Dissertations / Theses: 'Cacaoyer'

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Sossou-Dangou, Justine. "Etude des modifications biochimiques de l'albumen des graines de cacaoyer (Theobroma cacao L. ) au cours de leur développement. Application à l'amélioration de l'embryogénèse somatique." Montpellier 2, 2000. http://www.theses.fr/2000MON20040.

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Abstract:

Le cacaoyer (theobroma cacao l. ) est une plante perenne dont les programmes de selection sont tres longs. L'embryogenese somatique a partir des tissus sporophytiques represente une voie interessante par laquelle on peut esperer multiplier rapidement des clones elites. Le milieu de culture est un facteur determinant pour la reussite de l'embryogenese somatique. Ce travail a ete entrepris dans le but d'ameliorer les milieux de culture pour la regeneration d'embryons somatiques, prenant comme modele de reference la graine de cacaoyer, une graine exalbuminee. L'etude histocytologique de l'ontogenese des embryons et l'analyse de l'albumen de quelques stades de developpement de la graine ont fait l'objet de la premiere partie de ce travail. Quatre stades ont ete observes : i (embryon globulaire), i-ii (embryon cordiforme), ii (embryon cotyledonaire) et iii (embryon cotyledonaire en croissance). Il a ete observe que l'albumen cellulaire qui entoure l'embryon commence a degenerer au stade i-ii, au debut de la mise en place de la symetrie bilaterale chez l'embryon. Les resultats obtenus a partir des analyses montrent que l'albumen de cacaoyer est similaire aux autres albumens par sa richesse en acides amines, acide malique, phosphates, sulfates, aia, ipa, zeatine, et zeatine-riboside. Il presente cependant deux particularites, a savoir la preponderance des sucres reducteurs glucose et fructose qui representent 90% des sucres solubles, l'absence d'acides amines soufres la cysteine et la methionine. Deux phases ont ete distinguees. La phase 1 ou la symetrie bilaterale de l'embryon n'est pas encore en place (stade i et i-ii). Pendant cette phase, les sucres solubles, ammonium, phosphates, aia, ipa et zeatine-riboside sont a leur taux le plus eleve, alors que ceux des acides amines, du potassium et du magnesium sont faibles. A la seconde phase, la symetrie bilaterale est mis en place, et l'embryon est en croissance. Les taux de sucres solubles, d'ammonium, de phosphates, d'aia, d'ipa, de zeatine-riboside diminuent, et ceux du potassium, magnesium, des acides amines augmente. Ces derniers taux ont ete appliques a la croissance des embryons. D les resultats de l'analyse de l'albumen ont servi de base pour la formulation de nouveaux milieux de culture. Ceux-ci sont proposes en modifiant un seul element dans les milieux temoins. De tous ces milieux seuls ceux contenant la zeatine ou l'aia ont ete efficaces. La zeatine a ameliore de facon significative le taux d'embryogenese somatique des staminodes de deux clones etudies, et celui des cotyledons d'un clone. L'aia a augmente significativement le taux d'embryogenese somatique des cotyledons d'un clone.

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Aguilar, Vega Maria Elena. "Le microbouturage du cacaoyer (Theobroma cacao L. ) : identification et étude de quelques facteurs limitants de la réactivité des explants." Toulouse, INPT, 1996. http://www.theses.fr/1996INPT003A.

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Abstract:

Une faible reactivite des bourgeons d'explants nodaux de cacaoyer est observee dans les conditions preconisees par les auteurs: blocage du developpement des bourgeons et heterogeneite de reponse morphogenetique. Une demarche a ete mise en place pour definir les facteurs responsables du manque de reactivite. Les infections par champignons et par bacteries, phenomenes lies aux fluctuations climatiques, constituent un facteur limitant pour l'etablissement de cultures primaires saines. Une precocite dans les reponses morphogenetiques et une augmentation des capacites morphogenetiques sont observees dans les cas suivants: 1 des explants preleves sur des pieds meres en phase dormante par rapport aux explants preleves sur des pieds-meres en croissance active, 2 des bourgeons preleves en differente position sur le rameau: les bourgeons les plus eloignes de l'apex etant les plus reactifs, 3 des bourgeons issus de nuds cotyledonaires compares aux bourgeons d'explants classiques plus ages (2 ans). Le microgreffage des bourgeons classiques sur des porte-greffe juveniles a permis une meilleure reponse morphogenetique du bourgeon, lie a une amelioration de l'alimentation du bourgeon greffe et des caracteristiques de juvenilite du porte-greffe. Des donnes histologiques ont permis de caracteriser les differents stades morphogenetiques des explants en culture primaire et de conforter les resultats concernant l'etat hydrique des explants. L'etude des caracteristiques hydriques des explants au cours de la culture montre un gradient de potentiel hydrique et osmotique entre le milieu et la base de l'explant favorable a l'entree d'eau. Un ajustement osmotique par entree d'eau dans l'explant s'effectue des la premiere heure de culture. Celui-ci est plus important chez les explants cotyledonaires que chez les explants classiques. La desinfection des explants classiques entraine une deshydratation et une plasmolyse des tissus. En consequence, des degats induits sur la membrane cellulaire, peuvent etre responsables de la mauvaise reponse des explants classiques. L'etude de l'absorption des explants par l'utilisation de la technique d'autoradiographie et le marquage des explants (#3#2p), devrait etre poursuivi si l'on veut aller plus loin dans la quantification des capacites d'absorption des explants de cacaoyer par ces techniques. Les premiers resultats concernant l'enracinement montrent que les pousses primaires issues des explants classiques s'enracinent in vitro. Ils ont permis le sevrage et la reprise de croissance des microboutures ex vitro

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CLAEYS, CROUZILLAT FLORENCE. "Contribution à la transformation génétique du cacaoyer Theobroma cacao L." Rennes 1, 1999. http://www.theses.fr/1999REN10127.

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Abstract:

Theobroma cacao l. Est une espece ligneuse tres sensible aux contraintes phytosanitaires. La transformation genetique du cacaoyer permettrait de lui conferer rapidement des nouveaux caracteres, par exemple, de resistance a des pathogenes ou de qualite. Des essais de transformation genetique par agrobacterium tumefaciens ont ete tentes sur des embryons somatiques blesses et des cals embryogenes. Le protocole de transformation a ete etudie par etapes successives en se basant sur l'expression transitoire du gene uida puis, en associant les conditions les plus efficaces pour chacune des etapes prealablement etudiees. Un protocole de transformation genetique a pu etre ainsi propose et un pourcentage eleve d'embryons exprimant le gene uida de facon transitoire a ete observe. Une methode de decontamination originale a ete mise au point en associant l'immersion temporaire dans des unites de filtration sartorius a l'utilisation d'antibiotiques. Un agent selectif a egalement ete recherche afin de selectionner les eventuelles cellules transgeniques. Le protocole, ainsi defini n'a pas abouti a la regeneration de tissus transformes de facon stable. Par contre, l'association originale d'un protocole de cryocotraitement et de transformation genetique a permis l'obtention de cals resistants a la kanamycine et exprimants le gene uida de facon stable. La regeneration de ces cals est en cours d'etude.

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CHATELET, PHILIPPE. "Contribution a l'etude de l'embryogenese somatique chez le cacaoyer (theobroma cacao l. )." Paris 11, 1991. http://www.theses.fr/1991PA112131.

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Abstract:

Les travaux rapportes ont ete effectues selon une approche tres generale de l'embryogenese somatique chez le cacaoyer; ils ont porte a la fois sur l'etude de l'embryogenese directe (sans phase de callogenese) a partir d'embryons zygotiques ainsi que sur les conditions d'obtention de l'embryogenese indirecte a partir de tissus permettant le clonage d'individus adultes. Plusieurs facteurs, dont les regulateurs de croissance, susceptibles d'influer sur le taux de reaction embryogene d'embryons zygotiques, ont ete etudies; le role inhibiteur de la kinetine (en combinaison avec l'ana) sur le taux d'embryogenese a notamment ete mis en evidence. L'embryogenese adventive d'embryons somatiques a pu etre maintenue pendant deux ans; l'histologie a permis de preciser que ce bourgeonnement se produit a partir de la zone du suspenseur ainsi qu'a partir du protoderme. La callogenese a ete induite a partir d'hypocotyles, de petioles et de feuilles provenant de semis steriles, a partir de feuilles de plantes cultivees en serre, et d'explants composes du nucelle et du tegument interne de tres jeunes graines. Des nodules epidermises ou meristematiques ont ete obtenus de facon reproductible a partir d'explants foliaires cultives sur un milieu de murashige et skoog (ms) modifie contenant 0,43 m de 2. 4. D et 4,4 m de bap. Le developpement de ces nodules n'a pu etre obtenu. Des cellules embryogenes et des proembryons ont egalement ete observes dans des nucelles et des teguments internes cultives sur un milieu de ms modifie contenant 4,5 m de 2. 4. D et 0,44 m de bap. L'etude histologique a permis de preciser la chronologie de l'apparition de ces structures embryogenes et d'observer leur differenciation precoce ainsi que l'accumulation de polyphenols oxydes. Le developpement de ces structures embryogenes ne s'est pas poursuivi

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LAURENT, VALERIE. "Etude de la diversite genetique du cacaoyer a l'aide des marqueurs rflp." Paris 11, 1993. http://www.theses.fr/1993PA112110.

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Abstract:

L'espece theobroma cacao est originaire de l'amerique tropicale. Elle est divisee en trois groupes, criollo, forastero et trinitario, sur la base des caracteres morphologiques et de l'origine geographique des clones. Cette classification ne se revele pas toujours appropriee pour l'identification des clones et le choix des parents pour les croisements. Une etude de la diversite de l'adn de cacaoyer a ete realisee a l'aide des marqueurs rflp. La variabilite de l'adn ribosomique nucleaire, de l'adn mitochondrial et des sequences d'adn complementaire confirme la structuration de l'espece en trois groupes. Les deux groupes criollo et forastero sont bien discrimines et pourraient correspondre a deux sous-especes differentes qui se seraient differenciees independamment de part et d'autre de la barriere andine. La structure hybride des trinitario est confirmee. Les trois groupes presentent une tres grande diversite qui depasse largement la variabilite des clones cultives. La sous-exploitation des ressources genetiques de l'espece concerne essentiellement les criollo et les forastero sauvages de guyane, du venezuela et d'equateur qui sont caracterises par des types originaux d'adn

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Clément, Didier. "Cartographie de qtl controlant des caracteres d'interet chez le cacaoyer (theobroma cacao l. )." Paris, Institut national d'agronomie de Paris Grignon, 2001. http://www.theses.fr/2001INAP0021.

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Abstract:

Cette etude concerne l'identification de qtl pour des caracteres d'interet agronomique dans deux fonds genetiques, trinitario et forastero, tres utilises en amelioration genetique du cacaoyer (theobroma cacao). Trois descendances, deux trinitario et un forastero haut-amazonien heterozygotes croises avec un meme forastero bas-amazonien homozygote, ont ete analysees. Les observations phenotypiques, realisees a abengourou en cote d'ivoire, concernent le rendement sur neuf annees de recoltes, la vigueur des arbres, des caracteristiques des feves et des fruits, le nombre d'ovules par ovaire ainsi que la resistance a la pourriture brune des cabosses (phytophthora palmivora) et aux mirides. Plusieurs qtl ont ete identifies pour tous les caracteres, sauf pour la sensibilite aux mirides. Les qtl de rendement expliquaient individuellement entre 8 et 19% de la variation phenotypique et certains d'entre eux ont ete stables sur plusieurs annees de recolte. Cependant, ils etaient differents entre les deux fonds genetique etudies. Pour les autres caracteres, certaines colocalisations de qtl ont ete trouvees entre les trois geniteurs. Un qtl pour le poids moyen du fruit expliquait 44% de la variation phenotypique, correspondant a un gene majeur. L'origine des alleles favorables (criollo ou forastero) impliques dans les qtl chez les deux parents trinitario a pu etre identifiee. L'ensemble des resultats nous permet de proposer l'utilisation de marqueurs moleculaires dans des schemas d'amelioration du cacaoyer.

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Efombagn, Mousseni Ives Bruno. "Diversité génétique et sélection du cacaoyer (Theobroma cacao L. ) au Cameroun : approches participative, phénotypique et moléculaire." Rennes, Agrocampus, 2008. http://www.theses.fr/2008NSARA057.

