Academic literature on the topic 'Champignon de couche – Champignons pathogènes'

La présente étude se propose d’étudier l’efficacité des extraits aqueux, éthanoliques et des huiles essentielles de Chromolaena odorata et d’Ageratum conyzoïdes sur le développement des champignons responsables des pourritures des cabosses de cacaoyers dans les plantations villageoises d’Akonolinga, Dizangué et Tonga. Les extraits ont été obtenus par macération de 100 g de poudre de chaque plante. Les huiles essentielles obtenues par centrifugation ont été fixées par le sulfate de sodium anhydre. Trois milieux de cultures V6, V8 et le milieu Pomme de terre – Dextrose - Agar (PDA) ont été fabriqués pour la culture des champignons associés aux cabosses. Les extraits et huiles essentielles de plantes ont été préparés aux concentrations de 5 ; 10 ; 15 et 20 mg/ml. L’essai a été conduit suivant un dispositif en blocs complets aléatoires avec 3 répétitions. La fréquence d’isolement de chaque champignon par localité, la surface des lésions développées sur les cabosses infectées et le pourcentage d'inhibition PI (%) des champignons pathogènes ont été mesurés et soumises à l’analyse de la variance (ANOVA). Les moyennes obtenues ont été séparées par le test de Duncan au seuil de probabilité 5%. Les résultats suivants ont été obtenus : sur 8 espèces isolées, seulement Phytophtora megakarya, Botryodiplodia theobromae et Colletotrichum gloeosporioides. ont été pathogènes sur les cabosses saines. L’analyse statistique a montré des différences significatives (à P ≤ 0,05) entre les surfaces des lésions causées par ces champignons sur les cabosses entre le 4ième, 7ème et 10ème jour après inoculation (JAI) en fonction des espèces fongiques testées. Les extraits aqueux de C. odorata et d’A. conyzoides à la concentration de 20 mg/ml ont présenté des pourcentages d’inhibition à 100 % sur P. megakarya, B. theobromae et C. gloeosporioides. Les extraits éthanoliques et les huiles essentielles ont inhibé le développement de B. theobromae, de C. gloeosporioides et de P. megakarya à 100 % aux concentrations de 15 et 20 mg/ml. Les extraits et huiles essentielles de C. odorata et d’A. conyzoïdes pourraient donc être utilisés pour lutter contre les champignons responsables des pourritures de cabosses de cacaoyers.Abstract This work is to evaluate the antifungal activity of Chromolaena odorata and Ageratum conyzoides on the development of mycoflora associated with cocoa pods diseases in villager plantations in Akonolinga, Dizangue and Tonga. Extracts were obtained by steeping of 100 g of powder of each plant. Essential oil extractions were done through centrifugation. Essential oil were fixed by sulfate of sodium anhydre. Three culture media V6, V8 and Potato Dextrose Agar (PDA) were made to cultivate mycoflora associated with cocoa pods Data were randomized into completely blocs with three replications. Frequency of each fungus per locality, lesion area developed on cocoa pod by fungi and percentage of inhibition PI (%) of each fungus were being submitted in variance analysis. Means were separated by Duncan test with (P ≤ 0, 05). The results showed that: over 8 varieties of fungal species isolated from cocoa pods, unly Phytophthora megakarya, Botryodiplodia theobromae and Colletotrichum gloeosporioides were pathogens on cocoa pod inoculated. The analysis of the variance showed significatives differences (P ≤ 0, 05) of area lesions on cocoa pods between the 4th, 7th and the 10th days after inoculation. Mycelia growth was stopped at the concentrations of 20 mg/ml for aqueous extracts, of 15 and 20 mg/ml ethanolic extracts and essential oil. .The extracts and essential oil of C. odorata and A. conyzoides can be used to fight against micoflora associated with cocoa pods disease.

