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Deleporte, Pierre. "Phylogénie et classification : concepts, méthodologie générale et postulats requis." Biosystema N° 30, no. 1 (2015): 99–112. https://doi.org/10.3917/biosy.030.0099.

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Abstract:
Une phylogénie représente une succession d’événements de spéciation, constituant une explication historique sommaire de la distribution des caractères dans les organismes (matrice taxons x caractères ). L’inférence phylogénétique nécessite la mise en œuvre d’un « algorithme à remonter le temps », fondé sur une conception du processus évolutif (le « modèle » d’évolution des caractères). Les méthodes phylogénétiques diffèrent fondamentalement par les modèles mis en œuvre, plutôt que par les techniques d’optimisation. Mais que savons-nous des lois d’évolution des caractères ? C’est toujours le po
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Le Guyader, Hervé. "Les classifications pré-évolutionnistes et la classification phylogénétique." Biosystema N° 24, no. 1 (2014): 39–52. https://doi.org/10.3917/biosy.024.0039.

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Prelli, Rémi. "La classification phylogénétique des ptéridophytes actuelles." Le Journal de botanique 49, no. 1 (2010): 37–47. http://dx.doi.org/10.3406/jobot.2010.1081.

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Hennig, Willi, and Annemarie Ohler. "Remarques critiques concernant la question « Analyse cladistique ou classification cladistique ? »." Biosystema N° 29, no. 3 (2014): 71–95. https://doi.org/10.3917/biosy.029.0071.

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Abstract:
(traduit de l’anglais par Pascal Tassy) : Mayr rejette la systématique phylogénétique (« cladistique ») en faveur de ce qu’il appelle « la systématique évolutionniste ». Il prétend que « le postulat de base de la théorie cladistique, une congruence absolue entre le cladogramme et la classification, ne peut être satisfait qu’en faisant de nombreuses hypothèses et redéfinitions et en ignorant de nombreux faits de l’évolution et de la phylogénie (au sens large). » C’est une erreur. En réalité, des définitions claires et non ambiguës de termes tels que « monophylie » et « relation de parenté » son
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Selosse, Marc-André, and Guy Durrieu. "Une classification mycologique phylogénétique francophone (en 2003)." Acta Botanica Gallica 151, no. 1 (2004): 73–102. http://dx.doi.org/10.1080/12538078.2004.10516022.

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Martin, Patrick. "L’arbre du vivant : classification phylogénétique des Annélides." Biosystema N° 30, no. 1 (2015): 49–67. https://doi.org/10.3917/biosy.030.0049.

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Abstract:
Les Annélides, ou vers segmentés, forment un groupe généralement considéré comme monophylétique, qui est traditionnellement divisé entre les Polychaeta et les Clitellata. Ils sont évolutivement anciens, écologiquement importants et extrêmement diversifiés en termes d’espèces et de plans d’organisation. Pour ces raisons, les Annélides ont toujours constitué l’un des problèmes majeurs dans la résolution de la phylogénie des Métazoaires. La révolution conceptuelle et méthodologique liée à l’analyse cladistique et surtout l’accès, via l’ADN, à une nouvelle classe de caractères ont bouleversé la cl
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Jovet-Ast, Suzanne. "Vers une Classification Phylogénétique des Espèces du Genre Riccia." Bryologist 90, no. 4 (1987): 321. http://dx.doi.org/10.2307/3243093.

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Lévi-Strauss, Claude. "Guillaume Lecointe & Hervé Le Guyader, Classification phylogénétique du vivant." L'Homme, no. 162 (January 1, 2002): 309–12. http://dx.doi.org/10.4000/lhomme.169.

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d'Hondt, Jean-Loup. "Embranchement versus Phylum : comment la conjoncture internationale peut influencer la nomenclature scientifique et la classification animale." Bulletin de la société linnéenne de Lyon 87, no. 3 (2018): 111–20. http://dx.doi.org/10.3406/linly.2018.17870.

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Abstract:
Sous l’effet de la situation politique européenne du début du vingtième siècle, au terme d’Embranchement (unité systématique) a été substitué le mot fautif de Phylum (unité phylogénétique) qui a une signification toute différente, mais qui tend de plus en plus à s’imposer à la communauté scientifique par ignorance historique et inculture de certains naturalistes.
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d'Hondt, Jean-Loup. "Apoptoses et cellules-souches, bases fondamentales de la classification phylogénétique des Bryozoaires." Bulletin de la société linnéenne de Lyon 87, no. 3 (2018): 97–110. http://dx.doi.org/10.3406/linly.2018.17869.

