Dissertations / Theses: 'Biopelículas'

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Abarca, Grau Ana María. "Biopelículas en Agrobacterium spp." Doctoral thesis, Universitat Politècnica de València, 2011. http://hdl.handle.net/10251/11670.

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Abstract:

Diversas especies del género Agrobacterium producen tumores en gran cantidad de plantas cultivadas, causando la enfermedad conocida en inglés como "crown gall". En esta tesis se ha demostrado que cepas patógenas y no patógenas de las especies A. tumefaciens, A. rhizogenes y A. vitis son capaces de formar biopelículas tanto sobre superficies inertes como sobre raíces de tomate. Las cepas de A. tumefaciens y A. vitis se unieron a poliestireno y polipropileno, mientras que las de A. rhizogenes sólo se unieron a polipropileno. Se ha constatado que la formación de biopelículas in vitro sobre superficies abióticas en Agrobacterium spp. depende de la especie (biovar), la superficie y las condiciones de cultivo. Mediante microscopía electrónica de barrido y microscopía láser confocal, utilizando cepas marcadas con GFP, se demostró que las tres especies formaban estructuras complejas compuestas por numerosas células bacterianas dispuestas según alguno de los siguientes modelos: 1) tapices densos y continuos, 2) grandes agregados irregulares embebidos en material extracelular, o 3) en forma de setas globulares atravesadas internamente por canales. Los resultados sugieren que la formación de biopelículas puede estar asociada a la colonización y supervivencia de estas especies bacterianas en la rizosfera. Además, la capacidad del agente de biocontrol A. rhizogenes K84 de formar biopelículas durante su interacción con la planta podría ser una característica relevante para el control de la enfermedad. Con el propósito de ahondar y conocer genes implicados en la formación de biopelículas en este agente de biocontrol se han utilizado dos estrategias. Mediante genética clásica, se analizó una librería de mutantes al azar de la cepa K84 y se identificaron dos mutantes afectados en la formación de biopelículas. Uno fue incapaz de unirse y formar biopelículas sobre polipropileno, pero por el contrario se unió y formó biopelículas sobre ápices radiculares. El otro mutante produjo más biopelícula que la cepa K84, tanto en superficie abiótica como en ápices radiculares.
Abarca Grau, AM. (2011). Biopelículas en Agrobacterium spp [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/11670
Palancia

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Cabezas, Alvarez Camila Victoria. "Modelación de Biopelículas de Microorganismos para Lixiviación de Minerales." Tesis, Universidad de Chile, 2011. http://www.repositorio.uchile.cl/handle/2250/104099.

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Abstract:

La biolixiviación de minerales de cobre es un proceso que ha sido ampliamente estudiado debido principalmente a la importancia económica que tiene el optimizar este tipo de procesos para así lograr una mayor recuperación del mineral deseado. El mineral sulfurado de cobre más abundante es la calcopirita, pero a su vez el más difícil de lixiviar: la acumulación de partículas insolubles sobre la superficie del mineral produce la formación de una capa impermeable, la cual impide la correcta difusión de los compuestos lixiviantes hacia el mineral, volviéndola ineficiente. Un estudio anterior realizado en nuestro laboratorio, “Non-Homogeneous Biofilm Modeling Applied to Bioleaching Processes” [1], estudia el fenómeno de acumulación de partículas de azufre insolubles sobre la superficie del mineral y sus consecuencias en la biolixiviación del mineral. Sin embargo, no toma en cuenta la precipitación de otro compuesto insoluble: la jarosita. El objetivo de este trabajo es estudiar el fenómeno de precipitación de jarosita sobre la superficie, específicamente, de calcopirita y analizar el efecto que podría tener en la biolixiviación la formación de una capa impermeable de este compuesto. Para esto se incorporan al modelo ya estudiado las variables que definen este fenómeno, tal como los compuestos involucrados y reacciones con sus respectivos parámetros. Lo primero que se debió analizar fue el fenómeno de precipitación de jarosita. De esta forma los resultados obtenidos pueden ser comparados con curvas experimentales y así realizar los ajustes de parámetros que sean necesarios en el modelo para lograr obtener curvas similares. Los resultados obtenidos muestran una clara tendencia en el crecimiento de la capa de jarosita sobre la superficie del mineral y en la mayoría de las curvas puede observarse la ausencia de una “etapa inicial”. En algunos casos no se logró llegar a la “etapa estacionaria” debido a la larga duración de la “etapa de crecimiento”. Sin embargo fue posible obtener curvas similares a la teórica en términos de duración del fenómeno, las cuales fueron utilizadas para llevar a cabo las simulaciones incorporando la acumulación de azufre y formación de la biopelícula de microorganismos. Se observó la relevancia del parámetro constante k en la obtención de distintos resultados. La variación en su orden de magnitud permitió obtener curvas muy distintas unas de otras. En el caso de los tres fenómenos ocurriendo simultáneamente, se tiene que la precipitación de jarosita se incrementa al momento que las bacterias se van multiplicando. Se cree que esto puede deberse a la presencia de ión Fe3+ en los alrededores de estas, el cual es utilizado por la cinética de formación de jarosita.

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Damas, Rossana Cristóbal. "Influencia de la N-acetilcisteína en la prevención de la formación y remoción de las biopelículas de Pseudomonas aeuriginosa." Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Programa Cybertesis PERÚ, 2007. http://www.cybertesis.edu.pe/sisbib/2007/cristobal_dr/html/index-frames.html.

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Abstract:

Pseudomonas aeruginosa, es uno de los más importantes patógenos humanos oportunistas, que puede colonizar no solo superficies abióticas, sino también superficies bióticas. Una vez colonizadas estas superficies, dicha bacteria produce exopolisacárido originando la formación de biopelículas, en consecuencia, estas bacterias son mil veces más resistentes, no sólo a antibióticos, sino también a biocidas y desinfectantes, constituyendo un problema de salud pública. Para este trabajo de investigación se recolectaron 62 cepas aisladas de líquidos biológicos y secreciones de pacientes procedentes del Hospital Nacional Edgardo Rebagliati Martins durante el periodo de Enero a Setiembre del 2006, identificándose el 100% de ellas como cepas de Pseudomonas aeruginosa. Sólo se escogió el 81% de las cepas formadoras de biopelículas para investigar la influencia del mucolítico NAC sobre las biopelículas de Pseudomonas aeruginosa, ya que éstas presentaron mayor producción durante la cuantificación realizada por el Método de O’Toole and Kolter
Pseudomonas aeruginosa, is one of the most important human pathogens opportunistic, that can colonizes not only abiotics surfaces, also biotics surfaces. Once colonized these surfaces produce extracellular polysaccharides originating the biofilms formation, in consequence, these bacterias are thousand times more resistant to antibiotics, biocides and desinfectants, constituting a problem of public health. For this study, were collected 62 strains isolated from biological fluids and secretions of patients from the Edgardo Rebagliati Martins National Hospital during the period from January to September 2006, indentifying 100% of them like Pseudomonas aeruginosa strains. The determination of biofilm production we preferred to use Congo Red Agar Method (ARC), for its sensibility and reproducibility which showed that 42% were biofilm producers, whereas 48% were biofilm non developed. Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027 (non producer) were used as negative control. Only the 81% of them was chosen to investigate the influence of mucolitic N-acetylcysteine (NAC) on Pseudomonas aeruginosa biofilms, by the biggest biofim production during the quantification by O’Toole and Kolter Method

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Peña, Pascual Catalina Elizabeth. "Detección y caracterización de las biopelículas formadas por cepas de Salmonella enterica aisladas desde distintos hospederos en Chile." Tesis, Universidad de Chile, 2014. http://repositorio.uchile.cl/handle/2250/131998.

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Abstract:

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario
Salmonella spp. es el agente etiológico de la salmonelosis, enfermedad entérica transmitida principalmente por los alimentos. Este patógeno está ampliamente difundido en el medio ambiente y anualmente infecta a millones de animales y personas en todo el mundo. Salmonella es capaz de establecerse en un estado de biopelícula, el que se caracteriza por ser una comunidad de células de una o varias especies protegidas por sustancias poliméricas extracelulares (EPS) autogeneradas y fijadas a una superficie inerte o un tejido vivo. Las biopelículas son de gran importancia pues permiten la persistencia de los patógenos tanto dentro del hospedero como en el medio ambiente. El objetivo de este trabajo fue caracterizar la formación de biopelículas de los diferentes serotipos de S. enterica aisladas de distintos hospederos en Chile. Se cuantificó la formación de biopelículas por medio del método colorimétrico de titulación en placa y a través del coeficiente de correlación de Pearson's se estableció si las características de expresión fenotípica de las biopelículas tenían relación con la capacidad de supervivencia a condiciones de estrés, de las cepas en estado planctónico. Como resultado no se encontró una asociación significativa entre hospedero, serotipos y formación de biopelícula. Las propiedades de supervivencia a condiciones de estrés de las cepas de S. enterica ser. Enteritidis en estado de vida libre fueron independientes de la formación de biopelículas. Junto a esto, se estudió el fenotipo expresados por las cepas en placas de agar. Para observar la producción de fimbrias curli y celulosa se usaron placas de agar con tinción de Rojo Congo y Azul de Comassie, mientras que para determinar la expresión de ácido colánico se utilizaron placas de agar con tinción de Calcofluor. Este análisis evidencio que el morfotipo BDAR (café, seco y rugoso) que expresa fimbiras curli pero no celulosa es ampliamente expresado por los serotipos S. Agona (83%), S. Havana (60%), S. Infantis (57%) y S. Heidelberg (83%). Esto podría indicar que este morfotipo, relativamente poco estudiado, puede estar siendo expresado ampliamente por las cepas de Salmonella no Enteritidis en el medio ambiente. vi Mientras que los serotipos S. Agona, S. Anatum, S. Enteritidis, S. Havana, S. Heidelberg y S. Infantis resultaron positivos a ácido colánico. Lo que les otorgaría a estas cepas una mayor capacidad para formar biopelículas sobre células epiteliales. Palabras claves: Salmonella, Serotipo, Biopelícula, Morfotipo, Sustancias poliméricas extracelulares (EPS).
Fondo de Apoyo a la Investigación Universidad Autónoma 2013

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MONROY, GONZÁLEZ DIEGO ERNESTO. "ELABORACIÓN DE UNA BIOPELÍCULA ACTIVA COMESTIBLE CON CAPACIDAD ANTIMICROBIANA QUE AUMENTE LA VIDA DE ANAQUEL EN PESCADO FRESCO A PARTIR DE COLÁGENO." Tesis de Licenciatura, UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DEL ESTADO DE MÉXICO, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11799/104910.

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Abstract:

I RESUMEN La presente investigación se llevó a cabo en dos etapas la primera consistió en el desarrollo de una biopelícula activa con extracto de ajo (All i um sativum) como antimicrobiano, a base de colágeno extraído de residuos de pescado. La segunda etapa , consistió en la aplicación de la biopelícula al filetes de pescado y evaluación en vida de anaquel, para determinar el efecto sobre características físicas y microbiológicas del pescado fresco. Se realizó un análisis microbiológico a cuatro tratamientos. El tratamiento 1 (T1), estuvo representado por pescado sin recubrir. El tratamiento 2 (T2) representado por pescado recubierto con película sin antimicrobiano. El tratamiento 3 (T3), representado por pescado recubierto con biopelícula activa con extracto d e ajo ( Allium sativum ). El tratamiento 4 (T4), representado por pescado recubierto con película plástica comercial. Se realizó la determinación de Mesófilos Aerobios, psicotróficos y Coliformes Totales, de acuerdo con las Normas Oficiales Mexicanas NOM - 11 0 - SSA1 - 1994, NOM - 092 - SSA1 - 1994, aunado a lo anterior, se llevó a cabo la medición de pH y color durante 12 días Y 5 días de medición. Los resultados obtenidos mostraron que el T3 representado por pescado recubierto con biopelícula activa, fue el mejor tra tamiento para el experimento mostrando diferencias significativas ( P ≤0.05) en todas las pruebas, comprobando la hipótesis inicial que una biopelícula activa a base de colágeno activa con extracto de ajo como agente antimicrobiano permite aumentar la vida de anaquel del pescado fresco

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Guimerà, Villalba Xavier. "Diseño, caracterización y aplicación de microelectrodos para el estudio de biopelículas sulfuroxidantes." Doctoral thesis, Universitat Politècnica de Catalunya, 2016. http://hdl.handle.net/10803/396633.

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Abstract:

This thesis is focused on the development of microsensors specially designed for biofilms monitoring and on the application of these devices to study and characterize different biofilms. Using micro-electromechanical systems (MEMS) technology, an amperometric microsensor for DO monitoring, which improves the performance of the available microsensors, has been designed, constructed and validated. The multi-electrode design of these device, allows to obtain simultaneous information about dissolved oxygen (DO) concentration at 8 different depths through a biofilm, with an excellent DO sensitivity and a high spatial resolution (<50 µm). The high robustness exhibited by the microsensor has been exploited for the monitoring of biotrickling filters, obtaining instantaneous information of DO concentration inside biofilms. Heterotrophic biofilms monitoring has served to quantify mass transport rates within biofilms. These results have been used to increase the knowledge of mechanisms involved in these processes and to establish the relationship between mass transport mechanisms, hydrodynamic conditions and biofilm structure. The information obtained in these studies highlighted how important is to include biofilms heterogeneity in mass transport description, and has been used in the development of two correlations for the estimation of mass transport rate within biofilms. Biofilms monitoring has been also used in the development of specific kinetic models to replace those developed in suspension cultures, used conventionally to describe biofilms activity. From DO, H2S and pH recorded profiles was possible to calibrate kinetic models, which accurately described the activity of heterotrophic and sulfuroxidizing biofilms. Microsensors measurements proved to be an excellent tool to validate biofiltration models and to more accurately predict their behaviour from the characterization of mass transport and biokinetic. Results obtained during the simulations revealed that using microsensors measurements within biofilms, as central elements of bioprocess, increase the thoroughness and the ability to accurately predict the behavior of biofilms. The developed methodology allowed to design a novel MEMS microsensor, based on DO microsensor, integrating into a single device DO and pH measurement. The design and construction of the firts prototype was modified to include a second microelectrodes array to potentiometric pH detection, and some improvements. The reduction of microsensors dimensions and the protection of microelectrodes reduced biofilm perturbations during needle insertion and increased sensor response stability. These improvements place the microsensor as a powerful tool, and as an alternative to conventional monitoring systems, allowing obtaining simultaneous spatial and temporal information within low thickness biofilms.
Esta tesis se centra en el desarrollo de nuevos microsensores diseñados específicamente para la monitorización de biopelículas y en su aplicación para el estudio y caracterización de biopelículas de diferente origen (heterótrofas y autótrofas). Utilizando tecnología de sistemas micro-electromecánicos se ha diseñado, fabricado y validado un microsensor amperométrico para la detección del oxígeno disuelto (OD), que mejora las prestaciones de los microsensores disponibles. El diseño multi-electrodo de este dispositivo permite obtener información simultánea de la concentración de OD en 8 puntos diferentes a lo largo de una biopelículas, con una excelente sensibilidad para la detección del OD y una elevada resolución espacial (<50 µm). La elevada robustez que presenta este tipo de dispositivos ha sido aprovechada para monitorizar biofiltros percoladores, obteniendo información a tiempo real de la concentración de OD en el interior de las biopelículas. La monitorización de las biopelículas heterótrofas ha servido para cuantificar en su interior las velocidades de transporte de materia. Estos resultados han sido utilizados para incrementar el conocimiento sobre los mecanismos que intervienen en estos procesos y para establecer la relación entre estos mecanismos, las condiciones hidrodinámicas del sistema y la estructura de la biopelícula. La información obtenida en estos estudios ha demostrado la importancia de incluir la heterogeneidad de las biopelículas en la descripción del transporte de materia, y ha sido utilizada para desarrollar dos correlaciones para la estimación de las velocidades de transporte de materia en el interior de las biopelículas estudiadas. La monitorización de biopelículas también se ha utilizado para desarrollar modelos cinéticos específicos para sustituir los modelos desarrollados en cultivos en suspensión, utilizados tradicionalmente para describir la actividad de biopelículas. A partir de la adquisición de perfiles de OD, H2S y pH en el interior de biopelículas ha sido posible calibrar modelos cinéticos que describen con precisión la actividad de microorganismos en el interior de biopelículas heterótrofas y sulfuroxidantes. Las medidas obtenidas con microsensores demostraron ser una excelente herramienta para validar los modelos de biofiltración y predecir con mayor precisión su comportamiento a partir de la caracterización del transporte de materia y la biocinética. Los resultados obtenidos en la simulación demostraron que la utilización de medidas directas en el interior de biopelículas, como elementos centrales del proceso biotecnológico, aumenta la rigurosidad de los modelos de biofiltración. La metodología desarrollada permitió diseñar un nuevo microsensor MEMS, basado en el de OD, que incorporó en un solo dispositivo la medida de OD y pH. El diseño y la fabricación del primer prototipo se modificaron para incluir una segunda matriz de electrodos para la detección potenciométrica del pH y para incorporar mejoras. La reducción de las dimensiones del microsensor y la protección de los electrodos hizo menos invasiva su medida y aumentó la estabilidad de su respuesta. Estas mejoras sitúan el microsensor como una herramienta de gran potencial, alternativa a los sistemas de monitorización convencionales, que permite obtener información simultánea espacial y temporal de la concentración de OD y pH en el interior de biopelículas con bajo grosor

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Cristobal, Damas Rossana. "Influencia de la N-acetilcisteína en la prevención de la formación y remoción de las biopelículas de Pseudomonas aeuriginosa." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2007. https://hdl.handle.net/20.500.12672/2871.

