Dissertations / Theses: 'Cellules et tissus'

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Chopinet-Mayeux, Louise. "Effets des champs électriques pulsés milli et nanosecondes sur cellules et tissus." Phd thesis, Université Paul Sabatier - Toulouse III, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00874040.

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Abstract:

L'électroperméabilisation est une technique permettant, entre autre, l'entrée de molécules cytotoxiques dans les tumeurs. Elle consiste en la perméabilisation transitoire de la membrane plasmique suite à l'application de champs électriques pulsés. Certaines conditions électriques permettent le transfert de gène, ouvrant le champ d'application de la technique à la thérapie génique. Cette thèse s'est intéressée à étudier les effets des champs électriques sur cellules et tissus, dans le cas de l'électro-transfert de gène. En effet, la compréhension mécanistique de ce transfert est indispensable à l'optimisation de la technique pour les futures applications cliniques. Dans ce contexte, nous nous sommes attachés à étudier les 3 barrières rencontrées par le gène lors de son transfert, à savoir la complexité de l'environnement multicellulaire au niveau du tissu, la membrane plasmique et l'enveloppe nucléaire au niveau de la cellule. i) L'efficacité de l'electrotransfer de gène a été étudié sur le modèle de tumeur in vitro/ex vivo dit sphéroïde. Dans un premier temps ce modèle a été validé pour l'étude de l'électrotransfection et dans un deuxième temps les raisons de l'absence d'efficacité en structure tissulaire ont été mises en évidence et l'optimisation de la technique a été amorcée. ii) Une deuxième partie a été dédiée à l'étude nano-mécanique des cellules à l'échelle de la membrane plasmique par microscopie à force atomique. La microscopie à force atomique a été utilisée afin d'imager et mesurer par spectroscopie de force l'effet de l'électroperméabilisation sur la membrane plasmique. Nous avons imagé la perturbation membranaire et mesuré une diminution d'élasticité membranaire suivant l'application des champs électriques. Ce phénomène a été relié aux effets secondaires de l'électroperméabilisation affectant l'actine corticale. iii) Une dernière partie s'est intéressée aux effets des nanopulses. Ces impulsions très courtes (ns) et intenses (plusieurs kV/cm) représentent la nouvelle génération d'impulsions, dont les effets sont encore peu décrits, mais pourraient permettre une déstabilisation spécifique de l'enveloppe des organelles. L'impact de ses impulsions nanosecondes sur la membrane ont été analysée par Patch-Clamp pour déterminer l'implication du cytosquelette d'actine dans la forme des nanopores créés. Dans un deuxième temps leur impact sur l'enveloppe nucléaire a été étudié, dans le but de déterminer d'éventuels effets néfastes sur le fonctionnement cellulaire, et la potentielle augmentation de transfection résultant d'une déstabilisation de la deuxième barrière rencontré par le gène lors de son transfert. Il est montré que l'actine ne joue pas de rôle dans la formation des nanopores, et que les impulsions nanosecondes ne permettent pas d'augmenter l'efficacité de transfection. En conclusion ces travaux ont apporté de nouveaux éléments dans la compréhension du mécanisme d'électroporation et des barrières au transfert de gène. Des protocoles, modèles, et outils ont été mis en place et sont aujourd'hui validés et disponibles pour une investigation poussée des effets des champs électriques sur le vivant.

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Chopinet, Louise. "Effets des champs électriques pulsés milli et nanosecondes sur cellules et tissus." Toulouse 3, 2013. http://thesesups.ups-tlse.fr/2171/.

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Abstract:

L'électroperméabilisation est une technique permettant, entre autre, l'entrée de molécules cytotoxiques dans les tumeurs. Elle consiste en la perméabilisation transitoire de la membrane plasmique suite à l'application de champs électriques pulsés. Certaines conditions électriques permettent le transfert de gène, ouvrant le champ d'application de la technique à la thérapie génique. Cette thèse s'est intéressée à étudier les effets des champs électriques sur cellules et tissus, dans le cas de l'électro-transfert de gène. En effet, la compréhension mécanistique de ce transfert est indispensable à l'optimisation de la technique pour les futures applications cliniques. Dans ce contexte, nous nous sommes attachés à étudier les 3 barrières rencontrées par le gène lors de son transfert, à savoir la complexité de l'environnement multicellulaire au niveau du tissu, la membrane plasmique et l'enveloppe nucléaire au niveau de la cellule. I) L'efficacité de l'electrotransfer de gène a été étudié sur le modèle de tumeur in vitro/ex vivo dit sphéroïde. Dans un premier temps ce modèle a été validé pour l'étude de l'électrotransfection et dans un deuxième temps les raisons de l'absence d'efficacité en structure tissulaire ont été mises en évidence et l'optimisation de la technique a été amorcée. Ii) Une deuxième partie a été dédiée à l'étude nano-mécanique des cellules à l'échelle de la membrane plasmique par microscopie à force atomique. La microscopie à force atomique a été utilisée afin d'imager et mesurer par spectroscopie de force l'effet de l'électroperméabilisation sur la membrane plasmique. Nous avons imagé la perturbation membranaire et mesuré une diminution d'élasticité membranaire suivant l'application des champs électriques. Ce phénomène a été relié aux effets secondaires de l'électroperméabilisation affectant l'actine corticale. Iii) Une dernière partie s'est intéressée aux effets des nanopulses. Ces impulsions très courtes (ns) et intenses (plusieurs kV/cm) représentent la nouvelle génération d'impulsions, dont les effets sont encore peu décrits, mais pourraient permettre une déstabilisation spécifique de l'enveloppe des organelles. L'impact de ses impulsions nanosecondes sur la membrane ont été analysée par Patch-Clamp pour déterminer l'implication du cytosquelette d'actine dans la forme des nanopores créés. Dans un deuxième temps leur impact sur l'enveloppe nucléaire a été étudié, dans le but de déterminer d'éventuels effets néfastes sur le fonctionnement cellulaire, et la potentielle augmentation de transfection résultant d'une déstabilisation de la deuxième barrière rencontré par le gène lors de son transfert. Il est montré que l'actine ne joue pas de rôle dans la formation des nanopores, et que les impulsions nanosecondes ne permettent pas d'augmenter l'efficacité de transfection. En conclusion ces travaux ont apporté de nouveaux éléments dans la compréhension du mécanisme d'électroporation et des barrières au transfert de gène. Des protocoles, modèles, et outils ont été mis en place et sont aujourd'hui validés et disponibles pour une investigation poussée des effets des champs électriques sur le vivant
Electropermeabilization is a physical technique first developed to transfer cytotoxic drugs in tumor. It consists in the transient permeabilization of the plasma membrane following electric field application. In specific electric conditions using long pulses of several milliseconds, the membrane destabilization can allow transferring plasmid DNA into the cell, thus allowing the development of gene therapy. For now, one clinical trial has been published using gene eletro-transfer and several others are ongoing. However the efficiency of the technique remains low compared to other transfer methods. This thesis gets interested in how pulsed electric fields affect cell membranes, in the concrete situation of gene transfer by electroporation. The comprehension of electro-gene transfer process need to be well understood in order to optimize it. In this context, we focus on the 3 barriers that DNA is confronted to during its transfer: first at the cell level: plasma membrane and nuclear envelope, second at the tissue level: the complexity of a multicellular environment. I) We first studied the efficiency of gene transfer on multicellular spheroid model. This work allowed the validation of this model for electro-transfection study, and the further optimization of the technique by raising some of the failures encountered in gene transfer in tissue. Ii) The second part of the work has been dedicated to study plasma membrane destabilization due to electroporation by Atomic Force Microscopy. We used both innovating imaging modes and spectroscopy modes to analyze the effects on living cells, which resulted in the measurement of a decrease in elasticity, linked to side effects of electric fields on actin cytoskeleton destabilization. Iii) The last part has been dedicated to the effects of nanopulses (nsEP) on both plasma membrane and the second barrier encountered by gene during its transfer, namely nuclear envelope. The effects of these very short (ns) and intense (several kV/cm) pulses have been indeed shown to affect both cell membrane and internal envelope (organelles ones). We first study their effect on membrane using patch-clamp to discriminate in the implication of actin cytoskeleton in nanopores formation. We secondly aimed to study how these nanopulses affect the special structure that is nuclear envelope during gene transfer, for validating their potential use on humans, and their possible role in optimization for gene transfer. P-clamp study revealed that actin is not involved in nanopores formation, and gene transfer one that nsEP do not affect positively transfection efficiency. Altogether this thesis brings new insights in electropermeabilization mecanisms understanding and barriers for gene transfer in tissue. Methods, models and tools have been set and validated. They are now usable for investigating electric field effect on living organisms

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Jeanson, Yannick. "Métabolisme redox et plasticité tissulaire des tissus adipeux." Thesis, Toulouse 3, 2015. http://www.theses.fr/2015TOU30034.

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Abstract:

Une littérature très dynamique montre l'existence de profils métaboliques et redox spécifiques associés à des états d'immaturité, de différenciation ou d'activation cellulaire. Par ailleurs, certains produits dérivés du métabolisme, en déclenchant des voies de signalisation particulières, affectent le devenir cellulaire. Alors que le développement du tissu adipeux blanc est fortement dépendant du contexte métabolique, peu d'études se sont intéressées au rôle du métabolisme et plus particulièrement des métabolites sur les phénomènes de plasticité cellulaire très caractéristiques de ce tissu dont le brunissement. En effet, à côté des adipocytes blancs, des adipocytes dénommés "beige" exprimant la protéine découplante UCPl et distincts des adipocytes bruns dit classiques apparaissent dans le tissu adipeux blanc dans des conditions thermogéniques par exemple (brunissement). L'existence de plusieurs populations de précurseurs spécifiques des différents types d'adipocytes ainsi que le phénomène de transdifférenciation sont des mécanismes proposés comme étant à l'origine du phénomène de brunissement. L'objectif de nos travaux a été de déterminer i) s'il existait une hétérogénéité métabolique et fonctionnelle au sein des précurseurs adipocytaires et ii) l'impact de l'environnement métabolique sur le processus de brunissement. D'une part, nous avons mis en évidence que le marqueur de surface CD38, dont l'activité enzymatique est liée au métabolisme redox cellulaire par sa consommation de NAD+, constitue un marqueur d'engagement adipocytaire vers les voies adipogéniques blanche et beige. D'autre part, nous avons montré que le lactate, un important métabolite intermédiaire, induit le brunissement des adipocytes blancs et une forte augmentation de l'expression d'UCPI et ce par un mécanisme redox dépendant. Une seconde voie mettant en jeu le facteur FGF21 amplifie l'induction du browning induit par le lactate. De plus, grâce à différentes approches de perte et de gain de fonction in vivo, nous avons démontré que les adipocytes de type brun, dont le développement est fortement favorisé par le lactate, sont aussi de forts consommateurs de ce métabolite potentiellement toxique à fortes doses. Nos travaux attribuent donc une nouvelle fonction aux adipocytes de type brun. Outre leur fonction dans la régulation thermogénique, ne pourrions-nous pas en effet leur attribuer également une nouvelle fonction de défense face à un stress métabolique ?
A very dynamic literature daims that specific metabolic and redox profiles are associated with specific cellular states including stemness, differentiation or cell activation. Furthermore, some metabolism derivatives affect cellular behavior through the fine regulation of signaling pathways. Whereas white adipose tissue development and plasticity is highly dependent on the general metabolic context, few studies investigated the role ofmetabolism on its cell plasticity. Beside white adipocytes, some UCPI (uncoupling protein 1)-expressing adipocytes, that are distinct from classical brown adipocytes and named beige adipocytes arise among white fat in thermogenic conditions by the so-called browning process. The putative existence of different populations of precursors giving rise to the different types of adipocytes together with the transdifferentiation process appear as mechanisms at the origin of the browning process. The aim of our work was to define i) the putative existence ofmetabolic and functional heterogeneity within adipose precursors and ii) the impact ofthe metabolic environment on the browning process. First, we showed that the CD38 antigen, whose activity is linked to cell redox metabolism through NAD+ consumption, constitutes a marker for white and beige adipogenic commitment. We also demonstrated that lactate, a major redox metabolic intermediate, strongly induces browning ofwhite adipose cells through a redox-dependent increase in UCPI expression. An additional pathway involving the FGF21 growth factor also contributes to lactate induced-browning. Using different approaches of Joss and gain of function in vivo, we further showed that brown-like adioocvtes, whose development is strongly increased by lactate, constitute great consumers of this metabolite which is potentially toxic at high doses. Our works highlight a new function for brown-like adipocytes. Indeed, in addition to their thermogenic function, could they constitute cellular defense against metabolic stress?

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Sollier, Kévin, and Kévin Sollier. "Fonctions et régulations des protéines Crumbs dans la morphogenèse des tissus épithéliaux." Doctoral thesis, Université Laval, 2016. http://hdl.handle.net/20.500.11794/27011.

