Dissertations / Theses: 'Coffea'

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Wetala, Maketso Patrick Elias. "Weed control in establishing coffee (Coffea canephora Pierre and Coffea arabica L.) in Uganda." Thesis, University of Reading, 1997. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.363396.

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Le, Linh M. "Consumer Acceptability of a Kombucha Coffee (Coffea) Prototypewith Traditional Coffee Characteristics." Thesis, California State University, Long Beach, 2017. http://pqdtopen.proquest.com/#viewpdf?dispub=10604912.

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Abstract:

Coffee and Kombucha tea are both beverages that have been consumed for many years, with a current increased momentum in consumption due to many correlations with beneficial health aspects. The objective of this study was to assess the consumer acceptability of a Kombucha Coffee which tastes more like traditional coffee. A Kombucha Coffee prototype “BubbLê”, was created and compared to a market Kombucha Coffee via a hedonics evaluation, food action rating scale (FACT), and a paired-comparison ranking test. Participants rated the market Kombucha Coffee significantly higher than “BubbLê” Kombucha Coffee in all sensory aspects for flavor (6.84 ± 1.82; 4.46 ± 2.48; p < 0.001), sweetness (7.11 ± 1.63; 4.65 ± 2.33; p < 0.001), tartness (6.27 ± 1.77; 4.72 ± 2.55; p < 0.001), aroma (6.30 ± 1.82; 5.55 ± 2.59; p = 0.018), mouthfeel (6.87 ± 1.62; 5.36 ± 2.64; p < 0.001), and overall likeability (6.90 ±1.76; 4.59 ± 2.43; p < 0.001) in the hedonics evaluation. The FACT test indicated that participants would more likely drink the market alternative compared to the prototype (5.42 ± 1.96; 3.62 ± 2.29; p < 0.001). The majority of participants (80%) chose the market Kombucha Coffee over the more traditional coffee flavored Kombucha Coffee prototype. It is noted that flavor scored the lowest in sensory evaluation for the prototype, therefore, reevaluation of flavor by means of adding coffee enhancing notes are needed for further development of a Kombucha Coffee with a more traditional coffee flavor profile.

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Souza, Silvana Aparecida da Silva. "Oviposição de Ceratitis capitata (Diptera : Tephritidae) em Coffea arabica e Coffea canephora." Universidade Federal de Viçosa, 2009. http://locus.ufv.br/handle/123456789/3912.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:30:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 956764 bytes, checksum: 3bef5df3bcdc4114c6a2adb81f50f58b (MD5) Previous issue date: 2009-02-18
Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais
The behavior meeting and selection of host plants is a matter of great importance in the study of insect-plant interactions. The triggering of such conduct takes place through a set of physical and chemical signals emitted by plants. Chemical signals to attract insects and allow them to recognize the host plant, while the physical characteristics are encouraging initiatives to guide the insect to the host fruit. The Mediterranean fruit fly Ceratitis capitata explores a range of host plants and at the time of laying their choices are mediated by physical signs. C. capitata explores a range of host plants and has been reported frequently in cultures of Coffea arabica in different regions of the world. The females appear in the coffee plantations in the early stage of grain maturity, attacking mainly ripe fruits. In Brazil, has assumed great economic importance in coffee plantations of C. arabica of Bahia. However, in coffee plantations of Coffea canephora has not been reported and rejection or acceptance of fruits for oviposition of C. capitata. The objective was to obtain information on laboratory and field conditions on the oviposition of C. capitata in varieties of C. arabica and varieties of C. canephora. We assessed the preference of oviposition C. capitata among varieties of C. arabica and C. canephora, and combinations of varieties of C. arabica with those of C. canephora. Also were assessed effect of diameter and thickness of the shell of the fruits of C. arabica and C. canephora in the oviposition of C. capitata. Females of C. capitata showed no oviposition preference among varieties of C. arabica. Females showed a preference between the varieties of C. canephora, albeit with lower deposition of eggs in the fruit. The combinations of the varieties of C. arabica with varieties C. canephora highest average of eggs were obtained in the varieties of C. arabica. Therefore, one may conclude that the fruits of C. canephora were resistant to attack by C. capitata. The thickness of the peel of fruits of C. arabica and C. canephora influenced the deposition of eggs in the rosettes. With increasing shell thickness decreases the average number of eggs in the rosettes. The thickness of the peel of fruits of C. arabica had greater acceptability for oviposition of C. capitata. The diameter of the fruits of C. arabica and C. canephora influence the number of eggs deposited in rosettes. According, increases the diameter, increases the average number of eggs in the rosettes.
O comportamento de encontro e seleção de plantas hospedeiras é um assunto de grande importância no estudo de interação inseto-planta. O desencadeamento de tais comportamentos acontece mediante um conjunto de sinais químicos e físicos emitidos pelas plantas. Sinais químicos atraem os insetos e lhes permitem o reconhecimento da planta hospedeira, enquanto as características físicas são estímulos inicias que orientam o inseto para o fruto hospedeiro. A mosca-do- mediterrâneo Ceratitis capitata explora uma gama de plantas hospedeiras e no momento da postura suas escolhas são mediadas por sinais físicos. C. capitata explora uma gama de plantas hospedeira e vem sendo registrado com frequência em culturas de Coffea arabica em diferentes regiões do mundo. As fêmeas aparecem nos cafezais no início da fase de maturação dos grãos, atacando preferencialmente frutos maduros. No Brasil, vem assumindo grande importância econômica nos cafezais de C. arabica da Bahia. Entretanto, em cafezais de Coffea canephora não se tem relato de rejeição e ou aceitação dos frutos para oviposição de C. capitata. O objetivo do trabalho foi obter informações em condições de laboratório e campo, sobre a oviposição de C. capitata em variedades de C. arabica e em variedades de C. canephora. Avaliou-se a preferência de oviposição C. capitata entre as variedades de C. arabica e as de C. canephora, e combinações das variedades de C. arabica com as de C. canephora. Também avaliamos o efeito do diâmetro e espessura da casca dos frutos de C. arabica e C. canephora na oviposição de C. capitata. Fêmeas de C. capitata não apresentaram preferência de oviposição entre as variedades de C. arabica. Fêmeas apresentaram preferência entre as variedades de C. canephora, embora com baixa deposição de ovos nos frutos. Nas combinações das variedades de C. arabica com variedades de C. canephora maior média de ovos foram obtidos nas variedades de C. arabica. Portanto, pode se concluir que os frutos de C. canephora foram resistente ao ataque de C. capitata. Essa resistência pode estar relacionada com as características física ou química dos frutos. A espessura da casca dos frutos de C. arabica e C. canephora influenciou na deposição de ovos nas rosetas. Com o aumenta da espessura da casca diminui o número médio de ovos nas rosetas. A espessura da casca dos frutos de C. arabica teve maior aceitabilidade para oviposição de C. capitata. O diâmetro dos frutos de C. arabica e C. canephora influenciou no número médio de ovos depositados nas rosetas. Conforme aumenta o diâmetro dos frutos, aumenta o número médio de ovos nas rosetas.

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Parada, André Luís Duarte. "Caracterização da resistência a Colletotrichum kahawae em Coffea spp." Master's thesis, ISA/UTL, 2011. http://hdl.handle.net/10400.5/4051.

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Abstract:

Mestrado em Engenharia Agronómica - Instituto Superior de Agronomia
Coffee is one of the most valuable agricultural products in world trade being crucial to the economies of many developing countries. However its production is constrained by a number of major diseases, including Coffee Berry Disease (CBD) caused by Colletotrichum kahawae Waller & Bridge. Currently CBD is limited to Africa, constituting a serious threat to other coffee growing countries in other continents. This disease is responsible for up to 80% of crop losses, if no control measures are applied. The most widely used method to control this disease involves the application of fungicides. However some institutions in some coffee growing countries are developing breeding programs for the creation of resistant varieties to this pathogen. In this work resistance of different tetraploid interspecific coffee hybrids were characterized by pre-screening tests and several genotypes with different levels of resistance to some C. kahawae isolates were selected. Additional observations were made in hypocotyls inoculated with different isolates of C. kahawae allowed the characterization of dilatory resistance in coffee genotypes classified as susceptible. Histological studies were also made in hypocotyls with the aim of evaluating their behaviour compared with other known genotypes.

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Benatti, Luciana Benjamim 1978. "Atributos bioquímicos e fisiológicos de AC1 : um cafeeiro naturalmente descafeinado." [s.n.], 2012. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/315471.

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Abstract:

Orientador: Paulo Mazzafera
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-08-22T06:22:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Benatti_LucianaBenjamim_D.pdf: 2232263 bytes, checksum: f99e9792ce3a097423a6628b62ddb600 (MD5) Previous issue date: 2012
Resumo: Em 2004, Silvarolla e colaboradores descobriram três plantas (AC1, AC2 e AC3) de Coffea arabica, provenientes da Etiópia, com baixa quantidade de cafeína nas sementes. Esta pequena concentração (0,76 mg/g) em AC1, quando comparada com grãos de C. arabica com cafeína (em torno de 12 mg/g), foi verificada ser de origem constitutiva da planta, sendo esta denominada como naturalmente descafeinada. Neste trabalho a planta de AC1 foi estudada, já que esta é a mais adequada para a transferência genética do traço "sem cafeína" para cultivares com alta produtividade. Ao analisar o desenvolvimento das sementes de AC1, foi observado que endospermas maduros da planta com baixas quantidades de cafeína perderam menos massa do que os de Mundo Novo (MN) e que estes, no final do desenvolvimento, eram maiores do que os de AC1. Entretanto, apesar deste fato, os conteúdos de aminoácidos, açúcares solúveis, ácidos orgânicos, ácidos clorogênicos e trigonelina foram similares nas sementes de frutos de MN e AC1. Foi constatado que em todos os estádios fenológicos as sementes de AC1 apresentaram baixas quantidades de cafeína. Além disso, foi observado que não só sementes e folhas apresentaram esta característica, mas também flores e internódios. Experimentos com o fornecimento de [2-14C] adenina e análises enzimáticas de teobromina sintase e cafeína sintase nas sementes de AC1 confirmaram que, assim como em folhas, a síntese de cafeína é bloqueada na metilação de teobromina a cafeína, acumulando altas taxas de teobromina. Experimentos de análise de expressão gênica indicaram que, apesar dos genes responsáveis pela síntese das três metiltransferases envolvidas na síntese de cafeína ser expressos nos endospermas de AC1, suas expressões são menores se comparadas com o controle MN, principalmente ao analisar a expressão do gene CCS1, que codifica para a cafeína sintase. Os compostos fenólicos apresentaram valores próximos ao longo de todo o desenvolvimento do endosperma, sendo que a quantidade equivalente encontrada nestes grãos parcialmente explica a atividade antioxidante similar encontrada nos grãos maduros de MN e AC1. Análises de proteínas de reserva em endospermas maduros foram similares em MN e AC1
Abstract: In 2004, Silvarolla and co-workers discovery three plants (AC1, AC2 and AC3) of Coffea arabica, originated from Ethiopia, with low amount of caffeine in the seeds. This low concentration (0,76 mg/g) was found to be constitutive plant origin, this being referred to as naturally decaffeinate. In this work only the seeds of AC1 were studied, since this plant has shown to be the most suitable for gene transfer trace "without caffeine" for cultivars with high productivity. By analyzing the development of the seed AC1, it was observed that the mature endosperm of the plant with low amounts of caffeine lost less weight than those of MN, and also at the end of development, they were greater than those of AC1. However, despite this fact, the contents of amino acids, organic acids, chlorogenic acids and trigonelline were similar to MN and AC1 seeds and fruits. Soluble sugars were also similar in most part of the development despite the sucrose in the endosperm AC1 cherry stage, having it's significantly less than the one found in the endosperm MN at the stage. It was found that in all growth stages seeds AC1 presented low amounts of caffeine. Furthermore, it was observed that not only seeds and leaves showed this characteristic, but also flowers and internodes. Experiments with the supply of [2-14C] adenine and enzymatic analyzes of theobromine synthase and caffeine synthase in AC1 seeds confirmed that as leaves, caffeine synthesis are blocked in the methylation of theobromine to caffeine, accumulating high levels of theobromine. Experiments of the gene's expression analysis indicated that, although the genes responsible for the synthesis of the three methyltransferases involved in caffeine synthesis are expressed in AC1 endosperm, presented minor expressions compared to the control MN, especially when analyzing the expression of the gene CCS1, which synthesizes caffeine synthase. Phenolic compounds had similar values throughout the development of the endosperm, the equivalent amount found in these grains partly explains the similar antioxidant activity found in the MN and AC1 mature grains. The reserve proteins assays of mature endosperms were also similar in both endosperms
Doutorado
Biologia Vegetal
Doutora em Biologia Vegetal

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Pacheco, Bustos Alex Gustavo. "Allelochemical effects of aromatic species intercropped with coffee (Coffea arabica L.) in Puebla, Mexico." [S.l.] : [s.n.], 2007. http://deposit.ddb.de/cgi-bin/dokserv?idn=984679995.

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Campanha, Fernanda Gonçalves. "Discriminação de espécies de café (Coffea arabica e Coffea canephora) pela composição de diterpenos." Universidade Estadual de Londrina. Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Ciência de Alimentos, 2008. http://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls000127750.

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Abstract:

O Brasil é o maior produtor e exportador mundial de café, destacando-se as espécies Coffea arabica e Coffea canephora (conilon). O café conilon, de menor valor comercial, é muitas vezes adicionado ao arábica, no entanto apresenta qualidade e aceitabilidade inferior. Após a torra e moagem, não é possível distinguir visualmente as espécies, sendo necessários outros critérios para discriminação. Técnicas cromatográficas têm sido utilizadas, especialmente a Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (CLAE), devido à versatilidade e possibilidade de quantificação de componentes termolábeis. Dentre os compostos estudados, os diterpenos caveol e cafestol são relatados como potenciais indicadores pelo fato de estarem presentes em diferentes proporções nas espécies e terem maior estabilidade à temperatura que a maioria dos componentes hidrossolúveis. A avaliação da estabilidade à torra e da composição de diterpenos em grãos de café defeituosos é importante para verificar a possibilidade de emprego de caveol e cafestol como discriminadores de espécies em amostras de mercado, onde o nível de defeitos e torra não são conhecidos. O trabalho objetivou a discriminação de espécies de café arábica e conilon através dos teores de diterpenos. Utilizou-se amostras de café arábica, conilon e misturas com diferentes torras (clara, média e escura) e proporções de defeitos. Para extração, realizou-se saponificação direta, extração com terc-butil metil éter e limpeza com água. Empregou-se CLAE de fase reversa, eluição isocrática (acetonitrila 55% em água) e detecção no UV. Os resultados foram utilizados para estudo da estabilidade dos diterpenos (ANAVAR) e para gerar e validar um modelo preditivo da proporção de café conilon adicionado ao arábica (regressão múltipla). O teor de caveol variou de 661 a 933 mg/100 g nos cafés arábica, e não foi observada sua presença nos conilon. O cafestol variou de 275 a 478 no arábica e de 163 a 275 mg/100 g no conilon. A adição de conilon reduziu o teor de diterpenos, mas o efeito foi diferenciado dependendo do grau de torra e defeitos. O aumento na intensidade de torra não implicou em maior degradação dos diterpenos. Entre os modelos estudados, o que utilizou apenas cafestol como parâmetro de discriminação teve baixo poder preditivo. Ao utilizar o teor de caveol para construção do modelo, obteve-se bom ajuste (R2 = 0,91), que foi melhorado (R2 = 0,93) ao considerar os compostos caveol e cafestol em conjunto. Avaliando as amostras de diferentes torras separadamente, observou-se que os modelos para as torras média e escura tiveram melhor ajuste, interessante uma vez que no Brasil os cafés são comercializados com grau de torra mais intenso. Na validação com amostras externas, o modelo proposto não se mostrou satisfatório, necessitando-se a introdução de mais amostras para aumentar a abrangência e obter um modelo com melhor capacidade preditiva. Verificou-se que não houve diferença nos teores de caveol e cafestol comparando-se grãos defeituosos ou não. Os parâmetros caveol e cafestol mostraram-se promissores como discriminadores das espécies na avaliação de amostras com diferentes graus de defeitos e torra.
Brazil is the major coffee producing and exporting country and the most important species are Coffea arabica and Coffea canephora (robusta). Because of its lower commercial value the robusta coffee is often blended to arabica, but presents inferior quality and acceptability. Visual indicators are eliminated after roasting and grinding, so an alternative method to identification of the species is required. Chromatographic techniques have been used, particularly High Performance Liquid Chromatography (HPLC), due to the versatility and the ability to quantify thermolabile compounds. The diterpenes kahweol and cafestol are reported as potential indexes because they are present in different contents in species and they have thermal stability greater than the majority of the water-soluble compounds. The evaluation of the roasting effect and the composition of diterpenes in defective beans are important in order to use these compounds to discriminate species in commercial coffees, in which the level of defects and roasting degree are unknown. The aim of the work was to discriminate arabica and robusta coffee species by their contents of diterpenes. Samples of arabica and robusta coffees and blends of these species with different roasting degree (light, medium and dark) and levels of defective beans were used. Direct saponification, extraction with tert-Butyl methyl ether and clean up with water were applied for extraction. Reverse-phase HPLC, isocratic elution (55% acetonitrile in water) and UV detection were used. The results were used to study the stability of diterpenes (ANOVA) and to generate and validate a predictive model to estimate the proportion of robusta added to arabica coffee (multiple regression). The content of kahweol varied between 661 and 933 mg/100 g in arabica coffee, but it was not found in robusta. Cafestol ranged from 275 to 478mg in arabica and from 163 to 275 mg/100 g in robusta coffee. The addition of robusta coffee reduced the diterpenes content. However the effect was differently depending on the roasting degree and level of defects. The degradation of diterpenes did not increase with the increasing severity of roast. The model which used cafestol as a single variable had low predictive power. The used of the content of kahweol in the model allowed a good fit (R2 = 0.91), which was improved (R2 = 0.93) by the combined use of the compounds kahweol and cafestol. Considering samples of each roasting degree independently, it was observed that medium and dark roasting models had better fit. This is interesting because coffees are usually commercialized with darker roast in Brazil. Validation using external samples shows the necessity to add more samples to increase the limits the model and its predictive power. There were no differences between kahweol and cafestol levels comparing defective or regular beans. The parameters kahweol and cafestol showed potential for discrimination of species on samples with different roasting degrees and level of defects.

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Mendes, Luciane Carneiro. "Estudos para determinação das melhores formulações de blends de cafe arabica (C. arabica) com cafe robusta (C. canephora Conilon) para uso no setor de cafes torrados e moido e de cafes expresso." [s.n.], 2005. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/254404.

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Abstract:

Orientador: Hilary Castle de Menezes
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos
Made available in DSpace on 2018-08-05T00:35:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mendes_LucianeCarneiro_D.pdf: 2906438 bytes, checksum: ecefb4e80722a27e338165f61b693999 (MD5) Previous issue date: 2005
Resumo: Este trabalho teve como objetivo principal estudar diversas formulações de blends de café arábica com café robusta através de avaliação sensorial com consumidores, tanto para preparo em filtro de papel como para café espresso. Inicialmente, foi determinada a faixa de grau de torração mais adequada para cada café estudado, através de avaliação sensorial com experts e com equipe treinada para Análise Descritiva Quantitativa. Os resultados apontaram uma torração média como a que apresentava maior intensidade de aroma e sabor característicos de café sem a percepção do sabor queimado, caracterizada pela perda de peso de 15 a 16% e pela da luminosidade do grão (L*) entre 37 e 38. A etapa fundamental do trabalho se deu em seguida com a avaliação dos blends (de 10 a 50% de robusta, cereja descascado) mais uma amostra de arábica 100%, preparados em filtro de papel e tipo espresso, através de Teste de Aceitação com consumidores diários de café. Os resultados para ambos os preparos mostraram não haver diferença significativa (ao nível de 5%) na apreciação das amostras por parte dos consumidores. Os resultados do teste sensorial foram complementados por avaliações químicas. Utilizando-se de técnicas de Comatografia líquida de alta eficiência (HPLC), foram analisados os teores de ácidos clorogênicos, ácidos carboxílicos e açúcares dos cafés arábica e robusta (processado via seca ¿ RS, e cereja descascado - RCD), bem como de alguns blends (arábica 80% e robusta CD 20%; arábica 60% e robusta CD 40%). Foram determinados os teores desses componentes nos cafés verdes, após torração e nas bebidas (filtrada e espresso). Os resultados apontaram diferenças entre o café arábica e os robustas para diversos compostos, especialmente no café verde, havendo também algumas diferenças entre os robustas RCD e RS. Os teores dos componentes encontrados nos blends apresentaram comportamento coerente se comparados os resultados com o café arábica e o robusta RCD 100%. Com a torração as diferenças tenderam a diminuir tornando-se ainda menores com a extração da bebida, seja ela em filtro de papel ou tipo espresso. Para finalizar, foi observado o perfil de voláteis das amostras citadas no parágrafo anterior, exceto para o café verde, usando técnica de isolamento do headspace retido em polímero poroso e analisado por Cromatografia Gasosa (CG). Os resultados mostraram diferenças consideráveis nos perfis encontrados para o café arábica e os cafés robusta especialmente nas bebidas. No entanto, pouca diferença foi notada entre os blends e o café arábica. No geral, embora haja considerável diferença entre o café arábica e o café robusta, quando este é adicionado ao café arábica, até proporções de 50% (como mostrado na avaliação sensorial) pouca diferença se nota, tanto química quanto em relação à aceitação sensorial do produto final. Este resultado mostra a viabilidade do uso do café robusta para ambos os preparos de bebidas, em oposição ao preconceito que existe por parte de alguns setores do agronegócio café
Abstract: The main objective of this thesis was to study various blends of arabica and robusta coffees, prepared both by filtration and the espresso technique, by carrying out sensory evaluations with consumers. Initially, for each coffee studied, the most adequate degree of roast was determined using a sensory evaluation by experts and by a panel trained for Quantitative Descriptive Analysis. The results indicated a medium roast as being that presenting greater intensity of characteristic coffee aroma and flavour with no perception of a burnt flavour, characterised by a loss of mass from 15 to 16% and by a bean luminosity (L*) between 37 and 38. The fundamental stage of the work followed with the evaluation of the blends (from 10 to 50% semi-dry processed robusta) plus a 100% arabica sample, prepared both by filtration and by the espresso technique, using an acceptance test with daily coffee consumers. The results for both types of preparation showed no significant difference (at the 5% significance level) in the appreciation of the samples by the consumers. The results of the sensory test were complemented by chemical evaluations. The chlorogenic acid, carboxylic acid and sugar contents of the arabica and robusta (dry processed ¿ RS, semi-dry processed ¿ RCD) coffees, and of some blends (80% arabica + 20% RCD robusta; 60% arabica + 40% RCD robusta) were determined by high performance liquid chromatography (HPLC). The contents of these components were determined in the raw coffees, after roasting and in the brews (filtered and espresso). The results showed differences between the arabica and robusta coffees for various components, especially in the raw coffees, some differences between the RCD and RS robustas also being found. The values found in the blends were coherent considering the values found for the 100% robusta RCD and arabica samples. The differences tended to decrease with roasting and were even smaller in the brews, be the samples prepared by filtration or the espresso technique. To finalise the work, the volatile profiles of the samples cited in the previous paragraph, with the exception of the raw samples, were observed, using a technique of isolation from the headspace by retention in a porous polymer and analysis by gas chromatography (GC). The results showed considerable differences between the profiles of the arabica and robusta coffees, especially in the brews, but little difference was noted between the blends and the arabica coffee. In general, despite considerable differences between the arabica coffee and the robusta coffee, when the latter is added to the former up to 50% (as shown in the sensory evaluation), little difference is detected, either chemically or by the sensory acceptance of the final product. These results show the viability of using robusta coffee in both types of brew preparation, contrary to the prejudiced idea existing in some parts of coffee agro-business
Doutorado
Doutor em Tecnologia de Alimentos

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Dias, Rafael Carlos Eloy. "Discriminação de espécies de café (Coffea arabica e Coffea canephora) em diferentes graus de torra." Universidade Estadual de Londrina. Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Ciência de Alimentos, 2005. http://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls000108937.

