Dissertations / Theses: 'Concentré de protéines de poisson'

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Ouellet, Véronique. "Effets de la protéine de morue sur la sensibilité à l'insuline chez des hommes et des femmes résistants à l'insuline." Thesis, Université Laval, 2009. http://www.theses.ulaval.ca/2009/26307/26307.pdf.

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Durand, Rachel. "Valorisation d'hydrolysat de poisson pour la santé humaine : séparation des composés bioactifs par électrodialyse avec membranes d'ultrafiltration et évaluation de leurs activités biologiques impliquées dans le développement du syndrome métabolique." Doctoral thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/66672.

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Abstract:

La valorisation des co-produits de poisson est un enjeu économique et environnemental. Depuis plusieurs années, des recherches ont montré que les co-produits de poisson contenaient des molécules actives pour la santé humaine comme des acides gras polyinsaturés et des peptides bioactifs. L’objectif principal de cette thèse était d’évaluer l’utilisation potentielle d’hydrolysats de laitance de hareng pour l’amélioration de la santé humaine, spécifiquement en agissant positivement sur certaines fonctions physiologiques associées au syndrome métabolique, et l’effet de leur séparation par électrodialyse avec membranes d’ultrafiltration (EDUF) sur la production de fractions bioactives. Dans un premier temps, il a été démontré qu’une supplémentation avec différents hydrolysats de laitance de hareng d’une diète riche en gras et en sucre chez des souris permettait de moduler certains paramètres physiologiques impliqués dans le développement du syndrome métaboliques (MetS) : amélioration de la tolérance au glucose, augmentation de l’apport énergétique total et protection de la population de Lactobacillus dans le microbiote intestinal. De plus, les hydrolysats ont aussi montré des activités antiinflammatoires in vitro à des concentrations de 1ng/ml et 100pg/ml. Dans un second temps, la faisabilité d’une séparation par EDUF de deux hydrolysats de laitance de hareng différents a été évaluée : le premier plus complexe était un mélange de molécules (lipides, acides nucléiques, peptides, acides aminés libres), alors que le second était principalement composé de peptides et d’acides aminés libres. Une nouvelle configuration utilisant quatre membranes d’ultrafiltrations (deux de 50kDa et deux de 20kDa) a permis un double fractionnement simultané des composés anioniques et cationiques en seulement une étape. Il a d’abord été montré que seuls les peptides chargés ainsi que les acides aminés libres pouvaient être séparés par EDUF alors que les lipides et les acides nucléiques ne migraient pas dans les fractions de récupérations. De plus, l’utilisation de membranes présentant deux tailles de pores distinctes a permis le fractionnement des hydrolysats en différentes classes de poids moléculaires. En effet, l’utilisation de membranes de 20kDa a permis la concentration de peptides de faibles poids moléculaires (< 600Da) et IV d’acides aminés libres, alors que les populations peptidiques des fractions obtenues avec les membranes de 50kDa présentaient des poids moléculaires supérieurs et plus variés. Dans un troisième temps, les bioactivités des fractions de récupérations et des hydrolysats de laitance de hareng ont été évaluées in vitro. Ainsi, la séparation du premier hydrolysat a permis l’obtention d’une fraction finale stimulant la captation du glucose in vitro et d’une fraction anionique antioxydante. Le fractionnement du second hydrolysat a permis quant à lui la production de deux fractions cationiques anti-inflammatoires ainsi que l’identification subséquente de deux séquences peptidiques bioactives. L’ensemble de cette thèse a donc démontré que les hydrolysats de laitance de hareng contenaient des composés actifs, comme des acides gras polyinsaturés et des peptides, modulant positivement certains paramètres physiologiques impliqués dans le MetS et pouvant ainsi permettre la diminution de son occurrence. De plus, la séparation des hydrolysats par EDUF a permis la production de fractions bioactives ainsi que l’identification de deux nouvelles séquences peptidiques anti-inflammatoires (IVPAS et FDKPVSPLL). Ces travaux ont démontré l’effet bénéfique pour la santé humaine des hydrolysats de laitance de hareng et de ses fractions, permettant d’envisager une valorisation plus efficace de ces coproduits de poisson par les industries de transformation dans les secteurs liés à la santé humaine.
Fish by-product valorization is an economic and environmental issue. For several years, scientific researches have shown that fish by-products contained active molecules for human health, as polyunsaturated fatty acids and peptides. The aim of this thesis was to evaluate the potential use of herring milt hydrolysates for human health, especially by evaluating their potential actions in physiological parameters involved in the metabolic syndrome and the effect of their separation by electrodialysis with ultrafiltration membrane (EDUF) for the production of bioactive fractions. First, we have demonstrated that the supplementation of three different herring milt hydrolysates in a high fat high sucrose diet in mice was able to modulate some physiological functions involved in the metabolic syndrome: improvement of glucose tolerance, increase of the total energy intake and protection against the Lactobacillus disappearance in the gut microbiota. Moreover, the hydrolysates decreased the inflammation induction in macrophages stimulated with LPS at 1ng/ml and 100pg/ml. Secondly, we have evaluated the separation of two herring milt hydrolysates by EDUF: the first one was more complex with a mix of different molecules (lipids, nucleic acids and peptides) while the second one was mainly composed of peptides. A new configuration using four ultrafiltration membranes (two of 50kDa and two of 20kDa) allowed a simultaneous double separation of anionic and cationic compounds. It has been shown that only charged peptides and free amino acids were fractionated in EDUF, while the lipids and nucleic acids didn’t migrate to the recovery fractions. Moreover, the use of membranes with different cut-off allowed a separation of the hydrolysates in different molecular weight ranges. Indeed, the use of 20kDa membranes allowed the concentration of peptides with small molecular weights (<800Da) and free amino acids, while the recovery fractions obtained with the 50kDa membranes were composed oh peptide with higher molecular weights.Thirdly, the potential bioactivities of the recovery fractions and the herring milthydrolysates were evaluated in vitro. Hence, the separation of the first hydrolysate allowed the production of a final fraction increasing the glucose uptake and an antioxidant anionicfraction. While the separation of the second hydrolysate allowed the production of two antiinflammatory cationic fractions as well as the identification of two bioactive peptides sequences. All these results showed that milt herring hydrolysate contained bioactive compounds such as polyunsaturated fatty acids and peptides, improving some physiological functions involved in the MetS and may decrease its occurrence. More over, the separation of the hydrolysates by EDUF allowed the production of bioactive fractions and the identification of two new anti-inflammatory peptide sequences. This work demonstrated the existence of a beneficial effect of herring milt hydrolysate and its fractions for the human health, allowing a better valorization of this by-product of the food industry for the health sector.

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Amanajas, Claudio Chaves. "Contribution à la préparation de concentré protéique de poissons gras en vue de résoudre le problème du faux-poisson de la pêche de crevettes sur les côtes nord-brésiliennes : recherche sur l'extraction d'eau et d'huile par solvants." Toulouse, INPT, 1994. http://www.theses.fr/1994INPT008A.

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Abstract:

La pèche de crevettes correspond à une capture importante d'animaux marins dont tous ne sont pas valorises alors qu'il existe un déficit local de protéines (malnutrition). Les animaux non-conformes ou d'autres espèces constituant le faux-poisson, peuvent représenter jusqu'à 10 fois la masse de crevettes et sont rejetés, morts, a la mer. La production de produits alimentaires nobles à partir de ce poisson s'accompagne d'une grande quantité de déchets qui se rajoutent aux pertes initiales de la sélection de la pèche. L'étude réalisée montre que l'extraction des lipides peut être pratiquée à basse température et aboutir, avec peu de pertes, a un concentre protéique déshydrate, très purifie et peut être appliquée a des matières premières diverses (filet, tètes, viscères) de teneur variable en lipides. La modélisation de cette extraction avec de la farine de soja met en évidence le rôle de l'eau pour l'efficacité du procède et a permis de réaliser un fractionnement des lipides extraits. Mise à part l'élimination finale du solvant résiduel, retenu par les produits, le procède de fractionnement ne met en œuvre que des opérations de mélange et des séparations solide-liquide a basse (ou moyenne) température (environ 0c). L'efficacité des séparations solide-liquide due aux différences de masse spécifique des liquides et des solides, favorise considérablement les extractions. De plus, l'utilisation de la rupture in-situ de l'azéotrope (hexane-éthanol) permet d'obtenir un pré-raffinage des fractions lipidiques ce qui doit faciliter leur purification ultérieure en vue d'usages spécifiques. Le concentre protéique, après élimination de l'alcool et broyage, se classifie facilement en protéines de haute pureté (supérieur à 90%) avec très peu de lipides (inferieur a 2% sur sec) et en déchets (écailles, arêtes)

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Kapel, Romain. "Amélioration d'un procédé de production d'un concentré de protéines blanches de luzerne semi-industriel et valorisation du concentré protéique dans le domaine des adhésifs et des nutraceutiques." Lille 1, 2005. https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Num/2005/50376-2005-186.pdf.