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Abstract:

Les tissus épithéliaux recouvrent les surfaces et les cavités du corps et fonctionnent comme des barrières sélectives capables d'échanges entre les différents compartiments de l'organisme. La fonctionnalité de ces tissus repose notamment sur la mise en place et le maintien d'une asymétrie structurale des cellules épithéliales, aussi appelée « polarité épithéliale ». La modulation des mécanismes orchestrant l'asymétrie membranaire est centrale dans la formation et le maintien de l'architecture des tissus épithéliaux. Ainsi, des défauts de polarité épithéliale provoquent des anomalies morphologiques et fonctionnelles des tissus épithéliaux, qui peuvent contribuer au cancer chez l'Homme. C'est pourquoi, la compréhension des processus liés à la polarité épithéliale constitue des objectifs cruciaux dans la biologie des épithéliums et dans la santé humaine, pour assurer le développement de nouvelles thérapies liées au rétablissement des fonctions soutenues par une asymétrie membranaire. Les mécanismes de polarité épithéliale et leurs fonctions signalétiques dans la morphogenèse des tissus épithéliaux jouent un rôle central dans ma thèse et font l'objet de mon introduction. Mon projet de doctorat a consisté à caractériser la fonction et la régulation de Crumbs, un acteur clé dans la mise en place du domaine apical, dans le contrôle de la morphologie cellulaire et dans la morphogenèse des tissus épithéliaux. C'est pourquoi, l'étude de la régulation de la fonction de Crb au sein de la cellule épithéliale revêt un rôle capital dans la compréhension de la biologie des épithéliums. Dans ce cadre, nous avons d'abord permis d'approfondir les modalités d'une éventuelle fonction du domaine extracellulaire de CRB3A. De plus, nous montrons que la GTPase Rac1 permet de contrôler Crumbs dans un contexte tridimensionnel. Ainsi, nous proposons un modèle fonctionnel de Crumbs, soutenu par des approches in vitro et in vivo, dans le contrôle de la morphologie cellulaire et la morphogenèse des tissus tridimensionnels.
Les tissus épithéliaux recouvrent les surfaces et les cavités du corps et fonctionnent comme des barrières sélectives capables d'échanges entre les différents compartiments de l'organisme. La fonctionnalité de ces tissus repose notamment sur la mise en place et le maintien d'une asymétrie structurale des cellules épithéliales, aussi appelée « polarité épithéliale ». La modulation des mécanismes orchestrant l'asymétrie membranaire est centrale dans la formation et le maintien de l'architecture des tissus épithéliaux. Ainsi, des défauts de polarité épithéliale provoquent des anomalies morphologiques et fonctionnelles des tissus épithéliaux, qui peuvent contribuer au cancer chez l'Homme. C'est pourquoi, la compréhension des processus liés à la polarité épithéliale constitue des objectifs cruciaux dans la biologie des épithéliums et dans la santé humaine, pour assurer le développement de nouvelles thérapies liées au rétablissement des fonctions soutenues par une asymétrie membranaire. Les mécanismes de polarité épithéliale et leurs fonctions signalétiques dans la morphogenèse des tissus épithéliaux jouent un rôle central dans ma thèse et font l'objet de mon introduction. Mon projet de doctorat a consisté à caractériser la fonction et la régulation de Crumbs, un acteur clé dans la mise en place du domaine apical, dans le contrôle de la morphologie cellulaire et dans la morphogenèse des tissus épithéliaux. C'est pourquoi, l'étude de la régulation de la fonction de Crb au sein de la cellule épithéliale revêt un rôle capital dans la compréhension de la biologie des épithéliums. Dans ce cadre, nous avons d'abord permis d'approfondir les modalités d'une éventuelle fonction du domaine extracellulaire de CRB3A. De plus, nous montrons que la GTPase Rac1 permet de contrôler Crumbs dans un contexte tridimensionnel. Ainsi, nous proposons un modèle fonctionnel de Crumbs, soutenu par des approches in vitro et in vivo, dans le contrôle de la morphologie cellulaire et la morphogenèse des tissus tridimensionnels.

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GOLESTANEH, NADY. "Les recepteurs mineralocorticoides et les canaux a na + des tissus epitheliaux (enac) : expression et immunolocalisation dans les tissus oculaires et les cellules non epitheliales." Paris 6, 2000. http://www.theses.fr/2000PA066188.

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Abstract:

Les recepteurs mineralocorticoides (rm) font parties de superfamille des recepteurs nucleaires et interviennent dans la regulation de la balance hydrosodique via des canaux a na + des tissus epitheliaux (enac). Ces deux proteines sont largement reparties dans le regne animal. Notre engagement dans la recherche des rm et des canaux enac dans les tissus oculaires et deux lignees cellulaires resultent de l'importance de ces deux proteines qui se caracterise par leur conservation au cours de l'evolution. Nous avons fabrique au sein du laboratoire des anticorps polyclonaux diriges contre le rm et le enac. Ils ont permis de detecter ces proteines par des techniques immunochimiques ou immunocytochimiques. La biologie moleculaire, et l'utilisation des amorces specifiques, nous a permis d'etudier expression de ces proteines dans divers tissus et cellules et de les identifier par le sequensage. L'utilisation de digoxigenin 11-dutp nous a permis d'effectuer la pcr semi-quantitative et d'etudier la regulation de leur expression. Nous avons demontre pour, la premiere fois, l'expression d'arnm codant pour le rm et le canal enac dans les tissus oculaires comme la retine entiere, la couche des photorecepteurs separee par le vibratome, les cellules epr, les cellules de muller gliales de rat (rmg), les fibroblastes corneens humains et dans les cellules non epitheliales : une lignee cellulaire hel (human erythroleukemia cells) et une lignee cellulaire endotheliale des microvaisseaux du derme humain (hmec-1). Par ailleurs, nous avons demontre la regulation de l'expression des canaux enac par les hormones mineralocorticoides dans les cellules epr et les cellules rmg. Nous avons egalement montre l'effet de ces hormones sur la proliferation cellulaire dans les cellules fibrobalstes corneens, les cellules hel et les cellules endotheliales hmec-1. De plus nous avons demontre la disposition des rm et des canaux enac par rapport aux cytosquelettes dans les cellules rmg et hmec-1. L'ensemble de nos resultats nous amene a nous interroger sur les differents roles physiologiques possibles de ces proteines ainsi que leur implication dans diverses pathologies.

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Sallafranque, Marie-Line. "Expression et localisation de la tryptophanyl-tARN synthétase dans les tissus et cellules de bœuf." Bordeaux 2, 1986. http://www.theses.fr/1986BOR22002.

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Sallafranque, Marie-Line. "Expression et localisation de la tryptophanyl-tarn synthérase dans les tissus et cellules du boeuf." Grenoble 2 : ANRT, 1986. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37601003n.

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Daydé, Dominique. "Bioproduction et bioconversion de saponines triterpéniques par des tissus de gypsophile et de saponaire cultivés in vitro." Toulouse, INPT, 1990. http://www.theses.fr/1990INPT009A.

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Abstract:

La culture in vitro de quatre especes de gypsophila nous a permis de mettre en evidence une variabilite des caracteres morphololiques des differentes souches: nous avons obtenu des souches tissulaires chlorophylliennes constituees de tiges feuillees a partir des especes g. Paniculata et g. Muralis, et de cals formas de cellules indifferenciees a partir des especes g. Paniculata, g. Petraea et g. Repens. L'etude de la teneur en saponines triterpeniques de ces differentes souches cultivees en milieu gelose a ete realisee par un dosage indirect d'une prosaponine, le gypsogenine 3,0-glucuronide (g3,0g) qui peut etre obtenu apres hydrolyse acide des saponines de racines de gypsophile. Les quatre especes de gypsophile accumulent in vitro le g3,0g a des taux variables, l'espece g. Paniculata renfermant les souches les plus productrices du souchier (0,13% ms). Le passage en milieu liquide d'une souche tissulaire de g. Paniculata a permis de produire en presence d'acetate de sodium (2##1#4 c) de grandes quantites de g3,0g (activite specifique=184,6 kbq. Mm##1). L'utilisation de concentrations croissantes de g3,0g introduit dans la suspension cellulaire de saponaria offinalis (qui ne produit pas in vitro cette saponine), nous a permis de definir la concentration maximale de g3,0g toleree par les cellules. Cette dose (5 10##2 mm) ne perturbe ni la croissance des cellules (determinee par la mesure du nombre total de cellules et par la teneur en glucose residuelle du milieu de culture), ni la viabilite cellulaire, (evaluee pour le pourcentage des cellules mortes, par la consommation des cellules en oxygene dissous dans le milieu de culture et par la capacite des cellules a reduire le chlorure de triphenyl tretazolium (ctt) en un compose rouge, le formazan). L'utilisation de g3,0g radioactif nous a montre que substrat etait rapidement glycosyle par les cellules de s. Officinalis en suspension

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Rousseau, Alexandre. "Optimisation de substituts de tissus urologiques entièrement humains reconstruits par génie tissulaire avec les cellules isolées du tissu adipeux." Thesis, Université Laval, 2013. http://www.theses.ulaval.ca/2013/29958/29958.pdf.

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Abstract:

La vessie est un organe qui est sujet à diverses maladies ou malformations nécessitant parfois des chirurgies pour remédier aux problèmes. Ces chirurgies ont souvent pour but d’augmenter le volume utile de la vessie pour protéger les reins. Plusieurs substituts de tissu urologique existent, mais aucun ne possède les qualités suffisantes pour répondre aux conditions physiologiques auxquelles ces tissus seront soumis. L’objectif du projet consiste à créer un substitut entièrement humain par la méthode d’auto-assemblage et à caractériser ce tissu. De plus, la possibilité de produire ce substitut à l’aide des cellules stromales isolées du tissu adipeux a été étudiée. Le potentiel de ces cellules pourrait permettre d’optimiser la greffe de ces substituts. Nos résultats montrent qu’il est possible de reconstruire un substitut entièrement humain par la méthode d’auto-assemblage et que les cellules stromales isolées du tissu adipeux peuvent être utilisées pour participer à la reconstruction d’un substitut vésical.

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Leobon, Bertrand. "Etudes des potentiels cardiogéniques et angiogéniques in vivo des cellules dérivées des tissus adipeux." Toulouse 3, 2008. http://www.theses.fr/2008TOU30218.

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Abstract:

La transplantation de myoblastes dans un infarctus du myocarde amène à la formation de myotubes avec des propriétés électrophysiologiques différentes de celles des cardiomyocytes et sans couplage électromécanique avec le myocarde environnant. Nous avons alors exploré les cellules cardiomyogéniques du tissu adipeux murin (AD-CMG). Une procédure de culture optimisée a permis d'obtenir une grande quantité de ces cellules. La transplantation de telles cellules exprimant la protéine verte fluorescente dans un modèle murin d'ischémie myocardique a montré une différentiation cardiaque. L'exploration par échocardiographie a montré significativement l'absence de dilatation ventriculaire et la stabilité de la fonction ventriculaire gauche. En plus d'un mécanisme de régénération myocardique, l'hypothèse angiogénique a été analysée dans un modèle d'infarctus chronique du myocarde de rat, comparant 3 types de cellules murines: ADSC (adipose-derived stromal cells), AD-CMG et cellule mononucléées de la moelle. Les deux populations adipeuses amélioraient la fonction ventriculaire gauche à l'échographie, la viabilité myocardique en tomographie par emission de positons et augmentaient la densité capillaire. Un essai clinique de phase Ia de traitement de l'ischémie critique chronique du membre inférieur par injections d'ADSC autologues a été initié. Le critère principal était la faisabilité et la tolérance. Les bénéfices cliniques du étant analysés en critères secondaires. Les propriétés cardiovasculaires prometteuses des cellules dérivées du tissu adipeux ouvrent la voie à de nombreuses applications cliniques, comme la régénération myocardique, la revascularisation ou les biomatériaux
The transplantation of myoblasts in a myocardial infarction led to the formation of myotubes with electrophysiological properties different from those of cardiomyocytes and showed the absence of electromechanical coupling with the surrounding myocardium. We then used cardiomyogenic cells from murin adipose tissue (AD-CMG). An optimized culture procedure to obtain a large quantity of these cells. The transplantation of these cells expressing green fluorescent protein in an murin ischemic myocardium showed a cardiac differentiation. The assessment by echocardiography showed the absence of ventricular dilation and a significant stability of the left ventricular function. In addition to a mechanism of myocardial regeneration, the angiogenic assumption was investigated in a model of chronic myocardial infarction in rats, by comparing the injection of 3 types of murine cells: ADSC (adipose-derived stromal cells), AD-CMG and bone marrow mononuclear cells. Both adipose populations improved the left ventricular function on echocardiography, myocardial viability on positron emission tomography and increased capillary density. Finally, after the assessment of safety and technical feasibility, a phase Ia clinical trial on the treatment of chronic critical ischemia of the lower limb by autologous ADSC was initiated. The primary endpoints are feasibility and tolerance. Clinical benefits associated with the treatment are under investigation as secondary criteria. The promising properties of cells derived from adipose tissue in the cardiovascular field pave the way for many clinical applications in the areas of myocardial regeneration, revascularization or biomaterials

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Blache, Philippe. "Etude sur la maturation post-traductionnelle du proglucagon au niveau des tissus producteurs et d'un tissu-cible, le foie." Montpellier 2, 1989. http://www.theses.fr/1989MON20184.

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Abstract:

Le glucagon hormone hyperglycemiante du pancreas est un peptide de 29 acides amines. La glicentine et l'oxyntomoduline sont des peptides d'origine intestinale qui contiennent la sequence du glucagon plus une extension de 8 acides amines du cote c-terminal, la glicentine possede en plus une extension de 32 acides amines du cote n-terminal. Le fragment (19-29) du glucagon est 1000 fois plus actif que le glucagon sur l'inhibition de la pompe a calcium de l'hepatocyte. Nous avons developpe la methode de couplage au thiol-maleoyl qui permet de greffer un petit peptide a la surface d'un support proteique tel que la bsa. En utilisant cette methode pour preparer l'immunogene, nous avons obtenu: un anticorps c-terminal de l'oxyntomoduline et de la glicentine qui reconnait l'octapeptide c-terminal de ces deux peptides et qui ne reconnait pas le glucagon, un anticorps n-terminal du glucagon (19-29) qui reconnait l'hexapeptide n-terminal du glucagon (19-29) et qui ne reconnait pas le glucagon. En utilisant ces anticorps en association avec la separation physique des peptides par chromatographie en phase liquide a haute performance, nous avons montre que: les produits finaux derivant du proglucagon dans l'intestin grele humain et de rat ainsi que dans l'hypothalamus de rat sont la glicentine et l'oxyntomoduline, ces deux peptides sont egalement presents dans le plasma. Le glucagon (19-29) est produit dans le pancreas et dans l'estomac du rat ou il represente environ 3% de la quantite du glucagon. Nous avons mis en evidence, au niveau de la membrane hepatique, une maturation du glucagon en un fragment (19-29)

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Boubaker, El Andalousi Ramzi. "Modification des caractéristiques morphologiques et fonctionnelles des muscles squelettiques après transplantation de cellules précurseurs isolées des tissus musculaire et adipeux." Montpellier 2, 2002. http://www.theses.fr/2002MON20020.

