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Dissertations / Theses on the topic 'Compose biochimique'

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Carletti, Eugénie. "Études biochimiques et structurales d'enzymes interagissant avec les toxiques organophosphorés." Grenoble 1, 2009. http://www.theses.fr/2009GRE10035.

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Abstract:
Les enzymes réagissant avec les organophosphorés (OP) ont le potentiel de constituer les principes actifs des futures contre-mesures médicales destinées à protéger et à traiter l'homme contre l'agression OP. Les travaux réalisés au cours de cette thèse visent à 1) déterminer les facteurs permettant l'amélioration des propriétés des phosphotriesterases bactériennes, en vue de leur utilisation comme bioépurateurs catalytiques des OP; 2) approfondir les connaissances sur le mécanisme d'inhibition et de vieillissement des cholinestérases (ChEs), en particulier la butyrylcholinestérase humaine qui présente l'intérêt d'être le premier bioépurateur stoechiométrique proposé comme alternative au prétraitement actuel de l'intoxication organophosphorée. La phosphotriestérase bactérienne (PTE) hydrolyse la liaison phosphoester des OP. L'avantage de la PTE par rapport aux ChE s, est son activité catalytique élevée vis-à-vis des OP. C'est un bon candidat pour la décontamination et la protection cutanée. Cependant les difficultés d'expression et de production de l'enzyme entravent son développement. L'étude présentée dans cette thèse, permet de réévaluer les propriétés catalytiques de l'enzyme exprimée en présence de différents cations métalliques et une meilleure compréhension des problèmes d'expression rencontrés avec la PTE. PEGylée ou encapsulée dans des liposomes, la PTE pourrait être administrée à l 'homme et améliorer considérablement l'efficacité du traitement des intoxications OP. Les ChEs sont les principales cibles physiologiques des OP. Malgré les progrès réalisés ces vingt dernières années, la prophylaxie et le traitement de l'intoxication par les OPs neurotoxiques restent imparfaits. En particulier, les réactivateurs (oximes) utilisés comme antidotes contre l'intoxication organophosphorée, sont peu efficaces sur les cholinestérases inhibées par le tabun. Les études biochimiques et cristallographiques réalisées dans cette thèse montrent que cette résistance est principalement due à des facteurs électroniques propres au tabun et à des interactions particulières avec les résidus du site actif des ChEs. De plus, nous avons établi que la réaction secondaire de «vieillissement» correspondait à une O-déalkylation du groupement ethoxy de l'adduit phosphoramidate lié à la sérine catalytique, et non pas à une déamination, comme proposé jusqu'à présent. La déalkylation conduit à la formation d'un pont salin entre l'histidine protonée du site catalytique et l'oxyanion du composé OP déalkylé. À ce stade, la régénération de l'activité par réactivation par les oximes n'est plus possible. La connaissance du mécanisme d'inhibition et de déalkylation de la BChE et l'AChE phosphorylées par le tabun et des phosphoramidates analogues du tabun, en particulier la résolution de la structure cristallographique des conjugués non vieillis et vieillis, sont une base structurale essentielle à la conception de nouveaux réactivateurs plus efficaces. Les données structurales obtenues vont aussi permettre d'optimiser par modélisation moléculaire, des mutants de ChEs capables de se régénérer spontanément et/ou plus facilement réactivables par les oximes. De tels mutants pourraient alors être utilisables comme bioépurateurs pseudo-catalytiques.
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Fouret, Yolande. "Etude in vitro du rajeunissement prealable a la micropropagation chez le sequoia sempervirens (endl. ) : recherche de marqueurs morphologiques, physiologiques et biochimiques." Paris 6, 1987. http://www.theses.fr/1987PA066379.

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Abstract:
En utilisant la technique de culture in vitro, nous nous sommes attaches a etudier les modalites du rajeunissement par des subcultures reiterees d'explants miniaturises chez deuxx clones de sequoia sempervirens issus d'arbres ages de 50 et 500 ans. Le choix du traitement doit etre d'autant plus drastique que le clone est issu d'arbres ages. Parmi les nombreux criteres etudies, nous en avons determine plusieurs permettant de suivre l'evolution du rajeunissement du materiel : la hauteur des tiges, le nombre de feuilles, l'enracinnement ( pourcentage et delai) et la reactivation des meristemes caulinaires isoles
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Jeannin, Pascale. "Dégradation du phénol en conditions méthanogènes : aspects microbiologiques et biochimiques." Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO11727.

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Abstract:
Developpement d'une microflore resistante, simplifiee et active sur le substrat apres 5 mois de culture de la flore d'un digesteur en presence de phenol. Enrichissement et isolement des bacteries a partir de cette microflore adaptee. Caracterisation morphologique, physiologique et biochimique des bacteries isolees. Cinq morphotypes dominent, dont 3 non methanogenes, et une bacterie acetoclaste de type methanothrix sp. Etude de la biodegradation du phenol par les bacteries isolees (physiologie, voie metabolique). Le phenol est sans doute prealablement converti en benzoate, qui est ensuite reduit et dont le cycle aromatique est ouvert. La degradation du benzoate parait strictement liee a l'activite des bacteries methanogenes
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Mathieu, Sandrine. "Étude d'une carotène-dioxygenase de raisin (VvCCD1) : aspects biochimiques et moléculaires." Montpellier 2, 2005. http://www.theses.fr/2005MON20112.

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Parnaudeau, Virginie. "Caractéristiques biochimiques de produits organiques résiduaires prédiction et modélisation de leur minéralisation dans les sols." Rennes, Agrocampus, 2005. http://www.theses.fr/2005NSARD045.

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Abstract:
Dans le contexte de l'épandage des produits résiduaires organiques sur les sols agricoles les objectifs de notre travail ont été (i) : la mise en évidence des critères de composition de la matière organique des boues de stations d'épuration et des effluents agro-industriels, influençant la minéralisation de leur carbone et azote organique dans le sol ; (ii) la prise en compte des critères de composition précédemment mis en évidence pour prédire la minéralisation du carbone et de l'azote. Ce travail a été pour une grande part basé sur l'étude d'un grand nombre de produits organiques pour lesquels ont été acquis des données de minéralisation au moyen d'incubation de sol en conditions contrôlées et des données de caractérisation de leur composition organique (solubilité à l'eau, hydrolyse acide, fractionnement Van Soest). Des outils statistiques ont ensuite été utilisés pour mettre en évidence les relations entre les caractéristiques de la matière organique et la minéralisation du C et N des produits. Notre travail a montré une grande diversité des boues de stations d'épuration en termes de qualité de matière organique et d'aptitude à la minéralisation. Les méthodes de fractionnement de la matière organique choisies dans ce travail n'apparaissent pas pertinentes pour la prévision de la décomposition des boues. Il semble notamment que la fraction " soluble " issue de la méthode de Van Soest comprend des composés organiques de nature variée qui ne sont pas biodégradables. Le critère qui permet le mieux de prédire la minéralisation nette d'azote du sol, liée à l'apport des boues, est leur rapport C/N. La pyrolyse analytique a été ensuite utilisée pour mieux caractériser la qualité de la matière organique des boues ; cette technique s'est révélée appropriée pour mettre en évidence la diversité de leur composition biochimique. Bien que les résultats obtenus avec cette méthode soit non quantitatifs, il a été possible d'en déduire les critères quantitatifs permettant d'expliciter la minéralisation de la matière organique des boues dans le sol.
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TERTULIANO, MOUKARAM. "Resistance du manioc a la cochenille farineuses, phenacoccus manihoti (homoptera : pseudococcidae) : role de quelques composes biochimiques foliaires." Rennes 1, 1993. http://www.theses.fr/1993REN10074.

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Abstract:
Un criblage pratique au champ sur 25 varietes de manioc a permis d'identifier des cultivars presentant differents degres d'antibiose et d'antixenose. L'evaluation au laboratoire de la composante antibiotique sur 7 varietes de manioc, du faux-caoutchouc et de 2 plantes de substitution, talinum (talinum triangularae jacq) et poinsettia (euphorbia pulcherrima willd) montre que l'expression du potentiel biotique du ravageur est influencee par la plante-hote. L'infestation par la cochenille modifie peu la croissance de la plante traduisant la tolerance du manioc a p. Manihoti. Les modifications des teneurs en substances primaires (acides amines et sucres) et secondaires (composes cyanes et phenoliques) suite a l'infestation varient avec la plante-hote. La resistance de type antibiose qui n'a pas pu etre reliee aux teneurs en substances primaires semble etre correlee aux teneurs en substances secondaires. Les composes cyanes auraient un role phagostimulant, alors que les flavonoides glycosyles totaux et la rutine un role phagodissuadant. Enfin, l'etude de quelques techniques agronomiques montre que les augmentations de teneurs de l'acide cyanhydrique de la rutine et des flavonoides glycosyles totaux de l'extrait de feuilles de manioc (zanaga) apres infestation sont plus importantes avec le paillage, la fumure organique et l'amendement calcique qu'avec du npk ou du kcl en toute saison. Cependant, la plus forte augmentation intervient en saison seche
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Camus, Anne-Marie. "Paramètres biochimiques et métaboliques comme indicateurs de la sensibilité au cancer chimio-induit." Lyon 1, 1990. http://www.theses.fr/1990LYO10212.

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Abstract:
Plusieurs parametres biochimiques et metaboliques comme indicateur de la sensibilite au cancer chimio-induit ont ete etudies dans des experiences de cancerogenese chez le rat et dans le cas du cancer du poumon chez le fumeur. Les n-nitrosamines sont utilises comme modele de cancerogene, au metabolisme dependant des cytochromes p-450. Le risque de developper un cancer du foie (mesure par le temps de latence) chez des rats traites a la n-nitrosodiethylamine (den) est correle a certaines activites enzymatiques controlees par le locus ah. L'effet des lipides nutritionnels sur la cancerogenese chimio-induite est etudie chez des rats soumis a une alimentation enrichie ou appauvrie en lipides satures ou polyinsatures en quantites variables et traites a la n-nitrosodimethylamine (dmn) ou a la den. Une forte quantite de lipides poly-insatures: 1) augmente la teneur en cyt p-450 et modifie les activites des enzymes; 2) change l'incidence et le site des tumeurs induites par la den; 3) augmente la methylation de l'adn induite par la dmn; 4) augmente les moyens de defense et la peroxydation lipidique mesuree par l'exhalation d'ethane, conjointement avec la den. Ces modifications peuvent expliquer l'augmentation des tumeurs par les lipides nutritionnels, dont le mecanisme est mal connu. Dans une etude de cas control, chez les fumeurs recents, avec un cancer du poumon, les enzymes pulmonaires controles par le locus ah (ahh, epoxyde hydrolase) sont induits, cet effet n'est pas observe chez les fumeurs non cancereux. Cela suggere l'existence de predispositions genetiques au cancer du poumon chez le fumeur
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Nesci, Salvatore <1982&gt. "Composti organostannici nell'ambiente marino e membrane biologiche: risposte molecolari e biochimiche nei molluschi bivalvi." Doctoral thesis, Alma Mater Studiorum - Università di Bologna, 2010. http://amsdottorato.unibo.it/2786/.

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Abstract:
Organotin compounds are worldwide diffused environmental contaminants, mainly as consequence of their extensive past use as biocides in antifouling paints. In spite of law restrictions, due to unwanted effects, organotin still persist in waters, being poorly degraded, easily resuspended from sediments and bioaccumulated in exposed organisms. The widespread toxicity and the possible threat to humans, likely to be organotin-exposed through contaminated seafood, make organotin interactions with biomolecules an intriguing biochemical topic, apart from a matter of ecotoxicological concern. Among organotins, tributyltin (TBT) is long known as the most dangerous and abundant chemical species in the Mediterranean Sea. Due to its amphiphilic nature, provided by three lipophilic arms and an electrophilic tin core, TBT can be easily incorporated in biomembranes and affect their functionality. Accordingly, it is known as a membrane-active toxicant and a mitochondrial poison. Up to now the molecular action modes of TBT are still partially unclear and poorly explored in bivalve mollusks, even if the latter play a not neglectable role in the marine trophic chain and efficiently accumulate organotins. The bivalve mollusk Mytilus galloprovincialis, selected for all experiments, is widely cultivated in the Mediterranean and currently used in ecotoxicological studies. Most work of this thesis was devoted to TBT effects on mussel mitochondria, but other possible targets of TBT were also considered. A great deal of literature points out TBT as endocrine disrupter and the masculinization of female marine gastropods, the so-called imposex, currently signals environmental organotin contamination. The hormonal status of TBT-exposed mussels and the possible interaction between hormones and contaminants in modulating microsomal hydroxilases, involved in steroid hormone and organotin detoxification, were the research topics in the period spent in Barcelona (Marco Polo fellowship). The variegated experimental approach, which consisted of two exposure experiments and in vitro tests, and the choice of selected tissues of M. galloprovincialis, the midgut gland for mitochondrial and microsomal preparations for subsequent laboratory assays and the gonads for the endocrine evaluations, aimed at drawing a clarifying pattern on the molecular mechanisms involved in organotin toxicity. TBT was promptly incorporated in midgut gland mitochondria of adult mussels exposed to 0.5 and 1.0 μg/L TBT, and partially degraded to DBT. TBT incorporation was accompanied by a decrease in the mitochondrial oligomycin-sensitive Mg-ATPase activity, while the coexistent oligomycin-insensitive fraction was unaffected. Mitochondrial fatty acids showed a clear rise in n-3 polyunsaturated fatty acids after 120 hr of TBT exposure, mainly referable to an increase in 22:6 level. TBT was also shown to inhibit the ATP hydrolytic activity of the mitochondrial F1FO complex in vitro and to promote an apparent loss of oligomycin sensitivity at higher than 1.0 μM concentration. The complex dose-dependent profile of the inhibition curve lead to the hypothesis of multiple TBT binding sites. At lower than 1.0 μM TBT concentrations the non competitive enzyme inhibition by TBT was ascribed to the non covalent binding of TBT to FO subunit. On the other hand the observed drop in oligomycin sensitivity at higher than 1.0 μM TBT could be related to the onset of covalent bonds involving thiolic groups on the enzyme structure, apparently reached only at high TBT levels. The mitochondrial respiratory complexes were in vitro affected by TBT, apart from the cytocrome c oxidase which was apparently refractory to the contaminant. The most striking inhibitory effect was shown on complex I, and ascribed to possible covalent bonds of TBT with –SH groups on the enzyme complexes. This mechanism, shouldered by the progressive decrease of free cystein residues in the presence of increasing TBT concentrations, suggests that the onset of covalent tin-sulphur bonds in distinct protein structures may constitute the molecular basis of widespread TBT effects on mitochondrial complexes. Energy production disturbances, in turn affecting energy consuming mechanisms, could be involved in other cellular changes. Mussels exposed to a wide range of TBT concentrations (20 - 200 and 2000 ng/L respectively) did not show any change in testosterone and estrogen levels in mature gonads. Most hormones were in the non-biologically active esterified form both in control and in TBT-treated mussels. Probably the endocrine status of sexually mature mussels could be refractory even to high TBT doses. In mussel digestive gland the high biological variability of microsomal 7-benzyloxy-4-trifluoromethylcoumarin-O-Debenzyloxylase (BFCOD) activity, taken as a measure of CYP3A-like efficiency, probably concealed any enzyme response to TBT exposure. On the other hand the TBT-driven enhancement of BFCOD activity in vitro was once again ascribed to covalent binding to thiol groups which, in this case, would stimulate the enzyme activity. In mussels from Barcelona harbour, a highly contaminated site, the enzyme showed a decreased affinity for the 7-benzyloxy-4-trifluoromethylcoumarin (BCF) substrate with respect to mussel sampled from Ebro Delta, a non-polluted marine site. Contaminant exposure may thus alter the kinetic features of enzymes involved in detoxification mechanisms. Contaminants and steroid hormones were clearly shown to mutually interact in the modulation of detoxification mechanisms. The xenoestrogen 17α-ethylenyl estradiol (EE2) displayed a non-competitive mixed inhibition of CYP3A-like activity by a preferential bond to the free enzyme both in Barcelona harbour and Ebro Delta mussels. The possible interaction with co-present contaminants in Barcelona harbour mussels apparently lessened the formation of the ternary complex enzyme-EE2-BCF. The whole of data confirms TBT as membrane toxicant in mussels as in other species and stresses TBT covalent binding to protein thiols as a widespread mechanism of membrane-bound-enzyme activity modulation by the contaminant.
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Devier, Marie-Hélène. "Étude intégrée sur l'impact des différentes classes de contaminants (composés organostanniques, métaux, HAP, PCB) sur les moules : bioaccumulation et réponses biochimiques." Bordeaux 1, 2003. http://www.theses.fr/2003BOR12262.

