Dissertations / Theses on the topic 'Chimiotaxonomie'

Les bananiers cultivés sont supposés dériver de deux espèces particulières du genre Musa : M. Acuminata COLLA et M. Balbisiana COLLA. Une propagation végétative très ancienne a abouti à une très grande diversité des formes cultivées. Les données morphologiques et cytogénétiques n'ont pas permis d'éclaicir totalement l'organisation génétique et l'évolution des bananiers, sauvages et cultivés. Une approche chimiotaxonomique est entreprise : deux classes de marqueurs biochimiques, flavonoïdes et isozymes, sont utilisés pour analyser la diversification au sein du genre Musa. Le polymorphisme des flavonoïdes (anthocyanines et glycosides de flavonols) est examiné chez 80 variétés de bananiers et un schéma évolutif est dégagé. M. Acuminata et M. Balbisiana ont opté pour des métabolismes phénoliques distincts; les résultats observés montrent le haut niveau de différenciation de M. Acuminata et conduisent à une hiérarchisation évolutive des espèces et sous-espèces. L'étude des variétés cultivées suggère que la domestication a pu se répéter à différents niveaux évolutifs durant la différenciation de M. Acuminata. L'analyse de la diversité enzymatique chez 113 variétés sauvages et cultivées au travers de 8 locus polymorphes montre une grande divergence des espèces acuminata et M. Balbisiana. La diversité à l'intérieur de l'espèce M. Acuminata est élevée et sa structuration reflète une compartimentation vraisemblablement liée à un isolement reproductif partiel de nature géographique. Ces résultats concordent avec ceux obtenus par l'analyse du polymorphisme flavonique. La comparaison entre acuminata sauvages et cultivés révèle que la domestication s'est opérée sur une base génétique réduite. Les classifications obtenues au travers des deux types de marqueurs corroborent globalement les classifications morpho-physiologiques classiques. L'électrophorèse d'isozymes, appliquée aux bananiers, s'avère être un outil efficace et prometteur, tant dans le domaine des recherches en ressources génétiques que pour la classification et la sélection<br>Edible bananas are supposed to be originated from the two species M. Acuminata COLLA and M. Balbisiana COLLA. A long vegetative propagation has led to a wide diversity among cultivated forms. The genetic organization and the evolution of the crop is not completely elucidated through morphological and cytogenetical data. A chemotaxonomic study is undertaken : diversification in the genus Musa is analyzed by the use of two biochemical markers, flavonoids and isozymes. The polymorphism of flavonoids (anthocyanins and flavonol glycosides) is examined among 80 varieties of bananas and leads to the proposal of an evolutionary scheme. M. Acuminata and M. Balbisiana have choosen two distinct phenolic pathways. Observed results point out the high level of differentiation of acuminata species, and leads to recognize an evolutive hierarchical organization. The analysis of cultivars suggests that domestication did occur at several evolutive stages during differentiation of M. Acuminata. The analysis of enzyme diversity among 113 wild types and cultivars, through 8 polymorphie loci, displays the great divergence between M. Acuminata and M. Balbisiana species. The diversity within M. Acuminata species is high and the observed structure reveals a compartimentalization in all likelihood related to geographical isolation. These results are in good agreement with those obtained through flavonoid polymorphism. Comparison between wild acuminata and cultivars shows that domestication did act on a reduced genetic basis. Classifications obtained through the two kinds of markers globally corroborate previous classifications based on morphophysiological data. Isozyme electrophoresis applied to bananas turns out to be an efficient and promising tool, as well in genetic resources investigations as for classification and breeding

Le memoire est consacree a l'etude des esters heterosidiques de l'acide cafeique (ehac) chez des verbenacees d'origines diverses. Ces composes ont ete isoles a partir de feuilles de trois especes: avicennis marnia, lantana camara et lippia multiflora. Douze molecules ont ete isolees par divers procedes chromatographiques. Six ont ete identifies par des methodes spectrales. Une etude chimiotaxonomique basee sur la recherche des ehac par hplc sur quarante especes appartenant a dix neuf genres a permis, pour la premiere fois l'identification et le dosage du verbascoside dans dix genres. L'activite des ehac sur un test enzymatique, in vitro (proteine kinase c) a mis en evidence l'activite du desrhamnosyl verbascoside (ic 50=10-7 m). De plus le verbascoside a montre, in vitro, un puissant effet antiproliferatif des cellules l1210

Ce memoire est consacre a l'etude des diterpenes, des meroditerpenes et des sterols presents dans les extraits etheres de cystoseiracees. Il est constitue de deux tomes. Pour le tome un, le premier chapitre a pour objet l'analyse des donnees bibliographiques sur la biologie des cystoseiracees etudiees et sur leur repartition sur les cotes marocaines. Il propose une mise au point sur la systematique du genre cystoseira et une iconographie complete nos observations et donne tous les elements necessaires a l'identification des especes etudiees. Le deuxieme chapitre resume les etudes chimiques anterieures puis le troisieme est consacre a la methode d'obtention des composes etudies ainsi qu'a leur etude structurale et a leur dosage. Une methode c. L. H. P. De dosage des diterpenes est proposee, elle peut etre utilisee pour comparer des extraits ou caracteriser rapidement ces types de composes. L'etude des variations de la composition chimique des algues selon le lieu et la date de recolte ainsi que des considerations de chimiotaxonomie font l'objet du quatrieme chapitre. Nous proposons une caracterisation des especes par des marqueurs chimiques. Une conclusion qui tient lieu de cinquieme chapitre et une bibliographie completent ce travail. Le tome 2 rassemble les figures, chromatogrammes et spectres dans l'ordre ou ils se presentent dans le tome 1

Le genre Cochlearia constitue un complexe d'espèces polymorphes au regard de leur morphologie, de leur aire de répartition, de leur nombre de chromosomes et de leur adaptation écologique. En Bretagne, C. Aestuaria présente un statut taxonomique mal défini et peut éventuellement être confondue avec C. Anglica et C. Officinalis. Afin d'étudier la taxonomie de ce genre, une approche pluridisciplinaire a été réalisée combinant l'étude morphologique et écologique des espèces, un étude chiomiotaxonomique et une étude de phylogénie moléculaire. Les analyses biométriques ont mis en évidence quelques caractères permettant de clarifier la taxonomie du genre Cochlearia en Bretagne. De plus, les analyses en microscopie électronique à balayage ont révélé des différences d'ornementation des graines entre les espèces. En complément de cette étude, l'approche chiomiotaxonomique a permis la caractérisation de marqueurs chimiques permettant de distinguer les différentes espèces de ce genre, et de caractériser complètement les espèces C. Aestuaria et C. Officinalis. Enfin, l'approche de phylogénie moléculaire du genre Cochlearia a confirmé : (1) l'origine récente de complexe d'espèces, (2) la position des glaucocochlearia qui constituent une section soeur des Eucochlearia, (3) la monophylie des Eucochlearia et, (4) l'origine basale de C. Danica au sein des Eucochlearia. Ces différents approches ont permis de clarifier la taxonomie du genre en Bretagne tout en confirmant la proximité des différentes espèces de Cochleaires bretonnes<br>The genus Cochlearia represents a complex of highly polymorphic species with regard to their morphology, chromosome number, ecological adaptation and distribution areas. In Brittany C. Aestuaria presents a delicate taxonomic status and can be confused with C. Anglica and C. Officinalis. In order to elucidate the taxonomy of this genus, a multi-field work was carried out, including (1) a morpho-ecological, a chemotaxonomic and molecular phylogeny studies. The biometric analyses highlighted some characters allowing to clarify the taxonomy of Cochlearia genus in Brittany. Scanning electron microscopy also revealed differences of seed ornamentation between the species. In complement of this study, the biochemical approach showed the characterisation of chemotaxonomic markers in each Cochlearia species. Accordingly, C. Aestuaria and C. Officinalis have be clearly characterised. Finally, the molecular phylogenetic analyis of Cochlearia which constitutes a sister section of Eucochlearia, (3) the monophyly of the Eucochlearia and, (4) the basal origin of C. Danica within Eucochlearia. Overall, our work confirmed the proximity of the various Britain species of the Cochlearia genus, and it also clarified the taxonomy of this genus in Brittany