Le champignon de couche, Agaricus bisporus (Lange) est sensible à divers pathogènes fongiques, dont Verticillium fungicola, l'agent de la môle sèche. Cette pathologie est responsable de dégâts importants dans les cultures commerciales. Une analyse moléculaire a montré que les isolats de V. Fungicola européens appartiennent à la variété fungicola et présentent une grande homogénéité génétique. Leur variabilité physiologique (sensibilité aux métabolites d'agaric et à un fongicide, agressivité) est supérieure à celle rapportée pour les isolats de variété aleophilum responsables de la maladie en Amérique de Nord. Les champignons malades présentent trois types de symptômes : la môle, masse de tissus indifférenciés, le sporophore à pied fendu, et le sporophore taché. Pour comprendre le développement de la maladie, ils ont été étudiés sur le plan morphologique (différenciation, couleur des tissus) et moléculaire (quantification de l'hôte par PCR en temps réel). Le premier stade morphologique réceptif au pathogène a été identifié. Les môles présentent une grande variabilité de niveau de contamination et de brunissement. Ce dernier ne bloque pas le pathogène mais est lié à une forte contamination. Les tissus d'aspect sain des sporophores tachés ou à pied attaqué sont contaminés. La transcription de gènes candidats pour l'interaction hôte- pathogène et le développement de la môle a été suivie par PCR en temps réel. Les gènes de laccase lcc2 et lcc3 et de tyrosinase AbPPO2 montrent une baisse, voire une perte, de régulation chez la môle par rapport à celle observée chez le champignon sain. Le gène de choc thermique hspA fortement exprimé dans la môle montre une réaction à l'infection
The button mushroom, Agaricus bisporus (Lange) is susceptible to various fungal pathogens, among which is Verticillium fungicola the causal agent of dry bubble. The disease is responsible for severe losses at the mushroom industry. Molecular analyses showed that the European isolates of V. Fungicola belong to the variety fungicola and exhibited great genetic homogeneity. They showed higher variability in physiological traits than the var. Aleophilum isolates responsible for dry bubble in North America. The disease causes three types of symptoms: bubbles (undifferentiated spherical masses), blowout stipes and spotty caps. In order to understand disease development, affected mushrooms were studied at the morphological (differentiation, tissue colour) and molecular level (host quantification by real-time PCR). The initial morphological stage susceptible to the pathogen was identified. Bubbles were highly variable in contamination level and tissue browning. The latter did not contain the pathogen but resulted from severe tissue ontamination. Healthy looking tissues of mushrooms with spotty cap or blowout stipe were infected. Real-time PCR was used to assess the transcription of genes potentially involved in host-pathogen interaction and bubble development. The laccase genes lcc2 and lcc3, and the tyrosinase gene AbPPO2 showed a repression, or an absence of regulation in bubbles compared to that in healthy sporophores. The activation of the heat shock gene hspA in bubbles revealed a reaction against infection

La maladie de la môle sèche d'Agaricus bisporus due à Verticillium fungicola a été étudiée. Les travaux présentés visent à produire des connaissances sur l'interaction. Les résultats d'analyses statistiques montrent une grande variabilité dans le développement de la maladie ; l'intensité dépend du taux d'inoculum du pathogène, du moment de la contamination ; de la sensibilité de la souche d'A. Bisporus, et des facteurs environnementaux. Les deux variétés connues de V. Fungicola : var. Fungicola et var. Aleophilum représentent deux pathotypes avec des capacités différenciées pour s'implanter dans l'environnement immédiat du mycélium d'A. Bisporus et induire la maladie. Pour la première fois, la présence simultanée d'activité laccase et tyrosinase a été révélée dans les primordia, et dans les môles. La similitude d'expression des PPO indique que V. Fungicola agit sur A. Bisporus en bloquant son programme de différenciation cellulaire de l'état végétatif à l'état fructifère
The dry bubble disease of Agaricus bisporus due to Verticillium fungicola has been studied. The aim was to produce knowledge on the interaction. Results of statistical analyses showed a high variability in the development of the disease; the intensity depended on the rate of inoculum's pathogen, contamination time; susceptibility of A. Bisporus' strain, and environmental factors. The two known varieties of V. Fungicola: var. Fungicola and var aleophilum, represent two geographically isolated pathotypes, and exhibited differentiated abilities to establish in the immediate environment of the mycelium of A. Bisporus and to induce the disease. The simultaneous presence of both laccase and tyrosinase activities were observed, for the first time, in both the primordia and dry bubbles. Due to the identity of PPO expression, it was concluded that V. Fungicola acts on A. Bisporus by blocking its program of cellular differentiation from the vegetative mycelium to the fruitbody

