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Dissertations / Theses on the topic 'Chromatius'

Author: Grafiati
Published: 29 March 2025
Last updated: 31 July 2025

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Besnard, Emilie. "Modifications de l'organisation de la chromatine liées à l’entrée en sénescence et son impact sur la réplication du génome." Thesis, Montpellier 1, 2010. http://www.theses.fr/2010MON1T008.

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Abstract:
L'entrée en sénescence, considérée comme un arrêt irréversible du cycle, se caractérise par une modification de l'organisation de la chromatine formant de véritables foyers d' hétérochromatine spécifiques (SAHF) coordonnée à une modification d'expression génique et à un déclin progressif de la compétence à répliquer le génome. Ainsi, au cours de ma thèse, j'ai voulu comprendre en quoi ces changements d'organisation du génome pouvaient influer sur la distribution et l'activation des origines d e réplication lors de l'entrée en sénescence réplicative ou déclenchée de façon prématurée par l'inhib
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Beurton, Flore. "Étude de l’interaction physique et fonctionnelle entre le complexe histone méthyltransférase SET-2/SET1 et le complexe histone déacétylase SIN-3S dans l’embryon de C. elegans." Thesis, Lyon, 2018. http://www.theses.fr/2018LYSEN017.

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Abstract:
Les complexes histones méthyltransférases SET1, hautement conservés de la levure aux mammifères, sont ciblés aux régions promotrices par la protéine CFP1/CXXC, résultant en l’implémentation de la méthylation de la lysine 4 de l’histone H3 (H3K4me), modification post-traductionnelle influençant l’expression des gènes selon le contexte chromatinien. La présence de plusieurs complexes SET1 distincts dans différents systèmes modèles eucaryotes a compliqué l’étude de leurs fonctions dans un contexte développemental. Caenorhabditis elegans contient une seule protéine homologue de SET1, SET-2, et d’u
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Jurisic, Anamarija. "Développement d'une approche méthodologique basée sur la biotinylation in vivo de protéines de la chromatine - Application à l’étude des interactions entre des domaines chromosomiques et une protéine de l'enveloppe nucléaire dans des cellules individuelles." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLS349.

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Abstract:
Les arguments en faveur d’un rôle important de l'architecture des chromosomes en interphase pour la régulation des gènes et la maintenance du génome s’accumulent rapidement. Au cours de l'interphase, les chromosomes sont positionnés de façon non aléatoire l’un par rapport à l'autre et fournissent ainsi des points de repère nucléaires. Deux types d'interactions contribuent probablement à ce positionnement non aléatoire: (i) des domaines subchromosomiques interagissent avec des structures nucléaires telles l'enveloppe nucléaire (EN) et (ii) des interactions intrachromosomiques s’établissent entr
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Marie, Corentine. "The role of Chd7 & Chd8 chromatin remodelers in oligodendrogenesis and (re)myelination." Thesis, Paris 6, 2017. http://www.theses.fr/2017PA066365/document.

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Abstract:
Les oligodendrocytes (OLs) sont les cellules myélinisantes du système nerveux central, s’enroulant autour des axones et permettant la conduction saltatoire du potentiel d’action. Dans la Sclérose en Plaques, des gaines de myélines sont détruites et l’efficacité de la remyélinisation par les précurseurs d’oligodendrocytes (OPCs) diminue avec la progression de la maladie. Une meilleure compréhension du mécanisme qui contrôle la génération des OPCs et leur différentiation est donc essentielle pour développer des thérapies efficaces de remyélinisation. L’oligodendrogenèse, qui comprend les étapes
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Germier, Thomas. "Dynamique de la chromatine et transcription." Thesis, Toulouse 3, 2018. http://www.theses.fr/2018TOU30376.

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Abstract:
La dynamique de la chromatine est affectée par les processus biologiques. Pour comprendre comment la physique de la chromatine et la biologie se repondent, nous avons besoin d'outils pour analyser la dynamique de la chromatine in vivo. Plusieurs systèmes existent pour marquer les loci d'ADN et déterminer efficacement leur position dans le noyau, mais ils présentent des inconvénients dans les cellules de mammifères lorsqu'il s'agit d'étudier le mouvement de la chromatine dans le contexte de processus biologiques. Cela est particulièrement vrai lorsqu'il s'agit de mécanismes où l'ADN doit être l
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Galic, Hrvoje. "Heterochromatin dynamics upon release from stationary phase in budding yeast." Thesis, Montpellier, 2019. http://www.theses.fr/2019MONTT006/document.

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Abstract:
La complexe protéique Sir (Silent Information Regulator) de la levure bourgeonnante est l’acteur principal dans la formation de l’hétérochromatine, qui provoque l’atténuation de l’expression génique par un mécanisme épigénétique. Le complexe Sir lié à la chromatine maternelle est démonté lors de la réplication génomique et puis réformé sur les deux brins nouvellement répliqué. La dynamique de maintien de Sir sur la chromatine pendant le cycle cellulaire et dans de variables conditions de croissance n’est pas bien comprise. Pour comprendre comment la structure chromatinienne telle que l’hétéroc
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Clement, Camille. "Rôle du chaperon d'histone ASF1 dans le recyclage des histones parentales pendant la réplication de l'ADN." Electronic Thesis or Diss., Paris Sciences et Lettres (ComUE), 2018. https://theses.hal.science/tel-02518693.