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Abstract:

O café é um dos produtos agrícolas de maior importância na economia mundial. Seu cultivo se baseia nas espécies Coffea arabica e Coffea canephora (conilon). A diferença de preço incentiva a adição de conilon, de menor valor comercial e qualidade sensorial, ao arábica. Após a torra e moagem, não é possível a distinção visual das espécies, podendo-se utilizar métodos de caracterização baseados em Análise Estatística Multivariada. Os estudos para diferenciação das espécies trabalham muitas vezes com grãos crus e técnicas onerosas. O trabalho objetivou a diferenciação das espécies de café arábica (Iapar 59) e conilon e misturas (20, 30 e 50 % de conilon) em diferentes graus de torra. Empregou-se análises cromatográficas (CLAE fase reversa, gradiente HAc/MeCN, detecção UV), e espectrofotométricas (reações colorimétricas da matéria insaponificável com KI e HCl). A torra foi padronizada pela perda de peso: 13% para clara, 17% para média e 20% para torra escura. Caracterizou-se as amostras com relação à umidade e cor (L* e H*). A técnica cromatográfica foi padronizada e permitiu a separação e quantificação simultânea de trigonelina, ácido clorogênico (5-ACQ), cafeína e ácido nicotínico, que foi introduzido como um potencial discriminador e teve sua metodologia validada. Após padronização das diluições e comprimento de onda de leitura, constatou-se que a reação com KI com leitura a 620 nm (KI620) foi a mais eficiente para discriminação, permitindo identificar adição de conilon ao arábica acima de 30 %, podendo ser utilizada como método de triagem. Em todos os graus de torra, o café arábica apresentou maiores teores de ácido nicotínico, trigonelina e KI620 (associado ao baixo teor de caveol) e menores valores de L*, H* e cafeína. Cafeína e KI620 foram estáveis a torra, ao contrário de L* e H*. Os teores de trigonelina, ácido nicotínico e 5-ACQ reduziram-se com o aquecimento, constatando-se maior velocidade de degradação no café conilon. No geral, a instabilidade à torra dificultou o emprego de uma variável como discriminadora. Considerando-se cada parâmetro em separado, a menor diferença entre espécies foi observada na torra média, sugerindo que a discriminação seria mais difícil. Em todas as condições estudadas a cafeína foi eficiente para diferenciar espécies e misturas. Ácido nicotínico e trigonelina podem ser aplicados como discriminadores das espécies nas torras clara e escura. O 5-ACQ apresentou comportamento diferenciado: maior concentração poderia estar associada a teor mais elevado tanto de café arábica quanto de conilon, dependendo da torra. Destacou-se neste trabalho a importância de se caracterizar adequadamente o nível de torra para diferenciar as espécies de café, visto que houve interação entre espécies e torra (exceto para cafeína e KI620). A avaliação em conjunto dos dados, por Regressão Multilinear, Análise de Componentes Principais e Análise de Agrupamentos, permitiu determinar a relevância dos parâmetros na caracterização das espécies e torras. L*, H*, a soma das concentrações de ácido nicotínico e trigonelina, e o teor de 5-ACQ ou razão 5-ACQ/cafeína foram eficientes na discriminação do grau de torra. KI620, H*, cafeína e trigonelina foram as variáveis mais importantes na separação das espécies e misturas.
Coffee is one of the most important commodities in the worldwide economy. Its culture is based on Coffea arabica and Coffea canephora (robusta) species. The high commercial value and sensory quality of arabica beans stimulate the addition of conilon. Considering that after roasting and grinding the species cannot be visually distinguish, methods of characterization by Multivariate Statistical Analysis could be applied. Researches for differentiation of the species use green beans and expensive techniques. The aim of this work was to discriminate arabica and robusta coffee species and their blends (20, 30 and 50 % of robusta) roasted at different degrees. Chromatographic (reversed-phase HPLC, gradient elution of HAc/MeCN and UV detection) and spectrophotometrics (colorimetric reactions of the unsaponifiable matter with KI and HCl) methods were used. Roasting process was determinated by weight loss: 13% for light, 17% for medium and 20% for dark roasting. The sample was characterized regarding to moisture and color (L * and H *). The HPLC method was standardized and allowed separation and simultaneous quantification of trigonelline, clorogenic (5-CQA) and nicotinic acids and caffeine. The nicotinic acid was introduced as a potential discriminator therefore its methodology was validate. After standardization of the dilutions and wavelengths detection, it was observed that the KI reaction measures at 620 nm (KI620) was the most efficient for discrimination. The technique identified conilon addition to the arabic above 30% allowing its use as a screening method. Arabica coffee presented higher caffeine, nicotinic acid and trigonelline contents and smaller values of L*, H* and KI620 (associate to the low kahweol levels) in all roast degrees. Caffeine and KI620 were stable under roasting conditions, in contrast to L* and H*. Trigonelline, nicotinic acid and 5-CQA levels were reduced with heating and also showed higher degradation rate on robusta coffee. In general, the instability under roasting process difficulted the use of these variables as discriminators. Considering each parameter independently, the lower difference between species was observed for medium-roasted coffees suggesting that discrimination would be difficulted in this degree of roasting. Caffeine was efficient to differentiate species and blends in all cases. Nicotinic acid and trigonelline can be applied to species characterization under light and medium roasting. The 5-CQA presented differentiate behavior: high level could be associated to a greater content of arabica or robusta coffee, depending on the roasting degree considered. This work emphasized the importance of the appropriated characterization of the roasting degree to differentiate the coffee species, since there was interaction between species and roast (except for caffeine and KI620). The use of Multiple Regression, Principal Components and Cluster Analysis for evaluation of the data set allowed to determine the relevance of the parameters in the characterization of the species and roasts. L*, H*, the sum of nicotinic acid and trigonelline contents like the 5-CQA level or 5-CQA/caffeine ratio can be use as efficient parameters for discriminating roasting degree. KI620, H*, caffeine and trigonelline were the main variables to separate species and blends.

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Fontes, Bárbara Pereira Dantas. "Citogenética, citometria de fluxo e citometria de imagem em Coffea spp." Universidade Federal de Viçosa, 2003. http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/10496.

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Abstract:

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T14:07:48Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 681389 bytes, checksum: 13d59dc39cc9b534b7bc474992b0662b (MD5)
Made available in DSpace on 2017-06-02T14:07:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 681389 bytes, checksum: 13d59dc39cc9b534b7bc474992b0662b (MD5) Previous issue date: 2003-05-06
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Com o objetivo de obter cromossomos morfologicamente adequados para serem caracterizados citogeneticamente e identificados para montagem do cariograma de C. canephora (2n=2x=22), C. arabica (2n=4x=44) e C. eugenioides (2n=2x=22), empregaram-se novas técnicas citogenéticas associadas às metodologias computacionais de análise de imagens. As metodologias utilizadas possibilitaram a obtenção do cariograma das três espécies com cromossomos definidos e resolução adequada para caracterização de cada par de homólogos, aparentemente semelhantes quando obtidos por meio de técnicas convencionais. A análise citogenética revelou que C. canephora possui um par de cromossomos metacêntricos (m) e 10 pares submetacêntricos (sm). Foi observada a presença de satélites no braço curto do cromossomo 6, e o comprimento absoluto de seus cromossomos variou de 1,58 a 3,30 μm. A citometria de fluxo foi usada para estimar a quantidade de DNA (valor 2C), na fase G0/G1, em Coffea. Foram analisadas amostras das espécies de C. canephora (2x), C. eugenioides (2x), C. racemosa (2x) e C. arabica (4x); do Híbrido de Timor, híbrido natural triplóide entre C. arabica e C. canephora (4x); dos supostos híbridos interespecíficos naturais entre C. racemosa e C. arabica, denominados UFV 557; e de plantas resultantes do retrocruzamento entre C. arabica e UFV 557. A diferença na quantidade do conteúdo de DNA entre espécies diplóides foi de até 0,50 pg = 45% (Coffea racemosa 1,11 pg; Coffea eugenioides 1,40 pg e Coffea canephora cv. ‘Robusta’ 1,61 pg). Considerando-se os valores intraespecíficos (Coffea canephora 1,43 a 1,61 pg e Coffea arabica 2,40 a 3,04 pg), estas diferenças foram de 0,18 pg (12,59%) e 0,64 pg (26,67%), respectivamente. A citometria de fluxo também revelou-se uma ferramenta importante no monitoramento e identificação de híbridos interespecíficos de Coffea. A citométria de imagem foi empregada para determinação do índice de densidade óptica de preparações de pontas de raízes esmagadas e coradas com reação de Feulgen. O método prófase/telófase (mensuramento de 10 núcleos em prófase e 10 em telófase por lâmina) foi empregado nesta pesquisa. Assim, valores 4C e 2C, referentes ao núcleos em prófase e telófase, foram estimados, e as razões entre os genomas de Coffea arabica cv. Catuaí Vermelho (2n=44) e Coffea canephora cv. Conillon (2n=22) e entre Coffea arabica cv. Mundo Novo e cv. Catuaí Vermelho puderam ser estabelecidas. As estimativas do índice entre as cultivares obtidas pelo método de citometria de imagem foram comparadas com valores obtidos previamente usando a citometria de fluxo e apresentaram diferenças inferiores a 2,27%.
New cytogenetic techniques together with methods of computer image analyses were utilized to set up the karyogram of C. canephora (2n=2x=22), C. arabica (2n=4x=44), and C. eugenioides (2n=2x=22). Thereby, morphologically appropriate chromosomes were obtained for cytogenetic characterization and identification. These methodologies brought forth a karyogram of the three species with defined chromosomes and a suitable resolution for the characterization of each homologous pair, which, when obtained by conventional techniques, are apparently similar. The cytogenetic analysis indicated that C. canephora owns one metacentric (m) and 10 submetacentric chromosome pairs (sm). Satellites were localized on the short arm of chromosome 6, while the absolute chromosomes length varied between 1,58 and 3,30 μm. Flux cytometry was used to estimate the quantity of the DNA (value 2C) in the G0/G1 phase, for Coffea. Samples of the following species were analyzed: C. canephora (2x), C. eugenioides (2x), C. racemosa (2x), and C. arabica (4x); the Timor Hybrid, natural triploid hybrid of C. arabica and C. canephora (4x); the suspected interspecific natural hybrids of C. racemosa and C. arabica, designated UFV 557; and the backcrosses of C. arabica and UFV 557. The difference in the content quantity of the DNA among the diploid species reached 0,50 pg = 45% (Coffea racemosa 1,11 pg, Coffea eugenioides 1,40 pg, and Coffea canephora cv. ‘Robusta’ 1,61 pg). These differences were 0,18 pg (12,59%) and 0,64 pg (26,67%), respectively, in the intra-species values (Coffea canephora 1,43 to 1,61pg and Coffea arabica 2,40 to 3,04 pg). Flux cytometry proved to be of great usefulness to monitor and identify the interspecific hybrids of Coffea. Picture cytometry was employed in the determination of the optical density index in slide preparations of root tips pressed and dyed by the Feulgen reaction. The prophase/telophase method (measurement of 10 nuclei in prophase and 10 in telophase per slide) was used in this study. The values 4C and 2C of the nuclei in prophase and telophase were estimated, and the genome ratios of Coffea arabica cv. Catuaí Vermelho (2n=44) and Coffea canephora cv. Conillon (2n=22), as well as of Coffea arabica cv. Mundo Novo and cv. Catuaí Vermelho could be established. In a comparison between the estimate indices of the cultivars obtained by the picture cytometry method and the values established previously by flux cytometry, the differences lay below 2,27%.
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Leão, André Pereira. "Caracterização morfoagronômica de acessos de Coffea arabica L." Universidade Federal de Viçosa, 2009. http://locus.ufv.br/handle/123456789/4724.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2150351 bytes, checksum: 54e1125f79ec26c29d8a9a79daac9daa (MD5) Previous issue date: 2009-12-18
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
One hundred accesses from the Coffea spp. germplasm bank of Universidade Federal de Viçosa were evaluated agronomic and morphologically, and separate in groups according to their genetic correlation. 21 descriptors of the IPGRI (International Plant Genetic Resources Institute) were used. After that, statistics analysis were done, indicating, by order, the following characteristics to discard, because of their minor importance to the genetic clustering: number of nodes in the branch, number of nodes in the main stem, color of the fruit, estimative of fruit production, branch length, crown diameter, leaf length, fruit maturation uniformity and stem length until the first node. Also, the descriptors leaf apex shape and leaf shape were discarded because it does not present variation on the evaluated accesses. Therefore, of the initial 21 characteristics, only 10 were kept by the end of the analysis. Using all the 21 descriptors, the 100 accesses were separate in 78 different genetic groups, 67 of it being singular. On the other hand, after discarding the less important variables, the remaining 10 characteristics allowed the formation of 10 genetic groups, only one being singular.
Cem acessos de café pertencentes ao Banco de Germoplasma de Coffea spp. da Universidade Federal de Viçosa foram caracterizados agronômica e morfologicamente, e divididos em grupos de acordo com suas correlações genéticas. Utilizou-se 21 descritores do IPGRI (International Plant Genetic Resources Institute). Após a caracterização procederam-se as análises estatísticas que indicaram, na ordem, as seguintes variáveis para descarte, por serem menos relevantes para o agrupamento genético: número de nós no ramo plageotrópico, número de nós na haste principal, cor de fruto, estimativa comparativa de produção de frutos, comprimento do ramo plageotrópico, diâmetro da copa, comprimento da folha, uniformidade de maturação dos frutos e comprimento do ramo plageotrópico até o primeiro nó. Além disso, os descritores formato da folha e formato do ápice da folha foram descartados por não apresentarem variação nos acessos avaliados. Assim, das 21 características inicias, apenas 10 foram mantidas ao final da análise. Com as 21 características os 100 acessos foram separados em 78 grupos distintos, 67 deles sendo grupos singulares. Em contrapartida, após o descarte das variáveis menos relevantes, as 10 características permitiram a formação de 10 grupos, sendo apenas 1 singular.

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Pinheiro, Hugo Alves. "Physiological and morphological adaptations as associated with drought tolerance in robusta coffee (Coffea canephora Pierre var. kouillou)." Universidade Federal de Viçosa, 2004. http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/10031.

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Abstract:

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-10T16:42:15Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 200775 bytes, checksum: 0663c9ad48e1123c764746a1f7d8e744 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-04-10T16:42:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 200775 bytes, checksum: 0663c9ad48e1123c764746a1f7d8e744 (MD5) Previous issue date: 2004-02-19
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Clones de Coffea canephora Pierre var. kouillou com tolerância diferencial à seca vêm sendo selecionados com base em diferenças de produtividade, em condições de déficit hídrico. Porém, pouco se sabe sobre os mecanismos fisiológicos determinantes de tal tolerância. Objetivou-se, assim, examinar características morfológicas, as respostas estomáticas ao déficit hídrico do solo e da atmosfera, as relações hídricas, a eficiência do uso da água (E A ) e, também, examinar uma possível relação entre tolerância à seca e proteção contra o estresse oxidativo. Para isso, quatro clones (46 e 109A, sensíveis; 14 e 120, tolerantes à seca) foram cultivados em casa de vegetação, em vasos de 120 L, durante oito meses. O déficit hídrico foi imposto via suspensão da irrigação, até que o potencial hídrico na antemanhã (Ψ am ) atingisse –3,0 MPa. Os clones 109A e 120, sob irrigação, apresentaram maior condutância hidráulica entre a raiz e a parte aérea (K L ), maior potencial hídrico ao meio-dia e maior acúmulo de biomassa. Após 14 dias de suspensão da irrigação, Ψ am foi significativamente mais negativo no clone 109A que nos outros clones; sete dias após, Ψ am decresceu para –2,3 MPa nos clones sensíveis à seca, contra –0,8 MPa e –1,7 MPa nos clones 14 e 120, respectivamente. O clone 109A foi o primeiro a atingir –3,0 MPa na antemanhã, seguido pelo clone 46, clone 120 e, por fim, pelo clone 14. Não foi observado ajustamento elástico em nenhum dos clones, enquanto um ajuste osmótico de pequena magnitude foi limitado ao clone 109A, sob condições de seca. A condutância estomática (g s ) foi reduzida fortemente em resposta aos decréscimos em Ψ am e, em menor extensão, aos incrementos no déficit de pressão de vapor entre folha e atmosfera. A sensibilidade estomática à seca, tanto do solo quanto da atmosfera, foi menor no clone 109A e similar entre os demais clones. A composição isotópica do carbono (δ 13 C) aumentou significativamente, sob seca, em todos os clones, sugerindo incrementos em E A ; o clone 109A, entretanto, apresentou valores mais negativos de δ 13 C, independentemente do regime de irrigação. A profundidade do sistema radicular foi substancialmente maior nos clones tolerantes que nos sensíveis à seca. Isso pode explicar, pelo menos em parte, a manutenção de um status hídrico mais favorável nos clones tolerantes. O maior valor médio de K L no clone 120, sob seca, poderia explicar as diferenças de status hídrico entre ele e o clone 14. Em todos os clones, g s , K L e o potencial hídrico recuperaram-se rapidamente após a re-irrigação das plantas sob déficit hídrico; isso, aliado à forte sensibilidade estomática à seca, pode estar associado à resposta notável dessa espécie à irrigação. Independentemente do clone estudado, a seca pouco ou nada afetou o transporte de elétrons, a eficiência fotoquímica do fotossistema II e os coeficientes de extinção fotoquímico e não-fotoquímico. Comparativamente, o clone 120 apresentou maior tolerância de seu aparelho fotossintético ao estresse oxidativo mediado pela seca ou por ação do paraquat, com poucas diferenças observadas entre os demais clones nesse contexto. Sob seca, observaram-se incrementos significativos nas atividades da dismutase do superóxido (clones 109A e 120), peroxidase do ascorbato (clones 14, 46 e 109A), catalase e peroxidase do guaiacol (clones 46 e 109A), e redutase da glutationa (clone 46). As atividades da redutase do monodesidroascorbato e da redutase do desidroascorbato não foram afetadas pelos tratamentos aplicados; as atividades dessas enzimas foram substancialmente menores que a da peroxidase do ascorbato. O déficit hídrico acarretou danos oxidativos apenas no clone 109A. De modo geral, os clones avaliados foram capazes de manter, ou mesmo de aumentar, a atividade de seus sistemas de defesa contra danos oxidativos, mesmo a potenciais hídricos da ordem de –3,5 MPa. Em suma, a combinação de mecanismos que efetivamente restringem a perda d’água, associada a sistemas radiculares profundos, deve ser decisiva para a sobrevivência e, ou, relativa estabilidade da produção dos clones de C. canephora tolerantes à seca, quando cultivados em ambientes sujeitos a secas prolongadas. Atributos como ajustes osmótico e elástico e proteção contra danos oxidativos mediados pela seca teriam uma importância secundária na determinação da tolerância à deficiência hídrica nessa espécie.
Clones of Coffea canephora Pierre var. kouillou with contrasting tolerance to drought stress have been chosen on the basis of their productivities under rainfed conditions. As little is known about physiological mechanisms associated with differences in drought tolerance in those clones, this work aimed to examine morphological traits, stomatal responses to both soil and atmosphere drought, water relations, water-use efficiency (WUE) and, in addition, whether drought tolerance in C. canephora may be linked to protection against oxidative damage. For these purposes, four clones of C. canephora representing drought-tolerant (14 and 120) and drought-sensitive (46 and 109A) genotypes were grown under screen house conditions, in 120 L pots, during eight months. Drought stress was imposed by withholding irrigation until leaf water potential at predawn ( Ψ pd ) reached about –3.0 MPa. Under full irrigation, soil-to-leaf hydraulic conductance (K L ), midday leaf water potential and total biomass were all greater in clones 109A and 120 than in the other clones. After 14 days without irrigation, Ψ pd decreased significantly in clone 109A in comparison with the other clones; seven days latter, Ψ pd dropped to about –2.3 MPa in clones 46 and 109A, against –0.8 MPa in clone 14 and –1.7 MPa in clone 120. Clone 109A attained –3.0 MPa at predawn earlier, followed by clone 46, clone 120, and then clone 14, in this order. Under drought stress, there was no elastic adjustment, while a slight osmotic adjustment was only noted in the clone 109A. Stomatal conductance (g s ) was strongly decreased with decreasing Ψ pd ; it declined modestly with increasing leaf-to-air vapour pressure deficit. Stomatal sensitivity to both soil and atmospheric drought was lower in clone 109A and similar among the other clones. Drought stress led to a significant increase in carbon isotope composition (δ 13 C) for all clones, suggesting an increased WUE; however, absolute values of δ 13 C were lower in clone 109A than in the other clones irrespective of the irrigation treatments. Clones 14 and 120 exhibited deeper root systems than drought-sensitive clones. This at least partially explain their better avoidance to drought as compared with the sensitive clones. On average, the larger K L in clone 120 than in clone 14 might largely explain why the latter was better able to postpone dehydration. For all clones, water potential, g s and K L recovered rapidly following re-watering; these facts, associated with the remarkable stomatal sensitivity to drought, should explain greatly why C. canephora responds strongly to irrigation. Independently of the clone examined, little or no effect of drought on the quantum yield of electron transport, photosystem II photochemical efficiency and photochemical and non-photochemical quenching coefficients was observed. Comparatively, the clone 120 showed a more tolerant photosynthetic apparatus to both drought and paraquat-induced oxidative stress, with no clear distinction among the other clones in this regard. Drought triggered increases in superoxide dismutase (clones 109A and 120), ascorbate peroxidase (clones 14, 46 and 109A), catalase and guaiacol peroxidase (clones 46 and 109A), and glutathione reductase (clone 46). Monodehydroascorbate reductase and dehydroascorbate reductase were not induced in drought-stressed plants; their maximal activities were much lower than that of ascorbate peroxidase, irrespective of the clone investigated. Oxidative damage, however, appeared to be evident only in clone 109A. In general, the clones herein investigated were able to preserve, or even to increase, their antioxidant defences at water potentials as low as –3.5 MPa. The combination of mechanisms that effectively postpone dehydration, associated with deep root systems, should contribute to survival and/or stability of crop yield of drought-tolerant clones in regions with unpredictable precipitation. Attributes such as osmotic and elastic adjustments and protection against oxidative damage induced by drought should be of minor importance to drought tolerance in this specie.
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Mori, André Luiz Buzzo. "Composição e perfil sensorial de Coffea canephora." Universidade Estadual de Londrina. Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Ciência de Alimentos, 2016. http://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls000210036.

