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Dissertations / Theses on the topic 'Chimiotaxis'
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1
Pérès, Eléonore. "La souris humanisée : modèle d'étude in vivo du processus leucémogène induit par HTLV-1." Thesis, Lyon, 2017. http://www.theses.fr/2017LYSEN043/document.
Full textAbstract:
La leucémie T de l’adulte (ATL), caractérisée par une prolifération dérégulée de lymphocytesT CD4+ activés, se développe chez des individus infectés par le virus T-lymphotropehumain (HTLV-1). Une période asymptomatique de plusieurs décennies sépare l’infection del’apparition des symptômes cliniques de l’ATL, rendant complexe la compréhension des étapesinitiales de la leucémogenèse. Le modèle de la souris humanisée dans laquelle est reconstituéun système hémato-lymphoïde humain est pertinent pour étudier ces étapes, depuis l’infectionpar HTLV-1 jusqu’à l’apparition de la lymphoprolifération. Grâce à ce modèle, mes travaux dethèse ont aidé à mieux comprendre deux mécanismes importants. D’abord, le rôle du chimiotactisme dans le contact cellule infectée-cellule non infectée in vivo. En inhibant la sécrétion de leukotriène B4, un chimioattractant, dans des souris humanisées et infectées, la charge proviraleest plus faible que celle des souris témoins et la prolifération des CD4+ activés est égalementréduite, soulignant le rôle du leukotriène B4 dans la primo-infection. Ensuite, j’ai étudié l’implicationdes protéines PDZ dans le processus leucémogène in vivo. En effet, certaines de cesprotéines, dont Scribble, interagissent avec le PBM (PDZ-domain Binding Motif) de la protéinevirale Tax. Des souris humanisées ont été infectées avec un provirus soit sauvage soit muté auniveau du PBM et j’ai montré, dès 5 semaines après infection, que l’interaction de ce domaineavec des protéines PDZ augmente la prolifération des CD4+ activés et perturbe l’expression degènes impliqués dans la prolifération, l’organisation du cytosquelette et des voies de l’apoptose.Ces résultats attestent du rôle du PBM de Tax dans le soutien de la lymphoprolifération in vivoHuman T-Cell Leukemia Virus 1 (HTLV-1) is the causative agent of Adult T-cell Leukemia(ATL) characterized by a deregulated proliferation of activated CD4+ T cells. An asymptomaticperiod of several decades separates the infection and the onset of the leukemia, complicating thestudy of the initial leukemogenic steps. Humanized mouse models are relevant to study thosesteps as these mice harbor human hemato-lymphoid cells that can be infected by HTLV-1.I used this animal model to better characterized two biological mecanisms during my thesis.First, the role of chemotaxis in infected-non infected cell contact in vivo. Inhibiting the secretionof leukotriene B4, a potent chemoattractant, in HTLV-1-infected humanized mice reduces theproviral load and the proliferation of activated CD4+ T cells. Those results establish the importanceof leukotriene B4 in HTLV-1 primo-infection. Next, I focused on the importance of thePDZ proteins in the leukemogenic process in vivo. The PDZ-domain Binding Motif (PBM) ofthe Tax viral protein interacts with several cellular PDZ proteins including Scribble. I infectedhumanized mice either with a wild-type or a PBM-mutated provirus of HTLV-1. I showed thatinteraction of the Tax PBM with PDZ proteins enhances activated CD4+ T cells proliferationfrom 5 weeks after infection and disrupts expression of genes implicated in cell proliferation,apoptotic processes and cytoskeleton organization. This study indicated that the PBM of Taxis important for sustaining the lymphoproliferation in vivo
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Voisinne, Guillaume. "Chimiotaxie chez E. Coli et D. Discoideum : experiences et modélisation." Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066546.
Full textAbstract:
La chimiotaxie désigne le mouvement actif et dirigé de micro-organismes en réponse à des stimuli extérieurs. Chez E. Coli, le comportement chimiotactique repose sur sa faculté à biaiser sa marche aléatoire résultant de l’alternance entre une phase de nage quasi-rectiligne (run) et une phase de réorientation abrupte (tumble). Nous quantifions la réponse chimiotactique de E. Coli directement à partir du biais instantané et l’explicitons en fonction des différents paramètres de la voie de signalisation. Nous inférons cette réponse à partir de trajectoires individuelles et des détections effectuées par E. Coli au cours de son mouvement. Cette méthode non invasive fournit des estimations précises de paramètres clés de la voie de signalisation chimiotactique. Ce type de méthode d’inférence est d’un intérêt général pour l’étude de processus stochastiques. Nous appliquons cette méthode à l’étude du mouvement diffusif de protéines membranaires évoluant au sein de microdomaines et montrons qu’elle fournit une estimation optimale, au sens de la théorie de l’information, de la diffusivité ainsi qu’une estimation des forces effectives responsables du confinement en microdomaines. L’amibe Dictyostelium discoideum (Dicty) possède la faculté de détecter la direction de gradients extérieurs d'AMPc (« directional sensing »). En accord avec des observations expérimentales récentes, nous introduisons un modèle minimal faisant intervenir un inhibiteur local possédant une dynamique de relaxation lente. Nous présentons des expériences permettant de tester plus spécifiquement la dynamique spatio-temporelle de cette réponse et les interprétons à l'aide du modèle introduitChemotaxis designates the active and directed movement of microorganisms in response to external cues in their environment. E. Coli performs chemotaxis by biasing its random walk, an alternation of smooth swimming phases (runs) and abrupt changes of direction (tumbles). We quantify the chemotactic response directly from the instantaneous bias and explicit this response in terms of the different parameters of the signaling pathway. Using individual trajectories and detections of chemicals, we infer the chemotactic response. This non invasive inference method provides sharp estimates of key parameters of the signaling pathway. This inference scheme is of general interest for the study of stochastic processes. We use an analog scheme to study the diffusive motion of biomolecules evolving in cell membrane microdomains and show that it offers optimal estimates of the diffusivity according to general Information Theory concepts along with estimations of the effective forces responsible for the confinement in microdomains. The amoeba Dictyostelium discoideum (Dicty) is able to detect the direction of external cAMP gradients (« directional sensing »). In line with recent experimental data, we introduce a minimal model with a slowly relaxing local inhibitor. This model reproduces adaptation, directional sensing, and amplification of the response. We present experiments allowing to test more specifically the spatio-temporal dynamics of the response. Our experimental results are interpreted using our minimal model
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Weng, Qilong. "Stabilité pour des modèles de réseaux de neurones et de chimiotaxie." Thesis, Paris Sciences et Lettres (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017PSLED026/document.
Full textAbstract:
Cette thèse vise à étudier certains modèles biologiques dans le réseau neuronal et dans la chimiotaxie avec la méthode d’analyse spectrale. Afin de traiter les principaux problèmes, tels que l’existence et l’unicité des solutions et des états stationnaires ainsi que les comportements asymptotiques, le modèle linéaire ou linéarisé associé est considéré par l’aspect du spectre et des semi-groupes dans les espaces appropriés, puis la stabilité de modèle non linéaire suit. Plus précisément, nous commençons par une équation de courses-et-chutes linéaire dans la dimension d≥1 pour établir l’existence d’un état stationnaire unique, positif et normalisé et la stabilité exponentielle asymptotique dans l’espace L¹ pondéré basé sur la théorie de Kerin-Rutman avec quelques estimations du moment de la théorie cinétique. Ensuite, nous considérons le modèle du temps écoulé sous les hypothèses générales sur le taux de tir et nous prouvons l’unicité de l’état stationnaire et sa stabilité exponentielle non linéaire en cas sans ou avec délai au régime de connectivité faible de la théorie de l’analyse spectrale pour les semi-groupes. Enfin, nous étudions le modèle sous une hypothèse de régularité plus faible sur le taux de tir et l’existence de la solution ainsi que la même stabilité exponentielle sont généralement établies n’importe la prise en compte du délai ou non, au régime de connectivité faible ou forteThis thesis is aimed to study some biological models in neuronal network and chemotaxis with the spectral analysis method. In order to deal with the main concerning problems, such as the existence and uniqueness of the solutions and steady states as well as the asymptotic behaviors, the associated linear or linearized model is considered from the aspect of spectrum and semigroups in appropriate spaces then the nonlinear stability follows. More precisely, we start with a linear runs-and-tumbles equation in dimension d≥1 to establish the existence of a unique positive and normalized steady state and the exponential asymptotic stability in weighted L¹ space based on the Krein-Rutman theory together with some moment estimates from kinetic theory. Then, we consider time elapsed model under general assumptions on the firing rate and prove the uniqueness of the steady state and its nonlinear exponential stability in case without or with delay in the weak connectivity regime from the spectral analysis theory for semigroups. Finally, we study the model under weaker regularity assumption on the firing rate and the existence of the solution as well as the same exponential stability are established generally no matter taking delay into account or not and no matter in weak or strong connectivity regime
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Mouynet, Pascale. "Fonction des polynucléaires et expression membranaire des molécules d'adhésion dans les parodonties à début précoce." Rennes 1, 1992. http://www.theses.fr/1992REN1B048.
Full text
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Rivas, Aloïs de. "Quelques expériences sur l'évaporation de spray dense et la chimiotaxie de la mite." Thesis, Aix-Marseille, 2017. http://www.theses.fr/2017AIXM0205/document.
Full textAbstract:
Ce manuscrit présente des études expérimentales sur l'évaporation de gouttes et la chimiotaxie de la mite.Une première partie s'intéresse à l'évaporation de spray dense au moyen d'une nouvelle approche, par analogie avec le mélange scalaire. Dans cette limite de forte densité en gouttes, où il y a saturation en vapeur au sein des structures constituantes, l'évaporation est principalement fonction de l'étirement auxquelles ces structures sont soumises. C'est en effet celui-ci qui conditionne le taux d'évacuation de cette vapeur interstitielle, ce qui permet de mettre les gouttes en contact avec un environnement plus sec, déclenchant ainsi leurs évaporations.Une deuxième partie s'intéresse à une application de la compréhension de cette dynamique d'évaporation de spray dense à un contexte d'entomologie: la chimiotaxie de la mite. Il s'agit du processus par lequel l'animal va se repérer dans un champ de concentration, pour localiser la source d'une substance attractive par exemple (ici de la phéromone sexuelle). Cette partie a tendu vers l'obtention d'une visualisation conjointe de la trajectoire de l'animal et du champ de concentration sous-jacent par la visualisation des gouttesThis thesis present some experiments on droplets evaporation and moth chemotaxis.In a first part, dense spray evaporation is explained through a new approach, drawing an analogy with scalar mixing. In this high density droplets limit, where vapor saturation is reached within the structures, evaporation is mainly controlled by the intensity at which these structures are stretch. It is indeed the stretching that controls the rate at witch interstitial vapor is evacuated: droplets are thus in contact with a dryer environment, so they can start to evaporate.A second part take an interest in applying dense spray evaporation dynamic understanding to an entomologist situation: moth chemotaxis. This is the process by which animals find their way in a concentration field, such at finding a chemoattractant source for instance (sexual pheromone in our case). This part tended towards visualizing animal trajectory and concentration field underlying through droplets visualization simultaneously
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Chamoun, Georges. "ÉTUDE MATHÉMATIQUE ET NUMÉRIQUE DE MODÈLES EN CHIMIOTAXIE-FLUIDE ET APPLICATIONS À LA BIOLOGIE." Phd thesis, Ecole Centrale de Nantes (ECN), 2014. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01015918.
Full textAbstract:
Les résultats présentés dans ce mémoire sont dédiés à l'étude théorique et numérique de modèles en chimiotaxie-fluide motivés par un large éventail de phénomènes biologiques comme la chimiotaxie de populations cellulaires dans un fluide. Les deux premiers chapitres de cette thèse portent sur la chimiotaxie dans un fluide au repos. Au début, on généralise un schéma de volumes finis au cas de modèles isotropes de Keller-Segel avec des coefficients diffusifs scalaires généraux sur des maillages admissibles. Ensuite, on propose et on étudie un schéma monotone combinant les méthodes de volumes finis et d'éléments finis non conformes et permettant une discrétisation efficace et robuste de modèles de Keller-Segel avec des tenseurs diffusifs anisotropes hétérogènes sans imposer des conditions restrictives sur le maillage du domaine en espace. Les deux derniers chapitres sont dédiés à l'étude théorique (existence globale, unicité) et l'étude numérique (extension de la méthode combinée) du système chimiotactisme-fluide complet constitué d'équations chimiotaxiques anisotropes couplées aux équations de Navier-Stokes modélisant un fluide incompressible. Ce couplage s'effectue à travers les termes décrivant d'un part le transport des cellules vivantes et du chimio-attractant par le fluide et d'autre part la force gravitationnelle exercée par ces organismes vivants sur le fluide. Les travaux de cette thèse ont donné lieu à l'écriture d'un code de calcul très développé en Fortran 95 afin de valider nos résultats par des simulations numériques.
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Pina-Seguin, Karinne de. "Caractérisation du mécanisme de détection du nickel et de transduction du signal chez Escherichia coli." Lyon, INSA, 1996. http://www.theses.fr/1996ISAL0065.