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Abstract:
Chez les eucaryotes, l’ADN s’enroule autour de protéines appelées histones pour former la chromatine. Cette structure permet, d’une part, de compacter le génome dans le noyau, mais également de réguler son expression. En effet, les histones sont porteuses d’information dite « épigénétique » : elles existent sous différentes formes, les variants d’histone, et peuvent porter des modifications post-traductionnelles. La présence de tels variants et modifications organise le génome en domaines au statut transcriptionnel différent.La réplication de l’ADN déstabilise la structure chromatinienne, et r
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Szabo, Quentin. "Étude du repliement tridimensionnel de la chromatine en domaines topologiques." Thesis, Montpellier, 2019. http://www.theses.fr/2019MONTT064.

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Abstract:
Mon projet de thèse a consisté à étudier les mécanismes du repliement tridimensionnel du génome dans les cellules eucaryotes. L’organisation des chromosomes est étroitement liée à la régulation de nombreuses fonctions biologiques, telles que le contrôle de l’expression génique, la réplication de l’ADN ou encore la stabilité génomique. La méthode de « chromosome conformation capture » Hi-C, qui permet la cartographie des interactions entre régions d’ADN, a révélé que chez de nombreuses espèces, le génome est organisé en domaines enrichis en interactions chromatiniennes, les « Topologically Asso
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Bourbousse, Clara. "Dynamiques chromatiniennes au cours de la photomorphogenèse chez Arabidopsis thaliana." Thesis, Paris 11, 2012. http://www.theses.fr/2012PA112097.

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Abstract:
Les états chromatiniens peuvent être étudiés à l’échelle des unités transcriptionnelles par des approches moléculaires ou à l'échelle plus globale de l'hétérochromatine structurée au sein de chromocentres par des approches cytogénétiques. Ces deux niveaux d’organisation de la chromatine sont dynamiques et influencent l'ensemble des processus nucléaires. L’objectif de cette thèse était d'avancer la compréhension des dynamiques chromatiniennes à ces deux échelles chez la plante modèle Arabidopsis thaliana, en se focalisant sur une transition développementale majeure, la photomorphogenèse. Le pro
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Acquaviva, Laurent. "L' intéraction entre SPP1 et MER 2 : Le chaînon manquant entre la triméthylation de H3K4 et la recombinaison méiotique chez Saccharomyces cerevisiae?" Thesis, Aix-Marseille, 2012. http://www.theses.fr/2012AIXM4013.

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Abstract:
Chez Saccharomyces cerevisiae, la methylation de la lysine 4 de l'histone H3 (H3K4) est catalysée par le complexe à activité methyltransférase Set1, conservé au cours de l'évolution. Durant la méiose, l'absence de Set1 conduit à un retard de démarrage de la phase S, et à un défaut dans la formation des coupures double-brin de l'ADN (CDBs). Nous avons cherché à mieux caractériser ces deux conséquences phénotypiques liées à l'absence de Set1. Nous montrons que le retard de réplication est lié à la perte de méthylation de H3K4 mais qu'il ne résulte pas d'un défaut d'activité des kinases responsab
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Diagouraga, Boubou. "Rôle de l'activité méthyltransférase de la protéine PRDM9 dans la recombinaison méiotique chez la souris." Thesis, Montpellier, 2015. http://www.theses.fr/2015MONTS060.

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Abstract:
Chez les organismes à reproduction sexuée, les gamètes (cellules sexuelles) sont produits par un processus comprenant deux divisions successives appelé méiose. Durant la première division, la recombinaison méiotique permet un contact physique et un échange de matériel génétique entre les chromosomes homologues. Elle résulte de la réparation, par recombinaison homologue, de cassures double-brin de l’ADN générées par la protéine SPO11 au début de la prophase de la première division. Chez les mammifères, les évènements de recombinaison se situent dans des régions de 1-2 kb appelées points chauds
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Kahli, Malik. "Implication des protéines HMGA et HMGA2 dans les changements du programme de réplication au cours de la sénescence cellulaire." Thesis, Montpellier 2, 2011. http://www.theses.fr/2011MON20059/document.

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Abstract:
La sénescence, considérée comme étant un arrêt irréversible du cycle cellulaire, se caractérise par des changements drastiques de l'expression génique et de l'organisation de la structure de la chromatine. En effet, il se forme des foyers denses d'hétérochromatine au sein du noyau (SAHF) et ces modifications s'accompagnent d'un déclin progressif de la capacité à dupliquer le génome. Au cours de ma thèse, j'ai voulu savoir si ces modifications de la chromatine induite par les SAHF pouvaient influer sur le programme de réplication et changer la distribution des origines de réplication sur le gén
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Hodimont, Elsie. "Etude des fonctions de Cdk8 dans la régulation de la chromatine, la réplication et la transcription." Thesis, Montpellier 2, 2012. http://www.theses.fr/2012MON20166.