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Abstract:

La société VIRIDIS développe un procédé industriel d'extraction de protéines blanches de luzerne. Les objectifs de cette thèse étaient l'amélioration du rendement d'extraction en protéine du procédé, l'augmentation de la solubilité du concentré protéique et sa valorisation dans le domaine des adhésifs et des nutraceutiques. L'étude de l'effet du traitement thermique sur les protéines blanches a permis d'améliorer le rendement d'extraction en protéines de façon satisfaisante. En revanche, l'amélioration de la solubilité du CPBL s'est révélée inapplicable industriellement Une formulation à base d'hydrolysat pepsique de CPBL et d'urée présente une force d'adhésion équivalente à un adhésif protéique du commerce. Enfin, un hydrolysat de CPBL obtenu en REM présente une activité antihypertensive in vivo. Cette activité biologique peut être due à la présence du peptide inhibiteur de l'ECA, VW, ou à la présence de peptides à activité opioïdes, mis en évidences dans l'hydrolysat.

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Gavazzi-April, Camile. "Effet du mode opératoire sur l'efficience d'un procédé d'ultrafiltration pour la fabrication d'un concentré à haute teneur en protéines." Master's thesis, Université Laval, 2018. http://hdl.handle.net/20.500.11794/29956.

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Abstract:

Les concentrés laitiers à haute teneur en protéines (plus de 80% de protéines sur base sèche) sont générés par ultrafiltration (UF) et diafiltration (DF). Des membranes polymériques spiralées en polyéthersulfone de seuil de coupure de 10 kDa sont généralement utilisées en industrie laitière afin de maximiser la rétention des protéines. La baisse des flux de perméation et l’encrassement membranaire sont les principales limites à l’efficience du procédé. Ces inconvénients pourraient être limités par une sélection optimale du seuil de coupure membranaire et de la séquence UF-DF. Ce projet avait pour objectif de caractériser les performances (flux de perméation, résistance hydraulique, composition et consommation en énergie et en eau) de procédés d’UF-DF en fonction du seuil de coupure (10 et 50 kDa) et de la séquence UF-DF (3,5X – 2 diavolumes (DV) et 5X – 0,8DV). Les séquences UF-DF ont été réalisées avec du lait écrémé et pasteurisé au moyen d’un système de filtration pilote opéré à 50°C et à une pression transmembranaire (PTM) constante de 465 kPa. Pour une même séquence UF-DF, il a été démontré que le seuil de coupure n’avait pas d’impact (p>0.05) sur les flux de perméation, qui étaient toutefois significativement plus élevés (p<0.05) à l’étape de DF pour la séquence 3,5X – 2DV. Les données expérimentales de ces essais ont été utilisées dans le cadre d'une simulation pour la production d’un concentré de protéines laitières dans une usine laitière modèle traitant 1500 m3 de lait en 20 heures. Cet exercice a révélé que, malgré la forte baisse du flux de perméation (89% pour la séquence 5X – 0,8DV contre 58% pour la séquence 3,5X – 2DV) survenant lors d'une concentration du lait à haute teneur en solides, limiter l'étape de DF demeurerait bénéfique du point de vue de la consommation en énergie et en eau. Les données générées par ce projet permettront d’outiller les industriels pour leurs choix technologiques quant au niveau de concentration à cibler en lien avec une démarche d’amélioration de l’éco-efficience.
High-milk protein concentrates (over 80% total protein on a dry weight basis) are typically produced by ultrafiltration (UF) with constant-volume diafiltration (DF). Polymeric spiral-wound UF membranes with a molecular weight cut-off (MWCO) of 10 kDa are mostly used at commercial scale in order to maximize protein retention. Flux decline and membrane fouling during UF have been studied extensively and the selection of an optimal UF-DF sequence is expected to have a considerable impact on both the process efficiency and the generated volumes of by-products. The objective of this work was to characterize performances of UF-DF process in terms of permeate flux decline, fouling resistance, energy and water consumption and retentate composition as a function of MWCO (10 and 50 kDa) and UF-DF sequence (3.5X – 2 diavolumes (DV) and 5X – 0.8DV). UF-DF experiments were performed on pasteurized skim milk by means of a pilot-scale filtration system operated at 50°C and under a constant transmembrane pressure (TMP) of 465 kPa. Results showed that MWCO had no impact (p>0.05) on permeate flux for a same UF-DF sequence. However, permeate flux values were significantly higher during DF for the 3.5X – 2DV sequence whatever MWCO (p<0.05). Experimental values were used as part of a simulation for the production of high milk protein concentrates in a model dairy plant processing 1500 m3 of skim milk in 20 hours. This work revealed that despite the severe total flux decline occurring during high solid concentration of milk (89% for the 5X – 0.8DV sequence vs. 58% for the 3.5X – 2DV sequence), reducing the DF step could still be of great interest in terms of energy and water consumption. The results generated by this project will benefit dairy processors producing high-milk protein concentrates with regards with their technological choices in a sustainable development perspective.
Diafiltration

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Dupret, Barbara. "Etude du rôle des protéines Polycomb Pcgf1 et Ezh2 chez le poisson zèbre Danio rerio." Thesis, Lille 1, 2017. http://www.theses.fr/2017LIL10115/document.

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Abstract:

Les complexes PRC1 et PRC2 contrôlent l’expression génique via l’organisation de la structure de la chromatine. Ce contrôle se fait par l’ajout de la marque H2AK119ub1 par le PRC1 et l’ajout de la marque H3K27me3 par le PRC2. Cette étude s’attache à étudier le rôle de la protéine Pcgf1 (membre du complexe PRC1) et de la protéine Ezh2 (membre du complexe PRC2) lors du développement du poisson-zèbre. Les gènes sont inactivés par TALEN. Le complexe PRC1 est formé par différentes protéines dont les Pcgf. Il existe de nombreux homologues Pcgf qui ont des fonctions distinctes. Cette étude s’intéresse au rôle de la protéine Pcgf1 lors du développement du poisson-zèbre. Les individus pcgf1-/- sont viables et fertiles. Cependant, leur développement précoce est retardé et les adultes montrent des signes de vieillissement accéléré. Ce mutant est le premier modèle de vertébré qui met en évidence le rôle de Pcgf1 dans la prolifération cellulaire lors du développement et son association au vieillissement. La protéine Ezh2 est impliquée dans le devenir cellulaire et la différenciation. Les embryons se développent normalement puis les larves meurent à 12 jours post-fécondation. De façon intéressante, les embryons de poisson-zèbre peuvent gastruler en l’absence d’Ezh2, contrairement au modèle murin. Les organes sont correctement mis en place à 5 jours post-fécondation. Les larves présentent un défaut de maintien de la paroi du bulbe intestinal. La protéine Ezh2 est importante pour le maintien du pancréas exocrine. L’absence d’Ezh2 cause une augmentation importante du nombre de cellules apoptotiques. Ezh2 est essentiel lors de la régénération de la nageoire caudale
PCR1 and PRC2 are complexes that control gene expression via chromatin structure reorganization. This expression regulation is maintained by adding epigentics marks H2AK119ub1 by the PRC1 and adding of H3K27me3 by the PRC2. The study devotes to study the role of the protein Pcgf1 (part of the PRC1 complex) and of the Ezh2 protein (part of the PRC2 complex) during the zebrafish development. The PRC1 complex is formed by different proteins including Pcgf proteins. There are several Pcgf homologs that have different functions. The study reveals that some Pcgf proteins have a different expression during caudal fin regeneration and development. We are interested in Pcgf1 protein during the zebrafish development. The pcgf1 gene was inactivated by using TALEN. The fish pcgf1-/- are viable and fertile. However, the early development is delayed and adults show signs of accelerated aging. This mutant is the first vertebrate model showing the role of Pcgf1 in cells proliferation during development and aging. Ezh2 protein is involved in cell-fate decisions and differenciation. Inactivation of ezh2 gene by TALEN reveals the essential role of Ezh2 during development. Indeed, at the beginning embryos develop normally then larvae die at 12 days post-fertilization. Interestingly, zebrafish embryo can gastrulate without Ezh2. This contradicts with observations in mouse model. The organs are properly formed at 5 days postfertilization. Larvae show defects in the intestinal bulb wall. Ezh2 is important for exocrine pancreas maintenance. The absence of Ezh2 causes an increase in apoptic cells. Ezh2 is essential during caudale fin regeneration

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Mahuzier, Alexia. "Etude de la fonction du gène rpgrip1l dans les processus de différenciation et de polarité cellulaire chez le poisson-zèbre." Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066402.

