’une mise à l’échelle industrielle ont permis de développer un premier produit à teneur résiduelle en isoflavones inférieure à 50 μg/g de produit sec représentant une réduction de près de 98% de la teneur en isoflavones. Le second procédé étudié a été la rétention des isoflavones sur résine d’adsorption à partir d’un hydrolysat protéique de soja préalablement mis au point, et ceci, par l’utilisation de solution aqueuse sans étape préalable d’extraction. Ce procédé a fait l’objet d’une mise à l’échelle industrielle et d’une étude du comportement chromatographique des isoflavones. L’extraction des isoflavones par eau subcritique et CO2 supercritique est aussi présentée dans cette thèse. Elle a permis de mettre en évidence l’influence de la polarité des différents composés et de la teneur en protéines des produits de soja utilisés. Ces travaux de thèse ont aussi permis de définir un nouveau procédé pour la production d’isolat protéique de riz par l’intermédiaire d’enzymes de types cellulolytiques et amylases, à partir de coproduits issus de l’industrie du sirop de glucose. Des études sur des matières moins transformées telles que le son de riz et la farine ont aussi été étudiées pour la concentration des protéines. L’étude de l’hydrolyse des protéines de soja et de riz a été possible par le suivi de différents indicateurs tels que le pH, la solubilité des protéines, le degré d’hydrolyse, le profil de poids moléculaire par électrophorèse et par chromatographie d’exclusion stérique. Ces procédés ont permis la production de quatre nouveaux ingrédients pouvant être testés pour leurs caractéristiques hypoallergéniques avant une éventuelle production industrielle
The objectives of these works were to develop industrial processes for the production of four infant food ingredients with hypoallergenic properties and reduced levels of phytoestrogens. For this purpose, the nutritional properties of the rice and soy protein are promising. However, due to the presence of phytoestrogens (isoflavones) the consumption of soy protein isolates is a big concern for infant food security because the high exposure to these compounds, known to be endocrine disruptors. Consequently, it was first intended to develop a soy protein isolate with reduced content of isoflavones below 50 μg/g following the recommendations of French and European health authorities. Rice protein isolates are either non-existent on the market, or extremely rare. Therefore, the development of rice protein isolate with a minimum content of 90 % protein was another objective. For the sensitive population, such as infants, the aim of this work was also to develop soy and rice protein hydrolysates conferring hypoallergenic properties. To achieve this goal, the reduction of the size of proteins and the control of their molecular weight was studied. Two methods were used to achieve high extractions yields. A study of ethanol extraction ranging from small-scale optimization to industrial scale was used for a final product with a residual content in isoflavones below 50 μg/g. The second method was to retain isoflavones on adsorption resin from a soy protein hydrolysate. This was possible without preliminary extraction step by solvent. This method was also tested in the industrial scale. The chromatographic behavior of different isoflavones was also studied. The extraction of isoflavones with subcritical water and supercritical CO2 is also presented in this thesis even though these methods were not retained. These pressurized extractions showed the influence of the polarity of isoflavones and the protein content of soy products onto the isoflavone extraction. These works also identified a novel process for the production of rice protein isolate by the hydrolysis of polysaccharides with cellulolytic enzymes and amylases from concentrated protein byproducts from the glucose syrup industry. Studies on less processed materials such as rice bran and flour were also studied for protein isolation. The study of the hydrolysis by proteases of soy and rice proteins were monitored by various indicators such as pH, protein solubility, the degree of hydrolysis, the molecular weight profile by electrophoresis, and size exclusion chromatography. These processes are enabled for the production of four new ingredients that will be tested for their hypoallergenic characteristics before a large scale production

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Boutouili, Ghania. "Variations de la composition protéique et minérale du lait de vache : incidences sur les intéractions minéraux-protéines et la valeur technologique." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1991. http://www.theses.fr/1991INPLA003.

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Schweizer, Martin. "Fractionnement et identification de petits peptides issus de l'hydrolyse enzymatique des protéines de colza." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2002. http://www.theses.fr/2002INPL016N.

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Abstract:

Ce travail consiste en une étude préliminaire sur la production des petits peptides à partir des protéines de colza et se partage en trois parties: l'hydrolyse enzymatique des protéines de colza, les séparation et caractérisation des hydrolysats et, enfin, l'identification de la composition de petits peptides. L'intérêt de l'hydrolyse enzymatique réside dans la diversité des applications potentielles (cosmétique, pharmaceutique et alimentaire) des peptides obtenus. La première partie décrit l'obtention et la caractérisation de deux substrats protéiques (tourteau et concentrat) pour l'hydrolyse enzymatique. L'influence de quelques paramètres majeurs sur l'hydrolyse enzymatique comme la nature du substrat et de l'enzyme utilisée (Alcalase® 2. 4L, PTN® 3. 0S ou Orientase® 90N) est abordée. L'Alcalase® 2. 4L et l'Orientase® 90N conduisent à de très bons rendements en petits peptides. Dans une seconde partie, le fractionnement des hydrolysats par deux techniques complémentaires de séparation par la taille des molécules est abordé: l'ultrafiltration et la chromatographie liquide d'exclusion de taille à basse pression. Une cascade de séparations (ultrafiltration et C. L. -E. T. ) a conduit à l'obtention de fractions ciblées de petits peptides composés de deux à six acides aminés. Enfin, une nouvelle approche pour l'identification des petits peptides, utilisant le couplage C. L. H. P. /S. M. , est décrite. Le noyau de cette démarche est de combiner deux informations, la masse du peptide isolé et son temps de rétention en fonction de son caractère hydrophobe, afin de déterminer la composition des peptides en acides aminés. Cette méthode présente un intérêt pour la maîtrise des différentes étapes d'obtention de petits peptides et la recherche propriétés biologiques potentielles.

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Campanacci, Valérie. "Etudes fonctionnelles et structurales de protéines d'insectes impliquées dans le transport de phéromones ou de chémo-effecteurs." Aix-Marseille 1, 2001. http://www.theses.fr/2001AIX11023.

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Abstract:

Chez les insectes, deux familles de protéines interviennent dans la communication chimique : les "pheromone binding proteins" (PBPs) et les "chemosensory proteins" (CSPs). Les PBPs sont présentes à haute concentration dans la lymphe sensillaire des soies répondant aux phéromones. Leur rôle est de transporter les phéromones hydrophobes à travers la lymphe aqueuse jusqu'aux récepteurs olfactifs. Les CSPs ont été identifiées dans les organes dédiés au goût ou à l'olfaction. Leur rôle est encore inconnu, mais il a été supposé une fonction de transporteur de composés hydrophobes. Nous avons exprimé plusieurs PBPs et une CSP de Lépidoptères comme protéines recombinantes dans "E. Coli". Après leur caractérisation biochimique, nous avons étudié la spécificité de liaison des PBPs de "Mamestra brassicae" (MbraPBP1), "Antheraea polyphemus" (ApoIPBP1), "Bombyx mori" (BmorPBP) et un héxamutant de MbraPBP1 dont la cavité interne mime celle de BmorPBP,à l'aide d'une méthode spectroscopique utilisant une sonde fluroescente, le 1-aminoanthracène (AMA). MbraPBP1 et ApoIPBP1 sont capables de lier l'AMA, et par compétition ce dernier peut être chassé de la cavité par différentes phéromones. Ces résultats remettent en cause le dogme selon lequel les PBPs son spécifiques d'une phéromone donnée. Pour la première fois, nous avons utilisé des composés bromés en spectroscopie de fluorescence pour étudier la liaison d'une CSP et nous avons montré sa capacité à lier des composés aliphatiques (alcools ou acides gras) mais aucun composé cyclique. La liaison implique les deux tryptophanes de la protéine. Ces résultats ont été appuyés par la résolution par RMN hétéronucléaire de la structure tridimensionnelle de la CSP. La protéine est de forme triangulaire et composée de six hélices. Une des faces de la protéine possède un sillon dans lequel peut être modélisé un alcool à chaîne linéaire. Le rôle des CSPs pourrait alors être l'extraction d'acides gras des membranes et leur transport vers leur cible spécifique.

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Colin-Schoellen, Odile. "Taux protéique et qualité fromagère des laits : maîtrise des facteurs de production." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1990. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/INPL_T_1990_COLIN_O.pdf.

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Abstract:

Deux types d'intervention, niveau d'apports énergétiques et tri des animaux ont été réalisés en élevages pour améliorer le TP et caractériser la qualité fromagère et l'aptitude à la transformation des laits de troupeau. L’amélioration des apports énergétiques a augmenté le TP (0,2 à 0,9 g/kg) ainsi que le taux de caséines (1 essai) et le rendement fromager. L'élimination de 10% des multipares aux plus faibles taux améliore le TP du troupeau (0,2 g/kg). Des régressions linéaires multiples ont permis de chiffrer le poids des principaux facteurs zootechniques influant sur le TP. La qualité fromagère peut être caractérisée à partir des paramètres de composition du lait. La proportion des caséines dans les protéines totales ne varie pas en fonction du TP mais le niveau de TP joue sur les pourcentages des différentes caséines et protéines du lactosérum (PLS). Par ailleurs, à l'intérieur d'un troupeau, toute variation du TP est accompagnée d'une modification de la part prise par les caséines et les PLS. Les meilleures prédictions du rendement frais sont établies à partir du K20 et du TP à J+1 et J+3, à partir du TP et du TB à J+10. A l'inverse, le rendement sec est bien expliqué par le TP et le TB à J+1 et J+3 et par le K20 à J+10. Le TP et le TB ne suffisent pas à expliquer les variations de rendement des laits de fin d'hiver. D'autres paramètres de composition physicochimique interviennent. La teneur en M. S. Des fromages varie fortement

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Le, Floc'h Nathalie. "Régulation nutritionnelle de l'oxydation de la thréonine chez le porc." Aix-Marseille 3, 1995. http://www.theses.fr/1996AIX30028.

