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Dissertations / Theses on the topic 'Cell lignage'

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Finot, Laurence. "Identification et caractérisation du lignage épithélial dans la glande mammaire bovine." Thesis, Rennes, Agrocampus Ouest, 2019. http://www.theses.fr/2019NSARB319/document.

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Abstract:
Le développement de l’épithélium mammaire dépend des cellules souches qui, en proliférant et se différenciant, donnent naissance aux cellules du lignage épithélial. Les cellules souches sont ensuite sollicitées à chaque gestation pour régénérer une partie de l’épithélium. L’objectif de cette thèse est d’identifier et de caractériser en profondeur les différents types de cellules du lignage épithélial mammaire bovin par des approches de cytométrie en flux et de tri cellulaire. Nous avons défini et étudié des (sous)populations épithéliales engagées dans le développement mammaire à la puberté. A ce stade, l’épithélium mammaire contient de rares cellules souches mammaires, des cellules progénitrices à typage mixte luminal/basal et des cellules luminales et basales. Ces (sous)populations diffèrent soit en proportion soit en caractéristiques, voire les deux, aux stades physiologiques majeurssuivants (lactation et tarissement). Les cellules basales diminuent en lactation et au tarissement. Elles possèdent une signature moléculaire propre à chaque stade. La population luminale, composée de plusieurs sous-populations, est la plus variable. Elle arbore une réceptivité hormonale différente à chaque stade. Des (sous)populations épithéliales n’apparaissent qu’à un stade précis (puberté ou lactation) et disparaissent aux autres, comme certaines cellules prolifératives définies comme cellules progénitrices. Enfin, la fraction de rares cellules souches putatives diminue graduellement, de la puberté aux stades suivants, tout en conservant des caractéristiques moléculaires similaires. Ces<br>The development of the mammary epithelium relies on the mammary stem cells which, by proliferating and differentiating, give rise to the luminal, basal and progenitor cells of the epithelial lineage. The stem cells are then solicited at each gestation to regenerate a part of the epithelium. In this thesis work, we aim at identifying and characterizing in depth the different types of cell constitutive of the bovine mammary epithelial cell lineage by flow cytometry and cell sorting approaches. We defined and studied epithelial (sub)populations committed to mammary development at puberty. At this stage, the mammary epithelium contains rare mammary stem cells, mixed luminal/ basal progenitors, as well as luminal and basal cells.These (sub)populations were found to differ in proportion and/or characteristics at thesubsequent major physiological stages (lactation and dry periods). Basal cells decrease at lactation and dry off. They harbor a specific molecular signature at each stage. The luminal population, composed of several subpopulations, is the most variable. The hormonal receptivity of these cells changes at each physiological stage. Interestingly, some epithelial populations only appear at specific stages (puberty or lactation) and disappear at others, as one subpopulation of proliferative cells that we defined as progenitor cells. At last, the pool of rare putative stem cells gradually decreases from puberty to the next stages while maintaining a similar molecular signature. These are novel insights that show that the epithelial lineage evolves substantially through the
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Fabrèges, Dimitri. "Phenotypic Variations In Animal Morphogenesis : Sea Urchin Twins And Cloned Rabbits." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLS010/document.

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Abstract:
La variabilité est une propriété intrinsèque aux systèmes biologiques, essentielle pour l'évolution et l'embryogénèse. Souvent considérée comme du bruit, ce n'est que récemment que l'aléatoire des processus biologiques a commencé à être systématiquement étudié. Cette thèse pose les questions suivantes : qu'est-ce qu'un développement normal ? Quel est l'étendue et le rôle de la variabilité dans la robustesse et la résilience du développement embryonnaire ?Ces questions sont posées pour le lapin (Oryctolagus cuniculus) et l'oursin (Paracentrotus lividus et Sphaerechinus granularis).Nous nous sommes aussi intéressé à la quantification du déterminisme de la variabilité embryonnaire à l'aide d'oursins jumeaux et de lapins clonés.La mesure des comportements cellulaires est effectuée sur des lignages cellulaires obtenus à partir d'imagerie 3D+temps. Nous montrons que les oursins jumeaux peuvent se développer selon trois phénotypes différents, jamais observés chez le normal, avant de converger vers une blastula d'apparence normale. De plus, les comparaisons entre et au sein des pairs de jumeaux montrent que le phénotype et la survie ne dépend que de l'histoire individuelle des embryos.Nos mesures quantitatives des pairs de jumeaux amènent des questions ouvrant de nouveaux horizons de recherche : les jumeaux sont-ils robustes ou résilient ?Le développement pré-implantatoire des lapins a été étudié sur cinq embryons numériques (trois sauvages et deux clones), du stade 32-cellules à l'éclosion.Nous montrons que les divisions asymétriques internes et externes régulent la variation du nombre de cellules internes ainsi que la taille de la masse cellulaire.De plus, la variation du nombre de cellules internes est plus grande que pour les cellules externes, ce qui semble directement lié au taux de morts cellulaires.Notre hypothèse est que le potentiel de bon développement des clones est assuré par une grande plasticité épigénétique des cellules donneuses.Ce travail espère définir des méthodes et des concepts fondateurs pour une exploration quantitative et une modélisation multi-échelle de la morphogénèse animale<br>Variability is an intrinsic characteristic of biological systems, essential for evolution and embryogenesis.Considered as noise for centuries, it is only recently that the stochasticity of biological processes has began to be systematically explored.The present thesis addresses the following questions: What is a normal development?What is the extent and role of variability in developmental robustness and resilience?We tackle these issues in rabbit (Oryctolagus cuniculus) and sea urchin (Paracentrotus lividus and Sphaerechinus granularis).We also aimed to quantify determinism and stochasticity of developmental variability by means of sea urchin twins and cloned rabbits.Variations in cell behaviors were investigated through reconstruction of cell lineage from 3D+time imaging.We showed that sea urchin twins can follow three different developmental paths never observed in normal embryo, before converging to normal looking blastula.Moreover, comparisons between and within pairs of twins revealed that phenotype and survival depend on individual history alone.Our quantitative observation of twin pairs raises question opening a future line of research: are twins robust or resilient?Rabbit preimplantation development was explored with five digital specimens (three wild-types and two clones) from the 32-cell stage to hatching.We showed that inner and outer asymmetric divisions regulate the variation of inner cell number and may control inner cell mass size.In addition, the variation of inner cell number in clones is higher than outer cells which seems to be directly correlated to their cell death ratio.Our current hypothesis is that the potential to lead to viable clones requires plasticity of donor's epigenetic state.This work is expected to ground concepts and methods for a quantitative exploration and further multilevel modeling of morphogenetic processes
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Yeo, Wendy Wai Yeng. "Differentiation of skeletal muscle-derived stem cells into beta pancreatic lineage." Thesis, Montpellier, 2015. http://www.theses.fr/2015MONTS091.

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Abstract:
Le diabète de type 1 (DT1) est caractérisé par des niveaux élevés de glucose en raison de la destruction des cellules ß pancréatiques sécrétrices d'insuline. Cependant, les thérapies actuelles de remplacement des cellules bêta du pancréas impliquant la transplantation d'îlots pancréatiques sont techniquement difficiles et limitées par la disponibilité de don d'organes. Bien que les cellules souches embryonnaires et les cellules souches pluripotentes induites soient intensément étudiées, aucune de ces deux sources de cellules souches ne peut être utilisée directement sans le risque de développement de tumeurs. Les cellules souches dérivées du muscle squelettique (MDSC) sont une source de cellules alternative intéressante car elles sont multi-potentes et peuvent donc se différencier vers plusieurs lignages cellulaires tels que des cellules cardiaques à battement autonome “pacemaker-like” et des cellules neuronales. Par conséquent, nous avons émis l'hypothèse qu'elles pourraient se différencier en lignées de type pancréatique. Les objectifs de cette étude étaient donc d'étudier le potentiel des MDSC (1) à se différencier in vitro en cellules beta pancréatiques exprimant l'insuline et (2) à se différentier in vivo dans le pancréas et ainsi réduire l'hyperglycémie chez la souris modèle d'un diabète de type 1. Dans cette étude, les MDSC de muscle de souris ont été isolées via une série de passages des cellules les moins adhérentes en culture. Les cellules souches ainsi isolées peuvent adhérer sur une couche de cellules de types fibroblastes ou sur une matrice extra-cellulaire de type laminine pour ensuite se différentier in vitro ou bien être utilisées comme cellules souches MDSC non-adhérentes et non différentiées pour les études in vivo. In vitro, les MDSC peuvent se différencier spontanément en agrégats de cellules formant des îlots et exprimant des marqueurs de cellules bêta identifiés par immunofluorescence et analyse “PCR transcription inverse”. Ceci a été confirmé par immuno-analyse montrant l'expression des protéines nécessaires à la fonction des cellules ß, comme Nkx6.1, MafA et Glut2. Les MDSC différenciées en aggrégats cellulaires de type îlots pancréatiques montrent une sécrétion d'insuline en réponse au glucose in vitro. Cependant, dans des modèles murins de DT1 induit par la streptozotocine, l'injection intra-péritonéale des MDSC n'a pas permis de rétablir chez les souris diabétiques une normoglycémie du glucose sanguin en dépit d'un engreffement des MDSC dans les tissus pancréatiques. Ces données montrent que les MDSC peuvent constituer une source de cellules souches alternative intéressante pour le traitement du diabète<br>Type 1 Diabetes (T1D) is characterized by high and poorly controlled glucose levels due to the destruction of insulin-secreting pancreatic ß-cells. However, current ß-cell replacement therapies, involving pancreas and pancreatic islet transplantation are technically demanding and limited by donor availability. While embryonic stem cells and induced pluripotent stem cells are intensely investigated, neither can be used due to safety issues. Skeletal muscle-derived stem cells (MDSC) are an attractive alternative cell source as they have the potential to undergo multilineage differentiation into beating pacemaker-like cells and neuronal cells. Hence, it is hypothesised that they can differentiate into pancreatic lineages. This led to the goals of this study, which were (1) to investigate the potential of MDSC to differentiate into mature insulin expressing cells in vitro and (2) to reduce hyperglycemia in mouse model type 1 diabetes. In this study, MDSC were isolated from mouse via a serial pre-plating based on the adhesive characteristics of cultured cells, in which the cells of interest adhered to plates at a later time for in vitro differentiation, while the non-adherence undifferentiated MDSC were used for in vivo study. The MDSC were found to spontaneously differentiate into islet-like aggregates and expressed ß-cell markers in vitro, as determined by immunofluorescence and reverse transcription PCR analyses. This was further confirmed by immunoblotting analysis showing expression of proteins required for ß-cell function, such as Nkx6.1, MafA and Glut2. The differentiation of MDSC into islet-like clusters demonstrated glucose responsiveness in vitro. In streptozotocin-induced T1D mouse models, intraperitoneal injection of the undifferentiated MDSC did not restore the blood glucose levels of the diabetic mice to normoglycemia despite successful engraftment of MDSC into the pancreatic tissues. Taken together, these data show that MDSC may serve as an alternative source of stem cells for the treatment of diabetes
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Fernique, Pierre. "A statistical modeling framework for analyzing tree-indexed data : application to plant development on microscopic and macroscopic scales." Thesis, Montpellier 2, 2014. http://www.theses.fr/2014MON20064/document.

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Abstract:
Nous nous intéressons à des modèles statistiques pour les données indexées par des arborescences. Dans le contexte de l'équipe Virtual Plants, équipe hôte de cette thèse, les applications d'intérêt portent sur le développement de la plante et sa modulation par des facteurs environnementaux et génétiques. Nous nous restreignons donc à des applications issues du développement de la plante, à la fois au niveau microscopique avec l'étude de la lignée cellulaire du tissu biologique servant à la croissance des plantes, et au niveau macroscopique avec le mécanisme de production de branches. Le catalogue de modèles disponibles pour les données indexées par des arborescences est beaucoup moins important que celui disponible pour les données indexées par des chemins. Cette thèse vise donc à proposer un cadre de modélisation statistique pour l'étude de patterns pour données indexées par des arborescences. À cette fin, deux classes différentes de modèles statistiques, les modèles de Markov et de détection de ruptures, sont étudiées<br>We address statistical models for tree-indexed data.Tree-indexed data can be seen as a generalization of path-indexed data since directed path graphs are directed tree graphs where there is at most one child per vertex.In the context of the Virtual Plants team, host team of this thesis, applications of interest focus on plant development and its modulation by environmental and genetic factors.We thus focus on plant developmental applications, both at the microscopic level with the study of the cell lineage in the biological tissue responsible for the plant growth, and at the macroscopic level with the mechanism of production of branches. The catalog of models available for tree-indexed data is far less important than the one available for path-indexed data.This thesis therefore aims at proposing a statistical modeling framework for studying patterns in tree-indexed data.To this end, two different classes of statistical models, Markov and change-point models, are investigated
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Villoutreix, Paul. "Aléatoire et variabilité dans l’embryogenèse animale, une approche multi-échelle." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2015. http://www.theses.fr/2015PA05T016/document.

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Abstract:
Nous proposons dans cette thèse de caractériser quantitativement la variabilité à différentes échelles au cours de l'embryogenèse. Pour ce faire, nous utilisons une combinaison de modèles mathématiques et de résultats expérimentaux. Dans la première partie, nous utilisons une petite cohorte d'oursins digitaux pour construire une représentation prototypique du lignage cellulaire, reliant les caractéristiques des cellules individuelles avec les dynamiques à l'échelle de l'embryon tout entier. Ce modèle probabiliste multi-niveau et empirique repose sur les symétries des embryons et sur les identités cellulaires; cela permet d'identifier un niveau de granularité générique pour observer les distributions de caractéristiques cellulaires individuelles. Le prototype est défini comme le barycentre de la cohorte dans la variété statistique correspondante. Parmi plusieurs résultats, nous montrons que la variabilité intra-individuelle est impliquée dans la reproductibilité du développement embryonnaire. Dans la seconde partie, nous considérons les mécanismes sources de variabilité au cours du développement et leurs relations à l'évolution. En nous appuyant sur des résultats expérimentaux montrant une pénétrance incomplète et une expressivité variable de phénotype dans une lignée mutante du poisson zèbre, nous proposons une clarification des différents niveaux de variabilité biologique reposant sur une analogie formelle avec le cadre mathématique de la mécanique quantique. Nous trouvons notamment une analogie formelle entre l'intrication quantique et le schéma Mendélien de transmission héréditaire. Dans la troisième partie, nous étudions l'organisation biologique et ses relations aux trajectoires développementales. En adaptant les outils de la topologie algébrique, nous caractérisons des invariants du réseaux de contacts cellulaires extrait d'images de microscopie confocale d'épithéliums de différentes espèces et de différents fonds génétiques. En particulier, nous montrons l'influence des histoires individuelles sur la distribution spatiales des cellules dans un tissu épithélial<br>We propose in this thesis to characterize variability quantitatively at various scales during embryogenesis. We use a combination of mathematical models and experimental results. In the first part, we use a small cohort of digital sea urchin embryos to construct a prototypical representation of the cell lineage, which relates individual cell features with embryo-level dynamics. This multi-level data-driven probabilistic model relies on symmetries of the embryo and known cell types, which provide a generic coarse-grained level of observation for distributions of individual cell features. The prototype is defined as the centroid of the cohort in the corresponding statistical manifold. Among several results, we show that intra-individual variability is involved in the reproducibility of the developmental process. In the second part, we consider the mechanisms sources of variability during development and their relations to evolution. Building on experimental results showing variable phenotypic expression and incomplete penetrance in a zebrafish mutant line, we propose a clarification of the various levels of biological variability using a formal analogy with quantum mechanics mathematical framework. Surprisingly, we find a formal analogy between quantum entanglement and Mendel’s idealized scheme of inheritance. In the third part, we study biological organization and its relations to developmental paths. By adapting the tools of algebraic topology, we compute invariants of the network of cellular contacts extracted from confocal microscopy images of epithelia from different species and genetic backgrounds. In particular, we show the influence of individual histories on the spatial distribution of cells in epithelial tissues
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Uden, Wilhelmus van. "The production of podophyllotoxin and related cytotoxic lignans by plant cell cultures." [S.l. : [Groningen : s.n.] ; University Library Groningen] [Host], 1992. http://irs.ub.rug.nl/ppn/293040230.