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Abstract:

Le cil primaire, présent à la surface de la majorité des cellules chez les vertébrés, a un rôle primordial dans le développement embryonnaire et dans la modulation de voies de signalisation, notamment Hedgehog et Wnt. Des défauts de cette structure sont associés à des maladies héréditaires, les ciliopathies. Le gène Rpgrip1l est impliqué dans deux ciliopathies, le syndrome de Joubert de type B et le syndrome de Meckel, caractérisées par une polydactylie, des kystes rénaux et des malformations du système nerveux central. Rpgrip1l code pour une protéine localisée principalement à la zone de transition des cils, une région impliquée dans le contrôle du trafic des protéines vers et hors du compartiment ciliaire. Mon projet de thèse a porté sur les fonctions de Rpgrip1l dans les processus de différenciation et de polarité cellulaire dans le système nerveux du poisson-zèbre. Mon premier travail, basé sur la perte de fonction de rpgrip1l par injection de morpholino dans des embryons de poissons zèbre, a mis à jour une fonction de Rpgrip1l dans la mise en place de la polarité planaire via la stabilisation de dishevelled, une protéine clé de la voie Wnt/PCP. J’ai ensuite étudié les fonctions plus tardives du gène rpgrip1l et de son paralogue rpgrip1 dans la rétine, via l’analyse de lignées de poissons zèbre hypomorphes. Cette étude a montré l’existence de multiples isoformes de Rpgrip1l et suggère de nouvelles fonctions extra-ciliaires pour Rpgrip1l dans la morphogenèse des photorécepteurs. L’ensemble de ce travail devrait permettre de mieux comprendre l’origine développementale des anomalies cérébrales et rétiniennes observées dans les ciliopathies
In vertebrates, primary cilia are present in virtually every cell and are involved in several signaling pathways such as the Hedgehog and Wnt pathways. Cilium dysfunctions have been causally linked to a group of pleiotropic and genetically heterogeneous human diseases, the ciliopathies. The human RPGRIP1L gene is one of the causal genes in Meckel and Joubert type B syndromes, two ciliopathies characterized by polydactyly, kidney cysts, and central nervous system malformations. The Rpgrip1l protein is enriched in the ciliary transition zone that establishes the ciliary gate controlling entry and exit of proteins in and out of the cilium. During my PhD, I studied the function of the Rpgrip1l gene in differentiation and planar cell polarity events that participate in brain morphogenesis. The first study, based on the loss of function of rpgrip1l by morpholino injection in zebrafish embryo, highlights rpgrip1l function in planar cell polarity via dishevelled stabilization, a core protein of Wnt/PCP pathway. Then, I studied the later functions of rpgrip1l and its paralogue rpgrip1 in the retina, using hypomorphic zebrafish. This work, by the discovery of rpgrip1l variants and description of photoreceptors defects, provides leads for new extra-ciliary functions of rpgrip1l in retinal morphogenesis. Ultimately, this work should result in a better understanding of the developmental origin of cerebral and retinal defects found in ciliopathies

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Sadek, Céline. "Mécanismes de formation des grains et propriétés des poudres laitières associées : influence de la composition du concentré et des paramètres de séchage." Thesis, Rennes, Agrocampus Ouest, 2015. http://www.theses.fr/2015NSARB264.

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Abstract:

Le séchage par atomisation est un procédé relativement bien maîtrisé, certains aspects de la transition goutte-particule n’étant pas encore totalement compris. Ainsi, comprendre précisément comment la particule est formée et comment ce phénomène peut être contrôlé reste aujourd’hui un défi majeur. Ce projet visait à découpler la complexité du phénomène de séchage via une approche multi-échelles. La formation de particules à partir de protéines laitières (protéines de lactosérum et micelles de caséines) a été étudiée avec différents systèmes expérimentaux (gouttes suspendue, confinée, mono-dispersées et enfin pulvérisées) dans des environnements de séchage contrôlés (température de séchage: 20°C à 190°C et l'humidité relative: 40% à 2%).Les résultats obtenus montrent que le séchage d'une goutte de protéine comprend trois étapes distinctes, mises en évidence par l’apparition d'événements morphologiques spécifiques (rétrécissement à vitesse établie, flambage, formation de vacuole). Selon le type de protéines, ces étapes diffèrent en termes de cinétique de séchage et de dynamique structurale, conduisant à des formes de grains caractéristiques. Ces différents comportements peuvent être rattachés aux conditions particulières de la formation d’une peau en surface et aux modes de dissipation des contraintes internes par les matériaux protéiques. De manière générale, l’approche multi-échelles de ce travail a permis de mettre en évidence la signature particulière de protéines laitières dans un état concentré et l'impact de la matière dans le processus de séchage
Spray drying is a well-established process but certain aspects of droplet-particle transition are not yet fully understood, resulting in variability in terms of powder quality and performance. Therefore, understanding precisely how the particle is formed and how it can be controlled still remain a major challenge. This PhD project aims to break down the complexity of the drying phenomenon using an exploratory multi-scale approach. Particle formation of milk proteins (whey proteins and casein micelles) was investigated using different experimental systems (single pendant droplet, confined droplet, mono-dispersed droplets and spraying cone droplets) in controlled drying environments (drying temperature: 20°C to 190°C and relative humidity: 40% to 2%).The results showed that the drying of a single protein droplet included three distinct stages highlighted with the occurrence of specific morphological events (constant rate shrinkage, buckling instability, vacuole nucleation). According to the type of proteins, these drying stages differed in drying kinetics and droplet dynamics, leading to characteristic and reproducible particle shapes whatever the droplet configuration and the drying conditions. These different kinds of drying behaviour were related to specific skin formation conditions and different responses of the protein material to internal stress. Finally, by means of this multi-scale approach, this work highlighted the particular signature of milk proteins in a concentrated state and in general the impact of the matter in the droplet drying process

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Papa, Iris. "Etude de la strie z de muscle blanc de poisson, mécanismes de destructuration et protéines impliquées : interaction capz-alpha-actinine." Montpellier 1, 1997. http://www.theses.fr/1997MON13502.

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Bouzaffour, Mohamed. "Voies de signalisation impliquées dans la régénération chez le poisson zèbre adulte." Paris 7, 2010. http://www.theses.fr/2010PA077065.

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Abstract:

Le poisson zèbre à la capacité de régénérer à l'identique de nombreux organes et toutes ses nageoires par épimorphie. L'amputation de la nageoire caudale va induire le recrutement de cellules progénitrices du moignon vers la lésion afin de former un amas de cellules indifférenciées, le blastème, qu va permettre de régénérer la partie manquante de la nageoire. Sa formation et son devenir vont impliquer une régulation coordonnée de la prolifération cellulaire et de la morphogenèse. De précédentes études mettent en évidence le rôle primordial de voies de signalisation telles que Wnt, Fgf, Sdfl, Shh ou Bmp dans la formation et la prolifération des cellules du blastème. Au cours de ce travail, nous montrons que Sdfl a va exercer une double fonction: d'une part en relayant le signal Fgf pour la mise en place du blastème et d'autre part en participant à l'extinction de la voie Fgf via un rétrocontrôle négatif sur l'expression de fgfZOa. Cela va ainsi permettre de réguler la croissance du blastème afin de régénérer une nageoire identique à celle de départ. Un autre aspect de ce travail a permis de mettre en évidence une implication de la signalisation des hormones thyroïdiennes et de l'apoptose dans la formation du blastème. L'amputation va ainsi induire l'expression de la Déiodinase 3. Cette enzyme, qui inactive localement les hormones thyroïdiennes, est indispensable à la formation du blastème. L'analyse de l'apoptose révèle une régulation très fine de ce processus aussi bien dans le temps que dans l'espace. Son inhibition par un inhibiteur de l'activation des caspases ou son induction par l'acide rétinoïque entraine une inhibition de la régénération
Zebrafish present the ability to faithfully regenerate organs and fins after an injury by a process called epimorphic regeneration. During caudal fin regeneration, the amputation triggers the recruitment of progenitor cells towards the lesion to form a mass of undifferentiated cells, the blastema, which gives rise to the lost part of the fin. Its formation and its fate involve a coordinated regulation of cell proliferation, morphogenesis and patterning. Previous studies highlight the crucial role of signalling pathways like Fgf, Wnt, Sdfl, Shh or Bmp for the blastemal cell formation and proliferation. During this study, we show that the chemokine Sdfl a has a dual role throughout the first steps of caudal fin regeneration. First, it relays the Fgf Signalling for the formation of the blastema and then it exerts, with the Wnt pathway, a negative feedback on the Fgf pathway through the inhibition of fgfZOa expression. This negative feedback permits the regulation of the blastema size in order to regenerate a fin with the same length that the original one. Another aspect of this work was the identification of novel signalling pathways involved in blastema formation. We demonstrate that thyroid hormones signalling and apoptosis are involved in this process. The amputation triggers the expression of Deiodinase 3. This enzyme regulates locally the thyroid hormones concentration and is essential for blastema formation. The analysis of apoptotic cell death shows that this process is highly regulated in time and in space. Its inhibition by caspases activation inhibitor or its induction by retinoic acid inhibits the regeneration

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Picard-Deland, Éliane. "Les effets combinés d'une protéine de poisson et d'un supplément d'acides gras N-3 d'origine marine sur le profil lipidique et l'inflammation chez des hommes et des femmes résistants à l'insuline." Master's thesis, Université Laval, 2011. http://hdl.handle.net/20.500.11794/23134.

