Academic literature on the topic 'Autolyse cellulaire'

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Journal articles on the topic "Autolyse cellulaire"

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Tiwari, Kiran B., Craig Gatto, Suzanne Walker, and Brian J. Wilkinson. "Exposure ofStaphylococcus aureusto Targocil Blocks Translocation of the Major Autolysin Atl across the Membrane, Resulting in a Significant Decrease in Autolysis." Antimicrobial Agents and Chemotherapy 62, no. 7 (2018): e00323-18. http://dx.doi.org/10.1128/aac.00323-18.

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Abstract:
ABSTRACTPeptidoglycan (PG) and wall teichoic acid (WTA) are the major staphylococcal cell wall components, and WTA biosynthesis has recently been explored for drug development. Targocil is a novel agent that targets the TarG subunit of the WTA translocase (TarGH) that transports WTA across the membrane to the wall. Previously we showed that targocil treatment of a methicillin-susceptibleStaphylococcus aureusstrain led to a rapid shut down of cellular autolysis. Targocil II, which targets the TarH subunit of TarGH, also resulted in a drastic decrease in autolysis. Here, we address the mechanism of targocil-mediated decreased autolysis. The mechanism is WTA dependent since targocil treatment decreased autolysis in methicillin-resistant strains but not in a WTA-deficient mutant. Similar to cellular autolysis, autolysin-retaining crude cell walls isolated from targocil-treated cells had vastly decreased autolytic activity compared to those from untreated cells. Purified cell walls from control and targocil-treated cells, which lack autolytic activity, were similarly susceptible to lysozyme and lysostaphin and had similar O-acetyl contents, indicating that targocil treatment did not grossly alter PG structure and chemistry. Purified cell walls from targocil-treated cells were highly susceptible to autolysin extracts, supporting the notion that targocil treatment led to decreased autolysin in the crude cell walls. Quantitative real-time PCR analysis revealed that the decrease in autolysis in the targocil-exposed cells was not due to transcriptional repression of the autolysin genesatl,lytM,lytN, andsle1. Zymographic analysis of peptidoglycan hydrolase profiles showed a deficiency of cell surface autolysins in targocil-treated cells but higher activity in cell membrane fractions. Here, we propose that the untranslocated WTA molecules in the targocil-exposed cells sequester Atl at the membrane, resulting in significantly decreased autolysis.
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Debeer, Sabine O. S., Thierry G. M. Baron, and Anna A. Bencsik. "Immunohistochemistry of PrPsc Within Bovine Spongiform Encephalopathy Brain Samples with Graded Autolysis." Journal of Histochemistry & Cytochemistry 49, no. 12 (2001): 1519–24. http://dx.doi.org/10.1177/002215540104901205.

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Abstract:
Bovine spongiform encephalopathy (BSE) is a transmissible neurodegenerative disease of cattle. Clinical diagnosis can be confirmed by investigation of both spongiform changes and abnormal prion protein (PrPsc), a marker considered specific for the disease. Tissue autolysis, often unavoidable in routine field cases, is not compatible with histological examination of the brain even though PrPsc is still detectable by immunoblotting. To determine how autolysis might affect accurate diagnosis using PrPsc immunohistochemistry, we studied 50 field samples of BSE brainstem (obex) with various degrees of autolysis. We demonstrated that the antigen-unmasking pretreatments necessary for PrPsc immunohistochemistry were compatible with the preservation of autolyzed brain sections and that PrPsc detection was unaffected by autolysis, even though anatomic markers were sometimes lost. In tissue samples in which anatomic sites were still recognizable, PrPsc accumulation was detected in specific gray matter nuclei. In samples with advanced autolysis, PrPsc deposits were still observed, at least at the cellular level, as an intraneuronal pattern. We found that the sensitivity of PrPsc immunohistochemistry as a diagnostic method for BSE was undiminished even by severe tissue autolysis.
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Shin, Kwang-Soo, Nak-Jung Kwon, Young Hwan Kim, Hee-Soo Park, Gi-Seok Kwon, and Jae-Hyuk Yu. "Differential Roles of the ChiB Chitinase in Autolysis and Cell Death of Aspergillus nidulans." Eukaryotic Cell 8, no. 5 (2009): 738–46. http://dx.doi.org/10.1128/ec.00368-08.