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Jourdin, Sophie. "La culture des tissus végétaux, de la seconde moitié du XIXe siècle au XXe siècle." Paris 7, 2009. http://www.theses.fr/2009PA070061.

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Abstract:

L'histoire de la culture des tissus végétaux de la seconde moitié du XIXe siècle au XXe siècle révèle l'évolution de nombreux aspects de la biologie et physiologie végétales en construction, pour comprendre comment on maîtrise les parties végétales, leurs besoins et leur capacité à survivre isolées en dehors de l'organisme et en conditions artificielles. Au-delà du travail historique sur le développement de ces cultures - aux Etats-Unis, en Allemagne et en France - la thèse est une étude épistémologique de l'évolution de la représentation des conceptions théoriques sur les potentialités de la cellule et ses limites. En outre, cette étude insiste sur le caractère très empirique de la mise au point de ces méthodes expérimentales. Nous mettons en évidence le fait que les cultures sont des objets d'étude tout en étant des instruments de cette recherche en biologie ; nous étudions aussi les liens très étroits avec la physiologie de la nutrition et de la division cellulaire, impliquant la question des hormones végétales et engageant le concept même de cellule. Cette histoire étant liée à la génétique, la biochimie, la cytologie, et après la seconde guerre mondiale, à la biologie moléculaire, l'étude des cultures cellulaires est une problématique originale pour étudier les transformations importantes de la biologie contemporaine
The history of the plant tissue culture in the second half of the XIXe century at the XXe century shows the evolution of many aspects of the evolution of plant biology and physiology, to understand how to control the vegetable parts, their needs and their capacity to survive isolated and in artificial conditions. Beyond an historical work on the development of these cultures - in the United States, in Germany and in France -the thesis is an epistemological study of the evolution of the representation of the theoretical conceptions on the potentialities of the cell and its limits. Moreover, this study insists on the very empirical character of the development of these experimental methods. We emphasize that the cultures are objects of study while being instruments of this research in biology; we study also the very close links with the physiology of the nutrition and the cellular division, implying the question of the vegetable hormones and engaging the concept of cell itself. This history being related to the genetics, biochemistry, cytology, and after the second world war, molecular biology, the study of the cellular cultures is an original problematic for studying the important transformations of contemporary biology

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Li, Junjun. "Etude et exploration de microdispositifs : capture des cellules rares, criblage à haut débit, et formation de tissus cardiaques." Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066251.

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Abstract:

Ce travail de thèse vise à la conception et la fabrication de prototypes de dispositifs qui peuvent être utilisés pour le diagnostic, la découverte de médicaments et l'ingénierie biomédicale. Tout d'abord, un dispositif microfluidique est proposé pour la capture à haute efficacité de cellules rares. La simulation numérique est effectuée pour prouver le concept. Ensuite, le dispositif de capture est utilisé pour la capture de cellules progénitrices épithéliales (EPC) dispersées soit dans une solution tampon ou dans un échantillon de sang. Le même dispositif est également validé pour la capture des cellules tumorales circulantes (CTCs), montrant de nets avantages de ces dispositifs en termes d'efficacité de capture et de vitesse de traitement de l'image par rapport à d'autres configurations de dispositifs. Deuxièmement, un système multiplexé d’impédance est proposé pour suivre en temps réel l'effet de médicaments sur des cellules en culture. Le dispositif fabriqué est validé par mesure de différenciation des cellules adipogéniques pendant deux semaines en présence de facteurs d'inhibition ou de stimulation. Troisièmement, des nanofibres alignées sont transferrées sur la surface d’un dispositif de puces à électrodes multiples (MEA) pour améliorer la formation de couches de cellules cardiaques. Les cellules cardiaques dérivées des cellules souches pluripotentes (hPSCs) humaines sont utilisées pour la preuve de concept, montrant une forte anisotropie de la conduction et une meilleure maturation des couches de cellules cardiaques par rapport à celles cultivées sur une surface plane de MEA

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Sabri, Nai͏̈ma. "Approche biophysicochimique du transfert direct d'ADN dans des cellules et des tissus végétaux intacts par électroperméabilisation." Toulouse 3, 1996. http://www.theses.fr/1996TOU30291.

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Abstract:

Le developpement des techniques de transgenese a permis de lever les limites associees aux voies classiques impliquant les croisements naturels. Elles permettent en effet de modifier une espece vegetale de telle sorte qu'elle ne differe de l'espece parentale que par la presence d'un gene donne qui peut appartenir a n'importe quel type d'organisme. Se trouvent ainsi franchies les barrieres d'especes et maintenu le fond genetique a l'exception du ou des genes transferes. Ceci n'est pas le cas des methodes classiques qui impliquant les processus sexuels, seuls des genes de la meme espece sont ainsi retenus et cela dans un contexte genique a chaque fois different et non determine. L'etude presentee s'inscrit dans le cadre de la transgenese vegetale en utilisant des systemes intactes et l'electrotransformation comme methodologie. La cellule selectivement isolee du milieu extracellulaire maintient de part et d'autre de sa membrane plasmique une difference de potentiel. L'application d'un champ electrique externe (electropulsation) a une suspension cellulaire induit un etat permeable non selectif, transitoire et reversible dans des conditions de champ electrique respectant la viabilite des cellules electropulsees (electropermeabilisation). Cet etat permeable permet de surmonter cette barriere de permeabilite membranaire selective et le passage de petites molecules independamment de la nature du milieu d'electropulsation. Par contre, l'electrotransfert d'adn necessite la plasmolyse des cellules en presence du plasmide a transferer avant l'electropermeabilisation. Nous obtenons par cette double procedure, plasmolyse et permeabilisation, la transformation de cellules intactes aussi bien somatiques (suspension cellulaire de mais) qu'embryonnaire (embryons immatures de mais et cals embryogenes de soja). D'un autre cote, l'electropermeabilisation des cellules declenche une reaction de stress qui se manifeste par une generation d'especes oxygenees reactives. Nous proposons un modele mettant en jeu une cascade d'evenements similaire a celle induite lors d'une attaque de la plante par un pathogene, et qui est declenchee par l'electropermeabilisation aux ions calcium. Si la generation de ces especes oxygenees reactives ne presente pas un effet dominant dans la mortalite cellulaire electroinduite, leur piegeage par les molecules antioxydantes tel que l'ascorbate a pour effet d'ameliorer le taux d'electrotransformation

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Phulpin, Bérengère. "Modélisation de dégénérescence tissulaire radio-induite et conceptualisation de réhabilitation des tissus irradiés par thérapie cellulaire." Thesis, Nancy 1, 2011. http://www.theses.fr/2011NAN10064/document.

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Abstract:

La radiothérapie induit des séquelles aigues puis tardives affectant les tissus sains inclus dans le volume irradié. D'une façon générale, le processus lésionnel se caractérise par une ischémie vasculaire, une apoptose cellulaire et une fibrose cicatricielle. Dans ce contexte, la thérapie cellulaire à l'aide de cellules souches mésenchymateuses médullaires CSMM pourrait constituer une nouvelle approche thérapeutique séduisante, les CSMM ayant une capacité intrinsèque à promouvoir l'angiogenèse et une implication dans les processus naturels de réparation tissulaire. La première partie de ce travail a consisté à la mise au point de modèles murins présentant un processus de dégénérescence tissulaire similaire à celui survenant après radiothérapie. L'objectif étant d'affiner la compréhension des mécanismes physiopathologiques des lésions tissulaires radio-induites et de déterminer une stratégie thérapeutique la plus adaptée possible. La seconde partie de ce travail a été consacrée à l'évaluation de la faisabilité d'une autogreffe de CSMM dans le modèle murin d'irradiation précédemment établi en répondant à deux pré-requis : la rétention des cellules injectées au niveau du tissu cible et l'évaluation de la greffe sur le métabolisme osseux. Cette investigation préclinique sur un modèle murin a permis de réaliser une étape essentielle dans l'évaluation du traitement des lésions tissulaires radio-induites par thérapie cellulaire. Les données issues de ces travaux pourraient à terme permettre la mise en place d'études cliniques
Radiation therapy induced acute and late sequelae within healthy tissue included in the irradiated area. In general, lesions are characterized by ischemia, cell apoptosis and fibrosis. In this context, cell therapy using bone marrow mesenchymal stem cells (BMSC) might represent an attractive new therapeutic approach, based partly on their angiogenic ability and their involvement in the natural processes of tissue repair. The first part of this work consisted in the development of experimental mouse model of radio-induced tissue degeneration similar to that occurring after radiotherapy. The aim was to better understand the physiopathological mechanisms of radiation-induced tissue damage and to determine the best treatment strategy. The second part of this work investigated the feasibility of autologous BMSC therapy on the murine model of radiation previously established with emphasis on two pre-requisites : the retention of the injected cells within the target tissue and the evaluation of the graft on bone metabolism. This preclinical investigation in a mouse model constitutes an essential step allowing an evaluation of the benefit of cell therapy for the treatment of radiation-induced tissue injury. Data from these studies could allow the proposal of clinical studies

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Miron, Yannick. "Impact des produits de glycation avancée sur la mécanique des tissus à base de collagène et de l'endothélium." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2008. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/4017.

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Abstract:

Les produits de glycation avancée résultent d'une réaction chimique entre les sucres réducteurs, comme le glucose, avec les protéines et ainsi causer la réticulation des tissus exposés. L'hyperglycémie chronique observée dans la pathologie du diabète expose les tissus à des concentrations de glucose beaucoup plus importantes et amplifie la formation de réticulations. Les tissus vasculaires sont la voie de distribution périphérique du glucose et en sont donc directement exposés. La réticulation du système circulatoire serait la cause de complications majeures associées au diabète. Afin de mieux comprendre l'impact de la réticulation sur les vaisseaux sanguins, nous avons effectué des analyses mécaniques de différents éléments structurels composant les tissus vasculaires comme le collagène et les cellules endothéliales. Nous avons, dans un premier temps, étudié les propriétés mécaniques du collagène dans des expériences mécaniques sur des fibres de collagène. La microscopie à force atomique nous a permis d'identifier des déterminants structuraux majeurs dans la compréhension de la mécanique d'élongation des tissus de collagène. Des expériences mécaniques, suite à une réticulation par les produits de glycation avancée, ont révélé que le collagène réticulé perd une grande partie de sa capacité à dissiper la tension appliquée à sa structure. De plus, dans la phase"Toe", représentant le régime de fonctionnement physiologique et associée à une phase de déformation non linéaire, les fibres de collagène requièrent une dépense d'énergie beaucoup plus importante pour leur déformation. Le collagène réticulé par les produits de glycation avancée s'avère effectivement beaucoup plus rigide et cohésif. Ainsi, dans le contexte d'un tissu vasculaire, la réticulation par les produits de glycation avancée pourrait affecter leurs propriétés mécaniques ce qui aurait des impacts directs sur la rigidité et la compliance des vaisseaux sanguins. Parallèlement, nous avons mesuré l'impact de la réticulation sur la rigidité des cellules endothéliales suite à une exposition chronique à de fortes concentrations de glucose par une méthode de spectroscopie de force dérivée de la microscopie à force atomique. Les cellules endothéliales exposées à une forte concentration de glucose sont beaucoup plus rigides. Cette rigidité accrue serait associée à la formation de réticulations par les produits de glycation avancée. L'hyperglycémie diabétique favorise la réticulation de l'endothélium pour en modifier sa structure et affecter ses fonctions. Nous pensons que les impacts de la réticulation sur ces deux éléments des tissus vasculaires sont des facteurs majeurs de la rigidification des vaisseaux sanguins et de la dysfonction endothéliale. Ces phénomènes sont d'ailleurs clairement identifiés comme des causes directes des complications associées au diabète comme l'hypertension et l'artériosclérose.

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Robert, Rémi. "Étude des mécanismes contrôlant l’expression des gènes HOX et implications pour la génération in vitro de tissus humains." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2023SORUS399.pdf.

