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Dissertations / Theses on the topic 'Cellular plastic'
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1
Stone, Robert Michael 1957. "Shear modulii for cellular foam materials." Thesis, The University of Arizona, 1989. http://hdl.handle.net/10150/277020.
Full textAbstract:
The use of cellular foam as a core material in light-weight structural applications is of considerable interest. However, advances in this technology have been limited due to the lack of information concerning the macroscopic material behavior of cellular foams. Of particular interest in the design of composite structures is the shear modulus, G, of the core material, which must be established with a high degree of accuracy. Current ASTM test methods for shear modulus determination were researched and found inadequate for testing cellular foam materials. The difficulty in testing foam and the inaccuracies associated with the standard test methods established the need for the development of a test method for these materials. The test method (test fixture and test procedure) developed for cellular foam materials is presented. The design of the test fixture and the finite element analysis performed to determine fixture accuracy are discussed in detail. Additionally, the test procedure is presented, as well as the results for the 32 tests performed.
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Qian, Ming. "Coupled finite element and cellular automata simulations of plastic flow and microstructural evolution." Thesis, Queen Mary, University of London, 2007. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.445874.
Full text
3
Lin, Wing Shan Linda. "Effect of moisture and other volatiles on the cellular structure of plastic/wood-fiber composite foams." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 2001. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk3/ftp05/MQ63121.pdf.
Full text
4
Shen, Ninggang. "Microstructure prediction of severe plastic deformation manufacturing processes for metals." Diss., University of Iowa, 2018. https://ir.uiowa.edu/etd/6282.
Full textAbstract:
The objective of the research presented in this thesis has been to develop a physics-based dislocation density-based numerical framework to simulate microstructure evolution in severe plastic deformation (SPD) manufacturing processes for different materials. Different mechanisms of microstructure evolution in SPD manufacturing processes were investigated and summarized for different materials under dynamic or high strain rates over a wide temperature range. Thorough literature reviews were performed to clarify discrepancies of the mechanism responsible for the formation of nanocrystalline structure in the machined surface layer under both low-temperature and high-temperature conditions.
Under this framework, metallo-thermo-mechanically (MTM) coupled finite element (FE) models were developed to predict the microstructure evolution during different SPD manufacturing processes. Different material flow stress responses were modeled subject to responsible plastic deformation mechanisms. These MTM coupled FE models successfully captured the microstructure evolution process for various materials subjected to multiple mechanisms.
Cellular automaton models were developed for SPD manufacturing processes under intermediate to high strain rates for the first time to simulate the microstructure evolution subjected to discontinuous dynamic recrystallization and thermally driven grain growth. The cellular automaton simulations revealed that the recrystallization process usually cannot be completed by the end of the plastic deformation under intermediate to high strain rates. The completion of the recrystallization process during the cooling stage after the plastic deformation process was modeled for the first time for SPD manufacturing processes at elevated temperatures.
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Jardemyr, Pernilla, and Sally Touma. "Tillämpning av högpresterande isolering : PIR-isolering - ett effektivt isoleringsmaterial." Thesis, KTH, Byggteknik och design, 2013. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-136821.
Full textAbstract:
Högpresterande isolering är en typ av material som finns tillgängligt men inte används på den svenska marknaden i den utsträckning som de bör göra. I denna rapport kommer det högpresterande isoleringsmaterialet PIR att ligga i fokus och det jämförs främst med det traditionella isoleringsmaterialet cellplast men paralleller dras även till mineralullen. PIR- isoleringen har 40 % bättre värmekonduktivitet än cellplasten och detta innebär att materialet har bättre isoleringsförmåga som bidrar till tunnare konstruktioner. Isoleringen är därför idealiskt att använda för passiv-, lågenergi och nollenergihus. En annan egenskap som utmärker PIR- isoleringen är dess brandegenskaper som uppfyller en högre brandklass än cellplasten, trots att det är ett plastmaterial. PIR- isoleringen är ett dyrare material, dock sparas pengar in redan vid produktion då fukt- och vindskydd kan uteslutas i en konstruktion. Om högre energikrav ska uppfyllas kan pengar även sparas in på sikt genom lägre energikostnader.High performance insulation is a type of material that is available but has not been used at the Swedish market as it should have. In this rapport the high performance insulation material PIR will be the major subject. This material will be compared to the traditional insulation material cellular plastic; parallels will also be drawn to the mineral fiber. PIR- insulation has 40 % better thermal conductivity than the cellular plastic and means that the material has a better insulation ability, which leads to a thinner construction. This insulation is therefore ideal for use in passive-, low-energy- and zero-energy houses. Another property that makes PIR- insulation stand out is its fire resistant capacity which fulfill a higher fire class than the cellular plastic, despite that it also is a plastic material. PIR-insulation is a more expensive material; however, money can be saved during production when moisture and wind protection can be excluded. If a building has a higher energy requirement money can be saved over time trough lower energy costs.
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Tell, Emma, and Oskar Jansson. "Fuktproblem i putsade fasader : Enstegstätade ytterväggar utsatta för slagregn." Thesis, Mälardalens högskola, Akademin för ekonomi, samhälle och teknik, 2016. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:mdh:diva-32424.
Full textAbstract:
One purpose of this work was to examine if a modification of the exterior insulation finishing system can lower the number of outer walls damaged by damp. The modification is the cut of the cellular plastic which is 45 degrees instead of a horizontal cut. One other purpose was; is cellular plastic or mineral wool better as insulation to minimize the dampness in this type of outer walls? A third purpose was to examine if there is any difference of dampness in the outer walls if using a gravel bed or concrete stones next to the outer wall. To examine these three purposes a laboratory experiment with three test walls with an exterior insulation finishing system was built. The difference between the three walls was the insulation. One wall was built with mineral wool with a horizontal cut, one with cellular plastic with a horizontal cut and the third with cellular plastic with a cut of 45 degrees. Simulations of pelting rain and measurements of dampness were carried out for 21 days. The measurements were taken at the same time every evening. After 21 days small samples of tree from the walls was weight, dried in an oven and then weight again to get the quantity of moisture in the samples before they were dried. A diffusion calculation of two outer walls, one with cellular plastic and one with mineral wool, was completed to examine the difference between the relative humidity in the walls. An identical calculation without a plastic film was executed too. The result of the calculations showed a minimal difference in the walls built with a plastic film. When the film was removed the result presented critical values. The result of the laboratory experiment indicates that the test wall with the cut of 45 degrees is better than the walls with a horizontal cut of the insulation. The differences were minimal but possible to read. Some critical, too high, values regarding the moisture content in wood were found and they came from the sills in the walls that had insulation with horizontal cuts. Of the two insulation types the result of calculations and laboratory experiment shows a minimal difference but they both indicates a better result for the mineral wool. The conclusion of this work indicates that cellular plastic with a 45 degree cut is slightly better than the horizontal cut. The comparison of cellular plastic and mineral wool indicates that the mineral wool is better. Another conclusion of this work is that the material on the ground next to the outer wall did not alter the dampness in the wall.
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Lee, Delphine Juihoa. ""Naked" plasmid DNA vaccines : cellular roles and applications /." Diss., Connect to a 24 p. preview or request complete full text in PDF format. Access restricted to UC campuses, 1999. http://wwwlib.umi.com/cr/ucsd/fullcit?p9944207.
Full text
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Maple, Jodi. "The molecular and cellular characterisation of plastid division proteins in Arabidopsis." Thesis, University of Leicester, 2005. http://hdl.handle.net/2381/29732.
Full textAbstract:
In plants an integral part of chloroplast development is division, as they are not created de novo but arise by binary fission from pre-existing plastids in the cytosol. Because of plastids prokaryotic origin bacterial cell division has been successfully used as a paradigm for plastid division. This has resulted in the identification of the key plastid division components Ftsz, MinD and MinE. Recent efforts in the cloning of the disrupted loci in several of the accumulation and replication of chloroplasts mutants has further revealed that the division of plastids is controlled by a combination of prokaryote-derived and host eukaryote-derived proteins residing not only in the plastid stroma but also in the cytoplasm. Despite the recent characterisation of several new plastid division components very little is known about how these components function to bring about the event of chloroplast division. This study aims to increase our understanding of the chloroplast division processes through the identification of new components and the detailed functional analysis of known stromal chloroplast division components. The identification of GIANT CHLOROPLAST 1 (GC1), a new nuclear-encoded protein essential for correct plastid division in Arabidopsis, is described, in addition to the use of yeast-two hybrids screens to identify novel plastid division components. Furthermore potential protein-protein interactions between all known stromal plastid division proteins are analysed using a combination of techniques and an intraplastidic protein-protein interaction map of plastid division proteins in Arabidopsis is presented. Based on data derived from this Map one stromal plastid division component, AtMinE1, is analysed in further detail to begin to dissect the mechanism by which the Min proteins function in Arabidopsis to mediate the correct placement of the division site.
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Punyamurthula, Deepthi. "Structural performance of low-profile FRP composite celluar modules." Morgantown, W. Va. : [West Virginia University Libraries], 2005. https://etd.wvu.edu/etd/controller.jsp?moduleName=documentdata&jsp%5FetdId=3815.
Full textAbstract:
Thesis (M.S.)--West Virginia University, 2005Title from document title page. Document formatted into pages; contains xi, 91 p. : ill. (some col.) Includes abstract. Includes bibliographical references (p. 83-85).
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Salje, Jeanne Sophie. "A molecular and cellular study of the ParMRC plasmid partition system." Thesis, University of Cambridge, 2010. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.608678.
Full text
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Yasuda, Kei. "Plasmid DNA uptake and subsequent cellular activation mechanisms in cultured mouse macrophages." 京都大学 (Kyoto University), 2003. http://hdl.handle.net/2433/149188.
Full text
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Ma, Qianqian. "FUNCTIONAL INTERACTION ANALYSIS OF CHLOROPLAST TWIN ARGININE TRANSLOCATION (CPTAT) PATHWAY AND ITS ROLE IN PLASTID DEVELOPMENT." Miami University / OhioLINK, 2016. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=miami1477671264917956.
Full text
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Daher, Zeina. "Implication des plastes de racines dans la symbiose mycorhizienne à arbuscules : caractérisation cellulaire et moléculaire." Dijon, 2009. http://www.theses.fr/2009DIJOS021.