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Abstract:
Le tributylétain (TBT) a été largement utilisé comme biocide dans les peintures antisalissures des bateaux. Le TBT présent dans l'environnement marin induit chez les invertébrés des modifications hormonales et des perturbations biochimiques de certaines enzymes. Ces travaux de thèse ont porté, d'une part, sur la caractérisation de la bioaccumulation du TBT chez la moule Mytilus sp. En microcosme et sur le terrain, et d'autre part, sur l'utilisation des stéroi͏̈des endogènes comme indicateurs d'une perturbation hormonale induite par le TBT et de différents marqueurs biochimiques. Une étude de biosurveillance utilisant la transplantation de moules en cages a été réalisée dans le Bassin d'Arcachon pendant une année afin de dresser un bilan de la contamination du Bassin par les principales classes de polluants (composés organostanniques, métaux, HAP, PCB) et d'étudier les réponses biologiques associées (taux de stéroi͏̈des endogènes, biomarqueurs d'exposition : GST, AChE, catalase, TBARS).
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Bouet, Alexis. "Développement de la lactamisation stéréosélective de A. I. Meyers : nouvelles méthodes d'activation et valorisation en synthèse de nouveaux ligands potentiels des récepteurs NK1. Application à la synthèse de ligands chiraux pymox et 2,2'-bipyridines." INSA de Rouen, 2006. http://www.theses.fr/2006ISAM0008.

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Abstract:
Ce travail décrit différentes applications des travaux de A. I. Meyers sur la formation diastéréosélective des lactames bicycliques. Dans une première partie, nous avons cherché à développer de nouvelles conditions de lactamisation permettant de travailler dans des conditions plus douces et d'étendre la méthodologie à la formation de cycles lactamiques à 7 chaînons. Une étude mécanistique a permis de mettre en évidence les intermédiaires de cette réaction par suivi infrarouge in situ et de proposer différents mécanismes pour expliquer la diastéréosélectivité observée. Dans une deuxième partie, cette méthodologie a pu être appliquée à la préparation stéréosélective de ligands potentiels des récepteurs NK1 présentant une conformation et une configuration restreinte. Enfin, dans une dernière partie, ces lactames bicycliques ont été utilisés comme intermédiaires dans la synthèse de ligands N, N de type pymox et 2,2'-bipyridines présentant une chiralité axiale biarylique contrôlée lors de l'étape de lactamisation. Le potentiel de ces ligands a été évalué en réaction de cyclopropanation catalysée par le cuivre (l).
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Botondi, Rinaldo. "Caractérisation de melons transgéniques exprimant un gène antisens de l'Acc oxydase : étude de la composition biochimique et de l'activité d'enzymes de dégradation de la paroi." Toulouse, INPT, 1999. http://www.theses.fr/1999INPT009A.

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Abstract:
Il est generalement admis que l'hormone vegetale ethylene est responsable de la maturation des fruits climacteriques. On ignore cependant si l'ethylene lui seul regule l'ensemble des phenomenes intervenant dans la maturation. Dans cette these nous avons aborde cette question en utilisant des melons cantaloup charentais dans lesquel la production d'ethylene a ete inhibee par expression d'un gene antisens codant pour l'acc oxydase, enzyme intervenant dans la derniere etape de la biosynthese de cette hormone. En comparant les melons transgeniques avec les sauvages non transformes, nous avons pu montrer que des phenomenes tels que l'accumulation des sucres et la coloration de la chair se deroulent de facon identique dans les deux types de fruits, indiquant qu'ils sont independants de l'ethylene. Par contre le deverdissage de l'ecorce, le ramollissement et la formation de la zone d'abscission du pedoncule sont inhibes dans les fruits transgeniques mais peuvent etre restaures par l'ethylene exogene. La grande majorite des composes aromatiques volatils sont produits en beaucoup plus faible quantite dans les fruits transgeniques. Le traitement a l'ethylene des fruits antisens acc oxydase provoque une augmentation de des esters et des alcool aliphatiques et aromatiques. L'ethylene intervient donc dans la conversion des precuseurs acides amines ou acides gras en composes volatils, a l'exception de certains derives methythio dont la synthese semble etre independante de l'ethylene. Une fraction plus ou moins importante de l'activite polygalacturonase, pectine methyl esterase, galactosidase (-galactosidase et -arabinosidase) et galactane et presente dans les fruits transgeniques dont la production d'ethylene est inhibee. Cette fraction d'activite peut etre consideree comme independante de l'ethylene. La fraction d'activite qui augmente au cours de la maturation des fruits sauvages et qui est stimulee par l'ethylene correspond sans doute a des isoformes additionnelles des enzymes dependantes de l'ethylene. La degradation de la paroi du melon comporte donc des phenomenes dependants et independants de l'ethylene. Nos resultats demontrent l'interet de l'inhibition de la production d'ethylene par transgenese pour la discrimination des phenomenes dependants et independants de l'ethylene au cours de la maturation des fruits climacteriques.
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Tibaut, Rémi. "Etude chez le poisson et les organismes aquatiques du devenir métabolique d'un composé œstrogénique : le nonylphénol : conséquences écotoxicologiques et aspects biochimiques." Bordeaux 1, 2001. http://www.theses.fr/2001BOR12358.

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Abstract:
Le devenir métabolique du 4n-nonylphénol (4n-NP), contaminant lipophile de l'environnement aquatique a été étudié chez le poisson, un escargot et un macrophyte aquatiques, afin de mieux comprendre les effets cestrogéniques et les conséquences écotoxicologiques de cette molécule. Chez le poisson, le 4n-NP absorbé par voie branchiale ou intestinale, passe rapidement dans la circulation systémique. II est plus particulièrement concentré dans les tissus impliqués dans le métabolisme (foie et reins) et les tissus cibles des oestrogènes (gonades, foie et cerveau). La glucuronidation de la partie phénolique est la voie de biotransformation majeure. La chaîne alkyle est quant à elle hydroxylée en positions terminale (w) et subterminale (w-1) et du fait de sa linéarité, est soumise à une B-oxidation. Chez le saumon, les hydroxylations en positions w et w-1 et w-2 de la chaîne alkyle du NP, sont prises en charge, respectivement par les isoformes de cytochrome P450, CYP2M- et CYP2K-like. Ces voies métaboliques conduisent à une perte quasi totale de la capacité à activer le récepteur des oestrogènes (ER) et la transcription des gènes cibles. La vitellogenèse et l'embryogenèse sont des périodes du cycle de reproduction de la gambusie pendant lesquelles un transfert du contaminant a lieu de la mère vers les oeufs et les embryons, suggérant une possible perturbation de la différenciation sexuelle des embryons. Chez la limnée et la lentille d'eau, le 4n-NP est également largement biotransformé (hydroxylation et (B-oxidation) en métabolites inactifs vis à vis du ER.
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Caron, Coralie. "Ligands macrocycliques de sites abasiques en tant qu'inhibiteurs de la réparation de l'ADN : Synthèse, études biochimiques et biologiques." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS237.

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Abstract:
Dans le contexte de la chimiothérapie, la réparation de l’ADN réduit les dommages induits par les agents alkylants de l’ADN dont le témozolomide (TMZ), conduisant à la chimiorésistance. Une des voies principales de réparation de l’ADN est la voie par excision de base (BER) au sein de laquelle une enzyme clée, APE1 (endonucléase AP 1), clive les sites abasiques générés suite aux traitements par les agents alkylants et initie la réparation de la coupure simple-brin. Ce mécanisme représente une source majeure de chimiorésistance dans certains cancers. Plusieurs études ont ainsi validé la voie BER et plus particulièrement APE1 comme une cible importante dans le but d’améliorer l’efficacité des agents anticancéreux; pour ces raisons, de nombreux inhibiteurs d’APE1 ont été développés. Cependant, à la place d’une inhibition directe de l’enzyme, une stratégie alternative consiste à cibler le substrat de cette dernière : les sites abasiques. Les composés macrocycliques de type naphtalénophane ont montré la capacité à se lier fortement et sélectivement aux sites abasiques. Ce processus interfère avec la reconnaissance de ces derniers par APE1 et conduit in vitro à deux effets : l’inhibition du clivage enzymatique d’APE1 et le clivage du site AP par les macrocycles par un mécanisme différent de celui d'APE1, de type β-élimination. Ainsi, une nouvelle série de naphtalénophanes fonctionnalisés, composée de neuf nouveaux dérivés, a été synthétisée et étudiée. La plupart des macrocycles démontre la capacité à se lier fortement et sélectivement aux sites abasiques de l’ADN ainsi qu’à inhiber l’activité d’APE1 in vitro, avec des constantes d’inhibition s'étalant de 39 nM à 25 µM. De plus, l’activité d’inhibition d’APE1 par les ligands, caractérisée par les valeurs de Kı, a pu être corrélée avec leur affinité et leur sélectivité pour les sites abasiques. La structure moléculaire des macrocycles montre une forte influence sur l’activité de clivage de ces derniers pouvant conduire à une abolition ou à une très haute activité de clivage des sites abasiques. De façon intéressante, la formation d’un adduit covalent ADN – ligand avec un des macrocycles a été caractérisée. Enfin, l’activité biologique des naphtalénophanes sur la lignée cellulaire de glioblastome T98G résistante au TMZ a été étudiée. La plupart des ligands affiche une cytotoxicité élevée, avec des GI₅₀ de l’ordre du micromolaire. De plus, un remarquable effet synergique lors du traitement des cellules avec le TMZ et le MMS en combinaison avec un ligand (2,7-BisNP-O4Me) a été démontré. Ce macrocycle augmente également le nombre de sites abasiques et le nombre de coupures double-brins après un co-traitement cellulaire avec les agents alkylants suggérant ainsi l'inhibition d'APE1 attendue. Ces résultats mettent ainsi en évidence le fort intérêt thérapeutique de ce composé
In the context of chemotherapy, DNA repair reduces the DNA damage induced by DNA-alkylating drugs such as temozolomide, leading to chemoresistance. One of the most important pathways of DNA repair is Base Excision Repair (BER), where a key enzyme, APE1 (AP endonuclease 1), cleaves abasic sites generated following treatment with DNA-alkylating drugs and initiates the repair of the single-strand break. The DNA repair activity of APE1 was identified as the major source of chemoresistance in certain cancers. Several studies validated the BER pathway and, particularly, the APE1 enzyme as important drug targets for improvement the efficacy of anti-cancer drugs; for this reason, several APE1 inhibitors have been developed. However, instead of direct inhibition of the enzyme, an alternative strategy can rely on targeting its substrate: the AP sites in DNA. Macrocyclic compounds, namely naphthalenophanes, show a strong and selective binding to abasic sites in the DNA. This process interferes with the recognition of the latter by APE1 and leads in vitro to two effects: inhibition of the APE1-induced DNA cleavage and macrocycle-induced DNA cleavage by a mechanism different from that of APE1, namely β-elimination. Herein, a novel serie of functionalized naphthalenophanes, composed of nine novel derivatives, has been synthesized and studied. Most ligands demonstrate a strong and selective binding to AP-sites in DNA and an inhibition of APE1 activity in vitro, with inhibitory constants from 39 nM to 25 µM. Moreover, the inhibitory activity of ligands, as characterized by Kı values, could be directly related to their affinity and selectivity to AP-sites. The molecular design of macrocycles has a crucial influence on their intrinsic AP-site cleavage activity leading either to total abolition, or to an exceptionally high AP-site cleavage activity. Interestingly, an unprecedented formation of a covalent DNA-ligand adduct with one of the ligands have been characterized. Finally, the biological activity of naphthalenophanes was assessed in the TMZ-resistant glioblastoma cell line T98G. Most compounds are highly active, with GI₅₀ values in sub-micromolar or low-micromolar range. In addition, a remarkable synergic effect upon co-treatment of TMZ or MMS with one ligand (2,7-BisNP-O4Me) was demonstrated. This ligand was found to increase the number of AP-sites and the number of double-strands break in DNA upon co-treatment with TMZ and MMS suggesting APE1 inhibition as excepted. These observations highlight the hight therapeutic interest of this compound
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Anak, Ngadin Andrew. "Caractérisation biochimique et fonctionnelle de glutathion-S-transferases (GSTs) chez Phanerochaete chrysosporium." Thesis, Nancy 1, 2011. http://www.theses.fr/2011NAN10020/document.