Nous avons voulu caractériser des bactéries par une nouvelle méthode chimiotaxonomique, le couplage pyrolyse, chromatographie gazeuse et détection d'émission atomique (Py-GC-AED). Depuis 1965, de nombreuses publications rapportent des résultats pertinents obtenus par comparaison des profils de pyrolyse de cellules entières ou de fragments bactériens. Deux systèmes de détection pouvaient être couplés à ces pyrolyses: une séparation par chromatographie gazeuse et détection par une flamme ionisante (GC-FID), ou un spectromètre de masse avec ou sans séparation (MS ou GC-MS). Ces méthodes sont une alternative efficace, ou du moins un complément utile aux méthodes phénotypiques ou génotypiques usuelles. La pyrolyse a permis l'étude taxonomique de genres peu connus, la surveillance épidémiologique de souches nosocomiales, ou la détection de changements métaboliques, par exemple sous l'influence d'un antibiotique. Pour comparer plusieurs souches de corynébactéries, nous avons utilisé la pyrolyse de bactéries entières à 510°C, une détection simultanée des produits carbonés, soufrés ou azotés au moyen de l'AED, et une analyse statistique des profils par le programme Taxotron(R). Répétabilité et reproductibilité de la méthode semblent satisfaisantes, mais notre technique, basée sur la chimie, est sensible aux contaminations de tout ordre. Nous avons notamment séparé 29 souches de C. Amycolatum de 23 souches appartenant à 4 espèces génétiquement ou phénotypiquement proches: C. Xerosis, C. Frenevi, C striatum et C. Minutissimum. Nos résultats sont en accord avec les données taxonomiques connues. Dans un deuxième temps, nous avons utilisé la pyrolyse d'ADN total avec GC-MS ou GC-AED, pour caractériser des staphylocoques ou des mycobactéries. Pour les deux genres étudiés, une identification au niveau de l'espèce semble possible, mais pas l'épidémiologie, du moins pas pour l'instant.

Spongiaires Irciniidae de Méditerranée : Chimiotaxonomie, métabolites volatils et bio-indicateurs de pollution par les éléments traces métalliquesLe projet de recherche qui m’a été confié concerne l’étude des éponges Irciniidae de Méditerranée : Ircinia oros, I. variabilis, I. dendroides, Sarcotragus spinosulus et S. foetidus ; collectées, dans le cadre du programme ECIMAR (ANR Biodiversité 2006), dans huit différents sites : détroit de Gibraltar (Ceuta - Espagne), bassin nord occidental (Costa Blanca et l’Estartit – Espagne et Banyuls, Marseille et l’île de Corse - France) et le bassin oriental (Crète - Grèce et Liban).La famille Irciniidae est actuellement constituée de trois genres : Ircinia, Sarcotragus et Psammocinia. La systématique de ces éponges est relativement complexe. Ainsi, le statut de Sarcotragus est considéré comme incertain et la distinction entre certaines espèces d’Ircinia fait encore l’objet de nombreuses discussions. Pour tenter de clarifier ce désordre de la classification biologique, nous avons choisi, dans un premier temps, une étude chimiotaxonomique basée sur la RMN 1H et les analyses multivariées. Par cette approche de métabolomique des différentes espèces, nous avons pu démontrer que les genres Ircinia et Sarcotragus sont caractérisés, d’un point de vue chimique, par des marqueurs chimiotaxonomiques appartenant respectivement à la famille des furanoterpènes et des hydroquinones prénylées.Dans un second temps, nous avons mené une étude comparative des composés volatils présents dans les espèces I. oros, I. variabilis, I. dendroides et S. spinosulus, provenant de trois sites : Marseille, Ceuta et Costa blanca. En effet, des composés volatils comme le diméthylsulfure, le méthylisocyanate et le méthylisothiocyanate, sont présents dans Ircinia felix et ils sont responsables de la forte odeur caractéristique et nauséabonde de cette espèce. L’identité et le rôle écologique potentiel de l’ensemble des volatils sont encore peu étudiés. Plusieurs hypothèses concernant leurs origines ont été proposées (éponge et/ou symbiote) sans toutefois parvenir à une conclusion certaine. De plus, les composés volatils présents dans les éponges Sarcotragus n’ont pas été étudiés, bien qu’elles se distinguent également par une forte odeur. Dans ce cadre, nous avons mis au point un protocole d’étude des composés volatils des spongiaires en utilisant la microextraction SPME de l’espace de tête et l’analyse par CG-SM et/ou CG*CG-MS. Les composés identifiés sont des alcanes, des alcènes, des aldéhydes, des dérivés furaniques et soufrés, issus fort probablement de la dégradation de terpénoïdes par les bactéries associées aux éponges.Enfin, nous avons réalisé une étude comparative de la bioaccumulation d’éléments trace métalliques (ETM) par I. oros, I. variabilis et S. spinosulus, afin d’identifier de potentiels bioindicateurs de pollution par les ETM dont la contamination a considérablement augmenté en Méditerranée pendant ces 20 dernières années. Notre étude a révélé que les différentes espèces semblent bioaccumuler l’arsenic, le chrome, le cuivre, le fer et le plomb, alors qu’elles régulent le cadmium<br>The Irciniidae marine sponges from the Mediterranean Sea: secondary metabolism, volatile compounds and potential bio-indicators of a heavy metal pollutionMarine sponges of the Irciniidae family (I. oros, I. variabilis, I. dendroides, S. spinosulus and S. foetidus) collected during the french ANR program ECIMAR from eight different areas over the Mediterranean Sea: Gibraltar Straits (Ceuta - Spain), North Western basin (Costa Blanca and Estartit – Spain and Banyuls, Marseille and Corsica Island - France, and Monaco) and Eastern basin (Crete - Greece and Lebanon) were studied.We used first a chemotaxonomical approach based on 1H NMR chemical fingerprints and multivariate analysis to better characterize the species. Systematic of the Irciniidae family is still unclear, notably the status of Sarcotragus is viewed as uncertain and the distinction of some Ircinia species remains difficult. To clarify this biological classification disorder, we used a chemosystematics strategy. In the present study, we showed that Ircinia and Sarcotragus genera are chemically characterized by chemotaxonomic markers belonging to furanoterpenes and prenylated hydroquinones families respectively. We report also a comparative GC-MS analysis of the volatile components of S. spinolusus, I. oros, I. variabilis and I. dendroides using static headspace solid phase microextraction (HS-SPME). Sponges of the genus Ircinia were described to exude low-molecular-weight volatile compounds (e.g., dimethyl sulfide, methyl isocyanide, methyl isothiocyanate) that give these sponges a characteristic strong and unpleasant odor. To date, the volatile constituents of sponges of the genus Sarcotragus have not been studied, though their odor is no lighter than the associated genus Ircinia from the same family. The impact of different parameters (e.g., sample weight, fiber coating, extraction time and temperature) was evaluated to determine the best conditions of analysis. The types of compounds identified include alkanes, alkenes, aldehydes, ketones, furans, and sulfides probably produced from bacterial degradation of naturally occurring terpenoids. Finally, we performed a comparative study on metal bioaccumulation by I. oros, I. variabilis, and S. spinosulus to select the most suitable species for metal monitoring. Contamination by heavy metals has increased drastically in the coastal Mediterranean during the last 20 years. Arsenic, chromium, copper, iron and lead bioaccumulation were shown to fit an accumulation strategy, while cadmium seemed to be bio-regulated

L’étude de plantes utilisées en médecine traditionnelle camerounaise contre le paludisme a révélé des activités antiprotozoaires pour des espèces du genre Psorospermum conduisant à l’isolement d’anthranoïdes prénylés. De nouveaux fractionnements basés sur des techniques chromatographiques en polarité de phase inverse et de partage centrifuge ont permis d’isoler 9 vismiones de l’écorce de P. glaberrimum qui ont montré de fortes activités antileishmaniennes (30 nM &lt; CI50 &lt; 827 nM). Un protocole d’isolement à l’échelle du gramme de ces molécules, sensibles aux conditions classiques de purification, a été développé pour fournir les quantités nécessaires à une démarche d’hémisynthèse et pour comprendre leur mécanisme d’action. La répartition de ces molécules dans les organes de 10 espèces de Psorospermum a été étudiée. Une approche de synthèse organique a également été développée afin d’obtenir des analogues, déterminer leurs activités antiprotozoaires et leurs relations de structure-activité<br>The screening of plants used in Cameroonian traditional medicine against malaria revealed significant antiprotozoal activities for species belonging to the Psorospermum genus and led to the isolation of prenylated anthranoids. Further fractionations based on reversed-phase and centrifugal partition chromatography allowed us to isolate 9 vismiones from the bark of P. glaberrimum. All these compounds exhibited strong antileishmanial activities (30 nM