Full textAbstract:
Le nickel est un constituant essentiel des trois hydrogénases membranaires, indispensables à la croissance anaérobie d'Escherichia coli. Récemment, un système de transport spécifique du nickel, codé par l'opéron nik, a été mis en évidence au laboratoire. Il est constitué de cinq protéines présentant des homologies avec les composants des systèmes de transport bactériens de type ABC. NikA est la protéine périplasmique fixatrice du nickel. Nous avons surproduit et purifié la protéine NikA par chromatographie hydrophobe et échangeuse d'ions. Des études par spectrométrie de fluorescence intrinsèque de la protéine NikA et de dialyse en flux continu ont montré que le nickel se fixe, de façon spécifique, sur NikA avec une très forte affinité (Kd inférieur ou égal à 0,1 micro-molaire) et avec une stoechiométrie de 1/1. Nous avons également démontré l'implication de NikA dans chimiotactisme négatif vis-à-vis du nickel. Nous avons isolé, par insertion du transposon Tn10, un mutant touché au niveau du gène nikR qui code le répresseur du système de transport du nickel. Le gène nikR, situé en aval du locus nik, code une protéine de 15 kDa dont la séquence présente des homologies significatives avec les protéines Fur de diverses bactéries impliquées dans la régulation des systèmes de transport du fer. Le gène nikR a été inactivé sur plasmide par insertion d'une cassette uidA-kan, puis recombiné dans le chromosome. Le mutant ainsi obtenu présente une expression constitutive de NikA. Nous avons surproduit et partiellement purifié NikR par chromatographie d’affinité au nickelNickel is an essential component of the three membrane-bound hydrogenases which are necessary for the anaerobic growth of Escherichia coli. Recently, a specific nickel uptake system, encoded by the nik operon has been described in our laboratory. It consists of five proteins homologous to the components of the bacterial ABC uptake systems. NikA is the periplasmic nickelbinding protein. We overproduced and purified NikA by hydrophobic and ion exchange chromatography. Quenching of intrinsic protein fluorescence and dialysis methods showed that NikA binds one atom of nickel per molecule of protein with high affinity (Kd less than 0. 1 micromolar). We also demonstrated the implication of NikA in chemotaxis away from nickel. The nik operon is negatively controlled by an excess of nickel. Using Tn10 transposon insertion mutagenesis, we isolated a mutant affected in the nikR gene which encodes the repressor for the specific nickel transport system. In this mutant, expression of the nik operon was no longer repressed. The nikR gene, located downstream the nik locus, directs the synthesis of a 15 kDa protein whose sequence presents significant homologies with the Fur proteins involved in the regulation of ferric uptake systems of various bacteria. The nikR gene was inactivated on a plasmid by insertion of an uidA-kan cassette, and then recombined into the chromosome. As expected, the mutant obtained expressed NikA constitutively. We overproduced and partially purified NikR by affinity nickel chromatography
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El-Haloui, Nour-Eddine. "Incidences de la mobilité et du chimiotactisme sur la compétitivité chez Rhizobium meliloti." Lille 1, 1985. http://www.theses.fr/1985LIL10056.
Full textAbstract:
Dans la première partie du travail, l'influence de la mobilité et du chimiotactisme sur la compétitivité est étudiée après isolement de mutants affectés sur ces caractères et préparés à partir de la souche de Rhizobium meliloti Ve26. Trois types de mutants ont été isolés : un mutant non mobile (mob-), un mutant non chimitactique (che-) et un mutant hypermobile (mob+). Toutes les souches étudiées ont été rendues résistantes à des antibiotiiques différents afin de pouvoir les identifier dans les trsts biologiques. De tels marquages n'ont pas provoqué d'altération de leurs propriétés symbiotiques. En milieu liquide, les mutants ne présentent pas de différence de leur infectivité et de leur efficience par rapport au type sauvage parental. En substrat solide (essais en mini-serre expérimentale), la mobilité et le chimitactisme confèrent un avantage compétitif incontestable lors d'inoculations mixtes de souches de R. Meliloti. La seconde partie du travail concerne l'étude de la compétitivité d'une autre souche de R. Meliloti (2011) avec les mutants de la souche Ve26 (mob+ et mob-). Un effet antagoniste pour la nodulation entre la souche 2011 et le mutant Ve26 mob- est mis en évidence ; l'importance de la mobilité est de toute première importance puisque cet effet est "masqué" quand la souche 2011 est inoculée avec le mutant Ve26 mob+.
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Eyraud, Anne. "Étude de la réponse chimiotactique des polynucléaires neutrophiles chez le rat : impact des macrolides." Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO1W241.
Full text
10
Morel, Mathieu. "Développement de dispositifs microfluidiques pour l'étude du guidage axonal en molécules uniques." Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066753.
Full textAbstract:
Le fonctionnement de notre système nerveux repose sur l’établissement d’un réseau complexe de connexions neuronales au cours de l’embryogenèse et sur le maintien de ces circuits au cours de la vie adulte. C'est la présence de molécules de guidage qui permet aux axones de s'orienter correctement soit par attraction, soit par répulsion, et d'établir ainsi un réseau entre cellules nerveuses. Les recherches effectuées au cours de cette thèse de doctorat ont porté sur la détection des molécules de guidage par le cône de croissance, l’extrémité motile de l’axone, et sur sa capacité à répondre à un signal directif de très faible intensité. Dans un premier temps, nous avons développé des microsystèmes de stimulation utilisant la technologie microfluidique, compatibles avec la culture primaire de neurones et l’imagerie en molécule unique. Ceux-ci permettent de générer rapidement des gradients stables et contrôlés afin d’analyser la dynamique cellulaire en fonction des paramètres d’un signal chimique et de faire des mesures parallélisées sur plusieurs neurones. Nous avons alors utilisé ces « puces » pour étudier la distribution de récepteurs uniques diffusant sur la membrane du cône de croissance. Nous avons ainsi pu caractériser quantitativement les processus d’amplification et de filtrage temporel durant la détection d’un gradient de GABA en fonction des paramètres de ce gradient. Les résultats expérimentaux ont été confrontés à un modèle biophysique basé sur la diffusion libre des récepteurs membranaires et sur leur interaction transitoire avec le cytosquelette.
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Lombard, Jean-Yves. "Étude de l'effet de trois fluoroquinolones et de la spiramycine sur le chimiotactisme des neutrophiles humains." Lyon 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LYO1T081.
Full text
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Vereycken, Valérie. "Mécanique de la motilité cellulaire : mouvement d’un neutrophile humain active dans une micropipette." Paris 6, 1996. http://www.theses.fr/1996PA066427.
Full textAbstract:
La motilité cellulaire, déplacement spontané d’une cellule en direction d’une source chimique (chimiotactisme), est l’un des phénomènes les plus intéressants de la biologie cellulaire. Dans cette thèse, la mécanique avec ses principes et méthodes est mise en œuvre pour apporter un éclairage nouveau sur le mouvement unidirectionnel d’un globule blanc (le polynucléaire neutrophile) humain, cellule en première ligne de la défense immunitaire. Un polynucléaire neutrophile est forcé à migrer dans une micropipette de verre (diamètre de 5m) dans laquelle s’installe, par diffusion, un gradient de concentration d’une substance chémoattractante (fMLP). Le dispositif expérimental est conçu pour observer le déplacement du neutrophile en fonction du temps. Pour une concentration initiale de fMLP de 9. 10#-#7 M ont été déterminées, à partir d’observations microscopiques d’une part, la vitesse libre moyenne (0. 155 0. 04 m/s, 68 neutrophiles) et, d’autre part, la force moyenne (39 4NN, 9 neutrophiles) qu’il faut appliquer au neutrophile pour stopper son mouvement. D’un point de vue phénoménologique, le neutrophile se comporte comme un véhicule constitué d’un tracteur et d’une remorque attelée. Le tracteur a une caractéristique traction-vitesse linéaire, la remorque, contenant le noyau de la cellule, n’oppose pas de résistance au mouvement. Nous avons montré que la polymérisation de l’actine globulaire contenue dans la cellule était impliquée dans le mouvement ; ce que nous avons confirmé en réalisant la fragmentation du neutrophile. Enfin, nous proposons un possible mécanisme intracellulaire générant la force motrice du neutrophile.
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Lopez, Daniel. "Comportements collectifs de bactéries en géométrie contrôlée et sous l'effet de la centrifugation." Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066614.
Full textAbstract:
Escherichia coli est une bactérie dotée de flagelles lui permettant de se mouvoir dans un liquide. Les trajectoires de ce mouvement sont analogues à celles d'une marche aléatoire à 3 dimensions. Capable de puiser l'énergie de son environnement pour maintenir son mouvement, elle est un paradigme active autopropulsée. Les systèmes de particules actives autopropulsées ont déjà fait l'objet de nombreuses études mais le comportement de ces systèmes soumis à un champ de force homogène est encore mal compris. Ce travail a premièrement consisté à développer un dispositif exprimental afin de pouvoir visualiser l'influence de la centrifugation sur une population de bactéries. Les résultats reproductibles obtenus sur les profils d'équilibre de sédimentation nous ont permis de proposer un modèle de sphère solide afin de décrire le comportement de ce système. Par ailleurs, dans des géométries confinées, les bactéries E. Coli sont capables grâce à leur chimioactisme de se déplacer collectivement. Elles peuvent alors former des ondes de concentration. Ce travail a permis de déterminer comment de telles ondes de concentration réagissaient à des perturbations provoquées par des variations géométriques de l'environnement. L'ensemble des résultats expérimentaux obtenus peuvent être interprétés avec des arguments qualitatifs simples. Finalement nous confrontons ces résultats expérimentaux à ceux obtenus par des simulations issues de modèles cinétiquesEscherichia coli is a flagellated bacterium. It swims in liquids following trajectories that are all well described by a 3D random walk. E. Coli uptakes energy from its environment in order to maintain its movement, therefore it's an example of self-propelled particle (SPP). Many systems of SPP have been studied but it's still not clear how these systems react under a homogeneous force field. In this work we have designed an exprimental setup to study the effect of centrifugation on a bacteria population. We have obtained reproducible results of sedimentation profiles at equilibrium. These results are well described in a hard sphere model framework. In confined geometries, E. Coli bacteria are able to move collectively using their chemotaxis. It can lead to the formation of concentration waves. In the second part of this work, we have determined how these bacterial waves react to perturbations induced by geometrical changes of their environment. All experimental results can be interpreted with simple qualitative arguments. Finally we compare these with those obtained by experimental simulation results from kinetic models
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Maman, Louis. "Effets du Piroxicam sur les exsudats inflammatoires prélevés dans la cavité pleurale du rat." Paris 5, 1988. http://www.theses.fr/1988PA05M047.
Full text
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Cutolo, Pasquale. "Etude de l'interaction structurelle et fonctionnelle entre la chimiokine CXCL12 et ses récepteurs : CXCR4 et ACKR3/CXCR7." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLS550/document.
Full textAbstract:
L'axe formé par la chimiokine CXCL12 et son récepteur CXCR4 est conservé chez les vertébrés où il joue un rôle important dans l'embryogenèse et la vie adulte, régule de nombreux processus des réponses immunitaires grâce à ses fonctions dans la migration cellulaire, la survie et la prolifération.En outre, cet axe est impliqué dans les processus pathologiques tels que les cancers (croissance et métastase) et immunodéficiences ainsi que des dysfonctionnements (par exemple l'expression dérégulée, polymorphismes ou mutations) et est également détourné par certains agents pathogènes (par exemple le virus de l'immunodéficience humaine, virus du papillome humain).Un grand groupe de travail est consacré à cette paire comme cible thérapeutique, mais seulement un composé (à savoir Plérixafor) a atteint l'approbation pour une utilisation clinique faisant le potentiel de cet axe comme cible de médicament encore inexploré.Bien que cet axe est l'objet d'un grand intérêt, des questions demeurent quant aux déterminants structurels impliqués dans l'interaction CXCL12/CXCR4.Cependant, la structure récemment résolue par diffraction de CXCR4 a donné quelque indice au sujet de ces questions, et au delà, la possible stoichiométrie entre CXCL12 et CXCR4.Plusieurs éléments de preuve appuient le concept que les formes CXCR4 homo- et hétéro- oligomères (qui peut contribuer à la diversité des fonctions de récepteur), telles que la structure de diffraction, le gain de fonction d'un récepteur CXCR4 mutant responsable du syndrome WHIM et la modulation allostérique des fonctions de CXCR4 par CXCR7 (ACKR3), le second récepteur de CXCL12. La possibilité de former des oligomères ouvre de nombreuses questions en matière de CXCL12 et ses interactions avec CXCR4 et CXCR7/ACKR3. La stoichiométrie de cette interaction reste une question ouverte, comme le récepteur est capable de former des oligomères avec le même récepteur ou autre récepteurs, en particulier CXCR7/ACKR3. Ce récepteur, connu comme scavenger, n'a pas de structure résolue et son mécanisme d'interaction avec CXCL12 reste inconnu.Afin d'étudier les interactions CXCL12/CXCR4/CXCR7, nous avons appliqué plusieurs techniques de modélisation moléculaire tels que peptid-peptide docking et simulations de dynamique moléculaire.Objets du projet ont étés : la résolution des possibles formes stoichiométriques de l'interaction CXCR4/CXCL12 (modélisation moléculaire, docking et dynamique); la modélisation de la structure du récepteur CXCR7/ACKR3 et son interaction avec CXCL12 (homology modeling), avec caractérisation des domaines et des résidus clef de l'activation des pathways de signalisation en aval du récepteur (mutants CXCR7/ACKR3); l'étude et la caractérisation de nouveaux outils innovants pour la détection de l'oligomerisation de ces récepteurs en conditions endogènes. (Nanobodies, HTRF)Les résultats du premier objectif ont été publiés en janvier 2016 : PMID 26813575.La modélisation de CXCR7/ACKR3 nous a permit de générer plusieurs mutants du récepteur pour tester nos hypothèses sur l’activation.Les nanobodies caractérisés pour CXCR4 seront utilisé dans une deuxième étude pour l’identification des formes oligomériques du récepteur sur tissus et cellulesThe axis formed by the chemokine CXCL12 and its receptor CXCR4 is conserved in vertebrates where it plays an important role in embryogenesis and adult life, regulates many processes of immune responses through its functions in cell migration, survival and proliferation.In addition, this axis is involved in pathological processes such as cancers (growth and metastasis) and immune deficiencies and malfunctions (eg deregulated expression, mutations or polymorphisms) and is also hijacked by certain pathogens (eg HIV, human papilloma virus).A large working group is dedicated to this pair as a therapeutic target, but only a compound (ie Plerixafor) achieved approval for clinical use by the potential of this area as a drug target unexplored.Although this axis is the subject of great interest, questions remain about the structural determinants involved in CXCL12 / CXCR4 interaction.However, the recently resolved diffraction structure of CXCR4 gave some clue about these questions, and beyond possible stoichiometry between CXCL12 and CXCR4.Several lines of evidence support the concept that forms CXCR4 homo- and hetero-oligomers (which can contribute to the diversity of the receptor functions), as shown in the diffraction structure, the gain function of a mutant CXCR4 receptor responsible for the syndrome WHIM and allosteric modulation of CXCR4 functions by CXCR7 (ACKR3), the second receptor of the chemokine CXCL12. The ability to form oligomers opens many issues of CXCL12 and its interaction with CXCR4 and CXCR7 / ACKR3.The stoichiometry of this interaction still remains an open question, as the receptor is capable to form oligomers with the same receptor or other receptors, particularly CXCR7 / ACKR3. This receptor, known as scavenger, has not solved structure and the mechanism of interaction with CXCL12 is unknown.To study the interactions CXCL12 / CXCR4 / CXCR7, we applied several molecular modeling techniques such as peptide-peptide docking and molecular dynamics simulations.Objectives of this project were: the resolution of the different stoichiometric forms for the interaction of CXCR4 and CXCL12 (molecular modeling, docking and dynamic); modeling the CXCR7 / ACKR3 receptor structure and its interaction with CXCL12 (homology modeling), with the characterization of domains and residues key in the activation of downstream signaling pathways of the receptor (CXCR7 / ACKR3 mutants); the study and characterization of new innovative tools for the detection of oligomerization of these receptors in endogenous conditions. (Nanobodies, HTRF)The results of the first objective were published in January 2016: PMID 26813575.Modeling of CXCR7 / ACKR3 allowed us to generate several mutants of the receptor to test our hypothesis about the activation pathways.Nanobodies were fully characterized for CXCR4 to be used in a second study to identify oligomeric forms of the receptor in tissues and cells
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Er-Raki, Abdelouahed. "Importance du rôle physiopathologique du fibroblaste dermique dans les phénomènes inflammatoires liés au psoriasis." Toulouse 3, 1993. http://www.theses.fr/1993TOU30018.