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Abstract:

La threonine est un acide amine essentiel chez le porc. Dans cette espece, l'oxydation irreversible de la threonine s'effectue principalement par la voie de la l-threonine deshydrogenase (tdg) et conduit a la formation de glycine. In vivo, l'oxydation de la threonine par la voie de la tdg peut etre estimee grace a la perfusion simultanee de threonine et de glycine marquees. Par ailleurs, chez des porcs en finition, l'addition d'acide glutamique a un regime deficitaire en threonine se traduit a la fois par une amelioration des performances de croissance et une induction de l'activite de la tdg dans le foie. L'objectif de ce travail est d'etudier, au niveau de l'animal entier, les effets, d'une part, de la teneur en threonine alimentaire et, d'autre part, de l'addition d'acide glutamique sur l'oxydation de cet acide amine. Nos resultats ont mis en evidence une modification de la compartimentation tissulaire de l'oxydation de la threonine en glycine en fonction de la teneur en threonine de l'aliment et plus particulierement, l'existence d'une oxydation extra-hepatique. Le pancreas serait le tissu principalement implique dans la degradation extra-hepatique de la threonine par la voie de la tdg mais les contributions respectives des deux tissus dependraient de l'apport alimentaire. Dans des conditions d'apport limite en threonine, l'oxydation extra-hepatique prendrait proportionnellement plus d'importance et le transport de la threonine dans le foie apparaitrait comme le principal facteur limitant de l'oxydation totale in vivo. L'addition d'acide glutamique a un regime carence en threonine n'affecte pas de maniere mesurable ni l'oxydation mesurees in vivo ni les activites enzymatiques mesurees in vitro mais une epargne de threonine alimentaire par une reduction de son entree dans le foie n'est pas exclue. De plus, ceci semble s'accompagner d'une reduction du flux de threonine liberee par la proteolyse

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Gavazzi-April, Camile. "Effet du mode opératoire sur l'efficience d'un procédé d'ultrafiltration pour la fabrication d'un concentré à haute teneur en protéines." Master's thesis, Université Laval, 2018. http://hdl.handle.net/20.500.11794/29956.

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Abstract:

Les concentrés laitiers à haute teneur en protéines (plus de 80% de protéines sur base sèche) sont générés par ultrafiltration (UF) et diafiltration (DF). Des membranes polymériques spiralées en polyéthersulfone de seuil de coupure de 10 kDa sont généralement utilisées en industrie laitière afin de maximiser la rétention des protéines. La baisse des flux de perméation et l’encrassement membranaire sont les principales limites à l’efficience du procédé. Ces inconvénients pourraient être limités par une sélection optimale du seuil de coupure membranaire et de la séquence UF-DF. Ce projet avait pour objectif de caractériser les performances (flux de perméation, résistance hydraulique, composition et consommation en énergie et en eau) de procédés d’UF-DF en fonction du seuil de coupure (10 et 50 kDa) et de la séquence UF-DF (3,5X – 2 diavolumes (DV) et 5X – 0,8DV). Les séquences UF-DF ont été réalisées avec du lait écrémé et pasteurisé au moyen d’un système de filtration pilote opéré à 50°C et à une pression transmembranaire (PTM) constante de 465 kPa. Pour une même séquence UF-DF, il a été démontré que le seuil de coupure n’avait pas d’impact (p>0.05) sur les flux de perméation, qui étaient toutefois significativement plus élevés (p<0.05) à l’étape de DF pour la séquence 3,5X – 2DV. Les données expérimentales de ces essais ont été utilisées dans le cadre d'une simulation pour la production d’un concentré de protéines laitières dans une usine laitière modèle traitant 1500 m3 de lait en 20 heures. Cet exercice a révélé que, malgré la forte baisse du flux de perméation (89% pour la séquence 5X – 0,8DV contre 58% pour la séquence 3,5X – 2DV) survenant lors d'une concentration du lait à haute teneur en solides, limiter l'étape de DF demeurerait bénéfique du point de vue de la consommation en énergie et en eau. Les données générées par ce projet permettront d’outiller les industriels pour leurs choix technologiques quant au niveau de concentration à cibler en lien avec une démarche d’amélioration de l’éco-efficience.
High-milk protein concentrates (over 80% total protein on a dry weight basis) are typically produced by ultrafiltration (UF) with constant-volume diafiltration (DF). Polymeric spiral-wound UF membranes with a molecular weight cut-off (MWCO) of 10 kDa are mostly used at commercial scale in order to maximize protein retention. Flux decline and membrane fouling during UF have been studied extensively and the selection of an optimal UF-DF sequence is expected to have a considerable impact on both the process efficiency and the generated volumes of by-products. The objective of this work was to characterize performances of UF-DF process in terms of permeate flux decline, fouling resistance, energy and water consumption and retentate composition as a function of MWCO (10 and 50 kDa) and UF-DF sequence (3.5X – 2 diavolumes (DV) and 5X – 0.8DV). UF-DF experiments were performed on pasteurized skim milk by means of a pilot-scale filtration system operated at 50°C and under a constant transmembrane pressure (TMP) of 465 kPa. Results showed that MWCO had no impact (p>0.05) on permeate flux for a same UF-DF sequence. However, permeate flux values were significantly higher during DF for the 3.5X – 2DV sequence whatever MWCO (p<0.05). Experimental values were used as part of a simulation for the production of high milk protein concentrates in a model dairy plant processing 1500 m3 of skim milk in 20 hours. This work revealed that despite the severe total flux decline occurring during high solid concentration of milk (89% for the 5X – 0.8DV sequence vs. 58% for the 3.5X – 2DV sequence), reducing the DF step could still be of great interest in terms of energy and water consumption. The results generated by this project will benefit dairy processors producing high-milk protein concentrates with regards with their technological choices in a sustainable development perspective.
Diafiltration

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Lecourieux, David. "Analyse fonctionnelle des variations de la concentration en calcium libre dans le cytoplasme et le noyau des cellules de tabac en réponse à des éliciteurs des réactions de défense : identification de protéines kinases cibles." Dijon, 2001. http://www.theses.fr/2001DIJOS062.

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Abstract:

Au cours de ce travail, nous avons étudié le rôle du Ca2+ dans le mode d'action de la cryptogéine, un éliciteur des réactions de défense chez le tabac. Des suspensions cellulaires de tabac exprimant l'aequorine ont été utilisées pour analyser les variations de la concentration cytosolique en Ca2+ libre ([Ca2+]cyt) en réponse à la cryptogéine ou à des éliciteurs oligosaccharidiques. La signature [Ca2+]cyt induite par la cryptogéine se caractérise par un premier pic transitoire de [Ca2+]cyt suivi d'une seconde élévation prolongée de [Ca2+]cyt vraisemblablement reliée à la dépolymérisation des microtubules et à l'activation de la mort cellulaire. Le peroxyde d'hydrogène produit suite à l'activation Ca2+-dépendante de la NADPH-oxydase de la membrane plasmique, participe aux variations de [Ca2+]cyt provoquées par la cryptogéine ou les OGs. Par ailleurs, l'utilisation de cellules de tabac exprimant l'aequorine dans le noyau nous a permis de montrer que la cryptogéine induit une élévation de [Ca2+]nuc intense, contrairement aux éliciteurs oligosaccharidiques. La recherche de cibles moléculaires du Ca2+ nous a permis d'identifier 3 protéines kinases (40, 60 et 72 kDa). L'activité des PKs de 60 et 72 kDa est Ca2+-dépendantes et se maintient pendant 2 h. La PK de 72 kDa pourrait correspondre à une protéine de tabac homologue de la CCaMK identifiée chez le mai͏̈s.

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Vinot-Renaud, Catherine. "Contribution à la connaissance et à la valorisation d'hydrolysats industriels de protéines de poissons." Compiègne, 1989. http://www.theses.fr/1989COMPD208.

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Abstract:

Des hydrolysats enzymatiques de protéines de poissons sont produits industriellement par la CTPP (Boulogne sur Mer) à partir des déchets engendrés par l'industrie locale de la pêche. Ils présentent des propriétés intéressantes notamment en alimentation animale comme substituts des protéines laitières ou en microbiologie comme stimulateurs des cultures. Toutefois aucune molécule active n'a pu jusqu'alors être identifiée. Le travail effectué a eu pour but d'approfondir notre connaissance de ces hydrolysats industriels afin d'en améliorer la valorisation. Il présente dans un premier temps une synthèse bibliographique des propriétés mises en évidence, un bref exposé du procédé d'obtention des hydrolysats ainsi que les résultats de la détermination de leur composition. La démarche chromatographique ayant permis la mise au point d'un fractionnement des hydrolysats par échange d'ions est ensuite décrite. Enfin la composition des fractions obtenues est déterminéee et la mise en place de deux tests d'activités est réalisée, d'une part sur des cul¬tures bactériennes, d'autre part sur des cultures de lymphocytes. Ainsi nous avons pu mettre en évidence des propriétés immunostimulantes remarquables pour certaines fractions, ouvrant ainsi la voie à une obtention potentielle de molécules à haute valeur ajoutée à partir d'hydrolysats de protéines de poissons.

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Kuate, Kamga Blaise. "Caractérisation et formulation de nouveaux ingrédients alimentaires à base de complexes de protéines végétales et de polysaccharides." Master's thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/37917.

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Abstract:

L’objectif de ce travail était de caractériser les propriétés physicochimiques de complexes formés de protéines végétales et de fibres alimentaires. Neuf complexes ont été produits à partir de trois isolats de protéines végétales (deux isolats de soya et un isolat de pois) et de deux fibres (maïs et betterave) dans les ratios protéine – polysaccharide (P-PS) 1-1, 2-1 et 4-1 par ajout graduel d’acide chlorhydrique jusqu’à pH 4. La taille, la charge, les capacités d’absorption d’eau et d’huile de ces complexes ont été évaluées dans le but de développer de nouveaux ingrédients avec des fonctionnalités désirées. La formation de complexes a permis de créer un effet de synergie permettant d’augmenter la capacité d’absorption d’eau des nouveaux ingrédients qui était plus élevée pour les complexes à base de protéines de soya et de la fibre de betterave (20 et 26% pour Soya1-Bet et Soya2-Bet contre 9 et 23% pour Soya1-Maïs et Soya2-Maïs). L’augmentation de l’absorption d’eau était en générale plus faible que l’absorption d’huile avec une différence mesurée de plus de 35%. La synergie élevée entre les P-PS des complexes était corrélée à une faible teneur en protéines et à des tailles plus petites. La formation des complexes apparaît comme un nouveau moyen permettant de moduler les fonctionnalités des protéines et des fibres en support à l’enrichissement des aliments.
The objective of this work was to characterize the physicochemical properties of complexes formed of plant proteins and dietary fibers. Nine complexes were produced from three plant protein isolates (two soy isolates and one pea isolate) and two fibers (corn and beet) with protein-polysaccharide (P-PS) ratios 1-1, 2-1 and 4-1 by gradual addition of hydrochloric acid up to a pH of 4. The size, the charge and water and oil absorption capacities of these complexes were evaluated with the aim of developing new ingredients with desired functionalities. The formation of complexes allowed to create a synergistic effect on the water absorption capacity of these new ingredients, which was found to be higher for the complexes based on soybeans and beet fiber (20 and 26% for Soya1-Bet and Soya2-Bet against 9 and 23% for Soya1-Corn and Soya2-Corn). The increase in water absorption was generally lower than oil absorption by more than 35%. The great synergy between the P-PS complex was correlated with a low protein content and smaller complex sizes. The formation of complexes appears as an interesting way to modulate the functionality of proteins and fibers to improve the level of fortification of foods.

