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Dissertations / Theses on the topic 'Boucle microbienne'

Author: Grafiati
Published: 4 June 2021
Last updated: 4 February 2022

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1

Carrias, Jean-François. "La boucle microbienne en milieu lacustre : structure et fonctionnement des communautés picoplanctoniques et de protistes flagellés et ciliés." Clermont-Ferrand 2, 1996. http://www.theses.fr/1996CLF21822.

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Abstract:
Les dynamiques saisonniere et vertical des protistes, en relation avec les ressources nutritives particulaires ont ete etudiees dans deux lacs differents: le lac pavin et le lac de vassiviere. Par ailleurs, l'impact de predation des protistes phagotrophes sur les bacteries a ete estime au lac pavin. Les principaux resultats de ces etudes sont les suivants: 1) le developpement du picoplancton est essentiellement dependant de la temperature et de l'impact de predation, notamment des protistes phagotrophes 2) la distribution saisonniere et verticale des differents groupes de protistes est dependa
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2

Pekala, Gilberto Alves. "Régulation des communautés bacériennes planctoniques au sein de la boucle microbienne : étude des variations nycthemérales dans les lacs de niveaux tophiques différents." Toulouse 3, 1999. http://www.theses.fr/1999TOU30265.

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3

Elloumi, Jannet. "Distribution et rôle des microorganismes de la boucle microbienne dans la saline de Sfax : contribution à l'étude du fonctionnement microbiologique d'un milieu extrême." Clermont-Ferrand 2, 2006. http://www.theses.fr/2006CLF21639.

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Abstract:
Ce travail constitue la première étude annuelle de la biodiversité, la dynamique et la répartition spatio-temporelle des microorganismes de la boucle microbienne en relation avec quelques paramètres abiotique d'un milieu extrême : la saline de Sfax. Ce biotope est formé de bassins contigus de salinité croissante, allant de l'eau de mer de salinité 4% jusqu'aux bassins de cristallisation de sels de salinité supérieure à 32% où s'effectue la production des sels de halite. Les résultats obtenus au cours de cette étude soulignent l'importance de la salinité, des proies et des prédateurs dans la st
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4

Personnic, Sébastien. "Dynamique des communautés microbiennes et impacts des virus sur les bactéries auto- et hétérotrophes en milieu lacustre." Chambéry, 2007. http://www.theses.fr/2007CHAMS023.

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Abstract:
L'analyse écosystémique pluriannuelle menée dans les eaux de surface des lacs Léman, du Bourget et d'Annecy nous a permis d'étudier la dynamique des particules virales et des communautés procaryotiques (bactéries hétérotrophes et picocyanobactéries). Ce suivi, opéré de juillet 2002 à décembre 2006 dans la strate 0-50 m a permis de mettre en évidence (I) une forte reproductibilité interannuelle des dynamiques bactériennes, picocyanobactériennes et virales (II), l’importance du forçage saisonnier (i. E. La température) et de la prfondeur (épi- vs hypolimnion) (III) des abondances et des dynamiqu
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5

Pecqueur, David. "Rôle des protozoo-et virioplancton dans le contrôle des bactérioplancton et phytoplancton en zone côtière Méditerranéenne." Thesis, Montpellier 2, 2011. http://www.theses.fr/2011MON20149.

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Abstract:
Ce travail de thèse focalise sur le fonctionnement du réseau microbien de la lagune de Thau à travers une approche « Réseau » ayant permis l’étude simultanée de l’ensemble des groupes microbiens (21 groupes) des virus au microzooplancton. La croissance et la mortalité des micro-organismes ont été étudiées expérimentalement lors de plusieurs saisons puis d’une étude en mésocosme. Nous avons déterminé les proportions de mortalité dont sont responsables le microzooplancton et les virus au travers de la lyse virale. Un suivi in situ puis en mésocosme dans la lagune de Thau nous a permis d'observer
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6

Benoliel, Corinne. "La flore cutanéomuqueuse et ses perturbations." Paris 5, 1991. http://www.theses.fr/1991PA05P087.

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7

Barbagallo, André Luiz. "Étude de la diversité microbienne sous gingivale chez des patients diabétiques." Thesis, Université Laval, 2012. http://www.theses.ulaval.ca/2012/29151/29151.pdf.

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Abstract:
Notre objectif est d’étudier la façon dont le diabète affecte les interactions hôte-bactéries en mettant l'accent sur la diversité microbienne dans les poches parodontales profondes et peu profondes utilisant la technique d’analyse clonage du gène de l'ARNr 16S. Parmi les 1650 clonages en 12 patients sélectionnés pour l’étude, nous avons identifié plusieurs espèces bactériennes. En effet, dans les deux groupes, nous avons mis en évidence des espèces comme Tannerella forsythia, Porphyromonas gingivalis, Treponema denticola et Fusobacterium nucleatum, avec peu de différence, sauf une prévalence
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8

Alain, Karine. "Approches culturales et moléculaires des assemblages microbiens associés aux polychètes hydrothermaux de la famille Alvinellidae." Brest, 2003. http://www.theses.fr/2003BRES2027.

