Academic literature on the topic 'Complexo de espécies Cryptococcus neofarmas'

Cryptococcus neoformans é uma levedura encapsulada, presente em animais e humanos, que infecta tanto indivíduos imunocomprometidos como imunocompetentes. A criptococose é uma causa significativa de morbilidade e mortalidade em todo o mundo, sendo a meningoencefalite o sinal mais frequente da doença. Duas espécies estão incluídas no complexo de Cryptococcus neoformans: C. gattii (serotipos B e C) e C. neoformans. Por sua vez, C. neoformans é dividido em duas grandes variedades - var. grubii (serotipo A) e var. neoformans (serotipo D) –, além de incluir estirpes híbridas (serotipo AD). A técnica de RFLP tem sido usada para identificar facilmente os tipos moleculares dos isolados em estudos epidemiológicos. Oito tipos foram descritos: VNI, VNII (ambos correspondentes a estirpes C. neoformans var. grubii), VNIII (estirpes híbridas AD), VNIV (C. neoformans var. neoformans), e VGI-IV (correspondentes a C. gattii). Este trabalho teve como objectivo, caracterizar geneticamente uma colecção de isolados clínicos e ambientais, portugueses e estrangeiros, e avaliar a sua resistência a duas drogas antifúngicas, permitindo comparar os padrões epidemiológicos do complexo de espécies com os encontrados noutras regiões do mundo. A colecção possui 337 isolados de C. neoformans, provenientes de diversos hospitais e regiões, previamente identificados por métodos convencionais de diagnóstico. A determinação dos tipos moleculares foi realizada através do método de RFLP no gene PLB1. Dos 267 isolados analisados, o tipo mais abundante foi VN I (61,42%), seguido por VN III (24,34%). Menos abundantes foram VN IV (10,11%) e VN II (3%), enquanto que VG I foi raro (1,12%). Os restantes tipos moleculares de C. gattii não foram encontrados. Usando o método de difusão em disco, 98 destes isolados foram analisados quanto à susceptibilidade antifúngica. Foi registada resistência ao voriconazol em apenas 3,1% dos isolados testados. Foi encontrada resistência ao fluconazol num elevado número de isolados (32,7%) e susceptibilidade dependendo da dose em 15,3%. Este trabalho, também teve o intuito de correlacionar os resultados anteriores com o tipo molecular. Todavia não foi encontrada diferença estatisticamente significativa entre qualquer dos tipos moleculares e as CMIs correspondentes ao fluconazol. Porém, os resultados mostram que alguns tipos moleculares são menos susceptíveis do que outros em relação ao voriconazol: VN I e VN IV são mais resistentes do que VN II, e VN I e VN II são mais susceptíveis que VN III. Concluindo, a elevada frequência de VN I está de acordo com resultados obtidos em outros estudos em países Europeus e Sul-Americanos. É notável a abundância de VN III em Portugal, tal como relatado noutros países do Sul da Europa, mas também no Chile, contrariamente a outras regiões do globo. A elevada resistência ao fluconazol é compatível com os resultados documentados em estudos anteriores. Esta investigação é um importante passo na epidemiologia da criptococose e da ocorrência de C. neoformans em Portugal.<br>Cryptococcus neoformans is an encapsulated yeast that is present in animals and humans, both in immunocompromised and immunocompetent individuals. Cryptococcosis is a significant cause of morbidity and mortality worldwide, being meningoencephalitis the most frequent sign of disease. Two species are included on the Cryptococcus neoformans complex: C. gattii (serotypes B and C) and C. neoformans. Among C. neoformans, two major varieties exist - var. grubii (serotype A) and var. neoformans (serotype D) -, as well as hybrid strains (serotype AD). Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis has been used to easily identify the molecular types of isolates in epidemiological studies. As such, 8 types have been described: VNI, VNII (both corresponding to C. neoformans var. grubii strains), VNIII (serotype AD hybrid strains), VNIV (C. neoformans var. neoformans), and VGI-IV (all corresponding to C. gattii). The goal of this work was to genetically characterize a collection of clinical and environmental Portuguese and foreign isolates, and to assess their resistance to 2 antifungal drugs, aimed at comparing the epidemiological patterns of the species complex to those found in other regions of the world. The collection possesses 337 C. neoformans isolates obtained from several hospitals and regions, previously identified using conventional mycological diagnosis. The