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Bedie, Kouadio Gerard. "Microencapsulation de composés nutraceutiques dans des complexes protéines-polysaccharides." Doctoral thesis, Université Laval, 2008. http://hdl.handle.net/20.500.11794/19823.

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Dulau, Laurent. "Recherche sur les protéines responsables de la casse protéique des vins blancs secs : approche biochimique et génétique." Bordeaux 2, 1990. http://www.theses.fr/1990BOR20110.

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Abstract:

Les protéines du mout sont une cause bien connue d'instabilité des vins blancs. En l'absence de traitement spécifique de stabilisation protéique, ces protéines sont partiellement précipitées entrainant l'apparition de troubles caractéristiques. L'étude en chromatofocalisation de ces protéines, obtenues à partir d'un mout de sauvignon, montre que trois fractions de phi 6,17 ; 5,65 et supérieur à 9 sont responsables de l'apparition de troubles. Ces protéines, cause de la casse protéique ont des poids moléculaires compris entre 18 000 et 30 000 da. La teneur de ces protéines dans les mouts varie en fonction du cépage, du degré de maturité de la vendange et des modalités préfermentaires. La bentonite constitue depuis plus de 50 ans le seul traitement efficace de stabilisation des vins blancs. Cependant, à cause de certains progrès technologiques les doses de bentonite utilisées sont en augmentation. Aux niveaux d'utilisation actuels, les qualités organoleptiques des vins sont affectées par ce traitement. Des solutions de substitutions ont été étudiées. Le potentiel protéolytique de Saccharomyces cerevisiae par le biais de la protéase a permet de diminuer la teneur protéique des mouts de Sauvignon. Des approches génétiques faisant appel a différentes techniques de mutagenèse n'ont pas permis d'obtenir une souche œnologique a caractère protéolytique. Grace à une approche biochimique, une activité protéasique acide, dégradant les protéines d'un mout de Sauvignon, a été obtenue a partir d'extraits extracellulaires de Trichoderma harzianum. Au stade actuel de la purification et dans nos conditions d'analyse, il n'est pas possible de traiter efficacement les vins par ce procédé. Enfin, il a été possible de purifier des procyanidines de rafles précipitant une proportion importante des protéines d'un vin de Sauvignon. Cette action tannante réduit fortement la teneur en protéines des vins blancs.

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Bon, Nina. "Etude du rôle des protéines PiT1/Slc20a1 et PiT2/Slc20a2 dans la détection du phosphate extracellulaire dans le squelette des mammifères." Thesis, Nantes, 2017. http://www.theses.fr/2017NANT1034/document.

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Abstract:

Le phosphate (Pi) est vital pour de nombreux processus physiologiques. Un déficit prolongé en Pi provoque une hypophosphatémie conduisant à une déminéralisation osseuse, alors qu'une hyperphosphatémie entraîne des calcifications vasculaires morbides. Un contrôle adéquat de la concentration sérique de Pi est ainsi essentiel à la qualité et l'espérance de vie. La première étape de ce contrôle est la capacité de la cellule ou de l'organisme à détecter les changements des concentrations extracellulaires de Pi. Contrairement aux levures et aux bactéries, chez lesquelles les transporteurs de Pi membranaires jouent un rôle clé dans cette détection, le mécanisme reste inconnu chez les mammifères. Dans ce travail, nous avons émis l’hypothèse que les cotransporteurs Na-Pi de haute affinité, PiT1/Slc20a1 et PiT2/Slc20a2, étaient impliqués dans ce mécanisme. Dans un premier temps, nous avons montré que la délétion de PiT1 ou de PiT2 dans des ostéoblastes et des chondrocytes in vitro empêchait l’activation de la voie MAPK/ERK1-2 par le Pi. En utilisant une approche de BRET, nous avons ensuite montré que PiT1 et PiT2 pouvaient former des hétéro-dimères modulés par les variations de Pi extracellulaire, sans lien avec le transport de Pi au travers de la membrane. En utilisant des souris invalidées pour le gène PiT2, nous avons montré que PiT2 était indispensable à la régulation par le Pi de la sécrétion de FGF23, l’hormone principalement responsable du maintien de l’homéostasie du Pi. En conclusion, nos données représentent un argument fort en faveur d’un rôle clé des protéines PiTs dans la détection du Pi chez les mammifères, indépendamment de leur fonction de transport
Phosphate (Pi) is a vital ion involved in numerous biological processes. Prolonged deficiency of Pi results in hypophosphatemia leading to serious consequences, including impaired bone mineralization. On the other hand, hyperphosphatemia can lead to life-threatening situations such as vascular calcifications. Controlling serum Pi concentration is therefore critical to life quality and expectancy. The first necessary step of this control is the ability to detect changes in extracellular Pi levels, which implies the existence of a Pi-sensing mechanism that would inform the body or the individual cell. Contrary to yeasts and bacteria for which Pi membrane transporters play a key role in Pi signaling, the underlying mechanism in mammals remains unknown. In this work, we hypothesized that the high affinity Na-Pi cotransporters PiT1/Slc20a1 and PiT2/Slc20a2 could be involved in Pi-sensing in mammals. As a first step, we showed in vitro that deleting either PiT1 or PiT2 blunted the Pi-dependent activation of MAPK/ERK1-2 both in osteoblasts and chondrocytes. This suggested that both PiTs were necessary to Pi signaling. Using a BRET approach, we then demonstrated that PiT1 and PiT2 could form a hetero-dimeric complex that was modulated by variations of extracellular Pi, but not by Pi transport across the membrane. Using PiT2 knockout mice, we showed that PiT2 was also necessary for the Pi-dependent regulation of FGF23 secretion, the main hormone responsible for Pi homeostasis. Taken together, our data propose that the PiT proteins could play a pivotal role in the Pi-sensing mechanism in mammals, which may be uncoupled from their Pi transport function

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Alary, Rémi. "Isolement, caractérisation et importance technologique de deux gluténines de faible poids moléculaire chez le blé dur." Montpellier 2, 1988. http://www.theses.fr/1988MON20010.

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Abstract:

La teneur en sh plus s-s (accessibles et totaux) a ete determinee par une methode amperometrique dans les differentes fractions proteiques (albumines-globulines, gliadines et glutenines) du ble dur. Isolement d'une fraction (dsg proteines: durum-wheat de gunrich glutenin fraction) contenant 183 et 130 micromoles de s-h plus s-s/g de proteines pour les varietes mondur et kidur respectivement. Cette fraction riche est composee de deux proteines dsg-1 (masse moleculaire 14,7 kda) et dsg-2 (masse moleculaire de 15,4 kda). Correlation a ete etablie entre la teneur en sh plus s-s des proteines dsg et l'etat de surface des pates cuites (r=0,858), et la fermete du gluten d'autre part (1=0,630). On peut donc supposer que ces deux proteines jouent un role fonctionnel dans la qualite culinaire des pates alimentaires

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Chbab, Najat. "Réplication et morphogenèse du virus MDV-1 : caractérisation d'une protéine de tégument produit du gène UL17 essentiel à la réplication virale." Tours, 2006. http://www.theses.fr/2006TOUR4004.

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Abstract:

L'étude a porté sur la protéine pUL17 du virus MDV (Marek's Disease Virus), homologue à la protéine de capside et de tégument d'HSV-1. La stratégie adoptée repose sur la délétion et l'étiquetage du gène UL17 par recombinaison homologue en utilisant un chromosome bactérien artificiel (BAC) contenant le génome de la souche pathogène RB-1b du virus MDV (BAC-RB-1b). La délétion du gène UL17 ou la mutagenèse de l'ATG sont létales. La restauration du gène permet au virus de retrouver sa capacité de réplication. Lors de l'infection virale, la phosphoprotéine pUL17 (82 kDa) est localisée au noyau, pour partie associée à la membrane nucléaire. Cette localisation nucléaire n'est pas une propriété intrinsèque de la protéine et implique un facteur viral. La co-localisation partielle de pUL17 avec la protéine majeure de capside VP5 et l'influence qu'elle exerce sur la relocalisation de la protéine de tégument pUL14 semblent confirmer l'intervention de pUL17 dans la constitution du tégument viral
This work aimed at studying the Marek's Disease virus (MDV) UL17 protein which is homologous to the capsid and tegument protein of HSV-1 virus. For this purpose, we used a bacterial artificial chromosome (BAC) of the highly pathogenic MDV strain RB-1b to generate mutant viruses in which the UL17 gene was either deleted or tagged with the HA peptide. The results showed that MDV pUL17 is a phosphoprotein (82 kDa) essential for viral replication. During the infection, pUL17 localizes in the nuclear compartment. This nuclear localization is not an intrinsic property of pUL17 and implies a viral factor. The co-localization of pUL17 with the major capsid protein VP5 and its influence on the cellular distribution of the tegument protein pUL14 favour the hypothesis that pUL17 participates in early tegumentation

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Ducruet, Julien. "Etude des protéines du vin rouge : Mécanismes d'action d'enzymes de macération sur le raisin rouge." Bordeaux 2, 2000. http://www.theses.fr/2000BOR20742.