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Abstract:

Ce mémoire présente les travaux de maîtrise vérifiant les effets de l'ajout d'un supplément de gélatine de poisson à un supplément d'AGPI n-3 sur l'apport énergétique et le poids corporel ainsi que sur le profil lipidique et les marqueurs inflammatoire et du risque cardiovasculaire chez des sujets résistants à l'insuline. Suivant un dispositif d'expérience en chassé-croisé, 16 sujets ont été soumis à deux périodes expérimentales de huit semaines (AGPI n-3 seul et AGPI n-3+ un supplément de gélatine de poisson). Les résultats de cette étude ont montré que l'administration d'un supplément de gélatine de poisson provoque une diminution de l'apport en glucides sans modification de l'apport énergétique total et du poids corporel chez les hommes et les femmes. Ce même supplément de gélatine de poisson potentialise également les effets réducteurs d'un supplément d'AGPI n-3 sur les TG plasmatiques chez les femmes, mais non chez les hommes, montrant que l'effet de la supplementation en gélatine est dépendant du sexe.

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Dolez, Dixsaut Morgane. "Les Laminines participent à la diversification des types de fibres musculaires squelettiques et à la morphogenèse du myotome chez le poisson zébré." Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066164.

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Abstract:

Chez le poisson zébré, la formation d’un myotome fonctionnel implique la diversification de types musculaires et la migration au travers du myotome des fibres lentes. L'expression spécifique du facteur de transcription engrailed à la fois dans les fibres lentes pionnières et les fibres rapides médianes définit un compartiment central dans le myotome. Cependant, le mécanisme qui permet de restreindre l'expression d’Engrailed à ce compartiment central n’est que partiellement élucidé. Une fois déterminées, les fibres lentes, ancrées aux frontières intersomitiques riches en Laminines, migrent latéralement au travers du myotome jusqu’à atteindre leur position latérale finale. Les mécanismes sous-jacents à cette migration remarquablement coordonnée ne sont pas compris. Le rôle des Laminines dans la diversification des types de fibres musculaires et dans les comportements cellulaires dynamiques de ces fibres est analysé à l’aide du mutant sleepy/lamc1. Nos résultats montrent que les Laminines sont requises pour l’exclusion de la signalisation Bmp du compartiment central du myotome ce qui conduit à la restriction de l’expression d’Engrailed à ce compartiment central. Les Laminines, via la régulation spatiale de la réponse au signal Bmp, et en combinaison avec le signal Hedgehog provenant de la notochorde, ont donc un rôle organisateur du myotome en créant un domaine central Engrailed positif. Nos résultats montrent également que les Laminines sont requises pour la polarisation de la morphologie des fibres lentes en migration et pour la concentration d'adhésions focales aux extrémités de ces fibres, ce qui permettrait la coordination spatiale de la migration des fibres lentes

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Leinot, Alain. "Propriétés gélifiantes des protéines myofibrillaires (surimi) de sardines en fonction de la saison de pêche et de la durée d'entreposage réfrigéré ou congelé des poissons." Montpellier 2, 1991. http://www.theses.fr/1991MON20025.

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Abstract:

La valorisation d'un poisson gras pelagique, la sardine de mediterranee (sardina pilchardus), a ete etudiee en utilisant la technologie japonaise de preparation de surimi (concentre de proteines myofibrillaires). Les proprietes gelifiantes de ces proteines ont ete evaluees en mesurant la texture des gels de surimi prepares par incubation en presence de nacl, et par cuisson. L'alteration progressive des proprietes gelifiantes des proteines myofibrillaires a ete systematiquement etudiee en fonction de la temperature et de la duree d'entreposage refrigere ou congele des sardines. La vitesse d'alteration est toujours plus elevee avec les sardines pechees en periode de reproduction (mars ou juin 89) qu'avec celles pechees a d'autres periodes de l'annee (octobre ou decembre 88 ou 89). Les mecanismes biochimiques responsables de l'alteration des proprietes gelifiantes des proteines myofibrillaires ont ete etudies par mesures de solubilite a diverses forces ioniques, par electrophorese, et par calorimetrie differentielle a balayage

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Richard, Lenaïg. "Conséquences métaboliques du remplacement de la farine de poisson par des protéines végétales chez la crevette géante tigrée (Penaeus monodon)." Thesis, Bordeaux 1, 2011. http://www.theses.fr/2011BOR14256/document.

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Abstract:

De part son profil équilibré en acides aminés essentiels (AAE), la farine de poisson (FP) est la source protéique principale utilisée dans l’alimentation des crevettes d’élevage. Cependant, compte tenu des enjeux du développement durable de la production aquacole, son utilisation doit être réduite, et remplacée par d’autres sources protéiques comme les protéines végétales (PV), qui sont souvent carencées en lysine et méthionine mais riches en cystine. Les conséquences d’un tel changement alimentaire sont peu connues chez la crevette tigrée Penaeus monodon. Pour les évaluer, nous avons utilisédes aliments semi-purifiés reflétant les carences/excès en AA des PV pour estimer les besoins en protéine, lysine et méthionine pour l’entretien et la croissance. Tout en confirmant les données antérieures sur les besoins pour la croissance des stades postlarves, nous avons pu préciser la contribution de l’apport en ces deux acides aminés pour l’entretien. Au niveau métabolique, la variation de l’apport protéique (10, 30, 50% protéine brute) et la carence en méthionine (-30% par rapport au besoin) entraînent une modification de l’activité des enzymes du catabolisme des AA, mais pas celle des voies de reméthylation et transsulfuration. En revanche, et pour la première fois chez la crevette, nos résultats démontrent une épargne de la méthionine par la cystine (et la choline), soulignant l’importance de l’apport en AA soufrés totaux (methionine + cystine). Nos résultats illustrent aussi l’importance qu’il convient d’accorder à la disponibilité des AAE dans les études de remplacement de la FP par un mélange de PV pour améliorer l’utilisation azotée chez la crevette P. monodon
Due to its well balanced essential amino acid (EAA) profile, fishmeal (FM) is the major protein source used in the formulation of aquafeed for cultured shrimp. To sustain farming systems, its incorporation, however, must be reduced and substituted by other protein sources less well nutritionally balanced, such as plant protein ( PP) which are often low in lysine and methionine but rich in cystine. The metabolic consequences of such a shift in dietary profile are not well known for the black tiger shrimp, Penaeus monodon. To describe these consequences, we used semi-purified diets limiting in lysine and methionine (to reflect PP profile) to determine juvenile requirements of protein, lysine and methionine for both maintenance and growth, applying a factorial approach. Our results confirm the previous data on growth requirement for post-larvalstages of P. monodon while also providing new data on maintenance requirements. At the metabolic level, a variation in the dietary protein level (10, 30, 50 % crude protein) and methionine (adequate or 30% lower) resulted in a significant change in the activity of transdeaminating enzyme, but not those of remethylation and transsulfuration. Nevertheless, we found for the first time that methionine utilisation for body protein accretion can be spared by cystine and choline (up to 50%) in this species, illustrating the importance to consider total sulphur AA supply. Our data also show that full consideration should be given to AA availability in order to develop practical diets with low FM levels for P. monodon

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Pezeron, Guillaume. "Aspects moléculaires et cellulaires de la formation de l'endoderme chez le poisson zèbre." Paris 7, 2007. http://www.theses.fr/2007PA077046.

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Abstract:

Au cours la gastrulation, l'embryon de vertébré s'organise en une structure complexe composée de trois populations cellulaires distinctes, les feuillets embryonnaires, et présentant des axes antéro-postérieur et dorso-ventral morphologiquement identifiables. Au cours de ma thèse je me suis intéressé aux mécanismes moléculaires et cellulaires permettant la formation de l'endoderme, le feuillet embryonnaire le plus interne, à l'origine du tractus digestif et de l'épithélium du système respiratoire. J'ai étudié le rôle d'un nouveau gène, raslllb, sélectionné pour son expression dans le mésendoderme dorsal au début de la gastrulation. Cette étude m'a permis de montrer que Rasl11b est un modulateur négatif d'Oep qui est un corécepteur de Nodal, mais aussi qu'Oep, en plus de sa fonction de corécepteur de Nodal, peut réguler indépendamment la formation de l'endoderme. Parallèlement, j'ai analysé le comportement des cellules endodermiques in vivo en utilisant une lignée transgénique qui exprime une protéine rapporteuse fluorescente dans les cellules endodermiques. Ainsi, j'ai pu montrer que contrairement à ce qui était admis jusqu'à maintenant, l'endoderme se comporte différemment du mésoderme pendant la gastrulation et migre selon un mouvement actif de marche aléatoire. Ce mouvement permet aux cellules de l'endoderme de coloniser la surface du vitellus et ainsi de former le feuillet endodermique
During gastrulation, vertebrate embryos form the tree germ layer and develop antero-posterior and dorso-ventral axis. For my thesis, I have been working on molecular and cellular aspects of endoderm formation. The endoderm is the inner-most germ layer and give rise to digestive apparatus and respiratory epithelium. I studied the function of a new gene, rasl11b, selected for its expression within dorsal mesendoderme during gastrulation. 1 have shown that Rasll Ib is a negative modulator of Oep, a Nodal coreceptor, but also that Oep, beside its Nodal coreceptor function, can independently regulate the formation of the endoderm. Beside this study, using a transgenic line that express a fluorescent reporter protein, I analysed the behaviour of endodermal cells in vivo. I have shown that endoderm behave differently from mesoderm during gastrulation and migrate in a active random walk movement. This behaviour allow endodermal cell to colonise the yolk surface and thus to form the endodermal germ layer

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Galland-Irmouli, Anne-Valérie. "Etude des propriétés allergéniques et nutritionnelles de protéines d'origine marine : cabillaud, algue rouge Palmaria palmata." Nancy 1, 1999. http://www.theses.fr/1999NAN11012.