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Allen, Kristi Lynne. "Therapeutic reactivation of the p53 tumor suppressor protein in HPV-positive cervical cancer cells by the creosote bush lignan 3'-O-methyl-nordihydroguaiaretic acid." [Kent, Ohio] : Kent State University, 2007. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc%5Fnum=kent1176432164.

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Abstract:
Thesis (Ph.D.)--Kent State University, 2007.<br>Title from PDF t.p. (viewed Mar. 11, 2009). Advisor: Angelo L. DeLucia. Keywords: human papillomavirus, E6 oncogene, lignan, p53, apoptosis. Includes bibliographical references (p. 132-144).
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Daclin, Marie. "Mécanismes de développement des cellules épendymaires : origine et lignage des cellules épendymaires dans le cerveau des mammifères." Thesis, Paris Sciences et Lettres (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018PSLEE015.

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Abstract:
Les cellules épendymaires sont des cellules multiciliées qui tapissent les parois de toutes les cavités du cerveau. Une fois différenciées, ces cellules ne se divisent plus au cours de la vie. Le battement de ces multiples cils motiles joue un rôle important pour maintenir un flux constant de liquide cérébrospinal à travers toutes les cavités cérébrales. Les cellules épendymaires assurent également des fonctions critiques d’échanges moléculaires avec le liquide cérébrospinal. Dans son ensemble, l’implication des cellules épendymaires et de leurs cils motiles s’avère d’une importance majeure dans le maintien des circuits neuraux ainsi que dans le fonctionnement plus global du cerveau. Récemment, une nouvelle caractéristique des cellules épendymaires a été identifiée ; elles font partie d’un microenvironnement appelé une « niche » centrée autour de cellules souches neurales dans le cerveau du rongeur adulte. Ces cellules souches neurales adultes sont capables de produire de nouveaux neurones qui migreront vers le bulbe olfactif des rongeurs adultes. Concernant leur origine, il a été montré que les cellules épendymaires multiciliées dérivent des cellules souches neurales durant les stades tardifs embryonnaires. Ces mêmes cellules souches peuvent d’ailleurs donner naissance à la plupart des différents types de cellules du cerveau. Cependant, les mécanismes par lesquels les cellules souches décident de leur destin cellulaire restent largement méconnus. Dans ce projet, nous étudions quel type de division donne naissance à des cellules épendymaires et nous nous intéressons également au lignage épendymaire. Nos données suggèrent que les cellules épendymaires ne migrent pas après leur dernière division et qu’elles restent à proximité de l’endroit où elles ont été produites. Chose particulièrement intéressante, nous montrons que les cellules épendymaires peuvent être générées par division symétrique ou asymétrique. Nos résultats révèlent aussi que les cellules souches neurales embryonnaires se divisent de manière asymétrique pour donner naissance à la fois à une celluleépendymaire et à une cellule souche neurale adulte. Ces données viennent s’ajouter à la connaissance actuelle que nous avons du développement du cerveau. De plus, elles pourraient contribuer à ouvrir de nouvelles perspectives et stratégies thérapeutiques pour soigner les maladies neurodégénératives à beaucoup plus long terme<br>Ependymal cells are multiciliated cells lining the walls of all brain cavities. Once they are mature, they do not divide during life. Their motile ciliary beating endorses a crucial role in maintaining a proper flow of cerebrospinal fluid throughout all brain cavities. Ependymal cells also ensure critical molecular exchanges of the cerebrospinal fluid. On the whole, the involvement of ependymal cells and their multiple motile cilia in the maintenance of the neural circuits and more globally in the well-functioning of the entire brain have proven paramount. More recently, a new characteristic of ependymal cells has been brought to light. Namely, they are part of a microenvironment so called a “niche” surrounding adult neural stem cells in the adult rodent brain. Noteworthy, these adult neuralstem cells are capable of producing new neurons that will migrate to the olfactory bulb of rodents. In terms of their origin, it was shown that multiciliated ependymal cells derive from neural stem cells during late embryonic stages. Besides, the same stem cells can give rise to most cell types of the brain. However, little is known about how fate-decision is made in neural stem cells. In this project, we tackle more particularly how multiciliated ependymal cells arise from the neural stem cells. Most specifically, we address the type of celldivision and the ependymal cell lineage. We find that ependymal cells are not migrating subsequent to their last division, but rather stay where they were first produced. Most interestingly, they can be generated through both symmetric and asymmetric cell division. We also show that embryonic neural stem cells divide asymmetrically to give rise to both an ependymal cell and an adult stem cell. We are confident that these data bring major new insights in the current understanding of neural development. Additionally, these findingscould contribute in opening new therapeutic perspectives and strategies to cure neurodegenerative diseases in a much longer term
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Ozmadenci, Duygu. "Netrin-1 function in somatic cell reprogramming and pluripotency." Thesis, Lyon, 2017. http://www.theses.fr/2017LYSE1254/document.

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Abstract:
La pluripotence est la capacité d'une cellule à s'auto-renouveler et à donner toutes les cellules somatiques ainsi que les cellules germinales. Les cellules pluripotentes peuvent être aussi reprogrammées à partir de cellules somatiques, ouvrant ainsi de nouvelles opportunités pour l'utilisation thérapeutique des cellules souches dans le traitement des maladies dégénératives. La connaissance des mécanismes moléculaires, en particulier des voix de signalisation qui contrôlent la pluripotence, est cruciale pour l'amélioration de notre compréhension de l'embryogenèse précoce et l'utilisation des iPSC (cellules souches pluripotentes induites) dans la médicine régénérative. Ici, je donne la première description de la Nétrine-1 en tant que régulateur de la reprogrammation et de la pluripotence. La Nétrine-1 et ses récepteurs ont été initialement caractérisés dans le système neuronal, mais il a aussi été montré qu'ils étaient exprimés dans différents types cellulaires et impliqués dans divers processus. Dans la première partie, j'ai contribué à explorer comment Nétrine-1 empêche l'apoptose médiée par son récepteur à dépendance DCC (Deleted in Colon Carcinoma) pendant la reprogrammation. Dans la deuxième partie, j'ai disséqué les fonctions et la régulation de cette voie dans le maintien de la pluripotence et dans l'engagement des lignages<br>Pluripotency is the ability of embryonic epiblast cells to self-renew and to give rise to all somatic cells as well as germ cells. Somatic cells can also be reprogrammed toward pluripotency, opening new avenues for stem cell based therapies in the treatment of degenerative diseases. Deciphering the molecular mechanisms, and in particular signaling pathways that control pluripotency is crucial to improve our understanding of early embryogenesis and the use of iPSC (inducible Pluripotent Stem Cell) in regenerative medicine.Herein, I provide the first description of Netrin-1 as a regulator of reprogramming and pluripotency. Netrin-1 and its receptors are present in many cell types and are engaged in a variety of cellular processes beyond its initial characterization in the neuronal system. In the first part, I contributed to explore how Netrin-1 prevents apoptosis mediated by its dependence receptor DCC (Deleted in Colon Carcinoma) during reprogramming. In the second part, I dissected the functions and regulation of this pathway in pluripotency maintenance and in lineage commitment
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Mabrok, Hoda Hussein Bakr. "Protective role of lignan-converting bacteria on chemically-induced breast cancer in gnotobiotic rats." Phd thesis, Universität Potsdam, 2013. http://opus.kobv.de/ubp/volltexte/2013/6493/.

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Abstract:
Enterolignans (enterodiol and enterolactone) exhibit structural similarity to estradiol and have therefore been hypothesized to modulate hormone related cancers such as breast cancer. The bioactivation of the plant lignan secoisolariciresinol diglucoside (SDG) requires the transformation by intestinal bacteria including the deglycosylation of SDG to secoisolariciresinol (SECO) followed by demethylation and dehydroxylation of SECO to enterodiol (ED). Finally, ED is dehydrogenated to enterolactone (EL). It is unclear whether the bacterial activation of SDG to ED and EL is crucial for the cancer preventing effects of dietary lignans. The possible protective effect of bacterial lignan transformation on a 7,12 dimethylbenz(a)anthracene (DMBA)-induced breast cancer in gnotobiotic rats was investigated. Germ-free rats were associated with a defined lignan-converting consortium (Clostridium saccharogumia, Blautia producta, Eggerthella lenta, and Lactonifactor longoviformis). The rats colonized with lignan-converting bacteria consortium (LCC) were fed a lignan-rich flaxseed diet and breast cancer was chemical induced. Identically treated germ-free rats served as control. All bacteria of the consortium successfully colonized the intestine of the LCC rats. The plant lignan SDG was converted into the enterolignans ED and EL in the LCC rats but not in the germ-free rats. This transformation did not influence cancer incidence but significantly decreased tumor numbers per tumor-bearing rat, and tumor size. Cell proliferation was significantly inhibited and apoptosis was significantly induced in LCC rats. No differences between LCC and control rats were observed in the expression of the genes encoding the estrogen receptors (ERα and ERβ) and G-coupled protein receptor 30 (GPR30). Similar findings were observed for both insulin-like growth factor 1 (IGF-1) and epidermal growth factor receptor (EGFR) genes involved in tumor growth. Proteome analysis revealed that 24 proteins were differentially expressed in tumor tissue from LCC and germ-free. RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1 (RBCK1) and poly(rC)-binding protein 1 (PBCP1) were down-regulated by 3.2- and 2.0-fold, respectively. These proteins are associated with cell proliferation. The activity of selected enzymes involved in the degradation of oxidants in plasma and liver was significantly increased in the LCC rats. However, plasma and liver concentrations of reduced glutathione (non-enzymatic antioxidant) and malondialdehyde (oxidative stress marker) did not differ between the groups. In conclusion, the bacterial conversion of plant lignan to enterolignans beneficially influences their anti-cancer effect. However, the mechanisms involved in these effects remain elusive.<br>Enterolignanen (Enterodiol ED und Enterolacton EL) wird aufgrund ihrer strukturellen Ähnlichkeit zu Estradiol ein modulierender Einfluss auf hormonell bedingte Krebserkrankungen wie Brustkrebs nachgesagt. Das pflanzliche Lignan Secoisolariciresinoldiglucosid (SDG) wird durch Darmbakterien zum Enterolignan aktiviert. Dies erfolgt über dessen Deglykosylierung zu Secoisolariciresinol (SECO) gefolgt durch die Demethylierung und die Dehydroxylierung zu Enterodiol (ED). Schließlich wird ED zu Enterolacton (EL) dehydrogeniert. Es ist allerdings noch nicht bewiesen, dass die bakterielle Aktivierung von SDG zu ED und EL für die antikanzerogenen Wirkungen verantwortlich ist, die für dieses in der menschlichen Ernährung vorkommende Lignan beschrieben wurden. Um dies zu klären, wurde der Einfluss der bakteriellen Lignan-Transformation auf die Protektion gegenüber einem durch 7,12-Dimethylbenz(a)anthracen (DMBA)-induzierten Brustkrebs im gnotobiotischen Rattenmodell untersucht. Keimfreie Ratten wurden hierfür mit einem Konsortium aus vier Bakterienstämmen (Clostridium saccharogumia, Blautia producta, Eggerthella lenta, und Lactonifactor longoviformis) besiedelt, das die Umsetzung von SDG zu ED und EL katalysiert (LCC-Ratten). Ratten, die über den gesamten Versuchszeitraum keimfrei blieben, dienten als Kontrolle. Die Tiere wurden über 16 Wochen mit einer Leinsamen-Diät gefüttert, die reich an pflanzlichen Lignanen war. Während der Fütterung wurde bei allen Tieren Brustkrebs chemisch induziert. Das pflanzliche Lignan SDG wurde nur in den LCC Ratten zu den Enterolignanen ED und EL umgewandelt. Keimfreie Ratten zeigten keine Transformation von SDG. Die bakterielle Transformation von SDG hatte zwar keinen Einfluss auf die Inzidenz von Brustkrebs, jedoch verringerten sich durch die Besiedlung der Ratten mit SDG-transformierenden Bakterien die Anzahl von Tumoren pro tumortragender Ratte und die Tumorgröße deutlich. Zudem wurde die Zellproliferation in den LCC-Ratten deutlich gehemmt und die Apoptose induziert. Unterschiede in der Genexpression der Östrogenrezeptoren (ERα und ERß) und G-Protein-gekoppelte Rezeptoren (GPR30) wurden zwischen den LCC-Ratten und den Kontrolltieren nicht beobachtet. Ebenso verhielt es sich für die Gene des Insulinähnliche Wachstumsfaktoren 1 (IGF-1) und Epidermale Wachstumsfaktor rezeptoren (EGFR), welche in das Tumorwachstum involviert sind. Die Analyse des Proteoms des Tumorgewebes ergab 24 differentiell exprimierte Proteine zwischen keimfreien und LCC-Ratten. So wurden zum Beispiel die Proteine RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1 (RBCK1) und poly(rC)-binding protein 1 (PBCP1), die mit der Zellproliferation assoziiert sind, in LCC-Ratten um das 3,2 bzw. 2,0-fache herunterreguliert. Die Aktivität ausgewählter antioxidativer Enzyme in Plasma und Leber war in den LCC-Ratten im Vergleich zu den keimfreien Tieren deutlich erhöht. Allerdings unterschieden sich die Konzentrationen von reduziertem Glutathion (nichtenzymatisches Antioxidans) und Malondialdehyd (oxidativer Stress-Marker) in Plasma und Leber nicht zwischen den beiden Besiedlungs-Gruppen. Zusammenfassend zeigen die Ergebnisse, dass die bakterielle Umwandlung von pflanzlichen Lignanen zu Enterolignanen deren antikanzerogene Wirkung entscheidend beeinflusst. Allerdings bleiben die zugrunde liegenden Mechanismen weiterhin ungeklärt.
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Peulve, Pascal. "Inhibition de la croissance, in vitro, des cellules hématopoïétiques humaines par les surnageants de cultures de la lignée Raji." Rouen, 1987. http://www.theses.fr/1987ROUES022.

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Abstract:
Les surnageants de cultures de la lignée lymphoblastique humaine Raji, contiennent au moins un facteur capable d'inhiber in vitro la croissance des cellules hématopoïétiques de type granulocytaire, monocytaire, érythrocytaire et lymphoïde. Ce facteur est labile a 56°C pendant 30 minutes et précipitable au sulfate d'ammonium a 80% de saturation. Il ne semble pas être cytotoxique pour les cellules et est différent de l'interféron, des pustaglandines, ou d'une molécule de type prostaglandine. Ce facteur semble agir sur les progéniteurs hématopoïétiques les plus immatures. La présence de sérums humains dans les cultures, permet de "supprimer" partiellement l'inhibition de croissance produite par le facteur
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Poulain, Marine. "Développement de la lignée germinale femelle humaine." Thesis, Paris 11, 2014. http://www.theses.fr/2014PA11T056/document.