determination of molecular types was performed using the RFLP method on the PLB1 gene. From the 267 isolates analyzed, the VN I type was the most abundant (61.42%), followed by VN III (24.34%). Less abundant were VN IV (10.11%) and VNII (3%), whilst VG I were rare (1.12%). The other molecular types of C. gattii were not found. Using the disk diffusion method, 98 of these isolates were analyzed for antifungal susceptibility. Resistance to voriconazole was found in just 3.1% of the isolates studied. High resistance to fluconazole was registered in an relevant number of isolates (32.7%) and resistance depending on the drug dose in 15.3% other isolates. In this work, it was also aimed to correlate the previous results with the molecular types, although there was not statistically meaningful difference found between any molecular type and the MIC of fluconazole. However the results show that some molecular types are less susceptible than others regarding voriconazole: VN I and VN IV are more resistant than VN II, and VN I and VN II are more susceptible than VN III. In conclusion, the high frequency of VN I agrees with results from other European and South-American countries. It is remarkable the abundance of VN III (hybrid strains) in Portugal, as reported in other Southern European countries, but also in Chile, yet unlike in other regions of the world. Plus, the resistance to fluconazole, in a significant number of isolates is comparable to that found in previously documented studies. This investigation is an important step for the epidemiology of criptococcosis and occurrence of C. neoformans in Portugal.

Orientador: Márcia Marinho<br>Resumo: A criptococose é uma doença sistêmica causada pela inalação de basidiosporos desidratados de espécies patogênicas do gênero Cryptococcus presentes no ambiente. Os complexos espécies mais associados à doença são os complexos de espécies Cryptococcus neoformans e C. gattii. O complexo de espécies C. neoformans está associado a casos de criptococose em pacientes imunossuprimidos, sendo comumente isolados do solo e de fezes de aves. O complexo de espécies de C. gattii, por sua vez, afeta principalmente indivíduos imunocompetentes e geralmente é isolado em espécies de árvores nativas ou exóticas em estado de biodegradação. Este estudo teve como objetivo realizar o mapeamento ambiental de espécies patogênicas do gênero Cryptococcus em amostras ambientais arbóreas em locais públicos da cidade de Birigui, São Paulo. Para a coleta das amostras, foram selecionadas regiões com maior trânsito neste município. Após processamento, foram realizados testes morfo-fisiológicos, bioquímicos, teste de assimilação de carbono e nitrogênio e PCR URA5 e RFLP com dupla digestão enzimática para caracterização do complexo de espécies/espécie de Cryptococcus. Entre fevereiro de 2018 e março de 2019, foram coletadas 100 amostras de diferentes árvores em locais arborizados públicos. A porcentagem de colonização das árvores por C. gattii VGII foi de 5%, por C. neoformans VNIV de 1% e foram encontrados 6% de C. laurentii e 3% de C. albidus. Estes resultados sugerem a existência de micro-focos e diversidade ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)<br>Abstract: Cryptococcosis is a systemic disease caused by the inhalation of dehydrated basidiospores of pathogenic species of Cryptococcus genus present in the environment. The two species complex associated with the disease are the Cryptococcus neoformans and C. gattii species complex. C. neoformans species complex are associated with cases of cryptococcosis in immunosuppressed patients, being commonly isolated from the soil and birds feces. C. gattii species complex affects mainly immunocompetent individuals and are often isolated in native or exotic tree species in some state of biodegradation. This study aimed to perform the environmental mapping of pathogenic species of the genus Cryptococcus in tree samples of public places of the city of Birigui, São Paulo. For collection, the samples were collected from regions with greater traffic in this city. After processing, morphophysiological, biochemical, carbon and nitrogen assimilation and URA5 PCR and RFLP with double enzymatic digestion tests were performed to characterize the Cryptococcus species/species complex. Between february 2018 and march 2019 was collected a total of 100 samples from different trees in public arborized locations. The percentage of tree colonization by the C. gattii VGII was 5%, for C. neoformans VNIV was 1% and was found 6% of C. laurentii and 3% of C. albidus species. These results obtained suggests that there are a micro-foci and diversity of pathogenic Cryptococcus species in some arboreal environment loca... (Complete abstract click electronic access below)<br>Mestre