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Abstract:

A espécie Coffea canephora é empregada em blends de cafés torrado e moído e na fabricação de cafés solúveis. Somente recentemente a cultura de C. canephora tem sido mais valorizada, e cultivares melhores adaptadas tem sido indicadas para regiões produtoras específicas. O objetivo do trabalho foi caracterizar cultivares de cafés C. canephora, com diversidade genética, com relação à composição e perfil sensorial. Foram estudados três cultivares clonais - Diamante ES8112, ES8122 'Jequitibá' e Centenária ES8132 - que apresentavam diferentes épocas de maturação de frutos (precoce, intermediária e tardia, respectivamente) cultivadas nas fazendas experimentais de Bananal do Norte e de Marilândia, estado do Espírito Santo, maior produtor nacional da espécie. Foram avaliados teores de diterpenos no café torrado, e teores de compostos bioativos e/ou de interesse para a qualidade de bebida (trigonelina, cafeína, ácidos clorogênicos totais, açúcares e melanoidinas), acidez e atividade antioxidante (AA) em bebidas de café torrado. O estudo da composição foi feito com trinta amostras (3 cultivares, 5 genótipos por cultivar, 2 locais de cultivo). As bebidas foram ainda estudadas quanto ao perfil sensorial, sendo selecionadas 9 amostras (3 cultivares, 3 genótipos por cultivar, com blend dos dois locais de cultivo). Observou-se efeito significativo do genótipo e interação entre genótipo e local de cultivo para todos os compostos estudados no café torrado e nas bebidas das três cultivares. Foram observados teores mais altos de 16-Ometilcafestol para os cafés cultivados em Bananal do Norte, enquanto que maiores teores de trigonelina e carboidratos livres totais e maiores valores de acidez total titulável foram encontrados nas bebidas dos genótipos cultivados em Marilândia. A época de maturação dos frutos não afetou o teor dos diterpenos e teve pouco impacto na composição química da bebida sendo a variação entre os genótipos de uma mesma cultivar mais relevante. O perfil de diterpenos dos genótipos estudados reforçou a ampla variação nos teores de caveol e cafestol descrita na literatura, e mostrou uma alta variabilidade para 16-O-metilcafestol. O cafestol representou a maior fração dos diterpenos no C. canephora e o caveol esteve ausente na maioria dos genótipos estudados. As bebidas das três cultivares apresentam expressiva AA, associada aos teores de cafeína, trigonelina, ácidos clorogênicos totais e melanoidinas. Destaca-se a uniformidade nos teores de frutose e a grande variabilidade observada para sacarose, bem como ausência deste carboidrato em 60% das bebidas. Os parâmetros amargor, forte, encorpado, adstringência e sabor residual característico de café foram os mais relevantes na caracterização das bebidas de C. canephora das cultivares estudadas. O parâmetro de acidez se destacou pelo impacto na qualidade global da bebida. As cultivares estudadas apresentam bom potencial com classificação de bebida na faixa de tradicional, mas próxima a superior. A utilização das cultivares Diamante, Jequitibá e Centenária, com diferentes épocas de maturação de frutos, mas que possuem características de composição e perfil sensorial de bebida similar, permite a produção de C. canephora com boa qualidade de bebida e expressiva AA em um período maior do ano.
Coffea canephora species is used in blends of roasted and ground coffee and in the production of instant coffee. Only recently the C. canephora crop has been most valued and well-adapted cultivars have been recommended for planting in specific growing regions. The aim of this study was to characterize C. canephora coffees, with different genetic blackground, regarding the composition and sensory profile. Three clonal cultivars were studied - Diamante ES8112, ES8122 'Jequitibá' and Centenária ES8132. These cultivars presented different fruit-ripening seasons (early, medium and late, respectively) and they were grown in two experimental farm, Bananal do Norte and Marilândia in Espírito Santo state, the main C. canephora producer in Brazil. Diterpenes contents were evaluated in the roasted coffee. The contents of compounds with bioactive action and/or importance in cup quality (trigonelline, caffeine, total chlorogenic acids, sugars and melanoidins), acidity and antioxidant activity (AA) were evaluated in roasted coffee brew. The study of the composition was done with thirty samples (3 cultivars, 5 genotypes for cultivar, 2 growing sites). The sensory profile of 9 select coffee brews (3 cultivars, 3 genotypes for cultivar, with blend of two growing site) were also evaluated. A significant difference among genotypes and an interaction between genotypes and growing site was observed for all compounds studied in roasted coffee and coffee brew of the three cultivars. Higher contents of 16-O-methylcafestol were observed for the coffees grown in Bananal do Norte. Higher contents of trigoneline and total free carbohydrates and higher titratable acidity values were observed for coffee brews from Marilandia. The diterpenes content of the coffees and the chemical composition of the brews were less affected by the fruit-ripening seasons of the cultivars compared to effect of the genetic (differences among genotypes). The diterpenes profile of C. canephora genotypes studied here reinforces the wide variation of kahweol and cafestol contents described in the literature and shows a high variability for 16-O-methylcafestol content. Cafestol represents the largest fraction of diterpenes in C. canephora, and the kahweol was absent in most genotypes studied. The coffee brews of the three cultivars present high AA, associated with contents of caffeine, trigoneline, total chlorogenic acids and melanoidins. Stand outs the uniformity in the fructose content and the high variability observed for sucrose and absence of this carbohydrate in 60% of coffee brews. The terms bitterness, strong, body, astringency and coffee characteristic aftertaste were the most relevant parameters in the characterization of the C. canephora brews of the cultivars studied. The acidity parameter is highlighted by the impact on the overall brew quality. The cultivars have good potential and were classified as a tradicional brew, near the superior classification. The use of cultivars Diamante, Jequitibá and Centenária - with different fruit-ripening seasons, but with similar composition and sensory brew- allow the production of a C. canephora with good cup quality and high AA over a longer period of the year.

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MARTINS, L. D. "Implicações das alterações ambientais em Coffea spp." Universidade Federal do Espírito Santo, 2015. http://repositorio.ufes.br/handle/10/4898.

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Made available in DSpace on 2016-08-29T15:36:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8857_Lima Deleon Martins.pdf: 5003018 bytes, checksum: 6024d9e3d40945e8d8055d202cb4b9e9 (MD5) Previous issue date: 2015-11-13
O objetivo central foi estudar as implicações das alterações ambientais em Coffea spp. O primeiro capítulo apresentou um âmbito geral sobre o potencial impacto das mudanças climáticas sobre o desenvolvimento do cafeeiro, com foco nas implicações do dióxido de carbono (CO2) e da temperatura do ar. O segundo, resultou do ensaio que objetivou submeter plantas de dois genótipos de Coffea arabica e um de C. canephora, em vasos, sob condições controladas de irradiância (800 µmol m-2s-1), umidade relativa (75%) a duas condições de [CO2] (380 ou 700 µL CO2 L-1) durante aproximadamente um ano, sem restrições de água, nutrientes ou de desenvolvimento radicular. Os resultados apontaram que em todos os genótipos, a alta [CO2] promoveu tendências opostas para densidade e tamanho dos estômatos, que diminuíram e aumentaram, respectivamente. Independentemente do genótipo ou da [CO2], a taxa de assimilação líquida de CO2 aumentou (34-49%) quando medida a 700 em comparação a 380 µL de CO2 L-1. Este resultado, juntamente com a condutância estomática quase inalterados, levou a um aumento de eficiência do uso da água instantânea. Os resultados também mostraram um reforço de componentes fotossintéticos (e respiratório), ou seja, do transporte de elétrons nos tilacóide e das atividades de enzimas, o que pode ter contribuído para a melhoria nas taxas máximas de transporte de elétrons, na carboxilação e na capacidade fotossintética sob elevada [CO2], embora estas respostas tenham sido independes dos genótipos. A eficiência do fotossistema II, energia dirigida aos eventos fotoquímicos, carboidratos nãoestruturais, pigmento fotossintético e permeabilidade da membrana não respondeu ao aumento da [CO2]. Apesar de algumas diferenças entre os genótipos, não há respostas claras em relação ao comportamento dos genótipos a elevada [CO2]. No geral, como nenhum sinal aparente de regulação negativa fotossintética (down-regulation) foi encontrado, os resultados sugerem que plantas de Coffea spp. podem suportar com sucesso a alta [CO2], sob as atuais condições experimentais. O terceiro capítulo, pretendeu proporcionar um primeiro vislumbre sobre o efeito do impacto combinado da elavada [CO2] e da alta temperatura sobre o conteúdo mineral e equilíbrio em plantas de Coffea spp.. Foram cultivados, em vasos, dois genótipos de Coffea arabica (cv. Icatu e IPR 108) e um de C. canephora (cv. Conilon Clone 153) em 380 ou 700 µL de CO2 L-1, por um ano, após foram expostas a um aumento gradual da temperatura de 25/20°C (dia/noite) até 42/34 °C, ao longo de 8 semanas. Na temperatura de controle, plantas crescidas em 700 µL de CO2 L-1 apresentaram um efeito de diluição moderada (entre 7% e 25%) no clone 153 (para N, Mg, Ca, Fe) e em Icatu (para N, K e Fe), mas não em IPR 108 (exceto para Fe) quando comparada com plantas crescidas a 380 µL de CO2 L-1, nesta mesma condição, com o aumento da temperatura houve uma diminuição dos teores nutricionais. Apesar das mudanças promovidas pela [CO2] e temperatura, a grande maioria das relações minerais forammantidas dentro de uma faixa consideravelmente adequada, o que sugere que esta planta pode se manter estável em relação ao balanço mineral em um contexto de mudanças climáticas. O quarto capítulo, apresenta uma análise de variáveis climáticas históricas de forma espacial e temporal para caracterização da vulnerabilidade climática de microrregiões na busca de estratégias de mitigação e adaptação que possam subsidiar a melhoria dos sistemas de produção de plantas de café conilon, sendo considerado o Estado do Espírito Santo, Brasil, como estudo de caso. Os resultados indicam que a vulnerabilidade em áreas de cultivo de café robusta está ligada a alta temperatura do ar, ao baixo índice de precipitação pluvial, a sazonalidade da precipitação pluvial e ao déficit hídrico. As estratégias de adaptação e mitigação de maior potencial apontam para o plantio de clones melhorados de café robusta, para a utilização de sistemas de policultivos, arborizados e sombreados, para o adensamento de plantas de café conilon, para implantação de sistemas de irrigação e para a utilização de manejo de plantas espontâneas.

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Silva, Clovis Oliveira. "Formação e deposição da parede celular em sementes de cafe durante o desenvolvimento da semente." [s.n.], 2006. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/317727.

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Orientador: Marcos Silveira Buckeridge
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-08-07T20:11:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Silva_ClovisOliveira_D.pdf: 20554186 bytes, checksum: aa882a38d30a8d939c085c5dfd50f5db (MD5) Previous issue date: 2006
Resumo: No presente trabalho são efetuadas comparações entre a composição dos polissacarídeos de parede celular de grãos verdes de café colhidos de variedades diferentes de Coffea arabica e C. canephoraem que os frutos foram colhidosem umestágio específico de maturação (somente frutos avermelhados) com grãos verdes de cafés denominados conilon e arábica que são diretamente utilizados como matéria prima para a produção de café solúvel. Observou-se que no caso dos grãos colhidos em um estágio específico, as diferenças entre os conteúdos de pectinas e hemicelulosessão mínimas, enquanto para os grãos utilizados na indústria há maior rendimento de polissacarídeos (hemiceluloses) como um todo e há também uma diferença entre conilon e arábica. Umavez que se sabe que esta composição varia ao longo do processo de desenvolvimento do fruto, especula-se que o modo de colheita, que para no café colhido no campo inclui certa parcela de grãos verdes juntamente com frutos maduros, possa influenciar na composição final dos polissacarídeos nas sementes de café
Abstract: In the present work, comparisons. among the composition of cell wall polysaccharides of green coffee seeds were made with material collected from varieties of Coffea arabica and Coffea canephora in which fruits were harvested at the same developmental stage (red fruits) with green coffee beans from two varieties (arabica and conilon) used as raw material for production of soluble coffee. We observed that for seeds collected from red fruits, the differences found between pectins and hemicelluloses were minimal, whereas for the seeds used as raw material for industry conilon and arabica differed. As it is knownthat cell wall composition varies in the seeds during fruit development, it is speculated hat the harvesting mode, which in the field includes green beans along with the red mature fruits, might influence the final composition of the polysaccharides in coffee seeds
Doutorado
Biologia Celular
Doutor em Biologia Celular e Estrutural

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Cabanêz, Paula Alvarez. "Alterações químicas no solo e na água de drenagem decorrentes da aplicação da água residuária do processamento dos frutos do cafeeiro." Universidade Federal do Espírito Santo, 2010. http://repositorio.ufes.br/handle/10/6556.

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Made available in DSpace on 2016-12-23T14:37:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paula Alvarez Cabanez.pdf: 231732 bytes, checksum: 6e2450f53b32469200cf60207690e947 (MD5) Previous issue date: 2010-08-31
A reutilização de resíduos culturais na agricultura é uma alternativa promissora, que permite suster o agroambiente proporcionando melhorias ao sistema solo-planta. Nesse sentido, a água residuária oriunda do processamento dos frutos do café (ARC) pode ser utilizada na agricultura como fertilizante natural, respeitando a concentração dos nutrientes nela contidos. Este trabalho teve como objetivo utilizar dois solos como meio de tratamento da ARC, possibilitando a remoção de material orgânico e inorgânico presentes nesses efluentes. Para isso, fez-se ensaio de colunas de solos, sendo aplicados a eles a ARC. A ARC foi coletada no período de julho e agosto e as amostras de solos foram retiradas em profundidade de 0 a 40 cm, em dois solos classificados como Latossolo Vermelho Amarelo, apresentando texturas diferentes, sendo o solo um de textura média e o solo dois de textura arenosa. Foram coletadas amostras do lixiviado da ARC e foram feitas determinações de pH, condutividade elétrica (CE), demanda química de oxigênio (DQO), P, Ca, Mg e K. Após a percolação da ARC em colunas de solos, as mesmas foram encaminhadas ao laboratório a fim de proceder as determinações de P, K, Ca, Mg, pH, matéria orgânica do solo (MOS), soma de bases, capacidade de troca de cátions (CTC) em pH 7, CTC efetiva e índice de saturação em bases. Foi possível concluir que a ARC contribuiu para a alteração das concentrações de pH e Mg, aumento da CTC em pH 7 e da concentração de K, diminuição do índice de saturação em bases e da concentração de Ca, sendo que as concentrações de P, MOS, CTC efetiva e soma de bases não foram significativamente alteradas pela adição da ARC. Para o solo de textura arenosa, a ARC contribuiu para a alteração do pH e da concentração de K, diminuição da concentração de Ca, MOS, soma de bases e índice de saturação em bases, aumento da CTC em pH 7, sendo que as concentrações de P, Mg e CTC efetiva não foram alteradas significativamente pela adição da ARC. Com relação às águas de drenagem decorrentes da aplicação da ARC em colunas de solo de textura média, pode-se concluir que houve aumento do pH, CE e da concentração de Ca, diminuição da DQO, da concentração de Mg e P, sendo que a concentração de K não foi significativamente alterada. Quanto às águas do lixiviado da ARC nas colunas de solo de textura arenosa, pode-se inferir que houve aumento do pH, da concentração de Ca e Mg, diminuição da CE, DQO e em alguns momentos da concentração de P, sendo que a concentração de K não foi significativamente alterada
Reuse of crop residues in agriculture is a promising alternative, which allows sustain agroenvironment providing improvements to the soil-plant system. This sense, the wastewater coming from the processing of coffee fruits (ARC) can be used as natural fertilizer in agriculture, respecting the concentration of nutrients it contains. This study had as objective use two soils as a means of treatment of ARC, allowing the removal of organic and inorganic material present in these effluents. For this, made to test soil columns, being applied to them the ARC. The ARC was collected during july and august and soil samples were removed in depth from 0 to 40 cm in two soils classified as Yellow Red Latosol, with different textures, being one soil of medium texture and two soil of arenaceous texture. Samples were collected from the leachate of the ARC and were made the measurements of pH, electrical conductivity (EC), chemical oxygen demand (COD), P, Ca, Mg and K. After percolation of the ARC in soil columns, they were directed to the laboratory to proceed the determinations of P, K, Ca, Mg, pH, soil organic matter (SOM), total bases, cation exchange capacity (CEC) at pH 7, effective CEC and base saturation index. It was concluded that the ARC contributed to the change in the levels of pH and Mg, CEC at pH 7 and concentration of K, reduced the base saturation index and Ca concentration, and the concentration of P, SOM, effective CEC and total bases was not significantly altered by the addition of the ARC. For arenaceous soil, the ARC has contributed to the change of pH and concentration of K, reduction in the Ca concentration, SOM, total of bases and base saturation index, increased CEC at pH 7, and the concentrations P, Mg and effective CEC were not significantly altered by the addition of the ARC. With respect the drainage water from the application of ARC in columns of the medium textured soil can conclude that increasing pH, EC and Ca concentration, reduced the COD, the concentration of Mg and P, and the concentration of K was not significantly changed. As the waters of the leachate from the ARC in the columns of arenaceous soil can bein ferred that there was an increase of pH, Ca and Mg concentration, reduced of the EC, COD and at times the P concentration, and the concentration of K was not significantly altered

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Harding, Paul Ernest. "A comparison of the nitrogen requirements of two coffee (Coffea aribica L.) management systems in Papua New Guinea." Thesis, University of Reading, 1994. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.385179.

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Rendón, Mamani Mery Yovana. "Oxidação de lipídios e proteínas no café cru durante o armazenamento e sua relação com a perda da qualidade da bebida." [s.n.], 2012. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/255260.

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Orientador: Neura Bragagnolo
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos
Made available in DSpace on 2018-08-19T19:50:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RendonMamani_MeryYovana_D.pdf: 1061749 bytes, checksum: e4d872dcfdb5e597973a5b13542d1e51 (MD5) Previous issue date: 2012
Resumo: Mudanças na bebida e na cor dos grãos durante o armazenamento do café cru levam à perda do valor no mercado devido, provavelmente, a processos oxidativos nos lipídios. Durante a oxidação dos lipídios há formação de compostos muito reativos, os quais podem reagir com proteínas, ácidos clorogênicos e outros compostos presentes no grão cru. O objetivo do presente trabalho foi avaliar em café natural (CN) e café cereja descascado (CD) da cultivar IPR 98 as alterações nos lipídios, proteínas, ácido 5-cafeoilquínico, viabilidade da semente e na estrutura celular do grão, além das mudanças sensoriais na bebida e na cor do grão, verificando se a perda da qualidade sensorial durante a estocagem por 15 meses está relacionada com processos oxidativos. As modificações nos lipídios foram avaliadas pelo acompanhamento do processo oxidativo mediante análises de substâncias reativas com ácido tiobarbitúrico (TBARS) e no teor de ácidos graxos livres. A fração de ácidos graxos livres foi analisada por cromatografia gasosa após a extração com éter metil-t-butílico e fracionamento por cromatografia de permeação em gel. A oxidação de proteínas foi medida pelo método espectrofotométrico empregando dinitrofenilidrazina para a formação de osazonas. O teor do ácido 5-cafeolquínico foi medido utilizando cromatografia líquida de alta eficiência com detector de arranjo de diodos. A avaliação da viabilidade da semente foi realizada mediante imersão em sal de tetrazólio, e a análise da estrutura celular foi realizada por microscopia eletrônica de transmissão. As mudanças sensoriais avaliadas foram a qualidade global da bebida, a intensidade do sabor café descansado na bebida e a medida da cor nos grãos. No final da estocagem foi observado nos cafés CN e CD aumento do teor de ácidos graxos livres, do valor de TBARS e do número de grupos carbonilas nas proteínas, assim como diminuição do teor de ácido 5-cafeoilquínico e perda total da viabilidade da semente. A qualidade global da bebida aumentou até o nono mês da estocagem para o café CD e diminuiu nos meses seguintes, enquanto que para o café CN aumentou, mantendo-se até o final da estocagem. A intensidade do sabor café descansado aumentou durante todo o tempo da estocagem. Essas mudanças foram acompanhadas pelo branqueamento dos grãos de café. A microscopia revelou mudanças na estrutura celular durante a estocagem. A presença de grupos carbonilas e os valores de TBARS encontrados no inicio da estocagem, além de trabalhos na literatura que relatam o desenvolvimento de estresse oxidativo durante a secagem, levaram a realizar um novo estudo analisando o comportamento de algumas enzimas antioxidantes durante a secagem de outra amostra de café (cultivar Mundo Novo), processado como café natural e café cereja descascado. Nestas amostras foram quantificadas as atividades das enzimas superóxido dismutase (SOD), guaiacol-peroxidase (GOPX) e glutationa redutase (GR), além da quantificação simultânea de peróxido de hidrogênio. Durante a secagem foi observada maior atividade enzimática no café cereja descascado em comparação com o natural, e maior concentração de peróxido de hidrogênio no café natural do que no café cereja descascado. Considerando os resultados obtidos no presente estudo, pode-se concluir que as mudanças sensoriais observadas durante a estocagem são em parte decorrentes de processos oxidativos não enzimáticos, os quais podem ter sido iniciados durante a secagem do grão
Abstract: Changes in beverage and coffee beans color during storage lead to loss of commercial value probably due to the oxidative processes in lipids. Oxidation of lipids lead to formation of reactive compounds which can react with proteins, chlorogenic acids and other compounds present in raw coffee beans. The present study was initiated to determine the relationship between changes in lipids, proteins, 5-caffeoylquinic acid and sensory characteristics; in addition it was evaluated the viability of the beans and the cell structure of the coffee beans processed as natural coffee and pulped natural coffee during the storage for 15 months. Lipid oxidation was evaluated as thiobarbituric acid reactive substance (TBARS) and free fatty acids. Lipids were extrated with tertiary butyl methyl ether, fractionated by gel permeation chromatography and the fraction of free fatty acids analysed by gas chromatography. The protein carbonyl groups were quantified by following the dinitrophenylhydrazine coupling method. The 5-cafeoylquinic acid content was performed using high performance liquid chromatography. The viability of coffee beans was estimated by tetrazolium chloride test and the cellular structure was examined by transmission electron microscopy. The cup quality and rested coffee flavor using an intensity scale were used for the coffee beverage evaluation . The color was expressed in L*, a* and b*. After 15 months of storage the free fatty acids content, the TBARS values and the number of carbonyl groups increased, while the 5-cafeoilquinic acid content decreased and the coffee bean viability was lost. The cup quality increased until the ninth month of storage and declined in subsequent months to pulped natural coffee while the cup quality to natural coffee not declined during the storage. The rested coffee flavor increased during storage, these changes were accompanied by bleaching of the coffee beans. The transmission electron microscopy revealed changes in the cell structure during the storage. The number of carbonyl groups and TBARS values at the beginning of the storage and the literature reporting the possibility of oxidation stress during the drying of the coffee beans led to a new study aiming to analyze the behavior of some antioxidant enzymes in other coffee sample processed as natural coffee and pulped natural coffee during the drying. The activity of superoxide dismutase (SOD), guaicol-peroxidase (GOPX) and glutathione redutase (GR) as well as hydrogen peroxide content were evaluated. Pulped natural coffee showed more enzyme activities and lower hydrogen peroxide concentration than natural coffee. The results suggested that the sensory changes occurrence during the coffee storage are at least partly due to non enzymatic oxidative process initiated during drying of coffee bean
Doutorado
Ciência de Alimentos
Doutor em Ciência de Alimentos

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Greco, Marcelo. "Avaliação de diferentes combinações de tempo de revolvimento, em secador de camada fixa para café." Universidade Estadual do Oeste do Paraná, 2006. http://tede.unioeste.br:8080/tede/handle/tede/1286.