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Abstract:
La mise en place de la lignée germinale au cours du développement constitue une des étapes fondamentales conditionnant la fertilité de l’individu adulte. Au cours des dernières décennies, le nombre croissant de couples consultant pour une aide médicale à la procréation a fait émerger l’hypothèse d’une altération des fonctions de reproduction chez l’Homme qui pourrait trouver son origine dans la perturbation du développement précoce. Dans l’ovaire fœtal, les cellules germinales s’orienteront vers la voie de l’ovogénèse, caractérisée entre autres par l’entrée en méiose de ces cellules. La majorité des données actuelles relatives à ces évènements sont issues du modèle murin alors que le développement de l’ovaire humain est significativement diffèrent de celui de la souris. Il est donc nécessaire d’approfondir nos connaissances du développement ovarien humain et d’identifier ses éventuelles perturbations. L’objectif de mon travail a été de mettre au point un outil d’étude du développement ovarien et d’identifier de nouvelles voies impliquées dans la régulation de l’entrée en méiose des cellules germinales fœtales humaines et leurs perturbations éventuelles.Nous avons mis au point un nouveau modèle de xénogreffe d’ovaires fœtaux humains du premier trimestre de gestation (au moment de l’apparition des premières cellules méiotiques). Ce modèle nous a permis d’observer un développement de l’organe et une différenciation des cellules germinales similaires à ceux observés in vivo. Ce modèle permettra des travaux à des âges auxquels le matériel d’étude est peu accessible. En couplant ce modèle de xénogreffe à une stratégie d’ARN-interférence, il nous a été possible d’inhiber l’expression d’un gène spécifiquement exprimé dans les cellules germinales ovariennes, DMRTA2, et de mettre en évidence un potentiel rôle de ce gène dans leur différenciation pré-méiotique. Nous avons observé une diminution du nombre de cellules ayant initié la méiose après inhibition de l’expression de ce gène. Par ailleurs, nous avons également identifié la présence dans l’ovaire fœtal de nombreux marqueurs décrits comme testiculaires chez la souris (PLZF, DNMT3L, FGF9, NANOS2 ou CYP26B1). L’expression de ces marqueurs pourrait expliquer la présence de cellules mitotiques tardives dans l’ovaire fœtal humain que nous avons pu observer jusqu’à 30 semaines de gestation. En parallèle de ces travaux, nous avons testé la sensibilité des cellules germinales à la dexaméthasone, glucocorticoïde pouvant être administré au cours de la grossesse. Il a été observé une augmentation de l’expression de PLZF, gène cible de l’activation des récepteurs aux glucocorticoïdes, pouvant expliquer la diminution du nombre de cellules germinales.En conclusion, ce travail de thèse a permis d’identifier un nouveau gène potentiellement régulateur de la transition mitose/méiose dans l’ovaire humain, et d’affiner nos connaissances sur le développement de l’ovaire humain et l’entrée en méiose des cellules germinales. Toutefois, de nombreuses questions restent posées ainsi de futures études devront clarifier si les cellules germinales mitotiques observées à des stades tardifs sont capables de se différencier en ovocytes compétents<br>Woman fertility is partially dictated by the set up of the human female germ line. During the last ten years, which saw an increased number of couples consulting for assisted reproductive cares, the hypothesis of an early alteration in reproduction functions has emerged.In the fetal ovary, germ cells enter the path of oogenesis differentiation characterized by meiotic initiation. On this subject, vast majority of the scientific data are obtained from the mouse model, even if differences with human ovarian physiology are widely acknowledged. Therefore it is necessary to extend our knowledge on human ovarian development and identify its perturbations. The objective of my work was to assess a new model to study ovarian growth, studying regulation of meiotic entry and perturbation of germ line differentiation.We sat up a new xenograft model of early human fetal ovaries, when very early meiotic germ cells appear. Organ growth and germ cells differentiation were comparable with in vivo observations. Using this model with an RNA-interference strategy, we inhibited the expression of an oogonia germ cell gene, DMRTA2. This inhibition conducted to a significantly reduced number of germ cells gene that initiated meiosis and DMRTA2 seemed to be required for mitotic-meiotic transition. In another hand, we identified, in the ovary, the expression of germ cells markers described as specifically male in rodent (PLZF, DNMT3L, FGF9, NANOS2 ou CYP26B1). The expression of these markers in the human ovary could explain the observation of mitotic germ cells in late fetal ovaries (30 wpf).In parallel, we tested germ cells sensibility to a synthetic glucocorticoid, dexamethasone, administrated during pregnancy in some justified pathologies. We observed an increased expression of PLZF that could explain the decreased number of germ cells observed in treated ovaries.In conclusion, we identified a new gene expressed in human fetal ovaries, potentially involved in the meiotic entry, and we extended our knowledge to characterized human germ line development. However, many points have to be clarified, as the possible competence of late mitotic germ cells to form oocytes
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Valentin, Guillaume. "Chemokine receptors orchestrate collective cell migration in the zebrafish lateral line." Montpellier 2, 2009. http://www.theses.fr/2009MON20014.

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Abstract:
La migration cellulaire est un mécanisme fondamental pour le développement et la survie des organismes pluricellulaires. Le primordium de la ligne latérale est un groupe composé d'environ 100 cellules et dont la migration est guidée par la voie de signalisation Cxcr4b-SDF1a. Nous avons identifié le premier mutant pour la chimiokine, SDF1a. L'analyse de la migration du primordium dans ce mutant nous a permis de découvrir le rôle d'un nouveau récepteur à SDF1a, Cxcr7, qui est essentiel à l'arrière du primordium pour induire sa migration. Ensuite, nous avons démontré que Cxcr7 et Cxcr4b agissaient indépendamment dans des domaines distincts du primordium. Dans la seconde partie de cette thèse, nous avons créé une lignée transgénique Cxcr4b-GFP. Nous avons montré que l'expression du transgène correspondait à celle du gène endogène et sauvait le défaut de migration d'un mutant Cxcr4b. De plus, la relation entre la localisation et l'activation de Cxcr4b nous a permis d'identifier l'existence d'une activation différentielle du récepteur au sein du primordium (plus forte à l'avant qu'à l'arrière). Étonnamment, l'activation de Cxcr4b dans les cellules guidant la migration augmente leur dynamique et par conséquent leurs capacités migratoires<br>Tissue migration is a collective behaviour that plays a key role in the formation of many organ systems. The zebrafish lateral-line primordium is a cohesive cohort of over 100 cells that is guided through Cxcr4b-SDF1a signalling. Here, we present the first mutant in zebrafish SDF1a. Analysis of primordium migration in this mutant uncovers the role a new SDF1a chemokine receptor Cxcr7, whose expression and function is restricted to cells behind the leading edge. We also presented evidence that Cxcr4b and Cxcr7 act independently in spatially distinct domains to regulate tissue migration. In the second part of the thesis, we generate a Cxcr4b-GFP transgenic line. We showed that Cxcr4b-GFP fusion mimics endogenous expression of Cxcr4b, and rescues primordium migration of a Cxcr4b mutant. Interdependence between Cxcr4b localization and its signalling activity led us to identify a differential activation of Cxcr4 across the tissue (higher at the front than at the back). Surprisingly, we showed that active Cxcr4b-SDF1a signalling at the leading edge increases protrusive activity, and so enhances cell motility
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Couteaudier, Mathilde. "Réplication, dissémination et morphogénèse du virus de la maladie de Marek en cellules différenciées vers le lignage peau." Thesis, Tours, 2015. http://www.theses.fr/2015TOUR4018/document.

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Abstract:
Le virus de la maladie de Marek (MDV) est un alpha-herpesvirus responsable de lymphomes T mortels chez la poule. La peau et en particulier le follicule plumeux est considéré comme le seul site de production de particules virales extracellulaires et est à l'origine de la dissémination horizontale du virus et de la contamination de l'environnement. Cependant, aucun système cellulaire ne permet de reproduire ce qui se passe dans ce tissu. Le but de ma thèse a donc été de développer de nouveaux systèmes de culture permettant de reproduire la réplication, la morphogenèse et l’excrétion décrites in vivo. Pour cela, j’ai développé deux systèmes, des explants de peau d’embryons de poulet cultivés ex vivo et des kératinocytes obtenus par différenciation de cellules souches embryonnaires de poule. J’ai également montré la permissivité au MDV de ces deux modèles de peau puis y ai étudié la réplication et la morphogénèse virale. Ces modèles permettront la recherche des déterminants viraux et cellulaires impliqués dans la production de virions extracellulaires et leur dissémination<br>Marek's disease (MD) is a highly contagious virus-induced lymphoma in chicken, caused by an alphaherpesvirus named Marek’s disease virus (MDV). The skin and especially, the feather follicle is the only tissue known to produce infectious cell-free virions and is responsible for the shedding of MDV into the environment and transmission between birds. However, no cell culture system actually reproduces this process ex vivo. Herein my thesis aim was to develop new culture systems to reproduce the efficient MDV replication, morphogenesis and shedding from the feather follicle. For that, I developed two systems, skin explants derived from embryos cultivated ex vivo and keratinocytes obtained by differentiation of chicken embryonic stem cells. I also showed that these two models were permissive to MDV infection and I studied in each one MDV replication and morphogenesis. These models will allow the search of viral and cellular determinants involved in the production of extracellular virions and shedding
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Awad, Keytam Salem. "Inhibition of human papilloma virus E6 oncogene function by mammalian lignans activates the p53 tumor suppressor protein and induces apoptosis in cervical cancer cells." [Kent, Ohio] : Kent State University, 2007. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc%5Fnum=kent1183405761.

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Abstract:
Thesis (Ph.D.)--Kent State University, 2007.<br>Title from PDF t.p. (viewed July 8, 2009). Advisor: Angelo L. DeLucia. Keywords: human papilloma virus, mammalian lignans, p53, E6 oncogene. Includes bibliographical references (p. 133-149).
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Rols, Marie-Pierre. "Electropermeabilisation de cellules animales : approche biophysiochimique des mecanismes dans le cas des cellules de la lignee cho." Toulouse 3, 1989. http://www.theses.fr/1989TOU30005.

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Abstract:
L'application de champs electriques intenses a des cellules conduit a une permeabilisation transitoire de leur membrane plasmique (electropermeabilisation). L'etude des parametres physiques dans la creation du phenomene (amplitude, duree et nombre des impulsions) montre que l'electropermeabilisation se decompose en deux phases de creation et d'expansion des structures responsables de la permeation. L'etape de creation a lieu des que l'intensite du champ electrique devient superieure a un seuil. L'etape d'expansion est fonction unique du nombre et de la duree des impulsions; elle est controlee par les forces structurales responsables des forces repulsives d'hydratation intermembranaires. L'etat permeable est associe a une reorganisation des phospholipides membranaires qui entraine une diminution des forces d'hybridation. Cette nouvelle organisation permet d'expliquer le caractere fusogene des cellules electropermeabilisees
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Teixeira-Lebrun, Gorette. "Hématopoièse humaine : effet d'un glycosaminoglycane, l'acide hyaluronique ou hyaluronan sur la différenciation des progéniteurs du sang périphérique." Rouen, 1994. http://www.theses.fr/1994ROUES075.

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Abstract:
Notre étude a consisté à analyser les effets d'un glycosaminoglycane l'acide hyaluronique sur l'hématopoièse humaine. En effet, le rôle de AH reste peu étudié. La population des progéniteurs du sang a été caractérisé dans une première partie. Le CD34 est indétectable (marqueur des cellules souches/progéniteurs) (0. 2%+/-0. 2% ; n=17) alors que son taux atteint 2. 2+/-2. 1 (n=25) dans 25 échantillons de cytaphérèses (différence significative, p=0. 001). Les deux paramètres: pourcentage CD34 et colonies GM (178+/-133) sont corrélés positivement (r=0. 81). Ceci est important pour évaluer le nombre de progéniteurs dans les échantillons de cytaphérèses et décider donc l'arrêt des recueils. Différentes préparations de AH de cordon, de crête de coq, de streptocoque ont été ajoutées à plusieurs concentrations à des cultures clonogéniques de progéniteurs du sang. Le résultat était une faible dimunition des colonies BFU-E à 100 microgrammes/ml (79% p/r contrôle) (*p=0. 05, Wilcoxon). Une liaison de AH avec l'IL3 a été mise en évidence par un test affinoenzymatique et à l'aide de deux lignées humaines IL3 dépendentes (UT7 et TF1). Cette liaison semble faible et pourrait être due à la nature polyanionique de AH. Il est utile de vérifier que la fraction de la cytokine liée reste active
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Daubie, Valéry. "Les sérines protéases de la coagulation et leurs récepteurs "proteases-activated receptors": étude analytique de leur signalisation calcium dans une lignée endothéliale et les ostéoblastes." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2008. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210560.

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Abstract:
Des résultats d’expériences cliniques de reconstruction de l’os maxillaire faites à partir de la greffe d’une "pâte osseuse" gélifiée par l’ajout de facteur tissulaire ont été le primum movens de ce travail. Cette "pâte osseuse", faite d’os en poudre et de plasma enrichi en plaquette (PRP) à laquelle on ajoute du facteur tissulaire, est un modèle à la fois de la coagulation et de la régénération osseuse.<p>Pour analyser des effets de la coagulation, nous avons utilisé un modèle connu :la culture primaire de cellules endothéliales (HUVEC). Les effets in vitro des facteurs de coagulation, dénommés protéases de la coagulation, pris séparément, ont été bien étudiés dans ces cellules, néanmoins aucune information sur l’effet combiné de ces protéases ou du plasma en coagulation n’était connue. Nous avons mesuré la "signalisation calcium" comme réponse cellulaire aux différents agents et ces mesures de la signalisation calcium ont été complétées par la mesure d’une autre réponse biologique, à savoir la sécrétion de cytokines pro-inflammatoires (IL-6 et IL-8). Pour l’étude de la régénération osseuse, la signalisation calcium a été mesurée sur une lignée d’ostéosarcomes humains (SaOS-2), stimulée par des protéases de la voie extrinsèque de la coagulation (facteur VIIa, facteur Xa et thrombine). Comme réponse biologique complémentaire, nous avons évalué l’effet des protéases d’intérêt sur l’apoptose induite par l’absence de sérum dans le milieu de culture.<p>\<br>Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques<br>info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Laurent, Marc. "Rôle des G-quadruplexes dans la spécification des origines de la réplication chez les vertébrés." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2016. http://www.theses.fr/2016USPCC162/document.