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Abstract:

La diversité génétique du cacaoyer (Theobroma cacao L. ) existant dans les plantations paysannes et dans les banques de gènes au Cameroun, a été étudiée à l’aide de 12 marqueurs microsatellites et par des évaluations phénotypiques de caractères d’intérêt agronomique. Les connaissances des producteurs sur le matériel végétal collectées dans le cadre d’un programme de sélection participative, ont été comparées avec les données moléculaires phénotypiques. La caractérisation moléculaire de ce matériel montre que les accessions des producteurs et des banques de gènes sont génétiquement proches. Les accessions des banques de gènes appartiennent à trois grands groupes génétiques de l’espèce, à savoir les Forastero haut-amazoniens (HA), les Forastero bas-amazoniens (BA) et les Trinitario (Tr). Six groupes de référence (Amelonado, criollo, Nana, Iquitos Mixed Calabacillo, Parinari et Scavina) supposés être à l’origine des cacaoyers cultivés au Cameroun, expliqueraient la quasi-totalité de la diversité génétique des accessions des poducteurs. Les gènes du groupe Amelonado étaient les plus représentés dans le matériel des producteurs. Très peu d’allèles spécifiques aux Scavina et Criollo ont été détectés dans ce matériel. La forte diversité moléculaire et phénotypique et la présence d’allèles uniques parmi les accessions des producteurs montrent l’existence d’un potentiel de sélection dans ce matériel. Ce potentiel a été mis en évidence par l’identificatin de plusieurs génotypes résistants à la pourriture des fruits, contrainte majeure de la cacaoculture au Cameroun. L’évaluation de la résistance à cette maladie suggère également que les connaissances des producteurs sur le niveau de résistance au champ de leurs cacaoyers, peuvent être exploitées efficacement dans la sélection participative
Génétic diversity of cacao (Theobroma cacao L. ) accessions in farmers’ field and genebanks in Cameroon was studied with 12 microsatellite markers and several phenotypic traits of agronomic interest. Knowledge of farmers on their planting material was collected within the framework of a participatory selection programme, and subsequently compared with molecular and phenotypic data. The molecular assessment of the arm accessions are closely related. GA beong to three main genetic groups of the cacao species : Upper Amazon Forastero (UA), Lower Amazon Forastero (LA) and Trinitario (Tr). The genetic diversity among FA could be largely explained by the contribution of six reference genomes (Amelonado, Criollo, Iquitos Mixed Calabacillo, Nanay, Parinari and Scavina) supposed to be at the origin of cultivated cacao populations in Cameroon. The genes from the Amelonado group predominated in the FA whereas those from Scavina and Criollo were less represented. The large molecular and phenotypic diversity and the presence of private alleles among FA show the potential for selection of this material. This potential was further demonstrated by the identification of several resistant genotypes among FA tested for resistance to Phytophtora pod rot (Ppr), the major cacao production constraint in the country. The results from Ppr evaluations suggest also that farmers’ knowledge on the field resistance of individual cacao trees might be exploited efficiently in the participatory breeding programme

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Falque, Matthieu. "Fécondation et développement des fruits et des graines chez le cacaoyer (Theobroma Cacao L. ). Influence de l'irradiation du pollen et de l'intensité de la pollinisation." Toulouse, INPT, 1994. http://www.theses.fr/1994INPT020A.

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Abstract:

Cette etude porte sur l'influence de la qualite et de la quantite du pollen, sur la fecondation et le developpement des fruits et des graines chez le cacaoyer (theobroma cacao l. ). Les experiences utilisent du pollen irradie aux rayons gamma, des melanges de pollen normal et irradie, ou de faibles quantites de pollen normal. Le pollen irradie jusqu'a 2000 gy germe in situ jusqu'aux ovules, mais in vitro, sa germination est inhibee par l'irradiation a forte dose (dl50 d'environ 1500 gy). Le pollen irradie a 1000 gy est souvent capable d'accomplir normalement la caryogamie, mais les gametes males restent parfois accoles aux noyaux du sac embryonnaire sans fusionner. Dans tous les cas, les ovules degenerent dans les 10 jours qui suivent. Les memes phenomenes sont observes avec de l'autopollen incompatible non irradie. La deuxieme mitose pollinique observee in vitro et la tenue des fruits sont fortement inhibees par l'irradiation du pollen (dl50 d'environ 70 gy). Le developpement des embryons issus de pollen irradie entre 50 et 90 gy est altere, mais l'albumen se developpe normalement. Les plantules issues de ces graines sont hybrides, et la frequence des mutants morphologiques y est 20 fois plus importante que chez les temoins. Des pollinisations avec differents melanges de pollen normal et irradie, montrent une competition entre les deux pollens pour l'occupation des ovules. Apres pollinisation avec un melange de pollen irradie a 1000 gy et de pollen normal, six plantules haploides ont ete obtenues, mais leur origine est probablement spontanee. Des melanges d'autopollen incompatible et de pollen compatible irradie a 100 gy ont permis de lever l'auto-incompatibilite. Une technique de comptage des grains de pollen sur les styles sectionnes 24 heures apres pollinisation a ete mise au point pour etudier l'influence de l'intensite de pollinisation sur la tenue et le remplissage des fruits. Dans les deux cas, une forte relation a ete mise en evidence et modelisee. L'importance de la pollinisation dans l'elaboration du rendement du cacaoyer est discutee

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Soupi, Nkeutcha Marietta Solange. "Implication des arabinogalactanes protéines dans le développement des embryons chez Theobroma cacao L." Limoges, 2013. https://aurore.unilim.fr/theses/nxfile/default/faf4039e-ff63-48ee-87e0-8bc90908d5bd/blobholder:0/2013LIMO4007.pdf.

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Abstract:

Trois génotypes de cacaoyer, choisis en fonction de leur degré d’embryogénie ont été utilisés pour rechercher l’implication des arabinogalactanes protéines (AGPs) au cours de l’embryogenèse de Theobroma cacao L. . Les critères morphologiques histologiques et biochimiques ont permis de caractériser les stades de développement permettant une analyse comparative de l’embryogenèse somatique et l’embryogenèse zygotique. Les protéines glycosylées présentaient une expression différentielle en fonction des stades de développement et des génotypes. Les AGPs ont été mis en évidence pour la première fois chez le cacaoyer à l’aide du β-D-glucosyl Yariv et des anticorps spécifiques anti AGPs sans que l'on ne puisse observer aucune différence au regard des stades de développement ou du génotype. Les AGPs des embryons de cacayer, isolées à l’aide du β-D-glucosyl Yariv ont été purifiées suivant leur polarité et leur masse moléculaire. Elles sont en majorité très glycosylées et présentent une composition en monosaccharides similaire dans les embryons somatiques et zygotiques, mais qui diffère de celle du milieu de culture. La séparation par le CES calibrée par les protéines a permis de définir les masses moléculaires apparentes. Trois fractions ont été détectées, de 7 kDa à 180 kDa ; 180 à 670 kDa et supérieure à 670 kDa. L’association de la détection UV à 215 nm et la fluorescence des protéines à 221/350 nm : Ex/Em permet de détecter facilement l’hétérogénéité des fractions des AGPs et de suivre l’évolution des AGPs au cours du développement des embryons. La fraction éluée entre 9 et 11 ml a été identifiée comme celle qui serait la plus impliquée dans l’embryogenèse chez le cacaoyer
Three genotypes of Theobroma cacao L. , selected according to their degree of embryogenesis were used to investigate the involvement of arabinogalactan proteins (AGPs) during embryogenesis. Morphological, histological and biochemical criteria were used to identify developmental stages for a comparative analysis of somatic and zygotic embryogenesis. Glycosylated proteins showed differential expression according to developmental stages and genotype. The AGPs were highlight for the first time in cocoa with the β-D-glucosyl Yariv reagent and specific antibodies against AGPs without developmental stages or genotype effect. The AGPs isolated from cocoa embryos using β-D-glucosyl Yariv reagent, were purified according to their polarity and molecular weight. They are mostly glycosylated. The monosaccharide composition is different in somatic and zygotic embryos from the culture medium. Separation by SEC after proteins calibration of the column allowed us to define the apparent molecular weight of cocoa AGPs. Three fractions were detected, from 7 kDa to 180 kDa; 180-670 kDa and greater than 670 kDa. The combination of UV detection at 215 nm and proteins fluorescence at Ex/Em: 221/350 nm can detect the diversity of AGPs and has been used to monitor AGPs during embryos development. The fraction eluted between 9 and 11 ml has been identified as being heavily involved in the embryogenesis of cocoa tree

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Boulay, Michel. "Étude de la phénologie de différents hybrides de cacaoyer associés a six espèces d'arbre d'ombrage." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1999. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/ftp03/MQ38034.pdf.

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Mfegue, Crescence Virginie. "Origine et mécanismes de dispersion des populations de Phytophthora megakarya, pathogène du cacaoyer au Cameroun." Thesis, Montpellier, SupAgro, 2012. http://www.theses.fr/2012NSAM0015/document.

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Abstract:

L'introduction d'espèces exotiques dans un nouvel environnement constitue l'une des principales causes d'émergence d'agents pathogènes des plantes, à l'origine d'invasions biologiques. C'est le cas de la pourriture brune des cabosses causée par Phytophthora megakarya, à la suite de l'introduction du cacaoyer en Afrique. Cet agent pathogène est endémique à l'Afrique et l'hypothèse la plus probable est celle d'un saut d'hôte à partir d'une plante native africaine. Dans le but de réaliser une étude populationnelle et d'identifier son centre d'origine, nous avons mis au point 12 marqueurs microsatellites. Un total de 727 souches anciennes et récentes, provenant de toute la zone de production cacaoyère en Afrique (Cameroun, Gabon, Sao-Tomé, Nigeria, Togo, Ghana et Côte d'Ivoire) a été analysé. Un mode de reproduction de type clonal a été mis en évidence dans l'ensemble des zones étudiées. Des méthodes de structuration et d'assignation ont permis d'identifier 5 groupes génétiques : 3 groupes Afrique Centrale (AC1, AC2 et AC3), un groupe Afrique de l'Ouest (AO) et un groupe hybride (MC) au Cameroun. Les 5 groupes étaient représentés au Cameroun, suggérant une origine camerounaise de P. megakarya. Au Cameroun, 3 zones géographiques ont montré une forte diversité génétique, mais la zone Ouest qui abrite les zones refuge à Sterculiacées et où ont été implantées les premières cacaoyères serait la zone d'origine et de diversification potentielle de P. megakarya. Le deuxième chapitre de la thèse a porté sur la dynamique spatio-temporelle de P. megakarya en champ, afin d'apporter des informations biologiques complémentaires sur la survie et la dispersion de l'agent pathogène. Une étude épidémiologique a ainsi été menée pendant 2 années consécutives dans 2 zones agroécologiques contrastées au Cameroun (savane et forêt). Les résultats ont montré une diminution significative de l'incidence de la pourriture brune entre les 2 années, en relation certainement avec une variable climatique. Une surdispersion de l'incidence de la maladie a été détectée à la fin de chaque campagne dans les 2 zones, mais l'analyse des semivariogrammes tout au long des 2 campagnes de production a mis en évidence une dépendance spatiale des arbres infectés dans la seule zone forestière. Des foyers d'infection ont été mis en évidence à travers l'analyse de cartes de distribution de la maladie au cours des 2 années successives (GéoStat-R). Nous avons par ailleurs étudié la variabilité génétique entre les souches du sol et celles isolées sur cabosses. Une plus grande diversité génétique a été trouvée dans le sol par rapport aux cabosses infectées, confirmant ainsi que le sol est bien la source d'inoculum primaire de P. megakarya. Mots-clés : Pourriture brune des cabosses, Phytophthora megakarya, émergence, centre d'origine, marqueurs microsatellites, méthodes d'assignation, reproduction clonale, dynamique spatio-temporelle, foyers d'infection
The introduction of exotic species in a new environment is at the origin of most of the biological invasions. Black pod disease of cacao is an emerging disease caused by Phytophthora megakarya, since the introduction of the cacao in Africa. P. megakarya is endemic in Africa and had most likely emerged on cacao following a host jump from an African native plant. In order to achieve a population study and to identify the center of origin of this pathogen, we selected 12 novel microsatellite markers. A total of 727 strains from all the cacao production zones in Africa (Cameroon, Gabon, Sao-Tomé, Nigeria, Togo, Ghana and Ivory Coast) were analyzed. A clonal mode of reproduction was detected. Structuring and assignment analysis allowed us to identify 5 genetic groups: 3 groups in Central Africa (AC1, AC2 and AC3), one group western Africa (AO) and a hybrid group (MC) in Cameroon. The 5 groups were represented in Cameroon, suggesting a Cameroonian origin of P. megakarya. Three zones in Cameroon showed a strong genetic diversity, but the West would be the potential zone of origin and diversification of P. megakarya. The second chapter of the thesis concerned the spatiotemporal dynamics of P. megakarya in the field, in order to bring additional biological information on the survival and the dispersal of the pathogen. We conducted an epidemiological survey during 2 consecutive years in 2 agroécological zones in Cameroon (savanna and forest). The results showed a significant decrease of the incidence of the desease between 2 years, in relation certainly with a climatic variable. A overdispersion of the incidence of the disease was detected at the end of each campaign in the 2 zones, but the analysis of semivariogrammes throughout 2 production campaigns enlighted a spatial dependence of infected trees in the forest zone only. Infection hot spots were detected through the analysis of disease maps (GéoStat-R). The genetic variability of soil and infected pods isolates was assessed. A higher genetic diversity was found in the soil, suggesting that soil is the primary inoculums sources of P. megakarya. Key-words : Black pod disease, Phytophthora megakarya, emerging disease, center of origin, microsatellite markers, assignation analysis, clonal reproduction, spatiotemporal dynamics, infection hot spots

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Kohi, N'Goran Jeanne Andi. "Contribution à l'étude génétique du cacaoyer par les marqueurs moléculaires : diversité génétique et recherche de QTLs." Montpellier 2, 1994. http://www.theses.fr/1994MON20159.

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Abstract:

Les marqueurs rapd ont ete developpes pour etudier la diversite genetique et la cartographie du cacaoyer a cause de leur simplificite et des possibilites de transfert de technologie qu'ils offrent. Ils ont permis de classer les genotypes etudies en trois grands groupes qui sont les forastero bas amazoniens, les forastero haut amazoniens et les criollo, en accord avec la classification morphogeographique. Ils se presentent ainsi comme un outil efficace de classification. L'etude des parametres genetiques de la diversite revelee par les rflp a mis en evidence une grande diversite genique au sein des cacaoyers et a revelee une grande richesse allelique au sein de la population de la haute amazonie. Tous les groupes presentent des desequilibres dus au systeme de reproduction mais aussi a la presence tres probable de sous populations. Les groupes les plus eloignes sont les criollo et les forastero haut amazoniens. Cependant une forte differenciation genetique a ete mise en evidence entre les forastero haut amazoniens et les forastero bas amazoniens. La recherche de qtl pour les caracteres morphologiques et ceux de la resistance au phytophthora a permis de localiser des regions chromosomiques impliquees dans l'expression de certains des caracteres etudies. Ainsi, des qtl de la resistance au phytophthora ont ete mis en evidence sur les groupes de liaison 1 et 8. Differentes regions chromosomiques ont ete mises en evidence pour les caracteres mesures a divo et a bingerville

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Ametowoglo, Klusse. "Les filières du cacao : des planteurs africains aux consommateurs européens." Bordeaux 3, 1996. http://www.theses.fr/1996BOR30024.