Full textAbstract:
Malgré l'importance reconnue des plastes non photosynthétiques dans un large éventail de processus métaboliques, l’implication des plastes de racines dans la symbiose mycorhizienne à arbuscules (SMA) reste encore à explorer. Dans les racines de M. Truncatula, nous avons identifié par microscopie électronique, quatre types principaux de plastes dans les cellules corticales avec une prédominance des amyloplastes. Lorsque les cellules corticales sont envahies par le champignon MA, elles présentent une prolifération des plastes « sans membrane interne » et à « membrane interne tubulaire ». Le métabolisme plastidial est impliqué dans la synthèse de mycoradicine, dont l’accumulation a été mesurée dans les racines mycorhizées et s’est avérée concomitante avec l’augmentation du taux d’arbuscules. L’étude du protéome de ces plastes s’est avérée indispensable et nous a permis grâce à la technique de la GeLC-MS/MS d’établir le premier répertoire d’un plastidome de racines. La comparaison qualitative des plastidomes de racines mycorhizées ou non a mis en évidence 29 protéines potentiellement plastidiales détectées induites ou sur-accumulées en réponse à la SMA. Ces protéines participent pour leur grande majorité aux métabolismes des a. G. Et a. A. La stimulation du métabolisme des lipides dans les racines mycorhizées conforte les résultats des observations ultrastructurales : l’existence d’un basculement du métabolisme des hydrates de carbone vers un métabolisme lipidique plus prononcé. Les plastes sont des organites clefs dans le maintien d’une SMA fonctionnelleDespite the recognized importance of non-photosynthetic plastids in a wide array of plant processes, root plastids involvement in arbuscular mycorrhizal symbiosis (AMS) remains to be explored. Using electronic microscopy, we have clearly identified in cortical cells of M. Truncatula roots four main types of plastids with a predominance of amyloplasts. Whereas AM-colonized cortical cells had a proliferation of plastids without internal membrane and plastids with internal tubular membrane at the expense of amyloplasts. The metabolism of these plastids is involved in the synthesis of mycorradicin that we measure accumulation by HPLC in mycorrhizal roots. The latter accumulation is concomitant with the increase of arbuscules. The study of the root plastid proteome then proved fundamental allowing us using GeLC-MS/MS, to establish the first repertory of a root plastidome. These new candidates might play a role in the sentinel function that plastids may use in plants versus biotic and abiotic stress. The qualitative comparison of non-/mycorrhizal root plastidomes highlighted 29 plastid proteins identified as induced or up-regulated in response to the AMS. These proteins are involved for their great majority in fatty acid and amino acid metabolism. The stimulation of lipid metabolism in mycorrhizal roots confirms the results of our ultrastructural observations for existence of a shift of the metabolism of carbohydrates to a more pronounced lipid metabolism. Plastids are key organelles for maintaining functional AMS
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Svensson, Michelle. "Life cycle assessment of the semidetached passive house "Röda lyktan" in northern Sweden : A comparison between the construction phase and the use phase." Thesis, Mittuniversitetet, Institutionen för teknik och hållbar utveckling, 2013. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:miun:diva-19559.
Full textAbstract:
This report is a life cycle assessment of a relatively newly built semidetached passive house/low energy house located in Östersund/Jämtland. The analysis concentrates on the building materials in the construction phase and the energy in the use phase for 50 years. The construction phase include frame, foundation, interior and exterior walls, ceiling and roof, middle floor structure, floor coverings, interior and exterior doors, windows, interior staircase with banisters, stove and FTX-ventilation system. The inventory to obtain the volume of each material has been made with the help of blueprints and interviews. The inventory of the use phase has been made using measurements from a parallel study by Itai Danielski of the energy use in the house (Danielski, Svensson & Fröling, 2013). The database Ecoinvent has been used to get a result for the volume and energy values. The inventory data is allocated and the characterization methods GWP, CED (cumulative energy demand) and USEtox are used. The aim of this study was to compare the construction phase with the use phase to see which phase that has the highest energy values and environmental impact. Another goal was to examine which materials in the construction phase that has the highest embodied energy and environmental impact. The result shows that in a comparison between the construction phase and the use phase, and when considering the parameters included in this study, the use phase has the highest values for global warming potentials (around 54 %), cumulative energy demand (around 80 %), ecotoxicity (around 56 %), human non-carcinogenic toxicity (around 77 %) and total human toxicity (around 75 %). The construction phase has the highest values for human carcinogenic toxicity (around 57 %). Even if the use phase has the highest values in most categories the construction phase also has high values. As buildings become more energy efficient and with increasing use of renewable energy, the construction phase becomes more important from an environmental perspective. This means that the material choices which are made in passive houses become increasingly important if passive houses should be considered to be environmentally friendly also in the future. The study also shows that the FTX-ventilation system, some of the insulation materials (with cellular plastic sheets and rock wool in top), metals (with sheet metal roofing of steel in top), glued laminated timber and wood fiber boards have some of the highest values of environmental impact and the highest embodied energy. These materials should in future buildings be considered, if possible, to be replaced with materials with less environmental impact.Den här rapporten är en livscykelanalys av ett relativt nybyggt passivhus/lågenergihus som också är ett parhus (ett hus delat i två separata lägenheter) beläget i Östersund/Jämtland. Analysen koncentrerar sig på byggnadsmaterialen i konstruktionsfasen och energin i användningsfasen under 50 år. Konstruktionsfasen inkluderar stomme, grund, inner- och ytterväggar, inner- och yttertak, mellanbjälklag, golvbeklädnader, inner- och ytterdörrar, fönster, invändig trappa med trappräcke, kamin och FTX-ventilationssystem. Inventeringen för att få fram volymen på varje material har gjorts med hjälp av ritningar och intervjuer. Inventeringen av användningsfasen har gjorts med hjälp av mätvärden från en parallell studie av Itai Danielski på energianvändningen i huset (Danielski, Svensson & Fröling, 2013). Databasen Ecoinvent har sedan använts för att få fram ett resultat för volym- och energivärdena. Inventeringsdatan är allokerad och karaktäriseringsmetoderna GWP (globalt uppvärmingspotential), CED (kumulativt energibehov) och USEtox (toxicitet) har använts. Målet med studien är att jämföra konstruktionsfasen med användningsfasen för att kunna se vilken fas som har högst energivärden och miljöpåverkan. Målet är också att undersöka vilka material i konstruktionsfasen som har högst förkroppsligad energi och miljöpåverkan, i syftet att eventuellt kunna byta ut vissa material till miljövänligare alternativ, för att få ett miljövänligare hus i framtida liknande byggnationer. Resultaten visar att i en jämförelse mellan konstruktionsfasen och användningsfasen, och med hänsyn till de parametrar som ingår i studien, att användningsfasen har de högsta värdena för globalt uppvämingspotential (runt 54 %), kumulativt energibehov (runt 80 %), ekotoxicitet (runt 56 %), human icke-cancerogen toxicitet (runt 77 %) och total human toxicitet (runt 75 %). Konstruktionsfasen har högst värden för human cancerogen toxicitet (runt 57 %). Även om användningsfasen har högst värden i de flesta kategorierna så har även konstruktionsfasen höga värden. Ju mer energieffektiva husen blir och med en ökad användning av energi från förnyelsebara källor, desto viktigare blir konstruktionsfasen ur ett miljöperspektiv. Det betyder att materialvalen som görs i huset blir väldigt viktiga om passivhus ska fortsätta anses som miljövänliga även i framtiden. Denna studie visar också att FTX-ventilationssystemet, några av isoleringsmaterialen (med cellplasten och stenullen i topp), metallerna (med plåttaket av stål i topp), limträbalkar och träfiberskivor har några av de högsta värdena av miljöpåverkan och den högsta förkroppsligade energin. Dessa material borde i framtida byggnationer övervägas att om möjligt ersättas med andra material med mindre miljöpåverkan.
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Stadler, Eva Maria [Verfasser], Johannes [Akademischer Betreuer] Müller, Pierre [Gutachter] Magal, Daniel [Gutachter] Matthes, and Johannes [Gutachter] Müller. "Transport equations and plasmid-induced cellular heterogeneity / Eva Maria Stadler ; Gutachter: Pierre Magal, Daniel Matthes, Johannes Müller ; Betreuer: Johannes Müller." München : Universitätsbibliothek der TU München, 2019. http://d-nb.info/1181946859/34.
Full text
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EL, SHAMI MAHMOUD. "Etude de la division plastidiale chez les plantes superieures : analyse de l'expression des genes ftsz au cours du cycle cellulaire de cellules by2 de nicotiana tabacum." Université Joseph Fourier (Grenoble), 2000. http://www.theses.fr/2000GRE10146.
Full textAbstract:
Durant le cycle cellulaire des cellules vegetales, les organites comme les mitochondries et les plastes, doivent se diviser pour etre transmis aux cellules filles. Du fait de la complexite des organismes multicellulaires, nous n'avons que tres peu d'informations en ce qui concerne le controle de la division de ces organelles. La proteine bacterienne ftsz, l'ancetre de la tubuline, a ete impliquee a la fois dans la division des proplastes dans les cellules en division, et dans la division des chloroplastes dans les cellules differenciees. Nous avons utilise les cellules hautement synchronisables de tabac (by2), afin d'analyser l'expression des genes ftsz dans des cultures non-synchronisees et synchronisees. Dans ce but, nous avons tout d'abord caracterise 5 adnc codant pour cette proteine dans le tabac. Ensuite grace a une sonde specifique de la famille ftsz1 codant les proteines adressees dans les plastes, ainsi que d'un anticorps ne detectant que cette proteine, nous montrons une expression constitutive des genes de cette famille dans les cellules non-synchronisees, quelle que soit la phase de culture consideree. Cette expression est en accord avec la division plastidiale a la fois dans les cellules en expansion et dans les cellules en division. Par contre, le profil d'expression dans les cellules synchronisees, avec une faible expression durant la phase s et une augmentation durant la phase g2, culminant avec les cellules en mitose, suggere que la division plastidiale est couplee au cycle cellulaire par la regulation du gene ftsz.
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Kumar, Neela Shiva. "Cellular Mechanisms of Gravitropism in ARG1 (Altered Response to Gravity) Mutants of Arabidopsis Thaliana." Oxford, Ohio : Miami University, 2008. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc%5Fnum=miami1218220626.
Full text
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Goda, Ibrahim. "Micromechanical models of network materials presenting internal length scales : applications to trabecular bone under stable and evolutive conditions." Thesis, Université de Lorraine, 2015. http://www.theses.fr/2015LORR0055/document.
Full textAbstract:
Des méthodes micromécaniques spécifiques ont été développées pour la détermination du comportement effectif de matériaux cellulaires dotés d’une architecture discrète à l’échelle microscopique. La méthode d’homogénéisation discrète a été appliquée à des structures tissées monocouches ainsi qu’à l’os trabéculaire. La topologie discrète initiale de ces milieux est remplacée à l’échelle mésoscopique par un milieu effectif anisotrope micropolaire, qui rend compte des effets d’échelles observés. Ces méthodes d’homogénéisation permettent d’accéder à des propriétés classiques et non classiques dont la mesure expérimentale est souvent difficile. Des modèles 3D ont été développé afin de décrire la rupture fragile et ductile de l’os trabéculaire, incorporant des effets de taille des surfaces d’écoulement plastique. Nous avons construit par des analyses éléments finis de la microstructure de l’os trabéculaire un milieu de substitution 3D homogène, orthotrope de type couple de contraintes, sur la base d’une équivalence en énergie. Les tissus osseux ont la capacité d’adapter leur densité locale et leur taille et forme aux stimuli mécaniques. Nous avons développé des modèles de remodelage interne et externe dans le cadre de la thermodynamique des processus irréversibles, aux échelles cellulaire et macroscopique. Finalement, le remodelage interne anisotrope a été couplé à l’endommagement de fatigue, dans le cadre de la théorie continue de l’endommagementA methodology based on micromechanics has been developed to determine the effective behavior of network materials endowed with a discrete architecture at the microscopic level. It relies on the discrete homogenization method, which has been applied to textile monolayers and trabecular bones. The initially discrete topology of the considered network materials results after homogenization at the mesoscopic level in anisotropic micropolar effective continuum, which proves able to capture the observed internal scale effects. Such micromechanical methods are useful to remedy the difficulty to measure the effective mechanical properties at the intermediate mesoscopic level scale. The bending and torsion responses of vertebral trabecular bone beam specimens are formulated in both static and dynamic situations, based on the Cosserat theory. 3D models have been developed for describing the multiaxial yield and brittle fracture behavior of trabecular bone, including the analysis of size-dependent non-classical plastic yield. We have constructed by FE analyses a homogeneous, orthotropic couple-stress continuum model as a substitute of the 3D periodic heterogeneous cellular solid model of vertebral trabecular bone, based on the equivalent strain energy approach. Bone tissues are able to adapt their local density and load bearing capacities as well as their size and shape to mechanical stimuli. We have developed models for combined internal and external bone remodeling in the framework of the thermodynamics of irreversible processes, at both the cellular and macroscopic levels. We lastly combined anisotropic internal remodeling with fatigue continuum damage
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Rollman, Erik. "Concepts in DNA immunization : overcoming viral diversity and enhancing plasmid immunogenicity /." Stockholm, 2004. http://diss.kib.ki.se/2004/91-7349-943-9/.