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Abstract:
Les origines de réplication sont les sites à travers le génome où est initiée la synthèse de l’ADN. Les multiples cartographies des origines de réplication dans des cellules de vertébrés ont identifié une association entre origines de réplication et motifs G4. Les motifs G4 sont des séquences ayant le potentiel de se replier en G-quadruplexe. Des travaux menés précédemment au laboratoire ont montré que la capacité d’un motif G4 à se replier en G-quadruplexe est essentielle pour l’activité de deux origines de réplication modèles dans la lignée cellulaire de poulet DT40. Cependant, le motif G4 n’est pas suffisant pour spécifier une origine de réplication. Dans l’origine modèle βA, un élément cis de 227 pben 3’ du motif G4 est également nécessaire pour l’initiation de la réplication. L’analyse de la séquence de cet élément indique qu’il comporte plusieurs motifs connus pour être des sites de fixation de facteurs de transcription. Nous avons testé le rôle potentiel de ces motifs en évaluant l’effet de leurs délétions individuelles sur l’activité de l’origine βA. Ces travaux ont identifié les boites TATA et CCAAT, pouvant être liées par le facteur TBP (TATA Binding Protein) et NFY (Nuclear Factor Y) respectivement, comme étant les éléments cruciaux avec le motif G4 pour l’initiation de la réplication. Nous avons cherché à éclaircir de quelle manière ces éléments permettent la spécification d’une origine de réplication. A cet effet, nous avons émis l’hypothèse selon laquelle les motifs G4 qui se trouvent au niveau des origines de réplication sont ceux qui in vivo sont capables de former un G-quadruplexe. La formation du G-quadruplex dans l’origine βA dépendrait alors de la présence des boites TATA et CCAAT qui peuvent recruter des facteurs de transcription favorisant l’ouverture de la double hélice de l’ADN et le repliement du G-quadruplex. Cette hypothèse prévoit que la stabilisation d’un G-quadruplexe in vivo est nécessaire et suffisante pour former une nouvelle origine de réplication. Nous avons donc testé cette hypothèse de deux manières. D’abord, nous avons entrepris de stabiliser un G-quadruplex à une position donnée du génome en induisant la transcription d’un motif G4. Ensuite, nous avons déterminé les effets d’une stabilisation globale des G-quadruplexes à travers le génome sur la position des origines de réplication. Pour cela, nous avons cartographié les origines de réplication dans des lignées de cellules DT40 dans lesquelles des facteurs impliqués dans la linéarisation des G-quadruplexes ont été inactivés. Selon notre hypothèse, en l’absence de tels facteurs, comme l’hélicase FancJ ou l’ADN polymérase translésionnelle Rev1, davantage de motifs G4 pourraient se replier et former une origine de réplication. Les résultats obtenus avec chacune des deux approches indiquent que la stabilisation de G-quadruplexes ne permet pas de produire de nouvelles origines de réplication. L’ensemble de nos données indique que l’activité de l’origine βA dépend d’un motif G4 et des boites TATA et CCAAT. La manière par laquelle l’ensemble de ces éléments permettent l’initiation de la réplication reste à éclaircir<br>Replication origins are the position where DNA synthesis is initiated. Mapping of replication origins across the genome showed a link between origins and G4 motifs. G4 motifs are sequences the potential for forming G-quadruplexes. Works carried out previously in the laboratory showed that the ability to fold into G-quadruplex is critical for the activity of two model origin in the DT40 cell line. However, the G4 motif is not enough to specify a replication origin. In the βA model origin, a 227 bp cis element is required for the initiation of replication. The analysis of this sequence indicates the presence of several motifs known to be binding sites for transcription factors. We tested the potential roles of these motifs by evaluating the effect of their individual deletion on the activity of the βA origin. This work identified the TATA and CCAAT boxes who bind TBP (TATA Binding Protein) and NFY (Nuclear Factor Y) respectively as the crucial elements, with the G4 motifs, pour the initiation of replication.We endeavored to shed light on the manner by which these elements enable the specification of a replication origin. We hypothesized that the G4 motifs associated with replication origins are those able to form a G-quadruplex in vivo. The formation of the G-quadruplex of the βA origin would require the presence of the TATA and CCAAT boxes who could recruit transcription factors facilitating the opening of the double helix and G-quadruplex folding. We tested this hypothesis by two different manners. First, we undertook to stabilize a G-quadruplex at a given position in the genome by inducing the transcription of a G4 motif. Then, we observed the effects of a genome wide stabilization of G-quadruplexes on the position of replication origins. For that, we mapped replication origins in DT40 cell lines in which factors implicated in G-quadruplex linearization are inactivated. According to our hypothesis, without such factors, like the FancJ helicase of the translesional DNA polymerase Rev1, more G4 motifs could fold into G-quaduplexes and specify replication origins
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Makarchuk, Stanislaw. "Measurement of cell adhesion forces by holographic microscopy." Thesis, Strasbourg, 2016. http://www.theses.fr/2016STRAE034/document.

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Abstract:
Les forces mécaniques, générées par la cellule jouent un rôle crucial dans l'adhésion cellulaire, qui est un processus commun à un grand nombre de lignées cellulaires. Afin de mesurer la champ des forces pendant l'adhérence cellulaire, nous utilisons la microscopie de force de traction, où la cellule adhère à la surface plane d'un substrat souple dans le plan. Les forces sont calculées à partir du champ de déplacement mesuré à l'intérieur du substrat sous la cellule. Nous avons construit le microscope, dans lequel nous utilisons des billes sphériques en polystyrène pour mesurer le champ de déplacement. Les positions des marqueurs sont obtenues en analysant I' image interférentielle des particules. Avec cette technique, nous atteignons une précision nanométrique sur le champ de déplacement des particules, ce qui nous permet d'améliorer la résolution en force de ce type de microscope. Les premières mesures ont été effectuées avec la lignée de cellules cancéreuses SW 480<br>Mechanical forces, generated by the cell plays crucial role in cell adhesion - common process for different cell lines. ln order to measure the force map during cellular adhesion, we use Traction Force Microscopy (TFM), where cell adheres to the soft substrate in 20 plane, and the forces are calculated from measured displacement field inside the substrate underneath the cell. We built the microscope, where instead of using fluorescent markers, we use spherical polystyrene beads in order to measure the displacement field. Positions of the markers are obtained by analyzing the interference pattern caused by the beads in bright-field light. With this technique, we reach nanometer accuracy of the microsphere position determination, that, respectively, influence accuracy of the calculated force field. With the microscope first measurements were performed with cancer cell line SW 480
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Bensaadi, Nacira. "Differenciation cellulaire de la lignee cancereuse pancreatique humaine capan-1 : modulations enzymatiques dans les cellules traitees par des agents differenciant dans differentes conditions de culture." Toulouse 3, 1988. http://www.theses.fr/1988TOU30181.

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Awad, Keytam Salem. "INHIBITON OF HUMAN PAPILLOMA VIRUS E6 ONCOGENE FUNCTION BY MAMMALIAN LIGNANS ACTIVATES THE P53 TUMOR SUPPRESSOR PROTEIN AND INDUCES APOPTOSIS IN CERVICAL CANCER CELLS." Kent State University / OhioLINK, 2007. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=kent1183405761.

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Marchalot, Anne. "Analyse exploratoire des thérapies antisens innovantes dans le traitement des syndromes lymphoprolifératifs et autres maladies impliquant la lignée lymphoïde B." Thesis, Limoges, 2020. http://www.theses.fr/2020LIMO0030.

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Abstract:
Les oligonucléotides antisens (ASO) peuvent être utilisés pour diriger certaines étapes de la maturation des ARN comme l’épissage et la polyadénylation afin de moduler l’expression génique. Durant le développement des cellules de la lignée lymphoïde B, la maturation des transcrits d’immunoglobulines (Ig) fait intervenir des mécanismes d’épissage et de polyadénylation alternatifs. Mes travaux de thèse ont montré que les ASO peuvent être utilisés pour découpler les deux étapes interconnectées que sont l’épissage et la transcription des transcrits germinaux (GLT) des Ig afin d’étudier l’impact de l’épissage seul sur la commutation de classe d’Ig. Le dépôt du brevet n°EP19305716.3 m’a également permis de faire une preuve de concept dans l’utilisation des ASO pour influencer la polyadénylation d’un isotype spécifique d’Ig en ciblant les sites de polyadénylation (PAS) alternatifs responsables de la production d’Ig membranaire ou sécrétée. En effet, cibler le PAS utilisé pour le transcrit de l’IgE sécrétée avec un ASO a permis de réduire la sécrétion d’IgE et pourrait constituer une nouvelle piste thérapeutique dans les allergies IgE dépendantes. Enfin, j’ai développé une méthode de knock down par oligonucléotide modulant l’épissage (SSO) qui induit un saut d’exon lors de l’épissage et l’apparition d’un transcrit alternatif portant un décalage du cadre de lecture et un codon stop prématuré. Cette méthode permettrait de cibler de nombreux gènes exprimés dans les cellules eucaryotes comme la cellule B ou le plasmocyte.En dépit de leurs limitations en termes de biodistribution, les ASO constituent des pistes innovantes pour le développement de nouvelles thérapies contre les maladies impliquant la lignée lymphoïde B ou les lymphoproliférations<br>Antisense oligonucleotides (ASO) can be used to direct some steps in mRNA maturation as splicing and polyadenylation in order to modulate gene expression. During lymphoid B-lineage development, maturation of immunoglobulin (Ig) transcripts involves alternative splicing and polyadenylation mechanisms. My thesis work has shown that ASO can be used to dissociate the two interconnected steps of transcription and splicing in order to study the sole impact of splicing of Ig germinal transcripts (GLT) during Ig class switch recombination. The submission of patent n°EP19305716.3 also allowed me to make a proof of concept for ASO usage to influence the polyadenylation of a specific Ig isotype by targeting the alternative polyadenylation sites (PAS) responsible for the production of membrane or secreted Ig. In fact, targeting the PAS used for the secreted IgE transcript with an ASO has made it possible to reduce IgE secretion and could be a new therapeutic strategy in IgE-dependent allergies. Finally, I developped a knock down method using splice switching oligonucleotide (SSO) that induces exon skipping during splicing and the appearance of alternative transcripts carrying a reading frameshift and a premature stop codon. This method could be used to target many genes expressed in eukaryotic cells, like B or plasma cells.Despite their limitations in terms of biodistribution, ASOs constitute innovative avenues for the development of new therapies against B lineage related diseases and lymphoproliferations
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Lamotte, Damien. "Production et glycosylation de l'interféron-gamma humain par des cellules CHO cultivées en bioréacteurs discontinus et perfusés : influence des conditions opératoires et du potentiel de glycosylation des cellules." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1997. http://www.theses.fr/1997INPL061N.

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Abstract:
L’objectif général de ce travail est l'étude de la production et de la glycosylation de l'interféron-gamma humain recombinant (IFN) exprimé par différentes lignées de cellules animales CHO (Chinese Hamster Ovary) cultivées en bioréacteurs discontinus et perfusés. La première partie traite de l'influence de l'intégration du gène de l'[alpha]2,6-sialyltransferase ([alpha]2,6-ST) dans une lignée CHO produisant l'IFN sur les cinétiques de cultures en réacteurs discontinus (croissance cellulaire, consommation des nutriments et production d'IFN), et sur l'état de glycosylation de la glycoprotéine produite. La modification de la cellule permet d'accroitre la sialylation globale de l'IFN et de lier des acides sialiques en position [alpha]2,6 sans compromettre les capacités de croissance et de production de la cellule. La deuxième partie concerne l'influence de certains composants du milieu de culture lors de cultures discontinues. Le sérum de veau fœtal (10%) augmente les concentrations maximales en cellules et en IFN, mais altère dramatiquement la structure polypeptique et glycannique de l'IFN. L'ajout de butyrate de sodium (1 mM) en cours de phase de croissance augmente fortement la production d'IFN. De plus, lors de la culture de la lignée modifiée pour l'expression de l'[alpha]2,6-ST, le butyrate accroit la sialylation totale ainsi que le pourcentage d'acides sialiques lies en position [alpha]2,6. La troisième partie étudie la possibilité de produire l'IFN dans un réacteur perfusé muni d'un décanteur cellulaire interne. Cette configuration permet la rétention totale des cellules et la production d'IFN pendant plus de 1000 heures. La densité cellulaire et la production volumique d'IFN sont respectivement 3 et 8 fois plus importantes qu'en culture discontinue. Ce mode perfusé présente également l'avantage, par rapport au mode discontinu, de stabiliser l'hétérogénéité de la glycosylation de l'IFN.
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Zhang, Yu. "Mise en place de la réticulation des parois de maïs au cours du développement et impact sur la variabilité de la dégradabilité des polysaccharides pariétaux." Phd thesis, AgroParisTech, 2012. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00951436.

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Abstract:
Le potentiel de valorisation, aussi bien pour l'alimentation animale que pour la production bioénergétique, du maïs est limité par la lignification et la réticulation des parois. L'amélioration de la dégradabilité enzymatique des lignocelluloses est un objectif important. Nous nous sommes attachés dans ce travail à l'étude approfondie de la mise en place de la lignification dans la paroi chez le maïs ainsi qu'aux facteurs biochimiques et anatomiques pariétaux qui peuvent avoir un impact sur la dégradabilité des parois. Dans la première partie de ma thèse, 8 lignées recombinantes de maïs ont été sélectionnées sur la base d'une teneur en lignine comparable pour évaluer l'impact des facteurs biochimiques sur la dégradabilité des parois et sur les performances agronomiques des maïs. Ces lignées recombinantes et leurs parents ont été analysés biochimiquement de façon approfondie. Le rendement β-O-4 au sein des lignines et la teneur en acide p-coumarique estérifié sont les deux facteurs les plus corrélés négativement et significativement à la dégradabilité des parois. Une analyse par régression multiple a montré que plus de 80% des variations de la dégradabilité de paroi, dans ces dix lignées, sont expliqués par un modèle retenant comme meilleurs régresseurs la teneur en lignines combinée au pourcentage d'unité S acylées par l'acide p-coumarique. L'étude morphologique que nous avons réalisée nous a montré que les facteurs biochimiques limitant la dégradabilité de paroi peuvent par contre s'avérer favorables pour assurer la performance agronomique de la plante via des mécanismes de plasticité pariétale. Cependant et de façon très encourageante, nous avons aussi montré qu'il était tout à fait possible de retenir du matériel amélioré en termes de qualité de paroi et qui conservait de bonnes performances agronomiques. Dans la deuxième partie de ma thèse, nous avons étudié le schéma de mise en place des parois au cours du développement des plantes pour des lignées présentant des teneurs en lignine comparables au stade ensilage mais des dégradabilités de parois contrastées. Nous avons caractérisé biochimiquement les entrenoeuds au cours du développement. En parallèle, nous avons développé une méthode de quantification de la variation de distribution spatiale des lignines au long de la coupe afin de compléter notre étude au cours du développement par une caractérisation histologique détaillée. D'un point de vue temporel, les différentes composantes pariétales sont incorporées graduellement, en fonction du stade de développement. Trois étapes majeures de développement ont été identifiées. D'un point de vue spatial, au sein de l'entrenoeud, le développement des parois est différent selon les régions. Une importante variabilité génétique a été observée pour le développement sur ces deux axes et ces variations sont associées à la variation de la dégradabilité de paroi. L'ensemble des résultats de ce travail est discuté d'une part en termes de contribution à la compréhension de la lignification des parois ainsi qu'à l'impact des différents facteurs biochimiques et histologiques sur la dégradabilité et d'autre part en termes d'application afin de proposer des solutions pour améliorer de la qualité des parois.
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Benmouna, Amel. "Gestion énergétique reconfigurable d'un véhicule électrique basée sur l'identification en ligne des sources embarquées." Thesis, Bourgogne Franche-Comté, 2019. http://www.theses.fr/2019UBFCA020.