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Abstract:
ABSTRACT Autolysis is a natural event that occurs in most filamentous fungi. Such self-degradation of fungal cells becomes a predominant phenomenon in the absence of the regulator of G protein signaling FlbA in Aspergillus nidulans. Among a number of potential hydrolytic enzymes in the A. nidulans genome, the secreted endochitinase ChiB was shown to play a major role in autolysis. In this report, we investigate the roles of ChiB in fungal autolysis and cell death processes through genetic, biochemical, and cellular analyses using a set of critical mutants. Determination of mycelial mass revealed that, while the flbA deletion (ΔflbA) mutant autolyzed completely after a 3-day incubation, the ΔflbA ΔchiB double mutant escaped from hyphal disintegration. These results indicate that ChiB is necessary for the ΔflbA-induced autolysis. However, importantly, both ΔflbA and ΔflbA ΔchiB strains displayed dramatically reduced cell viability compared to the wild type. These imply that ChiB is dispensable for cell death and that autolysis and cell death are separate processes. Liquid chromatography-tandem mass spectrometry analyses of the proteins that accumulate at high levels in the ΔflbA and ΔflbA ΔchiB mutants identify chitinase (ChiB), dipeptidyl peptidase V (DppV), O-glycosyl compound hydrolase, β-N-acetylhexosaminidase (NagA), and myo-inositol-1-phosphate synthase (InoB). Functional characterization of these four genes reveals that the deletion of nagA results in reduced cell death. A working model bridging G protein signaling and players in autolysis/cell death is proposed.
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Fournier, Bénédicte, and David C. Hooper. "A New Two-Component Regulatory System Involved in Adhesion, Autolysis, and Extracellular Proteolytic Activity ofStaphylococcus aureus." Journal of Bacteriology 182, no. 14 (2000): 3955–64. http://dx.doi.org/10.1128/jb.182.14.3955-3964.2000.

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Abstract:
ABSTRACT A transposition mutant of Staphylococcus aureus was selected from the parent strain MT23142, a derivative of strain 8325. The site of transposition was near the 5′ terminus of the genearlS. ArlS exhibits strong similarities with histidine protein kinases. Sequence analysis suggested that arlSforms an operon with upstream gene arlR. The predicted product of arlR is a member of the OmpR-PhoB family of response regulators. The arlS mutant formed a biofilm on a polystyrene surface unlike the parent strain and the complemented mutant. Biofilm formation was associated with increased primary adherence to polystyrene, whereas cellular adhesion was only slightly decreased. In addition, the arlS mutant exhibited increased autolysis and altered peptidoglycan hydrolase activity compared to the parental strain and to the complemented mutant. As it has been shown for coagulase-negative staphylococci that some autolysins are able to bind polymer surfaces, these data suggest that the two-component regulatory system ArlS-ArlR may control attachment to polymer surfaces by affecting secreted peptidoglycan hydrolase activity. Finally, thearlS mutant showed a dramatic decrease of extracellular proteolytic activity, including serine protease activity, in comparison to the wild-type strain and the complemented mutant, and cells grown in the presence of phenylmethylsulfonyl fluoride (a serine protease inhibitor) showed an increased autolysin activity. Since the locusarlR-arlS strikingly modifies extracellular proteolytic activity, this locus might also be involved in the virulence ofS. aureus.
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Escamez, Sacha, and Hannele Tuominen. "Contribution of cellular autolysis to tissular functions during plant development." Current Opinion in Plant Biology 35 (February 2017): 124–30. http://dx.doi.org/10.1016/j.pbi.2016.11.017.

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Guillen, F., F. Reyes, J. Rodriguez, and C. Vazquez. "Induction of an extracellular cellulase system during autolysis of Alternaria alternata." Transactions of the British Mycological Society 89, no. 1 (1987): 35–39. http://dx.doi.org/10.1016/s0007-1536(87)80054-2.

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Davis, Bill D. "ASSOCIATION OF α-AMYLASE WITH CELLULAR AUTOLYSIS IN PEA STEM TISSUES". American Journal of Botany 72, № 12 (1985): 1902–7. http://dx.doi.org/10.1002/j.1537-2197.1985.tb08463.x.

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Rouslin, W. "Persistence of mitochondrial competence during myocardial autolysis." American Journal of Physiology-Heart and Circulatory Physiology 252, no. 5 (1987): H985—H989. http://dx.doi.org/10.1152/ajpheart.1987.252.5.h985.

