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Dissertations / Theses on the topic 'Classification phylogénétique'

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1

Pécaud, Sophie. "Systématique phylogénétique et biologie évolutive." Thesis, Paris 1, 2013. http://www.theses.fr/2013PA010663.

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Abstract:
La question des rapports entre systématique phylogénétique et biologie évolutive est abordée sous l'angle de la fondation problématique des concepts, principes et règles de la première sur les hypothèses que formule la seconde concernant les processus évolutifs. La question de la nature et du rôle des hypothèses évolutives utilisées par la cladistique est posée à chaque étape de la méthode : formation de taxons de bases, formulation d'hypothèses d'homologie primaires, mise à l'épreuve de ces hypothèses avec la construction de cladogrammes et dérivation de classifications. L'analyse des choix e
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Montreuil, Olivier. "Systématique phylogénétique et biogéographie du genre Amphimallon Berthold, 1827 (Coleoptera: Melolonthidae) : hypothèses évolutives." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2000. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00567081.

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Abstract:
Le travail expose dans ce volume traite différents aspects d'une étude en systématique, appliquée ici à un groupe de coléoptères melolonthides : le genre amphimallon Berthold, 1827. Apres une brève présentation historique du groupe, l'étude de sa phylogénie est abordée suivant les concepts et les méthodes cladistiques. Deux approches sont menées et confrontées. La première, fondée sur des observations morphologiques, concerne la quasi-totalité des espèces traditionnellement rattachées à ce genre. La deuxième, restreinte dans ce travail a quelques espèces, fait appel aux techniques de la biolog
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Moyne, Sébastien. "Dynamique macroévolutive des ammonites au Jurassique moyen : approches taxonomique, morphologique, phylogénétique et structuration paléogéographique." Dijon, 2004. http://www.theses.fr/2004DIJOS063.

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4

Perreau, Michel. "Intérêt phylogénétique de la morphologie des derniers segments abdominaux des femelles des coléoptères cholevidae." Paris 5, 1991. http://www.theses.fr/1991PA05P202.

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5

Dupuis, Fabien. "L'abdomen et les genitalia des femelles de coléoptères Scarabaeoidea : Morphologie et intérêt phylogénétique." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2003. http://www.theses.fr/2003MNHN0002.

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Abstract:
Le travail exposé dans ce volume est une étude de l'abdomen et des genitalia des femelles de Coléoptères Scarabaeoidea. La première partie est une présentation de la structure et du plan de base des segments génitaux. Elle est accompagnée d'une étude bibliographique permettant de faire le point sur la terminologie employée. La seconde partie est consacrée à l'étude détaillée de 114 taxons pour lesquels une description du type abdominal, des terminalia et des voies génitales est fournie et illustrée de nombreux schémas. La dernière partie est une analyse phylogénétique utilisant exclusivement d
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Nakouné-Yandoko, Emmanuel. "Orthobunyavirus de la République Centrafricaine : détection, séquençage et analyse phylogénétique." Nancy 1, 2007. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/SCD_T_2007_0160_NAKOUNE-YANDOKO.pdf.

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Abstract:
La famille des Bunyaviridae regroupe plus de 350 virus transmis par des arthropodes, classés en cinq genres. La prévalence de ces virus en République Centrafricaine est mal connue et mérite des études moléculaires afin mettre en place un diagnostic fiable, de mieux caractériser les vecteurs et d'identifier les réservoirs qui sont le plus souvent inconnus. Etant donnée la diversité de ces virus, seuls les virus du genre Orthobunyavirus ont été caractérisés dans cette étude. La caractérisation génomique de Bunyaviridae a été réalisée par le séquençage de segments encadrés par des amorces consens
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Gugger, Muriel. "Etudes taxinomique et phylogénétique des cyanobactéries toxiques d'eau douce par des approches biochimique et moléculaire." Paris 7, 2001. http://www.theses.fr/2001PA077136.

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Cheikh, Al Bassatneh Marwan. "Diversité taxonomique, phylogénétique et fonctionnelle en région méditerranéenne : congruence ou divergence ?" Thesis, Aix-Marseille, 2019. http://www.theses.fr/2019AIXM0499.