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Abstract:
Ce sujet de thèse porte sur l’étude de la gestion énergétique reconfigurable d’un véhicule électrique basée sur l’identification en ligne des sources embarquées. Ces dernières années, la gestion d’énergie d’un système hybride pour les applications automobiles a fait l’objet d’un grand nombre de travaux de recherche. Dans cette étude, la chaine énergétique considérée se constitue d’une pile à combustible comme source principale, de sources de stockage à savoir les batteries et/ou les supercondensateurs, de convertisseurs pour chaque source et enfin d’une charge émulant la demande en puissance. En effet, le problème qui se pose dans les systèmes hybrides est de trouver une stratégie permettant une meilleure répartition de la puissance électrique entre les différentes sources embarquées, ce qui constitue l’apport de ce travail de recherche. Ainsi que de définir des lois de gestion énergétique en considérant des mesures faites en temps réel dans le but d’augmenter la durée de vie et la fiabilité des sources d’une part, et la disponibilité du véhicule électrique d’autre part. Dans ce travail de thèse, le contrôle non linéaire nommé IDA-PBC (Interconnection and Damping assignment-Passivity Based Control) est utilisé avec la structure PCH (Port Controlled Hamiltonian) qui permet de présenter des propriétés structurelles du système à savoir l'énergie totale du système, l'amortissement et les interconnexions d'états. La méthode IDA-PBC est une technique non linéaire puissante, elle est considérée comme un moyen général pour stabiliser une grande classe de systèmes physiques. Dans une seconde partie de ce travail, une stratégie de gestion de l'énergie optimale est proposée pour le système hybride étudié qui est la combinaison entre l’IDA-PBC et la méthode d’Hamiltonian Jacobi Bellman. La preuve de stabilité est donnée et l'efficacité de la stratégie proposée est démontrée. Plusieurs validations expérimentales valident ce travail<br>This thesis deals with the study of the reconfigurable energy management of an electric vehicle based on the online identification of embedded sources. In recent years, the energy management of a hybrid system for automotive applications has been the subject of a great number of research. In this study, the energy chain considered consists of a fuel cell as the main source, storage sources such as batteries and/or supercapacitors, converters for each source and finally a load emulating the power demand. Indeed, the problem in hybrid systems is to find a strategy for a better distribution of electrical power between the different embedded sources, which is the added value of this research work. As well as defining energy management laws by considering real-time measurements in order to increase the lifespan and reliability of sources on the one hand, and the availability of the electric vehicle on the other hand. In this thesis, the nonlinear control called IDA-PBC (Interconnection and Damping assignment-Passivity Based Control) is used with the PCH (Port Controlled Hamiltonian) structure which allows to present structural properties of the system namely total system energy, damping and state interconnections. The IDA-PBC method is a powerful nonlinear technique, it is considered as a general means to stabilize a large class of physical systems. In a second part of this work, an optimal energy management strategy is proposed for the hybrid system under study, which is the combination of IDA-PBC and Hamiltonian's Jacobi Bellman method. Proof of stability is provided and the effectiveness of the proposed strategy is demonstrated. Several experimental validations are presented
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Petiot, Emma. "Procédés de cultures de cellules VERO en milieu sans sérum : contributions au développement d'une stratégie PAT." Thesis, Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2009. http://www.theses.fr/2009INPL071N/document.

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Abstract:
Ce travail apporte une contribution au développement de la stratégie PAT pour les procédés de culture de cellules animales. Il propose l'amélioration de la compréhension et de la maîtrise de la culture de cellules Vero, dédiées à la production de vaccins viraux, et cultivées sur microporteurs dans un milieu sans sérum. Une première partie a permis de cribler les effets de certains groupes de composés du milieu de culture par le suivi de la croissance en microplaques. Puis, des études cinétiques et métaboliques plus approfondies, réalisées en spinners, ont montré que le métabolisme carboné des cellules Vero est saturé par l'accumulation intracellulaire de pyruvate et qu’il est peu orienté vers la croissance. Alors que le renouvellement du milieu ou l'ajout ponctuel de glutamine amélioraient la croissance cellulaire sans ré-équilibrer le métabolisme, la substitution du glucose et de la glutamine a permis de réduire l’apoptose et d'améliorer les performances métaboliques et de croissance. Par ailleurs, les spectroscopies diélectrique et proche-infrarouge ont été évaluées pour le contrôle en-ligne du procédé, en prenant en compte les particularités des cellules adhérentes. Nous avons montré leur capacité à évaluer les concentrations de cellules, de composés du milieu, et à détecter l'apoptose. Enfin, les principales améliorations par substitution de la glutamine ont été appliquées en bioréacteurs, à la production d'un vaccin prototype contre la dengue, dans des conditions proches de celles d'un procédé industriel. Ceci a permis de limiter les renouvellements de milieu pendant l’expansion cellulaire, sans compromettre la production de particules virales infectieuses<br>This work contributes to the development of the PAT strategy for animal cell culture processes. The aim of this study was to improve the understanding and the control of Vero cell culture, dedicated to the production of viral vaccines, and grown on microcarriers in serum-free medium. An initial study was performed to screen the effects of certain groups of compounds of the culture medium, by the cell growth monitoring in microplates. Then, kinetic and metabolic studies conducted in spinners flasks allowed to go further and to show that the Vero cell metabolism is saturated through the pyruvate intracellular accumulation and that it is not oriented toward growth. While media renewal or punctual addition of glutamine improve the cell growth without improving the metabolism balance, the substitution of glucose and glutamine allowed to reduce apoptosis and to improve growth and metabolic performances.Furthermore, dielectric and near-infrared spectroscopies have been evaluated for the in-line process monitoring, taking into account the particularities of adherent cells. We have demonstrated their ability to quantify cell concentrations, medium component concentrations, and to detect apoptosis. Finally, major improvements by substitution of glutamine have been applied to bioreactor culture to produce a dengue vaccine prototype, with culture conditions close to industrial process. In these cases, medium renewal during the cell expansion was removed without compromising the production of infectious viral particles
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Denny, Carina. "Atividade anticancer de extratos e principios ativos obtidos de Virola sebifera (Myristicaceae)." [s.n.], 2006. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/289321.

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Orientadores: João Ernesto de Carvalho, Mary Ann Foglio<br>Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba<br>Made available in DSpace on 2018-08-06T02:42:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Denny_Carina_D.pdf: 2044243 bytes, checksum: 37d9912d0a46cbfff8c47cde834817fd (MD5) Previous issue date: 2006<br>Resumo: Modelos de avaliação da citotoxicidade têm proporcionado a obtenção de importantes dados preliminares, ajudando a selecionar extratos de plantas com propriedade antitumoral para estudos futuros. Como parte de um programa de screening de plantas medicinais brasileiras e produtos naturais com propriedades anticâncer, o presente trabalho apresenta a atividade da Virola sebifera (Myristicaceae), uma árvore endêmica do Cerrado brasileiro. O objetivo geral desse trabalho foi avaliar as propriedades in vitro e in vivo de amostras da V. sebifera. além de isolar e identificar seus compostos ativos. O primeiro estudo descreve a atividade antiproliferativa em cultura de células tumorais humanas de duas lignanas e dois policetídeos isolados das folhas da V. sebifera. Assim, reportamos o isolamento e elucidação estrutural de um novo policetídeo 3,5-diidro-2-(l'-oxo-3'-hexadecenil)-2-ciclohexano-l-ona com alta atividade antiproliferativa contra 8 linhagens de células tumorais humanas. No segundo estudo, purificamos a fração ativa (FR4) a partir do extrato bruto diclorometânico, com atividade in vitro (IC50- 5,19-10,57 (xg/mL - ensaio do SRB) pãrã âs mesmas linhagens celulares. Pãrã ãvãliãr ã atividade in vivo da fração ativa utilizamos o ensaio da hollow fiber. Assim, foram estabelecidas as condições de crescimento para as linhagens celulares MCF-7, NCI-ADR e OVCAR03 em fibras (hollow fibers) implantadas no abdômen (i.p.) e no dorso (s.c.) de camundongos imunocompetentes. Os animais foram tratados com FR4 (500mg/kg), doxorubicina (6mg/kg) ou veículo intraperitonealmente. Após 14 dias de tratamento, as fibras foram retiradas, seguindo-se a coloração do MTT para determinação da densidade de células viáveis. A fração FR4 demonstrou efeito significante contra células de mama (MCF-7) e ovário (OVCAR03). A confirmação das propriedades anticâncer in vitro e in vivo da Virola sebifera apresentadas nesse estudo, nos permite avançar em pesquisas futuras, orientando a seleção de outros modelos e estudos de mecanismo de ação<br>Abstract: Cytotoxicity screening models provide important preliminary data to help select plant extracts with potential antitumor properties for future work. As part of a screen program searching for Brazilian medicinal plants and natural products with anticancer properties, the present investigation reports the anticancer activity the Virola sebifera (Myristicaceae), an endemic tree from the Brazilian Cerrado. The overall aim of this work was the evaluation of in vitro and in vivo properties of samples from V. sebifera, there for the isolation and identification of the active compounds. The first study describes the antiproliferative properties against human cell lines of two lignans and two polyketides isolated from leaves of V. sebifera. Herein we report the isolation and structure elucidation of a novel polyketide 3,5-dihydro-2-(r-oxo-3J-hexadecenyl)-2-cyclohexen-l-one with high antiproliferative activity against 8 human cancer cell lines. In the second study, we purified the active fraction (FR4) from the crude dichloromethanic extract with in vitro activity (IC5ri=5.19 - 10.57 pg/mL - SRB assay) against the same cell lines. In addition, the hollow fiber assay was used to study the effect in vivo of the active fraction (FR4). Using this model, we have established growth conditions for MCF-7, NCI-ADR and OVCAR03 cells implanted at the intraperitoneal (i.p.) and subcutaneous (s.c.) compartments of immunocompetent mice. Then, the animals were treated with FR4 (500 mg/kg). doxorubicin (6mg/kg) or vehicle only intraperitoneally. After 14 days the fibers were retrieved, followed by determination of living cell density by MTT staining. FR4 showed significant effect against breast (MCF-7) and ovarian (OVCAR03) tumor cells. The anticancer properties of Virola sebifera in vitro and in vivo was confirmed in this study. These findings may guide future studies in other models and detailed studies on the mechanisms of action<br>Doutorado<br>Farmacologia, Anestesiologia e Terapeutica<br>Doutor em Odontologia
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Eisele, Almut. "La cinétique de différentiation des cellules souches hématopoïétiques uniques après transplantation : l´état d´équilibre et l´effet de la cytokine érythropoïétine." Thesis, Paris Sciences et Lettres (ComUE), 2019. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03028817.

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Abstract:
La majorité des cellules de notre corps sont des cellules hématopoïétiques. Un petit nombre de cellules souches hématopoïétiques produit toutes ces cellules par divisions de maintenance and différentiation. Il a longtemps été considéré que ces cellules souches étaient une population homogène et que chaque cellule produit le même nombre et type de cellule hématopoïétique mature. Cette idée a été réfutée quand il est devenu possible de suivre la différentiation de cellules uniques. Ainsi les cellules hématopoïétiques souches individuelles produisent différents types et quantités relatives de cellules hématopoïétiques matures, amenant la reconstitution après transplantation des cellules souches peut être hétérogène. Quelques cellules qui expriment les marqueurs de cellules souche hématopoïétique survivent uniquement pour une courte durée après transplantation, d’autres pour des années.Dans cette thèse, nous avons utilisé la technique de traçage de lignée des codes-barres cellulaires pour comprendre comment les différents types de cellules souches hématopoïétiques se comportent dans les six premières semaines après transplantation et l’influence de la cytokine érythropoïétine sur ce processus. Les codes-barres cellulaires sont des fragments artificiels d’ADN qui sont introduit dans les cellules souches hématopoïétiques murines par transfection virale. Après transplantation de cellules souche hématopoïétique barcodées de cette manière, chaque division cellulaire va transmettre le code-barre aux cellules filles. Par l’analyse des codes-barres dans les cellules hématopoïétiques matures on peut ainsi comprendre quels types et quelles quantités relatives de cellules matures les cellules souches hématopoïétiques ont produites. Nous avons observé que certaines cellules souches contribuaient de manière stable dans les premières semaines après transplantation, ainsi qu’une succession clonale. Des différences au niveau de la production de différents types de cellules hématopoïétiques matures a aussi été observées. Les globules rouges sont produits par des clones de vie courte et les cellules myéloïdes par des clones stables sur 6 semaines. Le traitement des cellules souches hématopoïétiques avec l’érythropoïétine avant leur transplantation, ne change pas ces phénomènes généraux. Cependant en réponse à l’érythropoïétine, deux types de clones deviennent prépondérants : des clones produisant beaucoup plus de globules rouges et myéloïdes que lymphoïdes, et des clones produisant beaucoup de cellules lymphoïdes et myéloïdes et très peu de globules rouges, suggérant une compensation clonale entre les cellules souches hématopoïétiques. Cet effet était transitoire et disparaît 4 mois après transplantation. Cet effet est dose dépendant en fonction de la concentration d’érythropoïétine.Nous espérons que l’étude détaillée de la différentiation de cellules souches hématopoïétiques uniques wt ou traitées avec l’érythropoïétine après transplantation ait un impact pour notre compréhension pour l’hématopoïèse fondamentale, mais aussi pour des applications cliniques. L’érythropoïétine est utilisée couramment comme médicament. La description détaillée de son effet sur les cellules souches hématopoïétiques est importante pour garantir la sécurité de telles utilisations. De plus, elle peut aider à comprendre les principes généraux de l’actions de cytokines sur les cellules souches hématopoïétiques. La transplantation de cellules souches est utilisée comme traitement dans de nombreuses pathologies. Une phase importante pour le succès d’une transplantation sont les premières semaines quand les niveaux de cellules sanguines ne sont pas encore normalisés. Comprendre quelles cellules produisent quels types de cellules dans cette phase peut servir de base pour le développement de nouvelles stratégies pour raccourcir cette phase critique pour le patient<br>Hematopoietic cells are the most numerous cells in our body, and their overall short half-life requires their steady production. At the apex of the hematopoietic system resides a small number of hematopoietic stem cells (HSC) which give rise to all mature hematopoietic cell types through self-renewal and differentiation divisions. For long it was assumed that these HSC are a homogeneous population of multipotent cells. Technical advancements, which allowed to trace HSC at the single cell level, revealed however that single HSC behave differently with respect to the number of lineages and the relative amounts of different lineages they produce and are heterogeneous with respect to their long-term engraftment capacity. Notably different lineage restricted and biased cells, as well as cells with long-term and short-term engraftment potential have been identified in the HSC gate. One technique allowing the lineage tracing of single HSC is cellular barcoding, which relies on the introduction of an artificially created DNA fragment, the barcode, in the genome of HSCs through viral transfection. As these barcodes are transmitted to all daughter cells, the analysis of the barcode identity of progeny cells reveals which lineages and how much of each is produced by each individual HSCs.In this thesis we used a new cellular barcoding library to analyze how the different HSC subsets previously described interact and behave in the first six weeks after bulk transplantation, as well as the influence of erythropoietin (EPO) on this process. More in detail, we described the reconstitution kinetics of HSC in the myeloid (M; macrophage, monocytes, neutrophils, eosinophils), lymphoid (B-cells), dendritic cells, megakaryocyte and erythroid lineage (E; erythroblasts) at the single cell level. For the analysis of HSC differentiation towards the erythroid lineage we established the detection of cellular barcodes from RNA. We discovered that HSC clonal succession and clonal stability co-occur in the first weeks after transplantation, but are not evenly distributed over the different hematopoietic lineages. Notably the production of erythroid cells 2-weeks after transplantation was maintained by distinct short-lived HSC clones, while high myeloid cell production after transplantation was guaranteed by long-lived multi-outcome HSCs. In vitro EPO exposure of HSC before transplantation, did not change the overall lineage output of transplanted HSC, or HSC differentiation kinetics, lineage restrictions, and biases at the single cell level in the first six weeks after transplantation. However, after transplantation of EPO-exposed HSC long-lived unbiased multi-outcome HSCs lost preponderance with respect to cellular output. Rather, changing clones of two types of highly biased HSCs, myeloid-erythroid (ME)-biased and myeloid B-cell (MB)-biased HSC, produced now the majority (&gt;60%) of erythroid, myeloid and B-cells. This effect was transient but stable over different EPO concentrations and after in vivo EPO treatment during transplantation. It suggests a functional compensation mechanism at work.We hope the detailed description of the engraftment kinetics of single control and EPO-exposed HSC after bulk transplantation will have relevance both for fundamental research and the clinics
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Boulerice, François. "Studies on HIV-1 replication in the monocytoid cell line U-937 : (etude de l'expression du VIH-1 dans la lignee cellulaire monocytaire U-937)." Thesis, McGill University, 1991. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=41051.