Quatre genres de Sargassaceae présentant de forte biomasse en Bretagne et/ou dans le Pacifique Sud ont été choisi comme modèles de cette étude. Les objectifs étant i) de mieux comprendre l'écologie chimique des Sargassaceae en milieu tempéré et en milieu tropical, ii) de rechercher des chimiomarqueurs spécifiques à certaines espèces et iii) de rechercher de molécules potentiellement bioactives. Ainsi, un travail pluridisciplinaire a été entrepris avec l'étude de l'écologie chimique des Sargassaceae, en Bretagne d'une part, via l'étude des variations spatio-temporelles de certains composés de défenses synthétisés par Sargassum muticum, Bifurcaria bifurcata et Cystoseira baccata associé à un suivi écologique de ces espèces et dans le Pacifique Sud d'autre part, via l'étude de ces mêmes composés de défenses au sein de Turbinaria sp. et Sargassum sp provenant de différents sites. Parallèlement, deux études de chimiotaxonomie ont été menées. D'une part sur le genre Turbinaria afin d'identifier un ou des chimiomarqueur(s) permettant de discriminer T. ornata et de T. conoides. Et d'autre part sur B. bifurcata afin de mieux comprendre la répartition géographique des types chimiques existants au sein de cette espèce. Puis, pour répondre au troisième objectif de cette thèse, trois activités biologiques ont été recherchées en priorité au sein des espèces étudiées: la cytotoxicité, l'activité anti-inflammatoire et la neurotoxicité. Les résultats de cette étude ont permis i) de mettre en évidence l'impact des conditions environnementales sur les variables biologiques et écologiques étudiées chez ces espèces en milieu tempéré comme en milieu tropical ; ii) d'identifier l'acide turbinarique comme étant un chimiomarqueur de l'espèce T. conoides et de mettre en évidence l'existence d'écotypes chez B. bifurcata ; iii) de rapporter l'activité anti-phospholipase A2 d'acides gras issus d'algues du Pacifique Sud et l'activité antiradicalaire et antioxydante de l'éléganolone isolée chez B. bifurcata.

Ce mémoire est consacré à l'étude chimique de l'extrait lipidique de quelques Phéophycées issues des genres Bifurcaria et Bifurcariopsis (Fucales, Cystoseiracées). La première partie a pour objet l'analyse des données bibliographiques sur les caractères biologiques des espèces étudiées et sur la composition chimique des algues brunes. La deuxième est axée sur la méthode d'obtention des composés étudiés ainsi que sur leur caractérisation structurale. L'isolement de ces métabolites est mené à l'aide de diverses techniques chroniatographiques (CC, CCM et CLHP) et leur élucidation structurale est obtenue grâce à différentes méthodes spectrales (SM, IR, UV, RMN !H et ' C, séquences DEPT et expériences de RMN 2D homo- et hétéronucléaires). Il s'agit, notamment, de sept nouveaux diterpènes linéaires isoles à partir d'échantillons de Bifurcaria bifurcata récoltés en différents lieux géographiques sur les côtes atlantiques françaises et marocaines. L'étude des variations saisonnière et géographique de la composition diterpéniquc de certains extraits, réalisée à des fins chimiotaxonorniques, constitue la troisième partie de cette thèse. La détermination des activités biologiques (antibactérienne, antifongique et antifouling) des extraits obtenus et des composés isolés complète ce travail et est rapportée en quatrième partie<br>This thesis covers the isolation, the structural elucidation and the quantitative analysis of novel secondary metabolites from a marine brown alga (Bifurcaria bifurcatd) belonging to the Cystoseiraceae family (Fucales, Phaeophyceae). The first part is a bibliographic study on the biology of the species of the both genera (Bifurcaria and Bifurcariopsis) we have studied, and on the chemical composition of brown algae. Second part is dedicated to the isolation and the structural analysis of novel secondary metabolites from B. Bifurcata. The isolation of these compounds was carried out by chromatographic methods (CC, TLC and HPLC) and their structural analysis mainly by spectral analysis methods (MS, IR, UV, 1H and 13C NMR, DEPT and 2D NMR experiments). The study of variations in the chemical composition of the lipid extract from this alga depending the date and place of harvest (with a HPLC method of analysis) completes this work from a chemotaxonomic point of view and is included in the third part of this thesis. The fourth and last part draws up the biological activities (antifouling, fungicidal and antibacterial) of extracts and compounds we have studied

Quatre genres de Sargassaceac présentant de forte biomasse en Bretagne et/ou dans le Pacifique Sud ont été choisi comme modèles de cette étude. Les objectifs étant i) de mieux comprendre l’écologie chimique des Sargassaceae en milieu tempéré et en milieu tropical, ii) de rechercher des chimiomarqueurs spécifiques à certaines espèces et iii) de rechercher de molécules potentiellement bioactives. Ainsi, un travail pluridisciplinaire a été entrepris avec l’étude de l’écologie chimique des Sargassaceae, en Bretagne d’une part, via l’étude des variations spatio-temporelles de certains composés de défenses synthétisés par Sargassum muticum, Bjfurcaria bifurcata et Cystoseira baccata associé à un suivi écologique de ces espèces et dans le Pacifique Sud d’autre part, via l’étude de ces mêmes composés de défenses au sein de Turbinaria sp. Et Sargassum sp provenant de différents sites. Parallèlement, deux études de chimiotaxonomie ont été menées. D’une part sur le genre Turbinaria afin d’identifier un ou des chimiomarqueur(s) permettant de discriminer T. Ornata et de T. Conoides. Et d’autre part sur B. Bifurcata afin de mieux comprendre la répartition géographique des types chimiques existants au sein de cette espèce. Puis, pour répondre au troisième objectif de cette thèse, trois activités biologiques ont été recherchées en priorité au sein des espèces étudiées: la cytotoxicité, l’activité anti-inflammatoire et la neurotoxicité. Les résultats de cette étude ont permis i) de mettre en évidence l’impact des conditions environnementales sur les variables biologiques et écologiques étudiées chez ces espèces en milieu tempéré comme en milieu tropical; ii) d’identifier l’acide turbinarique comme étant un chimiomarqueur de l’espèce T. Conoides et de mettre en évidence l’existence d’éeotypes chez B. Bifurcata; iii) de rapporter l’activité anti-phospholipase A2 d’acides gras issus d’algues du Pacifique Sud et l’activité antiradicalaire et antioxydante de l’éléganolone isolée chez B. Bifurcata<br>Four Sargassaceae genus presenting high biomass in Brittany and/or in the South Pacificwere chosen as models of this study. The aims of this works were i) to understand the chemical ecology of Sargassaceae in temperate and tropical environment, ii) to characterize specific chemomarkers from certain species and iii) to identify potential bioactive molecules. Then, a pluridisciplinary work was carry out with the study of the chemical ecology of Sargassaceae, in Brittany on one hand, with the study of the spatio-temporal variations of certain defense compounds of Sargassum muticum, Bifurcaria bifurcata and Cystoseira baccata associated with an ecological survey of these species and in the South Pacific on the other hand, with the study of these same defense compounds within Turbinaria sp. And Sargassun sp from various sites. At the same time, two chemotaxonomical studies were led. On the Turbinaria genera to identify one or several chemomarker(s) allowing discriminating T. Ornata and T. Conoides. And on the other hand, on B. Bifurcata to understand the geographical distribution of the existing chemical types within this species. Then, to answer the third objective of this work, three biological activities were looked for first and foremost within the studied species: cytotoxicity, anti-inflammatory activity and neurotoxicity. The results allowed i) to highlight the impact of the environmental conditions on the biological and ecological variables studied to these species in temperate and tropical enviromnents; ii) to identify the acid turbinaric as a chemomarker of T. Conoides and to highlight the existence of ecotypes from B. Bifurcata; iii) to report the anti-phospholipase A2 activity of fatty acids stemming from tropical seaweeds and the antiradical and antioxidant activities of eleganolone isolated from B. Bifurcata