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Abstract:

Pseudomonas aeruginosa, es uno de los más importantes patógenos humanos oportunistas, que puede colonizar no solo superficies abióticas, sino también superficies bióticas. Una vez colonizadas estas superficies, dicha bacteria produce exopolisacárido originando la formación de biopelículas, en consecuencia, estas bacterias son mil veces más resistentes, no sólo a antibióticos, sino también a biocidas y desinfectantes, constituyendo un problema de salud pública. Para este trabajo de investigación se recolectaron 62 cepas aisladas de líquidos biológicos y secreciones de pacientes procedentes del Hospital Nacional Edgardo Rebagliati Martins durante el periodo de Enero a Setiembre del 2006, identificándose el 100% de ellas como cepas de Pseudomonas aeruginosa. Sólo se escogió el 81% de las cepas formadoras de biopelículas para investigar la influencia del mucolítico NAC sobre las biopelículas de Pseudomonas aeruginosa, ya que éstas presentaron mayor producción durante la cuantificación realizada por el Método de O’Toole and Kolter.
Pseudomonas aeruginosa, is one of the most important human pathogens opportunistic, that can colonizes not only abiotics surfaces, also biotics surfaces. Once colonized these surfaces produce extracellular polysaccharides originating the biofilms formation, in consequence, these bacterias are thousand times more resistant to antibiotics, biocides and desinfectants, constituting a problem of public health. For this study, were collected 62 strains isolated from biological fluids and secretions of patients from the Edgardo Rebagliati Martins National Hospital during the period from January to September 2006, indentifying 100% of them like Pseudomonas aeruginosa strains. The determination of biofilm production we preferred to use Congo Red Agar Method (ARC), for its sensibility and reproducibility which showed that 42% were biofilm producers, whereas 48% were biofilm non developed. Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027 (non producer) were used as negative control. Only the 81% of them was chosen to investigate the influence of mucolitic N-acetylcysteine (NAC) on Pseudomonas aeruginosa biofilms, by the biggest biofim production during the quantification by O’Toole and Kolter Method.
Tesis

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San, Martín Galindo Paola Marina. "Identificación de nuevos poliquétidos anti-biopelículas de la clase de compuestos de piranonaftoquinonas." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2016. https://hdl.handle.net/20.500.12672/5257.

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Abstract:

Publicación a texto completo no autorizada por el autor
Evalúa e identifica nuevos poliquétidos de la clase de compuestos de piranonaftoquinonas (PNQs), de las especies de Streptomyces, con potencial contra biopelículas de Staphylococcus aureus. Determina el potencial antimicrobiano de los compuestos contra las células planctónicas y biopelículas a través de la tinción de viabilidad con base de tinte redox. La eficacia anti-biopelícula es confirmada por el recuento de viabilidad (Logaritmo de reducción). La alnumicina D resulta ser el más potente poliquétido de PNQ anti-biopelícula dentro del grupo de las alnumicinas. Es importante resaltar que la alnumicina D es un compuesto derivado de la ruta biosintética de las PNQs y que el producto final, alnumicina A, no muestra actividad significativa anti-biopelícula; así también, se observa que la presencia de la poco frecuente unidad C-ribosil en la forma de piranosa es esencial para presentar elevado potencial en el grupo de las alnumicinas. Por otro lado, la medermicina, compuesto glicosilado con una unidad de aminoazúcar cargada y derivada de glucosa, no presenta elevada actividad anti-biopelícula en comparación con su unidad de aglicona kalafungina. La granaticina B exhibe similar potencial anti-biopelícula que la alnumicina D y además ambas comparten características estructurales como el de no poseer carga, ser glicosilados y mostrar similar patrón de oxigenación. En consecuencia, estos hallazgos resaltan la ruta biosintética de los antibióticos como potencial fuente de efectivos compuestos anti-biopelículas.
Tesis

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Escobar, Guadarrama José Aldo. "Elaboración y caracterización de biopelículas elaboradas con quitosano y adicionadas con partículas de almidón." Tesis de Licenciatura, Universidad Autónoma del Estado de México, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11799/109321.

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Abstract:

Este documento es un trabajo de tesis correspondiente a la Licenciatura en Biotecnología
En los últimos años, la contaminación ambiental resultante de los materiales derivados de petróleo se ha convertido en un grave problema a nivel mundial, gran parte es debida a la cantidad de materiales y empaques de las diferentes industrias principalmente la alimenticia. Materiales tales como poliestireno (PS), polietileno (PE), polipropileno (PP) y el tereftalato de polietileno (PET) se han utilizado ampliamente en las industrias de alimentos y envases. Estos materiales requieren cientos de años para degradarse en compuestos básicos. En la actualidad, se están realizando esfuerzos en el diseño de películas a base de productos orgánicos, que brinden propiedades de barrera y que mantengan la calidad de los productos. A grandes rasgos el desarrollo y aplicación específica de biopelículas es un reto, ya que estas no pueden ser usadas de forma universal. Entre los materiales más utilizados para el desarrollo de las películas se encuentran los polisacáridos, como gomas, almidones, quitosano, carrageninas, proteínas, etc. El quitosano es el segundo polisacárido más abundante que se encuentra en la naturaleza, tiene características de biocompatibilidad, biodegradabilidad y actividad antimicrobiana, que son de gran interés en los empaques alimenticios. Debido a sus propiedades de formación de película y su carácter antimicrobiano, el quitosano es un material potencialmente útil en el embalaje de alimentos. Sin embargo, las biopelículas presentan propiedades físicas y mecánicas que deben mejorarse para competir con los polímeros derivados del petróleo. Actualmente se están investigando combinaciones de polisacáridos y plastificantes para mejorar dichas características. El objetivo del presente proyecto de tesis fue la elaboración y caracterización de biopelículas hechas a base de quitosano adicionadas con partículas de almidón de maíz. Para ello se procedió a la elaboración de las películas, a la obtención de las partículas de almidón de maíz, para posteriormente evaluar las propiedades físicas, ópticas y mecánicas de las diferentes formulaciones que se analizaron. Las biopelículas resultantes fueron translúcidas, la adición de las partículas de almidón de maíz en la formulación provocó que el porcentaje de solubilidad en agua de la biopelícula disminuyera este valor de 61.44% a 56.17%. Las propiedades físicas y mecánicas de las biopelículas obtenidas fueron aceptables comparadas con las reportadas en estudios donde usaron quitosano y almidón de maíz. El análisis de color mostró que la adición de partículas de almidón de maíz en las biopelículas provoca diferencias significativas en la coordenada b* teniendo una influencia hacia el color azul o amarillo de las biopelículas. La microscopía óptica mostró que la adición de partículas de almidón de maíz provocó irregularidades en las biopelículas debido a la aglomeración de las mismas. Al aumentar la concentración de partículas aumentaron las irregularidades, sin embargo, esto no tuvo un efecto significativo en el espesor de las biopelículas, estas fueron delgadas y homogéneas de 0.05 mm de espesor. Las propiedades mecánicas indicaron que la adición de partículas de almidón disminuye la resistencia a la tracción de 5 MPa hasta 4.3 MPa de las biopelículas. Esto significa que la adición de las partículas de almidón hace que las biopelículas se estiren menos y se rompan con menor fuerza aplicada.
No aplica

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Navea, Pérez Helen Makarena. "Evaluación de polisacáridos capsulares, de la formación de biofilm y de la invasión celular en cepas de Staphylococcus aureus aisladas de vacas con mastitis persistentes y transitorias." Tesis, Universidad de Chile, 2019. http://repositorio.uchile.cl/handle/2250/171006.

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Abstract:

Tesis para optar al Grado de Magíster en Ciencias Animales y Veterinarias
La mastitis bovina es la enfermedad de mayor prevalencia en la industria lechera y la de mayor importancia, ya que provoca enormes pérdidas económicas que oscilan entre el 30 y el 70% de las pérdidas totales. El principal problema a nivel productivo está representado por la mastitis subclínica, la cual tiende a la persistencia o cronicidad, y a ser refractaria a tratamiento antibiótico. Este tipo de mastitis es comúnmente causado por Staphylococcus aureus y suele ser la forma de presentación más frecuente en los planteles lecheros a nivel mundial. El objetivo de esta tesis fue determinar diferencias entre cepas de S. aureus provenientes de vacas con mastitis persistentes y de vacas con mastitis transitorias respecto a su capacidad de formación de biofilm e invasión celular, y a su genotipificación capsular. Para ello, se seleccionaron aislados provenientes de mastitis bovinas persistentes y transitorias, que fueron caracterizados según su perfil de resistencia a antibióticos y tipificados mediante la técnica de Electroforesis en Campo Pulsado (Pulsed-Field). Se evaluó in vitro la formación de biofilm en placas de 96 pocillos y la invasión celular con células MAC-T. La genotipificación capsular (cap5-cap8) de las cepas se llevó a cabo mediante técnica de PCR. Además, mediante esta misma técnica se realizó la detección de los genes implicados en la formación de biofilm e invasión celular (operón icaADBC, bap, fnbA, fnbB). Se lograron identificar aislados de S. aureus persistentes y transitorios (n=30) en la glándula mamaria bovina mediante PFGE. Dichos aislados se agruparon en diferentes pulsotipos, demostrando una elevada diversidad genética, y en general fueron sensibles a todos los antibióticos ensayados (n=12), incluída la meticilina. El gen cap5 fue el de mayor frecuencia, pesquisándose en todas las cepas provenientes de vacas con mastitis persistentes y en una cepa proveniente de una vaca con mastitis transitoria; el resto de las cepas fueron “no tipificables”. Todas las cepas analizadas fueron capaces de formar biofilm, sin embargo, las cepas de S. aureus provenientes de vacas con mastitis persistentes formaron mayor cantidad de biofilm que las cepas de S. aureus provenientes de vacas con mastitis transitorias. En paralelo, todas las cepas fueron capaces de invadir células MAC-T, sin embargo, esta última capacidad fue baja en general y no se asoció con la manifestación de la mastitis o con el origen de las cepas (cepas provenientes de vacas con mastitis persistentes o mastitis transitorias). En conclusión, las cepas de S. aureus provenientes de vacas con mastitis persistentes codificaron en su genoma el gen cap5 y formaron mayor cantidad de biofilm que las cepas de S. aureus provenientes de vacas con mastitis transitorias
Bovine mastitis is the most prevalent and important disease in the dairy industry, since it causes huge economic losses ranging among 30 and 70% of total losses. The main problem at the production level is represented by subclinical mastitis, which tends to persistence or chronicity and to be refractory to antibiotic treatment. This type of mastitis is commonly caused by Staphylococcus aureus and is usually the most frequent form of presentation in dairy farms in the world. The aim of this thesis was to determine differences between strains of S. aureus from cows with persistent mastitis and cows with transient mastitis respect to their biofilm formation capacity, cell invasion capacity, and their capsular genotyping. isolates from persistent and transient bovine mastitis were selected and characterized according to their antibiotic resistance profile and typified by the Pulsed-Field technique. The formation of biofilm in 96 well plates and the cellular invasion with MAC-T cells were evaluated. Capsular genotyping (cap5-cap8) of the strains was carried out by PCR technique. In addition, the detection of the genes involved in the formation of biofilm and cellular invasion (operon icaADBC, bap, fnbA, fnbB) was carried out using the same technique. It was possible to identify persistent and transient S. aureus isolates (n=30) in the bovine mammary gland using the Pulsed-Field technique. Those isolates were grouped into different pulsotypes showing a high genetic diversity, and in general were sensitive to all antibiotics tested (n=12), including methicillin. The cap5 gene was the most frequent, being identified in all strains from cows with persistent mastitis and in one strain from a cow with transient mastitis; the rest of the strains were "non-typeable". All the strains were able to form biofilm, however, strains of S. aureus from cows with persistent mastitis formed more biofilm than strains of S. aureus from cows with transient mastitis. In parallel, all the strains were able to invade MAC-T cells, however, this last capacity was low in general and was not associated with the manifestation of mastitis or with the origin of the strains (strains from cows with persistent mastitis or transient mastitis). In conclusion, S. aureus strains from cows with persistent mastitis encoded the cap5 gene in their genome and formed more biofilm than S. aureus strains from cows with transient mastitis

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Salazar, Salvatierra Maria Elena. "Prevalencia de genotipos de pili tipo IV y factores de virulencia asociados en aislados clínicos de Pseudomonas aeruginosa." Doctoral thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2014. https://hdl.handle.net/20.500.12672/3797.

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Abstract:

Pseudomonas aeruginosa es un importante patógeno oportunista del ser humano y tiene amplia versatilidad metabólica por lo que se puede adaptar a vivir en ambientes ubicuos, pudiendo persistir en ciertas superficies como tejidos formando comunidades especializadas llamadas biopelículas, además de elaborar otros factores de virulencia, como el pili tipo IV (T4P) vinculado no sólo a la motilidad llamada “contracción” sino también pareciera estar relacionada con las etapas tempranas en la formación de las biopelículas. La presente tesis tuvo como principal objetivo determinar la presencia de los diferentes genotipos del T4P así como los factores de virulencia asociados en cepas clínicas de diferentes fuentes, encontrando que la distribución de genotipos fue 25,9 % para el Grupo II, 19 % para el Grupo I, 24,1 % para el Grupo III, 10,3 % el Grupo IV y 20,7 % para el Grupo V, de tal manera que en nuestro medio existe distribución homogénea de los diversos genotipos. Palabras clave: Pseudomonas aeruginosa, Genotipos de pilA, Motilidad
Tesis

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Florian, Carrillo Jesús Christian Guillermo. "Evaluación de los principios activos de senecio calvus en la formación de biopelículas de pseudomonas aeruginosa." Master's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2014. https://hdl.handle.net/20.500.12672/4117.

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Abstract:

Los biofilms o biopelículas, comunidades complejas de microorganismos, se encuentran colonizando diferentes ambientes bióticos como abióticos; los problemas generados por estos son diversos en diferentes actividades humanas. Ya que las biopelículas son de difícil erradicación, se han planteado diversas formas de control en cada una de las etapas del ciclo de una biopelícula. Una de ellas es la interrupción de las moléculas de señalización del quorum sensing, sistema que regula el proceso de la formación de biopelículas, para tal efecto se están buscando actualmente tanto antagonistas sintéticos como de origen natural. La presente investigación utiliza el Senecio calvus, una planta de uso medicinal, nativa del Perú. Se han expuesto extractos etanólico, butanólico, acuoso, metanólico y de diclorometano además de fracciones cromatográficas de Senecio calvus contra Pseudomonas aeruginosa, una bacteria oportunista muy utilizada debido a que es una bacteria que forma rápidamente biopelículas. Se mezclaron los cultivos de P. aeruginosa en fase de crecimiento junto a los extractos y fracciones de S. calvus para determinar el grado de inhibición de las bioopelículas; para tal efecto se usaron concentraciones subinhibitorias, previa prueba de concentración mínima inhibitoria (CMI). Los resultados arrojaron una inhibición de 92.9 y 76.4% en dos de los extractos y de hasta 88% en las fracciones cromatográficas, lo cual indica que Senecio calvus es un buen candidato para el aislamiento de una molécula inhibidora de biopelículas con potencial patentable.
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Oyola, Salcedo Delia Graciela. "Evaluación de la influencia del meropenem en la formación de piocianina y alginato en Pseudomonas aeruginosa formadora de biopelícula." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2014. https://hdl.handle.net/20.500.12672/3881.

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Abstract:

La presente tesis tuvo como objetivo principal evaluar la influencia del meropenem en la formación de piocianina y alginato por cepas de Pseudomonas aeruginosa formadoras de biopelículas. Se detectó un 75% (60/80) de cepas formadoras de biopelículas por el método de O'Toole - Kolter de 80 aislados provenientes de pacientes de los Hospitales Nacionales Edgardo Rebagliati Martins y Guillermo Almenara Irigoyen, de las cuales el 30.0% (18/60) evidenciaron producción de piocianina en una concentración de 6.0 ug/mL a 6.5 ug/mL y el 36.6% (22/60) se evidenció producción de alginato en concentraciones de 6 ug/mL a 10 ug/mL expresado como ácido urónico en presencia de meropenem a la concentración de 10 μg . Sin embargo en ausencia de meropenem se obtuvo una menor producción de piocianina y alginato, por lo que se comprobó que el pigmento de piocianina y la producción de alginato son mecanismos de virulencia que favorecen la supervivencia de Pseudomonas aeruginosa en presencia del antibiótico.
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Villar, Calero Kaysser Alberto. "Formulación de biopelículas de quitosano funcionalizadas con aceite esencial de Minthostachys mollis “Muña” con propiedad antioxidante y antimicrobiana." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2021. https://hdl.handle.net/20.500.12672/16812.

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Abstract:

La presente investigación tuvo como objetivo central evaluar la actividad antioxidante y antimicrobiana de las biopelículas formuladas a base de quitosano y funcionalizadas con aceite esencial de Minthostachys mollis “Muña”. Para ello se formularon 12 biopelículas (preparadas de manera aleatorizada) con distintas concentraciones de aceite esencial de Muña (AE) y quitosano (Q0): F1 (Q0 3% y AE 5%), F2 (Q0 2% y AE 0.5%), F3 (Q0 1% y AE 2%), F4 (Q0 1% y AE 0.5%), F5 (Q0 3% y AE 0.5%), F6 (Q0 3% y AE 2%), F7 (Q0 1% y AE 5%), F8 (Q0 2% y AE 5%), F9 (Q0 2% y AE 2%), B1 (Q0 1%), B2 (Q0 2%), B3 (Q0 3%); una vez elaboradas las biopelículas se les realizó la prueba física de fuerza de tracción y determinación de la actividad antioxidante mediante la actividad captadora de radicales libre (DPPH) y la actividad antimicrobiana mediante ensayo de zona de inhibición. Las biopelículas funcionalizadas con aceite esencial de Minthostachys mollis “Muña” mostraron que su propiedad mecánica: fuerza de tracción, fue disminuida y su actividad antioxidante (p <0,05) fue potenciada. Así mismo las biopelículas funcionalizadas con aceite esencial de Minthostachys mollis “Muña” mostraron inhibición de crecimiento bacteriano (Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis y Escherichia coli) y fúngico (Aspergillus niger). En conclusión se obtuvieron biopelículas que potencialmente podrían ser empleadas en recubrimiento de alimentos para mejorar su conservación; siendo las biopelículas: F3 (Q0 1% y AE 2%) y F7 (Q0 1% y AE 5%), las que presentaron adecuadas actividades antioxidante y antimicrobiana y propiedades mecánicas.
Perú. Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Vicerrectorado de Investigación y Posgrado. Programa de Promoción de Tesis de Pregrado. A18040761-PTPGRADO.