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Abstract:
The rate of irreversible loss of mitochondrial phosphorylating respiratory function with NAD-linked substrates during zero flow myocardial autolysis at 37 degrees C was gradual and relatively linear with time, progressing at about 1% of the control activity per minute. State 3 respiratory rates and initial rates of inner membrane potential development dropped off in close parallel with one another as well as with NADH-coenzyme Q (CoQ) reductase activity, suggesting that oxygen uptake as well as membrane potential development were rate limited by the increasing impairment of electron flow through complex I. Although the initial rate of membrane potential development dropped off gradually, the time course for the loss of the ability to ultimately develop and hold a full potential was slower still, there being only a moderate impairment of this ability at 80 min of autolysis. This sustained ability to develop and hold a membrane potential after more than 1 h of autolysis suggested that inner membrane leakiness contributed little or not at all to the functional impairment observed. The irreversible loss of mitochondrial inner membrane competence emerged in these studies as a relatively late development in the sequence of cellular alterations which characterize the myocardial ischemic process.
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Neumar, Robert W., Scott M. Hagle, Donald J. DeGracia, Gary S. Krause та Blaine C. White. "Brain μ-Calpain Autolysis During Global Cerebral Ischemia". Journal of Neurochemistry 66, № 1 (2002): 421–24. http://dx.doi.org/10.1046/j.1471-4159.1996.66010421.x.

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Roy, Rakesh, Ren-In You, Chan-Hua Chang, Chiou-Ying Yang, and Nien-Tsung Lin. "Carboxy-Terminal Processing Protease Controls Production of Outer Membrane Vesicles and Biofilm in Acinetobacter baumannii." Microorganisms 9, no. 6 (2021): 1336. http://dx.doi.org/10.3390/microorganisms9061336.

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Abstract:
Carboxy-terminal processing protease (Ctp) is a serine protease that controls multiple cellular processes through posttranslational modification of proteins. Acinetobacter baumannii ATCC 17978 ctp mutant, namely MR14, is known to cause cell wall defects and autolysis. The objective of this study was to investigate the role of ctp mutation–driven autolysis in regulating biofilms in A. baumannii and to evaluate the vesiculation caused by cell wall defects. We found that in A. baumannii, Ctp is localized in the cytoplasmic membrane, and loss of Ctp function enhances the biofilm-forming ability of A. baumannii. Quantification of the matrix components revealed that extracellular DNA (eDNA) and proteins were the chief constituents of MR14 biofilm, and the transmission electron microscopy further indicated the presence of numerous dead cells compared with ATCC 17978. The large number of MR14 dead cells is potentially the result of compromised outer membrane integrity, as demonstrated by its high sensitivity to sodium dodecyl sulfate (SDS) and ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA). MR14 also exhibited the hypervesiculation phenotype, producing outer-membrane vesicles (OMVs) of large mean size. The MR14 OMVs were more cytotoxic toward A549 cells than ATCC 17978 OMVs. Our overall results indicate that A. baumanniictp negatively controls pathogenic traits through autolysis and OMV biogenesis.
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Dissertations / Theses on the topic "Autolyse cellulaire"

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Jeanson, Sophie. "La maturation du lait dans la fabrication de fromages à pâte pressée cuite : le rôle des lactocoques." Dijon, 2000. http://www.theses.fr/2000DIJOS020.