O Complexo Cryptococcus neoformans compreende as espécies C. neoformans e C. gattii. Estas leveduras basidiomicéticas causam criptococose em indivíduos imunocomprometidos e imunocompetentes, respectivamente. Particularmente em fungos, proteínas ancoradas por Glicosilfosfatidilinositol (GPI-Ps) estão envolvidas em muitos aspectos da interação patógeno-hospedeiro, como adesão e invasão das células hospedeiras, modulação e evasão da resposta imune do hospedeiro e patogênese. Este trabalho tem por objetivo identificar proteínas ancoradas por GPI nas espécies do Complexo C. neoformans por análise in silico de suas sequências genômicas. Para isso, foi utilizado um conjunto de algorítimos para predição de GPI-Ps nas linhagens C. neoformans var. grubii (H99) e C. gattii (R265) através da análise de 6967 e 6210 seqüências de ORFs traduzidas, respectivamente. A classificação de uma proteína como sendo uma GPI-P seguiu o seguinte critério: a seqüência de aminoácidos apresentou (i) um peptídio sinal de secreção N-terminal; (ii) uma sequência sinal de ancoramento por GPI na extremidade C-terminal; (iii) ausência de domínios transmembrana internos. As seqüências foram obtidas no banco de dados genômicos do Broad Institute (http://www.broadinstitute.org/science/data). Neste estudo, 63 proteínas foram identificadas como GPI-Ps em C. neoformans var. grubii (H99) e 47 em C. gattii (R265). Fosfolipase B1, Endo-1,3 -glucanases, Quitina desacetilases e Glioxaloxidases foram encontradas em ambas as espécies. Estas proteínas já foram previamente descritas como GPI-Ps, demonstrando que a metodologia empregada no estudo mostrou-se eficiente. As proteínas identificadas puderam ser, de maneira geral categorizadas funcionalmente, destacando-se aquelas envolvidas na biogênese e remodelamento da parede celular. Aproximadamente 70% das proteínas identificadas em ambas espécies não têm função conhecida, algumas tendo homólogas com outras proteínas fúngicas e outras sendo únicas da espécie. A identificação dessas proteínas será de extrema importância na elucidação de aspectos relacionados à patogênese e servirá de modelo para outras doenças causadas por fungos.<br>The Cryptococcus neoformans species Complex includes the Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii yeasts. These basidiomycete yeasts can cause disease in immunocompromised and immunocompetent patients, respectively. Notably in fungus, glicosylphosphatidilinositol-anchored proteins (GPI-Ps) are involved in different aspects of host-pathogen interaction, such as host cells adhesion and invasion, host immune response modulation and evasion and pathogenesis. In this work, we performed a systematic, genome-wide in silico identification of C. neoformans complex species GPI-Ps. A set of prediction tools was apllied for the screening of 6967 and 6210 predicted protein sequences from C. neoformans var. grubii (H99 strain) an C. gattii (R265 strain), respectively. The sequences were retrieved from the Broad Institute genome database (http://www.broadinstitute.org/science/data). The identification of putative GPI-Ps was based on the following criteria: i) the presence of an N-terminal signal peptide for secretion; ii) the presence of a C-terminal GPI-attachment site and iii) absence of internal transmembrane domains. A total of 63 putative GPI-Ps were identified in C. neoformans var. grubii and 47 proteins were identified as GPI-P in C. gattii. Proteins previously described as GPI-anchored, such as Phospholipase B1, Endo-1,3--glucanases, Chitin deacetylases and Glyoxaloxidases were identified in both species C. neoformans var grubii and C. gattii. The proteins identified could be classified in several functional categories, especially those involved in cell wall biogenesis and remodeling. About 70% of the GPI-Ps identified have unknown functions. Many of the putative GPI-Ps do not display conserved domains, but some possess have fungal orthologs homólogs while others are currently unique to specie. The GPI-P identification in Cryptococcus neoformans species complex is of extreme importance for elucidating aspects related to the pathogenesis and will serve as a model for others fungal diseases.