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Abstract:

La formation du schéma corporel des vertébrés dépend, lors de l’embryogenèse, de l’organisation spatiale des différents types cellulaires le long de l’axe antéro-postérieur. Ce processus est orchestré par les facteurs de transcription HOX qui sont différentiellement exprimés le long de cet axe et confèrent leur identité positionnelle aux tissus en développement. Ces patrons d’expression sont initiés par l’activation séquentielle des gènes HOX dans les progéniteurs axiaux, une population de cellules souches nourrissant l’allongement progressif du corps des embryons en développement, notamment les somites et la moelle épinière. Parallèlement à l’induction progressive de cette famille de gènes, ces progéniteurs génèrent donc des structures de plus en plus caudales transformant la séquence temporelle d’activation en domaines d'expression spatiaux le long de l’axe antéro-postérieur. Néanmoins, les mécanismes qui rythment la temporalité de cette induction et sa transformation en domaines spatiaux restent mal connus, en particulier chez l’humain. Pour aborder ces questions, au cours de ma thèse, j’ai produit à partir de cellules souches pluripotentes humaines des progéniteurs arborant les caractéristiques moléculaires et fonctionnelles des progéniteurs axiaux. En effet, nous avons montré que ces progéniteurs activent séquentiellement les gènes HOX et peuvent donner naissance à des organoïdes récapitulant de multiples aspects de la génération et de l’organisation de l’axe antéro-postérieur comme la formation de somites entourant un tube neural le long duquel les patrons d’expression spatiaux de plusieurs HOX sont récapitulés. En utilisant ces progéniteurs axiaux produits in vitro, nous avons tout d’abord démontré que la vitesse d’induction des gènes HOX est dynamiquement modulée par l’activité graduelle de facteurs extrinsèques, FGFs et GDF11 qui sont séquentiellement exprimés dans la région caudale des embryons vertébrés au cours du développement. Puis, nous avons montré 1) que les gènes HOX activés sont des cibles directes des voies de signalisation en aval de ces facteurs et 2) que la vitesse d’activation des gènes exprimés de plus en plus tardivement est déterminée par la durée d‘activation des voies de signalisation dans les progéniteurs axiaux, une propriété des voies régulée par des mécanismes intrinsèques de rétrocontrôles négatifs. Dans l’ensemble, mes résultats permettent de proposer un nouveau modèle dans lequel le rythme d’activation des gènes HOX est une propriété émergente des dynamiques de voies de signalisation en aval de facteurs extrinsèques. Parallèlement, mes études ont permis d’améliorer l’ingénierie cellulaire et tissulaire des cellules du tronc à partir de cellules souches pluripotentes humains culminant en des protocoles de génération des différents sous-types de motoneurones présent le long de l’axe du corps et en un nouveau modèle d’organoïde mimant la morphogenèse et la formation de la diversité cellulaire le long de l’axe du corps humain
During embryogenesis, the formation of the vertebrate body plan depends on the spatial organization of different cell types along the anterior-posterior axis. This process is orchestrated by HOX transcription factors, which are differentially expressed along this axis, conferring positional identity on developing tissues. HOX patterns of expression are initiated by the sequential activation of HOX genes in axial progenitors, a population of stem cells fueling the progressive elongation of the body of developing embryos, forming notably the somites and the spinal cord. In parallel with the progressive induction of this gene family, these progenitors generate increasingly caudal structures, transforming the temporal sequence of activation into spatial domains of expression along the anterior-posterior axis. Nevertheless, the mechanisms that regulate the temporality of this induction and its transformation into spatial domains remain poorly understood, particularly in humans. To address these questions, during my thesis I generated progenitors from human pluripotent stem cells that display the molecular and functional characteristics of axial progenitors. Indeed, we have shown that these progenitors sequentially activate HOX genes and can give rise to organoids recapitulating multiple aspects of the generation and organization of the anterior-posterior axis, such as the formation of somites surrounding a neural tube along which the spatial expression patterns of several HOXs are recapitulated. Using these in vitro-produced axial progenitors, we first demonstrated that the tempo of induction of HOX genes is dynamically modulated by the graded activity of two extrinsic factors, FGFs and GDF11, which are sequentially expressed in the caudal region of vertebrate embryos during development. Then, we showed that 1) activated HOX genes are direct targets of signaling pathways downstream of these factors and 2) that the speed of activation of genes expressed later and later is determined by the duration of pathway activation in axial progenitors, a property of the pathways regulated by intrinsic negative feedback mechanisms. Overall, my results suggest a new model in which the timing of HOX gene activation is an emergent property of the dynamics of signaling pathways downstream of extrinsic factors. In parallel, my studies have led to improved cellular and tissue engineering of trunk cells from human pluripotent stem cells, culminating in protocols for generating the different motor neuron subtypes present along the body axis, and a new organoid model mimicking morphogenesis and the formation of cellular diversity along the human body axis

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Fkih, m'hamed Insaf. "Etude de l'implication des miARNs dans le cancer du sein triple négatif et la régulation de BRCA1." Thesis, Clermont-Ferrand 1, 2015. http://www.theses.fr/2015CLF1MM19/document.

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Abstract:

Dans les cancers du sein triple négatif sporadiques, BRCA1 est fréquemment inactivé au niveau transcriptionnel, et il a été rapporté que cette inactivation peut être réalisée par une méthylation du promoteur. Plus récemment, il a été constaté que BRCA1 peut également être régulée au niveau post-transcriptionnel par les microARNs. L'accumulation de preuves indique que les miARNs ont un rôle causal dans la tumorigenèse. Nos travaux se sont axés sur l'étude de l’expression et des fonctions des microARN in vitro, in silico et ex vivo.Basé sur nos résultats de profilage de l'expression, quatre miARN candidats (miR-10b, miR-26a, miR-146a et miR-153) ont été choisis comme étant potentiellement impliqués dans le développement du cancer du sein triple négatif. Des essais d'expression exogènes ont révélé que miR-10b et miR-26a, mais pas miR-146a, peuvent réguler négativement l'expression du gène BRCA1 dans les cellules cancéreuses triple négatif MDA-MB-231 et luminales MCF7, alors que miR-153 pourrait réguler négativement l'expression du gène BRCA1 uniquement dans les cellules MCF7. L'analyse in silico des données de Cancer Genome Atlas (TCGA) a confirmé que miR-146a est significativement plus exprimé dans les tumeurs du sein triple négatif par rapport à d'autres tumeurs (non triple négatif) mammaires. L’étude ex vivo a montré que le niveau élévé d’expression de miR-146a et de miR-26 est associé à l’absence des métastases ganglionnaires dans le cancer du sein triple négatif. Aussi une corrélation entre l’expression de 4 miARNs est révélée permettant l’identification de différentes voies de signalisations impliquées dans le cancer du sein triple negatif.Nos travaux fournissent des preuves de l'implication des miARNs spécifiques comme des biomarqueurs potentiels dans le développement du cancer de sein triple négatif
In sporadic triple-negative breast cancers BRCA1 is frequently inactivated at the transcriptional level, and it has been reported that this inactivation may be brought about by promoter methylation. More recently, it was found that BRCA1 may also be regulated at the post-transcriptional level by miRNAs. Accumulating evidence indicates that miRNAs have a causal role in tumorigenesis. Our work focused on the study of microRNAs expression and functions in vitro, in silico and ex vivo.Based on our expression profiling results, four candidate miRNAs (miR-10b, miR-26a, miR-146a and miR-153) were selected as being potentially involved in triple-negative breast cancer development. Exogenous expression assays revealed that miR-10b and miR-26a, but not miR-146a, can down-regulate the expression of BRCA1 in both triple-negative MDA-MB-231 and luminal epithelial MCF7 breast cancer-derived cells, whereas miR-153 could down-regulate BRCA1 expression only in MCF7 cells. In silico analysis of The Cancer Genome Atlas (TCGA) data confirmed that miR-146a is significantly higher expressed in triple-negative breast tumors compared to other (non triple-negative) breast tumors. The ex vivo study showed that the high level expression of miR-146a and miR-26 is associated with the absence of lymph node metastasis in triple negative breast cancer. Also a correlation between the expression of the 4 miRNAs was revealed, allowing the identification of different signaling pathways involved in the triple negative breast cancer.Our work provides evidence of the involvement of specific miRNAs as potential biomarkers in breast cancer triple negative development

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Berces, Sophie. "Congélation des produits végétaux : caractérisation des cellules et des tissus et influence des cinétiques de refroidissement sur la qualité des fruits." Paris, AgroParisTech, 2009. http://www.theses.fr/2009AGPT0028.

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Lavoie, Amélie. "Localisation, quantification, dynamique et organisation des cellules souches épithéliales cutanées humaines in situ et in vitro." Thesis, Université Laval, 2009. http://www.theses.ulaval.ca/2009/26566/26566.pdf.

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Purbaningsih, Susiani. "Isolement et culture de protoplastes d'orchidées ("Phalaenipsis" et "Epidendrum") : implication de l'état vitreux des tissus et de l'éthylène." Montpellier 2, 1992. http://www.theses.fr/1992MON20280.

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Abstract:

Un protocole d'isolement de protoplastes de feuilles, tiges et racines de phalaenopsis et d'epidendrum, ainsi que des protocormes d'epidendrum, debarrasses des debris et des cristaux aciculaires d'oxalate de calcium, a ete standardise. Le melange enzymatique utilise comprend 1,5% de cellulase rs et 1% de macerozyme r10 prepare dans une solution de cac12 10 mm, du mannitol a 0,3 m et 10 mm de mes. Les protoplastes issus de feuilles, tiges et racines de phalaenopsis et d'epidendrum ont montre un haut taux de viabilite et de regeneration de la paroi, bien qu'aucune division n'ait ete observee. Seuls les protoplastes isoles a partir de protocormes d'epidendrum se sont divises. Ces protocormes, suivant leurs conditions de multiplication, ont une apparence normale ou vitreuse. Ces protocormes vitreux se caracterisent entre autre par un taux de multiplication superieur et un rapport ms/mf, une teneur en proteines, une activite peroxydasique soluble et une capacite de biosynthese d'ethylene plus faible. Les protoplastes issus de ces protocormes ont un taux de division 3 a 4 fois superieur. Suite a des divers pretraitements des protocormes avec des activateurs ou des inhibiteurs d'ethylene, le taux d'emission d'ethylene a ete mesure au moment de l'obtention des protoplastes et une relation inverse a ete obtenue entre le niveau de biosynthese d'ethylene et la reactivite des protoplastes mais ceux-ci ne se sont pas developpes au-dela du stade 3 a 4 cellules

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Georges, Didier. "Approches biotechnologiques (cultures de tissus, cellules et protoplastes) pour l'accroissement de la variabilité génétique chez le chèvrefeuille (lonicera, caprifoliaceae)." Tours, 1994. http://www.theses.fr/1994TOUR3802.

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Barrieu, François. "Polypeptides intrinsèques du tonoplaste bobTIP26 des cellules de chou-fleur (Brassica oleracea L. Var. Botrytis) : clonage de deux ADNc et expression dans les tissus sous contraintes hydriques." Dijon, 1996. http://www.theses.fr/1996DIJOS025.

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Abstract:

Dans la perspective de mieux connaitre l'organisation fonctionnelle de la membrane vacuolaire (tonoplaste), nous avons étudié les protéines intrinsèques du tonoplaste de 26 KDA (ou bobTIP26) des cellules du méristème du chou-fleur (Brassica oleracea L. Var. Botrytis). Une banque d'ADNc a été construite dans le vecteur d'expression lambda-gt 11 à partir des cellules en cours de vacuolisation du méristème. Le criblage immunologique de la banque par un sérum polyclonal monospécifique dirige contre les polypeptides tonoplastiques bobTIP26 a permis d'isoler deux ADNc (C26-1 ET C26-2). Les séquences peptidiques putatives ont été déduites. Chacune d'elles contient la séquence signature des protéines de la famille MIP. Les séquences déduites qui correspondent respectivement aux protéines bobTIP26-1 et bobTIP26-2 sont très similaires entre elles (94%) et très similaires (90%) à celle de l'aquaporine GAMMA-TIP du tonoplaste d'arabidopsis. L’injection d'ARNc bobTIP26-1 dans des ovocytes de xenope induit le gonflement des ovocytes et suggère que la protéine bobTIP26-1 pourrait être impliquée dans le transport de l'eau. Les transcrits codant les protéines bobTIP26 ont été localisés par hybridation in situ. Ils sont particulièrement abondants dans les cellules vivantes associées aux éléments conducteurs (xylème) et dans les cellules du méristème. Dans les tissus soumis à des contraintes hydriques, l'abondance des transcrits est régulée. Les ARNm bobTIP26 et les polypeptides correspondants s'accumulent dans les tissus soumis à une dessiccation progressive. Il pourrait s'agir d'un mécanisme d'adaptation et/ou de défense des cellules confrontées a un déficit hydrique. Des phénomènes de vésiculisation intense ont été corrélés aux modifications des patrons d'expression. Une intégration fonctionnelle des réponses à l'échelle cellulaire devra être explorée

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Riffault, Sabine. "Induction virale d'interferon-/ : etude in vivo des cellules productrices dans les tissus lymphoides et des modifications localement induites par l'interferon." Paris, Institut national d'agronomie de Paris Grignon, 1997. http://www.theses.fr/1997INAP0010.

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Abstract:

Une sous-population de leucocytes, qui produisent de fortes quantites d'ifn- apres induction in vitro par des structures virales non infectieuses, a ete decrite a partir de cellules mononucleees du sang peripherique. Ces cellules, nommees cellules naturellement produtrices d'interferon (nip), sont distinctes des lymphocytes t, des lymphocytes b, des cellules nk et des monocytes. En revanche, elles expriment les molecules du complexe majeur d'histocompatibilite (cmh) de classe ii et le marqueur cd4 et pourraient s'apparenter aux cellules dendritiques immatures. Deux etudes realisees in vivo ont montre la presence de cellules secretrices d'ifn-/ dans les tissus lymphoides suite a l'injection de preparations virales non infectieuses. L'objectif de cette these a ete d'etudier le mecanisme d'induction des cellules nip in vivo, de determiner leur localisation et leur phenotype in vivo et enfin d'analyser le role immunomodulateur de cette synthese d'ifn-/. Nous avons montre que la glycoproteine m de l'enveloppe virale du coronavirus de la gastroenterite transmissible (tgev) est necessaire a l'induction d'ifn- in vivo comme cela a ete decrit in vitro. Cependant, des virosomes reconstitues a partir des proteines de l'enveloppe virale et dont la proteine m comporte les epitopes necessaires a l'induction d'ifn- ont perdu le pouvoir intereferogene du virus natif. Ces resultats suggerent que d'autres elements viraux que la proteine m interagissent avec les cellules nip pour induire l'ifn-. Le modele experimental d'induction d'ifn- chez le porcelet nouveau-ne, par injection intra-veineuse de tgev non infectieux, nous a permis de montrer que les cellules nip induites in vivo sont presentes parmi les splenocytes mais absentes des cellules du sang peripherique. Nous avons alors determine par immunohistochimie, la localisation tissulaire et le phenotype in situ des cellules nip porcines detectees dans la rate. Ces cellules sont distinctes des cellules t et b mais elles forment une population heterogene sur la base de l'expression des molecules du cmh de classe ii et d'un marqueur des granulocytes/macrophages. Elles sont localisees dans le manchon lymphatique periarteriolaire en contact avec les cellules t et les cellules exprimant les molecules du cmh de classe ii. L'ifn- est donc secrete au site d'initiation de la reponse immunitaire anti-tgev et pourrait ainsi moduler cette reponse. Le modele experimental d'induction d'ifn-/ chez la souris a ete developpe de maniere a induire une reponse ifn-/ localisee dans le ganglion drainant le site d'injection (l'oreille) du virus de l'herpes simplex de type i non infectieux, les tissus contralateraux (oreille et ganglion) constituant des temoins internes. Ce modele nous a permis de montrer que l'ifn-/, secrete localement par les cellules nip, provoque un recrutement leucocytaire dans le ganglion drainant et augmente l'expression de cytokines viro-induites (ifn- et il-12) impliquees dans la differenciation des lymphocytes t vers le phenotype th1. Ces resultats etablissent donc les bases de l'analyse in vivo des fonctions immunomodulatrices de l'ifn-/ produit localement par les cellules nip lors de l'initiation d'une reponse immunitaire antivirale.