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Made available in DSpace on 2017-07-10T17:37:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcelo Greco.pdf: 571347 bytes, checksum: bbd60db2952ca5a0dde8ac3055608852 (MD5) Previous issue date: 2006-09-27
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
This assignment aimed to value the energetic efficiency on coffee drying (Coffea Arabica, L.), with different combinations of time revolvment on a fix layer dryer. The experiment was developed on July, 2004 in Jesuitas city, Paraná. The dryer was compound of: a drying chamber with a capacity to 4,5 m3 of grains, chamber plenum with volum of 2,9 m3, fan with leakage of 473,2 m3 mim-1, two motors with potency of 2 cv (one for the drive of the fan and another one for the drive of the revolvment system) and mechanical system with shovels, that kept the product in horizontal rotatory revolvment. The grain´s contents of damp were gotten by the standard method of greenhouse 105±1ºC for 24 hours. The sample´s collection was carried out with a collector segmented on four different points of the drying chamber at each two hours. The temperature and the air´s damp were gotten through digital thermhigrometer, installed in a meteorological shelter. The drying air´s temperature was 75ºC. The ventilation and the drying kept it continuous during the test, having as treatment the time´s interval and revolvment of one hour, two hours, three hours and continuous revolvment. It was observed the revolvment with intervals of three hours promoted the smaller energy electric (17,11 kWh) and firewood consume (208,25 kg). The average of the energetic efficiency between the treatments was 12,30 MJ kg--1. for the model of dryers used it is recommended the utilisation of the revolvment system with intervals of three hours and continuous dryer, considering that had not been difference in the final quality of the product in sensorial analysis
O presente trabalho objetivou avaliar a eficiência energética na secagem de café (Coffea arabica, L.), com diferentes combinações de tempo de revolvimento, em secador de camada fixa. O experimento foi desenvolvido no mês de julho de 2004, no município de Jesuítas-PR. O secador foi composto por: câmara de secagem com capacidade para 4,5m³ de grãos, câmara plenum com volume 2,9m³, ventilador com vazão de 473,2m³ mim-1, dois motores com potência de 2cv (um para o acionamento do ventilador e outro para acionamento do sistema de revolvimento) e sistema mecânico com pás, que mantinha o produto em revolvimento rotatório horizontal. Os teores de umidade dos grãos foram obtidos pelo método padrão de estufa 105±1ºC por 24 horas. A coleta de amostras foi realizada com um coletor segmentado em quatro diferentes pontos da câmara de secagem a cada duas horas. A temperatura e umidade do ar foram obtidas mediante o uso de termohigrômetro digital instalado em abrigo meteorológico. A temperatura do ar de secagem foi de 75oC. A ventilação e secagem mantiveram-se contínuas no teste, tendo como tratamentos os intervalos de tempo e revolvimento de: uma hora; duas horas; três horas e revolvimento contínuo. Observou-se que o revolvimento com intervalos de três horas promoveu o menor consumo de energia elétrica (17,11kWh) e de lenha (208,25kg). A média da eficiência energética entre os tratamentos foi de 12,30MJ kg--1. Para o modelo de secador utilizado recomenda-se a utilização do sistema de revolvimento com intervalos de três horas e secagem contínuas, uma vez que não foram observadas diferenças na qualidade final do produto em análise sensorial

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Mendes, Luciane Carneiro. "Otimização do processo de torração do cafe robusta (Coffea canephora Conillon) para formulação de blends com cafe arabica (Coffea arabica)." [s.n.], 1999. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/254393.

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Orientador: Hilary Castle de Menezes
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos
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Resumo: A variabilidade de preços que ocorre no agronegócio de café, ao mesmo tempo que gera problemas com a qualidade dos produtos, abre espaço para um assunto há muito discutido, mas pouco estudado: a utilização do café robusta no setor de cafés torrados e moídos em blends com o café arábica. Porém o preconceito existente com relação ao uso do café robusta nesse setor, devido às suas características organolépticas, cria uma necessidade de se otimizar a torração deste café antes de usá-lo num blend. Com o objetivo de otimizar o processo de torração do café robusta (Coffea canephora Conillon), foi realizado um planejamento fatorial 22 com cinco níveis, resultando em 11 amostras, tendo como variáveis independentes a temperatura interna do tambor do torrador no início do processo e o tempo de torração, cujos máximos e mínimos (-a, +a) foram de 200 a 230°C e 15 a 29 min, respectivamente. As amostras foram submetidas a um teste de aceitação por 25 consumidores e os resultados apontaram as seguintes condições ótimas de torração: tempo variando de 22 a 28 min e temperatura de 225 a 230°C. As notas para aceitação do aroma foram as que determinaram esta faixa ótima e variaram entre 6 e 7 na escala hedônica, indicando que os consumidores gostaram moderadamente do aroma destas amostras. Tais resultados foram confirmados pelo parecer de um provador e classificador profissional de café e ressaltam a neutralidade do café robusta e a viabilidade de sua utilização na formulação de blends com o café arábica sem comprometer o sabor e aroma característicos da bebida, com o objetivo de se reduzir o custo do produto final sem perda de qualidade. A formulação se blends utilizou café robusta e café arábica com classificação de bebida riada. Os resultados da avaliação dos provadores profissionais mostraram que o blend com 20% de café robusta não alterou as características sensoriais da bebida se comparada com a de arábica 100%, recebendo nota 4 (numa escala de 1 a 5, sendo 1 = péssimo e 5 = ótimo). Usando até 50% de robusta no blend as notas e o conceito ficaram acima da média. A torração adequada para ambos os cafés não permitiu a sensação dos sabores medicinais, característicos da bebida riada, no arábica 100% e em nenhum blend. Também foram realizadas determinações físicas, químicas e físicoquímicas (cor instrumental, umidade, sólidos solúveis, pH, acidez total, açúcares redutores e totais e fenólicos totais) para se analisar o comportamento destas em função do grau de torração e da porcentagem de robusta nos blends
Abstract: The variability of prices in the coffee trade leads to problems with product quality, but at the same time opens up some possibilities for a subject long discussed but little studied, that of the use of robusta coffee by the ground roasted coffee sector, in the form of blends with arabica coffee. However, due to a longtime bias against the use of robusta coffee by this sector, due to its organoleptic characteristics, there is a necessity to optimize the roasting process of robusta coffee, before using it in blends. With the objective of optimizing the roasting process of robusta (Coffea canephora Conillon) coffee, a 22 factorial design with five levels was used, resulting in 11 samples, the independent variables being the internal temperature of the drum at the beginning of the process and the roasting time, whose maximum and minimum values (-a, +a) were from 200 to 230°C and from 15 to 29 minutes respectively. A Consumer Acceptance Test using 25 consumers was applied and the results indicated the following ranges as optimal: 22 to 28 min. and 225 to 230°C. the sample scores which determined these optimized ranges varied from 6 to 7 on the 9 point hedonic scale, indicating that the consumers moderately liked these samples. These results agreed with the report of a professional coffee taster and classifier and emphasized the neutrality of robusta coffee and the viability of its use in the formulation of blends with arabica coffee without undermining the flavour and aroma characteristics of the beverage, aiming at reducing costs without loss of quality. In the formulation of the blends, robusta coffee was used together with arabica coffee whose beverage was classified as rioy. The results of the evaluation by professional tasters showed that the blend containing 20% robusta coffee did not alter the sensory characteristics of the beverage when compared with that of the 100% arabica sample, receiving a score of 4 (on a scale from 1 to 5, in which 1= terrible and 5 = optimum). Using up to 50% robusta in the blend, the scores were still above average. By the use of adequate roasting procedures for both types of coffee, the medicinal flavour, characteristic of rioy beverage, was not apparent either in the 100% arabica coffee or in any of the blends. Physical, chemical and physicochemical analyses were also carried out (instumentally measured colour, moisture and soluble solids contents, pH, total acidity, total and reducing sugar contents and total phenolic content) in order to evaluate their behaviour as a function of the degree of roast and of the percent robusta in the blends
Mestrado
Mestre em Tecnologia de Alimentos

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Agnoletti, Bárbara Zani. "Avaliação das propriedades físico-químicas de café arábica (Coffea arabica) e conilon (Coffea canephora) classificados quanto à qualidade da bebida." reponame:Repositório Institucional da UFES, 2015. http://repositorio.ufes.br/handle/10/1556.

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Submitted by Maykon Nascimento (maykon.albani@hotmail.com) on 2015-10-13T20:28:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Avaliação das propriedades fisico-quimicas de café arabica (Coffea arabica) e conilon (Coffea canephora).pdf: 1991648 bytes, checksum: 3bacfbdafce9c475b200092d081b4613 (MD5)
Approved for entry into archive by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2015-11-03T18:45:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Avaliação das propriedades fisico-quimicas de café arabica (Coffea arabica) e conilon (Coffea canephora).pdf: 1991648 bytes, checksum: 3bacfbdafce9c475b200092d081b4613 (MD5)
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CAPES
As espécies de café de maior importância econômica cultivadas no Brasil são Coffea arabica e Coffea canephora. O café cru de ambas as espécies é comercializado e valorizado de acordo com a qualidade dos grãos. A qualidade do produto final depende de vários fatores, tais como: a espécie, a forma de realização da colheita, o beneficiamento do grão, o armazenamento, a torrefação e a moagem. Para determinar a qualidade da bebida do café é realizada a análise sensorial, onde indivíduos treinados provam o café e lhe atribuem uma nota ou classificação. Poucos trabalhos relacionando as propriedades físico-químicas e a qualidade da bebida de café são encontrados na literatura. Neste contexto, o objetivo do presente estudo foi analisar as propriedades físico-químicas de café arábica e conilon, relacionando-as com a qualidade da bebida; verificar as diferenças entre as espécies; além da influência da torra sobre essas propriedades. As propriedades físico-químicas determinadas foram: umidade, perda de massa, cor do café torrado, pH, acidez total titulável, açúcares totais (redutores e não redutores), sólidos solúveis, teor de compostos fenólicos totais, condutividade elétrica, lixiviação de potássio, cafeína, trigonelina e ácido clorogênico. Não foram verificadas diferenças quanto às propriedades físico-químicas, entre os tratamentos (classificações) de cada espécie (arábica e conilon), tanto para as amostras de grãos crus como de grãos torrados, para as variáveis teor de sólidos solúveis, condutividade elétrica, lixiviação de potássio e ácido clorogênico. Foram verificadas diferenças quanto às propriedades físico químicas entre os tratamentos para as variáveis pH, acidez total titulável e açúcares. O teor de compostos fenólicos totais, trigonelina e cafeína, foram as propriedades físico-químicas que melhor discriminaram as duas espécies de café. As propriedades físico-químicas do café são dependentes da torra. Observou-se a diminuição do teor de sólidos solúveis, pH, açúcares, compostos fenólicos totais, ácido clorogênico e trigonelina, após a torra, enquanto que, a acidez titulável total aumentou e a cafeína se manteve estável. Através do teste de correlação de Pearson foram observadas correlações significativas entre as propriedades físico-químicas analisadas com a nota sensorial. Correlações positivas foram verificadas para a umidade e acidez do café torrado, ao passo que, correlações negativas foram verificadas para sólidos solúveis e pH do café torrado, condutividade elétrica e lixiviação de potássio, no café cru.
The species of greatest economic importance of coffee grown in Brazil are Coffea arabica and Coffea canephora. The raw coffee is marketed both species and enhanced according to the quality of the grains. The quality of the final product, depends on several factors, such as the species, the embodiment of the harvest, the grain processing, storage, roasting and grinding. To determine the coffee beverage quality is performed sensory analysis, where trained individuals taste the coffee and give it a score or rating. Few studies relating the physicochemical properties and beverage quality are found in the literature. In this context, the objective of this study was to analyze the physicochemical properties of arabica and conilon coffee, relating them to the quality of the beverage; check the differences between species; beyond the influence of roasting on these properties. They were determined moisture, mass loss, color in roasted coffee, pH, total acidity, total sugars (reducing and non-reducing sugar), soluble solids, total phenolics compounds, electrical conductivity, potassium leaching, caffeine, chlorogenic acids and trigonelline. There were no differences as to the physicochemical properties between treatments (ratings) of each species (arabica and conilon), for both the raw grain samples as roasted beans, for the content soluble solids, electrical conductivity, leaching potassium and chlorogenic acid. Differences were found regarding the physicochemical properties between treatments for pH, titratable acidity and sugars. The content of phenolic compounds, trigonelline and caffeine were the physicochemical properties that best discriminated the two species of coffee. The physicochemical properties of the coffee are dependent on the roasting. There was a decrease in soluble solids, pH, sugars, phenolic compounds, chlorogenic acid and trigonelline, after roasting, while the titratable acidity increased and caffeine remained stable. Through the Pearson correlation test, significant correlations were observed between the physicochemical properties with sensory note. Positive correlations were observed for moisture and acidity of roasted coffee, whereas negative correlations were observed for soluble solids and pH of roasted coffee, electrical conductivity and potassium leaching in raw coffee.

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AGNOLETTI, B. Z. "Avaliação das propriedades físico-químicas de café arábica (Coffea arabica) e conilon (Coffea canephora) classificados quanto à qualidade da bebida." Universidade Federal do Espírito Santo, 2015. http://repositorio.ufes.br/handle/10/4941.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:36:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8653_Resumo da Dissertação - Bárbara Zani Agnoletti.pdf: 5780 bytes, checksum: fd3b0c08ae38d2eb23657deba764a9f6 (MD5) Previous issue date: 2015-08-07
As espécies de café de maior importância econômica cultivadas no Brasil são Coffea arabica e Coffea canephora. O café cru de ambas as espécies é comercializado e valorizado de acordo com a qualidade dos grãos. A qualidade do produto final depende de vários fatores, tais como: a espécie, a forma de realização da colheita, o beneficiamento do grão, o armazenamento, a torrefação e a moagem. Para determinar a qualidade da bebida do café é realizada a análise sensorial, onde indivíduos treinados provam o café e lhe atribuem uma nota ou classificação. Poucos trabalhos relacionando as propriedades físico-químicas e a qualidade da bebida de café são encontrados na literatura. Neste contexto, o objetivo do presente estudo foi analisar as propriedades físico-químicas de café arábica e conilon, relacionando-as com a qualidade da bebida; verificar as diferenças entre as espécies; além da influência da torra sobre essas propriedades. As propriedades físico-químicas determinadas foram: umidade, perda de massa, cor do café torrado, pH, acidez total titulável, açúcares totais (redutores e não redutores), sólidos solúveis, teor de compostos fenólicos totais, condutividade elétrica, lixiviação de potássio, cafeína, trigonelina e ácido clorogênico. Não foram verificadas diferenças quanto às propriedades físico-químicas, entre os tratamentos (classificações) de cada espécie (arábica e conilon), tanto para as amostras de grãos crus como de grãos torrados, para as variáveis teor de sólidos solúveis, condutividade elétrica, lixiviação de potássio e ácido clorogênico. Foram verificadas diferenças quanto às propriedades físico químicas entre os tratamentos para as variáveis pH, acidez total titulável e açúcares. O teor de compostos fenólicos totais, trigonelina e cafeína, foram as propriedades físico-químicas que melhor discriminaram as duas espécies de café. As propriedades físico-químicas do café são dependentes da torra. Observou-se a diminuição do teor de sólidos solúveis, pH, açúcares, compostos fenólicos totais, ácido clorogênico e trigonelina, após a torra, enquanto que, a acidez titulável total aumentou e a cafeína se manteve estável. Através do teste de correlação de Pearson foram observadas correlações significativas entre as propriedades físico-químicas analisadas com a nota sensorial. Correlações positivas foram verificadas para a umidade e acidez do café torrado, ao passo que, correlações negativas foram verificadas para sólidos solúveis e pH do café torrado, condutividade elétrica e lixiviação de potássio, no café cru.

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LOUARN, JACQUES. "La fertilite des hybrides interspecifiques et les relations genomiques entre cafeiers diploides d'origine africaine (genre coffea l. Sous-genre coffea)." Paris 11, 1992. http://www.theses.fr/1992PA112403.

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Abstract:

48 combinaisons interspecifiques entre douze especes de cafeiers diploides africains (2n=22 chromosomes) ont ete realisees. L'etude des relations meiose-fertilite chez les hybrides f1 diploides et les amphiploides montre la parente des genomes et l'appartenance des especes a un meme complexe. Pour une combinaison interspecifique diploide donnee, la viabilite pollinique et la fertilite femelle sont de meme niveau. Entre combinaisons, toutes les situations sont observees depuis la quasi-sterilite jusqu'a des fertilites analogues a celle des parents. Les differences de fertilite sont liees aux variations de regularite meiotique et a la presence ou non de differences de structures entre genomes. La depression hybride est generalement importante en seconde generation. Compares aux autotetraploides artificiels, les amphiploides ont des meioses plus irregulieres. Trois groupes d'especes recouvrant les distributions geographiques sont mis en evidence sur la base de viabilites polliniques faibles chez les hybrides intergroupes: le groupe ouest (afrique occidentale, centrale et angola); le groupe central (dorsale est-africaine); le groupe est (facade est-africaine). La differenciation entre le groupe ouest et les deux autres groupes fait intervenir des differences de structure. Ces resultats sont pour la plupart originaux. La classification biosystematique qui peut en etre deduite rejoint la classification botanique de chevalier (1942). Des strategies d'amelioration de l'espece cultivee c. Canephora par hybridation interspecifique au niveau diploide sont discutees: seule c. Congensis, semble faire partie de son pool genetique primaire. De nouvelles perspectives de recherche sur les descendances hybrides recombinees sont presentees; elles concernent les limites de la recombinaison entre especes et la cartographie des genomes

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Vidal, Ramon Oliveira. "Avaliação in silico do transcriptoma do café = identificação de SNPs e inferência de mecanismos de regulação da expressão gênica." [s.n.], 2010. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/316769.

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Abstract:

Orientador: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-08-17T09:16:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vidal_RamonOliveira_D.pdf: 10264411 bytes, checksum: 901ef16d061b60c731c663ac6aa548bb (MD5) Previous issue date: 2010
Resumo: O café é uma das culturas mais importantes do mundo, sendo consumido mundialmente e com significativa participação na economia em países em desenvolvimento. Coffea arabica e Coffea canephora são responsáveis por 70% e 30% da produção comercial, respectivamente. Análise citogenética indicou que C. arabica é uma planta alotetraploide autógama formada por uma hibridação (1 milhão de anos atrás) entre os diplóides C. canephora e Coffea eugenioides. C. eugenioides é uma espécie silvestre que cresce em maiores altitudes próximo das bordas de florestas e produz poucas e pequenas sementes com baixo teor de cafeína. Por outro lado, C. canephora é alógama e cresce melhor em terras baixas, é também caracterizada por maior produtividade, maior tolerância a pragas e maior teor de cafeína, mas tem uma bebida considerada de qualidade inferior em comparação com a produzida por C. arabica. Durante a última década, algumas iniciativas de pesquisa têm sido lançadas para produzir dados genômicos e transcritômicos de algumas espécies de café. Esta coleção de ESTs representa uma boa visão do transcriptoma de C. arabica e C. canephora, sendo um importante recurso para análise molecular dessas espécies. Este trabalho teve como objetivo obter mais informações sobre algumas espécies do gênero Coffea, incluindo a estrutura dos genes, análise de expressão e identificação de genes e famílias gênicas que são específicos ou expandidos em café. Além disso, também foi proposto estudar a regulação da expressão gênica nos genes homeólogos da alotetraploide C. arabica. A fim de investigar estes conjuntos de dados de EST foram realizadas duas montagens: (i) a primeira montagem com cada espécie individualmente, com o objetivo de fazer uma análise comparativa entre as C. arabica, C. canephora e outras culturas, e (ii) com as duas espécies de café juntas, permitindo a identificação de SNPs entre C. arabica e C. canephora, e avaliar questões evolutivas em C. arabica. A identificação dos transcritos diferencialmente expressos e novas famílias gênicas foram utilizados como ponto de partida para a correlação de características de desenvolvimento e de perfis de expressão gênica em Coffea sp.. Domínios de proteínas e análises de Gene Ontology sugerem diferenças significativas entre os dados das espécies de café analisadas, principalmente em relação a síntese de açúcares, ligação de proteínas a nucleotídeos, retrotransposons e proteínas de resposta a estresse. A ferramenta OrthoMCL identificou as famílias de proteínas específicas ou predominante de café quando comparado com outras cinco espécies de plantas. Usando as discrepâncias de alta qualidade encontradas em ESTs sobrepostos de C. arabica e C. canephora, os perfis de diversidade de seqüência foram avaliados em ambas as espécies e utilizados para deduzir a contribuição de C. canephora e C. eugenioides na transcrição de C. arabica. A identificação de genes homeologous de C. arabica aos genomas ancestrais permitiu analisar as contribuições de expressão gênica de cada subgenoma. Nós sugerimos que este fenômeno tem uma questão importante na expressão dos genes e fisiologia de Coffea.
Abstract: Coffee is one of the most important crops in the world, being worldwide consumed and having significant participation in under development economies. Coffea arabica and Coffea canephora are responsible for 70% and 30% of commercial production, respectively. Cytogenetic analysis established that C. arabica is an autogamous alotetraploid formed by a recent (1 mya) hybridization between the diploids C. canephora and Coffea eugenioides. C. eugenioides is a wild species which grows in higher altitudes near forest edges, and produces few berries with small beans of low caffeine content. On the other hand, C. canephora is alogamous and grows better in lowlands. It is also characterized by higher productivity, more tolerance to pests, and higher caffeine content, but it has an inferior beverage compared with C. arabica. During the last decade, research initiatives have been launched to produce genomic and transcriptomic data about Coffea spp. This EST collection represents a good overview of C. arabica and C. canephora transcriptome, being appropriate as a resource for Coffea molecular analysis. This work aimed to obtain further information about Coffea spp. gene structure and expression and to identify genes that are specific or expanded in coffee plants. Moreover, it also intended to study the homeologous gene expression regulation in the alotetraploid C. arabica. In order to investigate these data two different EST assemblies were performed: (i) with each species individually, aiming the comparative analysis between the C. arabica, C. canephora and other crops; and (ii) with both coffee species together, allowing the identification of SNPs between C. arabica and one of its direct ancestors C. canephora and the examination of evolutive issues in C. arabica. The identification of differentially expressed transcrip ts and new gene families offered a starting point for the correlation of gene expression profil es and Coffea sp. development traits. Protein domain and Gene Ontology analyzes suggested significant differences between the data of coffee species analyzed, mainly in relation to complex sugar synthases, nucleotide binding proteins, retrotransposons and stress response. OrthoMCL tool identified specific or prevalent coffee protein families when compared with other five plant species. Using the high quality discrepancies, found in overlapped ESTs from C. arabica and C. canephora, sequence diversity profiles were evaluated within both species and used to deduce the transcript contribution of the C. canephora and C. eugenioides ancestors in the C. arabica. The assignment of the C. arabica homeologous genes to the ancestral genomes allowed us to analyze gene expression contributions of each subgenome. We suggest that this phenomenon has an important issue in Coffea gene expression and physiology.
Doutorado
Bioinformatica
Doutor em Genetica e Biologia Molecular

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Santos, Alexandre Rosa dos. "Zoneamento agroclimatológico para a cultura do café conilon (Coffea canephora L.) e arábica (Coffea arabica L.), na bacia do Rio ltapemirim, ES." Universidade Federal de Viçosa, 1999. http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/11401.