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Abstract:
Phanerochaete chrysosporium est un champignon ligninolytique largement étudié pour ses capacités à dégrader la lignine et certains xénobiotiques grâce à un important système d'enzymes extracellulaires. Son génome est entièrement séquencé et constitue un inventaire de séquences protéiques prédites qui a permis la description de nombreuses superfamilles de protéines. Parmi elles, les Glutathion S-transférases sont essentiellement impliquées dans le métabolisme secondaire du champignon. Cependant, malgré les nombreux travaux montrant l'implication de ces enzymes dans la réponse aux stress, le développement cellulaire et plus globalement dans certaines fonctions métaboliques, leurs réelles fonctions restent inconnues à cause de leur grande diversité et le manque de données concernant leurs spécificités catalytiques. P. chrysosporium possède 27 isoformes de GSTs qui se regroupent en 7 classes. Parmi elles, 3 sont étendues chez les champignons saprophytes : les classes Omega, Ure2p et ethérase. Deux membres de la classe Omega ont été caractérisés au niveau biochimique et montrent desspécificités de substrat. En effet, PcGTO1 fait partie d'une nouvelle classe appelée S-glutathionyl-phydroquinone reductase, alors que PcGTO3 est plutôt active avec le phenylacetophenone. La structure tridimensionnelle de PcGTO1 suggère que l'enzyme appartient également à une nouvelle classe structurale que nous avons appelée xi. La deuxième classe majoritaire que nous avons étudiée est la classe des Ure2p qui est composée de 9 isoformes et se regroupent en 2 sous-classes. Trois isoformes ont été étudiées au niveau transcriptionnel, biochimique et physiologique. PcUre2p4 et PcUre2p6 appartenant à la première sous-classe sont spécifiquement exprimés dans des cultures fongiques en présence d'hydrocarbures aromatiques polycycliques et l'activité des protéines recombinantes correspondantes est classique des GSTs à savoir le transfert de glutathion sur un substrat hydrophobe. A l'inverse, PcUre2p1 qui appartient à la deuxième sous-classe est exprimé de manière constitutive au niveau transcriptionnel et la protéine présente une activité thiol transférase comparable aux protéines de la classe Omega. Les analyses physiologiques menées grâce à la complémentation de souche déficience de Saccharomyces cerevisiae ont montré que PcUre2p1, PcUre2p4 et PcUre2p6 n'avaient pas la même fonction que l'isoforme de la levure puisqu'aucune complémentation n'a été détectée en ce qui concerne la résistance au stress ou la régulation du métabolisme azoté. Ces résultats suggèrent que leschampignons, en particulier ceux qui présentent des propriétés saprophytes ont développé des spécificités de fonction de leur GSTs probablement en réponse à des contraintes environnementales
Phanerochaete chrysosporium is a ligninolytic fungus widely studied because of its capacities to degrade wood and xenobiotics through an extracellular enzymatic system. Its genome has been sequenced and has provided researchers with a complete inventory of the predicted proteins produced by this organism. This has allowed the description of many protein superfamilies. Among them, Glutathione S-transferases (GSTs) constitute a complex and widespread superfamily classified as enzymes of secondary metabolism. However, despite the numerous associations of GSTs with stress responses, cell development and metabolism in various organisms, the functions of these enzymes remain usually evasive mainly due to their high diversity and also to the lack of knowledge about their catalytic specificities. In P. chrysosporium 27 GST isoforms have been highlighted and clustered into seven classes. Among them three are extended in saprophytic fungi: the Omega, the Ure2p and the etherase classes. Two members of the Omega class have been characterized at the biochemical level showing difference in substrate specificities. Indeed, PcGTO1 is member of a new class of Sglutathionyl- p-hydroquinone reductase, while PcGTO3 is rather active with phenylacetophenone. The three-dimensional structure of PcGTO1 confirms the hypothesis not only of a new biological class, but also of a new structural class that we propose to name GST xi. The second extended class we have studied is the Ure2p one. It is composed of nine isoforms in P. chrysosporium and clusters into two subclasses. Three Ure2p class members have been studied in more details at transcriptional, biochemical and physiological levels. PcUre2p4 and PcUre2p6 of the first subclass are specifically expressed in cultures treated with polycyclic aromatic hydrocarbons and the recombinant proteins are active as typical glutathione transferases. By contrast, PcUre2p1, which belongs to the second subclass is constitutively expressed whatever the condition tested and is active with small molecules as substrate, such as proteins from the Omega class. Physiological studies have revealed that these proteins do not have the same function than the Saccharomyce cerevisiae isoform, concerning both the response to oxidative stress and its involvement in the nitrogen catabolite repression. These results suggest that fungi, especially those with saprophytic capabilities, have developed specificities of GST function as an adaptation to environmental constraints
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Niamké, Florence Bobolé. "Recherche des déterminants biochimiques de la durabilité naturelle du bois de teck (Tectona grandis)." Thesis, Montpellier 2, 2010. http://www.theses.fr/2010MON20046.

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Abstract:
La durabilité du bois de teck (Tectona grandis) est une propriété pouvant varier selon le génotype et les facteurs environnementaux. Chez le teck, le degré d'implication des extractibles dans la durabilité naturelle est controversé. A partir d'une approche quantitative incluant les aspects biologiques et technologiques conduites sur des échantillons de bois séchés à l'air ambiant, cette thèse s'est attachée à rechercher les déterminants chimiques de nature phénolique de la durabilité naturelle. Nous avons tout d'abord mis en évidence que les formes osidiques stockées dans l'aubier sont transformées en extractibles de nature quinonique. Nous avons ainsi caractérisé deux composés, l'un dans l'aubier le forsythoside B, un trisaccharide de l'acide caféique et l'autre dans le duramen, le 4',5'-dihydroxy-épiisocatalponol qui ont été identifiés pour la première fois dans le bois de teck. Nous avons mis en évidence que le second composé inhibe la croissance de Trametes versicolor indiquant son rôle directe dans la propriété de durabilité naturelle du bois de teck. Ainsi, les composés du métabolisme des naphthoquinones sont les plus impliqués dans la durabilité naturelle du bois de teck à l'égard de Trametes versicolor et de Poria placenta. Les mécanismes de transformation des sucres pourraient indiquer le niveau de durabilité naturelle des espèces. Ces nouvelles données contribueront aussi à l'amélioration de la qualité du bois qui par ailleurs assure la pérennité des arbres
Teak (Tectona grandis) wood natural durability is a property which can vary with genotype and environmental factors. The implication of quinonic extractives in the property of natural durability is controversial. Using a quantitative approach including biological and technological conducted on air-dried wood samples, this thesis aimed to search chemical attributes of natural durability. We first demonstrated that osidic forms stored in the sapwood were transformed into quinone derivative. We have characterized two compounds the forsythoside B, a trisaccharide of cafeic acid in the sapwood and in the heartwood, the 4',5'-dihydroxy(epi)isocatalponol that were identified for the first time in teakwood. The latter compound exhibited strong fungicidal activity against Trametes versicolor indicating that its direct implication in decay resistance of teak wood. We have shown that compounds from naphthoquinones metabolism were involved in decay resistance of teak wood against Trametes versicolor and Poria placenta. The mechanisms of sugars transformation may indicate the natural durability level of sustainable species. There these new data will contribute to improve the wood quality that ensures the perennity of trees
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Henrot, Serge. "Synthese stereo et enantioselective de beta-hydroxy esters fonctionnalises par voie chimique et par voie microbiologique : application a la preparation de la (-) alpha multistriatine et du r (-) gabob." Paris 6, 1987. http://www.theses.fr/1987PA066428.

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Liebgott, Pierre-Pol. "Etude de la biodiversité bactérienne d'un biotope oléicole hypersalé et des voies biochimiques impliquées dans la transformation du tyrosol." Aix-Marseille 1, 2007. http://theses.univ-amu.fr.lama.univ-amu.fr/2007AIX11031.pdf.

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Abstract:
Les effluents liquides qui sont composés d'un mélange de margines et d'eaux de saumures, sont rejetés par les industries oléicoles, et contribuent considérablement à la pollution environnementale du pourtour méditerranéen. Ils sont caractérisés par une forte DCO et des quantités significatives de composés phénoliques peu biodégradables, dont le plus représentatif est le tyrosol. L’objectif de ce travail était donc de comprendre les voies dégradatrices du tyrosol, via l'utilisation de microorganismes endogènes isolés de ces effluents. En utilisant la technique 'Single Strand Conformation Polymorphism' (SSCP), l'étude de la biodiversité a montré un profil de biotope hypersalé. Différents isolats bactériens halophiles, aérobies et anaérobies ont alors été obtenus grâce à un isolement classique ciblé. Deux d'entre eux, TYRC17 et HTB24, appartenant au genre Halomonas, ont été retenus pour leur capacité à transformer le tyrosol et le p-hydroxyphénylacétate (HPA), en molécules ortho-diphénoliques (3,4-dihydroxyphénylacétate ou DHPA et homogentisate ou HGA), connues comme des antioxydants potentiels. Cette étude nous a permis de mettre en évidence le métabolisme de dégradation du tyrosol, encore jamais décrit à ce jour. Ainsi, le tyrosol est oxydé via une aryle-déshydrogénase en HPA. Ce dernier est à son tour hydroxylé soit en HGA via une HPA 1-monooxygénase chez la souche TYRC17, soit en DHPA via une HPA 3- monooxygénase chez la souche HTB24. Ces composés ortho-diphénoliques sont alors clivés par des catécholdioxygénases, et enfin dégradés. En présence de métaux de transition comme ceux contenus dans les oligoéléments ajoutés, l’HGA se transforme abiotiquement en 2,5-dihydroxybenzaldehyde (gentisaldehyde), qui intervient dans la formation de la pyomélanine. Quant à la souche HTB24, elle produit de l’hydroxytyrosol par hydroxylation aspécifique du tyrosol, via l’HPA 3-monooxygénase qui a été induite par le HPA. De plus, l’analyse d'autres bactéries possédant cette enzyme, telles que P. Aeruginosa ou E. Coli, a confirmé qu’elles étaient aussi capables de transformer le tyrosol en hydroxytyrosol. Ces bioconversions originales ouvrent donc de fortes perspectives pour la bioremédiation de ces effluents fortement salés, mais aussi pour une production prometteuse de molécules antioxydantes à haute valeur ajoutée
The liquid effluents which are composed of a mixture of olive mill wastewater and brine waters, are rejected by olive industries, and contribute considerably to the environmental pollution of the Mediterranean area. They are characterized by a high DCO and significant quantities of recalcitrant phenolic compounds, of which the most representative is the tyrosol. The objective of this work was thus to understand the degradation pathways of the tyrosol, via the use of endogenous microorganisms isolated from these effluents. By using the technique ' Single Strand Conformation Polymorphism' (SSCP), the study of the biodiversity showed a profile of salted biotope. Various halophilous, aerobic and anaerobic bacterial isolates were then obtained through a targeted traditional insolation. Two of them, TYRC17 an HTB24, belonging to the Halomonas genus, were studied for their capacity to transform the tyrosol and p - hydroxyphenylacetate d (HPA), into orthodiphenolic molecules (3,4-dihydroxyphenylacetate or DHPA and homogentisate HGA), known as potential antioxydants. This study enabled us to highlight two degradation pathways of the tyrosol, never yet described to date. Thus, the tyrosol is oxidized via an aryl-dehydrogenase in HPA. This last is hydroxylated either in HGA via a HPA 1-monooxygenase from strain TYRC17, or in DHPA via a HPA 3-monooxygenase from strain HTB24. These ortho-diphenolic compounds are then cleaved by catechol-dioxygenases, and finally degraded. In the presence of transition metals, contained in the Widdel oligo-element solution, the HGA is transformed not biologically, into 2,5-dihydroxybenzaldehyde (gentisaldehyde) which is involved in the pyomelanin formation. Moreover, strain HTB24 is able to produce hydroxytyrosol by aspecific tyrosol hydroxylation, via the same HPA 3-monooxygenase, the latter being induced by the presence of HPA in the medium. Moreover, the study of other bacteria having this enzyme, such as Pseudomonas aeruginosa or Escherichia coli confirmed that they are also able to transform the tyrosol into hydroxytyrosol. These original bioconversions thus open great prospects for the bioremediation for these strongly salted effluents, but also for a promising production of antioxydant molecules with high added value
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Labssita, Youssef. "Conception et synthèse de nouveaux dérivés benzopyroniques et de leurs analogues comme ligands des récepteurs sigma." Toulouse 3, 1996. http://www.theses.fr/1996TOU30025.

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Abstract:
Nous avons dans un premier temps etudie la reduction des derives gamma benzopyroniques en utilisant differents hydrures metalliques mettant ainsi a profit la reactivite et la force de l'hydrure en fonction des differents cations. L'etude de cette reaction et des differentes conditions operatoires, nous ont permis d'une part d'isoler parmi les divers produits reactionnels un couple de d'enantiomeres: le 2-hydroxymethyl-4 chromanol cis dont l'etude stereochimique a ete abordee et d'autre part d'optimiser l'acces a la 2-hydroxymethyl chromone, base de synthese de composes a visee therapeutique. Vu l'interet que peuvent presenter les ligands des recepteurs sigma dans la recherche de nouveaux antipsychotiques et dans l'identification des sites de ces recepteurs, nous nous sommes ensuite interesses a la preparation de nouveaux ligands plus affins. Puisque la benzylpiperazinomethylchromone a presente une affinite de l'ordre du nanomolaire vis-a-vis des recepteurs sigma, nous l'avons donc utilisee comme modele a partir duquel nous avons concu et realise un certain nombre de pharmacomodulations. Ceci nous a conduit a preparer differentes series de composes originaux afin d'ameliorer cette affinite et d'etablir des relations structures-affinites
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Vestalys, Ialy Rojo. "Recherche de marqueurs biochimiques et génétiques de l'adaptation des caféiers cultivés aux variations climatiques." Thesis, Montpellier, 2018. http://www.theses.fr/2018MONTG054/document.

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Abstract:
La baisse de la production et la prolifération des maladies engendrées par le changement climatique dans la caféiculture, particulièrement pour Coffea arabica, conduit à chercher de nouvelles pratiques culturales et étudier la réponse adaptative des caféiers aux modifications environnementales. En se basant sur l’importance des composés phénoliques dans la réponse des plantes aux stress et sur la richesse des caféiers en ces composés antioxydants, la réponse adaptative des caféiers cultivés en plein champ a été étudiée en s’intéressant à l’évolution du contenu des feuilles en ces composés dans différentes conditions de culture simulées par un gradient altitudinal, des cultures sous ombrage ou l’obtention de plants greffés. Les analyses biochimiques montrent que certains composés phénoliques s’accumulent dans les feuilles en réponse à la modification d’un paramètre météorologique spécifique. Ainsi, acides chlorogéniques et flavanols sont plus accumulés en cas de sécheresse alors que les flavonols glycosylés s’accumulent sous forte radiation solaire. La comparaison avec C. canephora permet de valider ces marqueurs. Les analyses transcriptomiques indiquent une différence d’expression des gènes de biosynthèse de ces composés suivant le stade de croissance de la feuille. Elles montrent également que la réponse à la lumière passe par la surexpression de nombreux gènes codant des HSP ainsi que ceux impliqués dans la photosynthèse et la glycosylation des flavonoïdes. Enfin, ces résultats montrent l’intérêt, suivant l’altitude, de l’ombrage et du greffage pour la culture de C. arabica
The decline in production and the proliferation of diseases caused by climate change in coffee growing, especially for Coffea arabica, leads to search new cultural practices and to study the adaptive response of coffee trees to environmental changes. Based on the importance of phenolic compounds in the response of plants to stress and the richness of coffee in these antioxidant compounds, the adaptive response of coffee grown in the field was studied by looking at the evolution of the leaf content in these compounds under different culture conditions simulated by an altitudinal gradient, shaded cultures or obtaining grafted plants. Biochemical analyzes show that certain phenolic compounds accumulate in the leaves in response to the modification of a specific meteorological parameter. Thus, chlorogenic acids and flavanols are more accumulated in case of drought while glycosylated flavonols accumulate under strong solar radiation. The comparison with C. canephora validates these markers. Transcriptomic analyzes indicate a difference in expression of the biosynthesis genes of these compounds according to the stage of growth of the leaf. They also show that the response to light is the overexpression of many genes encoding HSPs as well as those involved in photosynthesis and flavonoid glycosylation. Finally, these results show the interest, according to altitude, of shading and grafting for the cultivation of C. arabica
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Jeanty, Matthieu. "Conception de ligands mixtes mélatoninergiques et sérotoninergiques à structure naphtalénique et azaindolique." Orléans, 2008. http://www.theses.fr/2008ORLE2080.