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Gadzovska, Sonja. "Production de métabolites secondaires par les cultures de cellules et de tissus d'Hypericum perforatum L : effets de divers facteurs exogènes." Orléans, 2005. http://www.theses.fr/2005ORLE2005.

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Abstract:

Les pousses feuillées, les cals et les suspensions cellulaires d'Hypericum perforatum L. Cultivés in vitro ont été utilisés comme des modèles expérimentaux pour l'étude des effets de quelques facteurs exogènes sur la production de métabolites secondaires. Les méthodes analytiques développées dans ce travail ont permis le dosage de l'hypéricine, de la pseudohypéricine et d'autres métabolites secondaires extraits des explants cultivés in vitro. Afin de déterminer si la production de métabolites secondaires pouvait être augmentée, des cultures in vitro ont été soumises à des phytohormones (auxines et cytokinines) et des éliciteurs chimique (acide jasmonique, acide salicylique, pectine et chitine). Afin d'évaluer les réponses aux éliciteurs biotiques, les suspensions cellulaires ont été traitées avec des extraits de mycélium de trois champignons Fusarium oxysporum, Phoma exigua et Botrytis cinerea. Les pousses feuillées produisent des métabolites secondaires. Les cals et les suspensions cellulaires répondent rapidement à l'application d'éliciteurs exogènes. Les éliciteurs fungiques, les acides jasmonique et salicylique sont des éliciteurs efficaces pour la productions de métabolites secondaires dans des suspensions cellulaires d'Hypericum. La production de métabolites secondaires par des cellules d'Hypericum peut être partiellement modifiée par l'addition d'éliciteur. Des cultures bien contrôlées pourraient éventuellement être utilisées comme une source pour une production rapide et accrue d'hypéricine et de pséudohypericine.

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Florin, Bruno. "Étude de différentes voies de conservation d'embryons, de tissus et de cellules de végétaux cultivés in vitro : applications de l'hypoxie et de la cryoconservation." Tours, 1989. http://www.theses.fr/1989TOUR3804.

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Kamgoue, Tchouassi Alain Caril. "Problèmes inverses en biomécanique : de la caractérisation des propriétés élastiques de cellules adhérentes à l'élaboration d'un outil de mesure des déformations locales au sein des cellules contractiles et de tissus." Phd thesis, Grenoble 1, 2009. http://www.theses.fr/2009GRE10011.

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Abstract:

Les recherches en biologie cellulaire ont été fortement marquées au cours des deux dernières décennies par la prise en compte accrue des propriétés mécaniques des cellules vivantes. Le développement remarquable d'un nouveau champ disciplinaire, la mécanobiologie, et l'étude des voies de signalisation associées, ou mécano-transduction, en sont des signes tangibles. Dans ce contexte, cette thèse est une contribution à la caractérisation des propriétés mécaniques actives et passives de cellules adhérentes à partir de leur réponse à des sollicitations imposées. Cette approche, qui se définit formellement comme la résolution d'un problème inverse, a été développée dans une première partie de notre travail pour identifier le module d'élasticité intrinsèque de cellules adhérentes sollicités mécaniquement par pinces optiques ou pinces magnétiques. Ces techniques de micromanipulations permettent en effet de déformer le cytosquelette de la cellule par l'intermédiaire de billes fonctionnalisées accrochées aux récepteurs transmembranaires de la cellule. Cependant, l'analyse directe du couple sollicitation/réponse ne permet d'accéder qu'au module d'élasticité apparent de la cellule. L'originalité de notre travail est de proposer une amélioration significative de l'estimation du module d'Young de la cellule grâce à la prise en considération de plusieurs facteurs géométriques qui sont : (i) l'angle d'imprégnation de la bille dans la cellule, (ii) la hauteur sous bille de la cellule et (iii) la courbure de l'interface bille/cellule. Nous proposons notamment des fonctions explicites de ces paramètres permettant de corriger l'erreur commise lorsque la rigidité cellulaire est estimée sous l'hypothèse d'un milieu infini ou semi-infini. La seconde partie de notre travail concerne la caractérisation, plus complexe, des propriétés mécaniques actives de cellules contractiles observées par vidéo-microscopie. Dans ce cas, l'illumination de la cellule est la fonction d'entrée, tandis que le champ de déplacement observé au cours du temps constitue la réponse cellulaire. Le problème inverse consiste ici à remonter au champ de contraintes intracellulaires à l'origine du champ de déplacement observé. Afin de mieux comprendre la dynamique contractile spontanée de cardiomyocytes isolés, nous avons dans un premier temps développé un algorithme de flot optique performant, basé sur la corrélation d'images, qui nous a permis de quantifier précisément l'évolution des déformations intracellulaires à l'échelle des sarcomères. A partir de ce champ de déformation spatio-temporel, nous avons pu reconstruire de façon originale la propagation des contraintes intracellulaires calcium-dépendantes qui gouvernent la périodicité et l'amplitude de la contraction du cardiomyocyte. Nous montrons enfin en perspective l'intérêt de cette approche au niveau du tissulaire en présentant différents résultats obtenus en élastographie des artères coronariennes
The research in cell biology have been heavily marked during the last two decades by taking greater account of the mechanical properties of living cells. The remarkable development of a new discipline, the Mechanobiology, and the study of signaling pathways involved, or mechano-transduction, are tangible signs. In this context, this thesis is a contribution to the characterization of active and passive mechanical properties of adherent cells from their response to stress imposed. This approach, which is defined as a formal resolution of an inverse problem was developed in the first part of our work to identify the intrinsic modulus of adherent cells probed mechanically by optical tweezers or magnetic tweezers. These micromanipulation techniques allow in fact to distort the cytoskeleton of the cell through functionalized beads hanging from the transmembrane receptor in the cell. However, direct analysis of the solicitation/answer couple allows us to infer only the apparent modulus of the cell. The originality of our work is to offer a significant improvement of the cell Young modulus estimation through the consideration of several factors that are geometric: (i) embedding angle of the bead in cell, (ii) the height of the cell under the bead (iii) the curvature of the interface bead/cell. We propose including explicit functions of these parameters to correct the error of cell rigidity when this rigidity is estimated under the assumption of an infinite or semi-infinite medium. The second part of our work, concerns characterization, more complex, of contractile cells active mechanical properties observed by video-microscopy. In this case, the illumination of the cell is the input function, while the scope of movement observed over time is the cellular response. The inverse problem here is to infer the field of intracellular constraints at the origin of displacement observed. To better understand the dynamics of spontaneous contractile isolated cardiomyocytes, we first developed an optical flow algorithm performance based on the correlation of images, which allowed us to quantify accurately the evolution of intracellular deformation at the sarcomere level. From this spatial-temporal strain field, we were able to reconstruct originally intracellular constraints calcium-dependent governing the frequency and magnitude of the contraction of cardiomyocytes. We finally show interest in the prospect of this approach in the tissue with different results of coronary arteries elastography

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Tran, Thi Nhu Hoa. "Analyse et modélisation 3D de l’organisation spatiale des tissus dans des images biologiques." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2018. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2018SORUS457.pdf.

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Abstract:

Nombreux travaux ont été menés pour analyser automatiquement des cellules dans des images de microscopie. Néanmoins, ces travaux se concentrent principalement sur l’application de traitement et d’analyse d’images sur des cellules individuelles. Il y a un manque d’un outil générique pour analyser les interactions entre les cellules et leur organisation spatiale au sein de tissus biologiques. De plus, il existe une demande pour une approche qui est plus efficace pour gérer des images de cellules en 3D à haut débit. Car l’étude des cellules dans l’espace tridimensionnel (3D) donne une meilleure impression et est plus réaliste en ce qui concerne les propriétés physiques et biochimiques du micro-environnement des cellules par rapport aux approches bidimensionnelles. Nous avons proposé un ensemble de méthodologies et un outil pour l’analyse de l’organisation des tissus dans des images biologiques. Cette combinaison d’outils logiciels se propose d’algorithmes pour i) l’identification automatique de plusieurs noyaux individuels et ii) des marqueurs cytoplasmiques, iii) prédiction de la position de la membrane cellulaire, et enfin iv) la reconstruction du réseaux cellulaire. Nous avons appliqué notre outil pour étudier l’organisation spatiale de l’îlot de Langerhans en essayant de comprendre son mécanisme interne. Nous avons aussi appliqué notre outil pour explorer la fonction des cellules de type delta cell dans l’îlot, dont le rôle n’est pas encore déterminé. Nous avons introduit une procédure générique pour modéliser l’organisation spatiale des cellules dans un tissu, qui peut être utilisée pour créer des modèles virtuels de tissus et créer des données à tester
Cells within the tissue preferentially form a network that works together to carry out a specific function. Thus, the role of a tissue is affected by its cell types as well as the architecture of cellular interactions. A question is to what degree the spatial organization of these cells affects the function of the tissue. We first propose a set of methodologies to analyze the multi-cellular structure of tissues at both local and global scale. The goal is to analyze, formalize, and model the spatial organization of the tissue captured by fluorescence microscopy images. At the local scale, we investigate the spatial relationship of several structures with both direct and indirect cellular interactions. At the global scale, we apply spatial statistic approaches to investigate the degree of randomness of the cell distribution. In addition, an open source toolbox is developed which allows researchers to perform investigations of the position of different cells within a 3D multicellular structure. We apply the toolbox to study of the spatial organization of the islet of Langerhans, a special kind of tissue that plays an important role in regulating the blood glucose level. With a good segmentation accuracy, we have been able to perform our analysis of the islets of Langerhans on several different species such as mouse and monkey. We also utilize our toolbox to explore the structural-functional mechanism of the delta cell, a specific kind of cell within the islet whose role has not yet been determined, but could potentially influence the islet function, in mouse and human. Our generic toolbox is implemented with unbiased analytical capabilities in software platform ImageJ

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Gueniche, Farida. "Effets de dérivés d'exopolysaccharides bactériens sur le comportement de fibroblastes et de cellules mésenchymateuses d'origine médullaire dans des tissus reconstruits à des fins d'ingénierie tissulaire." Paris 13, 2006. http://www.theses.fr/2006PA132037.

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Abstract:

Les exo-polysaccharides (EPS) bactériens constituent une nouvelle génération de polysaccharides héparane-mimétiques issus de la biotechnologie marine (IFREMER). Notre travail a donc consisté à explorer les effets potentiels des dérivés de l’EPS GY785 natif. (GY785 OSDR, GY785 DROS) sur le comportement des cellules mésenchymateuses. Nous avons pu observer que le GY785 DROS stimulait la prolifération des fibroblastes dermiques humains ainsi que celles des cellules stromales médullaires humaines à la fois dans les cultures bidimensionnelles et tridimensionnelles (tissus conjonctifs reconstruits). Dans nos conditions de travail, en présence du GY785 DROS, les cellules stromales médullaires sont capables de maintenir leur phénotype mésenchymateux. Le GY785 DROS est également capable d’interagir avec des facteurs de croissance tel que le Fibroblast Growth Factor 2 (FGF2), en potentialisant ainsi son effet pro-prolifératif. Ces résultats nous permettent d’envisager l’utilisation de ces EPS en ingénierie tissulaire afin de favoriser la régénération ou d’améliorer la prise des tissus reconstruits à des fins de greffes chez les grands brûlés ou chez les patients atteints de maladies bulleuses
Exopolysaccharides (EPS) extracted from deep sea bacteria (IFREMER) are a new generation of polysaccharides heparan-mimetic. In this work, we are investigated the potential effects of native EPS and derived EPS, namely: GY785 OSDR, GY785 DROS on the performance of mesenchymal cells in 2D and 3D cultures. We demonstrated that derived EPS, GY785 DROS were able to stimulate the proliferation of human dermal fibroblasts as well as human medullary stromal cells in 2D and 3D cultures, the 3D cultures being considered as reconstructed conjonctive tissue. In our hands, with EPS GY785 DROS, medullary stromal cells were shown to adopt a mesenchymal cell phenotype. Furthermore we evidenced that derived EPS GY785 DROS was able to interact with growth factor particularly fibroblast growth factor 2 (FGF-2) and that this interaction promoted the pro-proliferative effect of this later. Our results raise the possibility to use EPS for tissue engineering in order to favour tissue regeneration and also to improve graftings in man for example with severely burnst patients and or with patients suffering from epidermolysis bullosa for whom dermal covering is vital

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Saade, Georges. "Les co-infections respiratoires du porc. Co-infections des cellules et des tissus respiratoires porcins par le virus de l’influenza A et le virus du syndrome dysgénésique et respiratoire porcin." Thesis, Nantes, Ecole nationale vétérinaire, 2021. http://www.theses.fr/2021ONIR152F.