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Abstract:
Cultural and molecular approaches were used to analyse the microbial assemblages associated to the deep-sea hydrothermal vent polychaete worms of the family Alvinellidae. In a first part of the work, the populations associated to three alvinellid species from the Juan de Fuca Ridge (paralvinella palmiformis, paralvinella pandorae and paralvinella sulfincola) were identified by phylogenetic analyses. A wide microbial diversity was detected, like a great number of new sequences or of sequences belonging to species previously unidentified at deep-sea hydrothermal vents. All the libraries were fou
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9

Koller, Robert. "Amoebae in the rhizosphere and their interactions with arbuscular mycorrhizal fungi : effects on assimilate partitioning and nitrogen availability for plants." Thesis, Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2008. http://www.theses.fr/2008INPL080N/document.

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Abstract:
Les interactions entre les végétaux et les organismes telluriques sont déterminantes pour la décomposition des matières organiques et la nutrition minérale des plantes. L’objectif général de la thèse était de comprendre comment les interactions multi-trophiques dans la rhizosphere agissent sur la disponibilité en azote minéral et l’allocation en carbone dans la plante. Nous avons mis au point des dispositifs de culture de plante, permettant de contrôler l’environnement biotique des racines (inoculation par des espèces symbiotiques modèles : un protozoaire bactériophage et/ou une espèce mycorhi
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10

Nercessian, Olivier. "Etude de la diversité spécifique et fonctionnelle des communautes microbiennes associées à des sources hydrothermales marines profondes par des approches moléculaires." Brest, 2003. http://www.theses.fr/2003BRES2005.

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Abstract:
Nos connaissances de la diversité des communautés microbiennes marines ont longtemps été restreintes aux informations précieuses, mais incomplètes, issues de l'utilisation de méthodes de culture. Lors de cette étude, des techniques moléculaires (PCR, RT-PCR, clonage, séquençage, hybridation) et des marqueurs génétiques [ARNr 16S, gènes codant pour des enzymes spécifiques de différentes voies métaboliques (mcr A, pmo A, dsrAB)] ont été utilisés pour contourner les limites inhérentes aux méthodes de culture et accéder à une vision plus réaliste de la diversité spécifique et fonctionnelle de comm
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Postec, Anne. "Diversité de populations microbiennes thermophiles d'une cheminée hydrothermale océanique : cultures d'enrichissement en bioréacteur et isolement d'espèces nouvelles." Aix-Marseille 1, 2005. http://www.theses.fr/2005AIX11049.

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Abstract:
Dans le cadre de l'exploration de la diversité microbienne des sources hydrothermales océaniques profondes, les techniques moléculaires basées sur l'analyse du gène codant pour l'ARN ribosomique 16S ont permis la mise en évidence d'une grande diversité archéenne et bactérienne. Cependant, la diversité des micro-organismes hydrothermaux cultivés à ce jour reste bien inférieure à celle décrite par l'approche moléculaire. Des méthodes innovantes doivent alors être mises en oeuvre pour cultiver de nouveaux micro-organismes, et ainsi déterminer leurs caractéristiques métaboliques et leur rôle poten
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Ben, Aissa Fatma. "Ecologie microbienne des systèmes hydrothermaux marins alcalins de la baie de Prony (Nouvelle-Calédonie)." Thesis, Aix-Marseille, 2015. http://www.theses.fr/2015AIXM4760.

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Abstract:
Nous avons étudié l’écologie microbienne d’un site hydrothermal alcalin sous-marin peu profond (0-50 m) localisé dans la baie de Prony (PHF) dans le sud de Nouvelle-Calédonie (Pacifique Sud-Ouest) comparable par son fonctionnement au site hydrothermal alcalin profond (800m) de Lost City (LCHF) (Dorsale médio-atlantique). PHF au même titre que LCHF est un système hydrothermal ultramafique associé à des réactions de serpentinisation des roches du manteau terrestre, libérant des fluides anoxiques très alcalins (jusqu'à pH 11) riche en calcium, en hydrogène et en méthane dissous. Le site hydrother
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13

Lazar, Cassandre Sara. "Diversité et activité des communautés microbiennes dans des sédiments marins associés aux émissions de fluides froids." Brest, 2010. http://www.theses.fr/2010BRES2003.

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Abstract:
La majorité du méthane, gaz à effet de serre, est stocké dans les sédiments marins. Or seule une faible proportion de ce méthane atteint l’hydrosphére et l’atmosphère, parce qu’il est consommé par un biofiltre efficace constitué d’Archaea anaérobies qui oxydent le méthane (ANME). Ce méthane a une origine principalement biogénique dans les sédiments marins, car il est synthétisé par des Archaea méthanogènes dans des sources profondes, et migre dans des zones spécifiques d’émissions de fluides froids des marges continentales. Dans le but d’étudier la diversité des communautés microbiennes associ
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Byrne, Nathalie. "Étude de la diversité métabolique des microorganismes des sources hydrothermales océaniques." Brest, 2008. http://www.theses.fr/2008BRES2032.