Full text
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Raynaud, Cécile. "Relations entre cycle cellulaire et division des plastes : caractérisation des gènes AtSulA, AtCDT1a/b et ATXR5/6." Paris 11, 2005. http://www.theses.fr/2005PA112087.
Full textAbstract:
Les plastes sont des organites indispensables à la survie des cellules végétales. Ils dérivent d'un évènement d'endosymbiose entre une cellule hôte et une bactérie, sans doute proche des cyanobactéries actuelles. De ce fait, les cellules ne les synthétisent pas de novo : ils se multiplient par fission binaire, grâce à un échaffaudage protéique complexe appelé anneau de division des plastes. A chaque mitose, le nombre de plastes est divisé par deux. De plus, il existe dans les cellules de parenchyme, une corrélation nette entre la taille et la ploidie de la cellule, et le nombre de plastes qu'elle contient. Il paraît donc vraisemblable qu'il existe un couplage entre la division des plastes et prolifération cellulaire d'une part, et division des plastes et endoréplication d'autre part. Au cours de ma thèse, j'ai cherché à vérifier cette hypothèse par une approche gène candidat chez Arabidopsis. Nous avons combiné deux approches : la recherche d'homologues de régulateurs de la division bactérienne dans le génome d'Arabidopsis, et l'étude de gènes déjà connus pour réguler le cycle cellulaire et présentant des signaux d'adressage aux plastes. La première approche nous a permis d'identifier une nouvelle protéine participant à la division des plastes. La seconde nous a permis d'aboutir à la conclusion qu'il existe bien un couplage entre division des plastes et cycle cellulaire, et qu'il se situe au moment de l'initiation de la réplication de l'ADN nucléaire, ce qui permet d'expliquer à la fois le maintien du nombre de plastes dans des cellules en prolifération, et l'augmentation du nombre de plastes au cours de l'endoréplicationPlastids are indispensable to plant cell survival because a large number of metabolic pathways take place in them. These organelles originated from an endosymbiosis between a host cell and a cyanobacteria. Therefore, plants do not synthetise plastids de novo : they proliferate by binary fission. The mechanism of plastid division is closely related to that of bacterial cell division but its regulation is poorly understood. Mitosis results in a two-fold decrease in plastid number. Moreover, plastid number in mesophyll cells correlates with cell size and cell ploidy. Plastid division and cell cycle are thus likely to be coordinated. To investigate this, and to analyse the underlying molecular mechanism, we caracterised the function of three Arabidopsis genes. The first was chosen on the basis of its sequence similarity with a bacterial cell division inhibitor. The others were analysed because they are known to play a role in cell cycle regulation, and harbour plastid targeting sequences. The first approach allowed us to identify a new plastid division protein. The second led us to the conclusion that cell cycle and plastid division are indeed coordinated, and that the link between the two processes could occur at the G1/S transition. This hypothesis accounts both for the maintain of plastid number in proliferating cells, and for the increase in plastid number in endoreduplicating cells
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Bertheuil, Nicolas. "Le tissu adipeux : approfondissement des connaissances fondamentales du tissu et de son compartiment vasculaire stromal, intérêt clinique pour la chirurgie plastique." Thesis, Rennes 1, 2017. http://www.theses.fr/2017REN1B051/document.
Full textAbstract:
L’objectif de cette thèse était d’améliorer les connaissances fondamentales sur le tissu adipeux, organe qui est au cœur de la pratique des chirurgiens plasticiens. En effet, ce tissu peut être transplanté de façon autologue afin de combler une perte de substance (rôle volumateur des adipocytes) mais également servir à des fins de régénération tissulaire en lien avec les cellules de la fraction vasculaire stromale (FVS) et tout particulièrement des cellules stromales mésenchymateuses (CSM). Ces cellules s’obtiennent après lipoaspiration du tissu par une digestion enzymatique de la graisse obtenue. Il s’avère que les connaissances disponibles sur ces CSM sont essentiellement issues d’études in vitro après une phase de culture cellulaire plus ou moins longue et ainsi les propriétés in vivo sont mal connues. Ce travail a donc consisté à caractériser l’hétérogénéité du compartiment stromal natif du tissu adipeux obtenu après digestion enzymatique. Nous avons isolé deux populations stromales natives distinctes : les ASC (CD34+), en grande majorité, et des cellules péricytaires (CD146+). Ces 2 types cellulaires différaient dans leurs phénotypes, leurs potentiels de clonogénécité et leurs propriétés immunomodulatrices in vitro et in vivo. Nous avons ensuite comparé la digestion enzymatique du tissu aux techniques de digestion mécanique utilisable au sein de nos blocs opératoires. Nous avons démontré que ces nouvelles techniques permettaient bien de produite les cellules de la FVS dont des CSM, cellules particulièrement intéressante pour des gestes de régénération tissulaire. De plus, l’ensemble des techniques de laboratoire acquise au cours de ce travail nous ont permis d’investiguer le rôle des techniques de lipoaspiration utilisé en chirurgie plastique sur le tissu adipeux. Nous avons démontré par cytométrie de flux et par immunofluorescence in situ qu’une partie de la trame microvasculaire était conservée. L’ensemble de ces résultats viennent s’ajouter aux données cliniques démontrant que la lipoaspiration du tissu est un geste permettant d’être plus conservateur pour le tissu et pourrait expliquer des taux de complications moindre après chirurgie de contour de la silhouetteThe aim of this work was to improve the knowledge on adipose tissue, organ that is at the heart of the practice of plastic surgeons. Indeed, this tissue can be transplanted autologously in order to fill a defect (volumizing role of the adipocytes) but also to be used for tissue regeneration in connection with the cells of the stromal vascular fraction (SVF) and especially the mesenchymal stromal cells (MSCs). These cells are obtained after liposuction of the tissue by enzymatic digestion of the extracellular matrix. It turns out that the knowledge available on these CSM is essentially derived from in vitro studies after a cell culture phase and thus the in vivo properties are poorly known. This work consisted in characterizing the heterogeneity of the native stromal compartment of adipose tissue obtained after enzymatic digestion. We isolated two distinct native stromal populations: the ASC (CD34 +), for the most part, and the pericyte cells (CD146 +). These 2 cell types differed in their phenotypes, their clonogenecity potentials and their immunomodulatory properties in vitro and in vivo. We then compared the enzymatic digestion of the tissue with the techniques of mechanical digestion usable within our operating room. We have demonstrated that these new techniques made it possible to produce the cells of the FVS including MSC, cells particularly interesting for regenerative surgery. In addition, all the laboratory techniques acquired during this work allowed us to investigate the role of liposuction techniques used in plastic surgery on adipose tissue. We have demonstrated by flow cytometry and confocal microscopy, that part of the microvasculature framework is conserved after liposuction. All of these results are in addition to clinical data demonstrating that liposuction of the tissue is a gesture to be more conservative for the tissue and could explain lower rates of complications after contour surgery
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Runge, Roswitha, Liane Oehme, Jörg Kotzerke, and Robert Freudenberg. "The effect of dimethyl sulfoxide on the induction of DNA strand breaks in plasmid DNA and colony formation of PC Cl3 mammalian cells by alpha-, beta-, and Auger electron emitters 223Ra, 188Re, and 99mTc." Saechsische Landesbibliothek- Staats- und Universitaetsbibliothek Dresden, 2017. http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bsz:14-qucosa-214821.
Full textAbstract:
BACKGROUND:
DNA damage occurs as a consequence of both direct and indirect effects of ionizing radiation. The severity of DNA damage depends on the physical characteristics of the radiation quality, e.g., the linear energy transfer (LET). There are still contrary findings regarding direct or indirect interactions of high-LET emitters with DNA. Our aim is to determine DNA damage and the effect on cellular survival induced by (223)Ra compared to (188)Re and (99m)Tc modulated by the radical scavenger dimethyl sulfoxide (DMSO).
METHODS:
Radioactive solutions of (223)Ra, (188)Re, or (99m)Tc were added to either plasmid DNA or to PC Cl3 cells in the absence or presence of DMSO. Following irradiation, single strand breaks (SSB) and double strand breaks (DSB) in plasmid DNA were analyzed by gel electrophoresis. To determine the radiosensitivity of the rat thyroid cell line (PC Cl3), survival curves were performed using the colony formation assay.
RESULTS:
Exposure to 120 Gy of (223)Ra, (188)Re, or (99m)Tc leads to maximal yields of SSB (80 %) in plasmid DNA. Irradiation with 540 Gy (223)Ra and 500 Gy (188)Re or (99m)Tc induced 40, 28, and 64 % linear plasmid conformations, respectively. DMSO prevented the SSB and DSB in a similar way for all radionuclides. However, with the α-emitter (223)Ra, a low level of DSB could not be prevented by DMSO. Irradiation of PC Cl3 cells with (223)Ra, (188)Re, and (99m)Tc pre-incubated with DMSO revealed enhanced survival fractions (SF) in comparison to treatment without DMSO. Protection factors (PF) were calculated using the fitted survival curves. These factors are 1.23 ± 0.04, 1.20 ± 0.19, and 1.34 ± 0.05 for (223)Ra, (188)Re, and (99m)Tc, respectively.
CONCLUSIONS:
For (223)Ra, as well as for (188)Re and (99m)Tc, dose-dependent radiation effects were found applicable for plasmid DNA and PC Cl3 cells. The radioprotection by DMSO was in the same range for high- and low-LET emitter. Overall, the results indicate the contribution of mainly indirect radiation effects for each of the radionuclides regarding DNA damage and cell survival. In summary, our findings may contribute to fundamental knowledge about the α-particle induced DNA damage.
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Iratni, Rabah. "Régulation de l'expression de l'opéron ribosomique rrn des plastes d'épinard." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1994. http://www.theses.fr/1994GRE10229.
Full textAbstract:
L'analyse de la repartition des transcrits de l'arnr16s de plastes d'epinard a permis d'observer une accumulation preferentielle de ces transcrits dans les cotyledons (organes photosynthetiques) par rapport aux racines (organes non photosynthetiques). Cette expression variable suivant les organes de la plante a pu etre associee a la presence de transcrits alternatifs inities au niveau des sites d'initiation de transcription pc et parnt-16s. Alors que parnt-16s est constitutivement represente, le transcrit pc est associe aux organes photosynthetiques. L'expression de l'arnr16s au niveau du site pc ne demarre qu'au 5#e#m#e jours de germination, juste avant l'apparition des cotyledons. Le site d'initiation de transcription pc est localise entre deux sites promoteurs p1 et p2 qui presentent de fortes homolgies avec les promoteurs procaryotiques. L'arn polymerase de e. Coli initie correctement la transcription in vitro au niveau de ces 2 sites. In vivo, seul le site pc est utilise ; p1 et p2 ne sont pas utilises en depit de l'existence de l'arn polymerase chloroplastique de type e. Coli. Dans la deuxieme partie de ce travail, nous avons donc etudie les mecanismes regulant l'expression du 16s au niveau du site pc. Deux complexes nucleoproteiques cl et cs se formant entre la region promotrice du 16s et des proteines chloroplastiques ont ete identifies. Le complexe cs resulte de la fixation des proteines cdf2 (baeza et coll. , 1991). Le complexe cl resulte de la fixation concomitante de l'arn polymerase plastidiale de type e. Coli et des proteines cdf2 sur le promoteur de l'arnr16s. Complexee aux proteines cdf2, cette polymerase ne transcrit pas le 16s au niveau des promoteurs p1 et p2. La transcription de l'arnr 16s au niveau du site pc serait probablement assuree par la polymerase plastidiale monomerique d'origine nucleaire. Le role probable de facteurs d'initiation ou d'activateurs de transcription par cette polymerase, pour les proteines cdf2 est discute
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Franche, Antoine. "Amphiphiles azobenzéniques : potentiel et relations structure-activité pour la lyse cellulaire." Thesis, Compiègne, 2019. http://www.theses.fr/2019COMP2523.