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Abstract:

Produit agricole des pays tropicaux du sud sous-developpes, le cacao est essentiellement transforme puis consomme dans les pays du nord developpes. Pour assurer la circulation internationale du cacao marchand, des filieres se sont constituees. De petites organisations peu ou pas du tout structurees (entreprises familiales, comptoirs d'achat) qu'elles etaient a l'origine (periode coloniale), ces filieres se sont bien developpees petit a petit pour devenir de nos jours de grosses societes financieres solides qui controlent le marche international du cacao brut et de ses derives (chocolat, beurre, poudre. . . ). En pays producteurs, ce sont les intermediaires agrees et commercants libanais qui controlent les filieres nationales d'achat aux producteurs. Les societes de commercialisation - societes d'etat - assurent quant a elles l'exportation du cacao. Au niveau international les societes de negoce (veritables intermediaires assurant la fluidite du commerce de cacao) fournissent en temps utiles aux industries leurs approvisionnements necessaires. Les problemes de qualite des feves exportees, de la surproduction, et du prix paye sont les principaux aspects de la crise du cacao
Farm product growing in the south tropical under-developed countries, cocoa is essentially transformed and consumed in the north developed countries. To secure the international circulation of cocoa beans, several channels have been constituted. Originally small organisations (family business, trading posts) little structurated in the colonial period, these channels have been gradually developed and are nowadays very important financial societies which control the international market of cocoa beans and its derivatives. In the producing countries, agreed intermediary agents and libanan business men control the national buying channels beside the planters; national commercialisation offices as cocoa boards assure the cocoa exportation. On the international level big trading companies (wich really insure the fluidity of cocoa trade) provide the industries with cocoa. The problems of quality concerning the cocoa beans exported, worldwide overproduction and low prices are the principal aspects of the cocoa crisis

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Lanaud, Claire. "Nouvelles données sur la biologie du cacaoyer (Theobroma cacao L. ) : diversité des populations, système d'incompatibilité, haploides spontanés : leurs conséquences pour l'amélioration génétique de cette espèce." Paris 11, 1987. http://www.theses.fr/1987PA112294.

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Abstract:

Plusieurs aspects de la biologie du cacaoyer impliqués dans son amélioration ont été abordés dans cette étude. Les techniques d'électrophorèse enzymatique ont été développées pour acquérir de nouveaux marqueurs génétiques, et ont permis d'identifier 9 loci polymorphes représentant 31 allèles possibles. Les études de diversité, faites sur différentes populations de cacaoyers sauvages et cultivés de provenances variées, ont montré la variabilité importante rencontrée dans l'espèce, et notamment parmi celles originaires de Haute Amazonie, ainsi que l'originalité d'autres populations. Des premières observations ont pu être faites sur la fixation possible, et plus ou moins complète de certains allèles dans de vraies populations sauvages observées en Guyane et au Venezuela. L'étude du fonctionnement du système d’incompatibilité, de type garréto-sporophytique, met en évidence la nature quantitative de la réaction d'incompatibilité: les interactions, créées par un mélange de pollen compatible et incompatible, en traînent une levée partielle de la réaction d’incompatibilité. Leur intensité dépend à la fois de la nature génétique et des proportions d'allopollen compatible et d'autopollen incompatible apportés en mélange sur les fleurs. En champs semenciers biclonaux où de telles pollinisations mixtes sont fréquentes, nous avons pu observer à l'aide des marqueurs enzymatiques, des taux souvent élevés de fèves, issues de l'autofécondation des géniteurs habituellement auto incompatibles lorsqu'ils ne sont pollinisés, de façon contrôlée, qu’avec leur propre pollen. L'étude des haploïdes spontanés de cacaoyer montre que leur origine est en partie liée à un phénomène de semigamie. A l’état haploïde doublé, des effets défavorables, dus probablement à leur état homozygote, peuvent se manifester sur tous les caractères, mais ne semblent pas être transmis aux descendants. Les haploïdes doublés issus d'un même génotype hétérozygote sont très variables et permettent la sélection de géniteurs plus performants que le parent d'origine; cependant, leur utilisation dans les pr0granmes d’amélioration se heurte encore à l'absence d'une méthode d'obtention d'haploïdes plus efficace. Ces résultats apportent des informations à la fois pour l'orientation des schémas de sélection et la diffusion du matériel végétal sélectionné; ils mettent l'accent sur la faible part de diversité génétique exploitée jusqu'à présent, et sur l'originalité du système d’incompatibilité chez le cacaoyer; ils montrent la nécessité d'un contrôle rigoureux des phénomènes d'incompatibilité dans les conditions naturelles de champs semencier, si l'on veut valoriser au maximum les sélections faites. Enfin, ils permettent une meilleure connaissance de la structure des populations et des conséquences que cela implique pour la gestion des ressources génétiques de cette espèce
Some aspects of the biology of cocoa tree were studied for their breeding implications. Isozymes electrophoresis was developed to obtain new genetic markers. 9 polymorphic loci and 31 alleles were identified. Studies on the diversity between wild and cultivated populations from various origins revealed large species variability, particularly among Upper Amazon populations. A study on the mechanisms of incompatibility showed different levels of expression when a mixture of incompatible and compatible pollen was used, a partial inhibition of incompatibility, due to their interactions, was observed. The degree of inhibition depended both on the genetic constitution and on the relative proportions of compatible and incompatible pollen mixed on the flowers. In hybrid seeds gardens, where mixed pollinations were frequent, the use of isozymes demonstrated a high level of self-fertilized seeds in progenitors usually incompatible when only pollinated with their own pollen. The origin of spontaneous haploids depended partially on semigamy. Probably due to hamozygosity, depressive effects appeared in many characteristics for doubled haploids, but this was not transmitted in progeny. Different doubled haploid were obtained from a heterozygous genotype thus allowing the opportunity to choose better progenitors than the parent. Meanwhile the use of haploids in a breeding program was limited by a lack of efficiency to obtain them. Results obtained gave information to design new breeding schemes and to assure the multiplication of selected seeds. They emphasize the small part of the genetic diversity of cocoa tree used hitherto. Because of the originality of incompatibility system and in order to valorize cocoa breeding a rigorous control in biclonal seeds gardens must be applied. A better knowledge of population genetics was obtained and consequences for genetic resources management for this species were discussed

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Gidoin, Cynthia. "Relations entre structure du peuplement végétal et bioagresseurs dans les agroforêts à cacaoyers. Application à trois bioagresseurs du cacaoyer : la moniliose au Costa Rica, la pourriture brune et les mirides au Cameroun." Phd thesis, Ecole nationale superieure agronomique de montpellier - AGRO M, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01015863.

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Abstract:

Une voie agroécologique pour améliorer la fourniture des services écosystémiques dans les agroécosystèmes est d'associer plusieurs espèces végétales au sein d'une même parcelle. Dans ce contexte, les agroforêts tropicales, caractérisées par une forte diversité végétale, sont un modèle d'étude d'intérêt croissant. Dans ce travail qui porte sur le service de régulation des bioagresseurs, notre hypothèse est que la structure des agroforêts inﬂuence la régulation naturelle des bioagresseurs de la culture principale. La composition en plante hôte de l'agroforêt est susceptible d'inﬂuencer les bioagresseurs via les variations de la ressource. La structure spatiale de la végétation est susceptible d'inﬂuencer les bioagresseurs via les variations des conditions microclimatiques. Enﬁn, les variations de la ressource et du microclimat ne sont pas des mécanismes indépendants puisqu'un microclimat favorable à la croissance de la plante hôte du bioagresseur peut augmenter la quantité des tissus sensibles et donc la ressource pour ce bioagresseur. Pourtant, l'importance relative de l'eﬀet de la composition et de la structure spatiale de la végétation des agroforêts sur l'intensité l'attaque des bioagresseurs a rarement été étudiée. Les objectifs de ce travail de thèse sont (1) de caractériser la composition et la structure spatiale des peuplements végétaux d'agroforêts à cacaoyers et (2) de quantiﬁer leurs interactions avec l'intensité d'attaque de biogresseurs du cacaoyer. Ce travail est appliqué à trois bioagresseurs du cacaoyer : au Costa Rica, la moniliose sur un réseau de parcelles installé dans la région de Talamanca ; au Cameroun, la pourriture brune des cabosses et les mirides sur un réseau de parcelles installé dans la région Centre. Premièrement, nous avons caractérisé la composition et la structure spatiale de la végétation des agroforêts à cacaoyers du Costa Rica et du Cameroun. Au Costa Rica, nous avons identiﬁé une diversité de structure spatiale des arbres forestiers entre parcelles, allant de l'agrégation à la régularité ce qui semble indiquer un gradient croissant de gestion entre ces parcelles. Au Cameroun, nous avons également observé une diversité de structure spatiale entre peuplement d'une même parcelle. En eﬀet, les arbres forestiers sont aléatoirement distribués ou agrégés alors que les arbres fruitiers sont aléatoirement ou régulièrement distribués à l'échelle de la parcelle ce qui semble indiquer une diﬀérence d'intensité de gestion entre ces deux peuplements. Deuxièmement, nous avons hiérarchisé les caractéristiques de composition en hôte, de quantité de tissus sensibles et de structure spatiale de la végétation des agroforêts qui inﬂuencent l'intensité (i) de la moniliose (ii) de la pourriture brune et (iii) des mirides. L'intensité de la moniliose et la densité en mirides diminuent lorsque les quantités de tis- sus sensibles diminuent et lorsque les arbres forestiers sont aléatoirement ou régulièrement distribués plutôt qu'agrégés ou en faible densité à l'échelle de la parcelle. D'autre part, l'intensité de la moniliose diminue lorsque la densité en cacaoyers augmente et l'intensité de la pourriture brune diminue lorsque l'abondance en cacaoyers augmente, ces résultats étant contraires aux hypothèses de diminution et de dilution de la ressource. Globalement, nos résultats indiquent donc que les variations de la ressource liées aux variations de la composition en hôte ne sont pas le principal eﬀet qui explique la présence des bioagresseurs dans les agroforêts complexes. La structure spatiale des arbres d'ombrage, encore jamais décrite à notre niveau de précision, joue un rôle déterminant et son optimisation pourrait être un moyen de lutte agroécologique contre la moniliose et les mirides du cacaoyer. Dans le cadre de l'agroécologie, ce travail nous a permis d'améliorer notre compréhension des mécanismes écologiques impliqués dans la régulation des bioagresseurs du cacaoyer à l'échelle de la parcelle et ouvre des perspectives pour leur gestion agroécologique.

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HAGEN, LYNDA. "Analyse du genome du cacao swollen shoot virus et mise au point d'une methode d'infection du cacaoyer." Paris 6, 1994. http://www.theses.fr/1994PA066590.

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Abstract:

Le virus du gonflement des tiges du cacaoyer (cssv) appartient au groupe des badnavirus. Une copie complete du genome a ete clonee et sequencee. L'adn excise est infectieux lorsqu'il est inocule par bombardement a des feves de theobroma cacao. Les plantes infectees developpent les symptomes typiques de la maladie. La descendance virale est detectee par elisa et hybridation moleculaire. Les particules ont de tailles variables. La diversite des symptomes de swollen shoot, et l'heterogeneite de taille des particules, resultent donc de l'infection par une population et non d'infections mixtes. La sequence des deux brins d'adn a ete deduite de celles de 75 sous-clones chevauchants. D'une taille de 7 161 bp, le genome comporte une region intergenique et 5 cadres de lecture (orfs) potentiels localises sur le brin (+). L'orf1 (17kda) et l'orf2 (14kda) codent pour des proteines de fonction inconnue. Le grand orf3 (211kda) code pour une polyproteine se divisant en 3 regions. La region 1 code pour une proteine de mouvement, la region 2 code pour la proteine capside. La region 3 presente les sequences consensus de proteinase aspartique, reverse transcriptase (rt), rnase h (rnh). Les derniers orfs (13kda et 14kda) chevauchent l'orf3 et ne sont presents que chez le cssv. Des etudes de phyllogenie moleculaire montrent que le cssv, le commelina yellow mottle virus et le sugarcane bacilliform virus forment un groupe distinct du rice tungro bacilliform virus. L'arn transcrit de taille superieure a celle du genome, predit par le modele de replication, est present dans les plantes infectees. Le site de polyadenylation correspond a un residu adenine localise 17 a 18 nt en aval d'une sequence aataaa de la region intergenique. 3 repetitions du motif agagtttgta situes en amont, correspondraient a des elements regulant la polyadenylation. Les travaux pour la determination de l'extremite 5' sont presentes

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Ortiz, Garcia Carlos Fredy. "Etude de la diversité génétique de populations de Phytophthora pathogènes du cacaoyer (Theobroma cacao L) et du cocotier (Cocos nucifera L)." Toulouse 3, 1996. http://www.theses.fr/1996TOU30046.

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Pugh, Moreno Tatiana. "Etude des déséquilibres de liaison dans une collection de cacaoyers (Theobroma cacao L. ) appartenant au groupe criollo/trinitario et application au marquage génétique des caractères d'intérête." Montpellier, ENSA, 2005. http://www.theses.fr/2005ENSA0005.