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Abstract:

L’étude des interactions physico-chimiques entre tanins et protéines a permis de mettre au point une technique novatrice d’isolement, de purification et d’analyse des protéines du vin rouge. Nous avons démontré que des vins riches en tanins contenaient des protéines et que certaines d’entre elles étaient N-glycosylées. Nous proposons également une méthode d’identification de ces protéines par " digestion tryptique dans le gel " et analyse des peptides d’hydrolyse par spectrométrie de masse. Quantitativement, cette méthode et l’utilisation d'un étalon interne (BSA) permettent d’estimer, avec une bonne précision (4 à 10%), la concentration individuelle et globale (20 mg/L) des protéines présentes dans le vin. Ces travaux constituent une étape capitale dans la compréhension des interactions colloïdales impliquées entre les différents constituants du vin rouge. Indépendamment, les mécanismes d’action et le rôle des enzymes de macération sur le raisin et le vin rouge sont étudiés. Des observations en microscopie optique et électronique montrent que les enzymes agissent de l’intérieur vers l’extérieur de la baie et que cette action dépend de la dose ajoutée. Les enzymes ne détruisent pas complètement les parois des cellules de la pellicule. Elles génèrent une diminution de densité au niveau de la lamelle moyenne et forment de multiples perforations dans la paroi qui sont autant de passages permettant la diffusion sélective des tanins de la pellicule dans le vin. Les enzymes de macération permettent d’obtenir des vins plus concentrés en composés pelliculaires, avec des tanins peu réactifs, très polymérisés et fortement combinés aux anthocyanes. Les enzymes de macération n’agissent que sur la pellicule et ne facilitent pas l’extraction des tanins de pépins. Ces différents résultats conduisent à une meilleure maîtrise et une utilisation raisonnée des enzymes de macération.

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Bogard, Matthieu. "Analyse génétique et écophysiologique de l'écart à la relation teneur en protéines - rendement en grains chez le blé tendre (Triticum aestivum L.)." Phd thesis, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00679581.

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Abstract:

Le rendement en grains (Rdt) et la teneur en protéines (%Prot) sont deux cibles majeures dans les programmes de sélection variétale chez le blé car ces caractères contribuent à la valeur économique de cette culture. Malheureusement, leur amélioration simultanée est empêchée par la relation négative %Prot-Rdt. Il a été montré que l'écart à cette relation ("Grain Protein Deviation", GPD) est déterminé en partie génétiquement et serait utile pour modifier cette relation négative mais ses bases biologiques restent mal comprises à ce jour. Nous avons montré que le GPD est principalement relié à la variabilité génétique pour l'absorption d'azote post-floraison (ABSN) dans les conditions agro-climatiques du Nord-Ouest de l'Europe. Nous proposons que la variabilité génétique pour l'accès à l'azote du sol (architecture et fonctionnement racinaire) ou pour la régulation de ABSN par le statut azoté (transport et assimilation de l'azote) pourrait expliquer le GPD. Etant donné que le retardement de la sénescence durant la période post-floraison peut résulter en une augmentation de ABSN, nous avons analysé les déterminants génétique des relations entre durée de sénescence des feuilles après floraison et Rdt ou %Prot, observées au niveau phénotypique, en utilisant des données acquises sur une population de cartographie de blé cultivée au sein d'un large réseau expérimental. Une association positive entre durée de sénescence des feuilles après floraison et %Prot ou Rdt a été observée selon les environnements étudiés. Nous faisons l'hypothèse que l'impact d'un retardement de la sénescence des feuilles après floraison pourrait être modulé selon la disponibilité en azote durant cette période, ce qui conduirait à modifier la relation %Prot-Rdt selon les environnements étudiés. Enfin, des données obtenues sur trois populations de cartographie cultivées dans un large réseau expérimental ont permis de suggérer, après méta-analyse de QTL, des régions génomiques potentiellement utiles en sélection pour améliorer la %Prot sans diminuer le Rdt. Ceci a permis de mettre en avant des régions situées sur les chromosomes 2A et 3B. En particulier, la région située sur le 2A pourrait être reliée à la présence d'un gène codant pour une glutamine synthétase chloroplastique qui a été associée à la variabilité génétique pour %Prot chez le blé tendre dans une étude antérieure.

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Bouvier, Nathalie. "Le soja : impact en nutrition et médecine humaine." Paris 5, 1998. http://www.theses.fr/1998PA05P145.

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Fontaine, Albin. "Diversité et Immunogénicité des protéines salivaires de Culicidae." Thesis, Aix-Marseille 2, 2011. http://www.theses.fr/2011AIX20661/document.

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Abstract:

Eviter la piqûre de moustiques vecteurs en utilisant des mesures antivectorielles reste le meilleur moyen de se protéger des maladies vectorielles. La salive de moustique peut induire une réponse anticorps (Acs) spécifique chez l’hôte qui pourrait être utilisé pour définir l'efficacité de ces mesures de protection antivectorielle. L’objectif de notre projet était d’évaluer la possibilité d’utiliser cette réponse Acs anti-salive de moustiques pour mesurer l’exposition à des espèces spécifiques de moustiques ainsi que d’identifier des marqueurs d’exposition. Nous nous sommes tout d’abord assurés de l’absence de différences intraspécifiques entre différentes colonies de moustiques, une condition indispensable pour pouvoir observer des différences au niveau de l’espèce. Par ailleurs, nous avons mis au point un protocole pour préserver les échantillons salivaires dans des conditions de terrains non optimales. A partir de ces expérimentations préliminaires, nous avons évalué la diversité du répertoire protéique salivaire de quatre espèces d’Anopheles par des différentes approches, et montré une spécificité de genre et d’espèce aussi bien au niveau protéique qu’antigénique. Enfin, nous avons montré une évolution spatio-temporelle de l’intensité de la réponse Acs anti-salive ainsi que sa spécificité de genre et d’espèce, chez des individus exposés à différents niveaux à Ae. caspius. Ces résultats souligne la possibilité de caractériser des antigènes salivaires spécifiques de genre et d’espèces qui peuvent avoir un intérêt pour mesurer le contact hôte/vecteur au niveau individuel, le risque de transmission de maladies vectorielles ou l’efficacité des mesures antivectorielles
The primary mean to protect individuals from arthropod-borne diseases is the prevention of bites from infected arthropods which could be achieved by vector control strategies. Mosquito saliva could induce a specific antibody response in exposed individuals that could be used to assess the effectiveness of anti-vector measures. The aim of this study is to assess the possibility to use anti-mosquito saliva antibody responses in order to evaluate the exposure to specific species of vectors and to identify salivary protein candidates that can be used as immunological markers of exposure. We first verify the lack of intraspecific differences among several mosquito colonies which is essential to further observe potential differences at the species level. Moreover, a convenient storage method was developed to preserve salivary samples in non optimal condition on the field. Based on these preliminary results, we evaluated the salivary gland protein repertory diversity among four Anopheles species using complementary approaches and we shown a genus and species specificity at the protein and antigen level. At least, a spatio-temporal evolution of anti-saliva antibody responses was shown according to the Aedes caspius density using sera of differentially exposed individuals. The specificity of this response was also reported at the genus and species level. All together, these results suggest the feasibility to characterize genus and species specific salivary antigens which could be used as immunological markers of exposure to evaluate host/vector contacts, the risk of vector-borne disease transmission or the effectiveness of anti-vector strategies

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Silvestre, Marialice Pinto Coelho. "Nouvelles méthodes d'étude de la composition d'hydrolysats de caséine (cuprimétrie, spectrophotométrie, chromatographie d'exclusion stérique) : application à l'estimation de leur teneur en di- et tripeptides." Paris 11, 1993. http://www.theses.fr/1993PA114820.

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Vigeant, Nathalie. "Effets de la diminution de la teneur en protéines et de l'ajout d'additifs sur les propriétés de foisonnement de la crème à fouetter U.H.T." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 2001. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk3/ftp04/MQ60660.pdf.

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Ilami, Golnar. "Purification, caractérisation structurale et fonctionnelle d'une protéine, BnD22, induite par la contrainte hydrique progressive chez le colza." Paris 12, 1996. http://www.theses.fr/1996PA120028.

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Abstract:

La bnd22 est une proteine induite au cours d'une contrainte hydrique progressive chez le colza. Cette proteine s'accumule fortement dans les jeunes feuilles de la plante au stade rosette. La synthese et l'accumulation de la bnd22 dans ces feuilles sont correlees avec la tolerance de celles-ci a la contrainte hydrique, caracterisee par le maintien du contenu relatif en eau, le maintien de la teneur en proteines solubles et l'inhibition de l'activite proteolytique foliaire endogene. Ces resultats constituent un argument en faveur d'une activite potentielle d'inhibiteur de proteases chez la bnd22, suggeree par des travaux anterieurs sur la base d'homologies de sequence avec les inhibiteurs de la famille de kunitz. La bnd22 a ete purifiee par chromatographie d'echange d'anions et par chromatographie en phase inverse. Elle a ete caracterisee sur le plan structural et une activite inhibitrice de proteases a ete recherchee. Elle presente une masse, mesuree par spectrometrie de masse, d'environ 19 kda. Sa structure secondaire, determinee par dichroisme circulaire et predite d'apres sa sequence en acides amines, est composee aux deux tiers de structure non periodique ainsi que d'un tiers de feuillet beta, analogue a celle de certains inhibiteurs de la famille de kunitz. Les mesures d'activite proteolytiques en presence de bnd22, effectuees sur les proteases endogenes foliaires ainsi que sur quatre proteases exogenes d'origines differentes, n'ont pas permis de mettre en evidence une inhibition significative

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Basset, Gilles. "Etude du protéasome 20S dans des racines de mai͏̈s : relation entre carence carbonée, oxydation des protéines et protéasome." Bordeaux 2, 2000. http://www.theses.fr/2000BOR28778.

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Kobbi, Sabrine. "Purification de la RuBisCO à partir de la Luzerne, hydrolyse enzymatique, identification, structure-fonction des peptides bioactifs et leur valorisation dans des produits alimentaires." Thesis, Lille 1, 2017. http://www.theses.fr/2017LIL10201.