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Abstract:
Les objectifs de la thèse sont d’analyser la biodiversité en région méditerranéenne européenne aux niveaux taxonomique, phylogénétique et fonctionnel et comprendre pourquoi ces différentes estimations de la biodiversité sont convergentes ou pas dans un contexte spatialisé et comment divers facteurs de l'environnement peuvent expliquer cette convergence ou son absence. Dans ce contexte, la thèse s’est d’abord focalisée sur la réalisation de nouveaux arbres phylogénétiques de la flore arborée méditerranéenne intégrant les espèces endémiques de cette région, permettant d’augmenter significativeme
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Otero, Olga. "Paléoichthyofaune de l'oligo-miocène de la plaque arabique : approches phylogénétique, paléoenvironnementale et paléobiogéographique." Lyon 1, 1997. http://www.theses.fr/1997LYO10361.

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Abstract:
La paleontologie de la peninsule arabique a ete particulierement etudiee en ce qui concerne les faunes de mammiferes, notamment ses primates anthropoides qui sont parmi les plus anciens, mais les faunes de poissons n'ont ete que tres brievement traitees. Il apparait pourtant que les ichthyofaunes de l'oligocene inferieur du sultanat d'oman et du miocene inferieur d'arabie saoudite et du sultanat d'oman sont parmi les plus riches de la plaque afro-arabique a ces epoques. Parce qu'elles sont situees, respectivement, bien avant et lors de la premiere connexion tertiaire entre la plaque afro-arabi
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Ait, Tayeb Lineda. "Étude phylogénétique des Pseudomonas sensu lato par séquençage du gène rpoB." Paris 11, 2006. http://www.theses.fr/2006PA114801.

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Abstract:
Le séquençage du gène rpoB apporte une résolution taxonomique trois fois plus élevée que celle donnée par le gène rrs codant l'ARNr 16S. L'application aux Pseudomonas rend plus facile l'identification des espèces. Une bonne corrélation a été obtenue entre les séquences rpoB et les hybridations ADN-ADN ainsi qu'avec la ribotypie, pour toutes les espèces de Pseudomonas et le complexe syringae (pathovars). La base de données obtenue est utilisée en identification. Le travail a été étendu aux Burkholderia, Comamonadaceae, Brevundimonas et bactéries apparentées en séquencant les gènes rpoB, gyrB et
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Costa-Mattioli, Mauro. "Le virus de l'hépatite A : de sa quantification, à l'analyse de sa variabilité génétique en vue d'une nouvelle classification phylogénétique." Nantes, 2002. http://www.theses.fr/2002NANT11VS.

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Abstract:
Les analyses phylogénétiques de régions spécifiques du génome virale du virus de l'hépatite A (VHA) ont montré que différents génotypes pouvaient circuler à travers des régions géographiques diverses. Afin de déterminer la variabilité génétique et le mode d'évolution du VHA au cours des épidémies survenues en Europe et en Amérique du Sud, des analyses des séquences des régions VP1-amino-terminale, VP/2A, et de la région codant pour la protéine VP1 complète des souches isolées en France, au Kosovo, en Uruguay, au Chili et en Argentine ont été réaliseés. . . . L'analyse de la région codant pour
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Grollemund, Rebecca. "Comparaison de différentes méthodes de classification : application aux langues bantu du nord-ouest." Thesis, Lyon 2, 2012. http://www.theses.fr/2012LYO20055.

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Abstract:
Ce travail de thèse propose une étude des nouvelles méthodes de classification, dites phylogénétiques, empruntées à la biologie dans le but de proposer une nouvelle classification linguistique. Les langues étudiées appartiennent à la famille « bantu », présentes au sein de la famille linguistique Niger-Congo, parlée en Afrique. De nombreux travaux ont été établis sur les langues bantu, montrant ainsi la complexité de cette famille linguistique. Notre étude se spécialise sur la zone « Nord-Ouest », qui comprend les pays suivants : Cameroun, Guinée Équatoriale, Gabon, Congo et République Démocra
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Bosdeveix, Robin. "Entre classifications fonctionnelle et phylogénétique : le groupe des végétaux : une reconstruction didactique fondée sur l'histoire des sciences dans le cadre de la formation des enseignants de sciences de la vie et de la Terre." Sorbonne Paris Cité, 2016. http://www.theses.fr/2016USPCC051.