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Abstract:

Dans une première partie, nous avons purifié par précipitation au sulfate d'ammonium, chromatographie sur hydroxylapatite et électrophorèse préparative un nouvel allergène de 41 kDa du cabillaud. La détermination de sa séquence N-terminale a montré qu'il s'agissait d'une glycéraIdéhyde-3-phosphate-deshydrogénase. Son allergénicité a été confirmée par western-blot avec des sérums de patients allergiques au cabillaud. Une sonde immunologique a été préparée. Elle a permis de détecter cet allergène de 41 kDa, purifié à partir d'un filet de cabillaud pre rigor mortis, dans des filets de cabillaud commerciaux, surgelé ou frais et dans des filets surgelés de colin, merlan, limande, saumon et thon. Dans une seconde partie, nous avons évalué les opportunités de valorisation de l'algue Palmaria palmata. Cette algue s'est confirmée être une source potentielle de protéines contenant la majeure partie des acides aminés essentiels. La digestion in vitro des protéines de cette algue s'est toutefois avérée modérée. Cette faible digestibilité était sans doute due à la présence de fibres solubles (xylane). La digestibilité des protéines de l'algue a pu être améliorée par une fermentation préalable de l'algue par Aspergillus oryzae et/ou Trichoderma pseudokoningii. Deux voies de purification de la phycoérythrine ont été mises au point: par l'électrophorèse préparative et par IMAC qui a donné de meilleurs rendements. La phycoérythrine obtenue a présenté un spectre caractéristique de la R-phycoérythrine (maximum d'absorption à 499, 545 et 565 nm) et un maximum de fluoresœnce à 578 nm. Une seule bande protéique de 240 kDa a été détectée en électrophorèse native. L'électrophorèse SDS-PAGE a montré deux bandes majoritaires de 20 et 21 kDa et une minoritaire de 30 kDa. Ces observations sont en accord avec une composition sous-unitaire de type (αβ)6γ, caractéristique de la R-phycoérythrine. La phycoérythrine ainsi purifiée a montré une bonne stabilité jusqu'à 60°C et entre pH 3,5 et 9,5.

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Gauron, Carole. "Rôle de l'apoptose et des ROS (Reactive Oxygen Species) dans les premières étapes de la régénération chez l'adulte." Paris 7, 2014. http://www.theses.fr/2014PA077208.

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Abstract:

Nous avons utilisé la régénération de la nageoire caudale du poisson zèbre comme modèle physiologique pour comprendre le rôle des cellules apoptotiques dans le recrutement des cellules souches chez l'adulte. Peu de temps après l'amputation, les cellules formant le moignon répondent à la blessure par dédifférenciation, en acquérant une identité de cellule progénitrice. Nous avons récemment identifié la mort cellulaire et les espèces réactives de l'oxygène (ou ROS, pour Reactive Oxygen Species) comme étant des signaux précoces régulés après blessure et amputation. La cicatrisation induit une mort cellulaire rapide et locale, tandis que l'amputation induit une seconde vague d'apoptose, spécifique de la régénération. Nous avons ensuite posé la question de la voie de signalisation engagée par les cellules apoptotiques, et un criblage chimique nous a permis d'identifier un signal purinergique. Par ailleurs, l'inhibition de la régénération par inhibition de l'apoptose peut être restaurée par de l'adénosine exogène. De façon surprenante, l'adénosine seule est suffisante pour augmenter le nombre de cellules progénitrices ainsi que pour stimuler la régénération. Afin de mieux comprendre la diffusion du signal apoptotique in vivo, nous avons mis au point des outils optogénétiques. Ces systèmes nous permettent d'induire l'apoptose et suivre sa progression in vivo. Combiné à des senseurs physiologiques fluorescents, ces outils nous permettent d'étudier de façon dynamique les effets de l'apoptose sur les cellules avoisinantes
We used regeneration of the zebrafish caudal fin as a physiological model to understand the role of apoptotic cells in stem cell recruitment in adult. Shortly after amputation, cells from the stump respond to injury by dedifferentiating and acquiring a progenitor identity. We recently identified cell death and ROS signalling as early events regulated after healing and amputation. Wound healing induces fast local cell death, while amputation induces a second round of apoptosis, specific of the regeneration. We then ask for the signalling pathway engaged by apoptotic cells and chemical screening allows us to identify a purinergic signalling. Moreover, the inhibition regeneration by inhibition of apoptosis could be rescued by exogenous adenosine. Surprisingly, adenosine alone is sufficient to enhance the number of progenitor cells and to stimulate fin regeneration. To better understand the spreading of apoptosis signalling in vivo, we implemented optogenetic tools. This system allows us to induce apoptosis and follow its progression in vivo. Combined with physiological fluorescent sensors, this allows us to investigate the dynamical effects of apoptosis on neighbouring cells

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Bonneau, Benjamin. "Implication des protéines de la famille Bcl-2 dans la régulation des flux calciques au cours du développement embryonnaire précoce du poisson zèbre." Thesis, Lyon 1, 2013. http://www.theses.fr/2013LYO10155/document.

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Abstract:

L'apoptose est un processus cellulaire fondamental pour l'homéostasie tissulaire. Ce type de mort cellulaire est sous le contrôle des protéines de la famille Bcl-2 qui régulent la perméabilité de la membrane externe de la mitochondrie. Cependant, au-delà de leur rôle dans le contrôle de l'apoptose, les protéines de la famille Bcl-2 peuvent intervenir dans d'autres processus tels que le cycle cellulaire ou le métabolisme. Au sein du laboratoire, nous nous intéressons tout particulièrement aux rôles non-apoptotiques des protéines Bcl-2 au cours du développement embryonnaire. Grâce à l'utilisation du poisson zèbre, nous avons pu montrer que les protéines de la famille Bcl-2 contrôlent différents processus au cours du développement grâce à leur capacité à réguler l'homéostasie calcique. En effet, nous avons montré que la protéine anti-apoptotique Nrz participe au remodelage du cytosquelette d'actine au cours de l'épibolie en régulant la concentration de calcium cytosolique par son interaction avec le récepteur à l'IP3 (IP3R). Nous avons de plus pu montrer que Nrz diminue la sortie de calcium du réticulum endoplasmique en inhibant la fixation de l'IP3 sur son récepteur. Nous avons également identifié un nouveau membre pro-apoptotique de la famille Bcl-2, Bclwav, spécifiquement exprimée chez les poissons et le xénope. Cette protéine participe à la régulation de l'homéostasie calcique mitochondriale en interagissant avec VDAC. Nous avons de plus montré que cette activité est essentielle pour les mouvements de convergence et d'extension au cours du développement embryonnaire précoce du poisson zèbre
Apoptosis is a key cellular process for tissue homeostasis. Apoptotic cell death is under control of Bcl-2 family proteins which regulate outer mitochondrial membrane permeability. However, beyond their role in apoptosis, Bcl-2 family proteins are also involved in other cellular processes such as cell cycle or metabolism. In our laboratory we are interested in non-apoptotic functions of Bcl-2 family proteins in embryonic development. Using zebrafish model we have shown that Bcl-2 proteins control different processes during early development thanks to their ability to regulate calcium homeostasis. Indeed, we have shown that the anti-apoptotic protein Nrz participates in actin cytoskeleton remodeling during epiboly by regulating cytosolic calcium concentration via an interaction with the IP3 receptor (IP3R). We have also demonstrated that Nrz decreases calcium release from the endoplasmic reticulum by inhibiting IP3 fixation on its receptor. We have furthermore identified a new pro-apoptotic member of Bcl-2 family, Bcl-wav which is expressed only in fish and frogs. This protein regulates mitochondrial calcium homeostasis by interacting with VDAC. We have moreover shown that this activity is essential for convergence and extension movements during early zebrafish development

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Dort, Junio. "Effet de la protéine de morue sur la régénération musculaire consécutive à une blessure chez le rat." Doctoral thesis, Université Laval, 2014. http://hdl.handle.net/20.500.11794/25208.