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Abstract:

La luzerne est la plante la plus cultivée dans le monde et est une excellente source de protéines. Cependant, la RuBisCO a montré le plus d'intérêt. Cette protéine a été étiquetée comme la protéine la plus abondante sur terre, elle constitue environ 65% (p/p) des protéines solubles de la luzerne. Dans ce travail une nouvelle méthode a été mise en place pour la purification de la RuBisCO à partir de la poudre de luzerne 10% (p/v) en utilisant deux solvants différents et l’effet du pH. Premièrement, des méthodes d’analyse qualitative et quantitative ont été utilisées pour confirmer l’efficacité de la méthode de purification qui pourrait remplacer certains procédés industriels classiques. Puis, une hydrolyse pepsique a été réalisée sur la RuBisCO purifiée qui aboutit à une forte population peptidique bioactive. Les peptides finaux de 24h d’hydrolyse ont montré une meilleure activité antibactérienne ou antioxydante par rapport aux autres hydrolysats. 9 nouveaux peptides antibactériens ont été identifiés et caractérisés par SM et qui ont un CMI entre 2-6mM contre quatre espèces de bactéries: B subtilis, E coli, L innocua et M luteus. En plus, des fractions peptidiques antioxydantes ont également été identifiées dans ce travail. Et leur activité antioxydante a été évaluée par différents tests in vitro et in vivo sur l’huile de Colza. Enfin, l’addition du peptide RDRFL issu de l’hydrolyse pepsique de la RuBisCO a montré un effet positif sur la prolongation de la durée de conservation de la viande hachée et de la purée de tomate
Alfalfa is an excellent source of protein. However, RuBisCO proteins showed most interest. Indeed, this protein has been labelled the most abundant on earth; it constitutes about 65% (w/w) of soluble leaf protein of Alfalfa. In this work, a new method was introduced for the purification of RuBisCO from alfalfa powder 10% (w /v), using two different solvents and pH effect. In a first step, the performance of the proposed RuBisCO recovery method was evaluated through qualitative and quantitative analysis and the results obtained showed that this new method could replace some conventional industrial processes. In a second step, enzymatic hydrolysis was carried out on the purified RuBisCO, which resulted in a large bioactive peptide population. The final peptides after 24h of hydrolysis showed better antibacterial or antioxidant activity compared to the other peptide hydrolysates. Nine new antibacterial peptides have been identified and characterized by MS and have a MIC of 2-6 mM against four species of bacteria: B subtilis, E coli, L innocua and M luteus. In addition, antioxidants peptide fractions were identified in this work, their antioxidant activity was evaluated by various in vitro and in vivo tests on oil of Colza. Finally, the addition of peptide RDRFL derived from the peptic hydrolysis of RuBisCO has a positive effect on the prolongation of the shelf life of minced meat and of tomato puree

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Rederstorff, Mathieu. "Etude du rôle du sélénium et de la sélénoprotéine N dans les pathologies musculaires." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2006. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2006/REDERSTORFF_Mathieu_2006.pdf.

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Cruveiller, Stéphane. "Organisation et évolution du génome des vertébrés : les impacts de la transition compositionnelle majeure à l'échelle des génomes, des gènes et des protéines." Paris 7, 2002. http://www.theses.fr/2002PA077058.

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Helle, Stanislas. "Etude de la stœchiométrie des protéines liées à l'amidon : vers des programmes novateurs pour la sélection et la production de nouvelles variétés de pommes de terre." Thesis, Lille, 2020. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/EDBSL/2020/50376-2020-Helle.pdf.

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Abstract:

La pomme de terre représente, en termes de quantité produite, la 5ème culture agricole, et la 4ème source d’amidon dans le monde. De plus, son marché est en pleine expansion parce qu'elle possède le plus haut rendement d'amidon produit par parcelle de terre. L’amidon est aujourd’hui la source principale de carbohydrates dans la nourriture humaine et du bétail. Il est aussi utilisé comme additif alimentaire, colle, bioplastique et biocarburant. Il s’agit d’un polymère de glucose lié en α-1,4 avec quelques points de branchements en α-1,6. Les recherches en matière de compréhension des protéines responsables de la synthèse et de la dégradation de l’amidon ont permis de mieux appréhender son métabolisme. Toutefois, les mécanismes d’association de ces protéines à l’amidon sont encore aujourd’hui mal compris. D’un point de vue fondamental, les objectifs de ma thèse étaient de mieux comprendre cette association entre le grain d’amidon et ces protéines. À l’aide d’analyses par spectrométrie de masse, nous avons, dans un premier temps, identifié l’ensemble des protéines liées à l’amidon de pomme de terre. Nous avons ensuite établi leur stœchiométrie par protéomique quantitative. Puis, nous avons comparé cette stœchiométrie entre différentes formes de grains et mis en évidence que cette stœchiométrie fluctuait en fonction de la taille des grains. Par la suite, nous avons étudié l’incorporation d’azote lourd 15N dans les séquences des protéines liées à l’amidon à différents temps de la tubérisation pour suivre de manière dynamique l’association des protéines au grain d’amidon durant la synthèse du tubercule. Ces résultats ont montré une plus forte incorporation de l’azote durant les 3 premières semaines de la tubérisation et une différence marquée de ce taux d’incorporation entre les amidons synthases, responsables de l’élongation des chaines de glucanes de l’amidon, et les enzymes de branchement, responsables de la formation des points de branchements. Nous avons aussi étudié l’impact que pouvait avoir la protéine majoritaire du grain, la Granule-Bound Starch Synthase (GBSS), sur l’association des autres protéines au grain par l’analyse protéomique comparative des protéines liées au grain d’amidon de pommes de terre mutantes pour cette protéine. Enfin, nous avons miniaturisé les protocoles jusqu'à l’analyse d’un grain unique, évitant ainsi les biais amenés par l’hétérogénéité des grains à l’intérieur d’un même échantillon. Les avancées techniques de ce projet permettront, au travers de la collaboration de mon laboratoire d’accueil et de l’entreprise Florimond Desprez Veuve et Fils, d’identifier de nouveaux marqueurs de sélection pour contribuer au développement de programmes novateurs pour la sélection et la production de nouvelles variétés de pommes de terre
Potato represents, in term of quantity produced, the 5th crop culture, and the 4th starch source in the world. Moreover, its market is booming, as a result of its highest starch/land parcel yield. Starch is nowadays the main source of carbohydrate in human and cattle food. It is also used as food additive, glue, bioplastic and biofuel. Researches that have been leaded in order to understand the functions of proteins responsible of starch synthesis and degradation allowed to understand better its metabolism. Nevertheless, the mechanisms of association between the granule and the proteins are still misunderstood. In a fundamental point of view, the objective is to better understand these association mechanisms. With the help of mass spectrometry, we first identified the whole proteome of potato starch. Then, established stoichiometry of proteins bound to potato starch by quantitative proteomics. Afterward, we have compared this stoichiometry between different granules morphologies, and have highlighted that protein stoichiometry inside the granule fluctuates with its size. Thereafter, we have studied the incorporation rate of exogen heavy nitrogen 15N in the sequence of starch bound proteins at different time, in order to follow dynamically the association of proteins to the granule. These results demonstrated a higher incorporation rate during the first three weeks of the tuberization, and a difference of incorporation between the starch synthases, which elongate the glucan chains, and the starch branching enzymes, which form the branching points. Moreover, we have investigated the impact of the major protein inside the starch granule, the Granule Bound Starch Synthase (GBSS), on the association of the other proteins by comparative proteomics between starch granules from mutant potatoes for this protein. Finally, protocols will be miniaturized up to the analysis of a single starch granules, to avoid bias due to inter-granule heterogeneity. In a research and development point of view, the collaboration with the breeding company Florimond Desprez Veuve et Fils will allow the development of programs of selection and production of new potato varieties, particularly by the identification of protein markers for a given phenotype

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Bédard-St-Amant, Jessika. "Effet de la pasteurisation haute du babeurre sur sa composition minérale et celle des constituants protéiques des fragments de la membrane du globule gras du lait." Thesis, Université Laval, 2009. http://www.theses.ulaval.ca/2009/26364/26364.pdf.

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Lesdema, Aurélie. "Etude de l'effet combiné des fibres et des protéines sur la satiété et influence des paramètres psychologiques." Thesis, Paris, AgroParisTech, 2012. http://www.theses.fr/2012AGPT0093.

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Abstract:

Dans le contexte général du contrôle du poids, le développement de produits à haut pouvoir satiétogène apparaît comme une alternative intéressante ou une réponse complémentaire aux propositions de régimes réduits en calories. Le principal objectif de cette thèse est d'évaluer le pouvoir satiétogène simple et combinés des fibres et des protéines dans une matrice biscuitière ainsi que l'influence de facteurs psychologiques telle que l'information fournie sur un aliment sur la satiété. Concernant l'influence de paramètres psychologiques, si l'on s'en réfère aux limites du TFEQ couramment utilisées par Stunkard et Messick, une cohorte de jeunes adultes français a de faibles score de TFEQ pour la restriction cognitive, la désinhibition et la faim. Ce résultat nous a permis de proposer de nouvelles limites plus basses que celles couramment utilisées et adaptées à cette catégorie de la population, souvent étudiée dans les études cliniques de comportement alimentaire. Ces limites ont été utilisées pour définir nos groupes de volontaires pour l'étude sur l'effet d'un message sur la satiété. Nous avons conclu qu'un message sur les propriétés satiétogènes d'un produit pourrait influencer un sous-groupe de la population, que sont les femmes faiblement restreintes et fortement désinhibées. Afin d'optimiser la sélection des prototypes utilisés dans l'étude clinique sur l'effet des fibres et des protéines sur la satiété, nous avons développé avec succès un nouvel outil pour entraîner un panel d'experts sensoriels à évaluer leur satiété. Un mélange de fibres et de protéines réduit les sensations d'appétit de manière plus importante que les biscuits enrichis simplement en un des ingrédients. Cette combinaison d'ingrédients actifs stimule des mécanismes qui sont induits par les fibres (comme la réduction de l'insulinémie et le ralentissement de la vidange gastrique) et les protéines (comme la diminution de la glycémie). En conclusion, cette approche intégrative de la satiété a permis d'apporter de nouvelles connaissances sur les effets synergique des fibres et des protéines sur les sensations d'appétit. Nous avons aussi proposé de nouvelles méthodes pour évaluer le pouvoir satiétogène de différents produits en utilisant l'expertise des domaines des sciences du sensoriel et de la nutrition. Ce travail souligne aussi l'importance des aspects psychologiques dans les études de nutrition humaine.Mots clés: Satiété, Fibres, Protéines, Three-Factor Eating questionnaire, Message satiété, entraînement à l'évaluation de la satiété
In the general context of weight management, the development of food with higher satiating power appears to be an interesting alternative or a complementary answer to the proposition of calorie-reduced diets. The main aim of this thesis was to evaluate the single and combined satiating effects of proteins and fibres in biscuits and the influence of psychological factors, such as a given message about a food, on satiety. As for cognitive parameters, considering Stunkard and Messick guidelines about TFEQ limits, young French adults aged 20–39 yrs have low cognitive restraint, disinhibition and hunger scores. This finding makes it possible to suggest new limits for the TFEQ scores better adapted to this category of the population which is often used in clinical studies. We used these limits to define our groups of volunteers in the study about the influence of a message on satiety. It was found that giving a message on the satiating potential of a food may affect a sub-group of the population, such as low-restrained high-disinhibited women. To optimize the selection of the prototypes used in the clinical study about fibre and protein effects on satiety, we developed a new successful methodology to train a panel of sensorial experts in satiety assessment. A combination of fibre and protein in biscuits reduces appetite sensations more than do single enrichment in fibre or protein. The mixing of fibre and protein activates mechanisms which are induced by fibre (such as reduced insulinemia and slowed gastric emptying) and protein (such as reduced glycaemia). In conclusion, this integrative approach on satiety brings new knowledge about the synergistic effect of fibre and protein on appetite sensations. It proposes a new methodology using sensory and nutrition expertise to assess the satiety power of products and it also highlights the importance of psychometric traits in human food studies.Key words: Satiety, Fibres, Proteins, Three-Factor Eating questionnaire, Satiety message, training in satiety assessment