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Abstract:
Cette recherche établit une dialectique entre didactique et histoire des sciences concernant les classifications biologiques, en ciblant le groupe des végétaux qui présente une multiplicité d'acceptions et une importante rectification historique. Cette étude s'inscrit dans le cadre de la formation des professeurs de sciences de la vie et de la Terre et se structure en trois enquêtes complémentaires. La première, de nature didactique, permet d'identifier à l'échelle nationale sept conceptions des végétaux dans une situation classificatoire ouverte et d'étudier les raisonnements classificatoires
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Rouhan, Germinal. "Systématique phylogénétique du genre Elaphoglossum Schott ex J. Sm (Elaphoglossaceae, Monilophytes) : approches morphologique, moléculaire, et implications biogéographiques pour la région de l'Océan Indien." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2005. http://www.theses.fr/2005MNHN0029.

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Abstract:
Elaphoglossum Schott ex J. Sm. (Elaphoglossaceae) est l’un des genres de Monilophytes les plus diversifiés. Cette diversité spécifique est paradoxalement associée à une morphologie générale simple et uniforme. L’objectif de cette Thèse est de proposer une hypothèse phylogénétique qui permette de clarifier la taxinomie du genre. Des caractères morphologiques et moléculaires ont été analysés. Les résultats confirment la monophylie du genre et suggèrent la reconnaissance de 5 clades majeurs. Les résultats phylogénétiques sont également utilisés pour expliquer la distribution actuelle du genre et
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Aubier, Thomas G. "Diversity of warning signals, speciation and clade diversification." Thesis, Montpellier, 2018. http://www.theses.fr/2018MONTG019/document.

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Abstract:
Les signaux d'avertissement que portent les proies toxiques (ou autrement défendues) offrent une opportunité unique de développer une vision intégrative de la diversification biologique. Ces signaux sont soumis à une forte sélection naturelle et sexuelle. D'une part, la stratégie d'échantillonnage utilisée par les prédateurs, caractérisée par l'apprentissage des signaux associés à la toxicité, protège les signaux en forte fréquence dans la communauté de proies. Cette sélection fréquence-dépendante positive favorise l'uniformité des phénotypes et la convergence de signaux entre espèces toxiques
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Leclerc, Camille. "Biodiversité endémique insulaire face aux changements globaux : état des lieux dans un contexte de conservation." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS507.

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Abstract:
Les changements globaux, du fait de l’empreinte humaine, sont associés à de nombreux déclins de populations et de disparitions d'espèces, et ce, notamment au sein des systèmes insulaires. L'importante biodiversité abritée par de tels écosystèmes est particulièrement vulnérable aux pressions anthropiques en raison de diverses caractéristiques (p. ex. syndrome d’insularité, faible redondance fonctionnelle, isolement géographique des îles). En dépit de cette vulnérabilité accrue, peu d’études se sont jusqu'à lors intéressées à ces systèmes comme modèle d’étude pour évaluer les patrons de menaces
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Brito, Paulo Marques Machado. "Révision des Aspidorhynchidae (Pisces, Actinopterygii) du Mésozoïque : ostéologie et relations phylogénétiques." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 1995. http://www.theses.fr/1995MNHN0008.

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Grand, Anaïs. "Représentation sémantique des phénotypes : métamodèle et ontologies pour les caractères taxonomiques et phylogénétiques." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2013. http://www.theses.fr/2013MNHN0008.

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Abstract:
La taxonomie du 21ème siècle se doit d’être « intégrative » en favorisant l’échange explicite et non ambigu des connaissances sur les phénotypes. Les caractères sont au coeur du travail des taxonomistes : découvrir, décrire, nommer, comparer, caractériser de nouveaux taxons, les classer selon leurs relations phylogénétiques, étudier l’histoire et la diversité de leurs caractères et de leurs distributions. Mon travail cherche à fournir un cadre formel et sémantique utile à l’intégration des caractères. L’information véhiculée par les caractères est explicitée grâce à l’outil logique défini par
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Allain, Ronan. "Les Megalosauridae (Dinosauria, Theropoda) : Nouvelle découverte et révision systématique : implications phylogénétiques et paléobiogéographiques." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2002. http://www.theses.fr/2002MNHN0011.