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Abstract:
Le comté, fromage à pâte pressée cuite, est aujourd'hui, le premier fromage français d'appellation d'origine contrôlée (AOC) par sa production annuelle. La maturation du lait avec ensemencement en lactocoques constitue la première étape de la fabrication. Elle est conduite par les fromagers avec beaucoup d'empirisme par manque de connaissances sur son rôle et son mode d'action. L'objectif de ce travail était de mettre en évidence et de comprendre le rôle des lactocoques au cours de la fabrication. Dans un premier temps, la diversité de souches sauvages de lactocoques, isolées de lait cru et de levains naturels, a été démontrée aux niveaux phénotypique et génotypique. L'étude de leur comportement sur le cycle thermique de type comte a permis de sélectionner des souches de propriétés différentes pour constituer un levain mésophile. Des mini-fabrications de type pate pressée cuite ont été réalisées avec ensemencement ou non de lactocoques pendant la maturation du lait. Elles ont permis de mettre en évidence l'influence des lactocoques sur la croissance des lactobacilles thermophiles (par la réduction de leur temps de latence) et, dans une moindre mesure, sur celle des streptocoques thermophiles, en début de pressage. La consommation (lactose puis glucose et galactose) et la production des sucres (galactose et glucose) se sont révélées plus rapides, voire plus précoces, avec une production concomitante de lactates pendant le pressage du fromage. Cette stimulation des levains thermophiles s'est traduite par une nette accélération de la cinétique d'acidification sous presse quel que soit le niveau de flore indigène du lait. En revanche, l'analyse de la protéolyse au cours de la fabrication n'a pu mettre en évidence aucune modification du lait pendant la maturation du lait ensemence en lactocoques, seule la stimulation de la croissance des lactobacilles thermophiles pendant le pressage semble pouvoir expliquer une augmentation de la protéolyse sous presse. Les investigations pour comprendre le mode d'action des lactocoques ont permis de confirmer que la durée de la maturation du lait module l'effet des lactocoques pendant la fabrication, que la lyse des lactocoques sous presse semble avoir lieu et influencer positivement la croissance des levains thermophiles sans l'expliquer en totalité. Par contre, si la capacité réductrice des lactocoques a été observée sur le lait au cours du cycle thermique type comte, il n'a pu être démontré qu'elle influençait la croissance des lactobacilles thermophiles.
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Fayard, Blandine. "Caractérisation de 69 bactériophages de Streptococcus salivarius subsp. Thermophilus, incluant 10 bactériophages tempérés." Nancy 1, 1993. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/SCD_T_1993_0011_FAYARD.pdf.

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Abstract:
Douze des 118 souches de Streptococcus salivarius subsp. Thermophilus de la collection CNRZ présentent une phase lytique après induction avec la mitomycine C et contiennent des phages actifs. Les phages temperés correspondants ont été multipliés sur des souches indicatrices et comparés à 56 phages isolés comme lytiques. Toutes les souches lysogènes se caractérisent par des propriétés autolytiques, dans certaines conditions de cultures. Du point de vue morphologique, les 69 phages étudiés, temperés ou virulents, appartiennent tous au groupe B de la classification de Bradley (1967) ou a la famille des Siphoviridae de l'International Committee on Taxonomy of Viruses (Matthews, 1982). Les profils protéiques des virions sont de 2 types. Les ADN phagiques sont pour la plupart linéaires, avec des extrémités cohésives et leur taille varie de 35 a 50 kb. Ils présentent un polymorphisme de restriction important. De l'homologie existe entre tous les ADN phagiques, en particulier entre les ADN des phages tempers et ceux des phages virulents. L'étude des interactions phages-bactéries a montré que certaines des souches lysogènes sont sensibles aux surinfections par de nombreux phages et que ces souches remanient alors le génome des phages infectants. Les résultats obtenus suggèrent que les souches lysogènes de S. Salivarius subsp. Thermophilus pourraient jouer un rôle majeur dans la genèse des infections phagiques et dans l'évolution de la population phagique spécifique de ce streptocoque<br>Twelve of the 118 strains of Streptococcus salivarius subsp. Thermophilus of the CNRZ collection exhibited a Iytic phase after mitomycin C induction and contained active phages. The corresponding temperate phages were multiplied on indicator strains and compared to 56 phages isolated as Iytic. All Iysogenic strains were characterized by autolytic properties in certain conditions of culture. Morphologically, the 69 temperate or virulent phages studied all belonged to Bradley's (1967) group B, or to the family of the Siphoviridae of the International Committee on Taxonomy of Viruses (Matthews, 1982). There were 2 types of virion protein profiles. Most phage DNA were linear with cohesive ends, and size varied trom 35 to 50 kb. There was considerable restriction polymorphism. Homology existed among all phage DNA, in particular between the DNA of temperate phages and those of virulent phages. The study of phage-bacteria interactions showed that some Iysogenic strains were sensitive to superinfections by numerous phages and that in this case, these Iysogenic strains rearranged the genome of infecting phages. The results suggest that Iysogenic strains of S. Salivarius subsp thermophilus could play a major role in the genesis of phage infections and in the evolution of the phage population specific to this streptococcus
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Chung, Sook-Hyun. "Contribution à l'étude de la formation des composés volatils au cours de l'autolyse de levures de vinification." Dijon, 1986. http://www.theses.fr/1986DIJOS059.

