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Dissertations / Theses on the topic 'Chaînes alimentaires'
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Kaldonski, Nicolas. "La manipulation de l’hôte par les parasites acanthocéphales, aspects éco-éthologiques." Dijon, 2007. http://www.theses.fr/2007DIJOS032.
Full textAbstract:
Les parasites à cycle complexe sont confrontés au problème de leur transmission de l’hôte amont à l’hôte aval. Des modifications comportementales induites par ces parasites sont fréquemment observées chez les hôtes intermédiaires, et ont pour conséquence d’augmenter la transmission trophique du parasite à son hôte définitif. De telles modifications doivent satisfaire à certains critères pour être considérées comme adaptatives. Nous avons étudié le caractère adaptatif de la manipulation parasitaire en nous appuyant sur deux critères principaux : un bénéfice en terme d’aptitude pour le parasite manipulateur et l’existence d’un lien logique entre le comportement modifié et l’hôte ciblé. Les acanthocéphales sont des helminthes parasites de Vertébrés qui ont été historiquement les premiers modèles d’études portant sur les modifications comportementales liées à l’infection parasitaire. Trois espèces, Pomphorhynchus laevis, Pomphorhynchus tereticollis et Polymorphus minutus, exploitent Gammarus pulex (Crustacés, Amphipodes) comme hôte intermédiaire en Bourgogne. Nos résultats démontrent que les modifications comportementales induites par P. Laevis et P. Tereticollis sur G. Pulex augmentent leur transmission par voie trophique vers deux hôtes définitifs, le chabot et la truite. Nous avons ensuite mis en évidence le caractère multidimensionnel des altérations, entraînant principalement un ajustement temporel de la manipulation à l’optimum de transmission des parasites et une inversion de la réaction anti prédateur initiée par la perception olfactive d’un poisson. Cette multidimensionnalité ne s’étend pas en revanche à l’hypothèse du rôle de la tache colorée du parasite dans l’augmentation de vulnérabilité des proies. Les altérations comportementales présentent enfin un certain niveau de spécificité quant à l’hôte ciblé, corroborant le caractère adaptatif de la manipulation. Elles permettent en outre d’établir des connexions entre proies et prédateurs qui ne semblaient pas être intégrées jusqu’alors dans l’étude des réseaux trophiques et des écosystèmes.
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Leclerc, Jean-Charles. "Biodiversité, structure et fonctionnement trophique des communautés à Laminaria hyperborea, en conditions naturelles et exploitées, en Bretagne." Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066690.
Full textAbstract:
Les forêts de laminaires représentent un habitat emblématique des fonds sous-marins rocheux dans les milieux tempérés. En Bretagne, ces écosystèmes sont dominés par Laminaria hyperborea, espèce exploitée pour sa teneur en alginates, par l’industrie goémonière. Dans le cadre de cette exploitation régionale, l’objectif de ce travail de thèse est de caractériser la biodiversité, la structure et le fonctionnement trophique associés à ces communautés en conditions naturelles et exploitées. Des échantillonnages réalisés sur deux stations de la côte bretonne ont mis en évidence la présence d’au moins 110 espèces algales et 462 espèces animales dans ces milieux. Cette diversité taxonomique est représentée par des assemblages structurés au sein de microhabitats stratifiés, présentant différents degrés de complexité. La compréhension de cette stratification ajoute une dimension à intégrer pour une exploitation de L. Hyperborea durable du point de vue des communautés associées. Avec un partitionnement de la ressource à micro-échelle, le réseau trophique global est principalement supporté par le phytoplancton, les laminaires et les macroalgues associées. La diversité des cycles saisonniers (i. E. Croissance, senescence) différenciant ces sources influence à la fois leur utilisation indirecte à travers les voies détritiques et leur utilisation directe par les brouteurs. L’ensemble de ces résultats montre l’importance de déterminer la diversité fonctionnelle dans son ensemble au sein des forêts de laminaires. Cette diversité doit être considérée à multi-échelle afin d’appréhender le degré de stabilité de l’écosystème<br>Kelp forests are emblematic habitats of temperate rocky reefs. In Brittany, these ecosystems are dominated by Laminaria hyperborea, this species is harvested for its alginic acid content. The aim of this thesis work is to characterise the biodiversity, structure and trophic functioning that feature these communities in natural and harvested conditions. The incidence of at least 572 species (110 algae and 462 fauna) was reported from sampling performed within two stations off the coast of Brittany. Diverse assemblages were highlighted according to the stratification of kelp forests in various microhabitats, with contrasting complexities. The link between habitat stratification and associated biodiversity suggests that considering this stratification is necessary for a sustainable management of this ecosystem. Within local food web, while the resource was partitioned at micro-scale, trophic pathways were based on phytoplankton, kelp and associated seaweeds. The seasonal cycle (i. E. The alternation of growth and senescence phases) of food sources proved to influence consumption by associated communities (both indirect consumption through detrital pathways and direct consumption through grazing). The results of this thesis highlighted the importance to ascertain the overall functional diversity within kelp forests. This diversity needs to be taken into consideration at a multi-scale level in order to comprehend ecosystem stability
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Dauphin, Karine. "Transfert du mercure depuis le milieu aquatique vers les chaînes alimentaires terrestres lors d'inondations." Thèse, Université du Québec à Trois-Rivières, 2007. http://depot-e.uqtr.ca/1983/1/030024785.pdf.
Full text
4
Roméo, Michèle. "Contribution à la connaissance des métaux traces (Cd, Cu, Hg, Pb, Zn) dans l'écosystème marin au niveau du plancton : approches analytiques et expérimentales." Nice, 1985. http://www.theses.fr/1985NICE4050.
Full text
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Lagarrigue, Thierry. "Croissance de la truite commune (Salmo trutta L. ) dans les Pyrénées françaises : analyse régionale et locale des principaux facteurs de variabilité en rivière de montagne." Toulouse, INPT, 2000. http://www.theses.fr/2000INPT013A.
Full textAbstract:
Les pyrenees francaises possedent un reseau hydrographique dense, fortement domine par la truite commune (salmo trutta l. ), espece d'un grand interet patrimonial. A l'echelle de la chaine pyreneenne, la croissance de la truite commune est tres variable et principalement influencee par les conditions globales d'habitat, notamment par l'action indirecte de l'altitude, qui integre les conditions thermiques et physico-chimiques, et par les perturbations artificielles du debit. Ainsi, selon l'altitude et la largeur du cours d'eau, des modeles predictifs de la taille a 3 ans ont ete etablis, permettant d'expliquer respectivement 53. 5% et 65. 5% de la variance en debit reserve et en debit naturel. A l'echelle du troncon, la croissance des 0 + en riviere naturelle est fortement influencee par la temperature. Chez les individus plus ages, elle presente une forte variabilite saisonniere qui se repercute sur la biomasse totale et la production. Faible a nulle en automne-hiver, la croissance s'effectue en quasi totalite au printemps. Elle est reduite en ete, malgre des conditions thermiques optimales, en raison de l'action conjuguee 1) de la maturation sexuelle, 2) d'une competition intra-specifique accrue a l'etiage par l'arrivee d'individus devalants des affluents et la reduction de la capacite d'accueil du milieu physique, et 3) par une ressource trophique abondante mais constituee de proies de tres petite taille. Toujours a l'echelle du troncon, les effets des modifications artificielles de debit ont ete evalues par rapport a des secteurs de reference en debit naturel. _ en secteur a debit reserve, la reduction de l'habitat physique favorable altere les conditions trophiques, provoquant un accroissement de la competition intra-specifique et des changements de strategie alimentaire, qui penalisent la croissance des adultes. _ en secteur a eclusees, les variations brutales de debit entrainent des mortalites chez les jeunes stades. En revanche, meme si les rythmes alimentaires sont perturbes, les adultes ayant reussi a s'implanter semblent compenser un probable surplus de depense energetique par une ingestion accrue. Leur croissance apparait donc peu perturbee sur ce site particulier, qui retrouve un debit naturel hors fonctionnement de l'usine. Suite a cette etude, il apparait que la croissance de la truite commune dans les cours d'eau pyreneens est faible, en raison des fortes contraintes environnementales. Sa flexibilite a differentes echelles spatiales ainsi que sa forte variabilite saisonniere, ont des incidences majeures sur le fonctionnement global des populations dans les rivieres des pyrenees.
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Kostecki, Caroline. "Dynamique trophique, habitat benthique et fonction de nourricerie des milieux côtiers et estuariens." Rennes, Agrocampus Ouest, 2010. http://www.theses.fr/2010NSARH081.
Full textAbstract:
Durant les premières années de leur vie, les juvéniles de nombreuses espèces de poissons plats, et en particulier la sole commune et la plie, fréquentent des zones de nourricerie côtières et estuariennes. Une fois leur maturité sexuelle atteinte, ils rejoignent l’aire de vie plus étendue des adultes, située sur le plateau continental et participent à la reproduction. L’emprise spatiale de ces nourriceries, très localisées, dépend notamment des apports en eau douce qui favorisent l’extension de la nourricerie vers le large et conduisent à un recrutement supérieur. Le lien entre les sources de matière organique, les populations invertébrés benthiques et les juvéniles de poissons plats étant complexe et mal connu dans ces milieux, il a été choisi d’étudier les relations trophiques et spatiales entre ces compartiments dans deux nourriceries différentes : l’estuaire de la Vilaine et la baie du Mont-Saint-Michel. La première partie de ce travail s’est attachée à décrire le réseau trophique benthique des juvéniles de poissons plats via l’analyse des isotopes stables (carbonne et azote) et des contenus digestifs. L’analyse spatio-temporelle de la signature isotopique du carbone des juvéniles de sole dans l’estuaire de la vilaine a indiqué une incorporation, variable selon le débit fluvial, de la matière organique d’origine terrigène dans le réseau trophique benthique. La baie du Mont-Saint-Michel, qui ne bénéficie pas d’autant d’apports en eau douce que les sytèmes purement estuariens, abrite une importante nourricerie pur les juvéniles de sole et de plie. Dans cette dernièe la production microphytobenthique issue des larges vasières intertidales (source autochtone de matière organique) a largement contribué au fonctionnement du réseau trophique des juvéniles de poissons plats<br>For a large proportion of flatfish species, and especially common sole and plaice, juveniles grow in restricted coastal and estuarine nursery grounds during their first years of life. Once their sexual maturity reached, they move to more extended adults habitat located on the continental shelf and contribute to the reproduction. Nursery grounds area depends on freshwater inputs which enhance the juvenile distribution to the open sea and the recruitment. The link between organic matter sources, benthic invertebrates populations that constitute their food supply and flatfish juveniles is complex and remains poorly known. Trophic and spatial interactions between these components have thus been investigated in two contrasted nursery grounds : the Vilaine estuary and the Mont-Saint-Michel bay. The first part of this project aimed to describe flatfish juveniles benthic food web using stable isotopes and gut contents analyses. Carbon stable isotope signatures in common sole juvenile in the vilaine estuary showed the incorporation of terrigenous organic matter into their benthic food wed. Furthermore, this assimilation varied according to Vilaine river flow. Conversely, the Mont-Saint-Michel bay receives little freshwater inputs, but supports an important nursery ground for plaice and common sole. In this nursery ground, microphytobenthos produced on the wide intertidal mudflats mainly contributed to flatfish juveniles food web. Combined utilisation of bot stable isotopes and gut contents analyses thus improved coastal and estuarine nursery grounds description : these analyses particularly pointed out the terrigeneous organic matter role and benthic diatoms production in the flatfish nursery grounds trophic functioning and the spatio-temporal variability of the respective influence of these two sources
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Mensens, Christoph. "Biodiversity and ecosystem functioning in stressed environments : primary producers and consumers at the basis of marine food webs." Electronic Thesis or Diss., Paris 6, 2016. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2016PA066736.pdf.
Full textAbstract:
La biodiversité est de plus en plus modifiée par les activités humaines, ce qui a conduit à des recherches considérables sur l'effet de la biodiversité sur le fonctionnement des écosystèmes. Ces recherches ont cependant rarement inclu le stress anthropogénique qui cause la perte de biodiversité. Cette thèse analyse l'impact du stress (pesticides et métaux lourds) sur la relation entre la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes à la base de la chaîne alimentaire marine, avec des producteurs marins primaires (diatomées) et leurs principaux consommateurs (copépodes). Le premier résultat est que la pollution chimique altère la régularité plutôt que la richesse des espèces, avec un effet disproportionné sur le fonctionnement si un stress sélectif provoque la domination par des espèces tolérantes avec une faible contribution fonctionnelle. L'effet du stress sur le fonctionnement est prévisible sur la base d'une corrélation des traits biologiques prédisant l'abondance des espèces et des traits prédisant leur effet sur le fonctionnement. L'effet de la biodiversité sur le fonctionnement augmente sous l'effet du stress dû à une augmentation d'interactions facilitatrices entre les espèces (effet de complémentarité). L'effet du stress sur la qualité alimentaire des producteurs primaires réduit le transfert d'énergie au niveau des consommateurs, soulignant la pertinence du changement de biodiversité dans un contexte trophique. La thèse se termine par un cadre synthétique présentant les trois principaux effets (stress sélectif, stress physiologique, complémentarité) déterminant l'effet du stress sur la relation entre la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes<br>Biodiversity is increasingly altered by human activities, which has led to considerable research on the consequences of biodiversity loss for ecosystem functioning. The anthropogenic stressors driving the ongoing biodiversity loss are however rarely included into biodiversity-ecosystem functioning experiments. The present thesis analyses the impact of anthropogenic stressors (pesticides, heavy metals) on the biodiversity-ecosystem functioning relation in marine primary producers (diatoms) and consumers (copepods). It was shown that chemical stress alters species evenness rather richness, with a disproportionate effect on functioning if stress causes dominance by tolerant species with a low functional contribution. Stress tolerance and the functional contribution were predictable based on the species’ biological traits, and the effects of stress on ecosystem functioning depended on the correlation of traits predicting species abundance and traits predicting the species’ effect on ecosystem functioning. The biodiversity effect on primary producer biomass production increased under stress due to facilitative interactions (complementarity effect). Stressor-induced biodiversity loss reduced the food quality of primary producers and impaired the energy transfer to the consumer level, highlighting the relevance of stressor-induced biodiversity changers in a trophic context. The thesis ends with a synthetic framework which puts forward the three main effects (selective stress, physiological stress, complementarity) through which anthropogenic stress affects biodiversity-ecosystem functioning relations at the basis of marine food webs
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Maasri, Alain. "Impact de l'enrichissement des eaux sur le peuplement d'invertébrés benthiques : approche multi-échelles des relations trophiques structurant la communauté de chironomidae (diptera : nematocera) rhéophiles." Aix-Marseille 3, 2007. http://www.theses.fr/2007AIX30031.