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Abstract:
La mélatonine est une hormone produite par la glande pinéale durant la nuit. De récentes études ont montré que des agonistes des récepteurs mélatoninergiques (MT1 et MT2) pouvaient être des antidépresseurs efficaces. Ainsi, a été développée l’agomélatine, un puissant antidépresseur commercialisé sous le nom de valdoxan®, agoniste des récepteurs MT1 et MT2, et antagoniste du récepteur 5-HT2C. Le travail de cette thèse a eu pour but d’élaborer un successeur à l’agomélatine possédant un profil pharmacologique similaire. Dans une première partie, des ligands à structure naphtalénique ont été synthétisés. Un composé fluoré s’est révélé intéressant mais malheureusement sa stabilité métabolique s’est avérée insuffisante. Par la suite, la synthèse de structures 4-azaindoliques, proches de la mélatonine, a été envisagée. Notre premier effort a été de trouver des voies de synthèse courtes et efficaces pour l’obtention de la 4-azamélatonine. Cette investigation a débouché sur la mise au point de deux méthodologies distinctes concernant la synthèse de structures 4-azaindoliques substituées en position 3 via, d’une part, la cyclisation de pyridylacétonitriles, et via, d’autre part, la cyclisation de Fischer. L’ensemble de ce travail a permis la mise au point de molécules innovantes dont le profil pharmacologique est prometteur.
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Chardon, Edith. "N-Heterocyclic carbene complexes : toward innovative anticancer agents." Strasbourg, 2011. http://www.theses.fr/2011STRA6265.

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Abstract:
Parmi les agents thérapeutiques utilisés en chimiothérapie, la molécule la plus connue et utilisée dans le monde est le cisplatine ou cis-diamminedichloroplatinum(II) démontrant le potentiel des métaux en chimie médicinale. Malheureusement, le cisplatine engendre de nombreux effets secondaires importants et une résistance cellulaire. Dans la quête de nouveaux agents anticancéreux, les complexes de carbènes N-hétérocycliques (NHC) de métaux de transition constituent des candidats prometteurs. C’est dans ce contexte que s’est inscrit l’objet du projet de thèse qui a consisté en la synthèse et l’étude de nouveaux complexes NHC cytotoxiques de métaux de transition (notamment le platine). Deux nouvelles voies de synthèse simples, reproductibles et facilement modulables ont été développées permettant la fonctionnalisation post-complexation de composés NHC (a) par réaction de cycloaddition 1,3-dipolaire et (b) par substitution sélective de ligand. Ces stratégies de fonctionnalisation ont alors été étendues à l’accrochage des molécules hydrosolubles, d’agents permettant le ciblage sélectif des cellules tumorales par interaction avec des récepteurs spécifiques souvent surexprimés dans le cas des cellules tumorales ou encore d’agents fluorescents. Les activités cytotoxiques de ces nouveaux composés ont été mesurées in vitro sur une variété de lignées cellulaires cancéreuses. Pour la majorité de ces composés, les activités observées sont supérieures à celle du cisplatine et certains ont également démontré une sélectivité vis-à-vis des cellules tumorales. Ces premiers résultats encourageants ouvrent ainsi de nouvelles perspectives thérapeutiques en cancérologie
Among the existing anticancer agents, cisplatin or cis-diamminedichloroplatinum(II), represents the most known and commonly used chemotherapeutic drug worldwide highlighting the potential of metals in medicinal chemistry. However, its clinical effectiveness is also accompanied by severe side toxicities and cell-resistance mechanisms. These therapeutic limitations have encouraged the development of substitutes to cisplatin and have led to the discovery of N-heterocyclic carbene (NHC) complexes of several late transition metals as new anticancer agents with similar to higher in vitro activities than cisplatin. In this context, the present project dealt with the synthesis and the study of novel cytotoxic NHC complexes of some transition metals (mainly platinum). Two simple, reproducible and modular synthetic routes were developed for the easy functionalization post-complexation of NHC derivatives using (a) ruthenium-catalyzed alkyne-azide cycloaddition and (b) ligand substitution. In order to improve the efficacy and selectivity of the NHC complexes, we have extended these strategies of functionalization to the attachment of biologically interesting moieties such as targeting agents, hydrosoluble groups and fluorescent dyes. In vitro cytotoxic activities of these newly synthesized complexes were measured against a wide variety of cancerous cells. The majority of the compounds demonstrated higher activities than the benchmark cisplatin and some were selective toward tumoral cells. These promising early-stage results offer new perspectives in cancer therapy while giving alternatives to the biomedical limitations of cisplatin
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Hugel-Le, Goff Catherine. "Synthèse et étude des systèmes 1-phosphaallyliques : un accès général aux ligands eta3-1-phosphaallyles de MO, W, FE, CO et NI et particulier aux phosphaalcènes." Palaiseau, Ecole polytechnique, 1990. http://www.theses.fr/1990EPXX0003.

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Abstract:
Les systèmes 1-phosphaallyliques, objet de cette thèse, se situent à la croisée de deux grandes familles de composes: les complexes pi-allyliques et les dérivés phosphores ligands de métaux de transition. En premier lieu sera abordé l'aspect synthèse et réactivité des eta3-allyles carbones, suivi d'une présentation des valences et des modes de coordination varies des ligands phosphores. Le but de la thèse sera introduit par les résultats déjà publiés de quelques laboratoires travaillant sur les hétéroallyles. Le chapitre essentiel intitule synthèses effectuées et discussions vise à rassembler les synthèses aboutissant aux complexes eta3-1-phosphaallyles de métaux de transition qui seront scindes en deux: les eta,eta3-1-phosphaallyles du chrome, du molybdène, du tungstène et du fer, et les eta3-1-phosphaallyles du cobalt et du nickel. Ainsi seront mis en lumière les propriétés intrinsèques et la capacite de ces complexes a pouvoir varier leur mode de coordination. Parmi les différents équilibres passés en revue, on remarquera celui de l'isomérisme générant un phosphaalcène à partir d'une simple phosphine vinylique. La conclusion de ce mémoire tentera de résumer l'apport de ces synthèses a la compréhension des 1-phosphaallyles et se posera le problème de leur mise en application en catalyse
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Carbajal, Ida Daniel. "Analyse multicritères de l'impact de la pourriture noble sur la texture et la composition biochimique des raisins de Chenin blanc." Thesis, Angers, 2016. http://www.theses.fr/2016ANGE0061.

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Abstract:
Les vignerons du Val de Loire souhaitent faire évoluer les différents types de vins liquoreux produits actuellement dans leurs appellations en lien avec l’élaboration d’une qualité de raisin correspondant à ces types. Pour cela, il est nécessaire de caractériser objectivement les baies de raisin et leur qualité.Notre étude porte sur le développement d’une méthode multicritères combinant des mesures physiques et biochimiques des raisins, permettant d’identifier et de caractériser différents niveaux de développement de la pourriture noble sur raisins de Chenin blanc dans un objectif de production de vins liquoreux.Pour cela, des raisins correspondant à trois niveaux de pourriture noble ont été sélectionnés, lors de deux millésimes, 2012 et 2013. Des analyses classiques de qualité du raisin ont été réalisées et complétées par des analyses de couleur, de texture et de composés phénoliques.Outre la caractérisation phénolique du Chenin (sain et botrytisé), cette étude met en évidence la présence de myricétine, que l’on retrouve traditionnellement dans les variétés de raisin rouge, et qui semblerait être aussi synthétisée dans les baies de raisins blancs fortement atteintes par la pourriture noble.Nous avons également montré qu’une analyse multicritères permet une très bonne différenciation des baies plus ou moins botrytisées. Une combinaison des teneurs en myricétine, astilbine et glycérol permet notamment une très bonne discrimination des baies en fonction de leur niveau de botrytisation. Enfin, nous avons détectés de nouveaux composés dans les baies suite à l’attaque fongique, qui pourraient provenir de réactions d’oxydation. Ces résultats restent toutefois à confirmer
Winemakers from the Loire valley are willing to improve the various types of sweet wines currently produced in their designation of origin altogether with the elaboration of grape quality that corresponds to these wines. For that purpose, it is necessary to objectively characterize the grapes and their quality. Our study implies the development of a multcriteria method that combines physical and biochemical measures on the grape, allowing the identification and characterization of the different levels of noble rot development on Chenin blanc grapes for the production of sweet wines. To do so, grapes corresponding to three noble rot levels were selected during two vintages, 2012 and 2013. Classical analysis of grape quality were carried out and complemented with color, texture and phenolic composition analysis. Besides the phenolic characterization of Chenin (healthy and botrytised), this study revealed the presence of myricetin, that is traditionally detected on red grape varieties, and that seems to be also synthetized on white grapes strongly affected by noble rot. We have also showed that a multicriteria analysis brings a very good differentiation of grapes more or less botrytised. A combination of myricetin, astilbin and glycerol concentrations showed a significantly good discrimination of grapes according to botrytisation level. Finally, we have detected new compounds on the grapes after the fungal attack that could be the result of oxidative reactions. These results are to be confirmed
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Miguel, Clave Ignacio de. "Utilisation des composés perfluorés en chromatographie en tant qu'additifs et phases stationnaires." Toulouse, INSA, 1989. http://www.theses.fr/1989ISAT0029.

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Abstract:
Ce travail a porte sur quelques aspects des proprietes chromatographiques des composes perfluores en tant qu'additifs dans la phase mobile et comme phases stationnaires perfluorees. Nous avons d'abord evalue l'utilisation de melanges complexes d'acides carboxyliques perfluores a courte chaine comme agents de paire d'ions pour la chromatographie en phase inverse des aminoglycosides. L'etude de l'efficacite de la separation en fonction de la composition de la phase mobile nous a permis de definir des phases mobiles aqueuses adaptees a la purification preparative des aminoglycosides. Nous nous sommes ensuite interesses au comportement chromatographique des phases stationnaires perfluorees vis-a-vis des composes perfluores et perhydrogenes. Nous avons demontre que ce comportement etait directement lie a l'existence d'un phenomene de segregation entre composes perfluores et perhydrogenes. Les resultats obtenus nous ont permis de modeliser ce phenomene de segregation en fonction des caracteristiques physico-chimiques de phases perfluorees greffees et des solutes
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Tondu, Sylvie. "Synthèse et étude biochimique d'hormones organométalliques : application à la détection du récepteur de la progestérone." Paris 6, 1986. http://www.theses.fr/1986PA066068.

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Abstract:
Synthèse de dérivés de métaux carbonyles d'hormones stéroïdes (progestatifs et glucocorticoïdes). Etude de l'affinité de ces produits pour les 2 récepteurs étudiés, avec sélection de 2 marqueurs potentiels. Spectrométrie IR.
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Bauer, Martin. "Membrane functionalisation using polyrotaxanes with amphiphilic cyclodextrins." Strasbourg, 2011. http://www.theses.fr/2011STRA6190.

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Abstract:
Ce travail est destiné à la conception et à la caractérisation d’une nouvelle famille de ligands attachés, appelé “Sliding Tethered Ligands” (STLs). Ils sont à base de complexes topologiques entre des polymères et des cyclodextrines amphiphiles (CD), qui peuvent être insérées dans les membranes phospholipidiques. Au début, nous étudions les propriétés d’insertion membranaire des dérivés de CD amphiphiles modifiées avec du cholestérol, qui sont des ancres membranaires appropriées pour les STLs. Avec l’aide de la réflectivité de neutrons on peut démontrer que les résidus de CD montrent une remarquable adaptabilité de conformation et que les cavités de CD restent accessibles lors de l’insertion dans des membranes modèles lipidiques. Nous avons développé une voie de synthèse pour assembler le STL à partir des polyrotaxanes avec un très bas nombre contrôlé des CDs mono-modifiées avec un groupe azido, enfilées sur une chaine de polyéthylène glycol (PEG). En utilisant de nouvelles méthodes in situ les polyrotaxanes sont bouchonnés avec des ligands d’adamantane, qui peuvent être reconnus par des récepteurs de beta-CD. Par ailleurs, une ancre membranaire de cholestérol est jointe aux CDs complexées afin de permettre au STLs à s’insérer dans les membranes. Nous démontrons que les STLs sont très bien ancrés dans des membranes modèles phospholipidiques (DPPC). Pour des densités de polymère suffisamment élevées les STLs forment des brosses de polymères qui suivent les lois d’échelle prédite par la théorie du champ moyen. En utilisant une machine de force, nous montrons que des membranes modèles modifiées avec des STLs et des récepteurs de cholestérol beta CD donnent lieu aux profils d’interaction typiques entre des ligands et des récepteurs
This work is aimed at the design and characterisation of a new family of tethered ligands, called sliding tethered ligands (STLs). They are based on topological complexes between polymers and amphiphilic cyclodextrins (CDs), which can be inserted into phospholipid membranes. At first we investigate the membrane insertion properties of amphiphilic cholesteryl CD derivatives, which are suitable membrane anchors for the STLs. With the help of neutron reflectivity it can be demonstrated that the CD residues show a remarkable conformational adaptability and that the CD cavities remain accessible upon insertion into lipid model membranes. We have developed a synthetic pathway to assemble the STLs from polyrotaxanes with a controlled low number of mono-modified azido-alpha-CDs, threaded on a polyethylene glycol (PEG) chain. Using newly developed in-situ capping methods the polyrotaxanes are endcapped with adamantane ligands, which can be recognized by a beta-CD receptor. Furthermore a cholesteryl anchor is attached to the threaded CDs in order to enable the STLs to insert into membranes. We demonstrate that STLs readily insert into phospholipid (DPPC) model membranes using IR Absorption Reflection Spectroscopy and investigating the film morphology by Brewster Angle Microscopy and Atomic Force Microscopy. Applying neutron reflectivity it is shown, that for sufficiently high polymer densities the STLs form polymer brushes, which follow the scaling laws predicted by the mean field theory. Using the surface force apparatus it is evidenced that model membranes modified with STLs and cholesteryl beta-CD receptors give rise to typical tethered ligand - receptor interaction profiles
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Bouquillon, Sandrine. "Nouveaux complexes à ligands isonitrile CNCH2R (R = triméthylsilyle, tosyle). Application en médecine nucléaire." Toulouse 3, 1993. http://www.theses.fr/1993TOU30036.