Full textAbstract:
Le psoriasis est une dermatose erythemo-squameuse qui s'accompagne d'une keratinisation anormale associee a une activite mitotique epidermique fortement augmentee. Les interactions cellulaires entre l'epiderme et le derme sont des evenements majeurs et indispensables a une differenciation optimale de la peau. Le but de notre travail a ete d'apprecier le role des fibroblastes dermiques dans 3 evenements majeurs du psoriasis: le stress oxydatif, l'hyperproliferation des keratinocytes et le recrutement des cellules immunitaires. Avec la technique de pick et mizel que nous avons adopte aux fibroblastes, les resultats obtenus montrent que la biosynthese d'anion superoxide par les fibroblastes psoriasiques (f. Pso), est augmentee par rapport aux fibroblastes normaux (f. Nor) et que cette liberation est proportionnelle au temps. Le dosage de la superoxide dismutase a montre que le taux de cette enzyme est diminue dans les f. Pso. Les essais de migration des polynucleaires humains in vitro ont montre que les f. Pso sont capables de liberer un ou plusieurs facteurs chimiotactiques. Nous avons montre que ces facteurs sont de nature proteique. Nous avons montre que les milieux conditionnes des f. Pso contiennent des facteurs capables d'induire une hyperproliferation des keratinocytes humains in vitro. Par deux types de dosage, biologique et radio-immunologique, nous avons montre que les f. Pso sont capables de liberer l'interleukine 1 beta. Ces resultats suggerent que les f. Pso sont dans un etat d'activite plus importance que les f. Nor au niveau de la synthese; d'anion superoxide, de certains facteurs induisant l'hyperproliferation des keratinocytes, de certains facteurs chimiotactiques responsables du recrutement des cellules immunitaires au site inflammatoire psoriasique. Ce travail a mis en evidence le role important et incontestable des fibroblastes dans la pathogenese du psoriasis. On pense alors que tout traitement de cette maladie doit tenir compte de ces alterations des fonctions biologiques des fibroblastes dermiques
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Voisset, Edwige. "Etude de l'implication des protéines fes et fer dans la signalisation des recepteurs à activité tyrosine kinase kit et FLT3." Aix-Marseille 2, 2008. http://theses.univ-amu.fr.lama.univ-amu.fr/2008AIX22027.pdf.
Full textAbstract:
La recherche de nouveaux acteurs de la signalisation du récepteur tyrosine kinase KIT, nous a conduit à étudier les protéines tyrosine kinase cytoplasmiques FES et FER. Trois projets ont émané de cette identification. Une première étude a porté sur le récepteur oncogénique KITD816V (mutant retrouvé chez la majorité des patients atteints de mastocytose). Dans ce contexte, FES est phosphorylée sur tyrosines, reflétant son activation constitutive. De plus, en aval de ce récepteur, FES est un régulateur positif de la prolifération cellulaire et plus précisément, cette kinase est impliquée dans la transition des phases G1/S du cycle cellulaire. Au plan moléculaire, FES n’est pas nécessaire à l’activation de la MAP Kinase p38, mais pour celles des protéines STAT et p70S6K. Alors que l’action de FES sur la phosphorylation des STAT semble dépendante du modèle d’étude, son action sur la p70S6K s’avère toujours être une régulation positive. De plus, en aval de KITD816V, FER n’est pas impliquée dans la prolifération cellulaire. Un deuxième sujet tente de déterminer la ou les fonction(s) de FES dans le contexte du récepteur KITWT. Ainsi, nous avons déjà pu montrer que FES interagissait avec KIT stimulé par son ligand et que selon la même cinétique, FES était activée. Ces deux événements sont d’une part, relativement tardifs et d’autre part, transitoires. D’un point de vue fonctionnel, FES et FER interviennent dans le chimiotactisme en réponse au SCF mais pas dans la prolifération cellulaire. Un troisième travail a été mené sur les rôles des protéines FES et FER en aval du récepteur oncogénique FLT3ITD (mutation majoritaire chez les patients atteints de LAM). Pour ces deux kinases, leurs activations sont dépendantes du contexte oncogénique induit par FLT3ITD. L’absence de FES ou de FER dans le système FLT3ITD provoque une diminution de la prolifération cellulaire. Dans le cas de FER, cet effet est consécutif à des défauts de transition entre les phases G1/S et G2/M du cycle cellulaire. Dans le cas de FES, sa présence semble nécessaire à la survie cellulaire. Au niveau moléculaire, ces deux protéines sont des régulateurs positifs de l’activation de STAT5 et des protéines en aval de la PI3Kinase. Ces études ont donc conduit à révéler les protéines FES et FER comme des effecteurs indispensables en aval des récepteurs KIT et FLT3.
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Courdouhji, Mohamed Kamal. "La phosphatase alcaline et les fonctions des polynucléaires neutrophiles sanguins : leur étude chez le mouton sain et au cours de carences expérimentales en zinc chez l'agneau." Toulouse, INPT, 1986. http://www.theses.fr/1986INPT005A.
Full textAbstract:
L'auteur étudie la PAL et quelques fonctions des polynucléaires neutrophiles du mouton au cours de carences expérimentales en zinc, dans le double but de mieux connaître la physiopathologie d'une carence importante en nutrition animale et de chercher des éléments intéressants la pathologie comparée médicale et chirurgicale. Après un rappel concernant la PAL et les fonctions PN, l'auteur présente ses méthodes d'étude puis les résultats obtenus chez le mouton sain. Il donne les caractères physicochimiques de la PAL granulocytaire ovine en remarquant surtout son insensibilité à la L-phénylalanine et à l'urée, sa forte inhibition par l'EDTA et par homoarginine, propriétés qui la rattachent au type d'isoenzyme hépatique/osseux/rénal et se très forte instabilité thermique. De plus, les études électrophorétiques sur gel de polyacrylamide en gradient de concentration montrent que la PAL des PN du mouton est du type isoenzyme M, constituée de trois sous unités, de poids moléculaire total 620 000 daltons. L'exploration du chimiotactisme par migration sous gel d'agarose et celle de la production d'anion superoxyde par la réduction du ferricytochrome c donnent des résultats satisfaisants. La phagocytose de S. Cerevisiae par les PN du sang total est assez peu précise mais a l'avantage de la simplicité.
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Saragosti, Jonathan. "Chimiotactisme collectif de Escherichia coli." Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066329.
Full textAbstract:
La bactérie Escherichia coli nage dans les liquides au moyen de ses flagelles en suivant une trajectoire qui est une marche aléatoire ˆ trois dimensions. Celle-ci est biaisée en réponse ˆ des gradients chimiques. Ce microorganisme chimiotactique peut ainsi s'orienter vers les sources de nourriture et établir une communication avec ses congénères lorsqu'il sécrète des molécules attractives. Dans des géométries confinées, où les gradients chimiques peuvent persister, les bactéries s'attirent ainsi mutuellement alors que la population dans son ensemble migre la recherche de nutriments. On observe alors des fronts de migration dont la dynamique complexe a fait l'objet de nombreux travaux théoriques initiés par Keller et Segel. Ce travail de thèse a consisté tout d'abord en la réalisation d'un montage expérimental permettant une étude quantitative de ces phénomènes. La bonne reproductibilité des expériences nous a permis d'une part de caractériser ce comportement collectif dans différentes conditions, mais aussi d'obtenir des informations sur les mouvements individuels au sein des fronts de migration. En particulier, nous avons pu mettre en évidence une modulation chimiotactique et active de la réorientation de ces bactéries le long de leurs trajectoires dans des gradients chimiques. En l'absence de ces gradients, nous montrons qu'un mécanisme effectif de diffusion rotationnelle permet de donner une description de ces phases de réorientation aléatoire. Tout au long de cette thèse, nous avons confronté nos résultats ˆ un modèle cinétique original qui intègre les observations expérimentales faites aux échelles individuelle et collective dans la description de ces phénomènes.
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Ouannes, Nesrine. "Évolution et adaptation de comportements de créatures artificielles dans un écosystème simulé." Thesis, Toulouse 1, 2015. http://www.theses.fr/2015TOU10043.
Full textAbstract:
De par son enjeu écologique important, l’étude des relations des êtres vivants entre eux et avec leur environnement est un défi majeur de la biologie. Le travail de cette thèse s’inscrit dans le cadre de la vie artificielle, domaine scientifique destiné à l’étude du vivant par la création de phénomènes naturels dans des systèmes de synthèse. Le but de la recherche consiste à exploiter la force des techniques évolutionnaires pour faire émerger des comportements de créatures artificielles, dans un écosystème simulé. La problématique générale de cette thèse est de faire évoluer des créatures artificielles capables de comportements de recherche de nourriture. Deux modèles ont été développés. Le premier modèle consiste à exploiter la chimiotaxie bactérienne afin de surmonter les problèmes de détection des ressources (ou de l’environnement). La voie chimiotactique d’une cellule est modulée par une approche hybride qui utilise un modèle algébrique de l’activité des groupes récepteurs, et des équations différentielles pour la dynamique d’adaptation, ainsi qu’un modèle métabolique qui convertit des nutriments en biomasse. Dans la partie résultats, nous avons développé une certaine analyse du mouvement obtenu à partir de certaines bactéries et leur influence sur le comportement de la population évoluée. Nous avons pu constater que le processus évolutif améliore la capacité des bactéries à réagir dans leur environnement ainsi que leurs capacités de croissance leur permettant de mieux survivre. Ensuite, nous avons étudié l’effet de la communication bactérienne qui permet de faire émerger de nouvelles espèces, et qui explore la dynamique des colonies. Certains des comportements obtenus ont été testés dans des environnements différents afin de montrer la façon dont la communication bactérienne peut affecter leurs comportements. Le deuxième modèle est celui du développement de créatures 3D physiquement simulées (les herbivores) qui se nourrissent des ressources disponibles dans leur milieu. Un algorithme génétique couplé à un réseau de neurones artificiel ont été mis en œuvre afin de garantir l’émergence de certains de ces comportements tels que la recherche de nutriments qui sont disposés à différents endroits dans l’écosystème artificiel. Le processus évolutif utilise les propriétés physiques des créatures virtuelles et une fonction multi-objective externe qui mèneront aux comportements espérés. L’expérience consistant à faire évoluer des créatures virtuelles possédant des capacités de locomotion montre que ces créatures virtuelles tentent d’obtenir au moins une des sources alimentaires disposées sur leurs trajectoires. Nos meilleures créatures sont capables d’atteindre plusieurs sources alimentaires durant le temps imparti à la simulationBecause of its important ecological underpinnings, the study of interactions between animals as well as with their environment is a research area of major interest in Biology. The work in this thesis belongs to the field of Artificial Life, a scientific discipline devoted to the study of natural phenomena inherent to living organisms by reproducing them by synthetic means. The aim of this research is to exploit the power of evolutionary techniques to cause behaviors of artificial creatures to emerge in a simulated ecosystem. The overarching problematic of this thesis is to evolve foraging behaviors in artificial creatures. Two models have been developed. The first model exploits bacterial chemotaxis to overcome the problem of resource detection (or features in its environment). The cell chemotactic pathway is modulated by a hybrid approach that reproduces the receptor group activity using an algebraic model, the adaptation dynamics using differential equations, as well as a metabolic model that converts nutrients into biomass In the results section, we developed a type of analysis of motion from selected bacteria and their influence on the evolved population’s behavior. We observed that the evolutionary process improves the bacteria’s capacity to react to their environment as well as their ability to grow, effectively improving their ability to survive. We then studied the effect of bacterial communication that allows new species to emerge, which exploits colony dynamics. Some of the obtained behaviors have been tested in separate environments in order to show how inter-bacterial communication can impact their behavior. The second model is about the development of 3D physically realistic creatures (herbivores) that feed on resources available in their environment. A genetic algorithm coupled to a neural network guarantees the emergence of a variety of behaviors such as the search of nutrients that are spread across the virtual ecosystem. The evolutionary process takes advantage of the virtual creature’s physical properties and an external multimodal fitness function to lead to the expected behaviors. Experiments designed to evolve virtual creatures displaying locomotion abilities shows that they attempt to reach at least one of the food sources placed on their trajectory. Our best creatures are able to reach multiple food sources within the imparted simulation time
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Lambert, Karine. "Implication d'un motif dileucine de l'hélice VIII du récepteur de haute affinité du LTB4 dans la chimiotaxie du neutrophile dépendante de RhoA." [S.l. : s.n.], 2007.
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Sbaa, Elhem. "Effet du SDF-1 et de la matrice extracellulaire sur la migration des cellules souches hématopoi͏̈étiques saines et leucémiques." Rouen, 2002. http://www.theses.fr/2002ROUES037.