Full textAbstract:
L’émergence de souches bactériennes et fongiques de plus en plus résistantes à la désinfection est un problème qui menace le développement et la santé humaine à travers le monde. Parmi les modes d’action possibles de ces traitements, notre intérêt va se porter sur les interactions avec la membrane plasmique dans le but de lyser le micro-organisme. Le premier objectif de cette thèse est donc de développer des molécules avec une structure amphiphile afin d’interagir avec ces membranes. Les azobenzènes sont intéressants à ce titre car leurs deux groupements phényles constituent déjà un squelette carboné apolaire. Le greffage d’une tête polaire sur ces molécules permettra donc de leur conférer des propriétés amphiphiles. Trois familles d’azobenzènes ont été synthétisées afin d’évaluer leurs propriétés antibactériennes et antifongiques. Un autre objectif de la thèse est de fournir les premières hypothèses sur le mode d’action des antibactériens synthétisés. Plus particulièrement, leur capacité à interagir avec des membranes plasmiques biomimétiques de bactéries a été évaluée. La première famille (AzoOH) comportant un groupement hydroxyle comme tête polaire a montré de bonnes propriétés biologiques mais une faible capacité à interagir avec les membranes plasmiques. La seconde famille (AzoPEG), avec une tête polaire de type triéthylène glycol a montré de médiocres activités biologiques, et une capacité à interagir avec les membranes plasmiques n’ont pas été améliorées. La troisième famille (AzoTAI) avec une tête polaire de type triméthylammonium a montré d’excellentes propriétés biologiques, une capacité à s’adsorber aux interfaces hydrophiles/hydrophobes et une interaction spécifique avec les lipides membranaires bactériens. L’interaction entre les AzoTAI à plus longue chaîne (6 carbones) et la phosphatidylethanolamine est particulièrement favorable. De manière globale, parmi les composés synthétisés, seule la famille des AzoTAI est capable d’interagir avec la membrane plasmique des bactéries et cette interaction est corrélée à l’activité antibactérienne. Néanmoins, même si ces composés constituent de bons candidats pour la lyse des microorganismes, leur activité cytotoxique vis-à-vis des cellules humaines pourrait limiter leurs applications dans le domaine médicalThe emergence of bacterial and fungal strains more and more resistant to disinfection is a threat to the development of nations and human health around the world. Amongst the mechanism of action, we will focus on the interaction between the molecule and the plasmic membrane for the lysis of the microorganism. The first goal of this work is to synthetize amphiphilic molecules to interact with bacterial membrane Azobenzene are interesting because their two phenyl group give them an apolar moiety, the next step is a grafting of a polar head to make them become an amphiphile molecule. Three types of azobenzene were synthetized to evaluate their antibacterial properties and their antifungal properties. The second goal of this work is tounderstand how they interact with the plasmic membranes. To perform this, we tested the azobenzenes on biomimetic models of plasmic membranes. The first group of compounds (AzoOH) with an alcohol group as polar head showed good biological properties but have a poor potential to interact with plasmic membrane. The second group of compounds (AzoPEG) with a triethylene-glycol type polar head have mediocre biological activities, and their ability to interact with the membrane were not enhanced. The third group of compounds (AzoTAI) with a trimethylammonium type polar head showed very good biological activities, and strong interaction with bacterial membrane lipid. These antibacterial activities are correlated to their interaction with bacterial lipids. It also has good abilities to adsorb themselves to hydrophilic/hydrophobic interfaces. However, their cytotoxic activity on human cells can be a severe drawback with their use
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Bligny, Muriel. "Caractérisation d'une ARN polymérase d'origine nuléaire (NEP) dans les plastes d'épinard." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1999. http://www.theses.fr/1999GRE10055.
Full textAbstract:
Nous avons aborde la caracterisation du systeme transcriptionnel plastidial nep grace a une approche in vitro utilisant le promoteur de l'operon plastidial rrn, pc, et des extraits plastidiaux contenant la nep. Dans un premier temps, nous avons verifie que le promoteur pc, utilise dans les chloroplastes d'epinard, est un promoteur nep. Nous avons ensuite separe et caracterise trois activites transcriptionnelles a partir d'extraits chloroplastiques d'epinard partiellement purifies, et en grande partie grace a la mise au point d'un systeme de transcription in vitro. La premiere correspond a la pep. La seconde, appelee nep-2, reconnait le promoteur pc in vitro et la troisieme, ou nep-1, pourrait etre une arnp de 110 kda de type phagique codee par un gene rpot. En ce qui concerne la nep-2, nous avons observe qu'elle n'est pas inhibee par la tagetitoxine tandis qu'elle l'est partiellement par la rifampicine a une concentration elevee d'une part, et d'autre part, qu'elle semble reconnaitre le promoteur t7. Nous en avons deduit que la nep-2 est probablement une arnp de type phagique. Le fait que la nep-1 pourrait elle aussi etre une arnp de type phagique resulte des observations suivantes : elle est reconnue par un anticorps dirige contre une proteine deduite d'un gene rpot, son poids moleculaire apparent est de 110-120 kda et le test alpa montre qu'elle a les proprietes d'une arnp. Ainsi, non pas une, mais deux arnps de type phagique pourraient partager la transcription du genome plastidial avec la pep ! enfin, nous avons demontre que cdf2 est un facteur d'initiation de la transcription conferant a la nep-2 la capacite de reconnaitre specifiquement le promoteur pc.
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Runge, Roswitha, Liane Oehme, Jörg Kotzerke, and Robert Freudenberg. "The effect of dimethyl sulfoxide on the induction of DNA strand breaks in plasmid DNA and colony formation of PC Cl3 mammalian cells by alpha-, beta-, and Auger electron emitters 223Ra, 188Re, and 99mTc." Springer, 2016. https://tud.qucosa.de/id/qucosa%3A30005.
Full textAbstract:
BACKGROUND:
DNA damage occurs as a consequence of both direct and indirect effects of ionizing radiation. The severity of DNA damage depends on the physical characteristics of the radiation quality, e.g., the linear energy transfer (LET). There are still contrary findings regarding direct or indirect interactions of high-LET emitters with DNA. Our aim is to determine DNA damage and the effect on cellular survival induced by (223)Ra compared to (188)Re and (99m)Tc modulated by the radical scavenger dimethyl sulfoxide (DMSO).
METHODS:
Radioactive solutions of (223)Ra, (188)Re, or (99m)Tc were added to either plasmid DNA or to PC Cl3 cells in the absence or presence of DMSO. Following irradiation, single strand breaks (SSB) and double strand breaks (DSB) in plasmid DNA were analyzed by gel electrophoresis. To determine the radiosensitivity of the rat thyroid cell line (PC Cl3), survival curves were performed using the colony formation assay.
RESULTS:
Exposure to 120 Gy of (223)Ra, (188)Re, or (99m)Tc leads to maximal yields of SSB (80 %) in plasmid DNA. Irradiation with 540 Gy (223)Ra and 500 Gy (188)Re or (99m)Tc induced 40, 28, and 64 % linear plasmid conformations, respectively. DMSO prevented the SSB and DSB in a similar way for all radionuclides. However, with the α-emitter (223)Ra, a low level of DSB could not be prevented by DMSO. Irradiation of PC Cl3 cells with (223)Ra, (188)Re, and (99m)Tc pre-incubated with DMSO revealed enhanced survival fractions (SF) in comparison to treatment without DMSO. Protection factors (PF) were calculated using the fitted survival curves. These factors are 1.23 ± 0.04, 1.20 ± 0.19, and 1.34 ± 0.05 for (223)Ra, (188)Re, and (99m)Tc, respectively.
CONCLUSIONS:
For (223)Ra, as well as for (188)Re and (99m)Tc, dose-dependent radiation effects were found applicable for plasmid DNA and PC Cl3 cells. The radioprotection by DMSO was in the same range for high- and low-LET emitter. Overall, the results indicate the contribution of mainly indirect radiation effects for each of the radionuclides regarding DNA damage and cell survival. In summary, our findings may contribute to fundamental knowledge about the α-particle induced DNA damage.
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Dal, Bo Davide. "Acteurs moléculaires des interactions énergétiques entre le chloroplaste et la mitochondrie chez la diatomée marine Phaeodactylum tricornutum." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019GREAV048.
Full textAbstract:
Pour produire l’énergie nécessaire au métabolisme cellulaire, les eucaryotes photosynthétiques se servent de deux organites : le chloroplaste et la mitochondrie. Le premier est capable de convertir l’énergie lumineuse en énergie chimique et la deuxième est le lieu de la phosphorylation oxydative. Puisque les deux organites partagent la même fonction de production d’énergie, leurs activités doivent être régulées. Chez les plantes et les algues vertes ces deux « moteurs » cellulaires travaillent principalement de façon indépendante selon les conditions environnementales, comme la présence de sucre ou de lumière. Au contraire, chez les diatomées, l’échange direct de ATP et de NAPDH entre ces organites est essentiel pour assurer la survie de la cellule. Bien que cette interaction énergétique ait été caractérisée d’un point de vue physiologique, les acteurs moléculaires responsables de ce processus restent encore inconnus. Dans le cadre de mon projet de thèse, quatre protéines candidates ont été sélectionnées et étudiées pour déterminer leur implication dans les échanges énergétiques entre ces deux organites. Ces protéines sont des transporteurs localisés au niveau de l’enveloppe chloroplastique et de la membrane interne de la mitochondrie. Pour comprendre leur rôle physiologique, les souches mutantes correspondantes ont été générées. La capacité photosynthétique et la respiration cellulaire de ces mutants ont été évaluées par des approches de fluorescence, de spectroscopie, ou de mesure du taux d’évolution de l’oxygène. Ces mesures suggèrent que les transporteurs sélectionnés contrôlent en partie les mécanismes des échanges énergétiques entre le chloroplaste et la mitochondrie bien que d’autres protéines (non identifiées) semblent aussi impliquées dans cette régulation. Une caractérisation plus avancée de ces transporteurs pourrait permettre d’augmenter la production de biomasse des microalgues dans le cadre d’applications biotechnologiques, en favorisant l’utilisation simultanée de la respiration et de la photosynthèse (mixotrophie)To produce the energy needed for cell metabolism, eukaryotic photosynthetic organisms rely on two organelles: the chloroplast and the mitochondrion. The former converting light energy into chemical energy, the latter performing cell respiration. Since both organelles have overlapping function, their activities need to be regulated. While in plants and green algae they seem to work overall independently according to environmental conditions, like light and sugar availability, in Diatoms the direct exchange of ATP and NADPH between these two organelles are essential for the cell’s survival. Although the physiology of this energetic crosstalk is well established, the molecular actors of this process are still unknown. During this PhD project, I have selected four candidate proteins, which turned out to play a role the organelles’ cross talk mechanisms. These are transporters predicted to be located within the chloroplast envelope and the inner membrane of the mitochondrion. To understand their physiological role, we compared the photosynthetic performances of the wildtype and the mutant strains with spectroscopic and fluorescence approaches, while the respiration was quantified measuring the oxygen evolution rates.The observed differences suggest that the selected transporters play a role the chloroplast-mitochondrion crosstalk and that other proteins might be involved in this regulative process.The further characterization of these transporters might also validate them as possible targets to improve algal biomass productivity for biotech, promoting the simultaneous use of respiration and photosynthesis (mixotrophy)
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Soler, Éric. "Métabolisme des alcools monoterpéniques : étude particulière de la géranyl diphosphate synthétase et du diphosphate d'isopentényle chez Vitis vinifera cultivé in vitro." Toulouse, INPT, 1993. http://www.theses.fr/1993INPT026A.