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Abstract:
La kinase Cdk8 est impliquée dans la régulation de la transcription. Pourtant, cette protéine est retrouvée sur la chromatine lors de la réplication dans le modèle d'extrait d'œufs de xénope, où la transcription n'est pas active. Mon projet de thèse avait pour but de caractériser les fonctions de Cdk8 sur la chromatine en cours de réplication.Les résultats de ma thèse montrent que Cdk8 est impliquée dans la réplication de l'ADN. Le recrutement de Cdk8 sur la chromatine est concomitant avec le recrutement de certaines protéines du complexe de pré-réplication, bien qu'elle ne soit pas accumulée
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Benyelles, Maname. "Le rôle de l'oncoprotéine INT6 dans la maintenance des télomères." Thesis, Lyon, École normale supérieure, 2015. http://www.theses.fr/2015ENSL0978/document.

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Abstract:
La protéine INT6/EIF3E codée par le gène mammalien correspondant au site d’intégration du rétrovirus Mouse Mammary tumor virus (MMTV) n°6 (int-6), a été impliquée dans le cancer du sein chez la souris et l’homme. Malgré qu’INT6 soit une sous-unité du facteur d’initiation de la traduction eIF3, elle n’est pas essentielle pour la traduction générale mais pour l’expression d’ARNm spécifiques tel qu’il a été montré pour la traduction d’ARNm histones. Elle a aussi été impliquée dans la réplication d’ADN en stabilisant le facteur de licence de la réplication MCM7, dans la réponse aux dommages à l’AD
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Chen, Zhenhui. "Régulation épigénétique de la production de mycotoxines chez Fusarium graminearum." Thesis, Bordeaux, 2019. http://www.theses.fr/2019BORD0600.

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Abstract:
La contamination des aliments par les mycotoxines représente un risque potentiel pour la santé humaine et animale. Des rapports de l'Autorité européenne de sécurité des aliments, l’EFSA, indiquent que près de la moitié des aliments dérivés des céréales et de céréales non transformées collectées entre 2007 et 2012 dans 21 pays européens étaient contaminées par des trichothécènes de type B, ou TCTB, et en particulier du déoxynivalénol, ou DON. Ces mycotoxines sont produites par des champignons phytopathogènes sur les grains en cours de remplissage, avant la récolte. Dans un contexte de changemen
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Teano, Gianluca. "Functional interplays between linker histone H1 variants and chromatin landscape in Arabidopsis thaliana." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASB003.

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Abstract:
Les plantes sont caractérisées par une remarquable plasticité développementale. En vertu de leur mode de vie sessile, elles sont capables d'adaptations phénotypiques rapides en réponse à des signaux environnementaux. En particulier, les plantes ont la capacité de détecter les conditions de lumière par de multiples photorécepteurs et utilisent cette information pour adapter leur morphologie et leur physiologie à un environnement changeant. Par exemple, la première perception de la lumière par des jeunes plantules, émergeant du sol, induit des changements profonds dans l'expression des gènes qui
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Boubacar, Ali Nabiya. "Etude des fonctions transcriptionnelles de la lysine methyltransférase PR-Set7 et de l’effet des enzymes de méthylation de la Lysine 20 de l’Histone H4 sur la radiosensibilité des cellules cancéreuses." Thesis, Montpellier, 2018. http://www.theses.fr/2018MONTT032.

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Abstract:
La chromatine, dont l’unité de base est le nucléosome, est une structure nucléoprotéique dynamique qui nécessite un remodelage au cours des processus nucléaires utilisant l’ADN comme matrice tels que la réplication, la transcription ou la réparation des cassures et autres types de lésions à l’ADN. Plusieurs facteurs capables de moduler la structure de la chromatine ont été caractérisés. Ils regroupent les complexes de remodelage ATP-dépendants et les enzymes modifiant les histones de façon post-traductionnelle. Nous nous intéressons au laboratoire à la voie de méthylation de la lysine 20 situé
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Boskovic, Ana. "Study of histone variants and chromatin dynamics in the preimplantation mouse embryo." Thesis, Strasbourg, 2014. http://www.theses.fr/2014STRAJ034/document.

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Abstract:
Comment le zygote acquiert la totipotence à partir de deux cellules complètement différenciées, et comment les décisions du destin cellulaire sont faites plus tard dans le développement sont des questions biologiques essentielles. Les études menées au cours de la première partie de mon doctorat ont contribué à l'annotation de la composition de la chromatine embryonnaire en ce qui concerne les variantes des histones et des modifications post-traductionnelles. L'expression ectopique de H2A.Z après la fécondation réduit la progression du développement, ce qui suggère que l'absence de H2A.Z au déb
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Tissot, Louis-Jean. "L'Ouvrage incomplet sur Matthieu (Opus imperfectum in Matthaeum) et les commentaires en latin sur l'évangile de Matthieu de l'Antiquité. Comparaison exégétique et stylistique ciblée sur la partie A (Mt. 1-8)." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2024. http://www.theses.fr/2024SORUL158.