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Abstract:

Les co-infections respiratoires chez le porc sont plus fréquentes que les infections causées par un seul micro-organismes. Dans un premier temps, un recensement des études sur les co-infections respiratoires porcines a permis de mettre à jour les connaissances sur ces co-infections virales et/ou bactériennes et de détailler les probables conséquences moléculaires sur l’hôte porcin. Le virus du syndrome dysgénésique et respiratoire porcin (ou Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus, PRRSV) et les virus responsables de l’influenza porcin A (swine Influenza A Virus, swIAV), sont des acteurs majeurs du complexe respiratoire porcin. Le swIAV infecte principalement les cellules épithéliales alors que le PRRSV infecte des cellules exprimant CD163 comme les macrophages alvéolaires (MA). Dans le but d’évaluer la réponse antivirale de l'hôte porcin et d'étudier l'effet d’une pré-infection par le PRRSV sur la réplication du swIAV, une série de co-infections et de surinfections a été effectuée sur des cellules épithéliales trachéales et sur des tranches pulmonaires fines. Les résultats montrent que le PRRSV est capable d'interférer avec l'infection par swIAV et d’altérer la réponse antivirale cellulaire sans infecter les cellules épithéliales. Cet effet du PRRSV parait moins important en augmentant le délai entre les inoculations virales. Finalement, une série d’expérimentations nous a permis d’identifier les agents pathogènes circulant chez des porcs provenant d’un abattoir local et d’évaluer l’effet des différentes infections bactériennes et virales résolues ou pas sur l’immunité entraînée des macrophages alvéolaires et leur capacité à répliquer les virus suite à une surinfection. Ces travaux contribuent à la compréhension de la réponse immune porcine suite aux co-infections respiratoires, pour une meilleure gestion des maladies respiratoire chez le porc
Respiratory co-infections in pigs are more common than infections caused by a single pathogen. First of all, we identified the viral and bacterial porcine co-infections studies and we detailed the possible molecular consequences on the porcine host. The porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) and the swine Influenza A Virus (swIAV), are major contributors to the porcine respiratory disease complex. SwIAV primarily infects epithelial cells while PRRSV infects cells expressing CD163 such as alveolar macrophages (AM). In order to evaluate the antiviral response of the porcine host and to study the effect of a pre-infection with PRRSV on the replication of swIAV, a series of co-infections and superinfections were carried out on tracheal epithelial cells and precision-cut lung slices. The results showed that PRRSV can interfere with swIAV infection and alter the cellular antiviral response without infecting epithelial cells. This effect of PRRSV appears to be less important following an increase in the delay between viral inoculations. Finally, a series of experiments enabled us to identify the pathogens circulating in pigs from a local slaughterhouse and to assess the effect of the various bacterial and viral infections, on the alveolar macrophages trained immunity and their ability to replicate viruses in case of superinfection. This study contributes to the understanding of porcine immune response to respiratory coinfections for a better management of respiratory diseases in swine

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Maury, Florence. "Étude des conditions de culture in vitro des tissus cornéens et application à l'évaluation de biomatériaux ophtalmiques." Compiègne, 1991. http://www.theses.fr/1991COMPD413.

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Abstract:

Notre but a consisté à adapter un modèle de culture organotypique au domaine de l'ophtalmologie afin d'évaluer d'une manière simple et reproductible la cytocompatibilité de biomatériaux destinés à la chirurgie oculaire. Ce test repose sur une mesure quantitative et reproductible de quatre propriétés impliquées à l'interface tissu/matériau : migration, multiplication, adhésion et viabilité cellulaires. Le choix et l'optimisation des paramètres de cette culture de tissus cornéens ont fait l'objet de la première partie. Puis, la validation du modèle a exigé la vérification de la nature des voiles tissulaires : utilisation de techniques biochimiques et immunologiques; la deuxième partie nous a permis de vérifier la sensibilité du modèle en l'appliquant à la présélection de matériaux ophtalmiques. Puis la troisième partie fut consacrée à la recherche et la sélection d'une lentille de polymère implantable dans les lames cornéennes d'après les caractéristiques requises pour un tel implant. Nous avons obtenu des informations intéressantes concernant certains phénomènes intervenant à l'interface tissu/matériau : formation de sites d'attachement particuliers comme des structures jonctionnelles caractéristiques de l'épithélium cornéen : les hémidesmosomes. Outre une comparaison indispensable avec des résultats d'expérimentations in vivo, nous envisageons d'étudier l'influence de diverses modifications physico-chimiques d'un matériau ou de l'incorporation de substances dans le milieu sur le développement et l'adhésion cellulaires.

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Badique, Florent. "Mécano-biologie de cellules cancéreuses sur surfaces à topographie et chimie contrôlées." Thesis, Mulhouse, 2013. http://www.theses.fr/2013MULH8315/document.

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Abstract:

Le travail présenté dans cette thèse est le résultat d'une collaboration fructueuse entre la chimie, la physique et la biologie. En effet, des matériaux avec des propriétés physico-chimiques très contrôlées ont été mis à profit dans le but de caractériser des fonctions cellulaires complexes. Nous présentons tout d'abord la création d'un outil permettant l'étude de la mécanotransduction cellulaire. L'originalité de cet outil est basé sur son activation par étirement permettant de lier réversiblement les cellules à la surface. Nous avons ensuite étudié des comportements de cellules souches et cancéreuses en réponse à des microtopographies sous forme de piliers. Cette approche a permis de définir un comportement cancéreux caractérisé par une déformation prononcée des corps et noyaux cellulaires. Nous montrons aussi que l'utilisation de cette surface couverte de micro-piliers permet de décrire la mécano-biologie de cellules cancéreuses. En effet, ce substrat à topographie contrôlée a permis de montrer que la chimie et la rigidité du substrat n'ont que peu d'incidence sur la déformation des cellules cancéreuses, alors que les éléments du cytosquelette sont primordiaux et que sans eux, la déformation n'est pas possible. Nous avons ensuite inhibé une à une des protéines de l'enveloppe et de la lamina nucléaire afin d'évaluer leur implication dans ces mécanismes de déformation. En parallèle, un séquençage total des ARN (Acides RiboNucléiques) de cellules déformées et non déformées a été réalisé dans le but de visualiser d'éventuelles modifications dans l'expression génique. Ces déformations des cellules cancéreuses entre les micro-piliers ont été comparées à celles que subissent les cellules lors de la traversée de membranes poreuses (Chambres de Boyden). Ces comparaisons nous ont permis d'identifier que plusieurs mécanismes peuvent aboutir à la déformation de cellules cancéreuses et en particulier de leurs noyaux. Nous montrons dans une dernière partie que la mitose cellulaire s'effectue sur les surfaces microstructurées. Nous décrivons une ségrégation des chromosomes qui semble être non parallèle. Toutefois, ces divisions atypiques ne causent pas davantage d'accidents mitotiques
The work shown in this thesis is the outcome of a successful collaboration between chemistry, physics and biology. Indeed, materials with well controlled parameters have been used in order to characterize complex cellular functions. We first introduce the creation of one tool which allow the study of cells mechanotransduction. The originality of this tool is based on its activation by stretching which allow a reversible adhesion of cells to the surface.Then, we studied the behavior of stem cells and cancerous cells on micropillared surfaces. This approach allowed us to describe a cancerous behavior of cells characterized by strong deformations of cells bodies and nuclei. We also showed that the use of such micropillared surfaces allowed us to describe cancerous cells mecanobiology. Indeed, this substrate with a well controlled topography allowed us to show that substrates chemistry and stiffness have only little effects on cancerous cells deformation while cytoskeleton components are necessary. More specifically, the deformation is impossible without the cytoskeleton. We also inhibited the nuclear envelope proteins and nuclear lamina proteins in order to evaluate their involvement in cells deformation mechanism. In the same time, a total RNA (RiboNucleic Acids) sequencing of deformed and non deformed cells have been done in order to identify an eventual modification in gene expression.These deformations of cancerous cells between micropillars have been compared to the deformation of cells during the transmigration through porous membranes (Boyden chambers). These comparisons allowed us to identify several mechanisms which lead to cells deformation and more specifically to nuclei deformation.We showed in a last part that cells can divide on micropillared surfaces. We described a non parallel like segregation of chromosomes. However, these unusual mitosis didn't lead to supernumerary troubles in cell division

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Tratner, Isabelle. "Etude de la methylation des genes codant pour l'albumine et l'alphafoetoproteine dans differents tissus au cours du developpement et dans des cellules d'hepatomes chez le rat : correlation avec l'expression genique." Paris 6, 1987. http://www.theses.fr/1987PA066651.

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Tratner, Isabelle. "Etude de la méthylation des gènes codant pour l'albumine et l'alphafoetoprotéine dans différents tissus au cours du développement et dans des cellules d'hépatomes chez le rat corrélation avec l'expression génique /." Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37610306g.

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Morin, Nathalie. "Les Microcodium : architecture, structure et composition, comparaison avec les racines calcifiées." Montpellier 2, 1993. http://www.theses.fr/1993MON20025.

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Abstract:

Les microcodium sont des fossiles calcaires, arborescents, de dimension millimetrique, dont la nature n'est toujours pas etablie avec certitude. Ces fossiles correspondent aux restes d'etres vivants souterrains endolithes, qui apparaissent au campanien et semblent s'eteindre au pliocene. Recemment, plusieurs auteurs ont decrit dans des sols actuels des racines calcifiees de structure comparable a celle des microcodium. Ce travail a pour objectif de comparer l'architecture, la structure et la composition des microcodium et des racines calcifiees actuelles, afin de tester l'hypothese d'une origine racinaire des microcodium. Les principaux resultats acquis consistent en la mise en evidence chez les microcodium de ramifications de type lateral monopodial en la mise en evidence de la presence systematique de stries d'accroissement au sein des prismes constitutifs, et en l'analyse de la composition isotopique des carbonates constitutifs. La comparaison avec les racines calcifiees actuelles montre que les microcodium consistent tres probablement en des racines de vegetaux superieurs, mais appartenant a un groupe fossile disparu actuellement. Differents elements suggerent qu'il pourrait s'agir d'un groupe apparente aux premieres monocotyledones

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Atger, Claire. "Essai sur l'architecture racinaire des arbres." Montpellier 2, 1992. http://www.theses.fr/1992MON20100.

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Abstract:

L'analyse architecturale de cinq especes arborescentes met en evidence le caractere endogene du determinisme de l'architecture et du developpement racinaires de l'espece. Les concepts d'unite architecturale, de developpement par intercalation et de strategies specifiques de reiteration sont elargis aux systemes racinaires des arbres. La comparaison des architectures racinaires et caulinaires des arbres souligne l'existence d'une organisation et d'un plan de developpement communs a ces deux appareils. Ces resultats permettent d'elargir la reflexion sur les organismes fixes

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Longchamps, Louis. "Discrimination entre le maïs et les mauvaises herbes par la signature spectrale de fluorescence induite par UV." Thesis, Université Laval, 2006. http://www.theses.ulaval.ca/2006/23931/23931.pdf.

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Benchabane, Meriem. "Modifications post-traductionnelles d'une serpine humaine recombinante exprimée chez les plantes." Thesis, Université Laval, 2007. http://www.theses.ulaval.ca/2007/24868/24868.pdf.

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García, García Alejandro. "Multiscale analysis of multi-layered tissues constructs : interfaces in the musculo-skeletal system based on tissue engineered osteotendinous junctions." Thesis, Compiègne, 2019. http://www.theses.fr/2019COMP2488.

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Abstract:

L’objectif de cette thèse était le développement d'un substitut bio-hybride pour la reconstruction du continuum tendon-os sur le principe de l’ingénierie tissulaire. Après une analyse bibliographique exhaustive des structures natives et de leur environnement, nous avons d'abord proposé la réalisation de chaque système séparément en utilisant des scaffolds en polycaprolactone réalises par electrospinning. Dans un premier temps, nous avons combiné l’electrospinning et l’electrospraying pour produire un scaffold composé de polycaprolactone et d’hydroapatite avec une structure en forme de nid d'abeille. Notre hypothèse était de doter le substitut d'une structure biomimétique favorisant l'adhésion, la colonisation et la différenciation cellulaire. L'analyse mécanique et biologique in vitro réalisée avec une lignée cellulaire progénitrice et des tests organotypiques a confirmé notre approche originale. Ensuite, le matériel ensemencé avec des cellules souches de moelle osseuse a été implanté avec succès par nos collaborateurs d'Amiens dans le but de traiter un défaut maxillo-facial chez un modèle de rongeur. Parallèlement, pour la reconstruction du tendon, nous avons réalisé différents scaffolds d'electrospinning, dont la taille et l'organisation (aléatoire/alignée) des fibres varient. Dans une perspective bio-inspirée, nous avons combiné les scaffold avec l'étirement dynamique pour reproduire l'entraînement physique. Sous ces stimulations mécaniques, établies d'abord avec la même lignée cellulaire progénitrice, nous avons démontré dans une deuxième étude que les CSM s'alignaient sur l'axe d'étirement et produisaient une matrice extracellulaire, ce qui a permis de conserver les propriétés mécaniques de la matrice biohybride pendant les deux semaines de la culture. Nous avons démontré que la différenciation cellulaire vers la lignée tendineuse et osseuse a été réalisée avec succès en l'absence de tout facteur de différenciation, étant spécifiquement lié aux propriétés des matériaux et à la mécanotransduction. Par conséquent, l'étape suivante, qui consiste à assembler les deux échafaudages avec une zone de transition, devrait conduire à la reconstruction de ce continuum osseux-tendon
The objective of this thesis was the development of a biohybrid substitute for the reconstruction of the bone-tendon continuum based on tissue engineering strategies. After an exhaustive bibliographic analysis of the native structures and their environment, we first proposed the realization of each system separately using electrospun polycaprolactone scaffolds. At first, we combined electrospinning with electrospraying techniques to produce a PCL-hydroapatite scaffold with honeycomb cavities. Our hypothesis was to provide the substitute with a biomimetic structure favoring cell adhesion, spreading and differentiation. The in vitro mechanical and biological analysis performed with a progenitor cell line and withorganotypic assays confirmed our original approach. Then, the material seeded with bone marrow stem cells was successfully implanted by our collaborators in Amiens with the objective of treating a maxillofacial defect in a rodent model. In parallel, for the tendon reconstruction, we investigated several electrospinning processes, varying fibers’ size and organization (random/aligned). In a bioinspired perspective, we combined the choice of the scaffold with dynamic stretching to reproduce physical training. Under those mechanical stimulations, established first with the same progenitor cell line, we demonstrated in a second study that MSCs aligned with the stretching axis and produced extracellular matrix, which in turn allowed to keep the mechanical properties of the biohybrid scaffold all over the 2 weeks of culture. We demonstrated that cell differentiation towards tendon and bone lineage was successfully achieved in the absence of any differentiation factor, being specifically related to materials properties and mechanotransduction. Therefore, the next step consisting in the assembly of both scaffolds with a transition area should lead to this bone-tendon continuum’s reconstruction

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Lacroix, Aurélie. "Etude de la localisation de l’herpèsvirus humain de type 6 (HHV-6) dans les tissus hodgkiniens : recherche de l’expression de l’oncogène viral DR7 et de ses conséquences pour la cellule." Limoges, 2008. https://aurore.unilim.fr/theses/nxfile/default/45243d16-ed38-4721-8146-f2c5dd68586b/blobholder:0/2008LIMO4001.pdf.