Full textAbstract:
Les suspensions cellulaires de vitis vinifera l. Cv muscat de frontignan n'accumulent pas les monoterpenes elabores par la plante entiere et responsables de la flaveur musquee du raisin. La comprehension des phenomenes impliques dans la production de ces composes nous a conduit a approfondir nos connaissances sur leur voie de biosynthese. Grace a une methode originale de purification de plastes intacts a partir de suspensions cellulaires, une geranyl diphosphate (gpp) synthetase a ete associee au compartiment plastidial. Les experiences de protection enzymatique ont permis de localiser cette enzyme a l'interieur de l'organite. Ces resultats nous ont amene a etudier la permeabilite de l'enveloppe plastidiale vis-a-vis du diphosphate d'isopentenyle (ipp). Un systeme de transport acheminant l'ipp exogene vers le plaste a ete mis en evidence. Sa caracterisation biochimique a revele la participation d'une entite proteique (systeme de diffusion facilitee) catalysant la penetration de l'ipp km 0,5 mm; vmax 25 nmoles d'ipp. (mg de proteine)##1. H##1. Ce transporteur doit jouer un role preponderant dans la regulation du metabolisme des terpenes plastidiaux. Les recherches a venir s'orienteront vers un approfondissement des connaissances sur la localisation subplastidiale de la gpp synthetase et sur l'origine du systeme d'energisation du transport de l'ipp
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Garrivier, Daniel. "Etudes théoriques et numériques d'objets "issus de la biologie" : torsion de fils d'ADN ; pelage de membranes en adhésion." Université Joseph Fourier (Grenoble), 2001. http://www.theses.fr/2001GRE10068.
Full text
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Chu, Cheng-Che. "Hydrogen-bonded supramolecular materials for organic photovoltaic applications." Thesis, Bordeaux 1, 2009. http://www.theses.fr/2009BOR13866/document.
Full textAbstract:
Dans ce manuscrit est décrite l'utilisation d'interactions supramoléculaires pour diriger l'auto-assemblage de composés donneurs et accepteurs d'électrons au sein de dispositifs photovoltaïques organiques. Dans ce but, des matériaux de type oligo-3-hexylthiophène et fullerène ont été fonctionnalisés avec des groupements de reconnaissance complémentaires mélamine – acide barbiturique. La présence de élements solubilisants confère à ces composés une bonne mise en oeuvre permettant la fabrication de dispositifs photovoltaïques à hétérojonction volumique. L'effet de la composition et du post-traitement de la couche active sur la performance de ces dispositifs ont été explorés. Les études de mobilité de charge et des mécanismes de recombinaison au sein de ces matériaux indiquent que l'équilibre entre auto-association et séparation de phases est crucial pour l'efficacité en conversion photovoltaïqueThis research aims to elucidate the use of supramolecular interaction to guide the formation of well-defined nanoscale self-assembled architecture in photovoltaic solar cells as a means to improve device efficiency. Complementary molecular recognition sites based on melamine and barbituric acid were used to obtain functionalized fullerene and oligothiophene materials with superior processibility thanks to the presence of specific solubilizing groups. The efficiency of solid-state devices fabricated using the bulk heterojunction design was studied with respect to device morphology and composition. Experiments on recombination mechanism and field effect mobilities suggest that the balance between hydrogen-bonding interactions induce self-assembly and p-p interactions to promote phase segregation is crucial to the micro-structure of the active layer. The investigated of the relationship between the oligothiophene chain size and various complementary hydrogen-bonding motifs is envisaged
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d'Audigier, Clément. "Modulation du potentiel angiogène des progéniteurs endothéliaux humains par des biomarqueurs plasmatiques vasculaires." Thesis, Paris 5, 2013. http://www.theses.fr/2013PA05P614/document.
Full textAbstract:
Rationnel : L’implication établie des progéniteurs endothéliaux circulants dans les phénomènes de néovascularisation chez l’adulte a stimulé la recherche de thérapeutiques angiogènes basées sur la greffe de ces cellules. Deux types cellulaires au phénotype endothélial sont actuellement définis entre autres par leur cinétique d’apparition en culture : les progéniteurs précoces (CFU-EC ou CAC) et tardifs (ECFC). Notre équipe a montré que l’injection thérapeutique de cellules mononucléées de moelle osseuse (BM-MNC) permettait la néovascularisation du site ischémié chez des patients atteints d’artériopathie des membres inférieurs, et que les néovaisseaux formés avaient le phénotype d’ECFC. Nous avons dans un premier temps mesuré les concentrations de différentes protéines modulant l’angiogenèse, chez des patients atteints de pathologies ischémiques et cardiovasculaires, ou impliquant des anomalies vasculaires associées à la fibrose. Ainsi, le transforming growth factor - β1 (TGF-β1) dans la fibrose pulmonaire idiopathique (FPI), la thrombospondine-1 (TSP-1) dans l’artériopathie des membres inférieurs (AMI), et le placental growth factor (PlGF) chez les patients atteints de pathologies cardiovasculaires [syndrome coronarien aigu (SCA), ou patients devant subir une chirurgie de la valve ou un pontage coronarien], se sont distingués comme potentiel biomarqueur plasmatique dans ces pathologies, et ont été étudiés dans la biologie des ECFC humaines.Résultats : Le taux plasmatique de TGF-β1 est augmenté chez les patients atteints de FPI par rapport à la population contrôle ; il a un effet pro-angiogène in vivo (vascularisation des implants de Matrigel®) et in vitro (prolifération et migration des ECFC) via les récepteurs ALK-1, ALK-5 et TGF-βRII. Le taux plasmatique de TSP-1 est augmenté chez les patients artéritiques par rapport à la population contrôle. Par ailleurs les néovaisseaux formés de patients artéritiques ayant été traités par injection locale de BM-MNC expriment la TSP-1. Dans les modèles murins de Matrigel®-plugs et d’ischémie du membre inférieur (IMI), la TSP-1 induit une diminution de la vascularisation des implants ainsi qu’une diminution de la revascularisation du membre ischémié. In vitro, la TSP-1 augmente l’adhésion via un mécanisme N-Terminal dépendant, et diminue le potentiel angiogène (prolifération et migration) des ECFC via sa liaison au récepteur CD47, ce qui active la voie de signalisation SDF-1/CXCR4. Le taux plasmatique de PlGF est augmenté chez les patients atteints de SCA par rapport à 2 populations contrôles ; il est également augmenté chez les patients ayant subit une chirurgie cardiaque. Les PlGF-1 et -2 potentialisent la tubulogenèse des ECFC in vitro via la phosphorylation du récepteur VEGFR1. Cet effet est aboli lorsque le VEGFR1 est inhibé par ARN interférence ou par le composé chimique « 4321 ». De plus ce composé « 4321 » inhibe la vascularisation des implants de Matrigel®, ainsi que la revascularisation du membre ischémié dans le modèle d’IMI.Conclusions : Le TGF-β1 joue un rôle dans le remodelage vasculaire de la FPI via les ECFC ; la TSP-1 est un potentiel biomarqueur de l’angiogenèse induite par les ECFC dans l’AMI ; l’inhibition de la voie PlGF/VEGFR1 module la tubulogenèse induite par les ECFC, cellules impliquées dans la formation de nouveaux vaisseaux. Nous avons ainsi mis en évidence 3 protéines modulant l’angiogenèse dans 3 contextes pathologiques différents, caractérisés par un remodelage vasculaire et où les ECFC sont impliquées dans leurs mécanismes physiopathologiques. Ces 3 protéines se présentent donc comme de potentiels biomarqueurs plasmatiques, modulant les propriétés angiogènes des ECFC et pouvant influencer leur efficacité en tant que produit de thérapie cellulaire. Ces protéines jouent un rôle probable dans l’équilibre homéostatique au décours des pathologies concernéesRationale: The pro-angiogenic capacities of endothelial progenitor cells are now well established, and their involvement in neovascularization events in adults has stimulated the research in the field of angiogenic therapy based on transplant of these cells. Current data converge towards the notion of two cell types with endothelial phenotype, defined at least by their kinetics of appearance in culture: early endothelial progenitor cells (CFU-EC or CAC) and late (ECFC). Our team has shown that the therapeutic injection of bone marrow mononuclear cells (BM-MNC) led to neovascularization of the ischemic site in patients with critical limb ischemia, and that the new vessels formed bore the phenotype of ECFC. We initially measured the concentrations of different proteins modulating angiogenesis in patients with ischemic and cardiovascular diseases, or involving vascular abnormalities associated with fibrosis. Thus, the transforming growth factor - ß1 (TGF-ß1) in idiopathic pulmonary fibrosis, the thrombospondin-1 (TSP-1) in peripheral artery disease, and the placental growth factor (PlGF) in patients with cardiovascular diseases [acute coronary syndrome (ACS), patients undergoing valve surgery or coronary artery bypass surgery], emerged as potential plasmatic biomarkers in these pathological settings, and have been studied in the biology of human ECFC.Results: TGF-ß1 plasma level is increased in patients with idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) compared to the control population; it exerts a pro-angiogenic effect in vivo (vascularization of Matrigel ®-plugs) and in vitro (proliferation and migration of ECFC) via ALK-1, ALK-5 and TGF-ßRII receptors. TSP-1 plasma level is increased in patients with peripheral artery disease (PAD) compared to the control population. In addition, the new vessels formed in PAD patients treated by local injection of BM-MNC express TSP-1. In murine models of Matrigel ®-plugs and hindlimb ischemia, TSP-1 induces a decrease in plugs vascularization and impaired revascularization of ischemic limb. In vitro, TSP-1 increases ECFC adhesion via an N-terminal dependent mechanism and reduces their angiogenic potential (proliferation and migration) via its binding to CD47 receptor, which activates the SDF-1/CXCR4 signaling pathway. PlGF plasma level is increased in ACS patients compared with the control population and stable angina patients and is also increased in patients undergoing cardiac surgery. PlGF-1 and -2 potentiate ECFC tubulogenesis in vitro via phosphorylation of the VEGFR1 receptor. This effect was abolished when the ECFC VEGFR1 is inhibited by RNA interference or by the chemical compound "4321". In addition this compound "4321" inhibits the vascularization of Matrigel ®-plugs, and revascularization of the ischemic limb in the hindlimb ischemia model.Conclusions: TGF-ß1 is involved in the IPF vascular remodeling through ECFC; TSP-1 is a potential biomarker of angiogenesis induced by ECFC in PAD; the inhibition of the PlGF/VEGFR1 pathway modulates ECFC tubulogenesis, cells involved in the formation of new vessels. We thus identified three proteins that modulate angiogenesis in three different pathological settings characterized by a vascular remodeling and where ECFC are involved in their pathophysiology. These three proteins therefore state as potential plasmatic biomarkers, modulating ECFC angiogenic properties and are able to influence their efficacy as a cell therapy product. These plasmatic biomarkers likely play a role in the homeostasis of those pathologies progress
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Zhang, Yingxiao. "Genetic Engineering of Rubber Producing Dandelions." The Ohio State University, 2016. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1480626773100647.