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Abstract:

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-20T12:14:39Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 27685777 bytes, checksum: 9849a516323681437d5c135d801a0b14 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-07-20T12:14:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 27685777 bytes, checksum: 9849a516323681437d5c135d801a0b14 (MD5) Previous issue date: 1999-07-12
Com o objetivo de avaliar as áreas aptas, restritas e inaptas para o cultivo do café conilon (Coffea canephora L.) e arábica (Coffea arabica L.), utilizou-se o soltware ldrisi (versão 2.0 para Windows) para o zoneamento agroclimatológico e a análise da influência dos elementos climáticos sobre a produtividade para as duas espécies de café cultivadas na Bacia do Rio Itapemirim, situada no sul do Estado do Espírito Santo. Os resultados mostraram que o café conilon pode ser cultivado em 38,78% da área, podendo apresentar alguma restrição por temperatura, deficiência hídrica e classe de solo; que 7,32% da área total é considerada totalmente apta; e que 53,9% desta área é considerada inapta para o cultivo do café conilon. Os resultados obtidos para o café arábica mostraram que ele pode ser cultivado em 25,02% da área, podendo apresentar alguma restrição por temperatura, deficiência hídrica e classe de solo; que 53,56% da área total e' considerada totalmente apta; e que 21,42% desta área é considerada inapta para o cultivo do café arábica. Os municípios produtores de café conilon que apresentaram maior produtividade estão localizados na região central da bacia, exatamente nas áreas totalmente aptas ou aptas com alguma restrição, e os que apresentaram menor produtividade estão localizados nas áreas mais próximas do litoral, consideradas inaptas por deficiência hídrica ou classe de solo. Da mesma forma, os municípios produtores de café arábica que apresentaram maior produtividade estão localizados nas direções oeste e noroeste da bacia, em áreas aptas ou aptas com alguma restrição; já os municípios que apresentaram menor produtividade estão localizados em áreas de maior elevação, inaptas por temperatura, e nas áreas próximas do litoral, que são inaptas por deficiência hídrica e classe de solo. A diferença ocorrida entre as áreas propícias para o cultivo do café conilon e arábica pode ser explicada pelo fato de a região apresentar o relevo bastante montanhoso, com altitudes elevadas e, consequentemente, temperaturas mais favoráveis para o cultivo do café arábica.
A climatological zoning was established to determine the suitable, restricted and unsuitable areas for Conilon (Coffea canephora L.) and Arabic coffee (Coffea Arabíca L.) tree plantation. A raster geographical information system software was used in order to get the homogeneous climatic areas, and to analyse the influence of the climatic elements on the yield response for two coffee tree species planted at Itapemirim river basin area, in the Southern part of the State of Espirito Santo, Brazil. The results showed that the Conilon coffee can be planted in 38.78% of the basin, but with some restriction due to temperature, soil water deficit and soil type; 7.32% of the total area are considered totally suitable; and 53.9% of the area are unsuitable for Conilon coffee tree plantation. The results obtained for Arabic coffee showed that it can be planted in 25.02% of the area, but with some restriction due to temperature conditions, soil water deficit and soil type; 53.56% of the total area are totally suitable; and 21.42% of the area are unsuitable. The municipal districts that presented larger productivity of Conilon coffee are located in the central region of the Itapemirim river basin, which correspond to areas that are climatically suitable or suitable with some restriction. The areas that presented smaller productivity are located near the coast, which is unsuitable due to soil water deficit and soil type. Moreover, the municipal districts that are producers of Arabic coffee presented larger productivity when located in the west and northwest side of the basin, which are suitable or suitable with some restriction. The districts that presented smaller productivity are located in areas of higher elevation, and they are unsuitable because of low temperature conditions, and in the areas close to the coast, which are unsuitable due to soil water deficit and soil type. The topographic conditions of high altitude showed to be more adequate for Arabic coffee plantation mainly due to more favorable temperature conditions for that coffee.

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Diniz, Inês Isabel Plácido dos Santos. "An innovative integrated approach to characterize coffee resistance mechanisms to Colletotrichum kahawae." Doctoral thesis, ISA, 2018. http://hdl.handle.net/10400.5/15829.

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Abstract:

Doutoramento em Engenharia Agronómica - Instituto Superior de Agronomia - UL
Coffee berry disease, caused by the hemibiotrophic fungus Colletotrichum kahawae, is a major constraint to Arabica coffee production in Africa. Coffee variety Catimor 88, which exhibit field resistance in Kenya, was selected to characterize the resistance to C. kahawae, comparatively to the susceptible variety Caturra. Hypocotyls of both varieties were challenged with C. kahawae (isolate Que2 from Kenya) and samples were collected during infection timecourse, simultaneously for analysis of fungal growth and plant responses (light microscopy), evaluation of enzymatic activities (spectrophotometry, electrophoresis, histochemistry) and gene expression analysis (quantitative real-time PCR). The resistance was characterized by restricted fungal growth associated with the hypersensitive reaction and early accumulation of phenolic-like compounds in the cell walls and cytoplasmic contents. Similar responses were detected in the susceptible variety but in a significantly lower percentage of infection sites. Regarding the genes related to the salicylic acid, jasmonic acid (JA) and ethylene (ET) pathways (phytohormones biosynthesis, reception, and responsiverelated genes), this study suggests the involvement of JA in the resistance while ET seems to be more related with the susceptibility. The expression of genes related to recognition and signaling (RLK, LRR-K, CML, PTL) and cell wall modification genes (PME41, MUR4) was induced in both coffee varieties, at early stages of the infection. However, in the resistant variety, a higher expression of recognition and signaling genes was induced together with the PME41 gene during fungal penetration, and the induction of expression of the Lignin-forming anionic peroxidase-like gene (PER4) was supported by the increase of total peroxidase activity and of an anionic isoform. Peroxidase was localized in the walls and cytoplasmic contents of host cells, at the infection sites. The new data obtained enable to identify potential biomarkers of disease resistance that, once validated, will be useful for marker-assisted selection in coffee breeding programmes
N/A

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Tumusiime, Sylvester. "Self incompatibility in Petunia hybrida and Coffea canephora." Thesis, University of Nottingham, 2006. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.437086.

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Maglio, Cecilia Alzira Ferreira Pinto. "Identificação dos cromossomos paquitenicos de coffea arabica L." [s.n.], 1991. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/315433.

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Abstract:

Orientadores: Neusa Diniz da Cruz, Gil Martins Felippe
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-20T00:54:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maglio_CeciliaAlziraFerreiraPinto_D.pdf: 4771289 bytes, checksum: 10010d7942a9aa832bde967a942cf6f1 (MD5) Previous issue date: 1991
Resumo: Dentro do gênero Coffea L. a espécie de maior importância econômica C. arábica é uma exceção no gênero pois é única espécie poliplóide com n=22 cromossomos e autocompatível, enquanto todas as demais espécies são diplóides e incompatíveis. A herança dissômica em C. arábica e a constatação de pareamento entre cromossomos de plantas di-haplóides dessa espécie e mesmo a facilidade de cruzamento com várias outras espécies do gênero, tem indicado ser a mesma um alopoliplóide de segmento, ou seja, os genomas que fazem parte de seu complemento são considerados bastante semelhantes, apesar do comportamento meiótico ser regular sem a formação de multivalentes. A origem da espécie C. arábica, apesar dos trabalhos realizados sobre o assunto, é ponto de controvérsia e continua a suscitar curiosidade tanto com relação às possíveis espécies ancestrais, como à constituição desta espécie poliplóide, a qual poderia ter surgido através de duas possibilidades a autopoliploidia ou alopoliploidia... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital
Abstract: Coffea arabica L, is all exception in the genus Coffea L, because it is the only species so far analysed to have 2n = 4x = 44 chromosomes and is predominantly autogamous. All the other species are diploid with 2n = 22 chromosomes and are self incompatible. The species C. arabica has been considered a segmental allopoliploid, because it presents : a diploid I ike behaviour, a marginal geographic distribution and a relatively easy crossability with other Coffea species. Di-haploid plants of this species show also some degree of chromosome pairing. The structure and the origin of C. arabica is a point of controversy and many coffee researchers consider this species as a segmentaI allopoliploid. Many diploid species have been suggested as possible parentals. Analysis of somatic metaphases chromosomes show Iittle differences among chromosomes. It is very difficult to identify them individually. In view of this problem, detailed morphological analysis of the pachytene chromosomes of C. arabica was carried out. The pachytene chromomeric patterns revealed that there occurs some structural similarities in about 54% of the 22 bivalentes. Twelve of these 22 pairs of bivalents are similar to each other, two by two, in their chromomeric patterns indicating some degree of structural homology, This fact is supported by two secondary associations observed, one of them involving one nucleolar bivalent. Based on these results and other from the Iiterature, it is suggested that C. arabica has a genetic system controlling chromosome pairing like that of Triticum and other genera.... Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations
Doutorado
Doutor em Ciências Biológicas

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Novaes, Paula. "Rustificação de plantas jovens de Coffea arabica L." Universidade Federal de São Carlos, 2007. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/1922.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:31:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 1456.pdf: 806888 bytes, checksum: c1a017c0d739e9db5205b7784a9e4a47 (MD5) Previous issue date: 2007-06-06
Universidade Federal de Sao Carlos
Young plants of Coffea arabica grafted over C. canephora were submitted to six watering cycles (WC) during 35 days. Each WC was accomplished until net photosynthesis (PN) close to zero or leaf water potential (Ψ) close to -2.0 MPa in Acauã (AC), Mundo- Novo (MN), and Obatã (OB) cultivars. After 2 WC (about 10 days) gs dropped from 0.15 to 0.01 mol m-2 s-1 in all cultivars changing the pattern of leaf gas exchange in subsequent WC. From 3 to 6 WC the cultivars showed high oscillations of water use efficiency or substomatal CO2 concentration (Ci) besides negative PN at the end of WC. After 3 WC, gs increased faster than PN after watering and Ci increased indicating some damage in photosynthetic machinery. It happened strongly in OB, which showed progressive reduction of PN after 3 WC and the lowest values of Ψ (-2.0 MPa) at the end of 6 WC. The survivorships for cultivars were 80% till 3 WC and 70% after 6 WC. The gas exchange pattern alteration could indicate the potential hardening of AC, MN and OB cultivars. After field plantation of hardened and control (without perivous hardening) Mundo-Novo and Obatã cultivars, with 180-days-old, it was observed significant (p<0.05) greater accumulation of leaf, stem and root biomass in hardened in control plants. Stem diameter, height and the number of leaf and branch were also higher (p<0.05) in previous hardened individuals. Greater differences in crown structure and biomass between control and hardened plants were observed mainly after the first period of low water availability (210 days under field conditions). The higher leaf number and leaf area in more branched crowns could carbon assimilation and grain production. For practical proposes, 3 WC before growing under field conditions are sufficient for changing consistently the leaf gas exchange pattern in 3 cultivars studied, keeping photosynthetic machinery free of damage and high survivorship. Previous hardening proportioned less interrupted vegetative development after transplantation under field conditions in both cultivars.
Plantas jovens de Coffea arabica enxertadas sobre C. canephora foram submetidas a 6 ciclos de suspensão de rega (CR) durante 35 dias. Cada CR foi acompanhado até que a fotossíntese líquida (PN) fosse próxima de zero ou até que o potencial hídrico foliar (Ψ) fosse próximo de -2.0 MPa nos cultivares Acauã (AC), Mundo-Novo (MN) e Obatã (OB). Após 2 CR (cerca de 10 dias) os valores médios de condutância estomática (gs) diminuíram de 0,15 para 0,01 mol m-2 s-1 em todos os cultivares, mudando o padrão de trocas gasosas nos subseqüentes CR. De 3 a 6 CR os cultivares apresentaram maiores oscilações da eficiência do uso da água e da concentração substomática de CO2, além de valores negativos de PN ao final dos CR. Após 3 CR ocorreu um aumento proporcionalmente maior em gs do que em PN após rega, com um aumento correspondente de Ci, indicando possíveis danos no aparato fotossintético. Este evento ocorreu de forma mais clara em OB, o qual demonstrou redução progressiva de PN após 3 CR e os menores valores de Ψ (-2,0 MPa) ao final de 6 CR. A sobrevivência dos cultivares foi de 80% em 3 CR e 70% em 6 CR. As alterações dos padrões de trocas gasosas nos cultivares AC, MN e OB podem indicar que os exemplares foram potencialmente rustificados. Após o plantio de MN e OB rustificados e controle (sem prévia rustificação) em campo, com 180 dias de idade, foi observado no tratamento rustificado valores significativamente (p<0,05) maiores do acúmulo de biomassa e do número de componentes estruturais da copa. A rustificação prévia proporcionou maior acumulo de biomassa de folhas, de caule e de raízes que nas plantas controle em ambos os cultivares. O diâmetro do caule, a altura, o número de folhas e o número de ramos também foram significativamente maiores (p<0,05) nos indivíduos previamente rustificados. As maiores diferenças da estrutura da copa e da biomassa acumulada entre plantas controle e rustificadas foram encontradas principalmente após o primeiro período de rezudida disponibilidade hídrica (210 dias em condições de campo). O maior número de folhas e a maior área foliar em copas mais ramificadas podem proporcionar um aumento da assimilação de carbono por planta e maior produção de grãos nas plantas rustificadas. Em termos práticos, 3 CR antes do crescimento em campo são suficientes para mudar consistentemente o padrão de trocas gasosas foliares nos 3 cultivares estudados, mantendo o aparato fotossintético livre de danos e proporcionando maior sobrevivência. A prática de rustificação prévia antes do plantio deve ser adotada nos cultivares estudados, pois o custo é reduzido e o desenvolvimento vegetativo inicial é fortemente favorecido após o transplante sob condições de campo.

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Yuyama, Priscila Mary. "Mapeamento cromossômico em espécies de Coffea L. (Rubiaceae)." UEL. IAPAR. EMBRAPA. Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, 2010. http://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls000159569.

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Abstract:

O gênero Coffea L. (Rubiaceae) possui mais de 100 espécies, nativas das florestas tropicais da África e Madagascar. Coffea arabica L. é a espécie mais importante economicamente, autocompatível e a única tetraplóide do gênero com 2n = 44. As demais espécies são diplóides com 2n = 22 e autoincompatíveis. Estudos moleculares e de hibridação genômica in situ revelaram que as espécies de Coffea apresentam uma elevada similaridade genômica, podendo ser consequência da presença de famílias de DNA repetitivo em comum. Neste sentido, este estudo buscou isolar e caracterizar elementos repetitivos em C. arábica variedade typica para utilizá-los como sondas em experimentos de hibridação in situ (FISH) em outras seis espécies do gênero, como C. canephora, C. eugenioides, C. kapakata, C. liberica var. dewevrei, C. racemosa e C. stenophylla. Foram feitas análises convencionais, de bandamento C-CMA/DAPI e FISH com DNAr 45S e retroelementos. Os resultados mostraram que as espécies possuem cromossomos do tipo meta e submetacêntrico e núcleos do tipo arreticulado a semirreticulado em todas as espécies, mas rico em cromocentros em C. arabica, C. canephora, C. liberica var. dewevrei e C. stenophylla. O bandamento cromossômico mostrou predomínio de bandas terminais e intersticiais com diferenças no tamanho, número, distribuição e composição de bases. Coffea arabica e C. canephora mostraram bandas CMA+ e DAPI+ intersticiais próximas ao centrômero na maioria dos cromossomos, enquanto as outras espécies mostraram poucas bandas. As bandas CMA+ foram encontradas nas regiões terminais, associadas ou não à RON, e intersticiais próximos ao centrômero. As bandas DAPI+ foram encontradas somente nas regiões intersticiais próximos ao centrômero, exceto em C. liberica var. dewevrei e C. racemosa. A FISH com a sonda de DNAr 45S mostrou dois e quatro sítios de hibridação, com exceção de C. arabica, com seis sítios. A partir da DOP-PCR, foram feitos o isolamento e a caracterização de dois retroelementos: i) fragmento da transcriptase reversa de grupo indeterminado com 311 pb (pCa21) e ii) fragmento do retroelemento Ty3-gypsy-like com 775 pb (pCa06). Esses clones foram utilizados como sondas na FISH, mostrando blocos e sinais dispersos na maioria dos cromossomos. Foram observados sinais co-localizados para os dois clones e alguns sinais específicos em determinadas regiões para cada clone, sugerindo que pCa21 e pCa06 sejam elementos diferentes. A distribuição das regiões heterocromáticas, sítios de DNAr 45S e dos retroelementos indicam que as famílias de DNA repetitivo se acumularam de modo independente na formação cariotípica dessas espécies. Apesar da ocorrência elevada desses retroelementos na maioria das espécies de Coffea, eles não foram responsáveis por grandes alterações na organização dos cariótipos. Ao contrário, este estudo mostrou que a elevada similaridade genômica entre estas espécies podem em parte ser explicada pelo ocorrência comum desses retroelementos.
Coffea L. (Rubiaceae) consists of more than 100 species, native of tropical forests of Africa and Madagascar. The most economically important specie is Coffea arabica L, selfcompatible and the only tetraploid with 2n = 44. The other species are diploid with 2n = 22 and self-incompatible. Molecular and genomic in situ hybridization studies revealed the species of Coffea has a high genomic similarity, and this could be due to common families of repetitive DNA. Thus, this study intended to isolate and characterize repetitive elements in C. arabica variety typica to use them as FISH probes in six species: C. canephora, C. eugenioides C. kapakata, C. liberica var. dewevrei, C. racemosa and C. stenophylla. Analysis involved convencional, C-CMA/DAPI banding and FISH with 45S rDNA and retroelements. The results showed meta and submetacentric chromosomes and non-reticulate to semireticulate nuclei in all species, with evident chromocenters in C. arabica, C. canephora, C. liberica var. dewevrei e C. stenophylla. The chromosomal banding showed a predominance of terminal and interstitial bands that differ in size, number, distribution and composition of bases. Coffea arabica and C. canephora showed interstitial CMA and DAPI bands in most chromosomes, while other species showed few bands. CMA bands were found in terminal regions, associated or not with NOR, and interstitial close to the centromere. DAPI bands were found only in the interstitial regions near the centromere, except in C. liberica var. dewevrei and C. racemosa. FISH with 45S rDNA probe showed two and four sites, except C. arabica with six sites. From DOP-PCR products two retroelements were isolated and characterized: i) fragment of reverse transcriptase with indeterminate group of 311 bp (pCa21) and ii) fragment of Ty3-gypsy-like retroelement of 775 bp (pCa06). These clones were used as probes in FISH, showing blocks and dispersed signals in most chromosomes. Co-located signs of two clones and some specific signs in certain regions for each clone indicated that pCa21 and pCa06 are different elements. The distribution of heterochromatic regions, 45S rDNA and retroelements indicate that families of repetitive DNA accumulated independently in the karyotype formation of the group. Despite the high occurrence of these retroelements in most species of Coffea, they were not responsible for major changes in the organization of the karyotypes. Although, this study showed the high similarity genomic among these species could be explained by the common occurrence of these retroelements.

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Fonseca, Aymbiré Francisco Almeida da. "Análises biométricas em café conillon (Coffea canephora Pierre)." Universidade Federal de Viçosa, 1999. http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/10131.

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Abstract:

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-04-24T17:27:26Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 344195 bytes, checksum: f00083004d6f88a28a8884775e1f79ba (MD5)
Made available in DSpace on 2017-04-24T17:27:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 344195 bytes, checksum: f00083004d6f88a28a8884775e1f79ba (MD5) Previous issue date: 1999-05-20
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Este trabalho teve como propósito a obtenção de um conjunto de informações genéticas, capazes de oferecer subsídios importantes para o adequado planejamento e execução de programas de melhoramento genético do café Conillon (Coffea canephora Pierre). Para isso, as seguintes análises biométricas foram realizadas: estimação de parâmetros genéticos e ambientais; correlações fenotípicas, genotípicas e de ambiente; repetibilidade do caráter produção de grãos; análise discriminante para classificação de genótipos; e análise da divergência genética, na qual foram utilizados diversos métodos multivariados. Utilizaram-se dados relativos a um conjunto de características, algumas das quais avaliadas em apenas uma repetição, obtidas a partir de um experimento conduzido em blocos ao acaso, com 80 tratamentos e quatro repetições, a partir do qual foi possível a obtenção das variedades EMCAPA 8111, EMCAPA 8121 e EMCAPA 8131, as primeiras variedades clonais da espécie, obtidas e recomendadas no Brasil. As elevadas estimativas dos coeficientes de determinação genotípicos (H2) para todos os caracteres considerados nesta etapa, bem como a tendência dos valores obtidos nas estimativas das correlações genotípicas em superar, em magnitude, aqueles verificados nas correlações fenotípicas, indicam a predominância dos componentes de variação genéticos em relação aos ambientais. A seleção de indivíduos para o caráter produção de grãos, com base em quatro colheitas, ofereceu uma acurácia, estimada pelo coeficiente de determinação (R2), variando entre 65,32 e 81,59%, dependendo do método de estimação utilizado. A classificação original dos genótipos apresenta grande concordância com aquela obtida através da análise discriminante, com taxa de erro aparente de apenas 6,25%. Os genótipos ES 22, ES 25 e ES 92, pertencentes, respectivamente, às variedades EMCAPA 8111, EMCAPA 8121 e EMCAPA 8131, mostraram-se como os mais divergentes do grupo, sendo os dois primeiros os mais indicados para programas de cruzamentos visando a obtenção de híbridos heteróticos, considerando-se conjuntamente a divergência genética e o desempenho individual destes. Verificou-se a existência de expressiva dissimilaridade genética entre os genótipos componentes de cada variedade clonal estudada, indicando a adequada composição destas, com clones distribuídos em vários grupos dissimilares. Foram discutidas as implicações destas e outras informações no estabelecimento de programas eficazes de melhoramento genético para a espécie.
Biometric analysis in conillon coffee (Coffea canephora Pierre). Adviser : Tocio Sediyama. Committee members: Cosme Damião Cruz and Ney Sussumu Sakiyama. The purpose of this paper is to obtain a set of genetic information, capable of offering important support to adequate planning and carrying out of conillon coffee (Coffea canephora Pierre) breeding programs. Thus , the following biometric analyses were accomplished: genetic and environmental parameter estimations; phenotypic, genotypical and environmental correlations; repeatability of the character grain production; discriminating analysis for genotype classification; and analysis of genetic divergence, in which different multivariated methods were used. Information was used related to a set of traits, some of which submitted to only one repetition, obtained from an experiment arranged in randomized block design, with 80 treatments and 4 repetitions, which made possible to obtain the varieties EMCAPA 8111, EMCAPA 8121 and EMCAPA 8131.These were the first clonal varieties of the species, obtained and recommended in Brazil.The high estimates of the genotypical discriminating coefficient (H2) to all characters considered in this stage, as well as, the tendency of the values obtained in the genotypical correlation estimates, to overcome in magnitude, those verified in the phenotypical correlation, point out the predominance of the components of genetic variation in relation to those of enviromental variation. The selections of individual for the character grain production, based on 4 crops, presented an accuracy, estimated by the determination coefficient (R2), varying from 65.32 to 81.59%, depending on the estimation method used. The original classification of genotypes presents great agreement with that obtained through the discriminating analysis, with an apparent error ratio of only 6.25%. The genotypes ES 22, ES 35 and ES 92, belonging, respectively, to the varieties EMCAPA 8111, EMCAPA 8121 and EMCAPA 8131, showed to be the most divergent in the group,the first two being the most adequate for breeding programs to obtain hetereotic hybrids, also considering, the genetic divergence and their individual performance. Expressive genetic dissimilarity among the genotypic components of each clonal variety studied was observed, indicating their adequate composition, with clones distributed in various dissimilar groups. The implications of this and other information are dicussed related to the establishment of efficient breeding programs for the species.