Full textAbstract:
L'étude des biocénoses aquatiques de l'Arc, rivière méditerranéenne soumise à de forts taux d'enrichissement, a permis de qualifier l'impact que peut avoir ce dernier sur la structure et le fonctionnement trophique de tels écosystèmes. Les communautés d'algues, de l'ensemble des macroinvertébrés benthiques et de Chironomidae ont été étudiées à différentes échelles spatiales. Une première étude des macroinvertébrés à l'échelle du bassin versant a permis d'évaluer le potentiel des affluents dans la préservation de la biodiversité des macroinvertébrés. Ensuite, une étude menée sur les exuvies de Chironomidae le long d'un gradient d'enrichissement a montré l'effet de l'enrichissement sur la structure taxinomique et trophique des communautés de Chironomidae. Plus localement, l'étude de l'assemblage de Chironomidae rhéophiles et de l'épilithon a permis de mettre en relation les changements survenus au niveau de l'assemblage d'algues avec les changements au niveau des communautés larvaires de Chironomidae racleurs. En dernier, l'étude du régime alimentaire d'Eukiefferiella claripennis (taxon dominant dans cette étude) a apporté des informations complémentaires sur le comportement alimentaire d'un taxon opportuniste. Ainsi, le couplage de toutes ces approches a permis de construire la cascade d'impacts de l'enrichissement sur les réseaux trophiques, depuis les producteurs autotrophes jusqu'aux communautés d'invertébrés benthiques<br>The aquatic biocenoses of the Arc stream, a coastal Mediterranean stream, were investigated to assess the impact of the water enrichment on the communities'trophic and taxonomic structures. The benthic macroinvertebrates communities, the chironomid communities and the epilithon were studied for this purpose. At first, the acroinvertebrates communities were studied in the main stem and in different pristine tributaries to consider the role of these tributaries in the maintenance of the macroinvertebrates biodiversity at the catchment scale. Then the chironomid communities were investigated using the pupal exuviae assemblages to assess changes in the chironomid communities' trophic and taxonomic structures along a water enrichment gradient. At the riffle scale, correlations were found between the epilithic algal structure and the chironomid larvae distribution; and the guts content analysis of Eukiefferiella claripennis revealed the foraging behaviour of such opportunistic taxa and helped to understand how this taxa spread under such conditions. All these approaches allowed us to assemble clues for understanding changes occurring in such enriched streams at different scales, going from the epilithic algae to the whole macroinvertebrate community
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Pusineri, Claire. "Niches alimentaires et partage des ressources : les petits cétacés du golfe de Gascogne." La Rochelle, 2005. http://www.theses.fr/2005LAROS146.
Full textAbstract:
Cette étude porte sur : 1) La détermination des niches alimentaires du dauphin commun, Delphinus delphis, du dauphin bleu et blanc, Stenella coeruleoalba, du grand dauphin, Tursiops truncatus et du marsouin commun, Phocoena phocoena, dans les secteurs néritiques et océaniques du golfe de Gascogne, à partir de l'analyse de contenus stomacaux. 2) L'analyse du partage des ressources alimentaires de ces petits cétacés avec les autres grands prédateurs et les pêcheries. Chacune des espèces de petits cétacés présente une niche alimentaire caractéristique : le dauphin commun consomme principalement des petits poissons grégaires dans la couche d'eau supérieure de l'épipélagique du plateau comme du secteur océanique. Le dauphin bleu et blanc se focalise sur les petites proies, indifféremment poissons ou céphalopodes, grégaires de la couche d'eau plutôt inférieure de l'épipélagique. Il chasse principalement en secteur océanique, et ponctuellement sur le plateau continental. Le grand dauphin chasse préférentiellement de grands poissons démersaux du plateau continental. Enfin, le marsouin consomme en majorité de petits poissons soit pélagiques soit démersaux sur le plateau continental. Dans le secteur néritique, on observe un fort chevauchement trophique d'une part entre les pêcheries et les cétacés, dont les proies préférentielles sont des espèces commerciales majeures, et d'autres par entre quelques espèces commerciales majeurs (raie fleurie, merlu et thon germon) et au moins une espèce de cétacé. Dans le secteur océanique, les rôles trophiques des dauphins commun et bleu et blanc se différencient largement de ceux des autres compartiments épipélagiques de niveaux trophiques supérieurs : il n'existe pas de chevauchement entre les régimes alimentaires des dauphins et les captures des pêcheries qui se focalisent sur le thon germon et l'espadon. De plus, les régimes alimentaires des petits cétacés chevauchent faiblement ceux de l'espadon et du requin peau bleue. Enfin, un chevauchement significatif est observé entre les tailles de proies et les périodes de chasse des dauphins et du thon germon, mais les taxons proies consommés diffèrent entre ces deux groupes. Compte tenu de ces résultats, les petits cétacés semblent bien être un compartiment d'intérêt majeur dans le cadre d'une gestion écosystémique des ressources du golfe de Gascogne, soit en tant que compétiteurs potentiels des pêcheries, soit en tant que compartiment au rôle trophique original<br>The present study focuses on: 1) The determination of the diets of the common dolphin, Delphinus delphis, the striped dolphin, Stenella coeruleoalba, the bottlenose dolphin, Tursiops truncatus and the harbour porpoise, Phocoena phocoena from stomach content analysis in the neritic and oceanic area of the Bay of Biscay. 2) The analysis of feeding niches segregation between these small cetaceans and both the other large predators and the fisheries. Each cetacean species showed a specific dietary niche: the common dolphin consumed essentially small gregarious fish in the upper epipelagic water layer both in the neritic and the oceanic area. The striped dolphin focused on small gregarious prey, either cephalopods or fish, of the lower epipelagic water layer. It foraged essentially in the oceanic area and occasionally in the neritic waters. The bottlenose dolphin foraged mainly on large demersal fish of the continental shelf. At last, the common porpoise ate mainly small pelagic or demersal neritic fish. In the neritic area, a high trophic overlap was observed between the fisheries and the cetaceans, whose preferred prey were species of major commercial importance, and between the diet of some of the main commercial prey and at least one cetacean species. In the oceanic area, the trophic role of the cetaceans was quite different from those of the other high trophic level epipelagic groups: first, there was no trophic overlap between the cetaceans and the fisheries that focused on swordfish and albacore tuna. Second, the dietary niches of the cetaceans did not overlap significantly those of the swordfish and the blue shark. Third, a significant overlap was observed between the cetaceans and the albacore tuna in terms of prey length and foraging period, but not in terms of prey taxa. Those results underlined that the Bay of Biscay small cetacean species are a trophic compartment of major interest within the framework of an ecosystem management of the resources either because of their potential competition with fisheries or because of their original role in the ecosystem
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Dupuy, Christine. "Rôle fonctionnel des protistes hétéro-mixotrophes dans le réseau trophique d'un écosystème conchylicole : le marais atlantique." La Rochelle, 1999. http://www.theses.fr/1999LAROS040.
Full textAbstract:
L’huitre Crassostrea gigas se nourrit en filtrant le phytoplancton, mais dans les marais atlantiques, cette production phytoplanctonique ne suffit pas pour équilibrer son bilan énergétique. L’analyse du réseau microbien planctonique au cours de l'isolement du marais en mortes-eaux montre une succession de peuplements : des diatomées qui épuisent rapidement les nutriments, puis des bactéries et enfin des protistes flagelles et cilies. La production bactérienne représente une ressource énergétique importante, mais l'huitre ne peut capter efficacement ces particules < 1m. Les protistes hétéro/mixotrophes qui se nourrissent de ces picoproies pourraient alors, s'ils sont retenus par l'huitre, représenter un relais trophique entre la production bactérienne et l'huitre. Cette étude a pour objectif de déterminer l'importance et le rôle des protistes dans les marais atlantiques et d'estimer leur contribution à la nutrition de l'huitre. Plusieurs approches ont été utilisées : (1) un suivi annuel dans un marais pour estimer l'importance des protistes comme ressource énergétique potentielle, (2) des expériences au laboratoire et in situ pour évaluer les capacités de l'huitre à retenir les protistes, (3) des incubations in situ pour estimer les taux de croissance des principaux types de protistes et le rendement du transfert de matière à travers ce compartiment-clé. Dans le marais, les flagelles de taille < 5 m représentent la première ressource trophique du plancton (681 g c1 - 1 en période estivale). Les dinoflagelles, les cilies et les diatomées apportent une contribution très variable selon la saison et la durée d'isolement des eaux. L’étude expérimentale de la rétention de particules par l'huitre montre que tous les protistes de taille < ou égale à 5 m sont captés par les branchies de l'huitre : dans 400 ml d'eau du marais, une huitre d'un an retient en 15 min 94% des cilies et 96% des flagelles (taille < 5 m). Les protistes hétéro/mixotrophes, qui consomment les bactéries et le phytoplancton, sont très abondants dans le marais en conditions saisonnières favorables. Des incubations in situ mettent en évidence une production élevée, un temps de génération court (7 à 26h) et un fort rendement de croissance (48% pour les cilies). L’huitre utilise donc, outre des diatomées, les protistes hétéro/mixotrophes : les flagelles < 5m constituent sa principale ressource énergétique (64 g c g - 1 j - 1 en été), les dinoflagelles et les cilies, un apport complémentaire. Ainsi, via les protistes, l'huitre récupère une partie de la forte production bactérienne (qu'elle ne peut capter) sous une forme particulaire d'une taille accessible à la rétention par son filtre branchial.
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Massol, François. "Modélisation de l'impact des changements planétaires sur les communautés et les réseaux trophiques." Montpellier 2, 2008. http://www.theses.fr/2008MON20011.
Full text
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Decottignies, Priscilla. "Mécanismes d'alimentatation et régimes trophiques de deux mollusques suspensivores invasifs en baie de Bourgneuf, Crassostrea gigas et Crepidula fornicata : comparaison et implications." Nantes, 2006. http://www.theses.fr/2006NANT2070.
Full textAbstract:
Le gastéropode Crepidula fornicata, contrairement au bivalve Crassostrea gigas, ne présente aucun potentiel anatomique ou fonctionnel pour la sélection des particules retenues sur sa branchie. Ses réponses physiologiques, en particulier la constance de sa filtration, ont toutefois révélé une meilleure adaptation aux conditions de charge sestonique rencontrées dans les écosystèmes côtiers peu profonds telle la baie de Bourgneuf. Une contribution significative des détritus végétaux, accompagnée de celle des microalgues benthiques et planctoniques, a été mise en évidence dans les régimes alimentaires des deux espèces par traçage isotopique naturel. Ces différentes sources sont assimilées dans des proportions qui varient selon les périodes de l’année, la disponibilité des ressources et l’activation des mécanismes de sélection (chez l’huître). Les capacités de sélection constituent un élément clé dans l’interprétation des relations trophiques dans les écosystèmes côtiers<br>The gastropod Crepidula fornicata, contrary to the bivalve Crassostrea gigas, showed no anatomical or functional potential for the qualitative selection of filtered particles. However, the physiological responses, notably a constant filtration, revealed a better adaptation to sestonic concentrations found in shallow coastal ecosystems such as Bourgneuf Bay. A significant contribution of plant detritus, together with those of benthic and planktonic microalgae, was shown in the diets of the two suspension-feeders using natural isotope tracing. Assimilated proportions of these sources varied according to time of year, resource availability, and activation of selection mechanisms (in oysters). Selection capacities constitute a previously overlooked determinant of trophic relationships in coastal ecosystems
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Madigou, Erwann. "Influence du statut trophique de cours d'eau sur les fonctionnalités microbiennes des Biofilms (épipsammon et épilithon)." Lyon 1, 2005. http://www.theses.fr/2005LYO10059.
Full textAbstract:
En plus des caractéristiques "naturelles" du bassin versant, la physico-chimie du cours d'eau est influencés par des facteurs anthropogéniques émanant des diverses activités humaines. Ces facteurs peuvent provoquer la modification des caractères physiologiques des biocénoses. Les communautés périphytiques, assurant des fonctions essentielles au sein des cycles biogéochimiques, peuvent être de bons bioindicateurs de la qualité écologique d`un cours d'eau. L'étude a été menée sur trois rivières de statuts trophiques différents. Deux types de communautés microbiennes ont été considérées (celles des épilithons et épipsammons). Divers descripteurs ont été retenus : fonctionnels (activités enzymatiques extracellulaires, respiration, dénitrification) et de structures (masse organique, chlorophylle-a, densité et viabilité bactériennes). Ce travail montre qu'une typologie chimique marquée n'engendre pas nécessairement une typologie fonctionnelle notable des communautés microbiennes périphytiques. La discrimination biologique repose sur quelques descripteurs et varie suivant la saison.
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Hette, Tronquart Nicolas. "Organisation trophique des peuplements piscicoles des cours d'eau : approche par l'analyse des isotopes stables." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2012. http://www.theses.fr/2012MNHN0022.
Full textAbstract:
L'étude des réseaux trophiques est un prérequis à la compréhension du fonctionnement des écosystèmes. Cependant, les déterminants potentiels des réseaux trophiques (disponibilité des ressources, stabilité et taille de l'écosystème) restent discutés. Dans ce contexte, 3 nouvelles questions portant sur les réseaux trophiques des cours d'eau sont abordés par l'analyse des isotopes stables. Une première étude confirme le rôle structurant du gradient amont-aval dans le fonctionnement des cours d'eau, en précisant son in fluence directe et indirecte sur le réseau trophique piscicole. Une deuxième étude montre l'incidence négative de la variabilité du régime thermique des cours d'eau sur la longueur de chaîne trophique et apporte un nouveau soutien au déterminant "stabilité de l'écosystème". Enfin, une troisième étude explore les effets de l'occupation des sols à 2 échelles spatiales, et suggère une influence complexe jouant sur la diversité des ressources et des niveaux trophiques du réseau.
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Bocher, Pierrick. "Ecologie alimentaire et interactions prédateurs-proies au sein d'une communauté de pétrels planctonophages des Iles Kerguelen." La Rochelle, 2001. http://www.theses.fr/2001LAROS064.