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Abstract:
S'inscrivant dans le projet d'édition critique de l'Ouvrage incomplet sur Matthieu (Opus imperfectum in Matthaeum, OIM), la présente thèse analyse les liens entre ce commentaire anonyme sur l'évangile de Matthieu, provenant d'un milieu subordinationiste riminien (i.e. « homéen »), et d'autres ouvrages exégétiques latins sur le même évangile. Après avoir rappelé, dans un état de la recherche, les principales caractéristiques du corpus pris en compte, nous avons procédé à une comparaison exégétique suivie portant sur la section Mt 1-8, correspondant à la première partie de l'OIM, avec les commen
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Ignatyeva, Maria. "Identification et caractérisation de HIRIP3 comme nouveau chaperon d'histone H2A." Thesis, Strasbourg, 2017. http://www.theses.fr/2017STRAJ028.

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Abstract:
Le génome des cellules eucaryotes est empaqueté dans la chromatine, dont l’établissement et la maintenance nécessitent des processus d’assemblage et de remodelage. Ce travail de thèse a été consacré à la caractérisation de deux facteurs de la machinerie d’assemblage de la chromatine. Le premier facteur étudié dans ce travail était HIRIP3, un homologue mammifère de la levure H2A.Z chaperon Chz1. Nous voulions vérifier si HIRIP3 est une chaperon d'histone par elle-même. Pour commencer, nous avons décrit l'interaction de HIRIP3 avec les histones in vivo. Ensuite, nous avons étudié la spécificité
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Stadelmayer, Bernd. "Le noyau cellulaire et la régulation génique par les protéines du groupe Polycomb." Thesis, Montpellier 1, 2010. http://www.theses.fr/2010MON13507/document.

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Abstract:
Les protéines des groupes Polycomb et trithorax sont des régulateurs épigénétiques très conservés qui permettent le maintient de l'identité cellulaire en régulant le niveau d'expression des gènes. Ils agissent sur leurs gènes cibles à travers des éléments régulateurs en cis, appelés éléments de réponse aux Polycombs (PRE). Dans des tests transgéniques, il a été montré que deux copies du même PRE sont fréquemment regroupés dans la même région nucléaire. Dans le cas particulier du PRE Fab-7, ce regroupement corrèle avec sa fonction répressive. Durant ma thèse, j'ai tenté de cloner un outil bicol
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Montibus, Bertille. "Régulation et fonction de la chromatine bivalente chez les mammifères : l'emprunte parentale comme modèle." Thesis, Clermont-Ferrand 1, 2016. http://www.theses.fr/2016CLF1MM23.

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Abstract:
La différenciation et le développement requièrent une régulation fine de l’expression desgènes, médiée en partie par les modifications épigénétiques. Parmi les modificationsd’histones, la chromatine bivalente, signature chromatinienne atypique associant lesmarques permissive H3K4me2/3 et répressive H3K27me3, est de par sa plasticité, pressentiepour jouer un rôle décisionnel dans l’acquisition d’une identité cellulaire. Pour étudier le rôlede la chromatine bivalente au cours du développement, nous avons choisi d’utiliserl’empreinte parentale. Ce cadre développemental bien caractérisé, conduit à
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Hoghoughi, Naghmeh. "Base moléculaire de la programmation post-méiotique du génome mâle Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase Histone variants: essential actors in the male genome programing." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2019. https://thares.univ-grenoble-alpes.fr/2019GREAV054.pdf.

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Abstract:
La chromatine des cellules spermatogèniques subit une réorganisation radicale pendant la spermiogenèse. Ce phénomène se produit pour deux raisons principales : premièrement, pour établir un génome très compact par l'incorporation de protamine, afin de protéger le génome du sperme avant et pendant la fécondation. Deuxièmement, afin de transférer avec succès l'information paternelle portée par le génome du sperme, à la génération suivante. Récemment, notre laboratoire a identifié différents acteurs et mécanismes moléculaires, qui sont au cœur de cette réorganisation radicale du génome. Une hyper
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Goutte-Gattat, Damien. "Etude des fonctions mitotiques du domaine amino-terminal de CENP-A." Thesis, Grenoble, 2011. http://www.theses.fr/2011GRENV079/document.

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Abstract:
Le variant d'histone CENP-A est le facteur responsable de la détermination épigéné- tique du centromère. Il permet le recrutement de nombreuses protéines centromériques, et constitue ainsi la brique fondatrice du kinétochore. Il possède un domaine amino-terminal non structuré dont la fonction précise reste encore à élucider, bien qu'il soit déjà établi chez certaines espèces que ce domaine est requis pour le bon fonctionnement du cen- tromère et conséquemment le bon déroulement de la mitose. Nous avons construit des lignées cellulaires humaines exprimant stablement diverses formes mutantes de
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Bellegarde, Fanny. "Rôle de la régulation chromatinienne dans le contrôle de l’expression des gènes en réponse aux variations nutritionnelles en azote chez Arabidopsis." Thesis, Montpellier, SupAgro, 2017. http://www.theses.fr/2017NSAM0037/document.