Full textAbstract:
Les événements cellulaires qui conduisent à la migration des cellules souches hématopoi͏̈étiques saines et malignes sont contrôlés par de nombreux facteurs tels que les cytokines, les chimiokines et les éléments de la matrice extracellulaire. Nous nous sommes intéressés à l'effet de la chimiokine SDF-1 sur le chimiotactisme des deux types cellulaire. Nous avons montré que la fibronectine (FN) augmente l'effet chimiotactique du SDF-1. Cette augmentation est due à l'amplification par le complexe intégrines/FN des voies de signalisation induites par le SDF-1. Nous avons étudié l'implication de certains fragments de la FN dans la migration. L'activité de la FN peut être localisée dans de courte séquence telle que CS-1, CS-5 et RGD. Le fragment III1-C inhibe l'effet chimiotactique de SDF-1. En effet, ce fragment inhibe l'expression de CXCR-4, induit la translocation de la GTPase RhoA vers le cytoplasme, provoque la désorganisation de l'actine et empêche la phosphorylation de FAK par le SDF-1The cellular events that lead to migration of normal and leukemic hematopoietic stem cells were controlled by multiple factors like cytokines, chemokines and the components of the extracellular matrix. The stromal cell derived factor-1 (SDF-1) is a chemokine that induces migration of these two types of cells. In this study, we demonstrated that fibronectin (FN) enhanced the SDF-1-dependent chemotactic effect. Our results suggested that the complex FN/integrin amplify signals pathways induced by SDF-1. We have demonstrated that FN activity can be localized to very short sequences of few amino acids such as CS-1, CS-5 and RGD. We also showed that III1-C fragment of FN inhibited the chemotactic effect of SDF-1. In fact, this fragment decreased the expression of CXCR-4, induced the translocation of RhoA from the cell membrane to the cytoplasm, disorganize the distribution of the actin and finally decreased the amount of FAK phosphorylation in the presence of SDF-1
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Legendre, Benjamin. "Etude comparative structurale et fonctionnelle de CCL18 recombinant humain produit par la cellule CHO et E. Coli." Lille 2, 2010. http://www.theses.fr/2010LIL2S004.
Full textAbstract:
En France, de 20 à 25% de la population générale souffre d’une maladie allergique. Les allergies respiratoires sont au premier rang des maladies chroniques de l’enfant. La prévalence de l’asthme est en constante augmentation, elle était de 2 à 3 % il y a 15 ans, contre 5 à 10% aujourd’hui. Près de 2000 décès sont recensés chaque année du fait d’un asthme, dont plus de 10% chez les enfants, les adolescents et les adultes de moins de 45 ans. L’asthme allergique implique la migration de cellules à profil Th2 ainsi que d’éosinophiles vers la muqueuse bronchique, qui jouent un rôle déterminant dans l’installation de l’inflammation chronique des voies respiratoires. Ce trafic leucocytaire est orchestré par un réseau complexe de chimiokines. Parmi celles-ci, CCL18 semble jouer un rôle clé. En effet, CCL18 est préférentiellement exprimé au niveau pulmonaire, essentiellement par les macrophages et les cellules dendritiques. Son expression est augmentée par des cytokines dites Th2, et est capable d’attirer et d’activer les lymphocytes Th2 et B, ainsi que les cellules dendritiques immatures. Bien que son récepteur n’a toujours pas été identifié, nous savons que la signalisation induite pas CCL18 est médiée par un récepteur couplé aux protéines G. A l’instar des autres CC-chimiokines, CCL18 possède potentiellement 2 ponts disulfures entre les cystéines Cys10-Cys34, et Cys11-Cys50, lui conférant sa conformation. CCL18 contient également une séquence consensus de fixation à l’héparine BBXB (ou B représente un acide aminé basique) qui permet de retenir la chimiokine à la surface cellulaire riche en glycosaminoglycanes. Cependant, CCL18 circule dans le flux sanguin à hauteur de 30 ng/mL chez les sujets sains, jusqu’à 75 ng/mL chez les patients asthmatiques, et à plus de 1000 ng/mL chez les patients atteints de la maladie de Gaucher. CCL18 a été purifié chez l’homme, et il a été montré qu’adjoint à la forme entière (1-69), mature, on retrouve diverses isoformes, tronquées en N (3-69 et 4-69) ou C terminal (1-68). De plus, le mélange des isoformes 1-69 et 1-68, obtenu à partir de plasma humain, a montré des propriétés chimiotactiques. Actuellement, le moyen le plus courant pour étudier le CCL18 est l’utilisation d’une chimiokine entière (1-69) produite par un organisme procaryote : E. Coli. Ainsi, nous avons voulu étudier les fonctions et la structure d’un CCL18 dérivé d’un organisme eucaryote (la cellule CHO), et les comparer à celles de la chimiokine dérivée de E. Coli. Nous avons montré que le CCL18 produit par la cellule CHO correspond bien à la forme entière 1-69, dont la masse concorde avec la masse théorique de CCL18 humain, à l’instar du CCL18 produit par E. Coli. Cependant, nous avons établi que le CCL18 produit par la cellule CHO présente bien 2 ponts disulfures entre les cystéines Cys10-Cys34, et Cys11-Cys50, alors que le CCL18 produit par E. Coli ne possède que le pont entre les cystéines Cys11-Cys50. Les tests en chimiotaxie sur des lymphocytes T naïfs et des basophiles, ainsi que les tests d’histaminolibération, ont montré que la concentration d’activité maximale de la CCL18 produit par la cellule CHO est de 10-9M, contre 10-7M pour la CCL18 produit par E. Coli. Nous avons également démontré que la réduction du pont Cys10- Cys34 dans la CCL18-CHO entraine la diminution de son activité biologique, à des niveaux équivalents de ceux observés pour la CCL18- E. Coli. Finalement, cette étude a permis de mettre en relief le lien direct entre l’activité biologique de la chimiokine et du premier pont disulfure de sa structure. Ce pont devenant par la même une cible potentielle dans la cascade de régulation de la chimiokine, et ouvrant de nouvelles perspectives pour l’identification de son récepteur
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Mhedbi-Hajri, Nadia. "Approches cumulées de phylogénie et d'écologie pour déterminer les bases génétiques de la spécificité d'hôte des bactéries phytopathogènes, cas des Xanthomonas spp." Angers, 2010. http://www.theses.fr/2010ANGE0057.
Full textAbstract:
La spécificité d'hôte est le résultat de plusieurs phases d'interaction avec l'hôte : attraction, multiplication, colonisation et transmission. Nous avons émis l'hypothèse que la spécificité d'hôte se dessine dès les étapes précoces d'attraction et d'adhésion. Pour tester cette hypothèse, nous avons sélectionné les gènes codant des senseurs du chimiotactisme (MCPs) et des régulateurs à deux composants, des transporteurs TonBdépendants et des adhésines, et avons déterminé leur distribution dans une collection de 173 souches appartenant à différents pathovars de Xanthomonas spp. Ayant des gammes d'hôtes différentes. Les résultats obtenus montrent que la majorité des pathovars (28/34) présente des répertoires uniques et propres de ces gènes candidats, indiquant une corrélation entre le répertoire des gènes candidats et la gamme d'hôte. Six pathovars non individualisés partagent chacun leur répertoire avec seulement un autre pathovar. Ces similarités pourraient refléter des spécificités écologiques communes. Les analyses de séquences des gènes codant les senseurs du chimiotactisme et les adhésines ont révélé la présence de signaux de sélection positive dans la divergence adaptative entre les espèces de Xanthomonas spp. Au sein de l'espèce X. Axonopodis, les gènes candidats sont soumis à une pression de sélection positive ou purificatrice. La pression de sélection positive s'exerce sur des sites appartenant à des domaines fonctionnels de ces protéines. Ces résultats suggèrent que la pression de sélection purificatrice agirait sur les gènes impliqués dans la reconnaissance de molécules végétales communes alors que la pression de sélection positive agirait sur les gènes impliqués dans la reconnaissance de molécules spécifiques d'une niche particulière. Ces résultats révèlent que la spécificité d'hôte se dessine dès les étapes précoces d'attraction et d'adhésion à la plante. Les études phylogénétiques et généalogiques menées sur les souches de X. Axonopodis confirment l'existence de sous-groupes au sein de cette espèce et indiquent une divergence très ancienne pour certains d'entre eux. Malgré un long isolement de ces sous-groupes, de nombreux échanges de matériel génétique ont été identifiés et associés à des transferts de gènes codant des facteurs de virulence. Les résultats présentés montrent l'importance de la perception de l'environnement et de l'adhésion dans les interactions entre les bactéries phytopathogènes et les leurs plantes hôtesHost specificity combines distinct successive phases of interaction between bacteria and host plant: attraction, ability to multiply on or inside the host and transmission to new hosts. We hypothesized that determinants responsible for bacterial host specificity are expressed starting from chemotactic attraction by host tissues and adhesion. We established the distribution of 70 genes involved in chemotactic attraction, chemical environment sensing and adhesion in a large collection of xanthomonad strains. These 173 strains belong to different pathovars of Xanthomonas spp and display different host ranges. Most pathovars (28/34) were characterized by unique repertoires of candidate genes highlighting a correspondence between pathovar clustering and repertoires of sensors and adhesins. In contrast, six pathovars may display the same repertoire. This may reflect common ecological behaviors. To further challenge our hypothesis, we tested for molecular signatures of selective pressures on genes encoding chemotactic sensors and adhesins of xanthomonad strains. We identified strong evidence of adaptive divergence acting on most candidate genes. Within X. Axonopodis, candidate genes were identified to be under purifying selection or positive selection. Most of sites under positive selection were located in conserved domains within proteins. These finding suggest that purifying selection may act on genes involved in recognition of common structures of plant tissues and positive selection may act on genes coding for sensors and adhesins used for colonization of specific niches. These findings provide new insights in the evolutionary importance of chemotactic attraction and adhesion in the host specificity of plant pathogenic bacteria. Thus, events leading to host specificity may occur as early as chemotactic attraction by host and adhesion to tissues for plant pathogenic xanthomonads. Phylogenetical and genealogical analyses conducted on X. Axonopodis strains strongly supported clustering of these strains into 6 subgroups corresponding to known subgroups within this species and indicated that the divergence between some subgroups is very ancient. Furthermore, recombination events due to genetic exchanges have been found to occur recently in X. Axonopodis strains and some were associated to transfers of virulence-associated genes. All these data support the importance of perception of the environment and adhesion in the plant-microbe interactions
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Lacroix, Olivier. "Etude préliminaire pour l'application en routine d'un test de chimiotaxie aux acides aminés utilisé pour la détection de l'altération de la perméabilité chez les entérobactéries." Paris 5, 1991. http://www.theses.fr/1991PA05P153.
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Lambert, Karine. "Implication d'un motif dileucine de l'hélice VIII du récepteur de haute affinité du LTB[indice inférieur 4] dans la chimiotaxie du neutrophile dépendante de RhoA." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2007. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/3881.
Full textAbstract:
La chimiotaxie des leucocytes implique plusieurs évènements structurels et biochimiques bien organisés. Nous avons étudié les voies de signalisation intracellulaires menant à la migration des neutrophiles impliquant le récepteur de haute affinité du LTB[indice inférieur 4], le BLTI, ainsi que la relation structure-fonction de la huitième hélice alpha du récepteur dans la migration des neutrophiles. Des neutrophiles humains de même que la lignée cellulaire humaine pro-myéloide PLB-985 transfectée de façon stable avec l'ADNc du BLTI humain (PLB-BLT) ou des mutants de substitution de l'hélice 8 du BLTI et différenciée en type neutrophile ont été utilisés lors de cette étude. Tous les récepteurs mutés étaient exprimés à la membrane plasmique à un niveau similaire au récepteur BLTI de type sauvage, déterminé par cytométrie de flux. Les réponses chimiotactiques vers le LTB[indice inférieur 4] étaient similaires pour les PLB-BLT différentiés et les neutrophiles. Cependant, les réponses chimiotactiques des mutants de l'hélice 8 du BLTI vers le LTB[indice inférieur 4] étaient significativement réduites. Le prétraitement des cellules PLB-BLT différenciées et des neutrophiles avec la toxine de pertussis ou les inhibiteurs pharmacologiques de la P13K ou de pl60-ROCK réduisait leur migration vers le LTB[indice inférieur 4], indiquant l'implication de G[alpha][indice inférieur i], P13K et RhoA dans la chimiotaxie induite par le LTB 4 . Les neutrophiles et les PLB-BLT différenciés répondait au LTB[indice inférieur 4] en adoptant une morphologie polarisée, avec la F-actine dans un pseudopode situé au pôle avant et des complexes contractiles actine-myosine à l'arrière et aux côtés de la cellule.La stimulation de cellules PLB-BLT 2L(304-305)/A différentiées avec le LTB[indice inférieur 4] menait à une formation de multiples pseudopodes accompagnée par une perte de migration. Le phénotype de multiples pseudopodes se produisait aussi quand les cellules PLB-BLT étaient transfectées de façon transitoire avec un dominant négatif de RhoA ou prétraitées avec l'inhibiteur de p160-ROCK, Y-27632. Le défaut de migration observé chez les cellules PLB-BLT 2L(304-305)/A était corrigé par la transfection transitoire avec une forme constitutivement active de RhoA. En résumé, nos résultats suggèrent un rôle essentiel du motif dileucine distal de l'hélice 8 du BLT1 dans l'activation de RhoA et permettant la migration normale des neutrophiles induite par le LTB[indice inférieur 4.
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Desaulniers, Philippe. "Étude des réponses phagocytaires et chimiotactiques du neutrophile humain dans des modèles in vitro." Thesis, Université Laval, 2006. http://www.theses.ulaval.ca/2006/23334/23334.pdf.
Full textAbstract:
Le neutrophile humain est impliqué dans la première ligne de défense du corps humain.
Pour jouer ce rôle le neutrophile doit se rendre au site inflammatoire et phagocyter les
agents microbiens. L’objectif de cette étude est d’étudier les mécanismes impliqués lors
de la chimiotaxie des neutrophiles et la phagocytose. Les résultats obtenus permettent
d’identifier plusieurs voies de signalisation impliquées dans ces deux réponses majeures
du neutrophile et décrivent des différences majeures entre les signaux chimiotactiques
qui permettent une spécialisation de la réponse.
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Lambert, Ambroise. "Etude de la motilité et du chimiotactisme chez les leptospires." Paris 7, 2014. http://www.theses.fr/2014PA077117.