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Methods: the in vitro susceptibility of the yeast to the compound punicalagin was verified using the broth microdilution method. The possible mechanism of action was verified by different methods such as: ergosterol assay of the fungal cell membrane, by morphological and ultrastructural analyzes of the yeasts, by flow cytometry (cell cycle, cytoplasmic membrane injury, reactive oxygen species production and loss of the mitochondrial membrane potential). The in vitro cytotoxicity of punicalagin was verified using Balb/c 3T3 cells, A549 lung carcinoma cells and sheep erythrocytes. Results: the punicalagin was able to inhibit yeast growth at concentrations ≤4 μg/mL with minimum fungicidal concentration (CFM) of >256 μg/mL. The punicalagin reduced the ergosterol synthesis of the fungal cell membrane and promoted alterations in the morphology and the cellular arrangement of the yeasts. The action mechanism analyzed by flow cytometry showed alteration of the cell cycle with increase of the G0/G1 phases and reduction of the G2/M phases, interfering in the cellular division of the DNA of the fungal cells. The compound showed low toxicity on the Balb/c cells 3T3, A549 and sheep erythrocytes. Conclusion: the results presented by punicalagin showed that this compound presents low cytotoxicity to the animal cells, with important antifungal activity against the yeasts of the Cryptococcus neoformans species complex and Candida species.<br>Introdução: a elevada incidência e taxa de mortalidade por infecções fúngicas despertam o interesse pela busca por fármacos mais eficazes e menos tóxicos para o tratamento dessas infecções. Plantas medicinais representam uma promissora fonte de descoberta de agentes antifúngicos. Dentre as plantas medicinais, a Lafoensia pacari A. St.-Hil (Lythraceae), planta do cerrado, destaca-se por apresentar propriedades medicinais conhecidas popularmente no Brasil. A punicalagina, um metabólito secundário extraído da folha da L. pacari, apresenta comprovadas atividades biológicas. Objetivo: neste trabalho foi avaliada a atividade biológica de punicalagina sobre leveduras pertencentes ao complexo Cryptococcus neoformans e espécies de Candida. Métodos: a suscetibilidade in vitro das leveduras ao composto punicalagina, foi verificada usando-se o método de microdiluição em caldo. O possível mecanismo de ação foi verificado por diferentes métodos como: doseamento de ergosterol da membrana da célula fúngica, por análises morfológicas e ultraestruturais das leveduras, por citometria de fluxo (ciclo celular, lesão da membrana citoplasmática, produção de espécies reativas de oxigênio e perda do potencial da membrana mitocondrial). A citotoxicidade in vitro de punicalagina foi verificada utilizando-se células Balb/c 3T3, células de carcinoma pulmonar A549 e eritrócitos de carneiro. Resultados: a punicalagina foi capaz de inibir o crescimento das leveduras em concentrações ≤ 4 µg/mL com concentração fungicida mínima (CFM) de > 256 µg/mL. A punicalagina reduziu a síntese de ergosterol da membrana celular fúngica e promoveu alterações na morfologia e no arranjo celular das leveduras. O mecanismo de ação analisado por citometria de fluxo mostrou alteração do ciclo celular com aumento das fases G0/G1 e redução das fases G2/M, interferindo na divisão celular do DNA das células fúngicas. O composto mostrou baixa toxicidade sobre as células Balb/c 3T3, A549 e eritrócitos de carneiro. Conclusão: os resultados apresentados pela ação da punicalagina mostraram que este composto apresenta baixa citotoxicidade para as células animais, com importante atividade antifúngica para as leveduras do complexo Cryptococcus neoformans e Candida.