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Abstract:
Le nitrate est une source essentielle d’azote pour les plantes. Les transporteurs racinaires qui prélèvent le nitrate du sol sont soumis à des régulations transcriptionnelles qui modulent les capacités de prélèvement du nitrate. NRT2.1, transporteur de nitrate essentiel et majoritaire au niveau racinaire, est très fortement exprimé en condition limitante en nitrate, et réprimé sous forte nutrition azotée. Cette répression est corrélée avec un enrichissement en marque chromatinienne H3K27me3 qui semble dépendant du régulateur chromatinien HNI9. H3K27me3 est une marque chromatinienne répressive
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Ciabrelli, Filippo. "Stable transgenerational inheritance of alternative chromatin states in Drosophila melanogaster." Thesis, Montpellier, 2015. http://www.theses.fr/2015MONTT034.

Full text
Abstract:
L’héritage épigénétique transgénérationnelle est un phénomène très controversé, selon lequel un phénotype non-génétiquement déterminé peut être transmis à la génération suivante. Jusqu'à présent, ce mode de transmission a été décrit dans quelques cas et il a été suggéré que les composants de la chromatine peuvent être impliqués, y compris des protéines du groupe Polycomb, qui agissent comme des répresseurs de gènes clés du développement et coordonnent la différenciation cellulaire et la prolifération. Les mécanismes moléculaires à la base du rôle de la répression génique Polycomb-dépendante à
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Kirstein, Nina Danielle. "Chromatin-dependent pre-replication complex positioning and activation in mammals." Thesis, Montpellier, 2017. http://www.theses.fr/2017MONTT005/document.

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Abstract:
Chaque division cellulaire requiert une duplication précise du génome. Des dizaines de milliers de sites d’initiation de la réplication d’ADN (origines de réplication) sont impliqués dans la réplication complète du génome humain. L’activation des origines de réplication est régulée précisément et des études génomiques extensives ont démontré la présence de caractéristiques génomiques associées à l’activation des origines de réplication. Le complexe de pré-réplication (pre-RC) est la base de l’initiation de la réplication et consiste en deux sous-complexes majeurs : l’ « origin recognition comp
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Barthes, Pauline. "Modifications de la chromatine associées à l'initiation de la recombinaison méiotique, chez la souris." Thesis, Montpellier 1, 2010. http://www.theses.fr/2010MON1T007.

Full text
Abstract:
La méiose est une étape de la différenciation germinale qui permet la formation des gamètes. Elle est composée de deux divisions successives. La ségrégation des chromosomes homologues à la première division nécessite des connexions entre homologues, mises en place par des événements de crossing-over (CO). Les CO augmentent également la diversité génétique, et leur fréquence et leur distribution sont étroitement régulées. Ils sont générés par un mécanisme de formation et réparation de cassures double brins de l'ADN (CDBs), catalysées par la protéine SPO11 et préférentiellement localisées dans d
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Dai, Dingli. "Caractérisation des interactions physiques et fonctionnelles entre le facteur d’assemblage de la chromatine, CAF-1, et des facteurs de la recombinaison homologue au cours de la réparation de l’ADN." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018SACLS498/document.

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Abstract:
L’ADN est constamment exposé à des insultes génotoxiques endogènes et exogènes. Plusieurs mécanismes de réparations de l’ADN sont mis en œuvre pour préserver la stabilité du génome et de l’épigénome. La recombinaison homologue (RH) joue un rôle central dans la réparation des cassures double brin de l’ADN (DSBs) et le redémarrage des fourches de réplication en réponse à un stress réplicatif. Ces deux processus sont tous deux couplés à l’assemblage de la chromatine. Le facteur d’assemblage de la chromatine 1 (CAF-1) est un chaperon d’histone conservé au cours de l’évolution qui fonctionne dans l
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Walter, Marius. "Transposon regulation upon dynamic loss of DNA methylation." Thesis, Paris 6, 2015. http://www.theses.fr/2015PA066672/document.

Full text
Abstract:
Les transposons sont des séquences d’ADN qui ont la capacité de se dupliquer de façon autonome, posant une menace pour l’intégrité et la stabilité du génome. De nombreux mécanismes existent pour contrôler l’expression des transposons, parmi lesquels la méthylation de l’ADN joue un rôle particulièrement important. Chez les mammifères, les profils de méthylation sont stables tout au long de la vie de l’individu, mis-à-part pendant deux moments clés du développement embryonnaire. Pendant ces deux périodes, la méthylation de l’ADN est globalement effacée, ce qui corrèle avec l’acquisition d’un éta
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Meyer, Sam. "Multiscale modeling of DNA, from double-helix to chromatin." Phd thesis, Ecole normale supérieure de lyon - ENS LYON, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00756315.

Full text
Abstract:
In the nucleus of eukaryotic cells, DNA wraps around histone proteins to form nucleosomes, which in turn associate in a compact and dynamic fiber called chromatin. The physical properties of this fiber at different lengthscales, from the DNA double-helix to micrometer-sized chromosomes, are essential to the complex mechanisms of gene expression and its regulation. The present thesis is a contribution to the development of physical models, which are able to link different scales and to interpret and integrate data from a wide range of experimental and computational approaches. In the first part
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Gaucher, Jonathan. "Rôle de la protéine à double bromodomaine BRDT dans le remodelage de la chromatine au cours de la spermatogenèse." Thesis, Grenoble, 2011. http://www.theses.fr/2011GRENV088/document.