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Abstract:
Les ligands isonitriles donneurs et accepteurs permettent l'elaboration de complexes metalliques stables. Le complexe (#9#9#mtc(mibi)#6)+(mibi=methoxyisobutylisonitrile) est utilise en imagerie cardiaque de routine. L'utilisation de complexes de rhenium en imagerie et en therapie connait un developpement croissant. L'introduction d'un ou plusieurs ligands isonitriles dans des complexes de rhenium permettra d'evaluer leur effet therapeutique. L'objectif de cette these est double: d'une part, etudier la complexation des deux isonitriles fonctionnalises cnch#2r (r=trimethylsilyle, tosyle) vis-a-vis de metaux de transition de la premiere serie (cu, zn, mn, ag) et du rhenium, et d'autre part, effectuer les premiers essais biologiques avec les complexes du #9#9#mtc. Le chapitre i resume la bibliographie decrivant les caracteristiques de l'imagerie medicale, les isonitriles et leur complexation avec les metaux de transition et expose l'objectif de cette these. Dans le chapitre ii est decrite la synthese de nouveaux isonitriles a substituants silicies. La reaction du trimethylsilylmethylisonitrile et du tosylmethylisonitrile avec les sels de cuivre, manganese, zinc et d'argent met en evidence cinq complexes originaux de cuivre et trois complexes originaux de manganese qui sont decrits dans le troisieme chapitre. La reactivite du trimethylsilylmethylisonitrile vis-a-vis de complexes monomeres et dimeres de rhenium, decrite dans le chapitre iv, permet de montrer l'originalite de ce ligand. Enfin, le chapitre v detaille les essais biologiques des complexes formes du #9#9#mtc et des deux ligands isonitrile et donne les resultats de biodistribution chez le rat
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El, Kazzouli Saïd. "Synthèse de divers hétérocycles sur support polymère à partir d'un synthon commun : élaboration et évaluation pharmacologique de ligands mélatoninergiques à structure imidazo[1,2-a]pyridinique." Orléans, 2004. http://www.theses.fr/2004ORLE2025.

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Abstract:
Ce travail se divise en deux parties : La première est consacrée à la synthèse sur support polymère de divers hétérocycles à partir d'un synthon commun. Dans cet esprit, une méthode originale permettant de générer une a-bromocétone est développée. Par la suite, cette entité est utilisée pour la préparation de thiazoles, d'imidazo[1,2-a]pyridines et pyrimidines en chauffage classique et sous irradiation micro-ondes. Afin d'obtenir des composés diversement fonctionnalisés, plusieurs réactions ont été optimisées sur phase solide telles que les séquences de couplage catalysées par le palladium. La deuxième partie est réservée à la préparation de nouveaux ligands mélatoninergiques. Dans ce cadre, deux synthèses ont été mises au point conduisant à des analogues de la 2-phénylmélatonine à structure imidazo[1,2-a]pyridinique. Deux composés sur lesquels des chaînes amide ou rétroamide sont introduites ont été élaborés et ont fait l'objet d'études pharmacologiques.
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Beghin, Vincent. "Étude de la matière organique et du réseau trophique en estuaire de Seine : utilisation des marqueurs biochimiques (acides gras et stérols)." Lille 1, 1999. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/1999/50376-1999-459.pdf.

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Abstract:
Cette étude, menée dans le cadre du programme Seine Aval, porte sur le régime alimentaire de deux organismes clefs du réseau trophique dans la zone oligohaline (0,5
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Louche, Julien. "Régulation de la sécretion des phosphatases acides des champignons ectomycorhiziens et mobilisation de phosphore organique dans la rhizosphère des arbres forestiers : approches biochimiques et moléculaires." Montpellier SupAgro, 2009. http://www.theses.fr/2009NSAM0026.

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Abstract:
En culture pure, certains champignons ectomycorhiziens sont capables de sécréter de grandes quantités de phosphatase acide (AcPase). L’hypothèse centrale de ce travail est que ces enzymes joueraient un rôle déterminant dans la mobilisation de P organique (Po) des sols forestiers. Pour étudier cette hypothèse nous avons utilisé le basidiomycète ectomycorhizien modèle Hebeloma cylindrosporum, reconnu pour sa forte capacité de sécrétion d’AcPase in vitro. La séparation des protéines sécrétées dans le milieu de culture par une résine échangeuse de cations a permis l’identification de quatre fractions d’activité phosphatase. Les AcPases contenues dans ces fractions ont libéré du P inorganique (Pi) à partir de Po extrait d’un podzol acide. Les vitesses d’hydrolyse sont accélérées quand le sol est préalablement autoclavé, suggérant que les pools de Po microbiens libérés par l’autoclavage seraient un meilleur substrat pour les AcPases de H. Cylindrosporum. Un gène codant pour une AcPase, nommé HcPhoA, a été identifié dans une banque d’ADNc de H. Cylindrosporum. L’expression de HcPhoA est fortement augmentée dans le mycélium en culture pure en réponse à la déficience en Pi, indiquant que la production de HcPhoA est régulée au niveau transcriptionnel. Cependant, la transcription de HcPhoA survient après celle de HcPT1, qui code un transporteur H+:Pi. La mycorhization du Pin maritime par H. Cylindrosporum a augmenté la croissance et le prélèvement net de P des plantes
Some ectomycorrhizal fungi are able to release appreciable amounts of acid phosphatase (AcPase) when grown in pure culture. The main hypothesis of this work is that these enzymes would play an important role in organic P (Po) mobilisation of forest soils. To study this hypothesis, we used the model ectomycorrhizal fungus, Hebeloma cylindrosporum, already known for its great capability to release AcPase in vitro. The separation of secreted proteins in the culture medium with a cation exchange resin made it possible to identify four AcPase fractions. AcPases from each fraction released inorganic P (Pi) from Po extracted in acidic podzol. The rates of Pi release were increased when the soil was previously autoclaved, suggesting that pools of microbial Po released after soil autoclaving could be a better substrate for H. Cylindrosporum AcPases. A gene coding for an AcPase, named HcPhoA, was identified from a cDNA library of H. Cylindrosporum. Expression level of HcPhoA was strongly increased in the mycelium grown in pure culture as a response to Pi deficiency, indicating that the regulation HcPhoA production was transcriptional. However, HcPhoAexpression level increased after that of HcPT1 coding for a H+:Pi transporter. The mycorrhizal association between H. Cylindrosporum and maritime pine increased plant growth and net Paccumulation from an acidic podzol low in Pi. The increase of HcPhoA in ectomycorrhizae could indicate a role of HcPhoA in the mineralisation of soil Po for the host plant
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Amiour, Nardjis. "Etude biochimique et génétique de la diversité des protéines de réserve du triticale hexaploïde, de leur influence sur les caractéristiques technologiques et recherche de facteurs impliqués dans la dureté du grain par une analyse protéomique des protéines amphiphiles du blé tendre." Clermont-Ferrand 2, 2002. http://www.theses.fr/2002CLF22348.

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Abstract:
L'effet des protéines sur la valeur en panification a été illustré dans ce travail par l'étude des protéines de réserve du triticale hexaploïde. Avant d'évaluer cet effet, nous avons procédé à une étude du déterminisme génétique des glutélines et sécalines (protéines de réserve) du triticale hexaploïde dans dix descendances F2. Les allèles identifiés ont permis de révéler la diversité de ces protéines au sein d'une collection de 134 variétés de triticale héxaploïde cultivées en Europe et de déterminer 96 diagrammes différents à partir des 40 allèles répertoriés. Ces allèles ont aussi été utilisés pour une étude des distances génétiques entre ces variétés et pour retracer l'origine de tricicales cultivés. L'effet d'une sécaline de haut poids moléculaire, identifiée chez le triticale, sur la qualité en panification a été étudié dans des lignées substituées de blé tendre où les 3 chromosomes du groupe 1 du blé 1A, 1B et 1D ont été remplacés par le chromosome 1R du seigle. La substitution 1R(1A) semble avantageuse pour la valeur en panification. Pour essayer d'appréhender les facteurs biochimiques qui interviennent dans la variation de la dureté du grain, une analyse protéomique des protéines amphiphiles a été conduite. Elle a permis de cartographier les gènes codant pour 72 spots (taches protéiques) sur 15 chromosomes, de déterminer 96 PQL (Protein Quantity Loci) répartis sur l'ensemble du génome. Ces PQL contrôlent la régulation et la variation quantitative de ces spots. 74 spots spécifiques et communs aux deux parents de la population étudiée (population ITMI) ont été identifiés après spectrométrie de masse et interrogation des bases de données. Comme les puroindolines, la majorité des spots correspondent à des protéines associées aux membranes et/ou impliquées dans la défense des plantes contre les agressions extérieures. Ces résultats vont permettre de rechercher parmi ces protéines celles qui sont impliquées dans la variation de la dureté du grain
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Mehdi, Ahmad. "Utilisation en chimie du silicium et du phosphore du 2,6-bis[(diméthylamino)méthyl]phényle, ligand potentiellement bis-chélatant : Etude de composés hypercoordonnés et stabilisation d'espèces très réactives." Montpellier 2, 1994. http://www.theses.fr/1994MON20267.

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Abstract:
Le ligand 2,6-bis (dimethylamino)methyl phenyle a ete utilise pour etudier l'extension de coordination au niveau des atomes de silicium et de phosphore. Nous avons prepare le (2,6-bis(dimethylamino)methyl phenyl) (1,2 benzene-diolato)phosphorane composes qui sont hexacoordonnes aussi bien a l'etat solide qu'en solution. L'etude en rmn dynamique de #1h a montre que le groupement nme#2 libre deplace le groupement lie par l'intermediaire d'un derive heptacoordonne. De plus nous avons montre que ce silicate presente un pouvoir basique superieur a celui de l'eponge a proton. Nous avons prepare le bis (2,6-bis (dimethylamino)methyl phenyl)silane (comportant deux ligands sur l'atome de silicium). Nous avons egalement prepare des ions silylenium stabilises par chelation intramoleculaire des deux groupements dimethylamino sur le silicium pour donner des ions siliconium diversement substitues. Dans le cadre de l'analogie silicium-phosphore, nous avons prepare des ions phosphenium ainsi que des ions phosphynium stabilises par deux chelations n-p intramoleculaires. Nous avons egalement montre que l'extension de coordination au niveau de l'atome de phosphore modifie la reactivite de la liaison p-h des phosphanes hypercoordonnes par rapport aux phosphanes classiques
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Berrada, Sai͏̈d. "Etude de la sensibilité de Psylla pyri L. (Homoptera : Psyllidae) aux produits phytosanitaires et mécanismes biochimiques de résistance aux organophosphorés." Toulouse 3, 1994. http://www.theses.fr/1994TOU30021.

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Abstract:
L'utilisation des insecticides dans la protection des vergers de poiriers, a ete conduite depuis des annees afin d'eradiquer le ravageur cle de ces cultures. Pourtant, le potentiel reproducteur du psylle reste un facteur important de son succes. Avec l'emploi abusif d'insecticides de plus en plus puissants, le ravageur s'est alors arme d'un moyen de lutte lui assurant une defense efficace contre les agressions xenobiotiques. Contrairement a la situation preoccupante de la resistance generalisee des psylles aux insecticides en amerique du nord, ce phenomene n'est pas encore en france un probleme d'actualite. La prise de mesures permettant de preserver l'efficacite des insecticides dans ce pays s'avere par consequent de toute urgence. La lutte chimique restant aujourd'hui le seul gage d'une production de qualite dans le verger commercial. Le present travail realise au laboratoire dans le cadre d'une lutte chimique raisonnee, montre, dans une premiere partie, que le rendement de l'amitraze, le dnoc et le monocrotophos dans la nature peut etre revalorise en tenant compte de la composition des populations de psylles presentes au moment des interventions phytosanitaires, et d'un facteur ecologique important, la temperature. Dans une deuxieme partie, le maintien d'une pression de selection d'un organophosphore, le monocrotophos, montre que le psylle possede un potentiel pour developper une resistance a cette famille d'insecticides. Une investigation basee a la fois sur l'etude de la resistance croisee au monocrotophos, le synergisme de sa toxicite par des inhibiteurs enzymatiques, et l'analyse d'activite de quatre enzymes, a permis de comprendre les mecanismes de resistance developpes dans la souche de psylles selectionnee a l'insecticide. La presence d'une acetylcholinesterase modifiee, moins sensible a l'inhibition du monocrotophos (70 fois) combinee avec une legere augmentation du metabolisme des monooxygenases a cytochrome p-450 (5 fois) etaient responsables du haut niveau de resistance developpe par les insectes resistants (150 fois)
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Maziani, Pierre-Xavier. "Vers une meilleure compréhension du mécanisme de transfert de soufre pour la maturation des formiate déshydrogénases microbiennes." Thesis, Aix-Marseille, 2019. http://www.theses.fr/2019AIXM0174.

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Abstract:
Les formiate déshydrogénases (FDH) utilisent un cofacteur à molybdène (Moco) pour convertir de façon réversible le formiate en CO2. Le Moco des FDH doit être sulfuré par la protéine soufre-transférase dimérique FdhD. Chez Escherichia coli, la protéine FdhD possède une boucle flexible par monomère, chacune portant deux cystéines essentielles et assurant le transfert de soufre depuis la cystéine désulfurase dimérique IscS vers le Moco. Nous avons étudié le mécanisme de transfert de soufre selon deux axes de travail : i) les bases structurales de l’interaction FdhD/IscS, et ii) l’importance fonctionnelle des deux boucles flexibles de FdhD. Par des approches de biochimie et de biophysique, nous avons montré que l’interaction FdhD/IscS est à la fois hautement dynamique et hautement affine, et que le complexe a une stœchiométrie FdhD4 -IscS2, interrogeant sur le rôle de chacune des boucles flexibles puisque deux boucles sont présentes pour transférer un seul atome de soufre depuis IscS. À l’aide d’un équivalent chimérique de la protéine FdhD nous avons montré qu’une seule boucle catalytique est suffisante pour sulfurer le Moco efficacement, et que le variant avec une seule cystéine par boucle reste actif bien que moins efficacement. De plus, nous avons montré que des homologues de FdhD possédant une seule cystéine par boucle sont actifs. En conclusion, nous proposons un modèle de sulfuration du Moco par FdhD impliquant deux résidus cystéines soit provenant de la même boucle catalytique, soit provenant chacun d’une boucle catalytique différente. Dans ce dernier cas, les boucles coopéreraient afin de fournir les deux cystéines requises pour le transfert de soufre
Formate dehydrogenases (FDH) use a molybdenum cofactor (Moco) to convert reversibly formate into CO2. FDH’s Moco must be sulfurated by the dimeric sulfur-transferase protein FdhD. In Escherichia coli, the protein FdhD possesses one flexible loop per monomer, each one bearing two essential cysteines and assuring sulfur transfer from the cysteine desulfurase IscS to the Moco. We studied the sulfur transfer mechanism through two working axis: i) the structural basis of FdhD/IscS interaction, and ii) the functional importance of the two flexible loops of FdhD. Through biochemistry and biophysics approaches, we showed that FdhD/IscS interaction is highly dynamic and also shows a high affinity. We also showed that the complex has a FdhD4-IscS2 stoichiometry, questioning on the role of each flexible loop since two loops are available for transfering only one sulfur atom from IscS. Thanks to a chimeric equivalent of the FdhD dimer, we showed that only one catalytic loop is sufficient to sulfurate Moco efficiently, and that the variant possessing only one cysteine per loop is active, though less efficient. Also, we showed that FdhD homologs possessing only one cysteine per loop are active. To conclude, we propose a model of Moco sulfuration by FdhD involving two cysteine residus originating either from the same loop, or from two different loops. In the latter case, the two loops would cooperate to provide the two cysteines required for sulfur transfer
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Grosbellet, Claire. "Evolution et effets sur la structuration du sol de la matière organique apportée en grande quantité." Phd thesis, Université d'Angers, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00487882.