Full textAbstract:
Leptospira interrogans sensu lato est responsable de la leptospirose une zoonose de répartition mondiale. L'homme est un hôte accidentel de cette maladie, il est contaminé par contact d'une peau lésée avec des sols et/ou des eaux contaminés par la bactérie. Les travaux présentés dans ce mémoire concernent l'étude du rôle du chimiotactisme et de la motilité des leptospires dans leur virulence ainsi que dans leur physiologie. Dans un premier temps, nous avons développé des outils de mesure du comportement motile des leptospires. Nous avons mis au point un essai par capillaire couplé à une quantification des bactéries entrées dans les capillaires par PCR en temps réel. Cette méthode a permis de mettre en évidence de nombreux attractants des leptospires comme le sucrose, le glucose ou encore le Tween 80. Cet essai a démontré des différences de chimiotactisme entre la souche pathogène et la souche saprophyte. Pour analyser plus précisément la motilité, nous avons développé un outil de vidéomicroscopie permettant de reconstituer les trajectoires des leptospires. Afin d'étudier le rôle de la motilité et du chimiotactisme dans la virulence des leptospires, nous avons utilisé une banque de mutants obtenus par mutagénèse aléatoire. Plusieurs mutants issus de cette banque présentaient une insertion dans un opéron codant pour deux protéines FlaA. Nous avons pu démontré que les mutants qui n'exprimaient plus les deux protéines F1aA n'étaient plus motiles et étaient avirulent. L'étude de ces mutants a aussi révélé une structure unique du flagelle des leptospires au sein des spirochètes. L'analyse en microscopie électronique de la structure du flagelle des mutants a indiqué que les protéines F1aA ne participent pas à la formation de la gaine du flagelle, contrairement aux autres spirochètes. Enfin, nous avons étudié deux autres mutants présentant une insertion du transposon dans un opéron du chimiotactisme chez l'espèce pathogène. L'étude de mutants aléatoires obtenus dans les deux premiers gènes de l'opéron en utilisant l'essai par capillaire, a indiqué un rôle critique de ces gènes dans le chimiotactisme de la bactérie. L'ensemble de ces résultats suggère une motilité atypique des leptospires au sein des bactéries et un rôle de la motilité dans la virulence de la bactérie. L'étude de la motilité et du chimiotactisme des leptospires réalisée au cours de cette thèse devrait permettre une meilleure compréhension du rôle de ces mécanismes dans la virulence des leptospires. Ces travaux ouvrent la voie à l'analyse des mécanismes de biologie cellulaire responsables de l'asymétrie des flagelles chez les spirochètes et pourraient permettre de démontrer l'existence de mécanismes bactériens uniquesLeptospira interrogans is the causative agent of leptospirosis, a zoonotic disease contracted through contact of an abraded skin with contaminated soil or water. Leptospires have a single flagellum inserted sub terminally at each pole, wrapping around the protoplasmic cylinder and extending towards the middle of the cell without overlapping. Chemotaxis is defined by the movement of an organism toward or away from a chemical compound. Attractants induce a movement toward themself and repellents induce a movement away from themself. I developed a capillary tube assay combined with real-time PCR. This strategy led to the characterization of several new chemoattractants of Leptospira spp. . We also showed significant differences in the chemotactic behaviour between pathogenic strain and the aquicole non pathogenic strain. Inactivation of an operon containing the two leptospiralfiaA genes had no effect on sheath morphology. However, further analysis of the flagellum confirmed that mutants lacking both FlaA proteins had an altered helicity, whereas the Wild-Type flagellum that is coiled. In addition I showed by scanning electron microscopy that this mutant lacked his hook shaped ends morphology confirming also that the flagellar coil is involved in cell ends morphology. Animal experimentations using both gerbil and hamster as acute model of leptospirosis showed that mutant lacking both FIaA proteins that was not able to translate failed to colonize target organs like kidney or liver and did not cause death while Wild-Type strain and the other mutant killed ail animais. Additionally, I explored chemotaxis involvement in the pathogenesis caused by L. Interrogans which had not been previously studied. Our findings suggest for the first time that chemotaxis regulatory system might be involved in assymetrical coordination of flagellar motor and virulence of L. Interrogans which was consistent with the previous findings obtained during my doctoral experience indicating that motility was involved in virulence. Finally, these data set the basis for the comprehensive analysis of the motility regulatory mechanisms and their function in Leptospira spp. Physiology
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Bouzigues, Cédric. "Dynamique de récepteurs uniques du GABAA dans le cône de croissance : rôle dans la détection des signaux de guidage." Paris 7, 2006. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00120620v3.
Full textAbstract:
Lors du développement du système nerveux, les axones en croissance choisissent une direction d'extension avec précision. Ce processus est permis par la détection sensible de signaux de guidage par les récepteurs membranaires de la membrane du cône de croissance. Nous avons étudié la dynamique de récepteurs individuels du GABA marqués par des nanocristaux fluorescents. Les récepteurs répartis également dans la membrane d'un cône de croissance soumis à un gradient de GABA sont spécifiquement redistribués vers sa source. Cette réorganisation est due à des interactions avec les microtubules déplaçant les récepteurs vers les régions à forte concentration de GABA, mises en évidence sur les trajectoires des récepteurs. Son rôle fonctionnel a été révélé par la mesure d'une amplification de l'asymétrie de la concentration intracellulaire de calcium, qui régule l'organisation du cytosquelette. Ces observations permettent l'élaboration d'un modèle d'auto-organisation des récepteurs, permettant une amplification du signal extérieur. Une faible activation asymétrique des récepteurs induit une asymétrie de concentration de calcium et de l'organisation du cytosquelette. Ceci crée une boucle de rétroaction positive en favorisant la redistribution, qui renforce le signé induit par le gradient en amplifiant l'asymétrie de la concentration de récepteurs et de calcium. L'auto-organisation des récepteurs est décrite par un système d'équations stochastiques étudiées numériquement et analytiquement. Les travaux présentés permettent de proposer un mécanisme général d'amplification de signaux extérieurs dans l'axone en croissance et dans les systèmes chémotactiques ou polarisésDuring the development of the nervous System, extending axons choose accurately their directions of growth. This step relies on the sensitive detection of guidance cues by receptors in the membrane of the growth cone. We studied the dynamics of single GABA receptors tagged by fluorescent nanocrystals. The receptors are initially homogeneously distributed in the growth cone membrane and are specifically relocalized toward the source when submitted to a GABA gradient. This reorganization is due to interactions with the microtubules that have been identified by single receptor trajectory analysis and that displace the receptors toward regions of high GABA concentration. The functional role of this phenomenon has been revealed by the measurement of a receptor redistribution induced an amplification in the asymmetry of calcium concentration. These results support a model of receptor self-organization providing an amplification of the external signal. A weak asymmetric activation of receptors causes a weak asymmetry of calcium concentration and of the cytoskeleton organization. This creates a positive feedback loop by favouring receptor redistribution that amplifies the gradient induced signal by enhancing the asymmetry in the calcium concentration. The self-organization of the receptors can be correctly described by a System of stochastic equations that has been analytically and numerically studied. This study provides a general mechanism of amplification of external signals in growing axons and also in chemotactic or polarized Systems
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Belot, Marie-Pierre. "Effets de la progestérone sur la migration des matocytes HMC-1(560) en réponse à la chimiokine CXCL12 et sur leur prolifération spontanée." Paris 11, 2006. http://www.theses.fr/2006PA114827.
Full textAbstract:
Les mastocytes sont des cellules du système immunitaire impliquées dans les réactions inflammatoires. Ils sont associés à différentes pathologies caractérisées par une augmentation locale de leur nombre. Les hormones ovariennes jouent un rôle sur les fonctions et le recrutement des mastocytes. La chimiokine SDF-1/CXCL12 est un facteur clé du recrutement des cellules du système immunitaire. Sur la lignée HMC-1560 de mastocytes humains, nous avons montré que la progestérone (1nM-1µM) diminue la migration des HMC-1560 en réponse à CXCL12 parallèlement à une diminution des signaux induit par CXCL12 et à la diminution de l’expression de CXCR4, récepteur de CXCL12. La progestérone réduit aussi la prolifération spontanée des HMC-1560 consécutivement à un blocage des cellules en phase G0/G1 du cycle cellulaire. Enfin, nous avons mis en évidence une augmentation par la progestérone de l’expression de Csk Homologous Kinase (CHK)The presence of mast cells in tissues implicated in many physiological functions and their accumulation is associated with several diseases. Mast cells recruitment in tissues depends on microenvironmental factors and hormones. On HMC-1560 human mast cells, progesterone significantly reduced cell migration towards CXCL12, a chemokine. Cells incubated with progesterone showed no rearrangment of actin filaments following the addition of CXCL12. The hormone also reduced the calcium response to CXCL12 and Akt phosphorylation. The amount of CXCR4 (mRNA, total protein) and the amount of membrane-bound protein were about reduced by progesterone. The spontaneous proliferation of HMC-1560 mast cells was also diminished up to 50%, with arrest in G1. This inhibition was accompanied by down regulation of phosphorylated Raf-1 and p42/44 MAPKs, and in parallel Csk Homolgous Kinase (CHK), an inhibitor for the Src-family members, was increased
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Gaudry, Murielle. "Rôle de la protéine kinase C cytosolique dans les activités fonctionnelles des polynucléaires neutrophiles humains." Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112183.
Full textAbstract:
La thèse rapporte un ensemble de données sur les relations entre une activation de la protéine kinase C et deux activités fonctionnelles du polynucléaire neutrophile humain (PN) : le déplacement et l'explosion oxydative.
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Confavreux, Antoine. "Optimisation des conditions de migration et de détachement de lignées cancéreuses du cancer du sein en vue de leur tri fonctionnel." Thesis, Lyon 1, 2014. http://www.theses.fr/2014LYO10209/document.
Full textAbstract:
Cette thèse concerne l'étude des propriétés de migration et de détachement de lignées cancéreuses du cancer du sein de type mésenchyme, très métastatique et invasif (MDA-MB-231), ou au contraire de type épithélial et peu invasif (MCF-7). Des techniques de vidéomicroscopie et d'analyse d'images automatisées ont été utilisées afin de tirer des informations sur la dynamique cellulaire sur de grandes populations. Nos expériences sur la migration aléatoire des cellules MDA-MB-231 montrent que les propriétés de déplacement de celles-ci sont liées à la fois à la composition de leur milieu environnant, mais aussi à la nature et la quantité de protéines d'adhésion. Nous avons notamment mis en évidence un comportement biphasique de la distance migrée au cours du temps en fonction de la densité de protéines adsorbées sur des surfaces pour deux types de protéines d'adhésion (collagène type IV et fibronectine). Selon le type de protéines d'adhésion, nous avons également mis en évidence un phénotype cellulaire très différent en termes de forme, d'adhésion et de mode de déplacement. Nous avons ensuite utilisé ces résultats pour mettre en place un protocole de migration dirigée de cellules cancéreuses dans un gradient chimiotactique généré par un système microfluidique. Ainsi, en faisant varier les paramètres du système (protéines de surface, concentration maximale en chimioattractants, …), nous avons pu caractériser les bonnes conditions d'obtention de la migration dirigée. Pour finir, nous avons montré la faisabilité d'un tri cellulaire entre cellules de type mésenchyme et épithéliales en utilisant la chimiotaxie à partir de ces systèmesThis thesis investigates migration and detachement properties of different types of breast cancer cell lines : metastatic, invasive MDA-MB-231 and epithelial, low-invasive MCF-7 celles. Videomicroscopy and image analysis techniques were used to obtain dynamic information for large cell populations. Random migration assays performed on MDA-MB-231 cells reveal that their migration properties are related to both medium and surface (substrate adhesion protein type and quantity) conditions. A biphasic behavior for the migrated distance through time was observed to be dependent on the density of adsorbed protein (collagen type IV or fibronectin) on the substrate. Cell shape, detachement and moving properties were also computed as a function of the surface protein characteristics. These results were then used to perform directed migration assays in a chemotactic gradient generated in a microfluidic chamber. Optimal conditions for directed migration of cells were determined by varying the parameters of the system such as gradient maximum concentration, substrate adhesion protein… Lastly, it was experimentally proved that it is possible to separate cancer epithelial cell lines from mesenchymal ones by using chemotactic microfluidic chambers
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Altinoglu, Ipek. "Organization of Bacterial Cell Pole." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018SACLS367/document.