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Abstract:
Cette étude a été entreprise dans le but de mieux comprendre, et donc de mieux maitriser la qualite organoleptique des vins veilllis sur lies, et eventuellement afin de trouver un moyen d'acélérer ce phénomène. On etudie l'evolution quantitative de l'azote total et soluble, de l'activite proteolytique et des substances volatiles liberees par les levures au cours de l'autolyse. Une etude qualitative et quantitative separee des composes volatils neutres, acides et souffres a ete effectuee en utilisant principalement la chromatographie en phase gazeuse et la spectrometrie de masse commes techniques de separation et d'identification. Dans le but de separer les phenolenes de vieillissement classique et d'autolyse, on utilise deux milieux synthetiques de compositions differentes dans lesquels les levures ont ete ajoutees. L'un est proche du mout et subit une fermentation prealable, alors que l'autre est proche d'un vin blanc sec et contient des levures ajoutees. Les influences d'un ajout d'autolysats obtenus par chauffage à 35° C ou par broyage ainsi que la quantité d'autolysat rajouté ont été systématiquement étudiées.
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Cibik, Recep. "Leuconostocs isolés de fromages traditionnels francais : identification classique et moléculaire, caractérisation biochimique et moléculaire du système autolytique." Dijon, 2000. http://www.theses.fr/2000DIJOS017.

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Abstract:
La diversité moléculaire de 220 souches de leuconostoc a été analysée par rapd. Cinq groupes ont été définis regroupant la majorité des souches étudiées. Cette technique a également permis de distinguer les souches de ln. Citreum. Des séquences d'adnr 16s et des hybridations in situ utilisant une sonde spécifique du genre leuconostoc (sauf ln. Fallax) ont permis i) d'établir une collection de souches correctement identifiées et ii) de confirmer la classification des souches aux profils rapd atypiques. Un test pcr, base sur des amorces spécifiques ciblant les régions variables des adnr 16s, a été développé. Il permet d'identifier rapidement et précisément les souches de ln. Mesenteroides, ln. Citreum, ln. Lactis et w. Paramesenteroides. Le comportement autolytique de 59 souches de leuconostoc a été étudié. Le taux d'autolyse est variable selon les souches et compris entre 7 et 44%. Deux bandes majeures correspondant aux peptidoglycane hydrolases (pgh) ont été détectées par SDS-PAGE renaturante. L'analyse de spécificité a révélé deux types de PGH : une glycosidase et une amidase (ou une peptidase). Le gène (lnmur) de ln citreum 22R, codant pour une PGH, a été clone et séquence. Lnmur a une masse moléculaire de 23,9 kDa et ne possède pas de séquence spécifique permettant son ancrage a son substrat. Une protéine chimère composée de lnmur et de la partie C-terminale de AcmA de L. Lactis a été construite. Cette enzyme est capable de complémenter une mutation de acmA chez l. Lactis.
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Freyssinet, Muriel. "Etude des mécanismes de libération des constituants intracellulaires et pariétaux au cours du processus d'autolyse chez Saccharomyces cerevisiae." Dijon, 1988. http://www.theses.fr/1988DIJOS021.

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Humbert-Goffard, Anne. "Recherches sur les phénomènes enzymatiques intervenant lors de l'élevage des vins." Bordeaux 2, 2003. http://www.theses.fr/2003BOR21076.