LA PRODUCTION DE MACROMOLECULES TOXIQUES POUR L'INSECTE LEPIDOPTERE GALLERIA MELLONELLA PAR DES SOUCHES DU CHAMPIGNON BEAUVERIA BASSIANA INDUCTRICES DE MELANISATION CUTICULAIRE (EX. : B. B. 618) OU NON MELANISANTES (EX. : B. B. 101) A ETE ETUDIEE IN VIVO ET IN VITRO. LE BUT ETAIT DE PROGRESSER DANS LA CONNAISSANCE DU MODE D'ACTION DE CET AGENT ENTOMOPATHOGENE, ET D'OBTENIR DES DONNEES UTILISABLES POUR LE DEVELOPPEMENT DE LA LUTTE MICROBIOLOGIQUE. L'UTILISATION DE PRELEVEMENTS D'HEMOLYMPHE DE SUJETS INFECTES PAR B. B. 618 A MONTRE QUE DES PROTEINES A EFFET INSECTICIDE ET/OU MELANISANT SONT BIEN SECRETEES DANS L'ORGANISME DE L'HOTE. PAR CONTRE LA SOUCHE 101 PRODUIRAIT SEULEMENT DES TOXINES DE FAIBLE P. M. IN VIVO. CETTE DEMARCHE A ETE COMPLETEE PAR UNE APPROCHE IN VITRO DEVELOPPEE EN UTILISANT LE MILIEU ADAMEK POUR LA REALISATION DE CULTURES, ET EN COMPARANT L'ACTIVITE DE SOURCES PROVENANT DES DIFFERENTES SOUCHES. LES SEPARATIONS CONDUITES A PARTIR D'UNE FRACTION DE B. B. 618 RECUEILLIE SUR DEAE ONT ABOUTI A LA PURIFICATION D'UNE PROTEINE DE TYPE CHITOSANASE (cIBb) INDUISANT LE BRUNISSEMENT CUTICULAIRE, MAIS DONT L'EFFET INSECTICIDE N'A PAS ETE ETABLI. LA MEME FRACTION N'EST PAS TOXIQUE CHEZ B. B. 101 QUI EST DEFICIENTE EN MATIERE DE SECRETION DE cIBb. D'AUTRES PROTEINES ACTIVES, PARALYSANTES DANS LE CAS DE B. B. 618, SONT EGALEMENT PRESENTES CHEZ LES DEUX TYPES DE SOUCHES.

