Academic literature on the topic 'Champignons pathogènes – Variabilité'

Le champignon de couche, Agaricus bisporus (Lange) est sensible à divers pathogènes fongiques, dont Verticillium fungicola, l'agent de la môle sèche. Cette pathologie est responsable de dégâts importants dans les cultures commerciales. Une analyse moléculaire a montré que les isolats de V. Fungicola européens appartiennent à la variété fungicola et présentent une grande homogénéité génétique. Leur variabilité physiologique (sensibilité aux métabolites d'agaric et à un fongicide, agressivité) est supérieure à celle rapportée pour les isolats de variété aleophilum responsables de la maladie en Amérique de Nord. Les champignons malades présentent trois types de symptômes : la môle, masse de tissus indifférenciés, le sporophore à pied fendu, et le sporophore taché. Pour comprendre le développement de la maladie, ils ont été étudiés sur le plan morphologique (différenciation, couleur des tissus) et moléculaire (quantification de l'hôte par PCR en temps réel). Le premier stade morphologique réceptif au pathogène a été identifié. Les môles présentent une grande variabilité de niveau de contamination et de brunissement. Ce dernier ne bloque pas le pathogène mais est lié à une forte contamination. Les tissus d'aspect sain des sporophores tachés ou à pied attaqué sont contaminés. La transcription de gènes candidats pour l'interaction hôte- pathogène et le développement de la môle a été suivie par PCR en temps réel. Les gènes de laccase lcc2 et lcc3 et de tyrosinase AbPPO2 montrent une baisse, voire une perte, de régulation chez la môle par rapport à celle observée chez le champignon sain. Le gène de choc thermique hspA fortement exprimé dans la môle montre une réaction à l'infection
The button mushroom, Agaricus bisporus (Lange) is susceptible to various fungal pathogens, among which is Verticillium fungicola the causal agent of dry bubble. The disease is responsible for severe losses at the mushroom industry. Molecular analyses showed that the European isolates of V. Fungicola belong to the variety fungicola and exhibited great genetic homogeneity. They showed higher variability in physiological traits than the var. Aleophilum isolates responsible for dry bubble in North America. The disease causes three types of symptoms: bubbles (undifferentiated spherical masses), blowout stipes and spotty caps. In order to understand disease development, affected mushrooms were studied at the morphological (differentiation, tissue colour) and molecular level (host quantification by real-time PCR). The initial morphological stage susceptible to the pathogen was identified. Bubbles were highly variable in contamination level and tissue browning. The latter did not contain the pathogen but resulted from severe tissue ontamination. Healthy looking tissues of mushrooms with spotty cap or blowout stipe were infected. Real-time PCR was used to assess the transcription of genes potentially involved in host-pathogen interaction and bubble development. The laccase genes lcc2 and lcc3, and the tyrosinase gene AbPPO2 showed a repression, or an absence of regulation in bubbles compared to that in healthy sporophores. The activation of the heat shock gene hspA in bubbles revealed a reaction against infection

La maladie de la môle sèche d'Agaricus bisporus due à Verticillium fungicola a été étudiée. Les travaux présentés visent à produire des connaissances sur l'interaction. Les résultats d'analyses statistiques montrent une grande variabilité dans le développement de la maladie ; l'intensité dépend du taux d'inoculum du pathogène, du moment de la contamination ; de la sensibilité de la souche d'A. Bisporus, et des facteurs environnementaux. Les deux variétés connues de V. Fungicola : var. Fungicola et var. Aleophilum représentent deux pathotypes avec des capacités différenciées pour s'implanter dans l'environnement immédiat du mycélium d'A. Bisporus et induire la maladie. Pour la première fois, la présence simultanée d'activité laccase et tyrosinase a été révélée dans les primordia, et dans les môles. La similitude d'expression des PPO indique que V. Fungicola agit sur A. Bisporus en bloquant son programme de différenciation cellulaire de l'état végétatif à l'état fructifère
The dry bubble disease of Agaricus bisporus due to Verticillium fungicola has been studied. The aim was to produce knowledge on the interaction. Results of statistical analyses showed a high variability in the development of the disease; the intensity depended on the rate of inoculum's pathogen, contamination time; susceptibility of A. Bisporus' strain, and environmental factors. The two known varieties of V. Fungicola: var. Fungicola and var aleophilum, represent two geographically isolated pathotypes, and exhibited differentiated abilities to establish in the immediate environment of the mycelium of A. Bisporus and to induce the disease. The simultaneous presence of both laccase and tyrosinase activities were observed, for the first time, in both the primordia and dry bubbles. Due to the identity of PPO expression, it was concluded that V. Fungicola acts on A. Bisporus by blocking its program of cellular differentiation from the vegetative mycelium to the fruitbody