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CERON, RIOS CECILIA ARACELI. "ELIMINACIÓN DE ESPECIES DE CROMO EN SOLUCIONES ACUOSAS POR UN SISTEMA A BASE DE BIOPELÍCULAS SOPORTADAS EN MATERIAL ZEOLÍTICO." Tesis de doctorado, Universidad Autónoma del Estado de México, 2021. http://hdl.handle.net/20.500.11799/112131.

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Abstract:

Esta tesis trata de implementar un sistema de descontaminación de cromo de aguas residuales
Los antimicrobianos y metales son compuestos de distinto origen y naturaleza química, cuya presencia en el ambiente no se considera algunas veces significativa en términos de distribución y/o concentración sin embargo, la presencia de éstos genera impactos ecológicos y efectos adversos sobre la salud. Especies metálicas como el Cr, están presentes en algunos tipos de desinfectantes, tintes, etc., y es comúnmente detectado en agua residual de distinto origen (Fedaku et al., 2015; Stuart, 2012). En este trabajo se evaluó el comportamiento de un sistema conformado por bacterias multirresistentes a antibióticos soportado en una zeolita natural acondicionada previamente, para remover de un medio acuoso al Cr(VI), como un sistema potencial para biorremediación del agua. Para ello se utilizaron ocho especies provenientes de dos ambientes diferentes: sedimentos del río Lerma, agua residual de un taller cromado de piezas automotrices las cuales habían sido aisladas en trabajos anteriores. Todas las cepas fueron cultivadas individualmente para después determinar si existía la compatibilidad entre cepas por medio de las pruebas de: difusión en agar y detección por sensi-discos para la formación de consorcios. Se determinó la concentración mínima inhibitoria (CMI) a Cr(VI), la resistencia a antibióticos por el método Kirby Bauer, la remoción de Cr(VI) en presencia de zeolita natural en su forma sódica. Además, se determinaron las condiciones para un reactor en columna. Todas las cepas utilizadas mostraron compatibilidad entre ellas, por lo que se formaron tres consorcios, las CMI variaron entre 150- 300 mg L-1 para Cr(VI). Los resultados mostraron que las ocho especies utilizadas en esta investigación son: cromo-resistentes (Bacillus altitudinis, Enterobacter cancerogenus, Pseudomonas cedrina, Pseudomonas monteilli, Pseudomonas graminis, Brevundimonas diminuta, Microbacterium phyllosphaerae y Brevundimonas nasdae), cromo-reductoras (Pseudomonas graminis, Pseudomonas cedrina, Pseudomonas monteilli, Brevundimonas diminuta, Enterobacter cancerogenus, Brevundimonas nasdae, Microbacterium phyllosphaerae y Bacillus altitudinis a pH 8, 26°C, 120 rpm en Caldo Tripticaseína y Soya y siete de ellas, multirresistentes a antibióticos. La especie Pseudomonas graminis se eligió, en combinación con la zeolita natural acondicionada con sodio, para la remoción de Cr(VI) en un sistema en lote (Bach), en donde se removió el 94.96% del Cr(VI) inicial, durante 192 horas. Se partió de una concentración 2 inicial de 100 mg L-1 de Cr(VI) a pH 8, 26°C y 120 rpm. El reactor en columna se operó durante 72 h, en el cual después de las 24 primeras horas de experimentación, se registraron porcentajes de remoción mayores al 20%. La biopelícula formada por Pseudomonas graminis soportada en zeolita natural sódica y empacada en una columna, es eficiente para la remoción de 100 mg L-1 Cr(VI) en solución acuosa, a pH 8 y 26°C. Este reactor en columna, puede ser utilizado durante 72 h en continuo.
Sin patrocinadores

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Zagastizabal, Mendoza Liz Madelyn. "Eficacia de dos desinfectantes de uso hospitalario frente a biopelículas de Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus formadas sobre acero inoxidable." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2018. https://hdl.handle.net/20.500.12672/9986.

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Abstract:

Evalúa la eficacia de dos desinfectantes de uso hospitalario (Dezavid® y Supersafe-D®) frente a biopelículas de Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus formadas sobre acero inoxidable. Adicionalmente se evaluó la eficacia del hipoclorito de sodio (lejía tradicional) de uso doméstico. Se formó durante 6 días una biopelícula sobre discos de acero inoxidable de 1 cm de diámetro y 1 mm de espesor, posteriormente se les trató con concentraciones de 0,05 %, 0,10 % y 1,00 % de Dezavid®; Supersafe-D® y lejía tradicional, dejando actuar el desinfectante durante el tiempo recomendado por el fabricante. Posteriormente se cuantificó las UFC/disco en comparación con un grupo de discos que no fueron sometidos a ningún desinfectante. Los desinfectantes con mayor eficacia fueron Dezavid® 1,00 %; 0,10 % y Supersafe-D® para Staphylococcus aureus ATCC y cepa clínica. En el caso de Pseudomonas aeruginosa ATCC y cepa clínica los desinfectantes con mayor eficacia fueron Dezavid® 1,00 % y Supersafe-D®. La lejía (1:20) tuvo igual eficacia que Dezavid® 1,00 %; 0,10 % y Supersafe-D® para Staphylococcus aureus ATCC y cepa clínica. En el caso de Pseudomonas aeruginosa ATCC y cepa clínica, la lejía (1:20) tuvo igual eficacia que Dezavid® 0,10 %.biopelículas de Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus formadas sobre acero inoxidable. Adicionalmente se evaluó la eficacia del hipoclorito de sodio (lejía tradicional) de uso doméstico. Se formó durante 6 días una biopelícula sobre discos de acero inoxidable de 1 cm de diámetro y 1 mm de espesor, posteriormente se les trato con concentraciones de 0,05 %, 0,10 % y 1,00 % de Dezavid®; Supersafe-D® y lejía tradicional, dejando actuar el desinfectante durante el tiempo recomendado por el fabricante. Posteriormente se cuantificó las UFC/disco en comparación con un grupo de discos que no fueron sometidos a ningún desinfectante. Los desinfectantes con mayor eficacia fueron Dezavid® 1,00 %; 0,10 % y Supersafe-D® para Staphylococcus aureus ATCC y cepa clínica. En el caso de Pseudomonas aeruginosa ATCC y cepa clínica los desinfectantes con mayor eficacia fueron Dezavid® 1,00 % y Supersafe-D®. La lejía (1:20) tuvo igual eficacia que Dezavid® 1,00 %; 0,10 % y Supersafe-D® para Staphylococcus aureus ATCC y cepa clínica. En el caso de Pseudomonas aeruginosa ATCC y cepa clínica, la lejía (1:20) tuvo igual eficacia que Dezavid® 0,10 %.
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Zagastizabal, Mendoza Liz Madelyn. "Eficacia de dos desinfectantes de uso hospitalario frente a biopelículas de Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus formadas sobre acero inoxidable." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2018. https://hdl.handle.net/20.500.12672/10075.

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Abstract:

Evalúa la eficacia de dos desinfectantes de uso hospitalario (Dezavid® y Supersafe-D®) frente a biopelículas de Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus formadas sobre acero inoxidable. Adicionalmente se evaluó la eficacia del hipoclorito de sodio (lejía tradicional) de uso doméstico. Se formó durante 6 días una biopelícula sobre discos de acero inoxidable de 1 cm de diámetro y 1 mm de espesor, posteriormente se les trató con concentraciones de 0,05 %, 0,10 % y 1,00 % de Dezavid®; Supersafe-D® y lejía tradicional, dejando actuar el desinfectante durante el tiempo recomendado por el fabricante. Posteriormente se cuantificó las UFC/disco en comparación con un grupo de discos que no fueron sometidos a ningún desinfectante. Los desinfectantes con mayor eficacia fueron Dezavid® 1,00 %; 0,10 % y Supersafe-D® para Staphylococcus aureus ATCC y cepa clínica. En el caso de Pseudomonas aeruginosa ATCC y cepa clínica los desinfectantes con mayor eficacia fueron Dezavid® 1,00 % y Supersafe-D®. La lejía (1:20) tuvo igual eficacia que Dezavid® 1,00 %; 0,10 % y Supersafe-D® para Staphylococcus aureus ATCC y cepa clínica. En el caso de Pseudomonas aeruginosa ATCC y cepa clínica, la lejía (1:20) tuvo igual eficacia que Dezavid® 0,10 %.
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Villanueva, Durand Diego Armando. "Capacidad de formación de biopelículas de cepas de Listeria monocytogenes aisladas de quesos frescos procedentes de mercados del Cercado de Lima." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2015. https://hdl.handle.net/20.500.12672/4431.

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Abstract:

Se analizaron 75 muestras de quesos frescos de diferentes mercados del Cercado de Lima, con la finalidad de aislar e identificar Listeria monocytogenes, además de determinar su capacidad para formar biopelículas. El análisis microbiológico se realizó empleando las metodologías recomendadas por el Manual de Bacteriología Analítica de la Food and Drug Administration (BAM - FDA). El procedimiento para determinar la capacidad de formación de biopelículas fue el método de microplaca de 96 pocillos descrito por Djordjevic con las modificaciones recomendadas por Borucki. El estudio microbiológico permitió aislar Listeria monocytogenes en 14 muestras de quesos frescos (18,67%), siendo un valor elevado representando un riesgo potencial para la población consumidora. La capacidad de las cepas de Listeria monocytogenes para producir biopelículas en microplaca de poliestireno fue clasificada según la densidad óptica obtenida a 595 nm. Se obtuvo que el 64,29 % (9/14) de las cepas de Listeria monocytogenes tienen capacidad de formar biopelículas, distinguiéndose entre formadores débiles y moderadas dependiendo del medio de enriquecimiento estudiado, los cuales fueron caldo tripticasa de soya (TSB) e Infusión cerebro corazón (BHI). El medio BHI fue el más efectivo en promover la formación de biopelículas de Listeria monocytogenes en microplaca de poliestireno. Palabras clave: Listeria monocytogenes, quesos frescos, Cercado de Lima, biopelículas, microplaca.
--- A total of 75 samples of fresh cheese from different markets in Cercado de Lima, were analyzed in order to isolate and identify Listeria monocytogenes and also determine its ability to produce biofilms. The microbiological analysis was performed using the methodologies recommended by FDA’s Bacteriological Analytical Manual (BAM – FDA). The methodology for assessment of Listeria monocytogenes biofilm formation was the 96-well microtiter plate method described by Djordjevic with the modifications recommended by Borucki. The microbiological study allowed identifying Listeria monocytogenes in 14 samples of fresh cheese (18,67%), being a high value and which means a potential risk for the consumer population. The assessment of Listeria monocytogenes strains to produce biofilm in microtiter polystyrene plate was classified according to optical density at 595 nm. It was found that 64,29% (9/14) of Listeria monocytogenes strains have the ability to produce biofilms, distinguishing between weak and moderate biofilm producers depending of the type of enrichment medium used, which were Trypticase Soy Broth (TSB) and Brain Heart Infusion (BHI). BHI medium was the most effective in promoting the Listeria monocytogenes biofilm formation in polystyrene microtiter plate. Key words: Listeria monocytogenes, fresh cheese, Cercado de Lima, biofilm, microtiter plate.
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Castro, Amaro Nilda Amelia. "Formación de biopelículas y su resistencia frente a dos desinfectantes en cepas de Listeria monocytogenes aisladas de embutidos y superficies inertes." Master's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2018. https://hdl.handle.net/20.500.12672/7650.

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Abstract:

Publicación a texto completo no autorizada por el autor
Evalúa la capacidad de formación de biopelículas de 20 cepas de Listeria monocytogenes aisladas de embutidos y superficies inertes de una planta de procesado cárnico. Se evalúan diferentes condiciones de temperatura: refrigeración (4ºC), ambiente (22ºC) y 35ºC, obteniendo formación de biopelículas en el 95% de las cepas según la clasificación Stepanovic. El 85% son productoras débiles de biopelículas a 4°C y 35°C; sin embargo a 35°C un 10% son productoras moderadas. El uso de un desinfectante eficiente y la concentración adecuada para reducir la formación de las biopelículas es de suma importancia. Para ello se analiza la acción de dos desinfectantes a base de Hipoclorito de sodio y Amonio cuaternario a tres tiempos de contacto (5, 10 y 30 minutos). Los resultados del presente estudio demuestran que el hipoclorito de sodio es más eficiente para eliminar las biopelículas que el amonio cuaternario a partir de los 30 minutos de exposición.
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Cervantes, Huamán Brayan Roger Héctor. "Evaluación de la capacidad de formación de biofilms de diferentes cepas de Listeria monocytogenes sobre acero inoxidable mediante microscopía de epifluorescencia directa." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2017. https://hdl.handle.net/20.500.12672/7220.

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Abstract:

Evalúa la capacidad de formación de biofilm por diecisiete cepas de L. monocytogenes sobre una superficie de acero inoxidable a una temperatura de 30°C, alta humedad y en un periodo de siete días, mediante el uso de tres métodos de recuento como el sistema TEMPO®, recuento en placa y microscopía de epifluorescencia directa, además de comparar su eficacia en determinar el número de células presentes en el biofilm. La cepa con un mayor número de células presentes en el biofilm es L. monocytogenes CECT 5672 con un recuento de 2.17×10⁷ UFC/cm², evaluado por microscopía de epifluorescencia directa. Sin embargo, la evaluación por sistema TEMPO® y recuento en placa determinan que la mayor productora de biofilm es la cepa L. monocytogenes 4423 con recuentos de 4.70×10⁶ y 3.98×10⁶ UFC/cm², respectivamente. Los tres métodos coinciden en que la cepa con una menor producción de biofilm es L. monocytogenes CECT 911, obteniéndose recuentos de 5.98×10⁵, 5.59×10⁵ y 2.98×10⁶ UFC/cm² por sistema TEMPO®, recuento en placa y por microscopía de epifluorescencia directa, respectivamente. Los recuentos de las cepas de mayor producción de biofilm, mencionadas anteriormente, no presentan diferencias estadísticamente significativas (P > 0.05), en su mayoría, con los recuentos obtenidos por las otras cepas estudiadas. Sin embargo, sí se encuentran diferencias estadísticamente significativas (P < 0.05) entre la mayor y menor cepa productora de biofilm, en los tres métodos evaluados. Sin embargo, se encuentran diferencias significativas entre los recuentos obtenidos por estos dos métodos con los obtenidos por microscopía de epifluorescencia directa para todas las cepas, excepto L. monocytogenes R6 en la que su recuento por microscopía de epifluorescencia directa no presenta diferencias significativas (P > 0.05) con el recuento en placa. No se encuentra una relación directamente proporcional entre la producción de biofilm y el porcentaje de células viables. El modelo de regresión lineal es el más idóneo para relacionar los tres métodos. Finalmente, se concluye que todas las cepas estudiadas presentan diferentes capacidades para formar biofilm, y que el método que presenta las mayores ventajas en cuanto a su sensibilidad y rapidez para cuantificar células del biofilm es la microscopía de epifluorescencia directa.
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Alviz, Gazitúa Pablo. "Caracterización de la vía del c-di-GMP en la formación de biopelículas y la resistencia a Cadmio en Cupriavidus metallidurans CH34." Tesis, Universidad de Chile, 2018. http://repositorio.uchile.cl/handle/2250/151337.

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Abstract:

Doctor en Ciencias mención en Microbiología
El cadmio es un metal pesado altamente tóxico para los sistemas biológicos. El estudio de microorganismos para la biorremediación de metales pesados, ha destacado a Cupriavidus metallidurans CH34, β-proteobacteria aislada desde instalaciones metalúrgicas, como modelo de resistencia a estos elementos. La biorremediación ex situ de metales pesados es comúnmente llevada a cabo en biorreactores de lecho fijo, donde los metales pesados en solución se concentran en la biomasa de comunidades de microorganismos adheridos a superficies llamadas “biopelículas”. El efecto de los metales pesados sobre la formación de biopelículas en C. metallidurans CH34 no ha sido descrito. Durante las últimas décadas, la vía de señalización mediada por un dinucleótido cíclico llamado “c-di-GMP” ha sido establecida como central en la regulación del estilo de vida bacteriano. La interacción de c-di-GMP con distintos receptores macromoleculares promueve del estilo de vida comunitario. Pese al rol fundamental de las biopelículas en los procesos de biorremediación, el efecto de los metales pesados sobre esta vía de señalización en bacterias ha sido poco estudiado. El objetivo de esta tesis es determinar el efecto del cadmio sobre la vía del c-di- GMP y la formación de biopelículas en C. metallidurans CH34. El cadmio inhibió la formación de biopelículas de C. metallidurans CH34. Esto se correlaciona con la descripción de una baja en los niveles de c-di-GMP tras la exposición a este metal pesado, concomitante con un aumento en la abundancia de un transcrito del gen urf2 de los operones de resistencia a mercurio Tn4378 (urf2.1) y Tn4380 (urf2.2), que codifica una potencial fosfodiesterasa. Ensayos de complementación con el gen urf2.2 de la cepa mutante nula P. aeruginosa PAO1 ΔrocR, carente de la fosfodiesterasa RocR, restituyeron la formación de biopelículas y concentración intracelular de c-di-GMP a niveles de la cepa silvestre. Estos resultados constituyen la primera evidencia de funcionalidad catalítica de la fosfodiesterasa codificada por el gen urf2, por lo que se denominó fosfodiesterasa Mrp (metal regulated phosphodiesterase). De forma coherente con la respuesta inhibitoria de formación de biopelículas mediada por la disminución de los niveles de c-di-GMP en C. metallidurans, niveles elevados de este segundo mensajero generados por una diguanilato ciclasa activa expresada en forma heteróloga, incrementaron la formación de biopelículas y la susceptibilidad a cadmio.
Cadmium is a highly toxic heavy metal for biologic systems. Ex situ heavy metal bioremediation is commonly carried out in fixed bed bioreactors in which heavy metals in solution are removed by adhered microbial communities in biofilms. Cupriavidus metallidurans CH34 is a model strain for heavy metal resistance and bioremediation. However, the effect of heavy metals on C. metallidurans CH34 biofilm formation has not been described. The signaling pathway mediated by the cyclic dinucleotide c-di-GMP is central in bacterial lifestyle regulation. c-di-GMP promotes biofilm lifestyle through the interaction with different receptors. Despite of the central role of biofilms on the bioremediation process, the effect of heavy metals over this signaling pathway has been poorly studied. Thus, the objective of this study was to assess the effect of cadmium on the c-di-GMP pathway and biofilm formation in C. metallidurans CH34. Cadmium exerted an inhibitory effect on C. metallidurans CH34 biofilm formation concomitant with a decrease of c-di-GMP levels. After cadmium exposure an increase in the transcription of the gene urf2 that codes for a phosphodiesterase and is located in the mercury resistance operons Tn4378 (urf2.1) and Tn4380 (urf2.2) was observed. Complementation assays with the urf2.2 gene in Pseudomonas aeruginosa PAO1 ΔrocR mutant null strain that is defective in RocR phosphodiesterase, restored biofilm formation and c-di-GMP intracellular concentration at wild type levels. This is the first evidence of catalytic functionality of the urf2 gene encoded phosphodiesterase, which was named Mrp por metal regulated phosphodiesterase. In agreement with the biofilm formation inhibition mediated by a c-di-GMP drop in C. metallidurans, high levels of this second messenger generated by an active diguanylate cyclase that was heterologously expressed, increased the biofilm formation and cadmium susceptibility of this bacterium.