Full text
Abstract:
BRDT et la réorganisation de la chromatine au cours de la spermatogénèsePendant la spermiogenèse, phase haploïde de la gamétogenèse mâle, le génome mâle subit une réorganisation majeure, durant laquelle la plupart des histones sont enlevées et remplacées par les protéines de transition (TP) et les protamines. Ce processus conduit à la compaction extrême du génome mâle au sein du noyau du spermatozoïde.Dans les spermatides allongées, les histones sont hyperacetylées juste avant leur éviction. Nous avons émis l'hypothèse que cette acétylation massive des histones pourrait être un signal pour l'e
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Tardat, Mathieu. "Contrôles épigénétiques du cycle cellulaire : fonctions et régulation de la lysine méthyltransférase PR-Set7." Thesis, Montpellier 2, 2010. http://www.theses.fr/2010MON20102.

Full text
Abstract:
La lysine méthyltransférase PR-Set7 est responsable de la monométhylation de la lysine 20 de l'histone H4 (H4K20me1). Son expression varie au cours du cycle cellulaire. D'un niveau peu élevé en phase S, l'enzyme atteint un niveau maximum au cours de la mitose. Mon projet de thèse avait pour but de caractériser les fonctions de PR-Set7 et les raisons de cette régulation au cours du cycle. Présentés sous forme de publication, les résultats de ma thèse montrent que PR-Set7 induit un signal H4K20me1 au niveau des origines de réplication pendant la mitose, ce qui permet le recrutement des complexes
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Durut, Nathalie. "Etudes fonctionnelles des protéines nucléaires dupliquées chez Arabidopsis thaliana." Thesis, Perpignan, 2014. http://www.theses.fr/2014PERP1208/document.

Full text
Abstract:
Chez les eucaryotes, les gènes d’ARNr 45S sont présents en un grand nombre de copies organisées dans des régions chromosomiques appelées NOR pour « Nucleolus Organizer Region ». Cependant, seule une fraction de ces gènes est activement exprimée et leur activation/répression est majoritairement contrôlée par des mécanismes épigénétiques. Parmi les facteurs requis pour l’expression de ces gènes, se trouve la nucléoline, une protéine majeure du nucléole. Chez A. thaliana, la protéine NUC1 est nécessaire pour le maintien de la méthylation et le control de l’expression de variants spécifiques des g
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Taty, Taty Gemael Cedrick. "Rôle des modifications de la chromatine dans la réparation des cassures double-brin de l'ADN et la stabilité génétique." Thesis, Toulouse 3, 2016. http://www.theses.fr/2016TOU30190/document.

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Abstract:
Le génome humain est constamment la cible d'agents qui endommagent l'ADN. Ces dommages sont multiples et variés tels que les cassures simple et double brin (DSB). Les DSBs sont des lésions très toxiques dont l'origine peut être multiple. Les cellules de mammifères réparent les DSBs en utilisant deux mécanismes principaux, la recombinaison homologue (RH) qui est dépendante du cycle cellulaire et utilise la chromatide sœur comme matrice de réparation et la jonction des extrémités non homologues (NHEJ) qui est indépendante du cycle cellulaire et consiste en la ligation des extrémités d'ADN endomm
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Clemot, Marie. "Role of CAF-1 in the establishment and maintenance of cellular identity during development in Drosophila." Thesis, Paris 6, 2016. http://www.theses.fr/2016PA066149.

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Abstract:
L’organisation de l’ADN sous forme de chromatine joue un rôle crucial dans la régulation de l’identité cellulaire. De par son rôle clé dans l’assemblage de la chromatine couplé à la synthèse d’ADN, le chaperon d’histone CAF-1 apparaît comme un acteur potentiel dans la transmission de l’information portée par la chromatine au cours des générations cellulaires. Bien que CAF-1 soit essentiel pour la survie au stade larvaire chez la Drosophile, les outils génétiques disponibles chez cet organisme permettent d’analyser sa fonction dans des types cellulaires ciblés. Mon travail montre que la grande
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Biedzinski, Stéphane. "Interplay between the nucleus and the microtubules : role in the regulation of chromatin organization in hematopoietic stem cells." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2018. https://theses.md.univ-paris-diderot.fr/BIEDZINSKI_Stephane_2_complete_20181116.pdf.

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Abstract:
Les cellules souches hématopoïétiques sont caractérisées, comme chaque cellule souche, par leur capacité à s'auto-renouveler et à se différencier, ce qui leur permettent de participer à l'homéostasie du système sanguin. Comment ces cellules souches entrent dans une voie de différenciation ou une autre est encore mal compris mais un nombre croissant d'éléments obtenus dans différents systèmes soulignent l'importance des signaux mécaniques dans ce choix. Les signaux physiques du microenvironnement de la cellule peuvent-être transduits au noyau par l'intermédiaire du cytosquelette, qui va alors m
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Bonnell, Erin. "The role of Tbf1 in telomere homeostasis in Saccharomyces cerevisiae." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2017. http://hdl.handle.net/11143/11077.