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Abstract:
De nombreux phénomènes enzymatiques interviennent au cours de l'élevage des vins. Des expériences d'élevage en milieu modèle ont montré une libération de mannoprotéines et peptides pariétaux au cours de l'autolyse. La libération de ces derniers est favorisée par la présence de préparations enzymatiques industrielles. Les activités enzymatiques impliquées dans ce phénomène sont des protéases acides. Les peptides de bas poids moléculaire (0,5-3 kDa) libérés sont sapides et présents à des concentrations supérieures au seuil de perception. Neuf expérimentations d'élevage sur lies en vin rouge ont été réalisées au cours de ces travaux et quel que soit le protocole employé (quantité de lies, d'enzymes, moment de leur addition), l'analyse de la couleur, des polyphénols et la dégustation n'ont révélé aucune différence. L'absence d'effet des enzymes exogènes est en partie due à une inhibition totale des activités β-1,3-glucanase et protéases en moins de 30 jours. Une expérimentation en vin blanc réalisée en présence d'une quantité d'enzyme 10 fois supérieure à celle généralement utilisée a permis de mettre en évidence une libération plus importante de mannoprotéines et de peptides. Dans ces conditions particulières, l'addition de préparations à forte activité protéolytique contribue à modifier les caractéristiques organoleptiques de ce vin blanc. D'autre part, l'effet de préparations enzymatiques exogènes et d'activités purifiées issus d'A. Niger ou de T. Harzianum sur la clarification et la filtrabilité de vins blanc et rouge a été mesuré. Le rôle des pectinases et éventuellement d'autres activités secondaires issues d'A. Niger comme celui de la β-1,3-glucanase de T. Harzianum est prépondérant dans l'amélioration de ces phénomènes. La protéase ou d'autres activités secondaires issues de T. Harzianum sont également impliquées dans l'amélioration de la filtrabilité mais sans effet sur la sédimentation<br>Many enzymatic phenomena intervene during wine ageing. The autolysis experiments in synthetic medium showed the release of mannoproteins and parietal peptides. The release of the latter is enhanced by the presence of industrial enzymatic preparations. The enzymatic activities implied in this phenomenon are acid proteases. Peptides of low molecular weights (0,5-3 kDa) that are released have taste and are present at higher concentrations than their sensory treshold. Nine experiments of red wine aged on lees red were carried out during this work and whatever the protocol employed (quantity of lees or enzymes, positioning of their addition), the analysis of the color, polyphenols and tasting did not reveal any difference. The absence of effect of the exogenic enzymes is partly due to a total inhibition of the β-1,3-glucanase activities and proteases in less than 30 days. A white wine experimentation realized in the presence of a quantity of enzyme 10 times higher thanthat generally used made it possible to highlight a more important release of mannoproteins and peptides. Under these partcular conditions, the addition of preparations with strong proteolytic activity contributes to modify the organoleptic characteristics of this white wine. In addition, the effect of exogenic enzymatic preparations and purified activities from A. Niger or T. Harzianum on the clarification and the filterability of white and red wines was measured. The role of the pectinases and possibly of other secondary activities resulting from A. Niger or β -1,3-glucanase of T. Harzianum are dominating in the improvement of these phenomena. The protease of other secondary activities of T. Harzanium are also implied in the improvement of filterability but have no effects on sedimentation
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Izard, Anne. "Expression de l'autolyse cellulaire chez clostridium acetobutylicum atcc 824 : influence des autolysines, des proteases et des alcools." Toulouse, INSA, 1988. http://www.theses.fr/1988ISAT0019.

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Leroy, Marie-Josée. "Incidence de la nature des souches de levure et des conditions de préparation des levains sur les phénomènes d'autolyse dans le champagne." Dijon, 1986. http://www.theses.fr/1986DIJOS044.

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Abstract:
Autolyse des levures au cours de leur vieillissement dans le champagne accompagnée par un enrichissement du vin en matières azotées. Certaines souches de levure s'autolysent plus facilement et permettent un vieillissement plus rapide du vin (saccharomyces cerevisiae, souche 001, par exemple). Accélération de l'autolyse si la préparation du levain se fait sur vin, en semi anaérobiose, en présence de phosphate diammonique et si les levures sont prélevées en phase stationnaire de croissance. Accélération du vieillissement des vins si des cellules agées ou des broyats de levures sont ajoutés au moment de la mise en bouteilles. Autolyse accélérée des levures, produite in vitro, en présence d'ethanol, met en évidence un appauvrissement en matières azotées, et un enrichissement en sucres des parois de levures et l'apparition d'une activité protéosique intracellulaire dosée à pH 3,7.
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Soucaille, Philippe. "Physiologie et biochimie des autobactériocines de Clostridium acetobutylicum ATCC 824." Toulouse, INSA, 1990. http://www.theses.fr/1990ISAT0016.