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Abstract:
The expression of HIV-1 in cells of monocytic origin was investigated. In order to do this, the cell line U-937 was chosen because it possesses many characteristics of immature monocytes and can be easily infected by HIV-1. We found that long-term chronically-infected cells generate a high amount of defective particles, unable by themselves to successfully infect any target cells. Two main phenotypes were detected, one showing defectiveness in reverse transcriptase activity, and the other one showing inability to express fully mature glycoproteins.<br>We also investigated the biological relevance of these defective particles, particularly in a situation where two cells generating defective virions are fused together by chemical methods. We show evidence that defective virions can complement each other in a hybrid cell and generate fully infectious particles resembling wild-type virus. Such a phenomenon may occur by genetic recombination, as suggested by Southern blot analysis. This finding may prove of clinical relevance since cells of phagocytic lineage can fuse in vivo naturally or by virus-mediated mechanisms.<br>We next tried to assess the efficacy of the antiviral drug, AZT, in controlling HIV-1 replication in such monocyte-like cells. AZT was found unable to completely abolish HIV-1 replication in vitro but was able to delay in a dose-dependent fashion the expression of the virus. In addition, we also studied the effect of AZT in clonal derivatives of U-937 cells, and found that the inhibitory effect was proportional to the degree of susceptibility of these cells to the virus.<br>Finally, we analyzed the susceptibility of U-937 cells by using such clonal derivatives and found that some displayed either high or low susceptibility to infection by HIV-1. The susceptibility which correlated with the amounts of intracellular viral DNA and TNF-alpha mRNA expression was found not to depend on levels of CD4 receptors, a result which suggests that other factors are involved in modulating replication in those cells.
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Sallez, Yves. "Conception d'un système de programmation hors ligne de cellules robotisées intégrant le langage ADA." Valenciennes, 1988. https://ged.uphf.fr/nuxeo/site/esupversions/3941307a-1d5e-4e41-8bd2-65df2a934515.

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Abstract:
Le système incluant les phases de description, programmation et simulation doit respecter les contraintes de modularité, prise en compte du parallélisme des activités au sein de la cellule, communication homme-machine. Un modèle conceptuel, décrivant les aspects fonctionnels, matériels et les caractéristiques de commande de la cellule, sert de base au modèle de description.
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Gaillard, Isabelle. "Mise en œuvre de la chromatographie liquide haute performance dans le cadre du suivi hors ligne et en ligne des protéines de cultures d'hybridomes : caracterisation de la méthode chromatographique et comparaison avec le test ELISA." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1993. http://www.theses.fr/1993INPL022N.

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Abstract:
Depuis la mise au point des techniques de formation des lignées d'hybridomes, des efforts importants sont fournis pour améliorer la productivité des anticorps monoclonaux et pour mieux comprendre le métabolisme cellulaire. Les méthodes analytiques jouent un rôle important dans le contrôle des procédés en permettant la détermination quantitative et qualitative de plusieurs paramètres et variables. L'objectif général de cette étude consiste à contribuer à l'amélioration de la maitrise des bioprocédés en proposant une méthode analytique capable de quantifier les protéines présentes dans les cultures d'hybridomes. Afin d'atteindre cet objectif, les potentialités de l'HPLC ont été testées. Les protéines considérées dans cette étude sont d'une part, les composes protéiques propres au milieu de culture et d'autre part, les anticorps monoclonaux secrétés par les cellules. La première partie de cette étude présente l'optimisation des conditions opératoires de la méthode chromatographique. Les deux modes chromatographiques mis à profit sont l'HPLC d'affinité et la RP-HPLC. Une étude comparative des performances de la méthode par HPLC et du test ELISA est exposée dans une seconde partie. La troisième partie concerne l'application de la méthode chromatographique aux suivis des protéines de cultures cellulaires d'hybridomes. Enfin, la réalisation couplage automatise réacteur-échantillonneur-HPLC et son application à la détermination en ligne de la concentration des IgG d'une culture discontinue, constituent la dernière partie de ce travail
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BOSC, CHRISTOPHE. "Caracterisation moleculaire et expression in vivo de la proteine stop de cerveau de rat, effecteur de la stabilite des microtubules neuronaux." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1996. http://www.theses.fr/1996GRE10151.

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Abstract:
Les cellules nerveuses contiennent une abondance de microtubules stables. La proteine stop (stable tubule only polypeptide) est une proteine neuronale qui s'associe aux microtubules et a la calmoduline. Elle est capable de stabiliser in vitro les microtubules vis-a-vis du froid, de la dilution et de drogues. Le clonage de l'adnc de la proteine stop a montre qu'il s'agit d'une nouvelle proteine, de masse moleculaire 100,5 kda et de pi 9,5. La proteine stop comprend deux domaines composes de motifs repetes distincts: un domaine central de 5 repetitions de 46 acides amines extremement conserves et un domaine carboxyterminal de 28 repetitions imparfaites de 11 acides amines. Elle contient egalement un site potentiel de liaison a un domaine sh3. La transfection de l'adnc de la proteine stop dans des cellules depourvues de microtubules stables au froid montre l'association de cette proteine aux microtubules. De plus, l'expression de la proteine stop peut induire in vivo la stabilite des microtubules au froid et au nocodazole, ainsi que la detyrosination de la tubuline des microtubules. La distribution des arnm de la proteine stop indique que la proteine est abondante dans le cerveau. Dans des cultures primaires de cervelet embryonnaire, les neurones sont fortement marques par les anticorps anti-stop. Des oligonucleotides antisens, correspondant au motif central, entrainent 75% d'inhibition de la differenciation de cellules pc12 traitees au ngf. Ces resultats montrent que la proteine stop doit jouer un role important dans la stabilisation au froid des microtubules neuronaux, dans le controle de leur dynamique et dans la differenciation neuronale
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Pernod, Gilles. "Propriétés pro-fibrinolytiques des cellules de la lignée gliomateuse C6 : implication dans la survenue d'hémorragie intra-tumorale." Université Joseph Fourier (Grenoble ; 1971-2015), 1998. http://www.theses.fr/1998GRE10230.

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Abstract:
Le traitement du gliome experimental c6 de rat par des hautes doses d'acide 13-cis retinoique (cra) est responsable du deces de ces animaux en rapport avec une necrose hemorragique de la tumeur. Nous demontrons que le traitement des gliomes c6 in vivo par des doses de 25 mg/kg/j de cra, augmente l'activateur tissulaire du plasminogene (t-pa), qui apparait comme l'espece moleculaire majeure associee a une activite fibrinolytique responsable de l'hemorragie intra-tumorale. La production de t-pa resulte d'un effet direct des retinoides sur la tumeur. La production de t-pa par la tumeur c6 in vivo est liee a la synthese specifique, temps et dose-dependant, de t-pa par les cellules c6. L'expression du gene du t-pa implique la synthese proteique du recepteur de l'acide retinoique (rar). La voie de signalisation de l'ampc agit synergiquement pour induire la synthese du t-pa. L'action du cra precede celle de l'ampc, et l'activite proteine kinase a est necessaire pour une induction optimale de la production de t-pa par le cra. Les cellules c6 lient le plasminogene et sont responsables d'une augmentation de 42 fois de l'efficience catalytique de la generation de plasmine par le t-pa, principalement due a une diminution de 20 fois du km de la reaction. Cette augmentation de l'affinite de l'enzyme pour son substrat est particulierement favorable a la generation de plasmine a la surface cellulaire. Ceci pourrait expliquer l'activite fibrinolytique et les aires de necrose hemorragiques decrites dans ces tumeurs.
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KAVERI, SRINIVAS-VENKATESH. "Etude immunologique des recepteurs beta-adrenergiques." Paris 7, 1987. http://www.theses.fr/1987PA077217.

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Abstract:
Caracterisation des recepteurs beta -adrenergiques humains a ete realisee par des methodes immunologiques (anticorps polyclonaux et anticorps monoclonaux ont ete developpes. Un anticorps anticodytypique ab2b4 reconnait egalement le recepteur beta -adrenergique et stimule l'activite de l'adenylate cyclase comme des ligands agonistes. Au cours de certaines maladies autoimmunes, l'existence d'autoanticorps diriges contre les recepteurs beta -adrenergiques ont ete detectes dans le serum de patients atteints de la maladie de chagas. Le developpement des groupes d'anticorps anti-recepteur obtenus permettront une etude structurale et fonctionnelle du systeme beta-adrenergique
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Longato, Giovanna Barbarini 1985. "Atividade anticancer do extratos brutos e das frações ativas obtidos de Piper regnellii (Miq.) C. DC. var. regnellii." [s.n.], 2010. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/317626.

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Orientadores: João Ernesto de Carvalho, Mary Ann Foglio<br>Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia<br>Made available in DSpace on 2018-08-16T06:52:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Longato_GiovannaBarbarini_M.pdf: 3207604 bytes, checksum: 101ab74753d736c58751655cdb930feb (MD5) Previous issue date: 2010<br>Resumo: O câncer é um conjunto de doenças que atinge milhões de pessoas, sendo a segunda causa de morte da população mundial. Caracteriza-se pelo desenvolvimento de células instáveis que passam a não responder aos estímulos internos e externos que controlam a proliferação, diferenciação e morte celular. Apesar da grande quantidade de estudos relacionados ao gênero Piper e suas espécies, não há descrição sobre a atividade antiproliferativa in vitro e antitumoral in vivo da espécie P. regnellii (Miq.) C. DC. var. regnellii. O presente estudo avaliou a atividade antiproliferativa in vitro desta espécie, coletada em três épocas diferentes: junho e outubro de 2008 e fevereiro de 2009. Dentre as coletas realizadas, o extrato bruto diclorometânico de junho e suas frações de média polaridade apresentaram atividade citotóxica in vitro com boa correlação entre concentração e efeito e também seletividade para as linhagens hormônio-dependentes de ovário (OVCAR-3) e mama (MCF7), bem como para as linhagens de melanoma (UACC- 62) e próstata (PC-3). De acordo com os nossos estudos, uma das substâncias responsáveis por esta atividade é uma neolignana denominada eupomatenóide-5. Os efeitos observados in vitro pela fração rica em lignanas foram comprovados em modelo in vivo de tumor sólido de Ehrlich. Além disso, o extrato bruto diclorometânico de P. regnellii reduziu o edema de pata produzido por carragenina sugerindo uma correlação entre câncer e inflamação. Este é o primeiro trabalho que relata o efeito antiproliferativo e antiinflamatório de P. regnellii e os resultados obtidos incentivam a continuação dos estudos visando a elucidação do mecanismo de ação e identificando outros princípios ativos que, em sinergismo com o composto eupomatenóide-5, potencializem a atividade de P. regnellii.<br>Abstract: Cancer is a pool of many diseases diagnosed in thousands of people all over the world and represents the second major cause of death worldwide. The loss of normal cell growth control is the main event in the development of cancer and includes specific steps known as cell proliferation, differentiation and apoptosis. Despite numerous studies related to Piper genus, there is no description of any antiproliferative (in vitro) or antitumoral activity (in vivo) of Piper regnellii (Miq.) C. DC. var. regnellii. The present study evaluated the antiproliferative activity of this species, collected in three different periods: June and October, 2008 and February 2009. Among the plants evaluated, the medium polarity fractions obtained from the dichloromethanic crude extract of the plants collected in June presented concentration-effect correlation and also selectivity towards hormonedependent ovary (OVCAR-3) and breast (MCF7) cell lines, as well as melanoma (UACC- 62) and prostate (PC-3). According to our studies, one of the compounds responsible for this activity is classified as eupomatenoid-5, that is a neolignan. Effects observed in vitro for the lignans enriched fractions were confirmed through the Ehrlich solid tumor model in mice. In addition, preliminary results with dichloromethane crude extract of P. regnellii in anti-inflammatory experimental model of paw edema induced by carrageenan suggest the connection between cancer and inflammation. The present study represents the first report of both antiproliferative and anti-inflammatory promising activities of this species indicating the benefits of further studies in the search of more purified compounds and active principles that in synergism with eupomatenoid-5 can potentiate anticancer activity's result, as well as their mechanisms of action.<br>Mestrado<br>Biologia Celular<br>Mestre em Biologia Celular e Estrutural
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Martineau, Thuillier Stephanie. "Rôle du disque télophasique dans la dynamique de la cytokinèse : étude de la régulation et des fonctions de la protéine TD-60." Université Joseph Fourier (Grenoble ; 1971-2015), 1998. http://www.theses.fr/1998GRE10078.

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Abstract:
La cytokinese est la derniere etape de la mitose. La cellule se scinde en son milieu, afin de former deux cellules filles contenant un stock chromosomique egal. La division doit obligatoirement survenir entre les deux stocks chromosomiques separes lors de l'anaphase. La cellule doit donc transmettre au cortex la position de la division. Differentes solutions ont ete choisies pour ce mecanisme : les levures bourgeonnantes semblent utiliser un marqueur membranaire ; les levures a fission semblent placer la division en fonction de la position du noyau ; pour la majorite des autres eucaryotes, les microtubules du fuseau mitotiques interviennent dans ce positionnement. Nous nous sommes interesses aux cellules somatiques de vertebres, dans lesquelles le disque telophasique semble jouer un role important dans la cytokinese. Le disque telophasique est une structure localisee des l'anaphase au centre de la cellule dans la zone de superposition des microtubules interpolaires. Certaines des proteines connues qui le constituent, comme les proteines td-60 et incenps, sont presentes sur les centromeres en debut de mitose et se relocalisent sur les microtubules en anaphase. Nous avons debute une etude afin de demontrer que la destruction de la cycline b en debut d'anaphase joue un role dans le controle de leur localisation. Nous avons demontre que la presence du disque telophasique est etroitement liee a l'induction de l'invagination membranaire. Cette structure, localisee au centre de la cellule par l'intermediaire des microtubules interpolaires, pourrait interagir avec des proteines corticales. Ce phenomene induirait l'organisation d'un anneau d'actine, sur le cortex, necessaire a la constriction membranaire. De plus, nous avons demontre que la cytokinese peut etre un evenement independant et dissociable de la mitose. Nous avons egalement mis au point un protocole de purification partielle de la proteine td-60. Un sequencage par la methode d'edman n'a pas donne les resultats esperes et nous envisageons actuellement de sequencer td-60 par spectrometrie de masse.
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Rouard-Talbot, Laurence. "Etude transcriptionnelle et fonctionnelle de CMAR : un modulateur des interactions cellulaires." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1999. http://www.theses.fr/1999GRE10033.

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Abstract:
Le gene cmar (cell matrix adhesion regulator), localise en 16q24. 3, code une proteine de 82 acides amines qui module l'adherence cellulaire via l'integrine 21. Cependant son role precis reste a determiner et la proteine n'est pas identifiee. Nos travaux confirment un polymorphisme dans le locus du gene cmar et indiquent la coexistence des deux arnm dans une meme cellule. L'insertion caca produit une proteine qui differe de la proteine sauvage par son extremite c-terminale. Dans les clones stables de cellules de carcinomes coliques ht-29 exprimant les proteines de fusion gfp-cmar ou gfp-variant c, seule la proteine cmar sauvage augmente l'adherence cellulaire sur la matrice extracellulaire. De plus, nous avons montre que cmar favorise l'agregation cellulaire independamment de l'extremite c-terminale puisqu'il est aussi observe avec le variant c. Cette nouvelle fonction suggere que cmar pourrait etre un regulateur biochimique des processus d'adherence cellule-cellule et cellule-matrice extracellulaire. La stabilite observee pour les transcrits cmar expliquerait le faible taux cellulaire de la proteine et serait compatible avec ce role de molecule regulatrice. Nos etudes de localisation subcellulaire indiquent que la proteine cmar-egfp est majoritairement localisee dans le noyau, tandis que la chimere egfp-cmar est essentiellement cytoplasmique et probablement associee aux microtubules. Cette difference pourrait etre attribuee a la presence d'une sequence potentielle d'exportation nucleaire a l'extremite c-terminale de cmar qui serait masquee dans la construction cmar-egfp. La phosphorylation de la tyrosine c-terminale, essentielle a la fonction d'adherence sur la matrice, n'est pas impliquee dans la localisation. La localisation du gene cmar dans une zone chromosomique souvent remaniee et son role de regulateur de l'adherence cellulaire suggerent que cmar soit implique dans la progression tumorale ou l'embryogenese, deux processus ou l'adherence cellulaire est souvent perturbee.
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Cahen, Pierre. "Caractérisation du gène et de la protéine p53, dans le clone F4NWO des cellules érythroleucémiques murines de Friend." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1994. http://www.theses.fr/1994GRE10145.