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Silva, Cyntia Meiry da. "Diversidade genética em Coffea arábica no cerrado brasileiro." Universidade Federal do Espírito Santo, 2015. http://repositorio.ufes.br/handle/10/5124.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:37:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8417_Dissertação Cyntia M. Silva.pdf: 2692985 bytes, checksum: 82cd88364ba63243ff1211e8d4ebf3c8 (MD5) Previous issue date: 2015-02-20
A cafeicultura apresenta importância em vários segmentos, desde social, econômica até o cultural, sendo o Brasil o maior produtor e exportador mundial. O objetivo desse trabalho foi avaliar a taxa de crescimento de 16 genótipos de café arábica (Coffea arabica) no Cerrado brasileiro. O experimento foi implantado em Morrinhos no estado de Goiás, com o espaçamento de 3x1m entre plantas. O delineamento utilizado foi em blocos ao acaso, com quatro repetições, sendo cada unidade experimental constituída de cinco plantas. Os caracteres avaliados foram comprimento dos ramos plagiotrópicos, comprimento dos ramos ortotrópicos, número de nós dos ramos plagiotrópicos e número de nós dos ramos ortotrópicos. As taxas de crescimento vegetativo variaram sazonalmente ao longo do período de avaliação. Ajustou-se o modelo não linear exponencial, sendo a qualidade do ajuste do modelo quantificada pelos Coeficientes de determinação , Coeficiente de determinação ajustado ( ), critério de informação de Akaike (AIC) e o critério de informação Bayesiano (BIC). Concluiu-se que é possível a obtenção de genótipos adaptados as condições climáticas do cerrado brasileiro, com períodos de crescimento maiores condizendo com períodos de chuva e temperatura amenas. Presumidamente, os genótipos Catucaí 2 SL e Catuaí amarelo IAC 62, apresentam características que propiciem futuros estudos de melhoramento visando a adaptação em situações de estresse hídrico uma vez que os mesmos demostraram menores alterações nas taxas de crescimento durante o período seco.
The coffee has importance in several segments, from social, economic to the cultural, and Brazil is the largest producer and exporter. The aim of this study was to evaluate the growth rate of 16 Arábica coffee genotypes (Coffea arabica) in the Brazilian Cerrado. The experiment was established in Morrinhos in Goiás State, with the spacing of 3x1m between plants. The design was a randomized block design with four replications; each experimental unit consists of five plants. Traits recorded length of reproductive branches, length of orthotropic branches, number of nodes of reproductive branches and number of nodes of orthotropic branches. The vegetative growth rates varied seasonally throughout the evaluation period. Set the exponential not linear model, and the quality of the model fit quantified by determining coefficients (R 2 ), adjusted determination coefficient ( ), information Akaike (AIC) and the criterion Bayesian (BIC) information. It was concluded that it is possible to obtain the genotypes adapted climatic conditions of the Brazilian cerrado, with highest growth periods befitting rain and mild temperature. Presumably, the Catucaí 2 SL genotypes and Yellow Catuaí IAC 62, have characteristics that facilitate future studies of breeding for adaptation to water stress situations since they have shown minor variations in growth rates during the dry season.

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Siles, Gutierrez Pablo Dreyer Erwin Vaast Philippe. "Hydrological processes (water use and balance) in a coffee (Coffea arabica L.) monoculture and a coffee plantation shaded by Inga densiflora in Costa Rica." S. l. : S. n, 2007. http://www.scd.uhp-nancy.fr/docnum/SCD_T_2007_0126_SILES-GUTIERREZ.pdf.

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Siles, Gutierrez Pablo. "Hydrological processes (water use and balance) in a coffee (Coffea arabica L.) monoculture and a coffee plantation shaded by Inga densiflora in Costa Rica." Thesis, Nancy 1, 2007. http://www.theses.fr/2007NAN10126/document.

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Abstract:

En zones marginales, les arbres d'ombrage augmentent la production de café arabica en améliorant le microclimat et la fertilité du sol. En zones optimales, ces effets sont plus controversés mais les systèmes agroforestiers (SAF) procurent toujours d'autres services tels que la lutte antiérosive ou la diversification des productions. Le présent travail compare en zone optimale du Costa Rica une monoculture (MC) et un SAF avec Inga densiflora Benth en termes de microclimat, productivité et bilan hydrique. Par rapport à MC, les arbres d'ombrage ont réduit la radiation globale de 40-50%, les températures maximales foliaires du caféier de 6°C en journée et le VPD foliaire, mais augmenté de nuit les minimales foliaires de 0,5°C. Selon l’année, les arbres ont augmenté l'interception de la pluie (12% à 85%) et la transpiration du système (29% à 33%) mais réduit le ruissellement de 50% et le drainage (1% à 14%). Le SAF a augmenté l'interception (13% de la pluie) par rapport à MC (7%) lorsque le LAI total augmentait de plus d'une unité. Les arbres ont réduit l'égouttement, augmenté l'écoulement le long des troncs et ont contribué pour 40-50% à la transpiration du SAF avec des caféiers transpirant moins qu'en MC. L’assèchement profond du sol sous SAF indique une certaine complémentarité avec les arbres utilisant vraisemblablement des ressources en eau non accessibles au caféier. Malgré l'absence de compétition en eau dans ces conditions de site, la production de café a été réduite de 29% en SAF par rapport à MC du fait d’une radiation et floraison réduites. Par contre, la production de biomasse a été multipliée par 3, contribuant au stockage du carbone et à la production d'énergie
Under suboptimal site condition for arabica coffee cultivation the shade trees increase the coffee production due to an enhancement of the microclimate and the soil fertility. Under optimal site conditions, the use of shade are more controversial, nevertheless the agroforestry systems (AFS) provide others services as the reduction of erosion and the diversification of production. The present study compare in optimal site conditions in Costa Rica a coffee monoculture (MC) and AFS with Inga densiflora Benth in terms of microclimate, productivity and water balance. In reference to MC, the shade trees reduced the global radiation between 40% to 50%, the maximal coffee leaf temperature to 6°C, the leaf to air VPD during the day and increased the leaf temperature in 0.5°C during night. According to the year of measurement, the trees increased the rainfall interception (12% to 85%) and the total system transpiration (29% to 33%), at the same time trees reduced the runoff (50%) and the drainage (1% to 14%). The trees reduced the throughfall, increased the stemflow and contributed 40% to 50% to the total transpiration of the AFS reducing the coffee transpiration in the AFS. Furthermore, higher reductions in the AFS compared to MC in soil water in deeper soil layers indicate a complementarity interaction in the use of water between coffee and trees. Despite the absence of water competition under these site conditions, the coffee yield was reduced by 29% in the AFS in comparison to the MC, due to a reduction in the radiation and flowering intensity. In other hand, the total aerial biomass was 3 times in the AFS compared to MC, contributing to carbon sequestration and renewable energy

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Yuyama, Priscila Mary. "Caracterização do transcriptoma de folhas e frutos de Coffea eugenioides e identificação de polimorfismos de acessos de Coffea arabica da Etiópia." Universidade Estadual de Londrina, EMBRAPA, Instituto Agronômico do Paraná, 2014. http://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls000206462.

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Abstract:

O café é uma das principais commodities agrícolas do mundo e o Brasil ocupa a posição de maior produtor e exportador de café mundial. Coffea arabica e C. canephora respondem pela maior parte dessa produção. As espécies do gênero são diplóides, exceto C. arabica, um alotetraplóide formado de uma recente hibridação de duas espécies diplóides, C. canephora e C. eugenioides. C. arabica apresenta uma estreita base genética, principalmente pelas suas características biológicas, recente história evolutiva e origem das espécies cultivadas. O RNA-Seq tem sido utilizado em trabalhos de anotação e identificação de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) em plantas, com obtenção de um grande volume de dados e resultados robustos. Neste trabalho, foram obtidos 98.635.514 reads em Coffea a partir da tecnologia de sequenciamento Illumina. As sequências foram obtidas de folhas e frutos a partir de genótipos selvagens de C. arabica originários da Etiópia, C. arabica cv. Mundo Novo e C. eugenioides. No primeiro trabalho, foi feita a caracterização do transcriptoma de C. eugenioides a partir de 36.935 contigs, obtidos de uma montagem de novo. As sequências foram anotadas baseadas em bancos de dados de proteínas não-redundantes (nr) do GenBank, Swiss-Prot, Gene Ontology (GO), InterproScan, PlantCyc e KEGG. Além disso, 10 contigs com maior expressão em órgãos de folha e fruto de C. eugenioides foram selecionados para validar a sua expressão por qPCR. O segundo trabalho desenvolveu análises de RNA-Seq de todos os genótipos sequenciados. Foi possível identificar 1.410 SNPs potenciais em cinco genótipos de C. arabica a partir de uma referência de novo de C. canephora. Um total de 311 SNPs foram validados em 128 genótipos selvagens de C. arabica e cinco cultivares de C. arabica através do Sequenom MassARRAY. A análise da estrutura da coleção com o programa Strucutre demonstrou quatro sub-populações. Assim, foi desenvolvido um atlas do transcriptoma de C. eugenioides como potencial referência para estudos futuros em Coffea e foram obtidos um grupo de SNPs validados. Esses resultados podem beneficiar o desenvolvimento de estudos de associação genética e auxiliar nos trabalhos de melhoramento de cafeeiros.
Coffee is one of the most important agricultural commodities worldwide and Brazil stands out as the main coffee productor and exporter. Coffea arabica and C. canephora account with the most part of this production. The genus species are diploid, except C. arabica which is an allotetraploid from a recent hybridization of two diploid species or related species, C. canephora and C. eugenioides. C. arabica presents a narrow genetic diversity, mainly due its biological characteristics, recent evolutionary history and origin of cultivated genotypes. RNA-seq has been done in several works of annotation and SNPs identification in plants, with the production of large volume of data and robust results. In this work, we report the generation of a total of 98,635,514 reads in Coffea using Illumina sequencing. Sequences were obtained from leaves and fruits using wild C. arabica genotypes from Ethiopia, C. arabica cv. Mundo Novo and C. eugenioides. The C. eugenioides transcriptome was characterized from 36,935 contigs, obtained of a de novo assembled. Sequences were successfully annotated based on the Genbank non-redundant (Nr), Swiss-Prot, Gene Ontology (GO), InterproScan, PlantCyc and KEGG protein database. Furthermore, 10 highly expressed contigs from leaf and fruit were selected to confirm their expression by qPCR. Second work developed RNA-seq analysis of all genotypes sequenced and it was possible discovered 1,410 potential SNPs in five C. arabica genotypes using a C. canephora reference de novo assembled. They were validated 311 SNPs in 128 wild genotypes and five cultivars of C. arabica on the Sequenom MassARRAY system. Structure analysis of collection demonstrated four sub-populations. Thus, we present an overview of C. eugenioides transcriptome as a potential reference for future studies in Coffea and we obtained a set of SNPs to genotyping. These results may benefit the development of genetic association and support future studies in coffee breeding.

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Aga, Esayas. "Molecular genetic diversity study of forest coffee tree (Coffea arabica L.) populations in Ethiopia : implications for conservation and breeding /." Alnarp : Dept. of Crop Science, Swedish University of Agricultural Sciences, 2005. http://epsilon.slu.se/200579.pdf.

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Muleta, Diriba. "Microbial inputs in coffee (Coffea arabica L.) production systems, southwestern Ethiopia : implications for promotion of biofertilizers and biocontrol agents /." Uppsala : Dept. of Microbiology, Swedish University of Agricultural Sciences, 2007. http://epsilon.slu.se/2007117.pdf.

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Piccino, Sébastien. "Rôle des constituants chimiques du café vert, du terroir et des traitements post-récolte sur la qualité aromatique du "Bourbon Pointu"." Thesis, La Réunion, 2011. http://www.theses.fr/2011LARE0021.

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Abstract:

Cette thèse est consacrée à l’étude du café « Bourbon Pointu », Coffea arabica var. laurina, né d'une mutation spontanée de la variété Bourbon à l’île de La Réunion. Les teneurs moyennes des composés majoritaires non volatils du café vert sont (pourcentage de matière sèche) les suivantes : saccharose (7,1), trigonelline (1,3), caféine (0,75), acide caféoyl-5- quinique (4,7), acide palmitique (5,0), acide linoléique (6,5). L’analyse sensorielle a permis de mettre au point un profil de torréfaction original de courte durée. Parmi les 145 composés volatils extraits des poudres de café torréfié par SPME, cinq sont majoritaires (teneurs moyennes en ppm): acide acétique (34), 2-furaneméthanol (117), 5-méthyl-2-furfural (166), furfural (144), 2-méthylpyrazine (47). Ces cinq composés volatils extraits par SPE se retrouvent dans le café en tasse : acide acétique (23), 2-furaneméthanol (405), 5-méthyl-2-furfural (36), furfural (85), 2-méthylpyrazine (73) avec en plus, la -butyrolactone (97). Le ratio entre la concentration de la molécule et son seuil de perception définit l’Odor Activity Value (OAV). La conversion des concentrations des composés volatils en unités OAV a permis de dégager neuf molécules ayant un impact olfactif important : 2-furfurylthiol (café torréfié), 2-méthylpropanal (chocolat), dodécanal (agrume), 2-éthylhexan-1-ol (agrume), -pinène (boisé, agrume), furfural (boisé, caramel), 2-hydroxy-3-méthylcyclopent-2-én-1-one (érable), hex-2-énal (pomme verte), 2-méthylbut-2-énal (fruité, vert). La détermination de ces OAV a permis de différencier les trois catégories commerciales au niveau olfactif avec la prédominance d’aldéhydes pour les « Grand cru », le phénylacétaldéhyde pour les « Sublime », et les pyrazines pour les « Authentique ». Les conditions géoclimatiques et les transformations post-récoltes influencent de façon non négligeable la composition chimique du café vert et donc les arômes générés lors de la torréfaction et en conséquence, la répartition des cafés dans les trois catégories. L’ensemble de ces résultats fait du «Bourbon Pointu», un café haut de gamme classé parmi les «cafés gourmets»
This thesis is devoted to the study of “Bourbon Pointu” coffee, Coffea arabica var. laurina, born from a spontaneous mutation of the Bourbon variety in Reunion Island. The mean contents of non-volatile main compounds of green coffee are (percentage of dry matter): sucrose (7.1), trigonellin (1.3), caffeine (0.75), cafeoyl-5-quinic acid (1.7), palmitic acid (5.0), linoleic acid (6.5). Sensory analysis allowed to develop an original short time roasting profile. Among the 145 volatiles compounds extracted from roasted coffee powders by SPME, the mean contents of the five major components (ppm) are: acetic acid (34), 2-furanmethanol (117), 5-methyl-2-furfural (166), furfural (144), 2 methylpyrazine (47). These five volatile compounds extracted by SPE are found in the brew coffee: acetic acid (23), 2-furanmethanol (405), 5-methyl-2-furfural (36), furfural (85), 2- methylpyrazine (73) plus -butyrolactone (97). The ratio of molecule content to its perception threshold defines the “Odor Activity Value” (OAV). The conversion of the contents of volatile compounds in units OAV emphasized nine molecules with an important olfactory impact: 2-furfurylthiol (roasted coffee), 2-methylpropanal (chocolate), dodecanal (citrus), 2-ethylhexan-1-ol (citrus),-pinene (woody, citrus), furfural (woody, caramel), 2-hydroxy-3-methylcyclopent-2-en-1-one (maple), hex-2-enal (green apple), 2-methylbut-2- enal (fruity, green). The determination of these OAV differentiated the three commercial categories related to their typical odor due to the predominance of aldehydes for the "Grand cru", phenylacetaldehyde for "Sublime" and pyrazines for "Authentic". Geoclimatic conditions and post-harvest processing have a significant influence on the green coffee composition, on the flavors generated during roasting and thus, on the coffee distribution in the three categories. All these results define the "Bourbon Pointu" as a premium coffee and classify it as a "specialty coffee."

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Cabral, Patrícia Gonçalves Castro. "Diversidade, estrutura populacional e caracterização fisiológica de raças de Hemileia vastatrix." Universidade Federal de Viçosa, 2013. http://locus.ufv.br/handle/123456789/4415.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1548096 bytes, checksum: 8d32f6171c3a663ddec02c659bcb8248 (MD5) Previous issue date: 2013-02-13
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
The fungus Hemileia vastatrix has many physiological races, reflecting in its great genetic diversity. Thirty eight single-pustule isolates of H. vastatrix were characterized in nineteen physiological races. Among them, the races XXIX and XXX were detected for the first time in Brazil. Eleven new physiological races with different combinations of virulence genes, denominated of UFV-Hv-01, UFV-Hv-02, UFV-Hv-03, UFV-Hv-04, UFV-Hv-05, UFV-Hv-06, UFV-Hv-07, UFV-Hv-08, UFV-Hv-09, UFV-Hv-10 and UFV-Hv-11 were also identified. These races do not possess any correspondence with other races of H. vastatrix described in the literature. The genetic structure and diversity of H. vastatrix were analyzed in 115 single-pustule isolates using seven AFLP primers combinations aiming to infer the importance of the host and geographic origin in the genetic structure of the pathogen population. The isolates collected from Coffea arabica, C. canephora, Híbrido de Timor and Icatú derivatives (HDTI) were sampled from five main coffee production Brazilian States. Genotypic diversity in the population of H. vastatrix was low, with 68 patterns AFLP. Genic diversity (h) in the population of H. vastatrix was 0.027 and the random mating possibility was rejected in total population. The lack of correlation between the geographical distance and the genetic similarity (r = -0.024, P = 0.74) suggests the occurrence of urediniospores dispersion to long distances. The genetic differentiation (GST) between H. vastatrix populations defined by host was 0.15 and in the populations defined by States was 0.12. Cluster analysis of AFLP data did not divide the isolates from the same geographical origin and host, neither the same physiological race, although the genetic similarity was above 90%. The molecular analysis of variance revealed that 90% of the genetic distribution occurred between the isolates within the subpopulation. The low level of genetic differentiation in the populations was consistent with the recent introduction of the H. vastatrix in Brazil and the susceptibility of the coffee resistant varieties and derivatives of HDTI to coffee leaf rust. The high level of variation within subpopulations suggests a high evolutionary rate of the pathogen and it may explain the overcoming of resistance of the HDTI derivatives.
O fungo Hemileia vastatrix possui várias raças fisiológicas que refletem consideravelmente na sua diversidade genética. Nesse estudo, trinta e oito isolados monopustulares de H. vastatrix foram caracterizados em dezenove raças fisiológicas, dentre elas, as raças XXIX e XXX, relatadas pela primeira vez no Brasil. Onze novas raças, com diferentes combinações de genes de virulência, denominadas de UFV-Hv-01, UFV-Hv-02, UFV-Hv-03, UFV-Hv-04, UFV-Hv-05, UFV-Hv-06, UFV-Hv-07, UFV-Hv-08, UFV-Hv-09, UFV-Hv-10 e UFV-Hv-11 foram identificadas. Essas raças não possuem correspondência com outras raças de H. vastatrix descritas na literatura. A diversidade e estrutura genética de H. vastatrix foram analisadas em 115 isolados monopustulares, utilizando sete combinações de oligonucleotídeos AFLP, com o objetivo de verificar a influência do hospedeiro e da origem geográfica na estrutura genética da população do patógeno. Os isolados analisados, provenientes de Coffea arabica, C. canephora, derivados de Híbrido de Timor e Icatú (HDTI), foram coletados nos cinco principais Estados produtores de café do Brasil. A população de H. vastatrix apresentou baixo nível de diversidade genotípica, sendo obtidos 68 padrões AFLP. A diversidade gênica (h) na população de H. vastatrix foi de 0,027 e a hipótese de acasalamento ao acaso foi rejeitada na população total. Os isolados não apresentaram correlação entre distância geográfica e similaridade genética (r = -0,024, P = 0,74), indicando a ocorrência de dispersão dos urediniosporos à longas distâncias. A diferenciação genética (GST) entre as populações de H. vastatrix definidas por hospedeiro foi de 0,15 e nas populações definidas por Estado foi de 0,12. A análise de agrupamento dos dados AFLP não revelou a formação de grupos entre os isolados da mesma origem geográfica e hospedeiro, nem entre isolados de uma mesma raça fisiológica, embora a similaridade genética tenha sido superior a 90%. A AMOVA revelou que 90% da distribuição genética do patógeno ocorre entre os isolados dentro da subpopulação. O baixo grau de diferenciação nas populações de H. vastatrix no Brasil é consistente com a sua introdução, relativamente recente, e com a suscetibilidade à ferrugem apresentada pelos cultivares resistentes e derivados de HDTI. A elevada variação dentro das subpopulações sugere uma alta taxa evolutiva do patógeno e pode explicar a suplantação da resistência nos derivados de HDTI.