Full text
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Menil, Sidiky. "Cascade bi-enzymatique autosuffisante in vivo : le jeu des plasmides." Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0040.
Full textAbstract:
Une attention croissante est portée aux cascades multi enzymatiques pour l’élaboration de procédés de synthèse plus efficaces. Cependant, le contrôle de l’expression hétérologue de plusieurs gènes dans un même hôte s’avère difficile et peut mener à un déséquilibre du flux réactionnel. Pour exploiter au mieux les avantages d’une cascade in vivo, il est nécessaire d’ajuster les activités de chaque étape, et de construire des catalyseurs cellulaires capables de programmer la stœchiométrie des enzymes. Nous avons développé dans ce projet une approche originale pour moduler le ratio de deux enzymes in cellulo en jouant sur le nombre de copies de plasmides par cellule (PCN). Nous avons choisi comme modèle un système autosuffisant associant une Alcool Déshydrogénase (ADH) et une Baeyer-Villiger MonoOxygenase (BVMO), NADP(H)-dépendantes. Plusieurs plasmides recombinants portant les deux gènes ont été conçus et combinés dans E. coli. Les souches de co-expression construites ont été comparées en termes de PCN, de production d’enzymes et d’activité. Nous avons montré l’importance d’un choix judicieux de la combinaison de plasmides ainsi que l’existence d’une corrélation entre ratios d’enzymes et activité. Nos biocatalyseurs s’étendent sur une gamme allant du système inactif à un système affichant un TTN d’environ 6000. Ce système a permis la synthèse de lactones d’intérêt industriel, la dihydrocoumarine et la caprolactone, à partir d’indanol et de cyclohexanol. Enfin, sur ce modèle de combinaison de plasmides, trois nouveaux biocatalyseurs cellulaires, associant l’ADH à diverses BVMOs, ont été créés afin d’élargir la gamme d’esters et de lactones synthétisables à partir d’alcoolsGrowing attention is paid to multienzymatic cascades to develop more efficient synthetic processes. However, in in cellulo process, the control of the simultaneous heterologous expression of several genes in the same host is often difficult and can lead to imbalances in the reaction flow. To exploit the benefits of cascades, activities of each step have to be adjusted and thus, cellular biocatalysts capable of programming enzymes stoichiometry have to be constructed. In this work, to modulate the stoichiometry of two enzymes in vivo, we developed an original approach based on the copy number per cell of plasmids (PCN) used as vectors. The PCN is regulated in bacteria by three main mechanisms leading, according to the replicon, to low, medium or high PCN. As proof of concept, we chose a self-sufficient system combining an Alcohol Dehydrogenase (ADH) and a Baeyer-Villiger MonoOxygenase (BVMO), both NADP(H)-dependent. Several recombinant plasmids harboring both genes were designed and combined in E. coli. Coexpression strains constructed were compared in terms of PCN, enzyme production and activity. We showed the importance of a judicious choice of plasmids combination and the existence of a correlation between enzymes ratios and activity. Our biocatalysts ranged from an inactive system to a system with a TTN of about 6000. This system allowed the synthesis of lactones of industrial interest, dihydrocoumarin and caprolactone, via double oxidation of indanol and cyclohexanol. Finally, based on this plasmids combination model, three new cellular biocatalysts combining ADH with various BVMOs were designed to broaden the range of esters and lactones synthesizable from alcohols
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Hakimi, Mohamed-Ali. "Identification et caractérisation de facteurs d'initiation de la transcription associés au plaste." Université Joseph Fourier (Grenoble), 2000. http://www.theses.fr/2000GRE10207.
Full textAbstract:
L'objectif de ma these a ete l'identification et la caracterisation de nouveaux facteurs d'initiation de la transcription plastidiale, associes a l'arn polymerase pep et a l'activite transcriptionnelle nep2. Dans un premier chapitre, nous mettons en evidence la presence de six facteurs de type sigma chez a. Thaliana : les proteines sig. In vivo, nous montrons que le facteur sigma chimerique 7 0 / sig1 permet la complementation du mutant d'e. Coli cag1 (rpod). Nous montrons egalement que les proteines sig1, sig2 et sig3 presentent, in vitro, une affinite variable pour les promoteurs plastidiaux et pour l'enzyme coeur d'e. Coli. En conclusion, nous proposons un classement provisoire de sig1 dans le groupe 1 des facteurs sigma essentiels, et suggerons que les proteines sig peuvent etre considerees comme les commutateurs genetiques de l'enzyme pep plastidiale. Dans un deuxieme chapitre, nous avons identifie un nouveau facteur b : la proteine brp. Les facteurs brp definissent un nouvel embranchement des homologues a tfiib, specifique aux plantes. Nous avons montre que ces proteines sont ancrees a la membrane externe des enveloppes plastidiales. L'identification de cette nouvelle famille de facteurs b suggere la presence d'un quatrieme systeme transcriptionnel eucaryotique dans les plantes, dont le role est certainement relie aux fonctions plastidiales. Les implications fonctionnelles de cette decouverte sont discutees et deux modeles moleculaires sont proposes.
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Robinet, Julien. "Les peptides GXXPG : nouvelles molécules thérapeutiques à visée régénératrice osseuse ?" Thesis, Reims, 2014. http://www.theses.fr/2014REIMS009/document.
Full textAbstract:
La cicatrisation de défauts osseux permet tout au plus une réparation de l'os et dans peu de cas, une régénération ad integrum. Le développement de biomatériaux issus de l'ingénierie tissulaire en vue d'une régénération osseuse est donc un enjeu majeur. Le but de cette étude a été d'évaluer si des peptides GXXPG issus de l'élastine sont capables de favoriser la différenciation ostéoblastique de cellules mésenchymateuses dérivées de la moelle osseuse humaine (CMMO) ainsi que la formation de la matrice osseuse et sa minéralisation. Pour y répondre, nous avons utilisés les lattis de collagène de type I (COL1). La contraction de lattis « flottants » (LF) stimule l'expression de marqueurs de l'ostéoblaste (Runx-2, BSP…) par les CMMO ainsi que la minéralisation de la matrice osseuse. Cette différenciation ostéoblastique est aussi associée à l'activation de la cascade MT1-MMP/MMP-2/MMP-13. Nous montrons ensuite que les peptides GXXPG stimulent de façon dose-dépendante l'expression de marqueurs ostéoblastiques comme Runx-2 via S-Gal. Sur « coating » de COL1, ils stimulent la différenciation ostéoblastique des CMMO, la formation de la matrice osseuse et sa minéralisation. Enfin, dans des conditions « inflammatoires » créées par l'ajout de plasminogène (Plg) exogène, ces peptides conservent une activité ostéogénique sous contraintes mécaniques ou non. Plg seul induit également la différenciation ostéoblastique. Bien que les peptides GXXPG stimulent la production d'enzymes à activité collagénolytique (MT1-MMP, MMP-1), la lyse des LF n'est pas significative. En conclusion, les peptides GXXPG apparaissent comme des biomolécules pharmacologiques prometteuses pour la régénération osseuseBone healing leads in only a few cases to an ad integrum regeneration, but most often to an incomplete tissue repair. Thus, the development of new biomaterials from tissue engineering in order to promote bone regeneration is a major goal. The purpose of our study was to evaluate if GXXPG peptides, derived from elastin, are able to favor human bone marrow mesenchymal cells (HBMC) to mature osteoblasts and bone matrix formation and mineralization.To this end, we used type I collagen (COL1) lattices. Floating lattice (LF) contraction stimulates osteoblasts markers expression (Runx-2, BSP…) by HMBC and bone matrix mineralization. Osteoblast differentiation is also associated to MT1-MMP/MMP-2/MMP-13 proteolytic cascade activation. We then showed that GXXPG peptides stimulate osteoblast markers like Runx-2 in a dose-dependent manner, an effect which involves S-Gal receptor. On a type I collagen coating model, these peptides also promote CMMO differentiation into osteoblast, bone matrix formation and mineralization. Finally, under “inflammatory” conditions, which can be catalyzed by plasminogen (Plg) supplementation, these peptides keep their ability to induce osteogenic responses in HBMC, even under mechanical stress. Plg alone is also able to promote osteoblast differentiation. Although GXXPG peptides stimulate collagenolytic enzymes (MT1-MMP, MMP-1) production, collagen degradation in LF is not significant. To conclude, GXXPG peptides appear as promising pharmacological biomolecules in bone regeneration
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Dietsch, Frank. "Caractérisation des fonctions des modifications post-traductionnelles de PCNA à l'aide d'un nouvel outil génétique." Thesis, Strasbourg, 2019. http://www.theses.fr/2019STRAJ014/document.
Full textAbstract:
PCNA est une protéine essentielle qui intervient dans de nombreux mécanismes cellulaires et qui possède de nombreuses modifications post-traductionnelles (MPTs) dont les fonctions de certaines, restent encore inconnues. Afin d’étudier la fonction de ces MPTs, nous avons développé un nouvel outil génétique permettant in cellulo, de substituer la protéine endogène PCNA par une version mutée de la protéine appelée version de complémentation. La technique consiste à cotransfecter des cellules en culture avec deux types de plasmides. Un premier plasmide permet l’invalidation du gène de PCNA endogène dans les cellules transfectées par le système CRISPR-Cas9. Le deuxième plasmide dit de complémentation permet l’expression d’une forme mutée de PCNA. Sur l’ensemble d’une banque de mutants testés, deux mutants de PCNA se sont avérés être létaux (D122A et E124A). Nous avons démontré que ces deux sites sont impliqués dans l’initiation d’une voie de dégradation ubiquitine dépendante CRL4Cdt2 essentielle pour la mise en place de la protéolyse d’un cocktail de protéines (cdt1, p21, set8) durant la phase S. Nous avons démontré que les cellules mutantes pour PCNA (D122A et E124A) accumulent la protéine p21. Ce défaut de dégradation de p21 provoque alors des évènements de re-réplication menant à terme à la mort des cellules mutantesPCNA is an essential protein that is involved in many cellular mechanisms and has many post-translational modifications (PTMs). The functions of some PTMs, still remain unknown. In order to study the function of these PTMs, we have developed a new genetic tool allowing, in cellulo, the substitution of endogenous PCNA protein with a mutated version of the protein named complementation version. The technique involves cotransfection of the cells in culture with two types of plasmids. A first plasmid allows invalidation of the endogenous PCNA gene in transfected cells by the CRISPR-Cas9 system. The second plasmid, named complementation plasmid allows the expression of a mutated form of PCNA. In the whole bank of tested mutants, two PCNA mutants were found to be lethal (D122A and E124A). We have demonstrated that these two sites are involved in the initiation of an ubiquitin-dependent protein degradation CRL4Cdt2 pathway essential for the proteolysis of a protein cocktail (cdt1, p21, set8) during the S phase. We demonstrated that PCNA mutant cells (D122A and E124A) accumulate p21 protein. This lack of degradation of p21 then causes re-replication events leading ultimately to the mutant cells death
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Villain, Patricia. "Fonction transcriptionnelle du site 1 : élément cis du gène nucléaire d'épinard RPS1 codant pour la protéine ribosomique plastidiale CS1." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1995. http://www.theses.fr/1995GRE10187.