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Abstract:

L’herpèsvirus humain de type 6 (HHV-6) au caractère lymphotropique présente deux variants A et B, ce dernier étant associé au lymphome de Hodgkin (LH). Toutefois, cette association est controversée dans la littérature car elle est présente dans de rares cas et absente dans la cellule caractéristique du LH : la cellule de Reed-Sternberg (RS). Lors du premier objectif de notre travail de thèse, la PCR quantitative a démontre�� l��existence et a quantifié le virus HHV-6 au sein d’une cohorte de patients atteints de LH; ceci de façon concomitante ou non au virus d’Epstein et Barr (EBV) connu pour être associé à cette pathologie. Par la suite, l’anticorps anti-DR7B de l’HHV-6 produit par nos soins a permis de connaître la localisation cellulaire du virus HHV-6 et ainsi de détecter sa présence en grande quantité dans la cellule RS pour 73,7% des patients atteints de LH seulement positifs pour l’HHV-6. En outre, un double marquage chez les patients de la cohorte positifs pour les deux herpèsvirus a démontré la colocalisation, notamment au niveau de la cellule RS, des oncoprotéines DR7B du virus HHV-6 et LMP1 du virus EBV signifiant une probable interaction virale. Enfin, un système de transfection stable permettant de moduler l’expression de DR7B au sein de cellules B matures proches des cellules RS a été réalisé. Il a permis d’observer l’induction, en présence de DR7B, de la surexpression tant au niveau transcriptionnel que traductionnel, comme au sein des cellules RS du LH, de Id2 qui est un inhibiteur de E2A, facteur de transcription impliqué dans la reprogrammation phénotypique des cellules RS
There are two variants, A and B, of human lymphotropic herpesvirus type 6 (HHV-6). The B variant is associated with Hodgkin’s lymphoma (HL). However this association is contreversial in the literature because it only exists in rare cases and not in Reed-Sternberg cells (RS), the characteristic cells of HL. In the first part of our study quantitative PCR demonstrated the existence of HHV-6 alone or concommitantly with Epstein-Barr virus, known to be associated with HL, in a cohort of HL patients. We then used an anti-HHV-6 DR7B antibody produced in our laboratory to determine the cellular localization of HHV-6 and to detect its presence in large quantities in RS cells from 73. 7% of HL patients positive only for HHV-6. Furthermore, double labeling studies in patients from the cohort positive for both herpesviruses demonstrated the colocalization, notably in RS cells, of DR7B from HHV-6 and LMP1 from EBV oncoproteins, indicating a probable viral interaction. Finally, a stable transfection system was realised to adjust DR7B expression in mature B cells which are close to RS cells. In the presence of DR7B, a transcriptionnal and translational expression of Id2, an inhibitor of E2A wich is a transcription factor implicated in phenotypical reprogramming of RS cells, similar to RS cells in HL, was observed

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Haj, Hassan Hawraa. "Détection et classification temps réel de biocellules anormales par technique de segmentation d’images." Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2018. http://www.theses.fr/2018LORR0043.

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Abstract:

Le développement de méthodes de la détection en temps réel de cellules anormales (pouvant être considérées comme des cellules cancéreuses) par captures et traitements bio-images sont des axes de recherche importants dans le domaine biomédical car cela contribue à diagnostiquer un cancer. C’est dans ce contexte que se situe ces travaux de thèse. Plus précisément, les travaux présentés dans ce manuscrit, se focalise sur le développement de procédures de lecture, de détection et de classification automatiques de bio-images de cellules anormales considérées comme des cellules cancéreuses. Par conséquent, une première étape du travail à consister à déterminer une solution de détection, à partir d’images microscopiques multispectrales permettant une répétitivité d’images sur une gamme de longueurs d'ondes de certains types de bio-images anormales associées à différents stades ou évolutions de cellules cancéreuses. L’approche développée dans ces travaux repose sur l’exploitation d’une nouvelle méthode de segmentation basée sur l'intensité de la couleur et pouvant être appliquée sur des séquences d'objets dans une image en reformant de manière adaptative et itérative la localisation et la couverture de contours réels de cellules. Cette étape préalable de segmentation est primordiale et permet une classification des tissus anormaux en utilisant la méthode de réseau de neurones à convolution (CNN) appliqué sur les images microscopiques segmenté de type snake. L’approche permet d’obtenir de bas résultats comparativement à une approche basée sur d’autres méthodes de segmentation de la littérature. En effet, cette méthode de classification atteint des valeurs de performance de 100% pour la phase d’apprentissage et de 99.168 % pour les phases de test. Cette méthode est comparée à différents travaux antérieurs et basée sur différentes fonctionnalités d'extraction, et a prouvé son efficacité par rapport à ces autres méthodes. En terme de perspectives, les travaux futurs visent à valider notre approche sur des ensembles de données plus larges, et à explorer différentes architectures CNN selon différents critères d’optimisation
Development of methods for help diagnosis of the real time detection of abnormal cells (which can be considered as cancer cells) through bio-image processing and detection are most important research directions in information science and technology. Our work has been concerned by developing automatic reading procedures of the normal and abnormal bio-images tissues. Therefore, the first step of our work is to detect a certain type of abnormal bio-images associated to many types evolution of cancer within a Microscopic multispectral image, which is an image, repeated in many wavelengths. And using a new segmentation method that reforms itself in an iterative adaptive way to localize and cover the real cell contour, using some segmentation techniques. It is based on color intensity and can be applied on sequences of objects in the image. This work presents a classification of the abnormal tissues using the Convolution neural network (CNN), where it was applied on the microscopic images segmented using the snake method, which gives a high performance result with respect to the other segmentation methods. This classification method reaches high performance values, where it reaches 100% for training and 99.168% for testing. This method was compared to different papers that uses different feature extraction, and proved its high performance with respect to other methods. As a future work, we will aim to validate our approach on a larger datasets, and to explore different CNN architectures and the optimization of the hyper-parameters, in order to increase its performance, and it will be applied to relevant medical imaging tasks including computer-aided diagnosis

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Urbach, Valérie. "Identification et étude de la régulation des canaux K+ dans la membrane basolatérale des cellules principales de la peau de grenouille (rana esculenta)." Nice, 1993. http://www.theses.fr/1993NICE4701.

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Abstract:

La réabsorption de Na+ à travers l'épithélium cutané de grenouille, est assurée par des canaux Na+ apicaux et des pompes Na/K ATPase basolatérales. Le K+ entrant dans la cellule par les pompes est recyclé par des canaux situes dans la même membrane. Par les techniques de patch-clamp nous avons identifié, dans la membrane basolatérale, deux types de canaux K+, étudié leur rôle physiologique et le mécanisme de leur régulation. Dans les conditions du transport spontané de Na+, est présent un canal K+ (Kir) de 25pS, rectificateur entrant et dont la probabilité d'ouverture (Po) maximale pour les courants sortants, lui permet de recycler le K+ parallèlement à l'activité de la pompe Na/K ATPase. L'activité du canal Kir est accrue par l'aldostérone, hormone stimulatrice de la réabsorption de Na+ (10nm, en configuration cell-attached). L'aldostérone régulerait son activité par l'intermédiaire du ph intracellulaire qu'elle contrôle en activant l'échangeur na/h et auquel les canaux Kir sont très sensibles (pK=7,2). L'activité du canal Kir est inhibe par l'ouabaïne (10-4 M, en configuration cell-attached), l'atp intracellulaire (Ki=50 m) et l'ADP (Ki=20 mm). Apres inhibition par l'atp (1 mm), une réactivation du canal est obtenue en ajoutant de l'ADP a une concentration physiologique (0,1 mm) au niveau de la face cytosolique du canal. Le rapport ATP/ADP régule essentiellement par l'activité de la pompe Na/K ATPase serait impliqué dans le couplage entre l'activité des canaux Kir basolatéraux, des canaux Na+ apicaux et de la Na/K ATPase. Enfin, l'élévation de la Ca2+ cytosolique, inhibe l'activité du canal Kir (Ki=180 m). Lors d'un choc hypotonique et dans les conditions conduisant à une élévation de Ca2+i un deuxième type de canal K+ (Kca: 35ps), est activé dans la membrane basolatérale des cellules épithéliales. Ce canal est sensible aux inhibiteurs classiques des canaux k#+ Ca-actives. Le canal Kca, seul canal k#+ présent dans ces conditions, dans la membrane des cellules cutanées de grenouille, serait responsable de la sortie de K+ impliquée dans la régulation du volume cellulaire. Dans la membrane basolatérale est présent également, un canal (Sca) active par le gonflement cellulaire ou l'étirement artificiel de la membrane (30 mbar) et perméable au Ca2+ (2-3 ps), avec une solution de Ringer, à la Ca2+ élevée (1 mm), dans la pipette. Ce canal cationique est non spécifique, avec une conductance de 30 ps, lorsque la Ca#2#+ dans la pipette est inférieure à 1 m. La Po de ce canal diminue avec une Ca2+ cytosolique supérieure à 1 m. Le canal Sca pourrait être impliqué dans l'élévation de la Ca2+ dans la cellule, observée lors d'un choc hypotonique et nécessaire à l'activation des canaux Kca

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Avallone, Sylvie. "Etude de la fermentation naturelle de "Coffea arabica L. " et des mécanismes de fluidification du tissu mucilagineux." Montpellier 2, 1999. http://www.theses.fr/1999MON20166.

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Abstract:

Au cours de la fermentation naturelle de coffea arabica l. , les bacteries lactiques et les levures sont les micro-organismes qui se developpent le plus. Les souches majoritaires appartiennent aux genres klebsiella, erwinia, leuconostoc, cryptococcus et candida. La microflore est stable selon l'annee et la region. La microflore metabolise 45%/ms du tissu mucilagineux sous forme de sucres simples et produit 5,8%/ms d'acide lactique. Ces rendements de conversion suggerent la superposition de plusieurs metabolismes (fermentations heterolactique, peut-etre alcoolique, respiration,). La flore sur pectine est constante et les souches isolees (erwinia herbicola et klebsiella pneumoniae) produisent des pectatelyases dont l'activite est nulle au ph de la fermentation et sur les pectines methylees. Seul lactobacillus brevis 166, isole a une frequence faible, produit une polygalacturonase compatible avec les conditions fermentaires. En atmosphere sterile, aucune fluidification du tissu n'est observee et l'acidification par les micro-organismes semble indispensable. Avant et apres fermentation, les cellules du tissu mucilagineux sont entourees de parois cellulaires de composition similaire et les pectines sont faiblement hydrolysees. L'acidification du milieu fermentaire limite la dissociation des fonctions carboxyles des pectines et induit une legere perte du calcium parietal. Les lysines et cysteines des proteines parietales sont moins accessibles au dosage apres fermentation et semblent impliquees dans des additions covalentes sur des acides phenols oxydes. La fluidification du tissu mucilagineux semble donc due a des modifications physico-chimiques des parois cellulaires et non a une pectinolyse. Au niveau industriel, l'utilisation d'eau au cours des etapes prefermentaires ralentit la fermentation. L'arret du procede peut etre decide en utilisant le ph comme traceur. Les procedes sec donnent une fluidification rapide par une microflore homogene. Une reorganisation du travail est alors necessaire pour arreter les fermentations plus tot. Le controle microbiologique par addition de lb plantarum ou lb brevis est envisageable pour standardiser la microflore et ameliorer la degradation du tissu. Ces ameliorations technologiques permettraient aux producteurs de cafe de controler la qualite et le prix du produit fini.

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Jbilo, Moulay-Omar. "Expression tissulaire des gènes de l'acétylcholinestérase et de la butyrylcholinestérase chez les mammifères. Caractérisation de la région promotrice du gène de la butyrylcholinestérase chez l'homme et le lapin." Montpellier 2, 1994. http://www.theses.fr/1994MON20206.

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Abstract:

La butyrylcholinesterase (bche) est une serine hydrolase tres voisine de l'acetycholinesterase (ache). Elle est presente uniquement chez les vertebres ou son role physiologique reste actuellement inconnu. Le travail effectue au cours de cette these a pour objet l'etude de la regulation du gene de la bche. Pour cela, deux approches ont ete utilisees, d'une part une etude comparative de l'expression de ce gene par rapport a celui de l'ache dans les tissus adultes (homme et lapin) et au cours du developpement embryonnaire chez le lapin, d'autre part la caracterisation des regions promotrices de ce gene chez l'homme et le lapin. La regulation des genes de l'ache et de la bche est differente. Cette difference se manifeste au niveau de la repartition tissulaire de leurs transcrits. Les regions 5' des genes de la bche chez l'homme et le lapin montrent egalement des sequences consensus pour des facteurs de transcription differents de ceux presents dans les genes de l'ache

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Riès, Delphine. "Etude d'une décharge hors équilibre à pression atmosphérique pour des applications biomédicales : physique de la décharge, cinétique de la production des espèces réactives lors de l'interaction avec des cellules et des tissus vivants." Thesis, Orléans, 2014. http://www.theses.fr/2014ORLE2065/document.