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Abstract:
L'inhibition de clostridium acetobutylium atcc 824 par ses autobacteriocines a ete etudiee. Ces dernieres sont produites en fin de phase exponentielle de croissance et affectent la concentration cellulaire maximale et la vitesse de lyse en fin de culture. Les autobacteriocines ont ete purifiees et caracterisees. Il s'agit d'une amylase et d'une enzyme lytique. L'amylase est une endo--amylase a calcium qui n'est pas inhibitrice de croissance dans les conditions normales de culture en milieu liquide. L'enzyme lytique est une muramidase dont l'activite est strictement dependante de la non-acetylation du peptidoglycane. Elle possede une forte affinite pour les parois de c. Acetobutylicum debarrassees totalement ou en partie de leur proteines. L'autolysine impliquee dans l'autolyse cellulaire du microorganisme a ete purifiee et identifiee a la muramidase extracellulaire. L'etude de l'effet des cations sur l'autolyse cellulaire, conjugue a l'inhibition de l'activite autolytique par les acides lipoteichoiques purifies ont permis de proposer un mecanisme de regulation in vivo du systeme autolytique. Ce mecanisme est en accord avec les resultats obtenus lors de cultures discontinues et continues realises en presence d'exces de cations bivalents. De telles cultures qui conduisent a une faible concentration en autolysines extracellulaires permettent d'ameliorer les performances de la fermentation acetonobutylique
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El, Meouche Imane. "Etude du régulateur transcriptionnel SigmaD chez Clostridium difficile." Rouen, 2014. http://www.theses.fr/2014ROUES008.

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Abstract:
La principale partie de ce travail porte sur l'étude du facteur SigD de C. Difficile et de son implication dans la régulation de l'autolyse, de la mobilité et de la production de ses deux facteurs majeurs de virulence, les toxines A et B. Nous avons pu montrer, par inactivation du gène sigD, que SigD régule positivement la mobilité de C. Difficile mais n'affecte pas, ou peu son autolyse. Le régulon global de SigD a été ensuite déterminé par une analyse transcriptonique en microarrays. Parmi les gènes sous-exprimés chez le mutant du gène sigD, nous retrouvons les gènes flagellaires tardifs, les gènes des toxines A et B et le gène de leur régulateur TcdR. Nous avons pu identifier des promoteurs SigD-dépendants notamment en amont des gènes de la flagelline FliC, de l'anti-SigD FlgM et deTcdR. De plus, nous avons prouvé que SigD se lie avec l'ARN polymérase pour démarrer la transcription de tcdR, dont il est un régulateur direct. Par ailleurs, nous avons identifié une séquence consensus propre au régulateur SigD chez C. Difficile. Enfin, nous avons déterminé le rôle antagoniste de FlgM, l'anti-SigD, dans la répression des gènes SigD dépendants. SigD s'avère être un régulateur positif et direct de la mobilité et de la synthèse des toxines chez C. Difficile. Une partie complémentaire du travail s'intéresse aux autolysines Acd et Cwp19 de C. Difficile. Des mutants simples des gènes acd et cwp19 ont permis de montrer que seule Cwp19 intervient dans l'autolyse de C. Difficile en présence du TritonX-100. Cette autolysine est impliquée dans la lyse à long terme chez C. Difficile. Un double mutant acd-cwp19 semble avoir le même profil autolytique que le simple mutant cwp19. La glucosaminidase Acd ne semble donc pas avoir une implication majeure dans l'autolyse de C. Difficile. Des analyses complémentaires en cours de réalisation permettront de déterminer l'activité enzymatique de l'autolysine Cwp19<br>The main part of this work focuses on the characterization of the C. Difficile SigD factor and its role in the regulation of autolysis, motility and production of the two major virulence factors, toxins A and B. After the inactivation of sigD, we show that SigD factor positively controls C. Difficile motility whereas its contribution to the autolysis, if any, is modest. The global regulon of SigD was then determined by transcriptonic analysis using microarrays. Among the down-regulated genes in the sigD mutant strain, we find the late flagellar genes, the genes encoding toxins A and B and the gene encoding their regulator TcdR. We could identify SigD-dependent promoters upstream many genes including those encoding the flagellin FliC, the anti-SigD FlgM, and TcdR. In addition, we proved that SigD binds with RNA polymerase to initiate the transcription of tcdR. Furthermore, we identified a specific SigD-dependent consensus sequence in C. Difficile. Finally, we determined the antagonistic role of FlgM, the anti-SigD, in the repression of SigD-dependent genes. We prove that SigD is a positive and direct regulator of motility and toxin synthesis in C. Difficile. Another part of the work focuses on the autolysins Cwp19 and Acd of C. Difficile. Single mutants for acd and cwp19 genes showed that only Cwp-19 is involved in the long-term lysis of C. Difficile. A double-mutant acd-cwp19 seems to have the same autolytic profile as cwp19 single mutant. The glucosaminidase Acd does not seem to have a major involvement in autolysis of C. Difficile. Additional analyzes are in progress to determine the enzymatic activity of the Cwp19 autolysin
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