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Barbottin, Aude. "Utilisation d'un modèle de culture pour évaluer le comportement des génotypes: Pertinence de l'utilisation d'Azodyn pour analyser la variabilité du rendement et de la teneur en protéines du blé tendre." Phd thesis, INAPG (AgroParisTech), 2004. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00001262.

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Abstract:

L'évolution des pratiques agricoles vers des systèmes moins intensifs nécessite d'évaluer rapidement la capacité des nouvelles variétés à valoriser ces systèmes pour des conditions pédoclimatiques variées. Les expérimentations traditionnellement réalisées dans cet objectif offrent une réponse souvent partielle, car les gammes explorées sont limitées par rapport à celles rencontrées dans la pratique agricole, et trop lente par rapport au renouvellement rapide des variétés en blé tendre. Pour accélérer cette étape d'évaluation des variétés, il est possible de s'appuyer sur de nouveaux types d'outils prévisionnels. Le travail présenté ici a pour objectif d'étudier la possibilité d'utiliser un modèle de culture pour analyser et prévoir le comportement variétal, dans une gamme d'environnements variés, pour des variétés existantes ou à créer. Nous nous sommes interrogés sur les adaptations nécessaires de ces outils pour prendre en compte le comportement variétal et nous avons proposé des pistes d'évaluation de la capacité de tels outils à choisir la variété la mieux adaptée aux conditions du milieu considéré. Les concepts et formalismes développés dans les modèles de culture en font des outils a priori pertinents pour l'évaluation et la prédiction du comportement variétal, les interactions entre la culture et le milieu étant simulées. Cependant, peu d'études se sont attachées à proposer des méthodologies d'estimation des paramètres génotypiques et d'évaluation de la capacité des modèles ajustés à rendre compte du comportement variétal. A partir d'un exemple de modèle de culture, Azodyn, intégrant dans son formalisme l'élaboration du rendement et de la teneur en protéines des grains, ainsi que les différents processus d'absorption et de transfert d'azote dans le système Sol-Plante, nous avons proposé une méthodologie d'identification et d'ajustement des paramètres génotypiques des modèles de culture, ainsi que différents critères d'évaluation de la capacité de ces modèles à rendre compte du comportement variétal. Nous avons dans un premier temps identifié, parmi tous les paramètres du modèle, ceux qui variaient en fonction du génotype, à partir d'expérimentations spécifiques, des acquis de la littérature et des connaissances d'experts. Nous avons identifié trois paramètres et trois variables d'entrée du modèle, variables entre génotypes, et susceptibles de représenter des marqueurs du comportement facilement accessibles aux différents utilisateurs de variétés. Les paramètres du modèle ont été ajustés pour un ensemble de quatorze génotypes par mesure directe de la valeur du paramètre dans des expérimentations spécifiques. Les effets des différents paramètres et variables d'entrée génotypiques sur les variations de la teneur en protéines des grains et du rendement ont été estimés par une analyse de sensibilité du modèle. Cette approche nous a permis d'identifier les principaux facteurs d'adaptation des variétés aux environnements, à savoir le poids de mille grains, les précocités à montaison et à floraison, et la capacité à fabriquer un nombre de grains élevé. Aucun paramètre spécifique à la nutrition azotée n'est apparu comme déterminant des sorties. Nous avons ensuite évalué la capacité du modèle à rendre compte du comportement des différents génotypes expérimentés sur 21 environnements, variant par la nature et l'intensité de facteurs limitants du rendement. Nous avons montré que, sur la base de ce faible nombre de paramètres variétaux, il était possible de rendre compte des niveaux moyens de rendements et de teneurs en protéines des grains des différents génotypes, pour des environnements variés. Nous avons également montré que le modèle de culture était un outil pertinent de prédiction du comportement des génotypes, que l'on s'intéresse à la stabilité des différents génotypes ou à leur classement pour différentes conditions de culture.

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El, youssef Cynthia. "Sensory benefits provided by selected microorganisms for the fermentation of plant matrices." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASB027.

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Abstract:

La nouvelle tendance alimentaire prônant la consommation accrue de protéines végétales est liée aux effets négatifs sur la santé et l’environnement des produits d’origine animale. Pour répondre aux besoins des consommateurs, les industries agro-alimentaires développent ainsi des produits à base de protéines végétales.Parmi les différentes sources de protéines, le pois (Pitsum sativum) présente des avantages environnementaux, technologiques et nutritionnels. Néanmoins, son utilisation dans la formulation de produits reste fortement freinée par la présence de défauts sensoriels qui sont généralement décrits comme étant de type “beany”, “vert” et “végétal”. La fermentation est un des leviers de choix pour modifier la qualité de ces produits.Ce travail de recherche a donc consisté à étudier l’impact de la fermentation sur la perception sensorielle d’un produit type yaourt à base de protéines de pois. Des méthodes microbiologiques, physico-chimiques et sensorielles ont été mises en œuvre.Les molécules responsables des défauts dans la matrice non fermentée ont été identifiées par chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse. Les aldéhydes, en particulier l’hexanal, les furanes, les alcools et les cétones sont les molécules majeures présentes dans cette matrice initiale.Divers microorganismes sélectionnés préalablement ont été cultivés sur cette matrice et leurs capacités d’acidification et d’aromatisation ont été évaluées. Des consortia de bactéries lactiques et de levures ont ainsi été sélectionnés apportant chacun les fonctionnalités recherchées.La modification de la perception des produits fermentés a été mise en évidence par des analyses sensorielles. L’origine de cette amélioration peut être liée à la production d'arômes fruités par les levures et/ou à la dégradation des défauts beany.Afin de mieux comprendre ce phénomène, des analyses sensorielles sur des solutions modèles de molécules cibles (méthodes de recombinaisons et d’omissions) ont été menées. En parallèle, des empreintes moléculaires par chromatographie en phase gazeuse couplée à l’olfactométrie ont été réalisées sur les produits fermentés.Ainsi, les esters produits par les levures ont un rôle déterminant dans l’amélioration de la perception sensorielle des produits fermentés à base de protéines de pois. Concernant les molécules responsables des défauts, l’impact dominant de certaines molécules dont l’hexanal et le 2-pentylfuran a été mis en évidence. Néanmoins, l’impact d’autres molécules de défauts, encore présentes dans la matrice fermentée, reste à approfondir. En particulier, il faudrait déterminer les seuils de perception dans ces matrices et étudier les effets d’interactions.Pour conclure, ce travail de thèse CIFRE nous a permis de déposer un brevet en vue du développement d’un ingrédient innovant, issu de la combinaison d’un procédé de fermentation et de stabilisation par séchage
The new food trend in favor of the increasing consumption of plant proteins is mainly linked to the negative effects of products of animal origin on health and environment. To meet consumers’ needs, agro-food industries are working on the development of plant protein-based products.Among the different sources of proteins, pea (Pitsum sativum) offers environmental, technological and nutritional advantages. However, its use in the formulation of products remains strongly hampered by the presence of off-flavors, described mainly as “beany”, “green” and “vegetable”. Fermentation is one of the means that could be chosen to modify the quality of these products.Therefore, this research consisted of studying the impact of fermentation on the sensory perception of a pea protein yoghurt-like product. Microbiological, physico-chemical and sensory methods were implemented.The molecules responsible for off flavors in the unfermented matrix were identified by gas chromatography coupled with mass spectrometry. Aldehydes, particularly hexanal, furans, alcohols and ketones are the major molecules present in this initial matrix.A variety of preselected microorganisms were cultured on this matrix, and their acidification and aromatization capacities were evaluated. Consortia of lactic acid bacteria and yeasts were selected, based on the desired functionalities that each provides.The modification of the sensory perception of fermented products was confirmed by sensory analyses. The origin of this improvement might be related to the production of fruity aromas by the yeasts and / or the degradation of off-flavors.In order to get a better understanding of this phenomenon, sensory analyses on model solutions of the targeted molecules (recombination and omission experiments) were performed.In parallel, molecular fingerprinting by gas chromatography coupled with olfactometry were carried out on the fermented products.Hence, the produced esters by yeasts played a decisive role in improving the sensory perception of pea protein fermented products. Regarding the molecules responsible for defects, the dominant impact of certain molecules including hexanal and 2-pentylfuran has been highlighted. Nevertheless, the effect of other off-flavor molecules, remaining in the fermented matrix, still needs further exploration. In particular, the perception threshold in these matrices needs to be determined and the interaction effects require exploration.To conclude, this industrial thesis allowed to file a patent pertaining to the development of an innovative ingredient, resulting from the combination of a fermentation process and stabilization by drying

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Paradis, Cloé. "Modification de la teneur en acides linoléiques conjugués du tissu adipeux du veau de boucherie au pâturage par l'apport de soya extrudé aux vaches allaitantes." Master's thesis, Université Laval, 2007. http://hdl.handle.net/20.500.11794/18956.