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Abstract:

La structure du génome des variétés de Criollo modernes et Trinitario de cacaoyer résulte d'une domestication récente datant de 250 ans et qui a mis en jeu un nombre réduit d'ancêtres parentaux : Criollo ancien et Forastero bas amazoniens. Une collection de 247 accessions de Criollo modernes et Trinitario conservées au CATIE (Centro Agronómico Tropical de Investigación y Enseñanza, Costa Rica) a été étudiée. La base génétique très étroite de ce groupe génétique et le petit nombre de générations de recombinaisons qui se sont produites depuis les premières hybridations entre ancêtres parentaux en font un bon modèle pour des études d'associations. Afin de disposer d'un outil d'analyse performant pour ces études d'association, une carte génétique saturée en marqueurs SSR (single sequence repeat) a été produite. Cette carte contient 465 marqueurs (268 SSR, 176 RFLP, 5 isoenzymes et 16 Rgenes). Sa longueur est de 783 cM, avec une distance moyenne entre marqueurs de 1,7 cM et une distance moyenne entre marqueurs SSR de 3 cM. La diversité génétique des 247 accessions de Criollo modernes /Trinitario a été évaluée à l'aide de 34 SSR répartis sur tout le génome du cacaoyer. Une moyenne de 5,2 allèles par locus a été observée. Deux allèles, toujours plus fréquents que les autres, correspondent à ceux des principaux ancêtres fondateurs: Criollo ancien et Forastero bas-amazoniens. Un sous ensemble de 37 accessions représentant 99,5% de la variabilité allèlique totale de cette collection de Criollo/Trinitario a été identifiée. Une caractérisation morphologique de 150 de ces accessions a été faite il y a 25 ans par Engels et al. (1981), et ces données sont accessibles par la base de données ICGD (International Cocoa Germplasm Database). Ces 150 accessions ont été utilisées pour nos études de déséquilibre de liaison. Un premier lot de 24 SSR a servi à vérifier l'absence de structure de cette collection ainsi que le déséquilibre de liaison (DL) global qui est apparu faible. Puis 110 SSR, pour lesquels des allèles spécifiques des Criollo ont été identifiés, ont été utilisés pour évaluer l'étendue du DL. Celui est variable mais s'étendre jusqu'à 30 cM. Des associations entre caractères de fruit, de fève et de fleur ont été identifiées sur 13 régions chromosomiques. Parmi elles 8 correspondent à des régions où des QTL portant sur les mêmes caractères ont déjà été identifiés par des approches classiques. Ces résultats nous démontrent l'intérêt et la faisabilité de ces études d'association pour identifier les bases génétiques des caractères d'intérêt chez le cacaoyer et représentent une valorisation supplémentaire des données de caractérisation de collection qui existent.

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Bock, Digne Marie-S. "Architecture et société : un mode de lecture de la formation et de l'intégration de l'espace cacaoyer équatorien (1890-1920)." Toulouse 2, 1994. http://www.theses.fr/1994TOU20027.

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Abstract:

A partir de l'analyse de la mise en valeur homogene et rapide de l'espace regional cotier equatorien a la fin du xixe siecle et au debut du xxe, basee sur l'interaction de l'architcture, de l'espace et de la societe, il a ete possible d'etablir un "modele" applicable non seulement au cas equatorien mais aussi a d'autres regions latino-americaines, aux antilles et aussi aux pays de l'ocean indien durant une epoque donnee (etude synchronique), soumises a des conditions politiques et sociales identiques et developpant des systemes d'exploitation de cultures agro-exportatrices differents sur le plan social (haciendas salariales et plantations esclavagistes). Ce modele semble egalement pouvoir, dans certains cas, s'appliquer sur des periodes historiques plus longues (etude diachronique) comportant des ruptures politiques, economiques, sociales et eventuellement architecturales qui viennent briser le systeme d'exploitation (passage d'un systeme esclavagiste a un systeme salarial). Toutefois des travaux de recherche sur un champ geographique plus vaste permettraient d'infirmer ou de confirmer la validite de ce modele, de l'ameliorer et de le modifier.

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Argout, Xavier. "Le génome du cacaoyer : du décodage de sa séquence jusqu'à l'étude des gènes impliqués dans des caractères agronomiques d'intérêt." Thesis, Montpellier, SupAgro, 2017. http://www.theses.fr/2017NSAM0006/document.

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Abstract:

Depuis plusieurs années, les programmes de recherche chez le cacaoyer ont mis l'accent sur l'étude des bases génétiques des caractères agronomiques d'intérêt, notamment concernant la résistance aux maladies et la qualité des fèves de cacao, qui représentent deux attributs importants pour la cacaoculture et la production de chocolat. Ce travail présente, par l'exploration du transcriptome et du génome du cacaoyer, la constitution de ressources moléculaires et l'analyse des voies de biosynthèse impliquées dans plusieurs de ces caractères agronomiques d'intérêt. L'étude du transcriptome a permis l'identification de plusieurs dizaines de milliers de gènes exprimés dans divers organes et pour différentes conditions environnementales et ont fourni de nombreux marqueurs moléculaires qui ont été utilisés pour réaliser des cartes génétiques haute densité. Les informations apportées par ce travail ont permis d’engager le séquençage du génome de la variété Criollo du cacaoyer. Son analyse et son annotation ont apporté un ensemble d'informations biologiques cruciales, depuis le catalogue des gènes et éléments mobiles jusqu'aux aspects évolutifs qui a révélé une structure du génome peu remanié par rapport à l'ancêtre commun aux dicotylédones. Par la suite, les travaux que nous avons menés pour améliorer la séquence complète ont conduit à une réduction considérable de la fragmentation chromosomique observée dans la première version. Par ailleurs 97% de la séquence assemblée et 99% des gènes sont désormais ancrés sur les chromosomes du cacaoyer. Pour commencer à exploiter cette nouvelle séquence du génome, nous avons conduit une étude QTL à partir d'une descendance entre Trinitario implantée en Guyane, permettant de localiser les régions génomiques impliquées dans la variation de la couleur des fèves de cacao. En s'appuyant sur la version améliorée du génome du Criollo, nous avons identifié deux gènes potentiellement impliqués dans la voie de biosynthèse des anthocyanines et flavonoïdes dans la principale région génomique concernée. Un des deux gènes, situé proche du marqueur situé au pic du QTL et codant pour une chalcone synthase, semble être un gène candidat prometteur. L'étude comparative de sa structure dans le génome du Criollo (à fève blanche) et du génome de l'Amelonado (à fève violette) a mis en évidence des différences structurales pouvant être à l'origine d'une modification fonctionnelle. L'ensemble des résultats présentés dans ce travail de thèse apporte une connaissance et des outils variés qui peuvent être exploités par de multiples approches intégrées pour étudier la génétique du cacaoyer
For several years, cocoa research programs have focused on studying the genetic basis of agronomic traits of interest, especially for disease resistance and quality of cocoa beans, two important attributes for cocoa farmers and chocolate production. This work presents, by exploring the transcriptome and cocoa genome, the constitution of molecular resources and the analysis of biosynthesis pathways involved in several of these agronomical traits. The transcriptome study allowed the identification of several tens of thousands of genes expressed in various organs and for different environmental conditions and provided numerous molecular markers, used to produce high-density genetic maps. The information provided by this work led to the genome sequencing of a cocoa Criollo variety. Its analysis and annotation have provided a set of crucial biological information, from the catalog of genes and transposable elements to evolutionary aspects, which revealed a close evolutionary relationship to the eudicot putative ancestor, showing a limited number of recombination between ancestral chromosomes. Subsequently, the work we carried out to improve the complete sequence led to a considerable reduction of the chromosomal fragmentation observed in the first version. In addition, 97% of the assembled sequence and 99% of the genes are now anchored on the cocoa chromosomes. To exploit this new sequence of the genome, we conducted a QTL study from a progeny between Trinitario clones established in French Guiana, allowing to identify genomic regions involved in color trait variation observed in cocoa beans. Based on the improved version of the Criollo genome, we identified two genes potentially involved in the biosynthesis pathway of anthocyanins and flavonoids in the main genomic region concerned. One of the two genes is located nearby the QTL peak and encoding a chalcone synthase, appears to be a promising candidate gene. The comparative study of its structure in the Criollo genome (white bean) and in the Amelonado genome (purple bean) revealed several variations that could be responsible for functional modifications. The results presented in this thesis provide a variety of knowledge and tools useful to conduct multiple integrated approaches to studying cocoa tree genetics

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Blaha, Georges. "Données sur la diversité physiologique des populations de Phytophthora megakarya et de P. Palmivora responsables de la pourriture brune des cabosses du cacaoyer (Theobroma cacao L. )." Toulouse, INPT, 1995. http://www.theses.fr/1995INPT008A.

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Abstract:

La diagnose de phytophthora megakarya et de p. Palmivora agents de la pourriture brune des cabosses du cacaoyer (theobroma cacao l. ) a d'abord ete verifiee a l'aide des electrophoretypes enzymatiques notamment avec les phosphogluco-isomerases (pgi) et les malate-deshydrogenases (mdh). Les travaux qui ont suivi ont eu alors pour objectifs l'utilisation de facteurs pouvant influencer l'expression specifique ou non specifique des caracteres observables, mycologiques et pathogeniques: croissances et caracteres morphoculturaux sur milieu de culture semi-naturel a des ph et sous des eclairements differents, developpements sur milieu synthetique en presence de differents additifs (oligoelements, beta-sitosterol), glucides ou polysaccharides, composes phenoliques. Quelques activites enzymatiques et le comportement infectieux sur epicotyles de semenceaux de cacaoyer ont ete egalement etudies alors que les donnees quantitatives ont ete exploitees par les methodes statistiques inferentielles et que les classements statistiques ont ete obtenus par differents tests (de duncan, de newman et keuls), les donnees qualitatives ont ete analysees, seules ou conjointement avec les donnees quantitatives, par des methodes descriptives comme l'analyse factorielle par composantes principales (acp) et les analyses factorielles des correspondances (afc) ou discriminantes (afd). Les typologies obtenues ont permis d'identifier des axes possibles de differenciations ou de strategies adaptatives de la pathogenie

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FLAMENT, MARIE-HENRIETTE. "Cartographie genetique de facteurs impliques dans la resistance du cacaoyer (theobroma cacao l. ) a phytophthora megakarya et a phytophthora palmivora." Montpellier, ENSA, 1998. http://www.theses.fr/1998ENSA0030.

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Abstract:

Phytophthora palmivora et p. Megakarya sont deux especes de champignon responsables de la pourriture brune des fruits du cacaoyer pouvant occasionner respectivement jusqu'a 30 et 50% de pertes. P. Palmivora est une espece plus repandue que p. Megakarya. Jusqu'a present, aucun cacaoyer totalement resistant a ces phytophthorae n'a ete identifie. Les seules resistances connues sont des resistances partielles. Afin de connaitre le determinisme genetique de resistance, quatre descendances au cameroun ont ete etudiees en condition naturelle d'infection au champ et en condition artificielle d'infection sur feuille et sur fruit par p. Megakarya. Une descendance en cote d'ivoire a ete evaluee pour la resistance a p. Palmivora avec les memes caracteres de resistance. Les cartes genetiques de ces descendances ont ete realisees a l'aide de marqueurs moleculaires : rflp, ssr et aflp. Cinq qtls de resistance a p. Megakarya et cinq autres qtls de resistance a p. Palmivora ont ete detectes pour l'ensemble des caracteres mesures par les trois methodes d'evaluation de la resistance. Des genes differents semblent impliques dans les differents caracteres mesures par chacune des methodes d'evaluation de la resistance, suggerant l'implication de divers mecanismes de resistance et confirmant l'absence de correlation observee entre ces methodes. Ces methodes apparaissent sensibles aux conditions environnementales. L'amelioration des mesures de la resistance est discutee ainsi que l'interpretation des qtls detectes. Une region genomique sur le chromosome 9 cumule des qtls de resistance communs aux deux especes fongiques pour un meme caractere de resistance et pourrait etre particulierement interessante pour la selection assistee par marqueurs.

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Nyassé, Salomon. "Etude de la diversité de Phytophthora megakarya et caractérisation de la résistance du cacaoyer (Theobroma cacao L. ) à cet agent pathogène." Toulouse, INPT, 1997. http://www.theses.fr/1997INPT012A.

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Abstract:

La diversite genetique des isolats de phytophthora megakarya provenant de quelques pays d'afrique centrale (cameroun, gabon et sao tome) et d'afrique de l'ouest (nigeria, togo et ghana) a ete etudiee par des marqueurs biochimiques (isozymes) et moleculaires (rapd). La separation de cette espece en deux grands groupes correspond bien a la separation biogeographique observee chez d'autres plantes et organismes en afrique, ce qui amene a supposer l'existence de deux sous-especes de p. Megakarya. La reproduction sexuee existerait chez cette espece, et la localite de ibule au nigeria semble etre le centre de diversite pour la sous-espece afrique de l'ouest. Un test d'inoculation artificielle de feuilles de cacaoyer a ete developpe et utilise pour caracteriser les relations hote-parasite. De tres faibles effets d'interactions entre souches et clones ont ete deceles. Cependant, ils ne modifient pas significativement les classements de clones, confirmant l'absence de pathotypes chez p. Megakarya avec l'echantillon etudie. Differents niveaux d'agressivite ont ete observes entre les souches, mais ne semblent pas lies a leur origine geographique. Le test feuille a ete mis en oeuvre sur le terrain, en comparaison avec le test d'inoculation artificielle sur fruits et le taux de pourriture observe au champ, sur des clones et sur des descendances provenant d'un essai diallele. Les resultats du test d'inoculation sur feuille s'averent plus stables que ceux du test sur fruit. Les correlations genetiques entre le test feuille et le test fruit sont positives, tandis que les correlations environnementales sont negatives. La resistance evaluee par le test feuille est fortement correlee aux taux de pourriture lorsqu'on etudie les effets moyens d'un clone ou d'une descendance ; par contre le niveau de cette correlation diminue quand on etudie les effets d'arbres individuels a l'interieur d'un clone ou d'une descendance. Le test sur feuille semble donc adapte a la caracterisation en pepiniere de clones ou de familles hybrides par leur sensibilite moyenne.

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Pakora, Gilles Alex. "Biocontrôle de la pourriture brune du cacaoyer par trois isolats de Trichoderma, étude des métabolites secondaires actifs et de leur biotransformation." Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066255.