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Abstract:
La diversité des modèles larvaires et morphogénétiques chez les Bryozoaires (Deutérostomiens, Coelomates) procède d’évènements pré-programmés intervenant lors des stades les plus précoces de l’ontogénie : phénomènes d’apoptoses, présence de cellulessouches, suppléances morphogénétiques. Ces évènements d’origine génétique déterminent les bases fondamentales de la classification phylogénétique des Bryozoaires et le paraphylétisme des lignées. État des connaissances sur la «pseudogastrulation » , caractéristique biologique majeure et unitaire des Bryozoaires larvipares, dont les modalités laissen
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Mayoyo, Sedard, Michael Kilela, Paulin Tshibuabua, Jude Mwamba, and Eugene Mukendi. "Innovations en Analyse Phylogénétique : La Méthode Pyrecos." Journal Africain des Sciences 1, no. 2 (2024): 125–36. https://doi.org/10.70237/jafrisci.2024.v1.i2.23.

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Abstract:
The phylogenetic analysis of homologous sequences is essential in molecular and evolutionary biology, allowing the understanding of relationships and the evolutionary history of genes and proteins. It relies on the similarities and differences between genetic sequences to reconstruct the phylogenetic tree. Its applications include the reconstruction of evolutionary history, inference of genetic functions, study of genetic diversity, medical applications, taxonomic classification, and evolutionary studies. Traditional methods (cladistics, phenetics, probabilistic methods, and phylogenomics) hav
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Espeut, Marc. "Histoire botanique du genre Viola et de la famille des Violaceae." Le Journal de botanique 101, no. 1 (2022): 2–28. http://dx.doi.org/10.3406/jobot.2022.2367.

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Abstract:
Les violettes sont des fleurs connues dans la littérature depuis l’Antiquité gréco-romaine. Ce travail retrace l’histoire botanique du genre Viola depuis Théophraste jusqu’à la dernière classification phylogénétique APG 4. Les pensées furent regroupées pour la première fois avec les violettes durant le 16e siècle mais le genre Viola dans sa conception actuelle n’apparut qu’au début du 18e siècle avec Tournefort. Ce genre fut longtemps regroupé dans d’autres familles et ce n’est qu’un siècle plus tard, en 1802, que la famille des Violaceae fut créée. Une vingtaine des plus importantes classific
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Audenet, F., S. Isharwal, E. Cha, et al. "Classification phylogénétique des récidives vésicales après tumeur de la voie excrétrice urinaire supérieure." Progrès en Urologie 28, no. 13 (2018): 681. http://dx.doi.org/10.1016/j.purol.2018.07.133.

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Zeitoun, Valéry. "Les paléoanthropologues sont-ils en meilleure position que les autres pour se permettre d’ignorer les règles de la systématique ? Un bref historique." Biosystema N° 30, no. 1 (2015): 155–72. https://doi.org/10.3917/biosy.030.0155.

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Abstract:
La propagation d’analyses à sensation ou incomplètes, de même que l’interprétation erronée de données, ont conduit à une série de consensus paléoanthropologiques qui, pour l’essentiel, relève de la répétition de conjectures. Ces pratiques sont associées à une absence de maîtrise des règles de la classification dont il résulte un discours paléoanthropologique phylogénétique le plus souvent découplé des règles de la systématique. À partir des années 1960, les travaux paléoanthropologiques s’intéressent plus spécifiquement à la nomenclature et la taxinomie des Hominidés en rendant compte explicit
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Van, Rossum F. "Classification phylogénétique moléculaire de la flore vasculaire de Belgique, du Grand-Duché de Luxembourg et des régions voisines." Dumortiera 113 (January 25, 2019): 29–38. https://doi.org/10.5281/zenodo.2548677.

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Abstract:
Molecular phylogenetic classification of the vascular flora of Belgium, the Grand-Duchy of Luxembourg and neighbouring regions. The classification based on molecular phylogeny has undergone numerous revisions since the first publication in 1998 for angiosperms. Given the new advances, it seemed appropriate to make a review of the latest changes for our vascular flora. A linear sequence of the classification of orders and families is also detailed.
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Bouee, S., and F. Detroit. "Morphométrie géométrique et classification phylogénétique, application à la question de l’origine d’Homo sapiens en Asie." Bulletins et mémoires de la Société d'anthropologie de Paris 22, no. 3-4 (2010): 172–84. http://dx.doi.org/10.1007/s13219-010-0018-7.

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Pénicaud, Pierre. "Conception et réalisation d’une exposition permanente consacrée à l’arbre du vivant." Biosystema N° 30, no. 1 (2015): 173–88. https://doi.org/10.3917/biosy.030.0173.