Full textAbstract:
L'écologie alimentaire de cinq espèces de pétrels planctonophages (le Pétrel bleu, les Prions de Belcher et de la Désolation, les Pétrels plongeurs commun et de Géorgie du Sud) et d'une espèce de manchot (le Gorfou sauteur) a été étudiée durant trois saisons de reproduction successives (Programme Interactions Oiseaux-Zooplancton) aux îles Kerguelen dans le sud de l'Océan Indien. Quatre des espèces de pétrels se nourrissent principalement de crustacés (82%-100% de la masse alimentaire), ainsi que le Gorfou sauteur (69%), alors que le Pétrel bleu capture également des poissons mésopélagiques (57%). Les principales espèces de crustacés capturées sont l'amphipode Themisto gaudichaudii, les euphausiacés Thysanoessa sp. Et Euphausia vallentini, et les copépodes Paraeuchaeta antarctica et Calanoides acutus. Ces proies sont communes à plusieurs espèces d'oiseaux mais les individus prélevés sont le plus souvent de tailles différentes montrant une ségrégation alimentaire relativement importante au sein de la communauté. Les espèces sont ségrégées selon une composante horizontale avec des aires de nourrissage clairement distinctes et très localisées pour certaines espèces et selon une composante verticale en raison des différences morphologiques entre les pétrels de surface et les oiseaux plongeurs. La comparaison des régimes alimentaires avec les prélèvements zooplanctoniques réalisés sur une partie des zones d'alimentation supposées des oiseaux à permis de mettre en évidence une partie des interactions entre les oiseaux et deux de leurs principales proies: T. Gaudichaudii et P. Antarctica. Les informations sur la répartition des proies dans le milieu marin a également permis de préciser que les pétrels plongeurs et le gorfou sont des espèces côtières à néritiques, alors que le Pétrel bleu et les prions exploitent une plus large gamme de milieux allant des champ d'algues côtiers au eaux antarctiques où ils consomment du krill antarctique.
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Malet, Nathalie. "Écologie alimentaire de l'huître Crassostrea gigas : dynamique des compositions isotopiques naturelles." La Rochelle, 2005. http://www.theses.fr/2005LAROS143.
Full textAbstract:
Cette étude a consisté en la caractérisation du transfert trophique des sources de matière organique d'un écosystème littoral sous influence estuarienne chez l'huître creuse suspensivore Crassostrea gigas, composante majeure faunistique du bassin conchylicole de Marennes-Oléron. Les isotopes stables naturels du carbone et de l'azote ont été utilisés comme traceurs de la matière organique, des sources de production primaire et des transferts trophiques. Les processus d'incorporation de la nourriture ont permis l'interprétation dynamique des transferts trophiques, avec en particulier les taux de renouvellement tissulaire et les enrichissements trophiques pour cinq organes, les branchies, la glande digestive, le manteau, le muscle et les gonades. Selon les organes, les renouvellements isotopiques du carbone s'échelonnent entre un et quatre mois. Le taux de renouvellement isotopique de l'azote est trois à cinq fois plus rapide que celui du carbone. La variabilité spatio-temporelle de la contribution des sources (facteur extrinsèque) au régime alimentaire de l'huître et la gamétogenèse (facteur intrinsèque) influent conjointement sur les signaux isotopiques tissulaires de l'huître. La composition isotopique de l'huître corrigée de son enrichissement trophique permet alors de définir son régime alimentaire. La glande digestive dont le renouvellement est rapide informe sur la dynamique temporelle des sources de nourriture accessibles alors que le muscle qui intègre sur le long terme révèle leur dynamique spatiale en période de croissance. L'huître s'avère être un tropho-indicateur de la dynamique des environnements nutritionnels intertidaux sous influence estuarienne<br>This study investigated the characterization of the trophic transfer of the organic matter sources in an estuarine littoral ecosystem of the suspended-feeder oyster Crassostrea gigas: the Marennes-Oléron bay oyster farming area. Natural stable isotopes of carbon and nitrogen were used as tracers of organic matter, primary production sources and trophic transfers. The processes of food incorporation allow to interpret the trophic transfer dynamics, thanks to the turnover rate tissues and the trophic enrichments, for five organs such as the gills, the digestive gland, the mantel, the muscle and the gonads. For different organs, the isotopic turnover rate of carbon was between one and four months. The isotopic turnover rate of nitrogen is three to five times faster than of carbon. The spatial and temporal variability of the source contributions (extrinsic factor) to the oyster diet and the gametogenic cycle (intrinsic factor) jointly influenced the tissue isotopic signals. Then the isotopic composition of oyster corrected for its trophic enrichment allows to determine its diet. The faster turnover rate of the digestive gland gave information about the temporal dynamics of the available food sources, whereas the muscle which integrated on long term period during growth, revealed spatial dynamics. To conclude, this study demonstrated the role played by oyster as a tropho-indicator of the nutritional dynamics in estuarine intertidal environment
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Chaalal, Nadia. "Épidémiologie moléculaire des bactéries multi-résistantes isolées de la chaîne alimentaire en Algérie." Thesis, Montpellier, 2020. http://www.theses.fr/2020MONTT023.
Full textAbstract:
L’émergence des bactéries à Gram négatif (BGN) productrices de carbapénémases et/ou résistantes à la colistine, provoquée par la consommation irrationnelle de ces antibiotiques, est en forte augmentation. Les pressions politiques se multiplient à l’égard de ce problème et il est de plus en plus urgent de mettre en place des mesures pour empêcher la dissémination de ces bactéries multi-résistantes et/ou des éléments génétiques mobiles qu’elles contiennent à l’homme, l’animal et dans l’environnement, pouvant alors être responsable d’infections dont les options thérapeutiques sont particulièrement limitées. Certains antibiotiques utilisés comme dernier recours pour le traitement des infections à BGN en médecine humaine, sont également fortement utilisés chez les animaux d’élevage pour le traitement et la prévention des maladies bactériennes dues à ces BGN, mais également pour favoriser la croissance et augmenter la rentabilité et les revenus des éleveurs. Cet usage non régulé des antibiotiques n’est pas sans inconvénients, pouvant entraîner la dissémination des bactéries et/ou le transfert des éléments génétiques mobiles portant les résistances aux antibiotiques à l’homme. Récemment, des résistances aux β-lactamines, aux carbapénèmes et à la colistine ont été largement rapportées chez les animaux et les aliments d’origine animale destinés à la consommation humaine, parmi les bactéries pathogènes, les bactéries zoonotiques mais aussi les bactéries commensales. En Algérie, des pratiques peu judicieuses concernant l'achat des antibiotiques par des agriculteurs sans avis des vétérinaires ont conduit à leur utilisation inappropriée. Cette pratique semble être très répandue dans les élevages, en particulier chez les volailles où les antibiotiques sont utilisés à titre prophylactique, mais aussi comme facteur de croissance rendant le risque de contamination humaine majeur. Pour contrôler l'administration rationnelle de colistine et des carbapénèmes dans le traitement des maladies animales, préserver leur efficacité et diminuer le risque d'émergence d'une résistance à un des ces antibiotiques, il est essentiel de connaître l’épidémiologie actuelle des BGN résistants à ces antibiotiques. Ainsi, ce travail de Thèse s’inscrivait dans ces objectifs : i) Caractérisation moléculaire des entérobactéries résistantes aux carbapénèmes isolées de la viande de poulet dans l'ouest de l'Algérie (Chapitre I)ii)Caractérisation moléculaire d'entérobactéries résistantes à la colistine isolées dans la viande de poulet dans l'ouest de l'Algérie (Chapitre II)Une revue de la littérature (Chapitre II) sur le rôle des animaux et en particulier des animaux producteurs d'aliments comme réservoirs de la résistance à la colistine induite par les plasmides (mcr) a été utilisée comme introduction de ce manuscrit de thèse et a permis de comparer nos résultats avec ceux préalablement obtenus<br>The emergence of carbapenemase-producing Gram negative bacteria (GNB) and/or colistinresistant bacteria, due to the irrational use of these antibiotic, is on the rise. It is becoming an urgent priority for policy-makers, there is an emergency to tackle the problem by developing measures to prevent the large dissemination of multidrug-resistant (MDR) bacteria and/or their genetic mobile elements to human, animal and environment. This is of importance because of the few therapeutic options remaining active to treat infections caused by MDR organisms. In veterinary settings, some common antibiotics used inhuman infections are frequently consumpted in livestock for the treatment and prevention of bacterial diseases (dueto these GNB) but also as growth promotion and to increase the farmers’ profitability and income. This unregulated use of antibiotics is not without drawbacks, which can lead to the spread of MDR bacteria and/or the transfer of the mobile genetic elements bearing the antibiotic resistance to humans. Recently, resistance to b-lactams, carbapenems and colistin has been widely reported in animals and food of animal origin intended for human consumption, among pathogenic bacteria, zoonotic bacteria but also commensal bacteria. However, little is known about the dissemination of MDR strains in food producing animals In Algeria, unwise practices concerning the purchase of antibiotics by farmers without veterinary advice led to their inappropriate use. This practice seems to be widespread infarms, especially in poultry where antibiotics are used prophylactically, but also as a growth factor, inducing the risk of major human contamination. In this way, polymyxins are widely used and poultry was identified to be an important source of colistin resistance mediated by the new transferable plasmid (mcr) among commensal GNB. To control the rational administration of antibiotics in the treatment of animal diseases, to preserve their effectiveness and to reduce the risk of the emergence of colistin/carbapenem resistance, it is essential to know the current epidemiology of the resistance of GNB to these antibiotics.Thus, the different objectives of this thesis were:The molecular characterisation of carbapenem-resistant Enterobacterales isolated from chicken meat in Western Algeria (Chapter I), The molecular characterisation of colistin-resistant Enterobacterales isolated from chicken meat in Western Algeria (Chapter III). A review of the literature (Chapter II) on the role of animals and particularly food-producing animals as reservoirs of the colistin resistance mediated plasmid (mcr) was conducted as an introduction to this thesis manuscript and was allowed to compare our results with those previously obtained
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Rakotomalala, Christiane. "Modélisation des interactions trophiques entre les producteurs primaires microphytobenthiques et la coque commune (Cerastoderma edule) au sein d’un écosystème estuarien : la Baie des Veys, Normandie, France." Caen, 2016. http://www.theses.fr/2016CAEN2015.
Full textAbstract:
Les écosystèmes benthiques sont caractérisés par la complexité des interactions qui existent entre les divers composants du système. Dans cette étude, les interactions trophiques et non-trophiques entre la coque (Cerastoderma edule) et le microphytobenthos (MPB) ont été appréhendées par le biais de la modélisation. Le développement des coques a été analysé à l’aide d’un modèle écophysiologique. La reconstitution du signal trophique a mis en évidence qu’il était essentiel de prendre en compte la diversité alimentaire et que deux sources principales contribuaient au régime alimentaire des coques : le phytoplankton et le MPB. Un modèle de remise en suspension du MPB sous l’effet de la bioturbation des coques a également été développé. Les résultats montrent que la coque intervient significativement dans le processus de remise en suspension et que la biomasse de coques seule est suffisante pour déterminer la quantité de matière resuspendue. Une corrélation positive entre l’intensité de la remise en suspension et la taille des coques a également été observée. Enfin, un modèle de production primaire du MPB intégrant le processus de migration et la production d’EPS (substances exopolymériques) a été utilisé. Les résultats obtenus ont permis de valider le contrôle de la migration par le quota cellulaire interne C:N du MPB. Il a également été démontré que les nutriments peuvent être un facteur limitant la croissance du MPB et que la biodiffusion des nutriments par la faune permet de maintenir la production primaire microphytobenthique<br>Benthic ecosystems are characterised by complex interactions between their constituting compartments. In this study, the trophic and non-trophic interactions between cockle (Cerastoderma edule) and microphytobenthos (MPB) were analysed using modelling approaches. The cockle growth pattern was analysed with an ecophysiological model. Trophic signal reconstruction reinforced the need to integrate food diversity in the diet of cockle whose main components were seen to be phytoplankton and MPB. A model of MPB resuspension in the water column under the bioturbation by cockle was also set up. Results showed that the biomass of cockle significantly determines the amount of suspended material. Moreover, a positive correlation between the intensity of resuspension and the body size of cockles was found. Finally, a model of MPB primary production integrating migration processes and EPS production (Extracellular Polymeric Substances) was applied. Results validated the control of the migration by internal cellular C:N ratio of MPB. Moreover, nutrients could be a limiting factor for MPB growth, and the biodiffusion of nutrients by sediment fauna sustained the microphytobenthic primary production levels
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Bec, Alexandre. "Flux de matière dans le réseau trophique planctonique du lac d'Annecy : approche expérimentale et in situ par les acides gras marqueurs et leurs rapports isotopiques (ς13C)". Chambéry, 2003. http://www.theses.fr/2003CHAMS021.
Full textAbstract:
Ce travail est principalement consacré aux interactions trophiques qui s'établissent entre les organismes microbiens et les microcrustacés zooplanctoniques du lac d'Annecy. Des expériences de nutrition ont permis d'apprécier la qualité nutritionnelle des protistes hétérotrophes pour le zooplancton. Les teneurs en Acides Gras Polyinsaturés (AGPI) de la série (n-3) de la nourriture semble être le principal facteur déterminant sa valeur nutritive. Cette étude montre en outre que l'addition d'un flagellé algivore comme intermédiaire trophique dans la chaîne alimentaire microalgue-zooplancton favorise le développement de Daphnia hyalina. L'amélioration trophique de la qualité nutritionnelle par les protistes phagotrophes (trophic upgrading) serait principalement liée aux capacités biosynthétiques de ces derniers. L'approche en milieu naturel s'est principalement focalisée sur le transfert des AG entre les communautés microbiennes et les microcrustacés zooplanctoniques prélevés en zone pélagique de mars à septembre 2000. Afin de révéler l'association AG biomarqueur-groupe taxonomique, le matériel sestonique a été divisé en classes de taille par filtrations successives. L'évolution des teneurs en 20:5(n-3) dans les lipides de Daphnia hyalina a pu être corrélée positivement avec les variations de sa fécondité. Les cryptophycées et les diatomées centriques apparaissent comme les principales sources d'AGPI(n-3) pour le cladocère. Enfin, il a été envisagé de caractériser les AG par leur rapport isotopique ς13C afin d'évaluer l'intérêt de l'utilisation des rapports isotopiques ς13C d'AG individuels comme biomarqueurs des relations trophiques<br>This study is mostly dedicated to microorganisms-crustacean zooplankton trophic relationships occurring in Lake Annecy. Nutrition experiments were performed to evaluate food quality of heterotrophic protists for zooplankton. Food contents in (n-3) Polyunsaturated Fatty Acids (PUFA) seem to be the main factor determining food quality. Moreover this study shows that the addition of an algivorous flagellate as an intermediary trophic level in the microalga-zooplancton food chain enhance Daphnia hyalina development. Trophic upgrading of food quality may be surely associated to biosynthetic capacities of heterotrophic protists. The field study mainly focused on FA transfer between microbial communities and crustacean zooplankton sampled in the pelagic zone between march and september 2000. To facilitate the FA biomarker approach, seston has been fractionated in different size classes. The evolution of 20:5(n-3) contents in Daphnia hyalina lipids has been positively correlated to its fecundity. Cryptophytes and centric diatoms appears as the main sources in (n-3) PUFA for the cladoceran. Endly the reliability of fatty acids-specific stable isotope analysis (ς13C) for trophic studies has been assessed
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Janjua, Muhammad Yamin. "Studies on fish population structure, trophic interactions and management in lake Annecy." Chambéry, 2010. http://www.theses.fr/2010CHAMS025.