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Abstract:
Abstract: By differentiating chromosomal ends from internal breaks, telomeres prevent DNA damage checkpoint activation and provide protection from inappropriate DNA repair activity that could create genomic instability. In Saccharomyces cerevisiae, a large number of genes have been identified that are implicated in telomerase and telomere structure and/or function. However, a comprehension of the mechanism of action of these genes and how they relate to other genes is lacking. The function of end protection is based on the telomeric repeats and associated proteins, but evidence is accumulating
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Yung, Yuk Kwong. "Histone H3 Serine 28 is essential for efficient Polycomb-mediated gene repression in Drosophila." Thesis, Montpellier, 2015. http://www.theses.fr/2015MONTT001/document.

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Abstract:
Dans le noyau de nos cellules l’ADN est enroulé autour de petites protéines que l’on appelle les histones et forme ainsi ce que l’on nomme la chromatine. L’activation des gènes permet la production de protéines qui sont nécessaires au bon fonctionnement des différentes cellules de notre organisme. Notre corps est composé de différentes cellules dont l’identité est définie par un patron de gènes actifs et inactifs bien spécifique. Au cours de la mitose (division des cellules) il est crucial que les cellules conservent leur identité, faute de quoi des structures non adaptées peuven
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Delamarre, Axel. "Etude des rôles et du mécanisme de chargement des complexes SMC dans la réponse au stress réplicatif chez S.cerevisiae." Thesis, Montpellier, 2016. http://www.theses.fr/2016MONTT040/document.

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Abstract:
Les trois complexes SMC Cohésine, Condensine et SMC5/6 sont principalement étudiés pour leurs rôles mitotiques, cependant tous trois sont localisés à proximité des fourches de réplication en condition de stress réplicatif. Au cours de cette thèse, nous nous sommes particulièrement intéressés aux complexes Cohésine et Condensine. Dans une première partie, nous décrivons un nouveau rôle des condensines dans la progression des fourches de réplication en condition de stress réplicatif à l’hydroxyurée (HU) et au Méthyl-Méthane-Sulfonate (MMS). Nos données montrent que dans ces conditions, les conde
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Barral, Sophie. "L'organisation post-méiotique de l'épigénome mâle." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018GREAV058/document.

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Abstract:
La spermatogénèse, processus de production des gamètes mâles, représente un modèle physiologique pertinent pour l’étude de la dynamique de la chromatine. En effet, une réorganisation drastique du génome est observée en fin de spermatogénèse, lors des étapes post-méiotiques du développement de la lignée germinale mâle. Ces réorganisations visent d’une part à compacter le génome afin de le protéger avant et lors de la fécondation et d’autre part à établir un épigénome mâle spécifique nécessaire pour le développement embryonnaire précoce. La chromatine organisée en nucléosomes est alors totalemen
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Izard, Fanny. "Étude du rôle des méthyltransférases de la Lysine 20 de l’Histone H4 dans la dynamique de la chromatine au cours du cycle cellulaire." Thesis, Montpellier, 2017. http://www.theses.fr/2017MONTT136/document.

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Abstract:
Dans les cellules eucaryotes l’organisation de l’ADN en chromatine n’assure pas seulement la compaction de l’ADN dans le noyau mais sert aussi de structure dynamique qui permet la régulation des processus pour lesquels l’ADN est une matrice comme la transcription, la réplication et la réparation de l’ADN. L’unité de base de la chromatine est le nucléosome qui est constitué de 147pb d’ADN qui s’enroule autour d’un octamère d’histones. Le nucléosome possède une structure flexible régulée par les modifications post-traductionnelles d’histones. Les modifications d’histones contribuent à la régulat
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Mauro, Eric. "Etude fonctionnelle de l'interaction entre l'intasome du VIH-1 et le nucléosome : la queue d'histone H4 comme nouveau partenaire de l'intégration." Thesis, Bordeaux, 2018. http://www.theses.fr/2018BORD0273/document.

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Abstract:
L'intégrase (IN) du VIH-1 est une enzyme qui catalyse l'intégration du génome du virus dans celui de la cellule infectée. Cette étape d'intégration est cruciale pour le virus pour qu'il puisse se répliquer de manière efficace, l'intégration est donc une cible de choix dans les thérapies antivirales. Comprendre les mécanismes qui participent à l'intégration est donc nécessaire afin de développer des solutions efficaces pour contrecarrer le virus.L’intégration rétrovirale est catalysée par une structure oligomérique d’IN et d’ADN viral bien particulière appelée intasome. Les intasomes rétrovirau
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Mahé, Elise. "Dynamique chromatinienne lors de l'activation des enhancers au cours de la différenciation cellulaire." Thesis, Rennes 1, 2016. http://www.theses.fr/2016REN1B056/document.