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Abstract:

Cette thèse visait à déterminer les effets de la protéine de morue sur la régénération post-blessure du muscle squelettique chez le rat. Nous avons observé que la croissance et la récupération de la masse musculaire étaient meilleures lorsque les animaux consommaient de la protéine de morue, conduisant à une augmentation de l’aire des fibres musculaires comparée à la caséine. Ces effets bénéfiques de la protéine de morue étaient accompagnés d’un niveau plus élevé de myogénine et d’une réduction de noyaux centraux et de l’espace interstitiel. Plus spécifiquement, cette thèse consistait à déterminer des mécanismes et à identifier un groupe d’acides aminés présent dans la protéine de morue pouvant expliquer ses effets bénéfiques. Nos résultats ont démontré que la protéine de morue, grâce à ses niveaux élevés d’arginine, de glycine, de taurine et de lysine, a réduit la densité des macrophages pro-inflammatoire (ED1+) et le niveau de COX-2 tandis qu’elle a augmenté la densité des macrophages anti-inflammatoires (ED2+) comparée à la caséine. Cependant, cette réponse anti-inflammatoire ne pouvait expliquer que partiellement l’effet positif de la protéine de morue. En effet, l’ajout d’arginine, de glycine, de taurine et de lysine à la caséine, bien que simulant adéquatement l’effet anti-inflammatoire, reproduisait en partie seulement la croissance et la régénération musculaire accrues observées avec la protéine de morue. De plus, nous avons observé que la protéine de morue diminuait le niveau de MuRF1 à la phase inflammatoire, indiquant une réduction de dégradation des protéines musculaires comparée à la caséine. La protéine de morue pourrait avoir aussi favorisé la protéosynthèse musculaire lors de la phase avancée du processus puisque les niveaux de phospho-Akt-Ser473 étaient augmentés. Par ailleurs, les effets hypertrophiques et anti-cataboliques de la protéine de morue n’étaient que partiellement expliqués par ses niveaux élevés d’arginine, de glycine, de taurine et de lysine. En conclusion, les effets anti-inflammatoires de la protéine de morue sont attribués à ses niveaux élevés d’arginine, de glycine, de taurine et de lysine alors que ces acides aminés contribuent partiellement aux effets bénéfiques observés avec la protéine de morue sur la récupération de la masse musculaire. Ces données pourront servir de tremplin vers des traitements nutritionnels efficaces pour optimiser la régénération musculaire post-blessure.
The overall aim of this thesis was to study the effects of cod protein on regeneration of skeletal muscle following injury in rats. We observed that recovery of muscle mass and/or growth were higher in animals consuming the cod protein regimen, leading to larger fiber size compared with those consuming the casein diet. The beneficial effects of cod protein on muscle regeneration were also shown by higher level of myogenin, lower number of centrally-nucleated fibers and reduced interstitial space. Specifically, the current thesis was designed to identify which specific amino acids in cod protein could underly its impact on muscle repair and to investigate the pathways supporting these effects. Our results showed that cod protein reduced the density of pro-inflammatory macrophages (ED1+) and the level of COX-2 while increasing the density of anti-inflammatory macrophages (ED2+) compared to casein, due to its high levels of arginine, glycine, taurine and lysine. However, this anti-inflammatory action could only partially explain the positive effect seen with cod protein on muscle recovery because the addition of arginine, glycine, taurine and lysine to casein, although it closely mimicked the anti-inflammatory effect of cod protein, did not support muscle growth and regeneration as did cod protein. When examining the IGF1-Akt/PKB signaling during the recovery period, we observed that cod protein decreased the level of MuRF1 early after the injury, indicating a reduced muscle protein degradation compared to casein. Data also suggest that cod protein might have increased muscle protein synthesis during the later phase of the recovery process based on an increased phospho-Akt-Ser473. Hypertrophic and anti-catabolic effects exerted by cod protein were only partially driven by its high levels of arginine, glycine, taurine and lysine. Through this work in rats, we have demonstrated that while the beneficial effects of consuming cod protein on inflammation are driven by its high levels of arginine, glycine, taurine and lysine, these amino acids only partly contribute to the effect seen with cod protein on muscle mass recovery following injury. These data could help elaborate more efficient nutritional strategies in order to optimize muscle recovery after injury.

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Passet, Bruno. "Contribution à l’étude du rôle biologique des gènes de la famille Prion." Versailles-St Quentin en Yvelines, 2012. http://www.theses.fr/2012VERS0055.

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Abstract:

La protéine Prion, PrP, est connue pour son implication dans les encéphalopathies spongiformes transmissibles. Cette protéine appartient à une famille de glycoprotéines membranaires qui comprend également la protéine Shadoo. Le rôle biologique de ces deux protéines reste peu connu. L’objectif de cette thèse a été de d’étudier le rôle de Shadoo par dérégulation de l'expression de son gène chez la souris et le poisson zèbre. Les résultats montrent que les protéines PrP et Shadoo interviendraient chez la souris dans le développement précoce de l’embryon, notamment dans la mise en place du placenta. Chez le poisson zèbre, le gène Shadoo1, exprimé précocement, aurait aussi un rôle dans le développement embryonnaire. Ces données apportent un éclairage nouveau sur le rôle de Shadoo et de la PrP dans le développement embryonnaire des vertébrés
The prion protein, PrP, is known for its involvement in transmissible spongiform emcephalopathies. This protein belongs to a membrane-associated glycoprotein family that comprises also the Shadoo protein. The biological role of these two proteins remains poorly understood. The aim of this thesis was to study the function of Shadoo by deregulating its gene expression in mice and zebrafish. The results indicate that PrP and Shadoo appear to be involved in early mouse embryonic development, and more precisely in the placenta development. In zebrafish, expressed Shaddo1-encoding gene is also involved in early embryogenesis. These data highlight a new role of PrP and Shadoo in vertebrate embryonic development

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Gibon, Guillaume. "Mécanismes moléculaires et cellulaires de la différenciation de l'endoderme pharyngien et des structures associées chez le poisson zèbre." Paris 7, 2010. http://www.theses.fr/2010PA077149.

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Abstract:

Chez les vertébrés, le développement du pharynx nécessite des interactions cellulaires et moléculaires coordonnées dont l'endoderme pharyngien est l'un des acteurs clés. Un des dérivés de l'endoderme dans le pharynx sont les organes sensoriels de la gustation, les bourgeons gustatifs. Au cours de ma thèse, j'ai examiné le développement de cet organe en utilisant une approche de génétique classique et une approche pharmacologique. J'ai caractérisé le phénotype présent dans la lignée mutante OL185 obtenue par mutagenèse ENU. Ce mutant présente une réduction du nombre de bourgeons gustatifs et une altération de leur distribution dans le pharynx. De plus, la mutation altère la maturation du cartilage et de la musculature des arcs pharyngiens. Donc cette mutation affecte à la fois plusieurs composés du pharynx. La mutation OL185 a été cartographiée dans un intervalle de 1,58Mb sur le chromosome 21. D'autre part, afin d'étudier les interactions cellulaires et moléculaires intervenant au cours du développement des bourgeons gustatifs, j'ai mis au point un protocole pharmacologique qui permet d'altérer l'expression de la sérotonine dans les bourgeons gustatifs. Cet outil devrait permettre de mieux comprendre le rôle de la sérotonine au cours de la formation des bourgeons gustatifs
The development of the pharynx relies on coordinated cellular and molecular interactions, largely conserved in vertebrates. Among different components, the endoderm and its derivatives play a key role in this process. My thesis was focused on the development of an endoderm derivative, the sensory organs of taste (taste buds). I analysed the development of taste buds in zebrafish, through forward genetics and a pharmacological approach. In particular, I characterized the phenotype of the OL185 mutant line obtained through ENU mutagenesis. In OL185, the number of taste buds and their distribution are altered. In addition, the late developments of skeletal and muscular components in the pharynx are also affected by this mutation. Introduction of wild type endoderm in the mutant pharynx restores the skeletal but not muscular development. The OL185 locus was genetically mapped on chromosome 21, in an interval of 1,58Mb. In parallel, to get further insight into the taste bud development, I established a pharmacological assay that affects the expression of serotonin in taste buds. This tool should allow the analysis of the role of serotonin in taste bud formation

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Bernard, David Claude. "Etude du système lymphocytaire Tαβ d'un poisson téléostéen, la truite arc-en-ciel : répertoires, récepteurs de co-stimulation, réponse antivirale". Versailles-St Quentin en Yvelines, 2005. http://www.theses.fr/2005VERS0018.

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Abstract:

Les poissons osseux possèdent les principaux constituants du système immunitaire des vertébrés dans un contexte physiologique particulier. En cela, le système lymphocytaire T et sa réponse spécifique contre les agents pathogènes présentent des aspects originaux, différents des mécanismes observés chez l'homme ou la souris. En réponse à une vaccination ADN contre le virus de la Septicémie Hémorragique Virale (SHV) et en utilisant une méthodologie de spectratypage de CDR3, les modifications du répertoire TCR  des splénocytes ont été analysées. Cette approche a permis de montrer que la truite arc-en-ciel est capable, comme les mammifères, de produire une réponse publique présentant une surprenante complexité interne, dirigée contre une protéine virale. Des homologues des récepteurs de co-stimulation CD28 et CTLA4 ont également été identifiés. La structure des gènes, les profils d'expression des transcrits et la fonctionnalité des protéines ont été étudiés, suggérant que ces récepteurs possèdent des fonctions homologues à celles de leurs équivalents chez les mammifères. Enfin, une population intestinale d'IEL a été caractérisée, qui exprime des homologues de marqueurs T. Cette population possède un répertoire TCR  polyclonal chez des individus naïfs, ce qui contraste fortement avec les répertoires humains ou murins. Ces IEL sont également capables d'élaborer une réponse publique après une infection systémique. La truite arc-en-ciel effectue donc des réponses T d'une grande diversité suivant des mécanismes d'activation proches de ceux des mammifères. En revanche, l'organisation des compartiments T semble différente au regard des observations réalisées sur les IEL
Most of the basic components of the vertebrate adaptive immune system are present in teleost fish, in the context of a particular physiology. Original aspects of the T-cell system and specific cellular response could be observed, compared to other vertebrate immune mechanisms. Using a CDR3 spectratyping method, we have described the modifications of the TCR  repertoire induced by DNA vaccination against Viral Hemorrhagic Septicemia (VHS). This approach demonstrated that a public response was targeted to VHS glycoprotein and revealed a great internal complexity. CD28 and CTLA4 homologues were also identified. Several lines of evidences as intron/exon structure, mRNA expression profiles and functional experiments suggest that these receptors constitute co-stimulatory receptors as their mammalian counterparts. At last, an intestinal IEL population was characterized. These cells expressed typical T-cell markers, and displayed a polyclonal and diverse TCR  repertoire in naive fish, in sharp contrast to what is observed in human and in the mouse. Moreover, IEL contain antigen responsive T cells, since they participate to the specific T-cell response against a systemic viral infection. The specific immune T-cell response in rainbow trout is extremely diverse and displays activation mechanisms comparable to their mammalian counterparts. However, the IEL characterization revealed that the organization of T-cell compartments is different from the one observed in human or in the mouse