Full textAbstract:
The thesis focuses on different aspects of management and ecology of commercially important fish species in Lake Annecy: an oligotrophic lake situated in Rhône-Alpes region of France. The main objectives of the study were to evaluate the fisheries data, growth of whitefish and Arctic char in Lake Annecy, study the trophic interactions in food web and to propose a trophic model for the lake using Ecopath with Ecosim (EwE) software using data collected mostly during the last 10 years from commercial and recreational fisheries monitoring. Fish monitoring data was found to be effective for management purpose. Growth of whitefish was found to be fluctuating during last 20 years. Food resources appeared to be partitioned among the Lake Annecy fish community during summer possibly limiting competitive interactions. The results from Lake Annecy trophic analysis including showed that fishery in Lake Annecy is sustainable at the present exploitation rate. Few conclusions were proposed for the fisheries management based on the results.
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Faivre, Bruno. "Coexistence et écologie de deux espèces jumelles d'hippolais." Dijon, 1992. http://www.theses.fr/1992DIJOS014.
Full textAbstract:
Deux espèces jumelles d'oiseaux à distributions parapatriques: Hippolais icterina et H. Polyglotta ne coexistent que sur une étroite bande frontière (zone de sympatrie) passant par la Bourgogne ou les populations sont étudiées depuis une trentaine d'années. H. Icterina régresse alors que H. Polyglotta est en expansion à l'échelle européenne. Les niches écologiques des deux espèces diffèrent sur une dimension fondamentale, à savoir le régime alimentaire, ce qui rend peu probable l'action d'un mécanisme de type exclusion par compétition. Lorsqu'elles coexistent directement, les deux espèces se groupent en agrégats plus populeux que lorsqu'elles nichent seules et subissent plus d'échecs totaux des nichées qui sont largement attribuables à la prédation. Ce phénomène est nettement plus accusé chez H. Icterina car le comportement des adultes expose plus les nichées aux predateurs chez cette espèce que chez l'autre hippolais. La simulation de modèles mathématiques de compétition interspécifique et de prédation à deux proies et un predateur confirme la prépondérance possible de la prédation. Ainsi, la régression de H. Icterina en Bourgogne semble liée à la présence de l'espèce jumelle (comme s'il s'agissait d'une exclusion par compétition) mais fait intervenir la prédation. La généralisation de ce mécanisme à la situation de retrait de H. Icterina au niveau européen reste à démontrer mais semble possible. Bien au-delà, ces résultats soulignent l'importance de la prédation dans la structuration et l'évolution des communautés.
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Vollaire, Yan. "Les polluants organiques persistants dans une lagune méditerranéenne protégée (réserve de biosphère MAB-UNESCO) : approche écologique et écotoxicologique." Paris 11, 2007. http://www.theses.fr/2007PA112301.
Full textAbstract:
L’évaluation et la prédiction des effets des contaminants organiques est un enjeu essentiel pour limiter la perte de biodiversité et le renforcement des capacités de gestion des écosystèmes. Une des premières étapes de cette étude a été de vérifier le potentiel de la méthode des isotopes stables appliquée à un milieu anthropisé. Dans ce but, deux études sur la perche Perca fluviatilis, élevée en conditions et sous alimentation contrôlées, ont été réalisées. La première a permis de montrer que le facteur de fractionnement varie selon le type d’aliment consommé, la seconde que les signatures isotopiques ne sont pas affectées par la présence d’un contaminant organique dans l’alimentation. La méthode des isotopes stables, appliquée à un réseau trophique de l’étang de Vaccarès (Camargue, France), a permis d’observer la bioamplification de certains contaminants organiques. Elle concerne des molécules de Kow variés et parfois inférieurs à 5 (ex. Les pesticides). Dans le but de prévenir l’apparition de pathologies associées, la validation de biomarqueurs in situ a aussi été envisagée. Même si, l’activité de l’AChE chez l’anguille varie avec le degré d’exposition aux hydrocarbures aromatiques polycycliques, les indicateurs biochimiques évalués ont montré l’incohérence du principe de « biomarqueur universel ». A ces principaux objectifs, s’ajoute la compréhension du rôle des rizières dans la contamination du réseau trophique de l’étang de Vaccarès et l’utilisation de bivalves filtreurs, Corbicula fluminea, dans la surveillance de la qualité du milieu<br>The evaluation and the prediction of the ecotoxicological impact of the organic contaminants constitute essential stages to halt the biodiversity loss and to reinforce the capacities in management of ecosystems. In a first time, this present study aimed to check the potency of the stable isotopes methodology applied to an anthropized environment. Following this objective, two studies using the perch Perca fluviatilis, raised and fed under controlled conditions, were carried out. The first study showed the variation of the fractionation factor when the diet changed, the second showed that a food contamination, with an organic, pollutant had no effect on the discrimination factor in liver, gills and muscle of perch. The method of the stable isotopes, applied to a food web in the Vaccarès lagoon (Camargue, South of the France), allowed to characterise of a biomagnification process of some organic contaminants. The latter occurred for molecules of different Kow and sometimes for Kow lower than 5 (e. G. Pesticides). In the aim of preventing the appearance of associated pathologies, the validation of in situ biomarkers was often considered. Even if, the activity of the AChE in eel varied with the degree of exposure to polycyclic aromatic hydrocarbons, the evaluated biochemical indicators showed the inconsistency of the principle of “universal biomarker”. Finally, to these main objectives, was added the understanding of the role played by rice fields in the contamination of a food web in the Vaccarès lagoon, and the use of bivalve filters, Corbicula fluminea, in the monitoring of the water quality
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Perez, Gabriel. "Etude des relations entre les compartiments épigé et endogé dans un contexte dynamique." Rouen, 2012. http://www.theses.fr/2012ROUES008.
Full textAbstract:
L’objectif de ce travail de thèse est de contribuer à une meilleure compréhension du fonctionnement des écosystèmes et de leur dynamique en évaluant le rôle des interactions entre les compartiments épigé et endogé. Le passage des stades de végétation herbacés aux stades boisés apparait comme une étape importante de la dynamique du compartiment endogé. Les premiers résultats montrent une augmentation progressive de l’abondance, la biomasse et de la richesse des communautés endogés au cours de la succession. Ces changements sont liés à une modification de la qualité des intrants en débris végétaux dans le sol, via les racines ou la litière. Les résultats du troisième chapitre supportent cela, avec une contribution significative de la litière et des racines dans l’approvisionnement en ressource azotée au sein des réseaux trophiques du sol. Cependant, nos résultats ne témoignent pas d’une spécialisation de la chaine des décomposeurs dans la décomposition des intrants produits au-dessus d’eux, précisément la litière. En effet, quel que soit le stade de végétation considéré, la performance du système pour dégrader la litière est en moyenne identique face à différentes qualités d’intrants. Néanmoins, il s’est avéré que l’impact de la mésofaune sur la décomposition et les interactions qu’elle entretient avec la microflore et la microfaune est de plus en plus important au cours de la dynamique de succession. En accord avec d’autres études, nos résultats montrent que la structure trophique des organismes édaphiques altère la croissance, la dominance, ou l’expression des plantes, certainement par une modification de la remise à disposition d’éléments nutritifs pour celles-ci.
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Ferraton, Franck. "Ecologie trophique des juvéniles de merlu (Merluccius merluccius) dans le golfe du Lion : implications biologiques de la variabilité spatio-temporelle des ressources alimentaires exploitées dans les zones de nourricerie." Montpellier 2, 2007. http://www.theses.fr/2007MON20223.
Full text
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David, Valérie. "Dynamique spatio-temporelle du zooplancton dans l'estuaire de la Gironde et implications au sein du réseau trophique planctonique." Bordeaux 1, 2006. http://www.theses.fr/2006BOR13173.
Full textAbstract:
L'objectif de cette thèse est de définir le fonctionnement du réseau trophique planctonique dans l'estuaire de la Gironde. Cette étude caractérise dans un premier temps la variabilité spatio-temporelle du zooplancton pour trois échelles de temps - inter-annuelle, saisonnière et tidale - afin de définir la co-distribution des principales espèces dans l'espace et dans le temps. Sur la base de ces résultats, des suivis ciblés ont été réalisés afin de décrire le réseau trophique planctonique à l'aide de marqueurs trophiques, d'expérimentations proies-prédateurs (conditions contrôlées / in situ simulées) et d'un modèle proies-prédateurs de type Lotka-Voltera.
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Barbier, Pierrick. "Déterminisme du recrutement des bivalves sous contraintes environnementales et anthropiques." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2016. http://www.theses.fr/2016MNHN0001.
Full textAbstract:
L'objectif de cette thèse est d'analyser le déterminisme du recrutement des bivalves de milieux côtiers tempérés à travers la fonction de nurserie des habitats benthiques, les contraintes liées à la mytiliculture et à la pêche à pied récréative et les variations qualitatives et quantitatives des ressources trophiques disponibles. Les bivalves juvéniles des habitats benthiques structurés par des espèces ingénieurs ont une meilleure condition physiologique, bien qu'ils s'alimentent sur la même ressource trophique. Alors que la mytiliculture sur bouchots augmente localement l'hétérogénéité des assemblages de recrues de bivalves, la pratique du ratissage impacte négativement la fixation primaire de ces organismes. Mes travaux révèlent notamment l'importance des processus de post-fixation. Enfin, le déclenchement de la phase de fixation/métamorphose des bivalves est marqué dans l'environnement par une modification de la composition en acides gras de la matière organique particulaire indiquant l'apparition de picoeucaryotes planctoniques<br>The objective of this thesis is to analyze the determinism of the bivalve recruitment in a temperate coastal environment through the nursery function of benthic habitats, anthropogenic constraints of mussel farming and recreational hand-raking fishing, and the qualitative and quantitative variations of the available trophic resources. Juveniles of bivalve from benthic habitats structured by engineer species have better physiological condition, although they feed on the same trophic resource. While the mussel farming locally increases the heterogeneity of bivalve recruits assemblage, the practice of raking negatively impacts the primary fixation of these organisms. My work reveals the particular importance of post-fixation process. Finally, the triggering of the settlement phase is marked in the environment by changing the fatty acid composition of the particulate organic matter indicating the occurence of planktonic picoeukaryotes
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Rigolet, Corinne. "Diversité structurelle et fonctionnelle des peuplements sablo-vaseux de Bretagne sud : impact de l'expansion d'Haploops nirae." Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066180.
Full textAbstract:
Ce travail de thèse a pour objectif, en s’appuyant sur le cas de la baie de Concarneau, de comprendre l’impact du développement de denses populations de l’amphipode tubicole Haploops nirae sur la diversité structurelle et fonctionnelle des peuplements sablo-vaseux de Bretagne Sud. L’étude des peuplements à Haploops dans ce projet de thèse se décline selon plusieurs niveaux d’organisation du vivant, du rôle spécifique d’Haploops nirae jusqu’au rôle fonctionnel du peuplement au sein de l’écosystème en passant par la description de la composition spécifique du peuplement et de son rôle sur la biodiversité en général. Nos résultats suggèrent dans un premier temps que le rôle fonctionnel de l’espèce seule (pression de filtration, production secondaire) est potentiellement important. De plus, les modifications physiques de l’habitat par les Haploops se sont révélées avoir des conséquences très importantes sur la composition des peuplements et la diversité spécifique. A contrario, l’étude de la diversité fonctionnelle abordée par l’analyse des traits biologiques (BTA) et la production secondaire des peuplements révèle que les conséquences fonctionnelles de la présence des Haploops dans un écosystème sont dans l’ensemble faibles. De la même façon, l’étude du fonctionnement trophique des peuplements benthiques de la baie de Concarneau (grâce à l’utilisation des isotopes stables) révèle une faible incidence fonctionnelle du développement des Haploops sur la structure du réseau trophique benthique. Bien que les peuplements à Haploops ne soient pas caractérisés par de profonds changements fonctionnels, les flux trophiques vers les niveaux trophiques supérieurs sont cependant vraisemblablement affectés par la présence des Haploops<br>This thesis aims here, based on the case of the Bay of Concarneau, to understand the impact of the development of dense populations of the tubiculous amphipod Haploops nirae on the structural and functional diversity of sandy-mud communities of South Brittany. The study of Haploops communities was developed on various levels of organization of life, from the specific role of Haploops nirae to functional role of Haploops community in the ecosystem passing through the description of the community composition and its role on the biodiversity. Our results suggest firstly that the functional role of Haploops nirae alone (filtration pressure, secondary production) is potentially important. Moreover, the physical changes induced by Haploops were found to have important consequences on the composition of species assemblages and species diversity. In contrast, the study of the functional diversity addressed by biological traits analysis (BTA) and secondary production at the community scale reveals that the functional consequences of Haploops occupation in an ecosystem are generally low. In addition, the analysis of the trophic functioning of benthic communities from the Bay of Concarneau (through the use of stable isotopes) showed low incidence of Haploops occupation on the functioning of the benthic food web. Although Haploops communities are not characterized by profound functional changes, trophic flows to higher trophic levels, however, are likely to be affected by the presence of Haploops
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Garnier-Laplace, Jacqueline. "Etude des mécanismes de transfert de l'argent 110-m en eau douce : conception et exploitation d'un modèle expérimental d'écosystème et d'un modèle mathématique de simulation de la distribution du radioélément au sein d'une chaîne trophique." Montpellier 2, 1990. http://www.theses.fr/1990MON20225.