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CORREIA, R. M. "Perfil Químico do Café Capixaba Conilon & Arábica Por ESI(-)FT-ICR MS e ATR-FTIR: uma Abordagem Quantitativa." Universidade Federal do Espírito Santo, 2016. http://repositorio.ufes.br/handle/10/7358.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2018-08-01T21:58:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_9982_Dissertação_Radigya (1).pdf: 1760976 bytes, checksum: 51ceba8c31d07e4fd2e5e4d40c305358 (MD5) Previous issue date: 2016-03-04
O Brasil é o maior produtor e segundo consumidor mundial de café, sendo o Espírito Santo um dos maiores pólos de produção nacional deste produto. O café é uma fruta de grande importância para o PIB do país e a presença de adulterantes infringe o direito do consumidor, causando-lhe prejuízos e possíveis danos à saúde. Desta maneira, desenvolver um método analítico para determinar possíveis adulterações, agregaria valor de commodity, fortalecendo o crescimento econômico do país. Amostras de café torrados Conilon e Arábica foram analisadas através da técnica de Espectrometria de Massas por Ressonância Ciclotrônica de Íons com Transformada de Fourier (ESI(-)FT-ICR MS) e Espectroscopia na região do infravermelho médio com refletância total atenuada (ATR-FTIR) com o objetivo de desenvolver um método de quantificação de café Conilon em blendas de café Arábica, utilizando modelos de análise de dados uni e multivariados. Para construção do modelo de calibração univariada por ESI(-)FT-ICR MS, foram usadas 10 amostras de café Arábica (Coffea Arábica) adulteradas com diferentes proporções de café Conilon (Coffea Canephora), e 2 amostras puras (0% e 100 wt% de café Conilon) dopadas com um padrão interno de ácido esteárico de concentração 5.10-3 mol.L-1 (m/z 283 e 567). Para a análise de ATR-FTIR foram usadas uma maior variabilidade de adulterações, totalizando 21 amostras de blendas e 2 amostras puras (0% e 100 wt% de café Conilon), a partir dos resultados foi proposto um modelo de regressão por mínimos quadrados parciais (PLS). A partir dos resultados de ESI(-)FT-ICR foi possível identificar as principais espécies químicas presentes nas amostras de cafés, tais como: ácido quínico (m/z 191), ácido cafeoilquínico (m/z 353) e ácido feruloilquínico (m/z 367). O modelo de calibração univariada desenvolvido apresentou boa linearidade (R2 de 0,976) e limites de detecção e de quantificação de 0.2 e 0.3 wt%, respectivamente. O modelo PLS construído com dados ATR-FTIR resultou em um RMSECV de 5.7 wt% e RMSEP de 9.2 wt%, com coeficientes de determinação para validação cruzada e previsão de 0.9635 e 0.9295, respectivamente. Foram encontrados valores de repetibilidade e precisão intermediária de 4 wt% e 5 wt% para ESI(-)FT-ICR MS respectivamente, e 1,7 wt% para ambas as figuras de mérito nas análises de ATR-FTIR.

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Dias, Elaine Silva. "Análise de diversidade e expressão de retrotransposons ativos em espécies de Coffea." São José do Rio Preto, 2015. http://hdl.handle.net/11449/139368.

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Abstract:

Orientador: Claudia Marcia Aparecida Carareto
Orientador: Alexandre de Kochko
Coorientador: Romain Guyot
Banca: Maura Helena Manfrin
Banca: Diana Fernandez
Banca: Gustavo Kuhn
Banca Maria Pilar Garcia Guerreiro
Resumo: A história evolutiva das angiospermas é marcada por rápida e ampla diversificação, cujo background deve-se à ação de numerosos fatores; dentre esses, os elementos de transposição (TEs) têm sido considerados como um dos agentes mais importantes. TEs podem compor grandes porções do genoma de plantas e, dessa forma, desempenhar um papel importante na promoção da diversidade genética. O objetivo deste estudo foi investigar a dinâmica evolutiva de TEs ativos em espécies do gênero Coffea. Uma ampla análise da distribuição e evolução de um retrotransposon com LTR (LTR-RT), o elemento Copia25, foi realizada em genomas de plantas. Copia25 é amplamente distribuído na família Rubiaceae, e, está presente em espécies distantemente relacionadas pertencentes às subclasses Asteridae e Rosidae, e à classe das monocotiledôneas. Em particular, foi observada uma incongruência envolvendo sequências Copia25 de espécies do gênero Musa, uma monocotiledônea, e do gênero Ixora, uma dicotiledônea (Rubiaceae), que seria devido a um evento de transferência horizontal (HT) entre essas espécies ou entre suas linhagens ancestrais. Copia25 apresenta dinâmica evolutiva complexa em angiospermas, cuja história incluiria conservação de sequências, perdas estocásticas e HT. Dez LTR-RTs foram anotados no genoma de C. canephora e tiveram seus perfis insercionais obtidos, usando os métodos de IRAP e REMAP, em genótipos das espécies progenitoras, C. canephora e C. eugenioides, e do alotetraploide, C. arabica. Perdas de inserções teriam ocorrido no alotetraploide, sendo essas mais significativas em cinco das dez famílias investigadas, e observou-se, ainda, a ocorrência de alterações direcionais nos subgenomas, sendo mais frequentes as ocorridas no subgenoma maternal, C. eugenioides. O presente trabalho contribui para o entendimento da evolução dos LTR-RTs nos genomas, da colonização de novos genomas por esses elementos,...
Abstract: The evolutionary history of the angiosperms is characterized by its rapid and broad diversification, whose background is due to the action of numerous factors; among them, the transposable elements (TEs) have been considered as one of the most important agents. TEs might compose large portions of the plant genomes, and play an important role in promoting genetic diversity. The aim of this study was to investigate the evolutionary dynamics of active TEs in the Coffea species. In the first chapter, are presented the results of an extensive analysis of the distribution and evolution in plant genomes of a retrotransposon with LTR (LTR-RT), the Copia25. Copia25 is widely distributed in the Rubiaceae family, and is present in distantly related species belonging to the Rosidae and Asteridae subclasses, and the class of monocotyledons. In particular, it was observed an incongruity involving Copia25 sequences of Musa species, a monocot, and Ixora species, a dicot (Rubiaceae), which could be due to horizontal transfer (HT) between these species or their ancestral lineages. Copia25 has a complex evolutionary dynamics in angiosperms, whose history could include conservation sequences, stochastic loss and HT. Ten LTR-RTs were annotated in C. canephora genome and had their insertional profiles obtained, using IRAP and REMAP methods, in genotypes of the parental species, C. canephora and C. eugenioides, and the allotetraploid, C. arabica. Losses of insertions could have occurred in the allotetraploid, these being more significant in five out of ten families studied, and also was observed the occurrence of directional changes in progenitors subgenomes, being more frequent those occurred in maternal subgenome, C. eugenioides. This study contributes to the understanding of the evolution of LTR-RTs within genomes, the colonization of new genomes for these elements as well as its evolutionary dynamics in a newly originated genome
Doutor

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N'Diaye, Amidou. "Etude de la différenciation génétique de Coffea liberica Hiern : cartographie génétique du croisement interspécifique Coffea liberica X C. Canephora, recherche de QTL." Montpellier, ENSA, 2004. http://www.theses.fr/2004ENSA0022.

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Abstract:

L'espèce Coffea canephora (Robusta), largement cultivée dans plusieurs pays en développement, n'est pas appréciée des consommateurs du fait de son goût amer et de sa forte teneur en caféine. L'effondrement des cours du Robusta sur le marché international fragilise l'économie des pays qui en ont fait leur principal produit d'exportation. Dans le souci de rendre le Robusta plus compétitif, C. Canephora a été croisée avec d'autres espèces de caféiers africains dont C. Liberica Hiern. Cette espèce présente une forte granulométrie et une teneur en caféine relativement faible. De plus, contrairement à C. Canephora, elle fructifie sur du « vieux bois» et les fruits mûrissent de manière groupée. Cela facilite la récolte et permet d'avoir du café de bonne qualité. Dans un premier temps, nous avons essayé de mieux comprendre la distribution de la diversité au sein de l'espèce C. Liberica Hiern. L'étude de différenciation génétique, combinant données morphologiques et marqueurs moléculaires, a mis en évidence deux groupes génétiques (liberica et dewevrei) distincts au sein de Coffea liberica Hiern, avec un niveau de différenciation supérieur à une différenciation intraspécifique. La faible fertilité de leurs hybrides FI corrobore l'idée d'une différenciation génétique suffisamment grande pour les considérer comme des espèces différentes (c. Liberica et C. Dewevrei) avec un flux génique réduit entre elles. Le comportement en croisement a été évalué au travers du croisement interspécifique C. Liberica x C. Canephora. La carte génétique obtenue comprend 84 marqueurs (80 AFLP et 4 ISSR) répartis sur 16 groupes de liaison. Elle a une longueur de 1301,4 cM et couvre 81% du génome. Un tiers des marqueurs cartographiés est affecté par une distorsion de ségrégation et 36% du total (131) des marqueurs générés sont restés génétiquement indépendants (non liés). Cette carte nous a permis de rechercher les régions du génome impliquées dans la variation de caractères quantitatifs discriminants entre les deux espèces. Deux QTL ont été détectés pour la variation de la forme du fruit, dont l'un serait un QTL majeur à effet pléiotropique (ou fortement lié à un autre QTL), impliqué également dans la variation de la forme de la graine. Un autre QTL a été mis en évidence dans la variation de la taille du disque du fruit. Face aux différents problèmes rencontrés dans la construction de la carte LIBxCAN, une méthode de simulation a été mise au point pour l'exploitation des cartes génétiques partielles. Elle a permis de montrer que: i) le taux. De marqueurs indépendants décroît de façon exponentielle avec l'augmentation du nombre de marqueurs analysés en ségrégation, ii) le nombre de groupes de liaison augmente jusqu'à un maximum, puis décroît pour tendre vers le nombre haploïde de chromosomes de l'espèce, iii) la longueur de la carte augmente avec le nombre de marqueurs cartographiés jusqu'à un maximum, selon une fonction logistique. Ces modèles prédictifs permettent d'estimer, à partir d'une carte de liaison partielle, le nombre de marqueurs nécessaires pour obtenir une carte génétique dense et couvrant une certaine proportion du génome. Elles ont également mis en évidence certaines différences entre les croisements interspécifiques
Coffea canephora species (Robusta), grown in a major extent in several developing countries, is not appreciated by consumers because of its bitterness and its high caffeine content. The international drop in prices of Robusta lessen the economy of countries for which, it's the major exportation product. Ln order to improve Robusta quality, interspecific crosses were performed. On C. Canephora, involving African coffee diploid species of which C. Liberica Hiern. This species is of interest in C. Canephora breeding programs for its clustered fruit maturation, high seed weight and low caffeine content. Moreover, C. Liberica yield fruits on "old wood". C. Liberica Hiem genetic differentiation, combining morphological data and molecular markers, showed two distinct genetic groups (liberica and. Dewevrei). The observed differentiation was higher than intraspecific differentiation. Their weak FI hybrids fertility suggests considering them as two different species (C. Liberica and C. Dewevrei) with reduced gene flow. Genetic map of the interspecific cross C. Liberica x C. Canephora consisted of 84 markers (80 AFLP and 4 ISSR) distributed into 16 linkage groups. Its length was 1301. 4 CM equivalent to 81 % of genome coverage. A third of mapped markers showed segregation distortion and 36% of the total (131) markers remained unlinked. QTLs analysis revealed implication of certain map area in discriminate characters variation. Two QTLs were associated to fruit shape variation. One of these QTLs could be a major QTL with pleiotropic effect (or closely linked to another QTL), also involved in seed shape variation. Another QTL was detected for fruit disc diameter. Because of problems in constructing LIBxCAN map, a simulation method was performed for partial genetic map exploitation. It showed that: i) percentage of unlinked markers decreases according to exponential function with analysed markers number, ii) linkage group number increase to a maximum before decreasing toward the species haploid chromosome number, iii) map length increases with additional markers according to logistic function. These prediction models allow markers numbers estimation for a dense map with a given genome coverage. They also pointed out some differences between interspecific genetic map

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Costa, Alves Gabriel Sérgio. "Characterization of a candidate gene for drought tolerance in Coffea : the CcDREB1D gene, in contrasting genotypes of coffea canephora and related species." Thesis, Montpellier, SupAgro, 2015. http://www.theses.fr/2015NSAM0002.

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Abstract:

Après le pétrole, le café est la seconde matière première cotée sur les marchés financiers. Comme pour d'autres grandes cultures, la sécheresse affecte à la fois le développement de la plante, la floraison, la productivité, le développement de fruits et leur qualité. Dans ce contexte, la création de variétés de caféiers tolérantes à la sécheresse est l'une des priorités des instituts de recherche. Chez le caféier, plusieurs gènes candidats pour la tolérance à la sécheresse ont été identifiés. C'est le cas de CcDREB1D dont l'expression augmente à la sécheresse dans les feuilles des clones de Coffea canephora résistants. Les gènes DREBs jouent un rôle clé dans les réponses aux stress abiotiques des végétaux. Sur la base de ces informations, une analyse approfondie de CcDREB1D a été initiée (i) par l'étude de la diversité génétique de ce gène, (ii) en identifiant les membres des sous-familles DREB de caféier et en évaluant des relations phylogénétiques entre CcDREB1D et ses homologues chez d'autres espèces et (iii) en menant une caractérisation fonctionnelle des promoteurs CcDREB1D par transformation génétique de C. arabica. La variabilité des promoteurs et des régions codantes DREB1D a été évaluée chez 38 accessions de Coffea, la plupart caractérisées par différents phénotypes vis-à-vis de la sécheresse. Nos résultats montrent qu'il existe des associations entre la tolérance à la sécheresse et les variations génétiques des promoteurs DREB1D. D'autres analyses ont montré que ces promoteurs ont évolué par réarrangements d'éléments cis-régulateurs qui pourraient influencer l'expression des gènes DREB1D. La récente publication de la séquence du génome de C. canephora, nous a permis d'identifier la famille de gènes DREB de cette espèce composée d'au moins 31 gènes de type DREB. Par comparaison aux autres espèces, aucune amplification spécifique de la famille des gènes DREB n'est observée. Un arbre phylogénétique construit avec les gènes homologues d'autres espèces a permis d'identifier les gènes de caféier des sous-groupes DREB I, II, III et IV, en référence à leur classification préétablie chez Arabidopsis. De plus, CcDREB1D est l'orthologue de C. canephora le plus proche du groupe AtDREB1/CBF mais, en raison d'une duplication récente menant à une sous-fonctionnalisation du groupe DREB1/CBF d'Arabidopsis, aucune inférence de fonction par homologie n'est possible. Ces résultats renforcent la nécessité de mener une caractérisation fonctionnelle des gènes CcDREB1D de caféier.L'étude de la variabilité génétique a révélé une forte diversité nucléique dans les promoteurs des gènes DREB1D de C. canephora. C'est par exemple le cas pour les promoteurs des clones 14 (tolérant) et 22 (sensible) de C. canephora connus pour présenter des profils d'expression différentiels du gène CcDREB1D vis-à-vis de la sécheresse. Afin de réaliser l'analyse fonctionnelle de ces promoteurs, les séquences entières ou tronquées des formes alléliques et homologues des promoteurs CcDREB1D ont été fusionnées avec le gène rapporteur uidA. Les plantes transgéniques de C. arabica contenant ces constructions ont été régénérées. La régulation spatio-temporelle, tissulaire, cellulaire et allèle-spécifique des promoteurs CcDREB1D a été analysée par détection de l'activité enzymatique GUS. En condition de sécheresse, la version pleine longueur du promoteur CcDREB1D permet une activité GUS spécifiquement dans les feuilles et seulement dans l'épiderme, le parenchyme et les cellules de garde. En comparant les différentes constructions, les 700 paires de base les plus en amont des allèles et homologues des promoteurs CcDREB1D se révèlent essentielles pour l'expression feuille-spécifique. Par ailleurs, l'expression allèle-spécifique observée en réponse aux différents traitements (PEG et humidité relative) imitant la sécheresse, montre que les variations nucléiques des formes alléliques CcDREB1D affectent la régulation spatio-temporelle du gène rapporteur uidA
Coffee is the world's second most valuable traded commodity after crude oil. Like in other crops, drought is the key factor affecting plant development, flowering, productivity, fruits development and their quality. In such a context, the generation of drought-tolerant coffee varieties has now turned into one of the priorities of many research institutes. In coffee, several candidate genes for drought tolerance have been identified. This was the case of CcDREB1D that showed increased gene expression upon drought stress mainly in leaves of Coffea canephora drought-tolerant clones. In several plant species, the DREBs genes play a key role in plant responses to abiotic stress. Based on these information, an in depth characterization of CcDREB1D was initiated by (i) studying the genetic diversity present in DREB1D loci, (ii) identifying DREB coffee subfamily members and evaluating phylogenetic relations between CcDREB1D and homologs from other plant species, and (iii) performing a functional characterization of CcDREB1D promoters by homologous genetic transformation of C. arabica. Sequence variability in DREB1D promoter and coding regions was evaluated using 38 Coffea accessions most of them characterized by different phenotypes (tolerance vs. susceptibility) regarding to drought. Our findings show several evidences of association between drought tolerance and the genetic variations on DREB1D promoter region. Further analyses indicated that these promoters are evolving by the rearrangement of cis-regulatory elements, and could influence DREB1D expression. The recent release of the C. canephora genome sequence allowed us to identify the DREB gene family in this species composed of at least 31 canonical DREB genes. Compared to other plants, no specific amplification of the DREB gene family could be noticed. A reconciled phylogenetic tree constructed with homologs from other species allowed us to identify the coffee members of the DREB subgroups I, II, III and IV, in reference to their classification previously established in Arabidopsis. In addition, CcDREB1D is the nearest C. canephora orthologue of AtDREB1/CBF group, but any functional inference could not be done due to a recent duplication that lead to DREB1/CBF group subfunctionalization in Arabidopsis. These results reinforced the necessity of CcDREB1D functional characterization in coffee.The study of genetic variability revealed a major source of nucleic diversity in the promoter region of DREB1D genes from C. canephora, with potential implication in local adaptation to drought tolerance. This is for example the case for the promoters of drought-tolerant clone 14 and drought-sensitive clone 22 of C. canephora known to present different CcDREB1D expression profiles regarding drought. In order to perform the functional analysis of these promoters, full length and truncated version of allelic and homolog forms of CcDREB1D promoters were fused to the uidA reporter gene. Transgenic plants of C. arabica harboring these constructions were regenerated. The spatiotemporal, tissue, cell and allelic-specific regulation of CcDREB1D promoters was analyzed by detecting GUS enzymatic activity. During drought stress, the full-length CcDREB1D promoter drives leaf-specific GUS activity only in epidermic, parenchyma and guard-cells. By comparing the different constructs, the most upstream 700 bp of allelic and homolog CcDREB1D promoters were shown to be necessary for the leaf-specific expression. In addition, allelic-specific expression observed in response to different (PEG and relative humidity) treatments mimicking drought stress showed that nucleic variations present between CcDREB1D promoter allelic forms affect the spatiotemporal regulation of the uidA reporter gene

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MARQUES, João J. P. "Relação entre o processamento de pós-colheita e atributos químicos e sensoriais de café de três locais de Minas Gerais." Universidade José do Rosário Vellano, 2017. http://tede2.unifenas.br:8080/jspui/handle/jspui/189.

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Submitted by Samira Ramos (samira.ramos@unifenas.br) on 2018-04-23T21:22:43Z No. of bitstreams: 1 João Paulo Marques.pdf: 1012005 bytes, checksum: 71d82a764900814bb8c03c30f77accce (MD5)
Made available in DSpace on 2018-04-23T21:22:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 João Paulo Marques.pdf: 1012005 bytes, checksum: 71d82a764900814bb8c03c30f77accce (MD5) Previous issue date: 2017-08-11
Brazilian coffee growers are becoming more and more concerned about the production of high quality coffees, with the purpose of producing special coffees, adding value to the final product. The production of special coffees gains force in the world market pleasing the palate of different consumers. Coffee beans have their intrinsic attributes modified by local characteristics such as altitude, temperature, lightness, rainfall index and relative humidity where the crop is located. Together with the climatic conditions of the place, the method of processing the grains by dry (producing natural coffee), wet (peeled coffees), moist with fermentation (pulped coffee) and wet desmucilador demultipled), confers changes in the quality of the grains produced. The objective of this study was to evaluate the relationship between post-harvest processing and the chemical and sensorial attributes of coffee from three locations in Minas Gerais. The coffees of the different regions presented their own characteristics, which are conferred according to the type of processing to which the grains are submitted in the post-harvest period. The samples of peeled coffees from the three regions studied presented higher scores for the sensorial attributes, compared to samples of natural coffees. The chemical analysis of coffee supports, however does not replace the sensorial analysis aiming at the classification of coffee beverage quality.
Os cafeicultores brasileiros vêm a cada dia mais se preocupando com a produção de cafés com qualidade superior, tendo como propósito a produção de cafés especiais, agregando valor ao produto final. A produção de cafés especiais ganha força no mercado mundial agradando o paladar de diferentes consumidores. Os grãos de café têm os seus atributos intrínsecos modificados pelas características locais como altitude, temperatura, luminosidade, índice pluviométrico e umidade relativa de onde a lavoura se encontra instalada. Juntamente com as condições climáticas do local, o método de processamento dos grãos realizado por via seca (produzindo o café natural), por via úmida (cafés descascados), por via úmida com fermentação (café despolpado) e por via úmida com desmucilador (cafés desmucilados), confere variações na qualidade dos grãos produzidos. Objetivou-se com o presente estudo avaliar a relação entre o processamento de pós-colheita e os atributos químicos e sensoriais de cafés de três locais de Minas Gerais. Os cafés das diferentes regiões apresentaram características próprias, que são conferidas de acordo com o tipo de processamento a que os grãos são submetidos no período de pós-colheita. As amostras de cafés descascados das três regiões estudadas, apresentaram maiores notas para os atributos sensoriais, em relação às amostras de cafés naturais. A análise química do café apoia, entretanto não substitui a análise sensorial visando a classificação da qualidade de bebida do café.

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Mazzafera, Paulo 1961. "Metabolismo de cafeina em especies de cafe (Coffea L.)." [s.n.], 1990. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/315689.

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Orientador : Antonio Celso Novaes de Magalhães
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-14T04:09:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mazzafera_Paulo_D.pdf: 4842310 bytes, checksum: 78f6406fedac0fce92441707f665e304 (MD5) Previous issue date: 1990
Resumo: No presente trabalho estudou-se o metabolismo da cafeína em folhas e, principalmente, no endosperma de sementes de frutos imaturos de vários cafeeiros, de diferentes cultivares pertencentes a diferentes espécies de café. De um total de 23 cafeeiros e de quatro espécies de gêneros afins ( Paracoffea e psilanthus), que tiveram o teor de cafeína determinado em suas folhas e no endosperma de frutos maduros, foram escolhidos alguns para a contInuidade dos estudos. Selecionados tais cafeeiros, determinou-se cafeína no endosperma de sementes de frutos neste estádio de desenvolvimento foram Incubados com S-Adenosilmetonina, teobromina, cafeína tritlacla no carbono 8 (cafeina3H), cafeina3H e teofilina, e cafeína3H e alopurinol, um inibidor de xantina oxidase, que catalisa a degradação de xantina à àcido úrico. ... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital
Doutorado
Doutor em Ciências Biológicas

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Mauri, Rafael. "Interação entre parâmetros hidráulicos e fotossintéticos em Coffea spp." Universidade Federal de Viçosa, 2015. http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/6775.