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Abstract:

La pourriture brune des cabosses de cacaoyer due aux espèces de Phytophthora est responsable de plus de 40% des pertes mondiales de cacao. La lutte chimique ayant montré ses limites, les recherches se sont orientées vers le biocontrôle de cette maladie. En Côte d’ivoire, premier pays producteur mondial, des études ont permis de sélectionner et d’identifier 3 isolats de Trichoderma (T. Virens T7, T. Asperellum T54 et T. Harzianum T40) comme antagonistes de la croissance d’un Phytophthora palmivora. L’étude chimique de ces 3 isolats de Trichoderma a conduit à l’isolement et à la production de 14 molécules dont une présente une structure originale, l’acide trichoderonique C et deux, la viridine et la gliovirine, produites en grande quantité présentent une activité inhibitrice contre P. Palmivora. La viridine possède une activité inhibitrice de la germination des zoospores des souches de P. Palmivora et la gliovirine agit contre la croissance mycélienne des souches de Phytophthora. Les études de biotransformation de la viridine ont montré sa détoxification par sa réduction en viridiol par de nombreux micro-organismes. En revanche, ce produit est phytotoxique et sa formation peut être une limite à la mise en place du biocontrôle par ces isolats de Trichoderma. Enfin, parmi les souches actives, la bactérie Rhodococcus globerolus réduit la viridine de manière non sélective en donnant le viridiol et le 3-épi-viridiol
The pod rot of cocoa caused by Phytophthora species is responsible for over 40% of cocoa losses in the world. Chemical control has its limitations, therefore the researches has been directed towards the biocontrol of the disease. In Côte-d'Ivoire, the first world cocoa producer, studies allowed to select and identify three isolates of Trichoderma (T. Virens T7, T. Harzianum and T. Asperellum T54 T40) as antagonists of the growth of Phytophthora palmivora. The chemical study of these three Trichoderma isolates led to the isolation and production of fourteen molecules. Among them one has a unique structure, trichoderonic acid C, and two others, viridin and gliovirin produced in large quantities, exhibit inhibitory activity against P. Palmivora. Viridin shows inhibitory activity against germinating zoospores of P. Palmivora strains and gliovirin is active against the mycelial growth of Phytophthora strains. The biotransformation studies of viridin showed its detoxification by its reduction into viridiol by many microorganisms. However, this product is phytotoxic and its formation may be a limit to the implementation of the biocontrol using isolates of Trichoderma. Finally, among the reducing strains, the bacterium Rhodococcus globerolus convert viridin in a non-selective manner to give viridiol and 3-epi-viridiol

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Faÿ, Elisabeth de. "La rythmicité de croissance cambiale et ses rapports avec la rythmicité de croissance apicale chez trois espèces d'arbres tropicaux, Hevea brasiliensis, Theobroma cacao et Terminalia superba, cultivées en conditions naturelles. Du cambium à l'arbre entier et de la cytologie à la morphogénèse : description des rythmes et approche du déterminisme et des mécanismes." Nancy 1, 1999. http://www.theses.fr/1999NAN10084.

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La périodicité des activités principales aériennes, notamment de la croissance en épaisseur du tronc, a été étudiée chez trois espèces d'arbres tropicaux utiles poussant en conditions naturelles : Hevea brasiliensis (l'arbre à caoutchouc), Theobroma cacao (le cacaoyer) et Terminalia superba (une essence forestière importante d'Afrique de l'Ouest) ; les phénomènes ont été analysés du point de vue morphologique, cinétique, anatomique et expérimental (effeuillage, marquage du cambium). [. . . ]

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Jagoret, Patrick. "Analyse et évaluation de systèmes agroforestiers complexes sur le long terme : application aux systèmes de culture à base de cacaoyer au Centre Cameroun." Thesis, Montpellier, SupAgro, 2011. http://www.theses.fr/2011NSAM0012.

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Abstract:

La cacaoculture est aujourd'hui considérée comme un des principaux facteurs de déforestation en milieu tropical. Dans de nombreux pays, elle repose en effet sur un modèle technique peu durable de monoculture intensive impliquant le déplacement des zones de production. Souvent délaissés par la recherche en raison de leurs faibles rendements en cacao marchand, les systèmes agroforestiers à base de cacaoyer apparaissent aujourd'hui comme une alternative crédible pour faire face aux nouveaux enjeux de la cacaoculture mondiale. Au Centre-Sud du Cameroun, la cacaoculture repose en grande partie sur des cacaoyères agroforestières anciennes, ce qui pose l'hypothèse qu'un modèle de cacaoculture durable basé sur des systèmes de culture agroforestiers est possible. Notre objectif est de mieux comprendre le fonctionnement de ces systèmes agroforestiers à base de cacaoyer, à travers leurs caractéristiques, leurs évolutions et leurs déterminants, ainsi que les conditions de leur production en cacao marchand sur le long terme. Notre démarche articule à la fois une évaluation des systèmes agroforestiers complexes à l'échelle de la parcelle et une analyse compréhensive des pratiques techniques sur le temps long. La thèse repose sur un dispositif de recherche mis en place dans la région du Centre, dans trois zones de culture différenciables par leurs conditions pédo-climatiques (Bokito, Zima et Ngomedzap). Une enquête d'agriculteurs a été réalisée à grande échelle (1 171 exploitations regroupant 1 638 cacaoyères), complétée par des observations spécifiques réalisées dans un réseau de 61 cacaoyères exploitées par 40 agriculteurs. Résultats. (1) Nos résultats d'enquête, complétés par des observations spécifiques, ont confirmé la durabilité des systèmes agroforestiers à base de cacaoyer aux plans agro-écologique et socio-économique. (2) Dans la zone de transition forêt-savane, considérée comme sub-optimale pour la cacaoculture, nous avons montré que le modèle technique adopté par les agriculteurs leur permet d'installer sur savane des cacaoyères viables sur le long terme. (3) Une méthode participative de quantification de la valeur d'usage des espèces par les agriculteurs, appliquée sur le réseau d'observation, a confirmé la multifonctionnalité des systèmes agroforestiers et mesuré la place qu'y occupe la composante cacaoyère. (4) L'évaluation des peuplements cacaoyers, réalisée en adaptant la méthode de diagnostic agronomique régional aux systèmes complexes, a permis d'identifier les facteurs limitant le rendement en cacao marchand. Celui-ci s'avère étroitement lié à la structure des peuplements cacaoyers et à celle des peuplements associés. (5) Enfin, l'analyse compréhensive des pratiques des agriculteurs sur le long terme, en lien avec l'évolution technique des peuplements cacaoyers a confirmé la flexibilité des systèmes agroforestiers à base de cacaoyer. Cette flexibilité peut être traduite par des trajectoires d'évolution des pratiques et des trajectoires de structures spécifiques. Ce travail fournit une nouvelle base méthodologique pour l'analyse et l'évaluation des systèmes agroforestiers complexes. L'ensemble des résultats et des connaissances produites dans ce travail permet de formuler des propositions pour la mise au point d'un nouveau modèle technique en cacaoculture
Cocoa cultivation is generally considered as one of the main deforestation factors in the Tropics. Indeed, in many countries it is based on a low-sustainability technical model of intensive monocrops with shifting production zones. Cocoa agroforests, which are often neglected by research due to their low fermented dried cocoa yields, now appear to be a credible alternative for taking up the new challenges facing world cocoa production. In Centre-South Cameroon, cocoa cultivation is largely based on old cocoa agroforests, which suggests that a sustainable cocoa growing model based on agroforestry systems is possible. Our aim was to more effectively understand how these cocoa agroforests function, through their characteristics, their evolution and their determinants, along with the conditions for their long-term fermented dried cocoa production. Our approach consisted of an evaluation of cocoa agroforests on a plot scale and a comprehensive analysis of technical practices over the long term. The thesis is based on an experimental design set up in the Centre region, in three growing zones that could be differentiated through their pedo climatic conditions (Bokito, Zima and Ngomedzap). A large-scale survey was undertaken (1,171 farms grouping 1,638 cocoa plantations) completed by specific observations collected in a network of 61 cocoa agroforests managed by 40 farmers. Results. (1) Our survey results, completed by specific observations, confirmed the sustainability of the cocoa agroforestry systems from an agro ecological and socio-economic viewpoint. (2) In the forest-savannah transition zone, which is considered sub-optimum for cocoa cultivation, we confirmed that the technical model adopted by the farmers enabled them to set up cocoa agroforests on savannah that were viable over the long term. (3) In the network, a participatory method applied to quantify the use value given to the species by the farmers confirmed the multi-functionality of cocoa agroforests and measured the place occupied in it by cocoa. (4) The evaluation of the cocoa tree stands, achieved by adapting the regional agronomic diagnosis method to complex systems, revealed the factors limiting cocoa yield. It was proved that cocoa yield is closely linked to the structure of the cocoa tree stand and that of the intercropped stands. (5) Lastly, a comprehensive analysis of farmer practices over the long term, in association with the evolution of the technical management of the cocoa tree stands, confirmed the flexibility of cocoa agroforestry systems. This flexibility was reflected in the evolution pathways for specific practices and structures. This work provides a new methodological basis to assess the performance of complex agroforestry systems. All the results and knowledge produced by this work make it possible to draw up proposals for developing a new technical model for cocoa growing

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Andrieu, Aurélie. "Explorer les voies de l’ARN interférence par initiation in planta pour dévoiler la fonction des gènes chez le riz (Oryza sativa L. ) et le cacaoyer (Theobroma cacao L. )." Montpellier 2, 2008. http://www.theses.fr/2008MON20174.

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Abstract:

Découvrir la fonction de l'ensemble des gènes végétaux est devenue une priorité depuis l'avènement des méthodes récentes de séquençage. Outre le nombre sans cesse croissant de génomes entièrement séquencés, à l'image de celui du riz, le nombre de séquences exprimées disponibles, ADNc et EST, est lui aussi en augmentation constante. C'est notamment le cas pour le cacaoyer (Theobroma cacao L. ) à travers un projet de séquençage d'EST réalisé au CIRAD Montpellier (Argout et al. , 2008), qui a permis de générer 149 650 ESTs. L'analyse bioinformatique de ces séquences a permis de repérer plusieurs gènes candidats potentiellement impliqués dans la résistance aux pathogènes, ou encore dans la qualité de la fève. La masse de données issue de ces programmes de séquençage nécessite maintenant de pouvoir disposer de méthodes efficaces à haut débit pour l'analyse fonctionnelle des gènes identifiés. Plusieurs techniques sont actuellement utilisées avec succès pour déterminer la fonction des gènes chez les plantes, mais la plupart d'entres elles impliquent l'utilisation de la transformation génétique stable, à l'image de la technologie d'inactivation de l'expression des gènes basée sur l'ARN interférence. Cette technique est couramment utilisée en génomique fonctionnelle car elle permet d'analyser avec efficacité et de manière ciblée la fonction des gènes. Ces travaux de thèse avaient pour objectif de développer un nouvel outil de génomique fonctionnelle permettant d'étudier la fonction des gènes avec efficacité et rapidité, sans avoir recours à la transformation génétique stable, en adaptant la technique d'agroinfection in planta pour initier et propager le mécanisme de l'ARNi dans la plante. La première étape de ces recherches a consisté à mettre au point une méthode d'expression transitoire de gènes dans les feuilles de riz et de cacaoyer par agro-infection. Si l'agro-infection in planta de cellules de feuilles de cacaoyer a été relativement aisée à obtenir en adaptant à cet arbre la méthode d'agro-infiltration de N. Benthamiana, aucune technique équivalente n'existait pour les céréales. L'agro-infection in planta du riz a donc nécessité de développer un protocole original, efficace et reproductible. Une fois la technique d'expression transitoire de gène validée pour ces deux espèces, des expériences d'extinction de gènes ciblées par ARNi ont été effectuées pour trois gènes endogènes pin1, chs et slr1, ainsi qu'un transgène gus pour le riz, et pour trois endogènes pin1, chs et pds pour le cacaoyer. Pour tous les gènes ciblés, il a été possible d'induire l'ARNi dans les cellules végétales. Après son initiation in planta, l'ARN interférence se maintient dans les tissus agro-infectés, ce qui conduit à une diffusion passive des siRNA dans les tissus situés autour de la zone agro-infectée, sans pour autant conduire à la mise en place d'un signal systémique permettant au mécanisme d'extinction de se propager dans l'organisme. Sur la base de ces résultats, une série d'expériences a été initié dans le tabac pour identifier les conditions nécessaires à la mise en place d'un tel signal systémique, et développer un nouveau protocole d'agro-infection des plantes d'intérêt

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Diomande, Gbe Gondo Didier. "Contribution des méthodes spectroscopiques et isotopiques à la caractérisation géographique et phénotypique du cacao." Nantes, 2014. https://archive.bu.univ-nantes.fr/pollux/show/show?id=fd4e7f5d-6094-444e-b12a-043f6c632eb5.