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Abstract:
En 2007, l’équipe scientifique du muséum Henri-Lecoq de Clermont-Ferrand dont j’étais alors le directeur décide de consacrer une salle des présentations permanentes à la classification phylogénétique du vivant. Pourquoi et comment réalise-t-on un tel projet muséographique dans le contexte d’un muséum d’histoire naturelle en région aux moyens relativement limités ? Dans cet article nous replaçons ce projet dans le contexte local du musée (présentation du musée, inscription de celui-ci dans le projet scientifique et culturel de l’établissement) ; nous expliquons la méthodologie et les choix adop
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Rolland-Thomas, Paule. "Essai sur la contribution de l’anthropologie culturelle aux fondements de la classification documentaire." Documentation et bibliothèques 42, no. 1 (2015): 7–18. http://dx.doi.org/10.7202/1033320ar.

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Abstract:
La classification est un phénomène qui répond à un besoin coextensif au monde vivant en permettant la mise en ordre des choses et des êtres vivants. Si dans l’ordre de la nature, l’être vivant est prédéterminé à classifier, il en va tout autrement dans l’ordre de la culture où les modèles culturels détermineront les structures classificatoires. Aussi loin que l’on puisse remonter dans la genèse de l’humanité, le témoignage d’artefacts et de documents de toutes sortes est assez éloquent pour que l’on puisse formuler des hypothèses qui attestent l’existence de pratiques classificatoires fort nom
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Souvenir Zafindrajaona, P., Voumparet Zeuh, Katayoun Moazami Goudarzi, et al. "Etude du statut phylogénétique du bovin Kouri du lac Tchad à l'aide de marqueurs moléculaires." Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux 52, no. 2 (1999): 155–62. http://dx.doi.org/10.19182/remvt.9690.

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Abstract:
Le polymorphisme de 25 systèmes de marqueurs génétiques autosomaux(11 systèmes de groupes sanguins, 5 locus de lactoprotéines et 9 microsatellites) a été analysé dans un échantillon de la population de bovins Kouri du lac Tchad provenant de la zone en bordure du lac et d'iles localisées dans la préfecture de Bol. Les résultats obtenus, ainsi que les données déjà acquises sur différentes populations de taurins et de zébus africains et sur les races françaises, ont été traités par analyse factorielle des correspondances et par des méthodes de classification pour tenter de préciser le statut phyl
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Mayr, Ernst, Pascal Tassy, and Martin S. Fischer. "Analyse cladistique ou classification cladistique ?" Biosystema N° 29, no. 3 (2014): 13–70. https://doi.org/10.3917/biosy.029.0013.

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Abstract:
Trois théories de la classification sont aujourd’hui en compétition, chacune prétendant qu’elle est la plus à même de fournir une classification significative et fiable. L’une d’entre elles, la théorie de la cladistique de Hennig utilise le « degré d’ancienneté de l’ascendance commune » comme critère primordial pour la délimitation et la catégorisation des taxons. Cependant, les opposants à la cladistique avancent une objection : on doit faire la différence entre l’analyse cladistique et la classification cladistique. Puisque tout groupe naturel (taxon) doit inclure les plus proches parents, i
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Jmel Boyer, Inès, and Emmanuel García Sánchez. "Le développement embryonnaire pré-gastrulatoire humain : modèles d’avenir et enjeux sociétaux." Biologie Aujourd’hui 214, no. 3-4 (2020): 109–13. http://dx.doi.org/10.1051/jbio/2020012.

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Abstract:
L’infertilité, les fausses couches précoces et les malformations congénitales sont des problèmes majeurs de santé publique fréquents et relativement méconnus. Jusqu’à présent ce que l’on sait du développement précoce humain provient de deux sources principales : l’étude d’embryons humains et l’étude d’animaux modèles. Bien que certains mécanismes moléculaires soient conservés, il existe des spécificités liées à l’espèce humaine. Ainsi, il est important d’étudier les animaux modèles les plus proches possibles dans la classification phylogénétique, ce qui a mené à l’utilisation de lignées cellul
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Rossetto, Elson Felipe Sandoli, and Marcos A. Caraballo-Ortiz. "Splitting the Pisonia birdcatcher trees: re-establishment of Ceodes and Rockia (Nyctaginaceae, Pisonieae)." PhytoKeys 152 (July 7, 2020): 121–36. http://dx.doi.org/10.3897/phytokeys.152.50611.