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Cornejo, Chanduvi Tasha Kelly. "Identificación, sensibilidad antifúngica y estudio de la capacidad formadora de biopelículas de cepas de Candida aisladas de pacientes con Candidosis vulvovaginal, en el Instituto de Medicina Tropical Daniel Alcides Carrión 2019." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2021. https://hdl.handle.net/20.500.12672/17134.

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Abstract:

Identifica y determina el perfil de sensibilidad in vitro frente a antimicóticos azólicos y la capacidad formadora de biopelículas de cepas de Candida aisladas de flujo vulvovaginal. Realiza un estudio transversal de 60 cepas de Candida aisladas en pacientes diagnosticadas con Candidosis vulvovaginal pertenecientes a la Micoteca del Instituto de Medicina Tropical “Daniel Alcides Carrión” de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos ubicada en el Callao, Perú. La identificación se llevó a cabo utilizando CHROMagar Candida, filamentación en suero a 37°C (prueba del tubo germinativo), agar harina de maíz, agar almidón arroz, fermentación de carbohidratos (Zimograma) y agar tabaco. Para la determinación del perfil de sensibilidad se utilizó el método de Difusión en agar utilizando discos de papel cargados con antifúngicos (CLSI M44-A) y la capacidad formadora de biopelículas se midió por el método directo en microplacas de poliestireno de fondo plano (Tumbarello y col. 2007). Se identificaron las siguientes especies: Candida glabrata (50.9%), Candida albicans (26.4%), Candida parapsilosis (7.6%), Candida dublinensis (1.9%), Candida kéfir (5.7%) y Candida famata (7.5%). El porcentaje de sensibilidad se encontró en 71.7% y 96.2% para Fluconazol y Voriconazol, respectivamente. Las cepas formadoras de biopelículas representaban el 64.2% del total de cepas evaluadas en este trabajo. Concluye que la especie identificada con mayor frecuencia fue Candida glabrata. Más de la mitad de la población fue sensible al Fluconazol y Voriconazol. Un porcentaje de 64.2%, que representa más de la mitad de la población estudiada, formó biopelículas mediante el método directo.

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Briceño, León Ricardo Jhoel, and Monterroso José Feliciano Chávez. "Determinación del efecto de los extractos de Hyptis eriocephala Benth y Piper umbellatum L. sobre las biopelículas de Staphylococcus aureus y Staphylococcus epidermidis." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2018. https://hdl.handle.net/20.500.12672/9415.

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Abstract:

Se determina la actividad antibacteriana in vitro de los extractos etanólicos y metanólicos de hojas y tallos de Hyptis eriocephala Benth y de hojas de Piper umbellatum L. recolectadas en el Departamento de Amazonas (Perú), frente a cepas planctónicas y biopelículas de Staphylococcus aureus ATCC 25923 y Staphylococcus epidermidis ATCC 12228. Para determinar la Concentración Mínima Inhibitoria (CMI) y la Concentración Mínima Inhibitoria de Biopelículas (CMIB) se empleó el método de microdilución en placa de 96 pocillos de poliestireno con resazurina. Para el caso de las biopelículas primero se seleccionaron a las Cepas Formadoras de Biopelículas (CFB) mediante el método de Agar Rojo de Congo (ARC). Concluye que todos los extractos de Hyptis eriocephala Benth y Piper umbellatum L. demostraron actividad antibacteriana frente a las cepas planctónicas de Staphylococcus aureus ATCC 25923 y Staphylococcus epidermidis ATCC 12228; La actividad antibacteriana moderada fue evidenciada frente a Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 para el extracto etanólico de tallos de Hyptis eriocephala Benth con un valor de CMI de 250 µg/mL y para los extractos de Piper umbellatum L con valores de CMI de 250 µg/mL y 125 µg/mL. Solo el extracto etanólico de Piper umbellatum L. presentó actividad antibiopelícula débil frente a biopelículas de Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 con un valor de CMIB de 1000 µg/mL, mientras que los demás extractos no presentaron actividad antibiopelícula frente a los microorganismos estudiados.
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Landeo, Villanueva Guillermo Ernesto. "Actividad inhibitoria de los aceites esenciales comerciales de Mentha spicata y Eucalyptus globulus sobre biopelículas de Streptococcus mutans en un modelo in vitro." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2018. https://hdl.handle.net/20.500.12672/7652.

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Abstract:

Publicación a texto completo no autorizada por el autor
Evalúa la actividad inhibitoria de los aceites esenciales de Mentha spicata (hierba buena) y Eucalyptus globulus (eucalipto) de origen comercial sobre el desarrollo de biopelículas de Streptococcus mutans ATCC 25175 en un modelo in vitro, emulando las condiciones de la placa dental. La composición de los aceites esenciales (AE) se evaluó por Cromatografía de Gases acoplada a Espectrómetro de Masas (CG/EM) siendo los principales metabolitos el R-(–)-carvona (57,93%) y Llimoneno (12,907%) para Mentha spicata y el 1,8-cineol (eucaliptol) (65,83%) para Eucalyptus globulus. Se evaluó la actividad inhibitoria de los AE por los métodos de difusión en pozo de agar y microdilución colorimétrica. Los halos de inhibición fueron de 18,3 ± 0,47 mm y 27,0 ± 0,82 mm y los CMI de 1,8484 x 10-3 mg/mL y 1,9168 x 10-3 mg/mL, para los AE de Mentha spicata y Eucalyptus globulus respectivamente. La actividad frente a biopelículas se evaluó en un sustrato de piezas de esmalte dental bovino, empleando medio basal de mucina (BMM), en condiciones de anaerobiosis y ciclos diarios de exposición a la sacarosa, para emular las condiciones de la cavidad oral. Los AE se aplicarón a una concentración de 0,5% en un vehículo salino estéril con polisorbato 20 al 1%. Tras 72 horas de cultivo, se observó una reducción significativa (P <0,001%) en la biomasa de la biopelícula, evaluada por su turbidez en suspensión, y en el recuento de organismos recuperables respecto al control. Los efectos de ambos AE no resultaron significativamente distintos entre sí. Ambos AE presentan actividad antimicrobiana frente a S. mutans en cultivos planctónicos y de biopelícula, por lo que podría tener gran potencial para el desarrollo de productos farmacéuticos y sanitarios en el área de la salud oral.
Tesis

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Leon, Moncada Alexandra Janeth. "Elaboración y caracterización de biopelículas a base de una mezcla de almidón de maíz - papa, sorbitol y aceite esencial de orégano (Origanum vulgare)." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2021. https://hdl.handle.net/20.500.12672/17451.

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Abstract:

El desarrollo de la tesis se enfocó en tres etapas: la primera etapa involucró la evaluación de la mejor formulación de la biopelícula a partir de la mezcla de almidón de maíz-papa y sorbitol en función de las propiedades mecánicas; la segunda etapa, consistió en la determinación de la concentración (%) de aceite esencial de orégano (AEO) que se requiere adicionar a la formulación de la biopelícula mediante evaluación de actividad antimicrobiana y finalmente, la caracterización de la biopelícula. Inicialmente, se elaboraron las biopelículas mediante el método de casting utilizando un diseño factorial multinivel 2x2x3 con una réplica, siendo los factores: la concentración de plastificante sorbitol (60% y 80%), temperatura de proceso (85°C y 95°C) y proporciones de almidón de papa (P) y almidón de maíz (M): 0%M:100%P, 25%M:75%P y 50%M:50%P, se realizó la evaluación de estos factores para la determinación de la mejor formulación en base a sus propiedades mecánicas: Resistencia a la tracción (RT) (MPa) y Elongación (E) (%). Los resultados se aceptaron con un nivel de 95% de confianza (p<0.05) y mediante comparación de medias LSD. El tratamiento seleccionado fue conformado por sorbitol al 60%, temperatura de proceso al 95°C y la proporción de mezcla al 50%P:50%M (almidón de maíz: almidón de papa), dicho tratamiento obtuvo 6.23 de RT (MPa) y 14.67 de E (%). La formulación seleccionada en la primera etapa se emplea como base polimérica para la segunda etapa, donde se adicionó el AEO a 0, 1 y 2.5 % a la matriz polimérica, utilizando un diseño factor categórico individual, en el que se determinó la influencia del AEO sobre la actividad antimicrobiana. La concentración seleccionada fue de 1% AEO, con un nivel de 95 % de confianza (p < 0.05). En la caracterización de la biopelícula con la mejor formulación y 1 % AEO, se obtiene un 4.03 de RT (MPa), 30.21 de E (%), espesor de 0.07 mm y actividad antimicrobiana con mayor inhibición de Staphylococcus aureus, seguido de Bacillus cereus. Todos los resultados fueron evaluados mediante Análisis de Varianza (ANOVA) y aceptados con un nivel de 95 % de confianza (p < 0.05).

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Bertacchi, Pepe Mónica María. "Archeas halófilas como causa de alteraciones en tripas bovinas saladas." Doctoral thesis, Universitat Politècnica de València, 2016. http://hdl.handle.net/10251/62205.

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Abstract:

[EN] The main objective of this study was the analysis, description, characterization and impact of red-orange colorations observed in salted bovine casings (intestines), ready for marketing. To achieve this, over the course of three years, an investigation was conducted in two slaughterhouses to assess the industrial process of obtaining cattle intestines (primary process); and three tripe shops to study the secondary process of obtaining salted bovine casings. A salt processing establishment was also visited. A sensory evaluation of the contaminated products was performed, and samples of salt, bovine casings, and water were collected and subjected to physico-chemical, microbiological, molecular, and histological analyses. Our study concludes that the microorganisms responsible for the color alterations are extremely halophilic archae, Haloarcula, Halogranum or Haloterrígena and Haloferax being the identified Genus. Archaea enter the system by cross-contamination through food grade salt. Our studies show that an extremely low load of archaea is sufficient for its development. According to our observations, red-orange coloration can be found in the salt and brine from the surface of open-head drums with only 20 days of storage, and up to a year and a half. Furthermore, electron microscope scans reveal that these halophilic microorganisms can form biofilms, adhering to the casings' surface, altering its histological structure, and therefore their properties when making sausages. In the establishments surveyed it was found that, despite all the measures taken to ensure product quality and safety (GMP, SSOP and HACCP), quality changes in the product were present. We conclude that this is a problem underestimated at an industrial level, and where preventive measures play a major role.
[ES] El objetivo principal de este trabajo fue el análisis, descripción, caracterización e incidencia de las coloraciones rojo anaranjadas observadas en tripas bovinas saladas (intestinos), prontas para su comercialización. Para ello, en el curso de tres años, se realizó una investigación en dos establecimientos de faena para evaluar el proceso industrial de obtención de intestinos bovinos (proceso primario); y en tres triperías, para estudiar el proceso secundario de industrialización de las tripas bovinas saladas. También se asistió a un establecimiento procesador de sal. Se realizó evaluación sensorial de los productos contaminados y se recolectaron muestras de sal, tripas vacunas y agua para estudios microbiológicos, físico-químicos, moleculares e histológicos. Este trabajo concluye que los microorganismos responsables de las alteraciones son arqueas halófilas extremas identificándose los géneros Haloarcula, Halogranum o Haloterrígena y Haloferax. Las arqueas ingresan al sistema por contaminación cruzada a través de la sal de grado alimentario. Los estudios muestran que una carga extremadamente baja de arqueas es suficiente para su desarrollo. De acuerdo a las observaciones realizadas, se constatan coloraciones rojo anaranjadas en la sal y salmuera de la superficie de las tarrinas con tan sólo 20 días de almacenamiento y hasta un año y medio. Por otra parte, la microscopía electrónica muestra que estos microorganismos halófilos pueden formar biopelículas, adhiriéndose a la superficie de la tripa, alterando su estructura histológica y, por tanto, sus propiedades al momento de la elaboración de embutidos. En los establecimientos estudiados se constató que, a pesar de adoptar todas las medidas para garantizar la inocuidad del producto (GMP, SSOP y HACCP), se presentaban alteraciones de calidad en el producto. En conclusión, se trata de un problema subestimado a nivel industrial, y donde las medidas preventivas desempeñan un papel fundamental.
[CAT] L'objectiu principal d'este treball va ser l'anàlisi, descripció, caracterització i incidència de les coloracions roig ataronjades observades en budells bovins salats (intestins), promptes per a la seua comercialització. Per a això, en el curs de tres anys, es va realitzar una investigació en dos establiments de faena per a avaluar el procés industrial d'obtenció d'intestins bovins (procés primari); i en tres triperies, per a estudiar el procés secundari d'obtenció de budells bovins salats. També es va assistir a un establiment processador de sal. Es va realitzar avaluació sensorial dels productes contaminats i es van recol¿lectar mostres de sal, budells vacunes i aigua per a estudis microbiològics, fisicoquímics, moleculars i histològics. Este treball conclou que els microorganismes responsables de les alteracions són arqueges halòfiles extremes identificant-se els gèneres Haloarcula, Halogranum o Haloterrigena i Haloferax. Les arqueges ingressen al sistema per contaminació encreuada a través de la sal de grau alimentari. Els estudis mostren que una càrrega extremadament baixa d'arqueges és suficient per al seu desenrotllament. D'acord amb les observacions realitzades, es constaten coloracions roig ataronjades en la sal i salmorra de la superfície de les terrines amb tan sols 20 dies d'emmagatzemament i fins a un any i mig. D'altra banda, la microscòpia electrònica mostra que estos microorganismes halòfils poden formar biofilms, adherint-se a la superfície del budell, alterant la seua estructura histològica i, per tant, les seues propietats al moment de l'elaboració d'embotits. En els establiments estudiats es va constatar que, a pesar d'adoptar totes les mesures per a garantir la innocuïtat del producte (GMP, SSOP i HACCP), es presentaven alteracions de qualitat en el producte. En conclusió es tracta d'un problema subestimat a nivell industrial, i on les mesures preventives exercixen un paper fonamental.
Bertacchi Pepe, MM. (2016). Archeas halófilas como causa de alteraciones en tripas bovinas saladas [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/62205
TESIS

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Noel, Ayma Miguel Ángel, and de la Cruz Gino Antonio Villanueva. "Eficacia de dos soluciones multipropósito frente a biofilms de Pseudomonas aeruginosa inducidos in vitro en lentes de contacto blandos." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2017. https://hdl.handle.net/20.500.12672/5834.

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Abstract:

Evalúa la eficacia de dos soluciones multipropósito comerciales (Renu Fresh ® y Multi 3 Max®) aplicando un método analítico cuantitativo. Utiliza el microorganismo Pseudomonas aeruginosa (Cepa clínica aislada) debido a su capacidad formadora de biofilm. Se elabora una curva de crecimiento utilizando lentes de contacto de Etalficon A, demostrando la acción de las soluciones multipropósito (SMP) a las concentraciones de 75 y 100%, frente al crecimiento de P. aeruginosa vegetativa. Para probar el desempeño se inocula la cepa en placas con agar tripticasa de soya, luego es llevado a una solución normalizada de caldo tripticasa de soya en la cual se ponen los lentes de contacto y las soluciones multipropósito (SMP) a concentraciones definidas.
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Charri, Macassi Katherine Milagros, and Torres Cynthia Fiorella Huamán. "Actividad del aceite esencial de Cinnamomum zeylanicum “Canela” frente a biopelículas de Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus inducidas in vitro sobre lentes de contacto blandos”." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2017. https://hdl.handle.net/20.500.12672/6729.

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Abstract:

Evidencia la actividad inhibidora del aceite esencial de Cinnamomum zeylanicum frente a la formación de biopelículas de Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus en lentes de contacto blandos. Utiliza el método de cuantificación de la formación de biopelículas por medio del ensayo de biopelícula estática. Los resultados mostraron que el aceite esencial de Cinnamomum zeylanicum presenta actividad inhibitoria frente a biopelículas de Pseudomonas aeruginosa a una concentración de 5 µL/mL, Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027 a una concentración de 5 µL/mL, Staphylococcus aureus a una concentración de 1,25 µL/mL y Staphylococcus aureus ATCC 25923 a una concentración de 0,625 µL/mL, logrando un efecto óptimo frente a la formación de biopelículas de Pseudomonas aeruginosa, donde se llegó a reducir en un 23,94% el crecimiento de dichas biopelículas mejor que la solución multipropósito “Renu Fresh®”, mientras que en las biopelículas maduras, el aceite esencial tuvo mejor actividad en Staphylococcus aureus ATCC 95923 con una reducción del 24,85% mejor que la solución multipropósito “Renu Fresh®”. Concluye que el aceite esencial de canela presenta una gran actividad inhibitoria frente a biopelículas de Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus inducidas en lentes de contacto blandos.
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Conislla, Vigo Alberto Noé, and Caballero Richard Kevin Guerra. "Resistencia microbiana y capacidad de formación de biopelículas de cepas de Staphylococcus aureus y Listeria monocytogenes aisladas de carnes frescas provenientes de mercados de Lima Metropolitana." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2019. https://hdl.handle.net/20.500.12672/11445.