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Turcotte, Stéphane. "Effets et mécanismes d'action de la consommation de protéines de saumon hydrolysées et des huiles de menhaden et d'argan sur la sensibilité à l'insuline chez un modèle de rat obèse." Master's thesis, Université Laval, 2008. http://hdl.handle.net/20.500.11794/20261.

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Abstract:

La consommation d'une diète riche en lipides et en sucre et à base de protéines de saumon hydrolysées améliore la sensibilité à l'insuline des rats Wistar comparativement aux rats consommant une diète à base de caséine. Cette amélioration de la sensibilité à l'insuline pourrait être expliquée par un plus faible gain de poids des animaux consommant la diète avec la protéine de saumon hydrolysée comparativement à l'autre diète diabétogénique. Comme aucune variation au niveau du poids des tissus adipeux viscéraux n'est remarquée chez ces animaux, l'hypothèse d'une augmentation de la dépense énergétique, due à la présence de composés tels que la calcitonine du saumon et les sels biliaires, pourrait être une explication possible à ce gain inférieur de poids corporel. Malgré un effet positif de cette protéine sur la sensibilité à l'insuline, cet effet n'est pas aussi remarquable que celui observé avec la protéine de morue dans une diète riche en lipides et en sucre, une étude réalisée précédemment dans notre laboratoire. Une explication possible de cette différence dans la protection de la sensibilité à l'insuline entre les deux diètes pourrait être la qualité de la protéine utilisée. Une partie de la protéine de saumon hydrolysée provient des viscères tandis que la protéine de morue provient entièrement de muscles. Par ailleurs, la consommation d'une diète riche en lipides et en sucre où 6% des lipides ont été remplacés par de l'huile de menhaden a démontré que ces rats ont une amélioration du profil glucidique et insulinémique comparativement aux animaux consommant la diète sans remplacement. La diminution de la phosphorylation de la protéine AKT sur le résidu serine 473 des foies de ces animaux comparativement aux animaux consommant une diète chow démontre que le foie n'est pas le tissu cible de cette amélioration du profil glucidique et insulinémique observée chez ces animaux. La baisse de poids des tissus adipeux viscéraux suggère que cette amélioration observée au niveau du métabolisme pourrait s'expliquer par l'implication des tissus périphériques. D'autre part, la consommation d'une diète riche en lipides et en sucre chez des rats Wistar où 6% des lipides ont été remplacés par de l'huile d'argan a démontré que cette huile n'exerce pas d'effet positif sur la sensibilité à l'insuline. De plus, les huiles d'argan et de menhaden n'ont pas d'effet notable sur la voie des MAPK.

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Lifrani, Awatif. "Etude du risque allergique à différentes protéines alimentaires Mise au point de modèle de souris allergiques à l'arachide, à l'albumine, à la caséine et à la colle de poisson." Phd thesis, INAPG (AgroParisTech), 2006. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00001928.

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Abstract:

L'allergie alimentaire est actuellement inquiétante par sa fréquence dans les pays industrialisés. En effet, son incidence est en constante et rapide augmentation. Parmi les allergènes majeurs: l'arachide, le poisson, l'oeuf et le lait de vache sont couramment trouvés dans de nombreux produits agro-alimentaires (farines, vins...) d'où l'obligation d'un étiquetage systématique. Notre objectif était d'établir des modèles de souris allergiques, à certaines protéines alimentaires (arachide, colle de poisson, albumine et caséine), caractérisés par la production in vivo d'IgE et d'IgG1 sériques spécifiques de ces protéines et par les manifestations cliniques suites aux tests de provocation avec ces mêmes protéines. Nous avons étudié, tout d'abord, l'allergénicité des vins sur quatre souches de souris (C3H, CBA, DAB/2 et SJL) après les différentes étapes du collage et nous avons montré que la décantation, la filtration et le vieillissement sont des étapes importantes pour l'élimination des produits utilisés pour la clarification des vins. Ensuite, nous avons étudié la réaction croisée arachide-lupin chez les souris C3H, CBA, SJL et BALB/c sensibilisées à l'arachide et nous avons montré que la réaction croisée arachidelupin in vitro n'implique pas une allergie croisée arachide-lupin. Enfin, nous avons, expérimenté et comparé plusieurs approches et voies de sensibilisation pour identifier les facteurs environnementaux nécessaires à la manifestation de la réponse allergique. Nous avons conclu que la sensibilisation avec l'arachide par voie orale naturelle sur un modèle de souris sensibilisable (C3H et CBA), en présence et en absence d'adjuvant, ne provoque pas d'allergie. En conclusion, la voie intrapéritonéale en présence d'adjuvant reste le moyen le plus rapide et le plus efficace pour obtenir un modèle de souris allergiques.

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Lifrani, Awatif. "Etude du risque allergique à différentes protéines alimentaires : mise au point de modèles de souris allergiques à l'arachide, à l'albumine, à la caséine et à la colle de poisson." Paris, Institut national d'agronomie de Paris Grignon, 2006. http://www.theses.fr/2006INAP0001.

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Talbot, Émilie. "Impact de la protéine de morue sur la sensibilité à l'insuline, le métabolisme du glucose et divers marqueurs cardiovasculaires chez des femmes atteintes du syndrome des ovaires polykystiques." Thesis, Université Laval, 2013. http://www.theses.ulaval.ca/2013/29767/29767.pdf.

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Grauffel, Cédric. "Etude in silico de la reconnaissance de la méthylation des lysines sur les queues d'histones." Strasbourg, 2009. http://www.theses.fr/2009STRA6202.

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Abstract:

Les modifications post-traductionnelles (MPT) sur les queues d'histone jouent un rôle important dans des mécanismes comme la régulation de l'expression des gènes. Un mode d'action passe par le reconnaissance d'une modification covalente par un domaine protéique appartenant généralement à une protéine associée au remodelage de la chromatine (enzyme, facteur de transcription, etc. . . ). La méthylation des lysines est une modification particulièrement importante, pour laquelle plusieurs sites ont été identifiés sur les histones. Nous avons entrepris de déterminer les bases de la sélectivité de domaines protéiques pour un site de méthylation donné, en utilisant les nombreuses données disponibles dans les banques de données structurales (PDB). Nous avons utilisé des calculs de dynamique moléculaire, couplés à un protocole dérivé de la méthode MM/PBSA, pour étudier les interactions entre les peptides d'histone et les domaines protéiques. Il a dans un premier temps fallu développer et valider un jeu de paramètres permettant l'étude par dynamique moléculaire des MPT. L'analyse de nos résultats a notamment mis en évidence le fait que certains domaines protéiques reconnaissent un court motif de séquence afin de discriminer entre différents sites de méthylation. Il apparaît ainsi clairement que les chromodomaines sont spécifiques d'un motif ARKmeS, tandis que les domaines PHD lient le motif ARTKme sur H3. L'ensemble de nos données peut servir de point de départ à la recherche de nouveaux effecteurs des MPT, comme nous avons entrepris de le faire pour le cas particulier des domaines PHD
Post-translationnal modifications (PTMs) of histone tails play an important role in cellular processes such as gene expression and regulation. They can act through their specific recognition by proteic domains belonging to chromatin remodeling factors (enzymes, transcription factors, etc). A particularly important modification is the methylation of specific histone tail sites, for which there exist many. Our goal was to get insights into the molecular selectivity of these proteic domains towards a given methylation site by taking advantage of the numerous structural data available in the Protein Data Bank. We studied the interactions between the domains and histone peptides, using molecular dynamics simulations combined with a protocol using the MM/PBSA method. A pre-requisite was to develop and validate force field parameters for the of PTMs. Our results notably revealed that some domains discriminate the methlyation sites by recognizing short linear sequence motifs. It thus appears that chromodomains are specific to an ARKmeS motif, while PHD fingers bind the ARTKme motif of H3. The study carried out on PHD fingers also proves that our overall results can be used as a reference for research of other effectors of histone tails

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Fievet, Lorraine. "ARN non-codants et protéines effecteurs de la biologie du cil : identification du microARN let-7b comme modulateur de la ciliogenèse et rôle ciliaire putatif de l'Ataxine-7 dans l'ataxie spinocérébelleuse 7." Thesis, Strasbourg, 2019. http://www.theses.fr/2019STRAJ050.