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Abstract:
Nous avons etudie la proteine p53 et son gene, dans le clone f4nwo de la lignee erythroleucemique murine de friend. La proteine est mutee par la presence d'une deletion de huit acides amines entre les domaines conserves iv et v. En revanche, le gene ne presente pas de deletion. La derniere base de l'intron 7 est mutee, sur un seul des deux alleles. Cette mutation detruit le site accepteur d'epissage. La deletion observee semble due a l'utilisation d'un site cryptique, situe 24 bases en aval. La recherche d'un arnm sauvage s'est revelee vaine. La p53 exprimee dans cette lignee cellulaire est donc le produit d'un seul allele. Nous avons etudie la localisation de la proteine durant le cycle cellulaire, a l'aide de cellules marquees avec differents anticorps monoclonaux anti-p53, triees par cytometrie en flux. Une fraction de la proteine, reconnue par l'anticorps pab 421, presente une translocation nucleaire liee au cycle cellulaire. En effet, durant la phase g1, elle a une localisation exclusivement cytoplasmique, et elle devient nucleaire au debut de la phase s, comme le ferait une p53 sauvage. Cette localisation semble specifique de certaines zones du noyau. Le reste de la proteine, non reconnue par pab 421, reste dans le cytoplasme durant tout le cycle cellulaire, conformement aux proprietes attribuees a une p53 mutee. En fonction de ces resultats, nous proposons que: i) la conformation mutee ou sauvage de p53 ne soit pas un facteur determinant pour sa translocation nucleaire. Il s'agirait plutot d'une modification post-traductionnelle, qui affecterait le domaine c-terminal de la proteine, reconnu par pab 421. Nous proposons que cette modification soit une dephosphorylation, qui demasquerait les sequences nls presentes dans l'extremite c-terminale de la proteine. Ii) des cibles nucleaires specifiques existent pour cette p53 mutee, comme il en existe pour la p53 sauvage. Nous concluons que le clone f4nwo de la lignee erythroleucemique murine de friend fournit un bon systeme d'etude de la translocation de p53, et de recherche de cibles nucleaires d'une telle proteine mutee
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Pomies, Pascal. "Approche moléculaire de la régulation de l'adhérence cellulaire médiée par les intégrines." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1995. http://www.theses.fr/1995GRE10011.

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Abstract:
A l'aide de cellules cho15b bloquees en prometaphase par du nocodazole, nous avons etudie la fonction du recepteur de la fibronectine exprime a la surface de cellules mitotiques. Une etude par cytometrie en flux a l'aide d'un anticorps dirige contre cette integrine, et des etudes de fixation de fibronectine radiomarquee sur la membrane cellulaire, montrent qu'un nombre constant d'integrines est exprime a la surface cellulaire au cours du cycle cellulaire. De plus, le recepteur de la fibronectine est toujours dans un etat de haute affinite pour son ligand soluble ou insoluble au cours de la mitose. Ces resultats indiquent que l'arrondissement des cellules observe durant la mitose ne resulte pas d'une parte de l'affinite du recepteur pour son ligand extracellulaire ; ce changement morphologique serait plutot la consequence d'une desorganisation des plaques d'adherence. A partir d'un lysat de cellules cho15b, nous avons mis au point un test in vitro afin d'etudier l'interaction de la fibronectine avec le recepteur de la fibronectine dans un environnement cytosolique. Dans ce test, l'interaction integrine/fibronectine necessite du calcium intracellulaire, la calmoduline, et une activite phosphatase. De plus, l'action d'inhibiteurs specifiques de phosphatases et l'inhibition de l'interaction integrine/fibronectine par un anticorps dirige contre la calcineurine, la phosphatase dependante du calcium et de la calmoduline, suggerent que la calcineurine permet l'interaction entre le recepteur de la fibronectine et son ligand. Des experiences de marquage metabolique montrent que l'integrine elle-meme n'est pas la cible d'une cascade de phosphorylation/dephosphorylation impliquant la calcineurine et modulant l'affinite de l'integrine. Ces resultats montrent qu'in vitro, un substrat de la calcineurine regule l'affinite du recepteur de la fibronectine en interagissant avec un effecteur non-identifie
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Orfanoudakis, Georges. "Diadenosine tetraphosphate : implication dans l'activite mitotique, la replication et la reparation du dna." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1988. http://www.theses.fr/1988STR13121.

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Abstract:
Le diadenosine tetraphosphate (ap**(4)a) est le principal produit de la reaction d'aminoacylation catalysee par certaines aminoacyl-trna synthetases. L'ap**(4)a est une molecule "signal" s'accumulant a l'interphase g1/5 du cycle cellulaire des cellules eucarydes declenchant ainsi la synthese du dna precedant la division cellulaire. Quantification du contenu cellulaire en ap**(4)a et en atp apres synchronisation des cellules (hepertome de rat, fibroblaste de souris) en culture par l'aphidicoline agent bloquant les cellules en phase s et par privation de serum qui arrete la croissance en mi-phase g. Mise au point d'un modele de reparation, dans les ovocytes ou les oeufs non fecondes de xenopus laevis, du plasmute pbr322 modifie par l'acetylaminofluorene. L'effet de l'ap**(4)a sur la reparation est etudie
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Heu, Céline. "Vieillissement des barrières biologiques. : caractérisation morphologique et fonctionnelle d'un modèle de stress environnemntal induit chez la lignée kératinocytaire humaine HaCat." Thesis, Besançon, 2012. http://www.theses.fr/2012BESA0005.

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Abstract:
II existe de nombreuses études mettant en relation le vieillissement et le stress oxydant, mais peu d'entre elles ont caractérisé l'évolution des marqueurs des défenses antioxydantes, notamment au niveau cutané, au cours du vieillissement dit extrinsèque ou environnemental.Nous avons cherché à mimer in vitro le vieillissement extrinsèque cutané, à partir d'un modèle de cellules épidermiques en culture, la lignée de kératinocytes humains HaCaT, soumises à un stress chimique, l'exposition au glyphosate, un principe actif entrant dans la composition de nombreuses formulations pesticides. Ainsi, nous avons exploré notre modèle par une approche multi-échelle originale et innovante: tout d'abord, à l'échelle moléculaire, par une étude protéomique quantitative différentielle des taux d'expression protéique intracytosolique suite à l'induction du stress ; puis, à l'échelle cellulaire en cytomètrie en flux, par la caractérisation fonctionnelle du stress oxydant et de la mort cellulaire qui en découle ; enfin, à l'échelle micro- et nanométrique, en microscopie confocale et à force atomique, par le suivi de l'évolution des propriétés morphologiques et viscoélastiques des kératinocytes stressés.Ce travail de thèse a démontré que le glyphosate altérait signifïcativement l'état et la fonction barrière de l'épiderme humain, ciblant notamment les kératinocytes, dont l'équipement moléculaire et les fonctions vitales d'adhérence et de dynamique membranaire se retrouvent fondamentalement dégradées. L'ensemble de ces résultats constitue un « tableau » qui évoque parfaitement les événements, les signaux et les comportements cellulaires s'installant au cours du vieillissement cutané<br>Numerous studies relate ageing to oxidative stress. Few of them described thé évolution of markers of antioxidant défenses, in particular at thé cutaneous level, during extrinsic or environmental ageing. We tried to mimic in vitro cutaneous extrinsic ageing, with a model of epidermic cells in culture, thé human kératinocytes cell line HaCaT, subjected to a chemical stress, Glyphosate, an active ingrédient présent in thé composition of numerous pesticide formulations. Indeed, we examined thé effects of induced ageing in thé loss of kératinocytes integrity in culture, by an original and innovative multi-scale approach: Firstly, at thé molecular scale, we assessed thé stress induced modifications of intracytosolic protein expression by a differential quantitative proteomic study; then, at thé .cellular scale, with flow cytometry, by thé functional characterization of thé oxidative stress and resulting cell death; fmally, at thé micro- and nanoscale, with confocal and atomic force microscopy by thé following thé évolution of morphological and viscoelastic properties of stressed kératinocytes. This PhD work demonstrated that glyphosate impaired thé state and thé barrier function of thé human skin, in particular by fundamentally impairing kératinocytes through thé molecular equipment, thé vital adhésion fonctions and membrane dynamics. Ail thèse results give us a global image of events, signais and cell behavior occurring in skin aging
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Li, Huan. "Energy consumption minimization strategy for fuel cell hybrid electric vehicles." Thesis, Bourgogne Franche-Comté, 2018. http://www.theses.fr/2018UBFCA034/document.

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Abstract:
Le réchauffement climatique, la pollution de l'environnement et l'épuisement des énergies pétrolières ont attiré l'attention de l'humanité dans le monde entier. Les véhicules électriques hybrides à pile à combustible (FCHEV), utilisant l’hydrogène comme carburant et n’émettant aucune émission, sont considérés par les organismes publics et privés comme l’un des meilleurs moyens de résoudre ces problèmes. Cette thèse de doctorat considère un FCHEV avec trois sources d'énergie: pile à combustible, batterie et supercondensateur, ce qui complique l'élaboration d'une stratégie de gestion de l'énergie (EMS) pour répartir la puissance entre différentes sources d'alimentation. Parmi les méthodes de gestion de l'énergie de la littérature actuelle, la stratégie de minimisation de la consommation équivalente (ECMS) a été sélectionnée car elle permet une optimisation locale sans connaissance préalable des conditions de conduite et cela en donnant des résultats optimaux.En raison de la faible densité énergétique du supercondensateur, sa consommation équivalente d'hydrogène est négligée dans la plupart des références bibliographiques, ce qui va non seulement à l'encontre de l'objectif de minimiser la consommation totale d'hydrogène, mais accroît également la complexité du système EMS en raison du besoin d'un système EMS supplémentaire pour calculer la demande en puissance du supercondensateur. Ainsi, une stratégie ECMS à programmation quadratique séquentielle (SECMS) est proposée pour prendre en compte le coût énergétique des trois sources d’énergie dans la fonction objectif. Une stratégie de contrôle basée sur des règles (RBCS) et une stratégie hybride (HEOS) a été également conçues pour être comparée à SECMS. La dégradation des sources d'énergie représente un défi majeur pour la stabilité du système SECMS développé. Basé sur l'estimation en ligne de l'état de santé de la pile à combustible et de la batterie, le système ECMS adaptatif (AECMS) a été implémenté en ajustant le facteur équivalent et le taux de changement dynamique de la pile à combustible. Les résultats de la simulation montrent que l’AECMS peut assurer le maintien de la charge de la batterie et l’augmentation de la durabilité de la pile à combustible.Pour valider les algorithmes de gestion de l'énergie et les modèles numériques proposés, un banc d'essai expérimental a été construit autour de l'interface temps réel DSPACE. La comparaison des résultats de la simulation numérique et des résultats expérimentaux a montré que le système SECMS proposé fonctionne à un rendement maximal, que le supercondensateur fournit la puissance de pointe et que la batterie fonctionne comme un tampon d’énergie. Il a été prouvé que la négligence de la consommation d'hydrogène équivalente au supercondensateur dans l'ECMS conduit à un fonctionnement non optimal. Comparé à RBCS et HEOS, la SECMS a le moins d'hydrogène consommé et le courant de pile à combustible le plus stable<br>Global warming, environment pollution and exhaustion of petroleum energies have risen their attention of the humanity over the world. Fuel cell hybrid electric vehicle (FCHEV) taking hydrogen as fuel and have zero emission, is thought by public and private organisms as one of the best ways to solve these problems. This PhD dissertation consider a FCHEV with three power sources: fuel cell, battery and supercapacitor, which increases the difficult to design an energy management strategy (EMS) to split the power between the different power sources.Among the EMS available in the current literature, the Equivalent consumption minimization strategy (ECMS) was selected because it allows a local optimization without rely on prior knowledge of driving condition while giving optimal results.Due to low energy density of supercapacitor, its equivalent hydrogen consumption is neglected in most bibliographic references, which not only counter to the aim of minimizing whole hydrogen consumption but also increase the complication of EMS due to the need of an additional EMS to calculate supercapacitor power demand. Thus, a sequential quadratic programming ECMS (SECMS) strategy is proposed to consider energy cost of all three power sources into the objective function. A rule based control strategy (RBCS) and hybrid strategy (HEOS) are also designed in order to to be compared with SECMS. Degradation of energy sources represents a major challenge for the stability of the developed SECMS system. So, based on online estimating state of heath of fuel cell and battery, an adaptive ECMS (AECMS) has been designed through adjusting the equivalent factor and dynamical change rate of fuel cell. The simulation results show that the AECMS can ensure the charge sustenance of battery and the increase of fuel cell durability.To validate the proposed energy management algorithms and the numerical models an exerimental test bench has been built around the real time interface DSPACE. The comparison of the simulation and experimental results showed that the proposed SECMS is operated at around maximum efficiency, supercapacitor supplies peak power, battery works as the energy buffer. It has been proved that the neglect of supercapacitor equivalent hydrogen consumption in ECMS leads to not optimal operation. Compared with RBCS and HEOS, SECMS has least hydrogen consumption and most stable fuel cell current
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Gamba, Laurent. "Etude de la régulation du gène codant le récepteur de chimiokine CXCR4 dans le système de la ligne latérale postérieure du poisson-zèbre (danio rerio)." Thesis, Montpellier 2, 2010. http://www.theses.fr/2010MON20085/document.