Full textAbstract:
Le transfert et la retention de l'ag-110m sont quantifies a partir d'etudes en laboratoire conduites sur un ecosysteme experimental comportant 2 unites abiotiques, eau et sediment, et 4 niveaux trophiques: producteur primaire (scenedesmus obliquus), consommateurs de premier ordre (daphnia magna, gammarus pulex, chironomus sp. ), consommateur de deuxieme ordre (cyprinus carpio) et consommateur de trosieme ordre (salmo trutta). La demarche adoptee consiste a traduire chaque transfert par une equation mathematique dont la formulation est basee sur une analyse theorique. Les parametres de ces equations sont cales a partir de l'experience pour chaque unite de la chaine trophique. L'ensemble des resultats relatifs a l'accumulation souligne l'importance qu'il faut accorder a l'ag-110m en raison des valeurs tres elevees des parametres radioecologiques calcules. Sur la base des resultats obtenus, un modele mathematique deterministe de simulation de la distribution du radioelement dans la chaine trophique en fonction du mode de contamination (chronique ou aigu) a ete concu. Il rend compte de l'evolution temporelle des valeurs moyennes des concentrations en ag-110m pour chaque niveau trophique. Afin d'etre connecte aux realites de terrain, des parametres ecologiques essentiels ont ete integres au modele. Les premieres approches fondees sur l'analyse des constats in situ se rapportant a des ecosystemes soumis a des rejets chroniques (rhone) ou aigus (suites de l'accident de tchernobyl), conferent au modele une importante valeur explicative et de prediction globale. L'age des poissons, leurs habitudes alimentaires en fonction des saisons et leur position au sein de la chaine trophique, sont apparus comme des parametres essentiels. Dans tous les cas, la voie trophique est nettement predominante pour les deux especes de poissons et explique la remanence de l'accumulation d'autant plus longue que le poisson
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Robledo, Gonzalo. "Quelques résultats sur la commande du chemostat." Phd thesis, Université de Nice Sophia-Antipolis, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00069800.
Full textAbstract:
Cette thèse s'attache à la commande de certains systèmes écologiques en chemostat (appareil de culture de micro--organismes en laboratoire). Nous commençons par un aperçu des modèles de compétition et de chaîne trophique dans le chemostat ainsi qu'un rappel des concepts basiques de la théorie de la commande adaptée aux équations du chemostat. Ceci nous permet de montrer quelques applications pratiques et aussi de mettre en évidence la complexité mathématique de la commande.<br /><br />La première partie considère la commande robuste d'un chemostat simple qui présente des imprécisions déterministes tant dans le modèle que dans la sortie, ainsi que des retards dans la sortie. Nous construisons une famille de boucles de rétroaction qui stabilise le modèle dans un polytope déterminé<br />par la grandeur des imprécisions. Cette famille stabilise aussi la sortie autour d'une consigne en présence des retards, mais en l'absence d'imprécision<br />sur le modèle et la sortie.<br /><br />La deuxième partie considère la commande en boucle<br />fermée d'un modèle de compétition entre espèces<br />qui permet la coexistence de celles--ci. Nous généralisons un résultat proposé par P. De Leenher et H.Smith dans deux directions: considération de fonctions de croissance plus générales et prise en compte de la mortalité des espèces.<br /><br />La troisième partie considère la commande en boucle ouverte d'une chaîne trophique dans un chemostat. Nous présentons une méthode de réduction de dimension qui permet de caractériser l'ensemble d'atteignabilité du système et d'obtenir un <br />résultat sur la commandabilité partielle de la chaîne.
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Crespin, de Billy Véronique de. "Régime alimentaire de la truite (Salmo trutta L. ) en eaux courantes : rôles de l'habitat physique et des traits des macroinvertébrés." Lyon 1, 2001. http://www.theses.fr/2001LYO10173.
Full textAbstract:
Comprendre les fluctations d'abondance de la truite (Salmo trutta L. ) nécessite de déterminer les facteurs limitant sa production. Par exemple, la modification de l'habitat peut altérer la survie de cette espèce et modifier la disponibilité (abondance) et la qualité (vulnérabilité) des ressources trophiques. Dans ce contexte, j'ai étudié comment les caractéristiques des habitats et des proies (invertébrés aquatiques et terrestres) modifient les régimes alimentaires des truites. J'ai collecté des données de benthos, dérive et contenus stomacaux de truites, dans trois tronçons de cours d'eau des Pyrénées dont deux soumis à un débit réservé. Les résultats montrent que si la quantité de proies consommées varie à large échelle (tronçon: 10 au cube par m ), la composition des régimes change en fonction des conditions locales du milieu (macro-habitat: 10 au carré par m). Pour comprendre ces variations, j'ai analysé la vulnérabilité potentielle des proies face à un prédateur, en cochant leurs traits écologiques, comportementaux et morphologiques. J'ai ainsi observé que 1) les traits des proies potentielles (invertébrés benthiques) varient essentiellement avec les paramètres hydrauliques, et la quantité des ressources trophiques tend à augmenter avec la vitesse du courant ; 2) malgré les différences de régimes observées entre les habitats, la truite sélectionne les proies les plus vulnérables (ex : exposées au courants, mobiles, flexibles, tailles entre 8 et 16 mm); et 3) le rôle des traits des proies sur les régimes augment avec la diminution des caractéristiques torrentielles du milieu. Ainsi, l'utilisation des traits codant la vulnérabilité potentielle des proies est pertinente dans la compréhension des régimes alimentaires des truites, notamment dans les milieux aux faibles contraintes hydrauliques (débits réservés). Dans le cadre de l'évaluation de la qualité des milieux, ceux-çi devraient constituer un véritable complément aux outils de gestion déjà existants.
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Mensens, Christoph. "Biodiversity and ecosystem functioning in stressed environments : primary producers and consumers at the basis of marine food webs." Thesis, Paris 6, 2016. http://www.theses.fr/2016PA066736/document.
Full textAbstract:
La biodiversité est de plus en plus modifiée par les activités humaines, ce qui a conduit à des recherches considérables sur l'effet de la biodiversité sur le fonctionnement des écosystèmes. Ces recherches ont cependant rarement inclu le stress anthropogénique qui cause la perte de biodiversité. Cette thèse analyse l'impact du stress (pesticides et métaux lourds) sur la relation entre la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes à la base de la chaîne alimentaire marine, avec des producteurs marins primaires (diatomées) et leurs principaux consommateurs (copépodes). Le premier résultat est que la pollution chimique altère la régularité plutôt que la richesse des espèces, avec un effet disproportionné sur le fonctionnement si un stress sélectif provoque la domination par des espèces tolérantes avec une faible contribution fonctionnelle. L'effet du stress sur le fonctionnement est prévisible sur la base d'une corrélation des traits biologiques prédisant l'abondance des espèces et des traits prédisant leur effet sur le fonctionnement. L'effet de la biodiversité sur le fonctionnement augmente sous l'effet du stress dû à une augmentation d'interactions facilitatrices entre les espèces (effet de complémentarité). L'effet du stress sur la qualité alimentaire des producteurs primaires réduit le transfert d'énergie au niveau des consommateurs, soulignant la pertinence du changement de biodiversité dans un contexte trophique. La thèse se termine par un cadre synthétique présentant les trois principaux effets (stress sélectif, stress physiologique, complémentarité) déterminant l'effet du stress sur la relation entre la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes<br>Biodiversity is increasingly altered by human activities, which has led to considerable research on the consequences of biodiversity loss for ecosystem functioning. The anthropogenic stressors driving the ongoing biodiversity loss are however rarely included into biodiversity-ecosystem functioning experiments. The present thesis analyses the impact of anthropogenic stressors (pesticides, heavy metals) on the biodiversity-ecosystem functioning relation in marine primary producers (diatoms) and consumers (copepods). It was shown that chemical stress alters species evenness rather richness, with a disproportionate effect on functioning if stress causes dominance by tolerant species with a low functional contribution. Stress tolerance and the functional contribution were predictable based on the species’ biological traits, and the effects of stress on ecosystem functioning depended on the correlation of traits predicting species abundance and traits predicting the species’ effect on ecosystem functioning. The biodiversity effect on primary producer biomass production increased under stress due to facilitative interactions (complementarity effect). Stressor-induced biodiversity loss reduced the food quality of primary producers and impaired the energy transfer to the consumer level, highlighting the relevance of stressor-induced biodiversity changers in a trophic context. The thesis ends with a synthetic framework which puts forward the three main effects (selective stress, physiological stress, complementarity) through which anthropogenic stress affects biodiversity-ecosystem functioning relations at the basis of marine food webs
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Neury, Julie. "Impact de la saisonnalité et d'une contamination pesticide environnementale sur des relations biotiques entre la micro-méiofaune et les microalgues d'un biofilm d'eau douce." Thesis, Bordeaux, 2019. http://www.theses.fr/2019BORD0343.
Full textAbstract:
Les pollutions chimiques sont des facteurs de stress pour le milieu aquatique qui est le réceptale final des microcontaminants (pesticides, médicaments, métaux). Le biofilm est un microécosystème aquatique dans lequel interagissent des microorganismes aux cycles de vie très court (bactéries, champignons, microalgues, micro-méiofaune) sur un substrat. Certains facteurs saisonniers (lumière, température) ou liés à l’anthropisation (substances dissoutes dont les polluants toxiques) modifient la composition de microalgues, et impactent également les cycles biologiques de la micro-méiofaune. Ces déterminants environnementaux façonnent diversement les communautés périphytiques au long de l'année, directement et indirectement au sein du réseau complexe d'interactions entre les espèces. Le déséquilibre potentiel entre les composantes susceptibles d'être impactées par des polluants (organismes cibles et non cibles) peut menacer la stabilité structurale et fonctionnelle des biofilms. Dans ces travaux de thèse nous avons étudié les effets de l’imidaclopride (insecticide) et du diuron (herbicide) sur les relations biotiques maintenues entre les microalgues et la micro-méiofaune des biofilms. Ces deux pesticides sont régulièrement détectés dans les rivières françaises. Des tests écotoxicologiques à des concentrations environnementales (5µg.L-1) ont d’abord été réalisés sur des populations monoespèces et des combinaisons de populations de micro-méiofaune (nématodes, chirnomes) et de microalgues benthiques (diatomées, algues vertes). La combinaison de stress biotique et chimique a un effet non négligeable sur les individus de notre étude, qu’ils soient producteurs primaires ou consommateurs. En combinant les impacts d’un herbicide et d’un insecticide sur une relation trophique, on peut estimer comment les effets directs de ces pesticides sur leur cible, peuvent indirectement, par le jeu des relations biotiques, affecter les individus des chaînons trophiques supérieurs et inférieurs. De manière à ne pas écarter l’influence structurante des relations trophiques, nous avons abordé la question de variabilité de la communauté périphytique par l’approche des traits morphofonctionnels liés à l’activité trophique. Pour ce faire, une base de données regroupant les traits morphofonctionnels de la micro-méiofaune a été créée, basée sur le modèle de la base des macroinvertébrés d’eau douce d’Usseglio-Polatera et al. (2000). Les conditions abiotiques qui définissent un habitat varient selon la saisonnalité. Des communautés périphytiques ont été soumises aux variations saisonnières puis à une contamination pesticide. Nos résultats ont démontré que les conditions abiotiques et biotiques saisonnières ont un impact plus fort sur la fonctionnalité du biofilm que la contamination pesticide aux concentrations testées. Les traits morphofonctionnels de la micro-méiofaune évoluent selon les conditions abiotiques saisonnières. En cas de contamination pesticide, le peu d’impact mesuré peut s’expliquer par la redondance des traits morphofonctionnels des espèces de la micro-méiofaune sélectionnées par la pression chimique. Ces travaux de thèse confirment l’importance de la complémentarité des échelles d’étude et des combinaisons de facteurs biotiques et abiotiques dans la recherche en écologie et écotoxicologie<br>Chemical pollutions are stress factors for aquatic environment, the final receptor of microcontaminants (pesticides, medications, metals). Biofilm is an aquatic microecosystem in which short lifecycle microorganisms interact (bacteria, fungi, microalgae, micro-meiofauna) on a substrate. Seasonal (light, temperature) or anthropogenic factors (dissolved substances such as toxic pollutants) modify microalgae composition and also impact biological micro-meiofauna cycles. These environmental determinants diversely buid periphytic community all along the year, directly and indirectly in the complex species interaction network. Potential imbalance between biofilm components likely to be impacted by pollutants (target and non-target organisms) can threat structural and functional biofilm stability. In these thesis works, we studied imidacloprid (insecticide) and diuron (herbicide) effect on biotic relation maintained among periphytic microalgae and micro-meiofauna. These two pesticides are regularly detected in French rivers. Ecotoxicological tests at environmental concentration (5µg.L-1) were firstly realized on monospecies populations and then, on combinations of benthic micro-meiofauna (nematodes, chironomids) and microalgae (diatoms, chlorophyts). Biotic and chemical stress combination showed non-negligible effects on studied species, primary producers or consumers. By combining herbicide and insecticide impact on trophic relation, we can estimate how direct target pesticide effects, indirectly affect other inferior or superior trophic levels. To take in account the structuring influence of trophic relation, we discussed about periphytic community variability via the morphofunctional trophic activity traits approach. Micro-meiofauna morphofunctional traits database was created following Usseglio-Polatera et al. (2000) works on freshwater macroinvertebrates. Abiotic conditions which defined a habitat vary with season. Periphytic communities were submitted to seasonal variations and pesticide contamination. Results demonstrated that abiotic and biotic seasonal conditions have a bigger impact on biofilm functionality than pesticide contamination at tested concentrations. In case of pesticide contamination, little measured impacts can be explained by morphofunctional traits redundancy of micro-meiofauna species selected by chemical pressure. These thesis works highlight the importance of studied scales complementarity and biotic and abiotic factors combination in ecology and ecotoxicology research
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Vaslet, Amandine. "Ichtyofaune des mangroves des Antilles : influence des variables du milieu et approche isotopique des réseaux trophiques." Antilles-Guyane, 2009. http://www.theses.fr/2009AGUY0262.