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Abstract:
Les Megalosauridae (Dinosauria, Theropoda) sont l'un des groupes les plus énigmatiques de dinosaures carnivores, n'étant connu[e]s que par un matériel relativement fragmentaire en comparaison avec celui des autres dinosaures carnivores. Le découverte de Poekilopleuron ? valesdunensis nov. Sp. Dans le Jurassique moyen de Normandie nous apporte de nombreuses informations sur l'anatomie de ces théropodes et sert de base à une révision détaillée des autres genres de théropodes européens, couramment rattachés aux Megalosauridae. Megalosaurus bucklandii, premier théropode non-avien jamais décrit, es
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Deveaux, Virginie. "Etude de la diversité génétique et inférence de liens phylogénétiques au sein de la section Mentha (Lamiaceae)." Saint-Etienne, 2002. http://www.theses.fr/2002STET4011.

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Abstract:
La taxonomie des menthes est très complexe du fait de leur polymorphisme morphologique, de leur capacité à s'hybrider et de leur domestication. La diversité génétique et les liens phylogénétiques ont été établis à l'intérieur de la section Mentha sur une collection de 62 accessions d'origines géographiques diverses, représentant les 4 espèces légitimes (M. Suaveolens L. , M. Longifolia (L. ) Huds. , M. Aquatica L. , M. Arvensis L. ) et les 3 hybrides les plus cultivés (M. Spicata L. , M. X piperita L. , M. X gracilis L. ). Les méthodes d'empreintes génétiques AFLP (Amplified Fragment Length Po
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Rolland, Morgane. "Etude des relations phylogénétiques entre les lentivirus des petits ruminants." Bordeaux 2, 2003. http://www.theses.fr/2003BOR21029.

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Abstract:
Les lentivirus des petits ruminants ou SRLV ("small ruminant lentivirus") correspondent au virus mae͏̈di visna ou MVV, qui infecte les moutons, et au virus de l'arthrite-encéphalite caprine ou CAEV ("caprine arthritis-encephalitis Virus"), qui infecte les chèvres. Pour faciliter l'étude des SRLV, nous avons immortalisé des cellules GSM ("goat synovial membrane") par l'expression ectopique de la télomérase. La lignée cellulaire GSM T a proliféré à un rythme constant avec plus de 160 passages en culture, tout en conservaNt la morphologie des cellules GSM primaires. De plus, les cellules GSM T pe
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Bouchard, Jean-Marie. "Morphologie fonctionnelle des systèmes de rétention de l'abdomen chez les Brachyoures (Crustacea Decapoda) : microstructure : implications phylogénétiques et systématiques." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2000. http://www.theses.fr/2000MNHN0022.

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Abstract:
Les brachyoures (crabes) sont les seuls décapodes qui possèdent un système de retention permettant de maintenir leur abdomen reployé contre la face ventrale. Chez les groupes les plus basaux, la rétention est appendiculaire ; chez les groupes distaux l'appareil de rétention est du type saillie sternale-fossette abdominale ; dans les groupes très spécialisés ou les plus distaux des brachyoures, le système saillie-fossette est remplacé par une complémentarité sterno-abdominale ou bien il disparaît (perte secondaire). Le passage de la modalité appendiculaire à sternale a favorisé la libération de
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Soccol, Vanete Thomaz. "Les Leishmania du Nouveau monde : analyse enzymatique, démarche progressive phénétique-cladistique, relations phylogénétiques avec les Leishmania de l'Ancien monde." Montpellier 1, 1993. http://www.theses.fr/1993MON1T002.

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Läng, Emilie. "Les Cétiosaures (Dinosaura, sauropoda) et les sauropodes du Jurassique moyen : revision systématique, nouvelles découvertes et implications phylogénétiques." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2008. http://www.theses.fr/2008MNHN0038.