Full text
Abstract:
Several genera of Nyctaginaceae, currently merged under Pisonia, have been described for the Indo-Pacific region. Results from a recent molecular phylogenetic study of tribe Pisonieae showed that Pisonia is non-monophyletic and comprises three well-supported lineages: one including typical Pisonia and allies (Pisonia s.str.), a clade of species which corresponds to the original description of Ceodes and a third lineage whose single representative was formerly treated under the monotypic genus Rockia. Thus, as part of an effort to achieve a natural classification for tribe Pisonieae, this work
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Rossetto, Elson Felipe Sandoli, and Marcos A. Caraballo-Ortiz. "Splitting the Pisonia birdcatcher trees: re-establishment of Ceodes and Rockia (Nyctaginaceae, Pisonieae)." PhytoKeys 152 (July 7, 2020): 121–36. https://doi.org/10.3897/phytokeys.152.50611.

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Abstract:
Several genera of Nyctaginaceae, currently merged under Pisonia, have been described for the Indo-Pacific region. Results from a recent molecular phylogenetic study of tribe Pisonieae showed that Pisonia is non-monophyletic and comprises three well-supported lineages: one including typical Pisonia and allies (Pisonia s.str.), a clade of species which corresponds to the original description of Ceodes and a third lineage whose single representative was formerly treated under the monotypic genus Rockia. Thus, as part of an effort to achieve a natural classification for tribe Pisonieae, this work
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Coomans, August. "Nematode systematics: past, present and future." Nematology 2, no. 1 (2000): 3–7. http://dx.doi.org/10.1163/156854100508845.

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Abstract:
AbstractA brief overview is given of nematode taxonomy since its beginnings in the second half of the 19th century. Most of the work concerned α-taxonomy, but in the thirties and subsequently from the sixties several classifications have been proposed. Since the eighties phylogenetic systematics was introduced as the underlying theory. Due to the pioneering work of several famous nematode taxonomists in the first half of the 20th century an increased interest for the discipline arose. Very unfortunately, this interest decreased in more recent times to an alarming extent. The difficulty to corr
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Ley, Paul De. "Lost in worm space: phylogeny and morphology as road maps to nematode diversity." Nematology 2, no. 1 (2000): 9–16. http://dx.doi.org/10.1163/156854100508854.

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Abstract:
AbstractThe taxonomic impediment in nematology is expanding rather than receding: in the past decade estimates of nematode species richness have increased by several orders of magnitude, while the number of active nematode taxonomists has continued to decline steadily. In order to survive as a discipline in the new century, nematode taxonomy will therefore have to i) prioritise taxa that are relevant to other scientific investigations, ii) provide identification and classification tools that are easily applicable by nonspecialists, and iii) focus on revealing patterns of relatedness rather tha
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Devineau, Jean-Louis. "Seasonal rhythms and phenological plasticity of savanna woody species in a fallow farming system (south-west Burkina Faso)." Journal of Tropical Ecology 15, no. 4 (1999): 497–513. http://dx.doi.org/10.1017/s0266467499000978.

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Abstract:
Leafing, flowering and fruiting of the 24 most representative species of trees and shrubs in Sudanian savannas and fallows near Bondoukuy (Burkina Faso) were studied for 2 y (May 1992 to June 1994). The period of defoliation was generally brief, and leaf flushing, flowering and fruiting occurred mostly in the dry season. The phenological behaviour varied nonetheless across species and individuals. A classification taking into account synchrony/asynchrony and duration in foliation, flowering, fruit ripening and seed dispersal phases allowed comparison of species' phenological plasticity. Specie
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Grésillon, Étienne, François Bouteau, Denis Chartier, and Patrick Laurenti. "Nos sœurs les plantes, une pensée interdisciplinaire pour aborder le vivant en termes de parenté." Natures Sciences Sociétés, 2023. http://dx.doi.org/10.1051/nss/2023003.

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Abstract:
La classification phylogénétique a mis fin à la distinction ontologique et scientifique entre les animaux et les plantes. Elle remet en question la partition entre ces deux règnes et réfute la thèse aristotélicienne dissociant les humains, les animaux et les plantes. « Les plantes nos sœurs » permet ici une réflexion sur le patrimoine biologique commun entre les animaux (humain compris) et les plantes. Pour comprendre ce qui relie les vivants, nous souhaitons apporter ici une pensée hybride combinant sciences de la vie et sciences humaines. Il s’agit, au moyen d’une approche interdisciplinaire
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"The Tree of Life: A Phylogenetic Classification. By Guillaume Lecointre and , Hervé Le Guyader; illustrated by Dominique Visset; translated by Karen McCoy. Belknap Press. Cambridge (Massachusetts): Harvard University Press. $39.95. 560 p + a booklet summarizing the phylogenetic groups in graphical format; ill.; indexes of common and Latin names. ISBN: 0‐674‐02183‐5. [Originally published as Classification Phylogénétique du Vivant, Third Edition, by Éditions Belin, Paris, France, 2006.] 2006." Quarterly Review of Biology 82, no. 3 (2007): 265. http://dx.doi.org/10.1086/523126.

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