Full textAbstract:
Les communautes ichtyologiques ont ete etudiees dans 38 stations de mangrove bordant les baies du grand cul-de-sac marin (gcsm) et du petit cul-de-sac marin en guadeloupe. Au total, 119 espèces de poissons ont pu être identifiées dont 40 présentent un intérêt commercial. Près de 70 % des effectifs de poissons observés en mangrove sont représentés par des juvéniles. Des analyses canoniques des correspondances ont révélé que, dans les deux baies de mangrove, les espèces sont influencées par la proximité des récifs ou des rivières, par la transparence de l'eau et par l'étendue des mangroves. Un gradient environnemental « côte-large» a pu être observé dans le lagon du gcsm et a permis de distinguer les îlets de mangrove, caractérisés par la présence d'espèces récifales et d'herbiers, des sites proches de rivières composés d'espèces inféodées aux mangroves. En saison des pluies, les apports d'eaux douces issus des précipitations renforcent un gradient terrigène qui va être à l'origine du remplacement des espèces récifales par des espèces de mangrove tolérant des eaux dessalées et turbides. Les analyses des isotopes stables du carbone (13c:12c) et de l'azote (15n:14n) ont permis de déterminer l'importance des mangroves comme zones d'alimentation pour l'ichtyofaune. Les rapports isotopiques en carbone des proies de mangrove sont plus appauvris en 13c par rapport à celles des herbiers. Ces signatures isotopiques ont ainsi permis de différencier trois groupes d'espèces en fonction de l'origine des sources de carbone consommées: celles qui s'alimentent dans les herbiers, celles qui consomment des proies présentes en mangrove et celles qui s'alimentent dans les deux ecosystemes<br>Fish communities were studied in 38 mangrove sites bordering the bays of grand cul-de-sac marin (gcsm) and petit cul-de-sac marin in guadeloupe. Out of a total of 119 fish species, 42 species are of commercial interest. Juveniles represent around 70 % of fish totalabundance in mangroves. Canonical correspondence analyses revealed that, in the two mangrove bays, fishes were influenced by reef or river mouth proximities, water transparency and the extent of mangrove areas. In the gcsm, an environmental gradient from the coast seawards was observed. This gradient separated reef and seagrass beds species of mangrove islets. Located near the barrier reef, to mangrove resident fish species located in the close vicinity of river and channel mouths. During the wet season, important rainfall and fresh water runoffs created a terrestrial gradient influencing the replacement of reef species by mangrove species, more tolerant to turbid and less salty waters. Stable isotopes analyses of carbon (13c:12c) and nitrogen (15n:14n) enabled to determine the importance of mangrove habitat as fish feeding grounds. Carbon isotopic ratios of mangrove preys were more depleted compared to preys from seagrass beds. These isotopic signatures enabled the differentiation of three groups of fish species: species that consume preys from seagrass beds, species feeding in mangroves and species feeding in both ecosystems
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Lobry, Jérémy. "Quel référentiel de fonctionnement pour les écosystèmes estuariens ? : le cas des cortèges de poissons fréquentant l'estuaire de la Gironde." Bordeaux 1, 2004. http://www.theses.fr/2004BOR12890.
Full textAbstract:
Afin de mieux appréhender la complexité des écosystèmes estuariens, cette thèse pose la question de la construction d'un référentiel de fonctionnement de ces écosystèmes sous contraintes diverses. Nous avons choisi les cortèges de poissons fréquentant l'estuaire de la Gironde comme cas d'étude. Ce travail met en exergue, d'après des données d'échantillonnages traitées par analyses multivariées, un fonctionnement des assemblages basé sur une dynamique saisonnière claire, une structuration aval-amont forte et une opposition nette entre espèces de surface caractéristiques des mois chauds et espèces de fond représentatives des mois froids. Il existe un couplage benthos/pelagos probablement déterminé, en partie, par la disponibilité des ressources trophiques. La structure trophique globale de l'écosystème estuarien est alors caractérisée via le modèle ECOPATH. A l'état stable et à l'échelle annuelle, la capacité trophique du système ne semble pas limitée mais elle pourrait l'être à certaines périodes de l'année. La majorité des flux sont issus du compartiment détritique. Ainsi, malgré une production primaire faible, l'écosystème reste très productif et supporte d'importants stocks de poissons. Comme la plupart des écosystèmes de même type, la Gironde renvoie une image de stabilité dynamique, d'optimisation des ressources et de haute adaptation aux contraintes du milieu.
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Jouve, André. "Flux des radionucléides dans les productions agricoles suites à un accident nucléaire : contre-mesures et techniques de réhabilitation." Aix-Marseille 1, 1996. http://www.theses.fr/1996AIX11069.
Full textAbstract:
Cette these traite des consequences radiologiques d'un accident nucleaire par la contamination radioactive de la chaine alimentaire et des moyens a mettre en uvre pour reduire les flux de radionucleides ou decontaminer les terrains agricoles. Apres un bref rappel du contexte et des concepts de radioprotection qui s'appliquent au cas des accidents nucleaires, ce travail recense les donnees actuelles sur les mecanismes de flux des radionucleides dans les sols et du sol vers les plantes. Le travail de recherche de cette these porte a la fois sur la prediction des flux de radionucleides et sur les remedes possibles: la mesure de la disponibilite des radionucleides dans la solution du sol, son utilisation dans une formulation mathematique quantifiant le transfert sol-plante du cesium et du strontium, et les perspectives offertes par une technique innovante de decontamination des sols. Les resultats obtenus montrent qu'il est possible de prevoir a 30% pres, la contamination d'une culture sur la base de 4 parametres: le coefficient de distribution des radionucleides entre le sol et la solution du sol kd, la teneur du sol en analogues chimiques du cesium et du strontium que sont, respectivement, le potassium et le calcium, le ph du sol et une constante caracteristique de l'espece vegetale consideree. Cependant, il ressort en general des etudes de transfert sols plante que la reduction des flux de radionucleides n'est pas une voie tres prometteuse de diminution de l'exposition radiologique en cas d'accident nucleaire. Le travail realise montre qu'il est plus efficace de s'attaquer a la source de contamination des plantes, c'est a dire decontaminer les sols. La technique proposee de decapage des sols a l'aide d'une deplaqueuse a gazon se presente comme la plus avantageuse des techniques etudiees pour une application a la decontamination des prairies de tourbieres
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Coat, Sophie. "Identification du réseau trophique de rivière et étude de sa contamination par les pesticides organochlorés (chlordécone et bêta-HCH)en Guadeloupe." Antilles-Guyane, 2009. http://www.theses.fr/2009AGUY0260.
Full textAbstract:
Ce travail étudie la pollution des rivières de Guadeloupe par les pesticides organochlorés anciennement utilisés sur les bananeraies: la chlordécone et le β3-HCH. Les objectifs sont 1) d'identifier le réseau trophique présent en aval de rivière, 2) d'évaluer la contamination de maillons qui le composent et 3) d'appréhender la dynamique des pesticides dans l'écosystème d'eau douce. L'analyse des isotopes stables du carbone et de l'azote, couplée aux données alimentaires issues de la littérature, a permis de déterminer les relations trophiques entre espèces et de montrer que le réseau alimentaire dépendait à la fois des sources de carbone primaires autochtones (algues et biofilm) et des apports allochtones des milieux terrestres et marins (détritus végétaux, matière particulaire et juvéniles de crevettes et de poissons diadromes provenant des eaux côtières). Les analyses chimiques ont témoigné d'une contamination forte et généralisée de l'écosystème aquatique par les pesticides organochlorés. L'identification des facteurs écologiques influant sur la bioaccumulation des pesticides a permis d'apprécier le mode d'interaction de ces polluants avec la biocénose. Alors que le polluant le plus persistant (la chlordécone) dépend de l'alimentation et de l'habitat des organismes aquatiques, la bioaccumulation du β3-HCH n'est influencée que par le taux de lipides de ces derniers. La mise en évidence d'une bioamplification de la chlordécone le long de la chaîne alimentaire a montré l'importance du transfert trophique dans l'accumulation de cette molécule. La voie d'entrée du β3-HCH dans la biocénose semble, quant à elle, être la bioconcentration par diffusion passive à partir de l'eau<br>This study examines the contamination of Guadeloupean rivers by organochlorinated pesticides, formerly used on banana plantations: chlordecone and β3-HCH. Its objectives are 1) to identify the downstream food web structure, 2) to evaluate the contamination levels of it~ various components and 3) to appreciate pesticide dynamics within the freshwater ecosystem. Stable carbon and nitrogen isotopes analysis, coupled with dietary data from Iiterature, helped investigate trophic relationships between species and revealed the dependenc of the stream food web on both autochthonous (algae and biofilm) and allochthonous food sources of terrestrial and marine origin (plant detritus, drifting particulate matter and juveniles of diadromous fishes and shrimps from coastal waters). Chemical analyses showed a general and heavy contamination of the aquatic ecosystem by organochlorinated pesticides. An assessment of the interaction patterns between contaminants and biota was conducted thanks to the identification of ecological factors that influence the bioaccumulation of pesticides. Whereas the most persistent pollutant (chlordecone) is related to the organisms' diet and habitat, bioaccumulation of β3-HCH i only influenced by the animais' Iipid content. The biomagnification potential of chlordecone through the food chain has been demonstrate and highlighted the importance of trophic transfer in this compound uptake. In contrast, bioconcentration by passive diffusion from water seems to be the main exposure route of β3-HCH in biota
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Vallières, Catherine. "Production bactérienne et structure du réseau alimentaire microbien dans le fleuve Mackenzie et l'océan Arctique côtier." Thesis, Université Laval, 2007. http://www.theses.ulaval.ca/2007/24315/24315.pdf.
Full textAbstract:
Les pergélisols nordiques contiennent une quantité significative de carbone organique. Or, son utilisation par les microorganismes dans les rivières et l’océan Arctique est peu connue. Au cours de l’Arctic River-Delta Experiment (ARDEX), des variables environnementales et microbiologiques furent mesurées le long d’un transect de 300 km entre le fleuve Mackenzie et la mer de Beaufort (juillet-août 2004). Nous voulions étudier les gradients fluviaux et estuariens de la structure et de l’activité de la communauté microbienne et évaluer l’influence des UV et de l’approvisionnement en carbone sur les processus bactériens. La communauté microbienne a changé le long du transect et les bactéries attachées aux particules jouaient un rôle majeur dans le fleuve et la zone de transition. Le métabolisme bactérien était limité par la disponibilité du carbone dans le fleuve Mackenzie. La photodégradation a augmenté la labilité du carbone organique dans le fleuve, mais l’a diminuée dans la mer de Beaufort.<br>Globally significant quantities of organic carbon are stored in northern permafrost soils, but little is known about how this carbon is processed by microbial communities once it enters rivers and is transported to the coastal Arctic Ocean. As part of the Arctic River-Delta Experiment (ARDEX), we measured environmental and microbiological variables along a 300 km transect across the Mackenzie River and coastal Beaufort Sea in July-August 2004 to investigate the river and estuarine gradients in microbial community structure and activity, and to evaluate the influence of UV exposure and carbon supply on bacterial processes in these ecosystems. Microbial community structure changed along the transect and the contribution of particle-attached bacteria was significantly higher in riverine and transition zone stations. Experimental results showed that bacterial metabolism was carbon limited in the Mackenzie River. Photodegradation increased organic carbon biolability in the Mackenzie River and decreased it in the Beaufort Sea.<br>Inscrite au Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures
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Quessada, Jean. "Aspects lipidiques des développements embryonnaires et larvaires du loup, Dicentrarchus labrax, du sar, Diplodus sargus, et de la daurade, Sparus auratus, en relation avec les réserves endogènes et les conditions trophiques." Montpellier 2, 1987. http://www.theses.fr/1987MON20186.
Full textAbstract:
Un des problemes majeurs lies a l'elevage des poissons marins demeure la nutrition larvaire. Aussi le present travail est-il axe sur la periode lecithotrophe du developpement des poissons et sur la chaine trophique phytoplancton-zoo-plancton-larves. Les aspects lipidiques ont ete plus particulierement abordes en raison du role primordial des lipides et des acides gras en matiere de nutrition des poissons
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Scheifler, Renaud. "Evaluation de la biodisponibilité et des transferts de polluants métalliques et organiques dans les réseaux trophiques "sols-plantes-invertébrés"." Besançon, 2002. http://www.theses.fr/2002BESA2022.
Full textAbstract:
Les transferts d'éléments en trace métalliques et de polluants organiques au sein des chaînes alimentaires constituent une des conséquences possibles de la pollution des écosystèmes. L'objectif général de cette thèse était d'améliorer l'évaluation de la biodisponibilité, des transferts et des effets de polluants métalliques (principalement le cadmium mais aussi le cuivre, le nickel, le plomb et le zinc) et d'un polluant organique, l'herbicide isoproturon, dans des réseaux trophiques. Les réseaux étudiés dans le cadre de cette thèse ont été composés, en fonction des expériences, de 2 ou 3 compartiments parmi les suivants : sol - producteur primaire (laitue Lactuca sativa, colza Brassica napus ou mai͏̈s Zea mays) - consommateur primaire (escargot Helix aspersa) - prédateur (coléoptère carabidé Chrysocarabus splendens). Trois approches complémentaires utilisant des réseaux trophiques de complexité croissante ont été mises en œuvre au laboratoire, en conditions semi-contrôlées et in situ<br>Pollution of ecosystems by metallic trace elements (MTEs) and organic compounds may lead to pollutant transfer in food webs. The aim of this work was to improve the assessment of bioavailability, transfer and effects of various MTEs (mainly cadmium (Cd) but also copper (Cu), nickel (Ni), lead (Pb) and zinc (Zn)) and an organic pollutant, the herbicide isoproturon. The food webs studied in this work were made up of 2 or 3 compartments among the following: soil - primary producer (lettuce Lactuca sativa, colza Brassica napus and maize Zea mays) - primary consumer (snail Helix aspersa) - secondary consumer (carabid beetle Chrysocarabus splendens). Three complementary approaches using food webs of increasing complexity were exploited in laboratory experiments, under semi-field conditions and in situ
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Emmery, Antoine. "Influence de l’environnement trophique et du métabolisme sur les dynamiques des isotopes stables chez l’huître du Pacifique (Crassostrea gigas) : approches expérimentales et de modélisation." Caen, 2012. http://www.theses.fr/2012CAEN2071.