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Abstract:

Le cacaoyer (Theobroma cacao L. ) est une plante de la famille des Sterculiacées. Le fruit, appelé cabosse contient des fèves utilisées dans la fabrication du chocolat. Le commerce des produits alimentaires frauduleux pousse les consommateurs de plus en plus soupçonneux de la qualité sanitaire, mais aussi des origines et de la production (bio, OGM…). Face à ce problème la nouvelle règlementation européenne 178/2002, effective au 1 janvier 2005, impose l’exigence de traçabilité pour l’aliment. Cette thèse se situe dans ce contexte. L’analyse de la teneur multi-isotopique (15N, 13C) par spectrométrie de masse isotopique (SMRI) de 61 échantillons de cacao issus de 22 pays, dont 37 échantillons de la Côte d’Ivoire a été faite. Le traitement statistique des résultats a permis de montrer que les paramètres isotopiques δ15N et δ13C de la fève cacao, et celles des différentes matrices de la fève, sont à l’origine de la discrimination observée au sein des échantillons de cacao issus des continents, de trois villes de la Côte d’Ivoire ainsi que des variétés Forastero et Trinitario. La fermentation du cacao est le processus qui influence le plus la qualité de la fève. L’étude de l’effet de la fermentation par l’analyse de la composition isotopique δ15N et δ13C a mis en évidence soit un enrichissement ou un appauvrissement de la fève et ces différentes parties excepté la théobromine qui ne subit pas de fractionnement isotopique. De ce fait, la molécule de théobromine a été utilisée en RMN quantitative isotopique du carbone-13 comme molécule sonde pour la caractérisation géographique du cacao. Un développement méthodologique a été réalisé pour permettre la mesure intramoléculaire du 13C de la théobromine, par sa transformation en caféine de précision adéquate. De nouveaux paramètres ont été obtenus qui ont permis de confirmer la distinction de l’origine géographique du cacao, mais aussi des produits contenants de la caféine (thé et café). De manière exploratoire, l’analyse de la teneur isotopique (18O) de la théobromine a également été réalisée par SMRI dans le même objectif. Enfin, le beurre de cacao qui est l’une des matrices importantes de la fève a également été analysé dans le cadre de la méthodologie « métabolomique » par RMN 13C, en ciblant plus particulièrement le glycérol
The cocoa tree (Theobroma cacao L. ) is a plant of the family Sterculiaceae. The fruit, called the pod, contains beans that are used in the manufacture of chocolate. Fraudulent production practices are making consumers increasingly suspicious both of the sanitary quality of foodstuffs and of the origin of production (organic, GM, etc. ). Faced with this problem, the new European legal ruling 178/2002, effective since 1 January 2005, imposes traceability for foodstuffs. This thesis is positioned within this context. The analysis of the multi-isotope content (15N, 13C) of 61 samples of cocoa obtained from 22 countries, of which 37 samples are from the Ivory Coast, has been carried out. By statistical analysis of the data, it is shown that the isotopic parameters δ15N and δ13C for the whole cocoa beans, and those from different parts of the bean, are responsible for the discrimination found between samples from different continents, from three villages in the Ivory Coast, and between the varieties Forastero and Trinitario. Fermentation of cocoa is the process that most influences the quality of the beans. A study of the influence of fermentation on the isotopic composition in δ15N and δ13C showed either enrichment or impoverishment for the bean and for different parts of the bean, with the exception of theobromine, for which no isotopic fractionation was found. As a result, theobromine was used in isotopic quantitative 13C NMR as molecular probe for the characterization of the geographical origin of cocoa. A methodology has been developed which allows the measurement of the intramolecular 13C distribution in theobromine with sufficient accuracy, subsequent to its transformation into caffeine. New parameters were obtained which not only allowed confirmation of the distinct geographical origins of different cocoa samples, but also to differentiate cocoa from products containing caffeine (tea and coffee). An exploratory study was also carried out measuring the 18O content of theobromine by irm-MS, with the same objective in mind. Finally, cocoa butter, which is one of the most important matrices in the beans, was analyzed by 13C NMR in the framework of the methodology “metabolomics”, notably targeting the glycerol

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Lanaud, Claire. "Nouvelles données sur la biologie du cacaoyer, Theobroma cacao L. diversité des populations, système d'incompatibilité, haploïdes spontanés, leurs conséquences pour l'amélioration génétique de cette espèce /." Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb376070362.

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Soussou, Tatongueba. "Dynamique forestière dans la plaine du Litimé sous pression anthropique au Togo." Aix-Marseille 3, 2009. http://www.theses.fr/2009AIX30049.

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Abstract:

La présente étude s'inscrit dans la dynamique générale des forêts tropicales. Elle intègre les résultats des analyses spatiales, phytoécologiques et socioéconomiques de la régression forestière de la plaine du Litimé. L'étude spatiale basée sur l'acquisition des images satellitaires Spot a permis d'établir une cartographie diachronique de la végétation de la zone d'étude afin d'apprécier les changements des modes d'occupation du sol survenus entre 1986 et 2001 dans cette zone. Dans cette étude, les espaces « urbanisés » de même que ceux affectés aux cultures évoluent au détriment des superficies couvertes. L'analyse des spectres biologiques et phytogéographiques sur l'ensemble du Litimé a non seulement mis en évidence le caractère guinéen de la végétation, mais a également montré la progression des taxons savanicoles notamment dans les milieux ouverts sous l'action humaine. Enfin, l'étude socioéconomique basée sur les enquêtes ethnobotaniques a mis en évidence l'importance de la forêt pour les populations locales à travers les usages socio-économiques, culturels et écologiques qu'elle procure à ces populations
The present study falls under the general dynamics of the tropical forests. It integrates the results of the space, phytoecological and socio-economic analyses of the forest regression of the plain of Litime. The space study based on the acquisition of the satellite images Spot made it possible to establish a diachronic cartography of the vegetation of the zone of study in order to appreciate the evolution of the changes of occupation of the ground which have occurred between 1986 and 2001 in this zone. In this study, "urbanized" spaces just as those assigned to the cultures move with the detriment of the covered surfaces. The analysis of the biological and phytogeographical spectra on the whole of Litime highlighted not only the Guinean character of the vegetation, but also showed the progression of the savannas taxa in particular in the mediums open under the human action. Lastly, the socio-economic study based on the ethnobotanic investigations highlighted the importance of the forest for the local populations through the socio-economic, cultural and ecological uses that it gets for these populations

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Ndoumbe, Nkeng Michel. "Incidence des facteurs agro-écologiques sur l'épidémiologie de la pourriture brune des fruits du cacaoyer au Cameroun : contribution à la mise en place d'un modèle d'avertissements agricoles." Paris, Institut national d'agronomie de Paris Grignon, 2002. http://www.theses.fr/2002INAP0038.

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Oro, Zokou-Franck. "Analyse des dynamiques spatiales et épidémiologie moléculaire de de la maladie du swollen shoot du cacaoyer au Togo : étude de diffusion à partir des systèmes d'information géographiques." Thesis, Montpellier, SupAgro, 2011. http://www.theses.fr/2011NSAM0050/document.

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Abstract:

Le Cacao swollen shoot virus (CSSV) est un virus infectant le cacaoyer transmis par des cochenilles farineuses de la famille des Pseudococcidae. La maladie qui en découle existe aujourd'hui dans les principales zones de production de cacao d'Afrique de l'Ouest qui représentent 72% de la production mondiale de cacao. Le CSSV a été découvert en 1922 au Ghana et identifié avec certitude dans le Kloto au Togo en 1955 ; le premier isolat étudié moléculairement est l'isolat très virulent Agou1 du Togo. Cet isolat provoque des gonflements de tiges et de rameaux ainsi que des colorations rouge intense au niveau des nervures des jeunes feuilles engendrant ensuite une défoliation complète de l'arbre et sa mort au bout de 5 ans. La progression actuelle du CSSV dans les nouvelles zones de production, notamment au Togo (Litimé) en 1996 et en Côte d'Ivoire (Issia, Bouaflé, Sinfra) en 2000, indique une nouvelle émergence de la maladie. La découverte de ces nouveaux foyers soulève des questionnements sur l'origine des isolats et sur les mécanismes épidémiologiques impliqués dans la propagation de la maladie à l'échelle parcellaire et à l'échelle des territoires.Ces questionnements scientifiques sont pris en compte dans cette étude à trois niveaux : i) l'analyse statistique de la répartition spatiale et temporelle de la maladie à l'échelle des parcelles (fonctions de Ripley et analyse du nombre de liens entre arbres malades) et la cartographie des dynamiques d'évolution au moyen de systèmes d'information géographique (SIG), ii) la diversité moléculaire des isolats de CSSV en lien avec leur répartition géographique afin d'établir une carte de répartition dans les deux régions de production (Kloto et Litimé) et d'essayer de retracer l'historique de la propagation du virus, iii) la cartographie des zones cacaoyères, des cacaoyères saines en comparaison aux cacaoyères malades, à l'échelle des territoires par la combinaison des données satellites Spot5 à 2.5 m de résolution spatiale et des motifs de paysage relevés sur le terrain.L'analyse spatiale avec les fonctions de Ripley et l'analyse du nombre de liens ont montré que les différents états sanitaires (sain, malade, mort) des cacaoyers sont agrégés indiquant ainsi une propagation à partir de foyers d'infection au niveau parcellaire. L'analyse du nombre de liens indique un processus de contamination de plante à plante dans les parcelles. Les études des dynamiques d'évolution au moyen de SIG ont montré à travers des cartes de densités que les cacaoyers malades et les cacaoyers morts sont regroupés en agrégats dans les parcelles et que la taille de ces agrégats augmente entre les deux années d'observation (2008 et 2009). Les dynamiques de changement ont permis de détecter une progression de la maladie plus rapide dans certaines parcelles, qui peut s'expliquer par leur moins bon entretien. La caractérisation des isolats de virus dans les cacaoyères togolaises a montré l'existence de trois groupes dont les groupes A et B uniquement dans le Litimé, et le groupe C uniquement dans le Kloto, indiquant une forte différenciation géographique. Les coefficients de corrélation de Pearson et de Spearman indiquent qu'il existe un lien entre distance génétique et distance géographique des isolats du groupe A, ce qui implique une contamination de proche en proche pour ce groupe à l'échelle du territoire. Compte tenu de la différenciation marquée entre les groupes du Kloto et du Litimé, nous pouvons conclure que les cacaoyères du Litimé n'ont pas été contaminées par du matériel venant du Kloto mais plus probablement à partir de parcelles cacaoyères situées au Ghana et contaminées précédemment pour se répandre ensuite dans le Litimé. L'étude des images satellites a montré qu'il n'existait pas de relation simple entre l'état sanitaire des motifs de cacaoyers et leur radiométrie en raison de la forte hétérogénéité du système agroforestier du Litimé
Cacao swollen shoot virus 'CSSV ' is a virus transmitted by mealybugs, insects of the Pseudococcidae family. The disease occurs in all the main cocoa-growing areas of Western Africa. It induces swellings on shoots and roots and mosaic and chlorosis on the leaves and has caused very serious crop losses in Ghana, Nigeria and more recently, Togo and Côte d'Ivoire. The cocoa production in Western Africa, representing about 72 % of the worldwide production is particularly important for the economic equilibrium of these countries. The actual progress of the CSSV epidemic in the large production areas in Togo like ‘Litimé' and ‘Kloto' and in Côte d'Ivoire (Issia, Bouaflé, Sinfra) requires to understand and forecast its spread in time. The discovery of these new focuses of the disease raises questions about the origin of the isolates and the mechanisms involved in the epidemiological spread of the disease at field scale and across territories.These scientific questions are addressed in this study at three levels: i) the spatial and temporal distribution of disease across the plots with statistical methods (Ripley and analysis of the number of links) and geographical information systems (GIS) to map the dynamics of evolution, ii) the molecular diversity of CSSV isolates related to their geographical distribution in order to establish a distribution map in the two regions of production (Kloto and Litimé) and try to understand the history of the virus spread, iii) the mapping of cocoa area in Litimé, the mapping of disead cocoa in comparison with healthy cocoa at the territories scale by combining satellite data with SPOT5 2.5 m spatial resolution and landscape motifs field surveys.The spatial analysis with Ripley's method and analysis of the number of links have shown that the different states of health (healthy, disead, dead) of cocoa trees are aggregated indicating a spread by patch at plot level. The analysis of the number of links indicates a process of contamination from plant to plant in the plots. Studies of the dynamics of evolution from Sig showed through density maps that disead cocoa trees and dead cocoa tree are grouped into clusters in the plots and the size of these aggregates increases significantly between the two years observation (2008 and 2009). The dynamics of change have detected a similar progression of the disease in plots 2 and 3 speedy than Parcel 1. This difference of the disease progress on the three plots can be explained by better maintenance of Parcel 1. The characterization of virus isolates on cocoa plots in Togo has shown the existence of three groups with groups A and B only in the Litimé, and group C only in the Kloto, indicating strong geographical differentiation. The correlation coefficients of Pearson and Spearman indicate a link between genetic distance and geographical distance of the isolates of group A, which implies a contamination step by step for this group at territories scale. Given the marked differentiation between the groups of Kloto and Litimé, we can conclude that the cocoa tree of Litimé were not contaminated with material from the Kloto but more likely from plots located in Ghana and previously infected then spread in the Litimé. The study with the satellite images showed that there was no simple relationship between the health patterns of cocoa trees and their radiometry because of the high heterogeneity of the agroforestry system of Litimé. The combination of landscape motifs and radiometry, however, possible to distinguish areas with dominant "cocoa", areas dominated by "crops", areas dominated by "forest". Among the areas to be dominant "cocoa", we have distinguished the cocoa denuded areas that correspond to potential disease areas and cocoa shade. These various studies indicate that disease progression is slow and works gradually. Emergences observed in new areas probably come from human movements

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Babin, Régis. "Contribution à l'amélioration de la lutte contre le miride du cacaoyer Sahlbergella singularis Hagl. (Hemiptera : Miridae). Influence des facteurs agro-écologiques sur la dynamique des populations du ravageur." Phd thesis, Université Paul Valéry - Montpellier III, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00871800.