Le projet « Viola Tolosa » a pour objectif de valoriser une plante produite en Occitanie, la violette et plus particulièrement l’emblématique violette de Toulouse, pour des domaines essentiellement non alimentaires tels que la chimie des substances naturelles et la cosmétique. Les violettes appartiennent au genre Viola qui comprend plus de 500 espèces. Aujourd’hui, leurs usages sont principalement limités à des aspects ornementaux et culinaires. Néanmoins, l’intérêt croissant de la part des acteurs de la filière (industriels, cultivateurs et académiques) a conduit la région Occitanie à mettre en place le projet Viola Tolosa intitulé « Spéciation chimique de la collection nationale des violettes et mise en place d’un agro-raffinage de la violette de Toulouse ». Il comporte quatre aspects interdisciplinaires associant aspects fondamentaux et applicatifs. La caractérisation de la centaine de plants de la collection de violettes détenue par les serres municipales de Toulouse, identifiée à 80% par des noms de cultivars ou vernaculaires, a été réalisée par l’intermédiaire d’études génétique et chimiotaxonomique. Une première étude génétique basée sur les séquences des espaces internes transcrits a permis de classer 58% de la collection au rang d’espèce. Cette étude phylogénétique a été complétée par une étude chimiotaxonomique à l’aide des profils chimiques des fractions volatiles des fleurs et non-volatiles des parties aériennes de la collection. Une projection orthogonale de structures latentes a permis d’indexer 96% de l’ensemble des plants par un nom d’espèce. L’étude des métabolites secondaires non volatils des feuilles a été entreprise dans le but d’étudier le potentiel biologique des violettes, notamment les activités antioxydante, antifongique et inductrice des réponses immunitaires des plantes. L’étude détaillée d’un extrait hydroalcoolique de la violette de Toulouse a permis d’identifier huit composés antioxydants de la famille des flavonoïdes et des coumarines, dont trois ont été caractérisés par RMN 1D et 2D et deux de novo dérépliqués par réseau moléculaire. L’application sur l’ensemble de la collection a ensuite permis d’identifier six composés antioxydants, dont deux coumarines et quatre flavonoïdes, prépondérants chez deux espèces. Une relation espèce-activité a donc été mise en évidence. Au niveau des activités antifongiques, réalisées sur cinq souches de champignons, et de défenses végétales, par l’intermédiaire de l’étude de l’expression du gène marqueur « pathogenesis-related protein 1 », les résultats sont plus ambigus. Cependant, certaines espèces ont présenté une activité plus prononcée que les autres et ce criblage a permis de poser une hypothèse forte quant à l’implication des cyclotides. Finalement, l’ensemble de ces travaux a permis d’obtenir une carte d’identité des violettes de la collection (identification génétique, profil chimique, potentiel biologique) et une description semi-quantitative de l’ensemble des groupes chimiques est proposée par combinaison des données chromatographiques du détecteur Corona (CAD) et des données spectrales. Différentes méthodes d’extraction (électroporation, micro-ondes, CO2 supercritique et extraction hydroalcoolique) répondant aux préceptes de la chimie verte ont ensuite été comparées afin de sélectionner celle présentant le meilleur compromis entre le cahier des charges cosmétiques et l’enrichissement en molécules d’intérêt, en vue d’un transfert technologique<br>The "Viola Tolosa" project aims to promote a plant produced in Occitanie region, the violet and especially the emblematic violet of Toulouse, essentially for non-food fields such as the chemistry of natural compounds and cosmetics. Violets belong to Viola genus including more than 500 species. Today, their uses are mainly limited to ornamental and culinary aspects. Nevertheless, the growing interest of the actors of the sector (industrials, growers and academicals) led the Occitanie region to implement the Viola Tolosa project entitled "Chemical speciation of the national collection of violets et establishment of an agro-refining of the violet of Toulouse ". It comprises four interdisciplinary aspects associating fundamental and applicative aspects. The characterization of the 100 or so plants in the violet collection owned by the Toulouse municipal greenhouses, including 80% identified by cultivar or vernacular names, was carried out through genetic and chemotaxonomic studies. A first genetic study based on internal transcribed spacers conducted to classify 58% of the collection as a species. This phylogenetic study was completed by chemotaxonomic studies of chemical profiles of flowers volatile fractions and non-volatile aerial parts of the collection. Discriminant analysis of orthogonal projection to latent structure model finally allowed indexation of 96% of all plants with a species name. Study of non-volatile secondary metabolites of leaves has also been undertaken to study the biological potential of violets, including antioxidant, antifungal and defense inducer. The detailed study of a hydroalcoholic extract of the violet of Toulouse allowed the identification of eight antioxidant compounds belonging to flavonoids and coumarins. Three of them have been characterized by 1D and 2D NMR and two were de novo dereplicated through molecular network. The application to the whole collection conducted to highlight six antioxidant compounds, including two coumarins and four flavonoids, predominant in two species. A species-activity relationship was therefore highlighted. Regarding antifungal activities carried out on five fungal strains, and defense inducer through the study of pathogenesis-related protein 1, the results are more ambiguous. However, some species showed better activity than others and this screening led to a strong hypothesis regarding the involvement of cyclotides. Finally, all this work led to the establishment of an identity card of violets of the collection (genetic identification, chemical profiling, et biological potential) et a semi-quantitative description of all the species is considered by combining chromatographic data based on corona detector et spectral data. Different methods of extraction (electroporation, microwaves, supercritical CO2 et hydroalcoholic extraction) corresponding to green chemistry precepts were then compared in order to select the one presenting the best compromise between cosmetic specifications et enrichment in molecules of interest, for technological transfer

Trichomanes speciosum Willd. , une des Ptéridophytes les plus rares d'Europe, est particulièrement menacée dans le Massif Armoricain. Les frondes se développent principalement dans des puits et sont soumises à de fortes pressions anthropiques. Cependant, des gamétophytes peuvent se maintenir, indépendamment, en milieu naturel. Par une étude multidisciplinaire, des réponses sont apportées sur l'écologie, la biologie et la physiologie particulières de la fougère. Il est prouvé, par des analyses de chimiotaxonomie et de taxonomie moléculaire, que les gamétophytes indépendants sont véritablement le Trichomanès remarquable, de même que des frondes de morphologie atypique récemment découvertes dans deux stations forestières. La confrontation des données chorologiques, écologiques, biologiques et écophysiologiques montre et explique que les gamétophytes présentent une aire de répartition plus large que les sporophytes, du fait de leur capacité à coloniser une plus grande diversité d'habitats caractérisés par des conditions environnementales extrêmes. La rareté des sporophytes du Trichomanès remarquable en milieu naturel armoricain ne résulte pas d'un défaut de reproduction sexuée. Les sporophytes produits se nécrosent par déficience physiologique avant de parvenir au stade adulte. En effet, les exigences des sporophytes ne semblent pas compatibles avec le très faible éclairement (jusqu'à seulement 0,5 pmol. M-2. Sec-1) et les périodes transitoires de sécheresse caractéristiques des stations de gamétophytes indépendants. Sur la base de ces résultats convergents, un ensemble de mesures est proposé pour la conservation de Trichomanes speciosum Willd. Dans le Massif Armoricain<br>Trichomanes speciosum Willd. , one of the most endangered European Pteridophytes, is particularly threatened in the Massif Armoricain (NW France). The fronds of the fem are for the most part recorded in wells and are submitted to intense human pressure. However, some gametophytes are able to maintain, independently, in natural habitat. Through a pluridisciplinary study, responses are brought about the peculiar ecology, biology and physiolog~, of the fem. It is proved, thanks to chemotaxonomic and molecular analyses, that the independent gametophytes are really belonging to the Killamey fer as well as the fronds with non typical morphology recently discovered in two forested sites. The confrontation of chorological, ecological, biological and ecophysiological data shows and explains that the larger distribution area of the gametophytes is related to their capacity to colonize a great diversity of habitats characterized by extreme environmental conditions. The scarcity of the sporophytes in natural habitat of the region is not related to a default of the sexual reproduction. The produced sporophytes undergo necrosis because of a physiological deficiency before reaching the mature stage The sporophytes requirements do not seem to be compatible with the very low light availability (until only 0,5 pmol. M-2. Sec-1) and the transient perioé of drought characterizing the independent gametophyte sites. On the basis of these results, measures are proposed for the conservation of Trichomanes speciosum Willd. In the Massif Armoricain