Full textAbstract:
La boite site 1, element de liaison du facteur nucleaire de feuilles d'epinard s1f, a ete identifiee, dans notre laboratoire, au niveau du promoteur du gene d'epinard rps1. Ce gene nucleaire code pour une proteine ribosomique plastidiale, cs1. L'etude des elements cis et de leurs facteurs trans, identifies au niveau des promoteurs de ce type de gene, constitue un bon modele pour la comprehension des mecanismes d'action, au niveau genetique, des facteurs internes (lies au type cellulaire) de la differenciation plastidiale. L'expression des genes nucleaires codant pour les proteines ribosomiques plastidiales est, en effet, regulee au niveau transcriptionnel, selon le type d'organe et de maniere independante de la lumiere. Nous avons etudie le site 1 in vivo, par la realisation de tabacs transgeniques, et in vitro par des experiences d'interactions proteines/adn (gels retards). Nos resultats in vivo montrent que l'element site 1 a une fonction specifique au sein des organes contenant des amyloplastes, comme les racines, et differente de celle observee dans les feuilles: dans les premiers, il fonctionne apparemment comme un element negatif de transcription, mais d'apres les experiences d'interactions in vitro, ce serait plutot un element positif faible de transcription. Cette fonction differente de l'element site 1 est correlee a une activite de liaison a cette boite, in vitro, qui est differente selon l'organe etudie. Les experiences de gel retard montrent, en effet, qu'il existe dans les racines, un facteur de liaison a l'element site 1, qui possede une specificite et une affinite de liaison relativement plus faibles que celles du facteur de feuille: nous l'avons appele s1r. Nous avons etudie l'homologie, pour la liaison, in vitro, de facteurs proteiques, de la boite site 1 avec d'autres elements cis: elle est homologue a la boite site 3 (element cis du promoteur du gene rps1), et elle est apparentee, mais non identique, a l'element box ii (element cis du promoteur du gene rbcs-3a de pois). Comme pour l'element site 1, ce travail a permis de mettre en evidence, dans les racines, une activite de liaison a l'element box ii differente de celle caracterisee dans les feuilles: ce facteur, gt-1r, a une specificite de liaison relativement plus faible que celle du facteur de feuille. Nos resultats montrent qu'il pourrait exister, dans les racines, une activite inhibitrice i qui permettrait a gt-1r de se fixer a l'element box ii dans cet organe. D'apres ces resultats, nous proposons deux modeles, qui decrivent in vivo et selon l'organe, la nature des activites de liaison aux boites site 1 et box ii, et les fonctions de ces boites et de leurs facteurs pour l'expression des genes rps1 et rbcs-3a
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Gatignol, Anne. "Expression de genes plasmidiques de resistance a la phleomycine chez les eucaryotes." Toulouse 3, 1987. http://www.theses.fr/1987TOU30257.
Full text
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Panagiotopoulou, Maria. "Organic-inorganic composite materials for specific recognition and optical detection of environmental, food and biomedical analytes." Thesis, Compiègne, 2016. http://www.theses.fr/2016COMP2315/document.
Full textAbstract:
Cette thèse décrit l'état de l'art des sondes et nanoparticules fluorescents traditionnels utilisés en imagerie de fluorescence ainsi que le développement de nouveaux nanomatériaux à base de polymère à empreinte moléculaire, aussi dénommé ‘anticorps plastique’, pour le ciblage et la bioimagerie. En biologie et en médecine, il y a un besoin constant de diagnostiquer diverses maladies pour leur éventuel traitement et prévention. Une distribution anormale et un taux élévé de glycosylation (e.g. acides hyaluronique et sialique) à la surface ou dans les cellules sont indicateurs d’une infection ou d’un cancer. Généralement, l’imagerie par fluorescence permet de visualiser, localiser et quantifier les biomarqueurs de pathologie mais à l’heure actuelle, il n’existe pas d’outil analytique fiable pour cibler spécifiquement les molécules de glycosylation car les anticorps et les lectines vendus dans le commerce ont une faible affinité et sélectivité vis-à-vis de ces cibles. Dans ce contexte, les polymères à empreintes moléculaires (MIPs) pourraient apporter une solution. Les MIPs sont des récepteurs synthétiques possédant des affinités et sélectivités comparables à ceux des anticorps, mais exhibant une stabilité physique, thermique et chimique bien plus accrue. De plus, leur fabrication est peu coûteuse et ne nécessite pas de tuer des animaux comme pour l’obtention des anticorps biologiques. Dans cette thèse, nous avons optimisé et synthétisé des MIPs biocompatibles pour leur utilisation en bioimagerie afin de détecter et quantifier l’acide hyaluronique et l’acide sialique sur les cellules et les tissus de peau humaine. L’acide glucuronique, une composante de l’acide hyaluronique et l’acide N-acétylneuraminique, l’acide sialique le plus commun, ont été utilisés comme molécules ‘patron’, générant des MIPs très sélectifs envers leur cible en milieu aqueux. Deux types de nanoparticules de MIPs fluorescents ont été synthétisés: (1) en incorporant un colorant rhodamine polymérisable dans la solution de pré-polymérisation et (2) en encapsulant des boîtes quantiques InP/ZnS générant ainsi des MIPs de type cœur-coquille. Pour cela, nous avons adopté une stratégie innovante qui consiste à synthétiser les coquilles de MIPs directement autour des boîtes quantiques en utilisant l’énergie de l’onde fluorescente émise par l’excitation des points quantiques, pour initier la polymérisation. Un protocole d'immunocoloration standard a ensuite été optimisé afin d’imager des kératinocytes humains fixés et vivants ainsi que des tissus de peau, par microscopie à épifluorescence et confocale. Les résultats étaient similaires à ceux obtenus par la méthode de référence utilisant une protéine biotinylée reconnaissant l'acide hyaluronique. L'imagerie multiplex en combinant deux MIPs couplés à deux couleurs de boîtes quantiques et l’imagerie des cellules cancéreuses ont également été démontrées. Bien que les MIPs n’étaient pas cytotoxiques aux concentrations utilisées pour la bioimagerie, la toxicité des différentes composantes du MIP pourrait être un frein à leur utilisation dans le domaine biomédical. Afin de rendre ces MIPs plus ‘inoffensifs’, nous avons supprimé l’amorceur de polymérisation, une molécule considérée comme toxique. Les MIPs ont été synthétisés en employant des monomères qui s’auto-initient sous l’effet de l’UV ou de la chaleur. La spécificité et la sélectivité des MIPs obtenus étaient similaires à ceux préparés avec des amorceurs. En conclusion, cette thèse décrit la première utilisation des MIPs comme anticorps synthétique pour la bioimagerie de fluorescence. Ce travail ouvre la voie à de nouvelles applications en détection, diagnostique et thérapie par des MIPsThis thesis describes the state of the art in nanomaterials-based targeted bioimaging and introduces molecularly imprinted polymers, also termed ‘plastic antibodies’ as novel biorecognition agents for labeling and imaging of cells and tissues. In fundamental biology and medical diagnostics, there is a constant need to localize and quantify specific molecular targets. Abnormal glycosylation levels or distributions of hyaluronan or sialic acids on cells are indicators of infection or malignancy. In general, bioimaging with fluorescent probes enables the localization and qualitative or quantitative determination of these pathological biomarkers. However, no reliable tools for the recognition of glycosylation sites on proteins exist, because the commercially available antibodies or lectins have poor affinity and selectivity for these targets. In this context, tailor-made molecularly imprinted polymers (MIPs) are promising synthetic receptor materials since they present a series of advantages over their natural counterparts such as the ease and low cost of preparation and their physical and chemical stability. Thus, MIPs could provide a robust and specific imaging tool for revealing the location/distribution, time of appearance and structure of glycosylation sites on/in cells, which would lead to a better insight of the tremendously diverse biological processes in which these molecules are involved. Herein, we describe the synthesis of water-compatible MIPs for the molecular imaging of hyaluronan and sialylation sites on cells and tissues. Since molecular imprinting of entire biomacromolecules like oligosaccharides is challenging, we opted for what is commonly called the ‘epitope approach’, which was inspired by nature. The monosaccharides, glucuronic acid and N-acetylneuraminic acid were imprinted, and the resulting MIPs were able to bind these molecules when present and accessible on the terminal unit of hyaluronan and sialylation sites. Fluorescent MIPs were synthesized as rhodamine-labeled nanoparticles and as MIP-coated InP/ZnS core-shell quantum dot (QD) particles. For the coating of the QDs, a novel versatile solubilization and functionalization strategy was proposed, which consists of creating polymer shells directly on QDs by photopolymerization using the particles as individual internal light sources. A standard immunostaining protocol was then successfully adapted for the application of the fluorescently labeled MIPs to image fixed and living human keratinocytes and skin tissues, by epifluorescence and confocal fluorescence microscopy. The results were comparable to those obtained with a reference method where staining was done with a biotinylated hyaluronic acid binding protein. Multiplexed and cancer cell imaging were also performed, demonstrating the potential of molecularly imprinted polymers as a versatile biolabeling and bioimaging tool. Although the MIPs were not cytotoxic at the concentrations used for bioimaging, in order to render them generally applicable in biomedicine, where toxicity of the polymerization precursors is a matter of concern, we suppressed the initiator, a toxic chemical. Initiator-free MIPs were thus synthesized by using monomers that can self-initiate under UV irradiation or heat. The specificity and selectivity of the obtained MIPs were as good as the ones prepared with initiators. In conclusion, we have demonstrated for the first time the great potential of MIPs as synthetic antibody mimics for bioimaging. The possibility to associate other functionalities such as QDs and additionally attach drugs to the same material appears rather straightforward due to the synthetic polymeric nature of MIPs, which paves the way to new potential applications in theranostics
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Michel, Bénédicte. "Recombinaison homologue et illegitime chez bacillus subtilis et escherichia coli." Paris 6, 1986. http://www.theses.fr/1986PA066534.
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Desprès, Philippe. "Le virus de la fievre jaune : clonage du genome amaril et expression de la proteine d'enveloppe (e)." Paris 7, 1988. http://www.theses.fr/1988PA077049.
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Forestier, Christiane. "Facteurs de virulence d'escherichia coli isoles de selles diarrheiques : mise en evidence et caracterisation d'une adhesine non filamenteuse." Clermont-Ferrand 2, 1987. http://www.theses.fr/1987CLF21047.
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Lajudie, Philippe de. "Contribution a l'etude de deux symbioses fixatrices d'azote : medicago sativa, legumineuse temperee, sesbania rostrata, legumineuse tropical." Paris 11, 1988. http://www.theses.fr/1988PA112066.
Full textAbstract:
Dans une premiere partie, on etudie les partenaires bacteriens : recherche de plasmides, essais de mutagenese par insertion de transposon, isolement et caracterisation de bacteriophages specifiques des souches isolees de s. Rostrata. Rhizobium meliloti, en association avec m. Sativa, possede des plasmides de type prme (130 a 300 kb) et des megaplasmides (1500 kb) qui portent les genes symboliques. Dans une deuxieme partie, on etudie le partenaire vegetal : proteines solubles des nodules et des tissus non infectes analysees par electrophorese sur gel et par western blotting, puis au niveau transcriptionnel, expression des genes de la plante par isolement des arn poly a et traduction in vitro
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Islam, Mohammad Rubyet. "Profile extrusion of wood plastic cellular composites and formulation evaluation using compression molding." Thesis, 2010. http://hdl.handle.net/10155/110.