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El, Zein Rana. "Dynamiques saisonnières des réserves carbonées et azotées chez le chêne sessile (Quercus petraea) et le hêtre (Fagus sylvatica) adultes." Thesis, Nancy 1, 2011. http://www.theses.fr/2011NAN10002/document.

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Abstract:

Le chêne sessile et le hêtre sont deux espèces feuillues décidues tempérées, caractérisées par des phénologies foliaires et cambiales contrastées. Afin de progresser dans la compréhension de la gestion des réserves qui sont des composantes importantes des cycles internes du carbone et de l'azote, nous avons étudié la dynamique saisonnière des réserves carbonées (C) et azotées (N) chez des arbres adultes des deux espèces dans leur environnement naturel. Afin de répondre à nos objectifs, nous avons développé une approche pluridisciplinaire associant écophysiologie, biochimie et isotopie. Le suivi mensuel des variations saisonnières des réserves C et N dans le tronc a révélé chez le chêne une forte remobilisation de l'amidon à partir des cernes les plus récents au printemps pour fournir le carbone nécessaire pour la croissance du bois initial du nouveau cerne qui est concomitante à l'expansion foliaire. Chez le hêtre, la croissance printanière ne semble pas dépendante des réserves C du tronc. Chez les deux espèces, deux polypeptides de 13 et de 26 kDa s'accumulent avec la sénescence foliaire en automne, sont très abondants en période hivernale froide et sont remobilisés avec le débourrement au printemps. Cette cinétique saisonnière leur confère un rôle dans le stockage de l'azote (protéines végétatives de réserve, VSP), mais n'exclut pas un rôle dans la tolérance au froid. Chez le chêne sessile, l'étude de la source d'azote pour la croissance des feuilles et des pousses par marquage isotopique au 15N a montré que les réserves N contribuent jusqu'à 90% de l'azote total des nouveaux organes aux premiers stades de développement. La contribution de l'azote nouvellement assimilé ne devient significative que quand le débourrement est achevé. L'étude de la répartition et des quantités des composés C et N non-structuraux à l'échelle de l'arbre a été réalisée par un échantillonnage destructif d'arbres des deux espèces en hiver (Janvier) et à l'étalement complet des feuilles (Juin). Cette étude a montré i) une distribution des concentrations entre organes dépendante de leur fonction physiologique, de l'anatomie du bois et de la distance aux organes puits, ii) l'importance du tronc et des racines dans le stockage des réserves en hiver, iii) l'importance des quantités d'azote non-structural des feuilles et des pousses malgré leur faible biomasse, iv) des quantités de C et N non-structuraux plus importants chez le chêne par rapport au hêtre, pouvant refléter des besoins contrastés pour la croissance et l'entretien des tissus en hiver
Sessile oak and beech are two deciduous temperate broadleaved species, characterized by contrasted foliar and cambial phenologies. In order to progress in our understanding of reserves management in these species, we studied the seasonal dynamics of carbon (C) and nitrogen (N) reserves in adult trees in their natural environment. For this purpose, we developed a multidisciplinary approach associating ecophysiology, biochemistry and isotopy. The monthly monitoring of seasonal variation in C and N reserves in the stem sapwood showed a strong remobilization of starch from the most recent rings of oak in the spring in order to supply the necessary C for early wood growth that is concomitant to leaf expansion in this species. For beech, spring growth seemed to be less dependant on C stored within the stem sapwood. In both species, 2 polypeptides of 13 and 26 kDa accumulated with leaf senescence in the autumn and were highly abundant during the dormant period then they were remobilized with bud burst in the spring. This seasonal variation supports their role in nitrogen storage as vegetative storage proteins (VSP) and does not exclude a role in cold hardiness too. In sessile oak, the in situ 15N labeling of soil N (newly absorbed N) during the bud burst in the spring showed that N reserves accounted for 90% of total N of the new organs (leaves and twigs) at the first stages of growth. The contribution of newly assimilated N became more important when bud burst was achieved. The distribution patterns of non-structural C and N concentrations and amounts at the tree level was realized by an exhaustive sampling of trees from both species in the winter (January) and at full leaf expansion (June). This study showed i) that the distribution of concentrations among tree organs was dependant of the physiological function, wood anatomy and proximity to sink organs, ii) the importance of stem sapwood and coarse roots in reserves storage during the winter, iii) the importance of non-structural nitrogen amounts in leaves and twigs despite their low biomass, iv) higher amounts of non-structural C and N compounds in oak compared to beech, that reflects contrasted needs for spring growth and tissue maintenance during the winter dormancy

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Casagrande, Marion. "Evaluation précoce des performances du blé biologique (rendement et teneur en protéines) : une approche combinée de diagnostic agronomique, de modélisation à l'aide d'indicateurs de nuisibilité et d'études des pratiques dans les exploitations agricoles." Phd thesis, AgroParisTech, 2008. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00004736.

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Abstract:

Dans l'optique d'une agriculture plus durable, l'agriculture biologique offre l'opportunité d'une production agricole plus respectueuse de l'environnement. Néanmoins, en agriculture biologique, les niveaux de production sont inférieurs à ceux de l'agriculture conventionnelle. Le rendement et la teneur en protéines du blé biologique sont très variables et limités par de nombreux facteurs. Les faibles teneurs en protéines posent des difficultés de commercialisation car elles sont généralement inférieures au seuil de 10,5% que les organismes de collecte exigent pour les débouchés de panification. Afin d'améliorer les performances du blé biologique, dans un premier temps, les facteurs limitants et les pratiques agricoles expliquant ces performances ont été identifiés et hiérarchisés à l'aide d'un diagnostic agronomique réalisé en région Rhône-Alpes. Ce diagnostic a été réalisé à l'aide d'une méthode statistique innovante de mélange de modèles. Puis, des modèles permettant de prédire la distribution du rendement et de la densité d'une population d'adventices tardive à partir d'une densité précoce dans des parcelles de blé biologique, ont été mis au point à l'aide de la méthode de régression quantile. Ils permettent d'aider au raisonnement des pratiques de désherbage et de fertilisation. Enfin, une analyse des pratiques des agriculteurs a permis de prendre en compte la manière dont les agriculteurs prélèvent des informations sur leurs parcelles pour déclencher leurs pratiques. Des propositions sont ensuite discutées pour valoriser les résultats de ce travail dans la construction d'un outil d'aide à la décision destiné à raisonner les pratiques de désherbage et de fertilisation.

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Gloaguen, Mathieu. "Identification des acides aminés limitants secondaires pour la croissance des porcelets dans des régimes à basse teneur en protéines et des mécanismes de régulation de la consommation volontaire lors d’une carence en valine." Rennes, Agrocampus Ouest, 2012. http://www.theses.fr/2012NSARB227.

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Abstract:

La réduction des émissions de polluants issus des rejets azotés des déjections des porcs est nécessaire pour assurer la durabilité de la production porcine. Elle passe par une réduction des quantités d’azote dans l’aliment des porcs. Le porcelet est d’autant plus concerné qu’il a une capacité d’ingestion limitée, un fort potentiel à déposer des protéines et qu’il doit ingérer un aliment riche en protéines qui lui fournissent les acides aminés essentiels (AAE) et l’azote nécessaire à la synthèse de protéines. La baisse de la teneur en protéines des aliments et l’apport sous forme libre des AAE les plus limitants, appelés acides aminés (AA) limitants primaires (lysine (Lys), thréonine, méthionine et tryptophane), a permis d’améliorer l’efficacité d’utilisation de l’azote tout en maintenant les performances du porcelet. Malgré ce contexte favorable, la baisse de la teneur en protéines est actuellement limitée par le manque de connaissances sur la nature et les besoins des prochains AA limitants, qualifiés d’AA limitant secondaires. Le 1er objectif de la thèse a été d’identifier les AA limitants secondaires pour la croissance des porcelets dans des régimes à basse teneur en protéines, en focalisant particulièrement sur les réponses aux apports d’acides aminés à chaînes ramifiées (AACR : valine (Val), isoleucine (Ile) et leucine (Leu)) et d’histidine (His). Lorsque la Val est limitante dans l’aliment, la baisse de la croissance résulte principalement d’une réduction de la consommation volontaire des porcs traduisant probablement une carence nutritionnelle en Val. Les mécanismes de régulation sous-jacents n’ont pas été étudiés chez le porc. Le second objectif a été l’étude du comportement alimentaire et des signaux métaboliques des porcelets après l’ingestion d’un aliment carencé en Val afin d’initier l’identification des mécanismes de régulation de la consommation volontaire. Nos résultats confirment l’estimation des besoins en His:Lys et en Leu:Lys en digestibilité iléale standardisée (DIS) présentés dans les tables nutritionnelles (NRC, 1998 ; BSAS, 2003) à 32 et 102 % respectivement. Dans un régime à base de céréales et de tourteau de soja, le besoin en Ile:Lys DIS est estimé à 49 %, ce qui est en dessous de celui estimé par la NRC (1998, 54 %) et BSAS (2003, 58 %). Cependant, l’incorporation dans l’aliment de sources de protéines déséquilibrées en AAE à base de produits sanguins augmente le besoin en Ile:Lys DIS (> 54 %). Nous n’avons pas observé un tel effet sur l’estimation du besoin en Val lorsque l’aliment contient un excès de Leu:Lys DIS (165 %). Cependant, un excès de Leu aggrave l’effet de la carence en Val et un apport minimal de 70 % de Val:Lys DIS est alors nécessaire pour éviter les effets négatifs d’un excès de Leu
Knowledge of amino acid requirements and the use of free AA in diets allow reducing the dietary crude protein(CP) content, improving the nitrogen efficiency and reducing the incidence of digestive disorders while maintaining performance of pigs. The 1st objective of the project was to identify the limiting amino acid for growth in low CP diets with a focus on valine (Val), isoleucine (Ile), leucine (Leu) and histidine (His). When the dietary Val supply is limiting, the voluntary feed intake of pigs decreases significantly. The underlying mechanisms have not yet been studied in pigs. The 2nd objective ws to contribute to the identification of mechanisms involved in feed intake regulation in pigs offered a diet deficient in Val. Our results indicated that a supply of 49 % Ile:Lys, 102 % Leu:Lys, and 32 % His:Lys (on a standardized ileal digestible bais) allows to maintain growth in pigs. The use of free Val, Leu, Ile, Phe and His enables a 4 percentage unit reduction in dietary CP content without affecting growth, which corresponds to a decrease of 40 % of nitrogen excretion. The feed intake reduction of a diet deficient in Val is the consequence of post-ingestive signals. The pig is able to detect a deficient supply of Val within A h after ingestion, which correspond to a low accumulation of plasma Val. In conclusion, our results show thaht it is possible to formulate very low CP diets for pigs and suggest implication of metabolic signals responsible for the reduction of feed intake when the diet is deficient in Val