L’étude phytochimique des hépatiques de la Nouvelle-Calédonie a été réalisée sur 34 espèces d’hépatique (dont 14 endémiques) appartenant à six familles (Plagiochilaceae, Lophocoleaceae, Lepidoziaceae, Porellaceae, Lejeuneaceae et Frullaniaceae). La composition chimique, notamment en constituants volatils principalement sesquiterpéniques, de ces espèces a pu être établie pour la première fois pour la majorité des espèces étudiées, et il s’agit de la première étude phytochimique réalisée sur les genres Chiastocaulon et Acromastigum. Environ 260 constituants ont pu être déterminés pour ces espèces ci-étudiées, ils appartiennent en majorité à la famille des terpénoïdes, et à d’autres familles de métabolites secondaires d’intérêt tels que les composés aromatiques. Quatre nouveaux produits naturels ont pu être isolés et caractérisés.L’activité antibactérienne d’extraits d’espèces issues de trois familles (Plagiochilaceae, Lepidoziaceae, Lejeunaceae) a été montrée sur deux souches bactériennes (Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis). Les extraits à l’éther les plus actifs sont ceux de Bazzania parisii (actif sur S. epidermidis avec une CI50 de 19,3±0,8 μg/ml) et de Bazzania subintegra (actif sur S. aureus avec une CI50 de 16,3±1,1 μg/ml). Les extraits méthanoliques les plus actifs sont ceux : de Bazzania serrifolia (actif sur S. aureus avec une CI50 de 17,7±1,9 μg / ml), de Chiastocaulon caledonicum (actif sur S. aureus avec une CI50 de 6,7±1 μg/ml), de Bazzania sp. AD212 (actif sur S. epidermis avec une CI50 de 14,1±1 μg/ml) et de Bazzania francana (actif sur S. epidermis avec une CI50 de 17,0±1,6 μg/ml)<br>Phytochemical survey of 34 New-Caledonian liverwort species (including 14 endemic species) belonging to six families (Plagiochilaceae, Lophocoleaceae, Lepidoziaceae, Porellaceae, Lejeuneaceae, and Frullaniaceae) had been performed. Chemical composition of these species, mostly of volatile constituents, had been established for the first time for most of them and phytochemical study of species from Chiastocaulon of Acromastigum genus had been performed for the first time. Nearly 260 compounds were reported as identified constituents of these plants extracts, most of them being terpene. Four new natural products had been characterized.Antibacterial activity of liverworts extracts from three Hepaticeae families (Plagiochilaceae, Lepidoziaceae, and Lejeuneaceae) had been shown on two strains (Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis). The most active ether extracts were found to be those from Bazzania parisii (active on S. epidermidis having an IC50 of 19.3±0.8 μg/ml) and from Bazzania subintegra (active on S. aureus having an IC50 of 16.3±1.1 μg/ml). The most active methanolic extracts were found to be respectively from : Bazzania serrifolia (active on S. aureus having an IC50 of 17.7±1.9 μg / ml), Chiastocaulon caledonicum (active on S. aureus having an IC50 of 6,7±1 μg/ml), Bazzania sp. AD212 (active on S. epidermis having an IC50 of 14.1±1 μg/ml) and Bazzania francana (active on S. epidermis having an IC50 of 17.0±1.6 μg/ml)

Les venins sont des armes sophistiquées, utilisées par les organismes venimeux pour se défendre des prédateurs, ainsi que pour paralyser et tuer leurs proies. Mais dans la nature, le bien n’est jamais très loin du mal, les toxines venimeuses pouvant se révéler être des agents thérapeutiques efficaces. Les peptides de venins de fourmis ont donc été étudiés dans cette thèse afin de déterminer le potentiel de ces toxines pour la découverte de molécules thérapeutiques innovantes. A l’instar des autres venins d’insectes, les venins de fourmis restent peu étudiés, principalement en raison de la petite taille de ces insectes et des quantités limitées de venins disponibles. Cependant, les fourmis offrent l’avantage d’être des insectes sociaux très abondants dans tous les milieux terrestres. En collectant les venins de plusieurs individus, il est donc possible d’obtenir des quantités suffisantes de venin pour les analyses biochimiques et pharmacologiques.Afin d’assurer la reproductibilité des analyses, une identification taxonomique correcte est nécessaire. Dans cette optique, un outil de chimiotaxonomie a été développé durant cette thèse (permettant ainsi de regrouper les venins provenant de plusieurs colonies afin de compenser les faibles quantités de matériel biologique par individu ou par colonie).Ensuite, nous nous sommes intéressés aux facteurs écologiques impliqués dans la diversification des venins de fourmis. Pour cela, la toxicité et la composition des venins de fourmis ont été analysés en relation avec le polyéthisme, la spécialisation alimentaire et la spécialisation défensive.La diversité écologique des fourmis a amplement contribuée à la diversification des venins. En étudiant les venins de 82 espèces de fourmis, nous avons révélé la grande diversité structurale des toxines. Bien que la majorité des peptidomes sont composés par de petits peptides linéaires, des peptides structurés par des ponts disulfure ont été révélés dans de nombreux venins et constituent de nouvelles familles structurales de toxines.La purification de certains de ces peptides à ponts disulfure a permis leur caractérisation biochimique et l’évaluation de leur rôle biologique. Ainsi nous avons décrit un groupe de peptides neurotoxiques, baptisés les formicitoxines qui sont capables de bloquer les canaux calcium humains de type L. La commutatoxine est, quant à elle, un peptide avec un pont disulfure qui semble activer les récepteurs humains TRPV1 et TRPV3 et laisse supposer une implication dans l’induction de la douleur chez les mammifères.La grande diversité des peptides mise en évidence dans les venins, associée à la grande diversité écologique et taxonomique des fourmis, suggère que les venins de fourmis constituent un nouveau champ d’exploration prometteur pour la recherche de molécules thérapeutiques et insecticides. Les venins de fourmis s’ajoutent à la chimiothèque conséquente déjà représentée par les venins des autres animaux venimeux<br>Venoms are sophisticated weapons employed by venomous organisms to ward off predators, as well as to subdue and kill prey. However, in nature, good is never far from bad and venom toxins may prove to be efficient therapeutic agents. Ant venom peptides were investigated in the course of this thesis to evaluate their potential in the discovery of novel drugs. Like other insect venoms, ant venoms remain understudied, mainly due to the small size of individual ants and, so, the limited a mount of venom available. The ecological diversity of ants has largely contributed to venom diversification. By studying the venom peptidomes from 82 ant species, we have revealed the great structural diversity of the toxins. Although the majority of the peptidomes are comprised of small and linear peptides, peptides structured by disulfide bonds were also brought to light in numerous venoms and constitute novel structural classes of toxins. The purification of some of these disulfided peptides permitted their biochemical characterization and the assessment oft heir biological functions. The enormous peptide diversity revealed among venoms combined with the great ecological and taxonomical diversity of ants suggests that ant venoms constitute a promising new source in the search for both novel drugs and insecticides. Ant venom augments the vast bioactive molecules library represented by venoms from other venomous animals

De nombreuses biomolécules qui constituent les plantes vasculaires ne sont synthétisées que par certains taxons de plantes et ont donc une spécificité chimiotaxonomique. Certaines d'entre elles, tels que les bioterpénoïdes, sont particulièrement résistantes et sont préservées dans les sédiments où elles se transforment en géoterpénoïdes lors de la diagenèse. Ces géoterpénoïdes conservent, partiellement ou totalement, leur spécificité initiale (spécifité paléochimiotaxonomique). Cependant, nos connaissances actuelles en paléochimiotaxonomie botanique, qui permettent d'associer ces biomarqueurs moléculaires à des taxons végétaux, restent encore lacunaires. L'objectif de cette étude est de déterminer la signature moléculaire des familles de conifères fossiles. 68 représentants appartenant aux 7 familles actuelles de conifères ont été artificiellement maturés par pyrolyse en milieu confiné afin de reproduire en laboratoire la transformation des bioterpénoïdes en géopterpénoïdes. Les résultats montrent que les Pinaceae, les Araucariaceae, les Cupressaceae, les Sciadopityaceae, les Podocarpaceae, les Taxodiaceae et les Taxaceae "fossilisés" peuvent se distinguer par la nature et la proportion relative de ces terpénoïdes. De plus, la comparaison des signatures moléculaires ont permis de réaliser des regroupements intergénériques pour chaque famille. Ces regroupements sont comparables avec ceux de la classification phylogénétique. À terme, ces résultats pourront être utilisés dans le cadre d’études paléobotaniques, paléoenvironnementales, environnementales et archéologiques<br>Many biomolecules that constitute terrestrial vascular plants are only synthesized by a restricted number of plant taxa and have thus a chemotaxonomic specificity. Some of these biomolecules, like the terpenoids, are particularly resistant and can be preserved within sediments where they are transformed into geomolecules during diagenesis. Geoterpenoids keep, partially or totally, their initial specificity (palaeochemotaxonomic specificity). However, our current knowledge in botanical palaeochemotaxonomy, allowing to link these plant biomarkers to plant taxa, remains incomplete. The aim of this study is to determine the molecular signature of fossil conifers. In this objective, 68 species belonging to the 7 extant conifer families were subjected to artificial maturation by confined pyrolysis. This process converts the bioterpenoids included within the plant material into geoterpenoids. The results show that the "fossilized" Pinaceae, Araucariaceae, Cupressaceae, Sciadopityaceae, Podocarpaceae, Taxodiaceae and Taxaceae can distinguished from each other by the nature and the relative proportion of these geoterpenoids. The comparison of these molecular signatures allows to achieve intergeneric groups for each family. These groups are comparable to those of the phylogenetic classification. In the future, these results could be used for palaeobotanical, palaeoenvironmental, environmental and archaeological assessments