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Abstract:
Les Cetiosauridae et plus généralement les sauropodes du Jurassique moyen demeurent l’un des groupes les plus énigmatiques de ces dinosaures herbivores. La révision des sauropodes du Jurassique moyen (Bothriospondylus madagascariensis et Lapparentosaurus madagascariensis de Madagascar, ?Cetiosaurus mogrebiensis du Maroc, Chebsaurus algeriensis d’Algérie et un nouveau spécimen du Calvados, France) constitue une source considérable d’informations pour mieux comprendre l'anatomie et l'évolution des sauropodes de cette époque. Les analyses phylogénétiques suggèrent que les Cetiosauridae sont parap
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Ataya, Abdou. "Étude isoenzymatique de populations naturelles d'amibes libres du genre Naegleria : relations phylogénétiques et arguments génétiques en faveur d'une reproduction de type sexué chez l'espèce Naegleria lovaniensis." Lyon 1, 1993. http://www.theses.fr/1993LYO1T184.

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Machado, Giselle Ribeiro de Paula. "Révision des †Ionoscopiformes (Actinopterygii : Neopterygii) et de certains taxons fossiles halécomorphes basaux : morphologie, taxonomie et relations phylogénétiques." Thesis, Poitiers, 2016. http://www.theses.fr/2016POIT2261/document.

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Abstract:
Les Ionoscopiformes sont un ordre de poissons actinoptérygiens fossiles avec de larges distributions temporelle et géographique, connus depuis le Trias moyen jusqu'au Crétacé supérieur, en Europe, Afrique, Asie et Amérique du Nord et du Sud. Les Ionoscopiformes sont composes des deux familles Ophiopsidae et Ionoscopidae, représentées par des espèces variées dont certaines ont leur anatomie encore mal connue. Bien que les Ionoscopiformes soient considérés comme un groupe monophylétique, les espèces d'Ophiopsidae et de Ionoscopidae diffèrent par plusieurs caractères, dont le type d'écaille et la
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Auvray, Gaëlle. "Les relations phylogénétiques au sein d'un système réticulé : cas particulier de Cytisus scoparius L. (Genisteae, Fabaceae) et des espèces, hybrides et cultivars apparentés." Phd thesis, Université d'Angers, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00975350.

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Abstract:
Le groupe " scoparius " est composé de Cytisus scoparius (Genisteae, Fabaceae) et des taxons qui lui sont apparentés dans le genre Cytisus. Des études taxinomiques et morphométriques ont permis de délimiter 10 espèces réparties en trois sections Alburnoides, Spartopsis et Verzinum. Une phylogénie moléculaire basée sur des marqueurs chloroplastiques trnD-T, trnS-G et nucléaires ITS, LEGCYCIAa, LEGCYCIAb et LEGCYCIAc a montré que les sections Alburnoides et Verzinum, toutes deux monophylétiques (à condition d'inclure C. striatus dans la section Alburnoides), sont des groupes frères alors que la
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Yakoubou, Sabarimatou. "Évaluation d'un marqueur d'ADN universel pour la reconstruction phylogénétique de taxa bactériens." Thèse, 2011. http://www.archipel.uqam.ca/4377/1/D2189.pdf.

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Abstract:
Différents marqueurs moléculaires ont été utilisés au cours des deux dernières décennies pour des études systématiques des espèces bactériennes à différents niveaux taxinomiques. L'apparition de nouvelles méthodes d'identification et de classification des espèces bactériennes telles que la taxonomie numérique et la taxonomie phylogénétique ont amenées à la révision de plusieurs taxa bactériens. Dans l'Ordre des Bacillales et dans la Classe des y-protéobactéries par exemple, ces méthodes ont aboutit à la révision de la famille des Bacillaceae et du genre Xanthomonas, respectivement. Compte tenu
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Cheikh, Rouhou Mouna. "Évaluation des classifications phylogénétiques des Bacillaceae basées sur les gènes de l'opéron rrn et de gènes de ménage." Mémoire, 2006. http://www.archipel.uqam.ca/3234/1/M9602.pdf.

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Abstract:
Plusieurs approches ont, jusqu'à présent, été utilisées pour l'identification de nouvelles souches ainsi que pour la caractérisation et la classification des différentes espèces au sein des Bacillaceae. Cependant, la plupart de ces méthodologies présentent certaines insuffisances. L'objectif de cette étude est d'établir et d'évaluer des classifications phylogénétiques des Bacillaceae basées sur divers gènes, d'analyser l'effet de l'hétérogénéité alléliques sur celles-ci, ainsi que d'étudier la distribution des mutations. Seuls les Bacillaceae dont le génome est complètement séquencé ont été c
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