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Abstract:

Le cil est une organelle conservée au fil de l’évolution qui se projette de presque toutes les cellules de vertébrés. Des mutations dans les gènes codant pour des protéines impliquées dans la structure ou la fonction des cils peuvent causer différentes anomalies développementales ou dégénératives, qui sont collectivement appelés ciliopathies. Les individus atteints de ciliopathies présentent une importante variabilité inter- et intra-familliale, suggérant la présence de gènes modificateurs de la pénétrance et de l’expression de la maladie. L’utilisation du poisson-zèbre comme organisme modèle permet de 1) valider le rôle du microARN let-7 comme modulateur de la ciliogenèse et ainsi de le considérer comme potentiel gène modificateurs dans les ciliopathies; et 2) d’explorer le rôle putatif de l’Ataxine-7 dans la biologie du cil et une potentielle contribution développementale à la maladie d’ataxie spinocérebelleuse 7 qui est une maladie dégénérative. Une meilleure compréhension de la biologie du cil et des ciliopathies permettrait de mieux diagnostiquer et prendre en charge les patients
Cilia are conserved organelles projecting from almost every vertebrate cell. Mutations in genes coding for proteins involved in cilia structure or function can cause different developmental and degenerative anomalies, which are collectively termed ciliopathies. Ciliopathy patients present an important inter- and intra-familial phenotypic variability, suggesting the presence of modifier genes of the penetrance and expressivity of the disease. Using the zebrafish model organism enables to 1) validate the role of the microRNA let-7 as a modulator of ciliogenesis, and thus consider it as a potential modifier gene of ciliopathies; and 2) explore the putative ciliary role of Ataxin-7 and a potential developmental contribution to spinocerebellar ataxia 7, which is a degenerative disease. A better understanding of cilia biology and ciliopathies would allow better diagnostics and care of patients

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Mikdache, Aya. "Analyse in vivo du comportement des cellules de Schwann et du rôle de rgs4 dans le développement du système nerveux périphérique chez le poisson zèbre." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS463.

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Abstract:

Les cellules de Schwann (CS) sont les cellules gliales myélinisantes du Système Nerveux Périphérique (SNP). Il existe une communication étroite entre ces cellules et les axones auxquels elles s’associent et ce dès les stades les plus précoces de leur développement. Elles migrent tout en se divisant le long des axones; cette division migratoire est suivie d’une deuxième division post-migratoire dans le but d’établir un ratio 1:1 avec les axones pour ensuite les myéliniser. Ce travail vise à analyser, in vivo, le comportement des CS chez le poisson zèbre au cours de leurs divisions.Nous avons remarqué que les CS se divisent parallèlement aux axones le long du nerf de la Ligne Latérale Postérieure (PLL). En analysant les deux mutants has et nok, nous avons montré que les gènes de polarité apicale aPKC et pals1 ne sont pas requis pour la migration et la division des CS, ni pour leur capacité à myéliniser. Nous avons mis en évidence, en analysant le mutant cassiopeia qui présente des défauts d’organisation du fuseau mitotique et en utilisant l’agent pharmacologique le nocodazole, que l’assemblage du fuseau mitotique au cours de la division des CS est essentiel pour la myélinisation.En parallèle, nous avons analysé le rôle du gène rgs4 (regulator of G-protein Signaling 4) dans le développement du SNP chez le poisson zèbre. Nous avons généré un mutant stable rgs4 par la technique CRISPR/Cas9 et montré un rôle de ce gène dans le développement du ganglion de la PLL et des motoneurones, et ce en agissant en amont de la voie PI3K/Akt/mTOR.Contrairement à l’inhibition pharmacologique qui suggère un rôle de rgs4 dans la myélinisation périphérique, le mutant ne présente pas de défauts de myéline
Schwann cells (SCs) are the myelinating glial cells of the Peripheral Nervous System (PNS). They derive from neural crest cells during development, then migrate and divide along the axons of the peripheral nerves. This migratory division is followed by a post-migratory division in order to radially sort the axons in a 1:1 ratio and wrap them with a myelin sheath. This work provides an analysis of the polarity of SC divisions, in vivo, in intact zebrafish embryos.We showed that SCs divide parallel to the axons along the Posterior Lateral Line nerve (PLL). By analyzing the two mutants has and nok, we revealed that the apical polarity genes aPKC and pals1, are neither required for the migration and division of SCs, nor for their capacity to myelinate. By studying the cassiopeia mutant that shows defects in mitotic spindle, we revealed that the assembly of the mitotic spindle is essential for SC myelination.We have also analysed the role of rgs4 (regulator of G-protein Signaling 4) in PNS development. We generated a stable rgs4 mutant using the CRISPR/Cas9 technology. We showed that rgs4 plays an essentiel role in PLLg and motoneurons development by acting upstream of PI3K/Akt/mTOR pathway. Pharmacological analysis suggested a role for rgs4 in peripheral myelination, however, the rgs4 mutant do not show any myelin defects

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Dubois, Morvan Ghislaine. "Le collagène de type I de Danio rerio : isolement, caractérisation et rôle au cours du développement." Lyon 1, 2002. http://www.theses.fr/2002LYO1T099.

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Munoz-Ruiz, Raphaël. "Novel aspects of TDP-43's interaction with ALS-related autophagy genes." Thesis, Sorbonne université, 2019. http://www.theses.fr/2019SORUS268.

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Abstract:

La Sclérose Latérale Amyotrophique (SLA) est une maladie dégénérative des neurones moteurs. Sa signature est la présence d’inclusions cytoplasmiques ubiquitinées (synonyme de protéostasie défaillante) majoritairement positives pour TDP-43, une protéine de liaison aux ARNs. Les altérations de l’autophagie et du métabolisme des ARNs sont particulièrement étudiées dans la SLA. Cette thèse explore le rôle de TDP-43 dans la régulation de l’autophagie et particulièrement sur les récepteurs de l’autophagie p62 et OPTN ainsi que leur kinase activatrice TBK1. Chez l’embryon de poisson zèbre, la sous-expression de tardbp (codant pour tdp-43) conduit à un phénotype moteur altéré que nous associons à une régulation négative de tbk1. De l’ARN humain de TBK1 améliore ce phénotype. Sur des cellules SH-SY5Y, une sous-expression de TARDBP conduit à un profil d’expression de gènes clés de l’autophagie contradictoire à celui du poisson zèbre. Cependant, activer l’autophagie basale grâce à la Torine 1 conditionne l’effet d’une déplétion de TDP-43 sur l’expression de p62/SQSTM1 et TBK1. De plus, la Torine 1 inhibe les liaisons de TDP-43 aux ARNs de RAPTOR et OPTN mais promeut celles avec p62/SQSTM1 et TBK1. Dans ces cellules, la surexpression progressive de TDP-43 conduit potentiellement à des effets antagonistes sur p62/SQSTM1. Plus globalement, moduler TARDBP se traduit par une apparition de phénomènes caractéristiques de la protéinopathie TDP-43 chez les patients SLA. Parallèlement, des techniques de visualisation des ARNs in vivo et in vitro sont développées. Ce travail met en lumière la faculté de TDP-43 à s’adapter au contexte cellulaire et d’influer différemment sur l’autophagie
Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is a degenerative disease of motoneurons. Its histological hallmark is the presence of ubiquitin-positive cytoplasmic inclusions in motor neurons of patients which indicates defective proteostasis. In the majority of cases, these inclusions are positive for TDP-43, an RNA-binding protein. Alterations of autophagy and RNA metabolism are widely investigated in ALS. This thesis explores the role of TDP-43 on autophagy regulation with a focus on autophagy receptors p62 and OPTN and their upstream activator TBK1. In the zebrafish embryo, knockdown of tardbp leads to an altered motor phenotype and correlates with a downregulation of tbk1. Human TBK1 RNA ameliorates this phenotype in a significant manner. In SH-SY5Y cells, knockdown of TARDBP leads to a profile of expression of key autophagy genes that is in opposition with the one obtained in the zebrafish. However, activating basal autophagy through Torin 1 treatment unveils conditional effect of TDP-43 on p62/SQSTM1 and TBK1. Moreover, Torin 1 treatment inhibits binding of TDP-43 to RAPTOR and OPTN mRNAs but promotes novel binding to p62/SQSTM1 and TBK1 mRNAs. In these cell lines, increasing overexpression of TARDBP also seems to affect p62/SQSTM1 in different manners. Overall, modulating TARDBP expression is accompanied by the appearance of characteristic traits of TDP-43 pathology in ALS. In parallel, techniques to visualize target RNAs in vivo and in vitro are being developed. This work highlights TDP-43 ability to adapt to cellular context and affect autophagy in different manners

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Dissertations / Theses on the topic 'Concentré de protéines de poisson'

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