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Abstract:
Les ANTHROPOSOLS RECONSTITUÉS sont définis comme des sols fortement modifiés par l'activité humaine, et fabriqués à partir de matériaux naturels ou transformés. Ces sols présentent une grande variabilité spatiale et temporelle de leurs propriétés physiques, et sont caractérisés par l'incorporation de grandes quantités de matière organique. Les mécanismes de décomposition de cette matière organique sont étudiés, ainsi que son influence en termes de structuration du sol et de modification des propriétés hydriques. Des mélanges avec trois produits organiques (compost de déchets verts, compost de boue de station d'épuration et de broyat de palette, tourbe blonde) incorporés à 20 ou 40% en volume dans une terre végétale, sont réalisés et placés en bac de 600L sur un site expérimental en conditions climatiques naturelles pendant 2 ans. Des prélèvements effectués 5, 12 et 24 mois après la mise en place du site ont permis de mesurer la décomposition de la matière organique (teneurs en C, fragmentation physique, composition biochimique et potentiel de minéralisation), la structuration des mélanges (masse volumique apparente, espace poral et stabilité structurale) et leurs propriétés hydriques (rétention d'eau et conductivité hydraulique à saturation). Les résultats montrent que la teneur en matière organique diminue au cours du temps et que des modifications importantes de sa composition biochimique apparaissent : augmentation de la teneur en solubles, et une diminution de la teneur en lignine dans les fractions de matière organique les plus grossières. Pour les mélanges à base de compost, ces changements s'accompagnent d'une diminution du potentiel de minéralisation de la matière organique. Pour les mélanges à base de tourbe, le potentiel de minéralisation évolue peu, puis augmente, ce qui correspond plutôt à une "levée d'inhibition" de la dégradation de la matière organique. Un modèle d'évolution de la matière organique est proposé et ses paramètres ont été ajustés sur les valeurs expérimentales mesurées dans les conditions contrôlées et naturelles. En se dégradant, la matière organique agit fortement sur la structuration des mélanges à base de compost, avec notamment une augmentation de la stabilité structurale, associée à une réorganisation de l'espace poral. L'apparition d'une macroporosité est d'autant plus importante qu'elle est majoritairement constituée de pores allongés et tortueux, impliqués dans le fonctionnement hydrodynamique. Cette structuration des mélanges s'accompagne d'une augmentation de la capacité de rétention d'eau, et d'une légère amélioration de la conductivité hydraulique à saturation. Les mesures directes de la porosité par analyse d'image sont comparées avec le modèle de van Genuchten ajusté sur les courbes potentiel / teneur en eau et semblent bien corrélées. En revanche on ne mesure pas d'effet de la tourbe sur la structuration du mélange. Si les effets immédiats de l'incorporation de matière organique sont similaires pour les composts et la tourbe, les composts induisent en 24 mois une structuration du sol, tandis que la tourbe n'a pas d'effet structurant. Les résultats les plus intéressants en terme de structuration sont obtenus pour les doses de 40% de compost.
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Maaliki, Carine. "Nouveaux ligands phospho-carbonés : synthèse et chimie de coordination." Toulouse 3, 2012. http://thesesups.ups-tlse.fr/1721/.

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Abstract:
La thématique de recherche développée au cours de ce doctorat concerne l'élaboration de nouveaux ligands à caractère donneur extrême en vue d'applications en catalyse. La première partie de ces travaux consiste à la synthèse de ligands phosphorés pauvres en électrons, plus particulièrement des imidazoliophosphines qui représentent des phosphines cationiques où la charge positive portée par un noyau imidazolium est conjuguée avec l'atome de phosphore. De ce fait, deux stratégies de synthèse ont été mises en place : (a) modifier les substituants de la partie phosphorée ou (b) introduire une deuxième charge cationique. Ces deux méthodes ont conduit à la préparation de trois types de ligands pauvres : les amidiniophosphonites, les di-amidiniophosphines et les hydroxy-phosphines cationiques. La limite de la coordination de ces nouveaux ligands pauvres en électrons a aussi été mise en évidence en série rhodium (I). A l'opposé, la seconde partie présente la synthèse de ligands riches en électrons de type ylures de phosphonium et plus précisément, des bis-ylures de diphosphonium. La préparation à partir des motifs 1,2- ou 1,3-diphénylphosphinobenzène et la coordination de ces espèces ont été étudiées. De nouveaux ylures de phosphoniums chiraux ont été également envisagés à partir de leurs précurseurs phosphoniums. La troisième partie s'intéresse à la synthèse de ligands hybrides riches-pauvres par leurs extrémités " électroniquement " opposées et présentant les caractéristiques des deux premières catégories de ligands développés. Des ligands bidentes à extrémités mixtes du type NHC - amidiniophosphine ont ainsi été préparés dans l'optique d'applications catalytiques mais aussi photo-physiques (transfert de charge). Ces nouveaux ligands à caractère donneur extrême, pauvres en électrons pour les amidiniophosphines, et riches en électrons pour les ylures de phosphonium, ouvrent ainsi de nouvelles perspectives en catalyse
The project developed during this PhD thesis aims at the elaboration of novel ligands with extreme donor character for applications in catalysis. The first part of this work, reports on the synthesis of electron-poor phosphorus ligands especially imidazoliophosphines. The positive charge of the imidazolium moiety of these ligands is conjugated with the phosphorus atom. Thereby, two synthesis methods were developed; while the first consists on the modification of the substituents at the phosphorus atom, the second aims to introduce an additional cationic charge. Both methods have yielded three types of electron-poor ligands, namely the amidiniophosphonites, the di-amidiniophosphines and the cationic hydroxyphosphines. The limits of the coordination of these ligands have been evidenced by the preparation of a series of rhodium (I) complexes. By marked contrast, the second part of this project, concerns the synthesis of electron-rich phosphonium ylide ligands, more particularly the diphosphonium bis-ylides. These ligands were elaborated from the 1,2- or 1,3-diphenylphosphinobenzene bridge, prior to complexation. Preparation of chiral phosphonium ylides were also considered. Finally, the third part of this work focuses on the elaboration of hybrid "rich-poor" ligands having a carbene (NHC) and an amidiniophosphine coordinating extremities. These hybrid bidente ligands were developed for catalytic but also for photo-physic (charge transfer) applications. These new ligands with extreme donating character, electron-poor for the amidiniophosphines, and electron-rich for phosphonium ylides, open interesting perspectives in catalysis
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Parmenon, Cécile. "Synthèse et évaluation pharmacologique de nouveaux ligands des récepteurs activés par les proliférateurs de peroxysomes pour le traitement du diabète de type II et du syndrome métabolique." Tours, 2006. http://www.theses.fr/2006TOUR3801.

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Abstract:
Le diabète de type II, maladie métabolique chronique aux complications invalidantes, connaît actuellement une progression à caractère épidémique. Ces dix dernières années, une meilleure compréhension des mécanismes clés de sa pathogenèse a permis l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques. Les PPARs, dont il existe trois isoformes (α, γ, δ), appartiennent à la superfamille des récepteurs nucléaires et possèdent des effets pleïotropes notamment sur le métabolisme énergétique. Ainsi, des dérivés de la 4,4-diméthyl-1,2,3,4-tétrahydroquinoléine ont été synthétisés selon l'optimisation des différents éléments structuraux essentiels à l'activation des PPARs. L'activité pharmacologique de ces composés a d'abord été évaluée in vitro. De nouveaux agonistes mixtes PPARα/γ et des Modulateurs Sélectifs du PPARγ ont ainsi été identifiés. Les effets hypoglycémiants et hypolipémiants des produits les plus prometteurs ont alors été déterminés in vivo chez la souris ob/ob
Type 2 diabetes, a chronic metabolic disease with disabling complications, is assumed to be reaching epidemic proportions. For the past decade, the emerging knowledge of its key pathogenic mechanisms has led to the identification of a number of molecular drug targets. Peroxisome Proliferator-Activated Receptors (PPARs), consisting on three subtypes PPARα, PPARγ, PPARδ, belong to the nuclear receptor superfamily with pleiotropic effects especially on energetic metabolism. Following a common model of PPAR ligands, we synthesized novel 4,4-dimethyl-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-based Selective PPARγ Modulators and PPARα/γ dual agonists optimizing each essential structural elements: the acidic head, the linker and the hydrophobic tail. After in vitro evaluation, the hypoglycemic and hypolipidemic effects of the most promising compounds were tested in vivo in ob/ob mice
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Bourles, Erwan. "Aptitude variétale des pommes à la transformation : Recherche d'indicateurs biochimiques de l'évolution de la texture et de marqueurs d'intérêt nutritionnel." Phd thesis, Université d'Angers, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00538900.

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Abstract:
La problématique de cette thèse repose sur la caractérisation de l'aptitude variétale des pommes à la transformation industrielle. Trois objectifs principaux ont guidé cette étude. Le premier objectif était d'identifier parmi dix variétés de pommes, celles étant les plus aptes à deux types de transformation industrielle : la 5ème gamme et la spécialité fruitière. Cette sélection a été effectuée par une analyse des propriétés mécaniques des fruits avant et après transformation. Au final, cinq variétés différentes ont été choisies pour chaque type de procédé. Le deuxième objectif était d'évaluer l'incidence de la maturité des fruits en post-récolte ainsi que la durée des traitements thermiques appliqués, sur les propriétés mécaniques, sensorielles et les marqueurs biochimiques en lien avec l'évolution de la texture des produits transformés. La caractérisation physique et sensorielle a permis de confirmer le fort impact du génotype des pommes sur la qualité des produits finis. L'analyse des polysaccharides pariétaux a mis à jour une solubilisation des composés pectiques liée au stockage et à la cuisson des fruits. Le troisième objectif a été de réaliser un suivi du devenir de certains polyphénols ainsi que leur activité, en fonction de la variété, et au cours de la transformation industrielle. Le procédé 5ème gamme préserve globalement ces composés. En revanche pour le procédé « spécialité fruitière », une dégradation est observée sur certaines variétés.
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Lisena, Jérôme. "Nouveaux complexes pince indényle et indolyle de palladium : préparation et réactivité." Toulouse 3, 2013. http://thesesups.ups-tlse.fr/2013/.

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Abstract:
L'objectif de cette thèse est le développement et l'étude d'une nouvelle famille de complexes pince basée sur les squelettes indène et indole. Ces dernières années, les complexes pince ont pris une place importante dans le domaine de la chimie organométallique. Ainsi, de nombreuses applications et propriétés de premier ordre leur ont été découvertes. Cela a alors encouragé une dynamique de développement de nouvelles structures pince. C'est dans ce contexte que s'inscrit cette thèse. Le premier chapitre fait un point bibliographique sur les complexes pince, les voies principales de préparation et quelques exemples d'applications originales (catalyse, stabilisation d'entités hautement réactives, études mécanistiques). Pour finir, il introduit l'apparition de la plateforme pince indényle au sein de l'équipe LBPB du LHFA. Le deuxième chapitre expose la mise en place de complexes SCS de type indényle et indénylidène de palladium (II). Une étude mécanistique pour la formation de ces complexes met alors en évidence que l'activation de la liaison Csp3-H est préférentielle à celle de la liaison Csp2-H. Un dérivé méthylé du pro-ligand pince est alors préparé pour bloquer l'accès à la liaison Csp3-H et confirme la faisabilité de l'activation directe de la liaison Csp2-H centrale avec la formation d'un complexe de type méthyle-indényle SCS de palladium. Dans le troisième chapitre, un nouvelle structure pince est développée à partir de l'indole. Ce nouveau pro-ligand permet de compléter la série de complexes pince indényle, indolyle et indénylidène, avec un panel de propriétés structurales et électroniques différentes. Pour finir ce chapitre, une étude du caractère non-innocent de ce nouveau système met en évidence l'inertie du doublet non-liant de l'azote. Dans le dernier chapitre, les trois plateformes sont comparées d'un point de vue structural, avec le co-ligand PPh3, et électronique, avec le monoxyde de carbone, pour étudier l'influence de chaque ligand pince sur le centre métallique. Les réactions d'hydroamination d'acrylonitrile et d'allylation d'imine permettent ensuite de discriminer les systèmes en fonction de leurs propriétés électroniques et du mécanisme réactionnel mis en jeu
The aim of this thesis is to develop and study a new family of pincer complexes based on indene and indole skeletons. In recent years, pincer complexes commanded much attention in the field of organometallic chemistry. Many important applications and properties were discovered and this contributes to the dynamic in the development of new pincer structures. The first chapter presents a bibliographic introduction of pincer complexes, the principal way of preparation and some original applications (catalysis, high reactive compound stabilization, mechanistic studies). Then, the development of the indenyl pincer complexes in the LBPB group of the LHFA is introduced. The second chapter contains the synthesis of SCS indenyl and indenylidene palladium (II) complexes. A mechanistic study of the formation of these complexes shows that the Csp3-H bond is activated preferentially compared to the Csp2-H bond. Therefore, a methyl substituted ligand is prepared in order to block the pathway of Csp3-H bond activation. It demonstrates the feasibility of the direct activation of the central Csp2-H with subsequent formation of a methylindenyl palladium complex. In the third chapter, a new ligand structure is developed starting from the indole skeleton. This new pro-ligand completes the serie of indenyl, indolyl and indenylidene complexes, which exhibit a range of different structural and electronic properties. Finally, the non-innocent character of this new complex is studied and proves the inertia of the lone pair of the nitrogen. In the last chapter, the influences of the three platforms are compared from a structural point of view, in all cases with the PPh3 co-ligand. The electronic properties are examined using carbon monoxide as spectroscopic probe. Hydroamination of acrylonitrile and allylation of imine are then carried out to distinguish the systems according to their electronic properties and their mechanism
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Duquesnoy, Isabelle. "Etude agrophysiologique, biochimique, protéomique de l'impact de l'arsenic inorganique pentoxyde et trioxyde chez 4 espèces végétales : 2 espèces annuelles (Lycopersicum esculentum et Zea mays) et deux espèces pérennes (Agrostis tenuis et Dechampsia cespitosa)." Clermont-Ferrand 2, 2009. http://www.theses.fr/2009CLF21976.