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Abstract:
La différenciation cellulaire implique une régulation transcriptionnelle coordonnée et finement contrôlée qui passe par le recrutement de facteurs de transcription (FT) cellules-spécifiques sur des régions génomiques régulatrices appelées enhancers. Parmi ces FT, des protéines nommées « facteurs pionniers » (FP) lient la chromatine condensée et favorisent la transition des enhancers d’un état inactif vers un état « préparé » (étape de « priming »), facilitant ainsi la fixation d’autres FT et permettant l’activation de ces régions. L’engagement vers un lignage cellulaire particulier est donc as
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Del, Prete Stefania. "Characterisation of transcriptional and chromatin events in relation to floral transition and identification of nuclear organisation determinants." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS022.

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Abstract:
La transition florale résulte d’un jeu complexe d’interactions entre des signaux endogènes et environnementaux. Les feuilles jouent un rôle crucial dans ce processus en percevant les changements associés à la lumière et en produisant les photosynthétats qui participant à la signalisation de la floraison. Toutefois, notre connaissance des changements se produisant dans les feuilles lors de la transition florale reste limitée. Nous avons caractérisé les événements morphologiques, moléculaires et transcriptionnels en relation avec la floraison florale dans les feuilles matures chez Arabidopsis, e
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Walter, Marius. "Transposon regulation upon dynamic loss of DNA methylation." Electronic Thesis or Diss., Paris 6, 2015. http://www.theses.fr/2015PA066672.

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Abstract:
Les transposons sont des séquences d’ADN qui ont la capacité de se dupliquer de façon autonome, posant une menace pour l’intégrité et la stabilité du génome. De nombreux mécanismes existent pour contrôler l’expression des transposons, parmi lesquels la méthylation de l’ADN joue un rôle particulièrement important. Chez les mammifères, les profils de méthylation sont stables tout au long de la vie de l’individu, mis-à-part pendant deux moments clés du développement embryonnaire. Pendant ces deux périodes, la méthylation de l’ADN est globalement effacée, ce qui corrèle avec l’acquisition d’un éta
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González, Morao Ana Karina. "Rôle des complexes PRC2 dans la régulation de la différenciation cellulaire chez Arabidopsis thaliana." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS153.

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Abstract:
Les protéines du groupe Polycomb (PcG) ont initialement été identifiées chez la Drosophile, en tant que facteurs nécessaires au maintien de l’expression spatio-temporelle de gènes homéotiques le long de l’axe antéro-postérieur. Depuis, leur rôle en tant que régulateurs du développement a été mis en évidence chez la plupart des métazoaires ainsi que chez les plantes, chez lesquelles elles orchestrent les transitions développementales, l’organogenèse et la différenciation cellulaire. Les protéines PcG sont nécessaires au maintien de la répression transcriptionnelle de gènes cibles, par la régula
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Tarhini, Batoul. "Oriented paths in digraphs and the S-packing coloring of subcubic graph." Electronic Thesis or Diss., Bourgogne Franche-Comté, 2023. http://www.theses.fr/2023UBFCK079.

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Abstract:
Cette thèse de doctorat est divisée en deux parties principales: La partie I explore l'existence de chemins orientés dans les digraphes, cherchant à établir un lien entre le nombre chromatique d'un digraphe et l'existence de chemins orientés spécifiques en tant que sous-digraphes. Les digraphes contenus dans n'importe quel digraphe n-chromatique sont appelés n-universels. Nous examinons deux conjectures : la conjecture de Burr, qui affirme que chaque arbre orienté d'ordre n est (2n-2)-universel, et la conjecture d'El Sahili, qui déclare que chaque chemin orienté d'ordre n est n-universel. Pour
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Jiao, Yue. "Rôle de l'intéraction Asf1-Rad53 dans la stabilité génomique chez S.cerevisiae." Thesis, Paris 11, 2011. http://www.theses.fr/2011PA112105/document.

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Abstract:
Asf1 est une protéine chaperon d’histone, qui participe à l’assemblage et au désassemblage des histones H3/H4 sur l’ADN. Asf1 n’est pas essentiel pour la viabilité cellulaire chez S. cerevisiae, mais les voies de surveillance des dommages à l’ADN sont activées de façon constitutive dans les cellules dépourvues d’Asf1 et celles-ci sont hypersensibles à plusieurs types de stress génotoxiques. Chez S. cerevisiae, Asf1 forme un complexe stable avec Rad53 en absence de stress génotoxique. Nos résultats suggèrent qu’au moins trois surfaces d’interaction sont impliquées dans le complexe Asf1-Rad53. L
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Tisseur, Mathieu. "Rôle de Hda1 dans la régulation de l'expression gènes par les longs ARN." Thesis, Paris 11, 2013. http://www.theses.fr/2013PA112100/document.

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Abstract:
Les ARNnc sont impliqués dans la régulation de l’expression de gènes chez les Procaryotes, les Archées et les Eucaryotes. Cette régulation peut être effectuée au niveau transcriptionnel ou post-transcriptionnel. Elle fait parfois intervenir des modifications des histones comme la méthylation ou l’acétylation. J’ai étudié le gène TIR1 dont l’expression est fortement réduite lorsqu’un ARNnc codant antisens nommé TIR1axut est stabilisé. J’ai montré que cette régulation est dépendante de l’histone déacétylase Hda1. De plus, j’ai montré que l’acétylation de H3K14 et H3K18 ne sont pas directement im
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