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Abstract:

Determina la resistencia microbiana y capacidad de formar biopelículas de las cepas de Staphylococcus aureus y Listeria monocytogenes aisladas de carnes frescas provenientes de tres mercados de Lima Metropolitana. Por eso se recolectaron 60 muestras que se distribuyó en tres grupos de 20 muestras de carne fresca (10 de pollo y 10 de cerdo) por cada mercado y se realizó el respectivo análisis microbiológico para identificarlos. Luego, se determinó la sensibilidad antimicrobiana por el método de Kirby Bauer según la CLSI y la formación de biopelículas por el método de microtitulación en placa, según las recomendaciones de Stepanovic et al. Se encontró incidencia de 75% para S. aureus y 13,33% para L. monocytogenes. Las cepas de S. aureus, presentaron resistencia a la penicilina (75,56%) y tetraciclina (28,89%); 97,78% al sulfametoxazol-trimetoprim, 82,22% para gentamicina y ciprofloxacino y 77,78% a la clindamicina. El 75% de las cepas de L. monocytogenes presentaron una resistencia a la clindamicina y ninguna presentó resistencia a la ampicilina, penicilina, tetraciclina, sulfametoxazol-trimetoprim, gentamicina, eritromicina y vancomicina. Se determinó que 33,33% de las cepas de S. aureus tienen capacidad fuerte, 28,89% capacidad moderada, 33,33% capacidad débil y 4,45% no tenían capacidad de formar biopelículas. En el caso de las cepas de L. monocytogenes, 100% presentó capacidad débil de formar biopelículas.
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Gonzales, Bernabel Evelin Eliza. "Identificación fenotípica y molecular de bacterias productoras de biofilm presentes en la formación del biofouling en cultivos de “concha de abanico” (Argopecten purpuratus), en la bahía de Huaynuma, Casma - Perú." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2019. https://hdl.handle.net/20.500.12672/11428.

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Abstract:

El biofouling es una acumulación indeseada de sustancias orgánicas en una superficie sumergida en agua y se considera que el origen se debe principalmente a la formación de biofilm por parte de bacterias, el cual sirve de alimento en la colonización de organismos superiores responsables de impactos negativos en el ambiente e industria acuática. Debido a esto, se debe identificar bacterias asociadas a este fenómeno en cultivos de “concha de abanico” (Argopecten purpuratus) en la bahía de Huaynuma, Casma, Perú, que permita realizar trabajos para disminuir la adhesión bacteriana. Se aislaron 40 cepas en total, las cuales fueron sometidas a la prueba de adherencia, para evaluar la producción de biofilm y su capacidad para adherirse a un sustrato, determinándose así que 16 (40%), 8 (20%) y 7 (17.5%) cepas fueron fuerte, moderada y débilmente productoras de biofilm y 9 (22.5%) cepas no productoras. Posteriormente se realizó la identificación fenotípica, basada en las pruebas del Manual de Bergey, cuyos resultados de similitud fueron superiores al 90%, predominando el género Vibrio, principalmente la especie de V. alginolyticus; la identificación molecular ratificó el predominio del género Vibrio, en especial V. alginolyticus, sin embargo esta identificación no fue específica para una sola especie por los altos porcentajes de similitud (100%) entre dos o más cepas. Por su parte la cepa M28 fue identificada al 100% como Photobacterium damselae subs. damselae., el cual se reporta por primera vez en cultivos de “concha de abanico” en la bahía de Huaynuma.
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Ríos, Rivera Anita Cecilia. "Eficiencia de fibras naturales, cabuya (Furcraea andina) y paja de trigo (Triticum vulgari) como biofiltros alternativos en el proceso de desnitrificación de aguas residuales de piscícolas de trucha arcoíris en la localidad Juan de Velasco." Doctoral thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2017. https://hdl.handle.net/20.500.12672/6225.

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Abstract:

Publicación a texto completo no autorizada por el autor
Plantea el uso de las fibras naturales andinas cabuya (Furcraea andina) y paja de trigo (Triticum vulgari) como soporte bacteriano de biorreactores anaerobios UASB, para procesos de desnitrificación de aguas residuales de piscícolas de truchas arcoíris en la zona alto andina de la localidad Juan de Velasco en Ecuador. Evalúa tanto la capacidad de desnitrificar las aguas residuales de acuicultura como la de remover metales pesados, mediante el uso combinado de biofilms soportados por fibras naturales, en condiciones controladas y acondicionamiento previo del medio bacteriano. Diseña nueve biofiltros a escala piloto para la remoción de contaminantes de las aguas residuales de piscícolas de truchas arcoíris. Determina si la incubación de la microbiota con pseudomonas acelera la adaptación de la población bacteriana en las fibras naturales en seis biofiltros. Determina la tasa de desnitrificación de los efluentes de las piscícolas de los biofiltros, las diferentes alturas de la columna de los biofiltros orgánicos en un proceso anaerobio, la altura del biofiltro necesario para la descontaminación de los efluentes de las piscícolas y si el biofiltro con la fibra cabuya–pseudomonas aisladas contribuye en la remoción de metales pesados que provienen de la ceniza de la zona volcánica del sector estudiado. Evalúa la degradación de las fibras naturales como medios filtrantes mediante el análisis de los cambios en las propiedades físicas y químicas, la calidad sanitaria del efluente de los biofiltros anaerobios, con cargas hidráulicas constante, para determinar si cumplen con los criterios que marca la normatividad ambiental ecuatoriana.
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Arízaga, Rujel Gastón Adolfo Martín. "Efecto antimicrobiano de tetraciclina en gel al 2% y clorhexidina en gel al 0,12% sobre el biofilm de pilares de cicatrización de implantes dentales. Estudio in vitro." Master's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2021. https://hdl.handle.net/20.500.12672/17194.

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Abstract:

Evalúa el efecto antimicrobiano de la tetraciclina en gel al 2 % y clorhexidina en gel al 0,12 % sobre el biofilm tomado de pilares de cicatrización de implantes dentales. El estudio es analítico experimental in vitro, transversal. Se recolectaron 19 muestras de biofilm localizados en los pilares de cicatrización en implantes dentales. Las muestras se tomaron con un microbrush estéril, a partir del pilar de cicatrización de la zona en contacto con el surco periimplantario, posteriormente en las placas Petri se procedió a sembrar con agar Schaedler, donde se realizó 3 pocillos con sacabocado estéril. En cada uno de los pocillos, se aplicó tetraciclina en gel al 2 %, clorhexidina en gel al 0,12 % y agua destilada respectivamente, en cantidades iguales. Las placas Petri se incubaron a 37°C en un medio anaerobio durante 96 horas, después se procedió a medir los halos de inhibición. Encuentra que los geles de tetraciclina y clorhexidina inhibieron el crecimiento del biofilm. La tetraciclina en gel al 2 % presentó mayores diámetros de halos de inhibición en relación a la clorhexidina en gel al 0,12 %, con un máximo de 50 mm y 17 mm, un mínimo de 21mm y 11mm, con medias de 36,37 mm y 12,84 mm respectivamente. En el agua destilada no se encontró halo de inhibición. Conclusiones. La tetraciclina en gel al 2 % obtuvo un efecto antimicrobiano mayor que la clorhexidina en gel al 0,12 % sobre el biofilm obtenido de los pilares de cicatrización procedente de los implantes dentales en boca.

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Huayanca, Huamán Ana Paola, and Luza Claudia Nayli Paniagua. "Incidencia de Escherichia coli resistente a antibióticos y formadora de biopelículas en pacientes con infecciones del tracto urinario de un Hospital de III Nivel de Atención en el año 2017 – Lima Perú." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2018. https://hdl.handle.net/20.500.12672/8134.

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Abstract:

Publicación a texto completo no autorizada por el autor
Determina la incidencia de E. coli formadora de biopelículas y resistente a antibióticos aisladas del Hospital Cayetano Heredia, se lleva a cabo un estudio observacional, descriptivo, prospectivo y serie de casos donde se recolectaron 100 cepas de E.coli aisladas de muestras de orina de pacientes con ITU del Hospital de biopelículas por microtitulación con tinción de CV, durante noviembre a diciembre del 2017, se verifican sus características fenotípicas en agar MacConkey y la prueba bioquímica IMVIC, además se realiza el ensayo caracterización molecular por PCR convencional para el gen usp, y Multiplex PCR para los genes fim H, hly A, agn 43, electroforesis y antibiograma mediante difusión de discos.
Tesis

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El, Haj Hidalgo Cristina. "Estudios de eficacia antimicrobiana frente a la infección de cuerpo extraño por Staphylococcus aureus: aplicación de un modelo in vivo y un modelo dinámico in vitro." Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2017. http://hdl.handle.net/10803/565664.

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Abstract:

Las infecciones de prótesis articulares causadas por S. aureus son difíciles de curar, y con los tratamientos actuales recomendados siguen habiendo fallos tanto microbiológicos como clínicos. Asimismo, no se han estudiado de forma exhaustiva las posibles alternativas terapéuticas en caso de no poder administrar por alergia o intolerancia a alguno de los antibióticos considerados de elección. Actualmente se están investigando nuevas terapias terapéuticas ya sea con antibióticos de reciente aparición, como es daptomicina, o a partir de terapias anti-biofilm. Daptomicina es un lipopéptido cíclico que ha demostrado tener actividad bactericida frente a bacterias en fase planctónica y en fase estacionaria, y se ha visto que tiene una alta eficacia en combinación con otros antimicrobianos frente a la infección de cuerpo extraño por S. aureus resistente a meticilina (SARM). Por otro lado, la escasa información existente sobre la terapia anti-biofilm con macrólidos frente a S. aureus es contradictoria; si bien algunos estudios defienden que posee una actividad contra el biofilm, otros observaron poca o ninguna actividad. Como se ha comentado, las consideradas como alternativas terapéuticas en la infección por S. aureus (ej., cotrimoxazol y ácido fusídico) no se han estudiado en profundidad y la información que se tiene de estos antibióticos es de hace algunas décadas. El objetivo de esta tesis fue por un lado estandarizar dos modelos, uno in vitro en el CDC biofilm reactor y otro in vivo de infección de cuerpo extraño con cepas S. aureus sensibles a meticilina (SASM) y SARM, para poder evaluar (i) la eficacia de las combinaciones de daptomicina frente a SASM; (ii) el potencial efecto anti-biofilm de claritromicina; y (iii) la actividad de cotrimoxazol, ácido fusídico y las combinaciones de rifampicina con cotrimoxazol y linezolid como posibles alternativas terapéuticas al tratamiento estándar para S. aureus. Los principales hallazgos son: - El modelo in vivo estandarizado con una infección de 3 y 7 días, como modelo de infección aguda de cuerpo extraño, se muestra válido para la evaluación de la eficacia antimicrobiana - El modelo in vitro dinámico de CDC biofilm reactor permite la formación de biofilm de S.aureus, su mantenimiento en el tiempo, así como el estudio de la eficacia de las diferentes pautas terapéuticas. - Daptomicina-cloxacilina ha demostrado tener una actividad similar a cloxacilina- rifampicina (tratamiento estándar) y podría utilizarse como alternativa terapéutica en fase precoz del tratamiento de infecciones de prótesis por SASM - Daptomicina-rifampicina fue el tratamiento más eficaz en la infección in vivo de cuerpo extraño por SASM, incluso tuvo más actividad que el tratamiento estándar levofloxacino- rifampicina. Estos resultados sugieren que daptomicina-rifampicina podría utilizarse como alternativa terapéutica en los casos que no pudiera utilizarse las fluoroquinolonas. - Claritromicina no tuvo actividad anti-biofilm relevante frente a las infecciones por SASM y SARM - Cotrimoxazol fue ineficaz frente a la infección por SASM y SARM en la rata. Los resultados observados sugieren que una de las causas de su inactividad podría ser la interacción con la timidina (que se encuentra en altas concentraciones de forma inherente en la rata, y en infecciones purulentas) . - Ácido fusídico presentó resultados microbiológicos prometedores (aumento de actividad de daptomicina, y protección frente la aparición total o parcialmente). Sin embargo no se pudo estudiar en el modelo in vivo debido a la toxicidad que presentó en los animales. - En el modelo in vitro dinámico del reactor para SASM observamos que la combinación de levofloxacino con rifampicina fue el tratamiento más eficaz, mientras que cotrimoxazol- rifampicina y linezolid-rifampicina no mostraron diferencias significativas entre ellos en términos de eficacia. Sin embargo, linezolid fue capaz de proteger frente a la aparición de resistencias a rifampicina, mientras que cotrimoxazol no lo hizo. En el modelo para SARM, linezolid-rifampicina se presentó como la terapia más eficaz y protegió frente a la aparición de cepas resistentes. De nuevo, la combinación de cotrimoxazol-rifampicina no protegió frente a la aparición de resistencias a rifampicina, que aparecieron de forma sistemática a las 8 horas de iniciar el tratamiento.
Despite optimal therapeutic management for acute prosthetic joint infections (PJI) caused by Staphylocococcus aureus, some clinical and microbiological failures occur, especially when implant retention is attempted. Moreover, occasions arise when drugs often cannot be administered owing to intolerance or allergy, and no adequately evaluated alternatives exist. In response to these difficulties, alternative therapies and other therapeutic approaches to bacterial biofilm are been investigated. Daptomycin combinations had a high efficacy against foreign-body infection by methicillin- resistant S. aureus (MRSA). On the other hand, the information about the potential anti-biofilm effect of macrolides against S. aureus is scarce and controversial. Additionally, the alternative therapies for S.aureus infections (ie cotrimoxazole and fusidic acid) have not been accurately evaluated. The aims of this project was standardize an dynamic in vitro model (CDC biofilm reactor) and an in vivo foreign-body infection (FBI) by methicillin-susceptible S. aureus (SASM) and MRSA strains, in order to evaluate (i) The efficacy of daptomycin and its combinations against SASM; (ii) the potential anti-biofilm effect of clarithromycin; and (iii) the activity of cotrimoxazole, fusidic acid and rifampicin combinations with cotrimoxazole and linezolid as possible therapeutic alternatives to the standard treatment for S. aureus. The main results were: - The In vivo model with a period of infection of 3 and 7 days, as an acute FBI model, and the dynamic in vitro model of CDC biofilm reactor were suitable to study the efficacy of different therapies. -Daptomycin-Cloxacillin therapy was as effective as cloxacillin-rifampicin (standard treatment) and can be considered as alternative anti-MSSA therapy for FBI. -Daptomycin-Rifampicin was the most effective combination, providing higher efficacy than levofloxacin-rifampicin. These results suggest that daptomycin-rifampicin may be useful as a first-line therapy against MSSA PJI. -Clarithromycin did not show anti-biofilm activity against MSSA and MRSA infections. -Cotrimoxazole was ineffective against S.aureus in animal model. The results observed suggest that the lack of activity could be due in part to its inactivation by thymidine. -Fusidic acid had promising microbiological results. However, it was not possible to perform the in vivo studies due to the animal intolerance to antibiotic. - In CDC biofilm reactor, levofloxacin-rifampicin was the most effective treatment against MSSA. Rifampicin combinations with cotrimoxazole and linezolid had similar activity. Against MRSA, linezolid-rifampicin combination was the most effective treatment. In both strains, the cotrimoxazole-rifampicin combination did not protect against rifampicin resistant strains.

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Cortés, Acha Berta. "Características del biofilm oral formado sobre implantes dentales." Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2019. http://hdl.handle.net/10803/667961.

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Abstract:

Desde hace más de 30 años, los implantes osteointegrados son una alternativa viable para el reemplazo de las ausencias dentarias, con un alto porcentaje de supervivencia y éxito. Sin embargo, la prevalencia de sus complicaciones biológicas no es despreciable. Se estima que entre un 12 y un 22% de los pacientes portadores de implantes padece de periimplantitis (PI), una alteración que se caracteriza por la presencia de inflamación y pérdida ósea periimplantaria. Puesto que se trata de una enfermedad inflamatoria en que las bacterias desempeñan un papel muy relevante, es interesante estudiar cómo se organizan éstas sobre la superficie de los implantes. La microbiota que coloniza los implantes dentales hasta ahora se ha considerado similar a la microbiota encontrada alrededor de dientes. En ausencia de inflamación, por ejemplo, tras un proceso de remodelado óseo, la superficie del implante queda expuesta al medio oral permitiendo el acúmulo de placa bacteriana. Para conocer más en profundidad cómo es este biofilm formado sobre la superficie expuesta de un implante dental, se diseñaron los 2 estudios que componen la presente tesis doctoral. El primer estudio tenía como objetivo principal determinar si un pilar experimental, que simula la macro y microestructura de un implante, es un método adecuado para recoger biofilm oral. Además, también pretendió describir las características del biofilm formado sobre estos pilares. Para ello, se colocaron pilares experimentales en 15 pacientes portadores de implantes sin patología periimplantaria. Tras 14 días, los aditamentos fueron analizados con microscopía confocal y electrónica de barrido. Los 5 primeros pilares se tiñeron para determinar la cantidad de biomasa que colonizaba los aditamentos y los 10 restantes con una tinción que permitiera además diferenciar células vivas de células muertas. Se observó un recubrimiento global de los pilares en todos los pacientes. El área supragingival mostró un mayor porcentaje de recubrimiento (38%) en comparación con el área subgingival (21%) y la ratio de bacterias vivas/muertas también fue ligeramente mayor en la zona supragingival (p<0.074). El segundo estudio pretendía identificar la composición de la microbiota formada alrededor de implantes expuestos a la cavidad bucal utilizando técnicas de metagenómica. El pilar experimental descrito anteriormente se empleó para recoger el biofilm de 10 pacientes portadores de implantes sanos. Transcurridos 14 días, se analizó dicho biofilm mediante un proceso de pirosecuenciación del gen 16S. Se identificaron un total de 96 especies y las bacterias más frecuentemente encontradas fueron Fusobacterium nucleatum y Prevotella denticola. Algunas de las especies que generalmente se asocian a la periodontitis se encontraron en mayor medida en aquellos pacientes que no tenían antecedentes de periodontitis. Además, se identificaron algunas bacterias que nunca habían sido descritas como parte del microbioma oral. Se puede concluir que la utilización de pilares experimentales removibles permite recoger y estudiar el biofilm formado sobre implantes dentales. Por otro lado, tras 14 días de exposición a la cavidad bucal, la mayoría de la superficie de los implantes se cubrirá por un biofilm maduro y espeso compuesto por una microbiota heterogénea con predominio de Fusobacterium nucleatum y Prevotella denticola. Además, la cantidad y distribución del biofilm formado sobre un implante tras 14 días.
Peri-implant diseases are oral diseases caused by a biofilm infection in a susceptible individual. This entity comprises two major pathologies; peri-implant mucositis and peri-implantitis. The prevalence of peri-implantitis given in private practice ranges from 12% to 22% of patients, and 39% of patients with mucositis at 5 years in media. Microbiota colonizing dental implants has been considered to be similar that microbiota observed around teeth. In absence of inflammation, i.e after a remodeling process, the surface of a dental implant can get exposed to the oral cavity and it will be colonized by a biofilm. The present thesis has two objectives. Firstly, to determine whether an experimental abutment mimicking the macro and microstructure of a dental implant is a suitable method for recovering biofilm, and to describe the features of biofilms formed around such abutments on healthy implants. Secondly, to identify microbiota surrounding exposed dental implants in patients with and without a history of periodontitis through a deep-sequencing approach. An experimental abutment with the same surface and structure as a commercially available dental implant was used. After 14 days’ absence of dental hygiene in this area, the abutments were retrieved and analyzed through a deep-sequencing approach in the first study. In the second study, the abutments used were studied through confocal laser scanning microscopy and with a scanning electron microscope. The results obtained from the first study showed a wide variety of bacteria, 96 species, were identified. The most frequently found bacteria were Fusobacterium nucleatum and Prevotella denticola. Some species generally associated with periodontitis were found to a greater extent in patients without a history of periodontitis. Some bacteria that have never been described as part of the oral microbiome were identified in the present sample. The second study showed a global plaque coverage of the abutments was observed in all cases. The submucosal area of the abutment was mostly covered with biofilm (over 21%). Moreover, significant differences between supra- and subgingival locations were detected. The ratio of live to dead bacteria was slightly higher in the supragingival portion of the abutment than in the subgingival part (p<0.074).