"Les travaux de cette thèse portent sur l'origine et l'évolution de séquences mobiles capables de se transférer d'un organisme à un autre et de s'intégrer dans les génomes mitochondriaux : (i) les séquences ayant pour origine des plasmides linéaires mitochondriaux et (ii) les introns portés par les gènes mitochondriaux. Nous avons montré la signature d'une intégration d'un plasmide linéaire mitochondrial dans l'ADNmt du champignon basidiomycète A. Aegerita. Pour la première fois chez un encaryote, l'intégration d'un plasmide aboutit à la duplication d'un gène mitochondrial entier : le gène nad4. Les séquences plasmidiques intégrées subissent des événements de mutation et de recombinaison conduisant à une érosion des gènes. En revanche, les deux copies du gène nad4 dupliquées demeurent intactes et potentiellement fonctionnelles. L"analyse phylogénétique des protéines POLB encodées par les plasmides linéaires mitochondriaux a montré leur caractère ancestral. Le clonage et le séquençage du gène cox1 d'A. Bisporus ont révélé que ce gène possède une taille de 29905 nt en faisant le plus grand gène mitochondrial décrit à ce jour chez un eucaryote. L'étude de son organisation moléculaire montre que cette taille est due à la présence de 18 introns de groupe 1 et d'un intron de groupe II, en faisant le plus grand réservoir d'introns mitochondriaux. Les analyses phylogénétiques menées sur ces introns ont amené des informations sur l'origine de ces séquences et leur évolution. La majorité des introns décrits chez A. Bisporus proviendraient du maintien au cours de l'évolution de séquences d'origine ancestrale, présentes chez l'endosymbionte à l'origine de la mitochondrie. Ces résultats sont clairement en faveur d'une hypothèse "early intron". A côté de ce moteur principal d'évolution, nos résultats ont confirmé l'existence d'un second moteur d'évolution des introns basée sur leur mobilité et l'existence de transferts latéraux entre espèces phylogénétiquement éloignées. "
This PhD research is focused on the origin(s and evolution of mobile sequences able of lateral transfer between strains or species and of integration in the mitochondrial genome (i) sequences derived from mitochondrial linear plasmids and (ii) introns carried by mitochondrial genes. Results have shown that, inthe basidiomycete fungus Agrocybe aegerita, the integration of a linear mitochondrial plasmid leads to a large duplication containing two intact copies of the mitochondrial nad4 gene. These duplicated copies are located on both sides of the plasmid integration site and transcripted. Contrary to both copies of the nad4 gene, the integrated plasmid sequences are affected by large deletions and mutations leading to non-functional genes. The phylogenetic analyses of the POLB proteins encoded by linear mitochondrial plasmids argue for an ancestral origin of these sequences. The cloning and sequencing of the Agaricus bisporus cox 1 gene have shown that this gene has a size of 29905 nt and so, represents, to date, the longest mitochondrial gene of eukaryots. This large size is due to the presence of 19 large introns (1 of Group II and 18 of Group I). Phylogenetic analyses have shown that most of the introns evidenced in A. Bisporus and in fungal genes in general would have an ancestral origin. This is clearly in accordance with an "early intron" hypothesis. In this context, the major way of evolution of these introns would be the maintenance or loss of ancestral or derived copies. However, a little number of intron sequences have been shown to result from a lateral transfer between phylogenetically distant species, followed by a site specific integration ("homing")

La propagation de la maladie du chancre de cyprès après sa première apparition en Californie, puis la rapidité de son extension en Europe et en Afrique a conduit à postuler l'existence d'une vection liée aux insectes. Dans le milieu algérien, les paramètres biologiques d'O. Depressus et ses conditions de développement dans le cadre climatique la favorise par rapport à O. Maculatus qui est donc dominée. Cette étude a permis de modéliser la transmission du pathogène par O. Depressus et de démontrer la possibilité de diffusion des spores par cet Orsillus. Nos essais certifient que la relation entre S. Cardinale et O. Depressus sur Cupressus sempervirens dépend essentiellement de la disponibilité des sites de ponte. Les femelles disséminent passivement les spores dans les blessures des arbres et sur les cônes sains lors de l'oviposition. Notre étude a mis en évidence l'existence d'un ooparasite, Telenomus gr. Floridanus, dont la morphologie semble très adaptée aux sites de pontes d'Orsillus.