Full textAbstract:
Les analyses d'isotopes stables ont considérablement contribué à améliorer la compréhension du fonctionnement des écosystèmes marins côtiers. Le manque d'outils de modélisation bioénergétique précis pour décrire la dynamique et le fractionnement trophique des isotopes stables chez les organismes, limite cependant leurs interprétations. L'effet de la ressource trophique et du métabolisme sur les dynamiques du δ13C et δ15N dans les tissus mous de l'huître du Pacifique Crassostrea gigas a donc été étudié à partir d'approches expérimentales et de modélisation. Les résultats du suivi in situ en Baie des Veys et en Rade de Brest, ont montré que la croissance (corps entier et organes) et la ressource trophique (quantité et diversité) devaient être considérées simultanément afin d'interpréter correctement les variations temporelles du δ13C et δ15N chez l'huître. Un modèle basé sur la théorie des budgets d'énergie dynamique (DEB), a ensuite été calibré et paramétré pour cette espèce. Cette approche a montré que plus la quantité de nourriture ingérée augmente, plus la croissance est forte et plus les valeurs de δ et Δ sont faibles. Elle a également montré que les voix anaboliques et cataboliques lors de l'assimilation, la croissance et la maintenance de l'organisme jouent un rôle important dans le fractionnement isotopique. Le modèle permet aussi de calculer de façon dynamique le fractionnement trophique. Les tendances du modèle ont été validées lors de l'expérience de fractionnement isotopique à deux niveaux de nourriture menée sur l'huître. Ce type de modèle constitue donc un outil pertinent pour caractériser l'environnement trophique variable des bivalves marins<br>Stable isotope analysis (SIA) contributed extensively to better understand the trophic functioning of marine coastal ecosystems. However, their ecological interpretations are limited by the lack of accurate modelling tools to describe the dynamics and the trophic fractionation of stable isotopes by organisms. The influence of the trophic resource and the metabolism on the dynamics of δ13C and δ15N in the soft tissues of the Pacific oyster Crassostrea gigas has been investigated using experimental and modeling approaches. The results of the in situ survey in the Bay of Veys and the Bay of Brest showed that growth (whole soft body tissues and organs) and the trophic resource (diversity and quantity) have to be considered simultaneously to accurately understand the temporal variations in δ13C and δ15N of oysters. Then, a model based on the Dynamic Energy Budget theory (DEB) has been developed and calibrated for this species. This approach showed that the higher the feeding level, the higher the growth and the lower the δ et Δ. It also demonstrated that the anabolic and catabolic routes of the assimilation, growth and maintenance of the organism play a key role in the isotopic fractionation. The model also allows to calculate dynamically the trophic fractionation. The trends simulated by the model have been validated during the fractionation experiment at two feeding levels carried out on oysters. This type of model thus constitutes a relevant tool to characterized the variable trophic environment of marine bivalves
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Potier, Simon. "Ecologie sensorielle des rapaces : vision et olfaction." Thesis, Montpellier, 2016. http://www.theses.fr/2016MONTT167.
Full textAbstract:
La vision est certainement le sens le plus développé chez les rapaces, souvent cités comme les vertébrés possédant la plus grande acuité visuelle. Pourtant, les rapaces figurent parmi les victimes les plus fréquentes des collisions avec des éoliennes et autres dispositifs anthropiques. Etant donné les enjeux de conservation et le coût des opérations de conservation, il est indispensable de mieux comprendre comment les capacités sensorielles des rapaces affectent leur technique de recherche alimentaire et les interactions avec les dispositifs anthropiques (par exemple jusqu’à quelle altitude/distance les vautours peuvent-ils être détecter les charniers et les obstacles potentiels et comment optimiser les mesures de gestion des habitats ?). En ce qui concerne l'olfaction, le postulat ancien que les oiseaux en général ont une olfaction quasi nulle est réfuté grâce à la publication récente d’expériences qui montrent le contraire chez plusieurs espèces d’oiseaux, des passereaux aux oiseaux marins. L’olfaction est-elle vraiment un sens « manquant » chez les rapaces? Pourquoi seuls les vautours américains auraient-ils développé un sens aigu de l’olfaction ? Notre projet d’étude de l’écologie sensorielle des rapaces repose principalement sur de test de conditionnement avec renforcement, conduits sur des oiseaux issus de plusieurs parcs zoologiques de France. L’originalité de notre projet serait de combiner des expériences de vision et d’olfaction, sur une grande diversité d’espèces (Vautours, Buses, Milans), d’origine phylogénétique, de régimes alimentaires et de technique de recherche alimentaire différents, à la fois au sol et en vol. La première étape aura lieu en conditions contrôlées en volières, avec des expériences de conditionnement opérant après dressage : réponses des oiseaux à différents stimuli visuels et odeur. Dans un deuxième temps des expériences en vol pourront être menées, sur des oiseaux dressés à effectuer des vols libres, dont les mouvements précis peuvent être suivis en 3 dimensions par des balises GPS couplées à des accéléromètres et des caméras vidéos. Il serait alors possible de connaître précisément les capacités sensorielles utilisées pour la recherche alimentaires de chaque espèce et d’analyser les comportements de vol en lien avec l'aérologie<br>The vision is certainly the most developed sense in raptors, and these birds are cosidered as the vertebrates with the greatest visual acuity. However, raptors are among the most frequent victims of collisions with wind turbines and other human features. Given the conservation issues and the cost of conservation operations , it is essential to understand how sensory abilities of raptor affect their foraging ecology and interactions with human features (eg at which altitude / distance vultures can detected graves and potential obstacles and how optimize the measure of habitats management). But vision is not the only sense that raptor may have. Olfaction in birds was historically neglected, but recent evidence suggests that many bird species, from passerines to seabirds, use olfaction. Consequently, it make sense that olfaction may lead some behaviours in raptor too. To date however olfaction has been searched and shown only in the American vultures. Our project aims to study the sensory ecology of raptors based primarily on captive animals and condition protocols. The originality of our project is to combine the experience of vision and olfaction, on a wide variety of raptor species present in French zoos, with different phylogenetic origin, diets, and different foraging ecologies. The first step will takes place under controlled aviaries conditions, with operant conditioning experiments: responses of birds to different visual and odor stimuli. In a second phase, flight experiments will be conducted on birds trained to perform free flights, whose precise movements can be tracked in three dimensions by GPS tags coupled with accelerometers and cameras videos. It would then be possible to determine precisely the sensory capabilities used for food research for each species, and analyze the flight behaviour with respect to aerology
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Ettajani, Hanane. "Transfert des éléments traces essentiels ou toxiques dans une chaîne trophique à mollusques." Tours, 1994. http://www.theses.fr/1994TOUR4007.
Full textAbstract:
Le transfert des éléments traces (l'argent, l'arsenic, le cadmium, le cuivre et le plomb) aux mollusques filtreurs a été étudié grâce à un modèle expérimental de chaîne trophique. Le premier maillon est représenté par du sédiment naturel et des microalgues: Skeletonema costatum, Tetraselmis suecica, et Haslea ostrearia, et le second par le mollusque filtreur l'huître Crassostrea gigas. La biodisponibilité des métaux au niveau du premier maillon, étudiée à l'aide d'essais in vitro (attaque enzymatique, changement de ph) montre, qu'à acidités comparables à celles du tube digestif des huîtres, une désorption se produit et son importance varie selon le métal. En effet, pour le sédiment de la baie de Bourgneuf, la biodisponibilité du cuivre est plus importante que celle de l'arsenic et du plomb, et s'est traduite par un transfert relativement élevé du cuivre à l'huître dans la chaine trophique expérimentale. Pour le sédiment de l'estuaire de la Loire, la biodisponibilité des métaux diffère selon les saisons et selon le métal testé. Ainsi la désorption du cuivre et surtout du cadmium est élevée. L'étude de compartimentation montre que chez les algues contaminées par des surcharges métalliques réalistes, les métaux sont principalement liés à la fraction insoluble, avec une faible proportion dans la fraction soluble thermosensible. La caractérisation des composés liant les métaux montre qu'ils sont de masse moléculaire élevée, surtout pour l'argent, et qu'ils diffèrent des phytochélatines. Pour les huîtres contaminées par le cadmium ou le cuivre, des protéines de type métallothionéine ont été mises en évidence. La bioaccumulation des métaux (Ag, Cd, Cu et Pb) par l'huître est beaucoup plus importante par voie directe que par voie particulaire. Toutefois, en considérant les quantités métalliques disponibles dans le milieu, la voie particulaire s'avère non négligeable. Les caractéristiques génétiques (diploïdie, triploïdie) n'ont pas eu d'influence sur la bioaccumulation des métaux chez les huîtres
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Juc, Liliana. "« ETUDE DES RISQUES LIES A L'UTILISATION DES PESTICIDES ORGANOCHLORES ET IMPACT SUR L'ENVIRONNEMENT ET LA SANTE HUMAINE »." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00330431.
Full textAbstract:
Ce travail a eu l'objectif d'étudier les risques de contamination du sol et des chaînes alimentaires avec des pesticides organochlorés (POC). Nous avons analysé les sols autour des entrepôts et la migration de POC en aval des sites. Nous avons effectué l'évaluation du risque d'un des sites pollués (ancien dépôt de pesticides) et nous l'avons estimé de « classe 2 » - site à surveiller. Nous avons étudié l'accumulation des POC dans les chaînes alimentaires : dans les produits végétaux, les poissons et les produits alimentaires d'origine animale (crèmes et œufs). Nous avons trouvé que les concentrations de POC dépassent les normes européennes dans beaucoup d`échantillons. Ces données indiquent que la contamination de produits alimentaires avec de pesticides est le résultat de l`interdiction de l`utilisation du DDT et du HCH en agriculture et dans le domaine de la santé publique. Dans cette étude, nous avons effectuées des estimations des apports quotidiens de pesticides (DDT, HCH et HCB). Les données obtenues ne dépassent pas les valeurs admissibles. Nous avons conclu que les anciens entrepôts sont la source principale de pollution de différents écosystèmes et nous avons proposé une méthode efficace pour la remédiation des sols pollués – le « landfarming ».
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Beghin, Vincent. "Étude de la matière organique et du réseau trophique en estuaire de Seine : utilisation des marqueurs biochimiques (acides gras et stérols)." Lille 1, 1999. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/1999/50376-1999-459.pdf.
Full textAbstract:
Cette étude, menée dans le cadre du programme Seine Aval, porte sur le régime alimentaire de deux organismes clefs du réseau trophique dans la zone oligohaline (0,5<S<10) de l'estuaire de la Seine : le copépode Eurytemora affinis qui fait partie du mésozooplancton et la crevette Palaemon longirostris qui appartient au suprabenthos. Les acides gras (AG) et les stérols (ST) ont été utilisés en tant que marqueurs des origines de la matière organique particulaire (MOP) et en tant que marqueurs trophiques caractérisant les origines de la nourriture ingérée par Eurytemora et Palaemon. Ils ont été analysés selon un protocole analytique rigoureux mettant en jeu une étape d'extraction, de préséparation et d'identification - quantification par chromatographie en phase gazeuse (CG - FID et CG - SM). Les prélèvements ont été réalisés en 1997 et en 1998 près du pont de Normandie au printemps lors du développement maximal d'Eurytemora. Les différentes sources de la MOP ont notamment été caractérisées lors de deux cycles de marée successifs en avril et en mai 1997. Des apports de phytoplancton d'eau douce ont été mis en évidence. Eurytemora se nourrit principalement des diatomées dulcaquicoles, et minoritairement des bactéries hétérotrophes et des chlorophycées. Dans cet environnement turbide, il semble ainsi faire un choix des particules ingérées. Par ailleurs, Palaemon se nourrit principalement de copépodes.
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Pouille, Lauren. "Paléobiodiversité des Radiolaires du Paléozoique inférieur (Cambrien-Ordovicien) : Aperçu à travers une étude des assemblages à radiolaires provenant des montagnes de l’Altai (Russie), d’Aksuran (Kazakstan), du bassin de Georgina (Australie) et de la Terre Neuve occidentale (Canada)." Electronic Thesis or Diss., Lille 1, 2012. http://www.theses.fr/2012LIL10152.
Full textAbstract:
Notre compréhension de la structuration des chaînes trophiques pélagiques du Paléozoïque inférieur, mise en place lors des évènements d’« explosion Cambrienne » et de « Grande Biodiversification Ordovicienne » et qui a abouti à la mise en place des écosystèmes marins à « caractère moderne », reste encore très fragmentaire. Nous nous intéressons ici à comprendre les origines et la dynamique de paléobiodiversité des Radiolaires polycystines, composantes biotiques clefs du plancton hétérotrophe, dans le but de mieux comprendre le calendrier et la dynamique de diversification du plancton au cours du Paléozoïque inférieur. La découverte de nouveau matériel provenant des montagnes de l’Altaï (Sibérie) apporte de nouvelles données sur l’enregistrement fossilifère des premiers radiolaires biominéralisés avec l’identification des plus anciens représentant de la famille des Archéoentactinidae d’âge Botomien. Des études menées sur du matériel de Terre-Neuve et d’Australie ont permis de caractériser l’ensemble des changements biotiques intervenus au sein des assemblages à radiolaires à l’aube de la révolution planctonique mais également de préciser la répartition paléogéographique des radiolaires au Cambrien supérieur. Une étude taxonomique menée sur un échantillon provenant du Kazakhstan a également permis la découverte d’un nouvel assemblage à radiolaire enrichissant considérablement notre connaissance de la diversité des radiolaires à l’Ordovicien moyen<br>Our understanding of the structuration of Lower Paleozoic pelagic trophic chains during the ‘Cambrian Explosion’ and the ‘Great Ordovician Biodiversification Event’, which has lead to the establishment of modern marine ecosystems, is still very fragmentary. We are here interested in understanding the paleodiversity dynamics of polycystines Radiolaria planctonic group, a key biotic component of the heterotrophic plankton, in order get a better idea of the timing and dynamics of plankton diversification at the Lower Paleozoic. The discovery of new material from the Altai Mountains (Siberia) brings new data on the fossil record of the first biomineralized radiolarians with the identification of the oldest representatives of the Archeoentactinidae family dated of a Botomian age. Study conducted on Newfoundland and Australian material allowed us to characterize precisely the various biotic changes undergone by radiolarians during the Cambrian-Ordovician transition, at the dawn of the planktonic revolution but also to precise their paleogeographic distribution at the Late Cambrian. A detailed taxonomic study conducted on a Kazakhstanian sample has allowed us to describe a new radiolarian assemblage enriching considerably our knowledge on the radiolarian diversity at the middle Ordovician
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Zriki, Ghais. "Etude intégrative des interactions au sein d’une association lâche, hôte-microprédateur-arthropodes non hématophages cohabitant avec lui : vers une gestion agro-écologique des bâtiments d’élevage de volaille." Thesis, Montpellier, 2020. http://www.theses.fr/2020MONTG025.