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Brañez, Reyes Katherine. "Evaluación del efecto antibacteriano in vitro del extracto de Stevia rebaudiana sobre el Actinomyces viscosus y Streptococcus sanguinis, bacterias iniciadoras en la formación de biofilm dental." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2017. https://hdl.handle.net/20.500.12672/6575.

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Abstract:

Determina la actividad antibacteriana del extracto de Stevia rebaudiana (S. rebaudiana) frente a Streptococcus sanguinis (S. sanguinis) y Actinomyces viscosus (A. viscosus). Desarrolla la prueba de sensibilidad en placa de agar con discos, previo al desarrollo de la prueba se activaron las cepas de S. sanguinis y A. viscosus en placas de Agar Tripticasa soya (TSA) y agar sangre respectivamente e incubada a 37 ºC por 48 horas a S. sanguinis y 7 días en condiciones de anaerobiosis a A. viscosus. Posteriormente se colocó en las 10 placas de agar sangre como de TSA un inóculo de 100 µL, que fue estandarizado al 0,5 de la escala de Mc Farland y sembrado por diseminación. Seguidamente se colocaron los discos de 6 mm de diámetro de forma equidistante, cargados con 10 µL de las diferentes concentraciones del extracto y se procedió a la incubación. Encuentra que las concentraciones de 15, 30, 50, 60 y 120 mg/ml presentan un halo de inhibición promedio de 6,8; 8,2; 8,2; 8,3; 8,1mm respectivamente, para el caso de S. sanguinis. Las concentraciones de 15, 30, 50,60 y 120 mg/ml presentan un halo de inhibición promedio 7,2; 9,65; 9,20; 8,05; 7,95 respectivamente para el caso de A. viscosus. La prueba de Kruskal Wallis determina que existe diferencia estadísticamente significativa de los promedios entre las concentraciones. Concluye que el extracto de S. rebaudiana no presenta actividad antibacteriana para las cepas de S. sanguinis, pero si presenta poca actividad antibacteriana sobre cepas de A. viscosus para las concentraciones de 30 y 50 mg/ml.
Tesis

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Baelo, Álvarez Aida. "New antimicrobial strategies against bacterial infections." Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2021. http://hdl.handle.net/10803/673587.

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Abstract:

Bacterial infections are a major health concern worldwide due to the mortality and comorbidity associated levels. Besides the development of drug-resistance mechanisms, most recalcitrant infections are caused by bacteria forming biofilms, which are bacterial communities that grow within an extracellular polymeric substance (EPS) matrix that protects bacterial cells from the action of antimicrobials and immune mechanisms. The frequent appearance and spreading of bacterial drug-resistant strains, together with the recalcitrance of infections caused by biofilms, has pointed out the urgent need to develop novel antibacterial agents that target essential bacterial processes and biofilm-forming bacteria. This thesis investigated the development of new antibacterial strategies by both targeting bacterial essential processes and biofilm-forming bacteria. Ribonucleotide reductase (RNR) are essential enzymes required by any cellular organism, since they catalyze the synthesis of deoxyribonucleotides, critical for both DNA synthesis and repair processes. Due to its key role in DNA replication, several RNR inhibitors have been developed as antiproliferative drugs in cancer and infectious diseases. Amongst RNR inhibitors, radical scavenger molecules have proved for long its inhibitory activity against the RNR enzyme, including some cytotoxic hydroxylamine derivatives such as hydroxyurea (HU). Here, the use of hydroxylamine derivative compounds as antibacterial agents specifically targeting the bacterial RNR enzyme was investigated. The results provided show that N-methyl-hydroxylamine (M-HA) molecule and some newly synthesized Nhydroxylamine derivative molecules (N-HA) inhibit bacterial RNR, displaying a wide range of antibacterial activity against different bacterial pathogens, together with low cytotoxicity to eukaryotic cells. Also, M-HA molecule shows intracellular antimycobacterial activity during macrophages infection, together with Pseudomonas aeruginosa in vitro antibiofilm activity. Several of the N-HA molecules display antibiofilm activity against P. aeruginosa, Staphylococcus aureus, and Escherichia coli biofilms, and we demonstrate the ability of such molecules to inhibit bacterial growth by radical scavenging of the RNR enzyme. Further, this thesis explores the use of a drug delivery system based on poly(lactic-co-glycolic) (PLGA) nanoparticles (NPs) to remove P. aeruginosa biofilms by combining the action of the antibiotic ciprofloxacin and the DNA-hydrolytic activity of the deoxyribonuclease I enzyme (DNase I). The synthesized biodegradable PLGA NPs, loaded with ciprofloxacin and functionalized with DNase I through poly(lysine) (PL) coating, synergistically improve the ciprofloxacin antibacterial efficacy by disassembling the extracellular DNA, one of the main components of the EPS matrix.

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López, Gómez Antonio. "Estudio de la variabilidad genética, factores de virulencia y mecanismos de invasión del epitelio respiratorio humano durante la infección por Haemophilus influenzae no tipable." Doctoral thesis, Universitat de les Illes Balears, 2012. http://hdl.handle.net/10803/104205.

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Abstract:

En esta Tesis Doctoral, hemos caracterizado el papel de un conjunto de estructuras de la superficie de Haemophilus influenzae (HiNT) como factores de virulencia implicados a distintos niveles del proceso infeccioso, mediante el empleo de mutantes generados en el laboratorio y de aislados clínicos. Hemos analizado la heterogeneidad fenotípica de aislados clínicos de HiNT respecto a su resistencia al ataque bactericida de péptidos antimicrobianos, a su interacción con superficies abióticas y epiteliales, y a mecanismos moleculares de subversión del epitelio respiratorio empleados por el patógeno durante los procesos de adhesión e invasión epitelial. Asimismo, el análisis de este repertorio de fenotipos asociados a virulencia en una batería de cepas mutantes que carecen de estructuras superficiales del patógeno, incluyendo modificaciones del lipopolisacárido y adhesinas de naturaleza proteíca, nos ha permitido establecer una asociación directa entre moléculas bacterianas y elementos de la inmunidad innata del hospedador. Por otra parte, hemos diseccionado la implicación de un conjunto de moléculas eucariotas en la invasión del epitelio respiratorio humano por HiNT, mediante la infección de células epiteliales humanas en cultivo en combinación con la interferencia de moléculas eucariotas ad hoc. Mediante esta disección, presentamos un modelo que integra un conjunto de eventos moleculares, incluyendo receptores y elementos de cascadas de señalización eucariota con un papel esencial en la invasión epitelial por este patógeno respiratorio. En conjunto, la identificación de moléculas, tanto bacterianas como celulares, implicadas en la infección por HiNT nos ha permitido ampliar nuestro conocimiento sobre la patogénesis de HiNT, así como la identificación de potenciales dianas terapeúticas para combatir la infección por este patógeno respiratorio.

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Gordón, Sahuquillo Mónica. "Fisiopatogenia y diagnóstico de la ventriculitis asociada a drenaje ventricular externo. Análisis de la formación de biopelículas bacterianas sobre el drenaje ventricular externo. Utilidad del sTREM-1 en el diagnóstico de la ventriculitis asociada a drenaje ventricular externo." Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2015. http://hdl.handle.net/10803/310938.

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Abstract:

INTRODUCCIÓN: La ventriculitis asociada a drenaje ventricular externo (DVE) es una grave complicación relacionada con el uso de estos dispositivos. La formación de biopelícula sobre la superficie del DVE es un factor etiopatogénico importante pero nunca ha sido estudiado de forma sistemática. Por otra parte, establecer el diagnóstico de ventriculitis puede resultar complicado en el paciente crítico. Biomarcadores de infección como la forma soluble del triggering receptor expressed on myeloid cells tipo 1 (sTREM-1), liberado localmente en el foco de infección, han sido utilizados con éxito en el diagnóstico de diversas infecciones y podrían ser eficaces en la ventriculitis. HIPÓTESIS: La biopelícula es un factor etiopatogénico clave en la ventriculitis y el uso de DVE impregnados con antibiótico reducirá su formación. El sTREM-1 medido en líquido cefalorraquídeo (LCR) es útil en el diagnóstico de ventriculitis. OBJETIVOS: Analizar la presencia de biopelícula en los DVE y su relación con las complicaciones infecciosas. Comprobar el efecto de los DVE impregnados con antibiótico sobre la formación de biopelícula bacteriana. Comprobar la utilidad del sTREM-1 medido en LCR en el diagnóstico de ventriculitis asociada a DVE. METODOLOGÍA: Estudio prospectivo de casos consecutivos. Tres veces por semana, cursamos muestras de LCR para análisis citobioquímico, cultivo microbiológico y determinación de cifras de sTREM-1 (mediante ELISA). Una vez retirado, procesamos el DVE para cultivo semicuantitativo (mediante sonicación) y análisis mediante microscopio electrónico de barrido. RESULTADOS: Con el objetivo de analizar la biopelícula, en el primer artículo estudiamos 32 DVEs (56% impregnados en antibiótico). Se diagnosticó ventriculitis en 6 pacientes (19%) y colonización del DVE en 12 pacientes (38%). Todos los casos de ventriculitis fueron debidos a bacterias gramnegativas. Detectamos biopelícula en 24 DVEs (75%), más frecuente en pacientes con ventriculitis o colonización bacteriana. El desarrollo de biopelícula sobre los DVEs impregnados vs. no impregnados fue 50% vs. 80% en DVEs de < 7 días (P = 0’264) y 88% vs. 89% en DVEs de ≥ 7 días (P = 0’929). Con el objetivo de analizar la utilidad del sTREM-1 medido en LCR, en el segundo artículo analizamos 73 pacientes consecutivos. Se diagnosticó ventriculitis asociada a DVE en 6 pacientes y colonización del DVE en 10 pacientes. La mediana de sTREM-1 en LCR en el momento de diagnóstico de ventriculitis fue 4.320 pg/ml (rango intercuartílico, RI: 2.987 – 4.886) vs. 266 pg/ml (RI: 118 – 689); p <0’001. No se observaron diferencias al comparar pacientes colonizados y controles. La determinación de proteínas y glucosa en LCR y el ratio glucorraquia/glucemia fueron también significativamente diferentes (p < 0’001). CONCLUSIONES: La formación de biopelícula es un fenómeno común en los DVEs. Los DVE impregnados con clindamicina y rifampicina no lograron evitar la ventriculitis debida a bacterias gramnegativas multirresistentes, pero se observó una tendencia al retraso en el desarrollo de biofilm en los primeros 7 días de permanencia del DVE. Por otro lado, el sTREM-1 medido en LCR resultó útil para diagnosticar ventriculitis, en similar medida que otros parámetros clásicamente medidos en LCR (proteínas, glucosa). La determinación de sTREM-1 en LCR podría confirmar el diagnóstico de infección en casos dudosos y discriminar entre colonización del DVE e infección.
INTRODUCTION: External ventricular drain (EVD)-related ventriculitis is a severe complication associated with the use of these devices. The formation of biofilm on the surface of EVD may be an important pathogenic factor, but it has never been systematically studied. Moreover, the diagnosis of ventriculitis can be difficult in critically ill patients. Biomarkers of local infection, as the soluble form of the triggering receptor expressed on myeloid cells-1 (sTREM-1), could be useful in the diagnosis of ventriculitis. OBJECTIVES: To assess the presence of biofilm on the EVD and its relationship with the development of infectious complications. To evaluate the effect of antibiotic impregnated EVD on bacterial biofilm formation. To analyze the usefulness of sTREM-1 measured in cerebrospinal fluid (CSF) for diagnosis of EVD-related ventriculitis. METHODOLOGY: Prospective study of consecutive cases. Samples of CSF for culture, cytobiochemical analysis and sTREM-1 determination were extracted three times a week. Ventriculitis diagnosis required a combination of microbiological, cytobiochemical and clinical criteria. Once removed, EVD were cultured using standard bacteriological techniques and examined under a scanning electron microscope. RESULTS: To assess the presence of biofilm, in the first article 32 EVD were collected (56% antibiotic impregnated EVD). Ventriculitis was diagnosed in 6 patients (all cases due to gram-negative bacteria) and colonization of EVD occurred in 12 patients. Biofilm was more frequent on EVDs from patients with ventriculitis or bacterial colonization. The development of biofilm on impregnated vs non-impregnated EVD was 50% vs. 80% for EVD used <7 days (P = 0.264) and 88% vs. 89% for EVD ≥ 7 days (P = 0.929). To analyze the usefulness of sTREM-1 measured in CSF, in the second article we evaluated 73 consecutive patients. Ventriculitis was diagnosed in 6 patients and EVD- colonization in 10 patients. The median CSF sTREM-1 was 4,320 pg/ml (interquartile range, IQR: 2,987-4,886) vs. 266 pg/ml (118-689); p < 0.001. There were no differences when comparing colonized-patients and controls. Determination of CSF proteins, glucose and the ratio CSF/serum glucose were also significantly different (p 0.001). Serum biomarkers were not useful to diagnose EVD-related infection. CONCLUSIONS: The formation of biofilm on EVD surface is a common phenomenon. Clindamycin and rifampicin impregnated EVD failed to prevent ventriculitis due to multidrug-resistant gram-negative bacteria, but a trend of delayment of biofilm development was observed in the first 7 days. Furthermore, CSF sTREM-1 was useful in the diagnosis of ventriculitis, in a similar measure to classical CSF parameters (protein, glucose). CSF sTREM-1 could confirm the diagnosis of infection in uncertain cases and discriminate between EVD-colonization and infection.

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Eguía, López Emilio. "Desarrollo de la biopelícula en medio soporte permeable." Doctoral thesis, Universidad de Cantabria, 1991. http://hdl.handle.net/10803/10600.

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Abstract:

El objetivo más general de la presente investigación ha sido la posibilidad de desarrollar un proceso biopelícula sobre membranas porosas en general, e incluso sobre membranas permeables a gases e hidrófilas. La observación del desarrollo de la biopelícula en el medio soporte permeable al oxígeno, se constituyo en el objetivo principal de esta tesis. El campo de investigación se delimito al caso de la eliminación de la materia orgánica carbonácea del agua residual. Para realizar dichos objetivos, se diseñó una planta piloto (RSP), en la que se llevó a cabo una experimentación lo más amplia y completa posible. Se empleó un dispositivo para extraer la biopelícula del soporte, ideado para tal fin. La carga orgánica afluente (COA), varió desde 146 GDQO/m2.D. hasta 584 GDQO/m2.D. El caudal de oxígeno empleado fue de 0,167 kg/m2.D. 0,195 kg/m2.D y 0.223 kg/m2.D. Se emplearon dos medios soporte (MS), de tamaño de poro de 0,5 y 0,2UM. Se han realizado balances de sustrato, oxígeno, nitrógeno y sólidos. También se ha hecho un análisis paramétrico y biocinético, así como las comparaciones de resultados con otros procesos.Como resultados más importantes que definen el proceso estudiado se citan los siguientes: el rendimiento alcanzado superior al 90%, lo es para cargas orgánicas comprendidas entre 130 y 160 GDQO/m2.D. La biopelícula desarrollada en el soporte permeable al oxígeno, tuvo un porcentaje muy alto de volátiles (90%), una densidad muy elevada (90-105 kg/m3), y muy elevado espesor (3 mm). La producción de fangos ha resultado muy baja. Los sólidos suspendidos en el efluente estuvieron en valores máximos de 27 mg/l. Las tasas de consumo de oxígeno son comparables a las de otros procesos con oxígeno (TCO(DQO) 1,2:1,6 kgO2/kgDQO EL).

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Baeza, Lara Nicolás. "Caracterización de las vesículas de membrana de Shewanella vesiculosa M7(T)." Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2021. http://hdl.handle.net/10803/673929.