La température est un des principaux facteurs climatiques pilotant le développement des champignons pathogènes foliaires pendant les différentes étapes de leur cycle parasitaire. Puisque ces microorganismes se développent à la surface, puis à l'intérieur des feuilles, c'est la température de feuille (" body temperature " en écologie) qui pilote leur développement. En épidémiologie végétale, c'est toutefois la température d'air qui est utilisée pour caractériser l'effet de la température sur le développement des agents pathogènes foliaires. Or, la température de feuille peut différer significativement de la température d'air en fonction des conditions climatiques. La prise en compte de la température d'air pour étudier la dynamique des maladies foliaires ne peut donc s'affranchir de deux biais : la température mesurée n'est pas celle qui est réellement perçue par l'agent pathogène et l'hétérogénéité spatiale des températures au sein du peuplement n'est pas prise en compte. De plus, la relation entre la température et le développement des agents pathogènes est non linéaire, ce qui limite la gamme de validité autorisant l'utilisation des sommes de températures, pourtant largement employées en protestion des cultures. L'objectif général de cette thèse est de reconsidérer la prise en compte de la température pour l'étude du développement des champignons pathogènes foliaires.Le pathosystème blé-Mycosphaerella graminicola a été choisi en tant qu'objet d'étude. La stratégie adoptée pour atteindre les objectifs de la thèse combine deux approches complémentaires, l'expérimentation et la modélisation. Pour la première fois, la loi de réponse d'un agent pathogène foliaire à la température de feuille a été établie. Un dispositif expérimental innovant a permis d'établir la loi de réponse pour trois isolats sur une large gamme de températures foliaires, via la mesure en continu de la température de 191 feuilles (F et F) inoculées et l'utilisation d'un système de forçage thermique par lampe infrarouge. La loi de réponse de la période de latence de la septoriose à la température de feuille s'apparente au concept de courbe de performance thermique développé en écologie. Celle-ci étant non linéaire sur l'ensemble de la gamme de température étudiée, l'impact de l'amplitude de fluctuations de température de feuille a été caractérisé. Une amplitude élévée a conduit à plusieurs effets négatifs pour le développement de M. graminicola : l'augmentation de la durée du cycle de l'agent pathogène, la diminution de la surface sporulante des lésions et de la densité de pycnides. Les différences de cinétique de développement en fonction de l'amplitude des fluctuations ne sont que partiellement expliquées par l'effet Kaufmann (purement mathématiques), suggérant que M. graminicola atténue les conséquences négatives d'amplitudes de fluctuation plus élevées. Enfin, les simulations du développement de la septoriose réalisées à partir de données de températures foliaires diffèrent signicativement de celles réalisées à partir de températures d'air mesurées de façon standard par une station météorologique. Ces simulations ont également souligné le caractère déterminant du pas de temps considéré.Par le transfert de concepts d'écologie vers l'épidémiologie, cette thèse ouvre des pistes pour améliorer la prise en compte de la température dans les modèles épidémiologiques. Elle contribue au développement d'une meilleure compréhension des mécanismes par lesquels l'environnement affecte les microorganismes, point clé pour le développement de modèles mécanistes de réponses possibles au changement climatique

Ce travail a permis de mettre en évidence des mécanismes de défense actifs développés par des Nicotiana vis-à-vis de l'agent de la pourriture noire des racines C. Elegans. Nous avons identifié et localisé cytochimiquement chez C. Elegans des polysaccharides pariétaux pouvant être à l'origine des phénomènes de reconnaissance cellulaire et d'incompatibilité. L'étude ultrastructurale du processus d'infection des racines de l'hôte modérément résistant par C. Elegans a révélé que des modifications pariétales différentielles, selon les couches cellulaires infectées, peuvent conférer à la paroi un certain degré de résistance à l'invasion fongique. Chez l'hôte sensible, aucune modification pariétale n'est observée. Nous avons pour la première fois mis en évidence les différents groupes de protéines PR-b dans les racines de N. Tabacum cv Xanthi nc infectées par C. Elegans, et localisé dans les tissus infectés et particulièrement au niveau des structures pariétales de défense de l'hôte, les protéines PR-b1 dont la fonction reste inconnue; ceci nous a amené à suggérer l'implication de ces protéines dans les mécanismes de défense contre l'invasion fongique. L'étude de l'expression du gène de la PR-b1* en fonction de la résistance de l'hôte et de la virulence du champignon, a révélé que le niveau d'accumulation des transcrits de la PR-b1* est lie au taux d'infection plutot qu'a la resistance de la plante ou a la virulence du pathogene. Chez l'hybride amphidiploide, l'expression constitutive de la pr-b1* n'est pas affectée par le taux d'infection. Nous avons démontré que lors d'une association endomycorhizienne entre les racines de N. Tabacum cv Xanthi nc et G. Mosseae, les gènes PR-b1 ne s'expriment que très faiblement, et que leurs produits de traduction sont limités à l'interface des deux symbiotes dans les cellules vivantes du parenchyme cortical. La faible activation de ces gènes est par contre corrélée avec l'induction d'autres gènes pouvant être impliqués dans l'établissement et le fonctionnement de la mycorhize.