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Abstract:

Durant la dernière décennie, un nouveau type de décharge hors équilibre thermodynamique à pression atmosphérique a suscité un engouement croissant compte tenu de sa capacité de produire un plasma s'étendant dans l'air ambiant à une température proche de l'ambiante. Ces jets de plasma, souvent basés sur un réacteur de type décharge à barrière diélectrique, sont intéressants du point de vue de leurs propriétés physico-chimiques. De plus, ces jets de plasmas ont l'avantage de permettre des applications des matériaux thermosensibles, ouvrant ainsi un nouveau domaine de recherche, Plasma Médecine. Au GREMI le Plasma Gun, a été développé tant pour l'étude de la physique des jets de plasma que pour les applications biomédicales notamment dans le domaine de la cancérologie. Dans une première étape, des traitements par Plasma Gun in vitro et in vivo, dans le cadre d'un modèle murin du carcinome pancréatique, ont été effectués. L'action anti-tumorale du plasma a été démontrée ainsi que la combinaison bénéfique avec un traitement chimiothérapique. Fondée sur ces résultats encourageants, l'objectif principal de cette étude porte sur l'influence drastique de la cible de l'application sur les propriétés du plasma (propagation et production des espèces réactives) ainsi que l'interaction du gaz et du plasma. Des diagnostiques tels que l'imagerie rapide et filtrée en longueur d'onde, la spectroscopie d'émission optique, l'imagerie Schlieren ainsi que la spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier ont été utilisés pour caractériser le jet de plasma. Une étude quantitative de la distribution spatiale et temporelle du radical hydroxyle (densité comprise entre 5.1011 et 1.1014 cm-3) a été réalisée par fluorescence induite par laser. L'étude de l'OH en combinaison avec un modèle numérique a permis une meilleure compréhension de la pénétration de l'air dans le jet de gaz et de l'interaction avec les surfaces humides. L'interaction complexe entre le comportement du gaz, du plasma et la nature de la cible est mise en avant en vue d'optimiser les applications biomédicales
Over the past decade, a new type of non-equilibrium discharge at atmospheric pressure has attracted growing interest, given the ability to produce a plasma extending in ambient air close to room temperatures. These plasma jets, often based on a dielectric barrier discharge type of reactor, are interesting on their physicochemical property perspectives. In addition, these cold plasma jets have the advantage of allowing applications to heat sensitive materials, creating a new field of research, Plasma Medicine. At GREMI the Plasma Gun, has been developed for both the study of the physics of plasma jets and for biomedical applications particularly in the field of cancerology. In a first step, in vitro and in vivo were performed, within a rodent model of pancreatic carcinoma. The anti-tumor action of the plasma has been demonstrated as well as its benefic combination with a chemotherapeutic treatment. Based on these encouraging biomedical results, the main focus of this study is to report on the drastic influence of the application target on the plasma properties (propagation and production of reactive species) and on the strong coupling between gas jet and plasma discharge. Diagnostics such as fast, wavelength-filtered and Schlieren imaging, optical emission spectroscopy as well as Fourier transform infrared spectroscopy were used to characterize the plasma. A quantitative study on spatial and temporal distribution of hydroxyl radicals (OH density ranging between 5.1011 and 1.1014 cm-3) was performed by laser-induced fluorescence. The study of the OH in combination with a numerical model allowed a better understanding of the moist air penetration into the gas jet and the interaction with wet surfaces. This PhD work enlightened the complex interaction between the gas flow, the plasma and the nature of the target which has to be taken into account for further optimization of biomedical applications

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Longuespée, Rémi. "Histologie moléculaire : développements et applications pour la recherche de biomarqueurs du cancer de l’ovaire." Thesis, Lille 1, 2012. http://www.theses.fr/2012LIL10045/document.

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Abstract:

Les cancers de l’ovaire épithéliaux (EOC) sont parmi les affections néoplasiques gynécologiques les plus meurtrières dans les sociétés occidentales. Il n’existe actuellement aucune méthode de dépistage efficace de la maladie dans ses phases précoces de développement. Les travaux de ce doctorat furent articulés autour de deux objectifs relatifs à la recherche de biomarqueurs des EOC. Le premier fût le développement des méthodes d’analyses par spectrométrie de masse MALDI pour le criblage global des marqueurs des différents types d’EOC. Une procédure d’extraction des protéines de hautes masses moléculaires sur coupes de tissus à été créée afin de repousser les limites de sensibilité de la méthode. Ensuite, des analyses multivariées ont permis la comparaison des informations spectrales contenues entre des zones histologiques de natures différentes. Tous ces développements ont conduit à la validation au niveau histopathologique d’un biomarqueur de l’immunosuppression associée au cancer de l’ovaire, le fragment C-terminal de PA28 ou Reg-Alpha. Une autre problématique, la détermination de l’origine des EOC, a également pu être étudiée. Le deuxième objectif fût l’exploration de l’implication relative des différents membres des proprotéines convertases dans les EOC, des enzymes clés dans la maturation de nombreux acteurs moléculaires de la progression tumorale. Pour ce faire, des lignées cellulaires SKOV-3, Knock Down des différents membres de ces enzymes ont été créées pour l’étude de la redondance fonctionnelle de celles-ci. Il a alors été possible de déterminer, in cellulo et in vivo que PACE4 est particulièrement influente sur la progression du cancer de l’ovaire séreux
Epithelial ovarian Cancers (EOC) are amongst the most deadly gynecological neoplastic afflictions in western countries. As this time, there is no method for the efficient screening of the disease in its early steps of development. The topics of this PhD are based on two objectives related to biomarkers research of EOC. The first one was the development of analytical methods for MALDI Mass Spectrometry for global biomarkers screenings in different types EOC. An extraction procedure for high molecular mass proteins on tissue sections has been designed in order to push back the limits of sensitivity of the method. Then, multivariate analyses allowed us to compare spectral informations contained in histological regions of different natures. All these developments conducted to the histopathological validation of a biomarker of immunosupression associated to ovarian cancer, namely the C-terminal fragment of PA28 (Reg-Alpha). Another issue, the determination of EOC origin, has also been studied. The second goal of this PhD has been the exploration of the relative implication of the different members of proproteine convertases (PCs) in EOC, which are keys enzymes involved in the maturation of many molecular actors of tumoral progression. To do so, SKOV-3 cell lines have been knocked-down for different PCs to study the functional redundancy of these enzymes. It has then been possible to determine, in cellulo and in vivo, that PACE4 is particularly influent on ovarian cancer progression

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Haj, Hassan Hawraa. "Détection et classification temps réel de biocellules anormales par technique de segmentation d’images." Thesis, Université de Lorraine, 2018. http://www.theses.fr/2018LORR0043.

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Abstract:

Le développement de méthodes de la détection en temps réel de cellules anormales (pouvant être considérées comme des cellules cancéreuses) par captures et traitements bio-images sont des axes de recherche importants dans le domaine biomédical car cela contribue à diagnostiquer un cancer. C’est dans ce contexte que se situe ces travaux de thèse. Plus précisément, les travaux présentés dans ce manuscrit, se focalise sur le développement de procédures de lecture, de détection et de classification automatiques de bio-images de cellules anormales considérées comme des cellules cancéreuses. Par conséquent, une première étape du travail à consister à déterminer une solution de détection, à partir d’images microscopiques multispectrales permettant une répétitivité d’images sur une gamme de longueurs d'ondes de certains types de bio-images anormales associées à différents stades ou évolutions de cellules cancéreuses. L’approche développée dans ces travaux repose sur l’exploitation d’une nouvelle méthode de segmentation basée sur l'intensité de la couleur et pouvant être appliquée sur des séquences d'objets dans une image en reformant de manière adaptative et itérative la localisation et la couverture de contours réels de cellules. Cette étape préalable de segmentation est primordiale et permet une classification des tissus anormaux en utilisant la méthode de réseau de neurones à convolution (CNN) appliqué sur les images microscopiques segmenté de type snake. L’approche permet d’obtenir de bas résultats comparativement à une approche basée sur d’autres méthodes de segmentation de la littérature. En effet, cette méthode de classification atteint des valeurs de performance de 100% pour la phase d’apprentissage et de 99.168 % pour les phases de test. Cette méthode est comparée à différents travaux antérieurs et basée sur différentes fonctionnalités d'extraction, et a prouvé son efficacité par rapport à ces autres méthodes. En terme de perspectives, les travaux futurs visent à valider notre approche sur des ensembles de données plus larges, et à explorer différentes architectures CNN selon différents critères d’optimisation
Development of methods for help diagnosis of the real time detection of abnormal cells (which can be considered as cancer cells) through bio-image processing and detection are most important research directions in information science and technology. Our work has been concerned by developing automatic reading procedures of the normal and abnormal bio-images tissues. Therefore, the first step of our work is to detect a certain type of abnormal bio-images associated to many types evolution of cancer within a Microscopic multispectral image, which is an image, repeated in many wavelengths. And using a new segmentation method that reforms itself in an iterative adaptive way to localize and cover the real cell contour, using some segmentation techniques. It is based on color intensity and can be applied on sequences of objects in the image. This work presents a classification of the abnormal tissues using the Convolution neural network (CNN), where it was applied on the microscopic images segmented using the snake method, which gives a high performance result with respect to the other segmentation methods. This classification method reaches high performance values, where it reaches 100% for training and 99.168% for testing. This method was compared to different papers that uses different feature extraction, and proved its high performance with respect to other methods. As a future work, we will aim to validate our approach on a larger datasets, and to explore different CNN architectures and the optimization of the hyper-parameters, in order to increase its performance, and it will be applied to relevant medical imaging tasks including computer-aided diagnosis

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Boytard, Ludovic. "Analyse moléculaire des types cellulaires impliqués dans l'anévrysme de l'aorte abdominale." Phd thesis, Université du Droit et de la Santé - Lille II, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00825204.

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Abstract:

L'anévrysme de l'aorte abdominale (AAA) est une maladie vasculaire consistant en une dilatationde l'aorte abdominale. Son caractère asymptomatique rend importante la recherche debiomarqueurs afin de faciliter la prise en charge des patients.Le but de mes travaux de thèse a été d'étudier spécifiquement les types cellulaires impliqués dansl'AAA.Après obtention d'une banque d'échantillons d'AAA, nous avons localisé ces types cellulaires etrepéré 3 zones d'intérêt : le thrombus intraluminal contenait des neutrophiles, lymphocytes T,mastocytes et macrophages M2. Les macrophages M1 étaient localisés dans l'adventice, avec leslymphocytes B et des mastocytes. La média contenait des cellules musculaires lisses (CML) dont lephénotype variait entre les états sain, anévrysmal et apoptotique.Ces résultats suggérant une implication différente des deux types de macrophages et uneévolution des CML au cours de l'AAA, nous avons isolé ces deux types cellulaires du tissu anévrysmalpar microdissection laser afin d'y étudier l'expression de biomarqueurs potentiels. Nous avons ainsimontré que l'augmentation plasmatique de peroxiredoxine-1 provient des macrophages M1 et quel'augmentation d'ADAMTS5 provient des CML anévrysmales allongées.Nous avons ensuite comparé les protéomes des macrophages M1 et M2 afin d'élucider leur rôledans l'AAA et d'identifier de nouveaux biomarqueurs. Cinq protéines différentielles ont étéidentifiées impliquées dans la phagocytose ou la réponse au stress.L'étude des différents types cellulaires impliqués dans l'AAA pourrait nous permettre unemeilleure compréhension de ses mécanismes et l'identification de biomarqueurs potentiels de cettepathologie.

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Le, gal Rozenn. "Potentiel thérapeutique d'un agent de la matrice extracellulaire après une ischémie cérébrale : quels effets sur la protection du tissus et la récupération fonctionnelle ? : étude chez le rat et le marmouset commun Assessment of behavioural deficits following ischaemic stroke in the marmoset." Thesis, Normandie, 2019. http://www.theses.fr/2019NORMC431.

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Abstract:

L’AVC ischémique est un problème de santé publique majeur, représentant la première cause d’handicap acquis chez l’adulte ainsi que la deuxième cause de mortalité dans le monde. A ce jour, les seuls traitements disponibles sont la thrombolyse et la thrombectomie, mais appliqués à une minorité de patients. En dépit de nombreuses études réalisées chez l’animal et chez l’Homme, la recherche de nouvelles thérapies neuroprotectrices et neurorégénératrices pour l’AVC accumule les échecs. Pour augmenter les chances de translation, des comités d’experts incitent la recherche préclinique à intégrer des facteurs de risques de l’AVC aux études. Ils encouragent également l’utilisation de primates non-humains afin de valider les résultats obtenus au préalable chez le rongeur avant toute tentative de translation chez l’Homme.Au cours de ces travaux de thèse, nous nous sommes intéressés aux effets thérapeutiques du RGTA (ReGeneraTing Agent) chez divers modèles animaux : le rat normo- et hypertendu, ainsi que chez le marmouset commun.Les résultats obtenus indiquent que le RGTA permet de protéger le tissu cérébral à la suite d’une ischémie chez le rat normotendu. De plus, lorsque ce traitement est combiné à une thérapie cellulaire à base de cellules souches mésenchymateuses, il offre également une neuroprotection et une amélioration de la récupération fonctionnelle chez le rat atteint d’hypertension artérielle. Toutefois, la dose du RGTA testée chez le marmouset ne nous a pas permis de valider son efficacité après ischémie cérébrale chez cette espèce. Des études supplémentaires avec de nouveaux paramètres sont donc nécessaires
Cerebral ischemic stroke is a devastating neurovascular disease worldwide. It is the leading cause of adult disability and the second cause of mortality in the world, making this pathology a public health priority. Nowadays, only thrombolysis and thrombectomy therapies are available to reduce ischemic outcome. However, they are applied to a minority of patients. So far, many therapeutic approaches to ameliorate ischemic stroke have been promising in animal studies but failed when transferred to the clinical situation. In order to improve successful translation from bench to bed, comity experts encourage the integration of comorbidity factors, such as arterial hypertension, in preclinical studies, as well as the use of higher order species such as non-human primates.Here, we have evaluated the therapeutic effects of a matrix-based therapy, RGTA (ReGeneraTing Agent) on several animal models: normo- and hypertensive rats, together with common marmoset.The results demonstrate that RGTA protects brain tissue in normotensive rats following ischemic stroke. Moreover, when this treatment is combined with a cellular therapy based on mesenchymal stem cells, it confers a neuroprotection accompanied with a better functional recovery in rats with arterial hypertension. However, the therapeutic potential of RGTA, at the dose tested, was not successfully validated in common marmoset. Thus, further investigations with new parameters are required

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Dissertations / Theses on the topic 'Cellules et tissus'

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