L'approfondissement des connaissances relatives aux relations entre coffea spp. Et hemileia vastatrix au moyen de l'etude de la virulence de l'agressivite et de variabilite au niveau de fragments d'adn d'un groupe de 11 isolats du champignon provenant d'afrique, de madagascar et d'indonesie, collectes sur c. Canephora, sur c. Arabica, et sur des derives de l'hybride de timor (catimor), a ete entrepris. L'analyse de la virulence des isolats collectes a permis d'observer une gamme de reactions differentielles sur six clones de c. Canephora. Deux clones de congusta (c. Congensis c. Canephora) ont montre des facteurs de resistance differents de ceux rencontres sur c. Canephora et sur c. Arabica. Les deux isolats provenant d'indonesie et recoltes sur catimor, ont montre le spectre de virulence le plus large, attaquant quelques plantes issues de l'hybride de timor, de catimor et plusieurs differentiels de c. Arabica. Les isolats d'indonesie ont manifeste une agressivite plus grande que la race ii et que les isolats provenant d'afrique. L'etude des fragments d'adn genomique n'a pas permis une distinction entre races. L'importance des resultats pour la distinction de nouveaux differentiels de coffea spp. Sont discutes, ainsi que la qualification de genotypes resistants ou sensibles sur la base de la sporulation

La lutte contre l'oidium des cucurbitacees repose essentiellement sur l'utilisation de fongicides et de varietes resistantes (pour le melon). Le developpement de strategies phytosanitaires efficaces et durables ne peut provenir que d'une connaissance de la diversite et de l'evolution des populations parasites responsables de la maladie. L'examen de plus de 400 echantillons de curcurbitacees parasitees, provenant de differentes regions du monde, a permis de verifier la presence des deux especes, erysiphe cichoracearum et sphaerotheca fuliginea, la seconde etant majoritairement presente dans les cultures. Des pathotypes ont ete caracterises sur concombre a, melon b, courgette c et pasteque d: ab, abc et bc chez e. Cichoracearum, ab et abc chez s. Fuliginea. L'etude de la diversite du pouvoir pathogene vis a vis de 9 varietes de melon a permis de detecter 2 races chez e. Cichoracearum et 5 chez s. Fuliginea (dont 2 nouvelles). L'analyse du determinisme genetique de la resistance a ete realisee sur deux cultivars de melon, pi 124112 et pi 414723. L'etude de la sensibilite des oidiums a 4 fongicides a necessite la mise au point d'une technique sur disques de cotyledons en plaque de microtitration. Les informations recueillies sur les 91 souches testees ont revele une grande diversite de phenotypes, une forte proportion de souches multiresistantes et une difference de comportement de chacune des especes vis a vis des fongicides inhibiteurs de la biosynthese des sterols. La diversite genetique des deux especes d'oidium a ete estimee sur 69 souches a l'aide de deux marqueurs moleculaires independants. La digestion de la region its par 11 enzymes de restriction n'a pas permis de mettre en evidence de variabilite intraspecifique chez s. Fuliginea contrairement a e. Cichoracearum. Une diversite genetique a ete observee chez les deux especes avec la technique de rapd. Aucun groupe de souches n'a pu etre degage chez s. Fuliginea. Trois groupes correspondant aux groupes its-rflp, et partiellement correles avec l'hote d'origine et la virulence des souches ont ete observes chez e. Cichoracearum. Enfin, le sequencage de la region its nous a permis de mesurer les distances genetiques existantes entre s. Fuliginea, e. Cichoracearum, oidium lycopersicon et e. Graminis