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Abstract:

La presente Tesis Doctoral se enmarca en el proyecto CTQ2014-59632-R concedido por el ministerio de economía y competitividad al grupo de investigación. El trabajo se ha centrado en caracterizar las vesículas de membrana (VM) de Shewanella vesiculosa M7T y explorar potenciales aplicaciones. Esta bacteria gramnegativa procedente de la Antártida fue descrita por nuestro grupo y ha sido usada como cepa modelo por la gran cantidad de VM que forma. Actualmente se acepta que las bacterias gramnegativas pueden formar distintos tipos de VM y que existen diferentes mecanismos de vesiculación implicados. A su vez, la formación de vesículas depende de diversos factores fisiológicos y ambientales. Todo ello, provoca que las VM de una población bacteriana puedan ser diversas en cuanto a su contenido y funciones, lo que les permite actuar en diversos procesos fisiológicos bacterianos. En estudios anteriores se demostró que S. vesiculosa M7T produce vesículas de membrana externa (VME) ya descritas y un nuevo tipo de vesículas que se denominaron vesículas de membrana externa e interna (VME-I) ya que se formaban por evaginación conjunta de ambas membranas y podían arrastrar contenido del citoplasma bacteriano como DNA. Las VME-I han suscitado un notable interés científico, de modo que un objetivo principal de esta tesis ha sido intentar separarlas del resto de VM de S. vesiculosa M7T para poder estudiar su contenido y su mecanismo de formación. La separación se ha conseguido mediante sorting por citometría de flujo de alta resolución, pero no en cantidades suficientes para poder trabajar con ellas. De todos modos, los estudios de citometría de flujo, junto con los de microscopía electrónica de transmisión y de crio-microscopía electrónica, han confirmado que la cantidad y tipo de vesículas producidas por S. vesiculosa M7T varía en función de su fase de crecimiento. Los diferentes ácidos nucleicos presentes en las VM han sido objeto de estudio en los últimos años con el objetivo de entender posibles mecanismos de regulación intercelular o de transferencia horizontal génica. En este trabajo, la secuenciación del genoma de S. vesiculosa M7T y del DNA contenido en sus VM, han confirmado que el genoma de la cepa estaba completamente representado en los fragmentos contenidos en las VM de cultivos de 24 y 48 horas. Además, permitió identificar la presencia de un fago lisogénico insertado en el genoma de la cepa. Por otro lado, a las 24 h de cultivo se han podido observar procesos de muerte celular programada (PCD). Este hecho, junto la presencia del genoma completo en los fragmentos de las VM, la identificación de un fago lisogénico y las imágenes de microscopía electrónica, han confirmado que en los cultivos de S. vesiculosa M7T se activa a las 24 horas, un proceso de lisis celular de una fracción de la población. Esta lisis es similar a la descrita como “lisis celular explosiva” por otros autores y da lugar a la formación de VME y VME-I mediante la recircularización de fragmentos de membranas de células explosionadas, lo cual confiere una gran heterogeneidad a la población de VM de S. vesiculosa M7T. Por tanto, podemos decir que existen dos mecanismos de formación de VME-I, el ya descrito por el grupo de extrusión conjunta de las dos membranas y el de la simple recircularización de fragmentos de membrana externa e interna generados en un proceso de lisis celular mediada por un fago. Las VM de algunas bacterias gramnegativas pueden contener otros componentes del citoplasma como ATP. Tanto las VM como el ATP extracelular (eATP) se han relacionado con la formación de biofilms. En este trabajo se ha estudiado la posible correlación entre la presencia de eATP en las VM y la capacidad de formar biofilms por parte de cepas antárticas descritas anteriormente por nuestro grupo de investigación. En la mayoría de las cepas analizadas, no se observó correlación entre estos estos factores estudiados. Solamente S. vesiculosa M7T secretó altos niveles de eATP y sus VM provocaron un aumento significativo en la velocidad y la cantidad de biofilm formado. También se observó que una gran parte del eATP está contenido dentro de las VM, protegido de la degradación enzimática, y que el ATP influye en la formación del biofilm. En relación al estudio de aspectos aplicados de las vesículas de S. vesiculosa M7T, se ha analizado la actividad bactericida de las VM de S. vesiculosa M7T frente a diversas cepas gramnegativas y grampositivas, tanto cepas procedentes de la Antártida como cepas de interés clínico. Las vesículas sólo han inhibido el crecimiento de bacterias grampositivas por su capacidad de degradar el peptidoglicano de dichas cepas, probablemente por la presencia de enzimas de tipo peptidoglicanasas. Sin embargo, la heterogeneidad y complejidad de las mezclas de VM han dificultado la reproducibilidad de los resultados, descartando su uso como antibióticos.

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Cendra, Gascón María del Mar. "Estudi de l'expressió i funció de les Ribonucleotidil Reductases d'Escherichia coli." Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2013. http://hdl.handle.net/10803/128932.

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Abstract:

La Ribonucleotidil Reductasa (RNR) és un enzim essencial encarregat de reduir els ribonucleòtids (NTP) als seus corresponents deoxiribonucleòtids (dNTP) per a la síntesi i reparació de l’ADN, és per això que requereix de ser finament regulat per mantenir els correctes nivells de dNTP cel•lulars. A diferència dels organismes eucariotes, els quals només codifiquen per una classe d’aquest enzim en el seu genoma (la classe Ia), els organismes procariotes poden codificar tres classes diferents de l’enzim (classe I, II i III) i diferents combinacions d’elles en el cromosoma. Les diferents classes de RNR s’expressen a diferents condicions ambientals, incrementant així la seva adaptació ambiental. El microorganisme Escherichia coli codifica en el seu genoma per la RNR de classe I (subdividida en classe Ia i Ib), la qual és activa en condicions aeròbiques, i classe III, només activa en condicions d’anaerobiosi. El principal objectiu d’aquesta tesi titulada “Estudi de l’expressió i funció de les Ribonucleotidil Reductases d’Escherichia coli” ha estat estudiar l’expressió diferencial i la funció de les RNR d’aquest bacteri en diferents condicions ambientals així com, intentar saber més sobre la seva regulació transcripcional. S’ha estudiat l’efecte del regulador global de transcripció gènica H-NS en la transcripció de les tres classes de RNR presents en E. coli i s’ha delimitat la regió d’unió del transcripcional en la regió promotora de la RNR de classe Ia. A més a més, s’ha volgut estudiar diferents efectes ambientals com l’osmolaritat, la temperatura i la disponibilitat d’oxigen en la regulació d’H-NS sobre les diferents classes de RNR. També s’ha pretés analitzar l’expressió diferencial de les diferents classes de RNR durant un procés de formació de biofilm i els mecanismes que fan canviar l’expressió de les RNR durant la maduració d’aquest complex bacterià. L’estudi s’ha dut a terme en una soca no patògena d’E. coli (la soca MG1655) però també en una soca enteropatogènica (la soca E2348/69) per intentar observar diferències o semblances en el patró d’expressió de les diferents classes de RNR durant la formació de biofilm. Seguidament, el fet que els organismes procariòtics expressin més d’una classe de RNR va fer que es volgués investigar una possible funció en la virulència bacteriana d’alguna de les diferents classes de RNR. En aquesta línia d’investigació s’ha estudiat l’expressió diferencial de les RNR durant un procés infectiu utilitzant la soca adhesiva i invasiva d’E. coli (AIEC) LF82, principal soca colonitzadora de malalts de Crohn i que te la capacitat de replicar dins del macròfag. Finalment, en aquesta tesi també s’ha inclós un estudi transcriptòmic global del factor transcripcional NrdR, inicialment descrit com a repressor de les diferents classes de RNR, amb l’objectiu de trobar més gens pertanyents al seu reguló i intentar trobar similituds en el seu mecanisme de regulació transcripcional gènica.
Ribonucleotide Reductase (RNR) is an essential enzyme responsible to provide the required dNTP for the DNA synthesis and repair. Surprisingly, eukaryotic organisms only encode for one class of the enzyme in their genome whereas in the prokaryotic world we can find three different classes of the enzyme (class I, II and III) and also different combinations of them encoded in the genome. The different classes of RNR are expressed in different environmental conditions and require to be tightly regulated to maintain the cellular dNTP pools. Escherichia coli encodes in its genome for the class I (subdivided in class Ia and Ib) and class III RNR. The global aim of this thesis has been to study the transcriptional regulation and the differential expression and function in different environmental conditions of the E. coli RNR classes. It has been provided the effect of the histone-like protein H-NS on the E. coli class Ia and III RNR transcription, the differential expression of the RNR classes during the biofilm formation of a non-pathogenic E. coli (MG1655 strain) and of an enteropathogenic E. coli (E2348/69 strain), the differential expression different RNR classes of the adherent and invasive E. coli (AIEC) LF82 during the infection and a global transcriptomic analysis of the NrdR transcriptional factor, only known for its repressive role on the transcription of RNR.

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Puig, Pitarch Carmen. "Nontypeable Haemophilus influenzae: colonization, infection and biofilm formation." Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2015. http://hdl.handle.net/10803/311616.

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Abstract:

Haemophilus influenzae is an opportunistic pathogen that forms part of the human nasopharyngeal microbiota. This microorganism is classified into encapsulated and nonencapsulated or nontypeable (NTHi) isolates, depending on the presence of a polysaccharide capsule. Although H. influenzae is a common respiratory commensal, it is also able to cause several infections, especially in patients with comorbidities. The most common respiratory infections in which H. influenzae can be identified as the main etiological agent are exacerbations in patients with Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD), community-acquired pneumonia (CAP), cystic fibrosis, and otitis media. In addition, this pathogen is also a common cause of invasive infections such as bacteraemia and meningitis. Before the introduction of the conjugate vaccine, H. influenzae serotype b (Hib) was the main cause of meningitis in children under five years. However, effective childhood vaccination has caused a dramatic reduction in Hib and allowed the expansion of NTHi, which is becoming more relevant in both respiratory and invasive infections. In this thesis, we studied three different aspects of the epidemiology of NTHi since the introduction of the vaccine. Our study focused on molecular genotyping, antimicrobial resistance and adhesion and biofilm formation of NTHi isolates from healthy children and from adult patients with CAP, COPD and invasive diseases. In the first part of this thesis, we set out to characterize the NTHi populations that are involved in adult infections in Bellvitge hospital. Furthermore, as humans are the only reservoir of NTHi, we aimed to identify the oropharyngeal carriage rate in healthy children attending day care centres in Oviedo. The aim of the second part of this thesis was to determine the antimicrobial susceptibility profile of clinical NTHi isolates, placing emphasis on the molecular characterization of B-lactam and fluoroquinolone resistance, the main antimicrobials used in the treatment of NTHi infections. The last part of this thesis focused on adhesion and biofilm formation. Biofilm is one of the mechanisms that microorganisms have developed in order to protect themselves and survive in hostile environments. Once the biofilm structure is formed, it is difficult to eliminate and, as a consequence, biofilm-associated infections commonly show recurrent symptoms. Although biofilm formation by NTHi remains controversial, biofilm-like structures have been observed in middle-ear mucosa in experimental chinchilla models of otitis media. Taken together, all the studies discussed in this thesis can improve our understanding of the clinical epidemiology of NTHi populations since the introduction of vaccination and of the mechanism of biofilm formation in clinical isolates of this microorganism.
Haemophilus influenzae és un patogen oportunista que forma part de la microbiota nasofaríngia humana. Aquest microorganisme es classifica en soques capsulades i no capsulades o no tipables (HiNT) depenent de la presència d’una càpsula polisacarídica. Tot i que H. influenzae és un comensal respiratori comú, posseeix la capacitat de causar diferents infeccions, especialment en pacients amb malalties de base. Les infeccions respiratòries més freqüents causades per H. influenzae són les exacerbacions agudes en pacients amb Malaltia Pulmonar Obstructiva Crònica (MPOC), pneumònia adquirida en la comunitat (PAC), exacerbacions en pacients amb fibrosis quística i otitis mitjana. A més, aquest patogen és també una causa freqüent de malalties invasives com bacterièmia i meningitis. Abans de la introducció de la vacuna conjugada, H. influenzae serotipus b (Hib) fou la causa principal de meningitis en nens/es menors de cinc anys d’edat. No obstant, l'efectiva vacunació ha causat un dramàtic descens del Hib permetent l’expansió dels HiNT, que s’estan convertint en un patogen més rellevant tant en infeccions respiratòries com en infeccions invasives. Els objectius plantejats en aquesta tesis, foren l’estudi de tres aspectes de la epidemiologia dels HiNT en l'etapa posterior a la introducció de la vacuna en Barcelona: la genotipificació molecular, la resistència antibiòtica i la formació de biofilm en soques d’HiNT aïllades de nens/es sans i de pacients adults amb PAC, MPOC i malalties invasives. L’objectiu de la primera part d’aquesta tesis fou caracteritzar les poblacions d’HiNT involucrades en les infeccions en pacients adults de l’hospital de Bellvitge així com la determinació de la freqüència de colonització orofaríngia d’HiNT en nens/es sans que van a llars d’infants en Oviedo. L’objectiu de la segona part de la tesis fou determinar els perfils de susceptibilitat antibiòtica dels aïllats clínics d’HiNT, emfatitzant en la caracterització molecular de la resistencia a B-lactàmics i fluoroquinolones, ja que són els antibiòtics més utilitzats en el tractament de les infeccions per HiNT. L’última part de la tesis està enfocada a l’estudi de l’adhesió i la formació de biofilm. El biofilm és un dels mecanismes que els microorganismes han desenvolupat per a la protecció i supervivència en ambients hostils. Una vegada l’estructura del biofilm està formada és molt difícil d’eliminar i, com a conseqüència, les infeccions associades a biofilm presenten símptomes recurrents. Tot i que la formació de biofilm per HiNT roman controvertida, estructures tipus biofilm s’han observat en la mucosa de l’oïda mitjana en models experimentals d’otitis mitjana en xinxilla. En conjunt, tots els estudis discutits en aquesta tesis contribueixen a ampliar el coneixement de la epidemiologia clínica, la resistència antibiòtica i la formació de biofilm de les poblacions d’HiNT en un període posterior a la introducció de la vacuna.

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Blanco, Cabra Núria. "Noves metodologies per al tractament de bacteris creixent en forma de biofilm." Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2021. http://hdl.handle.net/10803/671668.

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Abstract:

Les infeccions bacterianes han esdevingut un greu problema a escala mundial per culpa del mal ús que hom ha fet dels antibiòtics. L’adquisició de resistències als antimicrobians s’ha accelerat i cada cop hi ha més bacteris resistents a tots els antibiòtics coneguts. Aquest problema es veu agreujat quan els bacteris formen un biofilm i les infeccions es tornen cròniques. Els bacteris creixents en forma de biofilm produeixen una matriu extracel·lular protectora i adquireixen així un mecanisme extra de protecció vers els antibiòtics. A més, en l’actualitat no hi ha cap antibiòtic desenvolupat que sigui capaç d’actuar específicament contra els biofilms bacterians madurs i, per tant, es necessiten nous procediments i fàrmacs per a poder tractar-los. En aquest treball s’estudien noves metodologies per al tractament de bacteris creixent en forma de biofilm des de tres punts de vista diferents. En primer lloc, s’intenta buscar noves teràpies i, per això, s’analitza l’acció antimicrobiana i antibiofilm de noves molècules, que han sigut modificades químicament per a millorar el seu potencial contra els biofilms de Staphylococcus aureus. Una part d’aquestes molècules són derivades del triclocarban i unes altres són derivades de l’àcid oleanòlic i l’àcid maslínic. En ambdós casos s’han aconseguit molècules menys tòxiques i més actives que els compostos dels quals deriven, fins i tot contra la soca de S. aureus resistent a meticil·lina (MRSA). En segon lloc, es pretén desenvolupar una tecnologia que permeti determinar, de mantera senzilla i amb precisió, la sensibilitat antibiòtica dels biofilms, ja que els mètodes que es fan servir actualment es basen en el creixement microbià en forma planctònica i no són fiables en bacteris creixent en forma de biofilm. Seguint aquest fil, s’ha desenvolupat el dispositiu “BiofilmChip”, una estructura microfluídica que permet el creixement de biofilms de manera senzilla i l’anàlisi de la seva sensibilitat sense la necessitat d’usar un microscopi confocal. En tercer i últim lloc, es volen desenvolupar noves tecnologies per al tractament de biofilms utilitzant enzims disgregadors del biofilm i fent servir mètodes alternatius d’alliberament de fàrmacs (drug delivery), com són les nanopartícules. Així, s’ha treballat amb els enzims alginat liasa i desoxiribonucleasa I (DNasa I), que degraden components de la matriu extracel·lular dels biofilms i en trenquen l’estructura, fent possible que els antibiòtics travessin aquesta barrera i puguin actuar. Per una banda, s’ha analitzat l’especificitat, l’activitat disgregadora i la sinergia amb antibiòtics de cinc alginat liases contra els biofilms de Pseudomonas aeruginosa. Per altra banda, s’ha treballat amb unes nanopartícules que milloren l’activitat de l’antibiòtic tobramicina, ja que contenen l’enzim DNasa I que permet la penetració d’aquest antibiòtic en els biofilms de S. aureus i P. aeruginosa. Aquestes nanopartícules, a més, estan marcades amb un fluoròfor, la qual cosa ha permès visualitzar la seva interacció amb la matriu extracel·lular del biofilm.

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Sabater, Liesa Laia. "Disentangling the complexity of chemical and physical stressors impacting river systems." Doctoral thesis, Universitat de Girona, 2021. http://hdl.handle.net/10803/671769.

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Abstract:

Humanity has always been closely linked to rivers, benefiting from their resources while producing impacts associated with their activity.Thus, river systems have been exposed to multiple stressors, which have affected the quality of water and their biological communities, such as those attached to substrata (biofilms) or those that are suspended in water (phytoplankton). On the other hand, biological communities also respond and contribute to the transformation and/or degradation of certain anthropogenic organic compounds, such as pharmaceuticals. This thesis investigates the chemical state of the river systems and their impacts on the biological communities, using different approaches and scales
La humanitat ha estat sempre íntimament lligada als rius, beneficiant-se dels seus recursos però també produint impactes vinculats a la seva activitat. Així doncs, els sistemes fluvials han estat exposats a múltiples estressos, que han afectat la qualitat de l’aigua així com a l’ecosistema de les seves comunitats biològiques, com les adherides al biofilm o bé les que estan en suspensió a l’aigua, com el fitoplàncton. A més, les comunitats biològiques també responen i contribueixen a la transformació i/o degradació d’alguns compostos orgànics d’origen antropogènic, com els fàrmacs. Aquesta tesi investiga l’estat químic dels sistemes fluvials, i els seus impactes, utilitzant diferents aproximacions i escales
Programa de Doctorat en Ciència i Tecnologia de l'Aigua

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ARCHUNDIA, VELARDE ENRIQUE DANIEL 541109, and VELARDE ENRIQUE DANIEL ARCHUNDIA. "Desarrollo de una biopelícula activa, que aumente la vida de anaquel en carne de bovino." Tesis de doctorado, Universidad Autónoma del Estado de México, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11799/105413.