L'eutypiose est une maladie cryptogamique due au champignon ascomycete eutypa lata qui, en envahissant les tissus vasculaires, induit le deperissement des ligneux contamines. Ce parasite s'est considerablement propage dans le vignoble, notamment en bordelais et en poitou-charentes, engendrant une situation preoccupante du fait de l'absence de tout traitement curatif. Deux pistes ont ete ouvertes dans ce travail : (1) une strategie de lutte par l'emploi de substances naturelles presentant des proprietes antifongiques et (2) une approche des relations s'etablissant entre la vigne et le champignon. Eutypa lata presente une grande adaptabilite a son environnement physico-chimique (ph-temperature) et peut utiliser une grande variete de sources de carbone et d'azote pour sa nutrition. La cysteine, parmi d'autres composes soufres, s'est revelee nocive pour le mycelium, donc utilisable dans un traitement antifongique. Parmi les composes phenoliques testes (60), l'acide salicylique occupe une place privilegiee, presque unique, pour son efficacite a inhiber la croissance mycelienne, presentant meme une action fongicide. Cette action est specifique car une petite modification de la molecule diminue fortement son efficacite. 3 composes chlores peuvent etre egalement envisages pour mettre au point un traitement. L'emploi couple acide salicylique-cysteine montre un effet synergique tres significatif. Le champignon emet dans son milieu de culture, un facteur d'agressivite qui, apres separation chromatographique, se retrouve dans la fraction contenant les composes de masses moleculaires elevees notamment les proteines. Cette fraction agit sur la cellule vegetale a plusieurs niveaux : depolarisation membranaire, inhibition directe de l'h +-atpase plasmalemmique et du transport des assimilats, diminution de la respiration et de la photosynthese. De plus, cette fraction possede des proprietes elicitrices. Par comparaison, l'eutypine, toxine emise egalement par le champignon, hyperpolarise la membrane et n'a pas d'effet sur l'h +-atpase, augmentant seulement la conductance aux h + du plasmalemme et perturbant le transport actif des assimilats.

Les champignons du genre beauveria presentent une grande biodiversite. Ainsi, la souche b. Bassiana bb28 est pathogene d'ostrinia nubilalis, tandis que la souche b. Sulfurescens bs2 n'est pas pathogene mais secrete une entomotoxine puissante. L'amelioration genetique de beauveria a ete envisagee par la fusion de protoplastes. Des outils moleculaires ont ete developpes pour etudier la variabilite chez les souches parentales et pour suivre les genomes parentaux lors des fusions. Les techniques d'amplifications genique et de polymorphisme de longueueur des fragments de restriction ont permis d'obtenir des marqueurs incluant sept genes conserves dont pr1 codant pour une proteinase impliquee dans la penetration de la cuticule. L'etude des regions telomeriques des chromosomes de beauveria, avec une sequence telomerique clonee chez botrytis cinerea, a montre leur interet pour des etudes de structure des populations et de flux de genes. La mise au point de l'electrophorese en champ pulse chez beauveria a permis de mettre en evidence la flexibilite importante du genome. Des fusions de protoplastes entre bb28 et bs2 ont ete realisees dans le but d'obtenir des hybrides aux caracteristiques pathogenes et toxinogenes combinees. Parmi les hybrides interspecifiques stables obtenus, certains se sont averes hypervirulents validant l'interet de la fusion pour l'amelioration des champignons entomopathogenes. La caracterisation moleculaire des hybrides temoigne : (i) de l'intervention de la parasexualite, (ii) d'une ploidie proche de la diploidie et (iii) de la variabilite des structures moleculaires. Les caryotypes des hybrides ont indique la possibilite de rearrangements chromosomiques et l'existence de crossing-overs entre les telomeres de bb28 et bs2. Neanmoins, la recombinaison inter-chromosomique ne semble pas generale a l'ensemble du genome probablement du fait des differences genomiques entre b. Bassiana et b. Sulfurescens.

Nature chimique et role des metabolites actifs dans les milieux de culture (king b) de p. Tolaasii, bacteries des substrats du champignon de couche, agaricus bisporus. Le bicarbonate d'ammonium a ete isole des milieux de culture des deux bacteries, et son activite biologique sur la croissance et la sporulation de b. Cinerea a ete quantifiee. D'autres substances actives sont probablement excretees dans les milieux, comme l'ont montre les comparaisons avec les activites des milieux bacteriens bruts, qui sont differentes, surtout pour p. Tolaasii. Nature chimique et role des metabolites produits par les memes bacteries et actifs dans la "tache bacterienne" d'agaricus bisporus