Full textAbstract:
Les ennemis naturels tel que les arthropodes prédateurs jouent un rôle important dans le contrôle des populations des bioagresseurs dans les agroécosystèmes. Les élevages de poules pondeuses sont des agroécosystèmes de production intensifs qui intègrent une diversité élevée d’arthropodes : parasites des poules et les arthropodes du fumier (détritivores, prédateurs, etc.). Le pou rouge des poules, Dermanyssus gallinae, est l’ectoparasite le plus préjudiciable aux élevages de poules pondeuses. Les infestations de D. gallinae entraînent des problèmes économiques et de bien-être animal. Dermanyssus gallinae est un ectoparasite nidicole qui vit à proximité de son hôte dans un environnement partagé par les arthropodes prédateurs qui peuplent naturellement les bâtiments d’élevages de poules pondeuses.Dans le cadre de cette thèse, notre objectif était d’améliorer l’état des connaissances sur l’impact des arthropodes prédateurs natifs de bâtiments d’élevage de poules pondeuses sur D. gallinae. Basé sur trois approches méthodologiques (descriptive, corrélative et expérimentale), le présent travail a exploré les interactions prédateur-proie (centrées sur D. gallinae) à trois échelles: i) l’échelle de l'individu: Etablir le réseau trophique des arthropodes natifs (in-vitro), ii) à l’échelle de l’espèce : analyser la covariation de l’abondance de D. gallinae et ces prédateurs dans les bâtiments d’élevage, ii) l’échelle de la population : Mesurer dans un système expérimental (poule-D. gallinae-prédateur) en mésocosmes l’impact des arthropodes prédateurs sur le développement des populations de D. gallinae.L’analyse de réseau trophique des arthropodes natifs a montré que D. gallinae est une proie potentielle pour dix espèces d’arthropodes prédateurs. Ces prédateurs ont montré une disparité importante dans la fréquence de prédation sur D. gallinae et une préférence pour D. gallinae en présence de proies alternatives telles que les acariens détritivores. Dans les bâtiments d’élevage de poules pondeuses, l’analyse des abondances relatives de D. gallinae et les prédateurs natifs a permis de soutenir l’existence d’une interaction entre D. gallinae et ses prédateurs qui ont montré une capacité élevée de le consommer in-vitro. La mise en place des expériences en mésocosmes a permis le développement de D. gallinae, les prédateurs natifs et les acariens détritivores. Sous nos conditions expérimentales, les arthropodes prédateurs natifs n’ont pas montré un effet détectable sur le développement de populations de D. gallinae quand d’autres espèces de proies alternatives étaient présentes. Ces résultats suggèrent que, dans nos conditions expérimentales, le développement de populations de D. gallinae semblait être limité par les ressources alimentaires (la poule) et non pas par l’effet de prédation. La présence d’une proie alternative (les acariens détritivores) pourrait aussi avoir diminué l’effet des prédateurs sur les populations de D. gallinae. A travers notre système expérimental, nous avons également montré que les acariens prédateurs élevés en masse et commercialisés actuellement pour lutter contre D. gallinae n’ont pas d'effet négatif sur les espèces natives non-cibles tels que les acariens prédateurs natifs.Nos résultats révèlent des lacunes importantes dans notre compréhension de la biologie de D. gallinae et de la dynamique de ses populations. Ces résultats montrent également l’importance d’explorer d’avantage le rôle potentiel des proies alternatives dans l’absence d’un effet régulateur des prédateurs natifs sur les populations de D. gallinae<br>Natural enemies such as predatory arthropods play an important role in controlling pest populations in agroecosystems. Laying-hen farms are agroecosystems of intensive production that incorporate a high diversity of arthropods: hen parasites and manure arthropods (predators, detritivorous, etc.). The poultry red mites Dermanyssus gallinae is the most damaging ectoparasite in laying-hen farms. Infestations with D. gallinae cause both welfare and economic problems. Dermanyssus gallinae is a nidicolous ectoparasite that lives close to its host in an environment shared by the naturally-occurring predatory arthropods in laying-hen farms.In this thesis, our objective was to improve our knowledge on the impact of native arthropods predators in laying-hen farms on D. gallinae. Based on three methodological approaches –descriptive, correlative and experimental–, the present work explored predator-prey interactions (with focus on D. gallinae) and the impact of arthropods predators on D. gallinae at three levels: 1) individual level: building the food web of native arthropods (in vitro), 2) species level: analyzing the covariation of the abundances of D. gallinae and its predators in farm buildings, 3) population level: measuring in an experimental system (hen-D. gallinae-predator) in mesocosms the impact of native arthropod predators on the development of D. gallinae populations.The analysis of native arthropods food web showed that D. gallinae is a potential prey for ten predatory species. These predators showed a significant disparity in predation frequency on D. gallinae and in their preferences for prey species between D. gallinae and detritivorous mites as alternative prey. In laying-hen farms, analysis of the relative abundances of D. gallinae and native predators supported the presence of interactions between D. gallinae and predatory species that showed high predation frequencies on it in vitro. The experiments in mesocosm allowed the development of D. gallinae, native arthropod predators and detritivorous mites. Under our experimental conditions, native arthropod predators did not show any detectable effect on the development of D. gallinae populations when other alternative prey species were present. These results suggest that, under our experimental conditions, the development of D. gallinae populations seemed to be limited by food resources (the hen) and not by the predation effect. The presence of alternative prey (detritivorus mites) may have reduced predators’ impact on D. gallinae populations. Through our experimental system, we also showed that mass-reared and commercially available predatory mites currently used to control D. gallinae in laying farms, did not have a negative effect on non-target species such as native predatory mites.Our results uncovered important gaps in our understanding of D. gallinae biology and population dynamics. These results also demonstrate the importance of further investigating the impact of alternative prey species in the absence of a regulatory effect of native predators on D. gallinae populations
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Laidaoui, Abdelhafid. "Dommage à l'ADN et exposition aux contaminants de la chaine alimentaire chez les Inuit du Nunavik." Master's thesis, Université Laval, 2009. http://hdl.handle.net/20.500.11794/21060.
Full textAbstract:
L'exposition aux contaminants de la chaîne alimentaire tels que le méthylmercure et les biphényles polychlorés (BPC) peut induire un stress oxydatif et des dommages à l'ADN, lesquels sont considérés comme des événements primaires dans la carcinogenèse. La population inuit est exposée à des doses élevées de ces contaminants de la chaîne alimentaire par leur alimentation traditionnelle qui comprend plusieurs espèces prédatrices appartenant à la chaîne alimentaire marine. Le but de notre étude était de mesurer à l'aide du test des comètes les cassures dans l'ADN de lymphocytes obtenus d'adultes de la population inuit du Nunavik ayant participé à l'Enquête sur la santé des Inuit en 2004. Nous voulions également examiner la relation entre les concentrations sanguines de mercure ou les concentrations plasmatiques de BPC et les bris à l'ADN lymphocytaire, en contrôlant pour les habitudes de vie, la nutrition et différents autres facteurs potentiellement confondants. Nous n'avons pas trouvé de relation entre le dommage à l'ADN des lymphocytes et les concentrations sanguines de mercure ou les concentrations plasmatiques de BPC. Nous avons par contre observé une corrélation statistiquement significative entre la consommation d'alcool chez les participants et le dommage à l'ADN. Les participants qui consommaient de l'alcool au moins une fois par semaine avaient un dommage à l'ADN lymphocytaire significativement plus élevé que ceux consommant de l'alcool moins d'une fois par semaine. De plus, l'âge des participants était négativement corrélé avec le dommage à l'ADN, ce qui pourrait refléter un effet protecteur d'un ensemble de facteurs chez les participants les plus âgés dont une plus grande consommation d'aliments traditionnels et des consommations plus faibles d'alcool et de tabac. Ces résultats suggèrent donc que la consommation d'alcool augmente le dommage basai à l'ADN chez cette population inuit, mais que ni le méthylmercure ni les BPC ne semblent avoir un effet significatif sur le dommage à l'ADN des lymphocytes dans cette population.
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Spitz, Jérôme. "Stratégies alimentaires et énergétiques de la prédation chez les mammifères marins." Phd thesis, Université de La Rochelle, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00565430.
Full textAbstract:
Les stratégies alimentaires peuvent être définies comme la mise en place d'ensembles cohérents de réponses morphologiques, physiologiques, écologiques ou comportementales permettant d'optimiser le succès alimentaire d'une espèce. Le présent travail s'est proposé d'aller au-delà de la simple analyse taxonomique des régimes alimentaires en utilisant les caractéristiques des proies pour explorer certains aspects des stratégies alimentaires et de l'énergétique de la prédation chez les mammifères marins de l'atlantique nord-est. L'objectif majeur était de contribuer à une meilleure compréhension du "pourquoi une proie est une proie ?" La valeur énergétique des proies est apparue comme un élément central des stratégies de prédation. Il en résulte que des coûts d'existence importants chez les mammifères marins doivent être soutenus par une alimentation de qualité élevée et ne peuvent pas être satisfaits simplement par une plus grande quantité de proies de qualité moyenne ou faible. Les résultats obtenus lors de cette thèse ont ainsi permis de progresser de la description des régimes alimentaires vers la compréhension de certaines relations fonctionnelles entre proies et prédateurs. Ainsi, les traits descriptifs de la qualité des proies, comme la teneur en lipides et la valeur énergétique, et les traits descriptifs des coûts d'existence des mammifères marins, comme l'indice mitochondrial et la teneur en lipides des muscles, sont significativement corrélés. Enfin, ce travail souligne que pour comprendre l'écologie alimentaire d'un prédateur, il faut surtout bien connaitre les caractéristiques de ses proies.
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Breton, Elsa. "Qualité du pool nutritif et nutrition des copépodes pélagiques en Manche orientale." Littoral, 2000. http://www.theses.fr/2000DUNK0064.
Full textAbstract:
Ce travail traite de l'aspect quantitatif et qualitatif des relations trophiques en Manche orientale entre le phytoplancton et les copépodes, au moyen de l'analyse par HPLC des pigments photosynthétiques. Une méthode d'extraction et de séparation des pigments, appliquée à l'analyse des contenus stomacaux des copépodes, a été élaborée. En parallèle, des comptages ont été effectués au microscope pour : déterminer la tailles des particules nutritives, estimer la part des hétérotrophes, et vérifier la validité des pigments marqueurs. L'analyse des prélèvements, effectués de 1995 à 1997, à la côte et au large de Boulogne sur mer, montre que la quantité et la qualité du pool nutritif fluctuent de façon importante à travers les saisons. Les diatomées microplanctoniques composent l'essentiel de la biomasse phytoplanctonique par rapport aux phytoflagellés essentiellement nanoplanctoniques. Mais numériquement, ceux-ci représentent une part importante, et dominent en hiver, automne et avril-mai (Phaeocystis sp. ). Spatialement, les eaux côtières sont plus riches en diatomées que celles du large, induisant de plus fortes biomasses phytoplanctoniques et une plus faible proportion de phytoflagellés. Ces différences montrent l'influence de l'hydrodynamisme particulier en Manche orientale sur la distribution et la composition du phytoplancton, mais aussi sur la nutrition des copépodes : les individus du large ont une plus grande proportion de phytoflagellés dans leur ration alimentaire. A cette variabilité de l'environnement nutritif, les copépodes répondent de façon spécifique et sélectionnent la nourriture qu'ils rencontrent, préférant les Cryptophycées. Les diatomées sont ingérées uniquement en fonction de leur abondance, sauf en été et en hiver où elles sont généralement évitées. En fait, il semble que les copépodes ingèrent surtout des Thalasiosiraceae, présentes surtout au printemps et en automne. Nos résultats montrent aussi que les copépodes évitent Phaeocystis sp<br>This work investigates quantitative and qualitative sides of the in situ trophic relationships between phytoplankton and copepods, by means of pigments biomarkers, analyzed by HPLC. One method for extract and separate pigments from gut of copepods has been worked out. In parallel, microscopic counts have been carried out for : establish size of nutritive particles, estimate portion of heterotrophs, and verify validity of pigments biomarkers. Analysis of samples, collected fortnighly from November 1995 to July 1997, in two neighbour areas 'inshore and offshore) in the eastern English Channel, reveal that quality and quantity of the nutritive pool fluctuate substantially over the course of seasons. Microplanktonic diatoms contribute to the greatest part of phytoplankton biomass, incomparison with nano-phytoflagellates. However, numerically, these contribute to an important part of the phytoplankton, and dominate in winter, autumn, and April-May (Phaeocystis sp. ). Spatially, phytoplankton carbon biomass is higher in the coastal area, mainly due to higher frequency of diatoms. Thus, the offshore waters were characterised by a greater numerical contribution of flagellates. These differences show the importance of the particular hydrodynamism (tidal front) in the eastern English Channel on the distribution and composition of phytoplankton, and also on the nutrition of copepods. Thus, nanoflagellates compose a higher part in the copepods diet in the offshore waters. Concomitant copepods species respond with specific behaviour to such variability, and select food encountered, exerting always a strong preference on Cryptophyceae. Diatoms are ingested according their abundance, even are generally avoided during summer and winter. In fact, it seems that copepods overall feed on Thalasiosiraceae, present principally in spring and autumn. Results also show that copepods discriminate Phaeocystis sp
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Abdul, Rida Abdul Motalibe Mohammad. "Biosurveillance de la contamination du sol : apport de l'étude des lombriciens à l'évaluation des risques liés aus éléments traces." Montpellier 2, 1992. http://www.theses.fr/1992MON20124.
Full textAbstract:
L'objectif du travail a ete d'evaluer les risques ecologiques resultant des teneurs des sols en 5 elements traces (cd, cu, ni, pb et zn). Ces elements ont deux origines: geologiques et anthropogenetiques. Ce travail a ete realise a partir de 186 points d'etude repartis dans 6 sites au sud de la france. Les sols etudies ont des proprietes physicochimiques tres variees. L'etude montre d'une part la possibilite d'effectuer une biosurveillance directe (sur le terrain) de la contamination par les elements traces des milieux terrestres et d'autre part l'interet d'utiliser les lombriciens comme outils de mesure et de comparaison des niveaux de bio-contamination (bio-indication physiologique). Cette bioconcentration depend de la teneur totale en elements traces des sols mais aussi des proprietes physicochimiques et des categories ecologiques lombriciennes. Partant de ces bioconcentrations de contaminants observes, il a ete possible de faire une evaluation des transferts importants des contaminants depuis les lombriciens vers leurs predateurs, ceux-ci se sont averes preoccupants. En outre, nous avons constate la disparition (bio-indication existentielle), dans des sols contamines par les elements traces, d'un genre lombricien anecique (scherothe ca spp. ) important dans le fonctionnement d'ecosystemes (erosion, chaines alimentaires, degradation de la matiere organique et liberation des elements necessaires aux plantes et aux microorganismes. . . ). L'etude a montre egalement que les analyses partielles et les etudes en microcosmes contribuent peu a la connaissance ecotoxicologique