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Abstract:

Tesis de Doctorado
La carne es esencial en la alimentación humana por su calidad nutrimental. Sin embargo, es un producto degradable por oxígeno y microorganismos, los cuales, ponen en riesgo la calidad e inocuidad del alimento. De ahí la importancia de ocupar empaques plásticos que muestren y protejan éste tipo de productos. Sin embargo, los convencionales son altamente contaminantes por su baja degradación. Por ello en la actualidad se han desarrollado las denominadas biopelículas activas de fácil degradación y que confieren actividad antimicrobiana y antioxidante. Así, el objetivo de la investigación es desarrollar y caracterizar una biopelícula activa con desechos agroindustriales, que mejore las características fisicoquímicas y de inocuidad en la vida útil de carne bovina. Para ello se usó un diseño experimental factorial 3x3 entre tres concentraciones (etanol:agua 20:80, 50:50, 80:20 v/v) y tres residuos (hojas: guayaba aguacate y ciruelo). El resultado indicó que las mayores concentraciones las presentó la interacción 50:50 v/v (etanol/agua) con la hoja de guayaba (fenoles totales=111.78.8 mg GAE/g MS, saponinas =88.56.92 mg/g MS y Actividad antioxidante=450.318 μM TEAC/g MS). Posteriormente, se realizaron pruebas de capacidad antimicrobiana, donde solamente muestra inhibición el extracto de hojas de guayaba en contra de 8 microorganimos patógenos evaluados mostrando una capacidad mínima inhibitoria en un rango 0.62-1.25 mg/ml. Con estos resultados se realizaron biopelículas (Gelatina-quitosano) con y sin extracto de guayaba, las cuales fueron caracterizadas midiendo propiedades ópticas y mecánicas, VII permeabilidad, así como su morfología y propiedades térmicas. Encontrando como resultado que ambas muestran en general buenas propiedades plásticas., en cuanto al efecto que causo la adición del extracto se observan que no efecto las propiedades de grosor, elongación, módulo de Young, permeabilidad al vapor de agua y al oxígeno, así como la morfología, ni sus propiedades térmicas como TGA y DSC., ya que se muestran similares a las biopelículas sin extracto, En contraparte a esto la adición del extracto si mostro diferencia significativa (P<0.05) en resistencia a la tensión, donde se observa una diminución en este valor, así como un efecto visible en las imágenes SEM de la presencia y distribución homogénea de las micelas del extracto y las cuales se sugieren le brindan a las biopelículas un efecto benéfico bioactivo en la vida útil de carne bovina manteniendo la inocuidad y características fisicoquímica de la carne por un lapso mayor de tiempo.
UAEMex

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Ribera, Puig Alba. "Orthopaedic device-related infections: some thoughts on management and antimicrobial efficacy from a clinical and experimental perspective." Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2017. http://hdl.handle.net/10803/587107.

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Abstract:

Orthopaedic device-related infections represent a health care problem of first magnitude due to the increasing incidence, complexity of management, and elevated cost. These device related infections have etio-pathogenic features that involve the participation of bacteria in the stationary growth phase as well as mature biofilms, which makes their diagnosis and treatment more challenging. Several studies have been performed to ameliorate the present guidelines. Nevertheless, there are still many points of uncertainty and many relevant clinical questions remain unanswered. This thesis explores some of these unanswered questions in the field of orthopaedic device related infections from the perspective of an infectious diseases specialist. A. On the management of orthopaedic device-related infections A.1. Diagnostic aspects of PJI • Aim 1: to analyse the microbiological and clinical findings in patients with suspected prosthetic joint aseptic loosening, and to compare them to patients with chronic PJI Conclusions: 1.1 Several patients with suspected prosthetic aseptic loosening have misdiagnosed PJI or some microorganisms in their samples. 1.2 Sonication samples provide additional microbiological information that should help clinicians with the diagnosis of delayed low-grade infections that mimic natural aseptic failure. 1.3 Clinical parameters that determine the final prosthesis removal are correlated with the number of positive peri-prosthetic samples. A.2. Surgical management of PJI • Aim 2: to evaluate the risk of re-infection following one-stage and to-stage surgical revision with hip PJI Conclusions: 2.1 The one-stage revision strategy may be as effective as the two-stage revision strategy. B. On the assessment of antimicrobial efficacy for the treatment of orthopaedic devicerelated infections B.1. Infections by Streptococcus spp • Aim 3: to assess the efficacy of adding rifampicin to β-lactams for the treatment of streptococcal PJI managed with implant retention, and its impact on the prognosis Conclusions: 3.1 For the largest case series of stretopcoccal PJI managed with DAIR, this pathology showed a not-so-good prognosis as expected. 3.2 The treatment with β-lactams seems ideal for fighting the planktonic component of streptococcal PJI; the addition of rifampin some days or weeks after debridement could have a role in the antibiofilm profile to improve the current modest outcomes. 3.3 A concomitant and optimal surgical procedure is advised, following IDSA criteria and ensuring the exchange of removal components during the debridement. Similar prognosis results were observed when the IDSA criteria for DAIR were cutoff at the third month of revision. B.2. Infections by MDR Gram-negative bacilli B.2.1 The use of β-lactams in continuous infusion • Aim 4: to standardize a measurement procedure based on UHPLC-MS/MS for the simultaneous determination of multiple β-lactam concentrations in human plasma Conclusions: 4.1 The development of a single UHPLC-MS/MS method for the simultaneous measurement of multiple β-lactam concentrations in human plasma enable the applicability of this method to routine clinical practice and the validation of an easy-to use equation for clinical use. • Aim 5: to evaluate the efficacy and safety of β-lactams in continuous infusion for difficult-to-treat osteoarticular infections caused by Gram-negative bacilli, and to validate an easy method for clinical use Conclusions: 5.1 The use of β-lactams in continuous infusion is safe and effective, and may recover previously resistant strains that became susceptible in terms of their pharmacodynamic parameters. Lower doses could be used by BL-CI for susceptible strains. 5.2 A simple equation could help clinicians to estimate the β-lactams continuous infusion dosage and its plasma levels in the early hours of treatment. B.2.2 The use of antibiotic combinations with colistin • Aim 6: to evaluate the benefits of the combination of colistin and β-lactams when treating patients with MDR Pseudomonas aeruginosa infections Conclusions: 6.1 Current recommendations should consider the combination of low-dose colistin with β-lactams as an optimized treatment for osteoarticular infections caused by MDR P.aeruginosa. 6.2 This antibiotic combination is essential for achieving positive outcomes for these difficult-to-treat infections. • Aim 7: to study the effect of adding colistin to β-lactams against ESBL-producing klebsiella pneumoniae biofilm in an in vitro experimental model Conclusions 7.1 As expected, colistin in monotherapy was ineffective against biofilm-embedded bacteria and resulted in the emergence of colistin resistant strains. 7.2 Meropenem in monotherapy and its combination with colistin achieved rapid killing rates that were maintained until the end of treatment. However, only the combination showed bactericidal activity in one of the tested strains of ESBL-producing Klebsiella pneumoniae and its effect was more pronounced under conditions that produced a greater biofilm. The combined therapy avoided the emergence of colistin-resistant strains. 7.3 Our preliminary results may indicate a slight overall superiority in vitro of adding colistin to β-lactams against carbapenem-susceptible ESBL-producing K. pneumoniae.
Les infeccions osteoarticulars relacionades amb implants ortopèdics són un problema de salut de primera magnitud: per la seva incidència creixent, la seva complexitat i l’alt cost sanitari. Suposen un gran repte per l’especialista en malalties infeccioses, principalment per les seves particularitats etio-patogènicas amb participació de bacteris en fase estacionària de creixement i la formació de biofilm. Els objectius d’aquesta tesi pretenen explorar alguns aspectes no resolts sobre el maneig i la eficàcia antimicrobiana en el marc de la infecció osteoarticular relacionada amb l’implant. Al través de 7 treballs s’han desenvolupat els següents punts: • Estudi de les característiques clíniques i microbiològiques dels casos d’afluixament asèptic protèsic sotmesos a revisió, amb l’objectiu d’entendre millor aquesta entitat (interpretació dels cultius positius aïllats). • Estudi comparatiu del maneig quirúrgic de la infecció protèsica crònica: recanvi en un o dos temps. • Estudi de la infecció protèsica estreptocòccica manejada amb desbridament, antibiòtics i retenció de l’implant (DAIR); amb l’objectiu d’avaluar el pronòstic d’aquesta entitat i els factors que poden millorar la seva taxa de curació. • Estudi sobre l’ús de betalactàmics en infusió continua en les infeccions osteoarticulars relacionades amb implants causades per BGN, amb els objectius: 1) estandarditzar un procediment basat en UHPLC-MS/MS para la determinació dels nivells plasmàtics de betalactàmics, 2) validar una equació senzilla per estimar la dosis de betalactàmics òptima en perfusió continua i els nivells plasmàtics. 3) avaluar la seguretat i eficàcia antimicrobiana de l’ús de betalactàmics en infusió continua. • Estudis sobre l’eficàcia d’afegir colistina al tractament amb betalactàmics en el maneig d’infeccions gram-negatives multiresistents: 1) estudi clínic , 2) model in vitro per la formació de biofilm. Les principals troballes: • Alguns casos amb sospita d’afluixament protèsic asèptic són realment infeccions o presenten microorganismes aïllats sobre la superfície de l’implant. • L`estratègia de revisió protèsica pel tractament de les infeccions de pròtesis articulars en un temps pot ser (en general) tan efectiva com la revisió en dos temps. • La infecció protèsica estreptocòccica manejada amb DAIR va mostrar un pitjor pronòstic del descrit prèviament a la literatura. Un bon maneig de les guies IDSA, el recanvi dels components mòbils i la potencial eficàcia del tractament combinat amb rifampicina podrien millorar aquest modest pronòstic. • L’estandardització d’un mètode UHLPC-MS/MS per la determinació de betalactàmics permet la monitorització de nivells en pacients tractats amb perfusió contínua. • Mitjançant la comparació amb els resultats UHLPC-MS/MS s’ha pogut validar una equació simple per una estimació individualitzada de la dosi òptima de betalactàmics en perfusió continua i de nivells en plasma . • L’ús clínic de betalactàmics en perfusió continua és segur y eficaç. • Afegir colistina als betalactàmics en el tractament de les infeccions osteoarticulars produïdes per BGN multiresistents mostra millors resultats que el tractament en monoteràpia amb betalactàmic. • En el model in vitro per la formació de biofilm, també hem objectivat el benefici de la teràpia combinada amb colistina.

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Pérez, Cañestro Julio. "Aplicación de Nitrosomonas y Nitrobacter en forma de biopelícula para la nitrificación biológica en reactores de lecho fijo." Doctoral thesis, Universitat Autònoma de Barcelona, 2001. http://hdl.handle.net/10803/5294.

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Abstract:

El trabajo se ha desarrollado en el marco del proyecto MELISSA (Micro Ecological LIfe Support System Alternative) de la Agencia Europea del Espacio. Este proyecto se basa en el diseño de un Sistema de Soporte de Vida basado en microorganismos que pretende gestionar la atmósfera a partir de la transformación de los residuos generados en alimento comestible. Uno de las partes del proyecto es un biorreactor de nitrificación biológica, dicha parte es la que se desarrolla en el presente trabajo. Se ha realizado la caracterización de la operación del proceso de nitrificación biológica en forma de biopelícula en reactores de lecho fijo, para lo cual se han utilizado un reactor a escala piloto (de aproximadamente 8 L de volumen total), y tres reactores a escala laboratorio (de 0.65 mL de volumen total) con las bacterias Nitrosomonas europaea (ATCC 19718) y Nitrobacter winogradskyi (ATCC 25391) inmovilizadas sobre cuentas de poliestireno (Biostyr®).

Dentro de la parte de desarrollo de los reactores, se implementó la instrumentación básica y se configuró el control de las principales variables biotecnológicas que afectan al proceso de nitrificación biológica en biopelícula: pH, temperatura, oxígeno disuelto, presión, control de nivel, etc. Para profundizar en el conocimiento de este tipo de reactores se realizó una caracterización física en la que principalmente se estudió la mezcla de la fase líquida y la determinación del coeficiente de transferencia de oxígeno de la fase gas a la líquida. Posteriormente se definió y validó un modelo que permite describir la mezcla de la fase líquida en los reactores de lecho fijo que se utilizaron.

Con ambos tipos de biorreactores se realizaron experimentos en continuo de nitrificación biológica para determinar el efecto de las principales variables que afectan al proceso: carga amoniacal, temperatura y oxígeno disuelto. A partir del análisis de éstos experimentos se ha definido y validado un modelo dinámico que permite describir satisfactoriamente los resultados experimentales obtenidos e interpretar diferentes aspectos con relación a la nitrificación biológica, como son la respuesta del sistema ante perturbaciones de carga amoniacal ya sea debido a variaciones en el tiempo de residencia hidráulico o variaciones de la concentración de amonio en el alimento.
The present work has been developed in the frame of the MELISSA project (Micro Ecological LIfe Support System Alternative) of the European Space Agency (ESA). The aim of the project is the design of a Life Support System based in microorganisms, to manage the atmosphere from the transformation of the generated wastes into edible matter. A part of the project is a biological nitrifying bioreactor, which is developed in the present work. A complete characterisation of the operation of the biofilm nitrification process in fixed bed reactors has been carried out. To this purpose, a pilot reactor (8 L of total volume) and three bench reactors (0.65 L of total volume) with immobilised biomass (Nitrosomonas europaea, ATCC 19718 and Nitrobacter winogradskyi, ATCC 25391) onto the surface of polystyrene beads (Biostyr®, used as physical support of the bacteria) were used.

In the part of reactor development, the basic instrumentation and control configuration of the main biotechnological variables that have direct influence in the biofilm nitrification process were implemented: pH, temperature, dissolved oxygen, pressure, level control, etc. To go deeply into the study of the behaviour of these reactors, a physical characterisation was carried out. Mainly, the liquid phase mixing and the oxygen mass transfer coefficient from the gas to the liquid phase were studied. After this, a mathematical model was defined and validated in order to describe the liquid phase mixing in the fixed bed reactors used.

Biological nitrifying experiments operating in continuous mode were carried out using both, pilot and bench reactors, to determine the effect of the main variables that have strong influence on the process: ammonium input load, temperature and dissolved oxygen. From the analysis of the experiments, a dynamic model that allow the proper description and interpretation of the experimental results obtained has been defined and validated. This model provides a suitable description of the system response against perturbations in the ammonium load, due to changes in the residence time used or, on the other hand, after variations in the input ammonium concentration.

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Reyes, Beltrán Evelyn Magdalena. "Implementación de una metodología para la medición de la actividad ureasa y arginina deiminasa y biopelícula oral humana." Tesis, Universidad de Chile, 2012. http://www.repositorio.uchile.cl/handle/2250/111704.

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Abstract:

Trabajo de Investigación Requisito para optar al Título de Cirujano Dentista
Introducción. La producción de amonio genera alcalinización de saliva y biopelícula dental, este amonio puede ser producido a través de enzimas como la ureasa (U) y arginina deiminasa (ADS), ambas presente en la cavidad oral. Esta mayor producción de amonio puede estar relacionada con un factor protector de caries. Para ello es necesario establecer como primera medida una metodología que permita la medición de la actividad enzimática de U y ADS en saliva y biopelícula oral humana, a través del amonio generado por estas. Material y Método. Se recolectaron muestras de saliva y biopelícula dental de 20 sujetos, 10 correspondían al grupo de bajo COPD (COPD = 0) y 10 al grupo de alto COPD (4 o más caries dentinarias). Se construyó una curva estándar de amonio, una curva estándar de proteínas totales y se midió la producción de amonio en las muestras señaladas, siendo este amonio expresado por la cantidad de proteínas totales presente en cada muestra respectiva, lo cual represento la actividad enzimática estudiada. Resultados. La metodología establecida permitió medir la actividad de U y ADS en saliva y biopelícula oral humana. El modo de conservación de muestras propuesto no genero pérdidas. La curva de calibración de amonio presentó un coeficiente de correlación 0,976 y la curva de calibración de proteínas un coeficiente de correlación 0,902. La actividad enzimática, al compararla entre grupos de bajo y alto COPD, fue mayor en el grupo de bajo COPD en todos los sistemas medidos, U en saliva, ADS en saliva, U en biopelícula, ADS en biopelícula, siendo estas diferencias estadísticamente significativas. Conclusión. En la muestra de este estudio se pudo establecer una metodología adecuada para la medición de actividades enzimáticas de ureasa y arginina deiminasa, y su relación con el riesgo de caries. La metodología presentada permitió la discriminación en la producción de amonio, entre grupos con bajo y alto COPD. Estos resultados sugieren menor presencia de caries en individuos con mayor producción de amonio, a través de los sistemas enzimáticos estudiados, dado por la alcalinización que genera el amonio en el medio oral.

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Llanos, Rosales Carlos Daniel. "Caracterización de bacteriófagos nativos candidatos a fagoterapia en infecciones causadas por Pseudomonas aeruginosa resistente a antibióticos y productoras de biopelícula." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2019. https://hdl.handle.net/20.500.12672/11042.

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Abstract:

Describe fagos específicos para Pseudomonas aeruginosa resistentes a antibióticos y productoras de biopelícula. Se aisló P. aeruginosa a partir de muestras de pacientes hospitalizados de dos centros de salud. Se determinó, su nivel de resistencia antibiótica, producción de biopelícula y presencia de profagos. Posteriormente se aislaron fagos nativos a partir de efluentes hospitalarios y se determinó su rango de hospedero (capacidad de infectar a cepas MDR y productoras de biopelícula). Debido a sus características morfológicas en la formación de placa y su amplio rango de hospedero, se seleccionó el fago ФMARC-GA para una caracterización microbiológica. Éste presentó un periodo de latencia de 40 minutos y un tamaño de explosión aproximado de 100 fagos, con morfotipo C1 perteneciente a la Familia Podoviridae del Orden Caudovirales. Las características del bacteriófago lo presentan como un candidato con gran potencial para fagoterapia en infecciones recalcitrantes ocasionadas por P. aeruginosa MDR y productora de biopelícul.
Tesis

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Dissertations / Theses on the topic 'Biopelículas'

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