La diversité biologique représente une richesse très importante et précieuse pour l'humanité. Mais cette diversité diminue rapidement et son érosion entraîne des pertes massives. Ainsi sa mise en évidence et son exploitation sont un devoir capital. Une des méthodes les plus satisfaisantes actuellement pour évaluer la variabilité est l'étude enzymatique (par séparation électrophorétique) accompagnée d'une bonne analyse génétique. Notre travail s'insère dans ce contexte, l'objectif visé est l'analyse de la variabilité enzymatique intra et interspécifique de 9 espèces spontanées et cultivées du genre Lathyrus d'origine géographique différente. Il consiste par la suite à réviser et éclaircir le statut taxonomique de ces espèces et examiner les effets de la domestication sur la diversité génétique. Les résultats les plus marquants sont les suivants: 1) variabilité intraspécifique très importante chez toutes les espèces étudiées, quels que soient l'origine de l'espèce ou son régime de reproduction; 2) absence de regroupement géographique; 3) les marqueurs enzymatiques utilisés permettent de différencier les différentes espèces, à l'exception de la population de Tours de L. Latifolius. Cependant, nous pensons que le regroupement de ces taxons en sections reflétant leur similitude devrait s'organiser un peu différemment surtout à l'intérieur de la section Lathyrus. Nous estimons qu'il est nécessaire d'élever L. Tuberosus, L. Hirsutus et L. Odoratus à un rang taxonomique autre que celui ou ils sont classés actuellement; 4) au niveau interspécifique, la parenté la plus marquée existe entre les populations de L. Sylvestris, L. Heterophyllus et L. Latifolius.

Dans le tome 1, après un bref rappel de la biologie des spongiaires, une étude bibliographique concernant les genres luffariella, péprosia, xestospongia et haliclona a été realisée afin de mettre en évidence la divertsité des molécules isolées (alcaloïdes, stéroïdes, polyacétylènes, quinones, acides gras bromes) et de préciser leurs activités biologiques : antivirales, antifongiques, antibactériennes, antitumorales, anti-inflammatoires parmi les cinq éponges étudiées provenant de Mayotte (Océan Indien), l'une d'entre elle, luffariella cf. Variabilis s'est particulièrement distinguée : tout d'abord par l'absence de stérols puis par sa richesse en métabolites secondaires comprenant, d'une part, cinq sesterterpènes : le manoalide (0,029% du poids sec de l'éponge), le secomanoalide (0,022%). Le monoacétate de manoalide (0,0026%) et deux dérivés du manoalide isolés pour la première fois à savoir le 24-ethoxymanoalide (0,001%) et le 24-ethoxymanoalide (0,0029%). Non seulement, ces sesterterpènes ont permis par leur présence d'établir des critères chimiotaxomiques pour les éponges appartenant à la famille des thorectidäe mais certains d'entre eux ont aussi révelé une activité biologique concernant les tests antitumoraux. D'autre part, six stéroïdes particuliers appartenant au groupe des 5α, 8α-épidioxystérols et représentant 0,21% de la matière sèche de l'éponge ont également été isolés de cette éponge. Ces composés se sont révelés biologiquement actifs lors des tests antitumoraux et antiviraux (HTLV-I). L'isolement des métabolites a fait appel aux techniques classiques de fractionnement CCM, CC et CLHP. L'élucidation des structures a été réalisée par IR, SM, RMN (¹H, ¹³C, DEPT, COSY, HMQC, HMBC). Les quatre autres éponges : pétrosia sphéroïda, xestospongia sp. , haliclona sp. 1 et haliclona sp. 2 ont plus spécifiquement fait l'objet d'une anlyse détaillée de leur composition stérolique menée conjointement avec une discussion chimiotaxonomique. C'est ainsi que la présence du pétrostérol (50%), stérol majoritaire, a été décellée chez Petrosia spheroïda conformément aux éponges du même genre. Xestospongia sp. Contenant 92,9% de stérols conventionnels (C₂₇, C₂₈ et C₂₉ insaturés en ∆⁵, ∆5,22 ∆⁵̓́²⁴⁽²⁸⁾) se classe dans l'une des trois catégories d'éponges du genre xestospongia répertoriées dans la littérature et établies selon des critères chimiotaxonomiques. Enfin, si la composition stérolique d'haliclona sp. 1 (100% de stérols conventionnels ∆⁵ dont 53% de C₂₇ et 32,8% de C₂₈) se rapproche sans ambigüité de celle des éponges du genre haliclona, il n'en est pas de même pour haliclona sp. 2. En effet cette éponge met en évidence un profil ressemblant fortement à celui des éponges du genre Reniera avec 76,6% de stérols conventionnels ∆⁵ et 20,8% de stanols. L'analyse des stérols a été effectuée essentiellement par CG et CG/SM. Les extraits bruts de ces quatre éponges ont été soumis aux tests antiviraux (HTLV-I, VIH) et antitumoraux. Des résultats fort prometteurs ont été obtenus à partir des éponges des genres xestospongia et haliclona. Le tome 2 rassemble les spectres SM et RMN ainsi que les chromatogrammes CG et CLHP.

Le genre Eryngium L. (Apiaceae, Saniculoideae) comprend plus de 250 espèces utilisées en médecine traditionnelle à travers le monde. En Tunisie il existe seulement huit espèces : E. barrelieri Boiss., E. campestre L., E. dichotomum Desf., E. glomeratum Lamk., E. ilicifolium Lamk., E. maritimum L., E. tricuspidatum L. et E. triquetrum Vahl. ; ces espèces sont en majorité peu étudiées du point de vue phytochimique. La présente étude a été effectuée sur la totalité des Eryngium qui poussent en Tunisie dans le but d’évaluer leurs activités biologiques, essentiellement antimicrobienne contre des microorganismes multirésistants et producteurs de béta-lactamases à spectres étendus (BLSE), mais aussi phototoxique et cytotoxique ainsi que la variabilité chimique par analyse par GC-FID et GC-MS des extraits les plus actifs.Toutes les espèces étudiées étaient dotées d’un pouvoir antimicrobien (1,25 à 0,07 mg/mL) et cytotoxique (24,4 à 0,32 µg/mL) considérable. Le criblage de l’activité phototoxique a permis de mettre en évidence la richesse de ces plantes en composés photoréactifs antimicrobiens potentiellement intéressants pour leur efficacité d’action et l’élargissement du spectre d’activité antimicrobienne.L’analyse des extraits actifs apolaires a permis d’étudier la variabilité chimique entre les différentes espèces et la mise en évidence de la présence majoritaire de composés antimicrobiens notamment des sesquiterpènes oxygénés tels que le spathulénol, le lédol, l’α-bisabolol et le cubénol, et des sesquiterpènes hydrocarbonés comme le β-bisabolène et le copaène ; et cytotoxiques tel que le falcarinol.Une étude phytochimique approfondie a été réalisée sur les racines d’E. triquetrum afin d’extraire, isoler par des essais bio-guidés et identifier les composés actifs. Le fractionnement a été optimisé par des chromatographies sur colonnes, CPC et CLHP. Parmi les composés identifiés deux polyacétylènes, le panaxydiol et le falcarinol, ont montré un fort pouvoir antimicrobien et une spécificité d’action notamment contre les souches de Pseudomonas aeruginosa BLSE et multirésistantes, avec des CMI allant jusqu’à 0,25 ng/mL et une activité en majorité bactéricide<br>The genus Eryngium L., (Apiaceae, Saniculoideae) comprises more than 250 flowering plant species, which are commonly used as medicinal plants in different countries. Only eight species are growing in Tunisia: E. barrelieri Boiss., E. campestre L., E. dichotomum Desf., E. glomeratum Lamk., E. ilicifolium Lamk., E. maritimum L., E. tricuspidatum L. et E. triquetrum Vahl. These species are used in traditional medicine and there are relatively few papers on the phytochemical investigations of most of them. This study was performed on all Eryngium species growing in Tunisia in order to evaluate their chemical variability using GC-FID and GC-MS analyses and their biological activities, mainly antimicrobial against multiresistant microorganisms and extended spectrum beta-lactamase producing bacteria (ESBL), and also phototoxic and cytotoxic effects.All investigated species showed considerable antimicrobial effect with MIC value ranging between 1,25 and 0,07 mg/mL and important cytotoxic activity against J774 tumoral cells with IC50 from 24,4 to 0,32 µg/mL. Phototoxic investigation demonstrated a significant photoactive inhibitory effects against tested pathogenic microorganisms.GC–MS analysis of the most active crude extracts (petroleum ether extracts) revealed their high content of antimicrobial agents particularly oxygenated sesquiterpenes such as spathulenol, ledol, α-bisabolol and cubenol, and hydrocarbon sesquiterpenes such as β-bisabolene and copaene; and cytotoxic components such as falcarinol.The chemical investigation and bio-guided isolation of active compounds of the selected crude extract of E. triquetrum roots were performed using column chromatography, centrifugal partition chromatography (CPC) and preparative high-performance liquid chromatography (HPLC). among purified components, two bioactive polyacetylenes, panaxydiol and falcarinol, showed a great antimicrobial activity mainly against multiresistant and ESBL producing Pseudomonas aeruginosa with MIC value up to 0,25 ng/ml and a mostly bactericidal effect