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Abstract:
La ligne latérale postérieure embryonnaire du poisson-zèbre est composée d'un ensemble d'organes sensoriels, appelés neuromastes, qui permet au poisson de détecter les mouvements de l'eau. Le primordium qui génère la ligne latérale postérieure embryonnaire migre de la tête vers l'extrémité de la queue le long d'une piste de cellules sécrétrices de SDF-1, et dépose des groupes de cellules précurseurs des neuromastes. Cette migration dépend de la présence de CXCR4, le récepteur de SDF-1, dans la région en tête du primordium et de la présence du second récepteur de SDF-1, CXCR7, dans la région en queue du primordium. L'objectif de ma thèse est d'identifier des régulateurs de l'expression de cxcr4b au sein du primordium. Nous avons montré que l'inactivation du récepteur des strogènes ESR1 induit l'expression ectopique de cxcr4b dans les cellules de queue du primordium alors que sa surexpression induit une réduction du domaine d'expression de cxcr4b, suggérant que ESR1 agit comme un répresseur de cxcr4b. Cette découverte expliquerait pourquoi les strogènes diminuent la capacité métastatique des cellules du cancer du sein strogéno-dépendants. L'inactivation de ESR1 conduit aussi à l'extinction de l'expression de cxcr7b dans les cellules de queue du primordium, cet effet étant toutefois indirect et induit par la signalisation ectopique SDF-1/CXCR4 dans ces cellules. L'inactivation et la surexpression de ESR1 provoquent toutes deux une migration défectueuse du primordium, confirmant l'importance de ce récepteur dans le contrôle de la migration dépendante de SDF-1. Nous avons aussi montré qu'un effecteur majeur de la signalisation Wnt canonique, LEF-1, contribue au contrôle de l'expression de cxcr4b et de cxcr7b dans les cellules en tête du primordium. Nous montrons que la prolifération cellulaire, qui assure une taille constante du primordium en dépit des dépositions successives de cellules, est réduite en absence de LEF-1, et que cela conduit à une ligne latérale postérieure incomplète<br>The zebrafish embryonic posterior lateral line is componed by a set sense organs, called neuromasts, allowing the fish to detect the water movements. The primordium that generates the embryonic posterior lateral line of zebrafish migrates from the head to the tip of the tail along a trail of SDF-1-producing cells, and deposits cell groups that will become the neuromasts. This migration critically depends on the presence of the SDF-1 receptor CXCR4 in the leading region of the primordium and on the presence of a second SDF1 receptor, CXCR7, in the trailing region of the primordium. The aim of my thesis is to identify regulators of the cxcr4b expression within the primordium. Here we show that inactivation of the estrogen receptor ESR1 results in ectopic expression of cxcr4b throughout the primordium, whereas ESR1 overexpression results in a reciprocal reduction in the domain of cxcr4b expression, suggesting that ESR1 acts as a repressor of cxcr4b. This finding could explain why estrogens significantly decrease the metastatic ability of ESR-positive breast cancer cells. ESR1 inactivation alsoleads to extinction of cxcr7b expression in the trailing cells of the migrating primordium; this effect is indirect, however, and due to the down-regulation of cxcr7b by ectopic SDF-1/CXCR4 signaling in the trailing region. Both ESR1 inactivation and overexpression result in aborted migration, confirming the importance of this receptor in the control of SDF-1-dependent migration. We also showed that a major effector of the canonical Wnt signaling, LEF-1, contributes to the control of both cxcr4b and cxcr7b expression in the leading cells of the primordium. We show that cell proliferation, which ensures constant primordium size in spite of sucessive rounds of cell deposition, is reduced upon lef1 inactivation, leading in a truncated posterior lateral line
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Verrier, Thomas. "Function and plasticity of NKp46 expressing innate lymphoid cells." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2016. http://www.theses.fr/2016USPCC173/document.

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Abstract:
Les cellules lymphoïdes innées de groupe 3 (ILC3) contribuent activement à l’homéostasie intestinale par leur production d’Interleukin-22 (IL-22). Ces ILC3 regroupent 2 sous-populations majeures, les LTi (« Lymphoid Tissue inducer »), caractérisées par l’expression du récepteur au chimiokine CCR6, et les ILC3 exprimant le facteur de transcription (FT) T-bet, qui comprennent une population positive pour le marqueur de surface NKp46, récepteur originalement utilisé pour identifier les ILC de groupe 1 (ILC1). Les ILC1 jouent un rôle prépondérant dans la réponse aux pathogènes intracellulaires et anti-tumorale. Jusqu’à présent, trois populations majeures composent les ILC1 : les lymphocytes cytotoxiques Natural Killer (NK ou ILC1b), qui dépendent largement du FT Eomes et expriment l’intégrine CD49b ; les ILC1 hépatiques et intestinaux, qui dépendent du FT T-bet et expriment CD49a (ILC1a) ; et une population CD49a+ et DX5+ indépendante du FT Nfil3 localisée dans les glandes salivaires ou l’utérus (ILC1ab). Mes travaux visent à comprendre la biologie des ILC exprimant NKp46, ainsi que les facteurs impliqués dans leur développement, leur maturation et leur fonction. La majeure partie de ma thèse se concentre sur les NKp46+ ILC3. Premièrement, nous démontrons un rôle majeur pour le récepteur aux chimiokine CXCR6 dans la localisation des NKp46+ ILC3 dans les villi de la lamina propria intestinale (Satoh-Takayama et al. 2014). Deuxièmement, j’ai mis en évidence que NKp46+ ILC3 pouvait perdre l’expression de NKp46 (Verrier et al. 2016). Déclenchée par le TGFβ, cette perte d’expression est associée à une plus forte capacité à produire de l’IL-22, mais aussi à l’acquisition de marqueurs identifiant les LTi (CCR6, MHC-II), démontrant ainsi la plasticité des NKp46+ ILC3. Enfin, en collaboration avec le groupe de Rachel Golub, nous avons confirmé le rôle présumé de la molécule Notch dans cette plasticité (Chea et al. 2016). Dans ce manuscrit, je discuterai du développement et de l’hétérogénéité des ILC3, ILC1a, ILC1b et ILC1ab. L’ensemble de mes résultats soutient une vision dynamique de la biologie des ILC reflétant l’adaptation de ces cellules effectrices face à leur environnement. En caractérisant les différents acteurs impliqués dans ce processus dynamique, mes travaux pourront servir au développement de thérapies visant à contrôler l’équilibre entre ces différentes populations dans divers pathologies comme le cancer, les infections virales, ou encore les maladies intestinales<br>Group 3 Innate Lymphoid cells (ILC3) actively maintain mucosal homeostasis through the production of Interleukin-22 (IL-22). ILC3 encompass 2 major populations, LTi (« Lymphoid Tissue inducer »), characterized by the expression of the chemokine receptor CCR6, and ILC3 that express the transcription factor T-bet, which include a population expressing the surface marker NKp46, a receptor originally used to identify group 1 ILC (ILC1). ILC1 plays a major role in the defense against intracellular pathogens and anti-tumoral responses. Three major ILC1 populations have been identified: the cytotoxic lymphocytes « Natural Killer » (NK or ILC1b), which largely rely for on the transcription factor Eomes their generation and express the integrin CD49b; hepatic and intestinal ILC1 that depends on the T-bet transcription factor and express CD49a (ILC1a); and a population that expresses CD49a and CD49b (ILC1ab) and populates the salivary gland and the uterus, which is independent of the transcription factor Nfil3. My work aimed to understand the biology of NKp46 expressing ILC, as well as factor involved in their development, maturation and function. The major part of my work focuses on NKp46+ ILC3. First, we demonstrate a major role for the chemokine receptor CXCR6 in their localisation in the lamina propria villi (Satoh-Takayama et al. 2014). Second, I showed that NKp46+ ILC3 could lose NKp46 expression (Verrier et al. 2016). Induced by TGFβ, this loss of expression was associated with higher IL-22 production and by the acquisition of markers identifying LTi (CCR6, MHC-II), demonstrating NKp46+ ILC3 plasticity. Finally, in collaboration with Rachel Golub’s group, we confirmed a putative role for Notch-signaling in this plasticity (Chea et al. 2016). In this manuscript, I will discuss the development and the heterogeneity of ILC3, ILC1a, ILC1b and ILC1ab. All the results I generated support a dynamic vision of ILC biology, which reflects how they adapt in response to environmental cues. By characterizing the different actors involved in this dynamic process, my work could be used to design therapies aiming at controlling the equilibrium between these different populations in diverse pathologies such as cancer, viral infection, or intestinal diseases
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Rouis, Mustapha. "Regulation des recepteurs membranaires par les esters de phorbol : role de la proteine kinase c." Paris 6, 1987. http://www.theses.fr/1987PA066609.

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Abstract:
Caracterisation de la liaison du dibutyrate de phorbol, de la lipoproteine de basse densite (ldl) et de la somatomedine (ilas) sur les cellules de la lignee u 937 (premonocytes humains). Le tpa provoque une reduction du nombre de recepteurs des ldl et une baisse de l'affinite dans le cas des ilas. Le tpa provoque une phosphorylation rapide et reversible des antigenes hla (a,b,c). Etude de la differenciation de la lignee u937 en monocytes-macrophages par la vitamine d3 et l'acide retinoique par le dibutyril-ampc (dbampc). Mise en evidence d'une synergie d'action entre le tpa et l'ionophore de ca**(2+) a 23187 dans l'inhibition de la liaison de l'insuline. Les auteurs proposent l'hypothese de l'existence d'un "pool" de recepteurs endogenes et ont mis en evidence une translocation de la proteine kinase c du cytosol vers la membrane plasmique en presence du tpa
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Liu, Zhi-Jian. "The effects of calcium, short chain fatty acids and mammalian lignans on calcium transport, intracellular Ca²§+ and intracellular pH in the human colon tumor cells HCT-15." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 2000. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk1/tape4/PQDD_0020/MQ49776.pdf.

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Gourguillon, Lorène. "Etude de deux halophytes, Armeria maritima (Mill.) Willd. et Helichrysum stoechas (L.) Moench : exploration phytochimique, approche biotechnologique et valorisation dermo-cosmétique." Thesis, Strasbourg, 2017. http://www.theses.fr/2017STRAF039.

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Abstract:
L'étude phytochimique d'Armeria maritima et d'Helichrysum stoechas a permis d'isoler pour la première fois 31 molécules dans le genre Armeria dont 4 nouveaux flavonols diglycosylés, ainsi que le développement d'une stratégie de déréplication pour l'étude d'H. stoechas. Dans les deux espèces, nous avons relevé une richesse en polyphénols, qui pourraient être extraits par des techniques respectueuses de l'environnement comme la SFE. En parallèle, ces deux halophytes ont montré un fort potentiel biologique avec des extraits et des molécules dotés d'activités anti-oxydante, anti-collagénase, anti-inflammatoire ou encore cicatrisante. De plus, nous avons initié pour la première fois des suspensions cellulaires d'A. maritima et identifié des éliciteurs comme le méthyl jasmonate permettant d’augmenter dans les cellules d'H. stoechas la teneur en acide 3,5-dicaféoylquinique, un bio-marqueur de l'activité anti-inflammatoire. La production de molécules bioactives dans des cultures végétales in vitro pourrait par la suite être transposée à plus grande échelle, afin d’amplifier le potentiel de valorisation de ces deux halophytes en dermo-cosmétique<br>The phytochemical study of Armeria maritima and Helichrysum stoechas led to the isolation of 31 molecules never reported before in the genus Armeria, 4 of which being new flavonol diglycosides, and to the development of a dereplication strategy for the study of H. stoechas. In both species, an abundance of polyphenols was observed, which could be extracted with eco-friendly methods like SFE. Both halophytes showed a strong biological potential as their extracts and molecules demonstrated antioxidant, anti-collagenase, anti-inflammatory and wound healing activities. Moreover, we initiated for the first time cell suspensions of A. maritima, and identified elicitors, such as methyl-jasmonate, which led to H. stoechas cell suspensions with an increased content in 3,5-dicaffeoylquinic acid, a bio-marker of anti-inflammatory activity. The production of bioactive molecules in "plant cell factories" could be scaled-up to enhance the valorization potential of both halophytes in dermocosmetics
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Doglio, Alain. "Controle multi-hormonal de l'expression de genes impliques dans le processus de differenciation adipocytaire." Nice, 1987. http://www.theses.fr/1987NICE4122.

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Manon, Yannick. "Etude de milieux de culture complexes et évolutifs par développement de mesures physiques en ligne." Thesis, Toulouse, INSA, 2012. http://www.theses.fr/2012ISAT0015/document.

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Abstract:
Durant les cultures cellulaires en bioréacteur, la physiologie des micro-organismes et les paramètres physico-chimiques (alimentations en gaz et en substrat, agitation, température, pH, pression) interagissent très fortement. La spécificité des bioréactions microbiennes, en relation avec les couplages irréductibles entre les transferts de chaleur, de matière et de quantité de mouvement, réside dans la complexité (milieu triphasique) et la dynamique (bioréaction autocatalysé) de ces systèmes. L’objectif de ce travail est de progresser dans la compréhension et le contrôle dynamique des intéractions entre les aspects biologiques et les aspects physiques à différentes échelles (macro, micro et moléculaire) pour conduire la réaction biologique vers l’objectif défini (production de biomasse, de métabolites intra ou extra cellulaires, …) et l’optimiser. Les cellules (concentration, forme, dimension, physiologie, …) affectent fortement les propriétés physico-chimiques des moûts et par conséquent, les performances des bioprocédés (vitesses spécifiques, rendements, productivité). Le comportement rhéologique particulier du moût est souvent utilisé pour comprendre l’impact de la biomasse microbienne sur le rendement et les performances du bioprocédé.Dans ce travail, des cultures axéniques, définies comme des cultures pures de microorganismes unicellulaires procaryote et eucaryote, sont considérées. Notre approche s’appuie sur des mesures physiques et physico-chimiques en ligne et hors ligne réalisées sur un bioréacteur instrumenté, mesures qui sont mises en place de façon à respecter les conditions imposées par les contraintes biologiques propres aux microorganismes et à la stratégie de culture choisie. Des cultures d’Escherichia coli et d’Yarrowia. lipolytica, à taux de croissance controlé par l’apport de substrat, ont été réalisées dans une gamme de concentration allant de 0.1 à 100 g l-1. Le bilan qui peut être dressé pour ce travail, tant sur les aspects scientifiques que technologiques, est le suivant :- conception et réalisation d’un outil d’investigation original construit sur la base d’un bioréacteur (20 l) et pourvu d’une boucle de recirculation instrumentée pour la mesure,- identification hydrodynamique (courbes de frottement) de conduites calibrées permettant la viscosimétrie en ligne durant une culture cellulaire, - conception, développement et validation d’un code, LoCoPREL, permettant simultanément le contrôle de la culture cellulaire suivant une stratégie définie, la gestion de séquences de débit dans la boucle de dérivation et l’acquisition des données issues de l’instrumentation spécifique employée,- comparaison des mesures réalisées en ligne à débit constant ou selon des séquences de débit,- mise en évidence du comportement non newtonien des moûts et d’écarts entre les mesures en ligne et hors ligne,- analyse des mesures physiques réalisées en ligne et hors ligne, en lien avec les performances de la culture<br>During cell cultures in bioreactors, micro-organism physiology closely interacts with physico-chemical parameters such as gas and feed flowrates, mixing, temperature, pH, pressure. The specificity of microbial bioreactions in relation with irreductible couplings between heat and mass transfers and fluid mechanics, led into complex (three-phase medium) and dynamic (auto-biocatalytics reaction) systems. Our scientific approach aims to investigate, understand and control dynamic interactions between physical and biological systems at different scales (macro, micro and molecular) for molecules, strains and/or bioprocess innovation. Cells (concentration, shape, dimension, physiology…) strongly affect physico-chemical properties of broth. Then the modification of these characteristics interacts with bioprocess performances (specific rates, yields…) with an improvement or, more frequently, a decrease of yields. Among these properties, rheological behaviour is a strategy widely used to understand the impact of cells and the derivation of bioprocess performances.In this manuscript, axenic cultures, defined as cultures of a pure and unicellular Prokaryote and Eukaryote microorganisms in bioreactors, are considered. Our approach is based on physical and physico-chemical on-line and off-line measurements in respect with accurate and stringent conditions imposed by cell culture strategy. Escherichia coli and Yarrowia lipolytica cultures were investigated with a control of growth rate by carbon feed in the range from 0.1 up to 100 g l-1. Our scientific and technical actions and results led:- to design and realize an original pilot based on a bioreactor (20 l) with a derivation loop including a specific on-line rheometric device as well as additional physical and biological measurements,- to identify, from a hydrodynamic standpoint, the generalized friction curves of calibrated ducts enabling on-line viscosimetry during cell cultures,- to conceive and validate a homemade software, named LoCoPREL, enabling simultaneously to control cell cultures under defined strategy and to manage flow sequences within the derivation loop,- to discuss and compare on-line physical measurements under constant flow rate and various sequence strategy related to investigated shear-rates,- to highlight about the non-newtonian rheological behaviour of broths and the gap between on-line and off-line measurements,- to analyse on-line and off-line physical measurements in the light of biological performances during fed-batch cultures (mass balance, specific rate, yield)
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