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Abstract:
L'arsenic est un métalloïde naturellement présent dans l'environnement, majoritairement sous formes inorganiques (arsenate (As(V) et arsenite (As(III) qui se trouvent être les plus toxiques pour les organismes vivants posant ainsi un réel problème de santé publique. Différentes méthodes de bio-réhabilitation des sols contaminés sont en cours de développement. Toutefois, la phytoremédiation, réhabilitation par les plantes, est complexe et les mécanismes de tolérance mis en place par les végétaux à la base du procédé ne sont pas vraiment élucidés. Ce travail a pour pour objectif de contribuer à la compréhension des mécanismes de toxicité et de tolérance chez différentes espèces dites sensibles et tolérantes. L'analyse d'un ensemble de paramètres physiologiques, biochimiques et protéomiques a été conduite chez 2 espèces annuelles cultivées (L. Esculentum et Z. Mays) et 2 espèces pérennes endémiques (A. Tenuis et D. Cespitosa) à travers différentes conditions de milieux hydroponiques arséniés (associant forme d'As (As(V) et As(III)), concentrations (134 et 668 µM) et pH (4-7 et 9). Une inhibition de paramètres de croissance (RRL, RFB, RDB) a été observée chez les quatre espèces, dépendantes des conditions de concentration et de forme d'As voire de valeur de pH du milieu. Toutefois, il est ressorti des résultats physiologiques de L. Esculentum un comportement de tolérance cararctérisé par une croissance maintenue et la stimulation du système enzymatique antioxydant. Ainsi, L. Esculentum montre une tolérance au stade de germination à la forme As(V) à pH9, non observée pour les autres espèces. D. Cespitosa, connue pour être une espèce tolérante hyperaccumulatrice de l'élément arsenic a montré un seuil de tolérance à cet élément fonction de la concentration. Les activités enzymatiques antioxydantes ne sont pas apparues systématiquement stimulées dans leur ensemble. Il ressort que la tolérance, dans la majorité des cas, ne concernerait qu'un pool d'enzymes, et non la totalité et serait variable selon les conditions de milieu, les espèces et organes. Il est intéressant aussi de souligner que l'espèce pérenne A. Tenuis (espèce pseudométallophyte accumulatrice) montre une utilisation limitée de ce type de mécanismes de défense bien que tolérante à une majorité des milieux arseniés étudiés, alors que D. Cespitosa fait largement appel à ce système enzymatique antioxydant avec un niveau de tolérance plus limité. Le protéome foliaire de A. Tenuis montre suite à l'exposition arseniée une fragmentation de protéines fonctionnelles (Oxygen-Evolving Enhancer protein, RuBisCO LSU et SSU, RuBisCo activase et ATP synthase) impliquées dans les processus respiratoires et photosynthétiques particulièrement la RuBisCO, illustrant une réorganisation métabolique de la plante. L'identification d'autres protéines foliaires suggère la probable implication de ces dernières dans les mécanismes de tolérance d'A. Tenuis à l'arsenic
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Chablain, Patrice. "Etude biochimique et génétique d'une voie de dégradation des composés aromatiques par la souche psychrotrophe Pseudomonias putida 01G3 : influence de la température de croissance sur les capacités dégradatives." Compiègne, 1999. http://www.theses.fr/1999COMP1245.

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Abstract:
Sept souches de Pseudomonas ont été isolées à partir d'un sol pollué par du toluène pour leur capacité à dégrader ce composé à 10\c. Parmi celles-ci, la souche Pseudomonas putida 01g3 qui degrade le toluène à 4\c a été sélectionnée. La première partie de l'étude concerne la recherche de la voie de dégradation par des analyses physiologiques. Celle-ci est initiée par une dioxygénase périphérique proche de la toluène dioxygénase de p. Putida f1 (souche mésophile) et l'ouverture du cycle aromatique est réalisée par une catéchol 2,3-dioxygénase. La seconde partie a concerné la caractérisation génétique de la voie catabolique du toluène. Des expériences de mutagenèse avec le transposon mini-tn5lacz1 ont permis d'isoler 15 mutants tol. Les différents gènes ebd ont été clonés en deux fragments et séquences afin d'établir l'organisation génétique. Le premier renferme le gène ebdr dont le produit est une protéine de régulation positive impliquée dans la dégradation des alkylbenzènes. La seconde séquence renferme 6 orf dont les protéines putatives sont responsables de la dégradation de l'isopropylbenzène. Les gènes définis ebdaabcdbc codent respectivement pour une dioxygénase périphérique, une cis-dihydrodiol deshydrogénase et une catéchol 2,3-dioxygénase toutes similaires à celles présentées chez les souches Pseudomonas re204, jr1 et ip01. Le meilleur inducteur de la voie ebd est l'ethylbenzène. Dans la dernière partie, l'influence de la température sur les capacités dégradatives a été étudiée. Les cinétiques de croissance ont montré que la souche 01g3 ainsi que les souches dégradant l'isopropylbenzène minéralisent les alkylbenzènes de 4 à 30\c. Ces quatre souches sont psychrotrophes, alors que la majorité des souches connues jusqu'alors.
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Antalick, Guillaume. "Bilan biochimique et sensoriel des modifications de la note fruitée des vins rouges lors de la fermentation malolactique : rôle particulier des esters." Thesis, Bordeaux 2, 2010. http://www.theses.fr/2010BOR21792/document.

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Abstract:
L’objectif de cette thèse est d’étudier le rôle de la fermentation malolactique (FML) sur l’arôme fruité des vins rouges. Les bactéries lactiques (BL) modifient la composition du vin mais il n’existe pas de consensus concernant spécifiquement cette famille aromatique. Contrairement aux idées empiriques sur la FML, ce travail a démontré l’absence à court terme d’un " masque lactique ", cependant l’apparition d’une telle interaction olfactive pourrait être plus tardive. Par contre, il est montré l’existence d’un masque proche de la note de réduction, de type fumé/grillé, dont la caractérisation n’a pas été effectuée dans cette étude.Le suivi des principaux marqueurs fruités du vin (70 molécules) a été rendu possible par le développement des méthodes d’analyse chromatographique en phase gazeuse couplée à la microextraction sur phase solide (esters, C13-norisoprénoïdes, lactones, thiols). En particulier, une " base de données esters " (32 composés) a rendu plus robuste l’ensemble des variations constatées au cours du développement des BL. En effet, les modifications des teneurs en esters sont démontrées comme un processus majeur de la balance de la note fruitée au cours de la FML. Cette fermentation permet à court terme, aussi bien la synthèse que l’hydrolyse des esters grâce aux activités estérases et, à plus long terme, la formation tardive d'esters éthyliques d'acides branchés issus du catabolisme de certains acides aminés. La spécificité des estérases vis-à-vis de la nature et de la longueur de la chaîne carbonée des esters est mise en évidence, ainsi que l'importance de la disponibilité des substrats, liée en partie à l'activité des levures.L’étude de l’influence des souches de BL et de la co-inoculation levures/bactéries a permis de confirmer le rôle clé des interactions entre les microorganismes, ainsi que l’importance de la composition de la matrice vin
The aim of this thesis is to study the role of malolactic fermentation (MLF) on the fruity aroma of red wines. Lactic acid bacteria (LAB) modify wine composition but there is no consensus concerning this aromatic group specifically. In opposition to empirical ideas on MLF, this work has demonstrated the absence, in short-term, of a “lactic-mask” although this kind of olfactory interaction may still occur in a later stage of wine development. Nevertheless, the existence of a smoked/toasted reduction-like mask note was proved. Its characterization has not been done in this work. The survey of the main fruity markers of wine (70 compounds) was made possible by the development of several gas chromatography coupled with solid-phase microextraction analytical methods (esters, C13-norisoprenoids, lactones, thiols). In particular, the creation of an “ester database” (32 compounds) has improved the detection of variations during LAB development in terms of analysis robustness. In fact, changes on esters contents are proved to be responsible for a major part of fruity notes evolution during MLF. Initially, this fermentation allows both synthesis and hydrolysis of esters as a consequence of esterase activity. Moreover, it promotes late-production of ethylic esters through the catabolism of certain aminoacids. Esterases specificity towards nature and size of the esters carbon chain is pointed out along with substrates availability, partially related to yeast activity.The study of the influence of both LAB strains and yeast/bacteria co-inoculation has confirmed microorganisms interactions and wine matrix composition to be of the great importance
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Noël-Duchesneau, Ludovik. "Phosphines de type Buchwald incorporant des unités bétaïnes de pyrimidinium : synthèse et applications." Toulouse 3, 2014. http://thesesups.ups-tlse.fr/2655/.

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Abstract:
Ce travail s'articule autour de la fonctionnalisation de phosphines de type Buchwald par substitution formelle du groupe aryle distal de l'atome de phosphore par un cycle bétaïne de pyrimidinium. Suivant la position de substitution de l'hétérocycle (en position 2 ou 5), deux nouvelles familles de phosphines nommées 2-LudoPhos et 5-LudoPhos ont été obtenues. La synthèse des phosphines de type 2-LudoPhos a été réalisée via deux stratégies différentes. La première est basée sur une introduction tardive de l'unité phosphine, tandis que la deuxième consiste en une procédure " one-pot " modulaire en trois étapes. Ces phosphines ont été coordonnées sur des centres métalliques or(I), argent(I) et palladium(II) et ont été employées avec succès comme ligands ancillaires en catalyse homogène (couplage croisé de Suzuki-Miyaura au palladium et cycloisomérisation à l'or(I)). Un exemple de la famille des 5-LudoPhos a été synthétisé avec un rendement acceptable et a été utilisé comme ligand pour complexer un centre or(I). Par ailleurs, les analyses radiocristallographiques et par modélisation DFT des complexes d'or(I) et d'argent(I) incorporant les 2-LudoPhos ont permis de mettre en évidence l'existence d'une interaction non-covalente entre le carbone amidinium de l'hétérocycle et le centre métallique. La fonctionnalisation par alkylation de l'unité malonate des complexes d'or(I) de type [AuCl(2-LudoPhos)] entraîne une augmentation de l'électrophilie de l'amidinium conduisant à un renforcement de cette interaction. En particulier, la C-alkylation du carbone central de l'unité malonate conduit à l'isolation, en phase solide, d'un complexe neutre d'or(III)-alkyle dans lequel le centre or(I) a transféré deux électrons au carbone cationique de l'amidinium. Une interconversion très intéressante a été mise en évidence entre ce dernier complexe et son analogue ionique d'or(I), quasi-isoénergétique, et dans lequel l'unité amidinium reste intacte. Ces observations expérimentales ont été validées et confirmées par une étude DFT complète
This work is based on the derivatization of Buchwald-type phosphines by a formal replacement of the distal aryl group from the phosphorus atom by a pyrimidinium betaine. Depending on the position of substitution of the heterocycle (position 2 or 5), two new families of phosphines, named 2-LudoPhos or 5-LudoPhos, were obtained. The 2-LudoPhos phosphines have been successfully synthesized via two strategies. The first one is based on a last stage introduction of the phosphino moiety, and the second one consists in a modular, one-pot, three-step procedure. The resulting phosphines have been coordinated onto gold(I), silver(I) and palladium(II) centers and have been successfully engaged as supporting ligands in homogeneous catalysis (Pd-catalyzed Suzuki-Miyaura cross-coupling and gold(I) cycloisomerization). One achiral representative of the 5-LudoPhos family has been synthesized and used as ligand on a gold(I) center. The X-Ray diffraction analyses and DFT calculations on gold(I) and silver(I) complexes with 2-LudoPhos phosphines have shown a non-covalent interaction between the metallic centers and the carbon atom of the amidinium moiety of the heterocycle. The derivatization by alkylation of the malonate moiety directly on complexes of type [AuCl(2-LudoPhos)] has led to an enhancement of the interaction by increasing the electrophilic character of the amidinium unit. Specifically, the quaternization of the malonic central carbon atom has conducted to the isolation of a neutral gold(III)-alkyl complex in the solid state, wherein two electrons have been transferred from the gold(I) center to the cationic carbon atom. An interesting interconversion has been observed between the latter complex and its almost isoenergetic, ionic gold(I) analogue, bearing the unchanged amidinium moiety. These experimental findings have been fully supported by a thorough DFT study
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Villien, Mathilde. "Synthèse et études d’oligonucléotides et de peptides comportant un complexe photoactivable de ruthénium(II)." Grenoble 1, 2007. http://www.theses.fr/2007GRE10041.

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Abstract:
Les complexes de ruthénium(II) font l’objet d’un intérêt croissant en tant que photosondes du matériel génétique ou nouvelles drogues en photothérapie anti-cancéreuse. Les complexes contenant des ligands TAP (1,4,5,8-tétraazaphénanthrène) sont capables sous l’action d’une irradiation lumineuse, de génèrer spécifiquement un photoadduit avec la guanine. Cette photoréactivité constitue une stratégie prometteuse pour contrôler l’expression d’un gène. Toutefois, le manque de sélectivité de ce type de photoréaction bloque leur potentiel thérapeutique. Afin de surmonter cet obstacle, nous avons attaché le complexe de ruthénium à l’extrémité d’un oligonucléotide. Cette approche repose sur l’utilisation des propriétés intrinsèques de reconnaissance spécifiques des oligonucléotides vis-à-vis d’une cible acide nucléique. Pour préparer les conjugués, nous avons utilisé la formation d’un lien éther d’oxime en mettant au point une méthode douce et efficace de conjugaison, optimisée dans des conditions conformes aux exigences physiologiques. Nous avons préparé différents conjugués à partir des complexes [Ru(TAP)3]2+ et [Ru(TAP)2Phen]2+, ancrés indifféremment à l’extrémité 3’ ou 5’ des oligonucléotides, afin d’en étudier le potentiel photochimique. En illuminant ces nouveaux conjugués dans le visible, nous avons mis en évidence la formation spécifique d’un photopontage entre une guanine de l’acide nucléique ciblé et le complexe de ruthénium. Nous avons également étendu notre procédé en ancrant le complexe [Ru(TAP)2Phen]2+ à des peptides vecteurs
The Ru(II) complexes have found widespread interest as luminescent DNA probes, or new phototherapeutic agent against cancer. Complexes containing highly π-deficient polyazaaromatic ligands such as TAP (1,4,5,8-tetraazaphenanthrene) under illumination are able to form specifically a photoadduct with the guanine nucleobase. This photoreactivity might be an extremely promising strategy to control the normal cellular process, and so perturb the gene expression. However, the lack of selectivity of this photoreaction blocks their therapeutic development. To overcome this, we have realised the attachment of such metal complexes to the extremity of an oligonucleotide. This approach is based on the specific recognition of a target nucleotidic sequence by a nucleic acid probe. In this purpose, we have chosen to use the chemoselective oxime ligation. This coupling reaction was found to be highly efficient, between both unprotected moieties, with minimal chemical manipulation and working in physiological conditions. We have built some conjugate with two complexes of Ru(II) : [Ru(TAP)2Phen]2+ and [Ru(TAP)3]2+, anchoring at the 3’ or 5’ extremity of the oligonucléotides, in order to determine their photochemical potentiel. Then under visible illumination, we have demonstrated that the conjugates produce the specific and irreversible photocrosslinking between a guanine unit of the target and the ruthenium complex. Finally, we have also decided to extend our process by anchoring the complex [Ru(TAP)2Phen]2+ to cell-penetrating peptides
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Raynal, José. "Modifications structurales et biochimiques de la prune d'Ente au début du séchage effets de diverses températures sur la structure celulaire et ses incidences sur les composés pectiques et phénoliques /." Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37609216g.