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Abstract:

L'objectif de ce travail est d'améliorer notre compréhension des mécanismes et d'évaluer les facteurs agro-écologiques impliqués dans la dynamique spatio-temporelle des populations naturelles de Sahlbergella singularis. Le calcul des tables de vie sur une population d'élevage a révélé que S. singularis est une espèce à croissance lente. Ceci expliquerait le fait que le ravageur est généralement présent à de faibles densités dans les plantations. L'étude des paramètres démographiques de la population d'élevage a montré que la fécondité est un paramètre-clé des fluctuations saisonnières des populations naturelles. Leur croissance serait liée à la présence de jeunes cabosses sur les cacaoyers fournissant aux femelles une ressource alimentaire favorable à la reproduction. L'étude de l'influence des facteurs agro-écologiques sur les densités de populations de S. singularis en plantation a révélé que les densités dépendent des conditions parcellaires de culture du cacaoyer. Parmi les pratiques culturales, les traitements insecticides, l'ombrage et le recours aux variétés hybrides sont des facteurs déterminants. En outre, les populations du ravageur sont fortement agrégées dans les zones des plantations bénéficiant d'un ensoleillement maximal. Enfin, l'ombrage fourni par les arbres forestiers s'est avéré plus homogène que l'ombrage d'arbres fruitiers et par conséquent moins propice au développement des poches à mirides. Les recommandations de lutte préconisées par la recherche agronomique sont rarement appliquées par les planteurs. Aussi, nos résultats ont-ils été discutés dans l'optique d'adapter ces recommandations au contexte de culture du cacaoyer qui prévaut actuellement au Cameroun

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Babin, Régis. "Contribution à l'amélioration de la lutte contre le miride du cacaoyer Sahlbergella singularis Hagl. (Hemiptera : Miridae). Influence des facteurs agro-écologiques sur la dynamique des populations du ravageur." Phd thesis, Montpellier 3, 2009. http://www.theses.fr/2009MON30047.

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Abstract:

L’objectif de ce travail est d’améliorer notre compréhension des mécanismes et d’évaluer les facteurs agro-écologiques impliqués dans la dynamique spatio-temporelle des populations naturelles de Sahlbergella singularis. Le calcul des tables de vie sur une population d’élevage a révélé que S. Singularis est une espèce à croissance lente. Ceci expliquerait le fait que le ravageur est généralement présent à de faibles densités dans les plantations. L’étude des paramètres démographiques de la population d’élevage a montré que la fécondité est un paramètre-clé des fluctuations saisonnières des populations naturelles. Leur croissance serait liée à la présence de jeunes cabosses sur les cacaoyers fournissant aux femelles une ressource alimentaire favorable à la reproduction. L’étude de l’influence des facteurs agro-écologiques sur les densités de populations de S. Singularis en plantation a révélé que les densités dépendent des conditions parcellaires de culture du cacaoyer. Parmi les pratiques culturales, les traitements insecticides, l’ombrage et le recours aux variétés hybrides sont des facteurs déterminants. En outre, les populations du ravageur sont fortement agrégées dans les zones des plantations bénéficiant d’un ensoleillement maximal. Enfin, l’ombrage fourni par les arbres forestiers s’est avéré plus homogène que l’ombrage d’arbres fruitiers et par conséquent moins propice au développement des poches à mirides. Les recommandations de lutte préconisées par la recherche agronomique sont rarement appliquées par les planteurs. Aussi, nos résultats ont-ils été discutés dans l’optique d’adapter ces recommandations au contexte de culture du cacaoyer qui prévaut actuellement au Cameroun
This work aims at better understanding the mecanisms and agro-ecological factors involved in the Sahlbergella singularis population dynamics in farm. Life table analysis conducted on a rearing population showed that S. Singularis is a slow growing species. This result could explain the low densities of S. Singularis populations in cocoa farms. The study of S. Singularis demographic parameters showed that fecundity is a key-parameter of the seasonal variations of natural populations. Indeed, the high reproductive potential of females, due to optimal food supply and climatic conditions, may largely explain the growth of natural populations. Our work revealed that the density of S. Singularis populations in farms depends on agro-ecological conditions of cocoa production. Among cultural practices, spraying of insecticides, shade management and resort to hybrid varieties were the main factors influencing mirid density. The study of the impact of shade on mirid spatial distribution showed that mirids were aggregated in those areas where sunlight was highest. The infested areas, identified as mirid pockets, could be an infestation source for the surrounding farms. Our results also showed that large forest trees had a tendency to homogenize exposure to sunlight in plots and then to limit the development of mirid pockets. Overall, our study revealed that chemical control and shade management recommendations for cocoa mirids were seldom applied by farmers. Therefore, we discussed our results to fit recommendations to current cocoa production context in Cameroon

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Takam, Soh Patrice. "Estimation de la loi de la durée de séjour en présence d'une censure post-évènement d'intérêt. : Application à la croissance des fruits du cacaoyer et modélisation du risque d'attaque par la pourriture brune au Cameroun." Thesis, Montpellier 2, 2011. http://www.theses.fr/2011MON20163/document.

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Abstract:

Nous nous sommes intéressés dans cette étude à l'estimation de la loi de la durée de séjour en prenant en compte les individus sur lesquels l'évènement d'intérêt et la censure peuvent se produire dans un même intervalle et être observés. Pour cela, nous avons proposé deux approches d'estimation non paramétrique basées sur une approximation asymptotique quand la longueur de l'intervalle entre deux dates consécutives d'observation tend vers 0. La première est basée sur une relation intégrale et la deuxième est basée sur une restauration des durées de séjour. Nous nous sommes servis de ces approches pour monter un modèle de croissance des fruits du cacaoyer en fonction du climat. Nous avons également estimé la sensibilité (probabilité de pénétration et de réussite d'infection) des fruits en fonction de leur stade et le potentiel infectieux (nombre moyen de spores sur un fruit) par date. Ce potentiel infectieux nous permettrait de monter un modèle du potentiel infectieux en fonction des fruits attaqués. La connaissance du potentiel infectieux en fonction des fruits attaqués, de l'estimation de la sensibilité suivant les stades, de l'estimation du modèle de croissance permettra alors de monter un modèle dynamique du potentiel infectieux pour prédire le risque d'évolution de la pourriture brune des fruits du cacaoyer
We are interested in this study in estimating the lifetime distribution by taking into consideration individuals on which the interest event and the censorship can occur in the same intervaland both events were then observed. We proposed two nonparametric approaches based on an asymptotic approximation when the lengthbetween two consecutive observation days tends to 0. The first one was based on an integral relationship and the second one on a lifetime restoration. We used theses approaches to build a fruitgrowth model depending on climatic variables. We also estimated the susceptibility (success probability of attack by a spore on a fruit) of the fruit depending of its developmental stage and theinfectious potential of the disease over time.This infectious potential could help to build a model of infectious potential depending on infected fruits. The knowledge of the infectious potential depending on infected fruits, the estimation of the susceptibility of the fruit and the model of growth will allow to built a dynamic model of infectious potential to predict the evolution risk of disease progression

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Angue, Abane Monique. "Biodynamique des humus et cycles biogéochimiques des éléments dans des sites forestiers et des sites cultivés en cacaoyers du centre-sud Cameroun (réfion d'Akongo)." Nancy 1, 1988. http://www.theses.fr/1988NAN10246.

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Abstract:

On se propose d'étudier l'influence de la roche-mère sur l'orientation de la biodynamique des horizons organo-minéraux superficiels et sur le bilan biogéochimique des éléments minéraux, ainsi que les modifications apportées par la culture du cacaoyer dans la biodynamique des humus forestiers. On effectue des observations morphologiques, micromorphologiques et ultrastructruales de l'organisation des horizons A#1 et A#1#1 et des différentes activités biologiques intervenant dans la transformation des litières et dans la structuration de l'horizon. Les méthodes d'étude des matières organiques sont le fractionnement physique et chimique, la détermination de la CEC et la minéralisation du carbone. On propose un modèle de fonctionnement des 2 écosystèmes forêt et cacaoyère

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Acebo, Guerrero Yanelis. "Selection of fluorescent pseudomonas strains with antagonistic activity against phytophthora palmivora (Butl.) in theobroma cacao L." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2015. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/209034.

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Abstract:

Resumé

La pourriture brune de la cabosse de Theobroma cacao L. induite par Phytophthora palmivora est un maladie qui à l’échelle mondiale, cause de sérieuses pertes dans les plantations de cacao. L'utilisation de fongicides est coûteuse et est nuisible pour l'environnement. L'utilisation de micro-organismes est une alternative écologique

attractive pour les producteurs. L’objectif de ce travail est d’isoler et de caractériser des rhizobactéries de T. cacao avec une activité antagoniste contre Phytophthora palmivora, l'agent causal de la pourriture des cabosses. Parmi les 127 rhizobactéries isolés, trois isolats CP07, CP24 et CP30, identifiées comme Pseudomonas chlororaphis, ont montré une activité

antagoniste in vitro et in vivo contre P. palmivora.

La production d'enzymes lytiques, de sidérophores, de biosurfactants et d’HCN, ainsi que la détection de gènes codant pour des antibiotiques, la formation de biofilm et la mobilité des bactéries ont également été évalués pour les trois souches de rhizobactérie.

Le séquençage du génome de CP07 a confirmé la présence de gènes codant pour trois types de sidérophores, d’HCN, de phénazines et de biosurfactants de la famille de la viscosine, notamment. Un mutant de CP07 déficient dans la production viscosine a été généré et les études effectuées sur ce mutant indiquent que ce bio-tensioactif particulier est essentiel à la fois pour la mobilité bactérienne et pour la formation de biofilm, mais pas pour l'antagonisme in vitro contre Phytophthora, bien qu'il puisse contribuer à la bioprotection de T. cacao.

Cette étude fournit une base théorique pour l'utilisation potentielle de P. chlororaphis

CP07 comme un agent de lutte biologique pour la protection des plantes de cacao contre l'infection par P. palmivora.

Abstract

The black pod rot in Theobroma cacao L. is a major problem worldwide and in Cuba, is

one of the most important diseases. The use of chemical fungicides is expensive and

harmful to the environment. The use of microorganisms is an environmentally

attractive alternative for producers. In this work, fluorescent Pseudomonas strains were

isolated from cocoa rhizosphère. The in vitro antagonistic activity and bioprotection

against Phytophthora palmivora (Butler) was evaluated. Three strains with in vitro

antagonistic activity and bioprotection, CP07, CP24 and CP30, belonging to the species Pseudomonas chlororaphis, were obtained. P. chlororaphis CP07 was highlighted for the best behavior in vitro and in vivo. P. chlororaphis CP07 produces siderophores, HCN,

biosurfactants, exoproteases, lipases and motility (swarming and twitching). Genome

sequencing confirmed the presence of genes encoding three types of siderophores, HCN, phenazines, the biosurfactant viscosin, and exoproteases, among others. A mutant impaired in biosurfactant production was constructed. When the mutant was characterized, it was evident that the biosurfactant was not involved in the antagonistic effect in vitro against P. palmivora Mab1, although it is crucial to the motility and the ability to form biofilms. P. chlororaphis CP07 was selected as a potential biological control agent against Phytophthora.
Doctorat en Sciences
info:eu-repo/semantics/nonPublished

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Valentini, Simiane Grégoire. "Évaluation de la séquestration du carbone dans des plantations agroforestières et des jachères issues d'une agriculture migratoire dans les territoires autochtones de Talamanca, au Costa Rica." Master's thesis, Université Laval, 2007. http://hdl.handle.net/20.500.11794/18894.

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39

Eteme, Evariste. "Etude de l'économie cacaoyère et caféière au Cameroun." Paris, Institut national d'agronomie de Paris Grignon, 2003. http://www.theses.fr/2003INAP0009.

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Affou, Yapi Simplice. "Quel devenir pour les systèmes productifs à base de cacaoyers er de cafeiers en Côte d'Ivoire ?" Montpellier 1, 1995. http://www.theses.fr/1995MON10048.

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Abstract:

Les systèmes productifs à base de cacaoyers et de caféiers tiennent une place prépondérante dans le dispositif de production et de création des ressources nationales. Ces systèmes, fondés essentiellement sur l'utilisation de la main-d'œuvre familiale sont de type extensif. Ils connaissent aujourd'hui des signes d'essoufflement. Ces systèmes, fondés essentiellement sue l'utilisation de la main-d'œuvre familiale sont de type extensif. Ils connaissent aujourd'hui des signes d'essoufflement. Les tentatives de mise en place d'un mécanisme d'administration se sont avérées inefficaces parce que les structures qui sous-tendent ce mécanisme sont en perpétuelle réorganisation. Les organismes de promotion économique et de prise en charge des agriculteurs par eux-mêmes n'ont jamais réussi à affirmer leur autonomie, et leur rôle dans le développement agricole est resté marginal. Dans ce contexte, les paysans et l'état ont adopte des stratégies différentes face aux difficultés rencontres par les systèmes agricoles. Les agriculteurs émigrent des zones dites saturées vers de zones pionnières, une solution non viable à long terme. Quant aux initiatives étatiques, elles se caractérisent par des projets agricoles fondés sur une vision "techniciste". Elles sont sélectives, coûteuses et difficilement reproductibles à très large échelle.

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Rey, de Arce Maria. "Diagnostic des systèmes de production cacaoyers dans une vallée productrice de coca : l'Alto Huallaga, au Pérou /." Montpellier : CIHEAM-IAMM, 2008. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb41244898h.

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Abstract:

Thèse Master of science--Agronomie--Montpellier--Institut agronomique méditerranéen, 2007.
CIHEAM = Centre international des hautes études agronomiques méditerranéennes. IAMM = Institut agronomique méditerranéen de Montpellier. En appendice, choix de documents. Bibliogr. p. 113-114. Webliogr. p. 115. Résumé en français et en anglais.

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Da, Silva Gomes Andrea. "Dynamique du système agraire de la région cacaoyère de l'Etat de Bahia, Brésil." Paris, AgroParisTech, 2007. http://www.theses.fr/2007AGPT0007.