Afin d'apporter une aide pour la chimiotaxonomie du genre Stereocaulon, les acides gras totaux de dix espèces de Stéréocaulon, de quelques cyanolichens et d'une cyanobactérie ont été étudiés. Les profils obtenus des acides gras saturés, insaturés et ramifiés ont été comparés par classification hiérarchique ascendante. Les acides gras iso et antéiso pourraient permettre de distinguer le genre Stereocaulon des cyanolichens à la différence des autres classes d'acides gras. Dans un deuxième temps, l'étude phytochimique du lichen S. evolutum récolté en Bretagne a permis d'isoler et de caractériser 22 métabolites secondaires. Parmi ces composés, deux sont nouveaux. Sept molécules possèdent une structure proche de l'atranorine, depside abondant et récurrent chez les Stéréocaulons. L'atranorine ayant montré lors d'un criblage une activité intéressante sur le virus de l'hépatite C, six molécules ainsi que deux dérivés hémisynthétiques ont alors été évalués. L'atranorine et le 4-O-déméthylbarbatate de méthyle ont présenté une bonne activité anti-VHC, le premier ciblant l'étape de pénétration et le deuxième l'étape de réplication. D'autres composés, deux depsidones et cinq diphényléthers, ont été testés sur l'enzyme Protéine Tyrosine Phosphatase 1B (PTP1B) qui est une cible d'intétêt dans le traitement du diabète de type 2 et le cancer du sein. Les deux depsidones (acide lobarique, acide norlobarique) et un diphényléther, l'anhydro-sakisacaulon A, ont montré une inhibition de PTP1B avec des CI₅₀ similaires au témoin acide ursolique. La modélisation de cette enzyme ayant été réalisée en parallèle, les études de docking ont permis de proposer des mécanismes d'interactions mis en jeu lors de l'inhibition de PTP1B par ces métabolites secondaires lichéniques et d'envisager l'optimisation structurale de ces composés en vue d'augmenter leur activité<br>Total fatty acids (FA) of ten species of Stereocaulon in addition to cyanolichens and one cyanobacterium were studied. FA profiles based on saturated-, unsaturated- and branched chain-FAs were compared using a hierarchical ascendant classification. Cyanolichens differed from the Stereocaulon genus according iso- and anteiso-FAs profiles while no differences were seen according the other FAs families. The phytochemical study of Stereocaulon evolutum, harvested in Brittany, led to isolation and identification of 22 secondary metabolites. Two were new for lichens. Among the isolated compounds, seven compounds were structurally close to atranorin, a common and abundant depside in the Stereocaulon genus. In a previous screening, atranorin exhibited a noteworthy HCV inhibition, thus six lichen compounds and two synthetic molecules were also tested. Atranorin and methyl 4-O-demethylbarbatate were the most potent without any cytotoxicity, the first being active towards the virus penetration and the latter against the virus replication. Two depsidones and five diphenylethers were also isolated and were evaluated on the Protein Tyrosine Phosphatase 1B (PTP1B), a promising target for type 2 mellitus diabetis and breast cancer. Both depsidones (lobaric acid, norlobaric acid) and the diphenylether anhydrosakisacaulon A were as potent as the positive control ursolic acid. Simultaneously, a molecular docking study between PTP1B and the seven compounds suggested the most significant interactions to conceive possible more active compounds

Les resultats d'une analyse chimique des huiles essentielles de 18 especes aromatiques d'origine tropicale representatives des familles suivantes : lamiaceae (1), verbenaceae (1) et myrtaceae (16) sont presentes et discutes dans cette these. Deux especes ont ete recoltees au cameroun : hemizygia welwitschii et vitex madiencis ; la premiere espece est interessante pour sa teneur elevee en constituants susceptibles de trouver des applications dans l'industrie agro-alimentaire. Les especes representatives de la famille des myrtacees ont ete recoltees au bresil. L'une d'entre elles, calyptranthes tricona, se distingue par une teneur elevee en derives du chromene, dont les structures nouvelles, confirmees par synthese chimique, indiquent l'existence d'un processus biosynthetique original dans cette famille de plantes. Les autres especes fournissent des huiles essentielles tres complexes, de type sesquiterpenique, pour lesquelles un classement chimiotaxonomique a ete propose.

Le principal objectif de cette thèse, au caractère interdisciplinaire, concernait l'étude de l'éponge Biemna laboutei de Madagascar, connue pour sa toxicité (causant notamment des dermatites). Les travaux entrepris comprenaient en premier lieu, l'étude chimique de cette éponge incluant l'extraction, l'isolement et l'identification des métabolites secondaires par différentes techniques chromatographiques (CLMP, CLHP…) et spectroscopiques (UV-visible, HRMS, RMN 1D et 2D…). Dix-huit alcaloïdes appartenant à la classe rare des hétérocycles tricycliques (5,6,8b)-triazaperhydroacénaphtylène (i.e. ptilocaulines, mirabilines, nétamines) ont été isolés et identifiés. Douze de ces alcaloïdes tricycliques guanidiniques, de structures nouvelles, ont été nommées nétamines H-S. Ces composés ont été classés en fonction des insaturations de leur noyau tricyclique : type pyrimidine, insaturés en Δ8,8a et insaturés en Δ8a,8b. Pour deux des composés isolés, les nétamines I (58) et J (59), une étude configurationnelle reposant sur la comparaison de spectres UV et DCE, expérimentaux et théoriques (théorie de la fonctionnelle et de la densité), a permis la détermination de leurs configurations absolues : 5aS, 7R, 8R pour la nétamine I et 5aS, 7R, 8S pour la nétamine J. La valorisation des molécules isolées a ensuite été envisagée via d'une part la réalisation d'une étude chimiotaxonomique et d'autre part, l'évaluation de leurs activités biologiques (cytotoxicité, activité antipaludique, …). La nétamine M (62) a présenté une activité cytotoxique sur les cellules cancéreuses KB (CI50 = 1,0 μg/mL) et les nétamines O (64), Q (66) et K (60) se sont montrées actives contre le parasite Plasmodium falciparum, responsable du paludisme avec respectivement une CI50 de 4,66 ; 2,53 et 0,62 μg/mL. Enfin, au cours de ces travaux de thèse, ont été explorées trois nouvelles stratégies de synthèse conduisant au squelette des alcaloïdes guanidiniques tricycliques, suivant une approche biomimétique<br>The main purpose of this interdisciplinary thesis was to study Biemna laboutei, a sponge from Madagascar, known to have toxic properties (dermatitis-producing). The chemical investigation of this sponge including extraction, isolation and identification of secondary metabolites was first undertaken using several chromatographic (HPLC, MPLC…) and spectroscopic (UV-visible, HRMS, NMR 1D et 2D…) techniques. Eighteen alkaloids belonging to the rare class of tricyclic (5,6,8b)-triazaperhydroacenaphtylene heterocycles (i.e. ptilocaulins, mirabilins, netamines) were isolated and identified. Twelve new alkaloids from this group of guanidine derivatives were named netamine H-S. These compounds were grouped on the basis of unsaturation and double bond regiochemistry, with pyrimidine, Δ8,8a and Δ8a,8b heterocycles. For two compounds, netamine I (58) and J (59), a joint theoretical (Density functional theory) and experimental study of UV and ECD spectra allowed the determination of their absolute configuration: 5aS, 7R, 8R for netamine I and 5aS, 7R, 8S for netamine J. The chemotaxonomic meaning of these alkaloids was discussed. Their biological activities were also evaluated. Netamine M (62) exhibited a cytotoxic activity towards KB cells (IC50 = 1,0 μg/mL) while netamine O (64), Q (66) and K (60) were active against the malaria parasite Plasmodium falciparum with IC50 value of 4,66; 2,53 and 0,62 μg/mL respectively. Finally, this work was also dedicated to the biomimetic synthesis of the tricyclic guanidine skeleton. Three new synthesis routes were explored