Full textAbstract:
Wood Plastic Composites (WPCs) have experienced a healthy growth during the last decade. However, improvement in properties is necessary to increase their utility for structural applications. The toughness of WPCs can be improved by creating a fine cellular structure while reducing the density. Extrusion processing is one of the most economical methods for profile formation. For our study, rectangular profiles were extruded using a twin-screw extrusion system with different grades of HDPE and with varying wood fibre and lubricant contents together with maleated polyethylene (MAPE) coupling agent to investigate their effects on WPC processing and mechanical properties. Work has been done to redesign the extrusion system setup to achieve smoother and stronger profiles. A guiding shaper, submerged in the water, has been designed to guide the material directly through water immediately after exiting the die; instead of passing it through a water cooled vacuum calibrator and then through water. In this way a skin was formed quickly that facilitated the production of smoother profiles. Later on chemical blowing agent (CBA) was used to generate cellular structure in the profile by the same extrusion system. CBA contents die temperatures, drawdown ratios (DDR) and wood fibre contents (WF) were varied for optimization of mechanical properties and morphology. Cell morphology and fibre alignment was characterized by a scanning electron microscope (SEM).
A new compression molding system was developed to help in quick evaluation of different material formulations. This system forces the materials to flow in one direction to achieve higher net alignment of fibres during sample preparation, which is the case during profile extrusion. Operation parameters were optimized and improvements in WPC properties were observed compared to samples prepared by conventional hot press and profile extrusion.UOIT
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Leung, Siu Ning Sunny. "Mechanisms of Cell Nucleation, Growth, and Coarsening in Plastic Foaming: Theory, Simulation, and Experiment." Thesis, 2009. http://hdl.handle.net/1807/19285.
Full textAbstract:
This thesis highlights a comprehensive research for the cell nucleation, growth and coarsening mechanisms during plastic foaming processes. Enforced environmental regulations have forced the plastic foam industry to adopt alternative blowing agents (e.g., carbon dioxide, nitrogen, argon and helium). Nevertheless, the low solubilities and high diffusivities of these viable alternatives have made the production of foamed plastics to be non-trivial. Since the controls of the cell nucleation, growth and coarsening phenomena, and ultimately the cellular morphology, involve delicate thermodynamic, kinetic, and rheological mechanisms, the production of plastics foams with customized cell morphology have been challenging. In light of this, the aforementioned phenomena were investigated through a series of theoretical studies, computer simulations, and experimental investigations. Firstly, the effects of processing conditions on the cell nucleation phenomena were studied through the in-situ visualization of various batch foaming experiments. Most importantly, these investigations have led to the identification of a new heterogeneous nucleation mechanism to explain the inorganic fillers-enhanced nucleation dynamics. Secondly, a simulation scheme to precisely simulate the bubble growth behaviors, a modified heterogeneous nucleation theory to estimate the cell nucleation rate, and an integrated model to simultaneously simulate cell nucleation and growth processes were developed. Consequently, through the simulations of the cell nucleation, growth, and coarsening dynamics, this research has advanced the understanding of the underlying sciences that govern these different physical phenomena during plastic foaming. Furthermore, the impacts of various commonly adopted approximations or assumptions were studied. The end results have provided useful guidelines to conduct computer simulation on plastic foaming processes. Finally, an experimental research on foaming with blowing agent blends served as a case example to demonstrate how the elucidation of the mechanisms of various foaming phenomena would aid in the development of novel processing strategies to enhance the control of cellular structures in plastic foams.
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Tsai, Irene Y. "Gradient heterogeneous surfaces." 2004. https://scholarworks.umass.edu/dissertations/AAI3188681.
Full textAbstract:
The strength of the interfacial interactions and the length scale over which these interactions occur are two important factors to understand the behavior of polymer blends, diblock copolymers, cell recognition, adhesion and wettability on a surface. This has important implications in pattern recognition applications, biosensors and random recognition processes. A simple means of examining patterns and the influence of patterns on many length scales simultaneously is with gradient surfaces, where the lateral distribution of the chemical nature and functionality of surface interactions can be varied in a systematic manner. Surfaces with gradient heterogeneous topographies were prepared, using blends of homopolymers and diblock copolymers, to vary the lateral size scale of the heterogeneities from the microscopic to nanoscopic correlation of heterogeneity. By tuning the lateral size scale of the heterogeneities, surface patterning can be engineered to have a specific function. Mixtures of homopolymers macroscopically phase separate, whereas diblock copolymers microphase separate on nanoscopic length scales. By gradually varying the relative concentrations of homopolymers and block copolymers, the length scale of the domains can be continuously varied from the nanoscopic to the macroscopic length scale. A method to generate gradient surfaces based in such mixtures is described in Chapter 1. Several examples demonstrating their utility are shown in Chapters 2 and 3. Polystyrene film dewetting and polystyrene/poly(methyl methacrylate) phase separation in thin films are discussed in Chapter 2. In Chapter 3, cell adhesion and migration are shown to be vastly different when the cells are grown on surfaces with nanometer to micrometer features. In Chapter 4, cell migration on patterned surfaces is investigated to tackle the sole effect of topography. Cell migration on polystyrene surfaces with micron sized topographic features is compared to cell migration on flat polystyrene substrate. Actin cytoskeleton, focal adhesion and cell migration speed were characterized to understand cell movement on topographic surfaces. Cell movements on hydrophilic polystyrene posts show strong similarities to cells cultured in 3D environment. This may provide a simple model system to study cell migration in physiological relevant conditions and contribute to our understanding in cell migration to better design surfaces for medical applications.
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GU, CHA-REN, and 顧洽任. "In Vitro Immunomodulatory and Cellular Activities of the Plastein Reaction Products of Bovine Colostrum Hydrolysates." Thesis, 2012. http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/41236992257059030487.
Full textAbstract:
碩士大葉大學
生物產業科技學系
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In this research the skimmed milk isolated from colostrums collected on the 2nd day postpartum were hydrolyzed by Flavourzyme. The skimmed milk hydrolysates were subjected into a plastein reaction with Flavourzyme under pH 5 and 9 for 4, 8 and 12 hours, respectively. This research investigates the effects of different plastin products on human mononuclear cell (MNC) growth, on the secretion of cytokines (IL-1β, IFN-γ and TNF-α) as well as nitric oxide, and on the growth inhibition of human leukemic U937 cells. The results showed that the products of plastein reaction with Flavourzyme under pH 9 for 8 hours (Pp-9-8) (at 800 μg/mL) had significant effects on the inhibition of U937 cell growth and cytokine secretion. Additionally, Tp-9-8, Lp-9-8 and Gp-9-8 from the plastein reactions with three amino acids (Tyrosine, Leucine and Glycine) under pH 9 for 8 hours were compared with Pp-9-8. It was found that both Pp-9-8 and Lp-9-8 had significant effects on the inhibition of U937 cell growth, and could considerably stimulate the secretion of cytokines. This research also investigated the simulated digestion in the gastrointestinal tract for Pp-9-8 and Lp-9-8 and the effects of the enzymes in the gastrointestinal tracts on the growth inhibition and immunoregulation of U937 cells. Results showed that the plastein products after the simulated digestion in the gastrointestinal tracts had a tendency to decrease both the inhibition of U937 cell growth and the amount of cytokine secreted.
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Srinivasan, Shrija. "Effects of Environmental Pollutants on Gene Expression and Cellular Pathways in Model Organism." Thesis, 2021. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-446754.
Full textAbstract:
The increasing use of plastics has elevated the risk of exposure to environmental pollutants such as plasticisers in the general population, making it necessary to understand the possible long term health consequences of the same. In this study we aim to understand how DEHP affects the gene expression in mice models and if it causes disruptions to its cellular pathways. Two datasets, GSE18564 and GSE14920 comprising of 15 and 60 samples respectively were downloaded from GEO database for analysis. Quality control checks were done using Principal Component Analysis and quantile normalisation. Differentially expressed genes were found using LIMMA model, following which only top 20 genes were selected for pathway analysis using KEGG and Gene Ontology. DEHP was found to be associated with chemical carcinogenesis, including negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway and fatty acid metabolism. Furthermore, it seems likely that PPAR-alpha might play a key role in DEHP related metabolic disruption. Further studies are required to better elucidate the effect of DEHP on individual metabolic pathway implicated in this thesis.
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Ho, Cheuk Hei. "Molecular Barcoded Plasmid Yeast ORF Library: Linking Bioactive Compounds to their Cellular Targets and Mapping Dosage Suppressor Networks." Thesis, 2011. http://hdl.handle.net/1807/29745.
Full textAbstract:
In this thesis I describe a functional genomics resource in which each yeast gene, with its native promoter and 3’UTR, is cloned on a uniquely barcoded low-copy vector. We refer to this resource as the Molecular Barcoded Yeast ORF (MoBY-ORF) library 1.0. Each gene carried by MoBY-ORF 1.0 should mimic its native expression and thus is best suited for complementation cloning. The vector backbone of MoBY-ORF 1.0 is compatible with the mating-assisted genetically integrated cloning (MAGIC) system for recombination cloning in bacterial cells, which allows the transfer of the ORF fragment and its barcoded cassette to other vector backbones. Taking advantage of the MAGIC system, we created a multi-copy version of the library, which we refer to as MoBY-ORF 2.0.
I used MoBY-ORF 1.0 to map drug resistant mutants by complementation cloning with a barcode microarray readout. I investigated several drugs with known targets in my proof-of-principle experiments and showed the feasibility of this method. I identified a single mutation that causes resistance to two different natural products, theopalauamide and stichloroside. By doing so, I was able to link these two chemicals to their cellular target, ergosterol. In fact, theopalauamide represents a new class of sterol binding chemical.
I also describe the use of MoBY-ORF 2.0 to clone dosage suppressors of conditional temperature-sensitive mutants. By doing so, and combing our own data with published literature, we showed that dosage suppression interactions often overlap with protein-protein interactions and negative genetic interactions but not positive interactions; however the majority of dosage suppression interactions are unique and thus they represent an unique edge on a global functional interaction map. We also describe the first genome-wide dosage suppressor interaction map of budding yeast.
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Jouhet, Juliette. "ETUDE DES REMANIEMENTS LIPIDIQUES DES CELLULES VEGETALES EN CARENCE DE PHOSPHATE." Phd thesis, 2005. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00011166.
Full textAbstract:
Dans de nombreux sols, le phosphate est un élément limitant pour la croissance des plantes. Au niveau cellulaire, la carence de phosphate induit une diminution de la teneur en phospholipides, permettant la mobilisation du phosphate contenu dans ces molécules. Cette baisse est compensée par une augmentation de la teneur en glycolipides plastidiaux non phosphorés tels que le digalactosyldiacylglycérol (DGDG). Nous avons montré qu'au cours de la carence de phosphate, une partie des phospholipides est reconvertie en phosphatidylcholine (PC), produisant, au temps court de carence, une accumulation transitoire de PC dans les cellules. La PC est ensuite hydrolysée en diacylglycérol (DAG) qui s'accumule en carence de phosphate et nourrit la synthèse du DGDG. Nos résultats suggèrent un transfert direct du DAG à partir des membranes non plastidiales vers l'enveloppe des plastes, lieu de synthèse du DGDG. Le DGDG est ensuite exporté dans des membranes extraplastidiales. Nous avons mis en évidence la présence de DGDG dans les mitochondries et son transfert des plastes vers les mitochondries à partir de contacts entre des domaines spécialisés de l'enveloppe des plastes et des mitochondries. Enfin, pour identifier des protéines impliquées dans ces mécanismes de remaniement des lipides, nous avons collaboré à une analyse transcriptomique du génome d'Arabidopsis thaliana en carence de phosphate. Nous avons notamment sélectionné une phospholipase D, PLDzéta2, qui semble impliquée dans le contrôle de la teneur intracellulaire en phosphate inorganique et dans l'hydrolyse de la PC pour l'approvisionnement en DAG de la synthèse des galactolipides.