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Abstract:

Le système agraire de la région cacaoyère de l´État de Bahia, Brésil, a été l´objet d´importantes transformations, qui ont résulté d´une grave crise socio-économique. Cette crise a débuté fin des années quatre-vingt et sa cause principale fut le déclin de la monoculture cacaoyère, activité économique dominante de la région jusqu´au début des années quatre-vingt-dix. Parmi les transformations qui se sont produites dans la région, on note la migration de la main d´oeuvre rurale vers les villes les plus proches, une augmentation de la pauvreté rurale et urbaine, l´apparition de nouvelles formes d´organisation du travail et de production dans l´agriculture, des innovations technologiques et une augmentation du déboisement. Face à ce scénario régional, notre recherche a pour objectif de contribuer à la compréhension de la dynamique du système agraire de la région étudiée, du point de vue économique et social. Nous avons ainsi élaboré un modèle de dynamique de systèmes basé sur les données de notre recherche sur le terrain dans une micro-région cacaoyère, en particulier dans les municipalités de Itajuípe et Coaraci. Le modèle a été conçu de façon à mettre en évidence les relations existantes entre les investissements réalisés dans les exploitations cacaoyères, la création d´emplois agricoles, les modes de faire-valoir, les revenus des exploitants, la structure foncière et les types d´exploitations agricoles. Les différents systèmes de culture et/ou élevage mis en oeuvre sont liés à ce dernier facteur, compte tenu des différents types de main-d’oeuvre. À partir de l´interaction de différents sous-modèles, nous avons construit un modèle de développement régional. Celui-ci montre divers scénarios d´évolution pour le système agraire régional et montre quelles pourraient être les politiques publiques qui favorisent un développement agricole durable de la région
The cocoa growing region of Bahia State, Brazil has been experiencing important transformations in its agrarian system as a consequence of a grave socioecomical crisis. Initiated in the last 80s years, this crisis was principally caused by the decline of cocoa cultivation, the dominant economic activity in the region until the 90s. Some of the resulting transformations occurring in the region are: the exodus of rural labor force to the nearest cities, increased rural and urban poverty, the appearance of new forms of work organization and agricultural production systems, technological innovations and increased deforestation. In light of this regional scenario, our research aimed to contribute to the understanding of the agricultural system dynamic of the studied region, with an economic and social approach. A dynamic pattern system was created based on field research performed in a cocoa growing micro-region, in the municipalities of Itajuípe and Coaraci. The model shows relations between agricultural investments in cocoa farms, agricultural employment generation, land tenure, labor force employment (sharecroppers or wage-workers), agrarian structure and productive unit typology. This last factor is related to the adoption of different cropping and animal raising systems in addition to different types of workers. From the interaction of the distinct sub-models, a regional development model was constructed. Several scenarios for the regional agrarian system were shown and public policy proposals that promote agricultural development intervention were made

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Neves, Ramos Alba Regina. "Problèmes de l'éducation et le milieu rural micro-région cacaoyère, état de Bahia." Lille 3 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37600000c.

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Da, Silva Gomes Andréa. "Dynamique du systÈme agraire de la rÉgion cacaoyÈre de l´État de bahia, brÉsil." Phd thesis, AgroParisTech, 2007. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00004595.

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Abstract:

Le système agraire de la région cacaoyère de l´État de Bahia, Brésil, a été l´objet d´importantes transformations, qui ont résulté d´une grave crise socio-économique. Cette crise a débuté fin des années quatre-vingt et sa cause principale fut le déclin de la monoculture cacaoyère, activité économique dominante de la région jusqu´au début des années quatre-vingt-dix. Parmi les transformations qui se sont produites dans la région, on note la migration de la maind ´oeuvre rurale vers les villes les plus proches, une augmentation de la pauvreté rurale et urbaine, l´apparition de nouvelles formes d´organisation du travail et de production dans l´agriculture, des innovations technologiques et une augmentation du déboisement. Face à ce scénario régional, notre recherche a pour objectif de contribuer à la compréhension de la dynamique du système agraire de la région étudiée, du point de vue économique et social. Nous avons ainsi élaboré un modèle de dynamique de systèmes basé sur les données de notre recherche sur le terrain dans une micro-région cacaoyère, en particulier dans les municipalités de Itajuípe et Coaraci. Le modèle a été conçu de façon à mettre en évidence les relations existantes entre les investissements réalisés dans les exploitations cacaoyères, la création d´emplois agricoles, les modes de faire-valoir, les revenus des exploitants, la structure foncière et les types d´exploitations agricoles. Les différents systèmes de culture et/ou élevage mis en oeuvre sont liés à ce dernier facteur, compte tenu des différents types de main-d'oeuvre. À partir de l´interaction de différents sous-modèles, nous avons construit un modèle de développement régional. Celui-ci montre divers scénarios d´évolution pour le système agraire régional et montre quelles pourraient être les politiques publiques qui favorisent un développement agricole durable de la région.

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MOTAMAYOR, ARIAS JUAN CARLOS. "Etude de la diversite genetique et de la domestication des cacaoyers criollo (theobroma cacao l. ) a l'aide de marqueurs moleculaires." Paris 11, 2001. http://www.theses.fr/2001PA112171.

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Abstract:

Des prospections realisees dans cinq pays d'amerique latine ont permis d'echantillonner des cacaoyers appartenant au groupe criollo. Au moyen de marqueurs rflp, aflp et microsatellites, une tres faible diversite genetique a ete trouvee au sein des criollo non introgresses par des genes de forastero (criollo anciens). Les distances genetiques observees entre les individus criollo anciens et des individus sauvages de colombie et d'equateur sont apparues inferieures ou au moins equivalentes aux distances genetiques observees entre ces derniers et d'autres individus forastero d'amerique du sud. Ceci nous a amene a proposer que les individus criollo ne representaient pas une sous-espece de theobroma cacao l. Totalement differencie des populations de cacaoyers d'amerique du sud (contrairement a ce qui etait generalement avance), mais plutot une population de plus au sein d'une espece genetiquement tres diverse. Nos resultats suggerent egalement une origine sud-americaine des criollo. On a pu aussi identifier les parents forastero a l'origine des trinitario. La diversite allelique de ce groupe peut etre observee en seulement deux individus criollo anciens et trois individus forastero de basse amazonie peu de diversite mitochondriale a ete observee entre les differents individus criollo, trinitario et forastero analyses. On a pu montrer la transmission maternelle preponderante des mitochondries mais aussi une transmission a travers le pollen plus reduite. Des variations stchiometriques de differents genomes mitochondriaux entre individus d'une meme descendance ont aussi ete observes. La participation de genes nucleaires dans la regulation de ces variations stchiometriques a pu etre montree et ces genes cartographies. Enfin, une recherche bibliographique approfondie sur l'utilisation du cacao par les civilisations du sud-ouest du venezuela a permis de conforter les resultats moleculaires qui suggerent l'origine sud-americaine des cacaoyers criollo.

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Tano, Maxime Assi. "Crise cacaoyère et stratégies des producteurs de la sous-préfécture de Meadji au sud-ouest ivoirien." Phd thesis, Université Toulouse le Mirail - Toulouse II, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00713662.

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Abstract:

La crise cacaoyère de la fin de la décennie 1970 a profondément bouleversé les stratégies de survie des producteurs. Elle s'est manifestée par la rareté des facteurs de production (la terre et le travail), la diminution de la production et du revenu, la transformation du milieu écologique et la baisse de la pluviométrie. Pour faire face à l'ensemble de ces contraintes, les producteurs ont adopté diverses stratégies dont l'objectif était, soit de diversifier les sources de revenu, soit de réduire les charges familiales. Le résultat principal de cette recherche est d'avoir constaté que les stratégies les plus efficaces sont celles qui ont été modelées en tenant compte des rapports sociaux. Il s'agit des stratégies de diversification des revenus, de crédit, de mobilisation du facteur travail, le respect des règles du tutorat, etc. La diversification des revenus qui a reposé sur des valeurs de solidarité et d'entraide a constitué un élément important des stratégies de survie des producteurs parce qu'elles ont offert un filet de sécurité de premier plan dans un contexte de crise cacaoyère.

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Tano, Assi Maxime. "Crise cacaoyère et stratégies des producteurs de la sous-préfécture de Meadji au sud-ouest ivoirien." Thesis, Toulouse 2, 2012. http://www.theses.fr/2012TOU20015/document.

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Abstract:

La crise cacaoyère de la fin de la décennie 1970 a profondément bouleversé les stratégies de survie des producteurs. Elle s’est manifestée par la rareté des facteurs de production (la terre et le travail), la diminution de la production et du revenu, la transformation du milieu écologique et la baisse de la pluviométrie. Pour faire face à l’ensemble de ces contraintes, les producteurs ont adopté diverses stratégies dont l’objectif était, soit de diversifier les sources de revenu, soit de réduire les charges familiales. Le résultat principal de cette recherche est d’avoir constaté que les stratégies les plus efficaces sont celles qui ont été modelées en tenant compte des rapports sociaux. Il s’agit des stratégies de diversification des revenus, de crédit, de mobilisation du facteur travail, le respect des règles du tutorat, etc. La diversification des revenus qui a reposé sur des valeurs de solidarité et d’entraide a constitué un élément important des stratégies de survie des producteurs parce qu’elles ont offert un filet de sécurité de premier plan dans un contexte de crise cacaoyère
The cocoa crisis of the late 1970s greatly affected the survival strategies of producers. It manifests in the scarcity of production (land, labour), the decrease in production and revenue, the transformation of the ecological milieu and the decrease in rainfall. In order to overcome these constraints, producers have adopted various strategies that either aim at diversifying their sources of revenue or reduce family responsibilities. The main result of this study is the observation that, the most efficient of these strategies were those shaped while taking into consideration social relationships. They include strategies to diversify revenue, credit, mobilisation of the labour factor, the respect of guidance rules. The diversification of revenue which was based on solidarity and cooperation constitute an important element of the producers’ survival strategies because they have ensured an ineligible first degree security in cocoa crisis

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Deheuvels, Olivier. "Compromis entre productivité et biodiversité sur un gradient d'intensité de gestion de systèmes agroforestiers à base de cacaoyers de Talamanca, Costa Rica." Thesis, Montpellier, SupAgro, 2011. http://www.theses.fr/2011NSAM0026/document.

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Abstract:

Le cacaoyer (Theobroma cacao, L.) est cultivé dans les tropiques humides d'Amérique latine, d'Afrique et d'Asie. Principale source de revenus d'une agriculture essentiellement familiale, les systèmes agroforestiers à base de cacaoyers fournissent de nombreux services écologiques et contribuent à la conservation de la biodiversité. Ces systèmes associent plantes ligneuses et cultures de manière simultanée, dans une gamme importante et peu décrite de richesses et de structures botaniques. Les connaissances actuelles sur leur productivité se limitent à des essais en milieu contrôlé associant un petit nombre d'espèces. Nos travaux testent l'hypothèse d'une relation de compromis entre le niveau de productivité des cacaoyers et le niveau de biodiversité hébergée par les agroforêts à base de cacaoyers. Nous caractérisons ces compromis sur un gradient de situations de production paysannes, reposant sur la structure verticale, l'intensité de gestion de la composante végétale et le contexte bio-physique des agro-systèmes étudiés. Sur un dispositif de 36 cacaoyères paysannes situées dans la région de Talamanca, Costa Rica, nous montrons que des variations significatives de la structure végétale reflètent les modes de gestion de la parcelle et affectent le rendement par cacaoyer (295 à 667g/arbre/an) mais pas le rendement en cacao (136 kg/ha/an), ni le volume végétal global (400 m3/ha). Ces variations de la structure végétale affectent peu la diversité α des peuplements de plantes associées, d'épiphytes, d'amphibiens, de reptiles, de mamifères, d'invertébrés du sol et de la litière, mais leur diversité β répond de manière contrastée à ces variations d'habitat. Les relations de compromis que nous mettons finalement en évidence entre la productivité en cacao marchand à l'hectare ou à l'arbre et les niveaux de biodiversité atteints sont de nature (linéaire, cubique, quadratique) et de tendances (négative, postive) contrastées selon le taxon considéré et remettent en cause les résultats de certains travaux récents. Nos travaux dévoilent également des situations de compromis optimales, offrant des perspectives positives pour l'intensification écologique des systèmes agroforestiers tropicaux
Cacao (Theobroma cacao, L.) is cultivated in the humid tropics of Latin America, Africa and Asia. Cocoa-based agroforestry systems are the main source of income for smallholders' families and provide numerous ecological services and contribute to biodiversity conservation. These systems associate trees with crops simultaneously, in a wide and poorly described range of botanical and structural plant diversity. The current knowledge about their productivity is restricted to controlled trials with a low numer of associated plant species. Our work tests the hypothesis of a trade-off relationship between the level of cocoa productivity and the level of biodiversity hosted in cocoa-based agroforests. We characterize these trade-offs on a gradient of production situations, based on the vertical structure, the management intensity of the vegetal component and the bio-physical context of cocoa-based agroforests. On the base of a 36 on farm cocoa plots network located in Talamanca, Costa Rica, we show that significant variations in the vegetation vertical structure reflect farmer's management strategies and affect the cocoa yield per tree (295 to 667g/tree/year) but neither the cocoa yield per plot (136 kg/ha/year), nor the global plant volume (400 m3/ha). The variations in vegetation structure poorly affected the α-diversity of 7 plant and animal taxa, but their β-diversity gave contrasted and significant responses to habitat variations. Finally, the trade-offs relationships we display between dry cocoa productivity per hectare or per tree and the observed biodiversity levels showed contrasted forms (cubic, quadratic, linear) and tendances (positive, negative) according to the taxa considered and question results from recent publications. Our work also revealed optimal trade-off situations which offer positive prospects for the ecological intensification of tropical agroforestry systems

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Angue, Abane Monique. "Biodynamique des humus et cycles biogéochimiques des éléments dans des sites forestiers et des sites cultivés en cacaoyers du centre-sud Cameroun, région d'Akongo." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37611302b.

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Panduro, Alegría Juan Carlos. "Instalación De Un Módulo De Proceso De Panela Granulada (Azúcar Orgánica) Y Evaluación De Rendimiento En La Cooperativa Agraria Cacaotera ACOPAGRO." Bachelor's thesis, Universidad Ricardo Palma. Programa Cybertesis PERÚ, 2007. http://cybertesis.urp.edu.pe/urp/2007/panduro_jc/html/index-frames.html.

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Dissertations / Theses on the topic 'Cacaoyer'

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