Full textAbstract:
Chez les bactéries, les pôles cellulaires servent de domaines subcellulaires impliqués dans plusieurs processus cellulaires. Chez l’agent pathogène du choléra, Vibrio cholerae, en forme de bâtonnet incurvé, le pole contenant l’unique flagelle est impliqué dans la virulence. La protéine d’ancrage polaire HubP interagit avec plusieurs ATPases telles que ParA1 (ségrégation des chromosomes), ParC (localisation polaire du système de chimiotaxie) et FlhG (biosynthèse des flagelles), organisant ainsi l'identité polaire de V. cholerae. Cependant, les mécanismes moléculaires exacts de cet ancrage polaire doivent encore être élucidés. L’objectif de cette thèse est d’établir une vue d'ensemble de l'organisation de pôle cellulaire ce qui implique le mécanisme d’orchestration des différentes fonctions cellulaires par l’identification de l’ensemble des partenaires d'interaction de HubP ainsi que la cartographie fine du pôle cellulaire par microscopie à super résolution (PALM). Afin d’identifier de nouveaux partenaires d'interaction de HubP, j'ai étudié la différence de composition en protéines polaires entre les contextes HubP+ et HubP-. La composition en protéines polaires a été quantifiée de manière relative et absolue en ajoutant des Tag isobares aux protéines extraites de mini-cellules. Ces mini-cellules correspondent des petits compartiments cellulaires issus d’un évènement de division anormal proche du pole et sont enrichies en protéines polaires. Parmi ~800 protéines identifiées, ~ 80 protéines ont été considérées comme enrichies en contexte HubP+ incluant de nombreuses protéines attendues (FlhG, ParC et en aval des protéines de chimiotaxie). J'ai étudié la localisation de 14 protéines par microscopie à fluorescence et pu révéler 4 nouvelles protéines présentant une localisation polaire dépendant de HubP : VbrX, VbrY, et 2 protéines hypothétiques MotV et MotW. La délétion de motV et motW provoque un défaut significatif de propagation dans une gélose molle suggérant une implication dans la chimiotaxie et/ou la motilité. Alors que la microscopie électronique a montré que les deux mutants ont bien un flagelle polaire unique, le suivi-vidéo de leur déplacement a révélé que les deux mutants présentaient des défauts de nage assez distincts: ∆motV est plutôt affecté dans le changement de direction et ∆motW dans la vitesse de déplacement. Des expériences de microscopie fluorescente ont montré que MotV, MotW et HubP présentaient des dynamiques de localisation polaire distinctes au cours du cycle cellulaire. Pour une observation fine du pôle cellulaire par PALM, de nouveaux outils d’analyse d’image à haut débit étaient exigés. La précision des contours des petites cellules bactériennes faiblement contrastées n’est pas suffisante par l’observation en fond clair, j'ai développé une nouvelle technique de marquage avec des protéines fluorescentes photo-activables pour un tracé précis de la membrane interne ou du périplasme. En outre, nous avons créé un logiciel utilisant Matlab appelé Vibio qui intègre le contour de cellule et la liste des molécules obtenues par microscopie à super résolution. La capacité d’analyse à haut débit du logiciel permet d’étudier la distribution des molécules de l’échelle de la cellule unique à une population en orientant les cellules par leur courbure longitudinale. J’ai pu révéler que HubP est principalement localisé du côté convexe du pôle de la cellule, tandis que ses partenaires se situaient principalement au milieu du pôle. Mon travail de thèse a révélé avec succès de nouveaux partenaires d'interaction de HubP et la fonction de certaines protéines dans la motilité cellulaire. J'ai développé une nouvelle technique de microscopie pour une localisation subpolaire précise qui fonctionne bien pour l'analyse d'images PALM dans Vibio. J’ai ainsi pu faire progresser les connaissances de l’orchestration des fonctions polaires chez V. choleraeIn rod shaped bacteria, cell poles serve as important subcellular domains involved in several cellular processes including motility, chemotaxis, protein secretion, antibiotic resistance, and chromosome segregation. In the cholera pathogen Vibrio cholerae, vibrioid rod shape and single polarized flagellum involve in the virulence. Polar landmark protein HubP was shown to interact with multiple ATPases, such as ParA1 (chromosome segregation), ParC (polar localization of chemotaxis apparatus), and FlhG (flagella biosynthesis), thus organizing the polar identity of V. cholerae by tethering proteins to cell pole. However, the exact molecular mechanisms are yet to be elucidated. In this thesis, I tackled to unveil comprehensive view of the cell pole organization which implies the orchestration of different cellular functions, by identifying further interaction partners of HubP as well as drawing conceivable picture of the cell pole by super-resolution photoactivated localization microscopy. To identify new interaction partners of HubP, I used minicells in which cell poles were enriched as they derived from cell division near the cell pole. Difference in protein composition between HubP+ and HubP- minicells were examined by isobaric tags for relative and absolute quantitation. Among ~800 proteins identified, ~80 proteins were considered to be enriched in HubP+ minicells including many expected proteins (FlhG, ParC and downstream chemotaxis proteins). I chose 14 proteins to investigate their subcellular localization with fluorescent microscopy. In conclusion, I discovered 4 proteins that showed polar localization in a HubP-dependent manner. These proteins are VbrX, VbrY, and 2 hypothetical proteins MotV and MotW. ∆motV and ∆motW showed significant defect in a diameter of travel in soft agar plate that suggesting the possible involvement in chemotaxis and/or motility. Whereas electron microscopy showed that both mutants possess intact monotrichous flagellum, video-tracking revealed that the two mutants showed rather distinct defects during swimming: MotV is rather turning mutant while MotW is a speed mutant. Fluorescent microscopy experiments indicated that MotV, MotW and HubP showed distinct polar dynamics over cell cycle. For fine-scale observation of the cell pole by PALM, it was appreciated that novel tools for high-throughput analysis was demanded. Since brightfield images are not sufficient to have accurate contours of small and low contrast bacterial cells, I developed new labeling technique with photoactivatable fluorescent proteins for precise outlining at either inner membrane or periplasm. Furthermore, we created Matlab-based software called Vibio which integrates cell outline and the list of molecules obtained by super-resolution microscopy. High-throughput capability of the software enabled to analyze distribution of detected molecules from single cell to whole bunch of cells in a manner that cells are oriented by cell curvature. These allowed me to discover that HubP is mostly lopsided at the convex side of the cell pole, while its partners mostly located middle of the pole. Altogether, I successfully unveiled 4 novel interaction partners of HubP. I revealed of the function of hypothetical proteins that are involved in cell motility. I developed new labeling technique for precise polar localization that works well for PALM image analysis in Vibio. Therefore, I observed precise polar localization of HubP and other polar proteins
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Vaillancourt, Myriam. "Implication de la lipide phosphatase SHIP1 dans les voies de signalisation du CD32A dans le neutrophile humain." Thesis, Université Laval, 2005. http://www.theses.ulaval.ca/2005/22931/22931.pdf.
Full text
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Nabil, Karim. "Identification et caractérisation d'une protéine chimiotactique pour les monocytes humains." Nancy 1, 1997. http://www.theses.fr/1997NAN19005.
Full textAbstract:
Lors d'une étude effectuée dans notre laboratoire, nous avons constaté la présence d'une importante activité chimiotactique pour les monocytes (MCA) dans les effusions pleurales malignes par rapport aux effusions pleurales non malignes et aux plasmas. Parmi ces effusions pleurales malignes, celles associées à des mésothéliomes sont significativement plus actives. Dans le but d'identifier cette MCA, nous avons procédé par séparations chromatographiques successives : chromatographie d'échange d'anions, chromatographie d'échange de cations, chromatographie en phase inverse et chromatographie en gel d'exclusion. Nous avons ainsi purifié une protéine monomérique de 150 kDa, chimiotactique pour les monocytes et dans une moindre mesure, pour les granulocytes. Le séquençage N-terminal montre que la protéine purifiée présente une analogie de 100 % avec le Facteur H, sur les quatorze acides aminés déterminés, quoique nous ayons eu des difficultés à bien identifier la Cystéine en position 3. [. . . ]
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Gallant, Maxime. "Production de prostaglandine D[indice inférieur 2] par les ostéoblastes humains[ressource électronique] : augmentation de la chimiotaxie et diminution de la production d'ostéoprotégérine par la liaison aux récepteurs CRTH2 et DP." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2004. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/3369.
Full textAbstract:
Les effets des prostaglandines sur le métabolisme osseux sont définis principalement par les actions de la prostaglandine E[indice inférieur 2] sur les cellules osseuses. Cependant, peu de données existent sur les effets possibles des autres prostaglandines sur le métabolisme osseux. Considérant l'hypothèse que d'autres prostaglandines produites lors d'une réaction inflammatoire (ex.: prostaglandine D[indice inférieur 2] ) pourraient jouer un rôle encore inconnu dans le métabolisme osseux, nous avons décidé de caractériser les récepteurs de la PGD[indice inférieur 2] chez les ostéoblastes humains primaires en culture, ainsi que la production de PGD[indice inférieur 2] par ces mêmes cellules, pour finalement caractériser certaines actions physiologiques de l'activation de ces récepteurs sur les ostéoblastes. Nous voulions ensuite démontrer si la PGD[indice inférieur 2] produite par les ostéoblastes pouvait agir directement sur ces cellules. Nous concluons que la PGD[indice inférieur 2] est produite par les ostéoblastes humains primaires, et que ces cellules expriment de façon fonctionnelle les récepteurs DP et CRTH2. Nos résultats démontrent que la PGD[indice inférieur 2] peut agir en tant qu'autacoïde sur les ostéoblastes humains"--Résumé abrégé par UMI.
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Idohou, Nicole. "Étude in vitro de l'effet des lipoprotéines de très basse densité sur les fonctions du polynucléaire humain : application à l'étude du mécanisme d'action d'un immunomodulateur, le Biostim®." Paris 11, 1990. http://www.theses.fr/1990PA114852.
Full text
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Pourié, Grégory. "Comportement agonistique et communication chimique chez une araignée solitaire : Tegenaria atrica (Araneae, Agelenidae)." Nancy 1, 1999. http://www.theses.fr/1999NAN10268.
Full textAbstract:
Ce mémoire de thèse constitue le travail d'approfondissement d'un programme de recherche sur l'influence de la communication chimique sur le comportement agonistiqee chez les araignées. Le comportement est envisagé dans une perspective ontogénétique, car les deux questions posées dans le cadre de ce travail sont les suivantes : quelles sont les incidences des conditions de l'environnement (disponibilité en nourriture, présence de congénères) et les conditions du milieu interne (âge, état ovarien) sur le comportement social de l'individu (tolérance ou cannibalisme) ? De quelle nature sont les facteurs impliqués dans l'induction ou l'inhibition du comportement agonistique chez les araignées solitaires, comme Tegenaria atrica ? [. . . ]
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Attane, Jean-Claude. "Etude spectroscopique de l'état d'hydratation de peptides en milieu micellaire biomimétique : application au tripeptide chimiotactique." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1992. http://www.theses.fr/1992INPL081N.
Full textAbstract:
L'interaction peptide/membrane qui précède la reconnaissance des hormones peptidiques par les récepteurs membranaires s'accompagne d'une transition conformationnelle due au passage du milieu aqueux intercellulaire à l'interface membranaire, et probablement d'une déshydratation de certains sites du peptide. C'est ce dernier effet qui a été étudié par spectroscopie infrarouge a transformée de Fourier sur des amides, des mono et dipeptides non ioniques, et sur le tripeptide chimiotactique dans un milieu micellaire qui mime en première approximation l'interface membranaire cellulaire. Les états d'hydratation (mono, di et même trihydrate) du carbonyle amide ont été caractérises dans un mélange hydro-organique, puis, sur cette base, ceux des carbonyles des peptides modèles ont été examinés en milieu micellaire. Selon l'hydrophobie des résidus amino acides, une déshydratation partielle (mono-hydrate) ou totale est observée par addition de TTAB dans la solution aqueuse, preuve d'une interaction peptide/micelle. L'application au tripeptide chimiotactique de la spectroscopie infrarouge avec affinement des signaux par maximisation d'entropie montre que les carbonyles conservent en milieu micellaire le même état d'hydratation que dans l'eau, et restent donc exposés au milieu aqueux tandis que les trois chaines latérales des résidus pénètrent plus ou moins profondément dans la micelle. Le marquage isotopique des peptides bioactifs permettrait d'étendre les possibilités de cette technique pour l'étude des interactions avec les mimes d'interface membranaire
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Alkhayal, Jana. "Équations paraboliques non linéaires pour des problèmes d'hydrogéologie et de transition de phase." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLS448/document.
Full textAbstract:
L'objet de cette thèse est d’étudier l'existence de solution pour une classe de systèmes d'évolution fortement couplés, ainsi que la limite singulière d'une équation aux dérivées partielles d'advection-réaction-diffusion.Au chapitre 1, nous d écrivons brièvement la dérivation d'un modèle d'intrusion saline pour des aquifères confinés et non confinés. Dans ce but nous nous appuyons sur la loi de Darcy et la loi de conservation de masse en négligeant l'effet de la dimension verticale.Au chapitre 2, nous considérons un système qui généralise le modèle d'intrusion saline dans des aquifères non confinés. C'est un système non linéaire parabolique dégénéré fortement couplé. Après avoir discrétisé en temps, gelé et tronqué des coefficients et finalement régularisé les équations, nous appliquons le théorème de Lax-Milgram pour prouver l'existence et l'unicité de la solution d'un problème linéaire associé. Nous appliquons ensuite un théorème du point fixe pour démontrer l'existence d'une solution du problème non linéaire approché. Nous obtenons de plus une estimation d'entropie, qui permet en particulier de démontrer la positivité de la solution. Finalement, nous passons à la limite dans le système et dans l'entropie pour prouver l'existence de solution pour le problème initial.Au chapitre 3, nous montrons l'existence de solution pour un système qui contient en particulier le modèle d'intrusion saline dans des aquifères confinés. Ce système est semblable au système du chapitre 2, mais la pression intervient comme inconnue supplémentaire. Il se rajoute la contrainte que la somme des hauteurs inconnues est une fonction donnée et la pression est en fait un multiplicateur de Lagrange associé à cette contrainte. Nous obtenons de nouveau une inégalité d'entropie et nous effectuons également une estimation sur le gradient de la pression.Au chapitre 4, nous nous intéressons à la description d'interfaces abruptes qui se déplacent selon un mouvement donné, par exemple le mouvement par courbure moyenne. Des singularités peuvent apparaître en temps fini ce qui explique la nécessité de définir une nouvelle notion de surface. Dans ce chapitre, on introduit la notion de "varifolds", ou surfaces généralisées, qui étendent la notion de "manifolds". A ces varifolds on associe une courbure moyenne généralisée ainsi qu'une vitesse normale généralisée.Au chapitre 5, nous considérons une équation d'advection-réaction-diffusion qui intervient dans un système de chimiotaxie-croissance proposé par Mimura et Tsujikawa. L'inconnue est la densité de population qui est soumise aux effets de diffusion et de croissance et qui a tendance à migrer vers des forts gradients de la substance chimiotactique. Quand un petit paramètre tend vers zéro, la solution converge vers une fonction étagée ; l'interface diffuse associée converge vers une interface abrupte qui se déplace selon un mouvement par courbure moyenne perturbé. Nous représentons ces interfaces par des varifolds définis à partir de la fonctionnelle de Lyapunov du problème d'Allen-Cahn. Nous établissons une formule de monotonie et nous montrons une propriété d'équipartition de l'énergie. Nous prouvons de plus que le varifold est rectifiable et que la fonction de multiplicité associée est presque partout entièreThe aim of this thesis is to study the existence of a solution for a class of evolution systems which are strongly coupled, as well as the singular limit of an advection-reaction-diffusion equation.In chapter 1, we describe briefly the derivation of a seawater intrusion model in confined and unconfined aquifers. For this purpose we combine Darcy's law with a mass conservation law and we neglect the effect of the vertical dimension.In chapter 2, we consider a system that generalizes the seawater intrusion model in unconfined aquifers. It is a strongly coupled nonlinear degenerate parabolic system. After discretizing in time, freezing and truncating the coefficients and finally regularizing the equations we apply Lax-Milgram theorem to prove the existence of a unique solution for the elliptic linear associated system. Then we apply a fixed point theorem to prove the existence of a solution for the nonlinear approximated problem. We obtain in addition an entropy estimate, which allows us in particular to prove the positivity of the solution. Finally, we pass to the limit in the system and the entropy in order to prove the existence of a solution for the initial problem.In chapter 3, we prove the existence of a solution for a system that contains in particular the seawater intrusion model in confined aquifers. This system is very similar to that introduced in chapter 2, only the pressure is a new unknown and we have the constraint that the sum of the unknown heights is a given function. The pressure is the Lagrange multiplier associated to the constraint. We obtain again an entropy estimate and we establish an estimate on the gradient of the pressure.In chapter 4, we are interested in the study of sharp interfaces that moves by a certain flow, by mean curvature flow for example. Singularities may occur in finite time which explains the necessity of having a differnet notion of surfaces. In this chapter, we introduce the notion of "varifolds" or generalized surfaces that extend the notion of manifolds. To these varifolds we associate a generalized mean curvature and a generalized normal velocity.In chapter 5, we consider an advection-reaction-diffusion equation arising from a chemotaxis-growth system proposed by Mimura and Tsujikawa. The unknown is the population density which is subjected to the effects of diffusion, of growth and to the tendency of migrating toward higher gradients of the chemotactic substance. When a small parameter tends to zero, the solution converges to a step function; the associated diffuse interface converges to a sharp interface which moves by perturbed mean curvature. We represent these interfaces by varifolds defined by the Lyapunov functional of the Allen-Cahn problem. We establish a monotonicity formula and we prove a property of equipartition of energy. We prove also the rectability of the varifold and that the multiplicity function is almost everywhere integer
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Bailleul, Richard. "Embryonic patterning of the avian skin : mathematical modelling of embryonic dynamics." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2019. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2019SORUS022.pdf.