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Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-20T15:52:27Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1157871 bytes, checksum: 01b73ae1a3e50a6fc17a800368c9f6b1 (MD5)
Made available in DSpace on 2015-11-20T15:52:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1157871 bytes, checksum: 01b73ae1a3e50a6fc17a800368c9f6b1 (MD5) Previous issue date: 2015-07-29
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Existem lacunas consideráveis sobre a eficiência hidráulica em café (Coffea spp.), como também pouco se sabe sobre as inter-relações entre características hidráulicas foliares e características morfoanatômicas, e como tais características são associadas, com vistas à maximização das trocas gasosas em café. Neste estudo, explorou-se a variabilidade morfológica, hidráulica e fisiológica de oito genótipos de café a fim de se compreender como interagem entre si os principais fatores hidráulicos limitantes da fotossíntese no cafeeiro, bem como investigar as dicotomias entre eficiência e segurança hidráulica. Para tal, compararam- se diferentes genótipos de café, incluindo-se aí genótipos/espécies evoluídos em ambientes distintos no que respeita à disponibilidade hídrica, bem como cultivares antigas e modernas de café. O estudo foi conduzido em condições de campo e as medições fisiológicas e amostragens foram feitas entre outubro de 2014 e abril de 2015. A despeito da grande variabilidade morfológica em nível foliar em Coffea spp, demonstrou-se que os genótipos estudados apresentaram valores relativamente baixos de condutividade hidráulica foliar em paralelo a uma baixa capacidade transpiratória. Essas características estiveram associadas a fortes limitações difusionais à fotossíntese, fato adicionalmente ilustrado pela alta correlação entre taxa de fotossíntese líquida e condutância estomática. Registre-se, contudo, que, em condições de baixo déficit de pressão de vapor, as taxas fotossintéticas por unidade de área foliar parecem razoavelmente conservadas em Coffea spp. De modo geral, não se observaram correlações consistentes entre condutividade hidráulica foliar e densidade de venação (e vários outros parâmetros hidráulicos), sugerindo a existência de altas resistências extra-vasculares em café. Em todo o caso, os resultados evidenciaram uma moderada a alta resistência à disfunção hidráulica (com margens positivas de segurança hidráulica). Nesse sentido, o diâmetro de condutos do xilema parece estar diretamente envolvido na determinação da segurança hidráulica em Coffea spp., com uma maior proporção de condutos de menor diâmetro levando a uma maior segurança hidráulica. Observou-se uma alta correlação (r2=0,84) entre área foliar unitária e P50 (o valor de potencial hídrico associado à redução da condutividade hidráulica foliar em 50%), sugerindo que genótipos com folhas menores são mais tolerantes à cavitação. Em termos de coordenação entre parâmetros hidráulicos e de relações hídricas não houve relação entre valores de P50 e o potencial hídrico no ponto de perda de turgescência, mas houve correlações positivas entre P50 e o módulo de elasticidade (r2= 0,73) e o potencial osmótico em turgescência plena (r2= 0,57). Concernentes às características anatômicas relacionadas ao mecanismo de reforço em nível de vasos, não se observou relação entre o P50 e os valores de (t/b)3 (razão entre espessura da parede celular e diâmetro do lúmen dos vasos) tanto da nervura central como de nervuras minoritárias. Por outro lado, observaram-se correlações significativas entre P50 e parâmetros como diâmetro dos condutos do xilema (r2=0,60) e condutividade teórica do xilema (r2=0,41). Em suma, os resultados indicam que genótipos de Coffea spp. exibem características que lhes conferem uma média a alta tolerância à seca, e que a eficiência hidráulica relativamente baixa concorre, em última análise, para limitar o potencial fotossintético do cafeeiro.
There are considerable gaps on the hydraulic efficiency in coffee (Coffea spp.), as well as little is known about the interrelations between leaf hydraulic characteristics and morpho-anatomic characteristics and how these characteristics are associated with a view to maximizing gas exchange in coffee. This study explored the morphological, hydraulic and physiological variability in eight coffee genotypes in order to understand how they interact between each other the main limiting hydraulic factors of the photosynthesis in coffee as well as investigate the trade-off between efficiency and hydraulic safety. To this end, we compared different coffee genotypes, including genotypes/species evolved in different environments with respect to water availability, as well as old and new varieties of coffee. The study was conducted under field conditions and physiological measurements and samples were collected between October 2014 and April 2015. Despite the large morphological variability at leaf level in Coffea spp, it was demonstrated that the studied genotypes showed relatively low values of leaf hydraulic conductivity in parallel with a low transpiration capacity. These characteristics were associated with strong diffusion limitations to photosynthesis, a fact further illustrated by the high correlation between net photosynthesis rate and stomatal conductance. Register, however, that in low vapor pressure deficit conditions, photosynthetic rates per unit leaf area seem reasonably preserved in Coffea spp. Overall, there were no consistent correlations between leaf hydraulic conductivity and venation density (and various other hydraulic parameters), suggesting the existence of high extra-vascular resistance in coffee. In any case, the results showed a moderate to high resistance to hydraulic dysfunction (with positive hydraulic margins). Accordingly, the diameter of xylem conduits appears to be directly involved in the determination of the hydraulic safety in Coffea spp., with a larger proportion of smaller diameter conduits leading to greater hydraulic safety. There was a high correlation (r2 = 0, 84) between unitary leaf area and P50 (the leaf water potential inducing 50% loss of Kf compared with conductance values measured in well hydrated, near-full turgor leaves), suggesting that genotypes with lower leaves are more tolerant to cavitation. In terms of coordination between hydraulic parameters and water relations there was no relationship between P50 values and the water potential in the turgor loss point, but there was a positive correlation between P50 and the elastic modulus (r2 = 0,73) and the osmotic potential in full turgor (r2 = 0,57). Concerning the anatomical characteristics related to strengthening mechanism at the level of vessels, there was no relationship between P50 and the values of (t/b)3 (ratio between cell wall thickness and vessel lumen diameter). On the other hand, there were significant correlations between P50 and parameters such as diameter of xylem conduits (r2 = 0,6) and the theoretical conductivity of xylem (r2 = 0,41). In sum, the results indicate that genotypes of Coffea spp. exhibit characteristics that give them a medium to high drought tolerance, and that the relatively low hydraulic efficiency competes, ultimately, to limit the photosynthetic potential of the coffee.

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Carvalho, Humberto Fanelli. "Parâmetros genéticos interpopulacionais e seleção recorrente em Coffea canephora." Universidade Federal de Viçosa, 2015. http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/6905.

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Abstract:

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-12-07T09:04:37Z No. of bitstreams: 1 texto complet.pdf: 299404 bytes, checksum: e1a2e48c2315d78f3a7809f500923040 (MD5)
Made available in DSpace on 2015-12-07T09:04:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto complet.pdf: 299404 bytes, checksum: e1a2e48c2315d78f3a7809f500923040 (MD5) Previous issue date: 2015-06-03
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
O presente trabalho teve como objetivo estimar parâmetros genéticos interpopulacionais para vários caracteres de importância econômica em Coffea canephora, visando delinear a melhor estratégia de seleção recorrente, recíproca ou intrapopulacional em população híbrida. Para isso, foram utilizadas famílias de irmãos germanos oriundas de um dialelo parcial entre os dois grupos varietais. Utilizou-se para este trabalho famílias de irmãos germanos obtidas via dialelo parcial composto por cinco genitores de Coffea canephora var. kouillou, como machos, e cinco genitores de Coffea canephora var. robusta, como fêmeas. Esse dialelo faz parte do Programa de Melhoramento de Coffea canephora da Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (EPAMIG) em parceria com a Universidade Federal de Viçosa (UFV) e a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Café (Embrapa Café). O ensaio contendo as 20 famílias de irmãos germanos foi instalado, em janeiro de 2011, na Fazenda Experimental Vale do Piranga, localizada no município de Oratórios (20°25′51′′S, 42°48′21′′O), Minas Gerais, e pertencente à EPAMIG. O delineamenO presente trabalho teve como objetivo estimar parâmetros genéticos interpopulacionais para vários caracteres de importância econômica em Coffea canephora, visando delinear a melhor estratégia de seleção recorrente, recíproca ou intrapopulacional em população híbrida. Para isso, foram utilizadas famílias de irmãos germanos oriundas de um dialelo parcial entre os dois grupos varietais. Utilizou-se para este trabalho famílias de irmãos germanos obtidas via dialelo parcial composto por cinco genitores de Coffea canephora var. kouillou, como machos, e cinco genitores de Coffea canephora var. robusta, como fêmeas. Esse dialelo faz parte do Programa de Melhoramento de Coffea canephora da Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (EPAMIG) em parceria com a Universidade Federal de Viçosa (UFV) e a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Café (Embrapa Café). O ensaio contendo as 20 famílias de irmãos germanos foi instalado, em janeiro de 2011, na Fazenda Experimental Vale do Piranga, localizadto estatístico utilizado foi o de blocos com tratamentos casualizados, com 35 repetições e parcela experimental composta por uma planta com espaçamento entre fileiras de 3,0 metros e entre plantas 1,5 metros. Os caracteres avaliados foram: vigor vegetativo (VIG), reação a ferrugem (FER), altura de planta (APL), diâmetro da projeção da copa (DCOP), época de maturação (MAT) e produtividade em sacas de 60 kg por hectare (PROD). A metodologia de análise foi via modelos mistos, através do software SELEGEN- REML/BLUP. A falta de variância genética aditiva para os grupos de macho e fêmea e para a variância devido a capacidade específica de combinação dos cruzamentos, entre as características avaliadas não permitiu promover seleção dentro dos grupos de genitores, impossibilitando a condução de um programa de melhoramento via seleção recorrente recíproca. Assim a estratégia foi explorar variância genética das famílias interpopulacionais nas famílias híbridas por seleção recorrente intrapopulacional. O índice aditivo, feito à partir dos valores genéticos aditivos, proporcionou um ganho de 5,12% na seleção de 28 plantas, das dez melhores famílias híbridas, com intuito de compor a população base para o próximo ciclo de seleção. O ganho de seleção para esses indivíduos para as características de maior interesse como PROD e VIG foram 12,13% e 18,57% respectivamente. O índice aditivo, feito à partir dos valores genéticos totais, entre os 20% melhores indivíduos das famílias híbridas para compor os testes clonais proporcionou um ganho de 39,33%. Concluímos que baseado na estimação dos parâmetros genéticos interpopulacionais a estratégia viável para dar sequência ao programa de melhoramento genético de Coffea canephora é a seleção recorrente intrapopulacional em população híbrida ou sintética. Os indivíduos selecionados para compor os testes clonais apresentaram elevada capacidade produtiva, tendo potencialidade para compor futuras variedades clonais de Coffea canephora.
This study aimed to estimate interpopulation genetic parameters for multiple traits of economic importance in Coffea canephora, aiming to outline the best recurrent selection strategy, reciprocal or intrapopulation in hybrid population. For this, families of full sibs coming from a partial diallel between the two varietal groups were used. It was used for this work sib families obtained via partial diallel composed of five Coffea canephora var. Kouillou parents as males, and five parents of Coffea canephora var. robust as females. This partial diallel of Coffea canephora was conducted by the Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (EPAMIG) in partnership with the Universidade Federal de Viçosa (UFV) and the Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Café (Embrapa Café). The test containing 20 families sib was installed in january 2011 at the experimental farm of Vale do Piranga, located in the city of Oratorios (20 ° 25'51 "S, 42 ° 48'21" W), Minas Gerais, and belongs to EPAMIG. The statistical design was randomized blocks with treatments with 35 repetitions and experimental unit consisting of a plant with row spacing of 3.0 meters and 1.5 meters between plants. The characters evaluated were: vegetative vigor (VIG), rust reaction (FER), plant height (APL), diameter of the canopy projection (DCOP), ripening time (MAT) and productivity in bags of 60 kg per hectare (PROD). The analysis by mixed models was made in SELEGEN-REML / BLUP software. The lack of additive genetic variance for the male and female groups and the variance due to specific combining ability of the crossings between the traits not allowed selection within the parents groups, making it impossible to conduct a breeding program via selection reciprocal recurrent. So the strategy was to explore genetic variance of interpopulation families in hybrid families by intrapopulation recurrent selection. The additive index, made from the additive genetic values, provided a gain of 5.12% in the selection of 28 plants, of the top ten hybrid families, aiming to compose the base population for the next selection cycle. The gain selection for these individuals to the characteristics of greatest interest as PROD and VIG were 12.13% and 18.57% respectively. The additive index, made from the total genetic values, among the top 20% of individuals hybrid families to compose the clonal tests provided a gain of 39.33%. We conclude that based on the estimation of interpopulation genetic parameters viable strategy to sequence the genetic improvement program of Coffea canephora is the intrapopulation recurrent selection on hybrid or synthetic population. The individuals selected to compose the clonal tests showed high productive capacity, and capability to compose future clonal varieties of Coffea canephora.

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Mendonça, Rodolfo Ferreira de. "Reação de genótipos de Coffea canephora à Hemileia vastatrix." Universidade Federal do Espírito Santo, 2013. http://repositorio.ufes.br/handle/10/6565.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2016-12-23T14:37:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodolfo Ferreira de Mendonca.pdf: 887040 bytes, checksum: 634504ee1a6e6bcb495cae2c0feeafe0 (MD5) Previous issue date: 2013-02-20
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
The Espírito Santo state is the larger producer of conilon coffee in Brazil, and the leaf rust disease is considered the main disease of this culture. Genotypes of conilon coffee may have different behavior in relation to leaf rust. Within this approach, accurate characterization of genetic materials in search for superior leaf rust resistance is of fundamental importance, in order to assist the direct selection in the breeding program of conilon coffee being executed by Incaper (Instituto Capixaba de Assistência Técnica, Pesquisa e Extensão Rural). Therefore, this study aims to evaluate the reaction to Hemileia vastatrix of 54 genotypes of Coffea canephora selected in the referred breeding program of Incaper. The vegetal material and the fungus were collected in the Experimental Farm of Bananal do Norte, directed by Incaper, in Cachoeiro do Itapemirim, ES. The experiment was conducted in the laboratory of plant pathology of the Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal do Espírito Santo (CCA-UFES), Alegre, ES. A completely randomized experimental design was used, with three repetitions, and each plot was composed of 16 leaf discs, which were placed in gerbox and inoculated with 104 spores.mL-1 of H. vastatrix, using a brush. The gerboxes were placed in the dark at 22 °C for 48 hours and then at photoperiod of 12 hours until the end of the experiment. Five days later the inoculation, the discs were cleaned with cotton to prevent the growth of hyperparasites. From the tenth day, the appearance of symptoms was observed and were evaluated, until the 37th day, the incubation period, the latent period, the incidence, the percentage of discs with sporulation, the spore numbers and the severity. The data were analyzed in the software R, for Pearson correlation and STEPWISE, and in the software GENES, for variance analysis, Scott-Knott test and multivariate analysis. Based on the results, three groups of genotypes of conilon coffee were formed: Resistant, Intermediate and Susceptible. In the Resistant group, 19 genotypes were allocated: 05, 09, 11, 12, 13, 15, 16, 17, 20, 21, 22, 23, 24, 30, 33, 35, 37, 39 and 44; in the Intermediate were allocated 29 genotypes: 01, 02, 04, 06, 07, 08, 10, 14, 18, 19, 25, 26, 27, 28, 31, 34, 42, 45 and 50; and in the Susceptible group were allocated 16 genotypes: 03, 29, 32, 36, 38, 40, 41, 43, 46, 47, 48, 49, 51, 52, 53 and 54. Therefore, based on the results, it is concluded that there is variation in the resistance level of the genotypes of C. canephora to H. vastatrix. Such information should be considered in the decision about which genotypes will integrate the new cultivars to be released by the breeding program of conilon coffee
O Estado do Espírito Santo é o maior produtor nacional de café conilon e a ferrugem é considerada a principal doença da cultura. Os genótipos de conilon podem apresentar comportamento diferenciado em relação à ferrugem. Dentro desta abordagem, é de fundamental relevância a caracterização dos materiais genéticos superiores para resistência à ferrugem, no sentido de direcionar a seleção no programa de melhoramento de café conilon em execução pelo Incaper (Instituto Capixaba de Assistência Técnica, Pesquisa e Extensão Rural). Portanto, este trabalho objetiva avaliar a reação à Hemileia vastatrix de 54 genótipos de Coffea canephora selecionados no referido programa de melhoramento. A coleta do material vegetal e do fungo foi feita na Fazenda Experimental de Bananal do Norte, pertencente ao Incaper, em Cachoeiro de Itapemirim, ES. O experimento foi conduzido no laboratório de Fitopatologia do Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal do Espírito Santo (CCA-UFES), Alegre, ES. Foi utilizado o delineamento experimental inteiramente casualizado com três repetições, onde cada repetição foi composta por 16 discos de folha, que foram acondicionados em gerbox e inoculados com 104 esporos.mL-1 de H. vastatrix, com o auxílio de um pincel. Os gerbox foram colocados sob ausência de luz e 22ºC por 48 horas e então em fotoperíodo de 12 horas até o término do experimento. Cinco dias após a inoculação, os discos foram limpos com algodão para evitar o aparecimento de hiperparasitas. A partir do décimo dia foi observado o aparecimento de sintomas e foram avaliados, até o 37º dia, o período de incubação, o período latente, a incidência, a porcentagem de discos esporulados, o número de esporos, e a severidade. Os dados foram analisados no programa R, através da correlação de Pearson e STEPWISE e no programa Genes para a análise de variância, Scott-Knott e análise multivariada. Com base nos resultados verificou-se a formação de três grupos de genótipos de café conilon: Resistentes, Intermediários e Suscetíveis. No grupo Resistente foram alocados 19 genótipos: 05, 09, 11, 12, 13, 15, 16, 17, 20, 21, 22, 23, 24, 30, 33, 35, 37, 39 e 44; no grupo Intermediário foram alocados 19 genótipos: 01, 02, 04, 06, 07, 08, 10, 14, 18, 19, 25, 26, 27, 28, 31, 34, 42, 45 e 50; e no grupo Suscetível foram alocados 16 genótipos: 03, 29, 32, 36, 38, 40, 41, 43, 46, 47, 48, 49, 51, 52, 53 e 54. Assim, com base nos resultados, conclui-se que há variação no nível de resistência dos genótipos de C. canephora à H. vastatrix. Tal informação deve ser considerada no momento da decisão de quais genótipos integrarão as novas cultivares a serem lançadas pelo Programa de Melhoramento de Café Conilon

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Orozco, Castillo Carlos Alfonso. "Molecular diversity and evolutionary studies in the genus Coffea." Thesis, University of Edinburgh, 1995. http://hdl.handle.net/1842/11874.

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Neto, Ana Paula. "Eficiência de uso de fósforo por cultivares de café e adaptação morfológica do sistema radicular sob deficiência do nutriente." Universidade de São Paulo, 2014. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11136/tde-17042014-085602/.

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Abstract:

O fósforo (P) é um elemento essencial à produção agrícola, finito e insubstituível em suas funções no metabolismo vegetal. A baixa disponibilidade do nutriente nos solos tropicais está relacionada à sua forte interação com os colóides e íons na solução do solo, por meio da adsorção e precipitação, que reduzem a fração disponível. As plantas desenvolvem mecanismos de adaptação sob deficiência de P nos solos. Diversos estudos indicam variação genotípica das plantas em relação ao uso eficiente do nutriente. O aumento da eficiência de uso pode ser conseguida pelo aumento da aquisição do nutriente do solo (eficiência de absorção) e pelo aumento da produção por unidade de P absorvido (eficiência de utilização). Esta pesquisa foi realizada com o objetivo de caracterizar os cultivares das espécies Coffea arabica e Coffea canephora quanto ao uso de P, agrupar em relação a eficiência e resposta ao nutriente, e avaliar as adaptações morfológicas do sistema radicular do cafeeiro submetido a baixa disponibilidade de P. O crescimento do cafeeiro reduziu sob baixa disponibilidade de P, e a concentração do nutriente foi superior nos cultivares de C. canephora. As folhas jovens concentraram mais P, principalmente na forma de Pi. A colonização micorrízica em C. arabica foi superior nas raízes sob deficiência de P, e a atividade da enzima fosfatase ácida não variou com os níveis do nutriente. Os cultivares de C. canephora foram eficientes na absorção de P, enquanto os cultivares de C. arabica eficientes na utilização do nutriente. A eficiência de P variou entre os cultivares de café, em que E16 Shoa, E22 Sidamo, Iêmen e Acaiá foram eficientes e responsivos. A deficiência de P reduziu o crescimento e o acúmulo de biomassa no cafeeiro, mas aumentou a razão raiz/parte aérea em C. arabica. As raízes sob deficiência de P foram mais finas e cresceram menos. A eficiência de absorção de P correlacionou positivamente com a área superficial, comprimento, volume de raízes, número de ramificações e densidade de tecido de raiz, e negativamente com o comprimento específico. A eficiência de utilização correlacionou positivamente com a altura, número de folhas, massa seca e razão raiz/parte aérea, e negativamente com a concentração e acúmulo de P nos tecidos. Os cultivares mais eficientes em P apresentaram maior área superficial, comprimento, volume de raízes e densidade de tecido radicular, e menor comprimento específico sob deficiência do nutriente. Os cultivares mais eficientes em P foram: E22 Sidamo, Acaiá, Jimma Tane, Obatã, Ouro Verde, Caturra Amarelo, Icatu Precoce e Guarini.
Phosphorus is a nutrient essential to agricultural production, finite and irreplaceable in their functions in plant metabolism. Low P availability in tropical soils is related to its strong interaction with colloids and ions in soil solution by means of adsorption and precipitation, which reduce the fraction available. Plants develop adaptation mechanisms under P deficiency in soils. Several studies indicate genotypic variation of plants in relation to the efficient use of P. Increased use efficiency can be achieved by increasing soil nutrient acquisition (uptake efficiency) and by enhancing production per unit of P absorbed (utilization efficiency). The objective of this study was to characterize cultivars of the species Coffea arabica and Coffea canephora regarding the use of P, group them in terms of efficiency and response to P and assess the morphological adaptations of the root system of coffee cultivars subjected to low availability of P. Coffee growth reduced under low availability of P, and P concentration was higher in cultivars of C. canephora. Young leaves concentrated more P, mostly in the form of Pi. Mycorrhizal colonization of C. arabica was higher in the roots under P deficiency, and the activity of the phosphatase acid enzyme did not vary with nutrient levels. Cultivars of C. canephora were efficient in P uptake, while the cultivars of C. arabica were more efficient in nutrient utilization. P efficiency varied between the coffee cultivars, and E16 Shoa, E22 Sidamo, Iêmen and Acaiá were efficient and responsive. P deficiency reduced growth and biomass accumulation in the coffee plant, but increased the root/shoot ratio in C. arabica. Roots under P deficiency were thinner and grew less. The P uptake efficiency correlated positively with the surface area, length, root volume, number of branches and root tissue density, and negatively with the specific length. P utilization efficiency correlated positively with height, number of leaves, dry matter and root/shoot ratio, and negatively with the concentration and accumulation of P in the tissues. Cultivars that were more efficient in P uptake showed more surface area, length, root volume and root tissue density, and smaller specific length under P deficiency. The most P efficient cultivars were: E22 Sidamo, Acaiá, Jimma Tane, Obatã, Ouro Verde, Caturra Amarelo, Icatu Precoce and Guarini.

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Dissertations / Theses on the topic 'Coffea'

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