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Abstract:
Depuis la découverte des sources hydrothermales océaniques, la diversité microbienne de cet environnement a été étudiée en utilisant des approches culturales et moléculaires. Dans cette étude la diversité microbienne d’édifices hydrothermaux prélevés des sites TAG et Lucky Strike (Dorsale Médio-atlantique) a été étudiée par la réalisation d’inventaire moléculaires et de culture d’enrichissement en continu en bioréacteur. Afin de se rapprocher au mieux des conditions environnementales, les cultures ont été réalisées en condition et en présence d’hydrogéne et de dioxide de carbone ou en utilisan
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Pillot, Guillaume. "Biodiversités électroactives issues de sources hydrothermales profondes." Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0503/document.

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Abstract:
Les sources hydrothermales profondes sont des édifices géologiques formés par l’infiltration d’eau de mer dans la croûte océanique, formant un fluide chaud (>400 °C), riche en métaux qui précipite pour former des cheminées dans lesquelles circulent un courant électrique. Les travaux de recherche présentés ici avaient pour objectif de révéler la présence de microorganismes capable de participer à la production de ce courant électrique ou d’utiliser cette électricité pour vivre au sein de ces cheminées électriquement conductrices. Nous nous sommes focalisés sur les microorganismes capables de
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Qasemian, Leila. "Caractérisation du potentiel de dégradation de matières organiques naturelle (litière) et anthropique (HAP) par les communautés microbiennes issue du milieu littoral méditerranéen." Thesis, Aix-Marseille, 2012. http://www.theses.fr/2012AIXM4794/document.

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Abstract:
Les écosystèmes méditerranéens littoraux sont soumis à divers stress environnementaux naturels (stress hydrique et halin) et anthropiques susceptibles de s'intensifier dans les prochaines décennies. Dans ce contexte, le fonctionnement des communautés microbiennes - encore très peu étudiés dans de tels milieux - était important à préciser. L'effet du stress halin sur la transformation de la matière organique dans la litière de pin d'Alep issues des calanques de Marseille a été estimé ainsi que le potentiel de biodégradation d'un polluant chronique, l'anthracène, un Hydrocarbures Aromatiques Pol
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Duflos, Marie. "Biogéochimie des lipides en milieu marin côtier anthropisé : baie de Marseille - Méditerranée." Thesis, Aix-Marseille 2, 2010. http://www.theses.fr/2010AIX22008/document.

Full text
Abstract:
Le cycle biogéochimique des lipides a été étudié en milieu marin côtier anthropisé. Ce travail est basé sur l’analyse chimique des stocks de lipides par CCM/DIF et la mesure de leur hydrolyse par les communautés bactériennes associées à ces stocks. Un développement méthodologique a eu pour objectif d’identifier les bactéries marines possédant l’activité lipase. Le substrat testé (ELF-palmitate), vendu comme marqueur potentiel des lipases, n’est pas hydrolysé spécifiquement par ces dernières. Par conséquent, il ne constitue pas un outil adéquat pour l’identification des bactéries lipases en mil
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Arab-Jaziri, Faten. "Etudes structures/Fonctions et Ingénierie de l'alpha-L-arabinofuranosidase de Thermobacillus Xylanilyticus." Thesis, Toulouse, INSA, 2012. http://www.theses.fr/2012ISAT0053/document.

Full text
Abstract:
Dans ce projet de thèse, une variété de techniques a été employée pour étudier l’alpha-L-arabinofuranosidase de Thermobacillus xylanilyticus (TxAbf), notamment en ce qui concerne les relations structure/fonctions et son activité de transglycosylation. Nos travaux ont eu pour objectif d’apporter un éclairage quant au rôle de la dynamique dans l’activité catalytique de la TxAbf, en se focalisant sur le mouvement de la boucle bêta2alpha2, et d’explorer la spécificité du sous-site [+1], un élément du site actif qui est particulièrement pertinent pour l’activité de transglycosylation. Enfin, nous a
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DAMANHURI, IMAM-SLAMET TRI-PADMI. "Contribution a la mise au point de tests d'activite biologique pour les dechets soumis a biodegradation." Paris 7, 1987. http://www.theses.fr/1987PA077029.

Full text
Abstract:
L'utilisation du substrat enzymatique, le ttc, dans le test d'activite deshydrogenasique, permet d'evaluer l'activite de la biomasse active dans des milieux varies telle une boue activee, un milieu liquide anaerobie tel des lisiers, ou un milieu heterogene comme des ordures menageres. Ce test permet de prevoir l'apparition d'un phenomene de gonflement des boues en presence de germes filamenteux. Il est utilisable egalement comme outil toxicologique, puisqu'il permet d'identifier le mode d'action du toxique sur le systeme enzymatique controle. Dans les milieux heterogenes naturels, comme dans u
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