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Casagrande, Camille. "Evaluation précoce des performances du blé biologique (rendement et teneur en protéines) : une approche combinée de diagnostic agronomique, de modélisation à l'aide d'indicateurs de nuisibilité et d'études des pratiques dans les exploitations agricoles." Paris, AgroParisTech, 2008. http://pastel.paristech.org/4736/01/ThèseMCasagrande.pdf.

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Abstract:

Dans l’optique d’une agriculture plus durable, l’agriculture biologique offre l’opportunité d’une production agricole plus respectueuse de l’environnement. Néanmoins, en agriculture biologique, les niveaux de production sont inférieurs à ceux de l’agriculture conventionnelle. Le rendement et la teneur en protéines du blé biologique sont très variables et limités par de nombreux facteurs. Les faibles teneurs en protéines posent des difficultés de commercialisation car elles sont généralement inférieures au seuil de 10,5% que les organismes de collecte exigent pour les débouchés de panification. Afin d’améliorer les performances du blé biologique, dans un premier temps, les facteurs limitants et les pratiques agricoles expliquant ces performances ont été identifiés et hiérarchisés à l’aide d’un diagnostic agronomique réalisé en région Rhône-Alpes. Ce diagnostic a été réalisé à l’aide d’une méthode statistique innovante de mélange de modèles. Puis, des modèles permettant de prédire la distribution du rendement et de la densité d’une population d’adventices tardive à partir d’une densité précoce dans des parcelles de blé biologique, ont été mis au point à l’aide de la méthode de régression quantile. Ils permettent d’aider au raisonnement des pratiques de désherbage et de fertilisation. Enfin, une analyse des pratiques des agriculteurs a permis de prendre en compte la manière dont les agriculteurs prélèvent des informations sur leurs parcelles pour déclencher leurs pratiques. Des propositions sont ensuite discutées pour valoriser les résultats de ce travail dans la construction d’un outil d’aide à la décision destiné à raisonner les pratiques de désherbage et de fertilisation.

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Touratier, Christine. "Comportement des protéines sarcoplasmiques de la viande de porc au cours du stockage et du chauffage : relations avec la qualité de la viande." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1992. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/INPL_T_1992_TOURATIER_C.pdf.

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Abstract:

L’objectif de ce travail est la mise au point d'un prédicateur de la qualité de la viande de porc. La concentration en protéines sarcoplasmiques de viandes maturées (48 h p. M) présente des différences significatives suivant la qualité de ces viandes: 33. 5 mg/g de muscle pour les viandes normales, 24. 8 mg/g pour les viandes exsudatives, 28. 7 mg/g pour les viandes acides et 38. 6 mg/g pour les viandes DFD. L'évolution comparée de la teneur en protéines sarcoplasmiques de viandes normales et de viandes exsudatives entre 4 h et 168 h p. M à 4°C montre que: 1) l'insolubilisation progressive des protéines est plus marquée pour les viandes exsudatives (39. 3% d'insolubilisation pour les viandes exsudatives contre 25. 7% pour les viandes normales); 2) ces différences ne semblent pas exister in vivo; 3) les conditions de pH et de température dans les premières heures après l'abattage conditionnent en grande partie la qualité de la viande; 4) la CPK, la PHb et la TPI sont les protéines les plus fragilisées par la condition PSE. À 48 h p. M, la CPK présente une concentration de 5. 2 mg/g pour les viandes normales, la PHb 1. 5 et la TPI 1. 0 contre 1. 4, 0. 1 et 0. 2 pour les viandes exsudatives. Le chauffage accentue les différences observées au cours du stockage. Les 50% de dénaturation sont atteints à 58. 9°C pour les viandes normales, 51. 4 pour les viandes exsudatives, 56. 0 pour les viandes acides et 62. 0 pour les viandes DFD. Par ailleurs, l'insolubilisation des protéines induit parallèlement l'inactivation enzymatique. Un test prédictif de la qualité de la viande pourrait consister à maturer un échantillon de viande prélevé par biopsie, par un traitement thermique approprié, avant d'apprécier l'insolubilisation protéique ou l'inactivation enzymatique en résultant

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Barthélemy, Nicolas. "Protéomique qualitative et quantitative, une passerelle pour relier l’expression génomique à la construction des édifices biologiques : Application à la compréhension de la structure moléculaire du cheveu humain." Strasbourg, 2011. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2011/BARTHELEMY_Nicolas_2011.pdf.

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Abstract:

La fibre capillaire est un édifice biologique complexe dont le détail de la structure moléculaire est encore mal appréhendé principalement du fait du manque de précision concernant l’expression et l’organisation des protéines la constituant. Dans ce contexte, l’utilisation des approches protéomiques pour améliorer la connaissance des cellules spécifiques du cheveu humain a été développée au cours de cette thèse. Ce travail s’est articulé autour de quatre parties : l’établissement des connaissances de la biologie du cheveu et de ses structures moléculaires obtenues à partir des données de la littérature. La mise au point d’une stratégie protéomique adaptée aux cas très particuliers des protéines du cheveu et reposant en partie sur l’optimisation du couplage nanoLC-ESI-Q-TOF pour le séquençage peptidique à haut débit. L’isolement de deux types cellulaires pour en étudier précisément le protéome : les cellules du cortex et de la cuticule du cheveu. La comparaison de l’expression semi quantitative des protéines identifiées a permis de proposer la spécificité de localisation d’une partie d’entre elles dans ces protéomes. Ces analyses ont conduit à la démonstration de l’expression de 60% des gènes de protéines associées aux kératines (KAP) prédits contre 20% auparavant complétant ainsi la liste des gènes exprimés en protéines chez l’humain (source Uniprot). L’utilisation d’approches complémentaires pour tenter d’affiner la quantification des protéines majoritaires des cellules corticales, de mettre en évidence des propriétés structurales de certaines de ces séquences protéiques et de proposer des hypothèses quant à l’origine des principaux gènes des KAP
Hair fiber is a sophisticated biological material for which the details of its molecular structure failed to be well understood because of the lack of data regarding protein expression and organization. In this context, improvement on human hair cells knowledge with proteomic approaches has been performed in this PhD. This work has been structured in four parts : establishment of the knowledge on hair biology and its molecular structure obtained by literature mining. Development of a well-suited proteomic strategy for the special case of hair proteins analysis. This strategy is mainly based on the improvement of nanoLC-ESI-Q-TOF coupling for high-throughput peptide sequencing. Cell type isolation to study the proteome of cortical and cuticular hair cells. We have compared the semi quantitative expression of the identified proteins to investigate their location in those proteomes. These analyses led to protein expression evidence for 60% of keratin associated proteins predicted genes (KAP) compared to the only 20% previously evidenced (according to Uniprot). Use of complementary approaches to attempt to refine the quantification of the major proteins of cortical cells, to evidence structural properties for specific protein sequences and to propose hypotheses for the main KAP genes origin

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Vasconcelos, Antônio Silvio do Egito. "Les protéines du lait de jument : caractérisation physico-chimique et recherche de peptides inhibiteurs de l'enzyme de conversion de l'angiotensine I." Nancy 1, 2002. http://www.theses.fr/2002NAN10016.

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Abstract:

Une meilleure connaissance des protéines du lait de jument et des activités biologiques liées à des peptides est requise. Les races de juments peuvent être discernées par analyse électrophorétique des caséines. L' -lactalbumine et le lysozyme équins sont partiellement glycosylés. L'α-lactalbumine subit spontanément un changement conformationnel au cours du temps. Les caséines αs1, ß, [kappa], γ et le composant 5 des proteoses-peptones sont séparés et caractérisés par chromatographie, électrophorèse et microséquencés. Les caséines sont hétérogènes probablement du fait de phosphorylations et glycosylations variables. La caséine α possède un site d'hydrolyse par la chymosine, qui génère de la paracaséine α et du glycomacropeptide équin. Des peptides trypsiques de caséines αs1 et ß présentent une activité inhibitrice de l'enzyme de conversion de l'angiotensine I. Une concentration de 285 αM du peptide 32-40 de la caséine α permet de réduire de 50% l'activité enzymatique
A better knowledge of mares' milk proteins and biological activities related to peptides was required. Mares' breeds could be distinguished by electrophoretic analysis of caseins. Equine α-Lactalbumin and lysozyme were partially glycosylated. α-Lactalbumin spontaneously underwent an irreversible conformational change in time. αs1-, ß-, [kappa]-, γ-Caseins and proteose peptone component 5-like peptides were separated and characterized by chromatography, electrophoresis, and microsequencing. The equine caseins show a great heterogeneity probably resulting from variable phosphorylations and glycosylations. [kappa]- And ß-caseins had a preferential site of hydrolysis by chymosin, which generates para-[kappa]-casein and glycomacropeptide from [kappa]-casein. Some tryptic peptides of αs1- and ?-caseins presented an inhibition of the angiotensin I converting enzyme. A concentration of 285 ?M of the ß-casein 32-40 peptide was required to reduce 50% of the enzyme activity

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Dissertations / Theses on the topic 'Arthropodes – Teneur en protéines'

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