Full textAbstract:
Depuis la publication par Alan Turing de son article ‘The Chemical Basis of Morphogenesis” en 1952, une révolution moléculaire a eu lieu en biologie et les mathématiciens ont fourni un nombre croissant de cadres théoriques afin de modéliser des motifs observés dans la nature. Cette thèse a pour objectif d’unifier les récentes découvertes dans ces deux domaines en proposant un cadre théorique et des schémas de développement pour l’émergence des motifs cutanés aviaires par l’étude de la dynamique de formation du plumage dorsal. J'ai caractérisé l'apparition des primordiums de plumes dans le dos de plusieurs espèces d'oiseaux : poulets, cailles, faisans, diamants mandarins, émeus et manchots. Chez les quatre premières espèces, la peau est structurée de manière reproductible : de minces domaines de compétence longitudinaux, marqués par la bêta-caténine, déclenchent une vague de rangées formant des plumes qui se propagent latéralement. Le processus est très différent chez les émeus et manchots: les plumes s'individualisent dans des domaines compétents et apparaissent rapidement sur toute la peau, de manière régulière ou irrégulière. J'ai ensuite reproduit les attributs de cette dynamique avec un modèle unifié de réaction-diffusion-chimiotactisme, avec un terme de prolifération logistique. En ajustant les conditions initiales, ce modèle récapitule les différentes dynamiques de patterning observées, et prédit que la prolifération cellulaire contrôle la synchronisation du processus de configuration. Ce modèle étude ouvre des perspectives concernant l'évolution des motifs cutanés et discute les origines de propriétés de ces motifs tels que leur régularité et leur directionalitéSince Alan Turing’s milestone paper ‘The Chemical Basis of Morphogenesis” in 1952, a molecular revolution has taken place in biology and mathematicians have provided an increasing number of theoretical models that are able to generate many of the patterns observed in nature. This thesis aimed at unifying the extensive findings in both fields to propose theoretical frameworks and developmental schemes for the emergence of avian skin patterns, with a particular focus on dorsal plumage dynamics. I characterised the appearance of feather primordia in the dorsum of several bird species, namely chickens, quails, pheasants, zebra finches, emus and penguins. In the first four species, the patterning of the dorsal skin occurs in a highly reproducible manner: thin longitudinal domains of competence, marked by beta-catenin, trigger a wave of feather-forming rows that propagate laterally in a timely fashion, eventually forming feather tracts. In flightless emus and penguins, the process is much different: feathers first individualise within large competent domains, and later appear throughout the whole skin, in a quick and regular or irregular fashion. I then reproduced shared and varying attributes of these dynamics with a unified reaction-diffusion-chemotaxis model with logistic cell proliferation, which I used in a predictive way. It recapitulates all varying attributes of the patterning processes by tuning initial conditions, and predicts that cell proliferation controls the timing of the patterning process. Our framework opens up evolutionary perspectives, and the origins of pattern attributes such as regularity and directionality are discussed
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Missé, Dorothée. "Etude des interactions entre les structures conservées de la GP120 du VIH-1 et les cellules cibles." Montpellier 2, 1998. http://www.theses.fr/1998MON20175.
Full text
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Deleuze, Yannick. "Modeling and simulation of transport during acupuncture." Thesis, Paris 6, 2015. http://www.theses.fr/2015PA066372/document.
Full textAbstract:
L’objectif de cette thèse est d’appréhender la complexité des mécanismes biologiques de l’acupuncture afin de construire un modèle mathématique multi-échelle. Ce modèle est étudié théoriquement et numériquement. L’acupuncture est une des plus vielles pratiques de l’histoire de la médecine et une partie intégrante de la médecine traditionnelle chinoise. Dans sa pratique la plus classique, une ou plusieurs aiguilles sont placées à des endroits spécifiques, nommés points d’acupuncture. L’aiguille est ensuite manipulée en utilisant des mouvements de rotation et de translation de façon à stimuler le point d’acupuncture. Les effets cliniques de l’acupuncture pourraient être le résultat d’effet de cascades de réactions produites par les interactions entre l’hypoderme et les systèmes nerveux, endocrinien et immunitaire. Le travail présenté s’articule sur la modélisation de l’insertion d’une aiguille dans le tissu conjonctif de l’hypoderme. Un modèle d’écoulement en milieu poreux du liquide interstitiel de l’hypoderme a permis d’étudier numériquement les composantes de contrainte qui agissent sur les récepteurs à la surface des cellules du tissu et notamment des mastocytes.Un modèle mathématique de la réponse chimiotactique des mastocytes à une contrainte physique créée par le traitement d’acupuncture est développé. Ce modèle prend en compte les mécanismes de signalisation cellulaire. La contrainte physique induit la libération rapide et continue, grâce au recrutement chimotactique de mastocytes, d’attractants et de médiateurs chimiques. Le modèle est basé sur le modèle de chimiotaxie de type Keller-SegelThe objective of this thesis is to comprehend the complexity of the underlying basis of acupuncture. Acupuncture needling is investigated in order to establish a multiscale model that takes into account the complexity of biology but is mathematically simple enough to run simulations.Acupuncture is one of the oldest practices in the history of medicine and is the core of Traditional Chinese Medicine. Once needles are inserted in the right locations, called acupoints, they are manipulated via manual needling to stimulate the acupoint. The physiological reactions of acupuncture needling lead to therapeutic effects which can be explained by a series of interactions between the skin and the nervous, the endocrine, and the immune systems.In the present work, the thrusting and lifting of an acupuncture needle inserted in subcutaneous connective tissue is modeled. A porous media model is used to run simulations and compute the pressure and shear stress affecting the organization of fibers and of isolated cells in their matrix. A mathematical model was conceived to take into account cell signaling. There is ample evidence that needle manipulation in acupuncture can cause degranulation of mastocytes directly through a physical stress to occur. Activated mastocytes rapidly release granules containing chemical mediators. These chemical mediators play a key role recruiting mastocytes in their environment and are known to affect the excitability of nerve endings as well as local microcirculation permeability and size for the appropriate transfer of long-term acting endocrine signals. The process is sustained by the recruitment of mastocytes through chemotaxis
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Pham, Huu Trung. "Étude des granulocytes : aspects physio-pathologiques." Paris 11, 1987. http://www.theses.fr/1987PA112314.
Full textAbstract:
Cette thèse présente deux chapitres : le premier concernant les activités fonctionnelles normales des granulocytes, le second concernant les principaux états pathologiques en rapport avec une altération d'une ou plusieurs activités des granulocytes. Dans le premier chapitre, la séquence du déroulement des activités des Pn lors de l'envahissement de l'organisme par un agent microbien est étudiée : - la migration du Pn vers le foyer infectieux ; l'ingestion du microorganisme ; - l'activité tueuse par "l'explosion oxydative - la lyse des agents microbiens. Toutes ces diverses activités sont dépendantes de l'adhérence du PH. Pour chacune de ces différents activités du PN, se déroule un même processus de phénomènes : -reconnaissance de stimulus; - transduction et amplification de ce premier message; production des messagers secondaires intraceIlulaires (Ca++, inositol phosphates, diacylglycérol); -activation et désactivation des protéines-kinases -et enfin, mise en jeu des effecteurs de la fonction. Si les deux extrémités de ce processus sont différentes selon le type de cellule et de sa fonction, les étapes intermédiaires (transduction, messagers secondaires, protéines - kinases) semblent être communes à toutes les cellules de l'organisme humain. Dans le second chapitre, sont abordés les états pathologiques en rapport avec : - un trouble de locomotion (maladie de Chediak -Higashi , syndrome de susceptibilité aux infections avec hyper IgE, syndrome de Buckley) ; un défaut de l’explosion oxidative du PN (maladie granulomatose septique chronique et son dépistage anté-natal) ; une atteinte de l'adhérence du PN (déficit congénital en glycoprotéines d'adhérence LFA1, Mol ou récepteur du CR3, gp 150 ,95). L'étude de ces états pathologiques revêt un très grand intérêt. En effet, ils réalisent de véritables modèles expérimentaux permettant d’illustrer les mécanismes physiologiques émis
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Allaire, Marc-André. "Étude de l'implication de la prostaglandine E[indice inférieur]2 dans la signalisation cellulaire menant à la chimiotaxie des monocytes vers les ligands CCL19/CCL21 et l'impact de la maturation des monocytes en macrophages sur leur récepteur CCR7." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2013. http://hdl.handle.net/11143/6567.
Full textAbstract:
Le Récepteur de chimiokine CCR7 joue un rôle important dans la migration des cellules immunitaires, permettant ainsi l'initiation de la réponse immunitaire. Des études ont démontré qu'une déficience dans l'expression de ce récepteur ou de ces ligand CCL19 et CCL21 a un impact considérable sur la mise en place de la réaction immunitaire suite a un stimulus. D'autre part la prostaglandine de série E 2 a été identifié comme un agent régulateur important sur l'expression et la fonctionnalité du récepteur CCR7 dans l'établissement de la réponse immunitaire, principalement au niveau des cellules dendritiques. L'élévation du niveau de prostaglandine E 2 , lors de certaine infection, induit une augmentation importante de la migration des cellules immunitaires, lors de l'activation du récepteur CCR7. Ces cellules vont alors migrer vers ses ligands qui sont produit principalement au niveau des ganglions lymphatique, permettant ainsi la présentation antigénique aux cellules du système immunitaire adaptatif. Récemment, des travaux ont permis de mettre en évidence l'expression du récepteur CCR7 chez les monocyte et du rôle important de la PGE 2 dans l'expression et la fonctionnalité du récepteur chez ces cellules. Les travaux réalisés dans le cadre de cette maîtrise avaient pour but, dans un premier temps, de déterminer les mécanismes moléculaires permettant la migration cellulaire des monocytes suite à l'activation du récepteur CCR7 par la présence de son ligand CCL19. Nous avons également vérifié l'implication de la PGE 2 dans ce processus. Partant des mécanismes connus chez les cellules dendritiques et des cellules T, nous avons établi que la participation des MAPK p38, ERK et JNK sont importantes dans ce processus. La présence de PGE2 permet une phosphorylation plus rapide de ses MAPK. Nous avons ensuite vérifié la participation de la voie RhoA/ROCK, importante dans le réarrangement du cytosquelette d'actine. L'activation du récepteur CCR7 par son ligand CCL 19 permet une activation de RhoA. Cette activation survient plus rapidement lorsque les cellules sont en présence de PGE 2. Lorsque ces voies métaboliques sont bloquées par des inhibiteurs pharmacologiques, la migration des monocytes est alors inhibée, démontrant l'importance de ses voies pour la migration des monocytes vers les ligands CCL191 Dans un second temps, nous avons étudié l'impact de la maturation des monocytes en macrophage sur le récepteur CCR7. Jusqu'à maintenant, il est connu que la PGE2 permet une augmentation de l'expression de CCR7 chez les monocytes et augmente la réponse chimiotactique des cellules vers les ligands de CCR7. De plus on sait que lors de la maturation des monocytes en cellules dendritique mature, une forte augmentation de l'expression du récepteur CCR7 est observé et que la présence de PGE 2 est essentielle pour assurer la fonctionnalité du récepteur. Toutefois, l'impact de la maturation des monocytes en macrophage sur le récepteur CCR7 est encore inconnu. Nous avons alors démontré que lors de la maturation des monocytes en macrophages, il y a une importante perte de l'expression du récepteur CCR7 et que la présence inflammatoire de la PGE 2 ne permet pas une augmentation de l'expression du récepteur et de la migration des cellules chers les ligands de CCR7. La migration des macrophages vers les ganglions lymphatique ne serait alors pas attribuée à la chimiotaxie de CCR7 vers ses ligands. Ces travaux ont permis de mettre en lumière les principaux acteurs moléculaires impliqué dans la migration des monocytes suite à l'activation du récepteur CCR7 et que la PGE2 permettrait aux monocytes de migrer préférentiellement vers ses ligands au lieu de transmigrer vers les tissus où ils se différencieraient en macrophage. Suite à la différenciation des monocytes en macrophages, nous avons également pu démontrer qu'ils n'ont plus la capacité d'exprimer le récepteur CCR7 et amorcer leur migration vers les ligands CCL19 et CCL21 exerçant ainsi leur fonction en tant que cellules résidente des tissus.[ symboles non conformes]
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Boy, Agnès. "Analyse mathématique d'un modèle biologique régi par un système d'équations de réaction diffusion couplées." Pau, 1997. http://www.theses.fr/1997PAUU3028.