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Martinez, Lorente Maria Angeles. "Synthèse et propriétés magnétiques et structurales de complexes du fer(II) avec des ligands renfermant des noyaux imidazole : Modélisation du site ferreux non-heme des systèmes photosynthétiques. Etude de polymères du fer(II) à propriétés magnétiques inusuelles." Toulouse 3, 1992. http://www.theses.fr/1992TOU30034.

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Abstract:
Treize nouveaux complexes du fer(2+) haut-spin, faisant intervenir l'acide 2-propioniquebenzimidazole, l'acide 4-acetique-imidazole, le bis(benzimidazole-2-methyl) ether, le bis(imidazol-2yl) carboxymethylmethane, le 2,2-bis-imidazole, le 2,2-bis-benzimidazole et la 2,3-hydroxynaphtoquinone, ont ete synthetises et etudies dans le cadre de ce travail. L'etude de neuf de ces composes s'inscrit dans une perspective de modelisation du site ferreux non-heme des systemes photosynthetiques. Dans les complexes fer(benzimidazole-2-propionate)#2(biimidazole), fer(benzimidazole-2-propionate)#2(bibenzimidazole), fer(bis(imidazol-2-yl) carboxymethylmethane)#2, fer(biimidazole)#2(h#2o)#2co#3, fer(biimidazole)#2(2,3-hydroxonaphtoquinone) et fer(bibenzimidazole)#2(2,3-hydroxonaphtoquinone), l'environnement de ligands du fer, octaedrique deforme, est de type n#4o#2. Dans les complexes fer(biimidazole)#3co#3, fer(bis(benzimidazole-2-methyl) ether)(acetate)#2 et fer(bis(benzimidazole-2-methyl) ether)cl#2,meoh l'environnement de ligands du fer est, respectivement, de type n#6, n#2o#4 et n#2o#2cl#2. Les etudes spectroscopiques (ir et mossbauer), magnetiques et structurales de ces complexes comparees a celles realisees sur les systemes photosynthetiques montrent que: a) la nature et l'importance de la deformation de la symetrie octaedrique de l'environnement de ligands du fer constituent un facteur aussi important que la nature chimique des ligands, pour la modelisation des proprietes structurales et spectroscopiques; b) les carboxylates peuvent etre substitues par un dianion carbonate, mais celui-ci intervient comme contre-ion, hors de la sphere de coordination du fer; c) il est possible de stabiliser des paranaphtoquinones substituees dans l'environnement du fer(2+) sans l'oxyder. La synthese des quatre derniers composes s'inscrit dans le cadre de la recherche de polymeres du fer(2+) a proprietes magnetiques inusuelles. Les etudes spectroscopiques, magnetiques et structurales montrent que le reseau antiferromagnetique bidimensionnel du complexe fer(4-imidazoleacetate)#2,2meoh#n est le siege d'une transition de phase magnetique a 15k; celle-ci conduit a l'etablissement d'un reseau tridimensionnel ferromagnetique. Le complexe fer(biimh)#2#n constitue un reseau tridimensionnel faiblement antiferromagnetique. Enfin, le complexe fer(biim)#n est un reseau tridimensionnel ferromagnetique
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Clavaguera, Sarrio Carine. "Etude théorique de composés moléculaires d'actinides : propriétés électroniques, vibrationnelles et dynamiques." Toulouse 3, 2003. http://www.theses.fr/2003TOU30049.

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De, Oliveira Lino Leandro. "Etude de la variabilité génétique de la sensibilité à la pourriture brune au cours du développement du fruit chez la pêche en lien avec l’évolution des caractéristiques physiques et biochimiques du fruit." Thesis, Avignon, 2016. http://www.theses.fr/2016AVIG0677/document.

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Abstract:
La pourriture brune des fruits (BR), causée par les champignons du genre Monilinia, est une maladie courante qui peut provoquer jusqu’à 40% de pertes de récolte chez la pêche. Toutes les pêches cultivées sont plus ou moins sensibles à la moniliose. Aucune alternative aux traitements chimiques n’est disponible, ce qui rend nécessaire les applications de fongicides jusqu'au stade pré-récolte, qui sont préjudiciables pour l'environnement et peuvent laisser des résidus sur les fruits. Une revue de la littérature compile les connaissances disponibles sur le couple pêcher-monilioses.Le but de cette étude est d'étudier les facteurs de résistance du fruit à M. laxa à différents stades de croissance chez la pêche et de déterminer leur contrôle génétique.Nous avons focalisé d’abord sur quelques cultivars pour étudier l'évolution de la sensibilité des fruits à M. laxa au cours de leur développement en relation avec les caractéristiques structurales et biochimiques des fruits (conductance cuticulaire du fruit, micro-fissures de l’épiderme et composés de surface des fruits). Certains composés ont été détectés pour la première fois chez la pêche. Les résultats ont confirmé que lors de la phase I les fruits immatures sont sensibles à la moniliose. Au stade de durcissement du noyau, les fruits sont résistants, la conductance cuticulaire faible et les niveaux de composés de surface présentaient un pic de teneurs. A l’approche de la maturité, les fruits sont sensibles de nouveau. Au stade I, nous avons exploré le rôle des stomates et de la conductance du fruit immature en relation avec la sensibilité à M. laxa. Une centaine de génotypes d'une descendance interspécifique de pêchers appelée BC2 a été caractérisée par une infection au laboratoire, un suivi de pertes transpiratoires des fruits et une estimation de la densité de stomates (uniquement pour les nectarines). Des symptômes inattendus (une ‘tache claire’ qui ne progresse pas) ont été observés. La conductance cuticulaire était significativement liée à la probabilité d'infection, mais le nombre de stomates n’a montré aucun effet sur la probabilité d'infection. Des QTL contrôlant la résistance des fruits à la moniliose, à la conductance cuticulaire et au nombre de stomates ont été identifiés et des co-localisations observées.A maturité, le contrôle génétique de la résistance à la moniliose et des composés biochimiques de l'épiderme des fruits a été étudié. Pendant trois ans, les fruits de la BC2 ont été infectés avec une suspension de spores de champignon selon deux modalités. La BC2 a affiché une forte variabilité de résistance à la moniliose. Malgré une faible stabilité entre les années, des génotypes à haut niveau de résistance ont été identifiés. De plus en 2015, nous avons exploré la variation des composés de l'épiderme des fruits au sein de la BC2. Les composés phénoliques, les terpènes et dérivés ont été quantifiés par HPLC. La relation entre la résistance à la moniliose et la présence et / ou les niveaux de certains composés de l'épiderme et le contrôle génétique de ces composés ont été étudiés.La moniliose des fruits de pêche est un problème complexe qui est encore loin d'être résolu. Des progrès ont été accomplis dans la connaissance des caractéristiques structurales et biochimiques impliquées dans la résistance et des régions du génome qui pourraient conférer une certaine tolérance à la maladie ont été détectées. Des travaux supplémentaires sont nécessaires pour développer des marqueurs moléculaires pour la sélection assistée par marqueurs. Les résultats obtenus suggèrent que des solutions pour l'avenir résident dans l’association de cultivars tolérants _ moins sensibles aux micro-fissures et à haute teneur en composés épidermiques potentiellement inhibiteurs du développement du champignon _ avec des pratiques culturales réduisant les risques de fissuration des fruits et d'apparition de conditions climatiques favorables à la propagation de la moniliose
Brown rot (BR) in peach fruit caused by the fungus Monilinia spp. is a common disease that can provoke as much as 30 to 40% losses of crop. Currently, all cultivated peaches are more or less sensitive to BR. No other alternative than chemical treatment is available, hence fungicide applications are required until pre-harvest. Such applications are damaging the environment and may let residues in fruits. A review of literature was accomplished to compile the knowledge scattered in the literature from many years. The aim of this study is to investigate the factors of resistance of the fruit to M. laxa at different stages of fruit growth and their genetic control by studying contrasted genotypes and an interspecific peach progeny. The first focus was made on few cultivars to study the evolution of sensibility of fruits to M. laxa during their development in relation with structural and biochemical characteristics of the fruit, e.g. cuticular conductance, micro-cracks and fruit surface compounds. Some compounds were detected for the first time on peach fruit. The results confirmed that during the stage I immature fruits are susceptible to BR. Fruit cuticular conductance was high probably due to high density of stomata and thin cuticule in formation. In contrary, at pit hardening stage fruits were resistant, cuticular conductance was low and the levels of surface compounds exhibit a peak. When maturity approaches, fruit become susceptible again. With rapid development of the fruit during this stage, the surface compounds were diluted and micro-cracks often appear which resulted in high cuticular conductance. At stage I we explored the different physical characteristics of the immature fruit in relation with susceptibility to M. laxa. A hundred of individuals of an interspecific peach progeny called BC2 were characterized through laboratory infection, monitoring of fruit transpiratory losses and estimating stomata density (only for nectarines). Unexpected symptoms (not progressing ‘clear spot’) were observed. The cuticular conductance was significantly linked to the likelihood of infection, but the stomata number had no effect on the likelihood of infection. QTL controlling fruit resistance to BR, cuticular conductance and stomata number have been identified and some co-locations observed. At maturity stage we investigated the genetic control of BR resistance together with biochemical compounds of fruit epidermis. For three years, mature fruits from the BC2 progeny were infected with two modalities of infection: spray until runoff in the orchard to measure infection probability and drop in the laboratory conditions in order to observe the characters of beginning, progression and speed of infection. The BC2 progeny displayed high variability for BR resistance. Despite low stability between years, genotypes with high level of resistance were identified. In addition in 2015, we explored the variation in epidermis compounds of fruit within the BC2 progeny. Phenolic compounds, terpenoids and derivatives were quantified by HPLC. The relationship between BR resistance and presence and/or levels of certain epidermis compounds and the genetic control of these compounds were investigated. BR of peach fruit is a complex problem which is still far from resolved. Progress has been made in the knowledge of structural and biochemical characteristics involved in BR resistance and regions of the genome that could confer certain disease tolerance have been detected. Further work is needed to develop molecular markers for marker assisted selection. The results obtained suggest that solutions for the future lie in associations of tolerant cultivars _ less susceptible to micro-cracks and with high content of epidermis compounds potential inhibitor of the fungus development _ with cultural practices reducing both risks of fruit cracking and occurrence of micro-climatic conditions favorable to BR spread and sporulation
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Moune, Dimala Martin. "Développement de ligands et d’outils chimiques pour la protéomique fonctionnelle." Strasbourg, 2010. http://www.theses.fr/2010STRA6142.

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Abstract:
L'objectif majeur de ce travail était de développer des sondes « site-actif » dérivées d'inhibiteurs, comportant des modules chimiques fonctionnels biocompatibles de type photo-liaison, couplage par réaction bio-orthogonale, clivage chimique et module de purification par affinité pour des applications en protéomique. Les applications sont multiples et permettent entre autres de réaliser des études d'identification de complexes moléculaires actifs et de déconvolution de cibles thérapeutiques. Le travail réalisé porte sur la validation de ces modules chimiques au travers de l'étude d'une topoisomérase bactérienne de type II (l'ADN gyrase) et de son inhibiteur antibiotique naturel (la novobiocine) avec la perspective de développer divers types de sondes site actif ciblant d'autres familles d'enzymes. Dans un premier temps une sonde a été développée et une analyse qualitative des chimies de couplage de type cycloaddition de Huisgen et ligation de Staudinger (biocompatibilité, spécificité, efficacité) a été réalisée. Puis cette sonde équipée d'un module clivable azobenzène a ensuite permis de réaliser en condition non dénaturante la purification des complexes impliquant •la gyrase B et la déconvolution des cibles de la novobiocine chez Escherichia coli. Enfin, le travail réalisé sur le couple gyrase/novobiocine permis d'initier le développement d'une nouvelle étiquette de purification de complexes basée sur le domaine minimal de fixation de la novobiocine. Le développement d'une sonde ciblant les protéines histones désacétylases a également été entrepris
The major goal of this work was to develop a site specifie probe derived from inhibitors, contammg functional chemical and biocompatible modules (photo-labelling, bio orthogonalligation, chemical cleavage, affinity purification) for proteomic applications. The applications are multiple and would allow identification of protein partners in molecular complexes or target deconvolution studies. The work achieved concems the validation of these chemical modules through the study of a type II bacterial topoisomerase (DNA gyrase) and its antibiotic inhibitor (novobiocin) with the prospect at developing site specific probes targeting other enzyme families. First a probe was developed and a qualitative analysis of the bioorthogonal ligation reaction called Huisgen's cycloaddition was performed to compare to the Staudinger ligation. The biocompatibility, the specificity and the efficiency were analysed. The probe was then equipped with an azobenzene cleavable module and was used to purify (under non-denaturing conditions) multiprotein complexes containing gyrase B and achieve target deconvolution of novobiocin on Escherichia coli. Finally the work done on the gyrase B/novobiocin was used to initiate the development of a new purification tag that can be used for complex enrichment. A probe targeting HDAC proteins has also been developed
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Zarrouki, Mohamed. "Etude de l'adsorption dans un système liquide-solide. Solution d'ion dicyanoaurate-charbon actif." Grenoble INPG, 1990. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00845070.

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Abstract:
Ce travail a pour cadre l'étude de la récupération des métaux précieux complexes en solution grâce a du charbon actif. Il a permis de comprendre les mécanismes fondamentaux de l'adsorption dans un système modèle constitue d'une solution d'ion dicyanoaurate et de charbon actif. Les interactions entre cette solution et le solide ont été caractérisées par diverses techniques: la pHmétrie, la titrimétrie, la zetamétrie, la potentiométrie et la thermodésorption. Ces méthodes ont permis d'avoir des renseignements sur la nature des groupements fonctionnels à la surface du charbon, groupements constituant les sites responsables de l'adsorption des complexes. De même par une méthode de traitement originale gaz-liquide-solide, nous avons modifié la nature de ces sites et leur répartition à la surface du charbon, ce qui a permis d'améliorer la capacité d'adsorption du charbon. Cette modification dépend de la nature et de la pression du gaz utilise. L'étude thermodynamique a montré que l'adsorption de l'ion dicyanoaurate sur le charbon peut être représentée assez correctement par l'équation de Langmuir généralisée à plusieurs types de sites. L'adsorption s'effectue de façon plutôt localisée, avec interaction sur des sites d'énergie différente. La vitesse d'adsorption de l'ion dicyanoaurate sur le charbon actif a été étudiée en fonction de plusieurs paramètres physico-chimiques: la température, les conditions hydrodynamiques comme la vitesse d'agitation et le rapport solide/liquide, la concentration initiale en complexe, la nature des substances étrangères, et la nature du gaz en contact avec la solution. Le mécanisme d'adsorption se déroule en trois étapes. La réaction limitante est la diffusion à travers un film pendant le début de la réaction, puis la diffusion-adsorption dans la structure poreuse au voisinage de l'équilibre.
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