Depuis quelques décennies, la communauté scientifique s'intéresse de plus en plus à la recherche de nouvelles levures pour de nouvelles applications dans le domaine des biotechnologies blanches. De l'étude de la biodiversité à l'étude des propriétés métaboliques, les recherches visant à sélectionner de nouvelles levures avec des propriétés intéressantes pour l'industrie se sont intensifiées. Localisées dans le Sud-Ouest de l'océan Indien, les îles de La Réunion et de Madagascar sont aujourd'hui considérées comme des Hot Spot de la biodiversité. La grande diversité de plantes et de fruits tropicaux fournis des habitats naturels pour la propagation de nombreux microorganismes tels que les levures. A l'instar de ce qui se passe chez les plantes endémiques, nous avons formulé l'hypothèse que certains microorganismes ne peuvent être trouvés nulle part ailleurs que dans ces îles tropicales. 101 souches de levures réparties en 26 espèces différentes ont ainsi été isolées dans cette étude à partir de 13 fruits tropicaux récoltés aléatoirement dans les régions d'Antsirabe à Madagascar et de St-Paul à La Réunion. L'identification des espèces a été réalisée par analyse des séquences des domaines D1/D2 de la grande sous-unité des gènes de l'ARN ribosomique (ARNr). Les souches caractéristiques ont ensuite fait l'objet d’une analyse systématique par micro-extraction en phase solide couplée à une analyse chromatographique en phase gazeuse et couplé à un spectromètre de masse (ET-MEPS-CPG/SM) pour déterminer leurs capacités à produire des arômes. Parmi elles, deux souches isolées sur le fruit du poc-poc (Physalis peruviana) et sur le cacao (Theobroma cacao var. Criollo) semblent appartenir à de nouvelles espèces, probablement endémiques de la zone géographique étudiée. En effet, ces souches, EGPOC17 et EB23, présentent un faible pourcentage d'identité avec les séquences de l'ARNr des levures Rhodotorula mucilaginosa (97,1% d'identité) et Candida pararugosa (97,4% d'identité). 52 composés organiques volatiles (COVs) différents, classés en cinq grandes classes de molécules, les acides, les alcools, les aldéhydes, les cétones et les esters ont ainsi été identifiés. Une analyse statistique a ensuite été réalisée pour tenter de classer ces souches par catégories en fonction de leurs caractéristiques métaboliques. Avec une production de 32 molécules différentes sur les 52 identifiées, la levure Saprochaete suaveolens (anciennement connue sous le nom de Geotrichum fragrans) est de loin la souche produisant le plus grand nombre de composés d'arômes, en particulier d'esters et de composés insaturés. D'autres souches comme Candida quercitrusa, Debaryomyces nepalensis, Pichia kluyveri et Sporidiobolus pararoseus semblent également être intéressantes pour la production d'acides, d'alcools et de cétones. Parmi les COVs identifiés, des composés comme le 2 méthylbut-2-énoate d'éthyle (tiglate d'éthyle), le 2-méthylbut-2-énoate de 3 méthylbutyle (tiglate d'isoamyle), le 2-méthylbut-2-énoate de butyle (tiglate de butyle), 3-méthylbut-2-énoate d'éthyle, 2-méthylbut-2-énoate de 2-méthylpropyle et le but-2-énoate d'éthyle ont été retrouvés spécifiquement chez la levure Saprochaete suaveolens. La présence de ces molécules, très peu décrites chez les levures dans la littérature, suggère des relations taxonomiques de type «arôme-espèce» ou «arôme-genre » chez les levures<br>In recent years, there has been an increasing interest in identifying and characterizing the yeast ecosystems associated with diverse types of habitat because of the many potential desirable technological properties of these microorganisms, especially in food applications. In this study, a total of 101 yeast strains were isolated directly from the skins of tropical fruits collected in several locations in the South West Indian Ocean (in the regions of Anstirabe in Madagascar and Saint Paul in Reunion Island). Species identification was determined by sequence analysis of the D1/D2 domains of the large subunit (LSU) ribosomal RNA gene. The strains were classified into 26 different species and tested for their potential to produce aromatic flavouring compounds. Among the isolated strains, two species isolated from the skins of Cape gooseberry and Cocoa beans appeared to represent putative new yeast species. Strains EGPOC17 and EB23 showed LSU D1/D2 sequence homologies of only 97.1% and 97.4% with the yeasts Rhodotorula mucilaginosa and Candida pararugosa, respectively. In total, 52 Volatile Organic Compounds (VOCs) were detected by Head Space Solid Phase Micro Extraction coupled to Gas Chromatography and Mass Spectroscopy (HS-SPME-GC/MS) analysis and these were classified into five main groups, namely, acids, alcohols, aldehydes, ketones and esters. In order to classify and discriminate the yeast biodiversity, statistical analysis was performed which allowed the yeasts to be categorized according to their flavour production. With a production of 32 compounds among 52 VOCs, Saprochaete suaveolens (Geotrichum fragrans) seemed to be the best producer of flavour compounds, especially esters and unsaturated compounds. Other yeast species including Candida quercitrusa, Debaryomyces nepalensis, Pichia kluyveri and Sporidiobolus pararoseus also appeared of potential interest based on their abilities to produce acid, alcohol and carbonyl compounds. Among the VOCs detected, 6 uncommon compounds namely ethyl but-2-enoate, ethyl 2-methylbut-2-enoate (ethyl tiglate), ethyl 3-methylbut-2-enoate, 2-methylpropyl 2-methylbut-2-enoate, butyl 2-methylbut-2-enoate and 3 methylbutyl 2-methylbut-2-enoate were identified as possible yeast species specific flavour markers

Reproduction de : Thèse de doctorat : Chimie organique et macromoléculaire : Lille 1 : 2006.<br>N° d'ordre (Lille 1) : 3873. Titre provenant de la page de titre du document numérisé. Bibliogr. p. 281-304.

Quatre plantes appartenant à l'ordre des Lamiales, Marrubium peregrinum L. , Ballota larendana Boiss & Heldr. , Ballota pseudodictamnus (L. ) Benth (Lamiacées) et Lippia alba (Mill) N. E. Brown (Verbénacées) ont fait l'objet d'une étude phytochimique axée sur leurs constituants antioxydants. Au total trente-et-un métabolites secondaires différents (diterpènes, iridoïdes, flavonoides et phényléthanoides) ont été isolés. L'activité antiradicalaire de certains d'entre eux a été testée vis-à-vis du radical DPPH. L'intérêt chimiotaxonomique des molécules a également été envisagé. Lippia alba a fait l'objet d'études plus approfondies. Tests visant à l'établissement d'une monographie de cette plante à la Pharmacopée Française, étude comparative de la composition des extraits polaires et de l'huile essentielle de plusieurs lots, évaluation de l'activité antioxydante de molécules isolées vis-à-vis de l'anion-radical superoxyde en modèle cellulaire et acellulaire, essai d'inhibition de la peroxydation lipidique induite par le cuivre sur les LDL et détermination de l'activité agoniste des molécules majoritaires des extraits polaires sur les récepteurs aux benzodiazépines et GABAa, dans le but d'évaluer l'action sédative attribuée par la médecine traditionnelle caribéenne