Full textAbstract:
Cette thèse a pour objet léetude mathématique d'un modèle traduisant un phénomène de chemotaxis. Nous étudions un modèle de Keller et Segel traduisant la migration d'amibes en direction d'une zone ou la concentration en cyclic AMP produit par elles-mêmes est importante. Deux modélisations de ce phénomène sont ici étudiées. La première est un système non linéaire du second ordre constitué de deux équations paraboliques couplées par le terme de transport non linéaire. Le second modèle est formé d'une E. D. P parabolique et d'une E. D. P elliptique également couplées par le terme de transport. Pour le système parabolique associé à des conditions de bord de Neumann homogènes sur le domaine borne régulier de dimension 1, 2, ou 3, on prouve l'existance d'une unique solution locale, bornée. On démontre de plus que, pour un temps T fixé à priori, si la variation des données initiales n'excède pas un seuil dépendant de T, ce système admet une unique solution globale jusqu'au temps T. Pour le système parabolique-elliptique on obtient des résultats liés aux propriétés de la non linéarité présente dans le terme de transport ainsi. En effet, pour une non linéarité convexe, on démontre en dimension un l'existance d'une unique solution globale. En dimension deux ce résultat est obtenu soit pour une valeur moyenne de la densité initiale suffisamment petite soit pour une non linéarité décroissante. On a également ce résultat en dimension trois soit pour une non linéarité décroissante soit pour des conditions de bord de Dirichlet homogènes et pour une valeur moyenne de la densité initiale petite. Si par contre la non linéarité est croissante, la densité initiale à symétrie radiale et sa valeur moyenne suffisamment grande alors la solution explose en temps fini au centre de l'ouvert en dimension 2 et 3.
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Paris, Sébastien. "Un modèle de métastases pulmonaires spontanées fluorescentes et son utilisation dans l'étude des gènes." Rouen, 2000. http://www.theses.fr/2000ROUES079.
Full textAbstract:
L'existence de métastases rend difficile le traitement chirurgical définitif des cancers ou leur éradication par radiothérapie localisée. La détermination des bases moléculaires du développement métastatique représente donc une étape cruciale dans la découverte de nouveaux traitements des tumeurs malignes. L'utilisation d'un modèle in vivo mimant le développement des métastases s'avère être un outil indispensable pour ces études. Cependant, la plupart de ceux utilisés à ce jour présentent des inconvénients les rendant difficilement exploitables dans ce type d'étude. Ainsi les modèles utilisant des injections intraveineuses de cellules cancéreuses donnent de bons résultats en terme de quantité de métastases, mais leur utilisation est limitée en raison de l'absence des phases précoces du processus (ex : séparation du cancer et invasion). De plus, malgré la capacité de nombreuses lignées cellulaires cancéreuses humaines à croître chez la souris athymique " nude " après injection sous-cutanée (s. C. ), l'obtention des métastases spontanées, englobant l'ensemble des étapes du processus métastatique, reste difficile. Certains modèles utilisent des greffes orthotopiques induisant la formation de ce type de métastases, mais leur utilisation est limitée du fait de difficultés techniques importantes. De plus, la visualisation des micrométastases est souvent rendue difficile par l'absence d'un gène rapporteur permettant une détection simple et rapide d'un petit nombre de cellules dans le tissu de l'hôte. L'utilisation du gène lacZ dans de nombreux modèles donne de bons résultats pour cette visualisation. Cette technique est néanmoins très longue et le dénombrement complet des métastases pulmonaires quasiment impossible à réaliser. L'utilisation récente de la protéine fluorescente verte (GFP)comme gène rapporteur a bouleversé les techniques classiques de visualisation des métastases. Elle permet d'envisager la détection simple et rapide des micrométastases dans les tissus frais de l'hôte. La mise au point d'une lignée humaine produisant un grand nombre de métastases spontanées chez la souris athymique et exprimant de façon stable la GFP représenteront un outil puissant dans la recherche thérapeutique et biologique. Nous avons mis au point un modèle de métastases pulmonaires spontanées chez la souris immunodéficiente athymique utilisant la protéine fluorescente verte (GFP)comme système rapporteur. Afin de valider notre modèle, nous avons étudié l'impact de l'expression de différentes protéines présentes dans la matrice extracellulaire sur la croissance tumorale et la formation métastatique. Nous avons réalisé cette étude qur les chaînes ITI-H1, ITI-H2, ITI-H3 et ITI-L appartenant à la famille de l'inhibiteur inter-alpha de la trypsine (ITI) et sur la partie N-terminale du versican liant l'acide hyaluronique, l'hyaluronectine. Nous avons pu ainsi démontrer que les chaînes ITI-L, -H1 et -H3 inhibent la croissance tumorale et/ou la dissémination métastatique, tandis qu'hyaluronectine module la dissémination métastatique suivant la quantité expriméeThe existence of metastases prevents a definitive surgical treatment of cancer or its eradication by localized radiotherapy; Understanding the molecular bases of the metastatic development represents a crucial stage in the discovery of new treatments against cancer. In vivo models, which mimic the development of metastases, have been shown to be an essential tool for these studies. However, the majority of currently used models present drawbacks limiting their application. Models using intravenous injections of cancerous cells give good results as for the number of metastases, but their use is restricted because they do not involve the early steps of the metastatic process (e. G. : separation from primary tumour and invasion). Moreover, in spite of the capacity of human cancerous cell lines to grow in athymic nude mice after subcutaneous injection (s. C. ), it is still difficult to obtain spontaneous metastases that do induce the whole steps of the metastatic process. Some models take advantage of orthotopic grafts to induce the formation of this type of metastases, but their use is limited because of significant technical difficulties. Furthermore, the finding of micrometastases is often hampered by the absence of a reporter gene allowing a simple and fast detection of a small number of cells in tissues of the host. The use of the lacZ gene gives good results but it is time consuming and the complete enumeration of pulmonary metastases is almost impossible to realize. The recent introduction of the green fluorescent protein (GFP), as a reporter gene, radically changed the techniques traditionally used for the study of metastases. It should facilitate a simple and fast detection of micrometastases in fresch host tissues
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Danoy, Mathieu. "Development of a physiologically-relevant in-vitro microfluidic model for monitoring of pancreatic cancer cells interactions with the liver." Thesis, Lille 1, 2017. http://www.theses.fr/2017LIL10093/document.
Full textAbstract:
Le procédé de la métastase cancéreuse et sa compréhension sont devenus un des sujets majeurs de recherche en Biologie. En utilisant des modèles in-vitro en culture statique et dynamiques, nous avons étudié la possibilité de reproduire l’environnement physiologique in-vivo avec ces modèles. Nous avons développé un modèle de coculture hiérarchique dans des plaques à fond en PDMS. Composé d’hépatocytes, de pericytes et de cellules endothéliales. Dans différentes conditions, l’influence de ces cellules sur l’adhésion de cellules cancéreuses ou promyéloblastiques a été analysée ainsi que leur effet sur l’état inflammatoire du système. Afin de reproduire le flux sanguin et les forces de cisaillement présents in-vivo, le modèle a été transféré dans un système microfluidique. Le système se compose de trois canaux séparés par des micro-piliers, pouvant être remplis indépendamment. Les pericytes insérés dans du gel, les hépatocytes, les cellules endothéliales et finalement les cellules cancéreuses ont été injectés de façon successive afin de reproduire l’environnement in-vivo. Les cellules ont été trouvées viables durant toute la culture et des marqueurs relatifs au foie et à l’inflammation exprimés. L’influence des hépatocytes et des pericytes a été analysé. Il a été observé que les cellules cancéreuses adhérées dans le canal du haut étaient attirées par les autres cellules dans les diffèrent canaux. Les modèles établis posent de solides bases pour d’autres systèmes plus complexes et d’intérêt pouvant servir de complément aux modèles in-vivo lors de la recherche de nouvelles substances médicamenteusesThe cancer metastatic process and its understanding have been a major topic of interest for researchers in the past. Using in-vitro models in both standard culture conditions and in microfluidic devices, we investigated the feasibility of such models in the representation of the physiological in-vivo situation. We developed a hierarchical coculture model in PDMS plates, composed of hepatocytes, pericytes and endothelial cells. In different culture conditions, the influence of the different cells composing the model on the adhesion of cancer cells and promyeloblastic cells was investigated as well as the influence on the inflammatory state of the culture. To reproduce the in-vivo blood flow and shear stress to which the endothelial cells and the adhering cells are subjected, the model was then transferred into a microfluidic biochip. The device was composed of three channels, separated by micropillars and which could be filled independently one from another. Pericytes embedded in a hydrogel, hepatocytes, endothelial cells and finally pancreatic cancer cells could be inserted successively to reproduce the in-vivo hierarchical situation. Cells were found to viable after the culture and markers related to the liver and inflammation to be expressed. The influence of the presence of hepatocytes and pericytes was investigated by varying the culture conditions. It was found that pancreatic cancer cells were attracted by the cells in other channels in coculture. The established models lay the bases for more complex and relevant systems that could complement their in-vivo counterparts in the drug discovery process
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Sutherland, Audrey. "Etudes des activités anti- et pro-tumorales d'agents chimioattractants et de leurs récepteurs leucocytaires." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2008. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210378.
Full textAbstract:
Les chimiokines, petites protéines sécrétées par de nombreux types cellulaires, régulent le trafic et la fonction des populations leucocytaires en interagissant avec leurs récepteurs spécifiques, qui appartiennent à la superfamille des récepteurs à 7 domaines transmembranaires couplés aux protéines G. Dans le contexte tumoral, les chimiokines jouent des rôles ambivalents, en régulant le recrutement des leucocytes, ainsi que la croissance et l’angiogenèse des tumeurs. Aussi, les chimiokines semblent également contribuer à déterminer les sites métastatiques des tumeurs malignes.Notre travail porte sur l’étude du rôle de chimiokines et récepteurs, fréquemment exprimés au sein de tumeurs, dans un modèle tumoral chez la souris, la lignée cellulaire LLC (Lewis Lung Carcinoma). Chaque gène d’intérêt (CCR3, CCR6, CCR7, CXCR4, CXCR5, CCL19, CCL20, CCL21, CXCL13) a été exprimé dans la lignée LLC, ces différentes lignées ont été greffées à des souris syngéniques, et les caractéristiques phénotypiques des tumeurs ont été analysées, notamment la croissance tumorale, la fréquence et la distribution des métastases, et l’importance des réactions immunitaires de l’hôte.
Nous avons montré que la croissance tumorale n’est pas affectée par l’expression des différents récepteurs étudiés, ni par celle des chimiokines CCL19 et CCL21, alors que l’expression de CXCL13 et de CCL20 par les cellules LLC réduit leur croissance in vivo. La quantification des métastases pulmonaires a montré que l’expression de CCR3, CXCR5, CCR7, CCL19 ou CCL21 par les cellules tumorales n’affecte pas significativement le potentiel métastatique des cellules LLC. Par contre, l’expression de CXCR4 entraîne une augmentation, et CCR6 une diminution, du nombre de métastases pulmonaires. La diminution du potentiel métastatique des tumeurs LLC/CCR6 implique notamment l’augmentation des propriétés d’adhésion de ces cellules. Les cellules LLC produisent naturellement de petites quantités du ligand CCL20. Nous postulons que la stimulation autocrine de CCR6 par CCL20 dans ces cellules in vivo augmente leurs propriétés d’adhésion et diminue leur potentiel métastatique. Dans le contexte de l’implication des chimiokines et récepteurs dans la détermination des sites métastatiques, nous proposons dès lors un modèle plus général :les récepteurs aux chimiokines dirigent les cellules tumorales vers les sites métastatiques où est produit le ligand correspondant ;cependant, si le ligand est produit au niveau de la tumeur, il favorise le maintien des cellules tumorales au niveau du site primaire.
L’effet anti-tumoral de CCL20 ne dépend apparemment pas d’un recrutement plus important de cellules dendritiques, de lymphocytes T et de cellules NK exprimant le récepteur CCR6. Nos observations suggèrent plutôt un effet de CCL20 sur l’angiogenèse tumorale.
Doctorat en Sciences médicales
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Devosse, Thalie. "Functional caracterisation of formyl peptide receptor 3 and its peptidic ligand F2L in the development of physiological and pathological inflammatory responses." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2010. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210017.
Full textAbstract:
Tous les êtres vivants présentent un arsenal de défenses contre les pathogènes, et la réponse inflammatoire constitue le processus initial de cette défense, qui s’achève par la réparation des tissus lésés. Paradoxalement, un processus inflammatoire prolongé est également associé à de nombreuses pathologies comme l’athérosclérose, l’asthme, les maladies auto-immunes mais aussi certains cancers. Le recrutement excessif de leucocytes au site de l’inflammation est un processus commun à ces pathologies. Dès lors, la compréhension et la maîtrise du phénomène complexe et finement orchestré de la migration sélective des populations leucocytaires, appelée chimiotactisme, sont des enjeux majeurs de la recherche médicale contemporaine. Les récepteurs aux peptides formylés bactériens et mitochondriaux (FPRs) forment la première famille de récepteurs chimiotactiques identifiée. Elle comprend trois membres, FPR1, 2 et 3, présentant un haut niveau de similitude et partageant certains de leurs multiples ligands. Le troisième membre de ce groupe, FPR3, reste actuellement le moins bien connu. Récemment, un agoniste de FPR3, affin et spécifique, a été identifié dans le laboratoire. Il s’agit du peptide F2L, qui correspond aux 21 premiers acides aminés de la protéine intracellulaire HEBP1.
Dans le cadre de ce travail de thèse, nous nous sommes attelé à la caractérisation approfondie du récepteur FPR3 et son ligand peptidique F2L.
Dans un premier temps, et à l’aide d’anticorps validés dans le cadre de ce travail, nous avons montré que le peptide F2L induit le chimiotactisme d’un ensemble de populations leucocytaires qui expriment FPR3, dont les sous-populations de macrophages des poumons, du colon et de la peau, les éosinophiles et les cellules dendritiques plasmacytoïdes. Cette distribution suggère, pour FPR3, une fonction dans la réponse inflammatoire.
Nous avons pu montrer ensuite que F2L peut être généré par la protéolyse de son précurseur, HEBP1, sous l’action de la cathepsine D des macrophages. La cathepsine D est une aspartique protéase lysosomiale impliquée dans l’homéostasie cellulaire, les processus apoptotiques et inflammatoires physiologiques et pathologiques, et dans le développement tumoral. Il s’agit désormais d’identifier dans quel compartiment et sous quelles conditions F2L est produit et sécrété.
Enfin, parallèlement à ces travaux, nous avons démontré que la cathepsine G, une sérine protéase contenue dans les granules azurophiles des neutrophiles, active également le récepteur FPR3. Des résultats préliminaires suggèrent un mode d’activation alternatif du récepteur, impliquant la protéolyse d’un troisième partenaire et la génération d’un agoniste actuellement non identifié.
Le couple FPR3-F2L semble dès lors impliqué dans l’induction ou la résolution de la réponse inflammatoire en recrutant les éosinophiles, monocytes, macrophages et cellules dendritiques au site de la lésion.
Doctorat en Sciences agronomiques et ingénierie biologique
info:eu-repo/semantics/nonPublished